View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16607_low_10 (Length: 428)

Name: NF16607_low_10
Description: NF16607
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16607_low_10
NF16607_low_10
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (11-413)||(10211298-10211700)
chr3 (11-413)||(4598386-4598788)
chr3 (11-413)||(10209078-10209480)
chr3 (11-413)||(4600607-4601009)
chr3 (11-413)||(10056122-10056524)
chr3 (11-413)||(10058344-10058746)
chr3 (11-413)||(10060566-10060968)
chr3 (11-413)||(10062788-10063190)
chr3 (11-413)||(10065010-10065412)
chr3 (11-409)||(3617352-3617751)
chr3 (11-409)||(25637331-25637731)
chr3 (22-394)||(45282897-45283272)
chr3 (22-394)||(54635039-54635409)
chr3 (22-379)||(6716414-6716770)
chr3 (11-210)||(10067232-10067431)
chr3 (237-413)||(10067435-10067611)
chr3 (22-378)||(801005-801355)
chr3 (71-394)||(7779886-7780208)
chr3 (22-140)||(6718598-6718718)
chr3 (22-394)||(23200022-23200398)
chr3 (22-395)||(23197822-23198199)
chr3 (25-280)||(45095075-45095335)
chr3 (25-288)||(9636114-9636385)
chr3 (106-280)||(7762265-7762437)
chr3 (25-280)||(5258140-5258402)
chr3 (25-280)||(5260319-5260581)
chr3 (25-280)||(9581193-9581454)
chr3 (109-280)||(19683885-19684054)
chr3 (106-280)||(37408458-37408630)
chr3 (106-280)||(34491212-34491383)
chr3 (106-271)||(4569952-4570115)
chr3 (117-280)||(7764476-7764636)
chr3 (106-289)||(49199456-49199638)
chr3 (106-289)||(43401788-43401970)
chr3 (198-283)||(43403737-43403821)
chr3 (109-280)||(39153358-39153526)
chr3 (106-273)||(6095603-6095767)
chr3 (110-289)||(30236129-30236305)
chr3 (106-280)||(40734498-40734669)
chr3 (106-280)||(44331545-44331716)
chr3 (106-280)||(29196383-29196555)
chr3 (106-280)||(40735383-40735554)
chr3 (210-289)||(40913395-40913473)
chr3 (198-273)||(54593795-54593868)
chr3 (198-280)||(16499120-16499200)
chr3 (109-269)||(22835010-22835167)
chr3 (108-268)||(31314447-31314604)
chr3 (124-280)||(51398833-51398985)
chr3 (209-268)||(27305719-27305777)
chr3 (125-280)||(29813083-29813234)
chr3 (106-179)||(5236551-5236624)
chr3 (109-256)||(760850-760995)
chr3 (106-273)||(41819526-41819691)
chr3 (106-265)||(46860474-46860631)
chr3 (198-271)||(47304342-47304413)
chr3 (161-269)||(53921511-53921616)
chr3 (208-273)||(55301975-55302040)
chr3 (25-280)||(29682269-29682530)
chr3 (126-256)||(29810889-29811016)
chr3 (208-267)||(46173457-46173515)
chr3 (106-193)||(51352191-51352278)
chr3 (106-179)||(5433971-5434046)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (11-413)||(16544312-16544716)
chr5 (11-413)||(16546534-16546938)
chr5 (11-413)||(40379995-40380396)
chr5 (11-413)||(40382206-40382607)
chr5 (11-409)||(25078023-25078422)
chr5 (11-409)||(25135992-25136391)
chr5 (11-413)||(10593161-10593563)
chr5 (22-394)||(29751043-29751414)
chr5 (18-394)||(22536175-22536545)
chr5 (22-393)||(29720278-29720647)
chr5 (22-393)||(29722438-29722807)
chr5 (22-394)||(9789107-9789478)
chr5 (22-394)||(18441527-18441902)
chr5 (22-394)||(16409389-16409762)
chr5 (22-331)||(26177797-26178103)
chr5 (22-331)||(26170688-26170983)
chr5 (25-280)||(25412672-25412932)
chr5 (25-280)||(13342971-13343232)
chr5 (38-278)||(13239674-13239921)
chr5 (25-280)||(30182499-30182760)
chr5 (25-280)||(36074039-36074302)
chr5 (198-280)||(37439232-37439313)
chr5 (106-273)||(213465-213630)
chr5 (106-273)||(40147261-40147425)
chr5 (106-278)||(28278316-28278485)
chr5 (106-280)||(42428427-42428598)
chr5 (198-273)||(5058136-5058209)
chr5 (106-271)||(13488203-13488365)
chr5 (25-269)||(30682930-30683178)
chr5 (106-280)||(32636824-32636995)
chr5 (106-253)||(13695713-13695859)
chr5 (208-280)||(19806463-19806534)
chr5 (198-273)||(27637616-27637689)
chr5 (106-271)||(28750661-28750823)
chr5 (208-255)||(16640961-16641008)
chr5 (198-271)||(16452171-16452242)
chr5 (106-280)||(533769-533940)
chr5 (211-271)||(4160702-4160762)
chr5 (25-271)||(31182883-31183133)
chr5 (159-289)||(316815-316943)
chr5 (198-273)||(27015614-27015687)
chr5 (109-179)||(39468644-39468714)
chr5 (198-280)||(8565943-8566023)
chr5 (160-271)||(33906035-33906145)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (11-413)||(34164761-34165163)
chr6 (11-413)||(33341966-33342370)
chr6 (11-413)||(34166983-34167385)
chr6 (11-409)||(25421208-25421607)
chr6 (11-400)||(6027151-6027538)
chr6 (79-409)||(13153886-13154216)
chr6 (4-394)||(16653008-16653399)
chr6 (11-394)||(16554772-16555156)
chr6 (11-394)||(16631328-16631712)
chr6 (11-394)||(16578399-16578783)
chr6 (11-394)||(16616597-16616981)
chr6 (22-394)||(27647777-27648138)
chr6 (22-376)||(412016-412369)
chr6 (22-367)||(3072670-3073014)
chr6 (22-331)||(6097398-6097695)
chr6 (22-288)||(2171520-2171792)
chr6 (25-280)||(31404671-31404932)
chr6 (29-280)||(16452325-16452583)
chr6 (25-273)||(30834539-30834794)
chr6 (25-280)||(5406196-5406456)
chr6 (25-280)||(5410521-5410781)
chr6 (106-269)||(5413401-5413561)
chr6 (106-273)||(21588931-21589095)
chr6 (106-273)||(21593664-21593828)
chr6 (106-283)||(3808701-3808877)
chr6 (198-269)||(5409076-5409146)
chr6 (106-273)||(17762990-17763155)
chr6 (109-273)||(17758026-17758188)
chr6 (106-273)||(2972943-2973107)
chr6 (106-280)||(9183028-9183199)
chr6 (161-280)||(33160348-33160465)
chr6 (25-280)||(16568953-16569193)
chr6 (106-265)||(28137420-28137576)
chr6 (198-273)||(26830127-26830200)
chr6 (363-413)||(6136166-6136216)
chr6 (198-280)||(33211182-33211262)
chr6 (126-273)||(5043648-5043792)
chr6 (198-269)||(26800679-26800748)
chr6 (109-280)||(26954283-26954450)
chr6 (106-179)||(3038998-3039071)
chr6 (106-273)||(22424829-22424995)
chr6 (106-226)||(4045423-4045542)
chr6 (208-283)||(603082-603156)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (11-413)||(42575188-42575589)
chr8 (11-409)||(15290427-15290825)
chr8 (11-409)||(15470796-15471194)
chr8 (18-394)||(25689865-25690240)
chr8 (22-394)||(3439418-3439788)
chr8 (22-376)||(2627649-2628002)
chr8 (25-280)||(17982563-17982825)
chr8 (106-280)||(42498193-42498366)
chr8 (25-280)||(34254327-34254586)
chr8 (25-280)||(31218167-31218429)
chr8 (25-280)||(34256503-34256762)
chr8 (25-280)||(44303764-44304027)
chr8 (125-279)||(1746216-1746366)
chr8 (106-280)||(19945355-19945529)
chr8 (106-273)||(42434995-42435159)
chr8 (106-280)||(15212786-15212957)
chr8 (108-280)||(40321082-40321251)
chr8 (106-273)||(4283524-4283688)
chr8 (106-280)||(33352150-33352321)
chr8 (106-280)||(43036423-43036594)
chr8 (106-273)||(18655400-18655564)
chr8 (106-280)||(27811278-27811449)
chr8 (198-280)||(4743211-4743291)
chr8 (208-289)||(10930187-10930267)
chr8 (124-280)||(12702631-12702783)
chr8 (197-256)||(1345391-1345449)
chr8 (208-271)||(40221845-40221907)
chr8 (198-280)||(3303667-3303747)
chr8 (198-280)||(5689362-5689442)
chr8 (161-280)||(6599027-6599143)
chr8 (161-280)||(6674480-6674596)
chr8 (198-250)||(40328871-40328922)
chr8 (208-271)||(4733806-4733868)
chr8 (106-145)||(8965820-8965859)
chr8 (106-270)||(18141821-18141981)
chr8 (161-270)||(41366622-41366727)
chr8 (109-178)||(44353796-44353865)
chr8 (208-273)||(11384085-11384149)
chr8 (106-178)||(30291606-30291679)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (11-413)||(5138193-5138596)
chr4 (11-413)||(5135967-5136371)
chr4 (11-409)||(7124804-7125203)
chr4 (11-413)||(8395508-8395909)
chr4 (11-413)||(8393299-8393700)
chr4 (11-409)||(7122585-7122984)
chr4 (38-394)||(31495191-31495556)
chr4 (25-280)||(13992289-13992544)
chr4 (25-273)||(29999809-30000063)
chr4 (38-280)||(56178633-56178882)
chr4 (106-280)||(48143042-48143215)
chr4 (110-289)||(2209717-2209895)
chr4 (126-289)||(12119559-12119720)
chr4 (106-273)||(41639426-41639590)
chr4 (106-273)||(41964415-41964580)
chr4 (106-278)||(52095361-52095530)
chr4 (106-280)||(47038408-47038577)
chr4 (120-280)||(5370079-5370237)
chr4 (106-268)||(9927467-9927626)
chr4 (106-289)||(26364236-26364416)
chr4 (113-271)||(5207848-5208003)
chr4 (106-271)||(40632445-40632607)
chr4 (106-273)||(46703500-46703666)
chr4 (198-273)||(50673851-50673924)
chr4 (124-273)||(6655975-6656120)
chr4 (106-273)||(12073392-12073557)
chr4 (106-289)||(54883020-54883200)
chr4 (106-256)||(8665408-8665556)
chr4 (106-280)||(26175633-26175804)
chr4 (132-271)||(26699447-26699585)
chr4 (106-280)||(34570411-34570582)
chr4 (106-280)||(36463386-36463557)
chr4 (198-273)||(8648230-8648303)
chr4 (106-271)||(36994524-36994686)
chr4 (198-289)||(50262688-50262778)
chr4 (124-269)||(379399-379541)
chr4 (106-267)||(37229731-37229890)
chr4 (108-280)||(46147388-46147557)
chr4 (198-280)||(48893635-48893715)
chr4 (106-280)||(12739547-12739718)
chr4 (106-280)||(5429679-5429850)
chr4 (106-268)||(27416974-27417133)
chr4 (106-268)||(37740625-37740784)
chr4 (208-271)||(6542185-6542247)
chr4 (198-280)||(5871911-5871991)
chr4 (198-280)||(12743922-12744002)
chr4 (198-280)||(12745311-12745391)
chr4 (198-268)||(35662532-35662600)
chr4 (106-179)||(54200001-54200074)
chr4 (159-271)||(4588012-4588121)
chr4 (207-280)||(52467351-52467423)
chr4 (110-208)||(48142444-48142542)
chr4 (233-280)||(52082660-52082707)
chr4 (159-252)||(33989897-33989989)
chr4 (106-179)||(41639263-41639336)
chr4 (198-280)||(45687179-45687259)
chr4 (198-271)||(31474242-31474313)
chr4 (208-280)||(29254594-29254665)
chr4 (194-250)||(33089966-33090021)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (11-413)||(6594421-6594822)
chr7 (11-413)||(6592203-6592604)
chr7 (11-409)||(18392063-18392460)
chr7 (11-409)||(18388627-18389024)
chr7 (11-409)||(32060189-32060590)
chr7 (22-371)||(20343811-20344158)
chr7 (22-331)||(24789755-24790062)
chr7 (184-400)||(1560541-1560757)
chr7 (11-177)||(1562103-1562268)
chr7 (22-394)||(39731283-39731654)
chr7 (22-331)||(43504102-43504409)
chr7 (25-288)||(35853825-35854094)
chr7 (22-288)||(25766948-25767215)
chr7 (106-280)||(34310712-34310884)
chr7 (106-280)||(23555039-23555212)
chr7 (25-280)||(29990965-29991225)
chr7 (38-280)||(25615785-25616025)
chr7 (22-288)||(48408709-48408984)
chr7 (106-273)||(22269973-22270137)
chr7 (25-280)||(4178685-4178945)
chr7 (161-280)||(19502233-19502350)
chr7 (198-273)||(32358058-32358131)
chr7 (106-273)||(29608737-29608901)
chr7 (106-269)||(30024740-30024900)
chr7 (106-256)||(48491579-48491727)
chr7 (106-280)||(27347817-27347988)
chr7 (198-273)||(8359319-8359393)
chr7 (211-289)||(2390385-2390462)
chr7 (106-267)||(4253538-4253697)
chr7 (106-273)||(48599338-48599502)
chr7 (208-273)||(3259095-3259159)
chr7 (106-280)||(14069830-14070001)
chr7 (106-280)||(14379858-14380029)
chr7 (106-280)||(41317431-41317602)
chr7 (208-272)||(6432071-6432134)
chr7 (106-271)||(43864244-43864406)
chr7 (106-271)||(4586161-4586323)
chr7 (106-273)||(4508710-4508874)
chr7 (124-280)||(31732966-31733118)
chr7 (125-280)||(41649008-41649158)
chr7 (106-271)||(2360978-2361140)
chr7 (38-268)||(47673953-47674189)
chr7 (106-179)||(23343975-23344048)
chr7 (211-280)||(48489534-48489602)
chr7 (208-280)||(8153442-8153513)
chr7 (338-382)||(24790230-24790274)
chr7 (208-271)||(18396418-18396481)
chr7 (208-271)||(30814536-30814598)
chr7 (125-269)||(23565069-23565210)
chr7 (198-271)||(24525508-24525579)
chr7 (159-271)||(31105399-31105508)
chr7 (159-271)||(36574522-36574631)
chr7 (198-269)||(31518993-31519063)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (11-409)||(3593-3990)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (11-413)||(44203536-44203937)
chr1 (11-394)||(9036320-9036702)
chr1 (22-394)||(21053872-21054242)
chr1 (22-394)||(40282291-40282661)
chr1 (22-394)||(9987116-9987486)
chr1 (22-394)||(20622121-20622492)
chr1 (22-394)||(51765302-51765682)
chr1 (105-280)||(13316348-13316521)
chr1 (109-280)||(8550783-8550952)
chr1 (106-280)||(3189330-3189502)
chr1 (106-280)||(3198147-3198319)
chr1 (106-280)||(3206986-3207158)
chr1 (25-280)||(20762582-20762844)
chr1 (106-273)||(29136247-29136412)
chr1 (106-273)||(37168297-37168462)
chr1 (106-273)||(13547093-13547257)
chr1 (106-289)||(42297962-42298143)
chr1 (106-271)||(44455160-44455322)
chr1 (106-273)||(47255343-47255508)
chr1 (106-280)||(28220223-28220394)
chr1 (198-273)||(13549004-13549077)
chr1 (106-273)||(11348698-11348862)
chr1 (106-280)||(3156865-3157036)
chr1 (106-280)||(4552634-4552805)
chr1 (125-280)||(28265551-28265702)
chr1 (106-273)||(7482234-7482399)
chr1 (106-289)||(37033059-37033241)
chr1 (124-273)||(31925711-31925856)
chr1 (109-280)||(834164-834332)
chr1 (198-273)||(28242396-28242469)
chr1 (106-256)||(37503577-37503722)
chr1 (106-280)||(49918350-49918521)
chr1 (106-273)||(47115171-47115337)
chr1 (198-280)||(13659333-13659413)
chr1 (208-273)||(193711-193775)
chr1 (106-280)||(28223418-28223589)
chr1 (198-272)||(34603668-34603740)
chr1 (198-280)||(45644351-45644431)
chr1 (198-280)||(46065009-46065089)
chr1 (159-248)||(5459959-5460046)
chr1 (125-178)||(6378603-6378655)
chr1 (106-271)||(19754494-19754657)
chr1 (161-252)||(22079371-22079461)
chr1 (106-256)||(23555286-23555433)
chr1 (208-280)||(31659338-31659409)
chr1 (208-273)||(37876770-37876834)
chr1 (127-179)||(928071-928123)
chr1 (159-226)||(6808505-6808571)
chr1 (111-179)||(12318618-12318685)
chr1 (208-280)||(50167172-50167243)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (11-413)||(2467-2868)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (11-409)||(12647253-12647650)
chr2 (85-400)||(13655905-13656221)
chr2 (22-392)||(6266605-6266974)
chr2 (22-394)||(32289479-32289851)
chr2 (22-394)||(4484213-4484592)
chr2 (22-394)||(30833252-30833631)
chr2 (25-280)||(45099665-45099926)
chr2 (25-280)||(4503129-4503390)
chr2 (25-280)||(36205661-36205921)
chr2 (106-280)||(2334414-2334586)
chr2 (25-280)||(5723252-5723512)
chr2 (125-280)||(6595002-6595154)
chr2 (198-280)||(36988072-36988153)
chr2 (111-271)||(33648176-33648335)
chr2 (106-273)||(45726929-45727093)
chr2 (38-280)||(34139767-34140017)
chr2 (106-278)||(24398055-24398228)
chr2 (198-273)||(35446888-35446961)
chr2 (35-280)||(38312159-38312411)
chr2 (124-280)||(723741-723893)
chr2 (161-268)||(14633834-14633939)
chr2 (106-271)||(29867869-29868031)
chr2 (198-273)||(1631736-1631809)
chr2 (198-280)||(17057366-17057446)
chr2 (198-280)||(17085349-17085429)
chr2 (106-280)||(36773562-36773733)
chr2 (208-280)||(39284936-39285007)
chr2 (25-256)||(42362262-42362500)
chr2 (210-280)||(11151588-11151657)
chr2 (106-180)||(13121769-13121843)
chr2 (106-271)||(26353184-26353346)
chr2 (198-280)||(36318006-36318086)
chr2 (198-271)||(17490154-17490225)
chr2 (208-280)||(17450678-17450748)
chr2 (213-265)||(28672036-28672088)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (11-413)||(6177-6580)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (244-409)||(1-166)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (22-394)||(11044-11423)
scaffold0491 (104-394)||(8618-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (25-278)||(434443-434703)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (25-280)||(827-1087)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (106-288)||(11557-11737)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (106-280)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (125-273)||(18007-18151)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (208-271)||(10589-10651)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (198-280)||(149094-149174)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (106-273)||(7327-7491)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (106-271)||(20421-20583)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 10211298 - 10211700
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211298 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10211397  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211398 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10211497  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10211498 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctct 10211597  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10211598 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgatt 10211697  T
Q  411 ggt 413  Q
    |||    
T  10211698 ggt 10211700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 4598788 - 4598386
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598788 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgtagagagaatcattgagtgtcttggt 4598689  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598688 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 4598589  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4598588 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 4598489  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598488 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgctcaataagctttgttt 4598389  T
Q  411 ggt 413  Q
    |||    
T  4598388 ggt 4598386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 10209078 - 10209480
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209078 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10209177  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10209178 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtagtccttttgtaaagaactcatttg 10209277  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10209278 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctct 10209377  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10209378 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgatt 10209477  T
Q  411 ggt 413  Q
    |||    
T  10209478 ggt 10209480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 4601009 - 4600607
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4601009 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 4600910  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600909 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtattccttttgtaaagaactcatttg 4600810  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4600809 atagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 4600710  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4600709 ccttgtttatcttgtgattgttgatttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttctggcttgctcaataagctttgttt 4600610  T
Q  411 ggt 413  Q
    |||    
T  4600609 ggt 4600607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 10056122 - 10056524
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056122 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10056221  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056222 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10056321  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10056322 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10056421  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 409  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10056422 ccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtt 10056520  T
Q  410 tggt 413  Q
    ||||    
T  10056521 tggt 10056524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 10058344 - 10058746
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058344 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10058443  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058444 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10058543  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10058544 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10058643  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 409  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10058644 ccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtt 10058742  T
Q  410 tggt 413  Q
    ||||    
T  10058743 tggt 10058746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 10060566 - 10060968
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060566 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10060665  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060666 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10060765  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10060766 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10060865  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 409  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10060866 ccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtt 10060964  T
Q  410 tggt 413  Q
    ||||    
T  10060965 tggt 10060968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 10062788 - 10063190
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062788 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10062887  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062888 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10062987  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10062988 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10063087  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 409  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10063088 ccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtt 10063186  T
Q  410 tggt 413  Q
    ||||    
T  10063187 tggt 10063190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 10065010 - 10065412
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065010 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10065109  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065110 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10065209  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10065210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10065309  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 409  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10065310 ccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtt 10065408  T
Q  410 tggt 413  Q
    ||||    
T  10065409 tggt 10065412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 3617352 - 3617751
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3617352 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 3617451  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3617452 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatt 3617550  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3617551 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 3617650  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagcttt 406  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3617651 ctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaacttt 3617748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 25637331 - 25637731
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637331 caaaggggtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 25637430  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25637431 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 25637529  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatc 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||    
T  25637530 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctc 25637628  T
Q  310 tccttgtttatcttgtgattg-ttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagcttt 406  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||    
T  25637629 tccttgtttatcttgtgattgtttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcctgcttgcacaatacacttt 25637728  T
Q  407 gtt 409  Q
    |||    
T  25637729 gtt 25637731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 45282897 - 45283272
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282897 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 45282996  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta--aagaactcatttgatagtgg 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  45282997 aaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtgg 45283095  T
Q  218 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgtt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  45283096 attggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtt 45283194  T
Q  318 tatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||||||||||| |  | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45283195 tatcttgtgattgtgtattgtgtttctcactagtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 45283272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 54635039 - 54635409
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635039 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 54635138  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  54635139 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtggat 54635235  T
Q  220 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||  |||    
T  54635236 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--ttt 54635332  T
Q  319 atcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  54635333 atcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 54635409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 379
Target Start/End: Original strand, 6716414 - 6716770
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716414 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 6716513  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6716514 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtggat 6716610  T
Q  220 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| || |||  |||    
T  6716611 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccct--ttt 6716707  T
Q  319 atcttgtgattgttgcttt--gtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttg 379  Q
    |||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6716708 atcttgtgattgtatttttgagtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 6716770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 210
Target Start/End: Original strand, 10067232 - 10067431
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067232 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10067331  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067332 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10067431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 237 - 413
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067611
Alignment:
Q  237 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgtttatcttgtgatt-gttgct 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgct 10067534  T
Q  336 ttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10067535 ttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggt 10067611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 378
Target Start/End: Original strand, 801005 - 801355
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  801005 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 801103  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  801104 gaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagt 801199  T
Q  216 ggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttg 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||      
T  801200 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct-- 801296  T
Q  316 tttatcttgtgattgttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 378  Q
    |||||||||||  | ||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  801297 tttatcttgtg--tattg-tgtttttc-cacttgtttcctagattagatctaggtgctgtttt 801355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779886
Alignment:
Q  71 tgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaa 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||  ||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaa 7780111  T
Q  168 tttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7780110 tttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagt 7780013  T
Q  268 gggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgtttatcttgtgattgt-tgctttg-tttcacacttgtttcctagattggatc 365  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||| |  | || |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  7780012 gggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtgtattgtgttttttcacttgtttcctagattagatc 7779916  T
Q  366 taggtggtg-ttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||    
T  7779915 taggtgctgtttttgttgattattgcttgc 7779886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 140
Target Start/End: Original strand, 6718598 - 6718718
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718598 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 6718697  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtt 140  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  6718698 aaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23200398 - 23200022
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg------gtga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||      ||||    
T  23200398 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtga 23200300  T
Q  113 gattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcattt 209  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||     
T  23200299 gattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-ctttttgtaa-gaactcatt- 23200205  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatc 309  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| |||||| ||    
T  23200204 gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcttcttccctc 23200107  T
Q  310 tccttgtttatcttgtgattgttgctt-tgtttcaca-cttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||  |||||||| || |||| | || |||||  ||  |||||||||||||| |||||||||| | | |||||| || ||||||||    
T  23200106 tcct--tttatcttatgcttgtggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctaggtgttttattgttgattattgcttgc 23200022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23198199 - 23197822
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg------gtga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||      ||||    
T  23198199 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtga 23198101  T
Q  113 gattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcattt 209  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||  | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||     
T  23198100 gattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttttttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-ctttttgtaa-gaactcatt- 23198006  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatc 309  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| |||||  ||    
T  23198005 gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcctcttctctc 23197908  T
Q  310 tccttgtttatcttgtgattgttgctt-tgtttcaca-cttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgct 395  Q
    ||||  ||||||||||| |||| | || |||||  ||  |||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| || |||||||||    
T  23197907 tcct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctatgtgttttattgttgattattgcttgct 23197822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 45095075 - 45095335
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  45095075 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 45095172  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||    
T  45095173 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gat 45095267  T
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45095268 agtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 45095335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9636385 - 9636114
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt-------gaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||       ||||    
T  9636385 tagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgaga 9636287  T
Q  115 ttggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||| |    
T  9636286 ttgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtat-ctttttgtaa-gaactcatt-g 9636192  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 288  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9636191 atagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 9636114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 7762265 - 7762437
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||    
T  7762265 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaac 7762361  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7762362 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 7762437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5258402 - 5258140
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  5258402 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5258305  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||||||||| |    
T  5258304 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-g 5258210  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5258209 atagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 5258140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5260581 - 5260319
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt-------gaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||       ||||    
T  5260581 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgaga 5260484  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||||||||| |    
T  5260483 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-g 5260389  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5260388 atagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 5260319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 9581193 - 9581454
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 113  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||| |    
T  9581193 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtggg 9581290  T
Q  114 attgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgat 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  | ||||||||||||| |||||  || |||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  9581291 attcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-gat 9581386  T
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9581387 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9581454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683885
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactc 19683959  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19683958 att-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 19683885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 37408458 - 37408630
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| |||    
T  37408458 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaa 37408553  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37408554 ctcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatct 37408630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491383
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 34491308  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34491309 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct 34491383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570115
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4570048  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4570049 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggt 4570115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 280
Target Start/End: Original strand, 7764476 - 7764636
Alignment:
Q  117 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| |  | |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  7764476 gggaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagt 7764571  T
Q  216 ggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7764572 ggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatct 7764636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199456
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 49199542  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    |||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49199541 ctcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 49199456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401788
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattcct-tttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||   || | |  || ||||||| ||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctttgtaa-gaac 43401873  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43401872 tcatt-gatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 43401788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43403821 - 43403737
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43403821 aagaactcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43403737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39153526 - 39153358
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactca 206  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| | |  | |||||||||||||||||| |  |||||| |||||    |||||||||    
T  39153526 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttat--aagaactca 39153430  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  39153429 tt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095603
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | || ||| |  ||||| |||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 6095671  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6095670 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtga 6095603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 289
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236305
Alignment:
Q  110 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcat 207  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaactcat 30236225  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    | |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||| |||| |||||    
T  30236226 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgtt 30236305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 40734498 - 40734669
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||| ||||||    
T  40734498 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgta-tccctttgt-aagaac 40734594  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40734595 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331716
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |  ||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||| |||| ||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 44331641  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  44331642 ttatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196383
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| | |||| || |||||||||||| ||||  || ||||  |||| |||| |||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagc-ttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaa 29196459  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29196458 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29196383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 40735383 - 40735554
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||| ||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  40735383 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctcttt-gtaa-gaac 40735479  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40735480 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaatct 40735554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 289
Target Start/End: Original strand, 40913395 - 40913473
Alignment:
Q  210 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  40913395 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctcttggtgtt 40913473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 54593795 - 54593868
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  54593795 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtga 54593868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Original strand, 16499120 - 16499200
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16499120 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16499200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835010
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 206  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| |||||||    
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 22835071  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 269  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835070 tt-gatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314604
Alignment:
Q  108 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactc 205  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| ||||||    
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaa-gaactc 31314543  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 268  Q
     ||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31314544 -tttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactg 31314604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 280
Target Start/End: Original strand, 51398833 - 51398985
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51398833 gggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattgg 51398928  T
Q  223 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||    | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  51398929 agagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 51398985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 268  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 29813083 - 29813234
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  ||    ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29813083 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaa-gaactcattt-atagtggattggag 29813179  T
Q  225 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||  ||| |||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  29813180 agatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5236624 - 5236551
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  5236624 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 5236551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 760850 - 760995
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 206  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| |||||||    
T  760850 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 760946  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  760947 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819526
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtg-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaaga 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| | ||||  |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| ||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagc-ttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-ga 41819596  T
Q  202 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  41819595 actcatt--atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtga 41819526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 265
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860631
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||  |||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaat-aac 46860570  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  46860571 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 46860631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Original strand, 47304342 - 47304413
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  47304342 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 47304413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 53921616 - 53921511
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 259  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||| |||||||| |    
T  53921616 aagctaatttcttgtaactcatttgta-tcattttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-g 53921521  T
Q  260 accgaactgg 269  Q
    ||||||||||    
T  53921520 accgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55302040 - 55301975
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||    
T  55302040 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaacttggtga 55301975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 29682269 - 29682530
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 113  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  29682269 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgag 29682366  T
Q  114 attgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttga 211  Q
    |||||||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| | |  | ||||||||||||||| |||  || |||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  29682367 attgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-ga 29682462  T
Q  212 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29682463 tagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 256
Target Start/End: Original strand, 29810889 - 29811016
Alignment:
Q  126 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29810889 gtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 29810984  T
Q  225 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    ||  ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  29810985 agatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 46173457 - 46173515
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46173457 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 46173515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 51352278 - 51352191
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttt 193  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  51352278 ttggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaaccatttgtatttcttt 51352191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433971
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 16544312 - 16544716
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544312 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 16544411  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16544412 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 16544511  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16544512 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 16544611  T
Q  311 cc-ttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544612 cctttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 16544711  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  16544712 ttggt 16544716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 16546534 - 16546938
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546534 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 16546633  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16546634 gagattaggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 16546733  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16546734 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 16546833  T
Q  311 cc-ttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546834 cctttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatttaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 16546933  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  16546934 ttggt 16546938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 40379995 - 40380396
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379995 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 40380094  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40380095 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 40380193  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  40380194 atagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ct 40380291  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40380292 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 40380391  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  40380392 ttggt 40380396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 40382206 - 40382607
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382206 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 40382305  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40382306 gagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 40382404  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  40382405 atagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ct 40382502  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40382503 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 40382602  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  40382603 ttggt 40382607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 25078023 - 25078422
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25078023 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 25078122  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25078123 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatt 25078221  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25078222 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 25078321  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagcttt 406  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25078322 ctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaacttt 25078419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 25135992 - 25136391
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25135992 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 25136091  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25136092 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatt 25136190  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25136191 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 25136290  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagcttt 406  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25136291 ctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaacttt 25136388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 10593161 - 10593563
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10593161 caaagggggaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 10593260  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  10593261 gtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 10593358  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||  ||||| |    
T  10593359 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtat-ttgttttctacttccct 10593457  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagcttt 406  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||    
T  10593458 ctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacacttt 10593556  T
Q  407 gtttggt 413  Q
    |||||||    
T  10593557 gtttggt 10593563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29751414 - 29751043
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29751414 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 29751315  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29751314 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtgga 29751218  T
Q  219 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  |||    
T  29751217 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcct--ttt 29751120  T
Q  319 atcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29751119 atcttgtgattgtgtactgtgtttctcacttgttttctagattatatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 29751043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22536545 - 22536175
Alignment:
Q  18 gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536545 gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgcagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 22536446  T
Q  118 ggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22536445 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtgg 22536349  T
Q  218 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgtt 317  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||| || |||  ||    
T  22536348 attggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccct--tt 22536252  T
Q  318 tatcttgtgattgttgcttt--gtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  22536251 tatcttgtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggt-gttttttgttgattgttgcttgc 22536175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 393
Target Start/End: Original strand, 29720278 - 29720647
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720278 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 29720377  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgt-gaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29720378 aaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaac-ttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtgga 29720474  T
Q  219 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  |||    
T  29720475 ttggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--ttt 29720571  T
Q  319 atcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttg 393  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29720572 atcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg 29720647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 393
Target Start/End: Original strand, 29722438 - 29722807
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722438 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 29722537  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgt-gaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29722538 aaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaac-ttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtgga 29722634  T
Q  219 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  |||    
T  29722635 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--ttt 29722731  T
Q  319 atcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttg 393  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29722732 atcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg 29722807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9789478 - 9789107
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9789478 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 9789380  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 216  Q
     ||| |||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9789379 aaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtg 9789284  T
Q  217 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttg 315  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||||  |    
T  9789283 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcc--g 9789187  T
Q  316 tttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||| |||| |  | |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  9789186 tttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgatttttgcttgc 9789107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18441902 - 18441527
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18441902 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 18441804  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 216  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18441803 aaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtg 18441708  T
Q  217 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttg 315  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||||  |    
T  18441707 gattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcc--g 18441611  T
Q  316 tttatcttgtgattg----ttg-ctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||| |||    |||  ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  18441610 tttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattattgcttgc 18441527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 16409389 - 16409762
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16409389 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 16409487  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 216  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16409488 aaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtg 16409583  T
Q  217 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttg 315  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||      
T  16409584 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcct-- 16409680  T
Q  316 tttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacac-ttgtttcctagattggatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||| |||| |  | || ||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  16409681 tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgc 16409762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 26177797 - 26178103
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26177797 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 26177895  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 216  Q
     |||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26177896 aaaaggg-tagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtg 26177990  T
Q  217 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttg 315  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||      
T  26177991 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcct-- 26178087  T
Q  316 tttatcttgtgattgt 331  Q
    ||||||||||| ||||    
T  26178088 tttatcttgtgcttgt 26178103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 26170688 - 26170983
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26170688 ctctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 26170786  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 217  Q
     |||||| ||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||  |||||||||||||||           ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26170787 aaaaggg-tagaaattaggatt-gttctttgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 26170871  T
Q  218 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttgt 316  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  |    
T  26170872 attggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcct--t 26170968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 25412672 - 25412932
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  25412672 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 25412769  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||    
T  25412770 ttgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gat 25412864  T
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25412865 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct 25412932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 13342971 - 13343232
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  13342971 tagggtttagggt-ctctgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 13343068  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||    ||||||||||| |    
T  13343069 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg---aagaactcatt-g 13343162  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13343163 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaatct 13343232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 278
Target Start/End: Original strand, 13239674 - 13239921
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg-gg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||||||||| |||   ||    
T  13239674 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatgg 13239772  T
Q  127 tagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 225  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13239773 tagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggaga 13239868  T
Q  226 gtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 278  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13239869 gatcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaat 13239921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 30182499 - 30182760
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  30182499 tagggattagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 30182596  T
Q  115 ttgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 211  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | || |||  |||| |  ||||||||||| ||    
T  30182597 ttgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttgg--aagaactcatt-ga 30182691  T
Q  212 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30182692 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct 30182760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36074302 - 36074039
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  36074302 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 36074205  T
Q  115 ttgggaaag----gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    ||||||||     ||||||||||||||||| |||| | | |||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||  ||||    |||||||||||    
T  36074204 ttgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg---aagaactcatt 36074110  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36074109 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct 36074039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Original strand, 37439232 - 37439313
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37439232 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 37439313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213630
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 213561  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213562 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 213630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147425
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 40147357  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147358 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 40147425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278485
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||| |||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 28278412  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28278413 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat 28278485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42428598 - 42428427
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  42428598 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42428502  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  42428501 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 5058136 - 5058209
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058136 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 5058209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 13488203 - 13488365
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  13488203 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 13488299  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13488300 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 13488365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30683178 - 30682930
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  30683178 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaga 30683081  T
Q  115 ttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga-actcatttga 211  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||    |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||  | ||||||| ||    
T  30683080 ttgggaaaaagggtagaaattagggttcttt----gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaatactcatt-ga 30682987  T
Q  212 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 269  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30682986 tagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 32636824 - 32636995
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||    
T  32636824 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaa 32636919  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  32636920 ctc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 32636995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695713
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaact 204  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| | |  | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgta-tctctttgtaaagaact 13695761  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaa 253  Q
    || || |||||||||| |||||   |  |||||||||| ||||||||||    
T  13695760 ca-ttaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 19806463 - 19806534
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27637689 - 27637616
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27637689 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 27637616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28750823 - 28750661
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgt-gaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||| |||| ||||||| |||||||  || |||| | |||||||| |||    
T  28750823 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaa-attgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtat-ctttttgtaa-gaa 28750728  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28750727 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggt 28750661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16641008 - 16640961
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagt 255  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16641008 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Original strand, 16452171 - 16452242
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16452171 aagaactcattc-atagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 16452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 533769 - 533940
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | | |||| | |  |||||||||||| ||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  533769 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 533865  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  533866 tcatt-gatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 533940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 271
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 31182883 - 31183133
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt--gt-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 113  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||  || || || |||||||||||||||||       |||||    
T  31182883 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgag 31182980  T
Q  114 attgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 213  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||| | ||||   |  | ||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  31182981 attggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccatttgta-tccctttgt-aagaactca-ttgata 31183076  T
Q  214 gtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
     ||||||||||||  | | |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31183077 ctggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 31183133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 289
Target Start/End: Original strand, 316815 - 316943
Alignment:
Q  159 tgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagttt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |  ||| |||||| | |||||||||||   ||    
T  316815 tgaagctaatttcttgtaatccttttgta-tctctttgtaaagaactca-ttgataatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgtt 316912  T
Q  258 ggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  316913 ggaccgaacttggtaaacaat-tctttgtgtt 316943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 27015614 - 27015687
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||  ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27015614 aagaactcatt-gatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtga 27015687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39468714 - 39468644
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  39468714 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 39468644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8566023 - 8565943
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  8566023 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 8565943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33906145 - 33906035
Alignment:
Q  160 gaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttg 258  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||| |||| | | ||||||||||||  |||    
T  33906145 gaagctaacttcttgtaatccttttgtatctcttt-gtaaagaactcatt-gatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttg 33906048  T
Q  259 gaccgaactgggt 271  Q
    |||||| ||||||    
T  33906047 gaccgagctgggt 33906035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 34164761 - 34165163
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164761 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 34164860  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164861 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 34164960  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34164961 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 34165060  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 409  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34165061 ccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtt 34165159  T
Q  410 tggt 413  Q
    ||||    
T  34165160 tggt 34165163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33342370 - 33341966
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342370 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 33342271  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342270 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtactccttttgtaaagaactcatttg 33342171  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  33342170 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 33342071  T
Q  311 cc-ttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33342070 cctttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataagctttgt 33341971  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  33341970 ttggt 33341966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 34166983 - 34167385
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34166983 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 34167082  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34167083 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaacttatttg 34167182  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34167183 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 34167282  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||    
T  34167283 ccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagatttgatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgctcaatattttttgt 34167380  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  34167381 ttggt 34167385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 25421208 - 25421607
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25421208 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 25421307  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25421308 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatt 25421406  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  25421407 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc-- 25421504  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagcttt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25421505 ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaacttt 25421604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Original strand, 6027151 - 6027538
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027151 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 6027250  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6027251 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 6027349  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  6027350 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ct 6027447  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaata 400  Q
    || | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6027448 ccat-tttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 6027538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 79 - 409
Target Start/End: Original strand, 13153886 - 13154216
Alignment:
Q  79 accttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13153886 accttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac 13153985  T
Q  179 ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153986 ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 13154085  T
Q  279 ctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  13154086 ctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgta 13154183  T
Q  377 ttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154184 ttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 13154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 394
Target Start/End: Original strand, 16653008 - 16653399
Alignment:
Q  4 ggagaagcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgag 101  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16653008 ggagaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgag 16653107  T
Q  102 tgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaaga 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  16653108 tgtcttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-ga 16653205  T
Q  202 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||     
T  16653206 actcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttct 16653304  T
Q  301 tcttccatctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16653305 tcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgc 16653399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 16554772 - 16555156
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16554772 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16554871  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  16554872 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 16554969  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttcca 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||     
T  16554970 tgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccc 16555068  T
Q  308 tctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16555069 tctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgc 16555156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 16631328 - 16631712
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16631328 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16631427  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  16631428 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 16631525  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttcca 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||     
T  16631526 tgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccc 16631624  T
Q  308 tctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16631625 tctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgc 16631712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16578783 - 16578399
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16578783 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16578684  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  16578683 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 16578586  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttcca 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||     
T  16578585 tgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccc 16578487  T
Q  308 tctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16578486 tctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgc 16578399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 16616597 - 16616981
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16616597 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16616696  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  16616697 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 16616794  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttcca 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||     
T  16616795 tgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccc 16616893  T
Q  308 tctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16616894 tctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgc 16616981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 27647777 - 27648138
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647777 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 27647876  T
Q  122 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27647877 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 27647973  T
Q  222 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgtttatc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  27647974 gagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatc 27648070  T
Q  322 ttgtgattgttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||  | |||    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27648071 ttgtg--tattg---agtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 27648138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 412016 - 412369
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  412016 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 412114  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 217  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||| |||||| |    || |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  412115 aaaaaggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 412211  T
Q  218 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttgt 316  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  |    
T  412212 attagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccctctcct--t 412308  T
Q  317 ttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtt 376  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  412309 ttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttgttacctagattagatctaggtgctgtt 412369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3073014 - 3072670
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3073014 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 3072916  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagt 215  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3072915 gaaaatggtagaaattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagt 3072820  T
Q  216 ggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttg 315  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||      
T  3072819 gaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcct-- 3072723  T
Q  316 tttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatcta 367  Q
    ||||||||||| |||| |  | || ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  3072722 tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatcta 3072670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6097695 - 6097398
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  6097695 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttttggtgagattgg 6097596  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 217  Q
     |||  ||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||  |||||||||||||||           ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6097595 aaaaatggtagaaattaggatt-gttctttgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 6097510  T
Q  218 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttgt 316  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||     
T  6097509 attggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctccttg- 6097412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2171792 - 2171520
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||    
T  2171792 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg 2171694  T
Q  112 agattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 209  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||  |||| |||| |||||||||     
T  2171693 agattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt- 2171599  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 288  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2171598 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 2171520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31404932 - 31404671
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  31404932 tagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgaga 31404834  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||    
T  31404833 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gat 31404739  T
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31404738 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 31404671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16452583 - 16452325
Alignment:
Q  29 gtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgg 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||    
T  16452583 gtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg 16452486  T
Q  119 gaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagt 215  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||  ||  || ||   ||||||||||| ||||||    
T  16452485 gaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacc-ctttcatatctctttggaagaactcatt-gatagt 16452390  T
Q  216 ggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16452389 ggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 16452325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30834794 - 30834539
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  30834794 tagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 30834697  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||||||||| |    
T  30834696 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-g 30834602  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834601 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 30834539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5406456 - 5406196
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  5406456 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5406359  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||    
T  5406358 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gat 5406264  T
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5406263 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 5406196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5410781 - 5410521
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  5410781 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5410684  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||    
T  5410683 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gat 5410589  T
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5410588 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 5410521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5413561 - 5413401
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | | |||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  5413561 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 5413466  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413465 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5413401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589095
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 21589027  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589028 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21589095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593828
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 21593760  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593761 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21593828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808701
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||| ||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 3808781  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3808780 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctctt 3808701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5409146 - 5409076
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409146 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5409076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763155
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||   ||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat--ctttttggaagaac 17763086  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17763087 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtga 17763155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 273
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758188
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 206  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||||||    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactca 17758122  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    || |||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17758123 tt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtga 17758188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972943
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 2973011  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  2973010 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtga 2972943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9183199 - 9183028
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||  |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  9183199 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 9183103  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  9183102 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 9183028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33160465 - 33160348
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 259  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  33160465 aagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttgg 33160369  T
Q  260 accgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  33160368 accaaactgggtgaacaatct 33160348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569193
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 120  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  121 aag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  | ||||||||||||||||||||            |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacct------------ttgtaa-gaactcatt-gatagtggat 16569133  T
Q  220 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16569134 tggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16569193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137420
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaa-gaac 28137480  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28137479 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaa 28137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26830200 - 26830127
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26830200 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtga 26830127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6136216 - 6136166
Alignment:
Q  363 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  6136216 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatacactttgtttggt 6136166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33211262 - 33211182
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33211262 aagaactcattt-ataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 273
Target Start/End: Original strand, 5043648 - 5043792
Alignment:
Q  126 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  5043648 gtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtagattggag 5043743  T
Q  225 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||  ||| |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5043744 agatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 5043792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 269
Target Start/End: Original strand, 26800679 - 26800748
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 269  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  26800679 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgg 26800748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26954450 - 26954283
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctct-tgtattccttttgtaaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||   | |||||  |||| |||| ||||||||    
T  26954450 gtgagattgggaaattggtataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctcttt-gtaa-gaactcat 26954354  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    | |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  26954353 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038998
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacc 3038998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424829
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc---tcttgtattccttttgtaaaga 201  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||   | ||||||  |||| |||| ||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaa-ga 22424899  T
Q  202 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  22424898 actcatt--atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtga 22424829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaact 204  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| | |  ||||||||||||||||||| | | || || ||  |||||||| ||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttata-tctctttgtaaataact 4045521  T
Q  205 catttgatagtggattggagag 226  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4045522 ca-ttgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 603156 - 603082
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 283  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  603156 ttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctctt 603082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 42575589 - 42575188
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575589 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 42575490  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575489 gagattgggaaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 42575390  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  42575389 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 42575290  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 409  Q
    |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575289 ccttg--tatcttgtgtttggttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 42575192  T
Q  410 tggt 413  Q
    ||||    
T  42575191 tggt 42575188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 15290427 - 15290825
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290427 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 15290526  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290527 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 15290626  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15290627 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 15290726  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290727 ccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 15290824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 15470796 - 15471194
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470796 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 15470895  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470896 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 15470995  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15470996 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 15471095  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471096 ccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 15471193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 394
Target Start/End: Original strand, 25689865 - 25690240
Alignment:
Q  18 gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689865 gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 25689964  T
Q  116 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  25689965 tgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagt 25690061  T
Q  216 ggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctcctt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |||     
T  25690062 ggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctcccct- 25690160  T
Q  315 gtttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
     |||||||||||| ||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25690161 -tttatcttgtgagtgtgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattcttgcttgc 25690240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 3439418 - 3439788
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439418 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 3439517  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3439518 aaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaac-ttggcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggat 3439614  T
Q  220 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||  |||    
T  3439615 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--ttt 3439711  T
Q  319 atcttgtgattgttgcttt--gtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3439712 atcttgtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattgttgcttgc 3439788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 2627649 - 2628002
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2627649 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 2627747  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgt-gaagctaatttcttgtaa--cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||  || ||||||||||| ||  | | ||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2627748 gaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgt-aagaactca-ttgatagt 2627843  T
Q  216 ggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttg 315  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||      
T  2627844 ggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcct-- 2627940  T
Q  316 tttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtt 376  Q
    ||||||||||| |||| |  | || ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2627941 tttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 2628002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 17982563 - 17982825
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  17982563 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 17982660  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||||||||| |    
T  17982661 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-g 17982755  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17982756 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 17982825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 42498193 - 42498366
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||    
T  42498193 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaa-gaa 42498289  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42498290 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 42498366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34254586 - 34254327
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagat 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||||||    
T  34254586 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagat 34254489  T
Q  116 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||| ||| ||||    
T  34254488 tgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaacttatt-gata 34254394  T
Q  214 gtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34254393 gtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34254327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 31218167 - 31218429
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  31218167 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 31218264  T
Q  115 ttgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||||||||| |    
T  31218265 ttgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-g 31218359  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31218360 atagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 31218429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34256762 - 34256503
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagat 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||  | | |||  |||||||||||||||       |||||||    
T  34256762 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagat 34256665  T
Q  116 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 213  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||    
T  34256664 tggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gata 34256570  T
Q  214 gtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34256569 gtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34256503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 44303764 - 44304027
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  44303764 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 44303861  T
Q  115 ttgggaaag---gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 209  Q
    ||||||||    |||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||   |||||||||||     
T  44303862 ttgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctcttttt--aagaactcatt- 44303956  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  44303957 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatct 44304027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1746366 - 1746216
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 222  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  ||||    ||||||||||| |||||||||||||    
T  1746366 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg---aagaactcatt-gatagtggattgg 1746273  T
Q  223 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 279  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1746272 agagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 1746216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19945529 - 19945355
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| | |  || ||   |||||    
T  19945529 ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaagaa 19945432  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19945431 ctcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 19945355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434995
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42435063  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42435062 tcatt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 42434995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 15212786 - 15212957
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  15212786 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 15212882  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  15212883 tca-ttgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 15212957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  108 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactc 205  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |  ||||| |||||||||||||||  || ||||  |||| ||||| |||||    
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaa-aactc 40321178  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40321179 -tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283688
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4283620  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283621 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 4283688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352321
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  |||| ||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 33352246  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33352247 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33352321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 43036423 - 43036594
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||| ||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  43036423 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 43036519  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  43036520 tcatt-gatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 43036594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655564
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 18655496  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18655497 tcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 18655564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 27811278 - 27811449
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  27811278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 27811374  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
     |||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  27811375 ccatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4743291 - 4743211
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  4743291 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4743211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10930267 - 10930187
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  10930267 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtt 10930187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12702783 - 12702631
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattcct-tttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| | |  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  12702783 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc-cttttgtgtctctttgtaa-gaactcatt-gatattggattgg 12702688  T
Q  223 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12702687 agagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12702631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1345449 - 1345391
Alignment:
Q  197 aaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1345449 aaagaactcatt-gatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 1345391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 271
Target Start/End: Original strand, 40221845 - 40221907
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221845 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40221907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3303747 - 3303667
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  3303747 aagaactcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 3303667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Original strand, 5689362 - 5689442
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5689362 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 280
Target Start/End: Original strand, 6599027 - 6599143
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 259  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  6599027 aagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttgg 6599122  T
Q  260 accgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  6599123 accgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 280
Target Start/End: Original strand, 6674480 - 6674596
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 259  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  6674480 aagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttgg 6674575  T
Q  260 accgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  6674576 accgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Original strand, 40328871 - 40328922
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggt 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  40328871 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 271
Target Start/End: Original strand, 4733806 - 4733868
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4733806 ttgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 4733868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965820
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttc 145  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttc 8965820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaa-gaac 18141916  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 270  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141917 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41366727 - 41366622
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 259  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  41366727 aagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaa-gaactcattt-atagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttgg 41366633  T
Q  260 accgaactggg 270  Q
    |||||||||||    
T  41366632 accgaactggg 41366622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 178
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353865
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac 178  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 44353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Original strand, 11384085 - 11384149
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||| |||||||||||   | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11384085 ttgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 11384149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291679
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac 178  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 30291679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 5138193 - 5138596
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138193 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 5138292  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138293 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 5138392  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5138393 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 5138492  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgatt--gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5138493 ccttgtttatcttgtgttttggttgctttgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttgtctcttgcttgctcaataagctttgt 5138591  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  5138592 ttggt 5138596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 5135967 - 5136371
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttgg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5135967 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgtagagagaatcattgagtgtcttgg 5136066  T
Q  110 tgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136067 tgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 5136166  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5136167 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 5136266  T
Q  310 tccttgtttatcttgtgatt--gttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttg 407  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5136267 tccttgtttatcttgtgttttggttgctttgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttgtctcttgcttgctcaataagctttg 5136365  T
Q  408 tttggt 413  Q
    ||||||    
T  5136366 tttggt 5136371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 7124804 - 7125203
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7124804 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 7124903  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124904 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 7125002  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  7125003 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc-- 7125100  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagcttt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7125101 ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaacttt 7125200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 8395508 - 8395909
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395508 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 8395607  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8395608 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaaca-tgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttg 8395705  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8395706 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 8395805  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    || | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  8395806 ccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgcacaataaactttgt 8395904  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  8395905 ttggt 8395909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 8393299 - 8393700
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393299 caaaggggaagctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 8393398  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8393399 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaaca-tgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttg 8393496  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8393497 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 8393596  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    || | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  8393597 ccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaacttcgt 8393695  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  8393696 ttggt 8393700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 7122585 - 7122984
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7122585 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 7122684  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122685 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 7122783  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||      
T  7122784 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttctttgtgtttattgttttcttcttcc-- 7122881  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagcttt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7122882 ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaacttt 7122981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31495556 - 31495191
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaatt 134  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31495556 tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaatt 31495457  T
Q  135 agggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaa 231  Q
    ||| || |||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  31495456 aggatt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagttgattggagagttcaa 31495361  T
Q  232 actctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctcctt------gtttatcttgt 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||||||       ||||||||||    
T  31495360 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcctcttccctctccttttatccttttatcttgt 31495262  T
Q  326 gattgt-tgctttgtttcacac-ttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    | |||| |  | || ||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  31495261 gcttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattattgcttgc 31495191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13992544 - 13992289
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaa 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13992544 tagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 13992446  T
Q  122 ag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 217  Q
    |   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||||| || ||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  13992445 aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtat--ctcttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 13992352  T
Q  218 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13992351 attggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatct 13992289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30000063 - 29999809
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||       ||||||    
T  30000063 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgaga 29999966  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||    |||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| ||||||||| ||||    
T  29999965 ttgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaa-gaactcatt-gata 29999869  T
Q  214 gtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999868 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 29999809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 56178882 - 56178633
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-ggg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  |||    
T  56178882 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggg 56178784  T
Q  127 tagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 225  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  56178783 tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggaga 56178688  T
Q  226 gtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56178687 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 56178633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 48143042 - 48143215
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||   |||||    
T  48143042 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtat--ctcttcataagaa 48143138  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48143139 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct 48143215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 289
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209895
Alignment:
Q  110 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactca 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||||||    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaactca 2209813  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    || |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2209814 tt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 2209895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 289
Target Start/End: Original strand, 12119559 - 12119720
Alignment:
Q  126 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12119559 gtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgta-tctctttgtaaagaactcattt-atagtggattggag 12119656  T
Q  225 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    ||  ||| |||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  12119657 agatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtgtt 12119720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639590
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| || |||||||||||||||||||||  || |||| |  ||||||| ||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctatttgtaa-gaac 41639522  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41639523 tcatc-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 41639590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||| ||||||||  | |||||| ||||| |||| |||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaa-gaa 41964511  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964512 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52095530 - 52095361
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||    
T  52095530 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaa 52095435  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 278  Q
     || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52095434 atc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaat 52095361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038408
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactc 205  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  ||||||||||||||||||| |  |||||| |  ||||||| || |||    
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtat-ctgtttgtaagga-ctc 47038481  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  47038480 att-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 47038408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5370237 - 5370079
Alignment:
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgt--gaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  5370237 aaagaggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaac-ttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtg 5370143  T
Q  217 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    || | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5370142 gactagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 5370079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9927626 - 9927467
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  9927626 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 9927530  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9927529 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 9927467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 289
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364416
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta-tctctttgt-aagaac 26364332  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    ||| || ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||| |||||    
T  26364333 tca-ttaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttcttggtgtt 26364416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207848
Alignment:
Q  113 gattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttga 211  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||| ||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgt-aagaactca-ttga 5207907  T
Q  212 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  5207906 tagtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggt 5207848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632607
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaac 40632541  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40632542 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggt 40632607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703666
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 46703596  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  46703597 ctcattt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtga 46703666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50673924 - 50673851
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50673924 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 50673851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 273
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656120
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 222  Q
    |||||||||||| |||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 6656070  T
Q  223 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6656071 agagatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtga 6656120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073557
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  |||||||||||| ||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 12073488  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  12073489 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtga 12073557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 289
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883200
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 54883116  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  54883117 tcatt-gatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtt 54883200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 256
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | | || | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 8665504  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8665505 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175633
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| | |||| | |  |||| ||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 26175708  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  26175707 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 26175633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26699585 - 26699447
Alignment:
Q  132 attagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtaca 230  Q
    |||||||||||||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  26699585 attagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgtaaagaactcattt-ataatggattggagagatca 26699488  T
Q  231 aactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    | ||||   |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26699487 atctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34570582 - 34570411
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctc-ttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |||| ||||    
T  34570582 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctcttt-gtaa-gaac 34570486  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  34570485 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct 34570411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 36463461  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36463460 tc-tttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 8648230 - 8648303
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8648230 aagaactcatt-gatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 8648303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994686
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| | |  ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||| ||||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta-tccctttgt-aagaac 36994620  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36994621 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggt 36994686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 50262778 - 50262688
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||   ||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50262778 aagaactcatt-gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 50262688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 269
Target Start/End: Original strand, 379399 - 379541
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 222  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  379399 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaa-gaactaatt-gatagtggattgg 379494  T
Q  223 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 269  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  379495 agagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgg 379541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229731
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattcct-tttgtaaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||| | |  | |||| ||||| ||||||||  || |||  || ||||||| |||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaa-gaact 37229792  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  37229791 cattt-atagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaact 37229731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147388
Alignment:
Q  108 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactc 205  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||||    
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 46147461  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
     |||||||||||||||||||   ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  46147460 -tttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 46147388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48893715 - 48893635
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  48893715 aagaactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 48893635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12739718 - 12739547
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||  || |||| |  ||||||  |||    
T  12739718 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctatttgtat-gaa 12739623  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12739622 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 5429679 - 5429850
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || |||| |  ||||||| ||||    
T  5429679 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctatttgtaa-gaac 5429775  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5429776 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416974
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||| |||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 27417037  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27417036 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 27416974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 37740625 - 37740784
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  37740625 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 37740721  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  37740722 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactg 37740784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6542247 - 6542185
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6542247 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 6542185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Original strand, 5871911 - 5871991
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  5871911 aagaactc-tttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct 5871991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12744002 - 12743922
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12744002 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12743922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12745391 - 12745311
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12745391 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12745311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Original strand, 35662532 - 35662600
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35662532 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54200001
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 54200001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Original strand, 4588012 - 4588121
Alignment:
Q  159 tgaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagttt 257  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||| ||    
T  4588012 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaag-tt 4588107  T
Q  258 ggaccgaactgggt 271  Q
    ||||| ||||||||    
T  4588108 ggaccaaactgggt 4588121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52467423 - 52467351
Alignment:
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  52467423 tttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 52467351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48142542 - 48142444
Alignment:
Q  110 tgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtat-tccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| | |||| | |  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48142542 tgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacc-cttgtatatctctttgtaaagaactcatt 48142444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52082707 - 52082660
Alignment:
Q  233 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  52082707 ctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatct 52082660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 252
Target Start/End: Original strand, 33989897 - 33989989
Alignment:
Q  159 tgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtca 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  33989897 tgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctcttt-gtaaataactcgtta-atagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Original strand, 41639263 - 41639336
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | || ||| || |||||||||||||||||||||    
T  41639263 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtaaactttttgaagctaatttcttgtaacc 41639336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45687259 - 45687179
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  45687259 aagaactcatt-gatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45687179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Original strand, 31474242 - 31474313
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||   || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31474242 aagaactcatt-gatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaagtt-ggaccgaactgggt 31474313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 29254594 - 29254665
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29254594 ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29254665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 33089966 - 33090021
Alignment:
Q  194 tgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  33089966 tgtaaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6594822 - 6594421
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594822 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 6594723  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6594722 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 6594624  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  6594623 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ct 6594526  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6594525 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 6594426  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  6594425 ttggt 6594421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6592604 - 6592203
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592604 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 6592505  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6592504 gagattgggaaatgggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 6592406  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  6592405 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ct 6592308  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6592307 ccttgtttttcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 6592208  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  6592207 ttggt 6592203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18392460 - 18392063
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392460 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 18392361  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18392360 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 18392262  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18392261 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 18392162  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18392161 ccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 18392064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18389024 - 18388627
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389024 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 18388925  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18388924 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 18388826  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18388825 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 18388726  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    | |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18388725 ctttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 18388628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 32060590 - 32060189
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32060590 caaagggtaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 32060491  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc--ttttgtaaagaactca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32060490 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccctttttgtaaagaactca 32060392  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttcc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32060391 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc 32060292  T
Q  307 atctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagct 404  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32060291 --ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaact 32060194  T
Q  405 ttgtt 409  Q
    |||||    
T  32060193 ttgtt 32060189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 371
Target Start/End: Original strand, 20343811 - 20344158
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343811 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 20343910  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20343911 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggat 20344008  T
Q  220 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||  |||    
T  20344009 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--ttt 20344104  T
Q  319 atcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtg 371  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20344105 atcttgtgattgtgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtg 20344158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 24789755 - 24790062
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24789755 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtaagattggg 24789854  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgt-gaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 218  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24789855 aaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcccttttgtaaa-aactc-tttgatagtgga 24789951  T
Q  219 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |  ||||| |||||| ||||||  |||    
T  24789952 ttggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtttttcttcttccctctcct--ttt 24790049  T
Q  319 atcttgtgattgt 331  Q
    |||||||||||||    
T  24790050 atcttgtgattgt 24790062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560541
Alignment:
Q  184 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 283  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1560757 gtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctctt 1560659  T
Q  284 tgtgtttattgttttcatcttccatctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgtt 381  Q
     |||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1560658 ggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 1560560  T
Q  382 gtttcttgcttgctcaata 400  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  1560559 gtttcttgcttgcacaata 1560541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1562268 - 1562103
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562268 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 1562169  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1562168 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 39731283 - 39731654
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39731283 ctctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 39731381  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtga-agctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 216  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  39731382 aaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtg 39731477  T
Q  217 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgt 316  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| |||||| ||||||  |    
T  39731478 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcct--t 39731573  T
Q  317 ttatcttgtgattgttgctt-tgtttcacac-ttgtttcctagattggatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||||||| |||| | || || ||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  39731574 ttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgc 39731654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43504409 - 43504102
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  43504409 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcgagtgtcttggtgagattgg 43504311  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43504310 gaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagt 43504215  T
Q  216 ggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttg 315  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||      
T  43504214 gaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcct-- 43504118  T
Q  316 tttatcttgtgattgt 331  Q
    ||||||||||| ||||    
T  43504117 tttatcttgtgcttgt 43504102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 288
Target Start/End: Original strand, 35853825 - 35854094
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  35853825 tagggtttagggt-ctttgatttgagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 35853922  T
Q  115 ttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 211  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||    
T  35853923 ttgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-ga 35854017  T
Q  212 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 288  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35854018 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 35854094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25767215 - 25766948
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt----gagat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| |    |||||    
T  25767215 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctctttggg---aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgagat 25767120  T
Q  116 tgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 213  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| | |  || || | ||||||||||| ||||    
T  25767119 tggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcatt-gata 25767023  T
Q  214 gtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 288  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25767022 gtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 25766948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgt-gaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||| |||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaa-attgttgaagctaatttcttgtaacacatttgta-tctttttgt-aagaa 34310789  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34310788 ctca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 23555039 - 23555212
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattcct-tttgtaaaga 201  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||| ||    
T  23555039 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgta--cctctttgtaa-ga 23555134  T
Q  202 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23555135 actcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 23555212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 29990965 - 29991225
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  29990965 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 29991062  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 212  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||  | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  ||||    || |||||||| |||    
T  29991063 ttgggaaaaggatagaaattagggtt-gttatttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttct--aataactcatt-gat 29991157  T
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29991158 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 29991225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 280
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25616025
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaag-gggtagaaa 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  133 ttagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaa 231  Q
    ||||| |||||||   |||  | |  | |||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtat-cattttgtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagatcaa 25615976  T
Q  232 actctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25615977 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatct 25616025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 288
Target Start/End: Original strand, 48408709 - 48408984
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||    
T  48408709 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg 48408807  T
Q  112 agattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtattccttttgtaaagaactcat 207  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| | || ||| |||| || ||||||||||||||||| |||  ||||  |||||| ||| |||||||    
T  48408808 agattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg-aaataactcat 48408904  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 288  Q
    | ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  48408905 t-gatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgt 48408984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270137
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 22270069  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270070 tgatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 22270137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 4178685 - 4178945
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  4178685 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 4178782  T
Q  115 ttgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 212  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||| | |  ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||    ||||||||||| |||    
T  4178783 ttgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg---aagaactcatt-gat 4178877  T
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  4178878 agtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatct 4178945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 280
Target Start/End: Original strand, 19502233 - 19502350
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 259  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19502233 aagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttgg 19502329  T
Q  260 accgaactgggtgaccaatct 280  Q
    | |||| ||||||| ||||||    
T  19502330 aacgaagtgggtgaacaatct 19502350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32358131 - 32358058
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32358131 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 32358058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608901
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 29608833  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29608834 tcatt-gatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 29608901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30024900 - 30024740
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  30024900 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 30024804  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 269  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30024803 tc-tttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 30024740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 256
Target Start/End: Original strand, 48491579 - 48491727
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||  |||||||    
T  48491579 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat--ctctttgaaagaac 48491675  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  48491676 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27347988
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 27347913  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  27347914 tcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27347988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8359393 - 8359319
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8359393 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 8359319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 289
Target Start/End: Original strand, 2390385 - 2390462
Alignment:
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||||    
T  2390385 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgtt 2390462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253538
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtat-tccttttgtaaagaact 204  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||  |||| ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacc-cttttatatctctttggaaagaact 4253599  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    || |||||| |||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4253598 ca-ttgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaact 4253538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599338
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |  |||| |    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg--aagagc 48599406  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  48599405 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtga 48599338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Original strand, 3259095 - 3259159
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3259095 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtga 3259159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14070001 - 14069830
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||    
T  14070001 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaa 14069906  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  14069905 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14380029 - 14379858
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||    
T  14380029 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaa 14379934  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  14379933 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14379858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317431
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| | |||| || ||||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||| |||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagc-ttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaa-gaa 41317507  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  41317506 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41317431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Original strand, 6432071 - 6432134
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6432071 ttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 43864244 - 43864406
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||| |||||||  || ||||  |||| ||||| |||    
T  43864244 ttggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 43864340  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43864341 taatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 43864406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586323
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 204  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| |  |||||||||||| ||||||||  || |  ||  ||||| |||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgt-aagaact 4586258  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | || |||||  ||||||||||||||||    
T  4586259 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactgggt 4586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508710
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4508778  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4508777 tcatt-gagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 4508710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31733118 - 31732966
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  31733118 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatactggattgg 31733023  T
Q  223 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  31733022 agagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41649158 - 41649008
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||  ||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41649158 ggtagaaattagg-tttgttctttgtgagc-ttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 41649064  T
Q  224 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  41649063 gagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41649008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta-tctctttgt-aagaac 2361044  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||| ||||||||||||| ||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361043 tca-ttgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47674189 - 47673953
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gg 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||  ||    
T  47674189 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgg 47674091  T
Q  126 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47674090 gtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggag 47673995  T
Q  225 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 268  Q
    ||  ||| |||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  47673994 agatcaatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344048
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 23344048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 280
Target Start/End: Original strand, 48489534 - 48489602
Alignment:
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  48489534 atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 48489602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 8153442 - 8153513
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  8153442 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 382
Target Start/End: Original strand, 24790230 - 24790274
Alignment:
Q  338 gtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttg 382  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24790230 gtttctcacctgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 24790274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 271
Target Start/End: Original strand, 18396418 - 18396481
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18396418 ttgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggt 18396481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 271
Target Start/End: Original strand, 30814536 - 30814598
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30814536 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 30814598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565069
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||| | |  |||| ||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattgga 23565114  T
Q  224 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 269  Q
    |||  ||| |||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23565113 gagatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24525579 - 24525508
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24525579 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggt 24525508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31105508 - 31105399
Alignment:
Q  159 tgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagttt 257  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||   || |||||| | ||||||| ||||| ||    
T  31105508 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaa-gaactcatt-gatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-tt 31105413  T
Q  258 ggaccgaactgggt 271  Q
    ||||||||||||||    
T  31105412 ggaccgaactgggt 31105399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36574631 - 36574522
Alignment:
Q  159 tgaagctaatttcttgtaacctcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagttt 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||| |  ||| | |||||||||||| |||    
T  36574631 tgaagctaatttcttgtaacc-cttttatatctctttgtaaagaactca-ttgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaa-ttt 36574536  T
Q  258 ggaccgaactgggt 271  Q
    ||||| ||||||||    
T  36574535 ggaccaaactgggt 36574522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 269
Target Start/End: Original strand, 31518993 - 31519063
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctc-ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 269  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518993 aagaactcatt-gacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 31519063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3990 - 3593
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3990 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 3891  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3890 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaaca-tgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 3792  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3791 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 3692  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3691 ccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 44203536 - 44203937
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203536 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 44203635  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44203636 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 44203734  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  44203735 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 44203834  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44203835 ccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 44203932  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  44203933 ttggt 44203937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Original strand, 9036320 - 9036702
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9036320 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 9036419  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||    
T  9036420 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tt 9036516  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| |    
T  9036517 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 9036615  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9036616 ctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgc 9036702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 21053872 - 21054242
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21053872 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagaaaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 21053971  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 218  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21053972 aaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtgga 21054068  T
Q  219 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  |||    
T  21054069 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctcct--ttt 21054165  T
Q  319 atcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21054166 atcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 21054242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 40282291 - 40282661
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282291 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 40282390  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgt-gaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40282391 aaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaac-ttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtgga 40282487  T
Q  219 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  |||    
T  40282488 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--ttt 40282584  T
Q  319 atcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40282585 atcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 40282661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 9987116 - 9987486
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9987116 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 9987215  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtg-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  9987216 aaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgcaa-gaactcatt-gatagtgga 9987311  T
Q  219 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  |||    
T  9987312 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcct--ttt 9987409  T
Q  319 atcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    ||||||||||||| |    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9987410 atcttgtgattgtgtatagtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 9987486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20622492 - 20622121
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20622492 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcattgactgtcttggtgagattggg 20622393  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta-aagaactcatttgatagtgg 217  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  20622392 aaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttttgtaagaactc-tttgatagtgg 20622296  T
Q  218 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgtt 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||  ||    
T  20622295 attggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tt 20622199  T
Q  318 tatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20622198 tatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 20622121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 51765302 - 51765682
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttg------gtgag 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||      ||  |    
T  51765302 ctctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtttg 51765400  T
Q  114 attggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||    | | |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||| |||||||||    
T  51765401 attgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt 51765498  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| |||||| |    
T  51765499 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcctcttccct 51765595  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt-tgtttcacac-ttgtttcctagattggatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||  ||||||||||| |||| | || || ||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  51765596 ctcct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgc 51765682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316348
Alignment:
Q  105 cttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 13316426  T
Q  202 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13316425 actcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 13316348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8550952 - 8550783
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactca 206  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  | |||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  8550952 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgta-tccctttgt-aagaactca 8550856  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
     |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8550855 -ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 8550783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 3189330 - 3189502
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||| ||||    
T  3189330 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtat-ctttttgtaa-gaac 3189426  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3189427 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3189502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 3198147 - 3198319
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||| ||||    
T  3198147 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtat-ctttttgtaa-gaac 3198243  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3198244 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3198319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 3206986 - 3207158
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||| ||||    
T  3206986 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtat-ctttttgtaa-gaac 3207082  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3207083 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3207158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 20762582 - 20762844
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||| |||||       ||||||    
T  20762582 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgaga 20762679  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  || ||   ||||||||||| |    
T  20762680 ttgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat--ctcttcgtaagaactcatt-g 20762774  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20762775 atagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 20762844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136412
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| | |  |||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||| ||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttc-tttgt-aagaac 29136343  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29136344 tca-ttgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 29136412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168462
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 37168393  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168394 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 37168462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547093
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||| ||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 13547161  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547160 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13547093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297962
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||  | |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42298047  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42298046 tcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 42297962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 44455160 - 44455322
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| |  |||| ||||||||||||||| |  ||||| || |||||| ||||||    
T  44455160 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgta-tctttttgt-aagaac 44455256  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44455257 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 44455322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255343
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 47255412  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  47255411 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47255343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28220394 - 28220223
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  28220394 ttggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 28220298  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  28220297 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28220223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13549077 - 13549004
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549077 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13549004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348862
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  ||||    ||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttct--aagaac 11348794  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11348795 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 11348862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 3156865 - 3157036
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  3156865 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 3156961  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  3156962 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 3157036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552634
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | | |||| | |  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt-gtaa-gaac 4552709  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  4552708 tcatt-gataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4552634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28265702 - 28265551
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28265702 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc-tttgatagtggattgga 28265607  T
Q  224 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  28265606 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28265551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482234
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 7482303  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7482302 ctcatt-gatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 7482234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033059
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  ||||||||||||||||||| |  | ||| ||  |||| |||| |||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaa-gaa 37033145  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 289  Q
    |||||| |||||||||||||||||   || |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  37033144 ctcatt-gatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctattcgtgtt 37033059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31925856 - 31925711
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31925856 gggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 31925761  T
Q  223 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31925760 agagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 31925711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 834332 - 834164
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 206  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| |||||||    
T  834332 gtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 834236  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    || |||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  834235 tt-gatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 834164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 28242396 - 28242469
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  28242396 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 28242469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37503722 - 37503577
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| |||||||    
T  37503722 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac--cttgta-tctctttgt-aagaact 37503628  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  37503627 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagtt 37503577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918521
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 49918446  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  49918447 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 49918521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115337
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| ||||| ||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaa-aa 47115267  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  47115268 cccatt-gatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47115337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13659413 - 13659333
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  13659413 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 13659333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Original strand, 193711 - 193775
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  193711 ttgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtga 193775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28223589 - 28223418
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | || |  ||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  28223589 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 28223493  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  28223492 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28223418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Original strand, 34603668 - 34603740
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 272  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603668 aagaactcatt-gatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45644431 - 45644351
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  45644431 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Original strand, 46065009 - 46065089
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  46065009 aagaactcattc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct 46065089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 248
Target Start/End: Original strand, 5459959 - 5460046
Alignment:
Q  159 tgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtag 248  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||    
T  5459959 tgaagctaatttcttgtaacattttatatttc-tttgtaaagaactca-ttgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtag 5460046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Original strand, 6378603 - 6378655
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6378603 ggtagaaattagggtttgttcatgttgaacattgt-aagctaattttttgtaac 6378655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754657
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaa-gaa 19754590  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  19754591 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggt 19754657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 252
Target Start/End: Original strand, 22079371 - 22079461
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtca 252  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||    
T  22079371 aagctaatttcttgtaaccattttgtatctcttt-gtaaagaactcatt-gatattggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||| |||||||||| |||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 23555337  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23555336 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 31659338 - 31659409
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  31659338 ttgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31659409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37876834 - 37876770
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  37876834 ttgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtga 37876770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 928071
Alignment:
Q  127 tagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 928071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 226
Target Start/End: Original strand, 6808505 - 6808571
Alignment:
Q  159 tgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 226  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6808505 tgaagctaacttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaaagaactcattt-atagtggattggagag 6808571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318618
Alignment:
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 12318618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 50167243 - 50167172
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  50167243 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 50167172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2868 - 2467
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2868 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 2769  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2768 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 2670  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2669 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttttgtgtttattgttttcttcttccctct 2570  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2569 ccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 2472  T
Q  409 ttggt 413  Q
    |||||    
T  2471 ttggt 2467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12647650 - 12647253
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647650 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 12647551  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12647550 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 12647452  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12647451 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 12647352  T
Q  311 ccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgt 408  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12647351 ccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgt 12647254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 85 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13656221 - 13655905
Alignment:
Q  85 tagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13656221 tagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttg 13656123  T
Q  185 tattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 284  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656122 tatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 13656024  T
Q  285 -gtgtttattgttttcatcttccatctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgtt 381  Q
     |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13656023 ggtgtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 13655924  T
Q  382 gtttcttgcttgctcaata 400  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13655923 gtttcttgcttgcacaata 13655905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 392
Target Start/End: Original strand, 6266605 - 6266974
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6266605 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 6266704  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6266705 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtgga 6266801  T
Q  219 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgttt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||||  ||||    
T  6266802 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcc--gttt 6266899  T
Q  319 atcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgctt 392  Q
    |||||||| |||| |  | |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  6266900 atcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgttgttttgttgatttttgctt 6266974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 32289479 - 32289851
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32289479 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 32289577  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 216  Q
     |||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||     
T  32289578 aaaaggg-tagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagta 32289672  T
Q  217 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgt 316  Q
     ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |  |||||||| |||||| ||||||  |    
T  32289673 aattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttttcctcttccctctcct--t 32289770  T
Q  317 ttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacac-ttgtttcctagattggatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||||||| |||| |  | || ||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  32289771 ttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgc 32289851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4484592 - 4484213
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttg------gtga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||      ||||    
T  4484592 ctctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtga 4484494  T
Q  113 gattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
     |||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4484493 aattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt 4484397  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| |||||| |    
T  4484396 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcttcttccct 4484300  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttg-ctttgtttcacac-ttgtttcctagattggatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||  ||||||||||| |||| |  |||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  4484299 ctcct--tttatcttgtgcttgtggtttttgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgc 4484213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Original strand, 30833252 - 30833631
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttg------gtga 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| |  |||||||||||||||||      ||||    
T  30833252 ctctagggtttagggtt-tttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtga 30833350  T
Q  113 gattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  30833351 gattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt 30833447  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| |||||| |    
T  30833448 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcctcttccct 30833544  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt-tgtttcacac-ttgtttcctagattggatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||  ||||||||||| |||| | || || ||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  30833545 ctcct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgc 30833631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 45099665 - 45099926
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  45099665 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 45099762  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||  ||||    ||||||||||| |    
T  45099763 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg---aagaactcatt-g 45099856  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45099857 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 45099926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4503390 - 4503129
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt-------gaga 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| |       ||||    
T  4503390 tagggtttagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagaga 4503293  T
Q  115 ttgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    ||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||  ||||    ||||||||||| |    
T  4503292 ttgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg---aagaactcatt-g 4503199  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4503198 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 4503129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36205921 - 36205661
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  36205921 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 36205824  T
Q  115 ttgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 211  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||  ||||    ||||||||||| ||    
T  36205823 ttgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg---aagaactcatt-ga 36205730  T
Q  212 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
     || |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36205729 cagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 36205661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2334586 - 2334414
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| | |||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||| ||||||    
T  2334586 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaataaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgta-tctctttgt-aagaac 2334490  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2334489 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatct 2334414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5723512 - 5723252
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  5723512 tagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5723415  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgat 212  Q
    ||| |||| |||||||||||||| || |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||||| |||    
T  5723414 ttgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gat 5723320  T
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5723319 agtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 5723252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6595154 - 6595002
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||  ||  | ||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  6595154 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaa-gaactcgtt-gatagtggattggag 6595058  T
Q  225 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6595057 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 6595002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36988153 - 36988072
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36988153 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 36988072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 271
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648335
Alignment:
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcattt 209  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttcttt-gtaaagaactcatt- 33648273  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33648274 gatagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 33648335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727093
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaac 45727025  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45727026 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 45727093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34140017 - 34139767
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gg 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||  ||    
T  34140017 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgg 34139919  T
Q  126 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctct-tgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34139918 gtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 34139822  T
Q  225 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  34139821 agatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 34139767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398228
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaa--aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||||||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaaagaa 24398153  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 278  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||   |||||||||||||| ||| ||||    
T  24398154 ctcatt-gataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaat 24398228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 35446961 - 35446888
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35446961 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 35446888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 280
Target Start/End: Original strand, 38312159 - 38312411
Alignment:
Q  35 ggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | |||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||     
T  38312159 ggttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa 38312257  T
Q  124 -gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 221  Q
     ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||| ||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| || |||||| ||||||||||||    
T  38312258 tgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gatctcatt-gatagtggattg 38312353  T
Q  222 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||  ||| |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  38312354 gagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38312411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 723893 - 723741
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 222  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  723893 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 723798  T
Q  223 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  723797 agagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 723741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14633939 - 14633834
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 259  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  14633939 aagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaa-gaactcata-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgg 14633843  T
Q  260 accgaactg 268  Q
    |||||||||    
T  14633842 accgaactg 14633834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868031
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaa 29867964  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29867965 ctc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 29868031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1631809 - 1631736
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1631809 aagaactcatt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 1631736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17057446 - 17057366
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17057446 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17057366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17085429 - 17085349
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17085429 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17085349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773733
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 36773658  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36773659 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36773733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 39284936 - 39285007
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  39284936 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Original strand, 42362262 - 42362500
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 113  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  42362262 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgag 42362359  T
Q  114 attgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttga 211  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| | |  | |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  42362360 attgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-ga 42362455  T
Q  212 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||    
T  42362456 tagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11151657 - 11151588
Alignment:
Q  210 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  11151657 gatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 11151588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 180
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121843
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacct 180  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| | |  ||||| ||||||||||||||||    
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacct 13121843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353346
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaact 204  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||| | ||||   |  |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| |||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgta-tctttttgt-aagtact 26353281  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    || |||||||||||||||||||  ||  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26353282 ca-ttgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggt 26353346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36318086 - 36318006
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36318086 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36318006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17490225 - 17490154
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17490225 aagaactcatt-gatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttggaccgaactgggt 17490154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 17450678 - 17450748
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  17450678 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Original strand, 28672036 - 28672088
Alignment:
Q  213 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  28672036 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 28672088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 6177 - 6580
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 6276  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6277 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaagcccttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 6375  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  6376 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtg-ttattgttttcttcttccctct 6474  T
Q  311 ccttg-tttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttg 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6475 ccttgttttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 6574  T
Q  408 tttggt 413  Q
    ||||||    
T  6575 tttggt 6580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 244 - 409
Target Start/End: Original strand, 1 - 166
Alignment:
Q  244 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccatctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  1 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgttt 98  T
Q  342 cacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtt 409  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  99 cacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtt 166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11423 - 11044
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttg------gtga 112  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||      ||||    
T  11423 ctctagggtttatggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtga 11325  T
Q  113 gattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaag-ctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatt 208  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||| ||    
T  11324 gattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-gaactcgtt 11228  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccat 308  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| |||||| |    
T  11227 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcctcttccct 11131  T
Q  309 ctccttgtttatcttgtgattgttgctt-tgtttcacac-ttgtttcctagattggatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||  ||||||||||| |||| | || |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  11130 ctcct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgtttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgc 11044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8907 - 8618
Alignment:
Q  104 tcttggtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||| |    || |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |    
T  8907 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-g 8810  T
Q  201 aactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttca 300  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||||||     
T  8809 aactcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcc 8713  T
Q  301 tcttccatctccttgtttatcttgtgattgttgctt-tgtttcacac-ttgtttcctagattggatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgc 394  Q
    |||||| ||| ||  ||||||||||| |||| | || || ||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  8712 tcttccctcttct--tttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgc 8618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Original strand, 434443 - 434703
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  434443 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 434540  T
Q  115 ttggg--aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 210  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |    
T  434541 ttggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-g 434635  T
Q  211 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 278  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  434636 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 434703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 827 - 1087
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg------gtgagat 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||      |||||||    
T  827 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagat 924  T
Q  116 tgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 211  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||  ||||    || |||||||| ||    
T  925 tgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg---aacaactcatt-ga 1018  T
Q  212 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1019 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11737
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| |||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaa 11652  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11653 ctcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 11737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114774
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| |||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgta-tctctttgt-aagaa 114697  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  114698 ctca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatct 114774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18007
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  18151 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaaa--actcatt-gatagtggattgga 18057  T
Q  224 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18056 gagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtga 18007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 271
Target Start/End: Original strand, 10589 - 10651
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10589 ttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 10651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 149174 - 149094
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  149174 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 149094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7491
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 7423  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7424 tcatt-gatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 7491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20421
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtgaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||  | |||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 20487  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 271  Q
    || ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20486 tc-tttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 20421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University