View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16620_low_3 (Length: 372)

Name: NF16620_low_3
Description: NF16620
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16620_low_3
NF16620_low_3
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (1-366)||(2749407-2749772)
chr3 (1-352)||(2837975-2838326)
chr3 (1-331)||(2855206-2855536)
chr3 (1-359)||(5413298-5413656)
chr3 (1-366)||(2818969-2819334)
chr3 (1-366)||(2759626-2759991)
chr3 (1-355)||(2807679-2808033)
chr3 (4-366)||(2769484-2769846)
chr3 (1-329)||(2790732-2791060)
chr3 (8-331)||(2797780-2798103)
chr3 (21-127)||(3201376-3201482)
[»] scaffold0691 (1 HSPs)
scaffold0691 (1-366)||(5513-5878)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 2749407 - 2749772
Alignment:
Q  1 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2749407 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 2749506  T
Q  101 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2749507 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 2749606  T
Q  201 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2749607 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagctattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 2749706  T
Q  301 gtctggaattaggacgtaatgcccatttaacgtgtctagtaaagattctatcacttagtgatgatg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2749707 gtctggaattaggacgtaatgcccatttaacgtgtctagtaaagattctatcacttagttatgatg 2749772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2838326 - 2837975
Alignment:
Q  1 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2838326 aaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcataacctgcaacttttgcctcc 2838227  T
Q  101 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2838226 aaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttaaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 2838127  T
Q  201 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 300  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2838126 aaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaacgtgagtgaaaatatga 2838027  T
Q  301 gtctggaattaggacgtaatgcccatttaacgtgtctagtaaagattctatc 352  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||    
T  2838026 gactggaattgggacgtaatgcccatttaactagtctaacaaagattttatc 2837975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2855536 - 2855206
Alignment:
Q  1 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2855536 aaggtagtaggatcataatcactactagaatgatgcatgttgcagaatttttcaagaaatcctttctaactcatattcataacctgcaacttttgcctcc 2855437  T
Q  101 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2855436 aaacaaagcatgggaactcttctgtaagaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccaccagagcttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcta 2855337  T
Q  201 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 300  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2855336 aaatgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaacgtgagtgaaaatatga 2855237  T
Q  301 gtctggaattaggacgtaatgcccatttaac 331  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2855236 gattggaattgggacgtaatgcccatttaac 2855206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 5413298 - 5413656
Alignment:
Q  1 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||    
T  5413298 aaggtagtaggatcataatcaccactagaatgatgcaagttgcggattttttcaaaaaatcctttctagtatatgttcacaacctgcaacttttgcctcc 5413397  T
Q  101 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||| ||| ||||||||  |||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||||| |    
T  5413398 aaacaaagcatgggaactttactgcaagaaggtgtttggatttgaacttggtgggaattgtccatcggagcttcaggatgtatcgaaagaaattgttcga 5413497  T
Q  201 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 300  Q
    || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5413498 aaatgcaagcagcttcctctagaaattgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaacaattattgaatggcaaaaggtgagtcaaaatctga 5413597  T
Q  301 gtctggaattaggacgtaatgcccatttaacgtgtctagtaaagattctatcacttagt 359  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  5413598 gcctggaattaggacgtaatgcccatttaacgagtctaacaaagattctgtcacttagt 5413656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 2818969 - 2819334
Alignment:
Q  1 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  2818969 aaggtagtaggatcataatcaccacaagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcatttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactcc 2819068  T
Q  101 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2819069 aaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttaggtctgagcttggtggtcgttgtccaccggaacttgaggttgtggcaaaagaaattgttcaa 2819168  T
Q  201 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 300  Q
    || | || |||  ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  2819169 aaattcaagcaattacctttggcaatcgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaaccatgatcgaatggcaaaaggtgagtcaaaatttga 2819268  T
Q  301 gtctggaattaggacgtaatgcccatttaacgtgtctagtaaagattctatcacttagtgatgatg 366  Q
    | ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | || |||||| ||||||    
T  2819269 gcctggagttggaacgtaatgcccatttaacgagtctaacaaagattttgtcgcttagttatgatg 2819334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 2759626 - 2759991
Alignment:
Q  1 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  2759626 aaggtagtaggatcataatcaccactagaattatgcaagttgcagattttttcaagaaatcatttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactcc 2759725  T
Q  101 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  2759726 aaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttagatatgatcttggagggcgttgtccaccggagcttgaggctgtggcaaaagaaattgtgcaa 2759825  T
Q  201 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 300  Q
    |||| || ||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  2759826 aagttcaagcaactacctcttgcaattgtggccgttgctggtctactttcaacaaaatctaaaaccatgattgaatggcaaaaggtgagtcaaaatttga 2759925  T
Q  301 gtctggaattaggacgtaatgcccatttaacgtgtctagtaaagattctatcacttagtgatgatg 366  Q
    | ||||| || ||  ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| | || |||||| ||||||    
T  2759926 gcctggagttggggtgtaatacccatttaacgagtctaacaaagattttgtcgcttagttatgatg 2759991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 2807679 - 2808033
Alignment:
Q  1 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  2807679 aaggtagtaggatcataatcacaactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgactcc 2807778  T
Q  101 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || |||| ||| || |||||| | || ||||||||| |||||| ||| ||||||| |    
T  2807779 aaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagtatttagattcgatcttgatgggcactgtccaccggagcttgaggctatgtcaatagatattgttcga 2807878  T
Q  201 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 300  Q
    || |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2807879 aaatgcaagcagctacctttggcaattgtagctattggcggtctactttcaacaaaatataaaacaataatggaatgggaaaaggtgagtcaaaatctga 2807978  T
Q  301 gtctggaattaggacgtaatgcccatttaacgtgtctagtaaagattctatcact 355  Q
    |  |||| || ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||    
T  2807979 gcttggagttgggacgtaatgcccatttaacaagtctaacaaagattttatcact 2808033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 2769484 - 2769846
Alignment:
Q  4 gtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctccaaa 103  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  2769484 gtagtaggatcataataaccacaagaatgatgcatgttgcagattttttcaagaaatcctttctagttcatgttcttaacatgcaacttttgcctcctaa 2769583  T
Q  104 caaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaaaag 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| || |||||| |||| ||| || |  |||| ||||||||||||| |||     
T  2769584 caaagcatgggaactcttctgcaagaaagcattcagatttgaacttgatgggcaatgtccaccagagcttcagtccatgtctaaagaaattgttcgaaaa 2769683  T
Q  204 tgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctgagtc 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| || |  |    
T  2769684 tgcaagcagctacctctggcaattgtagccattggtggtctattttcaacaaaatctaaaacaagaactgaatggcaaaaggtgagtcaaaagctaaacc 2769783  T
Q  304 tggaattaggacgtaatgcccatttaacgtgtctagtaaagattctatcacttagtgatgatg 366  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |  |||||  ||||||| | || |||||| ||||||    
T  2769784 tggagttgggacgtaatgcccatttatctagtctaacaaagattttgtctcttagttatgatg 2769846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 2790732 - 2791060
Alignment:
Q  1 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 100  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  2790732 aaggttgtaggatcataatcaccactagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcttttctagttcatgttcacaacttgcaacttttgacacc 2790831  T
Q  101 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    |||||||||||||||||| |    
T  2790832 aaacaaagcatgggaactcttctgcaagaaagcattcagatttgagcttggtgggcattgtccaccagagcttaagttcatgtcaaaagaaattgttcga 2790931  T
Q  201 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 300  Q
    || |||| ||||||||| || |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||    
T  2790932 aaatgcaagcagctacccctggcaattgtagccgtcagtggtctactttcaacaaaagctaaaaccgtgactgaatggaaaatggtgagtcaaaacctga 2791031  T
Q  301 gtctggaattaggacgtaatgcccattta 329  Q
      ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2791032 acctggagttgggacgtaatgcccattta 2791060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Original strand, 2797780 - 2798103
Alignment:
Q  8 taggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctccaaacaaa 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  2797780 taggatcatcatcaccacgagaatgatgcaagttgcagattttttcaagaaatcctttcaagttcatgttcacaacttgcaacttttgacaccaaacaaa 2797879  T
Q  108 gcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaaaagtgca 207  Q
     |||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||| |  |  |||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  2797880 tcatgggaactcttctgcaagaaagcattcagatttgaggttggtgggcattgtccaccagagcttaactccatgtcaatagaaatagttcgaaaatgca 2797979  T
Q  208 ggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctgagtctgga 307  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  2797980 agcagctacccctggcaattgtagccattggtggtctattttcgacaaaagctaaaactgtgactgaatggaaaatggtgagtcaaaatctgaacctgga 2798079  T
Q  308 attaggacgtaatgcccatttaac 331  Q
     || ||||| ||||||||||||||    
T  2798080 gttgggacgcaatgcccatttaac 2798103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 3201376 - 3201482
Alignment:
Q  21 accactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctccaaacaaagcatgggaacttt 120  Q
    |||| |||||||||| |||| || || | ||| || ||||| |||||   |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3201376 accagtagaatgatgcatgtagctgaatattttaagaaatcttttcttgttcatattcaccacctacaacctttgcctccaaacaaagcgtgggaactgt 3201475  T
Q  121 tctgcaa 127  Q
    | |||||    
T  3201476 tttgcaa 3201482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0691 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0691
Description:

Target: scaffold0691; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5513
Alignment:
Q  1 aaggtagtaggattatcatcaccactagaatgatgtatgttgcagattttttcaaaaaatcctttctaactcatattcacaacctgcaacttttgcctcc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  5878 aaggtagtaggattataatcaccacaagaatgatgcttgttgccgaatttttcaagaaatcctttatagttcatgttcacaaactgcaactcttgcctcc 5779  T
Q  101 aaacaaagcatgggaacttttctgcaagagagtatttagatatgagcttggtggacattgtccatcagaacttgaggctgtgtcaaaagaaattgttcaa 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5778 aaacaaagtatgggaactcttctgcaaaaaagtatttagatttgaacctggtgggcattgtccacttgagcttgaggctgtatcaaaagaaattgttaaa 5679  T
Q  201 aagtgcaggcagctacctctagcaattgtagccattggtggtttactttcaacaaaatctaaaacaatgattgaatggcaaaaggtgagtgaaaatctga 300  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5678 aaatgcaagcagctacctcttgcaattgtagccattggtggtctactttcaacaaaatctaaaacaatggttgaatggcaaaaggtgagtcaaaatttga 5579  T
Q  301 gtctggaattaggacgtaatgcccatttaacgtgtctagtaaagattctatcacttagtgatgatg 366  Q
    | || || || | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  5578 gcctagagttggaacgtaatgcccatttaacgagtctaacaaagattttgtcacttagttatgatg 5513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University