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Alignment Overview

Query: NF16585_low_16 (Length: 341)

Name: NF16585_low_16
Description: NF16585
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16585_low_16
NF16585_low_16
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (11-327)||(7151883-7152195)
chr4 (3-217)||(6864247-6864461)
chr4 (3-216)||(25184325-25184538)
chr4 (3-178)||(7703721-7703896)
chr4 (3-216)||(35020817-35021034)
chr4 (3-178)||(36493513-36493688)
chr4 (3-177)||(1815513-1815687)
chr4 (11-216)||(34361277-34361483)
chr4 (14-218)||(19440432-19440636)
chr4 (3-177)||(33341610-33341784)
chr4 (1-177)||(879373-879549)
chr4 (6-178)||(46887982-46888154)
chr4 (5-177)||(55477716-55477888)
chr4 (11-178)||(25700880-25701047)
chr4 (11-178)||(28002810-28002977)
chr4 (3-174)||(34947923-34948094)
chr4 (3-178)||(47253952-47254127)
chr4 (3-178)||(55240929-55241104)
chr4 (3-216)||(32912365-32912579)
chr4 (3-216)||(33816302-33816515)
chr4 (3-175)||(37663568-37663740)
chr4 (3-178)||(50697453-50697629)
chr4 (3-218)||(19089237-19089452)
chr4 (12-178)||(30002465-30002631)
chr4 (3-218)||(32579658-32579873)
chr4 (11-177)||(50764940-50765106)
chr4 (1-178)||(23761281-23761458)
chr4 (12-177)||(37775879-37776044)
chr4 (3-178)||(37287940-37288116)
chr4 (11-216)||(49376187-49376392)
chr4 (3-178)||(3042831-3043006)
chr4 (19-178)||(39400236-39400395)
chr4 (3-178)||(17167925-17168100)
chr4 (3-178)||(17173502-17173677)
chr4 (12-177)||(4598203-4598368)
chr4 (26-178)||(32592319-32592471)
chr4 (3-178)||(29584024-29584199)
chr4 (23-216)||(4205216-4205409)
chr4 (3-178)||(17272176-17272351)
chr4 (3-177)||(27396828-27397000)
chr4 (27-176)||(9139465-9139612)
chr4 (3-217)||(5047751-5047965)
chr4 (11-178)||(46883938-46884101)
chr4 (53-178)||(35025391-35025515)
chr4 (3-178)||(42199941-42200117)
chr4 (62-178)||(23431826-23431942)
chr4 (3-177)||(26896299-26896474)
chr4 (3-174)||(4934040-4934201)
chr4 (98-178)||(38012569-38012649)
chr4 (3-106)||(38012066-38012169)
chr4 (3-67)||(35025531-35025595)
chr4 (32-95)||(56050171-56050234)
chr4 (2-63)||(54499177-54499237)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (3-216)||(29173710-29173922)
chr7 (3-178)||(37703297-37703472)
chr7 (3-177)||(18797514-18797688)
chr7 (11-178)||(9355625-9355792)
chr7 (3-178)||(31520540-31520715)
chr7 (3-176)||(17842385-17842558)
chr7 (3-178)||(37347208-37347383)
chr7 (3-177)||(32820853-32821027)
chr7 (3-176)||(37110061-37110234)
chr7 (3-178)||(10359013-10359188)
chr7 (4-219)||(24211929-24212145)
chr7 (11-220)||(6546714-6546923)
chr7 (3-220)||(15612516-15612733)
chr7 (3-178)||(31578863-31579038)
chr7 (3-215)||(32432639-32432851)
chr7 (3-213)||(23111379-23111589)
chr7 (11-172)||(44411345-44411506)
chr7 (3-175)||(30055714-30055886)
chr7 (3-178)||(41764877-41765052)
chr7 (3-217)||(35353295-35353509)
chr7 (3-178)||(43925288-43925457)
chr7 (3-178)||(26980493-26980668)
chr7 (3-178)||(46480928-46481103)
chr7 (3-177)||(48928097-48928271)
chr7 (5-178)||(8861474-8861647)
chr7 (3-200)||(10481792-10481989)
chr7 (3-178)||(15672558-15672736)
chr7 (12-147)||(12165939-12166074)
chr7 (21-159)||(37704387-37704525)
chr7 (11-171)||(27283939-27284100)
chr7 (48-178)||(22687463-22687593)
chr7 (11-216)||(4583114-4583319)
chr7 (3-178)||(5657279-5657455)
chr7 (12-176)||(12390450-12390614)
chr7 (11-159)||(11071401-11071546)
chr7 (3-177)||(25691344-25691518)
chr7 (40-178)||(26587891-26588029)
chr7 (3-178)||(21991823-21991989)
chr7 (11-178)||(7334989-7335155)
chr7 (29-178)||(34361975-34362126)
chr7 (3-178)||(32593006-32593180)
chr7 (4-178)||(44598854-44599028)
chr7 (104-217)||(38258867-38258980)
chr7 (5-122)||(33688117-33688234)
chr7 (3-106)||(38053648-38053751)
chr7 (3-83)||(38258732-38258812)
chr7 (11-106)||(43686235-43686330)
chr7 (3-67)||(48928474-48928538)
chr7 (3-47)||(37704344-37704388)
chr7 (142-177)||(12166215-12166250)
chr7 (59-135)||(27421207-27421283)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (3-216)||(32216263-32216476)
chr1 (3-217)||(2959956-2960170)
chr1 (3-176)||(16415854-16416027)
chr1 (3-178)||(37451493-37451668)
chr1 (4-216)||(48353751-48353963)
chr1 (3-218)||(7078816-7079031)
chr1 (3-176)||(27266995-27267168)
chr1 (3-216)||(10922935-10923148)
chr1 (3-216)||(14758240-14758453)
chr1 (3-178)||(47279397-47279572)
chr1 (11-221)||(8222344-8222554)
chr1 (11-218)||(34012135-34012342)
chr1 (3-222)||(46931617-46931837)
chr1 (3-176)||(27227280-27227453)
chr1 (3-178)||(238306-238481)
chr1 (14-177)||(3535142-3535305)
chr1 (3-178)||(11742161-11742336)
chr1 (3-177)||(23999555-23999730)
chr1 (11-178)||(28564576-28564743)
chr1 (3-178)||(28769861-28770036)
chr1 (3-177)||(30254631-30254805)
chr1 (5-216)||(32267244-32267455)
chr1 (5-219)||(27532734-27532947)
chr1 (3-178)||(27763103-27763279)
chr1 (15-178)||(15168316-15168479)
chr1 (3-176)||(19899563-19899737)
chr1 (3-176)||(27563700-27563873)
chr1 (3-221)||(47682244-47682462)
chr1 (3-178)||(3309361-3309537)
chr1 (3-178)||(9902847-9903022)
chr1 (3-177)||(38823422-38823596)
chr1 (3-176)||(4330489-4330662)
chr1 (3-220)||(22170919-22171136)
chr1 (11-178)||(51129075-51129240)
chr1 (11-177)||(25160848-25161015)
chr1 (11-216)||(15383149-15383355)
chr1 (3-176)||(10181802-10181976)
chr1 (11-162)||(1359744-1359895)
chr1 (11-218)||(15752245-15752452)
chr1 (3-177)||(39393592-39393766)
chr1 (40-178)||(1547516-1547654)
chr1 (11-171)||(30326751-30326912)
chr1 (24-176)||(21289829-21289981)
chr1 (16-176)||(41926378-41926537)
chr1 (16-143)||(37618729-37618856)
chr1 (3-178)||(31621341-31621522)
chr1 (3-160)||(40885021-40885178)
chr1 (11-177)||(42721255-42721418)
chr1 (32-178)||(31962853-31963000)
chr1 (3-157)||(18422859-18423006)
chr1 (1-216)||(33725366-33725570)
chr1 (6-108)||(38759744-38759846)
chr1 (122-216)||(48620916-48621010)
chr1 (12-73)||(48620845-48620906)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (3-216)||(46297522-46297735)
chr3 (3-176)||(11357181-11357354)
chr3 (3-216)||(22622478-22622691)
chr3 (11-216)||(26941020-26941225)
chr3 (12-216)||(40552019-40552223)
chr3 (3-178)||(48355144-48355319)
chr3 (3-177)||(1089897-1090070)
chr3 (3-176)||(53228952-53229125)
chr3 (3-178)||(24707913-24708088)
chr3 (3-217)||(33378544-33378758)
chr3 (3-176)||(52040722-52040895)
chr3 (3-215)||(39282855-39283067)
chr3 (3-217)||(4015663-4015876)
chr3 (3-175)||(42505876-42506048)
chr3 (3-178)||(33698356-33698531)
chr3 (11-178)||(44186315-44186482)
chr3 (3-177)||(7327281-7327455)
chr3 (12-178)||(29099558-29099724)
chr3 (3-219)||(21009558-21009775)
chr3 (3-178)||(54506010-54506186)
chr3 (3-214)||(47481725-47481937)
chr3 (3-177)||(24488761-24488935)
chr3 (3-177)||(44891700-44891874)
chr3 (11-217)||(51212536-51212736)
chr3 (3-176)||(3362458-3362631)
chr3 (16-178)||(22451184-22451346)
chr3 (3-216)||(37157910-37158124)
chr3 (3-216)||(37203270-37203484)
chr3 (15-216)||(43975652-43975856)
chr3 (3-178)||(2008135-2008317)
chr3 (5-218)||(21193812-21194025)
chr3 (19-178)||(14586478-14586636)
chr3 (3-153)||(34133138-34133288)
chr3 (5-176)||(22445865-22446036)
chr3 (3-178)||(40936176-40936351)
chr3 (5-216)||(11356918-11357121)
chr3 (3-216)||(32373673-32373885)
chr3 (3-177)||(4761447-4761621)
chr3 (3-177)||(25579942-25580116)
chr3 (3-216)||(36012341-36012556)
chr3 (3-153)||(38591901-38592051)
chr3 (3-147)||(46994490-46994634)
chr3 (12-177)||(29164021-29164179)
chr3 (11-178)||(50475022-50475196)
chr3 (11-178)||(3654997-3655167)
chr3 (11-178)||(20373061-20373209)
chr3 (11-131)||(54828546-54828666)
chr3 (3-170)||(27480164-27480339)
chr3 (3-216)||(11467027-11467226)
chr3 (19-115)||(45174725-45174821)
chr3 (3-106)||(43348460-43348563)
chr3 (3-115)||(11835494-11835600)
chr3 (5-113)||(53811597-53811701)
chr3 (130-178)||(35844577-35844625)
chr3 (142-178)||(43348556-43348592)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (3-176)||(699362-699535)
chr5 (14-221)||(22255405-22255612)
chr5 (3-177)||(22981005-22981179)
chr5 (3-178)||(24886299-24886474)
chr5 (15-177)||(35826275-35826437)
chr5 (3-178)||(31705400-31705575)
chr5 (11-178)||(31786434-31786601)
chr5 (3-212)||(2888199-2888408)
chr5 (11-216)||(35511232-35511437)
chr5 (3-216)||(38527987-38528200)
chr5 (12-221)||(42342942-42343151)
chr5 (3-178)||(15992328-15992503)
chr5 (11-176)||(5830112-5830278)
chr5 (3-177)||(22973871-22974045)
chr5 (12-178)||(25669797-25669963)
chr5 (14-176)||(25889593-25889755)
chr5 (3-216)||(33908445-33908657)
chr5 (11-216)||(40133605-40133810)
chr5 (11-178)||(8437185-8437352)
chr5 (3-178)||(19120071-19120246)
chr5 (3-177)||(7208653-7208827)
chr5 (12-178)||(9200445-9200611)
chr5 (3-178)||(5837767-5837942)
chr5 (3-178)||(35504577-35504752)
chr5 (3-218)||(17157779-17157994)
chr5 (12-178)||(22019844-22020010)
chr5 (26-178)||(8741673-8741825)
chr5 (4-176)||(12910568-12910740)
chr5 (3-216)||(14409091-14409304)
chr5 (11-216)||(36866982-36867187)
chr5 (11-177)||(36860644-36860810)
chr5 (40-178)||(39573060-39573198)
chr5 (12-177)||(7693442-7693607)
chr5 (3-178)||(27330516-27330691)
chr5 (3-178)||(35934108-35934283)
chr5 (3-178)||(23116018-23116185)
chr5 (11-222)||(25500670-25500881)
chr5 (3-177)||(27318277-27318450)
chr5 (3-214)||(13956116-13956325)
chr5 (3-178)||(15724700-15724875)
chr5 (3-177)||(30969113-30969287)
chr5 (12-178)||(32563361-32563527)
chr5 (48-178)||(28416339-28416469)
chr5 (3-142)||(1428983-1429125)
chr5 (11-177)||(21088558-21088721)
chr5 (19-178)||(43308448-43308607)
chr5 (3-177)||(8466939-8467112)
chr5 (3-216)||(23954552-23954752)
chr5 (3-178)||(14919327-14919491)
chr5 (90-176)||(43254154-43254240)
chr5 (51-178)||(26269069-26269196)
chr5 (26-118)||(6824329-6824420)
chr5 (3-60)||(26268286-26268343)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (11-217)||(41961060-41961266)
chr2 (3-221)||(44913876-44914097)
chr2 (3-216)||(11366158-11366372)
chr2 (3-216)||(18494059-18494272)
chr2 (11-178)||(7006754-7006921)
chr2 (3-177)||(4763843-4764017)
chr2 (11-177)||(26357797-26357963)
chr2 (3-216)||(2325156-2325369)
chr2 (13-216)||(33660155-33660358)
chr2 (11-216)||(4167142-4167347)
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chr2 (11-178)||(31862072-31862239)
chr2 (3-178)||(13711671-13711846)
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chr2 (33-178)||(41051116-41051260)
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chr2 (72-177)||(41463407-41463512)
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chr2 (79-178)||(18257354-18257453)
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chr2 (3-84)||(18258197-18258278)
chr2 (1-65)||(41463779-41463843)
chr2 (120-162)||(17053963-17054005)
chr2 (120-162)||(17071604-17071646)
chr2 (1-46)||(19424576-19424621)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (3-216)||(16446641-16446854)
chr8 (3-178)||(1953792-1953967)
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chr8 (11-177)||(34895181-34895347)
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chr8 (19-174)||(466059-466214)
chr8 (3-177)||(1205138-1205312)
chr8 (18-221)||(35859160-35859363)
chr8 (3-177)||(39098924-39099098)
chr8 (11-178)||(8803620-8803788)
chr8 (3-178)||(35459515-35459690)
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chr8 (19-178)||(34951861-34952020)
chr8 (3-178)||(36694770-36694945)
chr8 (3-178)||(44869708-44869883)
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chr8 (40-177)||(24823199-24823336)
chr8 (3-178)||(40862630-40862806)
chr8 (5-217)||(12876323-12876535)
chr8 (13-146)||(1149756-1149889)
chr8 (3-216)||(30654349-30654562)
chr8 (11-177)||(10555010-10555175)
chr8 (11-178)||(31933690-31933857)
chr8 (3-153)||(9864359-9864509)
chr8 (48-178)||(33198058-33198188)
chr8 (34-178)||(18259321-18259465)
chr8 (93-178)||(41362723-41362808)
chr8 (92-177)||(43025974-43026059)
chr8 (3-106)||(13307834-13307936)
chr8 (22-113)||(34463704-34463792)
chr8 (11-62)||(43025921-43025972)
chr8 (11-76)||(41910895-41910959)
chr8 (11-67)||(7998497-7998553)
chr8 (144-178)||(13307931-13307965)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (3-216)||(3879698-3879911)
chr6 (5-216)||(6090941-6091152)
chr6 (3-177)||(1946046-1946221)
chr6 (15-219)||(20768306-20768510)
chr6 (12-178)||(33892809-33892975)
chr6 (3-216)||(5627603-5627817)
chr6 (3-178)||(7234829-7235007)
chr6 (3-177)||(21016916-21017084)
chr6 (3-171)||(4318626-4318794)
chr6 (3-178)||(8513440-8513608)
chr6 (3-178)||(29182376-29182548)
chr6 (3-178)||(6089115-6089283)
chr6 (15-177)||(33619049-33619219)
chr6 (51-178)||(7054569-7054697)
chr6 (3-77)||(30353256-30353330)
chr6 (117-172)||(33724062-33724117)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (3-178)||(408227-408402)
scaffold0002 (3-178)||(346-515)
scaffold0002 (20-177)||(93900-94056)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (3-177)||(12121-12294)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (3-175)||(8099-8271)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (3-222)||(145769-145989)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (11-178)||(44176-44343)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (11-178)||(154444-154611)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (5-178)||(267499-267663)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (12-136)||(100948-101058)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7152195 - 7151883
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7152195 atcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 7152096  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||    ||| || ||||||    
T  7152095 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaaataactttttcaaaaaagtcagtttt----ctgcactgtataa 7152000  T
Q  211 gctcccattttagaattctaacatgattgggtaatggtcagatttatgcctaacgatattcaaaatttggcttgttacctctttttccttagtttagttg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7151999 gctcccattttagaattctaacatgattgggtaatggtcagatttatgcctaacaatattcaaagtttggcttgttacctctttttccttagtttagttg 7151900  T
Q  311 aaaccctgacccttttt 327  Q
    |||||||||||||||||    
T  7151899 aaaccctgacccttttt 7151883  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 6864247 - 6864461
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  6864247 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagat 6864346  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||| |    
T  6864347 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgca 6864446  T
Q  203 ccgtataagctccca 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  6864447 ccgtagaagctccca 6864461  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 25184325 - 25184538
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25184325 ttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 25184424  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |    
T  25184425 gaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgca 25184524  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    || || ||||||||    
T  25184525 ccatagaagctccc 25184538  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 7703721 - 7703896
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  7703721 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagat 7703820  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7703821 gaattactatttatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 7703896  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35021034 - 35020817
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  35021034 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagat 35020935  T
Q  103 gaattac----tattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgac 198  Q
    |||||||    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||    
T  35020934 gaattactatatattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaagagtcagttttctgac 35020835  T
Q  199 tgtaccgtataagctccc 216  Q
    |  |||||| ||||||||    
T  35020834 tacaccgtagaagctccc 35020817  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36493688 - 36493513
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||    
T  36493688 ttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattgcaagcattactcgat 36493589  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36493588 gaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttc 36493513  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 1815513 - 1815687
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  1815513 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattactagat 1815612  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1815613 gaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 1815687  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34361483 - 34361277
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaat-tac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  34361483 atcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatac 34361384  T
Q  110 tattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtata 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |||||| |    
T  34361383 tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtaga 34361284  T
Q  210 agctccc 216  Q
    |||||||    
T  34361283 agctccc 34361277  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19440636 - 19440432
Alignment:
Q  14 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19440636 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 19440537  T
Q  114 gatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataagct 213  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  19440536 gatcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagct 19440437  T
Q  214 cccat 218  Q
    |||||    
T  19440436 cccat 19440432  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 33341610 - 33341784
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  33341610 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagat 33341709  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33341710 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttt 33341784  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 879549 - 879373
Alignment:
Q  1 atttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  879549 atttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactag 879450  T
Q  101 atgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  879449 atgaattattattgatcattaataagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 879373  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46888154 - 46887982
Alignment:
Q  6 agacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaa 105  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  46888154 agactatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatgaa 46888055  T
Q  106 ttactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  46888054 ttactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttc 46887982  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 55477888 - 55477716
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  55477888 aagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 55477789  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  55477788 attactattaatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 55477716  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25701047 - 25700880
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25701047 atcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagattttgcaagcattgttagatgaattact 25700948  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25700947 attgatcattaatcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 25700880  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28002977 - 28002810
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||    
T  28002977 atcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgctaacattactagatgaattact 28002878  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28002877 attgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttc 28002810  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34948094 - 34947923
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34948094 ttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 34947995  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactt 174  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34947994 gaaatactattgatcgttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 34947923  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 47253952 - 47254127
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  47253952 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagat 47254051  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  47254052 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttc 47254127  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 55241104 - 55240929
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  55241104 ttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagat 55241005  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  55241004 aaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaatttttc 55240929  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32912579 - 32912365
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32912579 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 32912480  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||       ||||||| |||||||     
T  32912479 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgc 32912380  T
Q  202 accgtataagctccc 216  Q
    |||||| ||||||||    
T  32912379 accgtaaaagctccc 32912365  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33816515 - 33816302
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  33816515 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagat 33816416  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  33816415 gaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgca 33816316  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
     |||| ||||||||    
T  33816315 tcgtagaagctccc 33816302  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37663740 - 37663568
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37663740 ttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 37663641  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  37663640 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 37663568  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 50697453 - 50697629
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgca-tgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattaga 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  50697453 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgttgtaagcattactaga 50697552  T
Q  102 tgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  50697553 tgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttc 50697629  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19089452 - 19089237
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19089452 ttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 19089353  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||       ||| ||| ||||||| |    
T  19089352 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtcaatttcctgactgca 19089253  T
Q  203 ccgtataagctcccat 218  Q
    ||||| ||||||||||    
T  19089252 ccgtagaagctcccat 19089237  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30002631 - 30002465
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30002631 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 30002532  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30002531 ttgatcattaatcagtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 30002465  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 32579658 - 32579873
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  32579658 ttaagactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagat 32579757  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||       |||||||||| |||| |    
T  32579758 gaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttttctaactgca 32579857  T
Q  203 ccgtataagctcccat 218  Q
    ||||| || |||||||    
T  32579858 ccgtagaaactcccat 32579873  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 50764940 - 50765106
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  50764940 atcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattact 50765039  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50765040 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 50765106  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 23761281 - 23761458
Alignment:
Q  1 atttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattag 100  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23761281 atttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactag 23761380  T
Q  101 atgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23761381 atgaattattattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 23761458  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 37775879 - 37776044
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37775879 tcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 37775978  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37775979 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaacttttt 37776044  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 37287940 - 37288116
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37287940 ttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagat 37288039  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga-tgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37288040 gaattactattgagcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatttaaaattaactttttc 37288116  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 49376187 - 49376392
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||    
T  49376187 atcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgaaagcattactaaatgaattact 49376286  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  49376287 attgatcattaatcagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaa 49376386  T
Q  211 gctccc 216  Q
    ||||||    
T  49376387 gctccc 49376392  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 3042831 - 3043006
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  3042831 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaagcattactagat 3042930  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3042931 gaattagtattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 3043006  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 39400236 - 39400395
Alignment:
Q  19 atatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatca 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39400236 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattgatca 39400335  T
Q  119 ttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39400336 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 39400395  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 17167925 - 17168100
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  17167925 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagat 17168024  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  17168025 gaattactatttatcattaattagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttc 17168100  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 17173502 - 17173677
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  17173502 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagat 17173601  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  17173602 gaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttc 17173677  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 4598203 - 4598368
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4598203 tcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaagcattattagattaattacta 4598302  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4598303 ttgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacatttt 4598368  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 178
Target Start/End: Original strand, 32592319 - 32592471
Alignment:
Q  26 caactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatca 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  32592319 caactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagcattactaaatgaattactattgatcgttaatca 32592418  T
Q  126 ataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32592419 ataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 32592471  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29584199 - 29584024
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29584199 ttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 29584100  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29584099 gaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 29584024  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 4205216 - 4205409
Alignment:
Q  23 catcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||    
T  4205216 catcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaa 4205315  T
Q  123 tcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataagctccc 216  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||       |||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  4205316 taagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtagaagctccc 4205409  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 17272176 - 17272351
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17272176 ttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 17272275  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17272276 gaattactattgatcattaatcggtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 17272351  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 27396828 - 27397000
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  27396828 ttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttgcaagcattactagat 27396927  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27396928 gaattactattgatcattaat--gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27397000  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Original strand, 9139465 - 9139612
Alignment:
Q  27 aactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9139465 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagacgaattactattgatcattaatcaa 9139564  T
Q  127 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9139565 taatc--taatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 9139612  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5047965 - 5047751
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||||    
T  5047965 ttaagactatcacatgatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagttttactagat 5047866  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||       || |||| ||||||| |    
T  5047865 aaattattattgatcagtaatcaacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtctgtttcctgactgca 5047766  T
Q  203 ccgtataagctccca 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  5047765 ccgtaaaagctccca 5047751  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46884101 - 46883938
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  46884101 atcacataatatcataaattttgtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagtat--gtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattact 46884006  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  46884005 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaataaaaattaattttttc 46883938  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025391
Alignment:
Q  53 aacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaa 152  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
Q  153 acattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  35025415 acattaa-atcaaaattaactttttc 35025391  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 42199941 - 42200117
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatc-tgtaagtccaagattttgcaagcattattaga 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42199941 ttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 42200040  T
Q  102 tgaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  42200041 tgaatatactactgttcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaaaat-caaattaactttttc 42200117  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 178
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431942
Alignment:
Q  62 atagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga 161  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaaaa 23431925  T
Q  162 tgaaaattaactttttc 178  Q
    | |||||||||||||||    
T  23431926 ttaaaattaactttttc 23431942  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 26896299 - 26896474
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtcc-aagattttgcaagcattattaga 101  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||| || || |||||| ||||| ||||    
T  26896299 ttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa-atttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttgcaaacattactaga 26896397  T
Q  102 tgaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26896398 tgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaacttttt 26896474  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4934201 - 4934040
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||           || ||||| |||||| |||||    
T  4934201 ttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct-----------atgttgcacgcattaatagat 4934113  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactt 174  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4934112 gaatttctattaatcattaatcagtaatcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaattaactt 4934040  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 178
Target Start/End: Original strand, 38012569 - 38012649
Alignment:
Q  98 tagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38012569 tagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttc 38012649  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 38012066 - 38012169
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  38012066 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatattactagat 38012165  T
Q  103 gaat 106  Q
    ||||    
T  38012166 gaat 38012169  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 35025595 - 35025531
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagta 67  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35025595 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagta 35025531  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Original strand, 56050171 - 56050234
Alignment:
Q  32 tgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcatt 95  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  56050171 tgtttgcatgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 54499237 - 54499177
Alignment:
Q  2 tttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaat 63  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  54499237 tttaagactatcacatgatattagtaactctgtttccatgttaaa-atgccaacgataaaat 54499177  T

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Target: chr7 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 29173710 - 29173922
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29173710 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 29173808  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |    
T  29173809 gaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgca 29173908  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
     |||| ||||||||    
T  29173909 tcgtagaagctccc 29173922  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37703472 - 37703297
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  37703472 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagat 37703373  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37703372 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttc 37703297  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 18797514 - 18797688
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18797514 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 18797613  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18797614 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 18797688  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9355792 - 9355625
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  9355792 atcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgct 9355693  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9355692 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 9355625  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31520715 - 31520540
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  31520715 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactcgat 31520616  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31520615 gaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttc 31520540  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17842558 - 17842385
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17842558 ttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagat 17842459  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17842458 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 17842385  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 37347208 - 37347383
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  37347208 ttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaagcattactcgat 37347307  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37347308 gaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttc 37347383  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32821027 - 32820853
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  32821027 ttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagat 32820928  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32820927 gaattactattaatcattcatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 32820853  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 37110061 - 37110234
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37110061 ttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 37110160  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37110161 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 37110234  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10359188 - 10359013
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  10359188 ttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactaaat 10359089  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10359088 gatttactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaattaactttttc 10359013  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Original strand, 24211929 - 24212145
Alignment:
Q  4 taagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatg 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24211929 taagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatg 24212028  T
Q  104 aat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  24212029 aatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgca 24212128  T
Q  203 ccgtataagctcccatt 219  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  24212129 ccgtagaagctctcatt 24212145  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 6546714 - 6546923
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  6546714 atcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaagcattactagatgaattact 6546813  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| |||||| ||    
T  6546814 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaa 6546913  T
Q  211 gctcccattt 220  Q
    ||||||||||    
T  6546914 gctcccattt 6546923  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15612733 - 15612516
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  15612733 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagat 15612634  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||        |||||||  |||||| |    
T  15612633 gaattattgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttaaaaaaagtcagtttcatgactgca 15612534  T
Q  203 ccgtataagctcccattt 220  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  15612533 ccgtagaagctcccattt 15612516  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31579038 - 31578863
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31579038 ttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 31578939  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  31578938 gaattactattgatcattaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaactttttc 31578863  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 32432639 - 32432851
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  32432639 ttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagat 32432738  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||        ||||||| ||||||| |    
T  32432739 gaattattattaatcatgaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgca 32432838  T
Q  203 ccgtataagctcc 215  Q
    ||||| |||||||    
T  32432839 ccgtagaagctcc 32432851  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 23111379 - 23111589
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||| |||||||| ||||     
T  23111379 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaagcattactagaa 23111478  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||        |||||||||||||||||    
T  23111479 gaattactattgatcataaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgta 23111578  T
Q  203 ccgtataagct 213  Q
    ||||| |||||    
T  23111579 ccgtagaagct 23111589  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44411506 - 44411345
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  44411506 atcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaat 44411407  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaac 172  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  44411406 attgaccattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatgaaacattaagatcataattaac 44411345  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 30055714 - 30055886
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30055714 ttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 30055813  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  30055814 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 30055886  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41765052 - 41764877
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41765052 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgcaagcattactggat 41764953  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41764952 gaattattattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttc 41764877  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 35353295 - 35353509
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35353295 ttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagat 35353394  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  35353395 gaatcactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgca 35353494  T
Q  203 ccgtataagctccca 217  Q
    || || |||||||||    
T  35353495 ccttagaagctccca 35353509  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 43925288 - 43925457
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||       ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43925288 ttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcattactagat 43925381  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43925382 gaattactattaatcatgaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 43925457  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 26980493 - 26980668
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  26980493 ttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagat 26980592  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26980593 gaattattgttgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttc 26980668  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46481103 - 46480928
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  46481103 ttaagactatcacataatatcattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagat 46481004  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  46481003 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaactttttc 46480928  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48928271 - 48928097
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  48928271 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagat 48928172  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  48928171 gaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaatttttt 48928097  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 8861474 - 8861647
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  8861474 aagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcatgcattactagatga 8861573  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8861574 aatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaattaactttttc 8861647  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Original strand, 10481792 - 10481989
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  10481792 ttaagactatcacataatatcatcaactctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgcaagtattactagat 10481891  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  10481892 gaattactattgatcgttaatcagtaattaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactg 10481989  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15672736 - 15672558
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaata---gtatctgtaagtccaagattttgcaagcattatta 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  15672736 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattacta 15672637  T
Q  100 gatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  15672636 gatgaattactattgatcatgcatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaattaattttttc 15672558  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 12165939 - 12166074
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12165939 tcacataatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 12166038  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12166039 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 12166074  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Original strand, 37704387 - 37704525
Alignment:
Q  21 atcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcatt 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37704387 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcatt 37704486  T
Q  121 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 159  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37704487 aattagtaatcaacaatttacaaatgaatcaaacattaa 37704525  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 27283939 - 27284100
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27283939 atcacataatattatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 27284038  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaagatgaaaattaa 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  27284039 attgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaa 27284100  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 178
Target Start/End: Original strand, 22687463 - 22687593
Alignment:
Q  48 atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 147  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22687463 atgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaatagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 22687562  T
Q  148 atcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22687563 atcatacattaagattaaaattaactttttc 22687593  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 4583114 - 4583319
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  4583114 atcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactggatgaattact 4583213  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||| ||||||| ||| |||||| ||    
T  4583214 attaatcatgaatcagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctggctgcaccgtagaa 4583313  T
Q  211 gctccc 216  Q
    ||||||    
T  4583314 gctccc 4583319  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5657455 - 5657279
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  5657455 ttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagat 5657356  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt-aagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5657355 gaattactattgatcattaatgagtaatcaaaaatttaaaaatgaataaatcattaaagattaaaattaactttttc 5657279  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12390614 - 12390450
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12390614 tcacataatatcatcaactcagcttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaccattactagatgaattacta 12390515  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  12390514 tttatcattaatcagtaattgacaatttaaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaactttt 12390450  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 11071401 - 11071546
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |   ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  11071401 atcacataatatcatcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattact 11071497  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11071498 attgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 11071546  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25691518 - 25691344
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||| ||||| |||||    
T  25691518 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgttgcaaacattactagat 25691419  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25691418 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaattttt 25691344  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26588029 - 26587891
Alignment:
Q  40 tgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattt 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26588029 tgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 26587930  T
Q  140 aaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26587929 aaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 26587891  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 21991823 - 21991989
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     ||||    
T  21991823 ttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca-----agat 21991917  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21991918 gaattactattgatc----atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaccttttc 21991989  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 7334989 - 7335155
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7334989 atcagataatatcatcaacta-gtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 7335087  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7335088 attaatcattaatcagaaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttc 7335155  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34362126 - 34361975
Alignment:
Q  29 ctctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaata 128  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  34362126 ctctgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtc 34362027  T
Q  129 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt-aaga-tgaaaattaactttttc 178  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34362026 attaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagatttaaaattaactttttc 34361975  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32593180 - 32593006
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||  |||| |||||    
T  32593180 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaatattactagat 32593081  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
     ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32593080 aaattactatggatcattaatcagcaatcaacaattt-aaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttc 32593006  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 44598854 - 44599028
Alignment:
Q  4 taagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatg 103  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  44598854 taagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgttacaagcattactagatg 44598953  T
Q  104 aattactattgatcattaatc---aataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  44598954 aa--actattgatcattaatcaataataatcaacaattt-aaaatgaatcaatcgttaagattaaaattaattttttc 44599028  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258980
Alignment:
Q  104 aattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtac 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||| ||    
T  38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctgactgcac 38258966  T
Q  204 cgtataagctccca 217  Q
    |||| |||||||||    
T  38258967 cgtagaagctccca 38258980  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33688234 - 33688117
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  33688234 aagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 33688135  T
Q  105 attactattgatcattaa 122  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  33688134 attgctattgatcattaa 33688117  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 38053648 - 38053751
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  38053648 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattatttgat 38053747  T
Q  103 gaat 106  Q
    ||||    
T  38053748 gaat 38053751  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 38258732 - 38258812
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagat 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38258732 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 38258812  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 43686235 - 43686330
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaat 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  43686235 atcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaat 43686330  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 48928538 - 48928474
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagta 67  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48928538 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagta 48928474  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Original strand, 37704344 - 37704388
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaat 47  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704344 ttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaat 37704388  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 177
Target Start/End: Original strand, 12166215 - 12166250
Alignment:
Q  142 aaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12166215 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 12166250  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421207
Alignment:
Q  59 aaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaaca 135  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||   |||  ||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaataatattgatcattaattaatgatcaaca 27421207  T

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Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 32216263 - 32216476
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32216263 ttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattattagat 32216362  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||| |    
T  32216363 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgca 32216462  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  32216463 ccgtagaagctccc 32216476  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 2959956 - 2960170
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2959956 ttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 2960055  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  2960056 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgca 2960155  T
Q  203 ccgtataagctccca 217  Q
    ||||| ||| |||||    
T  2960156 ccgtagaagatccca 2960170  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 16415854 - 16416027
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16415854 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagat 16415953  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16415954 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 16416027  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 37451493 - 37451668
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  37451493 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagat 37451592  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37451593 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttc 37451668  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 48353751 - 48353963
Alignment:
Q  4 taagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatg 103  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48353751 taagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatg 48353850  T
Q  104 aattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtac 203  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| ||    
T  48353851 aattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcac 48353950  T
Q  204 cgtataagctccc 216  Q
    |||| ||||||||    
T  48353951 cgtagaagctccc 48353963  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7079031 - 7078816
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  7079031 ttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatattgcaaacattactagat 7078932  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||       |||||||  ||||||||    
T  7078931 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgta 7078832  T
Q  203 ccgtataagctcccat 218  Q
    ||||| || |||||||    
T  7078831 ccgtaaaaactcccat 7078816  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27267168 - 27266995
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  27267168 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagat 27267069  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27267068 gaattactattgataattaatcaataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 27266995  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 10922935 - 10923148
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  10922935 ttaagactgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagat 10923034  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |    
T  10923035 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaagagtcagttttctgactgca 10923134  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    || || ||||||||    
T  10923135 ccatagaagctccc 10923148  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 14758240 - 14758453
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14758240 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 14758339  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| |    
T  14758340 gaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcgtgactgca 14758439  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  14758440 ccgtagaagctccc 14758453  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 47279397 - 47279572
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47279397 ttaagactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattattagat 47279496  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47279497 gaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 47279572  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 8222344 - 8222554
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  8222344 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta-t 8222442  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtata 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |    
T  8222443 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgtaccgtaga 8222542  T
Q  210 agctcccatttt 221  Q
    ||||||| ||||    
T  8222543 agctcccctttt 8222554  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34012342 - 34012135
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  34012342 atcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattact 34012243  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  34012242 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaa 34012143  T
Q  211 gctcccat 218  Q
    ||||||||    
T  34012142 gctcccat 34012135  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 46931617 - 46931837
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46931617 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 46931716  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| || ||||     
T  46931717 gaatatattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttccttactgc 46931816  T
Q  202 accgtataagctcccatttta 222  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  46931817 accgtagaagctcccatttta 46931837  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27227453 - 27227280
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27227453 ttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 27227354  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  27227353 gaattactattgatcattaatcagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaattaactttt 27227280  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 238481 - 238306
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  238481 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 238382  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  238381 gaattactattaatcatgaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatcaactttttc 238306  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 3535142 - 3535305
Alignment:
Q  14 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactatt 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3535142 acatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 3535241  T
Q  114 gatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3535242 gatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaactaacttttt 3535305  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11742336 - 11742161
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11742336 ttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 11742237  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11742236 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 11742161  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 23999555 - 23999730
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23999555 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 23999654  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23999655 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 23999730  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28564743 - 28564576
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  28564743 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattact 28564644  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28564643 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 28564576  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 28769861 - 28770036
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  28769861 ttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattgctagat 28769960  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28769961 gaattactattgatcattaattaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttc 28770036  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 30254631 - 30254805
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30254631 ttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 30254730  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30254731 gaattactattgattattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 30254805  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Original strand, 32267244 - 32267455
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32267244 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttgcaagcattactagatga 32267343  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtacc 204  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||       ||| ||| ||||||| |||    
T  32267344 attactattgaacattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcacc 32267443  T
Q  205 gtataagctccc 216  Q
    ||| ||||||||    
T  32267444 gtagaagctccc 32267455  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27532947 - 27532734
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27532947 aagactatcacatgatatcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 27532848  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtacc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| |||    
T  27532847 attactattgatcattaatcagtaatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcacc 27532749  T
Q  205 gtataagctcccatt 219  Q
    ||| |||||||||||    
T  27532748 gtagaagctcccatt 27532734  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27763279 - 27763103
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  27763279 ttaagactatcacataatataatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagat 27763180  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27763179 aaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 27763103  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 15168316 - 15168479
Alignment:
Q  15 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15168316 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatgttgcaagcattattagatgaattactattg 15168415  T
Q  115 atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15168416 atcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttc 15168479  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19899737 - 19899563
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19899737 ttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 19899638  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19899637 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttt 19899563  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27563873 - 27563700
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  27563873 ttaagactatcatataatttcatcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagat 27563774  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27563773 gaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaactttt 27563700  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47682462 - 47682244
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || ||    
T  47682462 ttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactaaat 47682363  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||| ||||||| |    
T  47682362 gaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaacttgttcaaaaaagtcagtttactgactgca 47682263  T
Q  203 ccgtataagctcccatttt 221  Q
    || || |||||||||||||    
T  47682262 ccatagaagctcccatttt 47682244  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 3309361 - 3309537
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| || |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3309361 ttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaagatattgcaagcattactagat 3309460  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga-tgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3309461 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatttagatttaaaattaactttttc 3309537  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9903022 - 9902847
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| || |||||    
T  9903022 ttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagat 9902923  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  9902922 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttc 9902847  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 38823422 - 38823596
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| || || |||||||||||| |||||    
T  38823422 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagat 38823521  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38823522 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaacttttt 38823596  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 4330489 - 4330662
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  4330489 ttaagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattactagat 4330588  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4330589 gaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 4330662  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 22170919 - 22171136
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22170919 ttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgcaaacattattagat 22171018  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||| | || |    
T  22171019 aaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctaattgca 22171118  T
Q  203 ccgtataagctcccattt 220  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  22171119 ccgtagaagctcccattt 22171136  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 51129075 - 51129240
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51129075 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 51129174  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  51129175 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagtattaaaat--aaattaactttttc 51129240  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 25160848 - 25161015
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  25160848 atcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactatatgaattact 25160947  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  25160948 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaacctttt 25161015  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 15383149 - 15383355
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15383149 atcacataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 15383248  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtata 209  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||       ||| ||| ||||||| |||||| |    
T  15383249 attgattattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgaaccgtaga 15383348  T
Q  210 agctccc 216  Q
    |||||||    
T  15383349 agctccc 15383355  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10181976 - 10181802
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatct-gtaagtccaagattttgcaagcattattaga 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  10181976 ttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 10181877  T
Q  102 tgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10181876 tgaattactattgaacattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 10181802  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1359895 - 1359744
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  1359895 atcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgttgcaagcattactggatgaattact 1359796  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagat 162  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359795 atcgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagat 1359744  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 15752245 - 15752452
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||  |||||||||||||  ||||||   ||| |||||||||||||    
T  15752245 atcacataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaagttgcaatttttactagatgaattact 15752344  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||        ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  15752345 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttttaaaaaatcaattttctgactgcaccgtagaa 15752444  T
Q  211 gctcccat 218  Q
    ||||||||    
T  15752445 gctcccat 15752452  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 39393592 - 39393766
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| || |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  39393592 ttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagatgttgcaaacattactagat 39393691  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  39393692 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaattaacttttt 39393766  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 178
Target Start/End: Original strand, 1547516 - 1547654
Alignment:
Q  40 tgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattt 139  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1547516 tgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatcaacaattt 1547615  T
Q  140 aaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1547616 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttc 1547654  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30326912 - 30326751
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30326912 atcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 30326813  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatgaaaattaa 171  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  30326812 attgatcatcaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaatattaaaatcaaaattaa 30326751  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 176
Target Start/End: Original strand, 21289829 - 21289981
Alignment:
Q  24 atcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaat 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |  | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21289829 atcaactctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattattattgatcattaat 21289928  T
Q  124 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21289929 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 21289981  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 41926378 - 41926537
Alignment:
Q  16 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41926378 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagcattactagatgaattactattga 41926476  T
Q  116 tcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  41926477 tcattaattaataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataattaattttt 41926537  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37618856 - 37618729
Alignment:
Q  16 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37618856 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattga 37618757  T
Q  116 tcattaatcaataatcaacaatttaaaa 143  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  37618756 ccattaatcaataatcaacaatttaaaa 37618729  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31621522 - 31621341
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaat-----atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattat 97  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||     
T  31621522 ttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgttgcaagcattag 31621423  T
Q  98 tagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattta-aaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31621422 tagatgaactactattgatcattaatcatcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttc 31621341  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 40885021 - 40885178
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  40885021 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagat 40885120  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaag 160  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  40885121 gaattactattgatcattaattagcaatcaataattcaaaaatgaatcgaatattaag 40885178  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 42721255 - 42721418
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||    
T  42721255 atcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttgcaattattactagattaattact 42721351  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  42721352 attgatcattaatgagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttt 42721418  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 178
Target Start/End: Original strand, 31962853 - 31963000
Alignment:
Q  32 tgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatc 131  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  31962853 tgtttgcatgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaatc 31962952  T
Q  132 aacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31962953 aacaattttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 31963000  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 18422859 - 18423006
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  18422859 ttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgcaagcattgctagat 18422958  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 157  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422959 gaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 18423006  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33725570 - 33725366
Alignment:
Q  1 atttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattag 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||| |            
T  33725570 atttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaaac-------- 33725479  T
Q  101 atgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatt-taaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgact 199  Q
        |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||| ||||||    
T  33725478 ----attactattgatcattaatcagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaataaactttttcaaaaaaatcagtttcctgact 33725383  T
Q  200 gtaccgtataagctccc 216  Q
    | | |||||||||||||    
T  33725382 gcaacgtataagctccc 33725366  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Original strand, 38759744 - 38759846
Alignment:
Q  6 agacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaa 105  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  || |||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  38759744 agactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaagcattactagattaa 38759843  T
Q  106 tta 108  Q
    |||    
T  38759844 tta 38759846  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 48620916 - 48621010
Alignment:
Q  122 atcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataagctccc 216  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  48620916 atcattaatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 48621010  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 48620845 - 48620906
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgta 73  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||    
T  48620845 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgaataaatagtacctgta 48620906  T

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Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46297735 - 46297522
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46297735 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 46297636  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||| |||||| |    
T  46297635 gaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactgca 46297536  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  46297535 ccgtagaagctccc 46297522  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11357354 - 11357181
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11357354 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 11357255  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11357254 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 11357181  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22622691 - 22622478
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22622691 ttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 22622592  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  22622591 gaattactattgatcattaatcagtaatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgca 22622492  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  22622491 ccgtaaaagctccc 22622478  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26941225 - 26941020
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26941225 atcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 26941126  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||| ||    
T  26941125 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaa 26941026  T
Q  211 gctccc 216  Q
    ||||||    
T  26941025 gctccc 26941020  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40552223 - 40552019
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40552223 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttgcaagcattactagatgaattacta 40552124  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataag 211  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| | ||||| |||||| |||    
T  40552123 ttgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttccagactgcaccgtagaag 40552024  T
Q  212 ctccc 216  Q
    |||||    
T  40552023 ctccc 40552019  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 48355144 - 48355319
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  48355144 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagat 48355243  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48355244 gaattattattgatcattaatcagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 48355319  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 1089897 - 1090070
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1089897 ttaagactatcacataacatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagat 1089995  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1089996 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 1090070  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53229125 - 53228952
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  53229125 ttaagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactagat 53229026  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53229025 gaattagtattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 53228952  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24708088 - 24707913
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24708088 ttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgcaagcattattagat 24707989  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24707988 aaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttc 24707913  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33378758 - 33378544
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  33378758 ttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaaacattactagat 33378659  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||       ||||||| ||||||| |    
T  33378658 gaattactattgatcattaatcaataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgca 33378559  T
Q  203 ccgtataagctccca 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  33378558 ccgtagaagctccca 33378544  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52040895 - 52040722
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  52040895 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagat 52040796  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52040795 gaatgattattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 52040722  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 39282855 - 39283067
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  39282855 ttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatgttgcaagcattactagat 39282954  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  39282955 gaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgca 39283054  T
Q  203 ccgtataagctcc 215  Q
    ||||| |||||||    
T  39283055 ccgtagaagctcc 39283067  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 4015663 - 4015876
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4015663 ttaagactatcgcattgtatcaacaact-tgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 4015761  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| |    
T  4015762 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgca 4015861  T
Q  203 ccgtataagctccca 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  4015862 ccgtagaagctccca 4015876  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42506048 - 42505876
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42506048 ttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 42505949  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  42505948 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 42505876  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 33698356 - 33698531
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33698356 ttaagactatcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagat 33698455  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  33698456 gaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaattaactttttc 33698531  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44186482 - 44186315
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  44186482 atcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgcaagcattactagataaattact 44186383  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44186382 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttc 44186315  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7327455 - 7327281
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  7327455 ttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagat 7327356  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  7327355 gaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttt 7327281  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 29099558 - 29099724
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  29099558 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattacca 29099657  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29099658 ttgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttc 29099724  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21009775 - 21009558
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  21009775 ttaagactatcacataatatcatcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagat 21009676  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||        ||||||| |||||||     
T  21009675 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaagtcagtttcctgactgc 21009576  T
Q  202 accgtataagctcccatt 219  Q
    |||||| || ||||||||    
T  21009575 accgtagaaactcccatt 21009558  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 54506010 - 54506186
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  54506010 ttaagactatcacataatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcattactagat 54506109  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  54506110 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 54506186  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 47481725 - 47481937
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  47481725 ttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagat 47481824  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||| ||| ||||||||    
T  47481825 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgt 47481924  T
Q  202 accgtataagctc 214  Q
    |||||| ||||||    
T  47481925 accgtagaagctc 47481937  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24488935 - 24488761
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  24488935 ttaagactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagcattactagat 24488836  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24488835 gcattactattaatcatgaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaacttttt 24488761  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 44891700 - 44891874
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  44891700 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaagcattactagat 44891799  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44891800 gaattactgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 44891874  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 51212736 - 51212536
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51212736 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 51212637  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| ||| || ||    
T  51212636 attgatcattaattaaaaatcaacaatttaaaaatgaa------attaagatcaaaattaactttttcaaaaatgtcagttttctgactgcaccatagaa 51212543  T
Q  211 gctccca 217  Q
    |||||||    
T  51212542 gctccca 51212536  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 3362458 - 3362631
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  |  |||||||| || |||||||||||| | |||    
T  3362458 ttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaagcattactggat 3362557  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3362558 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 3362631  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Original strand, 22451184 - 22451346
Alignment:
Q  16 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattga 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22451184 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattga 22451283  T
Q  116 tcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22451284 tcattaatcagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttc 22451346  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 37157910 - 37158124
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactct-gtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattaga 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  37157910 ttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatatgtcgcaagcattactaga 37158009  T
Q  102 tgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| |||||||     
T  37158010 tgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgc 37158109  T
Q  202 accgtataagctccc 216  Q
    |||||| ||||||||    
T  37158110 accgtagaagctccc 37158124  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 37203270 - 37203484
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactct-gtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattaga 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  37203270 ttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatatatcgcaagcattactaga 37203369  T
Q  102 tgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| |||||||     
T  37203370 tgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgc 37203469  T
Q  202 accgtataagctccc 216  Q
    |||||| ||||||||    
T  37203470 accgtagaagctccc 37203484  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43975856 - 43975652
Alignment:
Q  15 cataatatcatcaactctgtt---tgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43975856 cataatatcatcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaata 43975757  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataag 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||       ||||||||||||||| |||||| ||     
T  43975756 ttgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaattttttcaaaagagtcagttttctgactgcaccgtagaaa 43975657  T
Q  212 ctccc 216  Q
    |||||    
T  43975656 ctccc 43975652  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 2008135 - 2008317
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2008135 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 2008234  T
Q  103 gaattactattgatcat-------taatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||| || ||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2008235 gaaataatattgatcattaatcagtaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 2008317  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 21193812 - 21194025
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||| || ||||    
T  21193812 aagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttgcaaccattactaaatga 21193911  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtacc 204  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| |||    
T  21193912 attactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcacc 21194011  T
Q  205 gtataagctcccat 218  Q
    ||| ||||||||||    
T  21194012 gtagaagctcccat 21194025  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14586636 - 14586478
Alignment:
Q  19 atatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatca 118  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  14586636 atatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagta-cggtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactactgatca 14586538  T
Q  119 ttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14586537 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaattttttc 14586478  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 34133138 - 34133288
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34133138 ttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 34133237  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 153  Q
    ||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34133238 gaattactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 34133288  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22446036 - 22445865
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| |||| | |||||    
T  22446036 aagactatcatataatatcatcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaagtattactggatga 22445937  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22445936 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 22445865  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 40936176 - 40936351
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  40936176 ttaagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagat 40936275  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  40936276 aaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaataaatcaatcattaagattgaaattaactttttc 40936351  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11357121 - 11356918
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||        |    
T  11357121 aagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagcatt--------a 11357030  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtacc 204  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       |||||| |||||||| |||    
T  11357029 attactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttgtctgactgcacc 11356930  T
Q  205 gtataagctccc 216  Q
    ||| | ||||||    
T  11356929 gtagatgctccc 11356918  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 32373673 - 32373885
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  32373673 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagat 32373772  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || |||||| |||||||||||||||       |||||||   |||||||    
T  32373773 gaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaattt-aaaatgaattcatcaataagattaaaattaactttttcaaaaaattcagtttcacgactgta 32373871  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  32373872 ccgtagaagctccc 32373885  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4761621 - 4761447
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||  ||||    
T  4761621 ttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgttgcaaacattaccagat 4761522  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4761521 gaattactattaatcattaatcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 4761447  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 25579942 - 25580116
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||| || ||||| |||||||||||| |||||    
T  25579942 ttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattgcaagcattactagat 25580041  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  25580042 gaattactattgatcattaatccgcaatcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagattaagattaacttttt 25580116  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 36012341 - 36012556
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactct-gtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattaga 101  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  36012341 ttaagactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactaga 36012440  T
Q  102 tgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaa-ttaactttttcnnnnnnntcagttttctgactg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||       |||||||  ||||||    
T  36012441 tgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatttaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactg 36012540  T
Q  201 taccgtataagctccc 216  Q
     |||||| ||||||||    
T  36012541 caccgtagaagctccc 36012556  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 38591901 - 38592051
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |     
T  38591901 ttaagactatcacataatatcatcaaatctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcattattaaac 38592000  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 153  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38592001 aaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 38592051  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 46994634 - 46994490
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46994634 ttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagat 46994535  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46994534 gaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatga 46994490  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 29164021 - 29164179
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  29164021 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagcattactagatgaattacta 29164120  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29164121 ttgatcat-------taatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 29164179  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 50475022 - 50475196
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  50475022 atcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagt 50475121  T
Q  111 attg-------atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||       ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  50475122 attgatcattaatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaaatttttc 50475196  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3655167 - 3654997
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat--gaatta 108  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||    
T  3655167 atcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatatgaatta 3655068  T
Q  109 ctattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3655067 ctattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaacattttc 3654997  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20373209 - 20373061
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||                   ||||||||    
T  20373209 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatataagtccaagat-------------------gaattact 20373129  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20373128 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 20373061  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 54828666 - 54828546
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  54828666 atcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattact 54828567  T
Q  111 attgatcattaatcaataatc 131  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  54828566 attgatcattaatcagtaatc 54828546  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27480339 - 27480164
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactct----gtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttg----caagcat 94  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||     ||| |||    
T  27480339 ttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttaattacaaacat 27480240  T
Q  95 tattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaatta 170  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  27480239 tactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaaatta 27480164  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 11467027 - 11467226
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||       |||||    
T  11467027 ttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatgttgcaa-------tagat 11467119  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||       |||||||  |||||| |    
T  11467120 gaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagaataaaattaactttttcaaaaaagtcagtttgatgactgca 11467212  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 115
Target Start/End: Original strand, 45174725 - 45174821
Alignment:
Q  19 atatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattga 115  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45174725 atatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 45174821  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 43348460 - 43348563
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||| || ||    
T  43348460 ttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattactaaat 43348559  T
Q  103 gaat 106  Q
    ||||    
T  43348560 gaat 43348563  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11835600 - 11835494
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||      |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  11835600 ttaagactatcacatgatatcatcaactctatttgcatg------atgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaat 11835507  T
Q  103 gaattactattga 115  Q
    |||||||||||||    
T  11835506 gaattactattga 11835494  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811597
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||| || |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  53811701 aagactatcacataatatcatcaact----ttgcatgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatga 53811606  T
Q  105 attactatt 113  Q
    |||||||||    
T  53811605 attactatt 53811597  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 178
Target Start/End: Original strand, 35844577 - 35844625
Alignment:
Q  130 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35844577 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaactttttc 35844625  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 178
Target Start/End: Original strand, 43348556 - 43348592
Alignment:
Q  142 aaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43348556 aaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttc 43348592  T

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Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 699362 - 699535
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  699362 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 699461  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  699462 gaattactattgattattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 699535  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 22255405 - 22255612
Alignment:
Q  14 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactatt 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22255405 acataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagccttactagatgaattactatt 22255504  T
Q  114 gatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataagct 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22255505 gatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagtcagtttcctgactgtaccgtagaagct 22255604  T
Q  214 cccatttt 221  Q
    ||| ||||    
T  22255605 cccttttt 22255612  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 22981005 - 22981179
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22981005 ttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaatcattactagat 22981104  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22981105 gaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 22981179  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 24886299 - 24886474
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24886299 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 24886398  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24886399 gaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 24886474  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35826437 - 35826275
Alignment:
Q  15 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35826437 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 35826338  T
Q  115 atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35826337 atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 35826275  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31705575 - 31705400
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31705575 ttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaagcattactagat 31705476  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31705475 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttc 31705400  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31786601 - 31786434
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31786601 atcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 31786502  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31786501 attgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaactttttc 31786434  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2888408 - 2888199
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  2888408 ttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagat 2888309  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||| ||||||||||| |    
T  2888308 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgca 2888209  T
Q  203 ccgtataagc 212  Q
    ||||| ||||    
T  2888208 ccgtagaagc 2888199  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35511437 - 35511232
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  35511437 atcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattact 35511338  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  35511337 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaa 35511238  T
Q  211 gctccc 216  Q
    ||||||    
T  35511237 gctccc 35511232  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38528200 - 38527987
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38528200 ttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 38528101  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  38528100 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgca 38528001  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  38528000 ccgtagaagctccc 38527987  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 42342942 - 42343151
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  42342942 tcacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacca 42343041  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataag 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| |||||| |||    
T  42343042 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaag 42343141  T
Q  212 ctcccatttt 221  Q
    ||||||||||    
T  42343142 ctcccatttt 42343151  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15992503 - 15992328
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15992503 ttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 15992404  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15992403 gaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 15992328  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 5830112 - 5830278
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5830112 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 5830211  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5830212 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttt 5830278  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22974045 - 22973871
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22974045 ttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 22973946  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22973945 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 22973871  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 25669797 - 25669963
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25669797 tcacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattacta 25669896  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25669897 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttc 25669963  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 25889593 - 25889755
Alignment:
Q  14 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25889593 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatgaattactatt 25889692  T
Q  114 gatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25889693 gatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 25889755  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 33908445 - 33908657
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33908445 ttaagactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 33908544  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| |||| |    
T  33908545 -aattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaactgca 33908643  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| | ||||||    
T  33908644 ccgtagatgctccc 33908657  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 40133605 - 40133810
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  40133605 atcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattact 40133704  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  40133705 attaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaa 40133804  T
Q  211 gctccc 216  Q
    ||||||    
T  40133805 gctccc 40133810  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 8437185 - 8437352
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  8437185 atcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaacattactagatgaattact 8437284  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  8437285 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaaaatcaaaattaactttttc 8437352  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 19120071 - 19120246
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  19120071 ttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgttgcaagcattactagat 19120170  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19120171 gaattactattgatcattaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttc 19120246  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7208827 - 7208653
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  7208827 ttaagactatcacataatattttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagtattactagat 7208728  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7208727 gaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaacttttt 7208653  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 9200445 - 9200611
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9200445 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 9200544  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||    
T  9200545 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaattttttc 9200611  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 5837767 - 5837942
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5837767 ttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaagcattactagat 5837866  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||    
T  5837867 gaattactgttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttc 5837942  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 35504577 - 35504752
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  35504577 ttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagat 35504676  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  35504677 gaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattgactttttc 35504752  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17157994 - 17157779
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17157994 ttaagaccatcacataatattatcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagat 17157895  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||       ||| |||  ||||||||    
T  17157894 gaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgactttttcaaaaaagtcaatttcttgactgta 17157795  T
Q  203 ccgtataagctcccat 218  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17157794 ccgtagaagctcccat 17157779  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 22019844 - 22020010
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22019844 tcacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaagcattactagatgaattacta 22019943  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22019944 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttttc 22020010  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8741825 - 8741673
Alignment:
Q  26 caactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8741825 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttgcaagcatcactagatgaaatactattgatcattaatca 8741726  T
Q  126 ataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8741725 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 8741673  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 12910568 - 12910740
Alignment:
Q  4 taagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatg 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12910568 taagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 12910667  T
Q  104 aattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12910668 aattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 12910740  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14409304 - 14409091
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  14409304 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaat 14409205  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||       ||||||| ||||||| |    
T  14409204 gaattactattgatcattattcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaatttttcaaaaaaatcagtttcctgactgca 14409105  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  14409104 ccgtagaagctccc 14409091  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 36866982 - 36867187
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  36866982 atcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactggatgaattact 36867081  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||        ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  36867082 attaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaa 36867181  T
Q  211 gctccc 216  Q
    ||||||    
T  36867182 gctccc 36867187  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 36860644 - 36860810
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  36860644 atcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaattact 36860743  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36860744 attaatcatgaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaacttttt 36860810  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 178
Target Start/End: Original strand, 39573060 - 39573198
Alignment:
Q  40 tgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattt 139  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39573060 tgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 39573159  T
Q  140 aaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39573160 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 39573198  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 7693442 - 7693607
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7693442 tcacatgatattagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 7693541  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7693542 ttgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 7693607  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 27330516 - 27330691
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27330516 ttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 27330615  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27330616 gaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 27330691  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 35934108 - 35934283
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  35934108 ttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcattactagtt 35934207  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35934208 gaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaattaactttttc 35934283  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23116185 - 23116018
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||           
T  23116185 ttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt------- 23116093  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
     | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23116092 -actgactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 23116018  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25500881 - 25500670
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  25500881 atcacatgatatcagcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaaatact 25500782  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| |||||| ||    
T  25500781 gttgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaa 25500682  T
Q  211 gctcccatttta 222  Q
    ||||||||||||    
T  25500681 gctcccatttta 25500670  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27318450 - 27318277
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |  ||||  ||||| |||||| ||||| || ||    
T  27318450 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacat--aagtttaagatgttgcaaacattactatat 27318353  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27318352 gaattactattgatcattaatcaaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27318277  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13956325 - 13956116
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13956325 ttaagactatcatataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcattactagat 13956226  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |   ||||||||||| || ||||||||| |||||       |||| |||||||||| |    
T  13956225 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt--aactttttcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaaaatcagctttctgactgca 13956128  T
Q  203 ccgtataagctc 214  Q
    ||||| ||||||    
T  13956127 ccgtagaagctc 13956116  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 15724700 - 15724875
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  15724700 ttaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaagcattactagat 15724799  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  15724800 gaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagttaaaattaactttttc 15724875  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30969287 - 30969113
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |||| |||||    
T  30969287 ttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaagtattactagat 30969188  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30969187 gagttactattaatcattaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 30969113  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 32563361 - 32563527
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  32563361 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagaattactagataaattatta 32563460  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32563461 ttgatcattaatcagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttc 32563527  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28416469 - 28416339
Alignment:
Q  48 atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 147  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28416469 atgccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaaaga 28416370  T
Q  148 atcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28416369 atcaaacattaagattaaaattaactttttc 28416339  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1429125 - 1428983
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1429125 ttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 1429026  T
Q  103 gaattactattgatcattaatc---aataatcaacaatttaaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  1429025 gaattactattgatcattaatcagtaatattcaacaatttaaa 1428983  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21088721 - 21088558
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  21088721 atcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgtaagcattactagatgaattact 21088622  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||| ||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  21088621 attaatcatgaataaataat---caatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaagttaatttttt 21088558  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43308607 - 43308448
Alignment:
Q  19 atatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43308607 atatcatcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 43308508  T
Q  119 ttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  43308507 ttaatcagaaatcaacaatttaaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaattaactttttc 43308448  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 8466939 - 8467112
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||| |||||  ||  |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  8466939 ttaagactatcatatgatatcaccaactctgtttacatattaaaggtgt-aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagat 8467037  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8467038 gaattactattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaatcaaacattaaaaataaaattaacttttt 8467112  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23954752 - 23954552
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||      | ||||| | |||    
T  23954752 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagat-----gaacattacttgat 23954659  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  23954658 gaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgca 23954566  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    || || ||||||||    
T  23954565 ccatagaagctccc 23954552  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14919491 - 14919327
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||    ||||||||||| |||||| ||      |||    
T  14919491 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgtat----aagtccaagatattgcaatca------gat 14919402  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14919401 gaattac-attgatcattaatcagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttc 14919327  T

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Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 176
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254240
Alignment:
Q  90 agcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 43254240  T

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Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Original strand, 26269069 - 26269196
Alignment:
Q  51 ccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatc 150  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  26269069 ccaaggataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaacc 26269168  T
Q  151 aaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||    
T  26269169 aatcattaagattaaaattaactttttc 26269196  T

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Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6824420 - 6824329
Alignment:
Q  26 caactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||  |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  6824420 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgagatactattgatca 6824329  T

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Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Original strand, 26268286 - 26268343
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataa 60  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  26268286 ttaagactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaaggataa 26268343  T

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Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 41961060 - 41961266
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  41961060 atcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 41961159  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  41961160 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaattcagtttcctgactgcaccgtagaa 41961259  T
Q  211 gctccca 217  Q
    |||||||    
T  41961260 gctccca 41961266  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 44913876 - 44914097
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattag-- 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  44913876 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagaa 44913975  T
Q  101 -atgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgact 199  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||| ||||||    
T  44913976 aatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaaccagtttgctgact 44914075  T
Q  200 gtaccgtataagctcccatttt 221  Q
    | |||||| |||||| ||||||    
T  44914076 gcaccgtagaagctctcatttt 44914097  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11366372 - 11366158
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11366372 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 11366273  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||| |||||||||||     
T  11366272 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaattttctgactgc 11366173  T
Q  202 accgtataagctccc 216  Q
    |||||| | ||||||    
T  11366172 accgtagatgctccc 11366158  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18494272 - 18494059
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  18494272 ttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagat 18494173  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||  |    
T  18494172 gaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactaca 18494073  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||||||||||||    
T  18494072 ccgtataagctccc 18494059  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7006921 - 7006754
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  7006921 atcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatttct 7006822  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7006821 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgattaaaattaactttttc 7006754  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 4763843 - 4764017
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  4763843 ttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagtt 4763942  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4763943 gaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 4764017  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 26357797 - 26357963
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26357797 atcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 26357896  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26357897 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 26357963  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2325369 - 2325156
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  2325369 ttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagat 2325270  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||        ||| ||||||||||| |    
T  2325269 gaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaaatcaattttctgactgca 2325170  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  2325169 ccgtagaagctccc 2325156  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33660358 - 33660155
Alignment:
Q  13 cacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactat 112  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33660358 cacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagcattactagatgaattactat 33660259  T
Q  113 tgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataagc 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  33660258 tgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagc 33660159  T
Q  213 tccc 216  Q
    ||||    
T  33660158 tccc 33660155  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 4167142 - 4167347
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  4167142 atcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattact 4167241  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataa 210  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  4167242 attaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaa 4167341  T
Q  211 gctccc 216  Q
    ||||||    
T  4167342 gctccc 4167347  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19289314 - 19289139
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19289314 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagat 19289215  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19289214 gaattactattgatcattaatcagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttc 19289139  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33709223 - 33709048
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  33709223 ttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaagcattactagat 33709124  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33709123 gaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttc 33709048  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43770830 - 43770664
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  43770830 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatttcta 43770731  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43770730 ttgatcattaattagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 43770664  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 41465713 - 41465926
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  41465713 ttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactatat 41465812  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| |||| |    
T  41465813 gaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctaactgca 41465912  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    || ||||| |||||    
T  41465913 ccatataaactccc 41465926  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43648236 - 43648061
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  43648236 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagat 43648137  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43648136 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 43648061  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 35959108 - 35959279
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  35959108 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaagcattactagat 35959203  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35959204 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 35959279  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 5881750 - 5881916
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5881750 tcacatgatatcaacaattttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 5881849  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5881850 ttgatcattattcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 5881916  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19500906 - 19500739
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  19500906 ttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgttgcaagcattactagat 19500807  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaatta 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19500806 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatta 19500739  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39167352 - 39167185
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  39167352 atcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttgctagcattactagatgaattact 39167253  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39167252 attaattatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaattaactttttc 39167185  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 3177151 - 3177362
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3177151 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatattacaagcattactagat 3177250  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  3177251 gaattactatttatcatgaataagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgca 3177350  T
Q  203 ccgtataagctc 214  Q
    ||||| ||||||    
T  3177351 ccgtagaagctc 3177362  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31570725 - 31570551
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||  |||||    
T  31570725 ttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattgctagat 31570626  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31570625 gaattactattgatcattaatcagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaattaacttttt 31570551  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27349930 - 27349789
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27349930 tcacatgatatcaggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 27349831  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27349830 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 27349789  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 31862072 - 31862239
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || || |||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||    
T  31862072 atcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgtagacattactagatgaattact 31862171  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31862172 attgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttc 31862239  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 13711671 - 13711846
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || || |||||    
T  13711671 ttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaaacaatactagat 13711770  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||    
T  13711771 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaatcatttaaattaaaattaattttttc 13711846  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 4478585 - 4478717
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  4478585 atcacatgatatcaccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgct 4478684  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaa 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4478685 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaa 4478717  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29242128 - 29241963
Alignment:
Q  4 taagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatg 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||       | |||| ||||||    
T  29242128 taagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagat-------gaattactagatg 29242036  T
Q  104 aattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29242035 aattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 29241963  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 44286161 - 44286283
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  44286161 ttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattgttagat 44286260  T
Q  103 gaattactattgatcattaatca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44286261 gaattactattgatcattaatca 44286283  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19424574 - 19424417
Alignment:
Q  62 atagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga 161  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19424574 atagtacctgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaga 19424475  T
Q  162 tgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataagctcccatt 219  Q
    | |||||||||||||||       |||||||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  19424474 ttaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttgatgactgcaccgtagaagctcccatt 19424417  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33550965 - 33550800
Alignment:
Q  16 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattga 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33550965 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaataactattga 33550866  T
Q  116 ----tcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
        | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33550865 ttatttattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 33550800  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 37905934 - 37906098
Alignment:
Q  15 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  |  |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  37905934 cataatatcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgcaagaattactggatgaattactattg 37906033  T
Q  115 atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  37906034 atcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttc 37906098  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41051260 - 41051116
Alignment:
Q  33 gtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatca 132  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41051260 gtttgcatgttaaa-atgccaaggataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatca 41051162  T
Q  133 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  41051161 acaattcaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaattttttc 41051116  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4264056 - 4263926
Alignment:
Q  14 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactatt 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4264056 acatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgttgcaagcattactagatgaaataatatt 4263957  T
Q  114 gatcattaatcaataatcaacaatttaaaaa 144  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4263956 gatcattgatcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41463512 - 41463407
Alignment:
Q  72 taagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaa 171  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41463512 taagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaa 41463413  T
Q  172 cttttt 177  Q
    ||||||    
T  41463412 cttttt 41463407  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 19314064 - 19314186
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgt---aagtccaagattttgcaagcattattagatgaatt 107  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||   ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19314064 atcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatt 19314163  T
Q  108 actattgatcattaatcaataat 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  19314164 actattgatcattaatcagtaat 19314186  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 36642200 - 36642296
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattatta 99  Q
    ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36642200 ttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgttgcaagcattatta 36642296  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Original strand, 45327933 - 45328025
Alignment:
Q  4 taagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcatta 96  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45327933 taagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 45328025  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 177
Target Start/End: Original strand, 33902321 - 33902400
Alignment:
Q  98 tagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33902321 tagatgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 33902400  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17071728 - 17071648
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagat 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17071728 ttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagat 17071648  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257354
Alignment:
Q  79 aagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||    
T  18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaataaattattaatattaaaattaactttttc 18257354  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 216
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328114
Alignment:
Q  129 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataagctccc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag-tttctgactgcaccgtagaagctccc 45328114  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17054087 - 17054007
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagat 83  Q
    |||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17054087 ttaanactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagat 17054007  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18258278 - 18258197
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatt 84  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  18258278 ttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatcccaacgataaaatagtaactgcaagtctaagatt 18258197  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41463843 - 41463779
Alignment:
Q  1 atttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatag 65  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41463843 atttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053963
Alignment:
Q  120 taatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagat 162  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagat 17053963  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071604
Alignment:
Q  120 taatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagat 162  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagat 17071604  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 19424621 - 19424576
Alignment:
Q  1 atttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 46  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19424621 atttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaa 19424576  T

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Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16446854 - 16446641
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16446854 ttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 16446755  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  16446754 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgca 16446655  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  16446654 ccgtagaagctccc 16446641  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1953967 - 1953792
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1953967 ttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagattttgcaagcattattagat 1953868  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1953867 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttc 1953792  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23854410 - 23854235
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23854410 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 23854311  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23854310 gaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 23854235  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43643574 - 43643361
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43643574 ttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 43643475  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |    
T  43643474 gaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgca 43643375  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    || || ||||||||    
T  43643374 ccatagaagctccc 43643361  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1149611 - 1149398
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1149611 ttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 1149512  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||       ||| ||| ||||||| |    
T  1149511 gaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttcctgactgca 1149412  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||||||||    
T  1149411 ccgtagaagctccc 1149398  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4132664 - 4132492
Alignment:
Q  4 taagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatg 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4132664 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 4132565  T
Q  104 aattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  4132564 aattactattgatcattaatttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaactttt 4132492  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27082817 - 27082642
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27082817 ttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 27082718  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27082717 gaattactacttatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttc 27082642  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37970498 - 37970323
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37970498 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 37970399  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37970398 gaattactgttgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 37970323  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7890928 - 7890761
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  7890928 atcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattact 7890829  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7890828 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttc 7890761  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 11727235 - 11727409
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  11727235 ttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagat 11727334  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  11727335 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttt 11727409  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 34895181 - 34895347
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  34895181 atcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattact 34895280  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34895281 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 34895347  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Original strand, 12587812 - 12587968
Alignment:
Q  22 tcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcatta 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12587812 tcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 12587911  T
Q  122 atcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12587912 atcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttc 12587968  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 466059 - 466214
Alignment:
Q  19 atatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatca 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  466059 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 466158  T
Q  119 ttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactt 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  466159 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 466214  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 1205138 - 1205312
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  1205138 ttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagat 1205237  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1205238 gaattactattgatcattaatcactaatcagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaacttttt 1205312  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859363
Alignment:
Q  18 aatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 35859259  T
Q  118 attaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataagctccca 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |||||| || |||||     
T  35859260 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaaactccct 35859359  T
Q  218 tttt 221  Q
    ||||    
T  35859360 tttt 35859363  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39099098 - 39098924
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  39099098 ttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagat 39098999  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  39098998 gaattactattgatcattaattaataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaattaatttttt 39098924  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8803788 - 8803620
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaat-tac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||    
T  8803788 atcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaatatac 8803689  T
Q  110 tattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8803688 tattgatcattaatcagtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 8803620  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35459690 - 35459515
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  35459690 ttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaacattactagat 35459591  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35459590 gaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 35459515  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 38644191 - 38644403
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38644191 aagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 38644290  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtacc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||  |||||| |||    
T  38644291 attactattgatcattaatcagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcacc 38644390  T
Q  205 gtataagctccca 217  Q
    ||| |||||||||    
T  38644391 gtaaaagctccca 38644403  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 16223082 - 16223248
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16223082 atcacataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattact 16223181  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16223182 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttt 16223248  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6098497 - 6098320
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaata-----gtatctgtaagtccaagattttgcaagcattat 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     |||  |||||||||||||| ||||||||||||     
T  6098497 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattac 6098398  T
Q  98 tagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  6098397 tagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcatgattaacttt 6098320  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 33906423 - 33906634
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33906423 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 33906522  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |    
T  33906523 gaattactattgatcattaatcagcaatca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgca 33906620  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    | ||| ||||||||    
T  33906621 ctgtagaagctccc 33906634  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34952020 - 34951861
Alignment:
Q  19 atatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatca 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  34952020 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattgatca 34951921  T
Q  119 ttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34951920 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 34951861  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36694945 - 36694770
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  36694945 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttgcaagcatcactagat 36694846  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  36694845 gaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttc 36694770  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 44869708 - 44869883
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44869708 ttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattgcaagcattactagat 44869807  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44869808 gaattactattgatcattaatcagtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttc 44869883  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5299909 - 5299750
Alignment:
Q  19 atatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatca 118  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5299909 atatcagcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatca 5299810  T
Q  119 ttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5299809 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttc 5299750  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24823336 - 24823199
Alignment:
Q  40 tgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattt 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24823336 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaattt 24823237  T
Q  140 aaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24823236 aaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 24823199  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 40862630 - 40862806
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40862630 ttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 40862729  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaattt-aaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40862730 gaattactatttgtcataaatcagtaatcgacaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaactttttc 40862806  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 12876323 - 12876535
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||| |||||||    
T  12876323 aagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaggcattactagatga 12876422  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtacc 204  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||        ||||||| |||| | ||||    
T  12876423 attactatttatcatgaataagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttttaaaaaagtcagtttcctgattatacc 12876522  T
Q  205 gtataagctccca 217  Q
    |||||||||||||    
T  12876523 gtataagctccca 12876535  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1149889 - 1149756
Alignment:
Q  13 cacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactat 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1149889 cacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactat 1149790  T
Q  113 tgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1149789 tgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 1149756  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30654562 - 30654349
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  30654562 ttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaat 30654463  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||       ||||||| |||||||     
T  30654462 gaatatattattgatcattaatcagtaattaacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgc 30654364  T
Q  202 accgtataagctccc 216  Q
    |||||| || |||||    
T  30654363 accgtagaaactccc 30654349  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10555175 - 10555010
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaatt--a 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |    
T  10555175 atcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattaca 10555076  T
Q  109 ctattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10555075 ctattgatcatta---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 10555010  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31933857 - 31933690
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||| |    
T  31933857 atcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcagacattactagatgaattatt 31933758  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  31933757 attgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttc 31933690  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 9864359 - 9864509
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  9864359 ttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagat 9864458  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 153  Q
    |||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9864459 gaataactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 9864509  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 178
Target Start/End: Original strand, 33198058 - 33198188
Alignment:
Q  48 atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 147  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198058 atgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 33198157  T
Q  148 atcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  33198158 atcaatcattaagattaagattaactttttc 33198188  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 178
Target Start/End: Original strand, 18259321 - 18259465
Alignment:
Q  34 tttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaa 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||    
T  18259321 tttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatcaa 18259420  T
Q  134 caatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||    
T  18259421 caatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttc 18259465  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 178
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362808
Alignment:
Q  93 attattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41362723 attactagatgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttc 41362808  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 177
Target Start/End: Original strand, 43025974 - 43026059
Alignment:
Q  92 cattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43025974 cattattagataaattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 43026059  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 13307834 - 13307936
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||  ||||    
T  13307834 ttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttgcaagcattacaagat 13307932  T
Q  103 gaat 106  Q
    ||||    
T  13307933 gaat 13307936  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Original strand, 34463704 - 34463792
Alignment:
Q  22 tcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactatt 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||   || |||||||||||| || |||||||||||||    
T  34463704 tcatcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtcc---atgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Original strand, 43025921 - 43025972
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaa 62  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43025921 atcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgtcaacgataaaa 43025972  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 41910959 - 41910895
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagt 76  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  41910959 atcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaaagatg-caacgataaaatattacctgtaagt 41910895  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 7998497 - 7998553
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagta 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7998497 atcacataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaacgataaaatagta 7998553  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 178
Target Start/End: Original strand, 13307931 - 13307965
Alignment:
Q  144 atgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13307931 atgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 13307965  T

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Target: chr6 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3879911 - 3879698
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3879911 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 3879812  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgta 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||| |    
T  3879811 gaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcctgactgca 3879712  T
Q  203 ccgtataagctccc 216  Q
    ||||| ||| ||||    
T  3879711 ccgtagaaggtccc 3879698  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6091152 - 6090941
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6091152 aagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 6091053  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtacc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        | ||||||||||||| |||    
T  6091052 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtaagttttctgactgcacc 6090953  T
Q  205 gtataagctccc 216  Q
    ||| ||||||||    
T  6090952 gtagaagctccc 6090941  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 1946046 - 1946221
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1946046 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaagcattattagat 1946145  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1946146 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 1946221  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 20768306 - 20768510
Alignment:
Q  15 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattg 114  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20768306 cataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaattactattg 20768405  T
Q  115 atcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgtaccgtataagctc 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||       ||| ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  20768406 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttcctgactgcaccgtagaagctc 20768505  T
Q  215 ccatt 219  Q
    |||||    
T  20768506 ccatt 20768510  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33892975 - 33892809
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  33892975 tcacatgatatcagcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattacta 33892876  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33892875 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaattaactttttc 33892809  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 5627603 - 5627817
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  5627603 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaggt 5627702  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||        ||||||| |||||||     
T  5627703 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaaatcagtttcctgactgc 5627802  T
Q  202 accgtataagctccc 216  Q
    |||||| ||||||||    
T  5627803 accgtagaagctccc 5627817  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7235007 - 7234829
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  7235007 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagat 7234908  T
Q  103 gaattactattgatcattaat---caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7234907 gaattactattgatcattaatcaacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttc 7234829  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21017084 - 21016916
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  21017084 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtctaagatgttgcaagcattactagat 21016991  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21016990 gaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaattaacttttt 21016916  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4318794 - 4318626
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||   | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4318794 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagatgttgcaagcattactagat 4318695  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  4318694 gaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaa 4318626  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 8513440 - 8513608
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  8513440 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatcttgcaagcattactagat 8513539  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8513540 gaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttc 8513608  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 29182376 - 29182548
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  29182376 ttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagtattactagat 29182475  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  29182476 gaattac---tgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaattaactttttc 29182548  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 6089115 - 6089283
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||| || ||    
T  6089115 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaagcattactatat 6089214  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  6089215 gaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaattttttc 6089283  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 33619049 - 33619219
Alignment:
Q  15 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaat-----atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattac 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  33619049 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattac 33619148  T
Q  110 tattgatcatta---atcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33619149 tattgatcattaatgatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaattaacttttt 33619219  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7054697 - 7054569
Alignment:
Q  51 ccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaat 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7054697 ccaacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaagatgaat 7054598  T
Q  150 caaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7054597 caaacattaaaatcaaaattaactttttc 7054569  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 30353330 - 30353256
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtc 77  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  30353330 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 30353256  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724062
Alignment:
Q  117 cattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaac 172  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33724062  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 408402 - 408227
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  408402 ttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 408303  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  408302 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttc 408227  T

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Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 346 - 515
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  346 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatgttgcaagcattactagat 439  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  440 gaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttc 515  T

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Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 94056 - 93900
Alignment:
Q  20 tatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcat 119  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  94056 tatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcat 93957  T
Q  120 taatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  93956 taatcactaatcaacaattt-aaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 93900  T

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Target: scaffold0318 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 12121 - 12294
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  12121 ttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagat 12220  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12221 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 12294  T

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Target: scaffold0291 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 8099 - 8271
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8099 ttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 8198  T
Q  103 gaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaacttt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  8199 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 8271  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 145989 - 145769
Alignment:
Q  3 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  145989 ttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaat 145890  T
Q  103 gaat-tactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttcnnnnnnntcagttttctgactgt 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||       ||| ||| |||||||     
T  145889 gaatatacaattgatcattaatcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcctgactgc 145790  T
Q  202 accgtataagctcccatttta 222  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  145789 accgtagaagctcccttttta 145769  T

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Target: scaffold0061 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 44176 - 44343
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||    
T  44176 atcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattact 44275  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  44276 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttc 44343  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 154611 - 154444
Alignment:
Q  11 atcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattact 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||    
T  154611 atcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattact 154512  T
Q  111 attgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  154511 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttc 154444  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 267499 - 267663
Alignment:
Q  5 aagacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatga 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||    
T  267499 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgctgcaagaattactagatga 267598  T
Q  105 attactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaattaactttttc 178  Q
    ||||         |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  267599 atta---------accaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttc 267663  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 100948 - 101058
Alignment:
Q  12 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattacta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||            |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||    
T  100948 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacga------------tgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta 101035  T
Q  112 ttgatcattaatcaataatcaacaa 136  Q
      |||||||||||| ||||||||||    
T  101036 --gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

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