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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF16631_low_5 (Length: 584)
Name: NF16631_low_5
Description: NF16631
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF16631_low_5 |
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Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 125 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 13871558 - 13871094
Alignment:
| Q |
125 |
catgagcttgtctataacgcatttaaaaagagatgcacaaattatcttatacatacgaaggcgaggaagaagg-----------------atagatgagc |
207 |
Q |
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| T |
13871558 |
catgagcttgtctataacgcatttaagaagagatgcacaaattatcttatacatatgaaagcgaggaagaagggggtcagccctggttggatagatgagc |
13871459 |
T |
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| Q |
208 |
aggcatggctgatcttgttacccattgggaaagtacacacttccaaagggtctacatcacagagtctcatatcattgcggcaccggagatgttatgtaaa |
307 |
Q |
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| T |
13871458 |
aggcatggctgatcttgttacccattgggaaagtacacacttccaaagggtctacatcacagagtctcatatcattgcggcaccggagatgttatgtaaa |
13871359 |
T |
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| Q |
308 |
aacttaacacttattgtctaaattcgttatcatagattatgtgttatttgttaacaagtgttgactttattggtaggccaaaaaacatgtgccatatgtg |
407 |
Q |
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| T |
13871358 |
aacttaacacttattgtccaaattcgttatcatagattatgtgttatttgtcaacaagtgttgactttattggtaggccaaaaaacatgtgccatatgcg |
13871259 |
T |
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| Q |
408 |
ccgattgataagcgatatttggccgctcacgagtggaatgacaaaagtgttgattgtccttctaagagaacatatgtaagtttctggtcgcatccattac |
507 |
Q |
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| T |
13871258 |
ccgattgataagcgatatttggccgctcacgagtggaatgacaaaagtgttgattgtccttctaagagaacatatgtaagtttctggtcgcatccattac |
13871159 |
T |
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| Q |
508 |
cctgatattacttgttcagcaagttaaatatgtatcttattagctcataactacatacacaggtt |
572 |
Q |
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| T |
13871158 |
cttgatattacttgttcagcaagttaaatatgtatcttattagctcataactacatacacaggtt |
13871094 |
T |
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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 125 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 14011683 - 14011219
Alignment:
| Q |
125 |
catgagcttgtctataacgcatttaaaaagagatgcacaaattatcttatacatacgaaggcgaggaagaagg-----------------atagatgagc |
207 |
Q |
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| T |
14011683 |
catgagcttgtctataacgcatttaagaagagatgcacaaattatcttatacatatgaaagcgaggaagaagggggtcagccctggttggatagatgagc |
14011584 |
T |
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| Q |
208 |
aggcatggctgatcttgttacccattgggaaagtacacacttccaaagggtctacatcacagagtctcatatcattgcggcaccggagatgttatgtaaa |
307 |
Q |
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| T |
14011583 |
aggcatggctgatcttgttacccattgggaaagtacacacttccaaagggtctacatcacagagtctcatatcattgcggcaccggagatgttatgtaaa |
14011484 |
T |
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| Q |
308 |
aacttaacacttattgtctaaattcgttatcatagattatgtgttatttgttaacaagtgttgactttattggtaggccaaaaaacatgtgccatatgtg |
407 |
Q |
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| T |
14011483 |
aacttaacacttattgtccaaattcgttatcatagattatgtgttatttgtcaacaagtgttgactttattggtaggccaaaaaacatgtgccatatgcg |
14011384 |
T |
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| Q |
408 |
ccgattgataagcgatatttggccgctcacgagtggaatgacaaaagtgttgattgtccttctaagagaacatatgtaagtttctggtcgcatccattac |
507 |
Q |
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| T |
14011383 |
ccgattgataagcgatatttggccgctcacgagtggaatgacaaaagtgttgattgtccttctaagagaacatatgtaagtttctggtcgcatccattac |
14011284 |
T |
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| Q |
508 |
cctgatattacttgttcagcaagttaaatatgtatcttattagctcataactacatacacaggtt |
572 |
Q |
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14011283 |
cttgatattacttgttcagcaagttaaatatgtatcttattagctcataactacatacacaggtt |
14011219 |
T |
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