View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16607_low_20 (Length: 281)

Name: NF16607_low_20
Description: NF16607
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16607_low_20
NF16607_low_20
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (14-269)||(16618640-16618895)
chr3 (14-269)||(32296486-32296742)
chr3 (14-269)||(29142904-29143160)
chr3 (14-269)||(4340823-4341080)
chr3 (14-269)||(4629642-4629898)
chr3 (14-269)||(8217489-8217745)
chr3 (14-261)||(28027148-28027396)
chr3 (14-269)||(4422776-4423031)
chr3 (14-269)||(16422041-16422295)
chr3 (14-261)||(22381735-22381982)
chr3 (14-269)||(28110102-28110359)
chr3 (14-269)||(21680558-21680814)
chr3 (14-269)||(24334030-24334286)
chr3 (14-269)||(31958604-31958860)
chr3 (14-269)||(17979098-17979356)
chr3 (14-269)||(19700344-19700599)
chr3 (14-269)||(5603462-5603718)
chr3 (14-269)||(10402006-10402262)
chr3 (14-269)||(15735242-15735498)
chr3 (14-269)||(17971011-17971267)
chr3 (14-269)||(18286501-18286757)
chr3 (14-269)||(18301802-18302058)
chr3 (14-269)||(28345028-28345284)
chr3 (14-269)||(29659115-29659371)
chr3 (14-261)||(32445011-32445259)
chr3 (14-269)||(6207757-6208014)
chr3 (14-269)||(5472845-5473101)
chr3 (14-261)||(6536898-6537146)
chr3 (14-261)||(8283624-8283872)
chr3 (14-269)||(18231050-18231306)
chr3 (14-261)||(22865001-22865249)
chr3 (14-261)||(22880060-22880308)
chr3 (14-269)||(31030385-31030641)
chr3 (14-269)||(35886621-35886878)
chr3 (14-261)||(4727490-4727738)
chr3 (14-269)||(5727835-5728091)
chr3 (14-269)||(18248595-18248851)
chr3 (14-269)||(20570993-20571249)
chr3 (14-261)||(7079081-7079327)
chr3 (14-261)||(18336485-18336734)
chr3 (15-269)||(4689509-4689765)
chr3 (14-269)||(5590508-5590764)
chr3 (14-269)||(5716925-5717181)
chr3 (14-269)||(5764277-5764533)
chr3 (14-269)||(10648928-10649184)
chr3 (14-269)||(11104509-11104765)
chr3 (14-269)||(47029310-47029566)
chr3 (18-261)||(48471788-48472032)
chr3 (14-262)||(18057117-18057367)
chr3 (14-269)||(51787879-51788135)
chr3 (14-261)||(4790788-4791037)
chr3 (14-269)||(20071892-20072146)
chr3 (14-261)||(5019570-5019818)
chr3 (14-269)||(5657992-5658249)
chr3 (15-227)||(15886894-15887109)
chr3 (14-203)||(8002417-8002607)
chr3 (184-263)||(27561022-27561101)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (14-269)||(3285-3541)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (14-261)||(27284421-27284668)
chr6 (14-269)||(27623760-27624015)
chr6 (14-269)||(22928934-22929189)
chr6 (14-261)||(29555449-29555697)
chr6 (14-269)||(8899750-8900006)
chr6 (14-261)||(26110469-26110717)
chr6 (14-269)||(13518245-13518500)
chr6 (14-261)||(27200077-27200326)
chr6 (14-261)||(26772687-26772935)
chr6 (14-269)||(28166385-28166641)
chr6 (14-261)||(27248907-27249157)
chr6 (14-261)||(16755711-16755959)
chr6 (14-269)||(27025036-27025292)
chr6 (14-269)||(4763655-4763910)
chr6 (15-269)||(24869602-24869857)
chr6 (14-261)||(26791707-26791955)
chr6 (14-269)||(27356162-27356418)
chr6 (14-269)||(33370482-33370738)
chr6 (14-269)||(27030913-27031170)
chr6 (14-261)||(27491024-27491272)
chr6 (14-261)||(4778771-4779020)
chr6 (14-261)||(4531179-4531427)
chr6 (14-261)||(13293004-13293252)
chr6 (14-261)||(14139453-14139701)
chr6 (14-269)||(24299806-24300062)
chr6 (14-261)||(27013624-27013872)
chr6 (14-261)||(4539817-4540066)
chr6 (14-269)||(26926661-26926915)
chr6 (14-269)||(27063372-27063629)
chr6 (14-261)||(28213345-28213594)
chr6 (14-261)||(29507307-29507555)
chr6 (14-269)||(16938075-16938332)
chr6 (14-261)||(16680030-16680278)
chr6 (14-269)||(29578906-29579162)
chr6 (14-269)||(34458557-34458813)
chr6 (14-269)||(15406579-15406836)
chr6 (14-269)||(15418366-15418623)
chr6 (14-269)||(30552051-30552323)
chr6 (14-198)||(23851450-23851634)
chr6 (66-261)||(27208848-27209043)
chr6 (66-261)||(27240185-27240380)
chr6 (15-269)||(20174441-20174696)
chr6 (15-269)||(22161295-22161550)
chr6 (203-261)||(26666716-26666774)
chr6 (14-106)||(4718349-4718442)
chr6 (14-55)||(27184819-27184860)
chr6 (14-55)||(27264380-27264421)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (14-269)||(21891852-21892108)
chr1 (14-259)||(20334531-20334776)
chr1 (14-269)||(20466675-20466929)
chr1 (14-269)||(16202139-16202393)
chr1 (14-269)||(3647042-3647298)
chr1 (14-269)||(10968561-10968817)
chr1 (14-269)||(51644116-51644372)
chr1 (14-269)||(10950987-10951243)
chr1 (14-261)||(41787422-41787671)
chr1 (14-261)||(28590979-28591227)
chr1 (26-269)||(28155636-28155878)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (14-269)||(22894318-22894573)
chr5 (14-269)||(37746332-37746587)
chr5 (14-269)||(3795439-3795695)
chr5 (14-269)||(33298434-33298690)
chr5 (14-269)||(33881028-33881283)
chr5 (14-269)||(28953784-28954040)
chr5 (14-269)||(24729871-24730127)
chr5 (14-269)||(28655143-28655399)
chr5 (14-269)||(37352648-37352904)
chr5 (14-261)||(15752864-15753111)
chr5 (14-269)||(30035328-30035583)
chr5 (14-269)||(9323378-9323635)
chr5 (14-269)||(26486297-26486554)
chr5 (14-261)||(11555255-11555503)
chr5 (14-269)||(18494771-18495027)
chr5 (14-269)||(31820412-31820668)
chr5 (14-269)||(33783388-33783644)
chr5 (14-269)||(6880204-6880461)
chr5 (14-269)||(33522280-33522539)
chr5 (14-269)||(11329538-11329794)
chr5 (14-269)||(32590279-32590535)
chr5 (14-261)||(37665498-37665746)
chr5 (14-261)||(23897776-23898023)
chr5 (14-269)||(12138077-12138334)
chr5 (14-269)||(13180792-13181049)
chr5 (14-269)||(9544713-9544968)
chr5 (14-261)||(18122428-18122676)
chr5 (14-261)||(22993128-22993376)
chr5 (14-269)||(25206180-25206435)
chr5 (14-269)||(25270336-25270591)
chr5 (14-269)||(37760883-37761139)
chr5 (14-269)||(41680605-41680861)
chr5 (14-261)||(13436691-13436941)
chr5 (14-261)||(13318839-13319087)
chr5 (14-269)||(18369536-18369792)
chr5 (14-261)||(23631870-23632118)
chr5 (14-261)||(24608147-24608395)
chr5 (14-269)||(24975750-24976006)
chr5 (14-261)||(31437365-31437613)
chr5 (14-269)||(30940537-30940794)
chr5 (14-261)||(34622419-34622668)
chr5 (14-261)||(2516966-2517214)
chr5 (14-261)||(15652770-15653018)
chr5 (14-269)||(30174366-30174622)
chr5 (14-266)||(8659479-8659732)
chr5 (14-261)||(30157934-30158183)
chr5 (14-261)||(40467565-40467813)
chr5 (14-269)||(5643703-5643957)
chr5 (14-269)||(43084159-43084415)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (14-269)||(16047208-16047462)
chr7 (14-261)||(11446779-11447027)
chr7 (14-269)||(5141325-5141581)
chr7 (16-269)||(16443994-16444247)
chr7 (14-269)||(16745511-16745767)
chr7 (14-269)||(26518684-26518940)
chr7 (14-269)||(26441144-26441400)
chr7 (14-269)||(31558384-31558639)
chr7 (14-269)||(4205280-4205537)
chr7 (14-269)||(4139237-4139493)
chr7 (14-261)||(5153975-5154223)
chr7 (14-269)||(10847474-10847730)
chr7 (14-269)||(24586524-24586781)
chr7 (14-269)||(26313837-26314094)
chr7 (14-261)||(31084620-31084869)
chr7 (14-261)||(45393109-45393358)
chr7 (14-261)||(5164275-5164523)
chr7 (14-269)||(16512424-16512680)
chr7 (14-269)||(2160462-2160717)
chr7 (14-269)||(26269079-26269335)
chr7 (14-261)||(2779143-2779391)
chr7 (14-261)||(3451209-3451457)
chr7 (14-269)||(11418769-11419025)
chr7 (14-261)||(31129796-31130044)
chr7 (14-265)||(26663907-26664159)
chr7 (14-269)||(26509686-26509943)
chr7 (14-269)||(45737194-45737448)
chr7 (14-265)||(26679099-26679351)
chr7 (14-269)||(39207129-39207385)
chr7 (14-269)||(10910910-10911166)
chr7 (14-203)||(26531926-26532116)
chr7 (14-105)||(16732684-16732776)
chr7 (204-269)||(26595750-26595815)
chr7 (14-64)||(2104357-2104407)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (14-269)||(1906158-1906413)
chr4 (14-269)||(15233722-15233977)
chr4 (14-269)||(54839297-54839552)
chr4 (14-269)||(30759669-30759925)
chr4 (14-261)||(14104449-14104696)
chr4 (14-261)||(6575767-6576015)
chr4 (14-269)||(14753597-14753853)
chr4 (14-269)||(33667905-33668161)
chr4 (14-269)||(39856542-39856798)
chr4 (14-269)||(15276736-15276992)
chr4 (14-260)||(21975606-21975856)
chr4 (14-269)||(5011782-5012039)
chr4 (14-269)||(17018957-17019214)
chr4 (14-269)||(18794721-18794977)
chr4 (14-261)||(36338630-36338878)
chr4 (14-262)||(14670921-14671171)
chr4 (14-261)||(5700445-5700694)
chr4 (14-269)||(24586465-24586722)
chr4 (14-269)||(15380342-15380598)
chr4 (14-269)||(20332527-20332783)
chr4 (14-269)||(31120615-31120874)
chr4 (14-261)||(34183074-34183322)
chr4 (14-265)||(40099745-40099997)
chr4 (15-269)||(27157418-27157675)
chr4 (14-261)||(24118567-24118816)
chr4 (125-269)||(1673877-1674021)
chr4 (14-137)||(18311414-18311539)
chr4 (198-261)||(36324421-36324484)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (14-269)||(1551-1808)
scaffold0322 (14-269)||(11941-12197)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (14-269)||(27602973-27603228)
chr8 (14-269)||(29835217-29835473)
chr8 (14-269)||(19680342-19680599)
chr8 (14-269)||(16260117-16260373)
chr8 (14-269)||(44566875-44567131)
chr8 (14-269)||(19202429-19202686)
chr8 (14-261)||(22138801-22139049)
chr8 (14-269)||(19655408-19655666)
chr8 (14-269)||(19693989-19694246)
chr8 (14-269)||(28356018-28356275)
chr8 (14-269)||(31360422-31360678)
chr8 (14-269)||(31483938-31484194)
chr8 (14-261)||(33248260-33248508)
chr8 (14-271)||(21342234-21342493)
chr8 (14-269)||(2131328-2131584)
chr8 (14-261)||(15773468-15773716)
chr8 (14-269)||(19911230-19911486)
chr8 (14-261)||(33264625-33264873)
chr8 (14-261)||(12086797-12087046)
chr8 (14-269)||(9360516-9360772)
chr8 (14-261)||(18796600-18796849)
chr8 (14-263)||(22075002-22075251)
chr8 (14-269)||(18715376-18715630)
chr8 (14-269)||(14569051-14569306)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (14-269)||(21697270-21697524)
chr2 (18-269)||(11629278-11629530)
chr2 (14-261)||(12710703-12710951)
chr2 (14-269)||(34867575-34867831)
chr2 (14-269)||(40239401-40239657)
chr2 (14-269)||(32055695-32055950)
chr2 (14-269)||(21671266-21671523)
chr2 (14-269)||(37679986-37680243)
chr2 (14-269)||(37695251-37695508)
chr2 (14-269)||(12592702-12592958)
chr2 (14-261)||(12661431-12661679)
chr2 (14-269)||(27809593-27809849)
chr2 (14-261)||(34160736-34160984)
chr2 (14-269)||(19410580-19410837)
chr2 (14-269)||(16823431-16823690)
chr2 (14-269)||(16897790-16898049)
chr2 (14-269)||(27396215-27396471)
chr2 (18-269)||(22922239-22922491)
chr2 (14-269)||(27122417-27122673)
chr2 (14-269)||(27428540-27428796)
chr2 (14-269)||(27782124-27782380)
chr2 (14-269)||(28888171-28888427)
chr2 (14-261)||(37383569-37383818)
chr2 (14-269)||(3788386-3788642)
chr2 (14-261)||(19450529-19450777)
chr2 (14-261)||(34269023-34269270)
chr2 (14-261)||(34297049-34297296)
chr2 (14-261)||(9344089-9344337)
chr2 (14-269)||(13930640-13930896)
chr2 (14-269)||(37931264-37931520)
chr2 (14-269)||(37945960-37946216)
chr2 (14-269)||(20843805-20844061)
chr2 (14-261)||(39895960-39896209)
chr2 (14-269)||(254746-255002)
chr2 (14-269)||(16167370-16167626)
chr2 (14-269)||(23122666-23122923)
chr2 (14-261)||(31882179-31882427)
chr2 (14-261)||(39045924-39046172)
chr2 (14-174)||(31887682-31887843)
chr2 (169-269)||(31868879-31868979)
chr2 (14-106)||(27821881-27821974)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (14-269)||(11932-12186)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (14-261)||(9753-10000)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (14-269)||(15463-15719)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (14-261)||(271-519)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (14-261)||(9040-9288)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (14-269)||(9808-10064)
scaffold0143 (14-269)||(33191-33448)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (16-263)||(25011-25259)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (14-261)||(13843-14092)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (14-261)||(4716-4967)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (14-261)||(18479-18728)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (14-269)||(5960-6217)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (14-269)||(25005-25262)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (48-263)||(26243-26458)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (21-257)||(40759-41008)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16618895 - 16618640
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16618895 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctt 16618796  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16618795 ctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 16618696  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16618695 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 16618640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 32296486 - 32296742
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32296486 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatttgcagctgttaatgaccattttcatcagaagtt 32296585  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296586 tctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 32296685  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296686 gtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 32296742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29143160 - 29142904
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  29143160 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 29143061  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143060 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 29142961  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142960 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 29142904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4341080 - 4340823
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa-gt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  4341080 caaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggccaaccactgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagc 4340981  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 4340823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 4629642 - 4629898
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  4629642 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 4629741  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4629742 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgttaatcc 4629841  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629842 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 4629898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 8217489 - 8217745
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  8217489 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 8217588  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8217589 cctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatcc 8217688  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217689 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 8217745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 28027148 - 28027396
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  28027148 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 28027247  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027248 tctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 28027347  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027348 gtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 28027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 4422776 - 4423031
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |     
T  4422776 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcgaaagctc 4422875  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4422876 ctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 4422975  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4422976 tggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgctt 4423031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 16422041 - 16422295
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgg-caaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  16422041 caaaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctgggccaaccaccgttcccttagggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 16422139  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16422140 tctgtgcttgcgaattcaaagtttcc-ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 16422238  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422239 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 16422295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22381982 - 22381735
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  22381982 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatca-aagct 22381884  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381883 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 22381784  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381783 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 22381735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28110359 - 28110102
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  28110359 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 28110260  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28110259 tctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttatgaatc 28110160  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110159 cgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 28110102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 21680558 - 21680814
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  21680558 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttggggtatctgcagctgttaatgaccattttcatctgaagct 21680657  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680658 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 21680757  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680758 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 21680814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 24334030 - 24334286
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  24334030 caaaaatgagaatgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 24334129  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    || |   ||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334130 tccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 24334229  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334230 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 24334286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31958860 - 31958604
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  31958860 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtgactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 31958761  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    || |   ||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958760 tccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 31958661  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958660 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 31958604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17979356 - 17979098
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccctt--ggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa-g 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17979356 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttgggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaag 17979257  T
Q  111 tttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 210  Q
     |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979256 cttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 17979157  T
Q  211 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17979156 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgctt 17979098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 19700344 - 19700599
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  19700344 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatcaggccaaccaccgttcccttggggcgtctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctc 19700443  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19700444 ctatgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 19700543  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19700544 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgctt 19700599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5603718 - 5603462
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  5603718 caaaaatgagattgaagcaaaaggcaagtgactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 5603619  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    || |   ||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603618 tccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 5603519  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603518 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 5603462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 10402006 - 10402262
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  10402006 caaaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgctgctgttaatgactatcttcatcaaaagct 10402105  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10402106 cctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 10402205  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10402206 gtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 10402262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15735498 - 15735242
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||      
T  15735498 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcc 15735399  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     |   ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735398 ccaacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 15735299  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15735298 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 15735242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17971267 - 17971011
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  17971267 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgtcaatgaccgtcttcatcaaaagct 17971168  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971167 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 17971068  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17971067 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 17971011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18286757 - 18286501
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18286757 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatttgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 18286658  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | ||||||  |||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18286657 cttatgcttgcaaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 18286558  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18286557 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 18286501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18302058 - 18301802
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18302058 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatttgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 18301959  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | ||||||  |||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18301958 cttatgcttgcaaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 18301859  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18301858 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 18301802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 28345028 - 28345284
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  28345028 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 28345127  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    || |   ||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345128 tccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 28345227  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28345228 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgctt 28345284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29659371 - 29659115
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  29659371 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 29659272  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659271 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 29659172  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29659171 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 29659115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 32445011 - 32445259
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  32445011 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 32445110  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||| | ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32445111 cttatgctcgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 32445210  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445211 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 32445259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 6207757 - 6208014
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  6207757 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 6207856  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6207857 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 6207956  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6207957 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgctt 6208014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5472845 - 5473101
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5472845 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtagctatacctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 5472944  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472945 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 5473044  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5473045 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 5473101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6537146 - 6536898
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6537146 caaaaatgagatcgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 6537047  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6537046 cttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 6536947  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536946 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 6536898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8283872 - 8283624
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  8283872 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcgaaagct 8283773  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283772 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 8283673  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283672 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 8283624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 18231050 - 18231306
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |    
T  18231050 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctaaagct 18231149  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18231150 cctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatcc 18231249  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231250 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 18231306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22865249 - 22865001
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22865249 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatcggcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 22865150  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22865149 cttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 22865050  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22865049 gtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagc 22865001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22880308 - 22880060
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22880308 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatcggcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 22880209  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22880208 cttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 22880109  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22880108 gtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagc 22880060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31030641 - 31030385
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  31030641 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 31030542  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31030541 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 31030442  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31030441 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgctt 31030385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 35886621 - 35886878
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  35886621 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 35886720  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35886721 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 35886820  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35886821 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 35886878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 4727490 - 4727738
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  4727490 caaaaatgggattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 4727589  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4727590 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 4727689  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727690 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4727738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5727835 - 5728091
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  5727835 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 5727934  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727935 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 5728034  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728035 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 5728091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 18248595 - 18248851
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  18248595 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 18248694  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18248695 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatcc 18248794  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18248795 gtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgctt 18248851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20571249 - 20570993
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  20571249 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccgaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 20571150  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571149 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 20571050  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20571049 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgctt 20570993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 7079081 - 7079327
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||      
T  7079081 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctattaatgaccatcttcatcaaaagcg 7079180  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      ||  |||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7079181 aatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 7079278  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079279 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 7079327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 18336485 - 18336734
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  18336485 caaaaatgagattgaaacgaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 18336584  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     || | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18336585 cctatacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 18336684  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18336685 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagc 18336734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Original strand, 4689509 - 4689765
Alignment:
Q  15 aaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |     
T  4689509 aaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggccaaccaccatcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctc 4689608  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  4689609 ctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatcc 4689708  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4689709 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 4689765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5590764 - 5590508
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  5590764 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgccgccgttgatgactatcttcatctaaagct 5590665  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5590664 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 5590565  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5590564 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 5590508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5716925 - 5717181
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  5716925 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 5717024  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717025 cctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 5717124  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717125 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 5717181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5764533 - 5764277
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  5764533 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 5764434  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764433 cctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 5764334  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764333 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 5764277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 10648928 - 10649184
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  10648928 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttgggacatctgctgctgttaatgactatcttcatctaaagct 10649027  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649028 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 10649127  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649128 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 10649184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11104765 - 11104509
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  11104765 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgctgttaatgactatcttcatctaaagct 11104666  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| || ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104665 cctacgcttgcgagttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 11104566  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11104565 gtggagccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 11104509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 47029310 - 47029566
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||   | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||| |    
T  47029310 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccggctcccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatctaaagct 47029409  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029410 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 47029509  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029510 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 47029566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Original strand, 48471788 - 48472032
Alignment:
Q  18 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttctg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||     
T  48471788 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagttccta 48471887  T
Q  117 tgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 216  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  48471888 cgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatgg 48471987  T
Q  217 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48471988 agtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagc 48472032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 18057117 - 18057367
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  18057117 caaaaatgagattaaaacaaaaggcaagtaactatatccggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 18057216  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18057217 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 18057316  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057317 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 18057367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 51787879 - 51788135
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  51787879 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgctgttaatgactatcttcatctaaagct 51787978  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787979 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 51788078  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51788079 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 51788135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4791037 - 4790788
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  4791037 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccgccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 4790938  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4790937 cctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 4790838  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790837 cgtggattcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4790788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 20071892 - 20072146
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||      
T  20071892 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcg 20071991  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      ||  |||| |||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20071992 aatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 20072089  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20072090 gtggagtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgctt 20072146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 5019570 - 5019818
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  5019570 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttgggacatctgctgctgttaatgactatcttcatctaaagct 5019669  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5019670 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 5019769  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5019770 gtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagc 5019818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5657992 - 5658249
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  5657992 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagccaaccaccgttccctgggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 5658091  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
     | |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5658092 ttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 5658191  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  5658192 tggagtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgctt 5658249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15887109 - 15886894
Alignment:
Q  15 aaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  15887109 aaaaatgagattgaaacgagaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 15887010  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatc 211  Q
     | |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15887009 ttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatc 15886910  T
Q  212 cgtggagtcacgcctt 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  15886909 cgtggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 8002417 - 8002607
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  8002417 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttgggacatctgctgctgttaatgactatcttcatctaaagct 8002516  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 203  Q
     ||  ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002517 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27561101 - 27561022
Alignment:
Q  184 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacca-ctcttatacatcaatttgagcct 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | || ||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27561101 aattaccattttccaaactttgtg-atctgtggtgccaagccttcggctggctaccatctcttttaaatcaatttgagcct 27561022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3541 - 3285
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3541 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagtt 3442  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3441 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 3342  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3341 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 3285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27284668 - 27284421
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  27284668 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagctt 27284569  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284568 ctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 27284469  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284468 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 27284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27624015 - 27623760
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27624015 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtctccatcagaagctt 27623916  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623915 ctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 27623816  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623815 tggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 27623760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22929189 - 22928934
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  22929189 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccattcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagctt 22929090  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22929089 ctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcca 22928990  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22928989 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgctt 22928934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 29555449 - 29555697
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29555449 caaaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctattaatgaccatcttcatcagaagtt 29555548  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29555549 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29555648  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555649 gtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 29555697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8900006 - 8899750
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  8900006 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 8899907  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899906 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 8899807  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899806 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 8899750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26110717 - 26110469
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26110717 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttgggacatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 26110618  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||  |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110617 tctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 26110518  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110517 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 26110469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13518500 - 13518245
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  13518500 caaaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 13518401  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518400 ctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 13518301  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518300 tggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 13518245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 27200077 - 27200326
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27200077 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 27200176  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200177 tctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 27200276  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27200277 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 27200326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26772935 - 26772687
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26772935 caaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 26772836  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||  |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772835 tctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 26772736  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772735 gtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 26772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 28166385 - 28166641
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  28166385 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 28166484  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166485 cctacgcttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 28166584  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28166585 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgctt 28166641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27249157 - 27248907
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccctt--ggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27249157 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttgggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagc 27249058  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaat 210  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27249057 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 27248958  T
Q  211 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27248957 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 27248907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 16755711 - 16755959
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  16755711 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 16755810  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755811 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 16755910  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16755911 gtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagc 16755959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 27025036 - 27025292
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  27025036 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 27025135  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27025136 cctacgcttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 27025235  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27025236 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 27025292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 4763655 - 4763910
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |     
T  4763655 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcgaaagctc 4763754  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4763755 ctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 4763854  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4763855 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgctt 4763910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Original strand, 24869602 - 24869857
Alignment:
Q  15 aaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  24869602 aaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 24869701  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
     | |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24869702 ttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 24869801  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24869802 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 24869857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 26791707 - 26791955
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26791707 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 26791806  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26791807 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 26791906  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26791907 gtggaatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagc 26791955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27356418 - 27356162
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  27356418 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 27356319  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356318 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 27356219  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27356218 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 27356162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33370738 - 33370482
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  33370738 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 33370639  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370638 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 33370539  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33370538 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 33370482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 27030913 - 27031170
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcac--aatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||     
T  27030913 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccgttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagc 27031012  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27031013 tcctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 27031112  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27031113 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 27031170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 27491024 - 27491272
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  27491024 caaaaatgagattgaaacagaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 27491123  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || | ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491124 cctatacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 27491223  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491224 gtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 27491272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 4778771 - 4779020
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |    
T  4778771 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctaaagct 4778870  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4778871 cctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4778970  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778971 cgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4779020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 4531179 - 4531427
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  4531179 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 4531278  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531279 tctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 4531378  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4531379 gtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagc 4531427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13293252 - 13293004
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  13293252 caaaaaggagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgcctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 13293153  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293152 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 13293053  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293052 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 13293004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14139701 - 14139453
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  14139701 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagct 14139602  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14139601 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 14139502  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14139501 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 14139453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24300062 - 24299806
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  24300062 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 24299963  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24299962 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 24299863  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24299862 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 24299806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 27013624 - 27013872
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  27013624 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagct 27013723  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27013724 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 27013823  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27013824 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 27013872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4540066 - 4539817
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  4540066 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 4539967  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4539966 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4539867  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4539866 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 4539817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 26926661 - 26926915
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||      
T  26926661 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatccgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcg 26926760  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      ||  |||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26926761 aatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 26926858  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26926859 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 26926915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 27063372 - 27063629
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaa-ggcaagtaactatatctggcaaatca-caatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||     
T  27063372 caaaaatgagattgaaacaaaaaggcaagtaactatatctggctaaccatcgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaagagc 27063471  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    |  | |||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27063472 tcttatgcttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 27063571  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27063572 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 27063629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 28213345 - 28213594
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  28213345 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 28213444  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213445 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 28213544  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28213545 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 28213594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 29507307 - 29507555
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  29507307 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaaataactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatatgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 29507406  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29507407 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29507506  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507507 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 29507555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16938332 - 16938075
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |    
T  16938332 caaaaatgagattgaaataaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatggccatctccatctgaagct 16938233  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    | ||| |||| |||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938232 tttgtacttgcgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16938133  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16938132 cgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 16938075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 16680030 - 16680278
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactata-tctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  16680030 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactataatctggccaaccaccgttcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 16680129  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16680130 cctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatcc 16680229  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16680230 gtggagtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagc 16680278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 29578906 - 29579162
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  29578906 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgccgccgttgatgactatcttcatctaaagct 29579005  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579006 cctacacttgcaaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 29579105  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29579106 gtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 29579162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34458813 - 34458557
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  34458813 caaaaacgagattgaaatgaaaggcaagtaactatatctggccaaccgccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 34458714  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458713 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 34458614  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34458613 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 34458557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15406836 - 15406579
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||      
T  15406836 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatggccatcttcatcaaaagcc 15406737  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||| | ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15406736 cctacgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 15406637  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15406636 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 15406579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15418623 - 15418366
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||      
T  15418623 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatggccatcttcatcaaaagcc 15418524  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||| | ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15418523 cctacgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 15418424  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15418423 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 15418366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30552323 - 30552051
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat--------------cccctt--ggggcatctgcagctgttaatgaccg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |              ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30552323 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtggctaaccaccgtcccccttggggggcatctgcagctgttaatgaccg 30552224  T
Q  98 tcttcatc-agaagtttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttc 196  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552223 tcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttc 30552124  T
Q  197 caagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30552123 caagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgctt 30552051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23851634 - 23851450
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  23851634 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccattcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagctt 23851535  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 198  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851534 ctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 27208848 - 27209043
Alignment:
Q  66 ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27208848 ccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaa 27208947  T
Q  166 tgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27208948 tgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 27209043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27240380 - 27240185
Alignment:
Q  66 ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27240380 ccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaa 27240281  T
Q  166 tgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240280 tgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 27240185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Original strand, 20174441 - 20174696
Alignment:
Q  15 aaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||| | |||| |||    ||  |  ||||||| | |    
T  20174441 aaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatttctagcaagtcaccatcccctttaggcatctgtaactgtcaatagttgttcttgtcagaagctac 20174540  T
Q  115 tgtgcttgtgaattcaaagtt-tccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    |   |||||||||||||| |  |  |||||||  |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20174541 tacacttgtgaattcaaaatgctaaaggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcca 20174640  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20174641 tggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgctt 20174696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22161550 - 22161295
Alignment:
Q  15 aaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||| | |||| |||    ||  |  ||||||| | |    
T  22161550 aaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatttctagcaagtcaccatcccctttaggcatctgtaactgtcaatagttgttcttgtcagaagctac 22161451  T
Q  115 tgtgcttgtgaattcaaagtt-tccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    |   |||||||||||||| |  |  |||||||  |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22161450 tacacttgtgaattcaaaatgctaaaggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcca 22161351  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22161350 tggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgctt 22161295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666716
Alignment:
Q  203 ttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 26666716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4718442 - 4718349
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  4718442 caaaaataagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctattaatgcctatcttcatca 4718349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Original strand, 27184819 - 27184860
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184819 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27184860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 27264421 - 27264380
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27264421 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggc 27264380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21892108 - 21891852
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  21892108 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagct 21892009  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892008 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 21891909  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21891908 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 21891852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20334776 - 20334531
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  20334776 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagctt 20334677  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  20334676 ctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagccttgtaaatcca 20334577  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttga 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334576 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttga 20334531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 20466675 - 20466929
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20466675 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaac-atatttggcaaatcaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctt 20466773  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    || ||||||  ||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20466774 ctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 20466873  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20466874 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 20466929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16202393 - 16202139
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  16202393 caaaaatgagattgaaacaga-ggcaagtaactatatctggccaaccaccatcctcttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctc 16202295  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16202294 ctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 16202195  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16202194 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 16202139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 3647042 - 3647298
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  3647042 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 3647141  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3647142 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 3647241  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647242 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 3647298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 10968561 - 10968817
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  10968561 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 10968660  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968661 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 10968760  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968761 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 10968817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 51644116 - 51644372
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||| |    
T  51644116 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgtcaatgcctatcttcatcaaaagct 51644215  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51644216 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 51644315  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51644316 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgctt 51644372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 10950987 - 10951243
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  10950987 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 10951086  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10951087 cctacacttgcggattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatct 10951186  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951187 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 10951243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41787671 - 41787422
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  41787671 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttggggcatctacagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 41787572  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41787571 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 41787472  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787471 cgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 41787422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 28590979 - 28591227
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||  |    
T  28590979 caaaaatgagattgaaataaaaggcaagtagctatatctggccgaccaccgtcccccttggggcatttgcagctgttaatgactatcttcatcaaaaact 28591078  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591079 cctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 28591178  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591179 gtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 28591227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 269
Target Start/End: Original strand, 28155636 - 28155878
Alignment:
Q  26 tgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttctgtgcttgtg 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    ||  |||| |    
T  28155636 tgaaacaaaagacaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcgaatg--cttgcg 28155733  T
Q  125 aattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28155734 aattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 28155833  T
Q  225 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28155834 cttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgctt 28155878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 22894318 - 22894573
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22894318 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaactaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctt 22894417  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22894418 ctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 22894517  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894518 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 22894573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37746587 - 37746332
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  37746587 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctc 37746488  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
     | |||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37746487 ttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 37746388  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746387 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 37746332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 3795439 - 3795695
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||      
T  3795439 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgctgttaatgactatcttcatctaaagcc 3795538  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 3795695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 33298434 - 33298690
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  33298434 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 33298533  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298534 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 33298633  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298634 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 33298690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 33881028 - 33881283
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  33881028 caaaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 33881127  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881128 ctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 33881227  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881228 tggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 33881283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28954040 - 28953784
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  28954040 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatccggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatctgaagct 28953941  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28953940 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 28953841  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953840 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 28953784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 24729871 - 24730127
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  24729871 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 24729970  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729971 cctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 24730070  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24730071 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 24730127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 28655143 - 28655399
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  28655143 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaactaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 28655242  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655243 cctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 28655342  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28655343 gtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 28655399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37352904 - 37352648
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  37352904 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactgtcttcatcaaaagct 37352805  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352804 tctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 37352705  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37352704 gtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 37352648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15753111 - 15752864
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  15753111 caaaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 15753012  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753011 ctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 15752912  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752911 tggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 15752864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 30035328 - 30035583
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  30035328 caaaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 30035427  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30035428 ctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 30035527  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30035528 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 30035583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 9323378 - 9323635
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9323378 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtt 9323477  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323478 tctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 9323577  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9323578 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 9323635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 26486297 - 26486554
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26486297 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtt 26486396  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486397 tctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 26486496  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26486497 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 26486554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 11555255 - 11555503
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  11555255 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 11555354  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555355 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 11555454  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555455 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 11555503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18495027 - 18494771
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  18495027 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 18494928  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494927 cctatgctggcgaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 18494828  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18494827 gtggagtcacgccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgctt 18494771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31820668 - 31820412
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  31820668 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 31820569  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820568 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 31820469  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31820468 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 31820412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 33783388 - 33783644
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  33783388 caaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 33783487  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33783488 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 33783587  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33783588 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 33783644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 6880204 - 6880461
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |    
T  6880204 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcaactgttaatgaccatcttcatctgaatct 6880303  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880304 tctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 6880403  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6880404 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 6880461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 33522280 - 33522539
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccctt---ggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33522280 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaa 33522379  T
Q  110 gtttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaa 209  Q
    | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522380 gcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaa 33522479  T
Q  210 tccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33522480 tccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgctt 33522539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 11329538 - 11329794
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  11329538 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgctgttaatgactatcttcatcaaaagct 11329637  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329638 cctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 11329737  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11329738 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgctt 11329794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32590535 - 32590279
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  32590535 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 32590436  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32590435 tctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaattc 32590336  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32590335 gtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 32590279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37665746 - 37665498
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37665746 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 37665647  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37665646 cttatgcttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 37665547  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665546 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 37665498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 23897776 - 23898023
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  23897776 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgttcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 23897875  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    || |||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  23897876 ctatgcttccgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattca 23897975  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897976 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 23898023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 12138077 - 12138334
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12138077 caaaaatgagattgaaacaaaagacaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtt 12138176  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138177 tctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 12138276  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12138277 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 12138334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13181049 - 13180792
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  13181049 caaaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 13180950  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
      |  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13180949 catacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 13180850  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180849 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 13180792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9544968 - 9544713
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  9544968 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctacagctgttaatgaccattttcatcaaaagct 9544869  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9544868 cttatgcttgcgaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 9544770  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9544769 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 9544713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18122676 - 18122428
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  18122676 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagct 18122577  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18122576 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 18122477  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122476 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 18122428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22993376 - 22993128
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |    
T  22993376 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcacccttggggcatctgcagctgttaatgactatcctcatcaaaagct 22993277  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22993276 cctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 22993177  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993176 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 22993128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 25206180 - 25206435
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  25206180 caaaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctggccaaccaccatcccgttggggcatctacagctgttaatgaccatcttcatcagaagctc 25206278  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    || || ||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25206279 ctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 25206378  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25206379 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 25206435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 25270336 - 25270591
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  25270336 caaaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctggccaaccaccatcccgttggggcatctacagctgttaatgaccatcttcatcagaagctc 25270434  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    || || ||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25270435 ctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 25270534  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25270535 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 25270591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 37760883 - 37761139
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  37760883 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttgggacatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 37760982  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37760983 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 37761082  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761083 gcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 37761139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 41680605 - 41680861
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  41680605 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 41680704  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680705 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 41680804  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680805 gtggagtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 41680861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13436941 - 13436691
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttca-tcagaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||     
T  13436941 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcaatcaaaagc 13436842  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 210  Q
    | || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13436841 tcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 13436742  T
Q  211 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436741 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 13436691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13319087 - 13318839
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  13319087 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 13318988  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      |  ||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13318987 catacgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 13318888  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318887 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 13318839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18369792 - 18369536
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||  |    
T  18369792 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccactgtcccccttggggcatttgcagctgttaatgactatcttcatcaaaaact 18369693  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369692 cctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 18369593  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18369592 gtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgctt 18369536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 23631870 - 23632118
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  23631870 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 23631969  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23631970 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatcc 23632069  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23632070 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagc 23632118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 24608147 - 24608395
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |     
T  24608147 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtccccttggggcgtctgcagctactaatgaccatcttcatcaaaagctc 24608246  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24608247 ctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 24608346  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608347 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 24608395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 24975750 - 24976006
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  24975750 caaaaatgagattgaaacgagaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 24975849  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||| | |||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24975850 cctatgctcgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 24975949  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24975950 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgctt 24976006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 31437365 - 31437613
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  31437365 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagct 31437464  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31437465 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 31437564  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31437565 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 31437613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 30940537 - 30940794
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  30940537 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 30940636  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  30940637 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatc 30940736  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30940737 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgctt 30940794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 34622419 - 34622668
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |    
T  34622419 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctaaagct 34622518  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34622519 cctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatc 34622618  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622619 cgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 34622668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 2516966 - 2517214
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||| |    
T  2516966 caaaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgtcaatgcctatcttcatcaaaagct 2517065  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517066 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 2517165  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517166 gtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 2517214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15653018 - 15652770
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  15653018 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccgaccaccgtctccctcggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 15652919  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15652918 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 15652819  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652818 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 15652770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 30174366 - 30174622
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  || |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||  ||| |    
T  30174366 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcggctgttaatgcctatcttcatctaaagct 30174465  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174466 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 30174565  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174566 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 30174622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8659732 - 8659479
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaagg-caagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8659732 caaaaatgagattgaaacaagagggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagc 8659633  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8659632 tcttgtacttgtgaattcaaagtttcg-ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatc 8659534  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8659533 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttg 8659479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 30157934 - 30158183
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa-gt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  30157934 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgttccccttgaggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagc 30158033  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    || ||| || ||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158034 ttatgtactcgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30158133  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30158134 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagc 30158183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40467813 - 40467565
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  40467813 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 40467714  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  40467713 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatcc 40467614  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467613 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 40467565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5643703 - 5643957
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||      
T  5643703 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgttccccttggggcatctgcagctgttaatgcccattttcatcaaaagcg 5643802  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      ||  |||| |||||||||||| | ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5643803 aatg--cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatcc 5643900  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5643901 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 5643957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 43084159 - 43084415
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatca-caatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |   ||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |    
T  43084159 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgcccccctgggggcatctgctgctgttaatgattatcttcatcaaaagct 43084258  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||| | ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084259 cctatgctggcgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 43084358  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43084359 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgctt 43084415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 16047208 - 16047462
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16047208 caaaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctgggcaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctt 16047306  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16047307 ctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 16047406  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047407 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 16047462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 11446779 - 11447027
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11446779 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 11446878  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446879 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 11446978  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446979 gtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 11447027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5141581 - 5141325
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  5141581 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 5141482  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141481 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 5141382  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141381 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 5141325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16444247 - 16443994
Alignment:
Q  16 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| || |    
T  16444247 aaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaacgaccatcttcgtctgaagcttat 16444148  T
Q  116 gtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16444147 gtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 16444048  T
Q  216 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444047 gagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 16443994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16745767 - 16745511
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  16745767 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 16745668  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745667 tctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 16745568  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16745567 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 16745511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 26518684 - 26518940
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  26518684 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 26518783  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518784 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 26518883  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26518884 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 26518940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 26441144 - 26441400
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |    
T  26441144 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcgtctgaagct 26441243  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441244 tctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 26441343  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441344 gtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 26441400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31558639 - 31558384
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |     
T  31558639 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcgaaagctc 31558540  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31558539 ctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 31558440  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31558439 tggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgctt 31558384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 4205280 - 4205537
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatca-caatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  4205280 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccatcgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 4205379  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaag-tttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205380 tctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4205479  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4205480 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 4205537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4139493 - 4139237
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  4139493 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatacctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 4139394  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    || |   ||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139393 tccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 4139294  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139293 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 4139237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 5153975 - 5154223
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  5153975 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 5154074  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5154075 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 5154174  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154175 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 5154223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 10847474 - 10847730
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaac-aaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  10847474 caaaaatgagattgaaatgaaaagacaaatgactgtatctggcaaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgatcatcttcatcagaagct 10847573  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10847574 tctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatcc 10847673  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10847674 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgctt 10847730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24586781 - 24586524
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |    
T  24586781 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgttccccttgaggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaatct 24586682  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586681 tctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 24586582  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24586581 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 24586524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26314094 - 26313837
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26314094 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtt 26313995  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313994 tctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 26313895  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26313894 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 26313837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31084869 - 31084620
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  31084869 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 31084770  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084769 tctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 31084670  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084669 cgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagc 31084620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 45393109 - 45393358
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa-gt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  45393109 caaaaatgagattgaaacaaagggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagc 45393208  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    || ||| |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393209 ttatgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 45393308  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45393309 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagc 45393358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 5164275 - 5164523
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  5164275 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 5164374  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164375 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 5164474  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164475 gtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 5164523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16512680 - 16512424
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  16512680 caaaaatgagattgaaacgagaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 16512581  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16512580 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 16512481  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16512480 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgctt 16512424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 2160462 - 2160717
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |     
T  2160462 caaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctagccaaccaccattcccttggggcatctgcagctattaatgaccatcttcatcaaaagctc 2160561  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2160562 ctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 2160661  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2160662 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 2160717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26269335 - 26269079
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  26269335 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttgggacatctgctgctgttaatgactatcttcatcaaaagct 26269236  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26269235 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 26269136  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26269135 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 26269079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 2779143 - 2779391
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  2779143 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagct 2779242  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2779243 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 2779342  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2779343 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 2779391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 3451209 - 3451457
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  3451209 caaaaaggaggttgaaacaaaaggcaagtaactatatccggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcctcatctgaagct 3451308  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3451309 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatcc 3451408  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451409 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 3451457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11419025 - 11418769
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| |    
T  11419025 caaaaaagagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtctcccttagggcatctgcagctgttcatgactatcttcatcaaaagct 11418926  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || ||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11418925 cctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 11418826  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11418825 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgctt 11418769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 31129796 - 31130044
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  31129796 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagct 31129895  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31129896 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 31129995  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31129996 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 31130044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26664159 - 26663907
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||| |    
T  26664159 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatctaaagct 26664060  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664059 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 26663960  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagccttt 265  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663959 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagccttt 26663907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26509943 - 26509686
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  26509943 caaaaacgagattgaaacgaaaggcaagtaactatatctggccaaccgccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 26509844  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
      | |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26509843 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 26509744  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26509743 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 26509686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 45737194 - 45737448
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||      
T  45737194 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcg 45737293  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      ||  |||| |||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45737294 aatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 45737391  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45737392 gtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgctt 45737448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26679351 - 26679099
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |  ||| |    
T  26679351 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcacctaaagct 26679252  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679251 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 26679152  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagccttt 265  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679151 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagccttt 26679099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 39207385 - 39207129
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  39207385 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgctgttaatgactatcttcatctaaagct 39207286  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207285 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 39207186  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39207185 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 39207129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10911166 - 10910910
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||| |    
T  10911166 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgccgctgttaacgactatcttcatcaaaagct 10911067  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10911066 cctacgcttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 10910967  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10910966 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 10910910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26532116 - 26531926
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  26532116 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 26532017  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 203  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532016 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16732776 - 16732684
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16732776 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatc 16732684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 269
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26595815
Alignment:
Q  204 tgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 26595815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 2104407 - 2104357
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2104407 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaa 2104357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 1906158 - 1906413
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  1906158 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctc 1906257  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  1906258 atgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtatatctg 1906357  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1906358 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgctt 1906413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 15233722 - 15233977
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  15233722 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcataagctt 15233821  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
     |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15233822 ttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 15233921  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233922 tagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 15233977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 54839297 - 54839552
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  54839297 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtccccttggggcatctgcagttgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 54839396  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54839397 ctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 54839496  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54839497 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 54839552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 30759669 - 30759925
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  30759669 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 30759768  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759769 cctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 30759868  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30759869 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 30759925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 14104449 - 14104696
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  14104449 caaaaatgagattgaagcaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 14104548  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104549 ctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 14104648  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104649 tggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 14104696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 6575767 - 6576015
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  6575767 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 6575866  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || ||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6575867 cctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 6575966  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575967 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 6576015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14753853 - 14753597
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14753853 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatttgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 14753754  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14753753 cttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 14753654  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14753653 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 14753597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33668161 - 33667905
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  33668161 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaaggaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 33668062  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668061 cctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 33667962  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33667961 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 33667905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 39856542 - 39856798
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  39856542 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactgtatctggccaaccaccgtcccccttggggtatctgcagctgttaatgaccattttcatctgaagct 39856641  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856642 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 39856741  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856742 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 39856798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15276992 - 15276736
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaac-aaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | | | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15276992 caaaaatgagattgaaatgaaaagactaatgactgtatctggcaaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagct 15276893  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15276892 tctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatcc 15276793  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15276792 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgctt 15276736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 21975606 - 21975856
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccctt---ggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21975606 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaa 21975705  T
Q  110 gtttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaa 209  Q
    | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975706 gcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaa 21975805  T
Q  210 tccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975806 tccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 21975856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5011782 - 5012039
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  5011782 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttgaggcatctgcagctgttaatgaccattttcatctgaagct 5011881  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5011882 tctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 5011981  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5011982 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 5012039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 17018957 - 17019214
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  17018957 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 17019056  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17019057 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 17019156  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17019157 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgctt 17019214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18794977 - 18794721
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  18794977 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 18794878  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  || || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794877 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 18794778  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794777 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgctt 18794721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36338878 - 36338630
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  36338878 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagct 36338779  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338778 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 36338679  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338678 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 36338630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 14670921 - 14671171
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  14670921 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 14671020  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14671021 cctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 14671120  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671121 cgtggagttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 14671171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 5700445 - 5700694
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcc-ccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5700445 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcctccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 5700544  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
      | |||||| |||||||||||||   |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5700545 cttatgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 5700644  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700645 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 5700694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24586722 - 24586465
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  24586722 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 24586623  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24586622 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 24586523  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586522 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 24586465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15380598 - 15380342
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaac-aaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||  |||||  || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  15380598 caaaaatgagattgaaatgaaaagagaaatgactatatctggcaaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatccgaagct 15380499  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15380498 tttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatcc 15380399  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15380398 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgctt 15380342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20332783 - 20332527
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  20332783 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 20332684  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332683 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 20332584  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332583 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 20332527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31120874 - 31120615
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccctt---ggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31120874 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggggtatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaa 31120775  T
Q  110 gtttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaa 209  Q
    | |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31120774 gcttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaa 31120675  T
Q  210 tccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31120674 tccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgctt 31120615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34183322 - 34183074
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |    
T  34183322 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatctccatcaaaagct 34183223  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34183222 cttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 34183123  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34183122 gtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagc 34183074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40099997 - 40099745
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||| |    
T  40099997 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatctaaagct 40099898  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099897 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 40099798  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagccttt 265  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099797 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagccttt 40099745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27157675 - 27157418
Alignment:
Q  15 aaaaatgagattgaaacaaaa-ggcaagtaactatatctggcaaatcacaat--ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     ||||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||| |||     
T  27157675 aaaaatgagattgaaacaaaaaggcaagtaactatatctggccaaccacccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatcaaaagc 27157576  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157575 tcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 27157476  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157475 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 27157418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 24118567 - 24118816
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactata-tctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaa-tgaccgtcttcatcagaagt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24118567 caaaaatgagattgaaacgaaaggcaagtaactataatatggccaaccaccgttcccttggggcatctgcagctgttaaatgaccgtcctcatcaaaagc 24118666  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    |  | |||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24118667 tcttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 24118766  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118767 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 24118816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674021
Alignment:
Q  125 aattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 224  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  225 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 1674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18311539 - 18311414
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatc-agaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  18311539 caaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggccaaccactgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagc 18311440  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttc 137  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18311439 ttctgtacttgtggattcaaagtttc 18311414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324421
Alignment:
Q  198 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 36324421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 1551 - 1808
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1551 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagttgttaatgaccatcttcatcagaagtt 1650  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1651 tctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 1750  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1751 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 1808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 11941 - 12197
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11941 caaaaatgagattgaaacaaaagacaagtaactatatctggccaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctt 12040  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12041 ctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcca 12140  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaa-tttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12141 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgctt 12197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27603228 - 27602973
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  27603228 caaaaacgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccctttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagctt 27603129  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603128 ctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 27603029  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27603028 tggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgctt 27602973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 29835217 - 29835473
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||      
T  29835217 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcc 29835316  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835317 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29835416  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29835417 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 29835473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 19680342 - 19680599
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  19680342 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatacctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 19680441  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680442 tctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 19680541  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19680542 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 19680599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 16260117 - 16260373
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16260117 caaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttagggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 16260216  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16260217 tctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 16260316  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260317 gcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 16260373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 44566875 - 44567131
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |     
T  44566875 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctc 44566974  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttcc-aggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44566975 ctacgcttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 44567074  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44567075 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgctt 44567131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19202686 - 19202429
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19202686 caaaaatgagattgaaacacaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtt 19202587  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagt-ttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202586 tctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 19202487  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19202486 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 19202429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 22138801 - 22139049
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  22138801 caaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 22138900  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22138901 ctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 22139000  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22139001 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 22139049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19655666 - 19655408
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  19655666 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 19655567  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat--aaaattaccattttccaagctttgtgaat 210  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19655566 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaat 19655467  T
Q  211 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19655466 ccgtggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 19655408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 19693989 - 19694246
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  19693989 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 19694088  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19694089 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 19694188  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19694189 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 19694246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28356275 - 28356018
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||  |    
T  28356275 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctacaactgttaatgaccatcttcatctgaatct 28356176  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356175 tctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 28356076  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356075 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 28356018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 31360422 - 31360678
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  31360422 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgctgttaatgactatcttcatctaaagct 31360521  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360522 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 31360621  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360622 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 31360678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31484194 - 31483938
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |    
T  31484194 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttgatgaccatcttcatctgaagct 31484095  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||     ||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484094 tccacatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 31483995  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483994 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 31483938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 33248260 - 33248508
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  33248260 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtctcccttggggcatttgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 33248359  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248360 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 33248459  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248460 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 33248508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21342493 - 21342234
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  21342493 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtgactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 21342394  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     || ||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21342393 cctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 21342294  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttct 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21342293 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttct 21342234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2131584 - 2131328
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  2131584 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccttcttcatcaaaagct 2131485  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2131484 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 2131385  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2131384 gtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 2131328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 15773468 - 15773716
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatca-caatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  15773468 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccatcgttccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 15773567  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15773568 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 15773667  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15773668 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagc 15773716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19911486 - 19911230
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  19911486 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgacgatcttcatcaaaagct 19911387  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19911386 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatcc 19911287  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19911286 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 19911230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 33264625 - 33264873
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  33264625 caaaaatgagattgaaacaaaaagcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttgggacatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 33264724  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| |||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33264725 cctatgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 33264824  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264825 gtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 33264873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12087046 - 12086797
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  12087046 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 12086947  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12086946 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 12086847  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12086846 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 12086797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 9360516 - 9360772
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  9360516 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttgggacatctgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagct 9360615  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360616 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 9360715  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9360716 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 9360772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 18796600 - 18796849
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |    
T  18796600 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttagggcatctgcagctattaatgaccatcttcatcaaaagct 18796699  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18796700 cctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatc 18796799  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796800 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 18796849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22075251 - 22075002
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaac-aaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  22075251 caaaaatgagattgaaatgaaaagacaaatgactgtatctggcaaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatct-catcagaagct 22075153  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    | |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22075152 tttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatcc 22075053  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22075052 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcct 22075002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 18715376 - 18715630
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||      
T  18715376 caaaaatgaggttgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcg 18715475  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      ||  |||| |||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18715476 aatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 18715573  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18715574 gtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgctt 18715630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 14569051 - 14569306
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |    
T  14569051 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaacgactatcttcatcaaaagct 14569150  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || || | | |||||||||||||   |||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569151 cctatgatggcgaattcaaagtttttgggaa-tgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 14569249  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14569250 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 14569306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21697524 - 21697270
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||    
T  21697524 caaaaatgagattgaaacaaa-ggcaagtaactatatctggccaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaatgaccaccttcatctaaagctt 21697426  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21697425 ctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 21697326  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21697325 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 21697270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11629530 - 11629278
Alignment:
Q  18 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttctg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  11629530 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctg 11629431  T
Q  117 tgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 216  Q
    | ||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629430 tacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 11629331  T
Q  217 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11629330 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 11629278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12710951 - 12710703
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  12710951 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatccggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctattaatgaccgtcttcatctgaagct 12710852  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710851 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 12710752  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710751 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 12710703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 34867575 - 34867831
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  34867575 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 34867674  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867675 cctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 34867774  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34867775 gtagagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 34867831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 40239401 - 40239657
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  40239401 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggtatctgcagctgttaatgaccattttcatctgaagct 40239500  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239501 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 40239600  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239601 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 40239657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 32055695 - 32055950
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  32055695 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtccccttggggcatctgcagctgttaataaccatcttcatcaaaagctc 32055794  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32055795 ctatgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 32055894  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32055895 tggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 32055950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21671523 - 21671266
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  21671523 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 21671424  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671423 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21671324  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21671323 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 21671266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37680243 - 37679986
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  37680243 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 37680144  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680143 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 37680044  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37680043 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 37679986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37695508 - 37695251
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  37695508 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagct 37695409  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695408 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 37695309  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37695308 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 37695251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 12592702 - 12592958
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  12592702 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 12592801  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592802 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 12592901  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592902 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 12592958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 12661431 - 12661679
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  12661431 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 12661530  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661531 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 12661630  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661631 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 12661679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 27809593 - 27809849
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  27809593 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 27809692  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809693 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 27809792  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809793 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 27809849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 34160736 - 34160984
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34160736 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 34160835  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34160836 cttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 34160935  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160936 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 34160984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19410837 - 19410580
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc--ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  19410837 caaaaatgagaatgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtccccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagc 19410738  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||| |   ||||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410737 ttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 19410638  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410637 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 19410580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16823690 - 16823431
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccctt---ggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16823690 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaa 16823591  T
Q  110 gtttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaa 209  Q
    | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823590 gcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaa 16823491  T
Q  210 tccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16823490 tccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgctt 16823431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 16897790 - 16898049
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccctt---ggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16897790 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaa 16897889  T
Q  110 gtttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaa 209  Q
    | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897890 gcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaa 16897989  T
Q  210 tccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16897990 tccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgctt 16898049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 27396215 - 27396471
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaac-aaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| | | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  27396215 caaaaatgagattgaaatgaaaagacaaatgattgtatctggcaaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagct 27396314  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27396315 tttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatcc 27396414  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27396415 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 27396471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22922491 - 22922239
Alignment:
Q  18 aatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttctg 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  22922491 aatgagattgaaacagaaggcaagtaactatatctggtcaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttccg 22922392  T
Q  117 tgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 216  Q
       ||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922391 catttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 22922292  T
Q  217 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922291 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 22922239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 27122417 - 27122673
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  27122417 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 27122516  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27122517 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 27122616  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27122617 gtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgctt 27122673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27428796 - 27428540
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |    
T  27428796 caaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctggtaatgaccatcttcatcaaaaact 27428697  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27428696 cttatgcttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 27428597  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27428596 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 27428540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 27782124 - 27782380
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  27782124 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 27782223  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782224 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 27782323  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27782324 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgctt 27782380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 28888171 - 28888427
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  28888171 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgacaatcttcatcaaaagct 28888270  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28888271 cttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 28888370  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28888371 gtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 28888427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 37383569 - 37383818
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  37383569 caaaaatgagattgaaaccaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 37383668  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383669 cctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 37383768  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383769 cgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 37383818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 3788386 - 3788642
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  3788386 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttgggacatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 3788485  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3788486 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatcc 3788585  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788586 gcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 3788642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19450777 - 19450529
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaac-aaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19450777 caaaaatgagattgaaatgaaaagacaaatgactgtatctggcaaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagct 19450678  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19450677 tctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatcc 19450578  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19450577 gtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagc 19450529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34269270 - 34269023
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  34269270 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagccaaccaccgttcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 34269171  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34269170 ccatgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccg 34269071  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34269070 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 34269023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 34297049 - 34297296
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |     
T  34297049 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaattatatctggccaaccaccgttcccttggggcatctgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctc 34297148  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
       |||||| |||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34297149 tcatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctg 34297248  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297249 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 34297296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9344337 - 9344089
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  9344337 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 9344238  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9344237 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 9344138  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344137 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 9344089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13930896 - 13930640
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  13930896 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 13930797  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930796 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 13930697  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930696 gtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 13930640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 37931264 - 37931520
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  || ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||| |    
T  37931264 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagtcaaccaccgtctcccttggagcatctgcagctgttaatgcctatcttcatctaaagct 37931363  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931364 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 37931463  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931464 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 37931520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37946216 - 37945960
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  37946216 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 37946117  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946116 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 37946017  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946016 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 37945960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 20843805 - 20844061
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  20843805 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 20843904  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20843905 -ctacgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 20844003  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20844004 cgtggagtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 20844061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 39895960 - 39896209
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |    
T  39895960 caaaaatgagattgaaacaagaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttgggacatctgcagctgttaatgaccatcgtcatctgaagct 39896059  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccagg-aaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| |||| |||||||||||||   || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39896060 tctgtacttgagaattcaaagtttttggggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatc 39896159  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896160 cgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 39896209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 255002 - 254746
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  | ||||||||||||||||| || ||  |||||  ||||||||  ||| |    
T  255002 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccagccaccgtcccccttggggcatctgctgccgtcgatgactatcttcatctaaagct 254903  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254902 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 254803  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254802 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 254746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 16167370 - 16167626
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  |||||||   ||| |    
T  16167370 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatataaagct 16167469  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167470 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 16167569  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167570 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 16167626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23122923 - 23122666
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  23122923 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctagccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 23122824  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  23122823 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatc 23122724  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23122723 cgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 23122666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 31882179 - 31882427
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  31882179 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatacctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 31882278  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31882279 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 31882378  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882379 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 31882427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39046172 - 39045924
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||  ||| |    
T  39046172 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactgtatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgctgccgttgatgactatcttcatctaaagct 39046073  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39046072 cctacgcttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 39045973  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045972 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 39045924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31887843 - 31887682
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  31887843 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggctaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 31887744  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccacc 174  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31887743 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 169 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868879
Alignment:
Q  169 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgct 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  269 t 269  Q
    |    
T  31868879 t 31868879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 27821881 - 27821974
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat-ccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatca 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  27821881 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatca 27821974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 11932 - 12186
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||      
T  11932 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcg 12031  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      ||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032 aatg--cttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 12129  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12130 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 12186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10000 - 9753
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagttt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  10000 caaaaatgagattgaaacgaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgttcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctc 9901  T
Q  114 ctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 213  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9900 ctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 9801  T
Q  214 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9800 tggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 15463 - 15719
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  15463 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 15562  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15563 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 15662  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15663 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgctt 15719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 271 - 519
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  271 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 370  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 470  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  471 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagc 519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9288 - 9040
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcc-ccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9288 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcctccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagct 9189  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
      | |||||| |||||||||||||   |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9188 cttatgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 9089  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9088 gtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 9040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 9808 - 10064
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  9808 caaaaatgagattgaaacgaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct 9907  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 212  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9908 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 10007  T
Q  213 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10008 atgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctt 10064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 33191 - 33448
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||      
T  33191 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagcc 33290  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33291 cctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 33390  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33391 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 33448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 263
Target Start/End: Original strand, 25011 - 25259
Alignment:
Q  16 aaaatgagattgaaac-aaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttc 114  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25011 aaaatgagattgaaatgaaaagacaaatgactgtatctggcaaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttc 25110  T
Q  115 tgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 214  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25111 tgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgt 25210  T
Q  215 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25211 ggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 25259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 13843 - 14092
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |    
T  13843 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtcccccttggggcatctgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagct 13942  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13943 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 14042  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14043 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 14092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4967 - 4716
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaa-ggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||     
T  4967 caaaaatgagattgaaacaaaaaggcaagtaactatgtctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagc 4868  T
Q  112 ttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaa 209  Q
    | || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4867 tcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaa 4768  T
Q  210 tccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4767 tccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 18479 - 18728
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatcccc-ttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  18479 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctgaccaaccaccgtcccccttggggcatctacagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 18578  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18579 cctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatc 18678  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 261  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679 cgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 18728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5960 - 6217
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  5960 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 6059  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6060 cctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 6159  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  6160 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgctt 6217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25262 - 25005
Alignment:
Q  14 caaaaatgagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaatc-cccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtt 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  25262 caaaaatgagatagaaacgaaaggcaagtaactatatctggccaaccaccgtctcccttggggcatctgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagct 25163  T
Q  113 tctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatc 211  Q
     ||  |||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25162 cctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatc 25063  T
Q  212 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgctt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25062 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgctt 25005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26458 - 26243
Alignment:
Q  48 tatctggcaaatcacaatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatga 147  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||     
T  26458 tatctagcaaaccaccatccccttggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgt 26359  T
Q  148 agtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttat 247  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358 agtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaagctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttat 26259  T
Q  248 acatcaatttgagcct 263  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26258 acatcaattcgagcct 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41008 - 40759
Alignment:
Q  21 gagattgaaacaaaaggcaagtaactatatctggcaaatcacaat---ccccttgggg-catctgcagctgttaatgaccgtcttcatcagaa-gtttct 115  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||      |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||    
T  41008 gagattgaaacgagaggcaagtaactatatctggccaaccacccgtccccccttgggggcatctgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaaagctcct 40909  T
Q  116 gtgcttgtgaa-ttcaaagtttccaggaaatgaagtgattactgtgtt-caat-gtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaa 209  Q
     |||| | ||| ||||||||||| |||||||| | |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  40908 atgctcgcgaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaa 40809  T
Q  210 tccgt-ggagtcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaattt 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40808 tccgttggagtcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University