View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16593_low_5 (Length: 448)

Name: NF16593_low_5
Description: NF16593
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16593_low_5
NF16593_low_5
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (11-440)||(18059582-18060014)
chr1 (11-440)||(17004638-17005070)
chr1 (11-440)||(38054915-38055347)
chr1 (91-440)||(17148647-17149000)
chr1 (148-440)||(19962323-19962617)
chr1 (16-388)||(46523394-46523768)
chr1 (147-434)||(22227947-22228236)
chr1 (147-385)||(22232644-22232882)
chr1 (130-388)||(22035568-22035827)
chr1 (130-388)||(7640810-7641069)
chr1 (181-414)||(5072237-5072467)
chr1 (147-346)||(2116393-2116589)
chr1 (147-346)||(45051561-45051757)
chr1 (315-414)||(15861258-15861358)
chr1 (181-328)||(18601052-18601197)
chr1 (324-394)||(18598845-18598914)
chr1 (272-388)||(51452765-51452882)
chr1 (11-53)||(22035448-22035490)
chr1 (11-52)||(20254312-20254353)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (11-440)||(16376197-16376629)
chr6 (11-440)||(16383521-16383953)
chr6 (11-440)||(22225562-22225994)
chr6 (11-440)||(10488699-10489131)
chr6 (11-430)||(16555973-16556395)
chr6 (11-430)||(16632529-16632951)
chr6 (11-435)||(1556005-1556434)
chr6 (11-414)||(19610018-19610425)
chr6 (182-440)||(22251390-22251648)
chr6 (148-440)||(19299375-19299669)
chr6 (91-414)||(16231972-16232297)
chr6 (91-397)||(18086690-18086999)
chr6 (91-388)||(23977849-23978149)
chr6 (91-346)||(13620712-13620970)
chr6 (237-432)||(27653814-27654006)
chr6 (130-414)||(29869627-29869911)
chr6 (83-342)||(29665945-29666208)
chr6 (147-440)||(14625953-14626243)
chr6 (237-389)||(25175792-25175945)
chr6 (181-346)||(1650022-1650184)
chr6 (237-335)||(16825678-16825775)
chr6 (11-98)||(33314387-33314474)
chr6 (131-440)||(15862592-15862916)
chr6 (315-388)||(4991396-4991470)
chr6 (330-424)||(16814837-16814930)
chr6 (272-440)||(1657566-1657738)
chr6 (129-191)||(27740957-27741021)
chr6 (234-266)||(19629556-19629588)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (11-440)||(7822728-7823160)
chr7 (11-440)||(7830039-7830471)
chr7 (11-440)||(27176433-27176865)
chr7 (11-440)||(27101461-27101893)
chr7 (11-440)||(27108809-27109241)
chr7 (11-440)||(38783553-38783985)
chr7 (11-440)||(15950614-15951047)
chr7 (11-435)||(15759941-15760370)
chr7 (91-414)||(18979872-18980197)
chr7 (91-414)||(15927648-15927973)
chr7 (91-440)||(14250721-14251074)
chr7 (91-388)||(13758450-13758750)
chr7 (237-440)||(2437686-2437888)
chr7 (147-440)||(16478786-16479075)
chr7 (129-432)||(13910855-13911156)
chr7 (237-414)||(10989638-10989814)
chr7 (143-346)||(48622584-48622788)
chr7 (148-414)||(13572816-13573079)
chr7 (130-346)||(10000288-10000505)
chr7 (130-346)||(16418618-16418835)
chr7 (245-346)||(18253761-18253862)
chr7 (263-346)||(15862174-15862257)
chr7 (129-388)||(13321134-13321407)
chr7 (315-389)||(15516719-15516793)
chr7 (272-388)||(7293289-7293406)
chr7 (272-388)||(30262002-30262119)
chr7 (291-388)||(11516520-11516617)
chr7 (291-388)||(15441437-15441534)
chr7 (291-346)||(14113904-14113959)
chr7 (11-53)||(10000583-10000625)
chr7 (11-53)||(16418498-16418540)
chr7 (272-346)||(14423555-14423629)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (11-440)||(1467563-1467995)
chr3 (11-440)||(49232436-49232868)
chr3 (11-440)||(12264615-12265049)
chr3 (11-435)||(25058739-25059168)
chr3 (108-440)||(12811938-12812273)
chr3 (62-424)||(22275260-22275626)
chr3 (62-440)||(15468162-15468545)
chr3 (15-414)||(5228317-5228719)
chr3 (91-440)||(18911073-18911427)
chr3 (11-346)||(12902008-12902346)
chr3 (181-435)||(18896871-18897127)
chr3 (83-388)||(54651529-54651837)
chr3 (11-346)||(44228985-44229323)
chr3 (149-435)||(16821280-16821564)
chr3 (237-414)||(41270304-41270478)
chr3 (237-414)||(55316448-55316622)
chr3 (11-127)||(18897139-18897255)
chr3 (245-346)||(15936553-15936654)
chr3 (245-346)||(15938395-15938496)
chr3 (148-346)||(15614973-15615168)
chr3 (315-440)||(14842392-14842519)
chr3 (315-440)||(23492696-23492823)
chr3 (140-266)||(11986172-11986300)
chr3 (314-388)||(8268609-8268683)
chr3 (314-388)||(8275709-8275783)
chr3 (291-388)||(2449111-2449208)
chr3 (272-412)||(13954738-13954880)
chr3 (272-412)||(45861078-45861220)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (11-440)||(11231162-11231594)
chr2 (11-440)||(22513009-22513441)
chr2 (11-440)||(28775631-28776063)
chr2 (11-440)||(24685605-24686037)
chr2 (11-440)||(16935593-16936027)
chr2 (11-440)||(17006253-17006687)
chr2 (11-388)||(12728392-12728772)
chr2 (11-388)||(34824475-34824855)
chr2 (11-346)||(23777963-23778301)
chr2 (91-440)||(42177791-42178145)
chr2 (91-388)||(8943926-8944226)
chr2 (91-388)||(12635744-12636044)
chr2 (91-385)||(3798482-3798779)
chr2 (91-388)||(12641518-12641818)
chr2 (11-299)||(21141895-21142187)
chr2 (237-440)||(19886484-19886684)
chr2 (130-388)||(23774257-23774516)
chr2 (130-346)||(5888548-5888765)
chr2 (315-432)||(24826531-24826646)
chr2 (147-346)||(7507758-7507969)
chr2 (315-388)||(25213372-25213446)
chr2 (291-388)||(14906313-14906410)
chr2 (272-346)||(19689316-19689391)
chr2 (291-388)||(23820364-23820461)
chr2 (11-53)||(5888843-5888885)
chr2 (11-53)||(23774137-23774179)
chr2 (272-346)||(17396568-17396643)
chr2 (291-388)||(20015304-20015401)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (11-440)||(31309-31741)
scaffold0107 (11-297)||(39646-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (11-440)||(39103-39535)
scaffold0076 (148-440)||(43137-43426)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (11-440)||(271184-271616)
chr8 (11-440)||(644304-644736)
chr8 (11-440)||(830039-830471)
chr8 (11-440)||(22088618-22089050)
chr8 (11-440)||(15318983-15319415)
chr8 (11-440)||(15499352-15499784)
chr8 (11-414)||(22006107-22006514)
chr8 (11-440)||(13662087-13662521)
chr8 (91-440)||(13720750-13721104)
chr8 (83-388)||(16195302-16195611)
chr8 (91-388)||(16872927-16873227)
chr8 (147-440)||(6774083-6774371)
chr8 (147-440)||(24549120-24549409)
chr8 (237-432)||(30120951-30121144)
chr8 (148-440)||(21844394-21844684)
chr8 (148-440)||(21851787-21852077)
chr8 (129-397)||(16674258-16674524)
chr8 (272-412)||(17345842-17345985)
chr8 (400-440)||(17142854-17142894)
chr8 (272-388)||(22907087-22907204)
chr8 (291-388)||(5238380-5238477)
chr8 (291-388)||(24661121-24661218)
chr8 (291-388)||(43685839-43685936)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (11-440)||(21932205-21932637)
chr5 (11-440)||(21938375-21938807)
chr5 (11-440)||(35582036-35582468)
chr5 (11-440)||(22882908-22883340)
chr5 (11-440)||(36989594-36990026)
chr5 (11-388)||(1219396-1219776)
chr5 (91-440)||(10777794-10778146)
chr5 (11-414)||(7425324-7425729)
chr5 (62-424)||(17471427-17471793)
chr5 (11-414)||(35790947-35791355)
chr5 (91-440)||(23514641-23514995)
chr5 (11-440)||(11211886-11212321)
chr5 (237-440)||(18777815-18778015)
chr5 (237-440)||(19500128-19500327)
chr5 (237-440)||(21073418-21073618)
chr5 (147-432)||(29188116-29188397)
chr5 (237-440)||(12603-12803)
chr5 (237-432)||(22366311-22366504)
chr5 (130-388)||(23328678-23328937)
chr5 (148-414)||(27009981-27010244)
chr5 (129-432)||(4199816-4200117)
chr5 (130-388)||(24616282-24616541)
chr5 (130-388)||(24712658-24712917)
chr5 (130-388)||(24745676-24745935)
chr5 (181-397)||(43443261-43443474)
chr5 (237-389)||(25426857-25427009)
chr5 (315-440)||(11343008-11343133)
chr5 (315-440)||(16105967-16106092)
chr5 (83-266)||(32950765-32950952)
chr5 (11-53)||(23328558-23328600)
chr5 (291-388)||(20623262-20623359)
chr5 (291-388)||(21233401-21233498)
chr5 (291-388)||(37053037-37053134)
chr5 (13-53)||(24616165-24616205)
chr5 (13-53)||(24712541-24712581)
chr5 (13-53)||(24745559-24745599)
chr5 (291-346)||(25900321-25900376)
chr5 (291-388)||(16536490-16536587)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (11-397)||(29162-29551)
scaffold0213 (378-440)||(29565-29626)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (11-440)||(18168970-18169402)
chr4 (11-414)||(15287096-15287501)
chr4 (11-397)||(15294221-15294610)
chr4 (11-346)||(19020486-19020824)
chr4 (91-440)||(7131887-7132241)
chr4 (91-388)||(20000803-20001103)
chr4 (11-440)||(17145479-17145913)
chr4 (11-358)||(18248218-18248568)
chr4 (131-346)||(22738390-22738607)
chr4 (149-440)||(10644360-10644647)
chr4 (145-414)||(22351915-22352184)
chr4 (130-388)||(26339140-26339399)
chr4 (222-337)||(8378365-8378480)
chr4 (237-414)||(47357883-47358057)
chr4 (11-224)||(8374508-8374724)
chr4 (314-440)||(14996444-14996572)
chr4 (271-346)||(9795490-9795564)
chr4 (315-414)||(14952085-14952183)
chr4 (129-241)||(40885585-40885698)
chr4 (308-346)||(8378486-8378524)
chr4 (291-388)||(16608972-16609069)
chr4 (11-52)||(22738269-22738310)
chr4 (291-388)||(26680493-26680590)
chr4 (291-346)||(16327841-16327896)
chr4 (11-53)||(22352260-22352302)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (11-440)||(153829-154263)
scaffold0023 (237-435)||(169738-169935)
scaffold0023 (242-432)||(36327-36514)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (11-414)||(1424-1831)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (11-424)||(2392-2810)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (91-440)||(1336-1690)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (11-418)||(10184-10595)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (11-440)||(7279-7712)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (11-440)||(33980-34414)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (147-440)||(5034-5329)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (11-257)||(3-252)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (237-440)||(20937-21139)
scaffold0139 (148-440)||(13883-14173)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (181-414)||(3895-4129)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (11-346)||(54416-54755)
scaffold0066 (83-346)||(45102-45369)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (237-440)||(10570-10775)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (130-397)||(6718-6986)
scaffold0183 (11-53)||(6598-6640)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (143-346)||(54008-54212)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (147-440)||(3101-3395)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (242-432)||(31506-31693)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (315-440)||(130880-131005)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (147-420)||(13169-13438)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (181-414)||(1153-1383)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (237-414)||(64372-64546)
scaffold0026 (245-346)||(107983-108084)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (150-414)||(177-438)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (143-306)||(3547-3711)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (130-414)||(23600-23884)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (315-429)||(17127-17241)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (130-346)||(7330-7547)
scaffold0003 (11-53)||(7210-7252)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (147-346)||(9266-9462)
scaffold0215 (147-346)||(16164-16360)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (242-346)||(12045-12149)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (83-266)||(56105-56291)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (271-346)||(13268-13342)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (322-414)||(154282-154373)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (315-424)||(803-914)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (181-414)||(5922-6155)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (272-346)||(34374-34450)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (291-388)||(22833-22930)
scaffold0141 (291-388)||(27088-27185)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (291-388)||(1455-1552)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (147-266)||(41786-41905)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (145-266)||(3324-3447)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (315-347)||(42677-42709)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18060014 - 18059582
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18060014 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 18059915  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18059914 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 18059815  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059814 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 18059715  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18059714 attatacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcc 18059615  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18059614 tcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 18059582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 17004638 - 17005070
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  17004638 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 17004737  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17004738 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 17004837  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004838 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 17004937  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004938 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 17005037  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17005038 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 17005070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38055347 - 38054915
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  38055347 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 38055248  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38055247 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 38055148  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38055147 tcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaagatgcaaag 38055048  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055047 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 38054948  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38054947 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 38054915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 91 - 440
Target Start/End: Original strand, 17148647 - 17149000
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17148647 atatgatttacatctcatttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 17148746  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17148747 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 17148846  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa-cccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcc 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17148847 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttgcttcaattcagctcc 17148946  T
Q  387 taggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17148947 tatgtcaccccacttgattcctcaagctttcccttcaaccctcttgttcttctc 17149000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 148 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19962617 - 19962323
Alignment:
Q  148 ttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19962617 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19962518  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962517 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 19962418  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19962417 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 19962323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 388
Target Start/End: Original strand, 46523394 - 46523768
Alignment:
Q  16 tcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46523394 tcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatc 46523493  T
Q  116 aaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatc 212  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  46523494 aaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatc 46523593  T
Q  213 aattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 312  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  46523594 aattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-atgga 46523692  T
Q  313 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||| |||| | ||||||    
T  46523693 acatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctttaatttatctccta 46523768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 147 - 434
Target Start/End: Original strand, 22227947 - 22228236
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  22227947 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaag 22228045  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22228046 agcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 22228145  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgtt 434  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  22228146 ttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcttaagcttaccccaattgattcttcaagttattcccttcaaaacccttgtt 22228236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Original strand, 22232644 - 22232882
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  22232644 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaag 22232742  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232743 agcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 22232842  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctc 385  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22232843 ttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctc 22232882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 388
Target Start/End: Original strand, 22035568 - 22035827
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  22035568 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 22035667  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  22035668 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 22035766  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  22035767 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 22035827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7641069 - 7640810
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7641069 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 7640970  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  7640969 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 7640871  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  7640870 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 7640810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5072467 - 5072237
Alignment:
Q  181 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 280  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  5072467 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 5072368  T
Q  281 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 380  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||    
T  5072367 tttcatacaacttgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttcaattc 5072270  T
Q  381 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  5072269 agctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 5072237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Original strand, 2116393 - 2116589
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| ||     
T  2116393 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaa 2116491  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2116492 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccctttacct 2116588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Original strand, 45051561 - 45051757
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  ||  || || ||||| |||    
T  45051561 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaag 45051659  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    | ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45051660 aacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--cacatgattatgataaagactaacccccttacct 45051756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861258
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctag-gtcacccaaattgattcctcaagc 413  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttatcccaattgattcctcaagc 15861259  T
Q  414 t 414  Q
    |    
T  15861258 t 15861258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18601197 - 18601052
Alignment:
Q  181 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 280  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  18601197 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 18601098  T
Q  281 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 328  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  18601097 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataat 18601052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18598914 - 18598845
Alignment:
Q  324 ataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcac 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18598914 ataataactaacccccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttcaattcagctcctaagtcac 18598845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 388
Target Start/End: Original strand, 51452765 - 51452882
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 369  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  51452765 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 51452863  T
Q  370 tgcttcaattcagctccta 388  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  51452864 ggcttcaatttagctccta 51452882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 22035448 - 22035490
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22035448 catcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 22035490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 20254312 - 20254353
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcac 52  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20254312 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcac 20254353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16376629 - 16376197
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  16376629 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16376530  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16376529 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16376430  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376429 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 16376330  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376329 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 16376230  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16376229 tcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 16376197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16383953 - 16383521
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  16383953 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16383854  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16383853 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16383754  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383753 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 16383654  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383653 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 16383554  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16383553 tcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22225994 - 22225562
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22225994 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 22225895  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22225894 caatcaaaacatttcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 22225795  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225794 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 22225695  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225694 attgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 22225595  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22225594 tcaagctttccattcaacactcttgttcttctc 22225562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 10488699 - 10489131
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  10488699 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 10488798  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10488799 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 10488898  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488899 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 10488998  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488999 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 10489098  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10489099 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 10489131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16556395 - 16555973
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  16556395 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16556296  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16556295 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16556196  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556195 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 16556096  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556095 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 16555996  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactct 430  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  16555995 ccaagctttcccttcaacactct 16555973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16632951 - 16632529
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  16632951 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16632852  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16632851 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16632752  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632751 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 16632652  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632651 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 16632552  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactct 430  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  16632551 ccaagctttcccttcaacactct 16632529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 1556005 - 1556434
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1556005 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 1556104  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1556105 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1556204  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1556205 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 1556304  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  1556305 attgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 1556404  T
Q  407 ctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 435  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  1556405 ctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 1556434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 414
Target Start/End: Original strand, 19610018 - 19610425
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  19610018 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaactacatctcattt 19610117  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610118 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataattttataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 19610217  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  19610218 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaa 19610317  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  19610318 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 19610417  T
Q  407 ctcaagct 414  Q
    ||||||||    
T  19610418 ctcaagct 19610425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 182 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251390
Alignment:
Q  182 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
Q  282 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251548 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 22251449  T
Q  382 gctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22251448 gctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttgttcttctc 22251390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 148 - 440
Target Start/End: Original strand, 19299375 - 19299669
Alignment:
Q  148 ttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19299375 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19299474  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299475 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 19299574  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19299575 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 19299669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 414
Target Start/End: Original strand, 16231972 - 16232297
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16231972 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16232071  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232072 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 16232171  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  16232172 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 16232271  T
Q  388 aggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||    
T  16232272 aagtcaccc-acttgattcctaaagct 16232297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 91 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18086999 - 18086690
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18086999 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18086900  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086899 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18086800  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18086799 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 18086700  T
Q  388 aggtcaccca 397  Q
    | ||||||||    
T  18086699 aagtcaccca 18086690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 91 - 388
Target Start/End: Original strand, 23977849 - 23978149
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23977849 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23977948  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23977949 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 23978048  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  23978049 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 23978148  T
Q  388 a 388  Q
    |    
T  23978149 a 23978149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13620970 - 13620712
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacgt--aattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  13620970 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaattt 13620871  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620870 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13620771  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  13620770 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27654006 - 27653814
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  27654006 cacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 27653908  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 432  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27653907 ccctcacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 27653814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 130 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29869911 - 29869627
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  29869911 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacacttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 29869812  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacat-gattatgata 326  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || ||||||||||    
T  29869811 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaa-attttaaattgattatgata 29869714  T
Q  327 ataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  29869713 ataactaacccccttaccttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 29869627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 342
Target Start/End: Original strand, 29665945 - 29666208
Alignment:
Q  83 tcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac- 180  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||| || |||  |||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  29665945 tcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatgcatactttgaaaca 29666044  T
Q  181 -gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaaccca 279  Q
     ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||  || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  29666045 tgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatcacccca 29666144  T
Q  280 ttttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 342  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  29666145 ttttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccactta 29666208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14626243 - 14625953
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||    
T  14626243 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 14626145  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttac 343  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||| | | || || || |||||||  |||||  || ||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14626144 agcacgaatttagcaataattatccataatcacaatt-caaacaacatttgagaatttgtaaag--tgaagatgattgtgataataactaacccccttac 14626048  T
Q  344 ctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14626047 ctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctc 14625953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 389
Target Start/End: Original strand, 25175792 - 25175945
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaac 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  25175792 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-attatacatgattatggtaatcactaac 25175890  T
Q  336 ccccttacctttgaagatgattattcctaa-cccttgcttcaattcagctcctag 389  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25175891 ccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctcctag 25175945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1650184 - 1650022
Alignment:
Q  181 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 280  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  ||  || || ||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  1650184 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 1650085  T
Q  281 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1650084 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16825775 - 16825678
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaac 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  16825775 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33314474 - 33314387
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  33314474 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaat 33314387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 440
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862916
Alignment:
Q  131 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaa 229  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||  | | || |||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  ||     
T  15862592 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaac 15862691  T
Q  230 atagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat----------caacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatg 317  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||||  ||||||| | |||          |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || |||||    
T  15862692 ataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatg 15862791  T
Q  318 attatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-t 415  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||| |    
T  15862792 attatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcacctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctat 15862891  T
Q  416 tcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    || |||||| |||||||||| ||||    
T  15862892 tctcttcaaaactcttgttcttctc 15862916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 388
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991470
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcct-aacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 4991470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 330 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16814930 - 16814837
Alignment:
Q  330 actaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaa 424  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||    
T  16814930 actaaccctcttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattgctaaagc-ttcccttcaa 16814837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1657738 - 1657566
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 369  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||    
T  1657738 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactct 1657639  T
Q  370 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    || ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  1657638 tgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 1657566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 191
Target Start/End: Original strand, 27740957 - 27741021
Alignment:
Q  129 ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacc 191  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  27740957 ttcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatacttcgaaacatgtaatttcacc 27741021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 266
Target Start/End: Original strand, 19629556 - 19629588
Alignment:
Q  234 caccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19629556 caccacaacaagagcacgaatttaacaacaatt 19629588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 7822728 - 7823160
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  7822728 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 7822827  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7822828 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 7822927  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822928 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 7823027  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7823028 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 7823127  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7823128 tcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 7823160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 7830039 - 7830471
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  7830039 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 7830138  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7830139 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 7830238  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830239 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 7830338  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830339 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 7830438  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7830439 tcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 7830471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 27176433 - 27176865
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  27176433 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27176532  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27176533 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27176632  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176633 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 27176732  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176733 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 27176832  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27176833 tcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 27176865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27101893 - 27101461
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  27101893 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27101794  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27101793 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27101694  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101693 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 27101594  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101593 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 27101494  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27101493 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 27101461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27109241 - 27108809
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  27109241 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27109142  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27109141 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27109042  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109041 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 27108942  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27108941 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 27108842  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27108841 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 27108809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38783985 - 38783553
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  38783985 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 38783886  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38783885 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 38783786  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783785 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 38783686  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783685 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 38783586  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38783585 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 38783553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15951047 - 15950614
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951047 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataatcacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 15950948  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15950947 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15950848  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15950847 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15950748  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  15950747 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcc 15950648  T
Q  408 tcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||| || ||||||| || ||||||| ||||    
T  15950647 tcaagctatttccttcaaaacccttgttcttctc 15950614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15760370 - 15759941
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15760370 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcattattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15760271  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15760270 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataa 15760171  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15760170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15760071  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  15760070 attgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 15759971  T
Q  407 ctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 435  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  15759970 ctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 15759941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18980197 - 18979872
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18980197 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18980098  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980097 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18979998  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18979997 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 18979898  T
Q  388 aggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||    
T  18979897 aagtcaccc-acttgattcctaaagct 18979872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 414
Target Start/End: Original strand, 15927648 - 15927973
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15927648 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 15927747  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15927748 cacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcata 15927847  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  15927848 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 15927947  T
Q  388 aggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||    
T  15927948 aagtcaccc-acttgattcctaaagct 15927973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14251074 - 14250721
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14251074 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 14250975  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250974 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 14250875  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  14250874 caacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttaccttagaagaagataact-caaactcttgcttcaattcagctcct 14250776  T
Q  388 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14250775 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 14250721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 91 - 388
Target Start/End: Original strand, 13758450 - 13758750
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13758450 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13758549  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13758550 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 13758649  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  13758650 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 13758749  T
Q  388 a 388  Q
    |    
T  13758750 a 13758750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Original strand, 2437686 - 2437888
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437686 cacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacc 2437784  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2437785 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcctgttct 2437884  T
Q  437 tctc 440  Q
    ||||    
T  2437885 tctc 2437888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 147 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16479075 - 16478786
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || | ||| |||    
T  16479075 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaag 16478977  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16478976 agcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--aaatgattatgataatcactaacccccttacct 16478880  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  16478879 ttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 16478786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13911156 - 13910855
Alignment:
Q  129 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaag 226  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| | ||||||||||| | || ||||| || | |||||||||| ||| |      
T  13911156 ttcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcataca 13911058  T
Q  227 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgata 326  Q
    || ||| || |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13911057 aacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgata 13910959  T
Q  327 ataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaaca 426  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||     
T  13910958 atcaataacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaacc 13910861  T
Q  427 ctcttg 432  Q
    ||||||    
T  13910860 ctcttg 13910855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 237 - 414
Target Start/End: Original strand, 10989638 - 10989814
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10989638 cacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacc 10989736  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  10989737 cccatacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattaagctcctatgtcacctcacttgattcctcaagct 10989814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48622788 - 48622584
Alignment:
Q  143 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 241  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48622788 ataatttcacaacttaacaattatgcatgctttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacag 48622689  T
Q  242 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 341  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  48622688 taagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 48622589  T
Q  342 acctt 346  Q
    |||||    
T  48622588 acctt 48622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 148 - 414
Target Start/End: Original strand, 13572816 - 13573079
Alignment:
Q  148 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 247  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || || || || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  13572816 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 13572915  T
Q  248 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 347  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13572916 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctta 13573013  T
Q  348 gaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  13573014 gaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 13573079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10000505 - 10000288
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa--acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  10000505 tcatcaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 10000407  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||| | || || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |  |||||||||| |    
T  10000406 aaacaacaacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatga 10000307  T
Q  328 taactaacccccttacctt 346  Q
      || ||||||||||||||    
T  10000306 agacaaacccccttacctt 10000288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Original strand, 16418618 - 16418835
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  16418618 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagc 16418717  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  16418718 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 16418816  T
Q  328 taactaacccccttacctt 346  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  16418817 aaacaaacccccttacctt 16418835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18253862 - 18253761
Alignment:
Q  245 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 344  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18253862 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 18253763  T
Q  345 tt 346  Q
    ||    
T  18253762 tt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 263 - 346
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
Q  263 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 388
Target Start/End: Original strand, 13321134 - 13321407
Alignment:
Q  129 ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaag 226  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |      
T  13321134 ttcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcataca 13321233  T
Q  227 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtac 314  Q
    || ||| || |||||  |||||||||||||| |||||||| | ||          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||    
T  13321234 aacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccacttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaac 13321333  T
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||   |||||| || ||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctccta 13321407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516719
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctag 389  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 388
Target Start/End: Original strand, 7293289 - 7293406
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 369  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  7293289 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 7293387  T
Q  370 tgcttcaattcagctccta 388  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  7293388 ggcttcaatttagctccta 7293406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30262119 - 30262002
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 369  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  30262119 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 30262021  T
Q  370 tgcttcaattcagctccta 388  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  30262020 ggcttcaatttagctccta 30262002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 11516520 - 11516617
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  11516520 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 11516617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15441534 - 15441437
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  15441534 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 15441437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14113959 - 14113904
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14113959 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 14113904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10000625 - 10000583
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10000625 catcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 10000583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 16418498 - 16418540
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16418498 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcact 16418540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14423629 - 14423555
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14423629 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataa-gactaacccccttacctt 14423555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1467995 - 1467563
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  1467995 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 1467896  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1467895 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 1467796  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467795 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 1467696  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467695 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 1467596  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1467595 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 1467563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 49232436 - 49232868
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232436 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 49232535  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49232536 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 49232635  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232636 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 49232735  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49232736 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcataggtcacccaaattgattcc 49232835  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49232836 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 49232868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12265049 - 12264615
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | ||||||||   |  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12265049 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 12264950  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccata 206  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12264949 caacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata 12264850  T
Q  207 atcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264849 atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 12264750  T
Q  307 gattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccaaattgatt 405  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12264749 aattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaaattgatt 12264650  T
Q  406 cctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12264649 cctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 12264615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 25058739 - 25059168
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25058739 catcatcaattcacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcataagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 25058838  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25058839 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 25058938  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25058939 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 25059038  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||   ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  25059039 attgtgcatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 25059138  T
Q  407 ctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 435  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  25059139 ctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 25059168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 108 - 440
Target Start/End: Original strand, 12811938 - 12812273
Alignment:
Q  108 tttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacatacca 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  12811938 tttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataaattcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacatacca 12812037  T
Q  205 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12812038 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgca 12812137  T
Q  305 aagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgat 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812138 aagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgat 12812237  T
Q  405 tcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12812238 tccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 12812273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 62 - 424
Target Start/End: Original strand, 22275260 - 22275626
Alignment:
Q  62 catcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaac 160  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22275260 catcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaac 22275359  T
Q  161 atttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  22275360 atttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttag 22275459  T
Q  259 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275460 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 22275559  T
Q  359 ttcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaa 424  Q
      | ||||  ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275560 accttaacttttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaa 22275626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 62 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15468545 - 15468162
Alignment:
Q  62 catcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaac 160  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15468545 catcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaac 15468446  T
Q  161 atttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  15468445 atttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttag 15468346  T
Q  259 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 358  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15468345 caacaattgttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagatta 15468246  T
Q  359 ttcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
      |||||  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  15468245 accctaattcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 15468162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 414
Target Start/End: Original strand, 5228317 - 5228719
Alignment:
Q  15 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5228317 atcaattcacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacacctcatttcaat 5228416  T
Q  115 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5228417 caaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 5228516  T
Q  212 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 311  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  5228517 caattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat-gttcatcaacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaattg 5228615  T
Q  312 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctca 410  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  5228616 aacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctca 5228715  T
Q  411 agct 414  Q
    ||||    
T  5228716 agct 5228719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 91 - 440
Target Start/End: Original strand, 18911073 - 18911427
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18911073 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18911172  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911173 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18911272  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18911273 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 18911372  T
Q  388 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  18911373 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 18911427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12902346 - 12902008
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||| |||||||   |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12902346 catcattaatccacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagtatcagttaataataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 12902247  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12902246 caatcaaaacatatcaaatttaatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 12902147  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12902146 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 12902047  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902046 attgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 181 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18897127 - 18896871
Alignment:
Q  181 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 280  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18897127 gtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccat 18897028  T
Q  281 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  18897027 tttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 18896928  T
Q  381 agctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 435  Q
    ||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  18896927 agctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 18896871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 83 - 388
Target Start/End: Original strand, 54651529 - 54651837
Alignment:
Q  83 tcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacg 181  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  54651529 tcaatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgcaaca 54651628  T
Q  182 t--aatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaaccca 279  Q
    |  |||||||| || || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54651629 tgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaaccca 54651728  T
Q  280 ttttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaatt 379  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||  || |||  |||||||||||    
T  54651729 ttttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaatt 54651828  T
Q  380 cagctccta 388  Q
     ||||||||    
T  54651829 aagctccta 54651837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Original strand, 44228985 - 44229323
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttg---gcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctca 107  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | ||||||||    |||||||||   | ||||||| |||||||||||||||    
T  44228985 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataacc---ttaatggaacatgaatcacatctca 44229081  T
Q  108 tttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacatacca 204  Q
    ||| ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  44229082 ttttaacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacatacca 44229181  T
Q  205 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgc 303  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  44229182 taatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa-tga 44229280  T
Q  304 aaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44229281 aaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 44229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 149 - 435
Target Start/End: Original strand, 16821280 - 16821564
Alignment:
Q  149 tcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 247  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||| | ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  16821280 tcatagcttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagag 16821378  T
Q  248 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 347  Q
    |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16821379 cacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaacccccttaccttt 16821475  T
Q  348 gaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 435  Q
    ||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||    
T  16821476 gaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcttcaagttattcccttcaaaacccttgttc 16821564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 414
Target Start/End: Original strand, 41270304 - 41270478
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  41270304 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 41270401  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  41270402 cccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 41270478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 414
Target Start/End: Original strand, 55316448 - 55316622
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  55316448 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 55316545  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    || ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  55316546 cctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 55316622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18897255 - 18897139
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18897255 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 18897156  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa 127  Q
    |||||||||||||||||    
T  18897155 caatcaaaacatatcaa 18897139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15936654 - 15936553
Alignment:
Q  245 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 344  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15936654 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccatacc 15936555  T
Q  345 tt 346  Q
    ||    
T  15936554 tt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15938496 - 15938395
Alignment:
Q  245 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 344  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15938496 gagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 15938397  T
Q  345 tt 346  Q
    ||    
T  15938396 tt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 346
Target Start/End: Original strand, 15614973 - 15615168
Alignment:
Q  148 ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 246  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| ||| |  || ||| |||||||| ||||    
T  15614973 ttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaaga 15615071  T
Q  247 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15615072 gcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842392
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 413  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgatccctcaagc 14842420  T
Q  414 t-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14842419 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 14842392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 440
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492823
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 413  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttacccaaattgattcctcaagc 23492795  T
Q  414 t-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  23492796 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 23492823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11986300 - 11986172
Alignment:
Q  140 agcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcacc 237  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||| || ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||| || |    
T  11986300 agcacaatttcataacttgacattaatacatactttaaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatc 11986201  T
Q  238 acagcaagagcacgaatttaacaacaatt 266  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11986200 acagttagagcacgaatttaacaacaatt 11986172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268609
Alignment:
Q  314 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8268683 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8268609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275709
Alignment:
Q  314 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8275783 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8275709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2449208 - 2449111
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  2449208 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 2449111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13954880 - 13954738
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 369  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  13954880 tcaacccattt-catacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 13954782  T
Q  370 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 412  Q
     ||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||| |||||    
T  13954781 ggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 13954738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 412
Target Start/End: Original strand, 45861078 - 45861220
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 369  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || | ||||||||| |||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  45861078 tcaacccattt-catacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaatatgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 45861176  T
Q  370 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 412  Q
     ||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||| |||||    
T  45861177 ggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 45861220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11231594 - 11231162
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  11231594 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 11231495  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11231494 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 11231395  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231394 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 11231295  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231294 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 11231195  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11231194 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 11231162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22513441 - 22513009
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  22513441 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22513342  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22513341 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 22513242  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513241 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 22513142  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513141 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 22513042  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22513041 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 22513009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28776063 - 28775631
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  28776063 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 28775964  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28775963 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 28775864  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775863 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 28775764  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775763 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 28775664  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28775663 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 28775631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24686037 - 24685605
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  24686037 catcatcaatccacaattaagtatacctaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 24685938  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24685937 caatcaaaacacatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 24685838  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685837 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 24685738  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685737 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 24685638  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24685637 ccaagctttcccttcaacacttttgttcttctc 24685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 16935593 - 16936027
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935593 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 16935692  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||    
T  16935693 caatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataa 16935792  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16935793 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 16935892  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| |||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  16935893 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 16935992  T
Q  407 ctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  16935993 ctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 16936027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 17006253 - 17006687
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006253 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 17006352  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||    
T  17006353 caatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataa 17006452  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17006453 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 17006552  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| |||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  17006553 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 17006652  T
Q  407 ctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  17006653 ctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 17006687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Original strand, 12728392 - 12728772
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728392 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 12728491  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12728492 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 12728591  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12728592 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 12728691  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  12728692 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 12728772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Original strand, 34824475 - 34824855
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824475 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 34824574  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34824575 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 34824674  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34824675 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 34824774  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  34824775 attgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 34824855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23778301 - 23777963
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23778301 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 23778202  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23778201 caatcaaatcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 23778102  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23778101 tcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 23778002  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23778001 attgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 42178145 - 42177791
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42178145 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 42178046  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178045 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 42177946  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||| |||    
T  42177945 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagcccct 42177846  T
Q  388 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  42177845 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 42177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 91 - 388
Target Start/End: Original strand, 8943926 - 8944226
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8943926 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 8944025  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944026 cacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 8944125  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  8944126 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 8944225  T
Q  388 a 388  Q
    |    
T  8944226 a 8944226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 91 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12636044 - 12635744
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12636044 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12635945  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12635944 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcata 12635845  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  12635844 caacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 12635745  T
Q  388 a 388  Q
    |    
T  12635744 a 12635744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3798779 - 3798482
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3798779 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 3798680  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3798679 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 3798580  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctc 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||    
T  3798579 caacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctc 3798482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 91 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12641818 - 12641518
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12641818 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12641719  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12641718 cagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 12641619  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  12641618 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 12641519  T
Q  388 a 388  Q
    |    
T  12641518 a 12641518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 21141895 - 21142187
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttg---gcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctca 107  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||  || | | ||||||||    |||||||||   | ||||||| |||||||||||||||    
T  21141895 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcgtaattcacccacaacaacatcagttaatagcaataacc---ttaatggaacatgaatcacatctca 21141991  T
Q  108 tttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacatacca 204  Q
    ||| ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  21141992 ttttaacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacatacca 21142091  T
Q  205 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 299  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142092 taatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 21142187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19886684 - 19886484
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19886684 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacc 19886586  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 436  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  19886585 cccttacctttgaagttgattatccttaatcctagtttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttct 19886488  T
Q  437 tctc 440  Q
    ||||    
T  19886487 tctc 19886484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 388
Target Start/End: Original strand, 23774257 - 23774516
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23774257 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23774356  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| || ||||||||||||    
T  23774357 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataa 23774455  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23774456 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23774516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5888765 - 5888548
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  5888765 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagc 5888666  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  5888665 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 5888567  T
Q  328 taactaacccccttacctt 346  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  5888566 aaacaaacccccttacctt 5888548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24826646 - 24826531
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||     
T  24826646 atgattatgatgatgactaacccctttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc- 24826549  T
Q  415 ttcccttcaacactcttg 432  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  24826548 ttcccttcaaccctcttg 24826531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7507969 - 7507758
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  7507969 tttcataacttattatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaag 7507871  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 333  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||    
T  7507870 agcacgaatttagcaataattattcattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagacta 7507771  T
Q  334 acccccttacctt 346  Q
    |||||||||||||    
T  7507770 acccccttacctt 7507758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 388
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213446
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcct-aacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 25213446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14906410 - 14906313
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  14906410 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 14906313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19689391 - 19689316
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19689391 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 19689316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 23820364 - 23820461
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  23820364 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 23820461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 5888885 - 5888843
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5888885 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcact 5888843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 23774137 - 23774179
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23774137 catcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 23774179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17396643 - 17396568
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  17396643 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttacctt 17396568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 20015304 - 20015401
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20015304 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 20015401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 31309 - 31741
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  31309 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 31408  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31409 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 31508  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31509 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 31608  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31609 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 31708  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31709 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 31741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 297
Target Start/End: Original strand, 39646 - 39935
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39646 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatgaaatatgaataacatctcattt 39745  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39746 caaaaaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataa 39845  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 297  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846 tcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39535
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  39103 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 39202  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39203 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 39302  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39303 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 39402  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39403 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 39502  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39503 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 39535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 440
Target Start/End: Original strand, 43137 - 43426
Alignment:
Q  148 ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || | ||||||||    
T  43137 ttcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaaga 43235  T
Q  247 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  43236 gcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-at--tacatgtttgtgatagtaactaacccccttacct 43332  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  43333 ttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttcagctcctagatcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 43426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 271616 - 271184
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  271616 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 271517  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  271516 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 271417  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271416 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 271317  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271316 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 271217  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  271216 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 271184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 644304 - 644736
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  644304 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 644403  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  644404 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 644503  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644504 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 644603  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644604 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 644703  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  644704 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 644736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 830039 - 830471
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  830039 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 830138  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  830139 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 830238  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830239 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 830338  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830339 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 830438  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830439 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 830471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22089050 - 22088618
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  22089050 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22088951  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22088950 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataa 22088851  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088850 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 22088751  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088750 attgtacatgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 22088651  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22088650 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 22088618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15319415 - 15318983
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  15319415 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctctttt 15319316  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15319315 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 15319216  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319215 tcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 15319116  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319115 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 15319016  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15319015 ccaagcttttccttcaacactcttgttcttctc 15318983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15499784 - 15499352
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  15499784 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctctttt 15499685  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15499684 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 15499585  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499584 tcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 15499485  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499484 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 15499385  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15499384 ccaagcttttccttcaacactcttgttcttctc 15499352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22006514 - 22006107
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006514 catcatcagtccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaataacatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 22006415  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22006414 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 22006315  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22006314 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22006215  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  22006214 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 22006115  T
Q  407 ctcaagct 414  Q
    ||||||||    
T  22006114 ctcaagct 22006107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13662521 - 13662087
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662521 catcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 13662422  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13662421 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 13662322  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13662321 tcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 13662222  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||    
T  13662221 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattc 13662122  T
Q  407 ctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  13662121 ctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 13662087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 91 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13721104 - 13720750
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13721104 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13721005  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721004 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13720905  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  13720904 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 13720805  T
Q  388 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  13720804 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 13720750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 83 - 388
Target Start/End: Original strand, 16195302 - 16195611
Alignment:
Q  83 tcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195302 tcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcataaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaac 16195401  T
Q  181 --gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaaccc 278  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16195402 atgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaaccc 16195501  T
Q  279 attttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaat 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  16195502 attttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgcttcaat 16195601  T
Q  379 tcagctccta 388  Q
    ||| ||||||    
T  16195602 tcaactccta 16195611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 91 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16873227 - 16872927
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16873227 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16873128  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16873127 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 16873028  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||| |||||||    
T  16873027 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaatttagctcct 16872928  T
Q  388 a 388  Q
    |    
T  16872927 a 16872927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 147 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6774371 - 6774083
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||    
T  6774371 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaag 6774273  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6774272 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttacct 6774176  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  6774175 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 6774083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 147 - 440
Target Start/End: Original strand, 24549120 - 24549409
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||    
T  24549120 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaag 24549218  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24549219 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccccttacct 24549315  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  24549316 tagaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 24549409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 432
Target Start/End: Original strand, 30120951 - 30121144
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  30120951 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaaattacacatgattatgataatcactaacc 30121050  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  30121051 cccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 30121144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21844684 - 21844394
Alignment:
Q  148 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 247  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  21844684 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 21844585  T
Q  248 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 347  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21844584 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccgtt 21844487  T
Q  348 gaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctt-tcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||| ||||||| | ||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  21844486 gaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctc 21844394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21852077 - 21851787
Alignment:
Q  148 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 247  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | |  |||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  21852077 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 21851978  T
Q  248 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 347  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21851977 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttt 21851880  T
Q  348 gaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctt-tcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||| ||||||| | ||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  21851879 gaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctc 21851787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16674524 - 16674258
Alignment:
Q  129 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaag 226  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| | ||||||||||| | || ||||| |  | ||| |||||| ||| ||     
T  16674524 ttcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcata-tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaa 16674426  T
Q  227 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgata 326  Q
    || ||| || ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  16674425 aacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgata 16674328  T
Q  327 ataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 397  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16674327 ataactaacccccttaccttagaagaagatta-actcaactcttgcttcaattcagctcataagtcaccca 16674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 412
Target Start/End: Original strand, 17345842 - 17345985
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 369  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||  || ||| ||    
T  17345842 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactct 17345941  T
Q  370 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 412  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  17345942 tgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaag 17345985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17142894 - 17142854
Alignment:
Q  400 ttgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17142894 ttgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 17142854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22907204 - 22907087
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 369  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  22907204 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 22907106  T
Q  370 tgcttcaattcagctccta 388  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  22907105 ggcttcaatttagctccta 22907087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 5238380 - 5238477
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  5238380 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 5238477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24661218 - 24661121
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  24661218 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 24661121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 43685839 - 43685936
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  43685839 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 43685936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21932637 - 21932205
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  21932637 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 21932538  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21932537 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 21932438  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932437 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 21932338  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932337 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 21932238  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21932237 tcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 21932205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21938807 - 21938375
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  21938807 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 21938708  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21938707 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 21938608  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938607 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 21938508  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938507 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 21938408  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21938407 tcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 21938375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 35582036 - 35582468
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  35582036 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 35582135  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35582136 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 35582235  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582236 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 35582335  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582336 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 35582435  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35582436 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 35582468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22883340 - 22882908
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  22883340 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22883241  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22883240 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataa 22883141  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883140 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 22883041  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22883040 attgtacatgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgatttc 22882941  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22882940 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 22882908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36990026 - 36989594
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  36990026 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 36989927  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36989926 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 36989827  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36989826 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaag 36989727  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989726 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 36989627  T
Q  408 tcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36989626 ccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 36989594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1219776 - 1219396
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1219776 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatgaaatatgaatcacatctcattt 1219677  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1219676 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1219577  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1219576 tcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 1219477  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  1219476 attgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 1219396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 91 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10778146 - 10777794
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10778146 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 10778047  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778046 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 10777947  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10777946 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgcttcaattcagctcct 10777847  T
Q  388 aggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  10777846 aggtcaccccacttgattcctcaagcttccccttcaactctcttgttcttctc 10777794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 414
Target Start/End: Original strand, 7425324 - 7425729
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7425324 catcatcaatccataattaagtatatccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 7425423  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7425424 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 7425523  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
     |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7425524 ccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 7425623  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7425624 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcc 7425722  T
Q  408 tcaagct 414  Q
    | |||||    
T  7425723 taaagct 7425729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 62 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 17471793 - 17471427
Alignment:
Q  62 catcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaac 160  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17471793 catcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatcttatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcattacttaac 17471694  T
Q  161 atttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  17471693 atttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttat 17471594  T
Q  259 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471593 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 17471494  T
Q  359 ttcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaa 424  Q
       | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17471493 actcaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaa 17471427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 35791355 - 35790947
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||   | | | ||||||||   |  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35791355 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 35791256  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccata 206  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  35791255 caacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcactcacaaacataccata 35791156  T
Q  207 atcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791155 atcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 35791056  T
Q  307 gattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgatt 405  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||    
T  35791055 aattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgatt 35790956  T
Q  406 cctcaagct 414  Q
    |||||||||    
T  35790955 cctcaagct 35790947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 440
Target Start/End: Original strand, 23514641 - 23514995
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23514641 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23514740  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514741 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 23514840  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  23514841 caacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 23514940  T
Q  388 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     || | |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  23514941 aagcttaccccaattgattcctcaagttattctcttcaaaacccttgttcttctc 23514995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11212321 - 11211886
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||  || | | ||||||||   |  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11212321 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatccacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 11212222  T
Q  111 caatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||  | ||||||| ||  ||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11212221 caacaacaacatattaaaattcactacttgagtataatttcataacttaacatttatacacactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 11212122  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11212121 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 11212022  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaa--ttgatt 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||||    
T  11212021 attgaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattttgatt 11211922  T
Q  406 cctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    | ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||    
T  11211921 cttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 11211886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18778015 - 18777815
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  18778015 cacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 18777917  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 436  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  18777916 cccttacctttgaagttaattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagc-ttcccttcaaccctcttgttct 18777819  T
Q  437 tctc 440  Q
    ||||    
T  18777818 tctc 18777815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Original strand, 19500128 - 19500327
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19500128 cacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 19500226  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 436  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  19500227 cccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcaccc-acttgattcctcaagc-ttcccttcaactctcttgttct 19500323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21073618 - 21073418
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21073618 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacc 21073520  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 436  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  21073519 cccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttct 21073422  T
Q  437 tctc 440  Q
    ||||    
T  21073421 tctc 21073418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 147 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29188397 - 29188116
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||    
T  29188397 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaag 29188299  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29188298 agcacgaatctagcatgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattataataatcactaacccccttacct 29188202  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 432  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  29188201 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 29188116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Original strand, 12603 - 12803
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12603 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaa-attacacatgattatgataataactaacc 12701  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 436  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  12702 cccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttct 12799  T
Q  437 tctc 440  Q
    ||||    
T  12800 tctc 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22366504 - 22366311
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  22366504 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 22366406  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 432  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  22366405 cccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcaactcctaggtcaccccacttgattgctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 22366311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 388
Target Start/End: Original strand, 23328678 - 23328937
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23328678 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23328777  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  23328778 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 23328876  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23328877 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23328937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 148 - 414
Target Start/End: Original strand, 27009981 - 27010244
Alignment:
Q  148 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 247  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | |  ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  27009981 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 27010080  T
Q  248 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 347  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27010081 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctta 27010178  T
Q  348 gaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  27010179 gaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 27010244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 129 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4200117 - 4199816
Alignment:
Q  129 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaag 226  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| | ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |      
T  4200117 ttcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcataca 4200019  T
Q  227 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgata 326  Q
    || ||| || |||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  4200018 aacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgata 4199920  T
Q  327 ataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaaca 426  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||     
T  4199919 atccctaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaacc 4199822  T
Q  427 ctcttg 432  Q
    ||||||    
T  4199821 ctcttg 4199816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 388
Target Start/End: Original strand, 24616282 - 24616541
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24616282 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24616381  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24616382 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24616480  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24616481 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24616541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 388
Target Start/End: Original strand, 24712658 - 24712917
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24712658 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24712757  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24712758 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24712856  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24712857 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24712917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 388
Target Start/End: Original strand, 24745676 - 24745935
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24745676 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24745775  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24745776 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24745874  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24745875 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24745935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 43443474 - 43443261
Alignment:
Q  181 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 280  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  43443474 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccat 43443375  T
Q  281 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 380  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  43443374 tttcatataacatgagaatatgca---attacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 43443278  T
Q  381 agctcctaggtcaccca 397  Q
    |||||||||||||||||    
T  43443277 agctcctaggtcaccca 43443261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 237 - 389
Target Start/End: Original strand, 25426857 - 25427009
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  25426857 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 25426955  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaa-cccttgcttcaattcagctcctag 389  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25426956 cccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctcctag 25427009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 315 - 440
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343133
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagct 11343107  T
Q  415 ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11343108 ttcccttcaacactcttgttcttctc 11343133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 440
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106092
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 16106066  T
Q  415 ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16106067 ttcccttcaacactcttgttcttctc 16106092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 32950765 - 32950952
Alignment:
Q  83 tcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacata-tcaatttcatcaattaagcataatttcataactta-acatttatacatactttgaaac 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||| | || |||| || || |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  32950765 tcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagtaaaattcaccatttgagcacaatttcataactttgacctttatacatactttgaaac 32950864  T
Q  181 --gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 266  Q
      ||||||||| ||| || ||||| || |||||||| |||  |||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32950865 atgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 32950952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 23328558 - 23328600
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23328558 catcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 23328600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 20623262 - 20623359
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20623262 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 20623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21233498 - 21233401
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  21233498 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 21233401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 37053037 - 37053134
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  37053037 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 37053134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 24616165 - 24616205
Alignment:
Q  13 tcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24616165 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24616205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 24712541 - 24712581
Alignment:
Q  13 tcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24712541 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24712581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 24745559 - 24745599
Alignment:
Q  13 tcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24745559 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24745599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 25900376 - 25900321
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25900376 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 25900321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 16536490 - 16536587
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16536490 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16536587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 397
Target Start/End: Original strand, 29162 - 29551
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29162 catcatcaatacacaattaagtataaccaaatcataattcactaacaataacataaattaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 29261  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29262 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataa 29361  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29362 tcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 29461  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29462 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttcagctcctaggtcaccca 29551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 440
Target Start/End: Original strand, 29565 - 29626
Alignment:
Q  378 ttcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  29565 ttcagctcctaggtcacccac-ttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 29626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 18168970 - 18169402
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18168970 catcatcaattcacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagcattatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 18169069  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18169070 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 18169169  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18169170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18169269  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  18169270 attgtacatgattatgataataactaacccccttacc-ttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcc 18169368  T
Q  408 tcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  18169369 tcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 18169402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15287501 - 15287096
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15287501 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15287402  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287401 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15287302  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15287301 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15287202  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  15287201 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcc 15287103  T
Q  408 tcaagct 414  Q
    | |||||    
T  15287102 taaagct 15287096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15294610 - 15294221
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15294610 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15294511  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294510 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15294411  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15294410 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15294311  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15294310 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccca 15294221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Original strand, 19020486 - 19020824
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19020486 catcatcaatccacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 19020585  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19020586 caatcaaaacatatcaaatttcatccattaaggataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 19020685  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  19020686 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaa 19020785  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19020786 attgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 91 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7132241 - 7131887
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7132241 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 7132142  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132141 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 7132042  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7132041 taacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgcttcaattcagctcct 7131942  T
Q  388 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  7131941 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 7131887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 91 - 388
Target Start/End: Original strand, 20000803 - 20001103
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20000803 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 20000902  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20000903 cacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 20001002  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  20001003 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 20001102  T
Q  388 a 388  Q
    |    
T  20001103 a 20001103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17145913 - 17145479
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | ||||||||   |  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17145913 catcatcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 17145814  T
Q  111 caatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17145813 caacaacaacatatcaaaattcactaattgagtataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 17145714  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17145713 tcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 17145614  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||| |||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  17145613 attgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttacttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 17145514  T
Q  407 ctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  17145513 ctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 17145479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 358
Target Start/End: Original strand, 18248218 - 18248568
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||  || | | ||||||||   |  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18248218 catcatcaatcgataattatgtataccaaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 18248317  T
Q  111 caatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||  | ||||||| ||  ||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18248318 caacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcatatcttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 18248417  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18248418 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaa 18248517  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18248518 attgtacaagattatgataataactaacccccttaccttagatgatgatta 18248568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 131 - 346
Target Start/End: Original strand, 22738390 - 22738607
Alignment:
Q  131 catcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22738390 catcaattaagcataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaa 22738489  T
Q  229 aatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 328  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |     
T  22738490 aatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaattgattatgatgaa 22738589  T
Q  329 aactaacccccttacctt 346  Q
     || ||||||||||||||    
T  22738590 gacaaacccccttacctt 22738607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 149 - 440
Target Start/End: Original strand, 10644360 - 10644647
Alignment:
Q  149 tcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 247  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  10644360 tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 10644458  T
Q  248 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 347  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644459 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttt 10644555  T
Q  348 gaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||| ||||||| | ||| |||  ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  10644556 gaagttgattatccttaatcctaacttcacttcagctcctagatcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 10644647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22352184 - 22351915
Alignment:
Q  145 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagc 242  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||| || | |    
T  22352184 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataac 22352086  T
Q  243 aagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 342  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22352085 aagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 22351986  T
Q  343 cctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  22351985 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 22351915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 388
Target Start/End: Original strand, 26339140 - 26339399
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26339140 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatagattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 26339239  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  26339240 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 26339338  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  26339339 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 26339399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 222 - 337
Target Start/End: Original strand, 8378365 - 8378480
Alignment:
Q  222 acaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgatta 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8378365 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgatta 8378464  T
Q  322 tgataataactaaccc 337  Q
    ||||||||||||||||    
T  8378465 tgataataactaaccc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 237 - 414
Target Start/End: Original strand, 47357883 - 47358057
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  47357883 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacc 47357979  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||||    
T  47357980 cccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattccttaagct 47358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 8374508 - 8374724
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||  || | | ||||||||   |  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8374508 catcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 8374607  T
Q  111 caatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa--acgtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||  | ||||||| ||  ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8374608 caacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacataccataa 8374707  T
Q  208 tcatcaattcaagcaca 224  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8374708 tcatcaattcatgcaca 8374724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 314 - 440
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996572
Alignment:
Q  314 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||    
T  14996444 catgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaaacttaccccaattgattcctcaag 14996543  T
Q  413 ct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    || ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14996544 ctattctcttcaaaacccttgttcttctc 14996572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 346
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
Q  271 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 414
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952183
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 14952183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40885698 - 40885585
Alignment:
Q  129 ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||| ||| |  |    
T  40885698 ttcaccaattgagcataatttcataacttgacatttatacatactttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaa 40885599  T
Q  228 aaatagcaccacag 241  Q
    | ||||||||||||    
T  40885598 acatagcaccacag 40885585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 346
Target Start/End: Original strand, 8378486 - 8378524
Alignment:
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378486 attgtacatgattatgataataactaatccccttacctt 8378524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16609069 - 16608972
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16609069 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16608972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 22738269 - 22738310
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcac 52  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22738269 catcattaatccacaattaagtatacccaagtcataattcac 22738310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 26680493 - 26680590
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  26680493 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 26680590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16327896 - 16327841
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16327896 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 16327841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22352302 - 22352260
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22352302 catcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 22352260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 154263 - 153829
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  154263 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacccacaatagcataagttaacaataaccacatcaatggaatatgattcacatctcattt 154164  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  154163 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataa 154064  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  154063 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 153964  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  153963 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 153864  T
Q  407 ctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  153863 ctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 153829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 237 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 169935 - 169738
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  169935 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacc 169837  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttc 435  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  169836 cccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagctcttatgtcaccccacttgattcctcaagcttcgccttcaactctcttgttc 169738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 242 - 432
Target Start/End: Original strand, 36327 - 36514
Alignment:
Q  242 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 341  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36327 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcattaaccccctt 36425  T
Q  342 acctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 432  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  36426 acctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagcttt-ccttcaaccctcttg 36514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1424
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| || |||||   |||||| | |||||||||||    
T  1831 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaattttatatgatttacatctcattt 1732  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1731 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1632  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1631 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 1532  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  1531 attgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 1432  T
Q  407 ctcaagct 414  Q
    ||||||||    
T  1431 ctcaagct 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 424
Target Start/End: Original strand, 2392 - 2810
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2392 catcatcaatccacaattaagtatacccaaaccatgattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 2491  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2492 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 2591  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2592 gcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 2691  T
Q  308 a-ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattc 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  2692 atttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattc 2791  T
Q  407 ctcaagct-ttcccttcaa 424  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  2792 ctcaagctattcccttcaa 2810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1690 - 1336
Alignment:
Q  91 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1690 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 1591  T
Q  188 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1590 cacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 1491  T
Q  288 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1490 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcct 1391  T
Q  388 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  1390 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 10595 - 10184
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10595 catcatcaatccacaattaagtatacccaagtcatgattccctcacaatagcatcagttaacaacaacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 10496  T
Q  111 caatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10495 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 10396  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10395 tcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 10296  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 406  Q
    |||| ||||||||||||  |  || |||||||||||||| || ||||||||  || |||    |||||| || ||||| | || | |||| |||||||||    
T  10295 attgaacatgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctcataagcttaccccaattgattc 10196  T
Q  407 ctcaagctttcc 418  Q
    ||||||||||||    
T  10195 ctcaagctttcc 10184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7712 - 7279
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || | | ||||||||   || ||  || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7712 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacatcagttaataacaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 7613  T
Q  111 caatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7612 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 7513  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 307  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7512 tcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 7413  T
Q  308 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 407  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  7412 atggaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcc 7313  T
Q  408 tcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  7312 tcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 7279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34414 - 33980
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||   |  ||| || | ||||||| |||||||| |||||||||    
T  34414 catcatcaatccataatttagtatacccaagtcatgattcactcacaatagcatcagttaatagcaacaacattaatggaacatgaatcatatctcattt 34315  T
Q  111 caatcaaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||  | |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34314 caacaacaacatatccaaattcatcaattaagtataacttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 34215  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaa 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34214 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca-tttcatacaacaatgagaaaatgcaaa 34116  T
Q  307 gattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgatt 405  Q
     |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||| ||||||| || | || | ||||||||    
T  34115 aattgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacgccaattgatt 34016  T
Q  406 cctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  34015 cctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 33980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 147 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5329 - 5034
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5329 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 5231  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5230 agcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaactcccttacct 5131  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||| ||||    
T  5130 ttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttaaaaacccttgttcttctc 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 252 - 3
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  252 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataactacatcaatgtaatatgaattacatctcattt 153  T
Q  111 caatcaaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  152 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 53  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaattta 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaattta 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21139 - 20937
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139 cacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacc 21041  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 436  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21040 cccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttct 20941  T
Q  437 tctc 440  Q
    ||||    
T  20940 tctc 20937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 148 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14173 - 13883
Alignment:
Q  148 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 247  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||  | || ||||  || |||||||||||| ||| |   | ||| || |||||||||||    
T  14173 ttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagag 14074  T
Q  248 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 347  Q
    ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14073 cacga-tttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 13976  T
Q  348 gaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13975 gaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttcttctc 13883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 181 - 414
Target Start/End: Original strand, 3895 - 4129
Alignment:
Q  181 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 280  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3895 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 3994  T
Q  281 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  3995 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 4094  T
Q  381 agctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  4095 agctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 4129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Original strand, 54416 - 54755
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttggcaataaccacttcaatggaatatgaatcacatctcattt 110  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||  || | | ||||||||   |  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54416 catcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 54515  T
Q  111 caatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacgt--aatttcacccataaacataccataa 207  Q
    |||  | ||||||||||  |||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |    
T  54516 caacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaatta 54615  T
Q  208 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaa 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  54616 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaaattgcaat 54715  T
Q  307 gattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
     |||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  54716 aattgaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt 54755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 346
Target Start/End: Original strand, 45102 - 45369
Alignment:
Q  83 tcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac- 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  45102 tcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcaaaacttgacatttatacatactttgaaaca 45201  T
Q  181 -gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaaccca 279  Q
     ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45202 tgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatcaaccca 45301  T
Q  280 ttttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45302 ttttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10775 - 10570
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775 cacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacc 10676  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgtt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  10675 cccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccacaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgtt 10576  T
Q  435 catctc 440  Q
    | ||||    
T  10575 cttctc 10570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 397
Target Start/End: Original strand, 6718 - 6986
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  6718 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 6817  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  6818 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 6916  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 397  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6917 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccca 6986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 6598 - 6640
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6598 catcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 6640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 346
Target Start/End: Original strand, 54008 - 54212
Alignment:
Q  143 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 241  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  54008 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacag 54107  T
Q  242 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 341  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  54108 taagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 54207  T
Q  342 acctt 346  Q
    |||||    
T  54208 acctt 54212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 440
Target Start/End: Original strand, 3101 - 3395
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 246  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | | |  || ||| || ||||||||||    
T  3101 tttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaaga 3200  T
Q  247 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3201 gcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacataattatgataataattaacccccttacctt 3299  T
Q  347 tgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
     ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||    
T  3300 agaagaagattaaccgaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 242 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31693 - 31506
Alignment:
Q  242 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 341  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31693 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaaccccctt 31595  T
Q  342 acctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 432  Q
    || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  31594 acatttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 31506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 315 - 440
Target Start/End: Original strand, 130880 - 131005
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 130979  T
Q  415 ttcccttcaacactcttgttcatctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  130980 ttcccttcaacactcttgttcttctc 131005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 147 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13169
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||  |||    
T  13438 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaag 13340  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13339 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgaaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttacct 13243  T
Q  346 ttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccct 420  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  13242 ttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagttcctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttcccct 13169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1153
Alignment:
Q  181 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 280  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  1383 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 1284  T
Q  281 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 380  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1283 tttcatacaacatgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattc 1186  T
Q  381 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  1185 agctcctaagtca-ccaacttgattcctaaagct 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 64546 - 64372
Alignment:
Q  237 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  64546 cacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 64449  T
Q  337 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  64448 cccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattccttaagct 64372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 107983 - 108084
Alignment:
Q  245 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 344  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  107983 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 108082  T
Q  345 tt 346  Q
    ||    
T  108083 tt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 414
Target Start/End: Original strand, 177 - 438
Alignment:
Q  150 cataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagca 249  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||||    
T  177 cataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagca 276  T
Q  250 cgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttga 349  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  277 cgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgag-caatgcaaa-at--tacatgattttgataataactaacccccttaccttaga 372  T
Q  350 agatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||| ||||| ||| ||| || ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  373 agaagattaatccaaactctcgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Original strand, 3547 - 3711
Alignment:
Q  143 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 241  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||||    
T  3547 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacag 3646  T
Q  242 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 306  Q
     |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3647 taagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaa 3711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23884 - 23600
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  23884 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataaga 23785  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  | || || | | ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||| ||||||||    
T  23784 aacaa-caacataaccagagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataa 23686  T
Q  328 taactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  23685 taactaacccccttaacttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagttcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 23600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17127
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 17142  T
Q  415 ttcccttcaacactc 429  Q
    |||| ||||||||||    
T  17141 ttcctttcaacactc 17127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7547
Alignment:
Q  130 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  7330 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagc 7429  T
Q  228 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 327  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  7430 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 7528  T
Q  328 taactaacccccttacctt 346  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  7529 aaacaaacccccttacctt 7547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 7210 - 7252
Alignment:
Q  11 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 53  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7210 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcact 7252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9462 - 9266
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||     
T  9462 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaa 9364  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9363 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacct 9267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16360 - 16164
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 245  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||     
T  16360 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaa 16262  T
Q  246 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 345  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16261 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacct 16165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
Q  242 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccct 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa-tgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct 12051  T
Q  341 tacctt 346  Q
    ||||||    
T  12050 tacctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 56291 - 56105
Alignment:
Q  83 tcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac- 180  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||  |||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  56291 tcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattcaccatttgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttaaaaca 56192  T
Q  181 -gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 266  Q
     ||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  56191 tgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 56105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  271 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 154373 - 154282
Alignment:
Q  322 tgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  154373 tgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 154282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 803
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 413  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaactcttgattcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 815  T
Q  414 t-ttcccttcaa 424  Q
    | ||||||||||    
T  814 tattcccttcaa 803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6155 - 5922
Alignment:
Q  181 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 280  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||   ||||||||||||| |||||||| | ||| | | ||     
T  6155 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaa 6056  T
Q  281 tttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttga-agatgattattcctaacccttgcttcaa 377  Q
    || ||||||||||  |||||  |||||||  || | |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  6055 tt-catacaacatttgagaatttgcaaag--tgaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataga-gattaatcctaactcttgcttcaa 5960  T
Q  378 ttcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 414  Q
    |||||||||| || | || | |||||||||||||||||    
T  5959 ttcagctcctaagcttactctaattgattcctcaagct 5922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34450 - 34374
Alignment:
Q  272 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 346  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34450 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccctcttacctt 34374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 22833 - 22930
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  22833 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 22930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Original strand, 27088 - 27185
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  27088 catgaaaaattgcaaagaaggaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 27185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1552 - 1455
Alignment:
Q  291 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 388  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  1552 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Original strand, 41786 - 41905
Alignment:
Q  147 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 246  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||  |||    
T  41786 tttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttaga 41885  T
Q  247 gcacgaatttaacaacaatt 266  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41886 gcacgaatttaacaacaatt 41905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 266
Target Start/End: Original strand, 3324 - 3447
Alignment:
Q  145 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagc 242  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||| ||| |  ||  || || ||||||    
T  3324 aatttcataacttgatatttatacatactttgaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagc 3423  T
Q  243 aagagcacgaatttaacaacaatt 266  Q
     |||||||||||||| || |||||    
T  3424 tagagcacgaatttagcatcaatt 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 347
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42709
Alignment:
Q  315 atgattatgataataactaacccccttaccttt 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttaccttt 42709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University