View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16573_high_1 (Length: 598)

Name: NF16573_high_1
Description: NF16573
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16573_high_1
NF16573_high_1
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (20-584)||(2982814-2983381)
chr6 (111-587)||(2937502-2937978)
chr6 (45-575)||(2964485-2965015)
chr6 (47-587)||(2973985-2974525)
chr6 (86-542)||(2658590-2659052)
chr6 (47-587)||(3003344-3003878)
chr6 (47-587)||(2951917-2952454)
chr6 (47-587)||(2927135-2927678)
chr6 (47-587)||(2934577-2935117)
chr6 (230-587)||(2929470-2929827)
chr6 (83-587)||(2996933-2997452)
chr6 (230-373)||(2978408-2978550)
chr6 (370-540)||(2979192-2979359)
chr6 (274-365)||(2954546-2954637)
chr6 (429-476)||(2985688-2985735)
chr6 (349-385)||(2985662-2985698)
[»] scaffold0024 (4 HSPs)
scaffold0024 (126-587)||(34802-35263)
scaffold0024 (274-540)||(44538-44804)
scaffold0024 (406-465)||(37984-38043)
scaffold0024 (237-278)||(45120-45161)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (231-584)||(3339187-3339540)
chr7 (142-179)||(3339092-3339129)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (230-539)||(49613597-49613906)
chr3 (87-476)||(49618436-49618819)
chr3 (121-154)||(49613494-49613527)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 584
Target Start/End: Original strand, 2982814 - 2983381
Alignment:
Q  20 ttcaagttccatatacaaaagtgttccttcttttcttgaactcactatccattactttcaacatttcaataaatcgaacttgtatttagatgatggtcat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| || |||| ||| ||| ||||| ||    
T  2982814 ttcatgttccatatacaaaagtgttccttcttttcttgaactcactatccattactttaaaaaattgaataaatcaaaattgtcttttgataatggtgat 2982913  T
Q  120 attagtataagtcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggccgagtagagtcgacatcgacaaacggataatac 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  2982914 attagtataaggcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcaacatcctattgaaagtcggccgagtagagtcaagatcgaaaaacggataatac 2983013  T
Q  220 atataccgactgcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttct 319  Q
    |||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2983014 atatacagactgcaactcagttggtagaagctggagttaggtttcaagtgaaaactaaaagtaagtgtttatatgacttgaggttttcgggaggagttct 2983113  T
Q  320 tcaaattcctcaattaacagttgacaattg---gaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatatt 416  Q
    | ||||||||||||||| |||| |  || |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  2983114 tgaaattcctcaattaatagttcatgatcggacgaccgaaattttgtttcggaatatgattgctttggagcattgtcattaccctcatgagtcatatatt 2983213  T
Q  417 catgattatgttgttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtc 516  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2983214 cttgattatgttcttgttttggattaccttataaataatggtaaggatgtggatgtacttattcagaagcaaatactagaaaacttgcttggagacggtc 2983313  T
Q  517 aatctgtggctatcttgtttaatggttttgccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttc 584  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  || || | ||||| ||||||| |||||||    
T  2983314 aatctatggctatcttgtttaatggtctttgcaaaaatgttgtaaaatctaaactcagttatcatttc 2983381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 111 - 587
Target Start/End: Original strand, 2937502 - 2937978
Alignment:
Q  111 gatggtcatattagtataagtcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggccgagtagagtcgacatcgacaaac 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||    
T  2937502 gatggtgatattagtataagtcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcaacatcctattgaaagtcggccgagtagagaagcgatcgacgaac 2937601  T
Q  211 ggataatacatataccgactgcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcagg 310  Q
     |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  2937602 agataatacatctaccgagtgcaactgagttgttagaagctggagttaggtttaaagtgaacactgaaagtaattgtttacttgacttgagattttcagg 2937701  T
Q  311 aggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtca 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2937702 aggagttcttgaaattcctcaattaacagttgaggattcgaccgaaattttgttttggaatatggttgctttggagcagtgtcattaccctcatgagtca 2937801  T
Q  411 tatattcatgattatgttgttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggag 510  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| |   ||   ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2937802 tatattgctgattatgttgttgttttggattaccttataaataccggtaaggatgcgggtatacttgtttggaacaaaatactggaaaattggcttggag 2937901  T
Q  511 acagtcaatctgtggctatcttgtttaatggttttgccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttctct 587  Q
    ||||| | ||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||  || || ||||| || |||||||||| ||||||    
T  2937902 acagtgattctgtggctaatttgtttaatggtctttgcaaaaatgttgtatattctgatatcagttctcaattctct 2937978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 45 - 575
Target Start/End: Original strand, 2964485 - 2965015
Alignment:
Q  45 ccttcttttcttgaactcactatccattactttcaacatttcaataaatcgaacttgtatttagatgatggtcatattagtataagtcacttcactgatc 144  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||| ||| |  ||| ||||||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2964485 ccttcttttcttaaactcactactgattattttgattattacaataaatcaaaattggattttgataagggtgatattagtataaggcacttcactgatc 2964584  T
Q  145 tgattaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggccgagtagagtcgacatcgacaaacggataatacatataccgactgcaaccgagttgtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  2964585 tgattaggatatttcatttgcaacatcctattgaaaatcggccgagtagagacaacatcaacaaacagataatacatctacctagtgcaactgagttgtt 2964684  T
Q  245 tgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgac 344  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||    
T  2964685 agaagctggagttaggtttaaagtgaacactgaaagtaagtgtttacttgacttgaggttttcgggaggagttcttgaaattcctcaattaatagctcac 2964784  T
Q  345 aattggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattacc 444  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2964785 gatgggaccgaaattatgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcgttacccttatgagtcatatattactgactatgttgctgttttggattacc 2964884  T
Q  445 ttataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatcttgtttaatggttt 544  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||   ||||||| |||||   ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |    
T  2964885 ttataaatactggcaaggatgtggatatacttgttcagaacaaaatactggaaaatatgcttggagatagtgattctgtggctaacttgtttaatggtct 2964984  T
Q  545 tgccaaaaaatttatacattctaatctcagt 575  Q
    | ||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  2964985 ttccaaatatgttatacattctaatatcagt 2965015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 587
Target Start/End: Original strand, 2973985 - 2974525
Alignment:
Q  47 ttcttttcttgaactcactatccattactttcaacatttcaataaatcgaacttgtatttagatgatggtcatattagtataagtcacttcactgatctg 146  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| | || |||  ||| ||| |   | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  2973985 ttcttttcttaaactcactattgcttactttcaatgtttcaataaaccaaaattgggttttgataacaatgatattagtataatgcacttcaatgatctg 2974084  T
Q  147 attaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggccgagtagagtcgacatcgacaaacggataatacatataccgactgcaaccgagttgtttg 246  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||  |||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||| |    
T  2974085 attaggatatttcatttgaaacatcctattgaaagtaggccgagtagagagcagatcgatgaacaaataatacatctaccgagtgcaactgagttgttag 2974184  T
Q  247 aagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaa 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |    
T  2974185 aagctggagttaggtttaaagtgaacactaaaagtgaatgtttacatgacttgaggttttcgggaggagttcttgaaattcctcaattaacagttcaaga 2974284  T
Q  347 ttggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattacctt 446  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  | || ||||||||||||||    
T  2974285 tgggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattattgattatcattttattttggattacctt 2974384  T
Q  447 ataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatcttgtttaatggttttg 546  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |   |||  | |||||  |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  2974385 ataaatactagtacggatgtggatatacttgttcggagcaatatactgcaaaattggcttggagacagtgattctgttgctatcttatttaatggtcttg 2974484  T
Q  547 ccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttctct 587  Q
       ||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  2974485 gagaaaatattacaaattctaatatcagttctcatttctct 2974525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 86 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 2659052 - 2658590
Alignment:
Q  86 caataaatcgaacttgtatttagatgatggtcatattagtataagtcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcgg 185  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||     
T  2659052 caataaatcaaacttgttttttgataatggtgatattagtataatgcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcaacttcctattgaaattcga 2658953  T
Q  186 ccgagtagagtcgacatcgacaaacggataatacatataccgactgcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagt 285  Q
    |||||||    ||  | |||| ||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  2658952 ccgagtaataacgcgaccgacgaacggatgatacatctaccgagtgcaactgagttgttagaagctggagttaggtttaaagtgagcactaaaagtaagt 2658853  T
Q  286 gtttatatgacttgaggttttca------ggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcggaatatggttgc 379  Q
    |||||  ||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2658852 gtttacttgacttgaggttttcaaaatcaggaggagttcttgaaattcctcaattaacggttgacgataggactgaaattttgtttcgaaatatggttgc 2658753  T
Q  380 tttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgtacttata 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  2658752 tttggagcaatgtcattacccttatgagtcatatattactgattatgttgctgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatatacttgtt 2658653  T
Q  480 aagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatcttgtttaatggt 542  Q
       |   ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||    
T  2658652 ccaaacaaaatactggaaaattggcttggagacagtgattctgtggctaacttgtttactggt 2658590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 3003878 - 3003344
Alignment:
Q  47 ttcttttcttgaactcactatccattactttcaacatttcaataaatcgaacttgtatttagatgatggtcatattagtataagtcacttcactgatctg 146  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||    ||| ||||||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3003878 ttcttttcttaaactcactattcattattttggttattacaataaatcaaaattggattttgataagggtgatattagtataagtcacttcactgatctg 3003779  T
Q  147 attaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggccgagtagagtcgacatcgacaaacggataatacatataccgactgcaaccgagttgtttg 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      || ||  |||| | ||||  ||||| |||||| |||||||| |    
T  3003778 attaggatatttcatttgcaacatcctattgaaagtcggccgagtagagtca-----gagaat-ggatgaaacatccaccgagtgcaactgagttgttag 3003685  T
Q  247 aagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaa 346  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||   |    
T  3003684 aagctggagttagatttaaagtgaacactgaaagtaagtgtttacttgacttgaggttttcgggaggagttcttgaaattcctcaattattagttgcgga 3003585  T
Q  347 ttggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattacctt 446  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||   ||||||  |  ||||||||||||||||    
T  3003584 ttcgaccgaaactttatttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattaccctgatgattcatatattaccgattatcgttctgttttggattacctt 3003485  T
Q  447 ataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatcttgtttaatggttttg 546  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||| |||||   ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3003484 ataaatactgctaaggatgtggatatacttgttcagagcgaaatactggaaaatatgcttggagacagtgattctgtggctaacttgtttaatggtcttg 3003385  T
Q  547 ccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttctct 587  Q
     |||| |  |||||| |||||   |||||||||| ||||||    
T  3003384 gcaaagatattatacgttctacaatcagttctcaattctct 3003344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 587
Target Start/End: Original strand, 2951917 - 2952454
Alignment:
Q  47 ttcttttcttgaactcactatccattactttcaacatttcaataaatcgaacttgtatttagatgatggtcatattagtataagtcacttcactgatctg 146  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||    ||| ||||||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2951917 ttcttttcttaaactcactattcattattttggttattacaataaatcaaaattggattttgataagggtgatattagtataaggcacttcactgatctg 2952016  T
Q  147 attaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggccgagtagagtcgacatcgacaaacggataatacatataccgactgcaaccgagttgtttg 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||   | |||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |    
T  2952017 attaggatatttcatttgcaacatcctattgaaagtcggccgagtagagttg---taga---atggataaaacatctaccgagtgcaactgagttgttag 2952110  T
Q  247 aagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaa 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  2952111 aagctggagttaggtttaaagtgaacactgaaagtaagtgtttacttgacttgaggttttcggaaggagttcttgaaattcctcaattaaaagttcagga 2952210  T
Q  347 ttggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattacctt 446  Q
    ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2952211 ttcaaccgaaactttatttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattaccctgaggagtcatatattgctgattatgttgttgttttggattacatt 2952310  T
Q  447 ataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggaga---cagtcaatctgtggctatcttgtttaatggtt 543  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| |   |||||| |||||||| ||   |||||||||    ||| | |||||||||| |  ||||||||||     
T  2952311 ataaatactggtaccgatgtggatatacttgttcggagggatatactagataatatgcttggagaaagtagtgattctgtggctaacaggtttaatggta 2952410  T
Q  544 ttgccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttctct 587  Q
    ||  ||||||  || || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2952411 tttgcaaaaatgttgtatattctaatatcagttctcaattctct 2952454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 47 - 587
Target Start/End: Original strand, 2927135 - 2927678
Alignment:
Q  47 ttcttttcttgaactcactatccattactttcaacatttcaataaatcgaacttgtatttagatgatggtcatattagtataagtcacttcactgatctg 146  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||    ||| ||||||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2927135 ttcttttcttaaactcactattcattattttggttattacaataaatcaaaattgaattttgataagggtgatattattataaggcacttcactgatctg 2927234  T
Q  147 attaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggccgagtagagtcgacatcgacaaacggataata---catataccgactgcaaccgagttgt 243  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  |  | |||| |||   ||| |||||| |||||| |||||||    
T  2927235 attcggatatttcatttgcaacatcctattgaaagtcggccgagtagagaccgggtctgcctagggatgataaaacatctaccgagtgcaactgagttgt 2927334  T
Q  244 ttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttga 343  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  2927335 tagaagctggagttaggtttaaagtgaacactgaaagtaagtgtttacttgacttgaggttttcgggaggagttcttgaaattcctcaattaaaagttca 2927434  T
Q  344 caattggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattac 443  Q
      ||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||  |  |||||||||||||    
T  2927435 ggattcgactgaaactttattacggaatatggttgctttggagcagtgtcattaccctgatgattcatatattactgattatcgttctgttttggattac 2927534  T
Q  444 cttataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatcttgtttaatggtt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||   |||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||     
T  2927535 cttataaatactggtaaggatgtggatatacttgttcagagggaaatactggaaaatatgcttggagacggtgattctgtggctaacttgtttaatggtc 2927634  T
Q  544 ttgccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttctct 587  Q
    |||  |||||  ||| || |||||   |||||||||| ||||||    
T  2927635 ttggtaaaaatgttacacgttctacaatcagttctcaattctct 2927678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 587
Target Start/End: Original strand, 2934577 - 2935117
Alignment:
Q  47 ttcttttcttgaactcactatccattactttcaacatttcaataaatcgaacttgtatttagatgatggtcatattagtataagtcacttcactgatctg 146  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| |||    ||| ||||||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2934577 ttcttttcttagactcactattcattattttggttattacaataaatcaaaattggattttgataagggtgatattagtataaggcacttcactgatctg 2934676  T
Q  147 attaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggccgagtagagtcgacatcgacaaacggataatacatataccgactgcaaccgagttgtttg 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||||| ||| ||  |||  | ||||   |||||| || ||||| |    
T  2934677 attaggatatttcatttgcaacatcctattgaaagtcggccgagtagagacatgttcgacgaacagaagataagtctacccggtgcaactgaattgttag 2934776  T
Q  247 aagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaa 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  2934777 aagctggagttaggtttaaagtgaatactaaaagtaagtgtttacttgacttgaggttttcgggaggagttcttgaaattcctcaattaacggttgacga 2934876  T
Q  347 ttggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattacctt 446  Q
    | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||   ||||||||||| |||  |||||||||||    
T  2934877 taggactgaaatttcgtttcgaaatatggttgctttggagcagtgtcattaccctgatgattcatatatcactgattatgttgctgtcatggattacctt 2934976  T
Q  447 ataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatcttgtttaatggttttg 546  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||||| |   ||  ||||||||  | ||   |||||  || ||| | |||||||||| ||||||||||||| ||     
T  2934977 ataaatactggtacggatgctgatatacttgttcggaacgaaatactgcataatatgcttgcggatagtgattctgtggctaacttgtttaatggtcttt 2935076  T
Q  547 ccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttctct 587  Q
      |||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2935077 ggaaaaatgttacacaatctaatatcagttctcatttctct 2935117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 587
Target Start/End: Original strand, 2929470 - 2929827
Alignment:
Q  230 tgcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcct 329  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2929470 tgcaactgagttgttagaagctggagttaggtttaaagtgaacactaaaagtaagtgtttacttgacttaaggttttcaggaggagttcttgaaattcct 2929569  T
Q  330 caattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttg 429  Q
    |||||||||||||   || ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||     
T  2929570 caattaacagttgcagatgggaccgaaactttattttggaatatgattgctttggagcagtttcattaccctcatgagtcatatattcttgattatgtta 2929669  T
Q  430 ttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctat 529  Q
     | || ||||||  |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||     
T  2929670 ctattatggattttcttataaatactggtaaggacgccgatatacttattcagaaagaaatactggaaaattggtttggagacaatcattctgtggctaa 2929769  T
Q  530 cttgtttaatggttttgccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttctct 587  Q
    | ||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2929770 catgtttaatggtttttgcaaatatattatacattctaatatcagtcctcatttctct 2929827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 2997452 - 2996933
Alignment:
Q  83 tttcaataaatcgaacttgtatttagatgatggtcatattagtataagtcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagt 182  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |    
T  2997452 tttcaataaatcaaacttgttttttgatgatggtgatattagtataaggcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcaacatccctttgaaaat 2997353  T
Q  183 cggccgagtagagtcga---------------catcgacaaacggataatacatataccgactgcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaag 267  Q
    |||||| ||||| | ||               |||||   || ||||  ||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  2997352 cggccgggtagaattgatatcaaggatatcaacatcggtgaatggatgttacatctaccaagtgcaactgagttgttagaagctggagttaagtttaaag 2997253  T
Q  268 tgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcg 367  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||   ||||  |||||  || ||||||||  ||| |||||    
T  2997252 tgaacactaaaagcaagtgtttacttgacttgaggttttcgggagaagttcttgaaattccttcgttaattgttgaggatcggaccgaagctttatttcg 2997153  T
Q  368 gaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtg 467  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  ||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2997152 gaatatggttgctttggagcagtttcattacactaacaagttatatattactgattatgtttctgttttggattaccttataaacactggtaaggatgtt 2997053  T
Q  468 gatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatcttgtttaatggttttgccaaaaaatttatacattcta 567  Q
    ||| ||||| |  | |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  || |||  || ||||| | |    
T  2997052 gatatacttgttcacaaagaaatactggaaaattggcttggagacagtgattctgtggctaacttgtttaatggtctttgcataaatgttgtacatacca 2996953  T
Q  568 atctcagttctcatttctct 587  Q
    || |||||||||| ||||||    
T  2996952 atatcagttctcaattctct 2996933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 373
Target Start/End: Original strand, 2978408 - 2978550
Alignment:
Q  230 tgcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcct 329  Q
    |||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2978408 tgcaactgaattgttagaagctgga-ttaggtttaaagtgaacactaaaagtgagtgtttacttgatttgaggttttcgggaggagttcttgaaattcct 2978506  T
Q  330 caattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcggaatat 373  Q
    ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  2978507 caattaagagttgaggatgggaccgaaattttgtttcggtatat 2978550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 540
Target Start/End: Original strand, 2979192 - 2979359
Alignment:
Q  370 atatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtgga 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||   |||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2979192 atatggttgctttggagcagtgttattaccctcatgagtcatatattactgatta---tgttgtcttcgattaccttataaataccggtacggatgtgga 2979288  T
Q  470 tgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatcttgtttaatg 540  Q
    | ||||| |   |||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||    
T  2979289 tatacttgttcggagcaaaatactggaaaatttgcttggagacagtcattctgctgctaaattgtttaatg 2979359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 365
Target Start/End: Original strand, 2954546 - 2954637
Alignment:
Q  274 ctaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaattggaccgaaattttgttt 365  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  2954546 ctaaaagtgagtgtttacttgacttgaggttttcacaacgagttcttggaattcctcaattaagagttgatgatcagaccgatattttgttt 2954637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 476
Target Start/End: Original strand, 2985688 - 2985735
Alignment:
Q  429 gttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgtactt 476  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2985688 gttgctttggattaccttataaatactagtaaggatgcggatatactt 2985735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 349 - 385
Target Start/End: Original strand, 2985662 - 2985698
Alignment:
Q  349 ggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttgga 385  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2985662 ggaccaaaattttgtttcagaatatggttgctttgga 2985698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 126 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 35263 - 34802
Alignment:
Q  126 ataagtcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggccgagtagagtcgacatcgacaaacggataatacatatac 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | | |||||| ||| |||||||||| |||    
T  35263 ataaggcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcaacatcctattgaaagtcagccaagtagagacaagatcgacgaacagataatacatctac 35164  T
Q  226 cgactgcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaat 325  Q
    ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||    
T  35163 cgagtgcaactcagttgttagaagctggagttaggtttcaagtgaagcctaaaagtgagtgtttacttgacttggggttttcggaaggagtgcttgaaat 35064  T
Q  326 tcctcaattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattat 425  Q
    ||||| ||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  35063 tcctcgattagaagttgaggatgggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatgagtcatatattactgattat 34964  T
Q  426 gttgttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtgg 525  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||  ||||||||    || | ||||||||||||| | |||||||    
T  34963 gttgttgttttggatttccttataaatactggtaaggatgcggatatacttgttcggaaagaaatactgactaatttgcttggagacagtgattctgtgg 34864  T
Q  526 ctatcttgtttaatggttttgccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttctct 587  Q
    ||| |||||||||| || ||  ||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  34863 ctaacttgtttaatcgtctttgcaaaaatgttatacatcataatatcagttctcatttctct 34802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 274 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 44804 - 44538
Alignment:
Q  274 ctaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcggaatat 373  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||  ||    | |||||||||||| | |||||    
T  44804 ctaaaagtgagtgtttacttgatttgaggttttcagaaagagttcttgaaattcctcaattaagagctgatgatcaacctgaaattttgttttgaaatat 44705  T
Q  374 ggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgta 473  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||| || | |||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  44704 ggttgctatggagtagtatcattaccctaatgaatcatatattattaattatgttgctattttggattaccttataaatactggtaaggatgcagatata 44605  T
Q  474 cttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatcttgtttaatg 540  Q
    | | |   |||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  44604 catgttcggagcaaaatactggaaaatttgcttggagacagtcattatgtggctaatttgtttaatg 44538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 465
Target Start/End: Original strand, 37984 - 38043
Alignment:
Q  406 agtcatatattcatgattatgttgttgttttggattaccttataaatactggtaaggatg 465  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  37984 agtcatatattattgattaggttgttgttttatatcaccttataaatactggtaaggatg 38043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45161 - 45120
Alignment:
Q  237 gagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45161 gagttgttagaagctggagttaggtttcaagtgaccactaaa 45120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 231 - 584
Target Start/End: Original strand, 3339187 - 3339540
Alignment:
Q  231 gcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctc 330  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3339187 gcaactgagttgttagaagcaggagttaggtttaaagtgaacactaaaagtgagtgtttacttggcttgaggttttcgggaggagttcttgaaattcctc 3339286  T
Q  331 aattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgt 430  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||     
T  3339287 aattaacagttgacgatgggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattaccctgatgagtcatatattattgattatgttgc 3339386  T
Q  431 tgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctatc 530  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||      
T  3339387 ttttttggatttccttataaatactagtatggatgtggatatacttgttaagagcgaaatactagaaaattggcttgcagacagtgattctgtggctaaa 3339486  T
Q  531 ttgtttaatggttttgccaaaaaatttatacattctaatctcagttctcatttc 584  Q
    |||||||||||| ||  ||||||  |||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  3339487 ttgtttaatggtctttgcaaaaatgttatgcattctagtgtaagttctcatttc 3339540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Original strand, 3339092 - 3339129
Alignment:
Q  142 atctgattaggatatttcatttgcatcatcctattgaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3339092 atctgattaggatatttcatttgcaacatcctattgaa 3339129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 539
Target Start/End: Original strand, 49613597 - 49613906
Alignment:
Q  230 tgcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaagtgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcct 329  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  49613597 tgcaactgagttgttagaagctggggtgaggtttaaagtgaacactaaaagtgagtgtttacttgatttgaggttttcaggacgggttcttgaaattcct 49613696  T
Q  330 caattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttg 429  Q
    ||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||| || |||   ||||||||||    
T  49613697 caattgaaagttgaggattggactgaaattttgtttcggaatatggttgctttggagcaatgtcactaccctagtgagtcctacattacggattatgttg 49613796  T
Q  430 ttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgtacttataaagagggaaatactagaaaactggcttggagacagtcaatctgtggctat 529  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |  ||| | ||||||| |  || |||||||| || ||| | ||||||||||     
T  49613797 ctgttttggatttccttattaatactggcaaggatgtggatatacttgttcagaagaaaatactggtgaattggcttggggatagtgattctgtggctaa 49613896  T
Q  530 cttgtttaat 539  Q
    ||||||||||    
T  49613897 cttgtttaat 49613906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 476
Target Start/End: Original strand, 49618436 - 49618819
Alignment:
Q  87 aataaatcgaacttgtatttagatgatggtcatattagtataagtcacttcactgatctgattaggatatttcatttgcatcatcctattgaaagtcggc 186  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||    
T  49618436 aataaatcaaaattggattttgatgacggtgatattagtataaggcacttcactgatctgattaggatatttcatttggaacatcctattgaaaggcagc 49618535  T
Q  187 cgagtagagtc------gacatcgacaaacggataatacatataccgactgcaaccgagttgtttgaagctggagttaggtttcaagtgaacactaaaag 280  Q
    || ||||| ||      ||| ||||||||   || ||| || |||| |   | || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  49618536 cgggtagaatcatcatggacttcgacaaatctatgatatatctacccagcaccactgagttgttagaagctggagttaggtttaaagtgaacactaaaac 49618635  T
Q  281 tgagtgtttatatgacttgaggttttcaggaggagttcttcaaattcctcaattaacagttgacaattggaccgaaattttgtttcggaatatggttgct 380  Q
    |   ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |  |||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  49618636 tacatgtttacttgacttgaggttttccggacgagttcttgaaattcctcaattaagagttgaggaccggaccgtaactttattt-ggaatatggttgct 49618734  T
Q  381 ttggagcagtgtcattacccttatcagtcatatattcatgattatgttgttgttttggattaccttataaatactggtaaggatgtggatgtactt 476  Q
               |||||||||| || | || |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||    
T  49618735 -----------tcattaccctcatgattcctatatttatgattatatttctgttttggattaccttataaatatcggtagggatgcggatatactt 49618819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 154
Target Start/End: Original strand, 49613494 - 49613527
Alignment:
Q  121 ttagtataagtcacttcactgatctgattaggat 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49613494 ttagtataaggcacttcactgatctgattaggat 49613527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University