View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16592_low_1 (Length: 1009)

Name: NF16592_low_1
Description: NF16592
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16592_low_1
NF16592_low_1
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (16-929)||(21849528-21850441)
chr3 (16-842)||(54167344-54168172)
chr3 (16-766)||(43553623-43554371)
chr3 (16-695)||(53353126-53353810)
chr3 (685-929)||(21847107-21847351)
chr3 (687-884)||(9697586-9697783)
chr3 (686-884)||(43547722-43547920)
chr3 (687-884)||(11004365-11004560)
chr3 (687-884)||(9105275-9105470)
chr3 (686-842)||(54171924-54172082)
chr3 (765-884)||(43554645-43554764)
chr3 (687-842)||(39399127-39399279)
chr3 (748-870)||(755889-756012)
chr3 (954-1009)||(21847375-21847430)
chr3 (954-1009)||(21850465-21850520)
chr3 (734-842)||(38175790-38175896)
chr3 (954-1009)||(54167181-54167236)
chr3 (954-1009)||(54171761-54171816)
chr3 (619-695)||(1298999-1299075)
chr3 (759-792)||(755824-755857)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (16-929)||(8054721-8055632)
chr2 (16-842)||(36674380-36675208)
chr2 (16-842)||(35950443-35951266)
chr2 (687-929)||(8050839-8051079)
chr2 (687-884)||(12999426-12999622)
chr2 (687-929)||(6463355-6463583)
chr2 (686-842)||(36670502-36670660)
chr2 (687-851)||(13270980-13271131)
chr2 (954-1009)||(8051103-8051158)
chr2 (687-842)||(41093824-41093976)
chr2 (754-842)||(34590280-34590366)
chr2 (954-1005)||(36670768-36670821)
chr2 (954-1005)||(36675316-36675369)
chr2 (954-1004)||(8055656-8055708)
chr2 (963-1004)||(6463284-6463325)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (16-842)||(44865-45693)
scaffold0044 (687-842)||(49445-49602)
scaffold0044 (954-1009)||(44703-44758)
scaffold0044 (954-1009)||(49283-49338)
scaffold0044 (886-929)||(44782-44824)
scaffold0044 (886-929)||(49362-49404)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (16-929)||(8315421-8316332)
chr6 (153-884)||(17886810-17887536)
chr6 (16-503)||(27568524-27569011)
chr6 (501-929)||(27552026-27552453)
chr6 (687-929)||(8319960-8320199)
chr6 (687-884)||(17096236-17096431)
chr6 (687-884)||(17895685-17895881)
chr6 (687-929)||(17779914-17780155)
chr6 (493-791)||(17163431-17163730)
chr6 (687-884)||(14531749-14531945)
chr6 (686-926)||(27574657-27574885)
chr6 (33-297)||(3596065-3596327)
chr6 (18-351)||(23255807-23256140)
chr6 (448-595)||(3596333-3596480)
chr6 (223-376)||(15565405-15565558)
chr6 (726-842)||(6440865-6440979)
chr6 (954-1009)||(8315342-8315396)
chr6 (954-1009)||(8319881-8319935)
chr6 (963-1009)||(17096114-17096160)
chr6 (632-695)||(8855275-8855339)
chr6 (754-792)||(7888212-7888250)
chr6 (613-695)||(23256303-23256385)
chr6 (661-694)||(3597592-3597625)
chr6 (750-791)||(17159659-17159700)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (16-842)||(197684-198512)
chr8 (16-842)||(312521-313349)
chr8 (16-842)||(43807485-43808311)
chr8 (16-929)||(30405737-30406631)
chr8 (16-789)||(41949139-41949902)
chr8 (25-700)||(1290662-1291337)
chr8 (25-675)||(31473324-31473974)
chr8 (25-867)||(27435169-27436000)
chr8 (687-926)||(28644562-28644799)
chr8 (687-929)||(30410246-30410486)
chr8 (687-884)||(33071918-33072113)
chr8 (687-884)||(42234656-42234851)
chr8 (686-842)||(202202-202360)
chr8 (686-842)||(317039-317197)
chr8 (687-895)||(38757003-38757197)
chr8 (687-842)||(43812044-43812199)
chr8 (33-349)||(17782650-17782963)
chr8 (480-694)||(17782356-17782570)
chr8 (687-785)||(41945339-41945434)
chr8 (510-611)||(44912831-44912931)
chr8 (954-1004)||(30405664-30405713)
chr8 (954-1009)||(38757253-38757307)
chr8 (954-1004)||(30410172-30410222)
chr8 (891-929)||(197602-197639)
chr8 (891-929)||(202120-202157)
chr8 (891-929)||(312439-312476)
chr8 (891-929)||(316957-316994)
chr8 (963-1004)||(28644833-28644875)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (16-842)||(44150887-44151715)
chr4 (16-884)||(8892582-8893449)
chr4 (16-884)||(50627904-50628759)
chr4 (16-842)||(31358489-31359303)
chr4 (686-929)||(31670089-31670330)
chr4 (686-884)||(53722006-53722202)
chr4 (687-884)||(10317025-10317220)
chr4 (687-884)||(27186142-27186341)
chr4 (687-842)||(3770842-3770999)
chr4 (687-842)||(44147023-44147180)
chr4 (694-884)||(43683636-43683813)
chr4 (33-187)||(29258040-29258194)
chr4 (785-884)||(35842843-35842942)
chr4 (687-842)||(41884925-41885076)
chr4 (686-842)||(49274517-49274669)
chr4 (954-1009)||(3771106-3771161)
chr4 (954-1009)||(44147284-44147339)
chr4 (954-1009)||(44151819-44151874)
chr4 (687-842)||(31354678-31354829)
chr4 (559-694)||(29258261-29258396)
chr4 (722-871)||(53785880-53786028)
chr4 (63-148)||(23428367-23428452)
chr4 (751-792)||(45976222-45976263)
chr4 (889-929)||(44147223-44147262)
chr4 (889-929)||(44151758-44151797)
chr4 (715-766)||(35842797-35842847)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (16-929)||(27760726-27761638)
chr7 (16-842)||(7940083-7940911)
chr7 (16-861)||(13828087-13828933)
chr7 (687-929)||(22901154-22901396)
chr7 (25-710)||(22580265-22580948)
chr7 (693-926)||(47419498-47419729)
chr7 (687-929)||(27756846-27757087)
chr7 (686-884)||(35705633-35705830)
chr7 (687-842)||(7944636-7944793)
chr7 (687-884)||(7466485-7466669)
chr7 (756-880)||(733632-733756)
chr7 (954-1009)||(7939921-7939976)
chr7 (954-1009)||(7944474-7944529)
chr7 (954-1009)||(22901420-22901475)
chr7 (954-1009)||(27757111-27757166)
chr7 (954-1009)||(27761662-27761717)
chr7 (717-798)||(37355589-37355670)
chr7 (887-929)||(7940000-7940041)
chr7 (887-929)||(7944553-7944594)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (16-842)||(12022618-12023446)
chr5 (16-842)||(7099374-7100202)
chr5 (16-842)||(16797998-16798826)
chr5 (16-842)||(37681365-37682182)
chr5 (166-798)||(10276683-10277313)
chr5 (332-926)||(40367531-40368112)
chr5 (540-884)||(26336767-26337111)
chr5 (25-695)||(26454406-26455076)
chr5 (687-926)||(30695293-30695530)
chr5 (687-884)||(32485947-32486143)
chr5 (687-884)||(19502307-19502504)
chr5 (687-842)||(12018731-12018888)
chr5 (687-842)||(7103943-7104100)
chr5 (687-842)||(16794108-16794265)
chr5 (687-884)||(36632314-36632497)
chr5 (687-874)||(43384945-43385138)
chr5 (687-926)||(40371669-40371892)
chr5 (736-870)||(20830304-20830437)
chr5 (17-113)||(10276578-10276674)
chr5 (687-842)||(37658732-37658878)
chr5 (18-695)||(25632059-25632735)
chr5 (687-842)||(10274546-10274698)
chr5 (954-1009)||(12018997-12019052)
chr5 (216-547)||(30066763-30067094)
chr5 (955-1009)||(7099212-7099266)
chr5 (955-1009)||(7103781-7103835)
chr5 (955-1009)||(16798935-16798989)
chr5 (954-1009)||(12023566-12023621)
chr5 (955-1002)||(16794374-16794421)
chr5 (736-811)||(20808675-20808749)
chr5 (955-1005)||(37658985-37659037)
chr5 (955-1005)||(37682289-37682341)
chr5 (889-926)||(12018932-12018970)
chr5 (889-926)||(12023490-12023528)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (16-929)||(26315342-26316240)
chr1 (16-884)||(43591783-43592648)
chr1 (687-929)||(39793831-39794070)
chr1 (687-929)||(16588395-16588635)
chr1 (687-929)||(26311522-26311749)
chr1 (57-695)||(30646736-30647373)
chr1 (686-842)||(10504435-10504588)
chr1 (954-1009)||(39794097-39794151)
[»] scaffold0440 (3 HSPs)
scaffold0440 (16-842)||(6835-7662)
scaffold0440 (441-842)||(2734-3137)
scaffold0440 (954-1004)||(7772-7822)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (689-791)||(60201-60302)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 820; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 820; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 929
Target Start/End: Original strand, 21849528 - 21850441
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21849528 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 21849627  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21849628 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattct 21849727  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21849728 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagtacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 21849827  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21849828 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgaatatattgcagggtgtatggcagcatgttaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 21849927  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21849928 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 21850027  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850028 aagtttcattttctaagggagcaagtgaacaagggagcactgcagattgttcattgctctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 21850127  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttg-ttttaattcaagtttagt 714  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21850128 aggttgacagattcaacaagctcagaagctttattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgtttttaattcaagtttagt 21850227  T
Q  715 tttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850228 tttagtgataatcacaatcagtggttaatcac-agtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagt 21850326  T
Q  815 ttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtata-ttttgtatgtagaatcaataaagatcattttac 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21850327 ttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacatttttgtatatagaatcaataaagatca-tttac 21850425  T
Q  914 aatttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||||    
T  21850426 aatttcatcataactt 21850441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 710; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 54168172 - 54167344
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54168172 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 54168073  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |    ||| || ||||  |||||||||    
T  54168072 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattct 54167973  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167972 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 54167873  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54167872 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatacttaaggagatggagat 54167773  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54167772 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcacatagaagca 54167673  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167672 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 54167573  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167572 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 54167473  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataa--gatctagag 813  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |   |||||    
T  54167472 tcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttaccaaataagggtgttagag 54167373  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167372 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 54167344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 766
Target Start/End: Original strand, 43553623 - 43554371
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  43553623 gttcactgaggtatttatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtggattcatgagtgaaccaag--tatctcacctgctagt 43553720  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43553721 agccaaaagagtggtgagatacatcaaaggaacactgcaatatggtatcctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattct 43553820  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43553821 gatgctgattggtgtggagacaaataggatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcacggtgtgctaagaagcaac 43553920  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43553921 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaagcaatatggcttgaaaatatactcaaatagatggagat 43554020  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    | |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43554021 ataggttagcagacctatggcattgttcatagacaacaaatatggtataatcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcc 43554120  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43554121 aagtttcattttctgagggagctagtgaacaaggaagcattgtagattgttcattgctctattgagctgcagcttgcaaacatattcactaaggcattga 43554220  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43554221 aggttgacaggttcatcaagctcagaagcttgatttgaatgaaggaagtggaaacttgaattaaggggagatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 43554320  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgtta 766  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  |||||||||||||    
T  43554321 ttagtgataatcacaatcagtgattagtcacattttgtttttagtttgtta 43554371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 53353810 - 53353126
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53353810 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcttgatattgcatatgcagttggtataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 53353711  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53353710 agccaaaagggtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattct 53353611  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53353610 gatgctgattggtgtggagacaagcaggatagaaagagcacttcagggtacctatttaagttcttaaatgctccaatttcatggtgtgctaagaaacaac 53353511  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  53353510 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcaggatgtatgacagcatgtcaggcagtatgacttgaaaatatacttaaggaaatggagat 53353411  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  53353410 agaggttagcagacctatagcattgttcatcgacaacaaatatgctataagcttagcaataaatccagttctgcatgggagaagcaagcatataaaggct 53353311  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  53353310 aaattccattttctaagggagcaagtgaacaaaggtgcattgcagattgtccattgctccactgagctgcagcttgcagacatattcacaaaagcattga 53353211  T
Q  616 aggttgacagattc-----atcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagttt 695  Q
    |||||||||| |||     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  53353210 aggttgacaggttcatcatatcaagctcagaagcttgattggcatgaaggaagtggaaacttaaattaagagaggatgctagttt 53353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 685 - 929
Target Start/End: Original strand, 21847107 - 21847351
Alignment:
Q  685 gatgttagtttgtttt-aattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagt 783  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847107 gatgttagtttgtttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcaca-gtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagt 21847205  T
Q  784 ttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtata-tt 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21847206 ttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacattt 21847305  T
Q  883 ttgtatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21847306 ttgtatatagaatcaataaagatca-tttacaatttcatcataactt 21847351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Original strand, 9697586 - 9697783
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697586 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaattagtgattaatcacattttgtttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 9697685  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9697686 ttagaggttagcaaataagatctagagtttgtaacattgcttgtgcttcaagaaacttagctagacattgtatataagctgcctcctttgtatatttt 9697783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 686 - 884
Target Start/End: Original strand, 43547722 - 43547920
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43547722 atgttagcttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtgattaattacattttgtttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 43547821  T
Q  786 gttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43547822 gttagaggttaacaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagcaagacattgtatataagctatctcctttgtatatttt 43547920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 11004560 - 11004365
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11004560 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtgaataatcacat-tttgttttagcttgttatgaagattgttacaagtttg 11004463  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004462 ttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgtttgtgcttcaagcaacctagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 11004365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Original strand, 9105275 - 9105470
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9105275 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcaatgattaatcacat-tttgctttagtttgttatgaagtatgttacaagtttg 9105372  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9105373 ttagaggttaacaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacctaactagacattgtatatgagctacctcctttgtatatttt 9105470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 54172082 - 54171924
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54172082 atgttagtttgttttaattcaagtttagtttcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 54171983  T
Q  786 gttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54171982 gttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 54171924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 765 - 884
Target Start/End: Original strand, 43554645 - 43554764
Alignment:
Q  765 tatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataag 864  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  43554645 tatgaagtttgttacaagtttgttagaggttaacaaataagatctagagtttattacattgcttctgtttcaagcaacttagtaagacattgtatatgag 43554744  T
Q  865 ctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  43554745 ctacctcttttgtatatttt 43554764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 39399279 - 39399127
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | || ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  39399279 tgttagtttgttttaattcaagtttag-tttagtgataatcacaattagtggttaatcac-atttagattcagtttgttatgaattttgttacaagttag 39399182  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||| |||||  ||||| | ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  39399181 ttagagattagctcataaggt-tagggtttgttacttagcttgtacttcaagcaac 39399127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 748 - 870
Target Start/End: Original strand, 755889 - 756012
Alignment:
Q  748 agtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataaga-tctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttag 846  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |  |||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  755889 agtttgttttagtttgttttgaagtttgttacaagtttgttagagtgtaactaataaaaggttagggtttgttacattgcttgtgcttcaagctacctaa 755988  T
Q  847 ctagacattgtatataagctacct 870  Q
    |||||   ||||||||||||||||    
T  755989 ctagatggtgtatataagctacct 756012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 21847375 - 21847430
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21847375 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 21847430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 21850465 - 21850520
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21850465 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 21850520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 734 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 38175896 - 38175790
Alignment:
Q  734 agtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgct 833  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||    
T  38175896 agtggttaatcacat-ttagtttcagtttgttatgaattttgttacaagttagttagagattagctcataagat-tagggtttgttacttagcttgtact 38175799  T
Q  834 tcaagcaac 842  Q
    |||||||||    
T  38175798 tcaagcaac 38175790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 54167236 - 54167181
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54167236 aattcgcataaatccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 54167181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 54171816 - 54171761
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54171816 aattcgcataaatccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 54171761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 695
Target Start/End: Original strand, 1298999 - 1299075
Alignment:
Q  619 ttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagttt 695  Q
    |||||||||||| | |||| | ||| |||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1298999 ttgacagattcaacgagcttaaaagcttgattggtatggtagaattggaaacttgaattaagggaggatgttagttt 1299075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 759 - 792
Target Start/End: Original strand, 755824 - 755857
Alignment:
Q  759 gtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagag 792  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  755824 gtttgttttgaagtttgttacaagtttgttagag 755857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 815; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 815; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 929
Target Start/End: Original strand, 8054721 - 8055632
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8054721 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 8054820  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8054821 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattct 8054920  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8054921 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 8055020  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8055021 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 8055120  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8055121 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctacatggaagaagcaagcatatagaagca 8055220  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8055221 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagtttgcagacatattcactaaggcattga 8055320  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8055321 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-t 8055419  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtt 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8055420 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcac-attctattttagtttgttatgaagtttgttgcaagtttgttagaggttagtagataagatctagagtt 8055518  T
Q  816 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgtatgtagaatcaataaagatcattttacaa 915  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8055519 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacatttcatatgtagaatcaataaagatc-ttttacaa 8055617  T
Q  916 -tttcatcataactt 929  Q
     ||||||||||||||    
T  8055618 ttttcatcataactt 8055632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 706; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Original strand, 36674380 - 36675208
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36674380 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 36674479  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |    ||| || ||||  |||||||||    
T  36674480 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattct 36674579  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674580 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 36674679  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674680 cagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 36674779  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36674780 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcc 36674879  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674880 aagttccattttctgagggagcaagtgaacaagggagcacttcagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 36674979  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674980 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattacgggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 36675079  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  36675080 tcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 36675179  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675180 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 36675208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 35951266 - 35950443
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35951266 gttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctactagc 35951167  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| || ||||| |||||||||    
T  35951166 agccaaaagaatgatgagatatatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgatctgatagcatattct 35951067  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35951066 gatgttgattggtgtggagacattcaagatagaaagagtacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 35950967  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35950966 cagttgtggcattgtcaatctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 35950867  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  35950866 agaggttagcagacctatataattgttcatagacaacaaatctgctataagcttagcaataaatccagttatgcatggaagaagcaagcatatagaagcc 35950767  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35950766 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactgcagattgttcattgctccactgagctacagcttgcagacatattcactaaggcattga 35950667  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35950666 aggttgacaggttcatcaagcttagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-t 35950568  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtt 815  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||   |||| | ||| |||    
T  35950567 ttagtgataatcacaattagtggttaatcac-atttaggttcagtttgttatgaattttgttacaagttagttagagattagctcgtaaggt-tagggtt 35950470  T
Q  816 tgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||    
T  35950469 tgttacttagcttgtacttcaagcaac 35950443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Original strand, 8050839 - 8051079
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050839 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tctattttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 8050936  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgt 886  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  8050937 ttagaggttagtagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacctagctagatattgtatataagctgcctcctttgtacatttcat 8051036  T
Q  887 atgtagaatcaataaagatcattttacaa-tttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8051037 atgtagaatcaataaagatc-ttttacaattttcatcataactt 8051079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 12999622 - 12999426
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12999622 tgttagtttgttttaatttaagtttagttttagtgataataacaatcagtggttaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 12999524  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12999523 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattacttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctatctcctttgtatatttt 12999426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 6463583 - 6463355
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||            ||||||||    
T  6463583 tgttagtttgtcttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tttgttttagtttgtta------------caagtttg 6463498  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt-g 885  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6463497 ttagaggttagtagataagatctagagtttgttacattatttgtgcttcaagcaacctagctagatattgtatataagctacctcctttgtacattttag 6463398  T
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6463397 tatgtagaatcaataaagatca-attacaatttcatcataactt 6463355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Original strand, 36670502 - 36670660
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670502 atgttagtttgttttaattcaagtttagtttcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 36670601  T
Q  786 gttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670602 gttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 36670660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 687 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 13271131 - 13270980
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||            |||||||    
T  13271131 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtgattaattac-actttattttagtttgttat------------aagtttg 13271045  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctaga 851  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13271044 ttagaggttagtaaataagatctaaagtttgttacattgtttttgcttcaagcaacttagctaga 13270980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 8051103 - 8051158
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8051103 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 8051158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 41093824 - 41093976
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  | || | || ||||||||||||| |||||||||| || |    
T  41093824 tgttggtttgttttaattcaaatttagttt-agtgataatcacaattagtgattaatca-tatttagattcagtttgttatgaattttgttacaaattag 41093921  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||| |||||  ||||| | ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  41093922 ttagagattagctcataaggt-tagggtttgttacttagcttgtacttcaagcaac 41093976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 754 - 842
Target Start/End: Original strand, 34590280 - 34590366
Alignment:
Q  754 ttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||| |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  34590280 ttttagtttgttatgaa-tttgttacaagtttgttagagattagcatat-agagttagggtttgttatatagcttgtgctttaagcaac 34590366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1005
Target Start/End: Original strand, 36670768 - 36670821
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaac--tgcttctgaaca 1005  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  36670768 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaacagtgcttctgaaca 36670821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1005
Target Start/End: Original strand, 36675316 - 36675369
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaac--tgcttctgaaca 1005  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  36675316 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaacagtgcttctgaaca 36675369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 954 - 1004
Target Start/End: Original strand, 8055656 - 8055708
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaac--tgcttctgaac 1004  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  8055656 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaacagtgcttctgaac 8055708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 963 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 6463325 - 6463284
Alignment:
Q  963 aaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaac 1004  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6463325 aaaaccttagaataagaaactgcttctgaactgcttctgaac 6463284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 778; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 778; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 45693 - 44865
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693 gttcactgaggtatctatgtaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 45594  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45593 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattct 45494  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45493 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 45394  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 45294  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45293 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcacatagaagca 45194  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45193 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 45094  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45093 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 44994  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  44993 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 44894  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44893 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 44865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 49602 - 49445
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49602 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 49503  T
Q  787 ttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49502 ttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 49445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 44758 - 44703
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44758 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 44703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 49338 - 49283
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  49338 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttatgaactgcttctgaacagtgc 49283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 886 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 44824 - 44782
Alignment:
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44824 tatgtagaatcaataaagatca-tttacaaattcatcataactt 44782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 886 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 49404 - 49362
Alignment:
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49404 tatgtagaatcaataaagatca-tttacaaattcatcataactt 49362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 778; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 778; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 8316332 - 8315421
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8316332 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 8316233  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |    ||| || ||||  |||||||||    
T  8316232 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattct 8316133  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8316132 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 8316033  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8316032 cagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 8315933  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315932 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagtttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 8315833  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8315832 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgatctactgagctgaagcttgcagacatattcactaaggcattaa 8315733  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8315732 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-t 8315634  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtt 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8315633 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagtagataagatctagagtt 8315534  T
Q  816 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgtatgtagaatcaataaagatcattttacaa 915  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  8315533 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacatttcatatgtagaatcaataaagatcaattt-cat 8315435  T
Q  916 tttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||    
T  8315434 tttcatcataactt 8315421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 153 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 17887536 - 17886810
Alignment:
Q  153 cagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaaga 252  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17887536 cagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatatcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaaga 17887437  T
Q  253 gcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17887436 gcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgatccaatttcaccgtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatat 17887337  T
Q  353 tgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaatttctcatagacaac 452  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17887336 tgcagggtgtatggaagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattgttcatagacaac 17887237  T
Q  453 aaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggag 552  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17887236 aaatcagctataagcttagcaagaaatctagttctgcatggaagaagtaaacatgtagaagctaacttccattttctgagggagcaagtaaacaagggag 17887137  T
Q  553 cactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattgg 652  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17887136 cactgcagattgttcattgctctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattgg 17887037  T
Q  653 aatgaaggaa--gtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagt 750  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  17887036 aatgaaggaagtgtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtgattaatcac-att 17886938  T
Q  751 ttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctag 850  Q
    ||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17886937 ttgttttagtttgttataaagt------aaagtttgttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcagcttagctag 17886844  T
Q  851 acattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17886843 acattgtatataagctacctcctttgtatttttt 17886810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 27569011 - 27568524
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27569011 gttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 27568912  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| || ||||| ||||||| |    
T  27568911 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatgacattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattat 27568812  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27568811 gatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 27568712  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27568711 caattgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 27568612  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaag 503  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27568611 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaag 27568524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 501 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 27552453 - 27552026
Alignment:
Q  501 aagcatatagaagcaaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatat 600  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552453 aagcatatagaagccaagtttcattttctaagggagcaagtaaacaagggagcactgcagattgttcattgctctactgagctgcagcttgcagacatat 27552354  T
Q  601 tcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgtttt 700  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552353 tcactaaggcattgaaggttgacatattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgtttt 27552254  T
Q  701 aattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcag 800  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  27552253 aattcaagtttag-tttagtgataatcacaatcagtggttaatcac-attttgttttagtttgttatgaagtttgttacaggtttgttaaacgttagcag 27552156  T
Q  801 ataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt--gtatgtagaatcaa 898  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  27552155 ataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacatttttcgtatggagaatcaa 27552056  T
Q  899 taaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  27552055 taagaatca-attacaatttcatcataactt 27552026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 8320199 - 8319960
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8320199 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacaa-tatgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 8320102  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgt 886  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  8320101 ttagaggttagtagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagaaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacatttctt 8320002  T
Q  887 atgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  8320001 atgtagaatcaataaagatcaattt-cattttcatcataactt 8319960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 17096431 - 17096236
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17096431 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtgattaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 17096334  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17096333 ttagaggttagcagataagatctatagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtacatttt 17096236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 17895881 - 17895685
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17895881 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtgattaatcacat-tttattttagtttgttctgaagtttgttacaagtttg 17895783  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17895782 ttagaggttagcaaataagatctagaatttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctaggcattgtatataagctacctcctttgtatttttt 17895685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Original strand, 17779914 - 17780155
Alignment:
Q  687 tgttagtttgtttt-aattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17779914 tgttagtttgttttgaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagagattaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttaaaagttt 17780011  T
Q  786 gttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt- 884  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  17780012 gttagaggctagtagataagatttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctatctcctttgtacattttc 17780111  T
Q  885 gtatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  17780112 gtatgtagaatcaataagaatca-attacaatttcatcataactt 17780155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 493 - 791
Target Start/End: Original strand, 17163431 - 17163730
Alignment:
Q  493 gaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgc 592  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||| ||||| || ||||||||||  |||||    
T  17163431 gaagaagcaaacacgtagaggcaaagttccattttctgagggagaaagtgaacaaaggtgcattgcagattgtccattgctccactgagctgcttcttgc 17163530  T
Q  593 agacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttag 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17163531 agacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggtatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttag 17163630  T
Q  693 tttgttt--taattcaagtttagttttagtgataatcacaatcag-tggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgtta 789  Q
    |||  ||  ||||||||||||||  |||||||| |||   || || || || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17163631 tttagttgataattcaagtttag-attagtgatgatcgtgattagttgattgatcac-actttgttttagtttgttttgaagtttgttacaagttggtta 17163728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 14531945 - 14531749
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14531945 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagttataatcacaatcaatgattaatcacat-tttgttttagttcgttatgaagtttgttacaggtttg 14531847  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14531846 ttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttgaagcaacttagctagacattgtatatactctaccacctttgtatatttt 14531749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 27574885 - 27574657
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||           
T  27574885 atgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgtta------- 27574795  T
Q  786 gttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt- 884  Q
        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  27574794 ----gaggttagcagataagatctaaagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgaacattttt 27574699  T
Q  885 -gtatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataa 926  Q
     ||||| | |||||||||  ||||  ||||||||||| |||||    
T  27574698 cgtatggaaaatcaataagaatca-attacaatttcaccataa 27574657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Original strand, 3596065 - 3596327
Alignment:
Q  33 tgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatga 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3596065 tgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggtataatcagacgattcatgagtgaaccaagagcatctcacctgctagcagctaaaagagtgatga 3596164  T
Q  133 gatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtgg 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||| | ||||| |  | || |||| | ||  | ||||||||||| ||||||| |||    
T  3596165 gatacatcaaaggaacactagagtat-gcattttgtttcctaaatgtataaatgaaaactctacggaatttataacttattctgatgcagattggt-tgg 3596262  T
Q  233 agacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcat 297  Q
      | |  | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3596263 gaataagcgagataggaagagcacatcaggttacctattcaagtttctgaatgctccaatttcat 3596327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 351
Target Start/End: Original strand, 23255807 - 23256140
Alignment:
Q  18 tcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcag 117  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |  ||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  23255807 tcactgaggtatttgtgcaatagaaggcctgatattgcttatgcacttggcataattagcatgttcgtgagtgaaccaagagcttctcacttgcaagcag 23255906  T
Q  118 ccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctga 217  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||| || |||||||||||| ||| | |   || ||||||  |||| || ||||||||    
T  23255907 ctaaaagggtgatgagatacatcaattgaatactagagtaaggtatactgtttcctaaatgtctgacttaagattctatggagttgatagcttattctga 23256006  T
Q  218 tgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaacca 317  Q
    |||  ||| |||||| || |  ||||||| ||||||||| | ||| |||||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  23256007 tgcatattagtgtggggataagcaagatataaagagcaccttaggttacctatttaaatttctgaatgctccaatctcttggtgtgctaagaagcaacta 23256106  T
Q  318 gttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtata 351  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  23256107 gtggtagcattgtgaacatgtaaatctgagtata 23256140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 448 - 595
Target Start/End: Original strand, 3596333 - 3596480
Alignment:
Q  448 acaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaa 547  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  3596333 acaacaaatcggctataaacttagtaaagaatccagttttgcatggaaggaggaagcacattgaagctaagtttcactttcttagggaacaagtaaacaa 3596432  T
Q  548 gggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcaga 595  Q
    |  |||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3596433 gcaagcattgaagattgtccattgttctactgagctgcaacttgcaga 3596480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15565558 - 15565405
Alignment:
Q  223 attggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgt 322  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| | ||  | ||||| |||||||||||||  || ||||||||| | |||||| ||||  |  |    
T  15565558 attggtgtggagataggcaagataggaaaagcacttcatgctaattgttcaaatttatgaatgctcttatatcatggtgtacaaagaagaaacctataat 15565459  T
Q  323 agcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtca 376  Q
     ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||    
T  15565458 ggcactttcaacttgtgaatctgagtacattgcagagtgtttagcagcatgtca 15565405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 726 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 6440979 - 6440865
Alignment:
Q  726 tcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattg 825  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | ||| ||||||||| | |    
T  6440979 tcacaattagtggttaatcacat-ttagattcagtttgttatgaattttgttacaagttagttagagattagctcataaggt-tagggtttgttacttag 6440882  T
Q  826 cttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||| |||||||||||    
T  6440881 cttgtacttcaagcaac 6440865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 8315396 - 8315342
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8315396 aattcacataaa-ccttagaataagaaactgcttctgaactgcttctgaagagtgc 8315342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 8319935 - 8319881
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8319935 aattcacataaa-ccttagaataagaaactgcttctgaactgcttctgaagagtgc 8319881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 963 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 17096160 - 17096114
Alignment:
Q  963 aaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17096160 aaaaccttagaataagaaactgcttctgaactgcttctgaagagtgc 17096114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 632 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 8855339 - 8855275
Alignment:
Q  632 caagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtgg-aaacttgaattaagggaggatgttagttt 695  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8855339 caagctcagaagcttgattggaatggtgaagttggaaaacttgaattaagggaggatgttagttt 8855275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 754 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 7888250 - 7888212
Alignment:
Q  754 ttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagag 792  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7888250 ttttagtttgttttgaagtttgttacaactttgttagag 7888212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 613 - 695
Target Start/End: Original strand, 23256303 - 23256385
Alignment:
Q  613 tgaaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagttt 695  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||  ||  | || |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  23256303 tgaaggttgacaggttcatcaagctaagaagcttgactggtttggtgaaaatggaaaccagaattaagggaggatgttggttt 23256385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 661 - 694
Target Start/End: Original strand, 3597592 - 3597625
Alignment:
Q  661 aagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtt 694  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3597592 aagttgaaacttgaattaagggaggatgttagtt 3597625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 750 - 791
Target Start/End: Original strand, 17159659 - 17159700
Alignment:
Q  750 tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttaga 791  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  17159659 tttgttttagtttgttttgacgtttgttacaagttggttaga 17159700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 770; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 770; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 198512 - 197684
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198512 gttcactgaggtatctatgtaatagtaagcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 198413  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  198412 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacaatgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattct 198313  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198312 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 198213  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198212 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 198113  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  198112 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcacatagaagca 198013  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198012 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 197913  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197912 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 197813  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  197812 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 197713  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  197712 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 197684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 770; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 313349 - 312521
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  313349 gttcactgaggtatctatgtaatagtaagcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 313250  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  313249 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacaatgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattct 313150  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  313149 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 313050  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  313049 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 312950  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  312949 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcacatagaagca 312850  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312849 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 312750  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312749 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 312650  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  312649 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 312550  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  312549 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 312521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 738; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 43808311 - 43807485
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43808311 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 43808212  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43808211 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaatgcttgaatgatagttctatggaactgatggtatattct 43808112  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43808111 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 43808012  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43808011 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 43807912  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43807911 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcc 43807812  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43807811 aagttccattttctgagggagcaagtgaacaagggagcacttcagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 43807712  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43807711 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagcttgttttaattcaagtttag-t 43807613  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  43807612 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcac-attctgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 43807514  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43807513 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 43807485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 708; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 30406631 - 30405737
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30406631 gttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 30406532  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| |||||||| |||||||||    
T  30406531 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattct 30406432  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30406431 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 30406332  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30406331 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 30406232  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30406231 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 30406132  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30406131 aagttccattttctaagggaacaagtgaacaagggagcactgcagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 30406032  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30406031 agattgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-t 30405933  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtt 815  Q
    ||||||||||||||| ||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30405932 ttagtgataatcacattc------------------tgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagtagataagatctagaatt 30405851  T
Q  816 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtata-ttttgtatgtagaatcaataaagatcattttaca 914  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  30405850 tgttacattgcttgtacttcaagcaacctagctagatattgtatataagctacctcctttgtacatttttatatgtagaatcaataaagatca-attaca 30405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 789
Target Start/End: Original strand, 41949139 - 41949902
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41949139 gttcactgaggtatctatgcaatagtagtcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 41949238  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| || ||||| |||||||||    
T  41949239 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattct 41949338  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  41949339 gatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctctaattttattgtgtgctaagaagcaac 41949438  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41949439 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 41949538  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||||     
T  41949539 agaggttagcagacctatagaattgttcatggacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccaattttgtatgggagaagcaagcacatataagct 41949638  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949639 aagttccattttttgagggagcaagtgaa--------cactacagattgttcattgctctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 41949730  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  41949731 aggttgacagtttcatcaagctcagaagcttgatttgaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttcttttaattcaagcttag-t 41949829  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgtta 789  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41949830 ttagtgataatcacaatcagtgattaatcac-actctgttttagtttgttttgaagtttgttacaagttggtta 41949902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 700
Target Start/End: Original strand, 1290662 - 1291337
Alignment:
Q  25 ggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaag 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1290662 ggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggtataatcagcagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaag 1290761  T
Q  125 agtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctgatgctgat 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1290762 ggtgatgagatacatcaaatgaacactgcagtatggcattttatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctaatgttgat 1290861  T
Q  225 tggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtag 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1290862 tggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagagtacctattcaaatttatgaatgcttcaatttcagggtgtgctaagaagcaacctgttgtgg 1290961  T
Q  325 cattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttag 424  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  1290962 tattgtcaacttgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcagacagtatgacttgaaaatatactcaaggagatggagatagaagttaa 1291061  T
Q  425 cagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcat 524  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1291062 cagacctataatattgttcatagacaacaaatctactataagcttggcaagaaatccagttctgcttgggagaagcaagcatatagaagccaagtttcat 1291161  T
Q  525 tttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgaca 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  1291162 tttctgagggagcaagtgaacaagggagcactgcagattgttcattgctctactgagcatcagcttgcagatatattcactaaagctttgaaggttgaca 1291261  T
Q  625 gattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgtttt 700  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1291262 gattcatcaaactcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgtttt 1291337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 31473974 - 31473324
Alignment:
Q  25 ggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaag 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||  | |||||| |||||||    
T  31473974 ggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcaattggtataatcagtatattcatgaatgaaccaagagcatctcattttctagcaaccaaaag 31473875  T
Q  125 agtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctgatgctgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  |||| ||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31473874 agtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcatcctatttcctaagggtttcaatgaaaattttatgaaactgattgcatattctgatgttgat 31473775  T
Q  225 tggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtag 324  Q
    |||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  31473774 tggtatggagacaagcaggatagaaaaagcacttcaggttacctattcaagtttctaaatgccccaatttcatggtgtgttaagaagcaaccagttgtgg 31473675  T
Q  325 cattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttag 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31473674 cattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcaggatgtatggcagcatgccaggcagtatggcttgaaaatatactcaaggagacggagatagaagttag 31473575  T
Q  425 cagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcat 524  Q
    ||||||||| | |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31473574 cagacctattgcattgttcatagataacaaatcttctataagcttagcaagaaatccaattcttcatggaagaagcaagcatatagaagctaagttccat 31473475  T
Q  525 tttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgaca 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31473474 tttctgagggagcaagtgaacaagggagaactgcagattgtccattgctccactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggtattgaaggttgaca 31473375  T
Q  625 gattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaa 675  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  31473374 ggttcatcaagctaagaagtttgactgccatgaaggaagtggaaacttgaa 31473324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 27436000 - 27435169
Alignment:
Q  25 ggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaag 124  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27436000 ggtatctatacaatagtaggccagatattgcatatgcagtaggaatcataagcaggttcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaag 27435901  T
Q  125 agtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctgatgctgat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||| || |||| |  | ||||||| | || || || ||| |||| |||    
T  27435900 agtgatgagatacatcaaaggaacactagagtttggcattctatttcctaggtgtctggatgaaaactctatggaattaatagcttactctaatgcagat 27435801  T
Q  225 tggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtag 324  Q
    ||||||||||| |  || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27435800 tggtgtggagataagcaggatagaaaaagtacctcaggttacctattcaagtttctgaatgccccaatttcatggtgtgctaagaagcaactagttgtgg 27435701  T
Q  325 cattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttag 424  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27435700 cattgtcaacctttgaatctgagtatattgcagggtgtatgacagcatgtcaggcagtatggctttaaaacatactcaaggagatggagatagaagtgag 27435601  T
Q  425 cagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcat 524  Q
    |||||| |||  |||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  27435600 cagaccaataacattgttcaaagataacagatctgctataagcttagcaagaaatccagttttgcttggaagaagcaaacacatagaggctaagttccat 27435501  T
Q  525 tttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgaca 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27435500 tttctgagggagcaagtgaacaagggagcattgcagattgttcattgtttcactaagctgcagcttgcagaaatattcactaagccattgaaggatgaca 27435401  T
Q  625 gattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgata 724  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||  |||||     ||||||| ||||||   |||||||||    
T  27435400 ggttcatcaagctaaagagtttgattggcatgaaagaagtgaaaacttgaattaagagaggaatttagt---agttaattctagttta--cttagtgata 27435306  T
Q  725 atcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagt-ttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacat 823  Q
    ||| || | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  | |||||||||||||      | |||||| || |||  ||| |||||||||||    
T  27435305 atctcacttagtggttaatcacattattgttttagtttgttatgagttattgttacaagttt------gattagcacat-agagttagggtttgttacat 27435213  T
Q  824 tgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagcta 867  Q
     |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  27435212 agcttgtgcttcaagcaacctaagtagatattgtatataagcta 27435169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 687 - 926
Target Start/End: Original strand, 28644562 - 28644799
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28644562 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 28644659  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtata-ttttg 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28644660 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacagtgtatataagctacctcctttgtatatttttg 28644759  T
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataa 926  Q
     |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  28644760 catgtagaatcaataagaatca-attacaatttcatcataa 28644799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 30410486 - 30410246
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30410486 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tctgttttaatttgttatgaagtttgttacaagtttg 30410389  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtata-ttttg 885  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  30410388 ttagaggttagtagataagatctagattttgttacattgcttgtacttcaagcaacctagctagatattgtatataagctacctcctttgtacattttta 30410289  T
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30410288 tatgtagaatcaataaagatca-attacaatttcatcataactt 30410246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Original strand, 33071918 - 33072113
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33071918 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtgattaatcacac-tttcttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 33072015  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072016 ttggaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 33072113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 42234851 - 42234656
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234851 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtgattaatcacac-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 42234754  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42234753 ttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataaactaccttctttgtatatttt 42234656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 202360 - 202202
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202360 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 202261  T
Q  786 gttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202260 gttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 202202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 317197 - 317039
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317197 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 317098  T
Q  786 gttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317097 gttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 317039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 687 - 895
Target Start/End: Original strand, 38757003 - 38757197
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||            |||||||||||||    
T  38757003 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tctgttttagtt------------tgttacaagtttg 38757088  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgt 886  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38757089 ttagaggttagtagataagatctagagtttgttacattgcttgtgattcaagcaacctagccagatattgtatataagctacctcctttgtatattttat 38757188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 43812199 - 43812044
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43812199 tgttagcttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tctgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 43812102  T
Q  787 ttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43812101 ttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 43812044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17782963 - 17782650
Alignment:
Q  33 tgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatga 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||   || ||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17782963 tgcaatagtaggcctaatattgtttatgcagttagcat---caataggttcatgactgaaccaagagcttctcacttgctagcagctaaaagagtgatga 17782867  T
Q  133 gatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtgg 232  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||  ||  | |||||||||||| ||| |||   |||||||||  | || || | |||||||||  | ||||||||    
T  17782866 gatacattaagggaacactagaatatgacatattgtttcctaaatgtctgactgaagattatatggattttatagcttcttctgatgcataatggtgtgg 17782767  T
Q  233 agacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtca 332  Q
     || |  ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  17782766 ggataagcaagatagaaaaaggacctcaggctacctattcaagtttctgaatgctctaatctcttagtgtgctaagaagcaaccagtgttaccattgtca 17782667  T
Q  333 acctgtgaatctgagta 349  Q
    || ||||||||||||||    
T  17782666 acatgtgaatctgagta 17782650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 480 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 17782570 - 17782356
Alignment:
Q  480 ccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactg 579  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||  |  ||||||| || || ||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  17782570 ccagttttgcatggaagaagcaaacacattgaagccaaaatcgattttcttagagaacaagtaaacaaggaagcattgaagattgtccattgttctactg 17782471  T
Q  580 agctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaa 679  Q
    | |||||| ||| |||  | |||| |||  |  ||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  17782470 aactgcagattgtagatttgttcattaaacctctgaaatttgacaggttcatcaagctaagaagcttgattggtatggtgaaagtggaaacttgaattaa 17782371  T
Q  680 gggaggatgttagtt 694  Q
    |||||||||||||||    
T  17782370 gggaggatgttagtt 17782356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 687 - 785
Target Start/End: Original strand, 41945339 - 41945434
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  41945339 tgttagtttgttttaattcaagtttag-tttagtgataatcacaatcaatgattaatcac-actttgttttagtttgtta-caagttggttacaagttt 41945434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 44912931 - 44912831
Alignment:
Q  510 gaagcaaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaagg 609  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||| || || ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  44912931 gaagtaaagtttcattttcttagggaataagtaaacaaaggggctctaaagatt-tccattgttctactgagctgcaacttcctgacatattcactaagg 44912833  T
Q  610 ca 611  Q
    ||    
T  44912832 ca 44912831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 30405713 - 30405664
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaac 1004  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30405713 aattcacataaa-ccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaac 30405664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 38757253 - 38757307
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38757253 aattcacataaa-ccttagaataagaaactgcttctgaactgcttctgaagagtgc 38757307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 30410222 - 30410172
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaact-gcttctgaac 1004  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30410222 aattcacataaa-ccttagaatcagaaactgcttctgaactagcttctgaac 30410172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 891 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 197639 - 197602
Alignment:
Q  891 agaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  197639 agaatcaataaagatcattt-acaatttcatcataactt 197602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 891 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 202157 - 202120
Alignment:
Q  891 agaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  202157 agaatcaataaagatcattt-acaatttcatcataactt 202120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 891 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 312476 - 312439
Alignment:
Q  891 agaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  312476 agaatcaataaagatcattt-acaatttcatcataactt 312439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 891 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 316994 - 316957
Alignment:
Q  891 agaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  316994 agaatcaataaagatcattt-acaatttcatcataactt 316957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 963 - 1004
Target Start/End: Original strand, 28644833 - 28644875
Alignment:
Q  963 aaaaccttagaatcagaaactgattctgaact-gcttctgaac 1004  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28644833 aaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactcgcttctgaac 28644875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 754; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 754; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Original strand, 44150887 - 44151715
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44150887 gttcactgaggtatctatgtaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 44150986  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44150987 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattct 44151086  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151087 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 44151186  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44151187 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 44151286  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44151287 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcc 44151386  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151387 aagttccattttctgagggagcaagtgaacaagggagcacttcagattgttcattgttctactaagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 44151486  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151487 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 44151586  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  44151587 tcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 44151686  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151687 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 44151715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 693; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 8893449 - 8892582
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8893449 gttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgccagc 8893350  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| || || ||| | | || ||| || ||||| |||||||||    
T  8893349 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttattttctaagtgcttaaataaaaattctattgagctgatagcatattct 8893250  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8893249 gatgttgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcaggatacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcacc 8893150  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8893149 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatagcttgaaaatatactcaaagagatggagat 8893050  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8893049 agaggttagcagacctatagaattaatcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaaacatatagaagct 8892950  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892949 gagttccattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgctctactgagctgcaacttgcagacatattcactaaggcattga 8892850  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892849 aggttgacagattcatcaagctcaaaaggttgattggaatgaaggaagtggaaatttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 8892750  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtt 815  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  8892749 ttagtgataatcacaatcagtgattaatcac-attttgttttagtttgttatgaagtttgttacaaatttgttagagattagcaaataagatatagagtt 8892651  T
Q  816 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892650 tgttacatcgcttgtgcttcaagcaacttaactagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 8892582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 612; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 50628759 - 50627904
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  50628759 gttcactgaagtatctatgtagtagttgacctgatattgtatatgcaattggcataatcagtagattcatgagtgaaccaaaagtatctcacctactagc 50628660  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| || |||||  |||||| |    
T  50628659 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgacattttatttcctaagtggttaaatgaaaattctattgagctgataacatatttt 50628560  T
Q  216 -gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaa 314  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50628559 tgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaa 50628460  T
Q  315 ccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggaga 414  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50628459 ccagttgtggcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggaga 50628360  T
Q  415 tagaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagc 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50628359 tagaagttagcagacctatagaattgttcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaattcagttccgcatggaagaagcaagcatatagaagc 50628260  T
Q  515 aaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattg 614  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50628259 caagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactgtagattgttcattgctctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattg 50628160  T
Q  615 aaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagt 714  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50628159 aaggttgacaggttcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggcagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagattagt 50628060  T
Q  715 tttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagt 814  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||  ||        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50628059 tttagtg-taatcacaatcagtgattaatcac---tttttttt--tt--------agtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataagatctagagt 50627974  T
Q  815 ttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50627973 ttgttacattgcttgtacttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttatatatttt 50627904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Original strand, 31358489 - 31359303
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||    
T  31358489 gttcactaaggtatctatacaatagtatgcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattca--------ccaagagtatctcacctgctagc 31358580  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| || ||||| |||||||||    
T  31358581 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgacattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattct 31358680  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358681 gatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 31358780  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31358781 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctaagtatattgcaggatgtatggcagtatgtcaggcagtatggcttgaaaatatactcaatgagatggagat 31358880  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||      
T  31358881 agaggttagcagacctatagcattgttcatagacaacaaatctgttataagcttagaaagaaatctagttatgcatgggagaagcaagcatatagaagtc 31358980  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31358981 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactgtagattgttcattgctctactgagctgcagcttgcagacatattcattaaggcattga 31359080  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31359081 aggttgacaggttcatcaagctcag-agcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-t 31359178  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtt 815  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || | || |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | ||| |||    
T  31359179 ttaatgataatcacaattagtggttaatcac-atttagattcagtttgctatgaattttgttacaagttagttagagattagctcataaggt-tagggtt 31359276  T
Q  816 tgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||    
T  31359277 tgttacttagcttgtacttcaagcaac 31359303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 686 - 929
Target Start/End: Original strand, 31670089 - 31670330
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31670089 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcaca-gtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 31670187  T
Q  786 gttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttg 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31670188 gttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttctgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttg 31670287  T
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31670288 aatgtagaatcaataaagatca-tttacaatttcatcataactt 31670330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 686 - 884
Target Start/End: Original strand, 53722006 - 53722202
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53722006 atgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 53722103  T
Q  786 gttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53722104 gttagaggctagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctatatattgtatataagctacctcctttgtacatttt 53722202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 10317220 - 10317025
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317220 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agttataatcacaatcagtgattaatcacac-tttgttgtagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 10317123  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317122 ttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttaactagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 10317025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Original strand, 27186142 - 27186341
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtt-tgttttagttt-gttatgaagtttgttacaagtt 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27186142 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaattagtgattaatcacattttgttttttagttttgttatgaagtttgttacaagtt 27186241  T
Q  785 tgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27186242 tgttagaggttagcaaataagatctagagtttgtaacattgcttgtgcttcaagaaacttagctagacattgtatataagctgcctcctttgtatatttt 27186341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 3770842 - 3770999
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770842 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 3770941  T
Q  787 ttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770942 ttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 3770999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 44147023 - 44147180
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44147023 tgttagtttgttttaattcaagtttagtttcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 44147122  T
Q  787 ttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44147123 ttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 44147180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 694 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 43683813 - 43683636
Alignment:
Q  694 ttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagagg 793  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  43683813 ttgttttaattcaagttta-ttttagtgataatcacaatcagtgattaatcacac-tttgttttagtttgttatgaagtttgtta-----------gagg 43683727  T
Q  794 ttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43683726 ttagcaaataagatatagagtttgttacattgtttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacatcctttgtatatttt 43683636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 187
Target Start/End: Original strand, 29258040 - 29258194
Alignment:
Q  33 tgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatga 132  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29258040 tgcaatagtaaaccttatattgcttatgcagttggtataatcagtaggttcatgagtgaaccaagagcttctcacttgctagcagctaaaagagtgatga 29258139  T
Q  133 gatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatga 187  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||    
T  29258140 gatacatcaagggaacactatagtatggcattttgtttcctaaatgtctgaatga 29258194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 785 - 884
Target Start/End: Original strand, 35842843 - 35842942
Alignment:
Q  785 tgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35842843 tgttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacaatgcttgtgcttcaagcaacttagttagacattgtatataaactacctcctttgtatatttt 35842942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 41884925 - 41885076
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || | || ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41884925 tgttggtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaattagtggttaatcac-atttagattcagtttgttatgaa-tttgttacaagttag 41885021  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  41885022 ttagagattagctcataagat-tagggtttgttacttagcttgtacttcaagcaac 41885076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 49274669 - 49274517
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | || | || ||||||||||||| |||||||||||||     
T  49274669 atgttagtttgttttaattcaagtttag-tttagtgatgatcataattagtggttaatcac-atttagattcagtttgttatgaa-tttgttacaagtta 49274573  T
Q  786 gttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||| |||||  ||||| | ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  49274572 gttagagattagctcataaggt-tagggtttgttacttagcttgtacttcaagcaac 49274517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 3771106 - 3771161
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3771106 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 3771161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 44147284 - 44147339
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44147284 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 44147339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 44151819 - 44151874
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44151819 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 44151874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 31354678 - 31354829
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || | || || |||||||||| |||||||||||||      
T  31354678 tgttagtttgttttaatttaagtttag-tttagtgataattacaattagtggttaatcac-atttagattcag-ttgttatgaattttgttacaagttac 31354774  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||| | |||||  ||||| | ||| ||||||||| | |||||| | |||||||||    
T  31354775 ttagggattagctcataaggt-tagggtttgttacttagcttgtacgtcaagcaac 31354829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 559 - 694
Target Start/End: Original strand, 29258261 - 29258396
Alignment:
Q  559 agattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaa 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |  | || ||||| || || ||||| || ||| | |||||||| ||||     
T  29258261 agattgttcattgttctactgagctacagcttgcagatttgttcactaaacctctaaaagttgaaaggttaatcaaactaagaggcttgattggtatgac 29258360  T
Q  659 ggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtt 694  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29258361 aaaagtttaaacttgaattaagggaggatattagtt 29258396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 722 - 871
Target Start/End: Original strand, 53785880 - 53786028
Alignment:
Q  722 ataatcacaatcagtggttaatcacaagt-ttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgtta 820  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||  || | |  ||| ||||||||    
T  53785880 ataatcacactcagtggttaatcacatttagtgtttttgtttgttaagaa-tttgttacaagtttgttagaaactagcttat-atagttagggtttgtta 53785977  T
Q  821 cattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctc 871  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||   | ||||||||||||||||    
T  53785978 catagcttgtgcttcaagcaacctaactagttctagtatataagctacctc 53786028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23428452 - 23428367
Alignment:
Q  63 gttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaac 148  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  23428452 gttggtataatcagcaggttcatgagtgaacctagaagctctcacttgcttgcagctaaaacaatgatgagatgcatcaagggaac 23428367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 45976263 - 45976222
Alignment:
Q  751 ttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagag 792  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  45976263 ttgttttagtttgttttgaagtttgttacaagttttttagag 45976222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 889 - 929
Target Start/End: Original strand, 44147223 - 44147262
Alignment:
Q  889 gtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44147223 gtagaatcaataaagatca-tttacaatttcatcataactt 44147262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 889 - 929
Target Start/End: Original strand, 44151758 - 44151797
Alignment:
Q  889 gtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44151758 gtagaatcaataaagatca-tttacaatttcatcataactt 44151797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 766
Target Start/End: Original strand, 35842797 - 35842847
Alignment:
Q  715 tttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgtta 766  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  35842797 tttagtgataatcacaatcagtgattaatcac-actttgttttagtatgtta 35842847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 748; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 748; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 929
Target Start/End: Original strand, 27760726 - 27761638
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27760726 gttcattgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 27760825  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |  | ||| || ||||| |||||||||    
T  27760826 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaactctattgagctgatagcatattct 27760925  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27760926 gatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 27761025  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27761026 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 27761125  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27761126 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaaaca 27761225  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761226 aagtttcattttctaagggagcaagtgaacaagggagcactgcagattgttcattgctctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 27761325  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27761326 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-t 27761424  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtt 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27761425 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcac-attctgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggtttgtagataagatctagagtt 27761523  T
Q  816 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtata-ttttgtatgtagaatcaataaagatcattttaca 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27761524 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacatttttatatgtagaatcaataaagatca-tttaca 27761622  T
Q  915 a-tttcatcataactt 929  Q
    | ||||||||||||||    
T  27761623 attttcatcataactt 27761638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 710; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 7940911 - 7940083
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7940911 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 7940812  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |    ||| || ||||  |||||||||    
T  7940811 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattct 7940712  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940711 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 7940612  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940611 cagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 7940512  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7940511 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcc 7940412  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940411 aagttccattttctgagggagcaagtgaacaagggagcacttcagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 7940312  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940311 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 7940212  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  7940211 tcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 7940112  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940111 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 7940083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 13828933 - 13828087
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  13828933 gttcactgaggtatctatgaaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggtataatcagtagattaatgagtgaaccaagagtatctcatctgctagt 13828834  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||  |||||| |    
T  13828833 agccaaaagagtgatgagatatatcaaaggaacactacattatggcatcttatttcctaaatgtttgaatgaaaattctatggaactaatatcatattat 13828734  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcact-tcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaa 314  Q
    |||| ||||||||||| ||| |  || ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  13828733 gatgttgattggtgtgtagataagcaggataggaagagcacactcaggttacctattcaagttcctgaatgccccaatttcatggtgtgctaagaagaaa 13828634  T
Q  315 ccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggaga 414  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13828633 ccagttgtggcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcagacaatatggcttgaaaatatactcaagaagatggaga 13828534  T
Q  415 tagaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagc 514  Q
    |||| ||||| | |||||| | |||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||    
T  13828533 tagaagttagtatacctattgcattgttcatagataacaaatctacaataagcttagcaagaaatccagttttgcatggaagaagcaaacacatagaggc 13828434  T
Q  515 aaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattg 614  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| |  ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  13828433 taagtttcattttttgagggagcaagtaaacaaaggtgcattgtagattgtccattgctccactgagctgcaacttgcagacatattcactaa-gcatta 13828335  T
Q  615 aaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagt-ttgtt-ttaattcaagttta 712  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  13828334 aaggttgacgggttcatcaagctcagaagtttgattggcatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtctagttgttaattcaagttta 13828235  T
Q  713 gttttagtgataatcacaatcag-tggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctag 811  Q
       |||||||||||||   | || ||||||||||| | |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |  |||| |  |||    
T  13828234 -ccttagtgataatcatgtttagttggttaatcac-attttcattttgtttgttctgaagtttgttacaagtttgttagagtgtatctaataatagttag 13828137  T
Q  812 agtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatat 861  Q
     || |||||||||||||||||||||||| || || ||||| | |||||||    
T  13828136 ggtctgttacattgcttgtgcttcaagctacctaactagatagtgtatat 13828087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Original strand, 22901154 - 22901396
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22901154 tgttagtttgttttaattaaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 22901253  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgt 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22901254 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgt 22901353  T
Q  887 atgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22901354 atgtagaatcaataaagatcattttacaaattcatcataactt 22901396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 710
Target Start/End: Original strand, 22580265 - 22580948
Alignment:
Q  25 ggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaag 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||    
T  22580265 ggtatttatgcaatagtaggcctgatattgcttatgcagttggtgtaattagtaggttcatgagtgaaccaagagcttctcacttgctagaagctaaaag 22580364  T
Q  125 agtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctgatgctgat 224  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| | |||||||||||| ||| |||   || ||||||| |||| || ||||||||||| |||    
T  22580365 agtgatgagatacatcaaggggacactagaatatggcattttgtttcctaaatgtctgactgaagattctatggaattgatagcttattctgatgcagat 22580464  T
Q  225 tggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtag 324  Q
    || |  || || |  |||||||||||||| || | ||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  22580465 tgctacggggataagcaagatagaaagagtaccttaggctacatattcaaatttctaaatgctccaatctcttggtgtgcttagaagcaacaagtggtag 22580564  T
Q  325 cattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttag 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||| ||||| ||| | |||||||||  ||||||  | |||||||| || |||||||     
T  22580565 tattttcaacctgtgaatctgagtacattgcatgttgcctagcagcttgtcaagcagtttggcttgaagttatacttgaggagatggaaattgaggttaa 22580664  T
Q  425 cagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcat 524  Q
    || ||||||||  ||  | ||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||| || || || || || |||    
T  22580665 caaacctataggtttgtttatagacaacaaatcaactataaacttagctaaaaatccagttttacatggaaggagcaagcacattgaggccaaattccat 22580764  T
Q  525 tttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgaca 624  Q
    ||||| |  || ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||  |  ||||||||||||    
T  22580765 tttcttatagaacaagtaaacaaggaagcattgaagattgttcactgctccactgaactgcagcttgcagatttgttcaccaaacctatgaaggttgaca 22580864  T
Q  625 gattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtt 710  Q
      ||||||||||| |||||  | ||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22580865 cgttcatcaagctaagaagcataattagtatggtgaaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttg--ttaattcaagtt 22580948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 693 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 47419729 - 47419498
Alignment:
Q  693 tttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagag 792  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47419729 tttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttcttagag 47419632  T
Q  793 gttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt-gtatgta 891  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47419631 gttagcagataatatctagagtttgttacattgtttgtgtttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttcgtatgta 47419532  T
Q  892 gaatcaataaagatcattttacaatttcatcataa 926  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  47419531 gaatcaataaaaatca-attacaatttcatcataa 47419498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Original strand, 27756846 - 27757087
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27756846 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcgcat-tctgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 27756943  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtata-ttttg 885  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  27756944 ttagaggtttgtagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacattttta 27757043  T
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaa-tttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27757044 tatgtagaatcaataaagatca-tttacaattttcatcataactt 27757087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 686 - 884
Target Start/End: Original strand, 35705633 - 35705830
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgtt-atgaagtttgttacaagtt 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35705633 atgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtgattaatcacat-tttgttttagtttgtttatggagtttgttacaagtt 35705730  T
Q  785 tgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacc-tcctttgtatattt 883  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35705731 tgttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac-cagctagacattgtatataagctacctttctttgtatattt 35705829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 7944793 - 7944636
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944793 tgttagtttgttttaattcaagtttagtttcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 7944694  T
Q  787 ttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944693 ttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 7944636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 7466669 - 7466485
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||            ||||||||    
T  7466669 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcaatgattaatcacat-tttgttttagtttgtta------------caagtttg 7466583  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7466582 ttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgtttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 7466485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 756 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 733756 - 733632
Alignment:
Q  756 ttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacatt 855  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  733756 ttagtttgttatgaaatttgttacaattttgttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcgagcaacttagctagacatt 733657  T
Q  856 gtatataagctacctcctttgtata 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  733656 gtatataagctacctcctttgtata 733632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 7939976 - 7939921
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7939976 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 7939921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 7944529 - 7944474
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7944529 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 7944474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 22901420 - 22901475
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22901420 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 22901475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 27757111 - 27757166
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27757111 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 27757166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 27761662 - 27761717
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27761662 aattcacataaaaccttagaattagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 27761717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 717 - 798
Target Start/End: Original strand, 37355589 - 37355670
Alignment:
Q  717 tagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagc 798  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  37355589 tagtgataatcacacttagtggttaatcatattattgctttagtttgttatgaaagttgttacaagtttcttagagattagc 37355670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 887 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 7940041 - 7940000
Alignment:
Q  887 atgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7940041 atgtagaatcaataaagatca-tttacaaattcatcataactt 7940000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 887 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 7944594 - 7944553
Alignment:
Q  887 atgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7944594 atgtagaatcaataaagatca-tttacaaattcatcataactt 7944553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 734; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 734; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Original strand, 12022618 - 12023446
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12022618 gttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 12022717  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| |||||||| |||||||||    
T  12022718 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattct 12022817  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12022818 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 12022917  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12022918 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatacttaaggagatggagat 12023017  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023018 agaggttagcagacctatagaattactcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 12023117  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023118 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 12023217  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023218 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 12023317  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  12023318 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 12023417  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023418 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 12023446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 710; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 7100202 - 7099374
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7100202 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 7100103  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |    ||| || ||||  |||||||||    
T  7100102 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattct 7100003  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7100002 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 7099903  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099902 cagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 7099803  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7099802 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcc 7099703  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099702 aagttccattttctgagggagcaagtgaacaagggagcacttcagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 7099603  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099602 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 7099503  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  7099502 tcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 7099403  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099402 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 7099374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 706; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Original strand, 16797998 - 16798826
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16797998 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 16798097  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |    ||| || ||||  |||||||||    
T  16798098 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattct 16798197  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798198 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 16798297  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798298 cagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 16798397  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16798398 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcc 16798497  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798498 aagttccattttctgagggagcaagtgaacaagggagcacttcagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 16798597  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798598 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 16798697  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  16798698 tcagtgataatcacaataagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 16798797  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798798 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 16798826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 684; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Original strand, 37681365 - 37682182
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37681365 gttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 37681464  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| |||||||| |||||||||    
T  37681465 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattct 37681564  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681565 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaaatttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 37681664  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37681665 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 37681764  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681765 agaggttagtagacctatagaattactcatagacaacaaatttgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 37681864  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681865 aagtttcattttctgagggagcaaatgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 37681964  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681965 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 37682064  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  37682065 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatg-----------aagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 37682153  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682154 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 37682182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 798
Target Start/End: Original strand, 10276683 - 10277313
Alignment:
Q  166 tatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggta 265  Q
    |||||||||| || || ||||| | || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10276683 tatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagatcacttcatggta 10276782  T
Q  266 cctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatg 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10276783 cctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtggcattgtcaacttgtgaatctgagtatattgcagggtgtatg 10276882  T
Q  366 gcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataa 465  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  10276883 gcagcatgtcaaacaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatataattgttcatatacaacaaatctgctataa 10276982  T
Q  466 gcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgt 565  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10276983 gcttagtaagaaatccaattctgcatggaagaagcaagcatatagaagccaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactgcagattgt 10277082  T
Q  566 tcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtg 665  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10277083 tcattgctctactgagctacagcttgcggacatattcactaaggcattgaaggttgacaggttcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtg 10277182  T
Q  666 gaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgtt 765  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | || ||||||||    
T  10277183 gaaactcgaattaagagaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-tttagtgataatcacaattagtggttaatcac-atttagattcagtttgtt 10277280  T
Q  766 atgaagtttgttacaagtttgttagaggttagc 798  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10277281 atgaattttgttacaagttagttagagattagc 10277313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 332 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 40368112 - 40367531
Alignment:
Q  332 aacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacct 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40368112 aacctgtgaatatgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacct 40368013  T
Q  432 atagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcattttctga 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40368012 atagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagccaagtttcattttctaa 40367913  T
Q  532 gggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcat 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40367912 gggagcaagtgaacaagggagcactgcagattgttcattgctctactaagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcat 40367813  T
Q  632 caagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaa 731  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40367812 caagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-tttagtgataatcacaa 40367714  T
Q  732 tcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtg 831  Q
    |||| | |||||||| | ||||||||            |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40367713 tcagagattaatcac-attttgtttt------------agtttgttacaagtttgttagaggctagtagataagatctagagtttgttacattgcttgtg 40367627  T
Q  832 cttcaagc-aacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt-gtatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataa 926  Q
    |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  40367626 cttcaagcaaacttggttagatattgtatataagctacctcctttgtacattttcatatgtagaatcaataagaatca-attacaatttcatcataa 40367531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 540 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 26337111 - 26336767
Alignment:
Q  540 gtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctca 639  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26337111 gtgaacaagggagcactgcagatttttcattgctctactgagctgcagcttgtagacatattcactaaggcattgaaggttgacaggttcatcaagctca 26337012  T
Q  640 gaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggt 739  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  26337011 gaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttaattttagtgataatcacaatcggtgat 26336912  T
Q  740 taatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagc 839  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26336911 taatcacattttgtttttagtttgttatgatgtttgttacatgtttgttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgtttgtgcttcaagc 26336812  T
Q  840 aacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26336811 aacttaactagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 26336767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 25 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 26455076 - 26454406
Alignment:
Q  25 ggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaag 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  26455076 ggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatattcagttggtataattagtaggttcatgagtgaaccaagagtttctcatttgctagctgctaaaag 26454977  T
Q  125 agtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctgatgctgat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||| || |||| |  | ||||||| ||||  | ||||||||||| |||    
T  26454976 agtgatgagatacatcaaaggaacactagagtatgtcattttgtttcctaaatgtctggatgaaaactctatggaattgatatcttattctgatgcagat 26454877  T
Q  225 tggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgc--tccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgt 322  Q
    | |||||| || |  |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454876 tagtgtggggataagcaagataggaagagcacctcagattacctattcaagtttctaaatgcgatcca--ttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgt 26454779  T
Q  323 agcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggtt 422  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||    
T  26454778 agcactgtcaacttgtgaatctgagtacattgcaggatgtatgacagcttgtcaagcagtttagcttgaaaatatactcaagaatatggaaatagaagtt 26454679  T
Q  423 agcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttc 522  Q
    | || || ||||  |||  ||||||| ||||||||  |||| | ||||||||  |||||| || |||||||||  || || || || ||||  |||||||    
T  26454678 aacatacttatatcattgttcatagataacaaatcatctattaacttagcaaataatccaattttgcatggaatgagtaaacacattgaagttaagtttc 26454579  T
Q  523 attttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttga 622  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||  ||| | || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  26454578 actttctgagggaacaagttaacaaggaggcattgcaaattgttcattgttccattgagctgcaacttgcagatatattcactaaacctttgaaggttga 26454479  T
Q  623 cagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagttt 695  Q
    || |||||||||||| || ||  ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26454478 catattcatcaagctaaggagcatgattggtatggttgaagtggaaacttgaattaagggaggaagttagttt 26454406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 687 - 926
Target Start/End: Original strand, 30695293 - 30695530
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695293 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 30695390  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt-g 885  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30695391 ttagaggttagtatataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacattttcg 30695490  T
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataa 926  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30695491 tatgtagaatcaataaagatca-attacaatttcatcataa 30695530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 32486143 - 32485947
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32486143 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcaatgattaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 32486045  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32486044 ttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaacctccttagctagacattgtatataagctacctcctttatatatttt 32485947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Original strand, 19502307 - 19502504
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaa-tcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502307 tgttagtttgttttaatttaagtttagttttagtgataatcacaatcagtgattaaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 19502405  T
Q  786 gttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19502406 gttagaggttagaaaataagatatagagtttgttacattgtttgtgcttcaagcaacttagctaaacattgtatataagctacctcctttatatatttt 19502504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 12018731 - 12018888
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12018731 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 12018830  T
Q  787 ttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12018831 ttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 12018888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 7104100 - 7103943
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104100 tgttagtttgttttaattcaagtttagtttcagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 7104001  T
Q  787 ttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104000 ttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 7103943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 16794108 - 16794265
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16794108 tgttagtttgttttaattcaagtttagtttcagtgataatcacaataagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 16794207  T
Q  787 ttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16794208 ttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 16794265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 687 - 884
Target Start/End: Original strand, 36632314 - 36632497
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||            |||||||||||||    
T  36632314 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtgaataatcacac-tttgttttagtt------------tgttacaagtttg 36632399  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632400 ttagaggttagcaaataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 36632497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 687 - 874
Target Start/End: Original strand, 43384945 - 43385138
Alignment:
Q  687 tgttagtttgtttt--aattcaagtttagttt----tagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttg-ttttagtttgttatgaagtttgttac 779  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43384945 tgttagtttgttttttaattcaagtttagtttagtttagtgataatcataattagtggttaatcaca--tttgcttttagtttgttatgaagtttgttac 43385042  T
Q  780 aagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatat-aagctacctcctt 874  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43385043 aagtttgttagaagttagcaaataaaatctagggtttgttacattgtttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataaagctacctcctt 43385138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 687 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 40371892 - 40371669
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40371892 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagagattaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagattgttacaagtttg 40371795  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt-g 885  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||              | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  40371794 ttagaggctagtagataagatctagagtttattacattgtttgtg--------------gttagatattgtatataagctacctcctttgtacattttca 40371709  T
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataa 926  Q
    ||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||    
T  40371708 tatgtagaatcaataagaatca-actacaatttcatcataa 40371669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 736 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 20830437 - 20830304
Alignment:
Q  736 tggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttc 835  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20830437 tggttaatcacat-ttagtttcagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagagattagcaaataagatcaagtgtttgttacattgcttgtgcttc 20830339  T
Q  836 aagcaacttagctagacattgtatataagctacct 870  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20830338 aagcaacttaactagacattgtatataagctacct 20830304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Original strand, 10276578 - 10276674
Alignment:
Q  17 ttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgcta 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10276578 ttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgcta 10276674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 37658732 - 37658878
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||||||    
T  37658732 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtcataatcataatcagtggttaatcacaagtttgttttagcttgttatg-----------aagtttg 37658820  T
Q  787 ttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37658821 ttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 37658878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 695
Target Start/End: Original strand, 25632059 - 25632735
Alignment:
Q  18 tcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcag 117  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  25632059 tcactgaggtatttgtgcaatattaggcgtgatattgcttatgcacatggtataattagtaggttcatgagtgaaccaagaacttctcacttgctagcag 25632158  T
Q  118 ccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattctga 217  Q
    | ||||| || | ||||||||| || |||| |||| ||||||  ||  | |||||||||||| ||| |||   ||  |||||  |||| || ||||  ||    
T  25632159 ctaaaagggtcacgagatacattaagggaatactagagtatgacatattgtttcctaaatgtctgattgaagatttcatggatttgatagcttatttcga 25632258  T
Q  218 tgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaacca 317  Q
    ||| ||||||||||||   || ||||||||||||| ||| | | | ||||| ||||| ||| | |||||||  || || ||||| ||||||||| |||||    
T  25632259 tgcagattggtgtggaataag-caagatagaaagaacaccttatgctacctgttcaaatttctaaatgctctgatctcttggtgagctaagaagaaacca 25632357  T
Q  318 gttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatag 417  Q
     | | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||| | |||||||||  |||||| || |||||| | || |    
T  25632358 atggcagccttgtcaacatgtgaatctgagtacattgcaggttgattggcagcctgtcaagcagtttggcttgaatctatactaaaggagatgaaaattg 25632457  T
Q  418 aggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaa 517  Q
    | || |  |||||||||    |  | || ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||| ||    
T  25632458 aagtaaatagacctataactctgtttatggacaacaaatcagctataaacttggctaaaaatccagttctgcttggaaggagcacgcacactgaagccaa 25632557  T
Q  518 gtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaag 617  Q
     ||||||||| | ||    ||||| ||||| |  |||||  | ||| | ||||| ||||||||  |  | ||| | || || ||||||||  |  |||||    
T  25632558 ctttcattttattagattacaagtaaacaaagaggcactgaatattatccattgatctactgatataaaacttcctgatatgttcactaaacctgtgaag 25632657  T
Q  618 gttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagttt 695  Q
    |||||||  |||||||| || |||||  ||||||| |||  |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25632658 gttgacatgttcatcaaactgagaagcctgattggtatggtgagagtgaaaacttgaattaaggaaggatgttagttt 25632735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 10274546 - 10274698
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | || | || ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  10274546 tgttagtttgttttaattcaagtttag-tttagtgataatcacaattaatggttaatcac-atttagattcagtttgttatgaattttgttacaagttag 10274643  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||| |||||  ||||| | ||| ||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  10274644 ttagagattagctcataaggt-tagggtttgttatttagcttgtacttcaagcaac 10274698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 12018997 - 12019052
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12018997 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 12019052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 547
Target Start/End: Original strand, 30066763 - 30067094
Alignment:
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||| | ||| | ||||| ||| |||||||||| || ||||||||| | || |||||||    
T  30066763 gatgcagattggtgtggagatatgcaagataggaaaagcacttcatgctacttgttcaaatttctgaatgctcctatatcatggtgtacaaaaaagcaac 30066862  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
      ||  ||| | | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||  || |  | || ||  || | ||    
T  30066863 ttgtattagtactttcaacttgtgaatctgagtacattgtagggtgtttagcagcatgtcaagcagtatggctagattatgtgttaaaggaactgaatat 30066962  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
     ||  |  |||  ||||| | |||  |  |||||||  ||||||| |||| |||||| | |||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30066963 tgaaatctgcaagcctattgcattgtttgtagacaatcaatctgccataaacttagccaaaaatcatgtgttgcatggaagaagcaagcatattgaagca 30067062  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaa 547  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  30067063 aagtttcattttctcagagaacaagtgaacaa 30067094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 955 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 7099266 - 7099212
Alignment:
Q  955 attcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7099266 attcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 7099212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 955 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 7103835 - 7103781
Alignment:
Q  955 attcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7103835 attcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 7103781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 955 - 1009
Target Start/End: Original strand, 16798935 - 16798989
Alignment:
Q  955 attcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16798935 attcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaacagtgc 16798989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 12023566 - 12023621
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12023566 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttttgaacagtgc 12023621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 955 - 1002
Target Start/End: Original strand, 16794374 - 16794421
Alignment:
Q  955 attcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctga 1002  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16794374 attcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctga 16794421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 736 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 20808749 - 20808675
Alignment:
Q  736 tggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctag 811  Q
    ||||||||||||  || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20808749 tggttaatcacat-ttagtttcagtttgttatgaagttagttacaagtttgttagaggttaacaaataagatctag 20808675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 955 - 1005
Target Start/End: Original strand, 37658985 - 37659037
Alignment:
Q  955 attcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaac--tgcttctgaaca 1005  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  37658985 attcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaacagtgcttctgaaca 37659037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 955 - 1005
Target Start/End: Original strand, 37682289 - 37682341
Alignment:
Q  955 attcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaac--tgcttctgaaca 1005  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  37682289 attcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaacagtgcttctgaaca 37682341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 889 - 926
Target Start/End: Original strand, 12018932 - 12018970
Alignment:
Q  889 gtagaatcaataaagatcattttacaa-tttcatcataa 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12018932 gtagaatcaataaagatcattttacaattttcatcataa 12018970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 889 - 926
Target Start/End: Original strand, 12023490 - 12023528
Alignment:
Q  889 gtagaatcaataaagatcattttacaa-tttcatcataa 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12023490 gtagaatcaataaagatcattttacaattttcatcataa 12023528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 725; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 725; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 929
Target Start/End: Original strand, 26315342 - 26316240
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26315342 gttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 26315441  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |    ||| || ||||  |||||||||    
T  26315442 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattct 26315541  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26315542 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 26315641  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26315642 cagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 26315741  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26315742 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcc 26315841  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26315842 aagttccattttctgagggagcaagtgaacaagggagcacttcagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 26315941  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26315942 aggttgacagattcatcaagctcagaagcttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-t 26316040  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtt 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||            |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26316041 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcac-attctgtttt------------agtttgttacaagtttgttagaggttagtagataagatctagagtt 26316127  T
Q  816 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgtatgtagaatcaataaagatcattttacaa 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  26316128 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacctagctagatattgtatataagctacttcctttgtatattttgtatgcagaatcaataaagatca-attacaa 26316226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 601; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 43592648 - 43591783
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43592648 gttcaccgaggtatttatgcaatagtcgacctgctattgcatatgcagttagcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 43592549  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || ||||| | |||||| ||  |||| ||||||| |    
T  43592548 agacaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttc-taagtgcttaaatgaaaattatattgagttgatagcatattat 43592450  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592449 aatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcatggtacctattcaaatttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 43592350  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43592349 cagttgtggcattgttaacctgtgaatttgagtatattacagggtgtatggcaacatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 43592250  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  43592249 agaggttagcagacctatataattgttcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaattcagttctgcatgggagaagcaagcatataaaagct 43592150  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592149 aagttccattttatgagggaccaagtgaacaagggagctctgtagattgttcattgctctactgagctacaacttgcagacatattcactaaggcattga 43592050  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43592049 aggttgacaggttcatcaagctcaaaagcttgattggaatgaaggaagtagaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttag-t 43591951  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagatctagagtt 815  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43591950 ttagtgataatcacaatcagtgattaatcgc-actttattttagtttgttatgaagtttgttacaatattgttagaggttagcaaataaaatctagagtt 43591852  T
Q  816 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591851 tgttacattgcttgtgcttcaagcaacttggctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttt 43591783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Original strand, 39793831 - 39794070
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39793831 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatctcat-tctgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 39793928  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgt 886  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  39793929 ttagaggttagtagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagatattgtatataagctacctcctttgtacatttcat 39794028  T
Q  887 atgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39794029 atgtagaatcaataaagatca-attacattttcatcataactt 39794070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 16588635 - 16588395
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588635 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaataagtggttaatcacat-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 16588538  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtata-ttttg 885  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16588537 ttagaggttatcatataagatctagagtttgttacattgcttgtgttttaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatatttttg 16588438  T
Q  886 tatgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    |||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  16588437 tatggagaatcaataagaatca-attacaatttcatcataactt 16588395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 687 - 929
Target Start/End: Original strand, 26311522 - 26311749
Alignment:
Q  687 tgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||            |||||||||||||    
T  26311522 tgttagtttgttttaattcaagtttagttt-agtgataatcacaatcagtggttaatcacat-tctgttttagtt------------tgttacaagtttg 26311607  T
Q  787 ttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacttagctagacattgtatataagctacctcctttgtatattttgt 886  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26311608 ttagaggttagtagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaacctagctagatattgtatataagctacttcctttgtatattttgt 26311707  T
Q  887 atgtagaatcaataaagatcattttacaatttcatcataactt 929  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26311708 atgcagaatcaataaagatca-attacaatttcatcataactt 26311749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 695
Target Start/End: Original strand, 30646736 - 30647373
Alignment:
Q  57 tatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagt 156  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  |||    
T  30646736 tatgcaattggcata-tcagtagatttatgagtgaaccaagagcttctcacctaattgcagctaaaagggtgataagatacatcaagggaactatggagt 30646834  T
Q  157 atggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagtta-tatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagca 255  Q
    |||| ||  | || ||||||||| | ||||| ||  | ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  30646835 atggcatatttttccctaaatgtataaatga-agcaactatggaattgatggcatactcatatgctgattggtgtggagataggcaagatagaaagagta 30646933  T
Q  256 cttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgc 355  Q
    ||| ||| ||| | || || ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  30646934 cttgaggctacttgtttaaatttctaaatgctcaaatatcatggtgtgctaagaagcaaccggtggtagccttatcaacttgtgagtttgagtgtattgc 30647033  T
Q  356 agggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaa 455  Q
    | ||||  | ||| | | ||| | | | |||||| |||  || || || || ||||||||  ||||  |||  ||||| |  ||  | |||||||||||     
T  30647034 atggtgcttagcaacttatcaagtagtttggctttaaacaattctgaaggaaatggagattaaggtatgcaagcctattgctttgtttatagacaacaag 30647133  T
Q  456 tctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcac 555  Q
    |   |||||| |||| | | ||| |||||| |||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||  | | ||| ||||| |    
T  30647134 ttaactataaacttatccaaaaacccagttttgcatggaaggagcaaacacattgaagcaaagttccattttcttagggaacagttaaccaaaggagctc 30647233  T
Q  556 tacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaat 655  Q
    || || |||| |||||||| |||||  ||||||||||  | || |||||||||||  ||||| ||| ||| || | |||||| ||||| |||||||| ||    
T  30647234 taaaggttgtccattgttccactgatttgcagcttgcgaatatgttcactaaggctatgaagattgtcaggtttaacaagcttagaagcttgattggcat 30647333  T
Q  656 gaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagttt 695  Q
    |   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30647334 ggtagaattggaaacttgatttaagggaggatgttagttt 30647373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Original strand, 10504435 - 10504588
Alignment:
Q  686 atgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagttt 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | || | || ||||||||||||| |||||||||||||     
T  10504435 atgttagtttgttttaattcaagtttag-tttagtgataatcacaattagtgattaatcac-atttagattcagtttgttatgaattttgttacaagtta 10504532  T
Q  786 gttagaggttagcagataagatctagagtttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    ||||||| |||||  ||||| | ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  10504533 gttagagattagctcataaggt-tagggtttgttacttagcttgtacttcaagcaac 10504588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1009
Target Start/End: Original strand, 39794097 - 39794151
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaacagtgc 1009  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  39794097 aattcacataaa-ccttagaataagaaactacttctgaactgcttctgaagagtgc 39794151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 718; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 718; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 842
Target Start/End: Original strand, 6835 - 7662
Alignment:
Q  16 gttcactggggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6835 gttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagc 6934  T
Q  116 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttatatggaactgatggcatattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | || ||| |||||||| |||||||||    
T  6935 agccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattct 7034  T
Q  216 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7035 gatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac 7134  T
Q  316 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7135 cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagat 7234  T
Q  416 agaggttagcagacctatagaatttctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7235 agaggttagcagacctatagaattgctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagca 7334  T
Q  516 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattga 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7335 aagtttcattttctgagggagcaagtgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgtagcttgcagacatattcactaaggcattaa 7434  T
Q  616 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7435 aggttgacagattcatcaagctcagaagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagtt 7534  T
Q  716 ttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagag 813  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||    
T  7535 ttagtgataatcacaatcagtgattaatcacaa-tttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagag 7633  T
Q  814 tttgttacattgcttgtgcttcaagcaac 842  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7634 tttgttacattgcttgtgtttcaagcaac 7662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 842
Target Start/End: Original strand, 2734 - 3137
Alignment:
Q  441 ctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagtttcattttctgagggagcaag 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2734 ctcatagacaacaaatctgctataagcttagcaagaaatccagttctgcatggaagaagcaagcatatagaagcaaagttacattttctgagggagcaag 2833  T
Q  541 tgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgcagcttgcagacatattcactaaggcattgaaggttgacagattcatcaagctcag 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2834 tgaacaagggagcactacagattgttcattgttctactgagctgaagcttgcagacatattcactaaggcattaaaggttgacagattcatcaagctcag 2933  T
Q  641 aagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggtt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2934 aagtttgattggaatgaaggaagtggaaacttgaattaagggaggatgttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggtt 3033  T
Q  741 aatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcagataagat--ctagagtttgttacattgcttgtgcttcaag 838  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3034 aatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgttagaggttagcaaataaggttgttagagtttgttacattgcttgtgcttcaag 3133  T
Q  839 caac 842  Q
    ||||    
T  3134 caac 3137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 954 - 1004
Target Start/End: Original strand, 7772 - 7822
Alignment:
Q  954 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgattctgaactgcttctgaac 1004  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7772 aattcacataaaaccttagaatcagaaactgcttctgaactgcttctgaac 7822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 689 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 60302 - 60201
Alignment:
Q  689 ttagtttgttttaattcaagtttagttttagtgataatcacaatcagtggttaatcacaagtttgttttagtttgttatgaagtttgttacaagtttgtt 788  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  |  ||||||||||| |||| |||||||||  |   |||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  60302 ttagtttgttttaattcaagtt-actttgtgatataatcacaattagtgattaatcacatttaatttttagtttgttataaattttgttaccagtttgtt 60204  T
Q  789 aga 791  Q
    |||    
T  60203 aga 60201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University