View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16566_low_44 (Length: 293)

Name: NF16566_low_44
Description: NF16566
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16566_low_44
NF16566_low_44
[»] chr1 (124 HSPs)
chr1 (1-168)||(34028721-34028888)
chr1 (1-177)||(33753215-33753392)
chr1 (7-168)||(34028946-34029107)
chr1 (6-177)||(14118521-14118692)
chr1 (1-174)||(23281229-23281402)
chr1 (9-161)||(10654256-10654408)
chr1 (1-165)||(19986341-19986505)
chr1 (7-175)||(25088009-25088177)
chr1 (7-162)||(50574742-50574897)
chr1 (17-171)||(22584348-22584502)
chr1 (17-171)||(51691871-51692025)
chr1 (1-165)||(37199140-37199304)
chr1 (1-168)||(4045318-4045485)
chr1 (1-168)||(5463337-5463504)
chr1 (7-168)||(16267915-16268075)
chr1 (7-168)||(52412823-52412984)
chr1 (6-169)||(14775959-14776122)
chr1 (1-168)||(34279459-34279627)
chr1 (1-168)||(10923582-10923749)
chr1 (1-168)||(32564169-32564335)
chr1 (1-167)||(16267716-16267882)
chr1 (1-167)||(50921061-50921227)
chr1 (7-172)||(11394885-11395050)
chr1 (12-165)||(42607525-42607678)
chr1 (1-172)||(22584570-22584742)
chr1 (1-173)||(24590444-24590616)
chr1 (1-165)||(49291202-49291366)
chr1 (10-166)||(51692099-51692254)
chr1 (17-168)||(33753451-33753601)
chr1 (7-165)||(30293238-30293395)
chr1 (7-168)||(9881552-9881712)
chr1 (17-168)||(28970419-28970570)
chr1 (1-171)||(11787737-11787907)
chr1 (1-166)||(18793693-18793859)
chr1 (26-176)||(45305654-45305803)
chr1 (7-168)||(46738949-46739109)
chr1 (9-165)||(13944514-13944670)
chr1 (17-157)||(29256843-29256983)
chr1 (1-165)||(30611223-30611387)
chr1 (7-170)||(13944736-13944899)
chr1 (6-157)||(25088240-25088390)
chr1 (17-168)||(32563959-32564110)
chr1 (1-163)||(29257042-29257204)
chr1 (9-166)||(21035987-21036144)
chr1 (1-166)||(35986234-35986399)
chr1 (1-165)||(24655589-24655753)
chr1 (17-165)||(50118350-50118498)
chr1 (1-168)||(6181835-6182002)
chr1 (17-168)||(37198932-37199083)
chr1 (21-164)||(51810141-51810284)
chr1 (21-168)||(52412598-52412745)
chr1 (7-165)||(6181619-6181777)
chr1 (7-168)||(14775745-14775906)
chr1 (11-168)||(46949756-46949913)
chr1 (7-167)||(42607727-42607887)
chr1 (18-165)||(30293016-30293163)
chr1 (23-168)||(10654030-10654174)
chr1 (1-118)||(13831241-13831358)
chr1 (17-168)||(30792440-30792591)
chr1 (1-168)||(1831664-1831827)
chr1 (7-165)||(4045102-4045260)
chr1 (7-178)||(18793917-18794089)
chr1 (11-125)||(28112793-28112907)
chr1 (1-167)||(36657501-36657668)
chr1 (7-156)||(49291005-49291154)
chr1 (8-164)||(36657727-36657883)
chr1 (35-155)||(50574527-50574647)
chr1 (1-157)||(51810357-51810513)
chr1 (18-168)||(24655822-24655972)
chr1 (17-181)||(4550835-4550999)
chr1 (19-168)||(21385173-21385322)
chr1 (8-157)||(24590237-24590386)
chr1 (7-168)||(34279240-34279401)
chr1 (1-145)||(21384960-21385103)
chr1 (8-167)||(30611446-30611606)
chr1 (1-165)||(40533928-40534092)
chr1 (56-168)||(50921365-50921477)
chr1 (7-157)||(10923373-10923524)
chr1 (1-168)||(11787960-11788126)
chr1 (17-156)||(34621870-34622009)
chr1 (7-125)||(5118094-5118212)
chr1 (20-165)||(32517751-32517894)
chr1 (1-173)||(3569371-3569544)
chr1 (7-108)||(9119517-9119618)
chr1 (7-131)||(46949961-46950085)
chr1 (22-125)||(11797218-11797321)
chr1 (17-156)||(27209181-27209320)
chr1 (1-104)||(30792659-30792762)
chr1 (7-165)||(1831889-1832047)
chr1 (1-165)||(36884725-36884882)
chr1 (32-165)||(44222195-44222328)
chr1 (17-165)||(45305412-45305561)
chr1 (1-157)||(9119303-9119459)
chr1 (2-168)||(27209369-27209535)
chr1 (1-125)||(19886106-19886228)
chr1 (87-168)||(36077271-36077352)
chr1 (1-168)||(20260598-20260765)
chr1 (17-164)||(40703100-40703247)
chr1 (32-168)||(48702131-48702266)
chr1 (32-166)||(4054550-4054685)
chr1 (62-165)||(19885985-19886088)
chr1 (7-156)||(40702880-40703026)
chr1 (17-115)||(36884939-36885037)
chr1 (7-166)||(31125938-31126090)
chr1 (21-164)||(2125448-2125584)
chr1 (61-156)||(20260440-20260535)
chr1 (38-144)||(32517629-32517735)
chr1 (1-71)||(34621718-34621788)
chr1 (17-145)||(5463140-5463269)
chr1 (85-170)||(19886217-19886302)
chr1 (18-114)||(31126165-31126261)
chr1 (87-166)||(5117995-5118074)
chr1 (18-168)||(21036218-21036367)
chr1 (7-149)||(40534150-40534292)
chr1 (79-168)||(19269360-19269449)
chr1 (91-168)||(28112721-28112798)
chr1 (7-96)||(50921285-50921374)
chr1 (87-167)||(11797147-11797227)
chr1 (79-167)||(43727274-43727362)
chr1 (85-164)||(11394697-11394775)
chr1 (105-156)||(36142122-36142173)
chr1 (17-58)||(11394771-11394812)
chr1 (17-45)||(2125341-2125369)
chr1 (32-180)||(46593544-46593692)
[»] chr3 (131 HSPs)
chr3 (1-168)||(12123090-12123257)
chr3 (1-176)||(8846068-8846243)
chr3 (1-168)||(34521266-34521433)
chr3 (1-168)||(15862394-15862561)
chr3 (7-178)||(44069113-44069284)
chr3 (7-169)||(54107668-54107830)
chr3 (1-169)||(31513862-31514030)
chr3 (7-170)||(8846301-8846464)
chr3 (1-168)||(28688209-28688376)
chr3 (7-168)||(4846821-4846982)
chr3 (7-168)||(7950275-7950436)
chr3 (1-165)||(7742984-7743149)
chr3 (17-166)||(10756720-10756869)
chr3 (1-169)||(7937782-7937950)
chr3 (1-165)||(14353267-14353430)
chr3 (17-168)||(26332319-26332470)
chr3 (1-168)||(26332537-26332708)
chr3 (9-168)||(44069350-44069509)
chr3 (7-157)||(34629993-34630143)
chr3 (7-165)||(40410715-40410873)
chr3 (17-169)||(27940271-27940423)
chr3 (1-165)||(41208404-41208568)
chr3 (7-165)||(12123304-12123462)
chr3 (7-168)||(41997819-41997980)
chr3 (23-171)||(40926252-40926399)
chr3 (32-168)||(41208650-41208786)
chr3 (7-167)||(45171292-45171452)
chr3 (1-168)||(54081502-54081670)
chr3 (1-168)||(45171068-45171235)
chr3 (17-168)||(45871697-45871848)
chr3 (17-168)||(52606129-52606279)
chr3 (6-168)||(43899298-43899460)
chr3 (6-163)||(53841250-53841407)
chr3 (1-169)||(9028410-9028578)
chr3 (17-165)||(21169669-21169817)
chr3 (1-172)||(40969251-40969422)
chr3 (17-173)||(50819215-50819371)
chr3 (17-173)||(50856493-50856649)
chr3 (1-180)||(28691333-28691511)
chr3 (17-168)||(54108355-54108506)
chr3 (46-172)||(43899107-43899233)
chr3 (32-166)||(51170631-51170765)
chr3 (17-165)||(34521492-34521640)
chr3 (17-165)||(40926014-40926162)
chr3 (17-164)||(7274878-7275024)
chr3 (22-165)||(14353049-14353192)
chr3 (17-168)||(31514098-31514248)
chr3 (43-165)||(35580210-35580332)
chr3 (7-168)||(15862182-15862343)
chr3 (7-168)||(50819442-50819603)
chr3 (7-168)||(50856261-50856422)
chr3 (17-165)||(17273780-17273928)
chr3 (17-141)||(28688017-28688141)
chr3 (1-165)||(35753650-35753814)
chr3 (9-168)||(19124189-19124348)
chr3 (33-164)||(22354946-22355077)
chr3 (17-168)||(52268339-52268489)
chr3 (17-147)||(19124407-19124537)
chr3 (7-145)||(27254007-27254145)
chr3 (1-165)||(2829410-2829575)
chr3 (17-174)||(7742769-7742926)
chr3 (1-165)||(10756926-10757091)
chr3 (8-168)||(17102384-17102544)
chr3 (1-167)||(29248320-29248484)
chr3 (8-157)||(45871915-45872064)
chr3 (7-165)||(54081287-54081444)
chr3 (7-168)||(9028191-9028352)
chr3 (61-178)||(52609641-52609758)
chr3 (7-175)||(53678426-53678594)
chr3 (21-140)||(17102616-17102735)
chr3 (7-165)||(46766625-46766784)
chr3 (8-165)||(5348582-5348739)
chr3 (7-177)||(40639342-40639512)
chr3 (41-166)||(49529078-49529204)
chr3 (1-173)||(588369-588542)
chr3 (7-156)||(5348793-5348942)
chr3 (7-156)||(37133289-37133438)
chr3 (1-165)||(40639120-40639284)
chr3 (1-165)||(17273995-17274159)
chr3 (7-170)||(53678658-53678820)
chr3 (17-175)||(33773025-33773184)
chr3 (41-170)||(13866922-13867052)
chr3 (1-165)||(2078691-2078855)
chr3 (1-165)||(47891732-47891896)
chr3 (41-168)||(20963547-20963675)
chr3 (17-149)||(29248543-29248675)
chr3 (17-168)||(2829643-2829793)
chr3 (41-168)||(44316627-44316754)
chr3 (1-173)||(41998038-41998205)
chr3 (8-168)||(46766838-46767000)
chr3 (17-157)||(40969489-40969629)
chr3 (17-150)||(47891531-47891664)
chr3 (8-168)||(28691114-28691274)
chr3 (47-165)||(33812727-33812845)
chr3 (17-115)||(53841080-53841178)
chr3 (61-174)||(38911497-38911610)
chr3 (61-166)||(53310001-53310106)
chr3 (17-125)||(35753475-35753582)
chr3 (1-168)||(54247272-54247429)
chr3 (6-123)||(22444410-22444527)
chr3 (87-163)||(35753408-35753484)
chr3 (109-173)||(43527018-43527082)
chr3 (89-173)||(51883854-51883938)
chr3 (52-173)||(43839957-43840077)
chr3 (61-164)||(49222040-49222143)
chr3 (43-156)||(43844359-43844473)
chr3 (6-71)||(2078580-2078645)
chr3 (21-165)||(21918500-21918643)
chr3 (91-172)||(33812852-33812933)
chr3 (1-97)||(4846667-4846762)
chr3 (21-77)||(21169904-21169960)
chr3 (6-146)||(49222251-49222389)
chr3 (33-148)||(50393337-50393453)
chr3 (17-156)||(51885599-51885738)
chr3 (92-166)||(7937645-7937719)
chr3 (103-168)||(7274653-7274718)
chr3 (17-94)||(43527068-43527145)
chr3 (17-73)||(43527220-43527276)
chr3 (17-56)||(22444298-22444337)
chr3 (89-168)||(51311825-51311904)
chr3 (61-166)||(50259109-50259215)
chr3 (7-73)||(51311685-51311751)
chr3 (91-149)||(52705478-52705536)
chr3 (85-177)||(8327742-8327834)
chr3 (28-72)||(33772087-33772131)
chr3 (1-44)||(51885488-51885531)
chr3 (1-95)||(52268176-52268271)
chr3 (47-124)||(37174894-37174972)
chr3 (32-116)||(12991393-12991478)
chr3 (12-65)||(52606348-52606401)
chr3 (105-173)||(40503727-40503795)
[»] chr4 (93 HSPs)
chr4 (1-171)||(33626083-33626253)
chr4 (1-165)||(46621146-46621310)
chr4 (1-168)||(54136091-54136258)
chr4 (6-168)||(9010505-9010667)
chr4 (1-168)||(29864176-29864343)
chr4 (1-164)||(44432843-44433006)
chr4 (1-170)||(25218082-25218251)
chr4 (7-164)||(33625868-33626025)
chr4 (169-274)||(49827278-49827383)
chr4 (7-168)||(52914952-52915113)
chr4 (1-173)||(34958827-34958998)
chr4 (1-165)||(45911582-45911746)
chr4 (1-168)||(46200484-46200652)
chr4 (1-168)||(44710403-44710570)
chr4 (17-164)||(46620931-46621078)
chr4 (7-164)||(33882174-33882331)
chr4 (6-166)||(8751289-8751449)
chr4 (1-168)||(21218066-21218233)
chr4 (9-168)||(40067348-40067507)
chr4 (7-165)||(25058836-25058994)
chr4 (7-165)||(32385037-32385194)
chr4 (17-168)||(52915178-52915331)
chr4 (7-168)||(21217847-21218008)
chr4 (7-168)||(25593316-25593477)
chr4 (7-168)||(43317104-43317265)
chr4 (27-168)||(48209948-48210089)
chr4 (17-172)||(18862675-18862831)
chr4 (8-168)||(27347823-27347983)
chr4 (1-168)||(43316880-43317046)
chr4 (7-170)||(44710628-44710791)
chr4 (1-156)||(53645463-53645618)
chr4 (1-171)||(45683114-45683284)
chr4 (1-170)||(1157201-1157373)
chr4 (17-170)||(2738878-2739031)
chr4 (7-168)||(45911799-45911960)
chr4 (27-167)||(28570666-28570806)
chr4 (17-165)||(34959066-34959214)
chr4 (1-168)||(12381273-12381440)
chr4 (7-146)||(25218309-25218448)
chr4 (7-170)||(40067573-40067736)
chr4 (17-168)||(45683352-45683503)
chr4 (18-140)||(4793835-4793957)
chr4 (7-165)||(4966093-4966251)
chr4 (17-167)||(21051360-21051510)
chr4 (17-173)||(46535518-46535673)
chr4 (1-170)||(8246767-8246934)
chr4 (17-170)||(10014463-10014615)
chr4 (17-170)||(10021604-10021756)
chr4 (21-166)||(29864414-29864559)
chr4 (17-165)||(1157441-1157589)
chr4 (18-181)||(24503926-24504090)
chr4 (17-165)||(29970196-29970343)
chr4 (9-173)||(32384648-32384812)
chr4 (1-168)||(43969746-43969913)
chr4 (20-150)||(4965889-4966019)
chr4 (7-165)||(24504165-24504323)
chr4 (7-169)||(27347596-27347758)
chr4 (7-125)||(44428614-44428732)
chr4 (1-169)||(1205596-1205764)
chr4 (17-173)||(38866393-38866549)
chr4 (18-168)||(10014700-10014849)
chr4 (18-168)||(10021841-10021990)
chr4 (17-168)||(9010740-9010891)
chr4 (7-165)||(1205381-1205538)
chr4 (8-168)||(22830796-22830957)
chr4 (17-165)||(8246981-8247129)
chr4 (7-167)||(54191810-54191969)
chr4 (7-165)||(22831022-22831181)
chr4 (7-118)||(54191638-54191749)
chr4 (23-168)||(9657667-9657812)
chr4 (7-168)||(46200710-46200871)
chr4 (17-157)||(37515688-37515828)
chr4 (12-167)||(46535752-46535907)
chr4 (25-165)||(15985469-15985610)
chr4 (12-124)||(21051577-21051689)
chr4 (7-168)||(54136316-54136473)
chr4 (27-168)||(44169979-44170121)
chr4 (26-165)||(11102218-11102358)
chr4 (2-168)||(9657867-9658033)
chr4 (12-167)||(11242699-11242849)
chr4 (24-165)||(25977771-25977913)
chr4 (87-168)||(44428513-44428594)
chr4 (9-165)||(38866626-38866783)
chr4 (89-177)||(44170288-44170376)
chr4 (12-115)||(42779573-42779676)
chr4 (1-83)||(29970411-29970493)
chr4 (32-132)||(21885074-21885174)
chr4 (7-94)||(43969599-43969687)
chr4 (127-170)||(10017813-10017856)
chr4 (7-173)||(15985687-15985854)
chr4 (62-165)||(37515532-37515634)
chr4 (41-174)||(16037788-16037922)
chr4 (120-166)||(29970511-29970556)
[»] chr2 (106 HSPs)
chr2 (1-165)||(32933594-32933758)
chr2 (1-168)||(28203079-28203246)
chr2 (6-173)||(31450890-31451057)
chr2 (3-174)||(41377575-41377746)
chr2 (7-164)||(16655610-16655767)
chr2 (7-168)||(31450666-31450827)
chr2 (1-167)||(38275674-38275842)
chr2 (1-168)||(5961669-5961836)
chr2 (6-173)||(27883463-27883630)
chr2 (1-172)||(4104155-4104326)
chr2 (6-169)||(27132734-27132897)
chr2 (7-180)||(32933816-32933989)
chr2 (1-165)||(16655825-16655989)
chr2 (17-173)||(21470290-21470446)
chr2 (1-168)||(12304373-12304540)
chr2 (17-168)||(39454451-39454602)
chr2 (6-167)||(16260872-16261032)
chr2 (7-172)||(28202856-28203021)
chr2 (7-168)||(41377355-41377515)
chr2 (9-173)||(20908738-20908902)
chr2 (1-165)||(34820498-34820662)
chr2 (1-168)||(4120764-4120930)
chr2 (1-168)||(16736101-16736268)
chr2 (7-173)||(12303780-12303946)
chr2 (7-168)||(27476592-27476753)
chr2 (7-172)||(41659741-41659906)
chr2 (7-168)||(45389131-45389292)
chr2 (17-169)||(4104394-4104546)
chr2 (1-165)||(43183802-43183966)
chr2 (1-168)||(13354177-13354344)
chr2 (17-168)||(13354412-13354563)
chr2 (6-168)||(17856412-17856575)
chr2 (17-168)||(25642503-25642654)
chr2 (17-164)||(34820283-34820430)
chr2 (7-168)||(15137029-15137190)
chr2 (7-168)||(17856199-17856360)
chr2 (7-180)||(28631262-28631435)
chr2 (17-165)||(27132514-27132662)
chr2 (1-165)||(28631493-28631657)
chr2 (17-168)||(18565066-18565217)
chr2 (1-163)||(25642273-25642435)
chr2 (8-166)||(43183585-43183743)
chr2 (6-163)||(21470519-21470675)
chr2 (1-166)||(34127784-34127948)
chr2 (1-165)||(39912630-39912795)
chr2 (25-168)||(39912869-39913014)
chr2 (1-161)||(12304004-12304164)
chr2 (17-169)||(16736333-16736485)
chr2 (6-170)||(36211348-36211512)
chr2 (21-169)||(37412817-37412965)
chr2 (17-168)||(20908511-20908662)
chr2 (7-166)||(37412595-37412754)
chr2 (18-165)||(38275480-38275627)
chr2 (9-167)||(36442361-36442519)
chr2 (7-165)||(37744613-37744771)
chr2 (17-170)||(4120998-4121151)
chr2 (7-168)||(16261095-16261256)
chr2 (17-125)||(36211576-36211684)
chr2 (7-168)||(44612708-44612870)
chr2 (17-168)||(39150060-39150211)
chr2 (1-170)||(10833253-10833423)
chr2 (7-168)||(33819621-33819780)
chr2 (1-168)||(27246202-27246369)
chr2 (1-165)||(33819400-33819563)
chr2 (1-145)||(39149867-39150011)
chr2 (8-155)||(15829733-15829880)
chr2 (7-145)||(40694400-40694538)
chr2 (11-168)||(40694195-40694352)
chr2 (7-168)||(27883682-27883847)
chr2 (1-168)||(27914112-27914279)
chr2 (17-165)||(32503772-32503920)
chr2 (1-165)||(44915743-44915906)
chr2 (17-156)||(35408756-35408895)
chr2 (1-175)||(39454661-39454826)
chr2 (32-168)||(14877483-14877617)
chr2 (17-165)||(27476369-27476518)
chr2 (1-170)||(32503544-32503713)
chr2 (17-164)||(34127570-34127716)
chr2 (7-168)||(36442133-36442295)
chr2 (6-165)||(16350080-16350239)
chr2 (47-166)||(37744451-37744570)
chr2 (87-173)||(20297405-20297491)
chr2 (17-149)||(16350306-16350438)
chr2 (17-168)||(5921621-5921772)
chr2 (1-156)||(11943711-11943862)
chr2 (7-129)||(44915964-44916086)
chr2 (1-165)||(5720145-5720309)
chr2 (17-165)||(41659971-41660119)
chr2 (55-171)||(18565276-18565392)
chr2 (39-150)||(34484303-34484414)
chr2 (41-170)||(23992164-23992294)
chr2 (87-169)||(36211704-36211786)
chr2 (98-165)||(34484238-34484305)
chr2 (7-83)||(27246068-27246144)
chr2 (101-165)||(44610865-44610928)
chr2 (25-76)||(3603597-3603648)
chr2 (25-76)||(29078010-29078061)
chr2 (91-178)||(38073790-38073877)
chr2 (1-109)||(44612550-44612650)
chr2 (46-155)||(1580019-1580128)
chr2 (89-156)||(1580148-1580215)
chr2 (86-173)||(15744815-15744902)
chr2 (21-156)||(27913906-27914041)
chr2 (87-125)||(36211675-36211713)
chr2 (105-155)||(38806856-38806906)
chr2 (105-157)||(31557549-31557601)
[»] chr8 (100 HSPs)
chr8 (1-168)||(35223986-35224153)
chr8 (1-166)||(119119-119283)
chr8 (7-179)||(24456877-24457049)
chr8 (1-167)||(39240031-39240197)
chr8 (1-176)||(18621966-18622141)
chr8 (1-168)||(31230613-31230780)
chr8 (7-166)||(37393702-37393861)
chr8 (1-168)||(3869168-3869335)
chr8 (7-178)||(31230838-31231009)
chr8 (7-169)||(40040161-40040323)
chr8 (21-178)||(1826030-1826187)
chr8 (21-178)||(1860475-1860632)
chr8 (4-165)||(18018008-18018169)
chr8 (8-165)||(6843498-6843657)
chr8 (18-168)||(18017790-18017940)
chr8 (1-162)||(23244734-23244895)
chr8 (7-168)||(30650190-30650351)
chr8 (7-168)||(35223774-35223935)
chr8 (6-165)||(16645769-16645931)
chr8 (1-177)||(39911908-39912084)
chr8 (18-166)||(44254867-44255015)
chr8 (6-168)||(758568-758730)
chr8 (7-173)||(39240244-39240410)
chr8 (7-168)||(11198430-11198591)
chr8 (32-165)||(39912169-39912302)
chr8 (1-165)||(8654155-8654319)
chr8 (7-163)||(14920636-14920792)
chr8 (17-165)||(37393480-37393628)
chr8 (9-168)||(5416812-5416971)
chr8 (6-165)||(9495247-9495406)
chr8 (7-170)||(26736123-26736286)
chr8 (17-168)||(30873013-30873164)
chr8 (6-168)||(7041853-7042010)
chr8 (7-168)||(8653936-8654097)
chr8 (17-169)||(18914486-18914638)
chr8 (7-165)||(40094477-40094636)
chr8 (8-170)||(119342-119504)
chr8 (6-168)||(1825810-1825971)
chr8 (6-168)||(1860255-1860416)
chr8 (1-171)||(21515419-21515589)
chr8 (1-166)||(30568495-30568660)
chr8 (7-168)||(36343962-36344122)
chr8 (7-166)||(5417038-5417197)
chr8 (17-165)||(23244518-23244666)
chr8 (1-177)||(29027191-29027363)
chr8 (17-171)||(40032423-40032578)
chr8 (1-168)||(30872783-30872954)
chr8 (7-168)||(14920411-14920572)
chr8 (8-165)||(29026971-29027132)
chr8 (7-165)||(758347-758505)
chr8 (47-170)||(40032693-40032817)
chr8 (1-177)||(40094694-40094870)
chr8 (7-144)||(7041653-7041790)
chr8 (7-168)||(11639052-11639212)
chr8 (17-149)||(12873076-12873208)
chr8 (1-108)||(18914320-18914427)
chr8 (1-175)||(12873267-12873439)
chr8 (7-156)||(26217082-26217230)
chr8 (11-168)||(44255091-44255248)
chr8 (21-166)||(3868946-3869094)
chr8 (86-168)||(24456734-24456816)
chr8 (17-157)||(410597-410738)
chr8 (37-178)||(6844695-6844836)
chr8 (1-166)||(26736344-26736509)
chr8 (89-168)||(44678317-44678396)
chr8 (17-158)||(5525881-5526020)
chr8 (17-114)||(32733765-32733862)
chr8 (24-109)||(44678426-44678511)
chr8 (18-169)||(28206765-28206916)
chr8 (1-168)||(33542384-33542551)
chr8 (1-97)||(40040381-40040477)
chr8 (25-174)||(28206996-28207145)
chr8 (9-125)||(26217296-26217412)
chr8 (1-115)||(410422-410536)
chr8 (7-114)||(33542609-33542716)
chr8 (38-168)||(45436415-45436548)
chr8 (33-172)||(15740609-15740749)
chr8 (53-168)||(21512413-21512527)
chr8 (7-109)||(30568335-30568437)
chr8 (7-165)||(36344186-36344344)
chr8 (8-147)||(19302206-19302345)
chr8 (17-83)||(9495117-9495183)
chr8 (9-83)||(11639277-11639351)
chr8 (126-168)||(11639379-11639421)
chr8 (88-166)||(26217404-26217485)
chr8 (17-118)||(35485921-35486022)
chr8 (86-155)||(44678517-44678586)
chr8 (7-55)||(16645658-16645706)
chr8 (21-171)||(35486102-35486252)
chr8 (106-157)||(9630797-9630848)
chr8 (107-173)||(35030834-35030900)
chr8 (105-155)||(41658413-41658463)
chr8 (105-155)||(43086401-43086451)
chr8 (105-178)||(13364039-13364112)
chr8 (1-45)||(6843705-6843749)
chr8 (105-173)||(7117111-7117179)
chr8 (28-72)||(19302422-19302466)
chr8 (105-157)||(30865328-30865380)
chr8 (105-173)||(31446155-31446223)
chr8 (32-88)||(45435578-45435634)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (17-168)||(10625319-10625470)
chr7 (1-168)||(35085739-35085906)
chr7 (1-169)||(18731018-18731186)
chr7 (12-168)||(47250776-47250932)
chr7 (1-168)||(9230896-9231063)
chr7 (8-166)||(8769508-8769666)
chr7 (7-168)||(31715633-31715794)
chr7 (1-173)||(11678922-11679093)
chr7 (1-168)||(5238451-5238618)
chr7 (7-166)||(34568585-34568744)
chr7 (17-171)||(23472791-23472945)
chr7 (7-168)||(23437152-23437313)
chr7 (7-168)||(35085965-35086126)
chr7 (1-165)||(8769285-8769449)
chr7 (12-168)||(31715852-31716007)
chr7 (1-168)||(2357067-2357234)
chr7 (17-168)||(32706732-32706883)
chr7 (18-168)||(41758676-41758829)
chr7 (1-168)||(43726461-43726628)
chr7 (1-155)||(47250570-47250724)
chr7 (1-173)||(26920136-26920308)
chr7 (27-166)||(2357300-2357439)
chr7 (17-168)||(9034550-9034701)
chr7 (6-165)||(21522442-21522599)
chr7 (7-168)||(11678703-11678864)
chr7 (12-168)||(47251127-47251282)
chr7 (3-168)||(473192-473354)
chr7 (1-168)||(32706951-32707117)
chr7 (10-165)||(44448140-44448295)
chr7 (7-168)||(23472593-23472754)
chr7 (1-140)||(34568802-34568942)
chr7 (6-169)||(31623648-31623811)
chr7 (17-165)||(39118013-39118161)
chr7 (1-165)||(43140701-43140864)
chr7 (7-169)||(44486157-44486319)
chr7 (17-166)||(38842035-38842182)
chr7 (17-165)||(473415-473563)
chr7 (7-162)||(21522226-21522379)
chr7 (4-165)||(37143985-37144146)
chr7 (8-168)||(24119714-24119875)
chr7 (1-166)||(38842241-38842405)
chr7 (7-123)||(9230721-9230837)
chr7 (7-165)||(43726247-43726403)
chr7 (7-169)||(44485557-44485719)
chr7 (7-168)||(47305127-47305288)
chr7 (17-166)||(44447916-44448064)
chr7 (1-168)||(22338492-22338662)
chr7 (17-145)||(47305362-47305490)
chr7 (17-123)||(23437387-23437493)
chr7 (32-169)||(37143763-37143899)
chr7 (17-171)||(22338269-22338424)
chr7 (17-156)||(28349616-28349754)
chr7 (17-156)||(36507044-36507183)
chr7 (1-123)||(47250942-47251064)
chr7 (93-168)||(10625106-10625181)
chr7 (6-71)||(10625180-10625245)
chr7 (42-168)||(15326872-15326998)
chr7 (7-125)||(48703852-48703970)
chr7 (79-157)||(48704105-48704183)
chr7 (41-165)||(4156511-4156636)
chr7 (1-132)||(36506848-36506979)
chr7 (25-168)||(28263496-28263639)
chr7 (32-168)||(28264601-28264739)
chr7 (33-157)||(38676069-38676194)
chr7 (105-178)||(41691915-41691988)
chr7 (33-168)||(40263562-40263697)
chr7 (91-177)||(38677051-38677137)
chr7 (43-156)||(43050396-43050510)
chr7 (7-76)||(24119930-24119999)
chr7 (129-171)||(23439512-23439554)
chr7 (21-71)||(28349480-28349530)
chr7 (87-180)||(36282774-36282867)
chr7 (103-155)||(19543503-19543555)
[»] chr5 (84 HSPs)
chr5 (1-177)||(35263485-35263661)
chr5 (1-170)||(334294-334463)
chr5 (1-174)||(10656313-10656486)
chr5 (19-168)||(35263731-35263880)
chr5 (17-168)||(7399077-7399228)
chr5 (17-168)||(40589289-40589440)
chr5 (17-168)||(40589892-40590043)
chr5 (26-168)||(33699275-33699417)
chr5 (7-163)||(7210461-7210617)
chr5 (7-167)||(7210670-7210830)
chr5 (1-168)||(7399297-7399465)
chr5 (21-173)||(15267479-15267631)
chr5 (1-169)||(31656577-31656745)
chr5 (17-168)||(10656094-10656245)
chr5 (7-165)||(9693143-9693301)
chr5 (17-173)||(31656352-31656509)
chr5 (17-165)||(19205178-19205326)
chr5 (1-168)||(3878481-3878648)
chr5 (6-165)||(12593680-12593839)
chr5 (7-166)||(36751904-36752063)
chr5 (1-165)||(41859896-41860062)
chr5 (7-164)||(5087811-5087968)
chr5 (17-174)||(12694921-12695078)
chr5 (1-174)||(40589651-40589824)
chr5 (9-173)||(9692914-9693077)
chr5 (1-164)||(39706270-39706433)
chr5 (19-172)||(28392006-28392160)
chr5 (7-169)||(31908927-31909091)
chr5 (17-174)||(40589048-40589205)
chr5 (17-165)||(5624382-5624530)
chr5 (1-177)||(19204935-19205110)
chr5 (7-167)||(40774339-40774498)
chr5 (1-168)||(12593456-12593623)
chr5 (9-168)||(16353381-16353540)
chr5 (7-168)||(29023937-29024095)
chr5 (1-168)||(38416353-38416520)
chr5 (7-165)||(31909155-31909313)
chr5 (19-169)||(42710587-42710737)
chr5 (31-163)||(8418206-8418337)
chr5 (1-165)||(15476478-15476641)
chr5 (17-157)||(26289031-26289171)
chr5 (7-169)||(16353150-16353315)
chr5 (6-168)||(36752126-36752287)
chr5 (9-173)||(17861034-17861197)
chr5 (1-165)||(25923121-25923285)
chr5 (1-172)||(8418405-8418574)
chr5 (26-173)||(18514283-18514430)
chr5 (6-155)||(14143524-14143670)
chr5 (7-171)||(28391765-28391930)
chr5 (1-168)||(33762901-33763072)
chr5 (17-156)||(41372393-41372532)
chr5 (7-156)||(5152840-5152989)
chr5 (40-168)||(5088386-5088514)
chr5 (17-173)||(38416138-38416294)
chr5 (6-165)||(14051892-14052051)
chr5 (6-168)||(40774561-40774723)
chr5 (1-167)||(42710351-42710517)
chr5 (1-165)||(15267245-15267406)
chr5 (18-168)||(39706055-39706201)
chr5 (17-166)||(43570006-43570155)
chr5 (1-168)||(26289239-26289406)
chr5 (18-165)||(15670387-15670534)
chr5 (7-168)||(17861263-17861416)
chr5 (78-168)||(21750810-21750900)
chr5 (24-166)||(32272082-32272224)
chr5 (27-168)||(33763153-33763293)
chr5 (17-168)||(25923354-25923504)
chr5 (19-177)||(14143742-14143900)
chr5 (28-157)||(15476277-15476400)
chr5 (1-168)||(5152616-5152783)
chr5 (41-168)||(19185506-19185634)
chr5 (64-155)||(17736529-17736620)
chr5 (88-168)||(3879318-3879398)
chr5 (92-168)||(5460188-5460264)
chr5 (21-77)||(5624617-5624673)
chr5 (108-179)||(26288980-26289049)
chr5 (1-49)||(43569889-43569937)
chr5 (17-66)||(41859779-41859828)
chr5 (33-156)||(2597334-2597458)
chr5 (125-165)||(19615425-19615465)
chr5 (9-48)||(5088034-5088073)
chr5 (17-56)||(21750900-21750939)
chr5 (111-165)||(5460275-5460329)
chr5 (27-76)||(22166056-22166104)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (1-168)||(11433-11600)
scaffold0236 (7-150)||(11231-11374)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (1-170)||(40571-40740)
scaffold0051 (7-168)||(40352-40513)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (1-165)||(33544825-33544989)
chr6 (1-168)||(35132601-35132768)
chr6 (9-173)||(9173896-9174060)
chr6 (9-173)||(14336897-14337061)
chr6 (1-173)||(24605093-24605264)
chr6 (17-173)||(33545057-33545213)
chr6 (17-168)||(3338477-3338628)
chr6 (17-167)||(6220291-6220441)
chr6 (7-165)||(24604878-24605035)
chr6 (1-169)||(31029743-31029911)
chr6 (12-175)||(2949289-2949447)
chr6 (2-173)||(3289130-3289301)
chr6 (1-170)||(7537824-7537994)
chr6 (7-168)||(3288930-3289091)
chr6 (7-166)||(29009956-29010115)
chr6 (17-168)||(33329206-33329357)
chr6 (17-168)||(3338712-3338861)
chr6 (1-155)||(11524778-11524933)
chr6 (17-168)||(25551347-25551498)
chr6 (18-168)||(19135682-19135832)
chr6 (7-168)||(11524991-11525151)
chr6 (7-168)||(14337127-14337287)
chr6 (9-165)||(25551563-25551719)
chr6 (17-165)||(31029527-31029675)
chr6 (12-168)||(33346478-33346634)
chr6 (7-169)||(1860711-1860872)
chr6 (17-170)||(1158586-1158741)
chr6 (12-168)||(35119041-35119197)
chr6 (6-169)||(12903220-12903383)
chr6 (1-165)||(6220059-6220223)
chr6 (1-165)||(13156058-13156217)
chr6 (1-165)||(13160914-13161073)
chr6 (17-168)||(29010189-29010340)
chr6 (6-140)||(12903435-12903569)
chr6 (18-156)||(24548477-24548615)
chr6 (1-168)||(1158810-1158975)
chr6 (7-124)||(2949516-2949633)
chr6 (41-169)||(6229645-6229773)
chr6 (6-173)||(24548236-24548403)
chr6 (17-157)||(13155850-13155990)
chr6 (17-157)||(13160706-13160846)
chr6 (41-168)||(17245582-17245710)
chr6 (7-124)||(33972431-33972548)
chr6 (1-172)||(17544450-17544620)
chr6 (61-173)||(32283021-32283133)
chr6 (8-146)||(2315601-2315739)
chr6 (1-76)||(33972296-33972373)
chr6 (17-168)||(35132836-35132976)
chr6 (32-156)||(2814561-2814685)
chr6 (8-165)||(17544679-17544835)
chr6 (32-146)||(29999653-29999767)
chr6 (1-90)||(33329425-33329514)
chr6 (87-167)||(11524706-11524786)
chr6 (101-165)||(33971931-33971995)
chr6 (1-157)||(31754215-31754371)
chr6 (1-71)||(29999510-29999580)
chr6 (98-168)||(33548173-33548243)
chr6 (135-177)||(33548118-33548160)
chr6 (86-170)||(32753175-32753259)
chr6 (17-56)||(35118934-35118973)
chr6 (105-155)||(8850230-8850280)
chr6 (105-179)||(27128833-27128907)
chr6 (105-173)||(3618776-3618844)
chr6 (105-149)||(13204224-13204268)
chr6 (32-76)||(29467206-29467250)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (7-168)||(4543-4704)
scaffold0809 (2-165)||(4341-4504)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (7-181)||(177290-177464)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (1-174)||(45055-45228)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (1-171)||(11706-11876)
scaffold0168 (20-168)||(11488-11636)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (8-172)||(90801-90965)
scaffold0016 (8-118)||(91734-91844)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (1-168)||(13542-13708)
scaffold0188 (7-173)||(13766-13932)
[»] scaffold0045 (4 HSPs)
scaffold0045 (1-165)||(65742-65906)
scaffold0045 (1-165)||(73074-73238)
scaffold0045 (7-172)||(65964-66129)
scaffold0045 (7-172)||(73296-73461)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (7-125)||(11711-11829)
scaffold0444 (87-168)||(11639-11720)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (1-173)||(93183-93357)
scaffold0022 (32-72)||(93439-93479)
[»] scaffold1436 (2 HSPs)
scaffold1436 (18-168)||(1476-1625)
scaffold1436 (17-123)||(1710-1815)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (41-173)||(9777-9910)
scaffold0225 (41-156)||(10878-10994)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (85-165)||(25970-26050)
scaffold0193 (7-65)||(26039-26097)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (32-74)||(90254-90296)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 124)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34028888 - 34028721
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  34028888 aagatgagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaat 34028789  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
      |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34028788 tgaattttagttaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 34028721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33753392 - 33753215
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  33753392 aagatgagaagaagatgaagaaaagctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagacaaaaatgtgtaactgggagaagttaaaggaccaaaataaat 33753293  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc-aaaaataaa 177  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33753292 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaaaaataaa 33753215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 34028946 - 34029107
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  34028946 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 34029045  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34029046 ttagttaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 34029107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14118692 - 14118521
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  14118692 gagaagaagataaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagaaaagttaaagtaccaaaataaatcgaat 14118593  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14118592 tttaattaaggaaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaaaataaa 14118521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 23281229 - 23281402
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  23281229 aagaggagaagaagatgaaaaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaat 23281328  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23281329 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaaaat 23281402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 10654256 - 10654408
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  10654256 aagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttt 10654355  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaa 161  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10654356 agttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaa 10654408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19986341 - 19986505
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19986341 aagaggaggagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaaaggaccaaaataaat 19986440  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19986441 caaattttatttaagagaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 19986505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25088177 - 25088009
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  25088177 agaagaaaatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 25088078  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaata 175  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25088077 ttagttaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaaaata 25088009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Original strand, 50574742 - 50574897
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  50574742 agaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 50574841  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaat 162  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50574842 ttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaat 50574897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22584502 - 22584348
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22584502 gaagaaaacctaacgtttttgatttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 22584403  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22584402 gaccaatgtgatactacctaaatagttaagagacaaaaaatgcaatatagccaaa 22584348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 51692025 - 51691871
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  51692025 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaatggaccaaaatagatcgaattttaattaagg 51691926  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51691925 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaa 51691871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 37199140 - 37199304
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||| |||||||    
T  37199140 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccagaataaat 37199239  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37199240 cgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaattta 37199304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 4045318 - 4045485
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  4045318 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggactaaaatgtgtagcagagaaaagttaaaggactaaaataaat 4045417  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4045418 cgaattttaattaagagaccaaagtgatactacttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcc 4045485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 5463337 - 5463504
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  5463337 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacagagaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaat 5463436  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5463437 caaattttaattaacggaccaaagcgatactagctaaatagttaagggactaaaaatgcattttagcc 5463504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 16267915 - 16268075
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16267915 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaacggagagaagtt-aaggaccaaaataaatcaaatt 16268013  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16268014 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 16268075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 52412823 - 52412984
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  52412823 agaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 52412922  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  52412923 ttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 52412984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Original strand, 14775959 - 14776122
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  14775959 gagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagggagaa-tttaagagaccaaaataaatcgaa 14776057  T
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14776058 ttttaattaagggaacaaaacgatactacctaaatagttaagtgaccaaaaatgcaatttagcca 14776122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 34279459 - 34279627
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaa-ctaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||  |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  34279459 aagaggagaagaagatgaaaaaaatataacgtttttaaataaaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaa 34279558  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34279559 tcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 34279627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 10923582 - 10923749
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||    
T  10923582 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaat 10923681  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10923682 cgaattttaattaagggaccaaagcgataccacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10923749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 32564169 - 32564335
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||    
T  32564169 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaatatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gatagaagttaagggaccaaaataaat 32564267  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32564268 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagcc 32564335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16267882 - 16267716
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  16267882 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaccaacggtaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 16267783  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16267782 caaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 16267716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 50921227 - 50921061
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||    
T  50921227 aagaagagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaaaactaaaatgtgtaacagagagaaatcaagggaccaaaataaat 50921128  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    |  |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50921127 cggattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 50921061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 11394885 - 11395050
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  11394885 agaagaaaatgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaataaccataatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 11394984  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11394985 ttaattaagggatcaaaacaaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagtcaaaa 11395050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42607678 - 42607525
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| | |    
T  42607678 aagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttaaat 42607579  T
Q  112 taagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42607578 taagggaccaaaacgatattatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 42607525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 22584570 - 22584742
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttg-aattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22584570 aagaggagaagaagatgaaaaaaatctaacatttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaa 22584669  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22584670 tcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaattagttaagggaccaaaaatataatttagccaaaa 22584742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 24590444 - 24590616
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  24590444 aagaggagaagaaggtgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaat 24590543  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
      ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  24590544 tgaattttaattaaaggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagccaaaaa 24590616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 49291202 - 49291366
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||    
T  49291202 aagatgagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaatcaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacatagagaaattaagggaccaaaataaat 49291301  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49291302 cgaattttaattaagggaccaaaacgatactatctaaatagttaagggacgaaaaatgcaattta 49291366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 51692099 - 51692254
Alignment:
Q  10 agaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttta 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  51692099 agaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttta 51692197  T
Q  110 gttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
     |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51692198 attaatggaccaaaacgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 51692254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 33753451 - 33753601
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33753451 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 33753550  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  33753551 gaccaaaacgatactacctaaatagttatgggac-caaaatacaatttagcc 33753601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 30293238 - 30293395
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30293238 agaagaaaatgaaaaaaacctaacatttttgaattaaaactaatggaaaataccaaaatgtgtaacatagagaagtt-aaggaccaaaataaatcgaatt 30293336  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30293337 ttaattaaaggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 30293395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9881712 - 9881552
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  9881712 agaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaatggaaaagaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 9881614  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9881613 ttaatttagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 9881552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28970570 - 28970419
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  28970570 gaagaaaacctaatgttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttcatggaccaaaataaatcgaattttaattaaag 28970471  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28970470 gaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 28970419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11787907 - 11787737
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||| |    
T  11787907 aagaggagaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaataatt 11787808  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  11787807 caaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaattcaatttagtcaaa 11787737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18793859 - 18793693
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaac-ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  18793859 aagaggagaagaagatgaaaaaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaa 18793760  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18793759 tcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgaaatttag 18793693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 176
Target Start/End: Original strand, 45305654 - 45305803
Alignment:
Q  26 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaat 125  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |    
T  45305654 ctaacgttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagaga-gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagt 45305752  T
Q  126 gatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45305753 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaaaataa 45305803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 46738949 - 46739109
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||| ||||    
T  46738949 agaagaaaatgaagaaaatctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaacagagagaagttaagcgaccaaagtaaatcgaatt 46739048  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  46739049 ttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaggggac-aaaaatacaatttagcc 46739109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13944670 - 13944514
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||  ||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  13944670 aagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtttaatggagagaagttaagggaccaatataaatcaaatttt 13944571  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13944570 aattaagggaccaaaacgatactagctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 13944514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29256983 - 29256843
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  29256983 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagg 29256884  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29256883 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 29256843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30611387 - 30611223
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||| ||| | |||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  30611387 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaatagaaatgaccaaattatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaat 30611288  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30611287 cgaattttaattaagggatcaaagtgataatatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 30611223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 13944736 - 13944899
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13944736 agaagaaaatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 13944835  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13944836 ctaattaagggatcaaaacgatactacctaaatgattaagggaccaaaaatacaatttagccaa 13944899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 25088240 - 25088390
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| | ||||| || |||||| |||    
T  25088240 gagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatggagaagttaagggaccgaactaaatcgaat 25088339  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25088340 tttagttaa-ggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 25088390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32564110 - 32563959
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32564110 gaagaaaacataatgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 32564011  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32564010 gaccaaagtgatacagcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 32563959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 29257042 - 29257204
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  29257042 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaat 29257141  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatt 163  Q
      ||||||| ||| ||||  ||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29257142 tgaattttaattaggggacaaaattaatactagctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatt 29257204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21036144 - 21035987
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||    
T  21036144 aagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacttaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaatttt 21036045  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    | |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  21036044 aattaatggaccaaagtgatactatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttag 21035987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 35986399 - 35986234
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| | | | |||||| |  |||||||||||||    
T  35986399 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtatcggcgagaagttaagagaccaaaataaat 35986300  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35986299 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaacaaaaatgcaatttag 35986234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24655753 - 24655589
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||| |  ||||||||| |||    
T  24655753 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggcccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagagaccaaaatgaat 24655654  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  24655653 cgaattttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatacttaagggaccaaatatgcaattta 24655589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 50118498 - 50118350
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  50118498 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaaattaagagaccaaaataaatcgaattgtaattaagg 50118399  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50118398 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 50118350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 6181835 - 6182002
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  6181835 aagaggagaagaagatgaagaaaaccttacgtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaat 6181934  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||| |||  |||  |||||||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  6181935 cgaattttaattaaaggactaaagcgatactacataaatagttatgagaccaaaaatacaatttagcc 6182002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37199083 - 37198932
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37199083 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 37198984  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  |||| | ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||    
T  37198983 gaccaaagcgatattgcctaaatagttaagaaaccaaaaatacaatttagcc 37198932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 51810284 - 51810141
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  51810284 aaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggacc 51810185  T
Q  121 aaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  51810184 aaagtgatactacctaaatagttaagagactaaaaatgcaattt 51810141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 52412745 - 52412598
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  52412745 aaaacctaacgttttggaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggacc 52412646  T
Q  121 aaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  52412645 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtattttagcc 52412598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6181777 - 6181619
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6181777 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatt 6181678  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||| | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  6181677 ttaattaaggaaccaaagcgatactaactaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 6181619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14775906 - 14775745
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  14775906 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggagcaaaataaatcgaatt 14775807  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||| | | |||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  14775806 ttaattaaagaagcaaaacaatactacctaaataattaagggaacaaaaatacaatttagcc 14775745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46949913 - 46949756
Alignment:
Q  11 gaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttag 110  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |  |||||| | ||||||||||||||| |||||||     
T  46949913 gaagatgaagaaaacttgacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacgaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaa 46949814  T
Q  111 ttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  46949813 ttaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaatgaattaaaaatgcaatttagcc 46949756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 42607727 - 42607887
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | | || ||||||| ||||||||| ||||    
T  42607727 agaagaaaatgaagaaaatctaacctttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttgtaacagagagtaattaaaggaccgaaataaatcaaatt 42607826  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  42607827 ttaattaagagaccaaaacgatactatctaaataattaagggatcaaaaatacaatttagc 42607887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30293163 - 30293016
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |  |||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  30293163 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaataaagag 30293064  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30293063 accaaagcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaattta 30293016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10654174 - 10654030
Alignment:
Q  23 aacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaa 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  10654174 aacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggacagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaa 10654075  T
Q  123 aatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |  | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10654074 agcg-tactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10654030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 13831241 - 13831358
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  13831241 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 13831340  T
Q  101 ccaattttagttaaggga 118  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  13831341 cgaattttaattaaggga 13831358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30792591 - 30792440
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30792591 gaagaaaacttgacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagagaaaagataagggaccaaaataaatcgaattttatttaagg 30792492  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||  || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30792491 gatcaaagcgacagtacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcc 30792440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1831827 - 1831664
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||| | ||||||||||||||    
T  1831827 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttt----taaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaagaagagaagttaagggaccaaaataaat 1831732  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  1831731 cgaattttaattaaaagaccaaagtgatactacctaaatagttaagagaccgaaaattcaatttagcc 1831664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4045260 - 4045102
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||  ||||    
T  4045260 agaagaaaatgaagaacacctaacgtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaattgaatt 4045161  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  4045160 ttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaaggggctaaaaatacaattta 4045102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 18793917 - 18794089
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||  |  |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  18793917 agaagaaaatgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaa-tgtgtaacgaaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 18794015  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgata--ctacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaat 178  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18794016 ttaattaagggaccaaagcgatatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaaaataaat 18794089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28112907 - 28112793
Alignment:
Q  11 gaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttag 110  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||     
T  28112907 gaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaa 28112808  T
Q  111 ttaagggatcaaaat 125  Q
    |||||||||||||||    
T  28112807 ttaagggatcaaaat 28112793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36657668 - 36657501
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaac--agagggaagtttaaggaccaaaataa 98  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| | |||| | ||| ||||||||    
T  36657668 aagatgagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggac-aaaatatgtaacggagagaggagttaagggatcaaaataa 36657570  T
Q  99 atccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||| ||||||| |||||||| | ||  ||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36657569 atcaaattttaattaagggacccaagagatgcaaactaaatagttaggggacgaaaaatgcaatttagc 36657501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49291154 - 49291005
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   || |||||| | | || |||||||||| ||||    
T  49291154 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaatgaagagaagttaaggaacaaaaataaatcaaatt 49291055  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  49291054 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaaaaaaaa 49291005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 36657727 - 36657883
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  36657727 gaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatagacagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattt 36657826  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    || |||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36657827 taattaagggaccaaagcgatactgcataaatagttaagggaccaaaaatacaattt 36657883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50574647 - 50574527
Alignment:
Q  35 ttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacc 134  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||  |||||||||    
T  50574647 ttgagttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatagaccaaagcgatactacc 50574548  T
Q  135 taaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50574547 taaatagttaagggacaaaaa 50574527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 51810357 - 51810513
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  51810357 aagaggagaagaggatgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacaagaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaat 51810456  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    | | ||||| || ||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51810457 caatttttaattcaggaacaaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 51810513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 24655822 - 24655972
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||  |||||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| | |    
T  24655822 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaccggaaggaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggctcaaaataaatcgaattttaattacgag 24655921  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24655922 accaaagcgatactacttaaatagttaagagactaaaaatgcaatttagcc 24655972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 4550835 - 4550999
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4550835 gaagaaaacctaacgtttttgaatttaacctaacggaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaag 4550933  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaattaa 181  Q
    ||| ||||  |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  4550934 ggaccaaagcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcctagaatgaattaa 4550999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 21385173 - 21385322
Alignment:
Q  19 agaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggga 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  21385173 agaaaacctaacgtttttgaattaaaatcaacggaaatgaccaaaatgtgttacatagagaagttaagggatcaaaataaattaaattttaattaaggga 21385272  T
Q  119 tcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
     ||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  21385273 ccaaagcgatactacttaaatagttaagggattaaaagtgcaatttagcc 21385322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24590386 - 24590237
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  || || |  |||||||||||||| |||||    
T  24590386 gaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggactaaaatgtgtaacatagacaaattaatagaccaaaataaatcgaattt 24590287  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    || |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  24590286 taattaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaagtgactaaaaat 24590237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34279401 - 34279240
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||  |  |||||| |  |||||||||||||  ||||    
T  34279401 agaagaaaatgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaatt 34279302  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34279301 ttaattaagggaccaaagcgttactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 34279240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21385103 - 21384960
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| |||| |||| |||||||||||||    
T  21385103 aagaggagaagaagatgaagaaaatctatcgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaag-ttaaagaccaaaataaat 21385005  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaa 145  Q
    | ||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  21385004 cgaattttaattaagggataaaagcgatactacataaatagttaa 21384960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 30611446 - 30611606
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggacc-aaaataaatccaatt 106  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||  ||| | | ||||| |||||||||| ||||    
T  30611446 gaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagaaaagataagggaccaaaaataaatcgaatt 30611545  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  30611546 ttaatttagggaccaaagcgatacaacctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagc 30611606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40534092 - 40533928
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||  ||||| |   | | ||||||||    
T  40534092 aagaggagaagaagataaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagaaaagttaagatagcgaaataaat 40533993  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40533992 caaattttaattaagggatcaaagcgatactaattaaatagttaagagactaaaaatgcaattta 40533928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Original strand, 50921365 - 50921477
Alignment:
Q  56 ggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50921365 ggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 50921464  T
Q  156 atgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||||    
T  50921465 atgtaatttagcc 50921477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10923524 - 10923373
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaa-actaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| |||  ||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  10923524 agaagaaaatgaagaaaacataacgtttttgaattaaatactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggatcaaaataaatcaaat 10923425  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10923424 tttacttaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaat 10923373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 11787960 - 11788126
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||  |||  ||||| | ||||||||||||||    
T  11787960 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaagagc-aaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaat 11788058  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||| | |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  11788059 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactgcttaaataattaaaagaccaaaaatgcaatttagcc 11788126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 34621870 - 34622009
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||  |||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34621870 gaagaaaatttaacgtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagg 34621969  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  34621970 gatcaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 34622009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5118212 - 5118094
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  5118212 agaagaaaatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 5118113  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaat 125  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  5118112 ttaattaagggaccaaaat 5118094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Original strand, 32517751 - 32517894
Alignment:
Q  20 gaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggat 119  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||   |     
T  32517751 gaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaatgagagaagttgagggatcaaaataaatcaaattttaattaa--aac 32517848  T
Q  120 caaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  32517849 caaagtgatactacctaaatagataagggatcaaaaatgcaattta 32517894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3569544 - 3569371
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||  |||||  ||||||||| |    
T  3569544 aagaggagaagaagatggagaaatcctaacgtttttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagataccaaaatata 3569445  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    || ||||||| |||||| | ||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||   |||||||| |||||    
T  3569444 tcaaattttaattaaggaaccaaaacgatactaattaaataattaagggaccaaaaacataatttagcaaaaaa 3569371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Original strand, 9119517 - 9119618
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  9119517 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaactgaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 9119616  T
Q  107 tt 108  Q
    ||    
T  9119617 tt 9119618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 46949961 - 46950085
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  46949961 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagagaccaaaataaatcgaatt 46950060  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    ||| |||| ||| |||  |||||||    
T  46950061 ttaattaaaggagcaatgtgatact 46950085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11797321 - 11797218
Alignment:
Q  22 aaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatca 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  11797321 aaacctaacattcttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaggttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacca 11797222  T
Q  122 aaat 125  Q
    ||||    
T  11797221 aaat 11797218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27209320 - 27209181
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27209320 gaagaaaacctaacggttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagg 27209221  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    || |||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  27209220 gaccaaagtgatattaattaaatagttaagggaccaaaaa 27209181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 30792659 - 30792762
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  30792659 aagaggagaagaagatgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 30792758  T
Q  101 ccaa 104  Q
    ||||    
T  30792759 ccaa 30792762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 1831889 - 1832047
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||| |||  ||||| |  ||| |||||||||| ||||    
T  1831889 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccataatatataacggagaaaagttaagagacgaaaataaatcgaatt 1831988  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||| |||  |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1831989 ttaattaaaggactaaaacgatactacatatatagttaagggaccaaaaatacaattta 1832047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36884882 - 36884725
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||       |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  |||||||||||||    
T  36884882 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaat-------aacggaaaggaccaaaatatgtaatggagggaagttaagagaccaaaataaat 36884790  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  36884789 cgaattttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaacaaaaatacaattta 36884725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44222328 - 44222195
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||| |    
T  44222328 tttttgaattaaaactaacagaaagaatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatatt 44222229  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || |||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  44222228 acataaataattaaaggaccaaaaatgcaattta 44222195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45305561 - 45305412
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaa-gtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  45305561 gaagaaacactaacgtttttgaattaaaagtaacggaaaagaccaaaaggtataacagagagaaagttaaaggaccaaaataaatcgaatcttaattaaa 45305462  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  45305461 ggaccaaagcaatactacctaaatagttaactgaccaaaaatgcaattta 45305412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9119459 - 9119303
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||| |||   |  |||||| | ||| ||||||||||    
T  9119459 aagaggagaagaacacgaagaaaatctaacgtttttgaattgaaactaacggaaataaacaaaatgtataatgtatagaagttaagggatcaaaataaat 9119360  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9119359 caaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaagtagttaagggataaaaaat 9119303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 27209369 - 27209535
Alignment:
Q  2 agatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaat 100  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||  |||||  ||||||||||||    
T  27209369 agatgatatgaagatgaagaagacctaacgttttttaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgcaag-gagagaaagttaagataccaaaataaat 27209467  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27209468 caaattttaattaaaggaccaaaacgatactaattaaattgtcaagggaccaaaaatgcaatttagcc 27209535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 19886106 - 19886228
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19886106 aagaggagaagaaaaggaagaaaacataacgtttttaaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgt--gagagagaagttaaaggaccaaaataaat 19886203  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaat 125  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||||    
T  19886204 cgaattttaattaaaggaccaaaat 19886228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36077352 - 36077271
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36077352 ggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 36077271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 20260598 - 20260765
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||  ||| ||   |||||  |||||||||||    
T  20260598 aagaggagaagaagatgaagaaaacataacgtttttaaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatatgtaag-gagagagagttaagataccaaaataaa 20260696  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20260697 tcagattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaataattaagggactaaaaatgcaatttagcc 20260765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 40703100 - 40703247
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagga-ccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||   |||||||||||| |||||||  ||||    
T  40703100 gaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatgccaaaataaatcaaattttaactaag 40703198  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    ||| ||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40703199 ggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 40703247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 168
Target Start/End: Original strand, 48702131 - 48702266
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    | ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  48702131 tttttgaattaaaaccaacg-aaatgaccaaaatgtgtaacgatagaaagttaaaataccaaaataaatccaattttaattaaaggaccaaaacgatact 48702229  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  48702230 aacaaaataattaagggactaaaaatgcaatttagcc 48702266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4054685 - 4054550
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatac 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||  | ||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || |||  |||||    
T  4054685 tttttgaattaaaactaacgtaaaagactaaaatgtgtaacggagagaaagtaaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaagaattaaatcgatac 4054586  T
Q  131 tacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    || |||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  4054585 tatctaaatagttaaggggataaaaatacaatttag 4054550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19886088 - 19885985
Alignment:
Q  62 aaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaa 161  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19886088 aaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactacaaaaatagttaagggaccaaaaatgcaa 19885989  T
Q  162 ttta 165  Q
    ||||    
T  19885988 ttta 19885985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40703026 - 40702880
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||  || |||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  40703026 agaagaaaaggaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaaagatcaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaatt 40702927  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||| || ||||| |    ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  40702926 ttaatttagggacc---gtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 40702880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Original strand, 36884939 - 36885037
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36884939 gaagtaaacctaacattttttaattaaaattaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagataagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaag 36885037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31126090 - 31125938
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||||| | | | ||||||||||| ||||    
T  31126090 agaagaaaatgaagaaaatctaacattttttaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaatt 31125991  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||| |||       |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31125990 ttaatta-------aaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttag 31125938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Original strand, 2125448 - 2125584
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  || |||||| | ||||||||||||||| |||||      ||||| |    
T  2125448 aaaacctaacgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgt-taacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattt------agggacc 2125540  T
Q  121 aaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  2125541 aaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgtaattt 2125584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20260535 - 20260440
Alignment:
Q  61 aaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  20260535 aaaatgtgtaacggagagaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaatgatactaattaaatagttaagagaccaaaaa 20260440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32517735 - 32517629
Alignment:
Q  38 aattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaa 137  Q
    |||||||||||||  |||  || |||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  32517735 aattaaaactaacaaaaataaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaa 32517636  T
Q  138 atagtta 144  Q
    |||||||    
T  32517635 atagtta 32517629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 34621788 - 34621718
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaa 71  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  34621788 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaa 34621718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5463269 - 5463140
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttg-aattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5463269 gaagaaaacctaacgtttttttaattaaaactgacggaaaggaccaaaatatgtacctgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaag 5463170  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaa 145  Q
     || ||||  |||| || ||||||| ||||    
T  5463169 agaccaaagcgatattatctaaataattaa 5463140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 170
Target Start/End: Original strand, 19886217 - 19886302
Alignment:
Q  85 aaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  19886217 aaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatacaatttaaccaa 19886302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
Target Start/End: Original strand, 31126165 - 31126261
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaa 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||  ||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  31126165 aagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtgacatagaaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaa 31126261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5118074 - 5117995
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5118074 ggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 5117995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 21036218 - 21036367
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||  |||   ||||||||||  ||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||| |     
T  21036218 aagaaaccctaaagttcttgaattaaaactaacggaaatgatcaaacaatgtaacagagaaaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaaaga 21036317  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | |||| ||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  21036318 accaaagtgatggtacctaaatagttaa-agataaaaaatgcaatttagcc 21036367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Original strand, 40534150 - 40534292
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||  |||  ||||| |   ||| ||||||||| ||||    
T  40534150 agaagaacatgaagaaaacttaacattttttaattaaaactaacagaaagggtcaaaatgtgtaatggagaaaagttaagataccgaaataaatcaaatt 40534249  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaaggga 149  Q
    ||| ||||| || ||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  40534250 ttaattaagagaccaaagcgatactaattaaatagttaaggga 40534292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19269449 - 19269360
Alignment:
Q  79 aagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||| || |||| |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19269449 aagttcaaggaccaaaataaaccgaattttaactaagagaccaaagtgatactggataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 19269360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28112798 - 28112721
Alignment:
Q  91 caaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28112798 caaaataaattgaattttaattaaggaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 28112721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 96
Target Start/End: Original strand, 50921285 - 50921374
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaat 96  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  50921285 agaagaaaatgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaattgaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaat 50921374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11797227 - 11797147
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  11797227 ggaccaaaataaattgaattttaattaagggacaaaagcgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatgcaatttagc 11797147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43727362 - 43727274
Alignment:
Q  79 aagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  || || |  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  43727362 aagttaaaggatcaaaataaatcaaaatttagttaagggatcaaaccgaaaccaattaaatagttaagggactaaaaaggtaatttagc 43727274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11394775 - 11394697
Alignment:
Q  85 aaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11394775 aaggatcaaaagaaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagagac-aaaaatgcaattt 11394697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36142173 - 36142122
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||    
T  36142173 ttttagttaagggatcaaaatgatatcatataaatagttaaggaacaaaaaa 36142122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 11394812 - 11394771
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaagga 58  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  11394812 gaagaaaacctaacgtttcttaattaaaactaacggaaagga 11394771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 2125369 - 2125341
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2125369 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaa 2125341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 180
Target Start/End: Original strand, 46593544 - 46593692
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||    ||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| |||   |||||     
T  46593544 ttttttaattaaatttaacggaaatgactaaatatagtaacagtgagaaacttaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatacc 46593643  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaatta 180  Q
    |  ||||||||||  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  46593644 aattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcctaaaataaatta 46593692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 131)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12123257 - 12123090
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||| | | ||||||||||||    
T  12123257 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaaccaaaataaat 12123158  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12123157 cgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 12123090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8846243 - 8846068
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||||| |||    
T  8846243 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaattaat 8846144  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataa 176  Q
    | ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8846143 cgaattttagttaagagaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaaaataa 8846068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34521433 - 34521266
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  34521433 aagaggagaagaagatgaaaaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaat 34521334  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34521333 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 34521266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 15862394 - 15862561
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  15862394 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaat 15862493  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
      ||||||| | ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862494 tgaattttaataaagggacaaaagagatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 15862561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44069284 - 44069113
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  44069284 agaagaaaatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaatt 44069185  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaat 178  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  44069184 ttagttaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaataataaat 44069113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 54107830 - 54107668
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  54107830 agaagaaaatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatt 54107731  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54107730 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 54107668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31514030 - 31513862
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  31514030 aagaggagaaaaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaactggaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaat 31513931  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    | ||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31513930 caaattttaattaaagaatcaaagcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcca 31513862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 8846301 - 8846464
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||  ||||    
T  8846301 agaagaaaatgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaatt 8846400  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8846401 ttagttaagtgaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 8846464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 28688209 - 28688376
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  28688209 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaacgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaat 28688308  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28688309 caaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaatttagcc 28688376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 4846821 - 4846982
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||| ||||    
T  4846821 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacagagagaagttatgagaccaaaataaatcgaatt 4846920  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4846921 ttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 4846982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7950436 - 7950275
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7950436 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcgaatt 7950337  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7950336 ttaattaagagaccaaaacaatactacataaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 7950275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 7742984 - 7743149
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    |||||||||||||    
T  7742984 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttatgagaccaaaataaat 7743083  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaaggga-caaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7743084 caaattttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaaatgtaattta 7743149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10756869 - 10756720
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10756869 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagcaacaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagg 10756770  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    || ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  10756769 gaccaaagcgatactacctaaatagctaagggaccaaaaatacaatttag 10756720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 7937782 - 7937950
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| |    
T  7937782 aagaggagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataatt 7937881  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    | ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  7937882 cgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgaaatttagcca 7937950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 14353267 - 14353430
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  14353267 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacggagagaagttaaaggaccaagataaat 14353365  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14353366 cgaattttatttaagggaccaatgcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 14353430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26332470 - 26332319
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  || |||| ||||||    
T  26332470 gaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaaatttaattaagg 26332371  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26332370 gaccaaagcgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcc 26332319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 26332537 - 26332708
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagt----ttaa-ggaccaaaa 95  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||| |||||||||    
T  26332537 aagatgagaagaagatgatgaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagttaagggaccaaaa 26332636  T
Q  96 taaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26332637 taaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaa-ggaccaaaaatgcaatttagcc 26332708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 44069350 - 44069509
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44069350 aagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatttt 44069449  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | |||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44069450 aattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 44069509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34630143 - 34629993
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  34630143 agaagaaaatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaatcgaatt 34630044  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34630043 ttaattaagggaccaaaacgatactacttaaatagttaagggaccaaaaat 34629993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40410873 - 40410715
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  40410873 agaagaaaatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 40410774  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40410773 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 40410715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27940423 - 27940271
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  27940423 gaagaaaacctaatgtttttgaattgaacctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtttagggaccaaaataaatcaaatttaaattaagg 27940324  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27940323 gaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagcca 27940271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41208568 - 41208404
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  41208568 aagaggagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgcaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 41208469  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41208468 caaattttaattaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 41208404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 12123304 - 12123462
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  12123304 agaagaaaatgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 12123403  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12123404 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaattta 12123462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41997980 - 41997819
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||  ||||    
T  41997980 agaagaaaatgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaattaaatt 41997881  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41997880 ttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 41997819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 171
Target Start/End: Original strand, 40926252 - 40926399
Alignment:
Q  23 aacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaa 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  40926252 aacctaacgtttttcaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagtgaagtt-aaggaccaaaataaatcaaattttaattaatggaccaa 40926350  T
Q  123 aatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40926351 agtgatactacctaaatagttaggggactaaaaatgcaatttagtcaaa 40926399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 168
Target Start/End: Original strand, 41208650 - 41208786
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  41208650 tttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatact 41208749  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41208750 acctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 41208786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 45171292 - 45171452
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||  ||| || | ||||||||||||||| ||||    
T  45171292 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaatt 45171391  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45171392 ttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagc 45171452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 54081502 - 54081670
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaa-tgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  54081502 aagaggagaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaaataacgaaaatgaccaaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaa 54081601  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  54081602 tcgaattttaattaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 54081670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45171235 - 45171068
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||    
T  45171235 aagaggagaagaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacttagagaagttaagggaccaaaataaat 45171136  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  45171135 cgaattttaattaaggggccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccagaaatacaatttagcc 45171068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45871848 - 45871697
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45871848 gaagaaaacctaacgatttttaattaaaactaacggaaatgacccaaatgtataacagagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 45871749  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45871748 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 45871697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 52606279 - 52606129
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52606279 gaagaaaacctaacgttttttatttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 52606180  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52606179 gaccaaaacgatactacataaatagttaagggac-caaaatgcaatttagcc 52606129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Original strand, 43899298 - 43899460
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  43899298 gagaagaagatgaagaaaacctaacgttgtttaattaaaactaacggtaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaat 43899397  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| ||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  43899398 tttaattaggggaccaaagcgatattacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcc 43899460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 53841250 - 53841407
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||| |||    
T  53841250 gagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatcgaat 53841349  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatt 163  Q
    |||| ||| | || ||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53841350 tttaattacgagaccaaagcaatactagctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 53841407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 9028410 - 9028578
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  9028410 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaaaactaaaatgtataacgaagagaagttaaaggaccaaaataaat 9028509  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
      ||||||| |||| ||| |||||  |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  9028510 tgaattttaattaaaggaccaaaacaatactagcttaatagttaatgaaccaaaaatgcaatttagcca 9028578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21169817 - 21169669
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21169817 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 21169718  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  21169717 gaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 21169669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40969422 - 40969251
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | || |||  |||||  |||||||||||    
T  40969422 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactgacggaaatgaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaa 40969324  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40969323 tcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccaaaa 40969251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 50819371 - 50819215
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  50819371 gaagaaaacttaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagc 50819272  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||  |||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  50819271 gacgaaagcgatgctacgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcctaaaa 50819215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 50856493 - 50856649
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  50856493 gaagaaaacttaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagc 50856592  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||  |||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  50856593 gacgaaagcgatgctacgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcctaaaa 50856649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 28691333 - 28691511
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  28691333 aagaggagaaaaagatgaagaaaacttaacatttt-gaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaatgatcaaaataaat 28691431  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaatta 180  Q
    | ||||||| || |||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||    
T  28691432 caaattttaatttagggacaaaagcgatactacctaaataattaagggacaaaaaatacaatttaacctaaaattaatta 28691511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 54108355 - 54108506
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  54108355 gaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 54108454  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  54108455 gaccaaagcgatactagctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 54108506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 43899233 - 43899107
Alignment:
Q  46 ctaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaa 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  43899233 ctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatgttacctaaatagttaa 43899134  T
Q  146 gggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
     |||| |||||||||||||||||||||    
T  43899133 aggaccaaaaatgcaatttagccaaaa 43899107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 166
Target Start/End: Original strand, 51170631 - 51170765
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  51170631 ttttttaattaaaactaattgaaaagactaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaatgatcaaaacgatact 51170730  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51170731 acctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttag 51170765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 34521492 - 34521640
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||  ||| || |  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34521492 gaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaaattaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagg 34521591  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34521592 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 34521640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40926162 - 40926014
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||     
T  40926162 gaagaaaacctaacgtttttcaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggatcaaaataaatcaaattttaattaaga 40926063  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  40926062 gatcaaagcgatactacataaatagttaaaagaccaaaaatgcaattta 40926014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 7274878 - 7275024
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7274878 gaagaaaacacaacgtttttgaattaaaactaaaagaaatgaccaaaatgtgtaaca-agagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 7274976  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7274977 gaccaaagtgatactacctaaatagttaacggaccaaaaatgcaattt 7275024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14353192 - 14353049
Alignment:
Q  22 aaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  14353192 aaacctaacatttttgaattaaaactgacggaaatggccaaaatgtgtcacagaggaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggacca 14353093  T
Q  122 aaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  14353092 aagcgatactacctaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 14353049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 31514098 - 31514248
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||| |    
T  31514098 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaagctaacggaaag-accaaactgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaaag 31514196  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31514197 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 31514248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 165
Target Start/End: Original strand, 35580210 - 35580332
Alignment:
Q  43 aaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagt 142  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  35580210 aaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagt 35580309  T
Q  143 taagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  35580310 taagggaccaaaaatgcaattta 35580332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15862343 - 15862182
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15862343 agaagaaaatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaatagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 15862244  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  15862243 ttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaataattaagggacctaaaatggaatttagcc 15862182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 50819442 - 50819603
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |  |||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  50819442 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaatt 50819541  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  50819542 ttaattaagggaccaaagcgatactaccttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50819603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 50856422 - 50856261
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |  |||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  50856422 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaatt 50856323  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  50856322 ttaattaagggaccaaagcgatactaccttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50856261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17273928 - 17273780
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||   || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17273928 gaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgtaatgaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 17273829  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17273828 aatcaaaacgatacggcctaaatagttaagggaccaaaaatgcatttta 17273780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28688141 - 28688017
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28688141 gaagaatacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaccggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 28688042  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatag 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  28688041 gatcaaagtgatactacctaaatag 28688017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 35753650 - 35753814
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |  ||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  35753650 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatggagagaagttaagggatcaaaataaat 35753749  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||| | |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  35753750 cgaatttaaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 35753814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19124348 - 19124189
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||| |  || ||||||| ||| ||||||    
T  19124348 aagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagatcaaaatagatcgaatttt 19124249  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||| |||| ||||   ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19124248 aattaggggaccaaagcaatattacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 19124189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22355077 - 22354946
Alignment:
Q  33 ttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatacta 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||| |||||||    
T  22355077 ttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacacagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaaacgatacta 22354978  T
Q  133 cctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22354977 cctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 22354946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 52268339 - 52268489
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |    
T  52268339 gaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaag-accaaaataaattgaattttaattaaag 52268437  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  52268438 gaccaaaacgatactaactaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcc 52268489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 19124407 - 19124537
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19124407 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacagagaaaagtcaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagg 19124506  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagg 147  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19124507 gaccaaaacgatactacctaaatagttaagg 19124537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27254145 - 27254007
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  27254145 agaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaataatcaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaatt 27254046  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaa 145  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  27254045 ttaattaagggaccaaagcgatactgcctaaatagttaa 27254007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2829575 - 2829410
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagttta-aggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | |  |||||||||||    
T  2829575 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactagcagaaaagaccaaaatgtttaacagagagaagttaagaaaaccaaaataaa 2829476  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||| ||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2829475 tcaaatgttaattaagagaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 2829410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7742926 - 7742769
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| | |  || ||||||||||| ||||||| |||||     
T  7742926 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgcaacagagagaagataagagaacaaaataaatcaaattttaattaagt 7742827  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
     | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  7742826 aaccaaaataatgttacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatataaccaaaaat 7742769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 10756926 - 10757091
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaac-ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| || |  ||||||||||||    
T  10756926 aagaggagaagaagatgaagaaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagatcaaaatgtgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaa 10757025  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10757026 ttgaattttaattaagggaccaaaacgatactgcctaaatagttaaaggacaaaaaatacaattta 10757091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17102544 - 17102384
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  17102544 gaagaatatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgcccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattt 17102445  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||||||  ||||  ||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||    
T  17102444 taattaagggaagaaaacaatattacctaaataattaagaaaccaaaaatgcaatttagcc 17102384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29248484 - 29248320
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  29248484 aagaggagaagaagatgaagaaaa--taacgtttttgaattaaaactaatgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaat 29248387  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
      ||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||   || ||||||||| ||||||    
T  29248386 taaattttaattaagggactaaaacgataccacctaaatagttaaataactaaaaatgcactttagc 29248320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 45871915 - 45872064
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaatt 106  Q
    |||||||| |||| ||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45871915 gaagaagatgaaggaaatccaacgctttttaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaa-tttaaggaaccaaaataaatcgaatt 45872013  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45872014 ttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 45872064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 54081444 - 54081287
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  54081444 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaatt 54081345  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  54081344 ttaattaa-ggaccaaagcgatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 54081287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9028352 - 9028191
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| |||   | |||| |  || ||||||||||| ||||    
T  9028352 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaataccaaaatgtgtagcaggaaggagttaagagaacaaaataaatcaaatt 9028253  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9028252 ttaacttagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 9028191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Original strand, 52609641 - 52609758
Alignment:
Q  61 aaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgca 160  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  52609641 aaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatgga 52609740  T
Q  161 atttagccaaaaataaat 178  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52609741 atttagccaaaaataaat 52609758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 53678594 - 53678426
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||| |   || |||||||||| ||||    
T  53678594 agaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagatactaaaataaatcaaatt 53678495  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaata 175  Q
    ||| |||| ||| ||||  |||||||  |||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  53678494 ttaattaaaggaccaaagcgatactatttaaataattaagggaccaaaaacgtaatttaaccaataata 53678426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 17102616 - 17102735
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  17102616 aaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctataagagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttatttaatggacc 17102715  T
Q  121 aaaatgatactacctaaata 140  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  17102716 aaagcgatactacctaaata 17102735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 46766784 - 46766625
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||  |||||  ||||||||||||| |||    
T  46766784 agaagaaaatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaat 46766685  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| || | ||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  46766684 tttaattaagggaccaaaacgatattagcaaaatagtaaaaggaccaaaaatgcaattta 46766625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5348739 - 5348582
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaatt 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||| ||||    
T  5348739 gaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaatt 5348641  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| || ||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5348640 ttaattgagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 5348582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 40639342 - 40639512
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |   ||||| ||||||| ||||    
T  40639342 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacacacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttaagataccaatataaatcaaatt 40639441  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||| |||||   ||||||||| ||||||||    
T  40639442 ttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaacataatttagcctaaaataaa 40639512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 166
Target Start/End: Original strand, 49529078 - 49529204
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||  |||||    
T  49529078 taaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaat 49529177  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49529178 agttaagggaccaaaaatgcaatttag 49529204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 588369 - 588542
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||  ||||||| |||    
T  588369 aagatgagaagtaggtgaagaaaccctaacattttttaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagataccaaaacaaa 588468  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    || ||||||| |||||| | | ||  |||| ||  ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  588469 tcaaattttaattaaggaaccgaagcgatattaattaaatagttaagatatcaaaaatgcaatttagccaaaaa 588542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 5348793 - 5348942
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  5348793 agaagaatatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacacacggaaaggaccaaaatatgtaacggagaaaagttaaaataccaaaataaatcaaatt 5348892  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||| ||| |||| ||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5348893 ttaattacgggaccaaagcgatactaattaaatagttaaaggacaaaaaa 5348942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37133438 - 37133289
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  || |||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  37133438 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacttacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagataccaaaataaatcaaatt 37133339  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  37133338 ttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagctaagggaccaaaaa 37133289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40639284 - 40639120
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||| |||  |||||  |||||||||||    
T  40639284 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatttgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaa 40639186  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  40639185 tcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaaagaactaaaaatgcaattta 40639120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 17273995 - 17274159
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||   | ||| || |  ||||||||||| |    
T  17273995 aagaggaggagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaaataacggaatgaaccaaaatgtgtaacgatgagaaattaagagaccaaaataatt 17274094  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  17274095 cgaattttaattaaaagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaattta 17274159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 53678658 - 53678820
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||| |||    
T  53678658 agaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaactaaaaccaacggaaagaaccaaaatgtgtaa-ggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaat 53678756  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  53678757 tttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaaggga-taaaaacgcaatttagccaa 53678820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 33773025 - 33773184
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||| |||  |||||  ||||||||||||| ||||||| | |||    
T  33773025 gaagaaactctaacgtttttaaattaaaaccaacggaaacgaccaaaatatggaacagagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaatcaag 33773124  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaata 175  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  33773125 ggatcaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaacacaatttagtcaaaaata 33773184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Original strand, 13866922 - 13867052
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||| |||||||||||| |||||   ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||  |||||    
T  13866922 taaaattaacggaaaggattaaaagtagtaactgagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaat 13867021  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13867022 agttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 13867052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 2078691 - 2078855
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||  |||||  |||||||||||    
T  2078691 aagaggagaagaagatgaagaaaatttaacgtgtttgaattaaaactaacagaaaagactaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaa 2078789  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  |||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2078790 tcaaattttaattaagggaccaaagcgatattaattaaatagttaagggactaaaaatacaattta 2078855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 47891732 - 47891896
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||   ||||||||||    
T  47891732 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaa-ggagagaaagttaagatgccaaaataaa 47891830  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||   ||||||  ||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  47891831 ttaaattttaattaagggaccaaagcaatactaattaaatagttaaaggaacaaaaatggaattta 47891896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 168
Target Start/End: Original strand, 20963547 - 20963675
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaa-ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||  |||||    
T  20963547 taaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggatcaaaccgatactaattaaat 20963646  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  20963647 agttaagggaccaaaaaggcaattaagcc 20963675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Original strand, 29248543 - 29248675
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||| |    
T  29248543 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaattgaccaaattgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaatagatcaaattttaattaaag 29248642  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaaggga 149  Q
    ||  ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  29248643 gactaaagtaatactatctaaatagttaaggga 29248675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 2829643 - 2829793
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||      
T  2829643 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaaa 2829742  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||   ||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  2829743 gaccaaatcaataatacataaatagttaa-ggatcaaaaatgcaatttagcc 2829793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44316754 - 44316627
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaata 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||  |||||||  ||||||    
T  44316754 taaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaataaatcaaattttagttaggggactaaaccgatactaattaaata 44316655  T
Q  141 gttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44316654 gttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44316627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 41998038 - 41998205
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacg-----gaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaa 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||   ||| ||||     
T  41998038 aagaggagaagaagacgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgtaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaggggatcaaa- 41998136  T
Q  96 taaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
             ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  41998137 ---------ttttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaaaa 41998205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Original strand, 46766838 - 46767000
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttg-aattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||  |||||  || |||||||||| |||    
T  46766838 gaagaagatgaaaaaacccttacatttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatacaaaaataaatcaaat 46766937  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  46766938 tttaattaagggaccaaagcgatactagcaaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 46767000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 40969489 - 40969629
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||  |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40969489 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactgacggaaaggaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaag 40969587  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
     ||  |||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  40969588 agactaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaat 40969629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 47891664 - 47891531
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |  |||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47891664 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagg 47891565  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggac 150  Q
    || ||||  |||||||  ||||| ||||||||||    
T  47891564 gaccaaagcgatactaattaaattgttaagggac 47891531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28691274 - 28691114
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||| | ||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||  |||||||||||   ||  ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  28691274 gaagaaaatgaaaaaaatctaacgtttttaaattaaaattaacataaaggatcaaaatgtgtaatgcagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattt 28691175  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||| ||||   |||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28691174 tagttaagggaacaaagcaataccacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcc 28691114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33812845 - 33812727
Alignment:
Q  47 taacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaag 146  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||||   ||||||||||||||||||||    
T  33812845 taacggaaatgacgaaaatgtgtaacggatagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcaatactacctaaatagttaag 33812746  T
Q  147 ggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  33812745 ggaccaaaaatgaaattta 33812727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 53841178 - 53841080
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  53841178 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgcaacagagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaag 53841080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 174
Target Start/End: Original strand, 38911497 - 38911610
Alignment:
Q  61 aaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgca 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  38911497 aaaatgtgtaacagagaaaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacaatattacctaaataattaaaggacaaaaaataca 38911596  T
Q  161 atttagccaaaaat 174  Q
    |||||||| |||||    
T  38911597 atttagcctaaaat 38911610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Original strand, 53310001 - 53310106
Alignment:
Q  61 aaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgca 160  Q
    |||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||    
T  53310001 aaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagtgatactacctaaataattaggagactaaaaatgca 53310100  T
Q  161 atttag 166  Q
    ||||||    
T  53310101 atttag 53310106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35753582 - 35753475
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||  || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35753582 gaagaaaac-taacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtcacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 35753484  T
Q  117 gatcaaaat 125  Q
    || ||||||    
T  35753483 gaccaaaat 35753475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 54247429 - 54247272
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||         || |||||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||    
T  54247429 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacta---------acaaaaatgtgtaatggaaagaagttaagggaccaaaataaat 54247339  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| | || ||| ||||  |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54247338 caaattttaatcaatggaccaaagcgatactatttaaatagttaaggga-taaaaatgcaatttagcc 54247272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Original strand, 22444410 - 22444527
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||| |||||| | | ||| ||||||||| |||    
T  22444410 gagaagaagatgaagaaaatctaatgttttcgaattaaaactaaacaaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaaggaaccgaaataaatcgaat 22444509  T
Q  106 tttagttaagggatcaaa 123  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  22444510 tttaattaagggaccaaa 22444527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35753484 - 35753408
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatt 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35753484 ggaccaaaataaatcgaattttaattaagaaaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 35753408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43527082 - 43527018
Alignment:
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43527082 agttaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccaaaaa 43527018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51883938 - 51883854
Alignment:
Q  89 accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  51883938 accaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggattaaaaatgcaatttagccaaaaa 51883854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43840077 - 43839957
Alignment:
Q  52 gaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggac 150  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||  |||||||  |||||||||||||||     
T  43840077 gaaaggaccaaaacgtgtaacggagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgatactaattaaatagttaagggaa 43839978  T
Q  151 aaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||||||  |||||||||| ||||    
T  43839977 aaaaaa--caatttagcctaaaa 43839957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 49222143 - 49222040
Alignment:
Q  61 aaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgca 160  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||  || | ||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  49222143 aaaatgtgtaacagagagaagttgaagaaccgaaataaatcgaattttaattaaaagaccgaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaataca 49222044  T
Q  161 attt 164  Q
    ||||    
T  49222043 attt 49222040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 156
Target Start/End: Original strand, 43844359 - 43844473
Alignment:
Q  43 aaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaa-ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatag 141  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||||  |||||||  |||||||    
T  43844359 aaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaatttaaaggacaaaaataaatcaatttttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatag 43844458  T
Q  142 ttaagggacaaaaaa 156  Q
    |||| |||| |||||    
T  43844459 ttaaaggaccaaaaa 43844473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 2078645 - 2078580
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaa 71  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2078645 gagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaatcaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaa 2078580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21918643 - 21918500
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggat 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||  ||  |||||  || |||| ||||| ||||||| || |||||     
T  21918643 aaaacttaacgtttttgaattaaaactaacg-aaaggatcaaaatgtgtaag-gagataaagttaagatacaaaaaaaaatcaaattttaatttagggac 21918546  T
Q  120 caaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21918545 caaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 21918500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Original strand, 33812852 - 33812933
Alignment:
Q  91 caaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33812852 caaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatactacctaaatatttaagagaccaaaaatgaaatttagccaaaa 33812933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 4846762 - 4846667
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaata 97  Q
    |||| |||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  4846762 aagaggagaagaagatgaagaaaattcaacgtttttgaattaaa-ctaatggaaaggaccaaaatgtgtaagagagagaagttaagggaccaaaata 4846667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 21169904 - 21169960
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagg 77  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21169904 aaaatctaacttttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagg 21169960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Original strand, 49222251 - 49222389
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||| ||| |  |||| | | ||||| ||||| || |||     
T  49222251 gagaagaagacgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatatgtgacatatagaaggtaagggacc-aaatagat-caaa 49222348  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaag 146  Q
    ||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49222349 tttaactaagggaccaaaacgatactatctaaatagttaag 49222389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 50393453 - 50393337
Alignment:
Q  33 ttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||    
T  50393453 tttttaattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatcaaaatttagttaagggatcaaaccgaaact 50393354  T
Q  132 acctaaatagttaaggg 148  Q
    |  |||||| |||||||    
T  50393353 aattaaataattaaggg 50393337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 51885599 - 51885738
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| | || |||   ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||     
T  51885599 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactgacggaaagggtcaaaatatgtaaga-agagaaagctaagataccaaaataaatcaaattttaattaaa 51885697  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  51885698 ggaccaaaacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaa 51885738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7937719 - 7937645
Alignment:
Q  92 aaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  7937719 aaaatgaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagcaaccaaaaatgcaatttag 7937645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7274718 - 7274653
Alignment:
Q  103 aattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7274718 aattttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 7274653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 43527145 - 43527068
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaa 94  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  43527145 gaagaaaatctaatgtttttgaatcaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccagagagaagttaagggaccaaa 43527068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 43527220 - 43527276
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaaca 73  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43527220 gaagaaaacataatgttcttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaca 43527276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 22444337 - 22444298
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaag 56  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22444337 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaag 22444298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Original strand, 51311825 - 51311904
Alignment:
Q  89 accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  51311825 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaacagaccaaaaatgtaatttagcc 51311904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 50259215 - 50259109
Alignment:
Q  61 aaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgc 159  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||  || || |  |||||||||||||||| |||||||     
T  50259215 aaaatgtgtaacaaagagaaagttaagggaccaaaataattcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaatgt 50259116  T
Q  160 aatttag 166  Q
    |||||||    
T  50259115 aatttag 50259109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 51311751 - 51311685
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaaca 73  Q
    ||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  51311751 agaagaaaatgaagaaactctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgcgtaaca 51311685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 52705536 - 52705478
Alignment:
Q  91 caaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaaggga 149  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||    
T  52705536 caaaataaatcaaattttagttaagggatcaaaccaatactaattaaatagttaaggga 52705478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 177
Target Start/End: Original strand, 8327742 - 8327834
Alignment:
Q  85 aaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||  ||||| |  |||||||||||||||  |||||  | ||||| |||||||||||    
T  8327742 aaggaccaaaataaatcaaaatatagttaagggaccaaaccgataccaaataaatagttaagggatcaaaaagactatttatccaaaaataaa 8327834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33772131 - 33772087
Alignment:
Q  28 aacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaac 72  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33772131 aacattttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaac 33772087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 51885531 - 51885488
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaa 44  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51885531 aagaagagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaa 51885488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52268271 - 52268176
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttt-tgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaa 95  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||| |||||| | |||||||||    
T  52268271 aagaggagaaaaagatgaagaaaaactaacgttttataaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaagtgagagaagttaagggaccaaaa 52268176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Original strand, 37174894 - 37174972
Alignment:
Q  47 taacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaa-ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaa 124  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  37174894 taacggaaatgacgaaaatgtgtaacggagagaaaattaatggaccaaaataattcaaaatttagttaagggaacaaaa 37174972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 12991478 - 12991393
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  12991478 ttttttaattaaatttaacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaaagttaagagaccaaaatcaatcaaaatttagttaagg 12991393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Original strand, 52606348 - 52606401
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaat 65  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  52606348 aagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaat 52606401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Original strand, 40503727 - 40503795
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  40503727 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagagcaattaagccaaaaa 40503795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 33626083 - 33626253
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  33626083 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaat 33626182  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33626183 cgaattttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagccaaa 33626253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 46621146 - 46621310
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  46621146 aagaggagaagaaaatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggaccaaaataaat 46621245  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46621246 cgaattttagttaaaggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 46621310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 54136258 - 54136091
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||    
T  54136258 aagaggagaagaaggtgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggatcaaaataaat 54136159  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54136158 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 54136091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9010667 - 9010505
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9010667 gagaagaagatgaagcaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaat 9010568  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9010567 tttaattaagggaccaaagtgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 9010505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29864343 - 29864176
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  29864343 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacctttttgaattaaaactaacagaaaggaccaacatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaat 29864244  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29864243 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcc 29864176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 44432843 - 44433006
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  44432843 aagaggagaagaagatgaagaaaatctgacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaat 44432942  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44432943 caaattttagttaagggaccaaagtgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 44433006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25218251 - 25218082
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  25218251 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaat 25218152  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  25218151 cgaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttaaccaa 25218082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33626025 - 33625868
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33626025 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaaaggaccaaaataaatcgaatt 33625926  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33625925 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33625868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 169 - 274
Target Start/End: Original strand, 49827278 - 49827383
Alignment:
Q  169 aaaaataaattaactgttaatctatcgaaacttgtcagatttttctgtgagaaattggtcattgccattctcagtttctcactgcaagtgcttgttacaa 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49827278 aaaaataaattaattgttaacctatcgaaacttgtcagatttttctgtgagaaattggtcattgccattctcagtttctcactgcaagtgcttgttacaa 49827377  T
Q  269 cataaa 274  Q
    ||||||    
T  49827378 cataaa 49827383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 52915113 - 52914952
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  52915113 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 52915014  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  52915013 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 52914952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 34958998 - 34958827
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  34958998 aagaggagaagaaaatgaaaaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaattgtgtaacagagataagtt-aaggaacaaaataaat 34958900  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34958899 caaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaaaaa 34958827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45911746 - 45911582
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  45911746 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 45911647  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  45911646 caaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaatgaaccaaaaatgcaattta 45911582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46200652 - 46200484
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaa-ctaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||  |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  46200652 aagaggagaagaagatgaaaaaaatataacgtttttaaataaaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaa 46200553  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46200552 tcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 46200484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44710570 - 44710403
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  44710570 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaat 44710471  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | |||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44710470 caaatttttgttaagagaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 46621078 - 46620931
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46621078 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 46620979  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46620978 gaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 46620931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Original strand, 33882174 - 33882331
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  33882174 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaagactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 33882273  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33882274 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33882331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8751449 - 8751289
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  8751449 gagaagaagatgaagaaaatctaacgttttttaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaat 8751350  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8751349 tttagttaagggaccaaaattatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttag 8751289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 21218066 - 21218233
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  21218066 aagaggagaagaagatgaaaaatatctaacgtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaat 21218165  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21218166 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 21218233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40067507 - 40067348
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40067507 aagaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatttt 40067408  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | |||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40067407 aattagaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcc 40067348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25058994 - 25058836
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  25058994 agaagaaaatgaagaaaagctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggagcaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcaaatt 25058895  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25058894 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagagacaaaaaatgcaattta 25058836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 32385037 - 32385194
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  32385037 agaagaaaatgaagaaaacctaacattttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaatt 32385136  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32385137 ttagttaagggat-aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 32385194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 52915178 - 52915331
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  52915178 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaag 52915277  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggac--aaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  52915278 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaaaatgcaatttagcc 52915331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21218008 - 21217847
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  21218008 agaagaaaatgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 21217909  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21217908 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 21217847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 25593316 - 25593477
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  25593316 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 25593415  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25593416 ttaattaagggaccaaaacaatactccctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcc 25593477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 43317104 - 43317265
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43317104 agaagaaaatgaaggaaacctaacgtttttcaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaatt 43317203  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  43317204 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaggagactaaaaatgcaatttagcc 43317265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48210089 - 48209948
Alignment:
Q  27 taacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatg 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  48210089 taacctttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagggagagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 48209990  T
Q  127 atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48209989 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 48209948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Original strand, 18862675 - 18862831
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagaggg-aagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  18862675 gaagaaatcctaacgttttttaattaaaactaacggaatggacaaaaaggtgtaacagagagcaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaa 18862774  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18862775 ggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaaa 18862831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Original strand, 27347823 - 27347983
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  27347823 gaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattt 27347922  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27347923 taattaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaaggaacataaaatgcaattaagcc 27347983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43317046 - 43316880
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  43317046 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttaagggaccaaaataaat 43316947  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
      ||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  43316946 aaaattttaattaagggaccaaagcgatactaccttaatagttaa-ggaccaaaaatacaatttagcc 43316880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 44710628 - 44710791
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  44710628 agaagaaaatgaagaaaatctaacttttttgaattaaaaccaacgaaaaggactaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 44710727  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    ||| |||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  44710728 ttaattaaggaaccaaaacgatactacataaatacttaagggatcaaaaatgcaattttgccaa 44710791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 53645618 - 53645463
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||     
T  53645618 aagaggagaagaagataaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaac 53645519  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53645518 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggacaaaaaa 53645463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 45683284 - 45683114
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  45683284 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaat 45683185  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  45683184 caaattttacttaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagagatcaaaaatgtaatttagccaaa 45683114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1157373 - 1157201
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagt--ttaa-ggaccaaaata 97  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  1157373 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagtacttaagggaccaaaata 1157274  T
Q  98 aatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    |||  ||||||| |||||| | ||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1157273 aattaaattttaattaaggaaccaaagcgatattacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccaa 1157201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2739031 - 2738878
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  2739031 gaagaaaacctaatatttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaag 2738932  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    || ||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  2738931 gaccaaagcgatactacttaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttaaccaa 2738878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 45911799 - 45911960
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||| ||||    
T  45911799 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagataagagaccaaaataaatcgaatt 45911898  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45911899 ttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcc 45911960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 167
Target Start/End: Original strand, 28570666 - 28570806
Alignment:
Q  27 taacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatg 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  28570666 taacttttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 28570765  T
Q  127 atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  28570766 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 28570806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 34959066 - 34959214
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34959066 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaaattaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaagg 34959165  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
     | ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34959166 aaccaaagcgataatacctaaatagttaagggaccaaaattgcaattta 34959214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 12381273 - 12381440
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  12381273 aagaggagaagaagatgaaaaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaat 12381372  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| ||||||||| |||  |||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  12381373 cgaattttaattaagggatgaaagcgatattgcctaaatagtttagggaccaaaaatacaattaagcc 12381440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Original strand, 25218309 - 25218448
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  25218309 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaatt 25218408  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaag 146  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25218409 ttaattaaaggaccaaaacgatactacctaaatagttaag 25218448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 40067573 - 40067736
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||   |||||| | | ||||||||||||  ||||    
T  40067573 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaatt 40067672  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  40067673 ttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagccaa 40067736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 45683352 - 45683503
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45683352 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttaagg 45683451  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
     | ||||   ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  45683452 aaccaaagcaatattacctaaatagttaaggaaccaaaaatacaatttagcc 45683503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 4793835 - 4793957
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4793835 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaggg 4793934  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaata 140  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  4793935 accaaaacgatactacctaaata 4793957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 4966093 - 4966251
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||||| |  ||| |||||||||| ||||    
T  4966093 agaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataatggagagaagttaagagacaaaaataaatcgaatt 4966192  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4966193 ttaattaaggaatcaaaacgataccacctaaatagttaaggggcaagaaatgcaattta 4966251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21051510 - 21051360
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21051510 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcaaattttagttaaga 21051411  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21051410 gatcaaagcgatgctacctaaataattaagggacaaaaaatgtaatttagc 21051360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 46535673 - 46535518
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagga-ccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| | || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  46535673 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgaacgagaagaaact--aaggaaccaaaataaatcgaattttagttaag 46535576  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  46535575 ggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaaaaa 46535518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8246934 - 8246767
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  8246934 aagaggagaagaagatgaaaaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggatcaaaataaat 8246836  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  8246835 caaattttaattaagggaccaaaatgatattatctaaataattaa-ggaccaaaaatacaatttagccaa 8246767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10014615 - 10014463
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  10014615 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaat-cgattttaattaagg 10014517  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10014516 gaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 10014463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10021756 - 10021604
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  10021756 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaat-cgattttaattaagg 10021658  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10021657 gaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 10021604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Original strand, 29864414 - 29864559
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  29864414 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 29864513  T
Q  121 aaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29864514 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 29864559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 1157441 - 1157589
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  1157441 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaag 1157540  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1157541 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 1157589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24504090 - 24503926
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaa-ggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  24504090 aagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaaggaccaagatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaag 24503991  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaattaa 181  Q
     | |||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24503990 aaccaaaacaatactacctaaataattaagggattaaaaatgcaatttagccaaaattaaattaa 24503926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29970343 - 29970196
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29970343 gaagaaagcctaacgtttttgaattaaaactaacggataagaccaaaatgtgtaacggagataagtt-aatgaccaaaataaatcaaattttaattaagg 29970245  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29970244 gatcaaagcgatactacctaaatagttatgggaccaaaaatgcaattta 29970196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32384812 - 32384648
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  32384812 aagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaggttaaagaaccaaaataaatcgaatttt 32384713  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | |||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  32384712 aattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccgaaaa 32384648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 43969746 - 43969913
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |  |||||| | |||||||| |||||    
T  43969746 aagaggagaagaagataaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtataacaaaaagaagttaagggaccaaagtaaat 43969845  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||  |||||||||    
T  43969846 cgaattttaatcaagggatcaaaacgatactacataaatagttaacgaaccaaaaataaaatttagcc 43969913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4966019 - 4965889
Alignment:
Q  20 gaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggat 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  4966019 gaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggag 4965920  T
Q  120 caaaatgatactacctaaatagttaagggac 150  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  4965919 caaagcgatactacctaaatagttaaaggac 4965889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 24504165 - 24504323
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  24504165 agaagaaaatgaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 24504264  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||| |||  |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24504265 ttaattaaaggactaaaacgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 24504323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27347758 - 27347596
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  27347758 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 27347659  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||| |||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  27347658 ttaattaaaggaccaaagcgatactatctaaatagtcaagggaccaaaaatataatttagcca 27347596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 44428732 - 44428614
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  44428732 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 44428633  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaat 125  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  44428632 ttagttaagggaccaaaat 44428614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 1205596 - 1205764
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  |||| | | |||| |||||||||    
T  1205596 aagaggagaagaagataaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaaggtaagggacaaaaataaat 1205695  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    | ||||||| ||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1205696 cgaattttaattaagggagaaaagcgatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 1205764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38866549 - 38866393
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |   |||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  38866549 gaagaaaacctgaggtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaatg 38866450  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  38866449 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaaaa 38866393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 10014700 - 10014849
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||| |  || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10014700 aagaaaagctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaaggg 10014798  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10014799 accaatacgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagcc 10014849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 10021841 - 10021990
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||| |  || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10021841 aagaaaagctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaaggg 10021939  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10021940 accaatacgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagcc 10021990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 9010740 - 9010891
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9010740 gaagaaaaccttatgtttttgaattaaaactaacggaagtaaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 9010839  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  9010840 gaccaaagagatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcc 9010891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1205538 - 1205381
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1205538 agaagaaaatgaagaaaacccaatgttttttaattaaaactaacggcaatgatcgaaatgtgtaacagaga-aagttaaaggaccaaaataaatcgaatt 1205440  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1205439 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaagtgcaattta 1205381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22830957 - 22830796
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaatt 106  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||  ||||||||||||| ||||    
T  22830957 gaagaagatgaagaaaccctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaatt 22830858  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||   |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22830857 ttaattaagggaccaaagctatactagcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattcagcc 22830796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 8246981 - 8247129
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||  ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8246981 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataacagaaatgacgaaaatgtttaagggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 8247080  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8247081 gaccaaagaaatattacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 8247129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 54191810 - 54191969
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  | | |||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  54191810 agaagaacatgaagaaaatctaacattttttaattgaaactaa-ggaaaggaccaaaatgtgtaatggggagaagttaatgaaccaaaataaatcgaatt 54191908  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  54191909 ttaattaagggaccaaaacgatgctatctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagc 54191969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 22831022 - 22831181
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||  |||||  ||||||||||||| |||    
T  22831022 agaagaaaatgaagaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaat 22831121  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22831122 tttaattaagggaccaaagcgatactagcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattta 22831181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 54191749 - 54191638
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  54191749 agaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 54191650  T
Q  107 ttagttaaggga 118  Q
    ||| ||||||||    
T  54191649 ttaattaaggga 54191638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9657812 - 9657667
Alignment:
Q  23 aacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatca 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||  |||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  9657812 aacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatatcaaaataaatcaaattttaattaagggacca 9657714  T
Q  122 aaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9657713 aaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 9657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 46200710 - 46200871
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||  |  |||||| |  |||||||||||||  ||||    
T  46200710 agaagaaaatgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaatt 46200809  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  46200810 ttaattaagggaccaaagcgttactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 46200871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 37515688 - 37515828
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37515688 gaagaaagtctaacgttttttaattaaaactaatggaattgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 37515787  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37515788 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaat 37515828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 46535752 - 46535907
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |    
T  46535752 aagatgaagaaaacctaatgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataccagaaagaagttaaaggaccaagataaatagaattttaat 46535851  T
Q  112 taagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  46535852 tagaggaccaaaacaatactacctaaatagttaagtgaccaaaaatacaatttagc 46535907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15985610 - 15985469
Alignment:
Q  25 cctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||  |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  15985610 cctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtattagagaaaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 15985511  T
Q  124 atgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15985510 acgatactagcaaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 15985469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Original strand, 21051577 - 21051689
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  21051577 aagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatctaattttaat 21051676  T
Q  112 taagggatcaaaa 124  Q
    ||||||| |||||    
T  21051677 taagggaccaaaa 21051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 54136316 - 54136473
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||    |||| | | ||||||||||||| ||||    
T  54136316 agaagaaaatgaaaaaaccctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgcaacaga----agttaaggaaccaaaataaatcaaatt 54136411  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  54136412 ttaattaaaggatcaaaacaattctacctaaatagttaaaggacaaaaattgcaatttagcc 54136473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44170121 - 44169979
Alignment:
Q  27 taacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||  |||||  || |||||||||| ||||||| | |||||| ||||      
T  44170121 taacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaatcaagggaccaaagc 44170022  T
Q  126 gatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44170021 gatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 44169979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 11102218 - 11102358
Alignment:
Q  26 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||  |||||  || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||     
T  11102218 ctaacatttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaac 11102317  T
Q  125 tgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
      ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11102318 caatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 11102358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 9657867 - 9658033
Alignment:
Q  2 agatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaat 100  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||    
T  9657867 agatgatatgaagatgaagataacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaa-ggagagaaagttaagataccaaaataaat 9657965  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
      ||||||| ||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  9657966 taaattttaattaggggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggatcaaaaatataatttagcc 9658033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 11242699 - 11242849
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||     |||||  || ||||| | |||| ||  ||| || | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  11242699 aagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaa-----ggaaataaccaaaatatataacggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaat 11242793  T
Q  112 taagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11242794 caagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagc 11242849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25977913 - 25977771
Alignment:
Q  24 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaa 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||| || || || ||||    
T  25977913 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattgagagaccaaa 25977814  T
Q  124 atgatactacctaaatagttaaggga-caaaaaatgcaattta 165  Q
      |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25977813 gcgatagtacctagatagttaagggaccaaaaaatacaattta 25977771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44428594 - 44428513
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  44428594 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcc 44428513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 38866626 - 38866783
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagga-ccaaaataaatccaattt 107  Q
    ||||||| |||||||| ||||  ||||| | |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| |||||    
T  38866626 aagaagatgaagaaaagctaatgttttttatttaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaaataaatcgaattt 38866725  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || |||  | | ||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  38866726 taattagagtaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaatcaaaaatacaattta 38866783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 177
Target Start/End: Original strand, 44170288 - 44170376
Alignment:
Q  89 accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  44170288 accaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcaatactaattaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagtctaaaataaa 44170376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 42779676 - 42779573
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  || || | |||  |||||||||| ||||||| |    
T  42779676 aagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaagataaattaacggattaaaataaatcgaattttaat 42779577  T
Q  112 taag 115  Q
    ||||    
T  42779576 taag 42779573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 29970411 - 29970493
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtt 83  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  29970411 aagaggagaacaagatgaagaaaacttaacgattttgaattaaaactaacggaaagctccaaaatgtgtaacagagagaagtt 29970493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Original strand, 21885074 - 21885174
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||  ||||||    
T  21885074 tttttgaattaaaagtaacggaaaggaccaaaatgtttaacggatagaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagtgaccaaagcgatact 21885173  T
Q  132 a 132  Q
    |    
T  21885174 a 21885174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 43969687 - 43969599
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgg-aaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaa 94  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| |||||||||  |||||| | ||||||||    
T  43969687 agaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaaccaatggaaaaggaccaaaatatgtaacagatagaagttaagggaccaaa 43969599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10017856 - 10017813
Alignment:
Q  127 atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10017856 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 10017813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Original strand, 15985687 - 15985854
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||  | | ||||||||||||||  |||  |||||  ||||| ||||||| |||    
T  15985687 agaagaaaatgaagaaaccctaacgttttttaattaaaactaacaaaaataa-tcaaatgtgtaacagatagaaagttaagataccaagataaatcaaat 15985785  T
Q  106 tttagttaaggg-atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    || | ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15985786 ttcaattaaggggaccaaaacgatactagcaaaatagttaagagactaaaaatgctatttagcccaaaa 15985854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37515634 - 37515532
Alignment:
Q  62 aaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaa 161  Q
    |||||||||||  || |||||| | |||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  37515634 aaatgtgtaacgaagagaagttaagggacaaaaataaattaaattttaattaaaggatcaacgggatactacctaaatagttaagaaac-aaaaatgcaa 37515536  T
Q  162 ttta 165  Q
    ||||    
T  37515535 ttta 37515532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16037922 - 16037788
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgt-gtaacagagggaagttta-aggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaa 138  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | |||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||  |||||| | |||||    
T  16037922 taaaactaacagaaaggactaaa-tgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaa 16037824  T
Q  139 tagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
    ||||||  |||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  16037823 tagttagaggaccaaaaatgtaattaagcctaaaat 16037788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 166
Target Start/End: Original strand, 29970511 - 29970556
Alignment:
Q  120 caaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29970511 caaaacgatactacctaaatagttaa-ggaccaaaaatgcaatttag 29970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 106)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32933758 - 32933594
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||    
T  32933758 aagaggagaagaagatgaagaaaacctgacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaat 32933659  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32933658 ggaattttagttaagggatcaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 32933594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 28203079 - 28203246
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28203079 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaat 28203178  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28203179 cgaattttaattaagggaccaaagcgatacgacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 28203246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Original strand, 31450890 - 31451057
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  31450890 gagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaat 31450989  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31450990 tttagttaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccaaaaa 31451057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Original strand, 41377575 - 41377746
Alignment:
Q  3 gatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatcc 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||     
T  41377575 gatgataagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatca 41377674  T
Q  103 aattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41377675 aattttaattacgggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaaaat 41377746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16655767 - 16655610
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16655767 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatt 16655668  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16655667 ttaattaaaggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattt 16655610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31450827 - 31450666
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31450827 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 31450728  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31450727 ttagttaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 31450666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 38275674 - 38275842
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaa--ggaccaaaataa 98  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||    
T  38275674 aagaggagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagagttacgggaccaaaataa 38275773  T
Q  99 atccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38275774 atcgaattttaattaagggatcaaagtgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 38275842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5961836 - 5961669
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  5961836 aagaggagaaaaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaat 5961737  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | | ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5961736 caatttttaattatgggatcaaagcgatactacctaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcc 5961669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27883630 - 27883463
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  27883630 gagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaat 27883531  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||| |||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27883530 tttacttaagggaccaaagcgatattacttaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 27883463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4104326 - 4104155
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |   ||||||||||||    
T  4104326 aagaggagaaggagatgaaggaaacccaacatttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacagagagaagttaagataccaaaataaat 4104227  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4104226 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaaa 4104155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Original strand, 27132734 - 27132897
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  27132734 gagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatatgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcgaat 27132833  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    |||| |||| ||| ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27132834 tttaattaaaggaccaaatcgacactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 27132897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Original strand, 32933816 - 32933989
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  32933816 agaagaaaatgaacaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 32933915  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaatta 180  Q
    ||| |||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32933916 ttatttaaaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaaaatatatta 32933989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 16655825 - 16655989
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  16655825 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactagtggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 16655924  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16655925 caaattttagttaaaggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 16655989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21470446 - 21470290
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21470446 gaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttgagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 21470347  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21470346 gaccaaagtgatactgcctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcctaaaa 21470290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 12304373 - 12304540
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||    
T  12304373 aagaggagaataagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaat 12304472  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304473 cgaattttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaattgttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 12304540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39454602 - 39454451
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39454602 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagg 39454503  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39454502 gaccaaagtgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 39454451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16261032 - 16260872
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  16261032 gagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtttaacggagagaagttaaaggaccaaaa-aaatcgaat 16260934  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16260933 tttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgctatttagc 16260872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28203021 - 28202856
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  28203021 agaagaagatgaagaaaacctaacgttattgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggatagaagttaaaggaccaatataaatcgaatt 28202922  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    ||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28202921 ttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaaa 28202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41377515 - 41377355
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  41377515 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 41377416  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  41377415 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaa-ggaccaaaaatacaatttagcc 41377355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Original strand, 20908738 - 20908902
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20908738 aagaagatgaagaaaacctaaagtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatttt 20908837  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | |||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20908838 aattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaaaaa 20908902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 34820498 - 34820662
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  34820498 aagaggagaggaagatgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 34820597  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | |||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34820598 caaattttagttaagggaccaaagcgagactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 34820662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4120930 - 4120764
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||| ||| || ||||||||||||||||    
T  4120930 aagaggagaagaagatgaagaaa-cctaagatttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatatgtaacggagagaaattaaaggaccaaaataaat 4120832  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4120831 cgaattttgattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 4120764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16736268 - 16736101
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  16736268 aagaggagaataagatgaagaaaacctaacgttttcaaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaat 16736169  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16736168 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 16736101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12303946 - 12303780
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||| ||||    
T  12303946 agaagaaaatgaagaaaacctaatgtttttgaaataaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagatgagttaagggaccaaaataaatcgaatt 12303847  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12303846 ttaattaagtgaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagctaaaaa 12303780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 27476592 - 27476753
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  27476592 agaagaaaatgaagaaaatctaacgttcttgatttaaaactaacggaaaggaccataatatgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 27476691  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27476692 ttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 27476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41659906 - 41659741
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  41659906 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggcccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaatt 41659807  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41659806 ttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggacaaaaaatataatttagccaaaa 41659741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45389292 - 45389131
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  45389292 agaagaaaatgaagaaaacctaatatttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagaaaagttaatggaccaaaataaatcaaatt 45389193  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45389192 ttaattaagggaccaaaacgacactacctaaatagttcagggaccaaaaatgcaatttagcc 45389131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 4104394 - 4104546
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4104394 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagg 4104493  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4104494 gatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcca 4104546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 43183802 - 43183966
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  43183802 aagaggagaagaaaataaagaaaacctaacgtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 43183901  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  43183902 caaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaattta 43183966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13354344 - 13354177
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  13354344 aagaggagaagaagatgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaat 13354245  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  13354244 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccgaaaattcaatttagcc 13354177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 13354412 - 13354563
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13354412 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaatatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 13354511  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13354512 gatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaattacaatttagcc 13354563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Original strand, 17856412 - 17856575
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacat-ttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||    
T  17856412 gagaagaagatgaagaaaacctaacgtatttttaattaaaactaacggaaataactaaaatgtataacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaa 17856511  T
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17856512 ttttaattaagggaccaaaccaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 17856575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 25642503 - 25642654
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25642503 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 25642602  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  25642603 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaacaaaaatacaatttagcc 25642654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34820430 - 34820283
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34820430 gaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaattaagg 34820331  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
     | ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34820330 aaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34820283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 15137029 - 15137190
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15137029 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtgcaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcaaatt 15137128  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  15137129 ttaattaagggaccaaatcggtactacctaaatagttatgtgaccaaaaatgtaatttagcc 15137190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17856360 - 17856199
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  17856360 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaggagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 17856261  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  17856260 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccgaaaatgaaatttagcc 17856199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28631435 - 28631262
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  28631435 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactatcggaaatgaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggactaaaataaatcgaatt 28631336  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaatta 180  Q
    ||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  28631335 ttaattaagggaccaaagcgatgctacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattttgccaagaataaatta 28631262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27132662 - 27132514
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27132662 gaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactatcggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 27132563  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27132562 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 27132514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 28631493 - 28631657
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  28631493 aagaggagaagaagatggcgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaat 28631592  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28631593 cgaattttaattaagagagcaaagcgatactacccaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 28631657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18565217 - 18565066
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18565217 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 18565118  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||  |||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18565117 gactaaagcgatactgcctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 18565066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25642435 - 25642273
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||    
T  25642435 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacagataaaagttaagagaccaaaataaat 25642336  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatt 163  Q
    | ||||||| |||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25642335 cgaattttaattaaggaaccaaagcgatactacttaaatagttaagggactaaaaatacaatt 25642273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43183743 - 43183585
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| |||||    
T  43183743 gaagaaaatgaagaaaatataacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttatgggaccaaaataaatctaattt 43183644  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43183643 taattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgtaatttag 43183585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 21470519 - 21470675
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  21470519 gagaagaagatggagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaat 21470618  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatt 163  Q
    |||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21470619 tttaattaaggga-ccaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatggaatt 21470675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 34127784 - 34127948
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  34127784 aagaggagaaaaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaa-tgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaat 34127882  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    | || ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  34127883 cgaactttagttaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggtccaaaaatacaatttag 34127948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39912795 - 39912630
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaa-ggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  39912795 aagaggagaagaagatgaaaaaaccctaatatttttgaattaaaactaacgtaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaacggaccaaaataaa 39912696  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39912695 ttgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39912630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 39912869 - 39913014
Alignment:
Q  25 cctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagag-ggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  39912869 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaggtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaa 39912968  T
Q  124 atgatactacct-aaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39912969 gtgatactacctaaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 39913014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 12304004 - 12304164
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  || |||||| |  |||||||||||||    
T  12304004 aagaggagaataagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaat 12304103  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaa 161  Q
    | ||||||| |||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12304104 cgaattttaattaaaggacgaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaa 12304164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 16736333 - 16736485
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  16736333 gaagaaaacctaacgtttctgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaagg 16736432  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||  | |  ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16736433 gactacagcgatacaacctaaacagttaagggaccaaaagtgcaatttagcca 16736485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36211512 - 36211348
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  36211512 gagaagatgatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacgaacagaagttaaaggaccaaaataaatcaaat 36211413  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    |||| |||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36211412 tttaattaagggaccaaaacaatacaacctaaacagttaagtgaccaaaaatgcaatttagccaa 36211348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 37412817 - 37412965
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  37412817 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaattaagggacc 37412916  T
Q  121 aaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37412917 aatgcgatactacttaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcca 37412965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20908662 - 20908511
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||| | | || |||||||||| |||||||||||| |    
T  20908662 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaactaaaataaatcgaattttagttaaag 20908563  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20908562 gaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcc 20908511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37412754 - 37412595
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  37412754 agaagaaaatgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtaacggaaagaagtcaagggaccaaaataaatcgaatt 37412655  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37412654 ttaattaagagaccaaagcgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 37412595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38275627 - 38275480
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38275627 aagaaaatctaacgtctttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagggaagttaaagaaccaaaataaatcaaattttaattaaggg 38275528  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||   ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  38275527 accaaagcaatactacataaatagttaagggatcaaaaatacaattta 38275480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 36442361 - 36442519
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  36442361 aagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgactaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaataaattaaatttt 36442460  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    | |||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  36442461 aattaaaggatcaaagcaatactatctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagc 36442519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 37744613 - 37744771
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  37744613 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctataagagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 37744712  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  37744713 ttaattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaattta 37744771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 4120998 - 4121151
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  4120998 gaagaaaacctgacgtttttgacttaaaactaacgaaaatgaacaaagtgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaag 4121097  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4121098 gaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccaa 4121151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 16261095 - 16261256
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||  ||| | | |||| |||||||||| ||||    
T  16261095 agaagaaaatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaaccaaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagctaagggacaaaaataaatcaaatt 16261194  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16261195 ttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 16261256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 36211576 - 36211684
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36211576 gaagaaaacctaacatttttgaattaaagctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagg 36211675  T
Q  117 gatcaaaat 125  Q
    || ||||||    
T  36211676 gaccaaaat 36211684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 44612708 - 44612870
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  44612708 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaatt 44612807  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatac--tacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||  ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  44612808 ttaattaagggaccaaagcgatactatacgtaaatagttaa-ggaccaaacatgcaatttagcc 44612870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 39150060 - 39150211
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39150060 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacaggaaggactaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagg 39150159  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
     |  |||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39150160 tacaaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 39150211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 10833253 - 10833423
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttg-aattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  10833253 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttttaattaaaactaatcgaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaatggaccaaaataaa 10833352  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    || ||||||| || |||||  |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10833353 tcgaattttaattgagggactaaagcgatactacctaaatagctaagggaccaaaaatgcaattcagccaa 10833423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 33819621 - 33819780
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33819621 agaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatagccaaaatatgtaacggagagaag-ttaaggaccaaaataaatcaaatt 33819719  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  33819720 ttaattaaaggaccaaagtgatactacctaaacagttatgagac-aaaaatacaatttagcc 33819780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 27246202 - 27246369
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||  |||||||||||    
T  27246202 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataaccgaaaggaccaaaatgtgtaa-ggagagaaaattaagataccaaaataaa 27246300  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27246301 tcaaattttaattaagggaccaaagcgatcctaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 27246369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33819563 - 33819400
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||  ||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  33819563 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatctgtaacgaagaaaagttaagggacc-aaataaat 33819465  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33819464 caaattttaattaagagaccaaaacggtactacctaaatagttaatggaccaaaagtgcaattta 33819400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39150011 - 39149867
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||| | ||| ||||||||||    
T  39150011 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggatcaaaataaat 39149912  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaa 145  Q
    | |||||||||||| |||  ||| ||||||||  |||||||||||    
T  39149911 cgaattttagttaaaggactaaagtgatactatttaaatagttaa 39149867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15829880 - 15829733
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||  |||||    
T  15829880 gaagaagatgaagaaaatttaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaagatgtgtaacggatagaagttaagggaccaaaataaattgaattt 15829781  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  15829780 taattaagggaccaaagtgatactacctaaatagctaagagaccaaaa 15829733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Original strand, 40694400 - 40694538
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||| ||||    
T  40694400 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatctaatt 40694499  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaa 145  Q
    ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  40694500 ttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaataattaa 40694538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40694352 - 40694195
Alignment:
Q  11 gaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttag 110  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| ||| |||||| | |||| |||||||||| ||| |||     
T  40694352 gaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaagtaatggaaatggccaaaatgtgcaactgagagaagttaagggactaaaataaatcgaatgttaa 40694253  T
Q  111 ttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  40694252 ttaagggactaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcc 40694195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 27883682 - 27883847
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  27883682 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagtcaccaaaataaatcaaatt 27883781  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaa----atagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||    ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27883782 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatatatagttaagggatcgaaaatgcaatttagcc 27883847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 27914112 - 27914279
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||   ||||||||||    
T  27914112 aagatgagaagaagatgaacaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaa-agagagaaagttaagatgccaaaataaa 27914210  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  27914211 tcaaattttaactaaggaaccaaaacgatactaattaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagcc 27914279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 32503772 - 32503920
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  32503772 gaagaaaatctaacgttttcgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaag 32503871  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  32503872 gaccaaatcaatactacctaaatagttaaaggactaagaatgcaattta 32503920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44915906 - 44915743
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||  ||||| |   ||||||||||||    
T  44915906 aagaggagaagaagatgaagaaaatttaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagataagttaagataccaaaataaat 44915808  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44915807 caaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 44915743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 35408756 - 35408895
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35408756 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagg 35408855  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
     | ||||  |||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  35408856 aaccaaagcgatactaattaaatagttaatggaccaaaaa 35408895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 39454661 - 39454826
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||    
T  39454661 aagaggagaagaagatgaagaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacg---------aaaatgtgtaacagagagaaattaagggacaaaaataaat 39454751  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaata 175  Q
    | ||||||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  39454752 cgaattttaattaaggaatcaaagcgatactacctgaatagtcaagggaccaaaaatgcaatttagtctaaaata 39454826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14877617 - 14877483
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||  ||||||    
T  14877617 tttttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaagagag--aagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaatcgatact 14877520  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  14877519 acctaaatagttttgggaccaaaaatgcaatttagcc 14877483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27476518 - 27476369
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaa-tgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27476518 gaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggataggaccaaaaatgtgtaaaggagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaag 27476419  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||    
T  27476418 ggaacaaagcgatactacctaaatagtctagggaccaaaaatacaattta 27476369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32503713 - 32503544
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  32503713 aagaggagaaaaagatgaagaaaatctaacgtttttgacttaaaattaaaggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaat 32503614  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    | |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  ||  |||||| ||||||| ||||    
T  32503613 cgaattttagttaaggaagcaaaacgatactacctaaataattaatcgatcaaaaatacaatttaaccaa 32503544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34127716 - 34127570
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||  |||||| |  ||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  34127716 gaagaaaac-taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggatagaagttaagcgacaaaaataaattgaattttaattaagg 34127618  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34127617 gaccaaaacgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34127570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36442295 - 36442133
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttg-aattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| | | ||||||||||||| |||    
T  36442295 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaatgaaccaaaataaatcaaat 36442196  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||  ||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  36442195 ttttattaatagaccaaaacgatactacctaaatagtgaagggaacaaaaatacaatttagcc 36442133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16350239 - 16350080
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaa 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||| ||    
T  16350239 gagaaaaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaacaaatggaaatgaccaaaatgtgtaa-ggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaa 16350141  T
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16350140 ttttaattaagggaccaatacgatactaattaaatagtcaagagaccaaaaatgcaattta 16350080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37744570 - 37744451
Alignment:
Q  47 taacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaag 146  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||  || |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37744570 taacggaattgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaag 37744471  T
Q  147 ggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  37744470 ggaccaaaaatgtaatttag 37744451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20297491 - 20297405
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20297491 ggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctgaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagccaaaaa 20297405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Original strand, 16350306 - 16350438
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||||||||||| ||||||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16350306 gaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacatgaatgactaaaatgtgcaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttagttaagg 16350405  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaaggga 149  Q
    || |||||  ||| ||  |||||||||||||||    
T  16350406 gaccaaaacaataataattaaatagttaaggga 16350438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 5921621 - 5921772
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | | || |||| ||||| ||||||| |||||     
T  5921621 gaagaaaatccaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggaacaaaaaaaaatcgaattttaattaaga 5921720  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  |||||||  |||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  5921721 gaccaaagcgatactatataaatagttaagggatcaaaaacacaatttagcc 5921772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 11943711 - 11943862
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    | |||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||    
T  11943711 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacttttatgaattaaaactgacggaa----ccaaaatgtgtaacggagagaagttaatgaaccaaaataaat 11943806  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    | ||||||| |||| | | ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11943807 cgaattttaattaaagtaccaaagcgatactacctaaatagttcagggaaaaaaaa 11943862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 44915964 - 44916086
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |   ||||||||||||  ||||    
T  44915964 agaagaaaatgaagaaaacctcacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatgaaatt 44916063  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgata 129  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  44916064 ttaattaagggaccaaaacgata 44916086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5720309 - 5720145
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    |||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||| |||  |||||  |||||||||||    
T  5720309 aagaagaggagaagaagaagaagacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtg-aaaggagagaaagttaagataccaaaataaa 5720211  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||||| |||| | | |||||  ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5720210 tcaaattttaattaaagaaccaaaacaatattaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 5720145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 41659971 - 41660119
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaa-cagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||| |   ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  41659971 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaagcagaga-aagttaagataccaaaataaattaaattttaattaag 41660069  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
     || |||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41660070 agaccaaagtgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 41660119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 171
Target Start/End: Original strand, 18565276 - 18565392
Alignment:
Q  55 aggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaa 154  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  ||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18565276 aggaccaaaatatgtaacagggaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggacccaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaa 18565375  T
Q  155 aatgcaatttagccaaa 171  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18565376 aatgcaatttatccaaa 18565392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Original strand, 34484303 - 34484414
Alignment:
Q  39 attaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaa 138  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||  |||||||||||||    
T  34484303 attaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagataccaaagcgatactacctaaa 34484402  T
Q  139 tagttaagggac 150  Q
    || |||||||||    
T  34484403 taattaagggac 34484414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Original strand, 23992164 - 23992294
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||  |||||    
T  23992164 taaaattaacggaaatgtctaaaattagtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaat 23992263  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  23992264 agttcagggaccaaaaagacaatttagccaa 23992294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 169
Target Start/End: Original strand, 36211704 - 36211786
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  36211704 ggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacgaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttagcca 36211786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34484305 - 34484238
Alignment:
Q  98 aatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34484305 aatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 34484238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27246144 - 27246068
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtt 83  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27246144 agaagaaaatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaatagaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagtt 27246068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44610928 - 44610865
Alignment:
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44610928 ccaattttaattaaggga-caaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 44610865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3603648 - 3603597
Alignment:
Q  25 cctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagag 76  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3603648 cctaacgtttttgaattaaatttaacggaaaggactaaaatatgtaacagag 3603597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 76
Target Start/End: Original strand, 29078010 - 29078061
Alignment:
Q  25 cctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagag 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  29078010 cctaacatttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtgtaacagag 29078061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 38073790 - 38073877
Alignment:
Q  91 caaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaat 178  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | || |||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  38073790 caaaataaatcgaattttaattaaagaattaaaacgatactatctaaatagttaaatgatcaaaaatataatttagccaaaaataaat 38073877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 44612650 - 44612550
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||    
T  44612650 aagaggagaagaaaatgaagaaaatctaacatttttgaattaaaa--------aaggaccaaaatgtgtaacggatagaagttaagggaccaaaataaat 44612559  T
Q  101 ccaatttta 109  Q
    | |||||||    
T  44612558 caaatttta 44612550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1580128 - 1580019
Alignment:
Q  46 ctaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagtta 144  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||  |||||  ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  1580128 ctaacgtaaaagaccaaaatgtgcaacagagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa-ggaccaaaacgatactaattaaatagtta 1580030  T
Q  145 agggacaaaaa 155  Q
     ||||||||||    
T  1580029 tgggacaaaaa 1580019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 156
Target Start/End: Original strand, 1580148 - 1580215
Alignment:
Q  89 accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  1580148 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactatttaaatagttaaggaaccaaaaa 1580215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 173
Target Start/End: Original strand, 15744815 - 15744902
Alignment:
Q  86 aggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||  |||||| | |||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  15744815 aggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccaaaaa 15744902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27914041 - 27913906
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| ||| |||||| |   | ||||||||||  ||||||| | ||||||      
T  27914041 aaaacctaatgtttttgaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagatagcaaaataaattaaattttaataaagggact 27913942  T
Q  121 aaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    |||  |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  27913941 aaagcgatactaattaaatagttaaggaaccaaaaa 27913906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 125
Target Start/End: Original strand, 36211675 - 36211713
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaat 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36211675 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaaat 36211713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38806906 - 38806856
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  38806906 ttttagttaagggaccaaaatgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 38806856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 157
Target Start/End: Original strand, 31557549 - 31557601
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  31557549 ttttagttaagggaccaaaacgataccaattaaatagttaagggaccaaaaat 31557601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 35223986 - 35224153
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  35223986 aagaggagaagaagatgaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaat 35224085  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35224086 cgaattttagttaagggaccaaaacgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 35224153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 119283 - 119119
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  119283 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaag-ttaaggaccaaaataaat 119185  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    | ||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119184 cgaattttaatcaagggaccaaagtaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 119119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 24456877 - 24457049
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  24456877 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 24456976  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaatt 179  Q
    ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24456977 ttaattaagggaccaaggcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaaaataaatt 24457049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39240197 - 39240031
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||| | | | ||||||||||    
T  39240197 aagaggagaataagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaatcaaaataaat 39240098  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39240097 cgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 39240031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 18621966 - 18622141
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  18621966 aagatgagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaagagcaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaat 18622065  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataa 176  Q
      ||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  18622066 tgaattttaattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagagaccaaaagtgcaatttagcccaaaataa 18622141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31230780 - 31230613
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  31230780 aagaggagaagaagatgaagaaaatataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 31230681  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  31230680 caaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtagtttagcc 31230613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 37393702 - 37393861
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  37393702 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacttacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 37393801  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37393802 ttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 37393861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 3869168 - 3869335
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| | |||| |||| ||||    
T  3869168 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaaaaaat 3869267  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3869268 cgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 3869335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 31230838 - 31231009
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||  ||||    
T  31230838 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaattgaatt 31230937  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaat 178  Q
    ||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31230938 ttaattaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagccaaagataaat 31231009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40040323 - 40040161
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  40040323 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaacaaaataaatcgaatt 40040224  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40040223 ttaattaaggtaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 40040161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Original strand, 1826030 - 1826187
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  1826030 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 1826129  T
Q  121 aaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaat 178  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  1826130 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttatccaaaaacaaat 1826187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Original strand, 1860475 - 1860632
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  1860475 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 1860574  T
Q  121 aaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaat 178  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  1860575 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttatccaaaaacaaat 1860632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 18018008 - 18018169
Alignment:
Q  4 atgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatcca 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||  |    
T  18018008 atgagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattga 18018107  T
Q  104 attttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18018108 attttaattaagggagcaaagcaatacttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 18018169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6843657 - 6843498
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtt-taagg-accaaaataaatccaat 105  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  6843657 gaagaaaatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttataagggaccaaaataaatcaaat 6843558  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6843557 tttaattaagggatcatagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 6843498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18017940 - 18017790
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  18017940 aagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagtg 18017841  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18017840 accaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaatatgcaatttagcc 18017790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 23244734 - 23244895
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||| | ||| ||||||||||    
T  23244734 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaat 23244833  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaat 162  Q
    | |||||||  ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23244834 cgaattttaactaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaat 23244895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30650351 - 30650190
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  30650351 agaagaaaatgaagaaaacctaaggttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaatt 30650252  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  30650251 ttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttagaggactaaaaatgcaatttagcc 30650190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35223935 - 35223774
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  35223935 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 35223836  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35223835 ttagtcaagggaccaaagcgatactacctaaatagtaaagggaccaaaaatgcaatttagcc 35223774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 16645769 - 16645931
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagg---gaagtttaaggaccaaaataaatcc 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || |   |||||| |||||||||||||||||     
T  16645769 gagaagaagatgaagaaaacctaatctttttgaattaaaactaatggaaaggaacaaaatgtgtaactgatgagagaagttaaaggaccaaaataaatcg 16645868  T
Q  103 aattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16645869 aattttaattaagggaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 16645931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39912084 - 39911908
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||     
T  39912084 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatataacggagagaagttaaaggaccaaaataaac 39911985  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    | ||||||| ||||| || ||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39911984 cgaattttaattaagcgaccaaagagataatatctaaataattaagggacaaaaaatgcaaattagccaataataaa 39911908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44255015 - 44254867
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44255015 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaacactaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaggg 44254916  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    | ||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  44254915 accaaagcgatactacttaaatagttaaggatccaaaaatgcaatttag 44254867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Original strand, 758568 - 758730
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||||| |||    
T  758568 gagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgactaaaatgtgtagcagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaat 758667  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| || | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  758668 tttaatttaaggaccaaagtgatactacttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcc 758730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Original strand, 39240244 - 39240410
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| |  |||||||||||||  ||||    
T  39240244 agaagaaaatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaattaaatt 39240343  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39240344 ttaattaagagaccaaaacgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttaaccaaaaa 39240410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 11198430 - 11198591
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  11198430 agaagaaaatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaatt 11198529  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11198530 ttaattaagggaccaaagcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 11198591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Original strand, 39912169 - 39912302
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  39912169 tttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatact 39912268  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39912269 acctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 39912302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 8654155 - 8654319
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  8654155 aagaggagaaaaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaagtaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggagcaaaataaat 8654254  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8654255 caaattttaattaaaggaccaaaacaatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8654319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 14920636 - 14920792
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  14920636 agaagaaaatgaagaaaacctaacgttttcgaattaaaagtaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 14920735  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatt 163  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14920736 ttaattaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 14920792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37393628 - 37393480
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  37393628 gaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaattgagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagg 37393529  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37393528 gaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 37393480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5416971 - 5416812
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||| ||||||    
T  5416971 aagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaagaccaaaatcaatcgaatttt 5416872  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  5416871 aattagaggaccaaaacgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcc 5416812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 9495247 - 9495406
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||     
T  9495247 gagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgagtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaac 9495346  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| |||| ||| ||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9495347 tttaattaacggaccaaagcaatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 9495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26736286 - 26736123
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  ||||    
T  26736286 agaagaaaatgaagaaagcctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaggtaagggaccaaaataaattaaatt 26736187  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    |||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26736186 ttaaaaaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttaaccaa 26736123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 30873013 - 30873164
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30873013 gaagaaaacctaacgtttttgaactaaaactaacgaaaatgactaaaatgtgtaacggatagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagg 30873112  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
     |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30873113 aatcaaactaatactaccaaaataattaagggacaaaaaatgcaatttagcc 30873164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Original strand, 7041853 - 7042010
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  7041853 gagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaat 7041952  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
         |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7041953 -----ttaagggaccaaagcgatactatataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 7042010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8654097 - 8653936
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| | | ||||| | ||||||||||||||  ||||    
T  8654097 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacaaatgaaagttaagggaccaaaataaattgaatt 8653998  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  8653997 ttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcc 8653936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 18914486 - 18914638
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  18914486 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaag 18914585  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||  | |  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18914586 gacaagagcgatgctacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcca 18914638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40094636 - 40094477
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||  ||||    
T  40094636 agaagaaaatgaagaaaatctaacgttcttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaattgaatt 40094537  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaa-aaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40094536 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaaatgcaattta 40094477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Original strand, 119342 - 119504
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | | |||||| | ||||||||||||| | |||||    
T  119342 gaagaagatgaagaaaacctattatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccggtgagaagttaagggaccaaaataaagcaaattt 119441  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    || ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  119442 taattaagggactaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaacaatgcaatttagccaa 119504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1825971 - 1825810
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||| |||    
T  1825971 gagaagaagatgaaggaaatctaatatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaat-aatcaaat 1825873  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1825872 tttaattaagagatcaaaacgatgctccttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 1825810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1860416 - 1860255
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||| |||    
T  1860416 gagaagaagatgaaggaaatctaatatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaat-aatcaaat 1860318  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1860317 tttaattaagagatcaaaacgatgctccttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 1860255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 21515419 - 21515589
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  21515419 aagaggagaagaagatgaagacaacgtaacgtttttgaattaaagctaacggaaatgaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaat 21515518  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  21515519 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacgtaaatagttaaaagactaaaaatgtaatttagccaaa 21515589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 30568495 - 30568660
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||  || || | ||||||||||||||    
T  30568495 aagatgagaagaaggtgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagaaaaattaagggaccaaaataaat 30568594  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    | |||||||  ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  30568595 caaattttaaataagggaccaaatcgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 30568660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36344122 - 36343962
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  36344122 agaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatgtgtaacatagaaaagttaaaggaccaaaattaatcgaatt 36344023  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||    
T  36344022 ttaattaagggaccaaaataatactacctaaataattaa-gaaccaaaaatacaatttagcc 36343962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 5417038 - 5417197
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagg-gaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | | ||||||||||||| |||    
T  5417038 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaaataaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaac-gagaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaat 5417136  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5417137 tttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcagtttag 5417197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23244666 - 23244518
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  23244666 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaacgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaag 23244567  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
     | ||||  |||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||    
T  23244566 aaccaaagcgatactacataaatggttagtggaccaaaaatgcaattta 23244518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 29027191 - 29027363
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    | |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  29027191 aagaggagaagaagatgacgaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaa----ccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 29027286  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| || |||||    
T  29027287 cgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatataatttagcctaacataaa 29027363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40032578 - 40032423
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt-agttaag 115  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  40032578 gaagaaaacctaatgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagacagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttaag 40032479  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
     || ||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40032478 agaccaaagcgatactacctaaataattaagtgaccaaaaatgcaatttagccaaa 40032423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30872954 - 30872783
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttg----aattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaat 96  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||     ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| || |||||| | ||||||||||    
T  30872954 aagaggagaagaacatgaagaaaacctaacgttttttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgttacaaagagaagttaagggaccaaaat 30872855  T
Q  97 aaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30872854 aaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 30872783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14920572 - 14920411
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  14920572 agaagaggatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 14920473  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| ||||  || |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  14920472 ttaattaaatgaccaaaacaatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaattaagcc 14920411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29027132 - 29026971
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| |   |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  29027132 gaagaaaatgaagaaaacctaacgttttagaattaaaactaacagaaatgaccaaattgtgtaacgggtagaagttaagggaccaaaataaatcgaattt 29027033  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaa----tagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29027032 taattaagggaccaaaatgatactacctaaatagctagttaagggaccaaaaatgcaattta 29026971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 758505 - 758347
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||  ||||    
T  758505 agaagaaaatgaagaacacctaacgtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaatttaatt 758406  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  758405 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggggccaaaaatgcaattta 758347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 170
Target Start/End: Original strand, 40032693 - 40032817
Alignment:
Q  47 taacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaag 146  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40032693 taacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaaatgatactacataaatagctaag 40032792  T
Q  147 ggac-aaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  40032793 ggacaaaaaaatacaatttagccaa 40032817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 40094694 - 40094870
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||| | |||| |||||||||    
T  40094694 aagaggagaagaagatgaggaaaatttaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaataaat 40094793  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    | ||||||| |||| ||| |||||   |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  40094794 cgaattttaattaaaggaccaaaacagtactaattaaatagttaagggaccaaaaatgtaattttgcctaaaataaa 40094870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7041790 - 7041653
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||||  || ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  7041790 agaagaaaatgaagaaaacctaatgtttttcaattaaaactttcgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 7041691  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagtta 144  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  7041690 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagtta 7041653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11639212 - 11639052
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |  ||| |||||||||| ||||    
T  11639212 agaagaaaatgaacaaaacctaacgtttt-gaattaaaacttacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagacgaaaataaatcgaatt 11639114  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11639113 ttaattaagggaccaaagcgacgctacctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcc 11639052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12873208 - 12873076
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |   ||||||||||||  ||||||| |||| |    
T  12873208 gaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagaaaccaaaataaattaaattttaattaaag 12873109  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaaggga 149  Q
    || |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  12873108 gaccaaagtgatactaattaaatagttaaggga 12873076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18914427 - 18914320
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  18914427 aagaggagaagaagatgaaaaaaacctaacatttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 18914328  T
Q  101 ccaatttt 108  Q
    | ||||||    
T  18914327 cgaatttt 18914320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 12873267 - 12873439
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||  ||| || ||| |   ||||||||||||    
T  12873267 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaaaaaaatgaccaaaatgtgtaag-gagaga-gttaagataccaaaataaat 12873364  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaata 175  Q
    |  |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  12873365 cagattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaaaata 12873439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26217230 - 26217082
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | |||| | ||||||||||||||  ||||    
T  26217230 agaagaaaatgaagaaaatccaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaa-tgtgtaacaaagaggagttaagggaccaaaataaattaaatt 26217132  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26217131 ttaattaaagggccaaaatgatactacttaaatagttaagggaccaaaaa 26217082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 44255091 - 44255248
Alignment:
Q  11 gaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttag 110  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||  |||||||     
T  44255091 gaagatgaagaaaatgtaacatttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagagaccaaaataaattgaattttaa 44255190  T
Q  111 ttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||| |||||  || | |||||||||||||| |||  |||||| || |||||||    
T  44255191 ttaagggaccaaaacaatcccacctaaatagttaaaggatcaaaaatacattttagcc 44255248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3869094 - 3868946
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgt---gtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||   ||||| ||| |||||| |  ||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  3869094 aaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtactgtaacggagagaagttaagagactaaaataaatcgaattttaattaaggg 3868995  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  3868994 accaaagtgatactacataaatagttaagggatcaaaagtgcaatttag 3868946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24456816 - 24456734
Alignment:
Q  86 aggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24456816 aggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 24456734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 410597 - 410738
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| | |   ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  410597 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacaaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaggtaagataccaaaataaatcaaattttaattaagg 410696  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaaggga-caaaaaat 157  Q
     | ||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  410697 aaccaaaacgatactaataaaatagttaagggatcaaaaaat 410738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Original strand, 6844695 - 6844836
Alignment:
Q  37 gaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactaccta 136  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||  ||| |||||||    
T  6844695 gaattaaaactaatgggaaagaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaagataaatcgatttttaattaagagatcaaagcgatgctaccta 6844794  T
Q  137 aatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaat 178  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6844795 aatagttaagagaccaaaaatgcaatttacccaaaaaaaaat 6844836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 26736344 - 26736509
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  || |||||| |||||||| |||||||    
T  26736344 aagaggagaaaaagatgaagaaactcaaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtatcgaagagaagttaaaggaccacaataaat 26736443  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  26736444 cgaattttaattaaaggaccaaatcaatactatctaaatagttaagggatcgaaaatgtaatttag 26736509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44678396 - 44678317
Alignment:
Q  89 accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44678396 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44678317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5526020 - 5525881
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||| |||   ||||  | |||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  5526020 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaaggaaatggccaaaatgtataagagat--aagtaaagggactaaaataaatcaaattttaattaaag 5525923  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatg 158  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5525922 gaccaaatcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatg 5525881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 32733862 - 32733765
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32733862 gaagaaaacataacatttttgaattaaaattaacggaaaggagcaaaatgtgtaacgtatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 32733765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 44678426 - 44678511
Alignment:
Q  24 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttta 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44678426 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaacgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatttta 44678511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28206916 - 28206765
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||  |||  |||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  28206916 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggatcaaaatgtgtaac-gatagaaaattaagataccaaaatacatcaaattttaattaagg 28206818  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    || ||||  ||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  28206817 gaccaaagcgatactagcaaaatagttatgggaccaaaaattcaatttagcca 28206765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33542551 - 33542384
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagaggga-agtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||  ||| || |||| ||  |||||||||||    
T  33542551 aagaggagaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaag-gagagagagttaaaataccaaaataaa 33542453  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  33542452 tcagattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagcc 33542384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 40040381 - 40040477
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaata 97  Q
    |||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  40040381 aagaggagaagaaaatgaagaacacctaacatttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaata 40040477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 28206996 - 28207145
Alignment:
Q  25 cctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||  |||  |||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  28206996 cctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatttgtaac-gatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggggtcaaa 28207094  T
Q  124 atgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
      ||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  28207095 gcgatactagcaaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagcctaaaat 28207145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Original strand, 26217296 - 26217412
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||| ||||||    
T  26217296 aagaagatgaagaaaaccgaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgacgaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggtacaaaataaatcaaatttt 26217395  T
Q  109 agttaagggatcaaaat 125  Q
    | ||||| || ||||||    
T  26217396 aattaagagaccaaaat 26217412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 410536 - 410422
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| |||  |||||  |||||||||||    
T  410536 aagaagagcagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaa-ggagagaaagttaagataccaaaataaa 410438  T
Q  100 tccaattttagttaag 115  Q
    || ||||||| |||||    
T  410437 tcaaattttaattaag 410422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Original strand, 33542609 - 33542716
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |   | ||||||||||| ||||    
T  33542609 agaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagaaatcaaaataaatcaaatt 33542708  T
Q  107 ttagttaa 114  Q
    ||| ||||    
T  33542709 ttaattaa 33542716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 45436415 - 45436548
Alignment:
Q  38 aattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-acc--aaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacc 134  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||  || || |      
T  45436415 aattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaagggacccaaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaat 45436514  T
Q  135 taaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45436515 taaatagttaagggacaaaaaatgtaatttagcc 45436548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15740749 - 15740609
Alignment:
Q  33 ttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaa-ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||   ||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  15740749 tttttaattaaatttaacggaaaggactaaaagtggtaacggaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatact 15740650  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  15740649 aattaaatagttaatggaccaaaaaggcaattaagccaaaa 15740609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21512527 - 21512413
Alignment:
Q  53 aaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaa 152  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| |||||| | || |||||||||||| ||||||| |||| |||  |||  |||||| |||||||||||||||||| |    
T  21512527 aaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaattaatggactaaagcgatact-cctaaatagttaagggacga 21512429  T
Q  153 aaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||| ||||||||||    
T  21512428 aaaatacaatttagcc 21512413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 30568437 - 30568335
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  30568437 agaagaaaatgaagaaaatatgacgtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 30568338  T
Q  107 tta 109  Q
    |||    
T  30568337 tta 30568335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 36344186 - 36344344
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||  |||  ||||||||| |||| ||| ||||  ||| ||||||||| || ||   ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  36344186 agaagaaaatgaagaaaatttaatgtttttgaatcaaaattaaaggaattgaccaaaatgtgtgacggaaataagttaaaggatcaaaataaatcaaatt 36344285  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| ||||  || ||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36344286 ttaattaaaagaccaaagcaatactacctaaatagttaaaggataaaaaatgcaattta 36344344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19302345 - 19302206
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaatt 106  Q
    |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||   |||||  || |||||||||| |  |    
T  19302345 gaagaagatgaagaaacccaaacgtttttgaattaaaactaacgcaaaagaccacaatgtgtaacagagagaccattaagatactaaaataaatcaatat 19302246  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagg 147  Q
    ||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19302245 ttaattaaggg-ccaaaacgatactaccaaaatagttaagg 19302206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 9495183 - 9495117
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtt 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||    
T  9495183 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttataagagagagaagtt 9495117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 11639277 - 11639351
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtt 83  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  11639277 aagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagtt 11639351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 168
Target Start/End: Original strand, 11639379 - 11639421
Alignment:
Q  126 gatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11639379 gatactacctaaatagttaagggacgaaaaatgcaatttagcc 11639421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Original strand, 26217404 - 26217485
Alignment:
Q  88 gaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaa--atgata-ctacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26217404 gaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaacgatactacctacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 26217485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35486022 - 35485921
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| | ||| || |||||| |   ||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  35486022 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtttgacaaagagaagttaatataccaaaataaaacaaattttaattaagg 35485923  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  35485922 ga 35485921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 44678517 - 44678586
Alignment:
Q  86 aggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44678517 aggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaacaaaaa 44678586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 16645706 - 16645658
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaa 55  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16645706 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaa 16645658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 171
Target Start/End: Original strand, 35486102 - 35486252
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggat 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||  ||| |||  |||||  || |||||||||  ||||||| ||||||||     
T  35486102 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggagcacaaggtgtaag-gagagaaagttaagatactaaaataaattaaattttaattaagggac 35486200  T
Q  120 caaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    ||||  |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  35486201 caaagcgatactaattaaatagttaggggaccaaaaatgcaatctaaccaaa 35486252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Original strand, 9630797 - 9630848
Alignment:
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9630797 tttaattaaggaattaaaatgatactacctaaatagttaaaggactaaaaat 9630848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 35030900 - 35030834
Alignment:
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||||||| |||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  35030900 ttagttatgggaccaaaatgaaaccacataattagttaagggactaaaaatgtaattaagccaaaaa 35030834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41658463 - 41658413
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  41658463 ttttagttaagggatcaaaacgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 41658413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43086451 - 43086401
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  43086451 ttttagttaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaa 43086401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13364112 - 13364039
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaat 178  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||| || | || |||||||||    
T  13364112 ttttagttaagggaccaaagtgatactaaataaatatttaagggaccaaaaacgcatttaaacctaaaataaat 13364039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 6843705 - 6843749
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaa 45  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6843705 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaa 6843749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Original strand, 7117111 - 7117179
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||| |||||  || || |||||||||    
T  7117111 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaacacatttaagccaaaaa 7117179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 19302422 - 19302466
Alignment:
Q  28 aacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaac 72  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  19302422 aacagttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatgtgtaac 19302466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 157
Target Start/End: Original strand, 30865328 - 30865380
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||    
T  30865328 ttttagttaagggaccaaaatgataccaattaaatacttaagggaccaaaaat 30865380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Original strand, 31446155 - 31446223
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  31446155 ttttagttaagggatcaaagcgatatcaattaaatagttaagggaccaaaaaagcatttaagccaaaaa 31446223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 45435634 - 45435578
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg 88  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  45435634 ttttttaattaaatttaacggaaaggaccaaaatgtataacagagagaaatttaagg 45435578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 10625319 - 10625470
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10625319 gaagaaaacgtaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaag 10625418  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10625419 gaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35085906 - 35085739
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  35085906 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaat 35085807  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35085806 cgaattttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 35085739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18731186 - 18731018
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  18731186 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagggaccaaaataaat 18731087  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    | ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18731086 cgaattttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 18731018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 47250776 - 47250932
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  47250776 aagaagaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaat 47250875  T
Q  112 taagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47250876 taaaggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 47250932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 9230896 - 9231063
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  9230896 aagaggagaagaagatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagtgaccaaaataaat 9230995  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  9230996 caaatcttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatcgttaagggaccaaaaatacaacttagcc 9231063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 8769508 - 8769666
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  8769508 gaagaaaatgaagaaaatataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggaccaaaataaatcaaattt 8769607  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8769608 taattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttag 8769666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31715794 - 31715633
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31715794 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 31715695  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31715694 ttaattaaggggtcaaagcgatactacctaaatagttaagagacaaaaaatacaatttagcc 31715633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 11678922 - 11679093
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  11678922 aagatgagaagaaaatgaagaaaaactaacctttttgaat-aaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggatcaaaataaat 11679020  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11679021 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaaaaa 11679093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5238618 - 5238451
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  5238618 aagaggagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaagtaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagagaacttaagggaccaaaataaat 5238519  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
      ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  5238518 tgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaacagttaatggatcaaaaatgcaatttagcc 5238451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34568744 - 34568585
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  34568744 agaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcgaatt 34568645  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34568644 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggacaaaaaatacaatttag 34568585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Original strand, 23472791 - 23472945
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23472791 gaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 23472890  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    || ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23472891 gaccaaagcgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaa 23472945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23437313 - 23437152
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23437313 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatatgtaaccgagagaggttaaaggaccaaaataaatcgaatt 23437214  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  23437213 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttagcc 23437152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 35085965 - 35086126
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  35085965 agaagaaaatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggtccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaaatt 35086064  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35086065 ttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 35086126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8769449 - 8769285
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  8769449 aagaggagaagaaaataaagaaaacctaacgtttttgaattaaatctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaat 8769350  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8769349 caaattttaattcagggaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8769285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 31715852 - 31716007
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| |    
T  31715852 aagaggaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacg-aaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttataggaccaaaataaatcaaattttaat 31715950  T
Q  112 taagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31715951 taagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 31716007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2357234 - 2357067
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  2357234 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaat 2357135  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  2357134 caaattttaattaagggaccaaagtgatactatttaaatagttaagagatcaaaaatgcaatttagcc 2357067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32706883 - 32706732
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32706883 gaagaaaacctaacgtttttgaattagaactaacggaaaggactaaaatgtgtaattgagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagg 32706784  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |   ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32706783 gtcaaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 32706732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41758829 - 41758676
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41758829 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggg 41758730  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaa---aaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41758729 accaaaacgatactatttaaatagttaagggacaaaaaaaaatgcaatttagcc 41758676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 43726461 - 43726628
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  43726461 aagaggagaagaagatgaagaaactctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaat 43726560  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43726561 caaattttaattaaggaactaaaacaataccacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 43726628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47250724 - 47250570
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | |||||| | ||||||||||||||    
T  47250724 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaatggggagaagttaagggaccaaaataaat 47250625  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
      ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47250624 tgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaataattaagggacaaaaa 47250570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 26920136 - 26920308
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  26920136 aagaggagaagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaat 26920235  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  26920236 cgaattttaattaagggaccaaagcgatacaaccgaaatagataagggattaaaaatgcaatttagctaaaaa 26920308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Original strand, 2357300 - 2357439
Alignment:
Q  27 taacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |    
T  2357300 taacatttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagttaagggcccaaaacg 2357399  T
Q  127 atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  2357400 atactacctaaatagttaagggaccagaaatacaatttag 2357439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 9034550 - 9034701
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  9034550 gaagaaaatctaacgtttttgatttaaaactaacgaaaaggaccaaaatctgtaacagagggaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaga 9034649  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  9034650 gaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagcc 9034701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 21522442 - 21522599
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21522442 gagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgt-taacggagagaagtt-aaggaccaaaataaatcaaat 21522539  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  21522540 tttaattaagggaccaaagcgatgctacctaaatagttaagggaccaaaaacacaattta 21522599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11678864 - 11678703
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  11678864 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 11678765  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  11678764 ttaattaagggaccaaagtgatattatctaaatatttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 11678703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 47251127 - 47251282
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |    
T  47251127 aagaagaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaat 47251225  T
Q  112 taagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47251226 taagagaccaaagcaatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 47251282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 473354 - 473192
Alignment:
Q  3 gatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatcc 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||     
T  473354 gatgagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgacttaaaactaaaggaaaggac---aatgtgtaacagagaaaagttaaggaaccaaaataaatcg 473258  T
Q  103 aattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  473257 aattttagttaagggaccaaagcgatactgcctaaatagttaagcgatcaaaaatgcaatttagcc 473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 32706951 - 32707117
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  32706951 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaac-aacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaatggaccaaaagaaat 32707049  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | | ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32707050 cgagttttaattaagggaccaaagcgatactatctaaataattaagggactaaaaatacaatttagcc 32707117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 44448140 - 44448295
Alignment:
Q  10 agaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttta 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  44448140 agaagatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaattaaatttta 44448239  T
Q  110 gttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
     |||||||| ||||  |||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||    
T  44448240 attaagggaccaaagcgatactacttaaataattaaaggactaaaaatccaattta 44448295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23472754 - 23472593
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  23472754 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaaagaaccaaaatgaatcgaatt 23472655  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23472654 ttaattaaaagaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 23472593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 34568802 - 34568942
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaa-cctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  34568802 aagaggagaagaagatgaagaaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggacaaaaataaa 34568901  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaata 140  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34568902 tcaaattttaattaagggatcaaagtgatactacataaata 34568942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Original strand, 31623648 - 31623811
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||  |||||   ||||||||||||||| |||    
T  31623648 gagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttatgggaccaaaataaatcaaat 31623747  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    |||| || ||||  ||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  31623748 tttacttgagggtccaaaacgatactacctgaataattaaggtactaaaaatgcaatttagcca 31623811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39118161 - 39118013
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||   | | ||||||||||| || |||| ||||||    
T  39118161 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttagggaatcaaaataaatcgaaatttaattaagg 39118062  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39118061 gatcaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39118013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43140864 - 43140701
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | |||| |  |||||||||||||    
T  43140864 aagaggagaataagatgaagaaaacgtaacgtttt-gaattaaaactaacagaaatgaccaaaatatgtaacagagaggagttaagagaccaaaataaat 43140766  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43140765 caaattttaattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 43140701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 44486157 - 44486319
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||  |||     
T  44486157 agaagaaaatgaagaaaatctaacgttttggaatttaaactaacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaattaaata 44486256  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44486257 ttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcca 44486319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38842182 - 38842035
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38842182 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaag-ttaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagg 38842084  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    || |||||||| | || | |||||||||||| || |||| | ||||||||    
T  38842083 ga-caaaatgacattatcaaaatagttaaggaaccaaaattacaatttag 38842035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 473415 - 473563
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||      
T  473415 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaattgagagaagttaagggacgaaaataaatcaaattttaattaaaa 473514  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||    
T  473515 gaccaaagcgatactacctaaatagttaaagaattaacaatgcaattta 473563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21522379 - 21522226
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||   ||||    
T  21522379 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaa--gaatt 21522282  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaat 162  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21522281 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaat 21522226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 37143985 - 37144146
Alignment:
Q  4 atgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatcc 102  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||  |||||  |||||||||||||     
T  37143985 atgagaaaaagatgaagaaaacctaacgtatttaaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaag-gagagaaaattaagataccaaaataaatca 37144083  T
Q  103 aattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37144084 aattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 37144146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24119875 - 24119714
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaa-cctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||| ||||    
T  24119875 gaagaagaggaagaaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagagaagttaagggatcaaaagaaatcaaatt 24119776  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  24119775 ttaattaagagaccaaagtgatactatctaaatagttaagaaaccaaaaatgtaatttagcc 24119714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 38842241 - 38842405
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| |   ||||||  || ||||||||||||    
T  38842241 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaatatgtgtaacgggtagaagttagag-accaaaataaat 38842339  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  38842340 cgaattttagttaagggaccaaagcgatgctacctaaatagttaaggaatcaaaaatacaatttag 38842405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9230837 - 9230721
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  9230837 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 9230738  T
Q  107 ttagttaagggatcaaa 123  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  9230737 ttaattaagggaccaaa 9230721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43726403 - 43726247
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  43726403 agaagaaaatgaagaaaacttaacatttttgaattaaaactaa-tgaaaagatcaaaatgtgtaacagagagaag-ttaaggaaccaaataaatcaaatt 43726306  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  || ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  43726305 ttaattaagggaccaaagcgagactacttaaataattaagggaccaaaaatacaattta 43726247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 44485557 - 44485719
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | || ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||  |||     
T  44485557 agaagaaaatgatgaaaacctaatgttttggaatttaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaattgaata 44485656  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||| |||| ||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44485657 ttaattaaaggaccaaagcgataatacttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcca 44485719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47305288 - 47305127
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||  |||||  ||||||||||||| |||    
T  47305288 agaagaagatgaagaaaacctaacgtctttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaag-gagataaagttaagataccaaaataaatcaaat 47305190  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  47305189 tttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 47305127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44448064 - 44447916
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  44448064 gaagaaagtctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatggccaaaatgtgtaaaagagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa-g 44447966  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    || |||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44447965 gaccaaaacaatactatctaaatagttaacggaccaaaaatgcaatttag 44447916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 22338492 - 22338662
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag---gaccaaaata 97  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||  ||| |    |||||||||    
T  22338492 aagaggagaagaagacaaagaaaccctaacatttttgaattaaaattaatgtaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaagttacgacataccaaaata 22338591  T
Q  98 aatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||  ||||||| ||||||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22338592 aatgaaattttaattaagggacgaaagcgatactaattaattagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 22338662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 47305362 - 47305490
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||| |||||| |   ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  47305362 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatggagtgaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagg 47305461  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaa 145  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||||    
T  47305462 gagcaaaacgatactaattaaatagttaa 47305490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 23437387 - 23437493
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||    |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23437387 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgggaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttacgagaccaaaataaatcaaattttaattaagg 23437486  T
Q  117 gatcaaa 123  Q
    || ||||    
T  23437487 gaccaaa 23437493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 37143899 - 37143763
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||   | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  37143899 tttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagaaaag-ttaagataccaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatact 37143801  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    |  |||||||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  37143800 aattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcca 37143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22338424 - 22338269
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaag 115  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||  |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22338424 gaagaaactctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaag 22338325  T
Q  116 ggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    | | ||||   ||||||  |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  22338324 gtaccaaagcaatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagccaaa 22338269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 28349616 - 28349754
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |   ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  28349616 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaa-agagaaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagg 28349714  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    || |||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28349715 gaccaaaacaatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 28349754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 36507044 - 36507183
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||| |   ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  36507044 gaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaagg 36507143  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    || ||||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  36507144 gaccaaatcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaa 36507183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 47251064 - 47250942
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagg-gaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||    
T  47251064 aagaggagaagaagatgaagaaaatttaacgtttttga-ttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggggagaagttaagggaccaaaataaa 47250966  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaa 123  Q
    || ||||||| |||||||| ||||    
T  47250965 tcgaattttaattaagggaccaaa 47250942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10625181 - 10625106
Alignment:
Q  93 aaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10625181 aaataaatcgaattttagttaagggaccaacacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 10625106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 10625245 - 10625180
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaa 71  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10625245 gagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa 10625180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15326998 - 15326872
Alignment:
Q  42 aaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaata 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  15326998 aaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaata 15326900  T
Q  141 gttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||   || |||||||||||||||||    
T  15326899 gttaaaaaactaaaaatgcaatttagcc 15326872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 48703970 - 48703852
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||| |||  ||||  ||||||||||||| ||||    
T  48703970 agaagaaaatgaataaaccctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaagttgtaacagagagaaaattaaaaaccaaaataaatcgaatt 48703871  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaat 125  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  48703870 ttaattaagtgatcaaaat 48703852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Original strand, 48704105 - 48704183
Alignment:
Q  79 aagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48704105 aagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 48704183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 165
Target Start/End: Original strand, 4156511 - 4156636
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||  |||||||  |||||    
T  4156511 taaaattaacgaaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagagaccaaaataaatcaaattttagttagggtaccaaacagatactaattaaat 4156610  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4156611 agttaagggaccaaaaaggcaattta 4156636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 36506979 - 36506848
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||  || ||||  |||||  |||||||||||    
T  36506979 aagatgataagaagatgaagaaaacccaacatttttaaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaa-ggatggaaagttaagataccaaaataaa 36506881  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatacta 132  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  36506880 tcaaattttaattaagagatcaaaacgatacta 36506848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28263639 - 28263496
Alignment:
Q  25 cctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaa 123  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    ||||| |   ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  28263639 cctaacattttttaat-aaaactaacggaaacgactaaaggtggtaacgggaagaaatttaaggtaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaa 28263541  T
Q  124 atgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
      |||||||  |||||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  28263540 ccgatactaattaaatagttaagggatcaaaaaagtaatttagcc 28263496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 168
Target Start/End: Original strand, 28264601 - 28264739
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatac 130  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| |||||   |||||| || |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||    
T  28264601 ttttttaaataaaactaatggaaaggattaaaagtagtaacatagagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaaaagaccaaattgatac 28264700  T
Q  131 tacctaaatagttaagggac-aaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||  ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  28264701 taattaaatagttaatggactaaaaagggcaatttagcc 28264739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38676194 - 38676069
Alignment:
Q  33 ttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  || |      
T  38676194 tttttaattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaaagttaagagaccaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaatc 38676095  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||    
T  38676094 aattaaatagttaagggaccaaaaat 38676069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41691988 - 41691915
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaat 178  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  41691988 ttttagttaagggaccaaaacgataccaattaaatagttaagggaccaaaaatacatttaagccaaaaataaat 41691915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Original strand, 40263562 - 40263697
Alignment:
Q  33 ttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatacta 132  Q
    |||| |||||||  ||| ||||| ||| |||| |||||||| | | ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  || || |    
T  40263562 tttttaattaaatttaatggaaatgaccaaaacgtgtaacaaaagaaagttaagggaccaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaacca 40263661  T
Q  133 cctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
      |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  40263662 attaaatatttaagggaccaaaaaggtaatttagcc 40263697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 177
Target Start/End: Original strand, 38677051 - 38677137
Alignment:
Q  91 caaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||  || || |  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  38677051 caaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttagcctaaaataaa 38677137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43050510 - 43050396
Alignment:
Q  43 aaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaa-ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatag 141  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||   ||| ||  |||||||    
T  43050510 aaactaacggaaagcaccaaaatatgtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttaattaggggaccaaaccaatattaattaaatag 43050411  T
Q  142 ttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||||||||| |||||    
T  43050410 ttaagggaccaaaaa 43050396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 24119930 - 24119999
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagag 76  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  24119930 agaagaaaatgaagaaaatctaacattttttaattaaaattaacagaaagaaccaaaatatgtaacagag 24119999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Original strand, 23439512 - 23439554
Alignment:
Q  129 actacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23439512 actacctaagtagttaagggatcaaaaatgcaatttagccaaa 23439554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 28349530 - 28349480
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaa 71  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  28349530 aaaacctaacgtttttgaattaaaattaatggaaagaaccaaaatgtgtaa 28349480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36282867 - 36282774
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaatta 180  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||  |||||| |  ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  36282867 ggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggactaaaaatgtaatttagccaaacaaaaatta 36282774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19543555 - 19543503
Alignment:
Q  103 aattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  19543555 aattttaattaagggatcaaagcgatactaaataaatagttaagggacgaaaa 19543503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 84)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35263661 - 35263485
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  35263661 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgttttttaattaaaattaacggaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaat 35263562  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  35263561 cgaattttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaatataaa 35263485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 334463 - 334294
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  334463 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgggaaggaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggaccaaaataaat 334364  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    | ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  334363 caaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagccaa 334294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 10656313 - 10656486
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  10656313 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaat 10656412  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  10656413 caaattttacttaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccataaat 10656486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 35263731 - 35263880
Alignment:
Q  19 agaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggga 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35263731 agaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaatttaatggaccaaaataaatcgaattttagttaaggga 35263830  T
Q  119 tcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
     |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35263831 ccaaagtcatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 35263880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7399228 - 7399077
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7399228 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 7399129  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7399128 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 7399077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 40589289 - 40589440
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40589289 gaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 40589388  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40589389 gaccaaaacgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcc 40589440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 40589892 - 40590043
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40589892 gaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 40589991  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40589992 gaccaaaacgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcc 40590043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33699417 - 33699275
Alignment:
Q  26 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaat 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||     
T  33699417 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaaccgaattttagttaaaggaccaaaac 33699318  T
Q  126 gatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33699317 gatactacctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagcc 33699275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7210617 - 7210461
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  7210617 agaagaagatgatgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 7210518  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatt 163  Q
    ||| | |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7210517 ttaatcaagggaccaaaacgatagtacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatt 7210461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 7210670 - 7210830
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||| ||||    
T  7210670 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacataaagaagttaaaagaccaaaataaatcgaatt 7210769  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  7210770 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagtgaccaagaatgcaatttagc 7210830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 7399297 - 7399465
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  7399297 aagaagagaagaagatgaagaaatcctaacttgtttgaataaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaat 7399396  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggac-aaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7399397 caaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggacaaaaaaatgcagtttagcc 7399465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 15267479 - 15267631
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatc 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15267479 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggacc 15267578  T
Q  121 aaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15267579 aaagcgatactacctaaatagttaaaggatcaaaaatgcaatttcgccaaaaa 15267631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 31656577 - 31656745
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  31656577 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaat 31656676  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31656677 cgaattttaattaagggaccaaagcgatactgcctaataagttaagggaccaaaaatgtaatttagcca 31656745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10656245 - 10656094
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10656245 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggagcaaaataaatcaaattttagttaagg 10656146  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10656145 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 10656094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 9693143 - 9693301
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||    
T  9693143 agaagaaaacgaaaaaaaccaaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaatataaatcgattt 9693242  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9693243 ttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatcgttaagggaccaaaaatgcaattta 9693301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31656509 - 31656352
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31656509 gaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtatcagagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagg 31656410  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaaggga-caaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31656409 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaaatgcaatttggccaaaaa 31656352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 19205178 - 19205326
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19205178 gaagaaaacctaaagtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggggtcaaaataaatcgaattttagttaagg 19205277  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19205278 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 19205326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3878648 - 3878481
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3878648 aagaagagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgcaatagagagaagttaaaggaccaaaataaat 3878549  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| ||||  || ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3878548 cgaattttaattaaacgaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcc 3878481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 12593680 - 12593839
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  12593680 gagaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaat 12593779  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  12593780 tttaattaaaggaccaaagcaatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgtaattta 12593839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 36752063 - 36751904
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  36752063 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtttaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaatt 36751964  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  36751963 ttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttag 36751904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 41859896 - 41860062
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||    
T  41859896 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacctttttgaattaatactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggatcaaaataaat 41859995  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatac--tacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
      ||||||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41859996 tgaattttaattaagggaccaaagtgatactatacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 41860062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5087968 - 5087811
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||| | | ||||||||||||  ||||    
T  5087968 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaatt 5087869  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5087868 ttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaattcaattt 5087811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Original strand, 12694921 - 12695078
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12694921 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaataaccaaaatgtgtaatggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 12695020  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  12695021 gaccaaagtgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttggcctaaaat 12695078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40589824 - 40589651
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  40589824 aagaggagaagatgatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaat 40589725  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
    | ||||||| ||  | || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40589724 cgaattttaatttggagaccaaagtgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaaaat 40589651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9693077 - 9692914
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  9693077 aagaagaggaagaaaacctaacgttattgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaatttt 9692978  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | |||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  9692977 aattaagggaccaaagcgatactacctaaatagtt-agggaccaaaaatacaatttagcccaaaa 9692914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 39706270 - 39706433
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  39706270 aagaggagaagaagatgaagaaaatccaacgtttttgaattgaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaat 39706369  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattt 164  Q
    | ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39706370 cgaattttaattaagggaccaaaagaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 39706433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Original strand, 28392006 - 28392160
Alignment:
Q  19 agaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaa-ggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  28392006 agaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaggttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaggg 28392105  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  28392106 accaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatagaatttagccaaaa 28392160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31909091 - 31908927
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||  ||||    
T  31909091 agaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattgaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaatagagagaagttaagggaccaaaataaattgaatt 31908992  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaa--atagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  31908991 ttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatatagttaaggcaccaaaaatacaatttagcca 31908927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40589205 - 40589048
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||  |     
T  40589205 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaatttgga 40589106  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40589105 gaccaaagtgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaaaat 40589048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5624530 - 5624382
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5624530 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 5624431  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  5624430 gaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 5624382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19205110 - 19204935
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||     ||   ||    
T  19205110 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccagagagaag-ttaaggtatttaagccat 19205012  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  19205011 caaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaagataaa 19204935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40774498 - 40774339
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| | |||    
T  40774498 agaagaaaatgaagaaaatctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagagagaagttaagggaccaaaataaat-cgatt 40774400  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40774399 ttaattaagggactaaaacaatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgaaatttagc 40774339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12593623 - 12593456
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | | ||||| ||||||    
T  12593623 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgacttaaaactaaaggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaggaaccaatataaat 12593524  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12593523 cgaattttagttaagggactgaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 12593456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 16353381 - 16353540
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  16353381 aagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttt 16353480  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16353481 aattaggggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 16353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29024095 - 29023937
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| || | |||||||   ||||| ||||    
T  29024095 agaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaa---aaatcgaatt 29023999  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29023998 ttaattaaggaaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 29023937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 38416353 - 38416520
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||| | | ||||||||||||    
T  38416353 aagaggagaacaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggaaagaagttaaggaaccaaaataaat 38416452  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  38416453 cgaattttaattaagtgagcaaagcgatactacctaaataattaagagaccaaaaatacaatttagcc 38416520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 31909155 - 31909313
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||| |||  |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31909155 agaagaaaatgaagaaaacctaacattttttaattaaaattaacgaaaatgaccaaaatatgtaaaagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 31909254  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31909255 ttaattaagggacgaaaacgatactacctaaacagttaagggaccaaaaatgcaattta 31909313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Original strand, 42710587 - 42710737
Alignment:
Q  19 agaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggga 118  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42710587 agaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttataacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaaggga 42710686  T
Q  119 tcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42710687 ccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcca 42710737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8418337 - 8418206
Alignment:
Q  31 atttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  8418337 atttttgaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagtt-aagaaccaaaataaatcgaattttaattaagtgaccaaaacgatac 8418239  T
Q  131 tacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatt 163  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  8418238 tacctaaataattaatggaccaaaaatgcaatt 8418206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 15476478 - 15476641
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||| |  |||||||||||||    
T  15476478 aagaggagaaaaagatgaaggaaaactaacatttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaat 15476577  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  15476578 caaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggac-taaaatgcaattta 15476641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26289171 - 26289031
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26289171 gaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaaatgtgtgacatatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 26289072  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    ||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26289071 gacgaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 26289031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16353315 - 16353150
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||  ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  16353315 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccgaaatgagtaacatagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 16353216  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaa---tagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16353215 ttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagtagttaagggaccaaaaatgtaatttagcca 16353150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Original strand, 36752126 - 36752287
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||| |||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  36752126 gagaagaagatgaagaaaacctaacttttttaaattaaaaccaatgaaaaggaccaaaatgtgcaacaaagagaagttaatggaccaaaataaatcgaat 36752225  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| |||| ||||  ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36752226 tttaattaa-ggattgaagcgatactacataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 36752287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17861197 - 17861034
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17861197 aagaagatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaatggaccaaaatgtgtaccgaagagaag-ttaaggaccaaaataaatcgaatttt 17861099  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | |||||||| ||||   | | ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  17861098 aattaagggaccaaagcaacattacctaaatagttaaaggaccaaaaatataatttagccaaaaa 17861034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25923285 - 25923121
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||| |||| ||| |||||| |  |||||||||||||    
T  25923285 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatggtaaaaatgtataacggagagaagttaagagaccaaaataaat 25923186  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  25923185 cgaattttaattaaaggaccaaaccgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatacaattta 25923121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 8418405 - 8418574
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||  ||||| | ||| ||||||||||    
T  8418405 aagaggagaagaagataaagaaaaccta-cgttttt-aattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggatcaaaataaat 8418502  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8418503 cgaattttaattaacggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagctaaaa 8418574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18514430 - 18514283
Alignment:
Q  26 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaat 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||  |||||||  |||| || ||||      
T  18514430 ctaacgtttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaactaagcgaccaaagg 18514331  T
Q  126 gatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18514330 gatacttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaaaa 18514283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14143670 - 14143524
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  14143670 gagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggagagaag-ttaaggactaaaataaat-caat 14143573  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    |||| ||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14143572 tttaattaa-aaaccaaaacgatactatctaaatagttaagggacaaaaa 14143524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28391930 - 28391765
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaat 105  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||| | ||||||||||| ||     
T  28391930 agaaaaagatgaaaaaaccctaacatttttgaattaaaactaactaaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaaagttaagggatcaaaataaatcgaac 28391831  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28391830 tttaattaagggaccaaagtaatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattgagccaaa 28391765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33763072 - 33762901
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtt-taa-ggaccaaaataa 98  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||    
T  33763072 aagaggagaagaaaataaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttataagggatcaaaataa 33762973  T
Q  99 atccaatttt-agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaa-gggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||    
T  33762972 atcgaattttaatttaagggaccaaagcgatactacctaaataattaaggggaccaagaatgcattttagcc 33762901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 41372393 - 41372532
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41372393 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagg 41372492  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    || ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  41372493 gaccaaaacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaa 41372532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 5152840 - 5152989
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||| || |   ||||||||||||| ||||    
T  5152840 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaaattaagataccaaaataaatcaaatt 5152939  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  5152940 ttaattaagggaccaaagcgatactaaataaatagttaagggaccaaaaa 5152989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Original strand, 5088386 - 5088514
Alignment:
Q  40 ttaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||  ||||||||||||||    
T  5088386 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacaaaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaat 5088485  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  5088486 agttaagagaccaaaaatacaatttagcc 5088514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38416294 - 38416138
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||| |   | ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  38416294 gaagaaaacccaatatttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaaccgagagaagttaagaaaacaaaataaattgaattttaattaagg 38416195  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    || ||||  ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  38416194 gaccaaagcgatactacctaaataattaagagattaaaaatgcaatttagcctaaaa 38416138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14052051 - 14051892
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||| | | ||||||||||||| |||    
T  14052051 gagaagaacacgaagaaagcctaacgtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttcaggaaccaaaataaatcgaat 14051952  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||| ||||   | |||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  14051951 tttaattaaaaaaccaaaacaatattacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 14051892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Original strand, 40774561 - 40774723
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||  || ||| |  | ||||||||||||||| |||    
T  40774561 gagaagaagatggagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtgacgtagagaaataaagggaccaaaataaatcgaat 40774660  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| ||||||||  |||  ||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  40774661 tttaattaagggactaaagcgatactagctaaataattaaggaatcaaaaatgcaatttagcc 40774723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42710517 - 42710351
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||| | ||| |||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  42710517 aagaggagaagaaaatgaaaaaaatcaaatatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaatggaccaaaataaat 42710418  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    | ||||||| |||| | |  |||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  42710417 cgaattttaattaaagaactaaagcgatactaccgaaatagttaaatgactaaaaatgcaatttagc 42710351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15267406 - 15267245
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||| ||  |||||||||||  ||| |||||| | || |||||||||||    
T  15267406 aagatgagaaaatgatgaagaaaatctaacattt--gaattaaaactaatagaaatgagcaaaatgtgtaattgagagaagttaaggggccaaaataaat 15267309  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15267308 caaattttaattaaaggaccaaaacgatactacct-aatagttaagggaccaaaaatgcaattta 15267245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39706201 - 39706055
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  39706201 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatatctaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaagg 39706102  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||  |    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39706101 accaaagcg----tacataaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 39706055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Original strand, 43570006 - 43570155
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||||| ||| |||||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43570006 gaagaaaacttaacgtttttgaatcaaaactaatcgaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaatgggacaaaataaatcaaattttaattaagg 43570105  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    || ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43570106 gaacaaagcgatgctatctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttag 43570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 26289239 - 26289406
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaa-ctaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||  ||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  26289239 aagacgagaagaaaatgtagaaaacctaacgtttttgaattaaaaaccaacgaaaaggacaaaaatgtgcaatggagagaagtt-aaggatcaaaatgaa 26289337  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  26289338 tcgaattttaattaagggaccaaaacgatactatttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatctagcc 26289406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 15670387 - 15670534
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||   || |||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||       
T  15670387 aagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaacatgtgtaatgcagagaagttaagggaccaaaataaataaaattttaattaaata 15670486  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15670487 accaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 15670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 17861263 - 17861416
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||      |    
T  17861263 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaccaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttacaggaccaaaataaa------t 17861356  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||    
T  17861357 ttaattaa-ggaccaaagtgatactacctaaataatt-agggaccaaaaatacaatttagcc 17861416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21750900 - 21750810
Alignment:
Q  78 gaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21750900 gaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttagcc 21750810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Original strand, 32272082 - 32272224
Alignment:
Q  24 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaa 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||| | ||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  32272082 acctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaatgaacaaaatatataacatagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 32272181  T
Q  124 atgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
      |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32272182 gcgatattatctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttag 32272224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Original strand, 33763153 - 33763293
Alignment:
Q  27 taacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatg 126  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |   |||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  33763153 taacgtttttgaattaaaaccaaaggaaatgtacaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcg 33763252  T
Q  127 atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33763253 atacta-ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 33763293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 25923354 - 25923504
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||| || |  |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  25923354 gaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaattaagg 25923453  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||   | || |||||||||||||||||    
T  25923454 gaccaaaacaatactacataaatagtt-ttgaaccaaaaatgcaatttagcc 25923504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 14143742 - 14143900
Alignment:
Q  19 agaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggga 118  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  ||  ||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||  ||||||| | ||| ||    
T  14143742 agaaaccctaatattttttaattaaaattaacaaaagtgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaatgaagaga 14143841  T
Q  119 tcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
     |||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  14143842 ccaaagtaatactacttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagccttaaataaa 14143900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15476400 - 15476277
Alignment:
Q  28 aacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||      || |||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  ||    
T  15476400 aacattttttaattaaaactaacg------accaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaataaaattttaattaagggatcaaagcga 15476307  T
Q  128 tactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15476306 tactacctaaatagttaagggaccaaaaat 15476277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5152783 - 5152616
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaa 99  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||  |   |||||  |||||||||||    
T  5152783 aagaagagaagaagatcaagaaaacctaaagtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaaga-agatagagttaagataccaaaataaa 5152685  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||||| |||||||  |||| | ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5152684 tcaaattttaattaaggggccaaagtcatactaattacatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 5152616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 168
Target Start/End: Original strand, 19185506 - 19185634
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||  |||||    
T  19185506 taaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccaatactaattaaat 19185605  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  19185606 agttaagggaccaaaaaggtaatttagcc 19185634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 155
Target Start/End: Original strand, 17736529 - 17736620
Alignment:
Q  64 atgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17736529 atgtgtaacagagagaa-tttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 17736620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 168
Target Start/End: Original strand, 3879318 - 3879398
Alignment:
Q  88 gaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||| | | |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3879318 gaccaaaataaatcaaattttaaataatgaaccaaagtcatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 3879398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5460264 - 5460188
Alignment:
Q  92 aaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5460264 aaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 5460188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 5624617 - 5624673
Alignment:
Q  21 aaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagg 77  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5624617 aaaatctaacttttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagg 5624673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26289049 - 26288980
Alignment:
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaatt 179  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  26289049 tagttaagggaccaaaa--atacaacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaaaattaatt 26288980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 43569937 - 43569889
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaa 49  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43569937 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacatttttaaattaaaactaa 43569889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 41859828 - 41859779
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatg 66  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41859828 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatg 41859779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 156
Target Start/End: Original strand, 2597334 - 2597458
Alignment:
Q  33 ttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaa-gtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||   | ||     
T  2597334 tttttaattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacaaagagaaagttaaaggaccaaaataaatcaaaatttagttaagagaccaaaccaaaacc 2597433  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    |  |||||||||||||||| |||||    
T  2597434 aattaaatagttaagggaccaaaaa 2597458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19615465 - 19615425
Alignment:
Q  125 tgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19615465 tgatactacctaaatagtcaagggaccaaaaatgcaattta 19615425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 5088034 - 5088073
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaacta 48  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5088034 aagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacta 5088073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 21750939 - 21750900
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaag 56  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21750939 gaaggaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaag 21750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 165
Target Start/End: Original strand, 5460275 - 5460329
Alignment:
Q  111 ttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5460275 ttaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 5460329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Original strand, 22166056 - 22166104
Alignment:
Q  27 taacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagag 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22166056 taacatttttgaattaaa-ctaacataaaggactaaaacgtgtaacagag 22166104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 11433 - 11600
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  11433 aagaggagaataagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaat 11532  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
      ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11533 tgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcc 11600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11374 - 11231
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  11374 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 11275  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggac 150  Q
    ||| ||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  11274 ttaattaagggacgaaagcaatactacctaaatagttaagggac 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 40571 - 40740
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||    
T  40571 aagaagagaagaagatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatgaaccaaaataaat 40670  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    | ||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40671 cgaattttaattaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaa 40740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40513 - 40352
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  || | | || | ||||| ||||||||| ||||    
T  40513 agaagaaaatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatctgtaacgtagagtaattaagggaccgaaataaatcaaatt 40414  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| ||||||||  |||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40413 ttaattaagggactaaagcgatactatctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcc 40352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33544989 - 33544825
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  33544989 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacctttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaat 33544890  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33544889 cgaattttaattaagggaccaaagcaatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33544825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35132768 - 35132601
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35132768 aagaggagacgaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaat 35132669  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35132668 ctaattttaattatgggaccaaagcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcc 35132601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9174060 - 9173896
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9174060 aagaagatgatgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatttt 9173961  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | |||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9173960 aattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaaaaa 9173896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14337061 - 14336897
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14337061 aagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtataacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatttt 14336962  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | |||| ||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14336961 aattaaaggaccaaagcgatactagctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagccaaaaa 14336897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 24605093 - 24605264
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  24605093 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacgaaaatgac-aaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaat 24605191  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  24605192 cgaattttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattaagccaaaaa 24605264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 33545057 - 33545213
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33545057 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 33545156  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| ||||    
T  33545157 gatcaaagtgatactacctaaatagttaatgcaccaaaaatataatttagcctaaaa 33545213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3338628 - 3338477
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3338628 gaagaaaacgtaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgagcaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 3338529  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3338528 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 3338477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Original strand, 6220291 - 6220441
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| || | |    
T  6220291 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattgatg 6220390  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6220391 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggattaaaaatgcaatttagc 6220441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24605035 - 24604878
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  24605035 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaagta-agggaccaaaataaatcgaatt 24604937  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24604936 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 24604878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 31029743 - 31029911
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  31029743 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgatcaaaatgtgtaacagagaaaagataaaggaccaaaataaat 31029842  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    | ||||||||||||||||  ||||  ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31029843 cgaattttagttaagggactaaaacaatactatttaaatggttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 31029911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2949447 - 2949289
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  2949447 aagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaaca-----aagttaatggaccaaaataaatcgaattttaat 2949353  T
Q  112 taagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaata 175  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2949352 taagggaccaaagtgatactacttaaatagttaacggacaaaaaatgcaatttagcctaaaata 2949289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 3289130 - 3289301
Alignment:
Q  2 agatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatc 101  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  3289130 agatgatatgaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaacaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatc 3289229  T
Q  102 caattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
     ||||||| |||||| | ||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3289230 aaattttaattaaggcaccaaagcgatattacctaaatagtttagggaccaaaaatgcaatttagccaaaaa 3289301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 7537824 - 7537994
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  7537824 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaaccgagagaagttatgggaccaaaataaat 7537923  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggac-aaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    | ||||||| ||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7537924 caaattttaattaagggacaaaagcgataccacttaaatagttaagggacaaaaaaatgcaatttagccaa 7537994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3289091 - 3288930
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  3289091 agaagaaaatgaaaaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaatggagagaagttaggggaccaaaataaatcgaatt 3288992  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3288991 ttagttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagcc 3288930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29010115 - 29009956
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||| || ||||    
T  29010115 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaagggaccgaaataattcgaatt 29010016  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttag 166  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29010015 ttaattaagggaccaaagcgatactacgtaaatagttaagggaccaaaaattcaatttag 29009956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33329357 - 33329206
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33329357 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 33329258  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33329257 gaccaaagcaatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 33329206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 3338712 - 3338861
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3338712 gaagaaaacctaaccttttcgaattaaaactaacgaaa--gaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaagg 3338809  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  3338810 gatcaaaacgatactacttaaatagttaagggaccaaaaataaaatttagcc 3338861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11524933 - 11524778
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacattttt-gaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||    
T  11524933 aagaggagaagaagatgaagaaaatctaacattttttgaattaaaaccaacagaaaggactaaaatgtgtaacggagagaggttaagggaccaaaataaa 11524834  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11524833 ttgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 11524778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25551498 - 25551347
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||| ||||| | ||||||    
T  25551498 gaagaaaacataatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggactaaaataaatcaaatttcaattaagg 25551399  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25551398 gaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 25551347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 19135682 - 19135832
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  19135682 aagaaaaccgaacgttttttaattaaaactaatggaaaggaccaacatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagag 19135781  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  19135782 atcaaaacgatactacctaaatacttaatggaccaaaaatgcaatttagcc 19135832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 11524991 - 11525151
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||  ||||    
T  11524991 agaagaaaatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaca-aggaaagttaagagaccaaaataaattgaatt 11525089  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11525090 ttaaataagggaccaaaccgatactacctaaattgttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 11525151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 14337127 - 14337287
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||| || | ||||||||||||||| ||||    
T  14337127 agaagaaaatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaatttaagggaccaaaataaatcaaatt 14337226  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14337227 ttaactaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaggga-taaaaatgcaatttagcc 14337287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 25551563 - 25551719
Alignment:
Q  9 aagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatttt 108  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  25551563 aagaagatcaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggacctaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttt 25551662  T
Q  109 agttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25551663 aattaggggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 25551719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31029675 - 31029527
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  31029675 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacgcagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagg 31029576  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    || ||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  31029575 gaccaaagcgatactacctaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 31029527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33346634 - 33346478
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  33346634 aagatgaagagaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaat 33346535  T
Q  112 taagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||    
T  33346534 taagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggatccaaaatgaaatttagcc 33346478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 1860711 - 1860872
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||| | | ||| ||||||||| ||||    
T  1860711 agaagaaaatgaagaaaacttaacgtttttgaattaagactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaacccaaataaatcgaatt 1860810  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1860811 ttaattaagggaccaaagagatac-acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcca 1860872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1158741 - 1158586
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaac--ggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaa 114  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1158741 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacacggaaaggaccaacatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 1158642  T
Q  115 gggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
     ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||    
T  1158641 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgtaattaagccaa 1158586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 35119041 - 35119197
Alignment:
Q  12 aagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagt 111  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  35119041 aagatgaagataacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaattaatggaccaaaataaatcgaattttaat 35119140  T
Q  112 taagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||    
T  35119141 taagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggatccaaaatgaaatttagcc 35119197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12903383 - 12903220
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||  ||||| | ||||||||||||||  |||    
T  12903383 gagaagatgatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaattgaat 12903284  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||| | || |||||| |||||||||||    
T  12903283 tttaattaagggaccaaagcgatactatctaaataattaaagaaccaaaaatacaatttagcca 12903220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6220223 - 6220059
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| || |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||    
T  6220223 aagaggagaagaagatgaggaaaatttaacgtttttgaatgaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaat 6220124  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||| ||  |||  |||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6220123 caaattttaattaagagacgaaagcgatattaattaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 6220059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 13156058 - 13156217
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||  || || | ||| ||||||||||    
T  13156058 aagaggagaaaaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaat 13156157  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13156158 cgaattttaattaagggacca-----atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaattta 13156217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 13160914 - 13161073
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||  || || | ||| ||||||||||    
T  13160914 aagaggagaaaaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaat 13161013  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13161014 cgaattttaattaagggacca-----atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaattta 13161073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 29010189 - 29010340
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||  || ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29010189 gaagaaaacctaatgtttttgaattaaaattaacagaatggaccaaaatgtgtaatggatggaagttaaggggccaaaataaatcgaattttagttaagg 29010288  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || || |  |||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  29010289 gaccacagcgatactacataaatagtcaaggaaccaaaaatgcaatttagcc 29010340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Original strand, 12903435 - 12903569
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaat 105  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| | | | |||||||| || |||    
T  12903435 gagaagaaaatgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtattacggagagaagttaaggaatcaaaataattcgaat 12903534  T
Q  106 tttagttaagggatcaaaatgatactacctaaata 140  Q
    |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  12903535 tttaattaaaggaccaaagggatactacctaaata 12903569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 24548477 - 24548615
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||| |   ||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  24548477 aagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaagg 24548576  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    | |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  24548577 accaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 24548615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 1158810 - 1158975
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||  || || | ||||||||||||||    
T  1158810 aagaggagaagaagatgaagaaaacgaaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtataacggagataa-ttaagggaccaaaataaat 1158908  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
     ||| |||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  1158909 -caaatttaattaagggaccaaagcgatactacttaaatagttaaggtaccaaaaatgcaagttagcc 1158975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Original strand, 2949516 - 2949633
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  2949516 agaagaaaatgaagaaaacctaacgttgttgaattaaaactaaccataaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaatt 2949615  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaa 124  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  2949616 ttaattaagggaccaaaa 2949633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 169
Target Start/End: Original strand, 6229645 - 6229773
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||  |||||    
T  6229645 taaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagtta-gggaccaaaccgatactaattaaat 6229743  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaatttagcca 169  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6229744 agttaagggaccaaaaaggcaatttagcca 6229773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24548403 - 24548236
Alignment:
Q  6 gagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaa 104  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||| ||    
T  24548403 gagaagaggatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaa-ggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaa 24548305  T
Q  105 ttttagttaagggatcaaaa-tgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||||  ||| || ||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24548304 ttttaactaa-ggctcaaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcccaaaa 24548236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13155990 - 13155850
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  13155990 gaagaaaacctaacgaatttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaagg 13155891  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13155890 gaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaat 13155850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13160846 - 13160706
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  13160846 gaagaaaacctaacgaatttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaagg 13160747  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13160746 gaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaat 13160706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 168
Target Start/End: Original strand, 17245582 - 17245710
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||  |||||    
T  17245582 taaaattaacggaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaat 17245681  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17245682 aattaagggaccaaaaatgcaatttagcc 17245710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Original strand, 33972431 - 33972548
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||  ||||    
T  33972431 agaagaaaatgaagaaaattcaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaatt 33972530  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaa 124  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  33972531 ttaattaagggaccaaaa 33972548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17544620 - 17544450
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaa 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||  |||||  || ||||||||    
T  17544620 aagaggagaagaagatgaagaaactctaacattcttgaatcaaaactaacgtaaaggattaaaatgtgtaac-gatagaaaattaagatactaaaataaa 17544522  T
Q  100 tccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    || ||||||| |||| ||| ||||  |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17544521 tcaaattttaattaaaggaccaaagcgatattagcaaaatagttaagggac-aaaaatgcaatttaaccaaaa 17544450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32283133 - 32283021
Alignment:
Q  61 aaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgca 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |    
T  32283133 aaaatgtgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatata 32283034  T
Q  161 atttagccaaaaa 173  Q
    |||||||||||||    
T  32283033 atttagccaaaaa 32283021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2315739 - 2315601
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaag-gaccaaaataaatccaatt 106  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||| ||||    
T  2315739 gaagaagatgaagaaaaccaaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaa-ggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaatt 2315641  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaag 146  Q
    ||| ||||| || ||||  |||||||  ||||||||||||    
T  2315640 ttaattaagcgaccaaagcgatactaattaaatagttaag 2315601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33972373 - 33972296
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaaca--tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagag 76  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33972373 aagaggagaagaagatgaagaagacctaaaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagag 33972296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 35132836 - 35132976
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||||           ||||||    
T  35132836 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaataaa-----------ttaagg 35132924  T
Q  117 gatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    || ||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  35132925 gaccaaagcggtactacctaaatagttaagggaccgaaaatacaatttagcc 35132976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 156
Target Start/End: Original strand, 2814561 - 2814685
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||  ||||||    
T  2814561 tttttgaattaaaactaacggaaagaatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagaaaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcgatact 2814660  T
Q  132 acctaaatagttaagggacaaaaaa 156  Q
    |  |||||||||||| ||| |||||    
T  2814661 aattaaatagttaagagaccaaaaa 2814685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 17544679 - 17544835
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaatt 106  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||  |||  | |||  ||||||||||||| ||||    
T  17544679 gaagaaaatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatatgtaac-gatagaaaatcaagataccaaaataaatcaaatt 17544777  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||| |||||||| |||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17544778 ttaattaagggaccaaagtgatattagcaaaatagttacgggac-aaaaatgcaattta 17544835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 29999653 - 29999767
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatact 131  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||  ||||||    
T  29999653 tttttgaattaaaagtaacagaaaggactaaaatgtgtaacagatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattacgggactaaagcgatact 29999752  T
Q  132 acctaaatagttaag 146  Q
    |  ||||||||||||    
T  29999753 aattaaatagttaag 29999767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 33329425 - 33329514
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggac 90  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  33329425 aagaggagacgaagattaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggac 33329514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11524786 - 11524706
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 167  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  11524786 ggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagc 11524706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33971995 - 33971931
Alignment:
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33971995 ccaattttaattaagggataaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33971931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31754371 - 31754215
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||| ||| |||||| |  ||  |||||||||    
T  31754371 aagatgagaaaaaaatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaatggaaaggtccaaaataagtaacggagagaagttaagagattaaaataaat 31754272  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaat 157  Q
      ||||||| ||||| || ||||| ||| |||  |||  |||||||| |||||||||    
T  31754271 agaattttaattaagagaccaaaacgattctatataatcagttaaggaacaaaaaat 31754215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 29999580 - 29999510
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaa 71  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  29999580 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatatgtaa 29999510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Original strand, 33548173 - 33548243
Alignment:
Q  98 aatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33548173 aatcaaattttaattaaggggccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaattcaatttagcc 33548243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33548160 - 33548118
Alignment:
Q  135 taaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaa 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33548160 taaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaaaataaa 33548118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32753259 - 32753175
Alignment:
Q  86 aggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaa 170  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||  ||||||||  ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  32753259 aggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagccaa 32753175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 35118973 - 35118934
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaag 56  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35118973 gaagaaaacctaacatttttaaattaaaactaacgaaaag 35118934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8850280 - 8850230
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 155  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  8850280 ttttagttaagggaccaaagtgatactaaataaatagttaagggaccaaaa 8850230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27128907 - 27128833
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaatt 179  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||  ||| || |||||||||| ||||    
T  27128907 ttttagttaagggaccaaagtgataccaaataaatagttaagggaccaaaagcgcatttaagccaaaaattaatt 27128833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3618844 - 3618776
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  3618844 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaaaagcatttaagccaaaaa 3618776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13204268 - 13204224
Alignment:
Q  105 ttttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaaggga 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  13204268 ttttagttaagggatcaaagtgatactaaataaatacttaaggga 13204224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 29467206 - 29467250
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagag 76  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29467206 tttttgaattaaatttaacggaaatgactaaaatatgtaacagag 29467250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 4543 - 4704
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  4543 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtgacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaatt 4642  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4643 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 4704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4504 - 4341
Alignment:
Q  2 agatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatc 101  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  4504 agatgatatgaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagtgaagttaagagaccaaaataaatc 4405  T
Q  102 caattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
     ||||| | |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4404 aaatttcaattaaggaaccaaagtgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 4341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Original strand, 177290 - 177464
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  177290 agaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaacaaaatgtgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaatcgaatt 177389  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaataaattaa 181  Q
    ||| |||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  177390 ttaattaagggatcgatctgataatacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcctagaataatttaa 177464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 45055 - 45228
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || |||||| | |||||| |||||||    
T  45055 aagaggagaagaagatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaat 45154  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaat 174  Q
    | | ||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45155 caatttttaattaagggagcaaagcgataatacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccgaaaat 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 11706 - 11876
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  11706 aagatgagaaaaatataaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatataacagagagaagttaagggaccaaaataaat 11805  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaa 171  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11806 cgaattttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccaaa 11876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11636 - 11488
Alignment:
Q  20 gaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagggat 119  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||| ||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  11636 gaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgcaacggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggac 11537  T
Q  120 caaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11536 caaagcgatactttctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 11488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 90965 - 90801
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |   ||||||||||||| |||||    
T  90965 gaagaaaatgaagaaaacctaataattttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaattt 90866  T
Q  108 tagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
     | ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  90865 caattaagggacaaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatgtagccaaaa 90801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 91734 - 91844
Alignment:
Q  8 gaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattt 107  Q
    |||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  |||||| |   ||||||||||||| |||||    
T  91734 gaagaaaatgaagaaaacctaatgattttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaattt 91833  T
Q  108 tagttaaggga 118  Q
    || ||||||||    
T  91834 taattaaggga 91844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13708 - 13542
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  13708 aagatgagaagaagatggagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaat 13609  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    |  ||||||  ||||||| ||||   || ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13608 cggattttaactaagggaccaaagcaattctaactaaatagttaa-ggaccaaaaatgcaatttagcc 13542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Original strand, 13766 - 13932
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13766 agaagaaaatgaagaaaacccaacgtttttgaattaaaatcaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatt 13865  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  13866 ttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttaaccaaaaa 13932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 65906 - 65742
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  65906 aagaggagaagaagacgaagaaaacctaacgttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaat 65807  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||| || ||||   ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  65806 cgaattttaattaagagaccaaagcaatattacctaaatagttaagagaccaaaaatgcagttta 65742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 73238 - 73074
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  73238 aagaggagaagaagacgaagaaaacctaacgttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaat 73139  T
Q  101 ccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    | ||||||| ||||| || ||||   ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  73138 cgaattttaattaagagaccaaagcaatattacctaaatagttaagagaccaaaaatgcagttta 73074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 65964 - 66129
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||| || |||||| | |||| |||||||||  ||||    
T  65964 agaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaatt 66063  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    ||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  66064 ttaattaaggaactaaaacgatactacctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttagtcaaaa 66129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 73296 - 73461
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||| || |||||| | |||| |||||||||  ||||    
T  73296 agaagaaaatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaatt 73395  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaa 172  Q
    ||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  73396 ttaattaaggaactaaaacgatactacctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttagtcaaaa 73461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11829 - 11711
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaatt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  11829 agaagaaaatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaatt 11730  T
Q  107 ttagttaagggatcaaaat 125  Q
    ||||| |||||| ||||||    
T  11729 ttagtcaagggaccaaaat 11711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11720 - 11639
Alignment:
Q  87 ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  11720 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcc 11639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 93357 - 93183
Alignment:
Q  1 aagatgagaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaa-cagagggaagtttaagg-accaaaataa 98  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||  ||||||||||    
T  93357 aagaggagaagaagatgaaaaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaaacagagagaaagttaagataccaaaataa 93258  T
Q  99 atccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||| ||||||| ||||| ||  |||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  93257 atcaaattttaattaagtgactaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccaaaaa 93183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 93439 - 93479
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaac 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  93439 tttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaac 93479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold1436
Description:

Target: scaffold1436; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1625 - 1476
Alignment:
Q  18 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaaggg 117  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1625 aagaaaagctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaaggg 1527  T
Q  118 atcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 168  Q
    | |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1526 accaatgcgatactacctaaatagttaagtgacaaaaaatgcaacttagcc 1476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 1710 - 1815
Alignment:
Q  17 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaaggaccaaaataaatccaattttagttaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  1710 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaat-cgattttaattaagg 1808  T
Q  117 gatcaaa 123  Q
    || ||||    
T  1809 gaccaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9910 - 9777
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaa-ggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||  ||||| |  |||||    
T  9910 taaaactaacggaaaggactaaaagtagtaacggatagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggagcaaaccgataccaattaaat 9811  T
Q  140 agttaagggacaaaaaatgcaatttagccaaaaa 173  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  9810 agttaagggaccaaaaaggcaattaagcctaaaa 9777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 156
Target Start/End: Original strand, 10878 - 10994
Alignment:
Q  41 taaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagggaagtttaagg-accaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaat 139  Q
    ||||| |||||||||| |||||||   ||||||||  |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||  |||||    
T  10878 taaaattaacggaaagaactaaaagtggtaacagaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaat 10977  T
Q  140 agttaagggacaaaaaa 156  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10978 agttaagggaccaaaaa 10994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26050 - 25970
Alignment:
Q  85 aaggaccaaaataaatccaattttagttaagggatcaaaatgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 165  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| | ||| |||| |||||||||    
T  26050 aaggaccaaaataaatcgagttttaattaagggatcaaagtgataccaactacatagttaggagaccaaaagtgcaattta 25970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 26097 - 26039
Alignment:
Q  7 agaagaagacgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaat 65  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26097 agaagaaaatgatgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaaggaaaggaccaaaat 26039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 90296 - 90254
Alignment:
Q  32 tttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacag 74  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  90296 tttttgaattaaaactagcggaaaagaataaaatgtgtaacag 90254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University