View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16609_high_6 (Length: 310)

Name: NF16609_high_6
Description: NF16609
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16609_high_6
NF16609_high_6
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (2-202)||(6110064-6110264)
chr3 (2-202)||(10572599-10572799)
chr3 (2-202)||(15600891-15601091)
chr3 (2-202)||(15607436-15607636)
chr3 (2-199)||(13211305-13211502)
chr3 (2-202)||(13248607-13248807)
chr3 (2-200)||(16482490-16482688)
chr3 (2-196)||(17781125-17781319)
chr3 (2-196)||(10579362-10579556)
chr3 (2-200)||(18522665-18522863)
chr3 (2-202)||(15357593-15357793)
chr3 (16-202)||(8490488-8490674)
chr3 (2-200)||(18519980-18520175)
chr3 (2-196)||(19089752-19089946)
chr3 (2-200)||(17200191-17200389)
chr3 (2-183)||(15342226-15342407)
chr3 (2-200)||(13516813-13517011)
chr3 (41-202)||(18640792-18640953)
chr3 (2-196)||(32056907-32057101)
chr3 (10-196)||(1647536-1647726)
chr3 (14-200)||(16200128-16200313)
chr3 (10-202)||(29924971-29925163)
chr3 (10-202)||(29974124-29974316)
chr3 (14-200)||(16200434-16200619)
chr3 (2-195)||(24253395-24253589)
chr3 (2-96)||(17136465-17136559)
chr3 (138-200)||(18534758-18534820)
chr3 (238-294)||(6109972-6110028)
chr3 (238-294)||(8490396-8490452)
chr3 (238-294)||(13248515-13248571)
chr3 (238-294)||(13211211-13211267)
chr3 (238-294)||(18640989-18641045)
chr3 (238-294)||(17136137-17136193)
chr3 (244-294)||(10579603-10579653)
chr3 (238-294)||(15607672-15607729)
chr3 (155-200)||(18510924-18510969)
chr3 (238-294)||(15351237-15351293)
chr3 (238-294)||(15357829-15357885)
chr3 (238-294)||(16482727-16482782)
chr3 (238-294)||(17200427-17200483)
chr3 (238-294)||(18519885-18519941)
chr3 (244-294)||(10572840-10572890)
chr3 (238-295)||(1647768-1647825)
chr3 (238-294)||(15601127-15601184)
chr3 (238-294)||(13516719-13516775)
chr3 (238-294)||(17781358-17781414)
chr3 (238-294)||(19089985-19090041)
chr3 (238-294)||(32057144-32057200)
chr3 (238-294)||(18510829-18510885)
chr3 (238-294)||(18522570-18522626)
chr3 (238-286)||(18534671-18534719)
chr3 (238-294)||(29924879-29924935)
chr3 (238-294)||(29974032-29974088)
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (2-202)||(2328-2528)
scaffold0234 (2-202)||(11219-11419)
scaffold0234 (238-294)||(2564-2620)
scaffold0234 (238-294)||(11455-11511)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (2-202)||(19926767-19926967)
chr4 (2-202)||(26970463-26970663)
chr4 (2-202)||(55612683-55612883)
chr4 (2-202)||(868597-868797)
chr4 (2-202)||(5707320-5707520)
chr4 (2-202)||(26963640-26963840)
chr4 (2-200)||(18262214-18262412)
chr4 (2-202)||(5713948-5714148)
chr4 (2-202)||(10621340-10621540)
chr4 (2-202)||(10628419-10628619)
chr4 (2-200)||(18269070-18269273)
chr4 (2-200)||(28393141-28393339)
chr4 (2-200)||(4426611-4426808)
chr4 (4-190)||(8845215-8845401)
chr4 (4-190)||(8858179-8858365)
chr4 (87-202)||(12357136-12357251)
chr4 (3-194)||(20311299-20311491)
chr4 (10-196)||(5668140-5668327)
chr4 (2-196)||(10677562-10677753)
chr4 (2-196)||(10891202-10891393)
chr4 (3-200)||(5616215-5616414)
chr4 (1-196)||(35223576-35223761)
chr4 (238-298)||(19927003-19927063)
chr4 (238-294)||(5713856-5713912)
chr4 (238-294)||(26963548-26963604)
chr4 (238-294)||(26970371-26970427)
chr4 (238-294)||(5707228-5707284)
chr4 (238-294)||(10621576-10621632)
chr4 (238-294)||(12357044-12357100)
chr4 (238-292)||(868507-868561)
chr4 (238-296)||(17142372-17142430)
chr4 (238-294)||(10628655-10628711)
chr4 (238-294)||(55612594-55612650)
chr4 (240-294)||(28393380-28393434)
chr4 (238-295)||(4426847-4426904)
chr4 (238-294)||(18268976-18269032)
chr4 (86-153)||(39074278-39074346)
chr4 (238-287)||(55992680-55992729)
chr4 (10-176)||(21454152-21454319)
chr4 (238-279)||(5668371-5668412)
chr4 (238-286)||(8845118-8845166)
chr4 (238-286)||(8858082-8858130)
chr4 (238-278)||(18262136-18262176)
chr4 (93-152)||(11161913-11161972)
chr4 (238-292)||(20311207-20311261)
chr4 (238-286)||(24699958-24700006)
chr4 (13-65)||(39074218-39074270)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (2-202)||(18252030-18252230)
chr1 (2-202)||(18532521-18532721)
chr1 (2-202)||(27131416-27131616)
chr1 (2-200)||(21171240-21171438)
chr1 (2-200)||(27310584-27310782)
chr1 (2-200)||(16359042-16359240)
chr1 (10-196)||(36816648-36816834)
chr1 (2-202)||(3855926-3856126)
chr1 (10-202)||(22657236-22657429)
chr1 (2-196)||(27277564-27277756)
chr1 (238-297)||(18532757-18532816)
chr1 (10-168)||(12006554-12006712)
chr1 (3-168)||(12014292-12014457)
chr1 (238-295)||(18251935-18251992)
chr1 (238-294)||(27310821-27310877)
chr1 (4-190)||(9917927-9918106)
chr1 (238-294)||(16359280-16359336)
chr1 (238-294)||(21171479-21171535)
chr1 (127-196)||(30720625-30720694)
chr1 (241-286)||(36816881-36816926)
chr1 (238-294)||(3856164-3856220)
chr1 (242-294)||(22657469-22657521)
chr1 (238-294)||(27131652-27131704)
chr1 (95-172)||(3403248-3403325)
chr1 (95-172)||(3443494-3443571)
chr1 (238-294)||(27277800-27277856)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (2-202)||(18288-18488)
scaffold0220 (238-294)||(18196-18252)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (2-202)||(29327784-29327984)
chr7 (2-202)||(11536069-11536269)
chr7 (2-202)||(11542987-11543187)
chr7 (2-200)||(15152445-15152643)
chr7 (2-200)||(15148144-15148342)
chr7 (2-200)||(18561009-18561207)
chr7 (10-200)||(12750828-12751018)
chr7 (2-196)||(12738542-12738736)
chr7 (10-200)||(18257857-18258047)
chr7 (14-196)||(13392157-13392338)
chr7 (10-180)||(2364917-2365086)
chr7 (238-296)||(12738441-12738499)
chr7 (238-295)||(2653275-2653332)
chr7 (238-294)||(11543223-11543279)
chr7 (109-196)||(39111819-39111905)
chr7 (10-169)||(7396221-7396381)
chr7 (238-294)||(11536305-11536361)
chr7 (238-294)||(12750733-12750789)
chr7 (238-294)||(15152350-15152406)
chr7 (239-294)||(29327690-29327745)
chr7 (238-294)||(15148049-15148105)
chr7 (85-128)||(3132748-3132791)
chr7 (239-294)||(13392030-13392085)
chr7 (87-152)||(10234179-10234244)
chr7 (238-294)||(18258087-18258143)
chr7 (170-202)||(2653207-2653239)
chr7 (238-294)||(18560913-18560969)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (2-202)||(27381259-27381459)
chr6 (2-202)||(27471642-27471842)
chr6 (2-200)||(17684476-17684674)
chr6 (2-202)||(29308890-29309090)
chr6 (2-202)||(29315850-29316050)
chr6 (2-200)||(16566327-16566525)
chr6 (2-202)||(17691447-17691647)
chr6 (2-200)||(188984-189182)
chr6 (2-200)||(25537166-25537364)
chr6 (2-200)||(11651725-11651923)
chr6 (12-200)||(13359286-13359474)
chr6 (238-292)||(17691683-17691737)
chr6 (2-163)||(20553594-20553755)
chr6 (238-294)||(27381495-27381551)
chr6 (238-294)||(27471878-27471934)
chr6 (238-294)||(29308798-29308854)
chr6 (238-294)||(29315758-29315814)
chr6 (238-294)||(17684712-17684768)
chr6 (10-183)||(8509941-8510115)
chr6 (240-294)||(11651630-11651684)
chr6 (10-179)||(27925772-27925946)
chr6 (238-294)||(25537405-25537461)
chr6 (2-164)||(17850502-17850663)
chr6 (140-195)||(31258065-31258120)
chr6 (238-286)||(13359512-13359560)
chr6 (238-286)||(16566563-16566611)
chr6 (238-295)||(189221-189281)
chr6 (238-280)||(16394484-16394526)
chr6 (121-186)||(22259925-22259990)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (2-202)||(6941-7141)
scaffold0390 (2-202)||(13957-14157)
scaffold0390 (238-294)||(7177-7233)
scaffold0390 (238-294)||(14193-14249)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (2-202)||(21940665-21940865)
chr8 (2-200)||(28554885-28555083)
chr8 (2-200)||(22171491-22171687)
chr8 (3-196)||(6094129-6094322)
chr8 (2-196)||(24642655-24642849)
chr8 (69-196)||(24636860-24636987)
chr8 (238-297)||(22070105-22070164)
chr8 (238-294)||(21940573-21940629)
chr8 (238-294)||(6094031-6094087)
chr8 (238-294)||(22171396-22171452)
chr8 (242-294)||(24642556-24642608)
chr8 (238-294)||(28554791-28554847)
chr8 (2-190)||(38232384-38232570)
chr8 (11-172)||(32872857-32873019)
chr8 (123-181)||(2375027-2375085)
chr8 (101-164)||(10920234-10920297)
chr8 (241-294)||(2374947-2375000)
chr8 (257-294)||(24636605-24636642)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (6-202)||(21330259-21330455)
chr2 (2-202)||(18796506-18796706)
chr2 (4-200)||(18619807-18620002)
chr2 (57-196)||(19692598-19692737)
chr2 (10-137)||(20977957-20978084)
chr2 (238-296)||(21330493-21330551)
chr2 (2-168)||(36270199-36270366)
chr2 (10-168)||(18822115-18822275)
chr2 (238-294)||(19692773-19692829)
chr2 (11-166)||(36802664-36802820)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (2-202)||(7107-7307)
scaffold0433 (238-294)||(7015-7071)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (2-202)||(24695473-24695673)
chr5 (2-202)||(18569870-18570070)
chr5 (2-200)||(19714505-19714703)
chr5 (2-196)||(19707225-19707419)
chr5 (14-197)||(27347497-27347679)
chr5 (10-196)||(22547031-22547217)
chr5 (93-202)||(39537962-39538071)
chr5 (17-198)||(17285754-17285935)
chr5 (238-294)||(24695709-24695765)
chr5 (93-196)||(31886537-31886640)
chr5 (17-198)||(17298907-17299088)
chr5 (238-294)||(19714742-19714798)
chr5 (238-294)||(19707462-19707518)
chr5 (238-294)||(27347722-27347778)
chr5 (2-136)||(18807041-18807175)
chr5 (2-89)||(39538701-39538788)
chr5 (86-176)||(33477389-33477479)
chr5 (238-286)||(18570108-18570156)
chr5 (239-294)||(39537870-39537925)
chr5 (84-152)||(11479420-11479489)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (2-202)||(993-1193)
scaffold0657 (238-295)||(900-957)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (2-202)||(25997-26197)
scaffold0186 (239-294)||(26231-26286)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (2-200)||(5531-5729)
scaffold0063 (238-286)||(5444-5492)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (19-200)||(230365-230545)
scaffold0008 (238-294)||(230584-230640)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (138-202)||(8446-8510)
scaffold0176 (238-294)||(8546-8602)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (238-294)||(23769-23825)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (238-294)||(16523-16579)
scaffold0326 (169-202)||(16615-16648)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (238-294)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (238-294)||(8944-9000)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (238-292)||(10202-10256)
scaffold0565 (152-183)||(10127-10158)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (258-294)||(1-37)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (242-294)||(5878-5930)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (101-173)||(92194-92267)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6110264 - 6110064
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110264 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 6110165  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110164 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 6110065  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  6110064 t 6110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 10572599 - 10572799
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572599 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 10572698  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572699 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 10572798  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  10572799 t 10572799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 15600891 - 15601091
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600891 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 15600990  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15600991 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 15601090  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  15601091 t 15601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 15607436 - 15607636
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607436 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 15607535  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15607536 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 15607635  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  15607636 t 15607636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13211502 - 13211305
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211502 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 13211403  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211402 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13248807 - 13248607
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248807 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 13248708  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248707 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 13248608  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  13248607 t 13248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 16482490 - 16482688
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16482490 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatgggg 16482589  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482590 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16482688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 17781125 - 17781319
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781125 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 17781224  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781225 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 10579362 - 10579556
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579362 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 10579461  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579462 tctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18522863 - 18522665
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18522863 gtctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 18522764  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522763 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18522665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 15357593 - 15357793
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15357593 gtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 15357692  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15357693 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 15357792  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  15357793 t 15357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8490674 - 8490488
Alignment:
Q  16 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490674 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 8490575  T
Q  116 tatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490574 tatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 8490488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18520175 - 18519980
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18520175 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat---ttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 18520079  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520078 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18519980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 19089752 - 19089946
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19089752 gtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaagggg 19089851  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089852 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 17200191 - 17200389
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17200191 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaagggg 17200290  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200291 tatcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 15342226 - 15342407
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15342226 gtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 15342325  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342326 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13517011 - 13516813
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13517011 gtctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgtttccttatgtttaacgggg 13516912  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516911 tctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 13516813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 202
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640953
Alignment:
Q  41 cacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  141 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18640953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 32056907 - 32057101
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32056907 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagtttctttatgtttaacgggg 32057006  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32057007 tcttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Original strand, 1647536 - 1647726
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1647536 acataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaa 1647635  T
Q  110 ttaagtta----tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647636 ttaagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16200313 - 16200128
Alignment:
Q  14 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200313 aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaa 16200214  T
Q  114 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200213 gttatacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29925163 - 29924971
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29925163 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29925064  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29925063 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29924971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29974316 - 29974124
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29974316 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29974217  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29974216 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16200619 - 16200434
Alignment:
Q  14 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 113  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16200619 aatagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttattggagtctcacaattaa 16200520  T
Q  114 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200519 gttatacataatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 24253395 - 24253589
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||| |||  ||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24253395 gtctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgtttgatgggg 24253494  T
Q  102 -tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 195  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24253495 atctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaaat 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 17136559 - 17136465
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaa 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17136559 gtctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18534820 - 18534758
Alignment:
Q  138 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534820 ggactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18534758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109972
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 6109972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248515
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13248515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211211
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13211211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 10579603 - 10579653
Alignment:
Q  244 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579603 acaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607729
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15607729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18510969 - 18510924
Alignment:
Q  155 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510969 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351293
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15351293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357885
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15357885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 17200427 - 17200483
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200427 catgctacaaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 17200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 10572840 - 10572890
Alignment:
Q  244 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10572840 acaaagtcaaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaaca 10572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647825
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaacat 1647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601184
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15601184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516719
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 13516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 17781358 - 17781414
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17781358 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17781414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 19089985 - 19090041
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089985 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19090041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510829
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18510829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522570
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534671
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggctta 18534671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 2328 - 2528
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2328 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 2427  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 2527  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  2528 t 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 11219 - 11419
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11219 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 11318  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 11418  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  11419 t 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11511
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 19926767 - 19926967
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926767 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 19926866  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926867 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 19926966  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  19926967 t 19926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26970663 - 26970463
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970663 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26970564  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970563 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 26970464  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  26970463 t 26970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 55612883 - 55612683
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55612883 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatgggg 55612784  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612783 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 55612684  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  55612683 t 55612683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 868797 - 868597
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  868797 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 868698  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  868697 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 868598  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  868597 t 868597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5707520 - 5707320
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707520 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 5707421  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707420 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 5707321  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  5707320 t 5707320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26963840 - 26963640
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963840 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26963741  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963740 tctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 26963641  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  26963640 t 26963640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18262412 - 18262214
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18262412 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 18262313  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18262312 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18262214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5714148 - 5713948
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714148 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 5714049  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714048 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 5713949  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  5713948 t 5713948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 10621340 - 10621540
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10621340 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 10621439  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621440 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 10621539  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  10621540 t 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 10628419 - 10628619
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10628419 gtctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 10628518  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628519 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 10628618  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  10628619 t 10628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18269273 - 18269070
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18269273 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 18269174  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-----aaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  18269173 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 18269074  T
Q  197 cctt 200  Q
    ||||    
T  18269073 cctt 18269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 28393141 - 28393339
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28393141 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 28393240  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28393241 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 28393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 4426611 - 4426808
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4426611 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt-ccttatgtttaacgggg 4426709  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426710 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 4426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8845401 - 8845215
Alignment:
Q  4 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8845401 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8845302  T
Q  104 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845301 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8858365 - 8858179
Alignment:
Q  4 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8858365 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8858266  T
Q  104 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858265 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357136
Alignment:
Q  87 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  187 taaagaaatgccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgccttgt 12357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20311491 - 20311299
Alignment:
Q  3 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 102  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||    
T  20311491 tctacccacaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtccttatgtttaatggggt 20311392  T
Q  103 ctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20311391 ctcacaattaagttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Original strand, 5668140 - 5668327
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggata--ctttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||| |||||||||||||  |||  |||| |||||| | |||||   ||||||||| ||||||    
T  5668140 acataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcac 5668238  T
Q  108 aattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
     ||||| | | |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5668239 gattaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 10677562 - 10677753
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||||||||     
T  10677562 gtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg- 10677658  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10677659 tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10677753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 10891202 - 10891393
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||||||||     
T  10891202 gtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg- 10891298  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10891299 tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5616414 - 5616215
Alignment:
Q  3 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagc--ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||  || ||| |  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||   |||||| |||    
T  5616414 tctacatacataatagtctcaatgctttattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataatgtcctctagtttaacggg 5616315  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
     |||||  ||| ||| | |||||||||||||  |||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5616314 atctcatgatttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaagaaatgcctt 5616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35223761 - 35223576
Alignment:
Q  1 cgtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||  |||| | |      
T  35223761 cgtctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataatgtcctttcgttttacg-- 35223664  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
            ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35223663 --------attaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 35223576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927063
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 19927063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713856
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5713856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963548
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26963548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970371
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621632
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 296
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142430
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaacata 17142430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  240 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426904
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaacat 4426904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268976
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 18268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Original strand, 39074278 - 39074346
Alignment:
Q  86 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctag 153  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  39074278 cttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctag 39074346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 21454152 - 21454319
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    |||||||| ||| ||||| ||| || |||| || ||| ||| |||| |||||||  |||| ||| | |||| | || ||||  ||||||||||||||  |    
T  21454152 acataataatctttatgcattattgttatctcatttcacaataaagtttgactatagatattttaaaaataatgtcattataattaatggggtctcaata 21454251  T
Q  110 ttaagttatactt-aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 176  Q
    |||||| | | || ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21454252 ttaagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 279
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatta 279  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 11161913 - 11161972
Alignment:
Q  93 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11161913 ttaatggagtctcacaattaagtcacactttgtgttccattaaactgattaactattcta 11161972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20311261 - 20311207
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  20311261 catgatacaaagccaaatccaatgaatacagattggctattacagcttactccaa 20311207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24700006 - 24699958
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24700006 catgatacaaaaccaaattcaatcaatatagattggttattcgggctta 24699958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 39074218 - 39074270
Alignment:
Q  13 taatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacg 65  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||    
T  39074218 taatagtctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagtatgactacg 39074270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18252230 - 18252030
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252230 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18252131  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252130 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 18252031  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  18252030 t 18252030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 18532521 - 18532721
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532521 gtctatctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18532620  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532621 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 18532720  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  18532721 t 18532721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 27131416 - 27131616
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131416 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 27131515  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131516 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 27131615  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  27131616 t 27131616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 21171240 - 21171438
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  21171240 gtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttcaacgggg 21171339  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171340 tctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 21171438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 27310584 - 27310782
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||    
T  27310584 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagtttccttatgttcaacgtgg 27310683  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310684 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 27310782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 16359042 - 16359240
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16359042 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 16359141  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359142 tctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Original strand, 36816648 - 36816834
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  36816648 acataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataatgtccttatgtttaacggagtctcacaa 36816747  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816748 ttaatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 3855926 - 3856126
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  3855926 gtctacccacgtaatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataatgtccttatgtttaatgggg 3856025  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3856026 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaagaaatgccttg 3856125  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  3856126 t 3856126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 22657236 - 22657429
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22657236 acatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattgtgtccttatgtttaaaggggtctcacaa 22657335  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-aaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22657336 ttaagttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaaatcaataaagaaatgtcttgt 22657429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 27277564 - 27277756
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||  | ||||   ||    
T  27277564 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataatgtcatttcggttaa-aagg 27277662  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||| | ||||||| | || ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27277663 tctcgcgattaagtcacac-taatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaaacaacaaagaaatg 27277756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 297
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532816
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 18532816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 12006554 - 12006712
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    |||||| | |||||| | ||||||| |||||| |||| ||  || ||||||||||| ||  ||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  12006554 acataacaatctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgtttcatggggtctcacga 12006653  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 168  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12006654 ttaaggcacacttaatattccattaaatagactaactattctagggactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Original strand, 12014292 - 12014457
Alignment:
Q  3 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 102  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||  ||| ||||||   || |||||||||||||| |    
T  12014292 tctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcattatgtttaatgggat 12014391  T
Q  103 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 168  Q
    || || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  12014392 ctaacgattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251935
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 9917927 - 9918106
Alignment:
Q  4 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 103  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||  ||    
T  9917927 ctaccgacatagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatatttaatgga-tc 9918025  T
Q  104 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 190  Q
    ||   || |||||||||||||||||| |||||||  |||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918026 tcgtgatcaagttatacttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171535
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaaca 21171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  127 ttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 286
Target Start/End: Original strand, 36816881 - 36816926
Alignment:
Q  241 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36816881 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggctta 36816926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856220
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaaca 3856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Original strand, 22657469 - 22657521
Alignment:
Q  242 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22657469 atacaaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaaca 22657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3403325 - 3403248
Alignment:
Q  95 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 172  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3403325 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 172
Target Start/End: Original strand, 3443494 - 3443571
Alignment:
Q  95 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 172  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3443494 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18488 - 18288
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18488 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18389  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388 tctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 18289  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  18288 t 18288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29327984 - 29327784
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327984 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 29327885  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327884 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 29327785  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  29327784 t 29327784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 11536069 - 11536269
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11536069 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 11536168  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536169 tctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 11536268  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  11536269 t 11536269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 11542987 - 11543187
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11542987 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 11543086  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11543087 tctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcattg 11543186  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  11543187 t 11543187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15152643 - 15152445
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15152643 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccgtatgtttaacgggg 15152544  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15152543 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15152445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15148342 - 15148144
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15148342 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 15148243  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15148242 tctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18561207 - 18561009
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18561207 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttcctaatgtttaacgggg 18561108  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561107 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12751018 - 12750828
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  12751018 acataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttctttatgtttaacgaggtctcacaa 12750919  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750918 ttaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 12750828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12738736 - 12738542
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  12738736 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacaagg 12738637  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12738636 tctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataaaatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 18257857 - 18258047
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18257857 acataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtccttgtgtttaatggggtctcacaa 18257956  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257957 ttaagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13392338 - 13392157
Alignment:
Q  14 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||| |||||||  |||||||| |||||| | |||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  13392338 aatagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacgattaa 13392240  T
Q  114 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    || | |||||||| |||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13392239 gtcacacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtcaacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2365086 - 2364917
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||| || | ||||||||| ||| ||| |||||| | || ||  |||||||||| |||||| |    
T  2365086 acatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatgtcatttagtttaatgggttctcacga 2364988  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 180  Q
    |||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2364987 ttaagccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738441
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacata 12738441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653332
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 2653332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543279
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11543279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39111905 - 39111819
Alignment:
Q  109 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39111905 attaagtcgtacttaatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7396381 - 7396221
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||  | ||| ||  || ||||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  7396381 acataatagtctctatgctttaatatcatcgtatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaaga 7396282  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttg 169  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  7396281 ttaagtcatacttaatgttccatttaaatgaactaactattctagcgacatttttattttg 7396221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536361
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaaca 11536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750733
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaaca 12750733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152350
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 15152350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327690
Alignment:
Q  239 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 29327690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3132791 - 3132748
Alignment:
Q  85 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132791 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392030
Alignment:
Q  239 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 13392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10234244 - 10234179
Alignment:
Q  87 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 152  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10234244 ttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattcta 10234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 202
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653239
Alignment:
Q  170 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2653239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18560969 - 18560913
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18560969 catgatacaaagccaagcccaatcaacatagattgcctttaagggcttactccaaca 18560913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 27381259 - 27381459
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27381259 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatgggg 27381358  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381359 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 27381458  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  27381459 t 27381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 27471642 - 27471842
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27471642 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatgggg 27471741  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471742 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 27471841  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  27471842 t 27471842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 17684476 - 17684674
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17684476 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 17684575  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684576 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17684674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29309090 - 29308890
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29309090 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 29308991  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308990 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 29308891  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  29308890 t 29308890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29316050 - 29315850
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29316050 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 29315951  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315950 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 29315851  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  29315850 t 29315850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 16566327 - 16566525
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16566327 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 16566426  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566427 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16566525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 17691447 - 17691647
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17691447 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 17691546  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691547 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 17691646  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  17691647 t 17691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 188984 - 189182
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  188984 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 189083  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189084 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 25537166 - 25537364
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25537166 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 25537265  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537266 tctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 25537364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11651923 - 11651725
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11651923 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagtttccttatttttaatgggg 11651824  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11651823 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 11651725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 13359286 - 13359474
Alignment:
Q  12 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaatt 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||||||| || |||| |||    
T  13359286 ataatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgtttaatggagtttcacgatt 13359385  T
Q  112 aagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13359386 aagttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaatgcctt 13359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 292
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Original strand, 20553594 - 20553755
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| ||| |||  || ||||||||| |||| |||||| | | ||||| |||||||||     
T  20553594 gtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatatttaatggga 20553693  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatt 163  Q
    |||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20553694 tctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27381495 - 27381551
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381495 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27471878 - 27471934
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471878 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27471934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308798
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29308798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315758
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29315758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684768
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaaca 17684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8510115 - 8509941
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg-tctcaca 108  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||  || ||||||| |||||  ||||||| | ||||   |||| || |||||||||| ||||| |    
T  8510115 acataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcctcatatttaatgggggtctcata 8510016  T
Q  109 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 183  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510015 attaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  240 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27925946 - 27925772
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||  || |||| |||||||  |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||| ||||||| |    
T  27925946 acataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagtttaatggagtctcacga 27925847  T
Q  110 ttaagt--tatactta---atgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 179  Q
    ||||||   | |||||   ||||||| ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27925846 ttaagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537461
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaaca 25537461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Original strand, 17850502 - 17850663
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| |||   ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| | |||||| ||     
T  17850502 gtctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgtttttaattgga 17850600  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 164  Q
    | ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17850601 tatcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattatagggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 195
Target Start/End: Original strand, 31258065 - 31258120
Alignment:
Q  140 actaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 195  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31258065 actaattattttagagactttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359560
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggactta 13359560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189281
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaacat 189281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 280
Target Start/End: Original strand, 16394484 - 16394526
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattag 280  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16394484 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattgtctattag 16394526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 186
Target Start/End: Original strand, 22259925 - 22259990
Alignment:
Q  121 ttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 186  Q
    ||||||||  |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22259925 ttaatgttatattaaatggactagttattttagggagtttattattttgcaacataacaaaatcaa 22259990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 6941 - 7141
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6941 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaataggg 7040  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7041 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 7140  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  7141 t 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 13957 - 14157
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13957 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 14056  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14057 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 14156  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  14157 t 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7233
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21940865 - 21940665
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940865 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 21940766  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21940765 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcattg 21940666  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  21940665 t 21940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28555083 - 28554885
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28555083 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 28554984  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554983 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 28554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22171687 - 22171491
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22171687 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttc--tatgtttaatgggg 22171590  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22171589 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaaaatcaataaggaaatgcctt 22171491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6094322 - 6094129
Alignment:
Q  3 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 102  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  6094322 tctacccatataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggt 6094223  T
Q  103 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094222 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24642849 - 24642655
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24642849 gtctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 24642750  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642749 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  69 actttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  169 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070105
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 22070105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171396
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24642608 - 24642556
Alignment:
Q  242 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642608 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 24642556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554791
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaaca 28554791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 38232384 - 38232570
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||||   |||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| | |  ||| ||||||||| |    
T  38232384 gtctacccacaaaatagtttttatgctttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaatactatt-ttacgtttaatggag 38232482  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 190  Q
    | |||  |||||||||||| |||   |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38232483 tgtcatgattaagttatacctaaaaatttattaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataaa 38232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 32872857 - 32873019
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||| ||| | | || | ||  | | || |||| | |||||||||    
T  32872857 cataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaatagtattgtcactcttttcaatgagatctcacaat 32872956  T
Q  111 taagttatacttaatgttccat-taaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 172  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32872957 taagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2375085 - 2375027
Alignment:
Q  123 aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaa 181  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2375085 aatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 164  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2375000 - 2374947
Alignment:
Q  241 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||    
T  2375000 gatacaaagccaaatccaatcaatacatatttattattagggcttattccaaca 2374947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  257 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Original strand, 21330259 - 21330455
Alignment:
Q  6 acctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330259 acctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctc 21330358  T
Q  106 acaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21330359 acaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 21330455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18796706 - 18796506
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| || | ||    
T  18796706 gtctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataatatccttatgttaaaagagg 18796607  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  18796606 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaataaattccttg 18796507  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  18796506 t 18796506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18620002 - 18619807
Alignment:
Q  4 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 103  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  18620002 ctacccacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataatatccttttgtttaatggg-tc 18619904  T
Q  104 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||| |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18619903 tcataattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaattcctt 18619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 196
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  57 ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggga 156  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| | |||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  157 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20978084 - 20977957
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  20978084 acataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatgggatctcatga 20977985  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaac 137  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20977984 ttaaattattcttaatgttccattaaac 20977957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 296
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330551
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 21330551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36270366 - 36270199
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| || || |||||||||  |    
T  36270366 gtctacccacacaatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagtgtcattgtgtttaatgatg 36270267  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga-ctaactattctagggactttattatttt 168  Q
    |||||| ||||||| | ||||||  || |||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270266 tctcacgattaagtcacacttaacatttcatttaagtaaactaactattctagggactttattatttt 36270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18822275 - 18822115
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||  ||  ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |    
T  18822275 acataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgtttaatggtgtctcacga 18822176  T
Q  110 ttaagttatacttaa-tgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatttt 168  Q
    |||||  | |||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18822175 ttaagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692829
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaaca 19692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 36802664 - 36802820
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||   || ||||| |||||||  ||| |||||| | || || |||||||||   |||  ||||    
T  36802664 cataataatctatatgctttaatgttatcccactttacactgaatcttgattacggatgttttaagaataatgtcattgtgtttaatgatatcttgcaat 36802763  T
Q  111 taagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatt 166  Q
    ||||| | | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  36802764 taagtaacatttaatattccatttaaacgaattaactattcaaaggactttattatt 36802820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 7107
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7307 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 7208  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7207 tctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaataccttg 7108  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  7107 t 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7015
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 24695473 - 24695673
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24695473 gtctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 24695572  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695573 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 24695672  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  24695673 t 24695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 18569870 - 18570070
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18569870 gtctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagtttccttatgtttaacgggg 18569969  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18569970 tctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 18570069  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  18570070 t 18570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 19714505 - 19714703
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19714505 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacgggg 19714604  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714605 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 19714703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 19707225 - 19707419
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19707225 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacgggg 19707324  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19707325 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 27347497 - 27347679
Alignment:
Q  14 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27347497 aatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaatggg-tctcacgattaa 27347595  T
Q  114 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 197  Q
    || | |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347596 gtcacacttaatgctccattaaacagattaattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Original strand, 22547031 - 22547217
Alignment:
Q  10 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 109  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||| || ||||||| | |||| | ||| ||| ||||||| | |||||| |    
T  22547031 acataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatatatttaatgagatctcacga 22547130  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22547131 ttaagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaataaatg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39538071 - 39537962
Alignment:
Q  93 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39538071 ttaatgaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaaga 39537972  T
Q  193 aatgccttgt 202  Q
    |||| |||||    
T  39537971 aatggcttgt 39537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 17285754 - 17285935
Alignment:
Q  17 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 116  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17285754 agtctatatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17285853  T
Q  117 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 198  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17285854 acacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17285935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695765
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 24695765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31886640 - 31886537
Alignment:
Q  93 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 192  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31886640 ttaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttattaatttgaaacaaaacaaaatcactaaaga 31886541  T
Q  193 aatg 196  Q
    ||||    
T  31886540 aatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 17298907 - 17299088
Alignment:
Q  17 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 116  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17298907 agtctatatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17299006  T
Q  117 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 198  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17299007 gcacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17299088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707518
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 18807041 - 18807175
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcc-ttatgtttaatggg 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| || |||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||     
T  18807041 gtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccattat-tttaatggt 18807139  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaa 136  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807140 gtctcacgattaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 39538788 - 39538701
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcctta 89  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  39538788 gtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagtgtcctta 39538701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 176
Target Start/End: Original strand, 33477389 - 33477479
Alignment:
Q  86 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 176  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33477389 cttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570156
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagctta 18570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  239 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11479489 - 11479420
Alignment:
Q  84 tccttatgtttaatg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||    
T  11479489 tccttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1193 - 993
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1193 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttctttatgtttaatgggg 1094  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1093 tctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 994  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  993 t 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 900
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 25997 - 26197
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25997 gtctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26096  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26097 tctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 26196  T
Q  202 t 202  Q
    |    
T  26197 t 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26286
Alignment:
Q  239 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaaca 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5729 - 5531
Alignment:
Q  2 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5729 gtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 5630  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5629 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaataaatcaataaagaaatgcctt 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5444
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggctta 5444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230545
Alignment:
Q  19 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagttat 230463  T
Q  119 acttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230464 acttaatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 230545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8510
Alignment:
Q  138 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8446 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8602
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23825
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16579 - 16523
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579 catgatataaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 16523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16615
Alignment:
Q  169 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648 gaancaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 41 - 97
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 292
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 292  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 183
Target Start/End: Original strand, 10127 - 10158
Alignment:
Q  152 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 294
Target Start/End: Original strand, 1 - 37
Alignment:
Q  258 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5878
Alignment:
Q  242 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5930 atacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaaca 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 92267 - 92194
Alignment:
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttgaaac 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  92267 gtctcacgattaagttatacttaatgttccatttaaaataactagatattctagagactttattactttaaaac 92194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University