View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16632_low_17 (Length: 495)

Name: NF16632_low_17
Description: NF16632
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16632_low_17
NF16632_low_17
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (14-480)||(25601959-25602426)
chr2 (16-460)||(28974003-28974447)
chr2 (14-442)||(36890532-36890959)
chr2 (16-459)||(271126-271568)
chr2 (16-438)||(4447981-4448402)
chr2 (18-459)||(27261761-27262201)
chr2 (16-459)||(23836555-23836996)
chr2 (16-442)||(25875770-25876193)
chr2 (82-451)||(32465822-32466189)
chr2 (16-438)||(22579711-22580129)
chr2 (16-442)||(24571141-24571565)
chr2 (59-446)||(67961-68350)
chr2 (281-457)||(22274681-22274856)
chr2 (58-438)||(31146068-31146450)
chr2 (117-412)||(43645896-43646191)
chr2 (281-457)||(22283914-22284089)
chr2 (58-445)||(19666498-19666885)
chr2 (226-455)||(25305405-25305635)
chr2 (58-438)||(722372-722747)
chr2 (288-445)||(19433452-19433609)
chr2 (275-438)||(6879414-6879577)
chr2 (285-442)||(9653021-9653179)
chr2 (285-423)||(21274174-21274312)
chr2 (330-438)||(3403-3510)
chr2 (16-407)||(19668957-19669348)
chr2 (294-446)||(23821731-23821883)
chr2 (294-446)||(23830810-23830962)
chr2 (14-113)||(17367119-17367219)
chr2 (217-445)||(24884656-24884884)
chr2 (20-423)||(24294374-24294778)
chr2 (283-438)||(25265520-25265675)
chr2 (169-355)||(22775206-22775392)
chr2 (169-355)||(22780584-22780770)
chr2 (58-243)||(23821529-23821714)
chr2 (58-243)||(23830608-23830793)
chr2 (217-445)||(9636715-9636943)
chr2 (125-198)||(24087345-24087417)
chr2 (283-355)||(24341519-24341591)
chr2 (20-98)||(7321837-7321914)
chr2 (166-437)||(24277739-24278010)
chr2 (58-190)||(3135-3269)
chr2 (117-198)||(25305648-25305729)
chr2 (283-421)||(36982571-36982708)
chr2 (416-457)||(12728352-12728393)
chr2 (145-258)||(19660037-19660150)
chr2 (416-457)||(24686036-24686077)
chr2 (416-457)||(34824435-34824476)
chr2 (288-392)||(6094739-6094843)
chr2 (304-392)||(24560867-24560955)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (14-479)||(34395193-34395658)
chr4 (14-459)||(44055871-44056315)
chr4 (14-438)||(21959310-21959733)
chr4 (16-459)||(16732124-16732567)
chr4 (17-459)||(23269783-23270225)
chr4 (14-437)||(12837048-12837468)
chr4 (18-412)||(45458706-45459099)
chr4 (20-459)||(30457859-30458297)
chr4 (62-424)||(55376493-55376853)
chr4 (14-393)||(8872320-8872699)
chr4 (18-438)||(53704585-53705003)
chr4 (14-410)||(819777-820154)
chr4 (16-424)||(44346818-44347223)
chr4 (14-423)||(30232342-30232751)
chr4 (14-279)||(20813393-20813658)
chr4 (18-438)||(53907560-53907966)
chr4 (16-424)||(13809359-13809766)
chr4 (20-459)||(18494181-18494620)
chr4 (16-411)||(52265356-52265751)
chr4 (16-424)||(27960963-27961370)
chr4 (52-435)||(15044808-15045192)
chr4 (52-435)||(15109232-15109616)
chr4 (58-460)||(14901187-14901589)
chr4 (281-438)||(14951739-14951896)
chr4 (281-457)||(25119328-25119505)
chr4 (281-457)||(5682648-5682824)
chr4 (217-455)||(41165995-41166233)
chr4 (145-355)||(47535042-47535252)
chr4 (58-445)||(7964601-7964988)
chr4 (58-445)||(18276404-18276792)
chr4 (58-435)||(7185734-7186111)
chr4 (59-443)||(41256259-41256644)
chr4 (281-423)||(15272433-15272576)
chr4 (58-435)||(15013172-15013549)
chr4 (332-438)||(19821940-19822046)
chr4 (330-438)||(37957187-37957295)
chr4 (152-445)||(40904918-40905210)
chr4 (58-411)||(38764713-38765067)
chr4 (166-392)||(18238155-18238381)
chr4 (283-392)||(15675219-15675328)
chr4 (283-355)||(10104380-10104452)
chr4 (281-392)||(31115653-31115764)
chr4 (217-355)||(40885618-40885756)
chr4 (378-459)||(47535256-47535337)
chr4 (337-445)||(16522788-16522896)
chr4 (288-392)||(13590194-13590298)
chr4 (288-392)||(54398406-54398510)
chr4 (58-159)||(19821665-19821768)
chr4 (448-478)||(9795314-9795344)
chr4 (337-441)||(9295668-9295772)
chr4 (416-457)||(18168930-18168971)
chr4 (288-389)||(41916846-41916947)
chr4 (58-137)||(34177538-34177617)
chr4 (448-480)||(34177767-34177799)
chr4 (58-94)||(37956913-37956949)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (14-459)||(132095-132541)
scaffold0021 (14-417)||(88273-88676)
scaffold0021 (14-442)||(11660-12090)
scaffold0021 (16-292)||(16022-16300)
scaffold0021 (16-292)||(25553-25831)
scaffold0021 (448-480)||(22186-22218)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (14-456)||(22650-23092)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (16-459)||(11287372-11287815)
chr7 (14-459)||(15822279-15822722)
chr7 (16-438)||(45452016-45452435)
chr7 (16-438)||(12758965-12759387)
chr7 (14-423)||(26070112-26070519)
chr7 (14-423)||(26093899-26094306)
chr7 (21-423)||(12369693-12370095)
chr7 (17-442)||(3894998-3895421)
chr7 (14-460)||(47289736-47290183)
chr7 (14-459)||(143601-144039)
chr7 (16-442)||(12247968-12248395)
chr7 (16-438)||(44865204-44865628)
chr7 (14-392)||(13862779-13863154)
chr7 (16-424)||(16569854-16570262)
chr7 (16-424)||(16595400-16595808)
chr7 (63-445)||(7283956-7284336)
chr7 (18-438)||(39046479-39046893)
chr7 (18-459)||(35094773-35095210)
chr7 (16-422)||(49047523-49047928)
chr7 (52-442)||(13274760-13275140)
chr7 (169-459)||(17223939-17224229)
chr7 (63-442)||(13377502-13377883)
chr7 (281-438)||(126392-126549)
chr7 (57-445)||(16914816-16915205)
chr7 (281-423)||(3049575-3049717)
chr7 (58-445)||(48356614-48357002)
chr7 (58-390)||(9838904-9839237)
chr7 (281-442)||(111390-111550)
chr7 (58-390)||(9611332-9611666)
chr7 (281-442)||(32494167-32494328)
chr7 (58-423)||(31501165-31501531)
chr7 (281-442)||(2028893-2029055)
chr7 (281-410)||(2190307-2190436)
chr7 (281-423)||(42056410-42056553)
chr7 (333-457)||(1937173-1937297)
chr7 (14-86)||(26069454-26069525)
chr7 (105-445)||(14271838-14272163)
chr7 (217-376)||(16919598-16919757)
chr7 (283-446)||(13320984-13321148)
chr7 (145-423)||(4484719-4484996)
chr7 (145-423)||(20583531-20583809)
chr7 (294-445)||(34241314-34241465)
chr7 (152-325)||(28722200-28722373)
chr7 (58-258)||(34241096-34241297)
chr7 (152-445)||(38424189-38424482)
chr7 (287-445)||(4446182-4446340)
chr7 (288-446)||(17947712-17947870)
chr7 (288-389)||(46474027-46474128)
chr7 (288-392)||(9723927-9724031)
chr7 (217-435)||(28390292-28390510)
chr7 (330-392)||(25124153-25124215)
chr7 (294-435)||(13448953-13449094)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (14-459)||(32898746-32899191)
chr6 (14-424)||(18432634-18433043)
chr6 (21-410)||(16086022-16086411)
chr6 (14-410)||(16106526-16106917)
chr6 (16-438)||(22440911-22441331)
chr6 (14-442)||(18777119-18777530)
chr6 (17-423)||(18570271-18570675)
chr6 (16-438)||(13014557-13014979)
chr6 (131-438)||(31628245-31628552)
chr6 (16-445)||(18398909-18399337)
chr6 (169-459)||(18381684-18381974)
chr6 (62-424)||(25367129-25367493)
chr6 (281-457)||(35015278-35015454)
chr6 (63-459)||(21623124-21623522)
chr6 (117-445)||(22361714-22362042)
chr6 (281-457)||(19983412-19983588)
chr6 (176-442)||(28195101-28195367)
chr6 (286-438)||(25744331-25744483)
chr6 (16-435)||(35135860-35136279)
chr6 (16-435)||(33324673-33325092)
chr6 (337-445)||(18823565-18823672)
chr6 (337-445)||(18839420-18839527)
chr6 (281-441)||(26089710-26089869)
chr6 (281-445)||(18583304-18583451)
chr6 (217-446)||(25651206-25651435)
chr6 (52-420)||(21410933-21411301)
chr6 (281-423)||(23994914-23995057)
chr6 (281-442)||(15742341-15742505)
chr6 (281-442)||(18002617-18002777)
chr6 (58-445)||(18629497-18629888)
chr6 (16-392)||(15079559-15079932)
chr6 (60-445)||(33538261-33538646)
chr6 (58-435)||(16887680-16888059)
chr6 (14-98)||(25640408-25640491)
chr6 (58-355)||(17083088-17083384)
chr6 (332-438)||(25919590-25919696)
chr6 (145-445)||(29605420-29605719)
chr6 (283-421)||(35009569-35009706)
chr6 (125-358)||(17556977-17557206)
chr6 (294-435)||(19854135-19854276)
chr6 (288-446)||(34966836-34966994)
chr6 (283-407)||(27740848-27740971)
chr6 (16-56)||(31628549-31628589)
chr6 (330-437)||(15740207-15740314)
chr6 (285-353)||(29665936-29666004)
chr6 (337-445)||(4991042-4991150)
chr6 (58-94)||(25919936-25919972)
chr6 (288-392)||(29160423-29160527)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (16-424)||(50111899-50112307)
chr3 (14-442)||(54423986-54424413)
chr3 (14-423)||(17100645-17101053)
chr3 (14-423)||(17101330-17101738)
chr3 (17-423)||(12349388-12349799)
chr3 (16-438)||(14298399-14298820)
chr3 (16-438)||(14304026-14304447)
chr3 (16-438)||(14295415-14295837)
chr3 (14-459)||(22144119-22144563)
chr3 (16-459)||(35123652-35124094)
chr3 (16-438)||(17522738-17523159)
chr3 (14-460)||(317357-317800)
chr3 (16-438)||(14301042-14301464)
chr3 (14-459)||(6154177-6154621)
chr3 (14-424)||(16995908-16996315)
chr3 (16-404)||(8631801-8632187)
chr3 (16-459)||(55440706-55441141)
chr3 (18-459)||(13817471-13817906)
chr3 (16-424)||(16181796-16182201)
chr3 (18-438)||(19570542-19570957)
chr3 (16-424)||(3578082-3578487)
chr3 (14-338)||(34439189-34439513)
chr3 (17-407)||(17938582-17938969)
chr3 (52-442)||(17139481-17139872)
chr3 (16-411)||(11060855-11061249)
chr3 (14-303)||(38527841-38528127)
chr3 (58-442)||(11328854-11329235)
chr3 (153-424)||(53898440-53898710)
chr3 (24-442)||(12560092-12560510)
chr3 (168-416)||(19260839-19261087)
chr3 (20-437)||(14059067-14059482)
chr3 (16-209)||(14527928-14528121)
chr3 (58-424)||(16880114-16880482)
chr3 (186-459)||(6146764-6147036)
chr3 (14-168)||(6146615-6146769)
chr3 (103-410)||(12488662-12488968)
chr3 (128-459)||(17191500-17191827)
chr3 (58-444)||(39656497-39656883)
chr3 (275-442)||(14528118-14528286)
chr3 (285-457)||(17956109-17956281)
chr3 (14-353)||(30207278-30207619)
chr3 (281-438)||(30152919-30153076)
chr3 (272-410)||(12349834-12349971)
chr3 (281-445)||(33341852-33342015)
chr3 (125-435)||(3576396-3576705)
chr3 (281-423)||(38167906-38168048)
chr3 (281-445)||(7853953-7854116)
chr3 (142-442)||(15876041-15876341)
chr3 (281-445)||(54685422-54685585)
chr3 (281-442)||(45581604-45581765)
chr3 (337-445)||(19946669-19946776)
chr3 (281-442)||(3992522-3992684)
chr3 (125-459)||(17204656-17204970)
chr3 (283-480)||(13838831-13839027)
chr3 (281-442)||(54038245-54038406)
chr3 (20-445)||(12952934-12953361)
chr3 (281-410)||(2844196-2844325)
chr3 (281-410)||(16261458-16261587)
chr3 (281-442)||(23492346-23492507)
chr3 (281-423)||(53771032-53771175)
chr3 (56-438)||(47784648-47785017)
chr3 (58-445)||(9590643-9591031)
chr3 (132-242)||(11196283-11196393)
chr3 (330-438)||(38811170-38811278)
chr3 (59-435)||(14080489-14080867)
chr3 (16-104)||(40939437-40939525)
chr3 (168-445)||(6228625-6228902)
chr3 (58-423)||(14814653-14815020)
chr3 (217-445)||(34559869-34560097)
chr3 (368-435)||(28558186-28558253)
chr3 (125-236)||(15517810-15517920)
chr3 (281-445)||(1990772-1990937)
chr3 (14-63)||(13835973-13836022)
chr3 (337-438)||(17960482-17960583)
chr3 (337-457)||(16934151-16934270)
chr3 (58-236)||(11882108-11882286)
chr3 (441-479)||(15468630-15468668)
chr3 (218-354)||(11638418-11638554)
chr3 (448-480)||(48421672-48421704)
chr3 (58-137)||(48421855-48421935)
chr3 (330-434)||(51961299-51961403)
chr3 (288-355)||(43427636-43427703)
chr3 (339-437)||(4162376-4162474)
chr3 (441-479)||(22275137-22275175)
chr3 (145-258)||(4145791-4145903)
chr3 (52-93)||(12487660-12487701)
chr3 (283-459)||(15859154-15859330)
chr3 (166-446)||(31412331-31412611)
chr3 (416-457)||(49232396-49232437)
chr3 (58-94)||(17960201-17960237)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (17-459)||(8942-9385)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (14-459)||(38254-38699)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (16-438)||(112394-112812)
scaffold0022 (58-438)||(102810-103192)
scaffold0022 (142-442)||(109563-109863)
scaffold0022 (21-94)||(109905-109977)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (81-480)||(252902-253301)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (20-445)||(21482-21905)
scaffold0120 (20-445)||(31181-31604)
scaffold0120 (20-173)||(47402-47554)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (16-459)||(117810-118255)
scaffold0035 (16-459)||(109309-109754)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (14-438)||(60784-61208)
scaffold0001 (14-459)||(70471-70913)
scaffold0001 (14-202)||(79736-79924)
scaffold0001 (283-480)||(171842-172038)
scaffold0001 (283-480)||(177545-177741)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (16-445)||(115-542)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (14-438)||(1168052-1168474)
chr5 (14-442)||(20712049-20712477)
chr5 (16-459)||(11337034-11337476)
chr5 (14-424)||(21397080-21397493)
chr5 (16-411)||(24182980-24183372)
chr5 (17-459)||(4865218-4865658)
chr5 (16-438)||(19405514-19405938)
chr5 (14-438)||(21906697-21907099)
chr5 (16-438)||(28261498-28261913)
chr5 (14-459)||(21646588-21647030)
chr5 (63-445)||(11584021-11584405)
chr5 (131-459)||(24475539-24475861)
chr5 (16-438)||(23466434-23466834)
chr5 (281-480)||(2031745-2031944)
chr5 (52-442)||(3673835-3674226)
chr5 (52-442)||(23493892-23494283)
chr5 (117-441)||(19862183-19862507)
chr5 (58-438)||(7728397-7728779)
chr5 (85-412)||(23981433-23981760)
chr5 (58-446)||(432432-432820)
chr5 (52-442)||(16595481-16595871)
chr5 (128-442)||(5450804-5451117)
chr5 (281-438)||(11342661-11342819)
chr5 (58-354)||(28902252-28902550)
chr5 (58-354)||(28938647-28938945)
chr5 (281-442)||(21650668-21650829)
chr5 (105-446)||(21222547-21222886)
chr5 (58-421)||(21617010-21617375)
chr5 (281-442)||(21204898-21205060)
chr5 (60-278)||(21310600-21310819)
chr5 (152-445)||(29917935-29918228)
chr5 (16-94)||(22662530-22662608)
chr5 (58-437)||(37983342-37983722)
chr5 (145-445)||(6456594-6456891)
chr5 (58-278)||(21297064-21297285)
chr5 (58-190)||(32966037-32966171)
chr5 (145-392)||(24084100-24084348)
chr5 (426-479)||(17471854-17471907)
chr5 (283-392)||(22053963-22054072)
chr5 (337-445)||(109010-109118)
chr5 (217-392)||(26559864-26560039)
chr5 (330-438)||(32966309-32966417)
chr5 (295-390)||(16835426-16835521)
chr5 (286-348)||(18531200-18531262)
chr5 (416-457)||(1219775-1219816)
chr5 (337-445)||(16105613-16105721)
chr5 (416-457)||(22883339-22883380)
chr5 (288-392)||(23417264-23417368)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (14-442)||(35054729-35055157)
chr1 (14-460)||(49967606-49968050)
chr1 (18-438)||(21718206-21718623)
chr1 (14-410)||(22402956-22403351)
chr1 (16-355)||(9783914-9784248)
chr1 (73-438)||(41212046-41212412)
chr1 (14-415)||(27329612-27330002)
chr1 (16-246)||(35522200-35522430)
chr1 (17-442)||(51627513-51627938)
chr1 (125-459)||(20177131-20177464)
chr1 (281-459)||(35522432-35522610)
chr1 (58-442)||(22143251-22143635)
chr1 (281-457)||(44035092-44035267)
chr1 (281-438)||(22366996-22367152)
chr1 (63-459)||(13376752-13377131)
chr1 (281-438)||(15861547-15861702)
chr1 (58-352)||(16645975-16646271)
chr1 (281-442)||(21859984-21860145)
chr1 (58-354)||(16656699-16656997)
chr1 (305-411)||(9784237-9784343)
chr1 (58-444)||(17608899-17609286)
chr1 (58-411)||(37233749-37234103)
chr1 (58-438)||(19603074-19603454)
chr1 (145-443)||(21194986-21195284)
chr1 (14-97)||(20346342-20346424)
chr1 (331-460)||(41229102-41229231)
chr1 (58-438)||(22829315-22829694)
chr1 (330-459)||(36356455-36356581)
chr1 (58-190)||(20955329-20955461)
chr1 (330-438)||(27674774-27674881)
chr1 (330-438)||(20955601-20955709)
chr1 (58-190)||(36356181-36356315)
chr1 (166-442)||(8537908-8538184)
chr1 (166-442)||(8603147-8603423)
chr1 (283-348)||(20445747-20445812)
chr1 (283-348)||(20531512-20531577)
chr1 (330-438)||(38033836-38033943)
chr1 (166-392)||(40436267-40436493)
chr1 (58-258)||(49997169-49997371)
chr1 (416-457)||(18060013-18060054)
chr1 (103-190)||(27675021-27675107)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (14-424)||(1308-1716)
scaffold0359 (18-459)||(11504-11942)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (22-424)||(85323-85724)
scaffold0014 (16-459)||(159257-159698)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (14-459)||(41246614-41247057)
chr8 (16-459)||(20573040-20573483)
chr8 (14-459)||(37611624-37612068)
chr8 (14-442)||(20481578-20482003)
chr8 (16-347)||(20561479-20561810)
chr8 (16-460)||(19992906-19993346)
chr8 (14-419)||(22234652-22235054)
chr8 (16-423)||(21680994-21681403)
chr8 (16-442)||(39446614-39447039)
chr8 (207-421)||(20653944-20654158)
chr8 (14-231)||(25122626-25122841)
chr8 (104-460)||(23837153-23837508)
chr8 (221-421)||(20647882-20648082)
chr8 (281-480)||(41506930-41507129)
chr8 (105-455)||(21198090-21198439)
chr8 (14-158)||(20529699-20529843)
chr8 (117-424)||(38533640-38533947)
chr8 (52-337)||(22981351-22981633)
chr8 (58-445)||(5854584-5854972)
chr8 (85-445)||(26011464-26011824)
chr8 (281-457)||(24716983-24717159)
chr8 (58-445)||(15933268-15933656)
chr8 (58-438)||(22735736-22736108)
chr8 (281-442)||(274416-274577)
chr8 (281-442)||(641272-641433)
chr8 (281-442)||(827078-827239)
chr8 (281-442)||(16039002-16039163)
chr8 (339-459)||(20567329-20567449)
chr8 (339-459)||(20573522-20573642)
chr8 (380-480)||(24929018-24929117)
chr8 (58-445)||(33528396-33528783)
chr8 (281-441)||(39115249-39115409)
chr8 (63-445)||(23225973-23226353)
chr8 (58-445)||(23149751-23150135)
chr8 (357-459)||(20567188-20567290)
chr8 (145-382)||(29306450-29306687)
chr8 (360-438)||(29759919-29759997)
chr8 (337-480)||(2544886-2545024)
chr8 (125-278)||(17285341-17285493)
chr8 (152-422)||(38635632-38635902)
chr8 (152-445)||(18261455-18261748)
chr8 (333-438)||(25122513-25122618)
chr8 (59-190)||(15970046-15970177)
chr8 (332-459)||(31194488-31194615)
chr8 (59-445)||(23158133-23158514)
chr8 (294-445)||(33611179-33611330)
chr8 (82-160)||(7000539-7000616)
chr8 (16-78)||(20653881-20653943)
chr8 (16-98)||(21259345-21259426)
chr8 (294-445)||(27233193-27233344)
chr8 (166-392)||(45558935-45559161)
chr8 (294-424)||(23151959-23152089)
chr8 (21-190)||(31194176-31194346)
chr8 (333-410)||(24385916-24385993)
chr8 (330-438)||(15969796-15969903)
chr8 (363-459)||(17285223-17285319)
chr8 (217-354)||(33172289-33172426)
chr8 (288-355)||(22497329-22497396)
chr8 (147-254)||(25296319-25296426)
chr8 (147-254)||(25758339-25758446)
chr8 (145-236)||(27233067-27233158)
chr8 (416-457)||(15319414-15319455)
chr8 (416-457)||(15499783-15499824)
chr8 (416-457)||(22006513-22006554)
chr8 (416-457)||(22089049-22089090)
chr8 (448-480)||(23217972-23218004)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (17-480)||(11557-12020)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (62-435)||(1-371)
scaffold0160 (341-480)||(3454-3593)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (16-438)||(11417-11837)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (14-451)||(669-1105)
scaffold0673 (14-438)||(6694-7118)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (14-442)||(24574-25002)
scaffold0037 (281-442)||(94948-95109)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (14-459)||(254662-255105)
scaffold0011 (14-459)||(261268-261711)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (14-403)||(7581-7970)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (16-438)||(424-846)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (16-438)||(9914-10334)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (63-438)||(1358-1732)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (121-473)||(4883-5235)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (14-442)||(4536-4961)
scaffold0447 (14-442)||(9150-9575)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (16-459)||(5097-5537)
scaffold0480 (16-442)||(8729-9156)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (20-459)||(1871-2310)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (14-442)||(7144-7570)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (14-438)||(48124-48544)
scaffold0068 (14-438)||(61572-61992)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (14-438)||(14854-15272)
scaffold0083 (345-438)||(14194-14287)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (18-411)||(33666-34059)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (14-411)||(46169-46566)
scaffold0034 (14-411)||(40662-41059)
scaffold0034 (281-423)||(79856-79998)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (63-445)||(10-390)
scaffold0310 (63-372)||(6304-6612)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (18-459)||(164171-164609)
scaffold0016 (281-457)||(162299-162476)
scaffold0016 (281-457)||(166385-166554)
scaffold0016 (342-459)||(116687-116804)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (16-438)||(31021-31444)
scaffold0031 (16-374)||(70654-71011)
scaffold0031 (64-445)||(97093-97475)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (62-409)||(25218-25564)
scaffold0158 (163-445)||(24930-25210)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (63-442)||(15367-15748)
scaffold0077 (145-445)||(6514-6814)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (16-424)||(3310-3718)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (96-442)||(5913-6261)
scaffold0342 (281-457)||(572-747)
scaffold0342 (20-94)||(12590-12664)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (16-349)||(4351-4681)
scaffold0740 (364-460)||(4262-4358)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (16-442)||(33576-34001)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (168-442)||(146574-146848)
scaffold0025 (63-445)||(53317-53699)
scaffold0025 (145-445)||(85503-85802)
scaffold0025 (283-348)||(8917-8982)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (63-459)||(76740-77138)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (63-313)||(20274-20524)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (268-438)||(618-788)
scaffold0195 (283-421)||(19202-19339)
scaffold0195 (283-421)||(21286-21423)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (310-480)||(30026-30196)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (18-218)||(2917-3115)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (16-442)||(2165-2590)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (63-255)||(19850-20041)
scaffold0122 (63-255)||(24154-24345)
scaffold0122 (339-480)||(24368-24509)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (310-445)||(3270-3404)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (281-457)||(6204-6380)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (281-457)||(31401-31577)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (281-457)||(41267-41443)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (16-294)||(7927-8204)
scaffold0589 (336-442)||(7807-7913)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (274-459)||(32159-32344)
scaffold0091 (274-459)||(41959-42144)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (169-459)||(35435-35724)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (58-445)||(28506-28895)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (145-443)||(2497-2795)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (58-445)||(69427-69815)
scaffold0009 (363-480)||(271962-272078)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (169-445)||(6631-6907)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (117-462)||(6974-7319)
scaffold0162 (283-398)||(8310-8422)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (281-449)||(17525-17693)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (58-435)||(197142-197520)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (62-424)||(8001-8364)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (125-438)||(93730-94042)
scaffold0032 (281-442)||(55553-55715)
scaffold0032 (58-435)||(104513-104889)
scaffold0032 (412-480)||(13537-13605)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (281-442)||(12641-12802)
scaffold0039 (310-442)||(19051-19183)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (392-480)||(1334-1422)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (288-442)||(10094-10248)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (63-188)||(1-125)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (281-440)||(6664-6823)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (281-442)||(1099-1261)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (52-442)||(11067-11457)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (281-442)||(13507-13669)
scaffold0251 (281-423)||(21481-21624)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (281-442)||(14921-15083)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (281-442)||(9628-9789)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (16-198)||(89713-89894)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (58-445)||(30990-31378)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (288-445)||(279-436)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (16-431)||(70154-70569)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (16-435)||(10642-11060)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (281-442)||(193609-193770)
scaffold0004 (281-423)||(186647-186789)
scaffold0004 (166-445)||(27467-27746)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (281-440)||(149-308)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (58-445)||(43687-44075)
scaffold0080 (142-389)||(23646-23893)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (14-97)||(8665-8747)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (16-411)||(1394-1790)
scaffold0456 (16-411)||(8539-8935)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (62-435)||(79519-79892)
scaffold0028 (283-354)||(89584-89655)
scaffold0028 (337-445)||(130526-130634)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (52-198)||(1231-1378)
scaffold0409 (52-198)||(9486-9633)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (298-446)||(2424-2572)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (14-160)||(5523-5670)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (283-353)||(51312-51382)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (286-438)||(41626-41778)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (217-435)||(21979-22197)
scaffold0165 (168-435)||(29944-30211)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (283-407)||(13516-13639)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (175-445)||(7372-7642)
scaffold0253 (175-445)||(16797-17067)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (217-446)||(7724-7953)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (339-423)||(1117-1201)
scaffold0387 (145-258)||(939-1052)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (371-442)||(22715-22786)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (217-443)||(107983-108207)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (52-411)||(22312-22661)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (346-435)||(5162-5251)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (219-435)||(37538-37754)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (339-411)||(5961-6033)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (166-392)||(3275-3500)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (294-445)||(22548-22699)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (283-376)||(3002-3096)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (275-389)||(17428-17542)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (275-389)||(61341-61455)
[»] scaffold0786 (1 HSPs)
scaffold0786 (346-435)||(1574-1663)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (363-424)||(3318-3379)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (448-480)||(201-233)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (448-480)||(1629-1661)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25602426 - 25601959
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caat 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25602426 gaagagctatgagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaat 25602327  T
Q  113 tatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagt 211  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25602326 tat-tgtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagt 25602228  T
Q  212 tatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25602227 tatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgagaaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgagttatgctatgtggt 25602128  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25602127 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaatcatggcttaggtttgcatgattcatgatttg 25602028  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25602027 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 25601959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 28974447 - 28974003
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  28974447 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttatttcaatttttcaatta 28974349  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  28974348 t-tgtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttat 28974250  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  28974249 ggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcatttggcgaattatgctatgttgttga 28974150  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28974149 tgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 28974050  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatta 460  Q
     |||||||||   ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  28974049 atgagaaatgagatgttgttggtgttttagtgaaaattggtgaatta 28974003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Original strand, 36890532 - 36890959
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36890532 gaagagctagcagcaaaattgaagcctaagctatagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgttattttcaatt 36890631  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36890632 atg-gtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattgtgatggcatgtttagatgtatgaagtta 36890730  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36890731 tggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatggaatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctatgttgttg 36890830  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36890831 ataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggcttgggtatgcatgattcttgatttgtt 36890930  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  36890931 gttgagaaataagttgttgttgttggttt 36890959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 271568 - 271126
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  271568 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctaaggagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 271470  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  271469 t-tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattattcataaatgaagaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttat 271371  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||     
T  271370 ggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgt 271271  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  271270 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatagcttgggtttgcatgattcatgatttg-tg 271172  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    ||||| ||||   ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  271171 ttgaggaatgagatgttgttggtgctttggtgaaaattggtgaatt 271126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 4447981 - 4448402
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4447981 agagctagaagcaaaattgaagcctaaactagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 4448079  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4448080 tttatatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttat 4448179  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |   |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  4448180 ggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaatgggtttgtgttgaaaatatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgt 4448279  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4448280 tgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tg 4448378  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||| |||||   |||||||||||    
T  4448379 ttgaaaaatgagatgttgttggtg 4448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27262201 - 27261761
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatc 116  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  27262201 agctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggagttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattat- 27262103  T
Q  117 tgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  27262102 tgtatgaataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgccctaattatgatgacatgtttggatgtataaagttatg 27262003  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |  |||     
T  27262002 gataattgaattgttgttagttcaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaatatgctc-attggtgaattatgctcaaagtatgag 27261904  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261903 aaat--tgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 27261806  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaa-ttggtgaatt 459  Q
    | |||||||   ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  27261805 taagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaacttggtgaatt 27261761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 23836555 - 23836996
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23836555 agagctaggagcaaaattgaagcctaagcttaggagattaacata-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat 23836652  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23836653 ttgaatgataagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 23836752  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  23836753 aatgattgaattgt-gttagtggaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 23836850  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23836851 atgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcattttgttgatgataattcatgacttgggtttgcataattcttgatttgtt 23836950  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||   ||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  23836951 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 23836996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 442
Target Start/End: Original strand, 25875770 - 25876193
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25875770 agagctacgagcaaaattgaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat 25875867  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25875868 ttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 25875967  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  25875968 aataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 25876064  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  25876065 atgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggcttgtt 25876164  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
     ||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  25876165 attgtgaaataagttgttgttgttggttt 25876193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 82 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 32466189 - 32465822
Alignment:
Q  82 ttcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctcta 181  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||| || ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32466189 ttcatcataatcactt-ttgaaaattttaattatttgtacgataagtgcttatttgaatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 32466091  T
Q  182 attatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaat 281  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  32466090 attgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatggatatgtgt-gaaaat 32465992  T
Q  282 atgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 381  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  32465991 atgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 32465892  T
Q  382 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaatt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  32465891 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatt 32465822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 22579711 - 22580129
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaatta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22579711 agagctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatttaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcac-tattgcaatttttcaatta 22579809  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22579810 t-tgtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagtta 22579907  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatga-aaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggt 311  Q
    || ||||||||||||||||||||  || |  ||  |||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   | ||    
T  22579908 tg-ataattgaattgttgttggtgaaactttatgatcaaggtatgagaaaaatgttatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgct---ttgt 22580002  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22580003 tgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttg 22580102  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||    
T  22580103 ttgtggagaaatgagatgttgttggtg 22580129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 442
Target Start/End: Original strand, 24571141 - 24571565
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaat-tttcaatta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24571141 agagctaggagctaaattgaagtttaagatagggagattaatctaactaaggttagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatgtttcaatta 24571239  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  ||||||||     
T  24571240 t-tgtatgaataaatgcttaattgggt-aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttg 24571337  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggtt 312  Q
    || ||| ||||||||||||| |   |||| ||| ||||| |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  24571338 tggatacttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgagaaaatgatatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctatgttttt 24571436  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  24571437 gttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataactcat-gcttggctatgtatgattcatgatttgt 24571535  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  24571536 tgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 24571565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 68350 - 67961
Alignment:
Q  59 taactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgca---attttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | | |   |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  68350 taactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aatagattaattg 68253  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  68252 ttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 68153  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  68152 tatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 68054  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    ||||| || || |||||| || | |||||||||||| || | ||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  68053 tgctaagtgatattgttgttggtgattcatggcttgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtg 67961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22274856 - 22274681
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||     
T  22274856 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgata 22274757  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22274756 gatggcttgggtt-gcatgattcatgaattgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22274681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Original strand, 31146068 - 31146450
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||    ||||||||| |   |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  31146068 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatcttttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaataagtgcttaactgagt-aattgattaatt 31146166  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    || ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||||| |   ||||  || ||||||    
T  31146167 gtccataattgttagaattcgtgttccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaa 31146266  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||||||  ||    
T  31146267 gtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgtg-ttgttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgttactg 31146364  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||  || |||||||||    
T  31146365 ttgctaagtgatgttgttgatgataaatcatggcctaggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttattgttggtg 31146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43646191 - 43645896
Alignment:
Q  117 tgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| |  || |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  |||||||| |     
T  43646191 tgtatgaataagtgtttaattgagtaaat-gattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgtt 43646093  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
     ||||||| ||||||||||||  |||| ||| || ||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||     
T  43646092 gataattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgt 43645994  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    |||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  43645993 tgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgatgattcatgacttgggtgttcataattcatgatttgt 43645896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22284089 - 22283914
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| || |  ||| | ||||||||||| ||     
T  22284089 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatgatgata 22283990  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22283989 catggcttgggtt-gcatgattcatgaattgctgttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22283914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 19666885 - 19666498
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||  | || |||||||||||    
T  19666885 ctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgaataaatgcttaattgaat-aagtgattaattgt 19666788  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||  || | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||  ||  ||||| ||    |||||||||||||| |||||  | || ||| ||||||||    
T  19666787 tcatagttgttaaaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaaagt 19666688  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    ||| | || || ||  |  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||    
T  19666687 atgtataagtgttaacttatgaat-tatgctcaaatggttgaattatgctatgttgttattgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgtt 19666589  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||| || || |||| | |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19666588 gctaagtgatattgtcgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgttttgatgatgagaaatggattgttgttgttggttttgt 19666498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25305635 - 25305405
Alignment:
Q  226 ttgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtgg-ttgatgaattgtg 323  Q
    ||||||||| |  |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25305635 ttgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatgtgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgattgttgaattgtg 25305537  T
Q  324 ataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
     ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25305536 gtaagagtcatgttcaattgatgttgttgtggctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaat 25305437  T
Q  424 ggattgttgttggtggttttgtggaattggtg 455  Q
    |  ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  25305436 gagttgttgttggtagttttgcgaaattggtg 25305405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 722747 - 722372
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtt 156  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  722747 ctaactaaggtaaaggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttgcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgtt 722650  T
Q  157 cataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagta 256  Q
    ||||| || | |||||||||||| |||||||||   ||||||  || |||||| ||    |||||||| |||||||||||  ||||  ||  ||||||||    
T  722649 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatattatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagta 722550  T
Q  257 tgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    |   ||| || ||||||||     ||||||| || ||   |||| || ||||| | || |||||| || | || |||||| |||||||| || |||| ||    
T  722549 tatgaaaatgatatatgtt-----tatgctctaaatgtcaaattgtgatatgttgatgttgaattatgctgagattcatgttcaattgaagtagttgctg 722455  T
Q  356 ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  722454 ctaagtgatgttgttattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttattgatgagatatgagttgttgttggtg 722372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 445
Target Start/End: Original strand, 19433452 - 19433609
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||    
T  19433452 aattgttgaattatgctatgttgttattgaattgttgtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggct 19433551  T
Q  388 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19433552 tgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 19433609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6879577 - 6879414
Alignment:
Q  275 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatg 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  6879577 tgaaaatatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatg 6879478  T
Q  375 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||| |||| |||||||||  || |||| || |||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  6879477 ataatacatgtcttgggtttaaataattcttggtttgttgttgagaattgagatgttgttggtg 6879414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 442
Target Start/End: Original strand, 9653021 - 9653179
Alignment:
Q  285 ctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 384  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||||||||    
T  9653021 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 9653120  T
Q  385 gcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  9653121 gcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9653179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 285 - 423
Target Start/End: Original strand, 21274174 - 21274312
Alignment:
Q  285 ctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 384  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||||||    
T  21274174 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 21274273  T
Q  385 gcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaat 423  Q
    ||||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  21274274 gcttggg-tagcatgattcataattttgttgttgtgaaat 21274312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 330 - 438
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3510
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| | |||||||||  |||    
T  3403 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatga-ttgtagatgagaaatgagttg 3501  T
Q  430 ttgttggtg 438  Q
    |||||||||    
T  3502 ttgttggtg 3510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 407
Target Start/End: Original strand, 19668957 - 19669348
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaatttt-caatt 113  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | |||||| || ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| || | || |||||| |||||    
T  19668957 agagctaggagctaaagtgaagcttgagctaggga-attaatctaactaaggtaacggggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaatt 19669055  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||| |||| ||| ||||||  ||  ||||| ||    
T  19669056 at-tgtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcatagatgttaaaatccatgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaatt 19669153  T
Q  213 -atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtgg 310  Q
     |||| ||||||| |||||||||||  |||| ||| ||| |||||||   || || ||  |  ||||   ||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19669154 gatga-taattgagttgttgttggtgaaattgcatgttctaagtatgtgtaagtgttaacttgtgaatc-atgcttaattggttgaattatgatatgttg 19669251  T
Q  311 ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 407  Q
    ||| |||||| ||||  |   |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  19669252 ttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatga 19669348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 446
Target Start/End: Original strand, 23821731 - 23821883
Alignment:
Q  294 tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||| |||||     
T  23821731 tgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtg 23821830  T
Q  394 tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    | ||| |||||||||||| || || |||||   ||||||||| ||||||||||    
T  23821831 ttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtg 23821883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 446
Target Start/End: Original strand, 23830810 - 23830962
Alignment:
Q  294 tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||| |||||     
T  23830810 tgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtg 23830909  T
Q  394 tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    | ||| |||||||||||| || || |||||   ||||||||| ||||||||||    
T  23830910 ttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtg 23830962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17367219 - 17367119
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaaccta--actaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaa 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17367219 gaagagctacgagcaaaattgaagcctaagctagaga-attaacctactaattaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgtaatattcaa 17367121  T
Q  112 tt 113  Q
    ||    
T  17367120 tt 17367119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 24884884 - 24884656
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||  ||| || |||||  |||   ||||||| || || |||||| ||||||||  ||| |    
T  24884884 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgatatattgtgagt-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgtt 24884786  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||    || |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | |||||||||| ||     
T  24884785 gaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatgatttgatga 24884686  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
     ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  24884685 ggagaaatgagttgttgttgttggttttgt 24884656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 423
Target Start/End: Original strand, 24294374 - 24294778
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatc 116  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | |    ||||||||||| |     
T  24294374 ctaggagctaaattgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttaaagttcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgt- 24294471  T
Q  117 tgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-at 214  Q
    |||||||| || | |||||||| || |||||||||||||||||| | || |  ||||||||||| ||||||||||  ||  ||  || |  ||| || ||    
T  24294472 tgtatgaataaattcttaattgagt-aattgattaattgttcatgattgttagaattcgtgctccaattatgatgttataattgtatgtgagaaattgat 24294570  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||||| |||||||||||  ||||  ||  |||||||||   ||| || |||||||| | | ||||||| || ||   |||| || ||||| | ||    
T  24294571 ga-taattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatatgtt-atattatgctccaaatgtcaaattgtgatatgttgatg 24294668  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     |||||| || | || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||     
T  24294669 ttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgtg 24294768  T
Q  414 gttgagaaat 423  Q
    | ||||||||    
T  24294769 gatgagaaat 24294778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 438
Target Start/End: Original strand, 25265520 - 25265675
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| | || | |||    
T  25265520 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatca 25265619  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||  || |||||||||||||    
T  25265620 tggcttgggtatgcat-attcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtg 25265675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 355
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775392
Alignment:
Q  169 aattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggt 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |   |||||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||| ||| |  |    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttat 22775305  T
Q  269 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||||||||||  | || |||| ||  ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  22775306 atatgttgaat-tgtgttcaaatttatgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttg 22775392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 355
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780770
Alignment:
Q  169 aattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggt 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |   |||||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||| ||| |  |    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttat 22780683  T
Q  269 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||||||||||  | || |||| ||  ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  22780684 atatgttgaat-tgtgttcaaatttatgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttg 22780770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 243
Target Start/End: Original strand, 23821529 - 23821714
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| || |||   ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23821529 ctaactaaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 23821626  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaatta 243  Q
    |||||  || | |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||  | |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23821627 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatta 23821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 243
Target Start/End: Original strand, 23830608 - 23830793
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| || |||   ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23830608 ctaactaaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 23830705  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaatta 243  Q
    |||||  || | |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||  | |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23830706 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatta 23830793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 9636943 - 9636715
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| || |||||  ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |    
T  9636943 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 9636845  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| | |||||| | ||| | |||||| ||  ||     
T  9636844 gaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcataaatcatgagtttgtga 9636745  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    || |||||   ||||||||| |||||||||    
T  9636744 tgtgaaataacttgttgttgttggttttgt 9636715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 24087345 - 24087417
Alignment:
Q  125 aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 198  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24087345 aagtgcttaattgagt-aagtgattaattattcataaatgttaaaattcgggctctaattatgatgatatgttt 24087417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 355
Target Start/End: Original strand, 24341519 - 24341591
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24341519 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttg 24341591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7321914 - 7321837
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactta 98  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  7321914 ctaggagctaaattgaagtttgagcttggga-attaatctaactaaggtaagggggttagaattcattataatcactta 7321837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24278010 - 24277739
Alignment:
Q  166 tgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaatt 265  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||| ||||  ||    | ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| |    
T  24278010 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgacaattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 24277911  T
Q  266 ggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcat 364  Q
    | |||||  ||||  | ||||| ||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | || |||||||||||||| || |  ||    
T  24277910 gatatattgtgaat-tgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagagat 24277812  T
Q  365 gttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggt 437  Q
     |||||| |||| |||||| ||||||||   ||| | |||||||||| || || |||||   |||||||||||    
T  24277811 attgttgttgatgattcatagcttgggtactcataaatcatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttggt 24277739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 190
Target Start/End: Original strand, 3135 - 3269
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattg---caattttcaattatctgtatga-aaagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3135 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgt-tgtatgattatgtgcttaattgagt-aattgattaatt 3232  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatg 190  Q
    |||||| | || |  |||||||||||  |||||||||    
T  3233 gttcatgattgttagaattcgtgctcctattatgatg 3269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25305729 - 25305648
Alignment:
Q  117 tgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |  || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25305729 tgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgttt 25305648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 421
Target Start/End: Original strand, 36982571 - 36982708
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||| | || | ||| || |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  36982571 tgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 36982670  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa 421  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  36982671 ttgtttgggtatgcat-attcatgaattgatgatgagaa 36982708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12728393 - 12728352
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12728393 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 12728352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19660150 - 19660037
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    |||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||| ||    ||||||||||| ||||||||  |||| |    
T  19660150 tgattatttgttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgatatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgc 19660051  T
Q  245 attttcaaagtatg 258  Q
    || |||| ||||||    
T  19660050 atgttcatagtatg 19660037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Original strand, 24686036 - 24686077
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24686036 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 24686077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34824476 - 34824435
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34824476 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 34824435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6094843 - 6094739
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  6094843 aattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 6094744  T
Q  388 tgggt 392  Q
    |||||    
T  6094743 tgggt 6094739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 392
Target Start/End: Original strand, 24560867 - 24560955
Alignment:
Q  304 tatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
    ||||| |||| |||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  24560867 tatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 24560955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 34395658 - 34395193
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34395658 gaagagctaggagaaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcattatcacttattgcaattttcaatt 34395559  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34395558 atttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaactgattaattgttcataaatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtaa 34395459  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  34395458 tgaataattgaattgt-gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgt 34395361  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34395360 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatgatttg 34395261  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34395260 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttgttgttgaaa 34395193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 44056315 - 44055871
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44056315 gaagagctaggagcaaaattgaaacctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaatt 44056216  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44056215 atttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 44056116  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  44056115 tgaat-tttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgaatatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttg 44056017  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44056016 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtt 44055917  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  44055916 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 44055871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Original strand, 21959310 - 21959733
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21959310 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaatt 21959409  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  21959410 atttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattaattgattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaaatgtatgaagtta 21959509  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21959510 tggatatttgaattgttgttgattgaattaca-tctcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 21959608  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  21959609 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggcttgcatgattcatagtttgtg 21959708  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||  | |||||||||||    
T  21959709 gttgagaaattaaatgttgttggtg 21959733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16732567 - 16732124
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttc-aatta 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16732567 agagctaggaccaaaattgaagcctaaactagggagattaatctaactaaggtaaagaggttagaattcatcataatca-ttattgcaattttttaatta 16732469  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16732468 g-tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttat 16732370  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16732369 ggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttga 16732270  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732269 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 16732170  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaa-ttggtgaatt 459  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  16732169 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaacttggtgaatt 16732124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 23269783 - 23270225
Alignment:
Q  17 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23269783 gagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatt 23269882  T
Q  117 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga 216  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23269883 tgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatga 23269982  T
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||    
T  23269983 ataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttga 23270080  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23270081 tgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtgg 23270180  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  23270181 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttcgtgaaaatggtgaatt 23270225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 437
Target Start/End: Original strand, 12837048 - 12837468
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12837048 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt 12837146  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12837147 tt-tgaatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaatgatgatattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 12837245  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12837246 tggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 12837345  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12837346 ttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 12837445  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggt 437  Q
    | ||||||||   |||||||||||    
T  12837446 g-tgagaaataagttgttgttggt 12837468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 412
Target Start/End: Original strand, 45458706 - 45459099
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  45458706 agctaggagcaaaattgaagtctaagctaaagagattaacctaactaaggtaag-gggttataattcatcataatcatttattgcaattttcaattattt 45458804  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  45458805 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtgataga 45458904  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatga 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  45458905 taattgaattgttgttagttgaattacatgctcaaaatatgagaagtttgtatatgttaaagatatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttga 45459004  T
Q  318 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45459005 attgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatccatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 45459099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 30458297 - 30457859
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgt 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||    
T  30458297 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttgaattatttgt 30458199  T
Q  120 atgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  30458198 atgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatggata 30458099  T
Q  220 attgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaat 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  30458098 attaaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaat 30457999  T
Q  320 tgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttga 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||| | ||    
T  30457998 tgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcattattttgttataga 30457900  T
Q  419 gaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||   ||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  30457899 gaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 30457859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 62 - 424
Target Start/End: Original strand, 55376493 - 55376853
Alignment:
Q  62 ctaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 161  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  55376493 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcactt-ttgaaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 55376591  T
Q  162 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaa 261  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||    
T  55376592 gtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttctaagtatgaaa 55376691  T
Q  262 aattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgt 361  Q
    ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |    
T  55376692 aatgggtatgtg-tgaaaatatactcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaat 55376790  T
Q  362 catgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 424  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55376791 tatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 55376853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 393
Target Start/End: Original strand, 8872320 - 8872699
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8872320 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaagtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaatt 8872417  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8872418 atttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagcta 8872517  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  8872518 tgaatgattgaagtgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttg 8872616  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8872617 atgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataactcatggcttgggtt 8872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 53704585 - 53705003
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||   | || ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |   | ||||||||||| |    
T  53704585 agctaggagtaaaattgaagcttaagcttaggggagtaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattattt 53704683  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53704684 gtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 53704783  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatga 317  Q
    | |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  53704784 tgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatga 53704882  T
Q  318 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 417  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  53704883 attgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttg 53704982  T
Q  418 agaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||   |||||||||||    
T  53704983 agaaatgagatgttgttggtg 53705003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 410
Target Start/End: Original strand, 819777 - 820154
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  819777 gaagagctatgagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaatt 819876  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  819877 atttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttagatgtatgaagtta 819976  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||||||||||||||| ||||  ||           ||    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  819977 tggataattgaattgttgtt-gttggttt-----------gt---gaaaatgtgtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 820061  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  820062 atgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattt 820154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 44347223 - 44346818
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  44347223 agagttaggagcaaaattgaagcctaagctaaggagattaatcta-ctaaggtaagggagttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat 44347126  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44347125 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 44347026  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatga-aaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |    
T  44347025 aataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtaagaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttca 44346928  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  44346927 tgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttg 44346828  T
Q  415 ttgagaaatg 424  Q
    ||||||||||    
T  44346827 ttgagaaatg 44346818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 30232342 - 30232751
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaa--ttttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30232342 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgcaattttttcaa 30232441  T
Q  112 ttatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaag 210  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30232442 ttat-ggtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaag 30232539  T
Q  211 ttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatg-aaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtg 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  || | |||  ||||||||||  |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30232540 ttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtt 30232637  T
Q  310 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 409  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  30232638 gttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcattattcataatt 30232737  T
Q  410 tgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||| |||||    
T  30232738 tgttgttgtgaaat 30232751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Original strand, 20813393 - 20813658
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20813393 gaagagctaggagcgaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttaaatt 20813492  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20813493 atttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 20813592  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaa 279  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20813593 tggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaa 20813658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 53907560 - 53907966
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |    
T  53907560 agctatgagcaaaattgaagcttaagcttaggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtagttttcaattattt 53907657  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53907658 gtatgataagtgcttaattgg--------attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 53907749  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatga 317  Q
    | ||||||||||| || |||| |||  || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  53907750 tgattgaattgttattagttggattgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatga 53907848  T
Q  318 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 417  Q
    ||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  53907849 attgtgaaatgtttcatgatcaat---tgttgttgttgattagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttg 53907945  T
Q  418 agaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||   |||||||||||    
T  53907946 agaaatgagatgttgttggtg 53907966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 13809359 - 13809766
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    ||||||||| || |||||||||  | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  13809359 agagctaggggctaaattgaagcttgagctaggga-attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaatta 13809457  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||  ||||||||     
T  13809458 t-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttg 13809555  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggtt 312  Q
    |   |||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  13809556 ttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaa-tatgctcaattagttgaattatgctatgttgtt 13809654  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  13809655 gttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggatatgcatgattcatgattggt 13809754  T
Q  413 tgttgagaaatg 424  Q
    ||||||||||||    
T  13809755 tgttgagaaatg 13809766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 459
Target Start/End: Original strand, 18494181 - 18494620
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgt 119  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  18494181 ctaggagctaaattgaggcttaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatg-gt 18494279  T
Q  120 atgaaaag-tgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaat 218  Q
    ||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  18494280 atgaataggtgcttaattgtgt-aattgatcaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagttatga-t 18494377  T
Q  219 aattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatga-aaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||| |||| ||    
T  18494378 aattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaa-tgtgctcaattggttggatgatgctatgttgttgttg 18494476  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 416  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18494477 aattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggtatgcatgattcatgacttgttgtt 18494576  T
Q  417 gagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  18494577 gagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 18494620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Original strand, 52265356 - 52265751
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  52265356 agagctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctgactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaatta 52265455  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||  ||||||||     
T  52265456 t-tgtatgaataagtgtttaattgggt-aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttg 52265553  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    |  ||||||||||||||||| |   ||||  || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||    
T  52265554 ttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgtt 52265652  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| || |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  52265653 gttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttg 52265751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 27961370 - 27960963
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcact--tattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || || || ||||||||    
T  27961370 agagctaggagcaaaagtgaagcttgagctaggga-attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattgttagtgtaaatttcaatt 27961272  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
     | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  27961271 gt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaatccgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagtt 27961174  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||    
T  27961173 atgaataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgaagaagtggtatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgttatattgt 27961075  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||     
T  27961074 tgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt-atgattta 27960976  T
Q  412 ttgttgagaaatg 424  Q
    |||||||||||||    
T  27960975 ttgttgagaaatg 27960963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15045192 - 15044808
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactta--ttgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||   ||  |||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  15045192 attaatctaactaaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgat 15045095  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattt 248  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |    
T  15045094 taattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgt 15044995  T
Q  249 tcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 347  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15044994 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgt 15044896  T
Q  348 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  15044895 tgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttg 15044808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 435
Target Start/End: Original strand, 15109232 - 15109616
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactta--ttgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||   ||  |||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  15109232 attaatctaactaaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgat 15109329  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattt 248  Q
    ||||| |||||||  | |  ||||| ||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |    
T  15109330 taattattcataatagttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgt 15109429  T
Q  249 tcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 347  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15109430 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgt 15109528  T
Q  348 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  15109529 tgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttg 15109616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 14901589 - 14901187
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca-cttattgcaa-ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14901589 ctaactaaggtaagggggttaaatttcatcataatcattttattgcaatttttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattg 14901492  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || |  ||||||||||||||||||||  | ||||||  || |||||| || |  | ||||| ||||||||||||  |||| ||| ||  |||    
T  14901491 ttcatatttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaaattgttgaaaattg-attgttgttggtgaaatttcatgtttgaag 14901393  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||| ||| || ||||||||  |||||||||| || || ||||||||| |||||  ||  ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  14901392 tatgagaaagtgatatatgtt-taaatatgctcaaaatgttgaattatgatatgttattattgaattgtggtaagaatcatattcaattgatgttgttgt 14901294  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattgg 453  Q
    ||||| || ||| ||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  14901293 tgctaagtgatgctgttgttgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatgagaaatgggttgttgttggtggttttgtaaaattgg 14901194  T
Q  454 tgaatta 460  Q
    | |||||    
T  14901193 taaatta 14901187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14951896 - 14951739
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |  ||||| ||||||||||| ||     
T  14951896 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatgatgata 14951797  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951796 tatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 14951739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 25119328 - 25119505
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||     
T  25119328 tatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataatgata 25119427  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25119428 catggcttgggtttgcatgattcataattttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 25119505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 5682648 - 5682824
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||  |   |||| ||||||||||| ||     
T  5682648 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttattcatattgttgatgatgata 5682747  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5682748 tatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 5682824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 217 - 455
Target Start/End: Original strand, 41165995 - 41166233
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |    
T  41165995 ataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 41166093  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    ||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| | | |||||||||||     
T  41166094 gaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcataacttatgatttgttga 41166193  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtg 455  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41166194 tgagaaatgagttgttgtgggtggttttgtgaaattggtg 41166233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 355
Target Start/End: Original strand, 47535042 - 47535252
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  47535042 tgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 47535141  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    |  |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  47535142 aagttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagaatcatgttcaattg 47535240  T
Q  344 atgttgttgttg 355  Q
    | ||||||||||    
T  47535241 acgttgttgttg 47535252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Original strand, 7964601 - 7964988
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  ||||||||||||| || || ||| |||||||    
T  7964601 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgt 7964699  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||  || | |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||    
T  7964700 tcatagttgttaaaatccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa-gt 7964798  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||  ||| || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||||| ||||||||    
T  7964799 atgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgattttgttgtt 7964897  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||| || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  7964898 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgt 7964988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 18276792 - 18276404
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| || |  ||||||||||    
T  18276792 ctaattaaggtaacggggttagaattcaatcataatcatttagtgcgatttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt-atgtgattaattg 18276695  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || | ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||| ||    |||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  18276694 ttcatagttgttaaaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaag 18276595  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
     |||  ||| || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||||| | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  18276594 catgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgt 18276496  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||| | || || |||||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||  | |||| | ||  ||||||||| |||||||||    
T  18276495 tgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatgatttgacgatgagtattgagttgttgttgttggttttgt 18276404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 7185734 - 7186111
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtt 156  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  |||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  7185734 ctaattaaggtaaggaggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgtt 7185832  T
Q  157 cataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagta 256  Q
    ||||  || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| |||   ||||||||||||||||||||  ||||  || |||| ||||    
T  7185833 catagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagta 7185932  T
Q  257 tgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||  ||| || ||||||||| || | ||| | || || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  7185933 tgtgaaaatgatatatgttg-aattgtgcactaaatgatgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 7186031  T
Q  356 ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||| |  || || ||| |||| ||||||||||||||| |  || | |||||||||| || ||||| |||  |||||||||    
T  7186032 ctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatcatgatttgatgatgagatatgagttgttgttg 7186111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 443
Target Start/End: Original strand, 41256259 - 41256644
Alignment:
Q  59 taactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcactta-ttgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||  |||   ||||||   |||||||||||||  | || |||||||||||    
T  41256259 taactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgt 41256357  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||    
T  41256358 tcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgttga-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 41256456  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||  ||| || |||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||   |||| | ||||||||||||||||    
T  41256457 atgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaaccatgtttaattgatgttgttgtt 41256555  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttt 443  Q
    | || |  || |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  41256556 gttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttt 41256644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Original strand, 15272433 - 15272576
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |  ||| |||||    
T  15272433 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaatt 15272532  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  15272533 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaat 15272576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 15013172 - 15013549
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcactta-ttgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| || | ||||||   |||||||||||||  | || ||||||||||    
T  15013172 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttcatttgt-tgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattg 15013269  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |    
T  15013270 ttcatagttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgttga-atgcatgaaattgatga-taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 15013367  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||  ||| ||  ||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||| ||||||    
T  15013368 gtatgtgaaaatgacatattgtgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttg 15013466  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  15013467 ttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttg 15013549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 438
Target Start/End: Original strand, 19821940 - 19822046
Alignment:
Q  332 catgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  19821940 catgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtt 19822039  T
Q  432 gttggtg 438  Q
     ||||||    
T  19822040 tttggtg 19822046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 330 - 438
Target Start/End: Original strand, 37957187 - 37957295
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||    
T  37957187 ttcatgttcaattgatgtggttgctgctaagtgatgttgttattgataattcacggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgataaatgagttg 37957286  T
Q  430 ttgttggtg 438  Q
    |||||||||    
T  37957287 ttgttggtg 37957295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 445
Target Start/End: Original strand, 40904918 - 40905210
Alignment:
Q  152 ttgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttca 251  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||    
T  40904918 ttgttcatagttgttgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 40905017  T
Q  252 aagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgt 350  Q
     ||||||  ||| || |  ||  ||||  | | ||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||    
T  40905018 tagtatgtgaaaatgatgcattgtgaat-tgtactccaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtt-aattgatgttgt 40905115  T
Q  351 tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||||||| |  || |||||| |||| | || |||||||||| | ||| | |||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  40905116 tgttgctaagagatattgttgttgatgactcgtggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgt 40905210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38765067 - 38764713
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatc-ataatcactta-ttgcaattttcaattatctgtatga-aaagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||| ||||||  ||||  || |||| |||||||||| |||  | ||||||||| ||     
T  38765067 ctaattaaggtaagagggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgataaagtgcttagttgaat-aattgattattt- 38764970  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || ||||||||||||| ||||||||  || ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||    
T  38764969 ttcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggggatatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatag 38764870  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||  ||| || |||||  ||||  | ||||||| ||| |||||||||| |||| |||| | |||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||||    
T  38764869 tatgtgaaaatgttatattgtgaat-tgtgctcaaattgttgaattatgcgatgttgttgttcaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 38764771  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||    
T  38764770 tgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttg 38764713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Original strand, 18238155 - 18238381
Alignment:
Q  166 tgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaatt 265  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||| ||||  ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| |    
T  18238155 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 18238254  T
Q  266 ggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcat 364  Q
    | |||||  ||||  | ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  ||    
T  18238255 gatatattgtgaat-tgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagat 18238353  T
Q  365 gttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
     |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  18238354 attgttgttgatgattcatagcttgggt 18238381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 392
Target Start/End: Original strand, 15675219 - 15675328
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  15675219 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 15675318  T
Q  383 tggcttgggt 392  Q
    | ||||||||    
T  15675319 ttgcttgggt 15675328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 355
Target Start/End: Original strand, 10104380 - 10104452
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  10104380 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttg 10104452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31115764 - 31115653
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||| |||| | |    
T  31115764 tatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaat 31115665  T
Q  381 catggcttgggt 392  Q
    ||| ||||||||    
T  31115664 cattgcttgggt 31115653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 355
Target Start/End: Original strand, 40885618 - 40885756
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||| | || ||  |  |  ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| ||    
T  40885618 ataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttg 40885717  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  40885718 aattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttg 40885756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 459
Target Start/End: Original strand, 47535256 - 47535337
Alignment:
Q  378 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  47535256 attcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttaatgagaaatgagttgttgttgatggttttgtaaaattggtgaatt 47535337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 16522896 - 16522788
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatggattgttgttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  16522896 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 16522798  T
Q  436 gtggttttgt 445  Q
    ||||||||||    
T  16522797 gtggttttgt 16522788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 392
Target Start/End: Original strand, 13590194 - 13590298
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || |  || || ||| |||| |||||| |||    
T  13590194 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattattgttgatgattcatagct 13590293  T
Q  388 tgggt 392  Q
    |||||    
T  13590294 tgggt 13590298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 54398510 - 54398406
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||||||||    
T  54398510 aattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggct 54398411  T
Q  388 tgggt 392  Q
    |||||    
T  54398410 tgggt 54398406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Original strand, 19821665 - 19821768
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattg---caattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |   |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19821665 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtcaattttcaattgt-tttatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 19821762  T
Q  154 gttcat 159  Q
    | ||||    
T  19821763 gatcat 19821768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 9795344 - 9795314
Alignment:
Q  448 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaa 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9795344 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaa 9795314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9295772 - 9295668
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatggattgttgttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  9295772 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 9295674  T
Q  436 gtggtt 441  Q
    ||||||    
T  9295673 gtggtt 9295668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18168971 - 18168930
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18168971 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 18168930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 389
Target Start/End: Original strand, 41916846 - 41916947
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | || |||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  41916846 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcattgct 41916945  T
Q  388 tg 389  Q
    ||    
T  41916946 tg 41916947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Original strand, 34177538 - 34177617
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattg 137  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||| |||||||||||||    
T  34177538 ctaactaaggtaag-gggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgaataagtgcttaattg 34177617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 480
Target Start/End: Original strand, 34177767 - 34177799
Alignment:
Q  448 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34177767 aattggtgaattatgacttgttgttgttgaaat 34177799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 37956913 - 37956949
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca 94  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37956913 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca 37956949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Original strand, 132095 - 132541
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caat 112  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  132095 gaagagctatgagaaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttggaattcatcataatcacttattgcaatttttcaat 132194  T
Q  113 tatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  132195 tatttctatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt 132294  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||    
T  132295 atggataattgaattgttgtttgttgaattatatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatcgttgtt 132394  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  132395 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgt 132494  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  132495 tgttgagaaatgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 132541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 88676 - 88273
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  88676 gaagagctaggagaaaaattgaagcctaagctagagagattaatctaataaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt 88577  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  88576 atttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgtccataaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 88477  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  88476 tgaataattaaaatgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgatcaattggtgaattatgctatgttgttg 88377  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  88376 atgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaattcttggcttgggtatgcatgatccataatttgtt 88277  T
Q  414 gttg 417  Q
    ||||    
T  88276 gttg 88273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12090 - 11660
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat--tgcaattttcaa 111  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |  |||||||| |||    
T  12090 gaagagctaggagttaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaaggtggttagaattcatcataatcatttttggtgcaattt-caa 11992  T
Q  112 ttatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaag 210  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  11991 ttat-tgtatgaataagtgcttaattgggtcaattgattaattgttcataaatgatgaatttcgtgctctaattatgatgacatgtttcaatgtatgaag 11893  T
Q  211 ttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtg 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  | |||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  11892 ttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaaagatatgagttgaaaacatgctcaattggttgaattatgctatgtt 11793  T
Q  310 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 409  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11792 gttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataattcatggcttggttatgcatgattcatgatt 11693  T
Q  410 tgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  11692 tgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16300 - 16022
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat--tgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  |||||||| |||||    
T  16300 agagctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaattt-caatt 16202  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt-gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagt 211  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16201 at-tgtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcataaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagt 16103  T
Q  212 tatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattg 292  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  16102 tatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 16022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25831 - 25553
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat--tgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  |||||||| |||||    
T  25831 agagctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaattt-caatt 25733  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt-gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagt 211  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  25732 at-tgtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcataaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgttttaatgtatgaagt 25634  T
Q  212 tatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattg 292  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25633 tatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 25553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 480
Target Start/End: Original strand, 22186 - 22218
Alignment:
Q  448 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22186 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 22218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 23092 - 22650
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23092 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctaaagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaatt 22993  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22992 atttgtatcaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttt 22893  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  22892 tgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttg 22793  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22792 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtt 22693  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtga 456  Q
     ||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  22692 attgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 11287815 - 11287372
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11287815 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 11287717  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11287716 t-tgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattagtgctctgattatgttgacatgtttagatgtatgaagttat 11287618  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11287617 ggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttga 11287518  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11287517 tgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 11287418  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  11287417 ttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 11287372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Original strand, 15822279 - 15822722
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15822279 gaagagctaggagcaaaattaaagtctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcagtt 15822377  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  15822378 atttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttg-gatgtatgaagtta 15822476  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  15822477 tggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaaatgtatgaaaa--tggtatatgttgaaaatatgctcaaatggtgaattatgctttgttgt 15822574  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15822575 tgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttg 15822674  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    | |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  15822675 tggttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 15822722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 45452016 - 45452435
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45452016 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctatagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattat 45452115  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45452116 ttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 45452215  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||    
T  45452216 gataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaatttgtga--catgctatgttgttgat 45452313  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  45452314 gaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttg-tgt 45452412  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
     ||||||||   |||||||||||    
T  45452413 ggagaaatgagatgttgttggtg 45452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12759387 - 12758965
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12759387 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaatta 12759288  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12759287 tttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttat 12759188  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12759187 ggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaaatgtgaaaaaggggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgg 12759088  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  12759087 tgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataattcatggcttgggtttgcaggatttatgatttg-tg 12758989  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    | ||||||||   |||||||||||    
T  12758988 tggagaaatgagatgttgttggtg 12758965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 26070112 - 26070519
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26070112 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaag-gggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaat 26070209  T
Q  113 tatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagt 211  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26070210 tatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagt 26070307  T
Q  212 tatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  26070308 tatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgt 26070407  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26070408 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttg 26070507  T
Q  412 ttgttgagaaat 423  Q
    ||||||||||||    
T  26070508 ttgttgagaaat 26070519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 26093899 - 26094306
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26093899 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaag-gggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaat 26093996  T
Q  113 tatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagt 211  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26093997 tatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagt 26094094  T
Q  212 tatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  26094095 tatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgt 26094194  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26094195 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttg 26094294  T
Q  412 ttgttgagaaat 423  Q
    ||||||||||||    
T  26094295 ttgttgagaaat 26094306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 423
Target Start/End: Original strand, 12369693 - 12370095
Alignment:
Q  21 taggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgta 120  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12369693 taggagcgaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagatttcatcattatcatttattgcaattttcaattatttgta 12369792  T
Q  121 tgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  12369793 tgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgattaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttacggataa 12369892  T
Q  221 ttgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaatt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  12369893 ttgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatctgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaatt 12369992  T
Q  321 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaga 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12369993 gtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattattcatggcttaggtatgcatgattcatgatttgttattgaga 12370092  T
Q  421 aat 423  Q
    |||    
T  12370093 aat 12370095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3895421 - 3894998
Alignment:
Q  17 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  3895421 gagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatt 3895324  T
Q  117 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  3895323 tgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataattgatgaaattcatgctctaattctgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgg 3895224  T
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3895223 ataattgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatg 3895124  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3895123 aattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 3895024  T
Q  417 gagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |  ||||   ||||||||| ||||||    
T  3895023 gtaaaataagttgttgttgttggttt 3894998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 47290183 - 47289736
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caat 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47290183 gaagagcttggagcaaaattgaagtctaaactagagagattaacctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaat 47290084  T
Q  113 tatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47290083 tatttgtatgaaaaatgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgagctctaattatgatgccatgtttagatatatgaagtt 47289984  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtgg 310  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  47289983 atgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttg 47289886  T
Q  311 ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tt 409  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  47289885 ttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgataattcatggcttgtg-ttgcatgattcatgattt 47289787  T
Q  410 tgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatta 460  Q
    |||| | ||||||||   ||||||||||| |||  || || ||||||||||    
T  47289786 tgttatggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatta 47289736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 144039 - 143601
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144039 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 143941  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  143940 atttgtataaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 143841  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  143840 taaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgt 143743  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttt 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  143742 tgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa------ttgttgttgttaagtcatgttgttaatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgatttt 143650  T
Q  411 gttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||| | ||||||||   ||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  143649 gttatggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 143601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 16 - 442
Target Start/End: Original strand, 12247968 - 12248395
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  12247968 agaggtaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatta 12248067  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12248068 t-tgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattacttgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtta 12248165  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggtt 312  Q
    || |||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12248166 tggataattgaattgttattagttgaatttcatgtttaaagtatgagaaaatagtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 12248265  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12248266 gttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataatgcatgacttgggtatgcatgattcatgatttgt 12248365  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  12248366 tgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 12248395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44865628 - 44865204
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44865628 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttaga-ttcatcataatcacttattgtaattttcaattat 44865531  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44865530 ttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatg 44865431  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  44865430 aataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttg 44865332  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  44865331 atgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgttgttaagtcatgtagtttatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattt 44865233  T
Q  410 tgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||| | ||||||||   |||||||||||    
T  44865232 tgttatggagaaatgagatgttgttggtg 44865204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 392
Target Start/End: Original strand, 13862779 - 13863154
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13862779 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagttagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaatt 13862878  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13862879 atttgtatgaa----gcttaattgggtgaatagattaattgtccataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagtta 13862974  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  13862975 tgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 13863074  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
    | |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||| | || || ||||||||||||    
T  13863075 gttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgttgctaagtgatattgttgttaatgatgcatggcttgggt 13863154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 16569854 - 16570262
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16569854 agagctaggagctaaattgaagcataagctagggagattaatctaacaaaggtaagggggttaaaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 16569952  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16569953 t-tgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaatgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagtta 16570050  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggtt 312  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16570051 tggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 16570150  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16570151 gttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgt 16570250  T
Q  413 tgttgagaaatg 424  Q
    ||||||||||||    
T  16570251 tgttgagaaatg 16570262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16595808 - 16595400
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16595808 agagctaggagctaaattgaagcataagctagggagattaatctaacaaaggtaagggggttaaaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 16595710  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16595709 t-tgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaatgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagtta 16595612  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggtt 312  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16595611 tggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 16595512  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16595511 gttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgt 16595412  T
Q  413 tgttgagaaatg 424  Q
    ||||||||||||    
T  16595411 tgttgagaaatg 16595400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 63 - 445
Target Start/End: Original strand, 7283956 - 7284336
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  7283956 taaggtaagggggttagttttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttatatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 7284054  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaa 262  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||| ||    
T  7284055 tggtgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtgtgaagttatggatgattgaattgttattagttgaattgtatgttcaaagtatgagaa 7284154  T
Q  263 attggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtc 362  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7284155 gttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 7284254  T
Q  363 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7284255 atgttgttgataataattcatggcttgagtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 7284336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 39046479 - 39046893
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |   | ||||||||||| |    
T  39046479 agctaggagcaaaattgaagcttaagcttaggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattattt 39046577  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39046578 gtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 39046677  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatga 317  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||  || |||||    ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  39046678 tgattgaattattgttagttgaattgtatgttcaa---ttgaaaaatgagtatatg-tgaaaatat-ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatga 39046772  T
Q  318 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 417  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  39046773 attgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttgatctgttgttg 39046872  T
Q  418 agaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||   |||||||||||    
T  39046873 agaaatgagatgttgttggtg 39046893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 35095210 - 35094773
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  35095210 agctaggagcaaaattgaagcttaagcttaggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattattt 35095113  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35095112 gtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcatgctctaattgtgataacatgtttagatgtatgaagttatgaa 35095013  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtat-gaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  35095012 tgattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtatatgaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatg 35094915  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 416  Q
    |||||| | | ||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35094914 aattgttaaatgtttcatgatcaa-tgttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcataattcttgatttgttgtt 35094816  T
Q  417 gagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||| ||| || || ||||||    
T  35094815 gagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgatgaatt 35094773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 49047523 - 49047928
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||  | | |||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  49047523 agagctaggagctaaattgaagcttgaactaggga-attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattg 49047621  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |  |||| |||||| |||||| |||||||||||  ||  ||||||||     
T  49047622 t-tatatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcagaattgttagaatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttg 49047719  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggtt 312  Q
    |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  49047720 ttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagagagtggtatatgttgaaa-tatgctcaattggttgaattatgttatgttgtt 49047818  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49047819 gttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgt 49047918  T
Q  413 tgttgagaaa 422  Q
    ||||||||||    
T  49047919 tgttgagaaa 49047928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13275140 - 13274760
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgatt 149  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  13275140 attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgatt 13275043  T
Q  150 aattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatttt 249  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||  | |||||| |   |||||||||||||||| ||  |||| ||| ||    
T  13275042 aattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgtt 13274943  T
Q  250 caaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 348  Q
    |||||||||| ||| |||||||||           |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13274942 caaagtatgagaaagtggtatatg-----------ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgtt 13274854  T
Q  349 gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  13274853 gttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 13274760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 169 - 459
Target Start/End: Original strand, 17223939 - 17224229
Alignment:
Q  169 aattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |    
T  17223939 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 17224038  T
Q  269 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgtt 367  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17224039 atatgttgaat-tatactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtt 17224137  T
Q  368 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17224138 gttaatgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaattggtgaatt 17224229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13377883 - 13377502
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 158  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||| ||||| || |||| || ||| |||||||||||||    
T  13377883 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgt-tgtatgaataagtgattcattgagt-aatcgattaattgttca 13377786  T
Q  159 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatg 258  Q
    ||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  13377785 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 13377686  T
Q  259 aaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgct 357  Q
    | ||| || |||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13377685 agaaagtgatatatgttgaat-tatactcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 13377587  T
Q  358 atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  13377586 aagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 13377502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 281 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 126549 - 126392
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  |||||  |||||||||| ||     
T  126549 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatgatgata 126450  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126449 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 126392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 445
Target Start/End: Original strand, 16914816 - 16915205
Alignment:
Q  57 cctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaa-ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||| ||| ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||    
T  16914816 cctaattaaggtaaaggggttagaattcaatcacaatcatttagtgtaacttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaatt 16914913  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaa 252  Q
    |||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||    
T  16914914 gttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatga-taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 16915012  T
Q  253 agtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 351  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||  ||||||| ||  | |||||| |||||||| |||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  16915013 agtatgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaacgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 16915111  T
Q  352 gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  16915112 gttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgaagagaattgagttgttgttgttggttttgt 16915205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3049717 - 3049575
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  3049717 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 3049618  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3049617 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 3049575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 48357002 - 48356614
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  || |||||||||| || || |||||||||||    
T  48357002 ctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagt-aagtgattaattgt 48356904  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||  || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  48356903 tcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 48356804  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||  ||| || |||||||||||  ||||||| || || |||||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  48356803 atgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgtt 48356705  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  48356704 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgt 48356614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9839237 - 9838904
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||| || |  ||||||||||    
T  9839237 ctaattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattg 9839140  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  9839139 ttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaag 9839040  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||  ||| || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||||||| |||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  9839039 tatgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgt 9838941  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgg 390  Q
    ||||| || || |||||| |||| ||||||| |||||    
T  9838940 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgg 9838904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 111390 - 111550
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  111390 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataatt 111489  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  111490 catggcttgggtatgcatgattca-aatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 111550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9611666 - 9611332
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||| || |  ||||||||||    
T  9611666 ctaattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattg 9611569  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  9611568 ttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaag 9611469  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc--aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    ||||  ||| || |||||||||||  ||||||   || || |||||| |||||||| |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  9611468 tatgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgcttctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 9611370  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgg 390  Q
    |||||| || || |||||| |||| ||||||| |||||    
T  9611369 ttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgg 9611332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 32494167 - 32494328
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  32494167 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatgataatt 32494266  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  32494267 catggcttgtgtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 32494328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31501531 - 31501165
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatca-taatcactta-ttgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||| ||| |||||||| | || || ||||  |||||||||||||  | || |||||| |||    
T  31501531 ctaactaaggtaagggggttagaattcaacaataatcaattagttgtaattttcattaat-tgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttg 31501434  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||    |||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| ||    
T  31501433 ttcatagttgatgaaattagtgatctaattatgaagatatgtttaaatacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatag 31501334  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||  ||| || |||||  |||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||    
T  31501333 tatgtgaaaatgatatattgtgaata-atgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 31501235  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
    || ||||  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||    
T  31501234 tgttatgagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgagtcatgatttgatgatgagaaat 31501165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 2029055 - 2028893
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatg-tggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || || ||||| | |||| ||||    
T  2029055 tatgctcaattggtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaagtgatgttatggatgctaat 2028957  T
Q  380 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  2028956 tcatgacttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 2028893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 410
Target Start/End: Original strand, 2190307 - 2190436
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  2190307 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 2190406  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2190407 catggcttgggtatgcatgattcataattt 2190436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Original strand, 42056410 - 42056553
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || || || |  ||| |||||    
T  42056410 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatgctaatt 42056509  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  42056510 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaat 42056553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 333 - 457
Target Start/End: Original strand, 1937173 - 1937297
Alignment:
Q  333 atgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttg 432  Q
    ||||||||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  1937173 atgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcataattttttgttgagaaatggattattg 1937272  T
Q  433 ttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  1937273 ttggtggttttgtgaaattgatgaa 1937297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Original strand, 26069454 - 26069525
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26069454 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaag-gggttagaattcat 26069525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 445
Target Start/End: Original strand, 14271838 - 14272163
Alignment:
Q  105 ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagata 203  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||     
T  14271838 ttttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagttg-tcaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatg 14271934  T
Q  204 tatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgct-caattggtgaattatg 302  Q
     ||||| || |  |||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||  ||| || ||||||||| || |||||| |||||| ||| | |||    
T  14271935 catgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaaatgatatatgttg-aactatgctccaattgttgattcatg 14272033  T
Q  303 ctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgatt 402  Q
    ||||||             |  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||    
T  14272034 ctatgt-------------tattaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataatt 14272120  T
Q  403 catgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||| | || |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  14272121 catgattagatgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgt 14272163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16919757 - 16919598
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||| ||| |||||| ||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |    
T  16919757 ataatcgaattgttattggtgaaatttcatgttcaaaatatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgtt 16919659  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 376  Q
    |||||||||||||  || || | |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  16919658 gaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgat 16919598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13321148 - 13320984
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtgg-ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||| |||| | ||    
T  13321148 tgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatc 13321049  T
Q  382 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  13321048 atgacttgggtttgca-cattcatgaattgatgatgagaatttggattgttgttggtgtttttgtg 13320984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4484996 - 4484719
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    |||||| |||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||||||||||||||||   |||| |    
T  4484996 tgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgtcctaat-atgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggagaaattgc 4484898  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    || ||||  |||||  ||| || |||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||    
T  4484897 atgttcattgtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattg 4484799  T
Q  344 atgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||    
T  4484798 atgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatgatttgatgatgagaaat 4484719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 423
Target Start/End: Original strand, 20583531 - 20583809
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    |||||| |||||||||  || |||||||  ||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||| |||||| |  |||| |    
T  20583531 tgattatttgttcatagttgttgaaatttttgccctaattatgaagatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttgatgaaattgc 20583630  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    || |||| ||||||  ||| || |||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | |||||    
T  20583631 atgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattg 20583729  T
Q  344 atgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||||||||    
T  20583730 atgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaat 20583809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 445
Target Start/End: Original strand, 34241314 - 34241465
Alignment:
Q  294 tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    |||||| || ||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || || |  |||||| |||| |||||||||||| ||     
T  34241314 tgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgataagtgacattgttgttgatgattcatggcttgagtg 34241413  T
Q  394 tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    | ||| | |||||||||| || ||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  34241414 ttcataaatcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgt 34241465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28722373 - 28722200
Alignment:
Q  152 ttgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttca 251  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||    
T  28722373 ttgttcatagttgttgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 28722274  T
Q  252 aagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgat 325  Q
     ||||||  ||| || |||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  28722273 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgat 28722200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Original strand, 34241096 - 34241297
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  ||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  34241096 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgattaattgagt-aagtgattaattgt 34241194  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||  |||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||||    
T  34241195 tcatagttgataaaattcgtgttataattatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagt 34241294  T
Q  256 atg 258  Q
    |||    
T  34241295 atg 34241297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 38424482 - 38424189
Alignment:
Q  152 ttgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttca 251  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||| || || ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||    
T  38424482 ttgttcatagttgttgaaattcgtgctctggttatgatgatatgtttgaatacataaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 38424383  T
Q  252 aagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgt 350  Q
     ||||||  ||| || |||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||  | ||| | || |||||||||    
T  38424382 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctcaaattgttgaattgttctatgttgttgttgaattatgatgagaattatgtttaagtgatgttgt 38424284  T
Q  351 tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| || |  || |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | |||||||||| || ||| ||||   |||||||||  ||||||||    
T  38424283 tgttgttaagagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatgatttgatggtgaaaaataagttgttgttgtgggttttgt 38424189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 4446340 - 4446182
Alignment:
Q  287 caattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatg-ataattcatgg 385  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  ||| || || || || ||||||||    
T  4446340 caattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-ttaattgatgttgttgttgataagagatgctgatgttgaatgattcatgg 4446242  T
Q  386 cttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||| | ||| | |||||| ||| || || ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4446241 cttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgtgaaatgagttgttgttgttggttttgt 4446182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 17947712 - 17947870
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  17947712 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 17947811  T
Q  388 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    ||||| | ||| | ||||||  |  || || |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  17947812 tgggtgttcataaatcatgagattgtgatgtgaaataaattgttgttgttggttttgtg 17947870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 46474128 - 46474027
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  46474128 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 46474029  T
Q  388 tg 389  Q
    ||    
T  46474028 tg 46474027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 392
Target Start/End: Original strand, 9723927 - 9724031
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || |  || || ||| |||| |||||| |||    
T  9723927 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattattgttgatgattcatagct 9724026  T
Q  388 tgggt 392  Q
    |||||    
T  9724027 tgggt 9724031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28390510 - 28390292
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| ||||||||  ||||  | ||||| || || |||||| ||||||||  ||| |    
T  28390510 ataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgtt 28390412  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||| |   ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| | |||||| | ||| | |||||| ||| ||     
T  28390411 gaattgtgatgataatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtgttcataaatcatgaattgatga 28390312  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttg 435  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  28390311 tgagaaatgagttgttgttg 28390292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25124215 - 25124153
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  25124215 ttcatgcttaattgatgttgttgttgatatgagatgttgttgttgatgattcatggcatgggt 25124153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 435
Target Start/End: Original strand, 13448953 - 13449094
Alignment:
Q  294 tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||| | ||||||||     
T  13448953 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcgtagcttgggtg 13449052  T
Q  394 tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    |  || | |||||| ||| || |||||||||  |||||||||    
T  13449053 ttgataaatcatgaattgatgatgagaaatgagttgttgttg 13449094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 32899191 - 32898746
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32899191 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagatagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaatt 32899092  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32899091 attggtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 32898992  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  32898991 tgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttg 32898892  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32898891 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattaatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtt 32898792  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||   || |||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  32898791 gttgagaaatgagatgatgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 32898746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 14 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18433043 - 18432634
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18433043 gaagagctaggagaaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaaattttcaat 18432945  T
Q  113 tatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18432944 tat-tgtatgaaaagagcttaattgggtgaattgattatttgttcataaatgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtt 18432846  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  18432845 atgaatacttgaattgttgttgattgaattacatgttaaaagtatgaaaaatgggtgtatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgtt 18432746  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  18432745 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattaatggtttat 18432646  T
Q  413 tgttgagaaatg 424  Q
    |||||| |||||    
T  18432645 tgttgaaaaatg 18432634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16086411 - 16086022
Alignment:
Q  21 taggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgta 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  16086411 taggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattaattgta 16086312  T
Q  121 tgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16086311 tgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataa 16086212  T
Q  221 ttgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaatt 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||| ||||||    
T  16086211 ttgaattgttgtttgttgaattacatgttcaaagtacgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaatt 16086112  T
Q  321 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16086111 atgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgacttgggtttgcatgattcatgattt 16086022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 14 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16106917 - 16106526
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16106917 gaagagctaggagtaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 16106818  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16106817 aattgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattaattaattgttcgtaaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 16106718  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||    
T  16106717 tggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgagtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttg 16106618  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||||||||    
T  16106617 ttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgac-----tttgcatgattcatgattt 16106526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22441331 - 22440911
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22441331 agagctaggagaaaaattgaagtctaagctatggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgcaattttcaattat 22441234  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22441233 ttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcatatatgatgaaattcgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 22441134  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||    
T  22441133 aataattgaattgtgatggggtgaattacatgttaaaagtatgaaaaatgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcat 22441034  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttg 414  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  22441033 gatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgtta 22440935  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    | ||||||||   |||||||||||    
T  22440934 tggagaaatgagatgttgttggtg 22440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18777530 - 18777119
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18777530 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattggaattttcaatt 18777431  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||||                 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18777430 atttgtatgaaaagtgcttaattg-----------------ttcataaaagatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 18777348  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18777347 tggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttg 18777248  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18777247 atgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgtt 18777148  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  18777147 gttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18777119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18570675 - 18570271
Alignment:
Q  17 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||     
T  18570675 gagctaggagcaaaattgaagcctaagctaaggagattaacata-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcaatt-ttgtaattttcaattatt 18570578  T
Q  117 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  18570577 tgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgatgttatgg 18570478  T
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18570477 ataattgaattgttattagttaaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatg 18570378  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18570377 aattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcctgggtatgcatgattcataatttgttgtt 18570278  T
Q  417 gagaaat 423  Q
    | |||||    
T  18570277 gtgaaat 18570271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 13014557 - 13014979
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13014557 agagctaggagcaaaatttaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaatttatcataatcacttattgtaattttcaattat 13014655  T
Q  116 ct--gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
     |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13014656 gtttgtatgaaaagtgctaaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 13014755  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||  ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  13014756 tgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgtt-gaagtatgaaaaatgggtatgagttggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 13014854  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  13014855 atgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataattcgtggcttggg-ttgcatgattcttgattttgt 13014953  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    | | ||||||||   |||||||||||    
T  13014954 tatggagaaatgagatgttgttggtg 13014979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31628552 - 31628245
Alignment:
Q  131 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgtt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  31628552 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtattcgaattatgattacatgtttagatgtatgaagttattgataattgaattgtt 31628453  T
Q  231 gttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtt 330  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  31628452 gttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtt 31628353  T
Q  331 tcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgt 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  31628352 tcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgt 31628253  T
Q  431 tgttggtg 438  Q
    ||||||||    
T  31628252 tgttggtg 31628245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 18399337 - 18398909
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaattttcaatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || | || || |||||||||    
T  18399337 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcttcataatcattttagtgtaaatttcaatta 18399238  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  ||||||||     
T  18399237 t-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttg 18399140  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    |  ||||||||||||||||| |   |||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  18399139 ttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatagtatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 18399041  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  18399040 gttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattg- 18398942  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    || | |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  18398941 tgataagaaatgagttgttgttgttggttttgt 18398909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 459
Target Start/End: Original strand, 18381684 - 18381974
Alignment:
Q  169 aattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggt 268  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |    
T  18381684 aatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 18381783  T
Q  269 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgtt 367  Q
    ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18381784 atatgttgaat-tatgcttaaattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtt 18381882  T
Q  368 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18381883 gttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 18381974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 424
Target Start/End: Original strand, 25367129 - 25367493
Alignment:
Q  62 ctaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaa-ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 158  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25367129 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattgagc-aattgattaattgttca 25367226  T
Q  159 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga-ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtat 257  Q
    ||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  || ||||||||| |   ||||| ||||||||||| |   |||| ||| ||||||||||    
T  25367227 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaagttttttgataatggaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtat 25367326  T
Q  258 gaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgc 356  Q
    || ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25367327 gagaaagtggtttatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 25367425  T
Q  357 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 424  Q
    || || ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25367426 taagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatg 25367493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 35015278 - 35015454
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||     
T  35015278 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgata 35015377  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35015378 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 35015454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21623522 - 21623124
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattca-tcataatcactt-attgcaattt-tcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 158  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || | || ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21623522 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttctcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 21623425  T
Q  159 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatg 258  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  |||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||    
T  21623424 taaatgttagaattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatg 21623325  T
Q  259 aaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgct 357  Q
    | ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21623324 agaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgct 21623226  T
Q  358 atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    | || |||||| || | || | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  21623225 aagtgatgttgatgttaatgagtcatggcttgggtattcataattcatgatttgtggatgaaaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaattggtgaa 21623126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 117 - 445
Target Start/End: Original strand, 22361714 - 22362042
Alignment:
Q  117 tgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| || |     
T  22361714 tgtatgaataagtgcttaattgagcaaat-gattaattgttcatagatgataaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgtt 22361812  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
     |||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||     
T  22361813 gataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgacataagttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgt 22361911  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||    
T  22361912 tgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatg 22362011  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
     |||||| ||  ||||||||| | |||||||    
T  22362012 atgagaattgagttgttgttgttagttttgt 22362042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 19983412 - 19983588
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatg-tggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | | | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||    
T  19983412 tatgctcaattagtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgat 19983510  T
Q  380 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19983511 acatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 19983588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 442
Target Start/End: Original strand, 28195101 - 28195367
Alignment:
Q  176 gctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgtt 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |    
T  28195101 gctccaattatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaatggtatatgat 28195200  T
Q  276 gaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataag-tttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgat 373  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||||| |||  |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||    
T  28195201 gaaa-tgtgctcaattagttgaattatgccatgatgttgttgaattgtgatgagattttatgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgat 28195299  T
Q  374 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  28195300 gataattcatggcttgagtttgcataatt-atgatttattgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 28195367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 286 - 438
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744483
Alignment:
Q  286 tcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 385  Q
    |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  386 cttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  25744431 cttgggtttgcataattcttggtttgttgtagagaaatgagatgttgttggtg 25744483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 435
Target Start/End: Original strand, 35135860 - 35136279
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaatttt--caat 112  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | || ||||||  ||||    
T  35135860 agagctaggagctaaagtgaagcttgagctaggga-attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattttttcaat 35135958  T
Q  113 tatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagt 211  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||  ||||| |    
T  35135959 tat-tgtatgaataagtgattaattagat-aattgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaat 35136056  T
Q  212 t-atgaataattgaattgttgttggttgaatta-cattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgt 308  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||  ||| |||||||| || | || || ||  |  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  35136057 tgatga-taattgaattgttgttg--tgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgctaacttgtgaat-tatgctcaattggatgaattatgctatat 35136152  T
Q  309 ggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat 408  Q
     || | |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||     
T  35136153 tgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaa 35136252  T
Q  409 ttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||| || |||||||||  |||||||||    
T  35136253 ttggtgatgagaaatgagttgttgttg 35136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33325092 - 33324673
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaatt--ttcaat 112  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | |||||| || ||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | || ||||  ||||||    
T  33325092 agagctaggagctaaagtgaagcttgagctaggga-attcatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattatttcaat 33324994  T
Q  113 tatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagt 211  Q
    ||  |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||  ||||| |    
T  33324993 taa-tgtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaat 33324896  T
Q  212 tatgaataattgaattgttgttggttgaatta-cattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtg 309  Q
    | |  ||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||||||| || | || || ||  |  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  33324895 tgttgataattgaattgttgttg--tgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgctaacttatgaat-tatgctcaattggatgaattatgctatatt 33324799  T
Q  310 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 409  Q
    || | |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  33324798 gtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaat 33324699  T
Q  410 tgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    || || |||||||||  |||||||||    
T  33324698 tggtgatgagaaatgagttgttgttg 33324673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 337 - 445
Target Start/End: Original strand, 18823565 - 18823672
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttgg 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||    
T  18823565 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgtggagaaatgagttgttggtgg 18823663  T
Q  437 tggttttgt 445  Q
    |||||||||    
T  18823664 tggttttgt 18823672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 337 - 445
Target Start/End: Original strand, 18839420 - 18839527
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttgg 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||    
T  18839420 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgtggagaaatgagttgttggtgg 18839518  T
Q  437 tggttttgt 445  Q
    |||||||||    
T  18839519 tggttttgt 18839527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26089869 - 26089710
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  26089869 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 26089770  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtt 441  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||   ||||||||| |||||    
T  26089769 catggtttgggtatgcatgattcat-aattgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtt 26089710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 18583451 - 18583304
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||    
T  18583451 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttg----------------atgataatt 18583368  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18583367 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 18583304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 25651435 - 25651206
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||||||| |||| |    
T  25651435 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgtt 25651337  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | ||     
T  25651336 gaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgattggatga 25651237  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    |||||| |   ||||||||| ||||||||||    
T  25651236 tgagaattaagttgttgttgttggttttgtg 25651206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 420
Target Start/End: Original strand, 21410933 - 21411301
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaa-ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||     
T  21410933 attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattgag-gaattgac 21411030  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattt 248  Q
    |||||||||||||  | |  |||| |||||| ||||||||||  |||| |  ||  |||||||| |  |||||||||| ||||||   | |||| ||| |    
T  21411031 taattgttcataatcgttagaatttgtgctccaattatgatgttatgtatgaatgcatgaagttgttgataattgaatggttgttaaataaatttcatgt 21411130  T
Q  249 tcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 348  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| | || || ||| || | || ||||||  ||||||||||     
T  21411131 tcaaagtatgagaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgctatgttgatgttggattatgctgagattcatgtgcaattgatgta 21411229  T
Q  349 gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaga 420  Q
    | ||||| ||  | ||| ||||  | ||||||||||||||| |  ||||||||| | || |||||| |||||    
T  21411230 gatgttgttaaatgatgatgttatttataattcatggcttgagcgtgcatgattaacgaattgttgatgaga 21411301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23995057 - 23994914
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |  ||| |||||    
T  23995057 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaatt 23994958  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  23994957 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaat 23994914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 15742341 - 15742505
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgttgctatgtcatgttgttgatgata 377  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||| || || ||||| |  ||| ||    
T  15742341 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgcta 15742440  T
Q  378 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  15742441 attcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgctggttt 15742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 18002617 - 18002777
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || | ||| | |||| |||||    
T  18002617 tatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaatt 18002716  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  18002717 catggcttgggtatgcatgattcat-acttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18002777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Original strand, 18629497 - 18629888
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  ||||| |||||||  | || |||||||||||    
T  18629497 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaattttttatttgttgtatgattaagtgtttaattgaat-aagtgattaattgt 18629595  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    |||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  18629596 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatga-taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaag 18629694  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctca-attggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gt 350  Q
    ||||  ||| ||||||||  ||||  |||||||  | || |||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||   ||    
T  18629695 tatgtgaaagtggtatattgtgaat-tatgctctgaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 18629793  T
Q  351 tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| || || || |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  18629794 tgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgt 18629888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 15079559 - 15079932
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca-cttattgcaa-ttttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| || || |||||||||    
T  15079559 agagctaggagcaaaagtgaagcttaagctagagggattaatctaactaaggtaag-gggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaatt 15079657  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    || | |||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||| ||  ||  ||||||||    
T  15079658 at-tttatgaataagggattaattggat-aattgattaattattcatagatg-ttaaattcgtgctctaactaggatgatatg-ttgtatgcatgaagtt 15079753  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctatgtggt 311  Q
      | ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||| || |  | || ||  |  || || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  15079754 gaggataattgaattgttgtt-gtgaaattgcatgttcaaagtgtgtatgagtgctaacttgtg-aattatgctcaattgggtgaattatgctatattgt 15079851  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
    || |||||| |||| ||   |||| ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  15079852 tgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatattgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggtttgggt 15079932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 445
Target Start/End: Original strand, 33538261 - 33538646
Alignment:
Q  60 aactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttc 157  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  33538261 aactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttc 33538359  T
Q  158 ataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta-tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagta 256  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||| || |||  ||  ||||| ||  ||||  |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  33538360 atagttgttaaaattcgtgctctaactatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtgaa--attgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 33538457  T
Q  257 tgaaaaattggtatatgttgaaaat-atgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    ||  ||| ||  ||||||||  ||| |||||| |  ||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||    
T  33538458 tgtgaaagtg--atatgttgtgaattatgctctaaaggttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttatt 33538555  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||| || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  33538556 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgt 33538646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 16887680 - 16888059
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaa---ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | | |    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  | ||| ||||||||    
T  16887680 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataatttttcaattat-tgtatgaataagtgattaattgaataaat-gattaatt 16887777  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaa 252  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||  ||||| || |||| |||||||| ||||||||||  | || ||| |||||    
T  16887778 gttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatga-taattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaa 16887876  T
Q  253 agtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 351  Q
    ||| || | || || ||  |  ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||||    
T  16887877 agtgtgtataagtgctaacttgtgaat-tatgctcaattgggtgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgattttgtt 16887975  T
Q  352 gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||  |||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||  |||||||||    
T  16887976 gtcactatgtgatgttattgttaatgattcatggcttgggtatacataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgttg 16888059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 98
Target Start/End: Original strand, 25640408 - 25640491
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25640408 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaatctagagagattaacc-aactaaggtaagggggttagaattcatcataatcactta 25640491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 355
Target Start/End: Original strand, 17083088 - 17083384
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtt 156  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  |||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  17083088 ctaactaaggtaagggggttagaattcattttaatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgtt 17083186  T
Q  157 cataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagta 256  Q
    ||||  || | | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| |  ||| |||||||||||||||||||  ||||  || |||| ||||    
T  17083187 catagttgttaatattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtga-taattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagta 17083285  T
Q  257 tgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||  ||| || |||||||||||  | ||||| || || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  17083286 tgtgaaaatgatatatgttgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 17083384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 332 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25919696 - 25919590
Alignment:
Q  332 catgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||  || ||    
T  25919696 catgttcaattgatgttgttgttgctatatgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgaaaaatgagttatt 25919597  T
Q  432 gttggtg 438  Q
    |||||||    
T  25919596 gttggtg 25919590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 29605719 - 29605420
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||| |  ||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  29605719 tgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtga-taattgaattgttgttggtgaaattac 29605621  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaat-tggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    || |||| ||||||  ||| ||  ||||  ||||  | |||||||  || |||||| |||||||| |||| |||||| ||||  |  ||||| | |||||    
T  29605620 atgttcatagtatgtgaaaatgaaatattgtgaat-tgtgctcaaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgtgaatcatgcttaattg 29605522  T
Q  344 atgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttt 443  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||| |||| |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| |  ||||||||   ||||| ||| |||||||    
T  29605521 atgttgttgttgctaagaaatattgttgttgatgattcatggtttgggtgtgcataaatcatgaattgataatgagaaataagttgttcttgttggtttt 29605422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 421
Target Start/End: Original strand, 35009569 - 35009706
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  35009569 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 35009668  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa 421  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  35009669 ttgcttgggtatgcat-attcatgaattgatgatgagaa 35009706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 358
Target Start/End: Original strand, 17556977 - 17557206
Alignment:
Q  125 aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattga 224  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||    ||||||||    
T  17556977 aagtgcttaattgaat-aattgattatttgttcatagttgtt-aaattcgtgctctaattatgatgatatgttt-gatgcatgaaattggtgataattga 17557073  T
Q  225 attgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgct-caattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtg 323  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||  ||| || ||||||||| || ||||||  |  || |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17557074 attgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctatagatgttgaatt-tgctatgttgttgttgaattgtg 17557171  T
Q  324 ataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgcta 358  Q
    || |   ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  17557172 attataatcatatttaattgatgttgttgttgcta 17557206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19854276 - 19854135
Alignment:
Q  294 tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||| |  || |||||| |||| |||||| ||||||||     
T  19854276 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtg 19854177  T
Q  394 tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    | ||| | |||||| ||| || |||||||||  |||||||||    
T  19854176 ttcataaatcatgaattgatgatgagaaatgagttgttgttg 19854135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 34966994 - 34966836
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  34966994 aattgttgaattatgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 34966895  T
Q  388 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||  || || |||||   ||||||||| ||||||||||    
T  34966894 tgggtgttcataaatcatgagttcgtgatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtg 34966836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27740971 - 27740848
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||||  ||| | |||    
T  27740971 tgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatca 27740872  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatga 407  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  27740871 tggtttgggtatgcat-attcatga 27740848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 31628589 - 31628549
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaa 56  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31628589 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaa 31628549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15740314 - 15740207
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| ||  | ||| ||||  | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||   ||    
T  15740314 ttcatgttcaattgatgtagatgttgttaaatgatgatgttattaataattcatggtttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatg 15740215  T
Q  430 ttgttggt 437  Q
    ||||||||    
T  15740214 ttgttggt 15740207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29666004 - 29665936
Alignment:
Q  285 ctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| |||| || |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  29666004 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgt 29665936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 4991150 - 4991042
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatggattgttgttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || | |  |||||||||| | |||   |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  4991150 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgatcatgaattttggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 4991052  T
Q  436 gtggttttgt 445  Q
    ||||||||||    
T  4991051 gtggttttgt 4991042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 25919972 - 25919936
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca 94  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25919972 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca 25919936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 392
Target Start/End: Original strand, 29160423 - 29160527
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||| ||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  29160423 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgcgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 29160522  T
Q  388 tgggt 392  Q
    |||||    
T  29160523 tgggt 29160527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 50111899 - 50112307
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50111899 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattat 50111998  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  50111999 ttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcatgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatg 50112098  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  50112099 aataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgat 50112198  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  50112199 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttgtttt 50112298  T
Q  416 tgagaaatg 424  Q
    |||||||||    
T  50112299 tgagaaatg 50112307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 54424413 - 54423986
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54424413 gaagagctaggcgcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttcaattttcaatt 54424314  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54424313 atttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagtta 54424214  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54424213 tggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 54424114  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54424113 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 54424014  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
      ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  54424013 -atgagaaataagttgttgttgttggttt 54423986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17101053 - 17100645
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17101053 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagaaattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt 17100954  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17100953 tt-tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 17100855  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17100854 tggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaacatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 17100755  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17100754 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgtt 17100655  T
Q  414 gttgagaaat 423  Q
    |||| |||||    
T  17100654 gttgtgaaat 17100645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17101738 - 17101330
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17101738 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagaaattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt 17101639  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17101638 tt-tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 17101540  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17101539 tggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaacatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 17101440  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17101439 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgtt 17101340  T
Q  414 gttgagaaat 423  Q
    |||| |||||    
T  17101339 gttgtgaaat 17101330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 423
Target Start/End: Original strand, 12349388 - 12349799
Alignment:
Q  17 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatc 116  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12349388 gagctaggagcaatattgaagcttaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatt 12349487  T
Q  117 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||     
T  12349488 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgtccataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtataaatttatgg 12349587  T
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  12349588 ataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtgagaagttgttatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttg 12349687  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg-----ggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||| |||||    
T  12349688 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaatcatggcttggccatggtttgcatgattcataatttg 12349787  T
Q  412 ttgttgagaaat 423  Q
     || ||||||||    
T  12349788 atgatgagaaat 12349799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14298820 - 14298399
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14298820 agagctaggagaaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 14298722  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14298721 tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttat 14298622  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |   | || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  14298621 ggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgatatggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgt 14298522  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14298521 cgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tg 14298423  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||   |||||||||||    
T  14298422 ttgagaaatgagatgttgttggtg 14298399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14304447 - 14304026
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14304447 agagctaggagaaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 14304349  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14304348 tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttat 14304249  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |   | || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  14304248 ggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgatatggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgt 14304149  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14304148 cgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tg 14304050  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||   |||||||||||    
T  14304049 ttgagaaatgagatgttgttggtg 14304026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14295837 - 14295415
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14295837 agagctaggagctaaattgaaccctaatctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 14295739  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||    
T  14295738 t-tgtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttat 14295640  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttg 313  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14295639 ggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 14295540  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295539 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 14295440  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||||   |||||||||||    
T  14295439 gttgagaaatgagatgttgttggtg 14295415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Original strand, 22144119 - 22144563
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22144119 gaagagatagaagaaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactttttgtaattttcaatt 22144217  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22144218 atttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaactgttcataactgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 22144317  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  22144318 tgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgt 22144415  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22144416 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgataatacatggcttgggtttgcatgattcatggtttg 22144515  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    | |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  22144516 tggttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 22144563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 35124094 - 35123652
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35124094 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaaaggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 35123996  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  35123995 tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtactttaattatgatgacgtgtttggatgtatgaaattat 35123896  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa-gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||  |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  35123895 ggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttaaagtgtatgaaaag--ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtta 35123798  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  35123797 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcatgattcatgatttg-t 35123699  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  35123698 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaattggtgaatt 35123652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 17522738 - 17523159
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17522738 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatataactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 17522836  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| | |    
T  17522837 t-tgtatgagaagtgcttatttgggtgaattgattatttgttcataaatgatgaacttcgtgctctaattatgatgacagttttggatgtatgaagatgt 17522935  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17522936 ggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtataacaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttattga 17523035  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtc-atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17523036 tgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgatttatgatttg-t 17523134  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||||   |||||||||||    
T  17523135 gttgagaaatgagatgttgttggtg 17523159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Original strand, 317357 - 317800
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  317357 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaatt 317454  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  317455 atttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaagtatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 317554  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||    
T  317555 tgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctaaattggtgaattatgcattgttgttg 317653  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||||||    
T  317654 atgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgtataattcttggtttgtt 317753  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatta 460  Q
    || ||||||||   ||||||||||| |||  || || ||||||||||    
T  317754 gtggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatta 317800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14301464 - 14301042
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14301464 agagctaggagctaaattgaaccctaatctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 14301366  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||    
T  14301365 t-tgtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttat 14301267  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttg 313  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14301266 ggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 14301167  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14301166 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattattcatgtctttggtttgcatgattcatgttttgtt 14301067  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||||   |||||||||||    
T  14301066 gttgagaaatgagatgttgttggtg 14301042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Original strand, 6154177 - 6154621
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6154177 gaagatctaggagcaaaattgaagcctaagctagagatattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaatt 6154276  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  6154277 atttctatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtcatgaaattcgtcctctaattataatgacatgtttagatgtatgaaatta 6154376  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag--tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |    
T  6154377 tgaatagttgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtttatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttat 6154474  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  6154475 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcataatttt 6154573  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
     | | ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  6154574 gtatggagaaatgagatgttgttggtgttttgatggaaatggtgaatt 6154621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 424
Target Start/End: Original strand, 16995908 - 16996315
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16995908 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctaggtagattaagcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaatt 16996005  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16996006 atttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattattcataagtggtgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 16996105  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  16996106 tgaatgattgaattgttgttacttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 16996204  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  16996205 atgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataattcttggtttgtt 16996304  T
Q  414 gttgagaaatg 424  Q
    |||||||||||    
T  16996305 gttgagaaatg 16996315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8632187 - 8631801
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||  ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8632187 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctaggga--ttactctatctaaggtaagggggttaggattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 8632090  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8632089 ttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattaattaattgttcttaagtgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg 8631990  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||| |||| |    
T  8631989 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtttgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttatttagtgaattatgctttgttgttgtt 8631890  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattca 404  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8631889 ggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggtttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 55440706 - 55441141
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||             
T  55440706 agagctaggagcaaaattgaagcctaggctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatt--------- 55440796  T
Q  116 ctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  55440797 --gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttat 55440894  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttg 313  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || |    
T  55440895 ggataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgatgaaaatatgctcaactggttgaattatactatgttgtgg 55440994  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  55440995 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgatttttt 55441094  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  55441095 gttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 55441141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13817906 - 13817471
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  13817906 agctatgagcaaaattgaagtctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattattt 13817809  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13817808 gtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgtacatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 13817709  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |    
T  13817708 taattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggt 13817612  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  13817611 gaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgtt--ta-gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgt 13817515  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||   ||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  13817514 tgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 13817471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 16181796 - 16182201
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16181796 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat 16181893  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16181894 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 16181993  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||    
T  16181994 aataattgaattg-tgttagttaaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtg-tgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttg 16182090  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  16182091 atgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggattgtt 16182190  T
Q  414 gttgagaaatg 424  Q
    |||||||||||    
T  16182191 gttgagaaatg 16182201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 19570542 - 19570957
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  19570542 agctaggagcaaaattcaagccttagctagggagattaaccta-ctaaggtaag-gggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattattt 19570638  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19570639 gtatgataagtgcttaattggatgaattgattaatttttcatatgtgatgaaatttgtgctctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 19570738  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |    
T  19570739 taattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgagtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggt 19570835  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||    
T  19570836 gaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataattcttg-gttgttgt 19570934  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||   |||||||||||    
T  19570935 tgagaaatgagatgttgttggtg 19570957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3578487 - 3578082
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3578487 agagctatgagaaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagcgggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattat 3578388  T
Q  116 ctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  3578387 -tgtaggaataagtgcttaattgggtaaattgattaattgttcataaatgatgatattcattctctaattatgatgacatgttga-atgtatgaagttat 3578290  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttg 313  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || |    
T  3578289 ggataattgaattgttattagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatagtatatgttgaaaatatgctcaactggttgaattacgctatgttgtgg 3578190  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3578189 ttgaattgcgataagtttcatgatcaattgat-ttgttgttgctaagtcatgttgttgattaaaaat--tggcttaggtatgcatgattcatgatttgtt 3578093  T
Q  414 gttgagaaatg 424  Q
    || ||| ||||    
T  3578092 gtggaggaatg 3578082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Original strand, 34439189 - 34439513
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34439189 gaagagctaggagcaaaattgaagcctatgctagagagattaaccta-ctaaggtaaggagattagaattcatcataatcacttattgtaattttcaatt 34439287  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttta-gatatatgaagtt 212  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  34439288 atttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttatgaggtatgaagtt 34439387  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  34439388 atggataaatgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaaaatgggtatgtgtttaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 34439487  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatc 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  34439488 gatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17938969 - 17938582
Alignment:
Q  17 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatc 116  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||  | | ||||| |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17938969 gagctaggagcaaaattgaagcttaagctaggga--ttactccatctaagataagggggttagggttcatcataatcacttattgcaattttcaattatt 17938872  T
Q  117 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  |||     
T  17938871 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcttgagtgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttggatgtataaagc-atgg 17938773  T
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
     |||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  17938772 ttaagcgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgagaagttgatatatgttgaaaatatgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttg 17938673  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 407  Q
     |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17938672 gattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcattcatggcttgggtttacatgattcatga 17938582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17139872 - 17139481
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca--cttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| || || |||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  17139872 attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattcttagtgtaaatttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgat 17139775  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattt 248  Q
    ||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||| |   |||||||||||||||||||  |||| ||| |    
T  17139774 taagtgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgt 17139675  T
Q  249 tcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 347  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17139674 tcaaactatgagaaaatggtatatgttgaaa-tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgt 17139576  T
Q  348 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||    
T  17139575 tgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgcgaaatgagatgttgttggtagttt 17139481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Original strand, 11060855 - 11061249
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  11060855 agagctaggagcaaaactgaagcttaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttggaattcatcataatca-taattgcaatttttcaatta 11060953  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | || |||| || ||||||||||    
T  11060954 t-tgtatgaataagtgcttaattggat-aattaattatttgttaatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatca-atttttaaatgtatgaagtta 11061050  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggtt 312  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  11061051 tgaataattggattgttgttagttgaatttcaggttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 11061150  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  11061151 gttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttggtgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttg 11061249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38528127 - 38527841
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  38528127 gaagagctaggagcaaaattgaagcttaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaact 38528030  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38528029 atttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 38527930  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 303  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527929 tgaataattgaattat-gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgg-gaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 58 - 442
Target Start/End: Original strand, 11328854 - 11329235
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11328854 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 11328951  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||||||       || ||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||    
T  11328952 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttgc-----ataaagttgttaataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaa 11329046  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11329047 gtatgagaaagtggtatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttg 11329145  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||    
T  11329146 ttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 424
Target Start/End: Original strand, 53898440 - 53898710
Alignment:
Q  153 tgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||    
T  53898440 tgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatctatgaagttatgaataattgaattgt-gttagttgcattaaatgttcaa 53898538  T
Q  253 agt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgt 350  Q
    |||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53898539 agtgtatgaaaa-tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgt 53898637  T
Q  351 tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 424  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  53898638 tgttgatatgtcatgttgttggtgataattcatggcttgggtttgcaagattcatgattt-atgttgagaaatg 53898710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 442
Target Start/End: Original strand, 12560092 - 12560510
Alignment:
Q  24 gagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatg 122  Q
    |||| |||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12560092 gagctaaattgaagcttaagttagggagattaatctaactaaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattat-tgtatg 12560190  T
Q  123 aa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataat 221  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||| ||  ||   |||||||||  ||| |    
T  12560191 aataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgattgaatgcttgaagttattgatact 12560289  T
Q  222 tgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaatt 320  Q
    |||||| ||||| |   |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  12560290 tgaatttttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgt-gaaaatatgcccaactggttgaattatgctatgttgttgttgaatt 12560388  T
Q  321 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaga 420  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12560389 gtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggtatgcatgattcatgatttgatgttgaga 12560488  T
Q  421 aatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||   |||||||||| ||||    
T  12560489 aatgagatgttgttggtagttt 12560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 416
Target Start/End: Original strand, 19260839 - 19261087
Alignment:
Q  168 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattgg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19260839 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 19260938  T
Q  268 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgtt 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||    
T  19260939 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgtt 19261038  T
Q  368 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 416  Q
     |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19261039 atgaatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 19261087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 14059067 - 14059482
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaattttcaattatctg 118  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||    
T  14059067 ctaggagctaaagtgaagtctaagctaggga-attaatctaactaag-taagggggttataattcatcataatcattttagtgcaattttcaattat-tg 14059163  T
Q  119 tatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  |    
T  14059164 tatgaataagtgcttaattgact-aattgactaattgttcatgattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttga 14059262  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    ||||||||||||| || |   |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||    
T  14059263 taattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgacatatgttgaaa-tatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttg 14059361  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 416  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  14059362 aattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcatgatctgttgat 14059461  T
Q  417 gagaaatggattgttgttggt 437  Q
    ||||||||   ||||||||||    
T  14059462 gagaaatgagatgttgttggt 14059482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 14527928 - 14528121
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14527928 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaatta 14528027  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaa 209  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14528028 t-tgtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatatgtgaa 14528121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16880482 - 16880114
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  16880482 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgt-tgtatgaacaagtgtttaattgagt-aattgattaatt 16880385  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||  | |||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||    
T  16880384 gttcataattgtttgaattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaa 16880285  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa-ttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  16880284 gtatgagaaagtggtatatgtt-agaatatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattg 16880186  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 424  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| |||||    
T  16880185 ttgctaagtgatgttgtggatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattattggtgataaatg 16880114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 459
Target Start/End: Original strand, 6146764 - 6147036
Alignment:
Q  186 tgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatat 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  6146764 tgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgta-ttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgttgaaaatat 6146861  T
Q  284 gctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcat 383  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  6146862 gctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataataattcat 6146961  T
Q  384 ggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||   ||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  6146962 ggcttgggttt-catgattcatgattttgtatggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 6147036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 6146615 - 6146769
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6146615 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaatt 6146714  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatga 168  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6146715 atttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatga 6146769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 410
Target Start/End: Original strand, 12488662 - 12488968
Alignment:
Q  103 aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttaga 201  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || | || ||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||    ||||| ||    
T  12488662 aattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagtca-ttaattaattgttcataattgttagaattcatgctctaattatgatattgtgtttgga 12488759  T
Q  202 tatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaatta 300  Q
    |  |||||||| |  |||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  12488760 tgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaatta 12488858  T
Q  301 tgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatga 400  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  12488859 tgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgttcataa 12488958  T
Q  401 ttcatgattt 410  Q
    ||||||||||    
T  12488959 ttcatgattt 12488968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 128 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17191827 - 17191500
Alignment:
Q  128 tgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaatt 227  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| || |  ||||| |||||    
T  17191827 tgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaatt 17191729  T
Q  228 gttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgata 326  Q
    |||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| || | |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  17191728 gttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatttatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgctgaattgtgata 17191630  T
Q  327 agtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgga 426  Q
    ||  ||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||||      
T  17191629 agaatcatgtttaattgatgttgctgttgctaagtaatgttgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatg-- 17191532  T
Q  427 ttgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
      |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  17191531 -agttgttggtggttttgtaaagttggtgaatt 17191500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39656883 - 39656497
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  39656883 ctaactaaggtaagggagttagaattgatcataatcatttagtgcaatttttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 39656786  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||| || | |||| ||||||| ||||||||||  ||||||  || |||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||    
T  39656785 tcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagt 39656686  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  39656685 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagattcatgttcaattgatgtggttgtt 39656587  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttg 444  Q
    |||| || || |||||| |||| |||||||| || ||  | ||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  39656586 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttaggggttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttg 39656497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Original strand, 14528118 - 14528286
Alignment:
Q  275 tgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgat 373  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14528118 tgaaaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgat 14528217  T
Q  374 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  14528218 ggtaattcatggcttgggtatgaatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 14528286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 285 - 457
Target Start/End: Original strand, 17956109 - 17956281
Alignment:
Q  285 ctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 384  Q
    ||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||    
T  17956109 ctcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatg 17956208  T
Q  385 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17956209 acttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 17956281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30207619 - 30207278
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattg---caattttca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||    
T  30207619 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttataattcatcataatcatttttagtgtaaattttca 30207520  T
Q  111 attatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaa 209  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||   | |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||    
T  30207519 attgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattcatactggttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 30207422  T
Q  210 gttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgc-tcaattggtgaattatgctatgt 308  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  30207421 gttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgcttaaattgatgaattgtgctatgt 30207323  T
Q  309 ggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
     |||| | |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||    
T  30207322 tgttgttcaattgtgataagattcaagttcaattgaagttgttgt 30207278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 281 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30153076 - 30152919
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||     
T  30153076 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgata 30152977  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152976 tatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 30152919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 272 - 410
Target Start/End: Original strand, 12349834 - 12349971
Alignment:
Q  272 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttg 371  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  12349834 tgttgataatatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttg 12349933  T
Q  372 atgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12349934 atgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattt 12349971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 281 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 33342015 - 33341852
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  33342015 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataatt 33341916  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33341915 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 33341852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 435
Target Start/End: Original strand, 3576396 - 3576705
Alignment:
Q  125 aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattga 224  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |  || |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||    
T  3576396 aagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcaaagttgttataattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattga 3576494  T
Q  225 attgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtg 323  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||| ||| || ||||| |||||  ||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  3576495 attgttgttggtgaaatttcatgttcaatgtatgagaaagtgatatatattgaat-tatgctcaaattgatggattatgctatgttgttgttgaattgtg 3576593  T
Q  324 ataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||  ||||| |  ||||||||||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3576594 ataagagtcatgtttgattgatgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaat 3576693  T
Q  424 ggattgttgttg 435  Q
    |  |||||||||    
T  3576694 gagttgttgttg 3576705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 38168048 - 38167906
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  38168048 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 38167949  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38167948 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 38167906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 7854116 - 7853953
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatg-tggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 379  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||    
T  7854116 tatgttcaattggtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataat 7854018  T
Q  380 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7854017 tcatggcttgggtttgcatgaatcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 7853953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15876341 - 15876041
Alignment:
Q  142 aattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaat 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |  |||| ||||||||||||| |  |||    
T  15876341 aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgttgatgaaat 15876242  T
Q  242 tacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa 340  Q
    |  || ||| |||||||| ||| || ||||| |||||   || ||||| ||| || |||||  || || |||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15876241 tttatgttccaagtatgagaaagtgatatatcttgaatg-atactcaaattgttggattatcataagttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaa 15876143  T
Q  341 ttgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggt 440  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||| ||    
T  15876142 ttgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttaggtattcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttggtgttggtagt 15876043  T
Q  441 tt 442  Q
    ||    
T  15876042 tt 15876041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 445
Target Start/End: Original strand, 54685422 - 54685585
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  54685422 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataatt 54685521  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  54685522 catggcttggatttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgctgttgctggttttgt 54685585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 45581765 - 45581604
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatg-tggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||    
T  45581765 tatgctcaattggtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataat 45581667  T
Q  380 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  45581666 tcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 45581604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 337 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 19946776 - 19946669
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttgg 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19946776 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgttgg 19946678  T
Q  437 tggttttgt 445  Q
    |||||||||    
T  19946677 tggttttgt 19946669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3992684 - 3992522
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  3992684 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 3992585  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  3992584 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 3992522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17204970 - 17204656
Alignment:
Q  125 aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattga 224  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| || |  ||||| ||    
T  17204970 aagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcga 17204872  T
Q  225 attgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtga 324  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||                   ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  17204871 attgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa-------------------ttatgctatattgttgttgaattgtga 17204791  T
Q  325 taagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 424  Q
    || |  ||||| | ||| |||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  17204790 taggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatgatttgttgatgagaaatg 17204691  T
Q  425 gattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
      |||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  17204690 agttgttgttagtggttttgtaaagttggtgaatt 17204656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 283 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13839027 - 13838831
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || | || |||| | || | ||| || |||||||||||| | | || ||  | ||||||| | |||| | |||    
T  13839027 tgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 13838928  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13838927 ttgtttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttgttgttgaaat 13838831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 54038245 - 54038406
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||| ||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  54038245 tatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgataatt 54038344  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  54038345 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttaagaaataaattgttgttgttggttt 54038406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 12953361 - 12952934
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcactt-attgcaatttt-caattatc 116  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| || | || |||||| |||||| |    
T  12953361 ctaggagctaaattgaagtttgggctaggga-attgatctaactaaggtaaggggattagaattcaatcataatcaatttagtgtaatttttcaatta-c 12953264  T
Q  117 tgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatga-aattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    |||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |  | | |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||      
T  12953263 tgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcattagttgttagaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgg 12953165  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
      ||||||  ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||   ||| || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||||||| ||||    
T  12953164 tgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttg 12953066  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     ||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  12953065 ttgaattgtgatgagatttatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 12952966  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    | |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  12952965 gatgagaaatgagttgttgttgttggttttgt 12952934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2844325 - 2844196
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  2844325 tatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 2844226  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2844225 catggcttgggtatgcatgattcataattt 2844196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16261587 - 16261458
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  16261587 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 16261488  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16261487 catggcttgggtatgcatgattcataattt 16261458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23492507 - 23492346
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    ||||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  23492507 tatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 23492408  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  23492407 catggcttgggtatgcatgattcatagtttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 23492346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 53771175 - 53771032
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |  ||| |||||    
T  53771175 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaatt 53771076  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  53771075 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaat 53771032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 438
Target Start/End: Original strand, 47784648 - 47785017
Alignment:
Q  56 acctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaa 151  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||| |||| |    
T  47784648 acctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattta 47784745  T
Q  152 ttgttcata--aa--tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatt 247  Q
    ||||||| |  ||  || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| |||     
T  47784746 ttgttcaaaggaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatg 47784845  T
Q  248 ttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 347  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||                   ||||||||||| |||| ||||||||  ||||   |||| ||| |||||||    
T  47784846 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa-------------------ttatgctatgttgttgttgaattgtagtaagaaacatgttcagttgatgt 47784926  T
Q  348 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||| || || ||||||||| | || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  47784927 tgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggtg 47785017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Original strand, 9590643 - 9591031
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |   |||||||  |||||||||||||  | || || ||||||||    
T  9590643 ctaactaaggtaaggggattagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaaattgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtggttaattgt 9590741  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||  || | |||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||  || || ||    ||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||||    
T  9590742 tcatagttgttaaaatccgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcattaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagt 9590841  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||  ||| ||||||    ||||  ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||   |||| ||||||||||||||||||    
T  9590842 atgtgaaagtggtatgatatgaat-tatgctcaatttgttgaattatgctatgttgttgttgagttctgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgtt 9590940  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    | || || || |||||| |||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9590941 gttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgt 9591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Original strand, 11196283 - 11196393
Alignment:
Q  132 taattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttg 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11196283 taattaggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgctctaataatgatgatatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttg 11196382  T
Q  232 ttggttgaatt 242  Q
    || ||||||||    
T  11196383 ttagttgaatt 11196393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 438
Target Start/End: Original strand, 38811170 - 38811278
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || | |||||||  |||    
T  38811170 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgatcagaaatgagttg 38811269  T
Q  430 ttgttggtg 438  Q
    |||||||||    
T  38811270 ttgttggtg 38811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14080867 - 14080489
Alignment:
Q  59 taactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  14080867 taactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaactatg-gtatgaataagtgtttaattggataaat-gattaattg 14080770  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    | |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||  ||  ||||| || |||| |||||||||||| ||| ||  | || ||| ||||||    
T  14080769 tgcatagatgttaaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatga-taattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaa 14080671  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    ||||| | || || ||  |  ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||     
T  14080670 gtatgtataagtgctaacttatgaat-tatgctcaattgggtgaattgtgctatattgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtta 14080572  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    |||| | || ||||||||| |||| ||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  14080571 ttgcgaagtaatgttgttgttgatgatttacggcttgggtattcataattcatgatttggtgatgagaaatgagttgttgttg 14080489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 40939525 - 40939437
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  40939525 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattcattgcaa 40939437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 445
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228902
Alignment:
Q  168 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattgg 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||  ||| ||     
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatga 6228724  T
Q  268 tatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgt 366  Q
    |||||  ||||  | ||||| || || |||||| |||||||| ||||  ||||| ||||  |  ||||| | |||||||||||||||||||| |  || |    
T  6228725 tatattgtgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgtcgaattatgatgtggatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagaaatat 6228823  T
Q  367 tgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||| |   ||||||||| |||||||||    
T  6228824 tgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgt 6228902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 423
Target Start/End: Original strand, 14814653 - 14815020
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatc-ataatcactta-ttgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||| ||| ||||||  ||||  || ||||  |||||||||||||  | || |||||| |||    
T  14814653 ctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttg 14814751  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
     |||||  || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||    
T  14814752 ctcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 14814851  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||  ||| || |||||  ||||  | ||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  14814852 tatgtgaaaatgatatattgtgaat-tgtgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgttgt 14814950  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
    || || |  || |||||| ||||  |||||||| || || | ||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  14814951 tgttaagagatattgttgttgatgtttcatggcctgcgtgttcatgaatcataatttgatgatgagaaat 14815020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 34560097 - 34559869
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||  ||  || || ||||||||  ||||||| || |  ||||||||| ||||| |||| |    
T  34560097 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaaatatgtgaatgtgttacatgttgaat-tatgctctaaattttgaattatgttatgtagttgtt 34559999  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    ||||| |||| || |||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||| ||||| ||     
T  34559998 gaattatgatgagattcatgttcgattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgatga 34559899  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  34559898 tgagaattgagttgttgttgttggttttgt 34559869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 368 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28558253 - 28558186
Alignment:
Q  368 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28558253 gttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttg 28558186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15517920 - 15517810
Alignment:
Q  125 aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattga 224  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||| ||    ||||||||    
T  15517920 aagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcataaatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattga 15517822  T
Q  225 attgttgttggt 236  Q
    ||||||||||||    
T  15517821 attgttgttggt 15517810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 1990937 - 1990772
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||| |||| |||| |||||| ||  ||||| | || |||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||    
T  1990937 tatgctcaaattgtgaattgtgttatgttgttgttgaactgtgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgatt 1990838  T
Q  381 catggcttgggtt-tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||||||||| || | ||| | |||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1990837 catggcttggtttgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 1990772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13836022 - 13835973
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaact 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13836022 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaact 13835973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 438
Target Start/End: Original strand, 17960482 - 17960583
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttgg 436  Q
    |||||||||||  ||| ||||| || ||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||    
T  17960482 tcaattgatgtgtttgctgctaagtgatgttgttattaataattcatgacttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgggaaatgagttgttgttgg 17960581  T
Q  437 tg 438  Q
    ||    
T  17960582 tg 17960583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 457
Target Start/End: Original strand, 16934151 - 16934270
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttgg 436  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||| | || ||| ||||||||||| | ||| | |||||| |||||  ||||||||    |||||||||    
T  16934151 tcaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtattcataaatcatga-ttgtttgtgagaaataagatgttgttgg 16934249  T
Q  437 tggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16934250 tggttttgtgaaattggtgaa 16934270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 236
Target Start/End: Original strand, 11882108 - 11882286
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatga-aaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtt 156  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||| ||||   |||||||  |||||||||||||  | || |||||| |||||    
T  11882108 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgtt 11882206  T
Q  157 cataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggt 236  Q
    | || ||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||| ||||||||    
T  11882207 cttagatgttgaatttcatgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggt 11882286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 479
Target Start/End: Original strand, 15468630 - 15468668
Alignment:
Q  441 tttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaa 479  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468630 tttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaa 15468668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 11638554 - 11638418
Alignment:
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| ||||||||  ||||  | ||||  ||||| |||||| |||||||| |||| ||    
T  11638554 taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgaat-tgtgctttaattgttgaattgtgctatgttgttgttg 11638456  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    | ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||    
T  11638455 atttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgtt 11638418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 48421704 - 48421672
Alignment:
Q  448 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48421704 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 48421672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 48421935 - 48421855
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattg 137  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||| |||||||||||||    
T  48421935 ctaactaaggtaagagagttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgaataagtgcttaattg 48421855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 434
Target Start/End: Original strand, 51961299 - 51961403
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||  | |||||||||| || ||||| |||  |||    
T  51961299 ttcatgcttaattgatgttgttgttgatatgagatgttgttgttgatgattcatggtttgggtgttcacaaatcatgatttgatgatgagatatgagttg 51961398  T
Q  430 ttgtt 434  Q
    |||||    
T  51961399 ttgtt 51961403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 355
Target Start/End: Original strand, 43427636 - 43427703
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  43427636 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgagttgtgatgagaatcatgattaattgatgttgttgttg 43427703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 437
Target Start/End: Original strand, 4162376 - 4162474
Alignment:
Q  339 aattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggt 437  Q
    |||||||||||||||||||| |   | |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||| |   |||||||||||    
T  4162376 aattgatgttgttgttgctaagaactattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattaagttgttgttggt 4162474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22275175 - 22275137
Alignment:
Q  441 tttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaa 479  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22275175 tttgtgaaattagtgaattatgacatgttgttgttgaaa 22275137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 258
Target Start/End: Original strand, 4145791 - 4145903
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    |||||| |||||||||  || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  4145791 tgattatttgttcatagttgttgaaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtga-taattgaattgttgttgatgaaattac 4145889  T
Q  245 attttcaaagtatg 258  Q
    || |||| ||||||    
T  4145890 atgttcatagtatg 4145903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 93
Target Start/End: Original strand, 12487660 - 12487701
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatc 93  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12487660 attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 12487701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 459
Target Start/End: Original strand, 15859154 - 15859330
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| | || | ||| || |||||||||||| | | || ||  | ||||||| | |||| | |||    
T  15859154 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 15859253  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||  || |||||||||| || ||| ||| || |||||||||    
T  15859254 ttgcttgggtatgcat-attcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttgttgttttggtgaaaatggtgaatt 15859330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 446
Target Start/End: Original strand, 31412331 - 31412611
Alignment:
Q  166 tgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaatt 265  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| |    
T  31412331 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 31412430  T
Q  266 ggtatatgttgaaaatatgc-tcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcat 364  Q
    | |||||  || || | ||| | ||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||  | | | | ||||||||||||||||| || |  ||    
T  31412431 gatatattgtg-aattgtgctttaattgttgaattgtgatatgttgttgttgaattgtgatgagaattaggtttaattgatgttgttgttgttaagagat 31412529  T
Q  365 gttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
     |||||| |||| |||||| ||||| || | ||| | |||||| ||  || || |||||   ||||||||| ||||||||||    
T  31412530 attgttgttgatgattcatagcttgagtgttcataaatcatgagtttgtgatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtg 31412611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 49232437 - 49232396
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49232437 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 49232396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 17960201 - 17960237
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca 94  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17960201 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca 17960237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9385 - 8942
Alignment:
Q  17 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt--caatta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  9385 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaatttatcataatca-ttattgcaattttttcaatta 9287  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9286 t-tgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaatttttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttat 9188  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9187 ggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttga 9088  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9087 tgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcttgattcatgatttgttg 8988  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  8987 ttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 8942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 38699 - 38254
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38699 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 38600  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  38599 atttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatacgcgctctaattatgatgacatgtttagatttatgaattta 38500  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||    
T  38499 tgaataattgaatttttgttggttgaattacatgttcaaaggaagagaaatgggtatatgttgaaaatatgctcaattggcgaattatgcattgttgttg 38400  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38399 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcataacttgggtttgcatgattcatggtttgtt 38300  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||   || |||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  38299 gttgagaaatgagatgatgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 38254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 112394 - 112812
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  112394 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 112492  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  112493 t-tgtatgaaaagtacttatttgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttat 112591  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  112592 gaacaattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgctatgtggttga 112691  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112692 tgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgttgt---tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 112788  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||   |||||||||||    
T  112789 ttgagaaatgagatgttgttggtg 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Original strand, 102810 - 103192
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  102810 ctaactaaggtaaggggtttataattcatcataatcattttttgtgtaaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 102907  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||    
T  102908 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaa 103007  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| ||||||||| || || |||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||    
T  103008 gtatgagaaagtggtatatggtggaa-tatgctaaatttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgttattg 103106  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  103107 tttctaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttgttgttggtg 103192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 109863 - 109563
Alignment:
Q  142 aattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaat 241  Q
    ||||||||||||| | |||| || |  |||||||| || || |||||||| ||||||  ||  |||||||| |  |||||||||||||||||  |  |||    
T  109863 aattgattaattgatgataattgttagaattcgtgatccaagtatgatgatatgtttgaatccatgaagttgttgataattgaattgttgttaatgaaat 109764  T
Q  242 tacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa 340  Q
    | ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  109763 ttcatgtttaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcag 109665  T
Q  341 ttgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggt 440  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||    
T  109664 ttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcacgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagt 109565  T
Q  441 tt 442  Q
    ||    
T  109564 tt 109563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 109977 - 109905
Alignment:
Q  21 taggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca 94  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  109977 taggagctaaagtgaagcctaagctaggga-attaatctaactaaggtaaggtggttagaattcatcataatca 109905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 81 - 480
Target Start/End: Original strand, 252902 - 253301
Alignment:
Q  81 attcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  252902 attcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtgcataaatgataaaattcgtgcttt 253001  T
Q  181 aattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaa 280  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  253002 gattatgatgacatgtttggatgtatgaagttagggataattgaattgttgttagttgaattacattttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaa 253101  T
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  253102 tatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataatt 253201  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253202 caaggcttgggtttgcatgattcatgatttcttgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 253301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 20 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 21905 - 21482
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctg 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  21905 ctaggagcaaaattgaagcctaaggtagagagattaacctaactaaggtaagggggttataattcatcataatca-ttattgcaatttttcaattat-tg 21808  T
Q  119 tatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaat 218  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  21807 tatgaaaaaggcttaattgggcgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatga-t 21709  T
Q  219 aattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaa 318  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21708 aattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaa 21609  T
Q  319 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttga 418  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21608 ttgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaa 21509  T
Q  419 gaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21508 gaaatgagttgttgttggtggttttgt 21482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 31604 - 31181
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctg 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  31604 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaattat-tg 31507  T
Q  119 tatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaat 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  31506 tatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcatgatctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatga-t 31408  T
Q  219 aattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaa 318  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  31407 aattggattgttgttagttgaattaaatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaa 31308  T
Q  319 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttga 418  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31307 ttgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttga 31208  T
Q  419 gaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  31207 gaaatgagttgttgttggtggttttgt 31181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Original strand, 47402 - 47554
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaattatctg 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  47402 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaattat-tg 47499  T
Q  119 tatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattc 173  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47500 tatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaatgatgaaattc 47554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 117810 - 118255
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt---caat 112  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  117810 agagctaggagaaaaattgatgcctaaggtagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttttcaat 117908  T
Q  113 tatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  117909 tat-tgtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtt 118007  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  118008 atggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgtt 118107  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  118108 gatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggggttgcatgattcatgatttgt 118207  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  118208 tgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 118255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 109309 - 109754
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt---caat 112  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  109309 agagctaggagaaaaattgatgcctaaggtagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttttcaat 109407  T
Q  113 tatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  109408 tat-tgtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtt 109506  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||    
T  109507 atggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatattgaaaatatgataaattggtgaattatgctaagttgtt 109606  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  109607 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggattgcatgattcatgatttgt 109706  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  109707 tgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 109754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 61208 - 60784
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  61208 gaagagataggagcaaaattgaagcttaagctagagaaattaacttaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaat 61109  T
Q  113 tatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  61108 tatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgataacatgtttagatgtatgatgtt 61009  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||    
T  61008 atgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttaaaaatatacttaattggtgaattatgctttgttgtt 60909  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  60908 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgacttgggtttgcatgattcatgatttg- 60810  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||    
T  60809 tgtggagaaatgagatgttgttggtg 60784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Original strand, 70471 - 70913
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    |||||| ||| |||| |||||||||||    
T  70471 gaagagctaggatcaaaattgaagcctaacctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaat----cataataactcattgtaattttcaatt 70566  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  70567 atttgtaagaaaagtgcttatttggatgagttgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 70666  T
Q  214 -tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||    
T  70667 atgaataattgatttattgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaagtaggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgtt 70766  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  70767 gatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgacttgggtttgcatgattcatggtttgt 70866  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  70867 tgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 70913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 79736 - 79924
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  79736 gaagagctaggagtaaaattgaagcataagctagagagattaacctaactaagctaagggggttagaattgatcataatcactcattgtaattttcaatt 79835  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagat 202  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79836 atttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagat 79924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 283 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 172038 - 171842
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || || | ||||||| | || | ||| || |||||||||||| | | || ||  | ||||||| | |||| | |||    
T  172038 tgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 171939  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  171938 ttgcttaggtatgcat-attcatgatttgttgttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattacaacatgttgttgttgaaat 171842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 283 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 177741 - 177545
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || || | ||||||| | || | ||| || |||||||||||| | | || ||  | ||||||| | |||| | |||    
T  177741 tgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 177642  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  177641 ttgcttaggtatgcat-attcatgatttgttgttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattacaacatgttgttgttgaaat 177545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 542 - 115
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  542 agagctaggagaaaaattgaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattaatcataatcacttattgcaattttcaattat 444  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  443 ttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg 344  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacat-tttcaa-agtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  343 aataattgaattgttgttggttgaaattcatgtttcaagtgtatgaaaa--gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 246  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  245 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgtt 147  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    | |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  146 gctgagaaatgagttgttgttgttggttttgt 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Original strand, 1168052 - 1168474
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1168052 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcata-tcacttattgcaattttcaatt 1168149  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1168150 atttgtatgaaaaatgcttattttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtta 1168249  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1168250 tggataatagaatggttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttg 1168349  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168350 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 1168449  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||||   |||||||||||    
T  1168450 gttgagaaatgagatgttgttggtg 1168474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20712477 - 20712049
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttatt-gcaattttcaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20712477 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagaaattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttgcaattttcaat 20712378  T
Q  113 tatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20712377 tacttgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataa-tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtt 20712279  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20712278 atggataactgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 20712179  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20712178 gatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgt 20712079  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  20712078 tgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 20712049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 11337034 - 11337476
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11337034 agagctaggagcaaaattgaagcttgagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattat 11337133  T
Q  116 ctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  11337134 -tgtatgaataagtgcttaattggatgaattggttaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttat 11337232  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11337233 gaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaatatggtaaatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgttatgttgttga 11337332  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  11337333 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattcatggcttgagtttacatgattcatga-ttgttg 11337431  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  11337432 ttgagaaatgagatgttgttggt-gttttgtgaaaattggtgaatt 11337476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 21397493 - 21397080
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21397493 gaagatctaggagaaaaattgaagcctaagatagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaatt 21397394  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21397393 atttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 21397294  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  21397293 tgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgt 21397196  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg---ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21397195 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggt 21397096  T
Q  409 ttgttgttgagaaatg 424  Q
    ||||| ||||||||||    
T  21397095 ttgttattgagaaatg 21397080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Original strand, 24182980 - 24183372
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24182980 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 24183078  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  24183079 tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtcat 24183178  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  24183179 ggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttcaaagtgtatgaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgt 24183278  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24183279 tgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtca---tgttgatgataattaatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 24183372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 4865658 - 4865218
Alignment:
Q  17 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  4865658 gagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatt 4865561  T
Q  117 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4865560 tgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatga 4865461  T
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    || |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4865460 atgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtat-gggtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatg 4865362  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataa-ttcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  4865361 aattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataatttcatggcttgggtttgcataattcttgaattgttgt 4865262  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||| |||   ||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  4865261 tgagagatgaggtgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 4865218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19405938 - 19405514
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19405938 agagctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaatta 19405839  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  19405838 t-tgtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttatgctctaattatgatgacatatttgaatgtatgaagtta 19405740  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  || |||    
T  19405739 tggataattgaattattgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattagttgaattatgattcgttgtt 19405640  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19405639 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgt 19405540  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||    
T  19405539 tgtggagaaatgagatgttgttggtg 19405514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21907099 - 21906697
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  21907099 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagagtaatataactaaggtaagggggt-agaatttatcataatcatttatcacaattttcaatt 21907001  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21907000 atttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagacatatgaagtta 21906901  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||                  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21906900 tggataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagtatg------------------aaaatatgttcaattgatgaattatgctatgttgttg 21906819  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21906818 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt---taagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtg 21906722  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    | ||||||||| | |||||||||||    
T  21906721 gctgagaaatgaaatgttgttggtg 21906697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28261913 - 28261498
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28261913 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctaaggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat 28261816  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28261815 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaattcgtgctctagttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 28261716  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  28261715 aatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa----tatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgat 28261621  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  28261620 aaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgt 28261521  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||   |||||||||||    
T  28261520 tgagaaatgagatgttgttggtg 28261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Original strand, 21646588 - 21647030
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21646588 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaaactagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttattgcaattt-caatt 21646685  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21646686 atttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaaatgttcatatgtgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 21646785  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctat-gtgg 310  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |    
T  21646786 tgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttaaaagtgtatg-aaaatgggtatgt-atgaaaatatgttcaattggtgaattatg-tatcgttg 21646881  T
Q  311 ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||    
T  21646882 ttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatgttgatgataattcatggcttgggtttgtataattattggttt 21646981  T
Q  411 gttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| || || ||||||    
T  21646982 gttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgatgaatt 21647030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 63 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 11584405 - 11584021
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |     
T  11584405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattaattaattgttcatgag 11584307  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacat-tttcaa-agtatgaa 260  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||  |||||||    
T  11584306 tggtgaaattcgtgctctatttatgatgacatatttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtatgaa 11584207  T
Q  261 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgct---atgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgct 357  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  11584206 aa--gggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 11584109  T
Q  358 atgtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
      ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  11584108 tagtcatatggttgatgataattcatggcttgggttttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgttcgtggttttgt 11584021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 131 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24475861 - 24475539
Alignment:
Q  131 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgtt 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24475861 ttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-t 24475763  T
Q  231 gttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataag 328  Q
    ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  || |    
T  24475762 gttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatg 24475667  T
Q  329 tttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggatt 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   |    
T  24475666 tttcatgatcaattgttgttgttgtt--ta-gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagat 24475570  T
Q  429 gttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||| ||| ||| || || ||||||    
T  24475569 gttgttggtgttttggtgaaaatgatgaatt 24475539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23466834 - 23466434
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23466834 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcaattattgcaattttcaattat 23466735  T
Q  116 ctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
     |||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| |||||||   ||||||||  || || ||||||||    
T  23466734 -tgtatgaataagtgattaattgtgt-aattgattaattgttcataattattagaattcgtgctccaattatggcaacatgtttgtatgtaagaagttat 23466637  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatga-aaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    | ||||||||||||||||||||  || | |||  ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||                       
T  23466636 g-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgagaaaaatggtgtatgttg-aaatatgctcaattggt------------------- 23466558  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23466557 -tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 23466459  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||| ||||   |||||||||||    
T  23466458 gttgaggaatgatatgttgttggtg 23466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 281 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2031944 - 2031745
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  2031944 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataatt 2031845  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2031844 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttaatggaattggtgagttatgacatgttgttgttgaaat 2031745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3674226 - 3673835
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat--tgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  3674226 attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgat 3674129  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattt 248  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| |   |||| |||      
T  3674128 taattgttcataattgttagaattcgtgctcaaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatga 3674029  T
Q  249 tcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 347  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3674028 tcaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 3673930  T
Q  348 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||| |  | || ||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||| |||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  3673929 tgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcacgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 3673835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23494283 - 23493892
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat--tgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |  || || |||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||  ||    
T  23494283 attaatctaactaaggtaagggggttagaaatcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aatcaat 23494186  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattt 248  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||||||||||||   ||  |||||||| || | |||||||||||| || || |||||  || |    
T  23494185 taattgttcataattgttagaattcgtgctccaactatgatgacatgttcgaatgcatgaagttgtggaaaattgaattgttattagtggaattttatgt 23494086  T
Q  249 tcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 347  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23494085 tcaaagtatgaagaataggtatatgttgaga-tatgcgaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgt 23493987  T
Q  348 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  23493986 tgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 23493892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 117 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19862507 - 19862183
Alignment:
Q  117 tgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||| |     
T  19862507 tgtatgaataagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtt 19862409  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
     ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||     
T  19862408 gataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgt 19862310  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| || || || ||| |||| ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||    
T  19862309 tgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgacttgggtgttcataattcatgatttgatg 19862210  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggtt 441  Q
     |||||||||  |||||||||||||||    
T  19862209 atgagaaatgagttgttgttggtggtt 19862183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7728779 - 7728397
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    |||||||| || | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7728779 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgtaaattttcatttgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 7728682  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    |||||||| || |  ||||||| ||| |||||||| |  || |||  ||  ||||| ||    |||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||    
T  7728681 gttcataattgttagaattcgtactccaattatgaagttatatttgaatggatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 7728582  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7728581 gtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 7728483  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| |||   |||||||||||    
T  7728482 ttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgcttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgagagatgaggtgttgttggtg 7728397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 412
Target Start/End: Original strand, 23981433 - 23981760
Alignment:
Q  85 atcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaatt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23981433 atcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaatttagtgcattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaatt 23981532  T
Q  185 atgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatg 284  Q
    ||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||| | || || ||  |  || || ||||    
T  23981533 atgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgttaacttatg-aattatg 23981631  T
Q  285 ctcaattgg-tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcat 383  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||    
T  23981632 ctcaaatggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 23981731  T
Q  384 ggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||    
T  23981732 ggcttgggtgttcataactcatgatttgt 23981760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 432820 - 432432
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||     
T  432820 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttactgcaatttttcaattgt-tgcatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattga 432723  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||  ||| |||| |  ||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||||    
T  432722 tcataattgttaaaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagt 432623  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  432622 atgagaaaatgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 432524  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    |||| || || |||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||  ||||||||||    
T  432523 gctaagtgatattgttgttgatgattcctggcttgggtattcataatttatgatttgatcatgagaaataagttgttgttattggttttgtg 432432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16595871 - 16595481
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaa-ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||     
T  16595871 attaatcttactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgac 16595774  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattt 248  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||| | |   |||| ||| |    
T  16595773 taattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgt 16595674  T
Q  249 tcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 348  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| | || |||||| || | || |||||| |||||||||||     
T  16595673 tcaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaa-tatgctcaaattgtgaattatgttatgttgatgttgaattatgttgagattcatgttcaattgatgta 16595575  T
Q  349 gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    | ||||| ||  | ||| ||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||| ||||    
T  16595574 gatgttgttaaatgatgatgttattgataattcatgacttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggtagttt 16595481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 442
Target Start/End: Original strand, 5450804 - 5451117
Alignment:
Q  128 tgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaatt 227  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  |||||||||||    
T  5450804 tgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaatt 5450902  T
Q  228 gttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgata 326  Q
    |||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5450903 gttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgata 5451001  T
Q  327 agtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgga 426  Q
    |  |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| |   ||| | |||||||||| || ||||||||       
T  5451002 aaattcatgttcaactgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcttggcttggatgatcataaatcatgatttgatgatgagaaataag 5451101  T
Q  427 ttgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||| ||||||    
T  5451102 ttgttgttgttggttt 5451117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 281 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11342819 - 11342661
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctat-gtcatgttgttgatgataat 379  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | | ||||| ||||||||||| ||    
T  11342819 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgat 11342720  T
Q  380 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342719 atatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 11342661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28902550 - 28902252
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28902550 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 28902453  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  || ||||| |  ||||||||||||||||||||  || | | | ||||||    
T  28902452 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaa 28902353  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28902352 gtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttg 28902254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28938945 - 28938647
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28938945 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 28938848  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  || ||||| |  ||||||||||||||||||||  || | | | ||||||    
T  28938847 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaa 28938748  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28938747 gtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttg 28938649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21650829 - 21650668
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |  ||| |||||    
T  21650829 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaatt 21650730  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||   ||||||||| ||||||    
T  21650729 catggtttgggtatgcatgattcataatttgttgtggtgaaataagttgttgttgttggttt 21650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 446
Target Start/End: Original strand, 21222547 - 21222886
Alignment:
Q  105 ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagata 203  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  21222547 ttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt--attgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatg 21222643  T
Q  204 tatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatg 302  Q
     ||||| ||    |||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||   ||| || |||||||||||  ||||||| || || | |||| ||    
T  21222644 catgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgtttaattgtg 21222742  T
Q  303 ctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgatt 402  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||| || | ||| | |    
T  21222743 ctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattaatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggattgagtgttcataaat 21222842  T
Q  403 catgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    ||||| ||| || |||||| |   ||||||||  ||||||||||    
T  21222843 catgacttgatgatgagaattcagttgttgttattggttttgtg 21222886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21617375 - 21617010
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  21617375 ctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt-aagggattaattg 21617278  T
Q  155 ttcataaatgatga-aattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    ||||| | |  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||| ||||||||| ||  |||| ||| ||| ||    
T  21617277 ttcattagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttccaa 21617178  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    ||||   ||| || |||||||||||  ||||||| || || |||||| | |||||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  21617177 gtatatgaaagtgttatatgttgaac-tatgctctaaatgttgaattgttctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttg 21617079  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa 421  Q
    |||||| || || |||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||    
T  21617078 ttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaa 21617010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21205060 - 21204898
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| || || ||||| || ||  |||||    
T  21205060 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttatttattctaatt 21204961  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  21204960 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 21204898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 278
Target Start/End: Original strand, 21310600 - 21310819
Alignment:
Q  60 aactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttc 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | || ||||||  |||   |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21310600 aactaaggtaagggggttaaaattcatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttc 21310698  T
Q  158 ataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtat 257  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| |    
T  21310699 ataaatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagttt 21310798  T
Q  258 gaaaaattggtatatgttgaa 278  Q
    |  ||| || |||||||||||    
T  21310799 gtgaaaatgatatatgttgaa 21310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 29918228 - 29917935
Alignment:
Q  152 ttgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttc 250  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||    
T  29918228 ttgttcatagttgttgaaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatga-taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc 29918130  T
Q  251 aaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 349  Q
    | ||||||  ||   | |||||  ||||  ||||||| || || |||||| || ||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | || ||||||||    
T  29918129 atagtatgtgaacaggatatattgtgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaactgatgttg 29918031  T
Q  350 ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||| | |||||||||    
T  29918030 ttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgttgagaaataaattattgtcgttggttttgt 29917935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Original strand, 22662530 - 22662608
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca 94  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  22662530 agagctaggagaaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggatagaattcatcataatca 22662608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37983722 - 37983342
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  37983722 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 37983624  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||  || | ||||| ||||||||  |||| ||| || |||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  37983623 tcatagttgttaaaatttgtgctctatctatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatattcaaagt 37983524  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||  ||| || |||||  ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||  ||| |||||||| || ||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  37983523 atgtgaaagtgatatattgtgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtaatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 37983425  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggt 437  Q
    | || || || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||| | ||| |||||| || ||| |||||  |||||||||||    
T  37983424 gttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcaggatttgatgatgaaaaatgagttgttgttggt 37983342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 6456891 - 6456594
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||| ||    |||| |    
T  6456891 tgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgaagatacgtttgaatacatgaaattggcgataattgaattgttggtga---aattgc 6456795  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    || |||| ||||||  ||| || |||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||    
T  6456794 atgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattg 6456696  T
Q  344 atgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttt 443  Q
    |||||||||||| || |  || | |||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||   ||||||||| || ||||    
T  6456695 atgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgttttt 6456596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 21297064 - 21297285
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | || | || ||||||  |||   |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21297064 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 21297162  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||  |   ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  21297163 tcataaatgttaaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 21297262  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaa 278  Q
     ||  ||| || |||||||||||    
T  21297263 ttgtgaaaatgatatatgttgaa 21297285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 190
Target Start/End: Original strand, 32966037 - 32966171
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  32966037 ctaactaaggtaagagggttagaattcatcataatcatttttagtgtgaattttcaattgt-tgtataaataagtgcttaattgagtaaat-gattaatt 32966134  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatg 190  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  32966135 gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatg 32966171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24084348 - 24084100
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaat-gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaatta 243  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  24084348 tgattatttgttcattaattggtgacattcgtgccctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaatta 24084249  T
Q  244 cattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatt 342  Q
    ||| |||| ||||||  ||| || |||||  ||||  | ||||| || || |||||| |||||||| |||| |||||||||||  |  ||||| | ||||    
T  24084248 catgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgtgaatcatgtttaatt 24084150  T
Q  343 gatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||| |||  |||||||||||||||    
T  24084149 gatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgaagattcatggcttgggt 24084100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 479
Target Start/End: Original strand, 17471854 - 17471907
Alignment:
Q  426 attgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaa 479  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471854 attgttgttggtgttttggtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaa 17471907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 392
Target Start/End: Original strand, 22053963 - 22054072
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  22053963 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatca 22054062  T
Q  383 tggcttgggt 392  Q
    | ||||||||    
T  22054063 ttgcttgggt 22054072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 445
Target Start/End: Original strand, 109010 - 109118
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatggattgttgttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  109010 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 109108  T
Q  436 gtggttttgt 445  Q
    ||||||||||    
T  109109 gtggttttgt 109118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 392
Target Start/End: Original strand, 26559864 - 26560039
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| || |||||  ||||  | ||||| || || |||||| |||||||| |||| |    
T  26559864 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgtt 26559962  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
    || ||||||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||| |  || |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  26559963 gatttgtgatgagaattatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttggtgatgattcttggcttgggt 26560039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 438
Target Start/End: Original strand, 32966309 - 32966417
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| |||||||||||  ||| | ||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||| |||| |||||||||  |||    
T  32966309 ttcatgttcaattgatgtaattgcttctaagtggtgttgttattgataattcatggcttgagcgtgcataattcataattggttgatgagaaatgagttg 32966408  T
Q  430 ttgttggtg 438  Q
    |||||||||    
T  32966409 ttgttggtg 32966417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 390
Target Start/End: Original strand, 16835426 - 16835521
Alignment:
Q  295 gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgg 390  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||| || |||||| | |||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  16835426 gaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagatgttgttgttgatgattcatagcttgg 16835521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 348
Target Start/End: Original strand, 18531200 - 18531262
Alignment:
Q  286 tcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 348  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  18531200 tcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 18531262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Original strand, 1219775 - 1219816
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1219775 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 1219816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 16105721 - 16105613
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgag-aaatggattgttgttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || | | ||||||| ||| | |||   |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  16105721 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttaggtgttcatatatcatga-ttgttgttgagaaaatgagttgttgttg 16105623  T
Q  436 gtggttttgt 445  Q
    ||||||||||    
T  16105622 gtggttttgt 16105613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Original strand, 22883339 - 22883380
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22883339 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22883380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23417368 - 23417264
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||| | |  |||||| | ||||||||||||||||| ||||   | |||||| |||| |||||| |||    
T  23417368 aattgctgaattgtgctatgttgttgttgatttgtggtgacattcatgtttaattgatgttgttgttgttatgaggtattgttgttgatgattcatagct 23417269  T
Q  388 tgggt 392  Q
    |||||    
T  23417268 tgggt 23417264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 35055157 - 35054729
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35055157 gaagatctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttatttctattttcaatt 35055058  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35055057 atttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattggttaattgttcataaatgatttaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 35054958  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35054957 tgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtagttg 35054858  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  35054857 atgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgtt 35054758  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||| | |||   ||||||||| ||||||    
T  35054757 gttgtggaataagttgttgttgttggttt 35054729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 49968050 - 49967606
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  49968050 gaagagctagaagcaaaattgaagtctaaggtagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcgtaatcacttattgtaattttcaatt 49967952  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  49967951 atttgcatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcaaaaatcatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagtta 49967852  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||    
T  49967851 tgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaattataaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttg 49967752  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||    
T  49967751 atgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcattgcttcggtttgcatgattcatg-gttgtt 49967653  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatta 460  Q
    |||||| ||||   ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  49967652 gttgaggaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatta 49967606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21718623 - 21718206
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatc 116  Q
    ||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  21718623 agctatgagctaaattgaagcataagctagggagactaatctaactaaggtaag-ggattagaattcaatataatca-ttattgcaatttttcaattat- 21718527  T
Q  117 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21718526 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgg 21718427  T
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21718426 ataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatgtgttcaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatg 21718327  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 416  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21718326 atttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-gttgttctt 21718228  T
Q  417 gagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||   |||||||||||    
T  21718227 gagaaatgagatgttgttggtg 21718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 410
Target Start/End: Original strand, 22402956 - 22403351
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22402956 gaagagttaggagcaaaattaaagcctaaggtagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaatt 22403055  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22403056 atttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtctagatgtatgaagtta 22403155  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  22403156 tgaataattaaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgt 22403253  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22403254 tgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttt-catgattcatgattt 22403351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 355
Target Start/End: Original strand, 9783914 - 9784248
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9783914 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctaggga--ttactctatctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttactgcaattttcaattat 9784011  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9784012 tggtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgataaattgttcataagtgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 9784111  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||| |    
T  9784112 gataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgct---ttgttgtt 9784208  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784209 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9784248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 73 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41212412 - 41212046
Alignment:
Q  73 gggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaatt 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41212412 gggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaatt 41212314  T
Q  173 cgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatat 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  41212313 cgtgctctaattatgatgacctgtttagaggtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaactgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgt 41212214  T
Q  273 gttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctat---gtcatgttgt 369  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||||    
T  41212213 g-taaaaatatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgt 41212115  T
Q  370 tgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  41212114 tgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 41212046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 415
Target Start/End: Original strand, 27329612 - 27330002
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27329612 gaagagctaggagtaaaattgaagcccaatctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaat 27329711  T
Q  113 tatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagt 211  Q
    |||  ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||            ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27329712 tatg-gtatgaataagtgtttaattgtgt-aattgattaattgttag----------aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagt 27329799  T
Q  212 tatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatga-aaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtgg 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || | |||  ||||||||||  |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27329800 tatga-taattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgggttatgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttg 27329897  T
Q  311 ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27329898 ttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 27329997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 35522200 - 35522430
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35522200 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctaaggagattaatctaactaaggtaagggagttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 35522298  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35522299 tttgtatgaaaagggcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttat 35522398  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacat 246  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35522399 ggataattgaattgttgttagttgaattacat 35522430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 442
Target Start/End: Original strand, 51627513 - 51627938
Alignment:
Q  17 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat--tgcaattttcaatta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  || || ||||||||     
T  51627513 gagctaggagctaaattgaagcttaagctagggag-ttaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattg 51627611  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | || ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  | |  |||| |||||| ||||||||||| ||| ||  ||  ||||| ||     
T  51627612 t-tgcatgaataagtgcttaattgagt-aattgattatttgttcataatcgttagaatttgtgctccaattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttg 51627709  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggtt 312  Q
    |  || |||||||||||||| ||  || | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  51627710 ttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaa-tatgttcaattggttgaattatgatatggtgtt 51627808  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  51627809 gttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgc 51627908  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  51627909 tgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 51627938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 125 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 20177464 - 20177131
Alignment:
Q  125 aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattga 224  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||  | |||||| |  ||||||||    
T  20177464 aagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttgataattga 20177366  T
Q  225 attgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtg 323  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20177365 attgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 20177267  T
Q  324 ataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
     |||   ||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  20177266 gtaaaagtcaagttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttggatattcataattcatgatttgttgaagagaaat 20177167  T
Q  424 ggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20177166 gagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 20177131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 281 - 459
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522610
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataatt 35522531  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  35522532 catggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaattggtgaatt 35522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 442
Target Start/End: Original strand, 22143251 - 22143635
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  22143251 ctaactaaggtaag-gggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattg 22143347  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  | || ||| |||||||    
T  22143348 ttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaag 22143447  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    |||| | || || ||  |  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||     
T  22143448 tatgtataaatgttaacttatgaat-tatgctcaaatggttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgctcaattgatgttgttgc 22143546  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22143547 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgatgatgagaaatcgattgttgttgttggttt 22143635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 44035092 - 44035267
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| | ||||||||| ||     
T  44035092 tatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgatgata 44035191  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44035192 -atggcttgagtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgcaattggtgaa 44035267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22367152 - 22366996
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||     
T  22367152 tatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgata 22367054  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367053 catgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 22366996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 459
Target Start/End: Original strand, 13376752 - 13377131
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattca-tcataatcactt-attgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 158  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || | || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  13376752 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaatttagt-aattgattaattgttca 13376849  T
Q  159 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatg 258  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||| |  |||||| ||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||    
T  13376850 tagatgatgagaatcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattaaattgttgtcgttgaaatttcatgttcaaagtatg 13376949  T
Q  259 aaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgcta 358  Q
    || || ||||||||||||||                   ||||| ||||| |||| |||||| || | |   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13376950 aagaagtggtatatgttgaa-------------------ttatgttatgttgttgttgaattatggtgaaagtcatgctcaattgatgttgttgttgcta 13377030  T
Q  359 tgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaat 458  Q
     || |||||||||||| | |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13377031 agtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgaattgttgttggcggttttgtgaaattggtgaat 13377130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 281 - 438
Target Start/End: Original strand, 15861547 - 15861702
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  || |  ||||| ||||||||||| ||     
T  15861547 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt--tgtttagtcatattgttgatgatgatg 15861644  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861645 catgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 15861702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16646271 - 16645975
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16646271 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 16646174  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||| ||| ||||||    
T  16646173 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgttggtaaaatttcatgttcaaa 16646074  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| || ||||||||| || ||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16646073 gtatgagaaagtgatatatgttg-aattattctcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 16645975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21860145 - 21859984
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||     
T  21860145 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgata 21860046  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21860045 catggctcgggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatgaattgttgttgttggttt 21859984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16656997 - 16656699
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16656997 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgttaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 16656900  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  || ||||| |  ||||||||||||||||||||  || | | | ||||||    
T  16656899 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaa 16656800  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16656799 gtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttg 16656701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 411
Target Start/End: Original strand, 9784237 - 9784343
Alignment:
Q  305 atgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattca 404  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9784237 atgttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattca 9784336  T
Q  405 tgatttg 411  Q
    |||||||    
T  9784337 tgatttg 9784343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17609286 - 17608899
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| || || |||||| |||    
T  17609286 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattagttg 17609189  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
     |||||  || |  ||||||||||||||||||||||| || |||  ||  ||||| ||    ||||||| ||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  17609188 atcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaag 17609089  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    |||   ||| || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||||||| |||| |||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||    
T  17609088 tatatgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgt 17608990  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttg 444  Q
    || || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |  |||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  17608989 tgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgattatgagaattgagttgttgttgttggttttg 17608899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 411
Target Start/End: Original strand, 37233749 - 37234103
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  37233749 ctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtattattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattg 37233846  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    || |||  || |  |||||||||| || ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  37233847 ttaatagttgttagaattcgtgctttagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaag 37233946  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    |||   ||| || |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  37233947 tatatgaaagtgatatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgt 37234045  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    ||||| || || |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||    
T  37234046 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgtccataaatcatgatttg 37234103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19603454 - 19603074
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19603454 ctaactaaggtaagggggctagaattcatcataatcatttagtgcaaattttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgt 19603357  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||  || |||||| ||    |||||||| |||||||||||  ||||  ||  |||||||    
T  19603356 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagt 19603257  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    ||   ||| || |||||| | | | ||||||| || ||     || || ||||| | || |||||| || | |  |||||| ||||||||||| |||| |    
T  19603256 atatgaaaatgatatatg-tcatattatgctctaaatgtcatcttgtgatatgttgatgttgaattatgctgaaattcatgttcaattgatgtagttgct 19603158  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||| || |||| |||  |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  19603157 gctaagtgatgtggttattgataattcatgacttgggtgtgaataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtg 19603074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21195284 - 21194986
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  ||||      
T  21195284 tgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgt 21195185  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    || |||| ||||||  ||| || |||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||     
T  21195184 atgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatta 21195086  T
Q  344 atgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttt 443  Q
    |||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  21195085 atgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttt 21194986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20346424 - 20346342
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20346424 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaacct-actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt 20346342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 331 - 460
Target Start/End: Original strand, 41229102 - 41229231
Alignment:
Q  331 tcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgt 430  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||    
T  41229102 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgt 41229201  T
Q  431 tgttggtggttttgtggaattggtgaatta 460  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  41229202 tgttggtagtttggtaaaattggtgaatta 41229231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Original strand, 22829315 - 22829694
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  22829315 ctaactaaagtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattat 22829412  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  || ||||||  |    |||||||| |||||||| ||  ||||  ||  ||||||     
T  22829413 tcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaactggtgataattgatttgttgttagtgaaattgaatggtcaaagc 22829512  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||   ||| || |||||| | | | ||||||| |   || |||| || ||||| |  | |||||| || | ||||||||| || ||||||||  ||||||    
T  22829513 atatgaaaatgatatatg-tcatattatgctctaaatgtcaattgtgatatgttgaggttgaattatgttgagtttcatgttccattgatgtaattgttg 22829611  T
Q  356 ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
     || || || ||  |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22829612 ttaagtgatttttctattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtg 22829694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 330 - 459
Target Start/End: Original strand, 36356455 - 36356581
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||    |    
T  36356455 ttcatgttcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgatgatttatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatg---ag 36356551  T
Q  430 ttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  36356552 ttgttggtagtttggtaaaattggtgaatt 36356581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 190
Target Start/End: Original strand, 20955329 - 20955461
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc-aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  20955329 ctaactaaggtaagggggttataattcatcataatcatttagtgcaaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgt 20955426  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatg 190  Q
    |||||| || |  |||| |||||| ||||||||||    
T  20955427 tcataattgttagaatttgtgctccaattatgatg 20955461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 330 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27674881 - 27674774
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  27674881 ttcatgttcaattggtgtagttgttgttaagtgatgttgttattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattt-ttgatgagaaatgagttg 27674783  T
Q  430 ttgttggtg 438  Q
    |||||||||    
T  27674782 ttgttggtg 27674774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 438
Target Start/End: Original strand, 20955601 - 20955709
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| || ||||||  |||    
T  20955601 ttcatgttcaattgatgtagttgctgctaagtgatgttgttattgataattcatggcttcggtgtgaataattcgtgaattgttggtgtgaaatgagttg 20955700  T
Q  430 ttgttggtg 438  Q
    |||| ||||    
T  20955701 ttgtgggtg 20955709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 190
Target Start/End: Original strand, 36356181 - 36356315
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36356181 ctaactaaagtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 36356278  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatg 190  Q
    |||||| | || |  |||||||||||  |||||||||    
T  36356279 gttcatgattgttagaattcgtgctcctattatgatg 36356315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 442
Target Start/End: Original strand, 8537908 - 8538184
Alignment:
Q  166 tgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaatt 265  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||  ||||| |||   ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| |    
T  8537908 tgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 8538007  T
Q  266 ggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcat 364  Q
    | |||||  ||||  | |||| || ||| |||| | |  ||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  ||    
T  8538008 gttatattgtgaat-tgtgcttaaattgttgaaatgtcttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaat 8538106  T
Q  365 gttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | | |||||||| || || |||||   ||||||||| ||||||    
T  8538107 attgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaataatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 8538184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 442
Target Start/End: Original strand, 8603147 - 8603423
Alignment:
Q  166 tgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaatt 265  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||  ||||| |||   ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| |    
T  8603147 tgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 8603246  T
Q  266 ggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcat 364  Q
    | |||||  ||||  | |||| || ||| |||| | |  ||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  ||    
T  8603247 gttatattgtgaat-tgtgcttaaattgttgaaatgtcttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaat 8603345  T
Q  365 gttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | | |||||||| || || |||||   ||||||||| ||||||    
T  8603346 attgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaataatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 8603423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20445812 - 20445747
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20445812 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20445747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20531577 - 20531512
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20531577 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20531512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 438
Target Start/End: Original strand, 38033836 - 38033943
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||| || |||||| || || ||||||||||||||||| |||||  |||| || |||||| ||||||||   |||    
T  38033836 ttcatgttcaattgatgtgattgctgctaagtgatgttgctgttgttaattcatggcttgggtgtgcatagttcacga-ttgttgatgagaaataagttg 38033934  T
Q  430 ttgttggtg 438  Q
    |||||||||    
T  38033935 ttgttggtg 38033943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Original strand, 40436267 - 40436493
Alignment:
Q  166 tgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaatt 265  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||| ||    |||||||||||||||||| |  |||| ||| |||| | ||||  ||| |    
T  40436267 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat 40436366  T
Q  266 ggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcat 364  Q
    | |||||  || || | ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||  || |  ||    
T  40436367 gatatattgtg-aattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatgtttaattgatgttgttgtttttaagagat 40436465  T
Q  365 gttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
     |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  40436466 attgttgttgatgattcatagcttgggt 40436493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Original strand, 49997169 - 49997371
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcat-cataatcactta-ttgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||| ||||||  ||||  || ||||  |||||||||||||  | || |||||| |||    
T  49997169 ctaactaaggtaagggggttagaattcaaacataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttg 49997267  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||| | || ||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||    
T  49997268 ttcatgattgttgaaatttgtgccctagttatggtgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 49997367  T
Q  255 tatg 258  Q
    ||||    
T  49997368 tatg 49997371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Original strand, 18060013 - 18060054
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18060013 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 18060054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27675107 - 27675021
Alignment:
Q  103 aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatg 190  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | || |  ||||||||||| ||||||||||    
T  27675107 aattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattatttgttcatgactgttagaattcgtgctccaattatgatg 27675021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1716 - 1308
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1716 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggcaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatt--caatt 1619  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1618 atttgtatgaaaagtggttaattgaatgaattgattaattgtgtataaatgatgaaattcgtgctctaatcatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 1519  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1518 tggataattgaattgttggtggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgatgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttg 1419  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1418 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 1319  T
Q  414 gttgagaaatg 424  Q
    |||||||||||    
T  1318 gttgagaaatg 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 459
Target Start/End: Original strand, 11504 - 11942
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  11504 agctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattattt 11602  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11603 gtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaa 11702  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  11703 taattgaattgttcttggttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgat 11801  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttg 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||     
T  11802 gaattgtgaaaagtttcatgatcaat---tgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcataactcatgattttgtta 11897  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    | ||||||||   ||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  11898 tggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 11942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 22 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 85724 - 85323
Alignment:
Q  22 aggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  85724 aggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatcttactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaattat-tgta 85627  T
Q  121 tgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  85626 tgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtttataaatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataa 85527  T
Q  221 ttgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaatt 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  85526 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaatt 85427  T
Q  321 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaga 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85426 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaga 85327  T
Q  421 aatg 424  Q
    ||||    
T  85326 aatg 85323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 159698 - 159257
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  159698 agagcttggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 159600  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  159599 t-tgtacgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttat 159501  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttg 313  Q
    | ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  159500 ggataatggcattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatgagttgaaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatg 159401  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  159400 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaag---tgatgttgatgataatttttggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 159304  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  159303 gttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 159257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 41247057 - 41246614
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41247057 gaagaggtaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattgaccta-ctaaggtaagggggttagagttcatcataatcacttattgtaattttcaatt 41246959  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41246958 agttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagtta 41246859  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||    
T  41246858 tgaataattaaattgttgttggttgaattacatgttaaaagtaggaaaaatgggtatatgatg-aaatatgcttaattggtgaattatgcattgttgttg 41246760  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41246759 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtt 41246660  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  41246659 gttgagaaatgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 41246614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 20573040 - 20573483
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20573040 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 20573138  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  20573139 tttgtatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttat 20573238  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |   |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||     
T  20573239 ggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaagggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgt 20573338  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20573339 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tg 20573437  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  20573438 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaattggtgaatt 20573483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 37612068 - 37611624
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37612068 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagatagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaatt 37611970  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37611969 atttgtatgaaaagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 37611870  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37611869 taaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgt 37611772  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttt 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  37611771 tgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgatttt 37611673  T
Q  411 gttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||| | |||||||| | ||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  37611672 gttatggagaaatgaaatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 37611624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20482003 - 20481578
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20482003 gaagaggtaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttaaaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaatt 20481906  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  20481905 aa-tgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagtt 20481808  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  20481807 atgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggatatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatactttgttgtt 20481708  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20481707 gatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgt 20481608  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  20481607 tgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 20481578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Original strand, 20561479 - 20561810
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20561479 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaatta 20561577  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20561578 tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttat 20561677  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20561678 agataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttga 20561777  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561778 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20561810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 460
Target Start/End: Original strand, 19992906 - 19993346
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  19992906 agagctaggagaaaaattgaagcctaagctagggagattaatcta-ctaaggtaagggggttataattcatcataatcactt-ttgtaattt-caattat 19993002  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19993003 ttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaatccgtactctaattatgatgacatgtttagatgtacgaagttatg 19993102  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||  ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  19993103 aataattgaattgt-gttagttgaattacttgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 19993199  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||    
T  19993200 atgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggctagggtttgcataattcttggattgtt 19993299  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatta 460  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  19993300 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatta 19993346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 419
Target Start/End: Original strand, 22234652 - 22235054
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22234652 gaagagctaggagcaaaattgaagactaagtttgggagattaatcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaatt 22234749  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22234750 atttgtatgataagtgcttaattgaatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacgtgtttagatgtatgaagtta 22234849  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  |||||||  ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  22234850 tgaataatttaattgt-gttagttgaattacatgctcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgt 22234946  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  22234947 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggattgggtttgcataattcttggtttg 22235046  T
Q  412 ttgttgag 419  Q
    ||||||||    
T  22235047 ttgttgag 22235054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21681403 - 21680994
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21681403 agagctaggagaaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaaataaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaatta 21681304  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||| |  |||    
T  21681303 t-tgtatgaataagtgcttaatttgttgaattgattaattgttcataaatgataaaattcgtgatctaattatgatgacatatttgaatgtataagttta 21681205  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa-ttatgctatgtggtt 312  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||    
T  21681204 tggataattgaattattgttagttgaatttcatgtttaaagtatgagagaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatgctttgttgtt 21681105  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21681104 gttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgt 21681005  T
Q  413 tgttgagaaat 423  Q
    ||| |||||||    
T  21681004 tgtggagaaat 21680994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 442
Target Start/End: Original strand, 39446614 - 39447039
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat--tgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  || || ||||||||    
T  39446614 agagctatgagctaaattgaagcttgagctaggga-attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaatt 39446712  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
     | |||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||   |||||||    
T  39446713 gt-tgtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagtt 39446810  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggt 311  Q
     || ||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  39446811 gtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatgaagaagtgttatatgttgaaa-tatgctaaattggttgaattatgctatgttgt 39446909  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39446910 tgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggtatgcatgatt-atgatttg 39447008  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  39447009 ttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 39447039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 207 - 421
Target Start/End: Original strand, 20653944 - 20654158
Alignment:
Q  207 gaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctat 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20653944 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgctaa 20654043  T
Q  307 gtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 406  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20654044 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaattcattgcttgggtttgcatgattcatg 20654143  T
Q  407 atttgttgttgagaa 421  Q
    ||||||||| |||||    
T  20654144 atttgttgtggagaa 20654158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25122841 - 25122626
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25122841 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattataattttcaatt 25122744  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25122743 atttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatcaaattcgtgctccaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtta 25122644  T
Q  214 tgaataattgaattgttg 231  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25122643 tgaataattgaattgttg 25122626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 104 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 23837508 - 23837153
Alignment:
Q  104 attttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagat 202  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23837508 attttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaat 23837411  T
Q  203 atatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattat 301  Q
      |||||||| |  |||||||||||||||||  |  |||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  23837410 gcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaac-tatgctcaaattgttgaattat 23837312  T
Q  302 gctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgat 401  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||    
T  23837311 gctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataat 23837212  T
Q  402 tcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatta 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23837211 tcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtgaaattggtgaatta 23837153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 221 - 421
Target Start/End: Original strand, 20647882 - 20648082
Alignment:
Q  221 ttgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaatt 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20647882 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaatt 20647981  T
Q  321 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaga 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20647982 gtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatccatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggaga 20648081  T
Q  421 a 421  Q
    |    
T  20648082 a 20648082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 281 - 480
Target Start/End: Original strand, 41506930 - 41507129
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  41506930 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataatt 41507029  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41507030 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttagtggaattggtgagttatgacatgttgttgttgaaat 41507129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 105 - 455
Target Start/End: Original strand, 21198090 - 21198439
Alignment:
Q  105 ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagata 203  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  21198090 ttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatg 21198187  T
Q  204 tatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatg 302  Q
     |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  21198188 catgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatg 21198286  T
Q  303 ctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgatt 402  Q
     ||||| |||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || | || ||||||||||||||| | ||| |||    
T  21198287 ttatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgctgttaatgattcatggcttgggtgttcataatt 21198386  T
Q  403 catgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtg 455  Q
    |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  21198387 catgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtggtttggtaaaattggtg 21198439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Original strand, 20529699 - 20529843
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20529699 gaagatctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttataattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 20529798  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 158  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20529799 atttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 20529843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 117 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 38533947 - 38533640
Alignment:
Q  117 tgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
    |||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| || |  ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |     
T  38533947 tgtatgaataagtgcttaattaagt-aattgactaattgttcataattgttagaattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgtt 38533849  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
     ||||||||||||||||| |   |||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||     
T  38533848 gataattgaattgttgttagagaaatctcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaa-tatgctcaaattattgaattatgctatgttgttgt 38533750  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  38533749 tgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttg 38533650  T
Q  415 ttgagaaatg 424  Q
     |||||||||    
T  38533649 atgagaaatg 38533640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22981633 - 22981351
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgatt 149  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22981633 attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatttt--gtatgaataagtgcttaattgggt-aattgatt 22981537  T
Q  150 aattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatttt 249  Q
    ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||||| |   |||| ||| ||    
T  22981536 aattgttcaga--tgatgaaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgtt 22981439  T
Q  250 caaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgat 337  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22981438 caaagtatgagaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgat 22981351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 5854972 - 5854584
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  5854972 ctaattaaggtaaggaggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattg 5854875  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||    
T  5854874 ttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaag 5854775  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    |||   ||| || |||||||||||  ||||||| || || ||| || |||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  5854774 tatatgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgagttgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgt 5854676  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  5854675 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgt 5854584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 26011824 - 26011464
Alignment:
Q  85 atcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaa 182  Q
    |||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  26011824 atcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtgtttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaa 26011727  T
Q  183 ttatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaata 282  Q
    ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||  ||    
T  26011726 ttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaat-ta 26011628  T
Q  283 tgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 381  Q
    ||||| || || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||    
T  26011627 tgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 26011528  T
Q  382 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||| |   ||||||||| |||||||||    
T  26011527 atggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgt 26011464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 24716983 - 24717159
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||     
T  24716983 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgata 24717082  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24717083 catggcttgggtttgcatgattcataatttgttgttgataaatggattgttgttggtggttttgtaaaattggtgaa 24717159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 15933656 - 15933268
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  15933656 ctaattaaggtaagggggttagaattaaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattg 15933559  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  15933558 ttcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaag 15933459  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||  ||| || || ||||||||  ||||||| || || |||||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  15933458 tatgtgaaagtgttaaatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgt 15933360  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| |   | | ||||||||||  | |||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  15933359 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatcatgatttgaagatgagaattgagttgttgttgttggttttgt 15933268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Original strand, 22735736 - 22736108
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt---attgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||   ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22735736 ctaactaaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttttaatgtaaattttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaatt 22735833  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    |||            ||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||  |||||||  |  |||||||| |||||||||||  || | ||| ||||||    
T  22735834 gttag----------aattcgtgctccaattatgataatatgttga-atgcatgaagtggttgataattgagttgttgttggtaaaacttcatgttcaaa 22735922  T
Q  254 gtatgaaaaat-tggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 351  Q
    |||| |||||  || |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22735923 gtataaaaaaaatgatatatgttgaat-tatgatcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaattgatgttgtt 22736021  T
Q  352 gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
     ||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  22736022 cttgctaactgatgttgttgttgttaattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattgttgatgaaaaatgagttgttgttggtg 22736108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 274577 - 274416
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| |||||    
T  274577 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaatt 274478  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  274477 catggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 274416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 641272 - 641433
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| |||||    
T  641272 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaatt 641371  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  641372 catggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 641433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 827078 - 827239
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| |||||    
T  827078 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaatt 827177  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  827178 catggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 827239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 16039002 - 16039163
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  16039002 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 16039101  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
     ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  16039102 tatggcttggatatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 16039163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 339 - 459
Target Start/End: Original strand, 20567329 - 20567449
Alignment:
Q  339 aattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  20567329 aattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567427  T
Q  439 gttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
     ||| |||  ||||||||||||    
T  20567428 ttttggtgaaaattggtgaatt 20567449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 339 - 459
Target Start/End: Original strand, 20573522 - 20573642
Alignment:
Q  339 aattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  20573522 aattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573620  T
Q  439 gttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
     ||| |||  ||||||||||||    
T  20573621 ttttggtgaaaattggtgaatt 20573642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 480
Target Start/End: Original strand, 24929018 - 24929117
Alignment:
Q  380 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaa 479  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24929018 tcattgcttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttgttgttgaaa 24929116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 33528783 - 33528396
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  |||||||||||||  | || |||||||||||    
T  33528783 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgt 33528685  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    || || ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| || |  |||||||||||||||||| |  ||||  || |||  |||    
T  33528684 tcttagatgttgaattccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgatgaaattgtatcttcttagt 33528585  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    ||   ||| || |||||||||||  | ||||| || || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||    
T  33528584 atatgaaaatgatatatgttgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgtt 33528486  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||| |  || || ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  33528485 gctaagagatatt-ttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgggttgttgttgttgattttgt 33528396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39115409 - 39115249
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  39115409 tatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataatt 39115310  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtt 441  Q
    |||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  39115309 catgacttgtgtatgcatgattcataatttattgttgagaaataaattgttattgttggtt 39115249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 445
Target Start/End: Original strand, 23225973 - 23226353
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaatttt-caattatctgtatgaaaa-gtgcttaattgggtgaattgattaattgttcat 159  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||    | |||||||||||||||    
T  23225973 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcattttagtgcaatttttcaattat-tgtatgaaaaagtgtttaattgg----aatgattaattgttcat 23226067  T
Q  160 aaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatg 258  Q
    | ||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||| || |||| ||||||| |||||||||||  | || ||| |  ||||||||    
T  23226068 agatgttaaaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatga-taattgagttgttgttggtgaatttgcatgtcaaaagtatg 23226166  T
Q  259 aaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgct 357  Q
     | || || ||  |  ||||  ||||||||| || | |||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||| |    
T  23226167 tataagtgttaacttatgaat-tatgctcaaatgattgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgtt 23226265  T
Q  358 atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    | || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23226266 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgattatgagaaatggattgttgttgttggttttgt 23226353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 23150135 - 23149751
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagaggg-ttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| || | |||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23150135 ctaactaaggtaaggggggttataattcatcataatcatttagtttaattttca-ttgt-tgtatgagtaagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 23150039  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatt-ttcaaag 254  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||  ||   |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||     
T  23150038 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataaatgaattgttgttggtgaaatttcatgattcaaaa 23149939  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||  ||| ||||||    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||   ||| |||| ||  ||||| ||||| | |||| ||||    
T  23149938 tatgtgaaagtggtatggtatgaat-tatgctcaattggttgaattatgctaagttgttga---attatgatgagaatcatgttcaatagttgtttttgt 23149843  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||| || ||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  23149842 tgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgt 23149751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 357 - 459
Target Start/End: Original strand, 20567188 - 20567290
Alignment:
Q  357 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  20567188 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaattggtg 20567286  T
Q  456 aatt 459  Q
    ||||    
T  20567287 aatt 20567290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29306687 - 29306450
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    ||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||   ||  ||||| |||   ||||||||||||||||||||  | ||      
T  29306687 tgattgattgttcatagatgttaatattcgtgctctaactatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgt 29306588  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    || |||||||| ||  ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||| | |||||    
T  29306587 atgttcaaagtttgtgaaaatgatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattg 29306489  T
Q  344 atgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||    
T  29306488 atgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 29306450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 360 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29759997 - 29759919
Alignment:
Q  360 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29759997 gtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgttgttggtg 29759919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 337 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2545024 - 2544886
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttgg 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||||||| | || ||| ||||||||||| |  ||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  2545024 tcaattgatgttgttgttgata---catgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttgatatatcatgatt-gttgttgagaaatggactgttgttag 2544930  T
Q  437 tggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2544929 tggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttgttgttgaaat 2544886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17285493 - 17285341
Alignment:
Q  125 aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattga 224  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |  ||||||||    
T  17285493 aagtgcttaattgaat-aattgaataattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattga 17285395  T
Q  225 attgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaa 278  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  17285394 attgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 17285341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 422
Target Start/End: Original strand, 38635632 - 38635902
Alignment:
Q  152 ttgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttca 251  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||    
T  38635632 ttgttcatagttgttgaaattcgtgctctagttatcatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 38635731  T
Q  252 aagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgt 350  Q
     | ||||  ||| || |||||  ||||  ||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||    
T  38635732 taatatgcgaaaatgatatattgtgaat-tatactcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgt 38635830  T
Q  351 tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaa 422  Q
    ||||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||||    
T  38635831 tgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcataatttgttgatgagaaa 38635902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 445
Target Start/End: Original strand, 18261455 - 18261748
Alignment:
Q  152 ttgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttca 251  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||    
T  18261455 ttgttcatagttgttgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatcttca 18261554  T
Q  252 aagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgt 350  Q
     ||||||  ||| || |||||  ||||  | ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||    
T  18261555 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgt 18261653  T
Q  351 tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||| |   ||||||||| |||||||||    
T  18261654 tgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgt 18261748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122513
Alignment:
Q  333 atgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgtt 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||   ||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgtt 25122520  T
Q  432 gttggtg 438  Q
    |||||||    
T  25122519 gttggtg 25122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15970177 - 15970046
Alignment:
Q  59 taactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtt 156  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  15970177 taactaaggtaagggggttggaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattat-tgtatgaataaatgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 15970080  T
Q  157 cataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatg 190  Q
    ||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  15970079 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatg 15970046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 459
Target Start/End: Original strand, 31194488 - 31194615
Alignment:
Q  332 catgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||    
T  31194488 catgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgcacatgattcatgatttgttggtgaaaaatgagttgtt 31194587  T
Q  432 gttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||  |||||  ||||||||||||    
T  31194588 gttggtgactttgtaaaattggtgaatt 31194615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 23158514 - 23158133
Alignment:
Q  59 taactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttc 157  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||  || | |||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  23158514 taactaagataagggagttataattcattataatcatttagtgtaattttc--ttgt-tgtatgaataagtgcttatttgagtaaat-gattaattgttc 23158419  T
Q  158 ataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatt-ttcaaagta 256  Q
    |||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||  ||   |||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||| ||    
T  23158418 ataattgttaaaattcatgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataaatgaattgttgttggtgaaatttcatgattcaaaata 23158319  T
Q  257 tgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
     |  ||| ||||||    ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||   |||| ||||| | ||||||||||     
T  23158318 cgtgaaagtggtatgatatgaat-tatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaatagttgttgttgttc 23158220  T
Q  356 ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||| || ||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |  ||| |||||  ||||| ||| |||||||||    
T  23158219 ctaagtgatgttgttgatgat---tcatggcttgggtgttcataattcatgatttgataatgaaaaatgagttgttcttgttggttttgt 23158133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 445
Target Start/End: Original strand, 33611179 - 33611330
Alignment:
Q  294 tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||   |||| | |||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| ||     
T  33611179 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgttgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgtgtg 33611278  T
Q  394 tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    | ||| | |||||||||| || ||||| ||   ||||||||| |||||||||    
T  33611279 ttcataaatcatgatttgatgatgagatataagttgttgttgttggttttgt 33611330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 160
Target Start/End: Original strand, 7000539 - 7000616
Alignment:
Q  82 ttcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 160  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7000539 ttcatcataatcactttttt-aattttcaattatttgtatgataagtgcttaataggatgaattgattaattgttcata 7000616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Original strand, 20653881 - 20653943
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggtta 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20653881 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggtta 20653943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Original strand, 21259345 - 21259426
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactta 98  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21259345 agagctaggagctaaattgaagcttaagctaggga-attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcactta 21259426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 445
Target Start/End: Original strand, 27233193 - 27233344
Alignment:
Q  294 tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    |||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||||||||||||     
T  27233193 tgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtg 27233292  T
Q  394 tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    | ||| | |||||||||| |  ||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  27233293 ttcataaatcatgatttgataatgagaaataagttgttgttgttggttttgt 27233344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Original strand, 45558935 - 45559161
Alignment:
Q  166 tgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaatt 265  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||   || ||||| |||   ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| |    
T  45558935 tgaaattcatgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 45559034  T
Q  266 ggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcat 364  Q
    | |||||  ||||  | ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  ||    
T  45559035 gatatattgtgaat-tgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggat 45559133  T
Q  365 gttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
     |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  45559134 attgttgttgatgattcatagcttgggt 45559161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Original strand, 23151959 - 23152089
Alignment:
Q  294 tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||   | || |||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||     
T  23151959 tgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccgtgttcaattgatgctgttgttgctatgtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtg 23152058  T
Q  394 tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 424  Q
    | ||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  23152059 ttcataattcatgaattgatgatgataaatg 23152089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Original strand, 31194176 - 31194346
Alignment:
Q  21 taggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca--cttattgc-aattttcaattatct 117  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| | |    
T  31194176 taggagcaaaagtgaagcttaagctagtga-attaatctaactaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttttagtgcaaattttcaattgt-t 31194273  T
Q  118 gtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatg 190  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||| ||||    
T  31194274 gtatgaataattgcttaattgagt-aattgattaattgttcatgattgttagaattcgtgctctaattacgatg 31194346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 410
Target Start/End: Original strand, 24385916 - 24385993
Alignment:
Q  333 atgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || || || | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24385916 atgatcaatagatgttgttgttgttaagtgattttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 24385993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15969903 - 15969796
Alignment:
Q  330 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 429  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| || || |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |  ||||||||  |||    
T  15969903 ttcatgttcaattggtgtagttgttgttaagtgatgttgctattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatga-ttgtagaggagaaatgagttg 15969805  T
Q  430 ttgttggtg 438  Q
    |||||||||    
T  15969804 ttgttggtg 15969796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17285319 - 17285223
Alignment:
Q  363 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||||||  ||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  17285319 atgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcaaaattggtgaatt 17285223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33172426 - 33172289
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| || |||||  ||||  | ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |    
T  33172426 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 33172328  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  33172327 gaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 33172289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 355
Target Start/End: Original strand, 22497329 - 22497396
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 355  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  22497329 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 22497396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25296426 - 25296319
Alignment:
Q  147 attaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacat 246  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||  ||||| |||   |||||||||||| |||||||  |||| |||    
T  25296426 attaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcat 25296327  T
Q  247 tttcaaag 254  Q
     |||||||    
T  25296326 gttcaaag 25296319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25758446 - 25758339
Alignment:
Q  147 attaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacat 246  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||  ||||| |||   |||||||||||| |||||||  |||| |||    
T  25758446 attaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcat 25758347  T
Q  247 tttcaaag 254  Q
     |||||||    
T  25758346 gttcaaag 25758339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 236
Target Start/End: Original strand, 27233067 - 27233158
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggt 236  Q
    |||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||||||||||| |||||    
T  27233067 tgattattagttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgtttttggt 27233158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Original strand, 15319414 - 15319455
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15319414 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 15319455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Original strand, 15499783 - 15499824
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15499783 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 15499824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Original strand, 22006513 - 22006554
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22006513 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22006554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 457
Target Start/End: Original strand, 22089049 - 22089090
Alignment:
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22089049 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22089090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23218004 - 23217972
Alignment:
Q  448 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23218004 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaaat 23217972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 11557 - 12020
Alignment:
Q  17 gagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatc 116  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11557 gagctaggaacaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaagctaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatt 11656  T
Q  117 tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11657 tgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatttgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatga 11756  T
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  11757 ataattgaattgttgttggatgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtattagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatg 11856  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  11857 aattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatggttcatga-ttggtgtt 11955  T
Q  417 gagaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||||||   |||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11956 gagaaatgagatgtttttggtgttttggtgaaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 12020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 62 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 371 - 1
Alignment:
Q  62 ctaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 161  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  371 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataa 272  T
Q  162 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  271 atgatgaaattcgtgctctaat---gatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaagtatgaga 175  T
Q  262 aattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174 aattggtatatgttgaaaatatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgt 75  T
Q  362 catgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  74 catcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggattgttgttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 341 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3454
Alignment:
Q  341 ttgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggt 440  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3593 ttgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggaatgttgttggtggt 3494  T
Q  441 tttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3493 ttagtggaattggtgagttatgacatgttgttgttgaaat 3454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 11417 - 11837
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11417 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtatgggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattat 11516  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11517 ttgtatgaaaagtgtttaattgt-tgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 11615  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  11616 gataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgtt 11715  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  11716 gaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgacttgggtttgcataattcatgatttg-tgt 11814  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
     ||||||||   |||||||||||    
T  11815 ggagaaatgagatgttgttggtg 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 451
Target Start/End: Original strand, 669 - 1105
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  669 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagagtaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaatt 767  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  768 atttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattgattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 867  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||    
T  868 tgaataattggattgttgttagatgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattg 967  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  968 atgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtt 1067  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaatt 451  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  1068 gttgagaaatgagatgttgttggtgatttggtgaaatt 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Original strand, 6694 - 7118
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6694 gaagatctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaacctaactaaggtg---gggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 6790  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  6791 atttgtatgatcagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattacgaggacatgtttagatgtatgaagtta 6890  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  6891 tgaatagttgaattgttgttggttgaattacatgttcagagtgtatg-aaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgt 6988  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  6989 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggt 7088  T
Q  409 ttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  7089 ttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Original strand, 24574 - 25002
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24574 gaagagctaggagcaaaattgaagcataagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgaaattttcaatt 24673  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24674 atttgtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgtccataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 24773  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24774 ttgataattaaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaacatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 24873  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  24874 atgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcttggcttgggtattcatgattcataatttgtt 24973  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  24974 gttgtgaaataagttgttgttgttggttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 95109 - 94948
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  95109 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatgctaatt 95010  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  95009 catggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 94948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Original strand, 254662 - 255105
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  254662 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caatt 254759  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  254760 atttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatatatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagtta 254859  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  254860 tgaataattgaattgttgtag-ttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgt 254957  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  254958 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttg 255057  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  255058 ttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaatt 255105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 459
Target Start/End: Original strand, 261268 - 261711
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  261268 gaagagctaggagcaaaattgaagactaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caatt 261365  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  261366 atttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatatatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagtta 261465  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  261466 tgaataattgaattgtagtag-ttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgt 261563  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  261564 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttg 261663  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  261664 ttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaatt 261711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 14 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7970 - 7581
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7970 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttcaatt 7872  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgac-atgtttagatatatgaagtt 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  7871 atttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcatgatctaattatgatgcctatgtttagatgtatgaagtt 7772  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  7771 ataaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatatgatgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 7672  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 403  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7671 gataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 7581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 424 - 846
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  424 agagctaggatcaaaattgaagcctaatctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata-tcatttattgctatttttcaatta 522  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||    
T  523 t-tgtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaatta 621  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  622 tggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttg 721  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  722 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttgtt 821  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||||   |||||||||||    
T  822 gttgagaaatgagatgttgttggtg 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10334 - 9914
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaatta 114  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||     
T  10334 agagctaggag--aaattgaagcctaagctaaggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcataataatca-ttattgcaaattttcaattc 10238  T
Q  115 tctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttat 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10237 tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttat 10138  T
Q  215 gaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag--tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10137 ggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagagtatgaaaag--ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 10040  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 9940  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||    
T  9939 tgtggagaaatgagatgttgttggtg 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 63 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1732 - 1358
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  1732 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttggatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcctatg 1634  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  1633 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattatatgttcaaagtatgagaa 1534  T
Q  263 attggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  1533 attggtatatgttgaaaatatgctcaattgttgaattatgttatgtgattgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtc 1434  T
Q  363 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1433 atgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 1358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 121 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5235 - 4883
Alignment:
Q  121 tgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5235 tgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataa 5136  T
Q  221 ttgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaatt 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  5135 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcacagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaatt 5036  T
Q  321 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaga 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| || |||||    
T  5035 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggttgttcataattcatgatttgctgatgaga 4936  T
Q  421 aatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4935 aatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttg 4883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 4961 - 4536
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  4961 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttgt---aattttcaatt 4866  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4865 atttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 4766  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  4765 tgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 4666  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | | |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||||     
T  4665 gtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttga 4566  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    || || |||||   ||||||||| ||||||    
T  4565 tgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 4536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9575 - 9150
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  9575 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttgt---aattttcaatt 9480  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9479 atttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 9380  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  9379 tgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 9280  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | | |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||||     
T  9279 gtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttga 9180  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    || || |||||   ||||||||| ||||||    
T  9179 tgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 9150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 5097 - 5537
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  5097 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttctaattttcaattat 5194  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5195 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctcttattatgatgagatgtttagatgtatgaagttatg 5294  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  5295 aataattgaattgt-gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-taggtatgtgc-gaaaatatgctcaattggtgaattaggcattgttgttg 5391  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 413  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5392 atgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcatgattcatggtttgtt 5491  T
Q  414 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  5492 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatt 5537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 442
Target Start/End: Original strand, 8729 - 9156
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat--tgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |  |||||||| |||||    
T  8729 agagctaggagaaaaaatgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagagttcatcataatcatttttggtgcaattt-caatt 8827  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  8828 at-tgtatgaataagtgcttaattgggaaaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagtt 8926  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggt 311  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8927 atggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgttg-atatatgctcaattggttgaattatgctatgttgt 9025  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9026 tgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttaggtatgcatgattcatgatttg 9125  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  9126 ttgttgagaaatgagatgttgtcggtggttt 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 2310 - 1871
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctg 118  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  2310 ctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaagtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaattat-tg 2213  T
Q  119 tatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||    
T  2212 tatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgctcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggat 2113  T
Q  219 aattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttgatga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  2112 aattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaatggtatatgatgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgt-gttgttga 2014  T
Q  318 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 417  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2013 tttgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattcttggcttgagtatgcatgattcatgatttgttgttg 1914  T
Q  418 agaaatggattgttgttggtggttttgtg-gaattggtgaatt 459  Q
    |||||||   ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  1913 agaaatgagatgttgttagtggtttggtgaaaattggtgaatt 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7570 - 7144
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  7570 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttgt---aattttcaatt 7475  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7474 atttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 7375  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  7374 tgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgtt 7275  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaatt-gatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    | | |||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  7274 gtttaattgtgataatattcattttcaattggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttg 7175  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
     || || |||||   ||||||||| ||||||    
T  7174 atgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 7144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 48544 - 48124
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  48544 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaag-gggttagaatttatcataatcactt-ttgtaattttcaatt 48448  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48447 atttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagtta 48348  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  48347 tgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttg 48249  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgt 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  48248 atgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgt 48150  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    | | ||||||||   |||||||||||    
T  48149 tatggagaaatgagatgttgttggtg 48124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 61992 - 61572
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  61992 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaag-gggttagaatttatcataatcactt-ttgtaattttcaatt 61896  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  61895 atttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagtta 61796  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  61795 tgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttg 61697  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgt 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  61696 atgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgt 61598  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    | | ||||||||   |||||||||||    
T  61597 tatggagaaatgagatgttgttggtg 61572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15272 - 14854
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15272 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagagagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaatt 15175  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15174 atatgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 15075  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  15074 tgaataattgaattg-tgttagttagattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgt 14978  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||    
T  14977 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgtt--ta-gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttg 14881  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||||||   |||||||||||    
T  14880 ttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14287 - 14194
Alignment:
Q  345 tgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  14287 tgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34059 - 33666
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  34059 agctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaaggggattagaattcatcataatcatttattgcaattttcaatta-ct 33961  T
Q  118 gtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatga 216  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||      
T  33960 gtatgattaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcgtaaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatag 33861  T
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatg 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33860 ataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatg 33761  T
Q  317 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  33760 aattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctagggtgttcataattcatgatttg 33666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 46566 - 46169
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  46566 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctaaagagattaacctaattaaggtaagagggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaatt 46467  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46466 at-tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtactctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagtta 46368  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttg-aattacattttcaaagtatg-aaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    || ||||||||||||||||| |||| || | |||  ||||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46367 tggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgt 46269  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  46268 tgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttg 46169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 41059 - 40662
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41059 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctaaagagattaacctaactaaggtaagggggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaatt 40960  T
Q  114 atctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40959 at-tgtatgaatagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtta 40861  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttg-aattacattttcaaagtatg-aaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    || ||||||||||||||||| |||| || | |||  ||||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  40860 tggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgggttatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatattgt 40762  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  40761 tgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttg 40662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 79998 - 79856
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatg-tggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||    
T  79998 tatgctcaattggtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataat 79900  T
Q  380 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  79899 tcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 79856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 63 - 445
Target Start/End: Original strand, 10 - 390
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  10 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaaatgttaataaa 108  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaa 262  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  109 tgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagtatgagaa 208  T
Q  263 attggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtc 362  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  209 gttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 308  T
Q  363 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  309 atgttgttgatgataattcatagcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagcttttgttggtggttttgt 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 63 - 372
Target Start/End: Original strand, 6304 - 6612
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6304 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaactgttcataaa 6402  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaa 262  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  6403 tgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagtatgagaa 6502  T
Q  263 attggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtc 362  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6503 gttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttattgatatgtc 6602  T
Q  363 atgttgttga 372  Q
     |||||||||    
T  6603 ttgttgttga 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 164609 - 164171
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |    
T  164609 agctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattaatt 164512  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  164511 gtatggtaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataagtgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 164412  T
Q  218 taattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt--atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  164411 taattgaattgt-gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgt-gaagatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgat 164315  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  164314 gaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgt 164215  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||||||||   || |||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  164214 tgagaaatgagatggtgttggtgttttggtgaaaatggtgaatt 164171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 162299 - 162476
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctat-gtcatgttgttgatgataat 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | | ||||| ||||||||||| ||    
T  162299 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgat 162398  T
Q  380 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  162399 atatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 162476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 166385 - 166554
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    ||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||       |||||||||| ||     
T  166385 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttaatat-------tgttgatgatgata 166477  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  166478 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaaaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 166554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 342 - 459
Target Start/End: Original strand, 116687 - 116804
Alignment:
Q  342 tgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtt 441  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  116687 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggtt 116786  T
Q  442 ttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  116787 ttgtaaaattggtgaatt 116804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31444 - 31021
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagaggg--ttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  31444 agagctaggatcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggggttagaattcatcataatcattcattgcaatttttcaat 31345  T
Q  113 tatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31344 tat-tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattatttgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtt 31246  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa-ttatgctatgtggt 311  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| | ||| ||    
T  31245 atggataattgaattgtggttagttgaatt-catgttcaaagtataagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaatttgttaagttatg-tttgtagt 31148  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31147 tgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattcatgacttg 31048  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||||||   |||||||||||    
T  31047 ttgttgagaaatgagatgttgttggtg 31021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 71011 - 70654
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  71011 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgtaattttcagttat 70912  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  70911 -tgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaatagtttataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttggatgtatgaagttatg 70813  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttga 314  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||     
T  70812 gataattgaattgttgttagttgaatt-catgttcaaagtatgagaaaatggaatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgt 70714  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  70713 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctgatatatgatgttgttgatg 70654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 445
Target Start/End: Original strand, 97093 - 97475
Alignment:
Q  64 aaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaaa-agtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 160  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||   |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  97093 aaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgatttagtgtttaattgagtgagt-gattaattgttcata 97190  T
Q  161 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaa 260  Q
      || | | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||  || || ||    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||      
T  97191 gttgttaagattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagtatgtg 97290  T
Q  261 aaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctat 359  Q
    ||| || |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||     
T  97291 aaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattatgctatgttggtgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatattgttgttactaa 97389  T
Q  360 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
     | || || ||| |||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| || | |||| ||  ||||||||  |||||||||    
T  97390 ttgatattattgttgatgattcatgccttgggttttcataaatcatgatttgatgataagaattgagttgttgttattggttttgt 97475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 62 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25564 - 25218
Alignment:
Q  62 ctaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 161  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25564 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataa 25465  T
Q  162 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaa 261  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||  |||| |   |    
T  25464 atgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtagga 25365  T
Q  262 aattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgt 361  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||     
T  25364 aaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatgg 25265  T
Q  362 catgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25264 catgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgatt 25218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 163 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 25210 - 24930
Alignment:
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaa 262  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||  |||| |   ||    
T  25210 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25111  T
Q  263 attggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtc 362  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  25110 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggc 25011  T
Q  363 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25010 atgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 24930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 63 - 442
Target Start/End: Original strand, 15367 - 15748
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15367 taaggtaagggggttagcattcatcataatcactt-ttgtaattttaaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 15465  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtat-gaaa 261  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||  |||    
T  15466 tggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggacaattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtataaaaa 15565  T
Q  262 aattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctat-- 359  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |      
T  15566 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgttt 15664  T
Q  360 -gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
     |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15665 agtcatgttatagatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 15748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 6814 - 6514
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||| | ||    |||||||||||||| |||||  |||| |    
T  6814 tgattatttgttcatagttgatgaaatttgtgttctaattatggtgatatgtttaaatacatggaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgc 6715  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    || |||| ||||||  ||| || |||||  |||   ||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | |||||    
T  6714 atgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgagt-tatactcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattg 6616  T
Q  344 atgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttt 443  Q
    ||| ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| | |||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  6615 atgatgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttaggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttt 6516  T
Q  444 gt 445  Q
    ||    
T  6515 gt 6514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3718 - 3310
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3718 agagctaggagctaaattgaagcttaagatagggggattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttacaatta 3619  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||||    
T  3618 t-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagtta 3521  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtg-aattatgctatgtggtt 312  Q
    |  ||||||||||||||||| |   ||||  || |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  3520 tttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgt-gaaaatatgctcaattggtccaattatgctatgttgta 3422  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3421 gttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgt 3322  T
Q  413 tgttgagaaatg 424  Q
    ||||||||||||    
T  3321 tgttgagaaatg 3310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 96 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6261 - 5913
Alignment:
Q  96 ttattgcaatttt-caattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacat 194  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6261 ttattgcaatttttcaattat-tgtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgacgacat 6163  T
Q  195 gtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatga-aaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg 293  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6162 gtttgaatgtatgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattgg 6063  T
Q  294 -tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| ||    
T  6062 ttaaattatgctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagt 5963  T
Q  393 ttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
     | ||| || ||||||||| || || |||||   ||||||||| ||||||    
T  5962 gttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 5913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 572 - 747
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |  |   |||| ||||||||||| ||     
T  572 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatgatgata 671  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  672 catggcttgggtttgcatgattaataatttgttgttgagaaatggattattgttggtggttttgt-gaattggtgaa 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12664 - 12590
Alignment:
Q  20 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca 94  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12664 ctaggagaaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4681 - 4351
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  4681 agagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacgt-ttgtaattttcaattat 4584  T
Q  116 ctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||    
T  4583 ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattataatgacatgtttagatgtatcaaattatg 4484  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  4483 aataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatg-aaaatgggtatgtg-tgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttg 4387  T
Q  314 atgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4386 atgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 364 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 4358 - 4262
Alignment:
Q  364 tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatta 460  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  4358 tgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatta 4262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 442
Target Start/End: Original strand, 33576 - 34001
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat--tgcaattttcaatt 113  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  || || ||||||||    
T  33576 agagctatgagctaaattgaagcttgagctaggga-attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaatt 33674  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
     | |||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||   |||||||    
T  33675 gt-tgtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcataattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagtt 33772  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggt 311  Q
     || ||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  33773 gtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatgaagaagtgttatatgttgaaa-tatgctaaattggttgaattatgctatgttgt 33871  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33872 tgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggtatgcatgatt-atgatttg 33970  T
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  33971 ttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 34001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 168 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 146848 - 146574
Alignment:
Q  168 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattgg 267  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  146848 aaattcatgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 146749  T
Q  268 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgtt 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||    
T  146748 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 146649  T
Q  368 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
     |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  146648 atgcatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgtttttgtgaaataagttgttgttgttggttt 146574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 53699 - 53317
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcat 159  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  53699 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcat 53602  T
Q  160 aaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatga 259  Q
    |  || |  ||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||  ||||  ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||     
T  53601 agttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgt 53502  T
Q  260 aaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgcta 358  Q
     ||  || |||||||||||  ||||||| || || | ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  53501 gaaggtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttcaattatgctattttgttgatgaattgtgatgagattcatgttcaatggatgttgttgttgcta 53403  T
Q  359 tgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
     || |  |||||| | || ||||||||||||||  | ||| | |||||||||| || |||||| ||   |||||||| |||||||||    
T  53402 agtgacattgttgttaatgattcatggcttgggagt-cattaatcatgatttgatgatgagaattgacgtgttgttgttggttttgt 53317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 85802 - 85503
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  85802 tgattaattgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 85704  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    || |||| ||||||  ||| || |||||  || || ||||||| ||||  |||||| || ||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | || ||    
T  85703 atgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg-aattatgctcaaattaatgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaagtg 85605  T
Q  344 atgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttt 443  Q
    || |||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | ||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  85604 atattgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatggtttgttgatgaaaaataggttgttgttgttggtttt 85505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8982 - 8917
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | || ||| ||||||||||||    
T  8982 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgtt 8917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 459
Target Start/End: Original strand, 76740 - 77138
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattca-tcataatcactt-attgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 158  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || | || |||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  76740 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtacttaattgagt-aattgagtaattgttca 76837  T
Q  159 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatg 258  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| || |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  76838 tagatgatgaaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 76937  T
Q  259 aaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgct 357  Q
    | ||| || |||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  76938 agaaagtgatatatgttgaat-tatgttcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 77036  T
Q  358 atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    | || || |||||  |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  77037 aagtgatattgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 77136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20274
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20524 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 20426  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa--gtatgaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||  ||||| |    
T  20425 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg-a 20327  T
Q  261 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttg 313  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  20326 aaatagatatatgttgaaaatatgctcaattggttaattatgctttgttgttg 20274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 268 - 438
Target Start/End: Original strand, 618 - 788
Alignment:
Q  268 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgtt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  618 tatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgtt 717  T
Q  368 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  718 gttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19339 - 19202
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| | || | ||| || |||||||||||| ||| || ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  19339 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatca 19240  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa 421  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  19239 ttgcttgggtatgcat-attcatgaattgatgatgagaa 19202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21423 - 21286
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| | || | ||| || |||||||||||| ||| || ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  21423 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatca 21324  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa 421  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  21323 ttgcttgggtatgcat-attcatgaattgatgatgagaa 21286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 310 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30026
Alignment:
Q  310 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 409  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30196 gttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 30097  T
Q  410 tgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30096 tgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 30026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Original strand, 2917 - 3115
Alignment:
Q  18 agctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatct 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  2917 agctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagactaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaattttcaattattt 3014  T
Q  118 gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaa 217  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3015 gtatgataaatgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 3114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 442
Target Start/End: Original strand, 2165 - 2590
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaattttcaatta 114  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | ||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| ||||     
T  2165 agagctaggagctaaagtgaagcttgagcaagaga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgcaatttttaattg 2263  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  ||||||||     
T  2264 t-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattaatcataattattagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttg 2361  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggtt 312  Q
    |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  2362 ttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgacatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgtt 2460  T
Q  313 gatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 412  Q
    | |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||     
T  2461 gttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggcgttcataattcatgttttga 2560  T
Q  413 tgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    || ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  2561 tgatgagaaataagttgttgttgttggttt 2590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 19850 - 20041
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  19850 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 19948  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  19949 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 20041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 24154 - 24345
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  24154 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 24252  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  24253 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 24345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 339 - 480
Target Start/End: Original strand, 24368 - 24509
Alignment:
Q  339 aattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368 aattgttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 24467  T
Q  439 gttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24468 gtttaaagaaattggtgaattaagacatgttgttgttgaaat 24509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 310 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 3404 - 3270
Alignment:
Q  310 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3404 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-t 3306  T
Q  410 tgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3305 tgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6380
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  || || ||||||||||| ||     
T  6204 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatgatgata 6303  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6304 catgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 6380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31577
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||     
T  31401 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgata 31500  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31501 catggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 31577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 281 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 41443 - 41267
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||     
T  41443 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgata 41344  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaa 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41343 catggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 41267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8204 - 7927
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caatta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8204 agagctaggagctaaattgaagcttaagctagggggattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcgtaatcatttattgcaattttacaatta 8105  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtta 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||||    
T  8104 t-tgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcatatttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagtta 8007  T
Q  214 tgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 294  Q
    |  ||||||||||||||||| |   |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8006 tttataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatg-tgaaaatatgctcaattggt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7913 - 7807
Alignment:
Q  336 atcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  7913 atcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttg 7814  T
Q  436 gtggttt 442  Q
    || ||||    
T  7813 gtagttt 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 32344 - 32159
Alignment:
Q  274 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgat 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  32344 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgat 32245  T
Q  374 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  32244 gataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatt 32159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 41959 - 42144
Alignment:
Q  274 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgat 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  41959 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgat 42058  T
Q  374 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  42059 gataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatt 42144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 169 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 35724 - 35435
Alignment:
Q  169 aattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggt 268  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |    
T  35724 aattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 35625  T
Q  269 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgtt 367  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  35624 atatgttgaat-tatactcaaattgttgatttatgctatgttgttgttgaaatgtggtaagagtcatgttcaattgatgtttttgttgctaagtgatgtt 35526  T
Q  368 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaatt 459  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35525 gttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaattggtgaatt 35435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 28895 - 28506
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgc---aattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 153  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| || | |    ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||    
T  28895 ctaactaaggtaacggggttagaattcatcataatcatttttagtttaaattttcaattgt-tgtatgaataagttcttaattgagtaaat-gattaatt 28798  T
Q  154 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaa 253  Q
    || || |  || |   |||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| || |  |||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  28797 gtccaaagttgttatcattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaa 28698  T
Q  254 gtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 352  Q
    |||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  28697 gtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaagaattatgttcaattgatgttgttg 28599  T
Q  353 ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28598 ttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 28506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2497
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  2795 tgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 2696  T
Q  245 attttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 343  Q
    || ||||||||||   ||| || |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| |||||||    
T  2695 atgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattg 2597  T
Q  344 atgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttt 443  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  2596 atgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttgttggtttt 2497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 69815 - 69427
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  69815 ctaattaagataagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgaga-aagtgattaattg 69718  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||    |||||||||||||||| |||  |||| ||| || ||||    
T  69717 ttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgtttaaag 69618  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||  ||| || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  69617 tatgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgt 69519  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||| ||   |||||||| |||||||||    
T  69518 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattgaggtgttgttgttggttttgt 69427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 363 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 272078 - 271962
Alignment:
Q  363 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatg 462  Q
    ||||||| | |||| | |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  272078 atgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatgaattgttatagagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattagtgaattaag 271980  T
Q  463 acatgttgttgttgaaat 480  Q
    |||||| |||||||||||    
T  271979 acatgtagttgttgaaat 271962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 169 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6631
Alignment:
Q  169 aattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggt 268  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| || |    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 6808  T
Q  269 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgtt 367  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||  | ||| || |||||    
T  6807 atatgttgaattt-tgctcaaattgttgaattatgctatgctattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttactcctaagtgatgtt 6709  T
Q  368 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
     ||| |||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6708 tttgttgatgattcatggcttgggtggtcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 6631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 462
Target Start/End: Original strand, 6974 - 7319
Alignment:
Q  117 tgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatg 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||| |     
T  6974 tgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gatttgttgttcataattgtcaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtt 7072  T
Q  216 aataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttga 314  Q
     ||||||||||||||||| ||  ||||  || |||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||      
T  7073 gataattgaattgttgttagtgaaatttaatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgtttaattatgttatgttgttat 7171  T
Q  315 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 414  Q
    || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||    
T  7172 tggattgtgataagaatcatgttcaattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgaattgttg 7271  T
Q  415 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatg 462  Q
     |||||||||  ||||   || |||||||||  |||||||||||||||    
T  7272 atgagaaatgagttgtgaatgatggttttgtaaaattggtgaattatg 7319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 398
Target Start/End: Original strand, 8310 - 8422
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| | || | |||    
T  8310 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttga---attatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatca 8406  T
Q  383 tggcttgggtttgcat 398  Q
    |||||||||| |||||    
T  8407 tggcttgggtatgcat 8422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 449
Target Start/End: Original strand, 17525 - 17693
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  17525 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 17624  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaa 449  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  17625 catggcttgggtatgcatgattcataatatgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtggaa 17693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 197142 - 197520
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||   |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  197142 ctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattggat-aagtgattaattgt 197240  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagt 255  Q
    || || ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||| || |  ||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||    
T  197241 tcttagatgttgaatttcgggctctaattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagt 197340  T
Q  256 atgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||  ||| || |||| ||||||  ||||||| || || |||||| | |||||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  197341 atgtgaaagtgttataagttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtcctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgtt 197439  T
Q  355 gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    |||| || || |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | ||||| |||| || |||||| ||  |||||||||    
T  197440 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtcttcataaatcatgctttgatgatgagaattgagttgttgttg 197520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8364 - 8001
Alignment:
Q  62 ctaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 158  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | || |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  8364 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttaatgtaatttttcaattat-tgtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttca 8267  T
Q  159 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtat 257  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||    
T  8266 tagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatga-taattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtat 8168  T
Q  258 gaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgc 356  Q
    | | || || ||  |  |||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  8167 gtataagtgctaacttatgatt-tatgctcaattgggtgaattatgctatgttgttgtggaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgc 8069  T
Q  357 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 424  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  8068 tatgtgatgttgttgttgatgattcatagcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatg 8001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 438
Target Start/End: Original strand, 93730 - 94042
Alignment:
Q  125 aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgat-gaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattg 223  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||  |||||||| |  |||||||    
T  93730 aagtgcttaattgggtaaatt-attaattgttcataactgttagaaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataattg 93828  T
Q  224 aattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtggttgatgaattgt 322  Q
    ||| |||||| |   |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  93829 aatggttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatttgttgaaa-tatgctcaaattattgaagtatgctatgtg-ttgttaaattgt 93926  T
Q  323 gataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaa 422  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  93927 gatgaaattcatgttcaattgatgttgttattaataagtgatgttgttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttgttggtgagaaa 94026  T
Q  423 tggattgttgttggtg 438  Q
    ||   |||||||||||    
T  94027 tgagatgttgttggtg 94042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 55715 - 55553
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  55715 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 55616  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||   ||||||||| ||||||    
T  55615 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 55553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 104513 - 104889
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 155  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| | |||||||| || |||||||||| || || |||||||||||    
T  104513 ctaattaaggtaagtgggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaattgt-tgtatgaataattgcttaattgagt-aagtgattaattgt 104610  T
Q  156 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||| ||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||  || || || ||| ||||||||||||||||||||  | || ||  |||||||    
T  104611 tcatagatgttaaaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaag 104709  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    |||| | || || ||  |  || || ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||| |    |||| | |||||||||||||||    
T  104710 tatgtataaatgctaacttatg-aattatgctcaaatggttgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgataaccatg-ttaattgatgttgttgt 104807  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || ||| |||||  |||||||||    
T  104808 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgttg 104889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Original strand, 13537 - 13605
Alignment:
Q  412 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13537 ttgttgagaaatggattgttgttagtggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttcttgttgaaat 13605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 12641 - 12802
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatg-tggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||    
T  12641 tatgctcaattggtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataat 12739  T
Q  380 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12740 tcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 310 - 442
Target Start/End: Original strand, 19051 - 19183
Alignment:
Q  310 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 409  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19051 gttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatt 19150  T
Q  410 tgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  19151 tgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 19183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 392 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1334
Alignment:
Q  392 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtggaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1422 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 1334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 442
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10248
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 10193  T
Q  388 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  10194 tgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgatggttt 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 125 - 1
Alignment:
Q  63 taaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatctgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  125 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 27  T
Q  163 tgatgaaattcgtgctctaattatga 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26 tgatgaaattcgtgctctatttatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 281 - 440
Target Start/End: Original strand, 6664 - 6823
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  6664 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 6763  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggt 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||    
T  6764 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggt 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 1099 - 1261
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |  ||| |||||    
T  1099 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaatt 1198  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  1199 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgagaaataagttgttgttgttggttt 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11457 - 11067
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgatt 149  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || ||||    
T  11457 attaatctaactaaggtaag-gggttataattcatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattgagtagat-gatt 11361  T
Q  150 aattgttcataaatgatgaaa-ttcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattt 248  Q
    |||||||||||| || | ||| ||| || || ||||||||||| ||||||  ||  |||||  ||   ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |    
T  11360 aattgttcataattgttaaaaattcatgttccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgt 11261  T
Q  249 tcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 347  Q
    ||||||| ||  ||| || |||||||||||  ||||||||| | || ||| |||||||| | |||| |||||| |||| ||   |||| |||||||||||    
T  11260 tcaaagtgtgtgaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaatagttgaaatatgctatcttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgt 11162  T
Q  348 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||| | |||   |||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  11161 tgttgttgctatgtgatgttgttgtttatgattcatggcttaggtgttcatagatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 11067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 13507 - 13669
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  13507 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 13606  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  13607 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 13669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Original strand, 21481 - 21624
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |  ||| |||||    
T  21481 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaatt 21580  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  21581 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaat 21624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15083 - 14921
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  15083 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 14984  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  14983 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 9628 - 9789
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    ||||||||||| |||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || | ||| | |||| |||||    
T  9628 tatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaatt 9727  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  9728 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 89713 - 89894
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatc-acttattgcaattttcaatta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||| || ||||||||||||    
T  89713 agagctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatctttttagtgtaattttcaatta 89812  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 198  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  89813 t-tgtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttcatagatg-ttaaattcgtgctccaactatgatgatatgttt 89894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 31378 - 30990
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  31378 ctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattat-tgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattg 31281  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || |  ||||||||||||||||||||||| || |||  ||  ||||| ||    ||||||| ||||||||||||  |||| ||| |||| ||    
T  31280 ttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 31181  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    ||||  ||| || |||||||||||  ||||||  || || |||||| ||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  31180 tatgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctttaaatgttgaattgtgctatgttcttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgt 31082  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| || ||  ||||| |||| |||||||||||| || | ||| | ||| |||||| || |||||| ||  ||||||||| || ||||||    
T  31081 tgctaagtgatactgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcaagatttgatgatgagaattgagttgttgttgttgcttttgt 30990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 279
Alignment:
Q  288 aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 387  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||| ||    
T  436 aattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgcct 337  T
Q  388 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    |||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  336 tgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 431
Target Start/End: Original strand, 70154 - 70569
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcacttat-tgcaattttcaatta 114  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  70154 agagctaggagcaaaaatgaagcttaagctagggggattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttgtgaaattttcaatta 70253  T
Q  115 tctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgat-gaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||| || |||||||| ||||||  ||  ||||| ||    
T  70254 t-tgtatgaataagtgattaaatgtat-aattgattaattgttcatagatgttaaaaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaatt 70351  T
Q  213 -atgaataattgaattgttgttggttgaa-ttacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgctatgtg 309  Q
     ||| |||||| |||| ||||||  |||| || ||| |||||||| || |  | || ||  |  || || ||||||||||| ||||||||||| ||| |     
T  70352 gatg-ataattcaattattgttg--tgaatttgcatgttcaaagtgtgtatgagtgctaacttgtg-aattatgctcaattgggtgaattatgttatatt 70447  T
Q  310 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 409  Q
    |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||||| |    
T  70448 gttgttgaattatgatgaggaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcttggcttgggtattcataattcatgaat 70547  T
Q  410 tgttgttgagaaatggattgtt 431  Q
    || || |||||||||| |||||    
T  70548 tggtgatgagaaatgggttgtt 70569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11060 - 10642
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtcta-agctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca-cttattgcaattttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |  |||||||||||    
T  11060 agagctaggagcaaaagtgaag-ctagagctagag-gattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtataattttcaatt 10963  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| | || | |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||||  ||  ||||| ||    
T  10962 at-tgtatgaataagtgattaattggat-aaataattaattgttcatagatgttataattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaatt 10865  T
Q  213 -atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtgg 310  Q
     ||| |||||||| ||||||| ||   | || ||| ||||||||||| | || || ||  |  || || |||||| |||||| || |||||| || || |    
T  10864 gatg-ataattgagttgttgtcggagaatttgcatgttcaaagtatgtataagtgttaacttgtg-aattatgcttaattggttggattatgatacgttg 10767  T
Q  311 ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    |||  ||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  10766 ttgtcgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttgatcattcatggcttgggtgttcataattcatgaatt 10667  T
Q  411 gttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    | || ||| ||||| ||||||||||    
T  10666 gatgatgaaaaatgaattgttgttg 10642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Original strand, 193609 - 193770
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  193609 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 193707  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  193708 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgcgaaataagttgttgttgttggttt 193770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Original strand, 186647 - 186789
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  186647 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 186745  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  186746 catggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaat 186789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 27746 - 27467
Alignment:
Q  166 tgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaatt 265  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| |    
T  27746 tgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatgtgaaaat 27647  T
Q  266 ggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcat 364  Q
    | |||||  ||||  | ||| | || || |||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||| || |  ||    
T  27646 gatatattgtgaat-tgtgccctaaatgttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgatgttgttgttaagagat 27548  T
Q  365 gttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
     |||||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| ||| || || ||||||  |||||||||  ||||||||    
T  27547 attgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttgatgatgtgaaatgagttgttgttgtcggttttgt 27467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 440
Target Start/End: Original strand, 149 - 308
Alignment:
Q  281 tatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||| | |||| |||||    
T  149 tatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 248  T
Q  381 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggt 440  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||   ||||||||| ||||    
T  249 catggcttgagtatgcatgattcataatttattgttgtgaaataagttgttgttgttggt 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 445
Target Start/End: Original strand, 43687 - 44075
Alignment:
Q  58 ctaactaaggtaagagggttaaaattca-tcataatcacttattgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 154  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  43687 ctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattgt-tgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattg 43784  T
Q  155 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaag 254  Q
    ||||||  || | |||||  ||||||||||||||||  ||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  43785 ttcatagttgttaaaattaatgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 43884  T
Q  255 tatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
     ||   ||| || |||||||||||  |  | || || ||   |||| |||||||| |||| |||||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||||    
T  43885 gatatgaaagtgatatatgttgaat-tgggttctaaatgtcaaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 43983  T
Q  354 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  43984 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgt 44075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 389
Target Start/End: Original strand, 23646 - 23893
Alignment:
Q  142 aattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaat 241  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||||||||   |||    
T  23646 aattgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgttggagaaat 23745  T
Q  242 tacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa 340  Q
    | ||| |||| ||||||  ||| || |||||  || || | ||||| || || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  23746 tgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg-aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaa 23844  T
Q  341 ttgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 389  Q
    |||| |||||||||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||    
T  23845 ttgacgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttg 23893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8747 - 8665
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8747 gaagagctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaacct-actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt 8665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Original strand, 1394 - 1790
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaa-ttttcaatt 113  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | |||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| | || | || || |||||||||    
T  1394 agagctaggagctaaagtgaagcttgagctaggga-attaatctatctaaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaatt 1492  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    || |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||| ||    
T  1493 at-tgtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaatt 1590  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    |   ||||||||||||||||||||  | || | | || |||||||| | || || || || |   || |||| || ||| ||||||||||||||||| ||    
T  1591 agtgataattgaattgttgttggtgaatttgcttgttaaaagtatgtataaatgcta-atttatgaattatgttcaaatgggtgaattatgctatgttgt 1689  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg-ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    || |||||| |||| ||   |||| |||||||| ||||||||||  |  |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1690 tgttgaattatgatgagaaccatgctcaattgaagttgttgttgaattagatatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgattt 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Original strand, 8539 - 8935
Alignment:
Q  16 agagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaa-ttttcaatt 113  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | |||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| | || | || || |||||||||    
T  8539 agagctaggagctaaagtgaagcttgagctaggga-attaatctatctaaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaatt 8637  T
Q  114 atctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt 212  Q
    || |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||| ||    
T  8638 at-tgtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaatt 8735  T
Q  213 atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggt 311  Q
    |   ||||||||||||||||||||  | || | | || |||||||| | || || || || |   || |||| || ||| ||||||||||||||||| ||    
T  8736 agtgataattgaattgttgttggtgaatttgcttgttaaaagtatgtataaatgcta-atttatgaattatgttcaaatgggtgaattatgctatgttgt 8834  T
Q  312 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg-ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 410  Q
    || |||||| |||| ||   |||| |||||||| ||||||||||  |  |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  8835 tgttgaattatgatgagaaccatgctcaattgaagttgttgttgaattagatatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgattt 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 79892 - 79519
Alignment:
Q  62 ctaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaatttt-caattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 158  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| | || | || |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  79892 ctaaggtaag-gggttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcaattat-tgtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttca 79796  T
Q  159 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtat 257  Q
    || ||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||  ||||| || |||| ||||||| |||||| ||||  |||| ||| ||| ||||||    
T  79795 tagatgctaaaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatga-taattgagttgttggtggtgaaattgcatgttctaagtat 79697  T
Q  258 gaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgc 356  Q
    |   || || ||  |  ||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||  |   |||| ||||||||||||||||||||    
T  79696 gtgtaagtgttaacttgtgaat-tatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgc 79598  T
Q  357 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    || || || || ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||  |||||||||    
T  79597 taagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgttg 79519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 354
Target Start/End: Original strand, 89584 - 89655
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  89584 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 130634 - 130526
Alignment:
Q  337 tcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgga-ttgttgttg 435  Q
    ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  130634 tcaattgatgttgttgttgttgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgatt-gttgttgagaaaatgagttgttgttg 130536  T
Q  436 gtggttttgt 445  Q
    ||||||||||    
T  130535 gtggttttgt 130526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 1231 - 1378
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca-cttattgcaa-ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  1231 attaatctatctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattggat-aaatgat 1328  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 198  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1329 taattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgttt 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 9486 - 9633
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca-cttattgcaa-ttttcaattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  9486 attaatctatctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattat-tgtatgaataagtgcttaattggat-aaatgat 9583  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 198  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9584 taattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgttt 9633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2572 - 2424
Alignment:
Q  298 ttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgca 397  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||    
T  2572 ttatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattca 2473  T
Q  398 tgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    | |||| | ||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  2472 taattccttatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtg 2424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 5523 - 5670
Alignment:
Q  14 gaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatca-cttattgcaa-ttttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||  ||| || || |||||||    
T  5523 gaagagttaggagcaaaattgaagcctaagctagagggagtaacctaactaagataagggggttataattcatgataatcattttagtgtaatttttcaa 5622  T
Q  112 ttatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 160  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  5623 ttat-tatatgaataagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcata 5670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 353
Target Start/End: Original strand, 51312 - 51382
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||    
T  51312 tgctcaattggtgaattatgttatgtggttgatgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 51382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41778 - 41626
Alignment:
Q  286 tcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 385  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| | |||| |    
T  41778 tcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattg 41679  T
Q  386 cttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtg 438  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||  || |||||||||||||    
T  41678 cttgggtatgcat-attcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtg 41626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22197 - 21979
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| ||||||||  ||||  | ||||| || || ||||||  ||||||| |||| |    
T  22197 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgaat-tgtgctctaaatgttgaattgggctatgttgttgtt 22099  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||  |||||||| || || | |||||| ||| ||     
T  22098 gaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcacagcttgggtatgtataaatcatgaattgatga 21999  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttg 435  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  21998 tgagaaatgagttgttgttg 21979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30211 - 29944
Alignment:
Q  168 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattgg 267  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||||||||||||| |||  |||| ||| |||| ||||||  ||| ||     
T  30211 aaattcgtgctcttactatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 30112  T
Q  268 tatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgt 366  Q
    |||||  ||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |    
T  30111 tatattgtgaattt-tgctctaattgttgaattgtgctatgtttttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagcgatat 30013  T
Q  367 tgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||  | || | |||||| ||| || |||||||||  |||||||||    
T  30012 tgttgttgatgattcatagcttgggtacgtataaatcatgaattgatgatgagaaatgagttgttgttg 29944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13639 - 13516
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 382  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  13639 tgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 13540  T
Q  383 tggcttgggtttgcatgattcatga 407  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||    
T  13539 tgacttgggtatgcat-attcatga 13516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 7642 - 7372
Alignment:
Q  175 tgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||| ||||||  ||| || |||||      
T  7642 tgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattattgttggtgaaattgcattctcatagtatgtgaaaatgatatattg 7543  T
Q  275 tgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgat 373  Q
    ||||  | ||||  || || |||||| |||||||  |||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||| |||||||| |  || |||||| |    
T  7542 tgaat-tgtgctataaatgttgaattgtgctatgctgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatattgttgct 7444  T
Q  374 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
     || |||||||||||||||   ||| | |||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  7443 aatgattcatggcttgggtactcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgt 7372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 17067 - 16797
Alignment:
Q  175 tgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||| ||||||  ||| || |||||      
T  17067 tgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattattgttggtgaaattgcattctcatagtatgtgaaaatgatatattg 16968  T
Q  275 tgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgat 373  Q
    ||||  | ||||  || || |||||| |||||||  |||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||| |||||||| |  || |||||| |    
T  16967 tgaat-tgtgctataaatgttgaattgtgctatgctgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatattgttgct 16869  T
Q  374 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
     || |||||||||||||||   ||| | |||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  16868 aatgattcatggcttgggtactcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgt 16797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 446
Target Start/End: Original strand, 7724 - 7953
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| || |||||  ||||  | ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |    
T  7724 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 7822  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    || ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| ||  ||     
T  7823 gatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagtttgtga 7922  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtg 446  Q
    || |||||   ||||||||| ||||||||||    
T  7923 tgtgaaataagttgttgttgttggttttgtg 7953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 423
Target Start/End: Original strand, 1117 - 1201
Alignment:
Q  339 aattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 423  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||||||||    
T  1117 aattgatgttgttgttgctaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaat 1201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 258
Target Start/End: Original strand, 939 - 1052
Alignment:
Q  145 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattac 244  Q
    |||||| |||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  939 tgattatttgttcatagttgttaaaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 1038  T
Q  245 attttcaaagtatg 258  Q
    || |||| ||||||    
T  1039 atgttcatagtatg 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 442
Target Start/End: Original strand, 22715 - 22786
Alignment:
Q  371 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 442  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  22715 gatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 22786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 108207 - 107983
Alignment:
Q  217 ataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| ||||||||  || || ||||||| || || ||||||||||| |||  ||| |    
T  108207 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattatg-aattatgctctaaatgttgaattatgct-tgttattgtt 108110  T
Q  316 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 415  Q
    |||||||||| |   ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||     
T  108109 gaattgtgatgaagatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaatt-ttga 108011  T
Q  416 tgagaaatggattgttgttggtggtttt 443  Q
    ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  108010 tgagaaataagttgttgttgttggtttt 107983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 411
Target Start/End: Original strand, 22312 - 22661
Alignment:
Q  52 attaacctaactaaggtaagagggttaaaattcatcataatcactt-attgcaattttc-aattatctgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgat 148  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | ||  |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  22312 attaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgttattttttaattat-tgtatgaataagtgattaattggatga-ttgat 22409  T
Q  149 taattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagtt-atgaataattgaattgttgttggttgaattacatt 247  Q
    | |||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||||  ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||  | || |||     
T  22410 tgattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatga-taattgaattgttgttggtgaatttgcatg 22508  T
Q  248 ttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg 346  Q
    |||||||| || | || || ||  |  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| |||| ||   ||||               
T  22509 ttcaaagtgtgtataagtgttaacttgtgaat-tatgctcaattgggtgaattatgctaagttgttgttgaattatgatgagaaccatg----------- 22596  T
Q  347 ttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    || ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  22597 tttttgttgctaagtgatgttgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttg 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5251 - 5162
Alignment:
Q  346 gttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    |||||||||||||||| || |||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || ||| |||||  |||||||||    
T  5251 gttgttgttgctatgtgatattgttgttggtgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgttg 5162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 37754 - 37538
Alignment:
Q  219 aattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatga 317  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| ||||||||  ||||  | ||||| || || |||||| ||||||||  ||| |||    
T  37754 aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttga 37656  T
Q  318 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 417  Q
    |||| ||  ||  ||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| ||| || ||    
T  37655 attgagacgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatg 37556  T
Q  418 agaaatggattgttgttg 435  Q
    |||||||  |||||||||    
T  37555 agaaatgagttgttgttg 37538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6033 - 5961
Alignment:
Q  339 aattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 411  Q
    |||| ||||| ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  6033 aattaatgtttttgttgctaagtgatgttgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttg 5961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3500 - 3275
Alignment:
Q  166 tgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacattttcaaagtatgaaaaatt 265  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||| |    
T  3500 tgaaattcgtgcgcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 3401  T
Q  266 ggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcat 364  Q
    | |||||  ||||  |  |||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| |  | |||| | ||||||||||||||||| || |  ||    
T  3400 gatatattgtgaat-tgggctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgaaat-catgtttaattgatgttgttgttgttaagagat 3303  T
Q  365 gttgttgatgataattcatggcttgggt 392  Q
     |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  3302 attgttgttgatgattcatagcttgggt 3275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 445
Target Start/End: Original strand, 22548 - 22699
Alignment:
Q  294 tgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 393  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| |||  |  ||||| | ||||||||||||||||| ||  | || |||||| |||  |||||| | ||||||     
T  22548 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaattgatattgttgttgaagattcatagtttgggtg 22647  T
Q  394 tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 445  Q
    | ||||| | |||||||| || |||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  22648 ttcatgaattatgatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgt 22699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3096 - 3002
Alignment:
Q  283 tgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatg-atcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||  | |||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  3096 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgat 3002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 389
Target Start/End: Original strand, 17428 - 17542
Alignment:
Q  275 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatg 374  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||  |||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||| | || |  || |||||| ||    
T  17428 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtggttaagagatattgttgttg 17527  T
Q  375 ataattcatggcttg 389  Q
    || ||||||||||||    
T  17528 atgattcatggcttg 17542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 389
Target Start/End: Original strand, 61341 - 61455
Alignment:
Q  275 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatg 374  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||  |||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||| | || |  || |||||| ||    
T  61341 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtggttaagagatattgttgttg 61440  T
Q  375 ataattcatggcttg 389  Q
    || ||||||||||||    
T  61441 atgattcatggcttg 61455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1663 - 1574
Alignment:
Q  346 gttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 435  Q
    ||||||||||||| || || |||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || ||| |||||  |||||||||    
T  1663 gttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgttg 1574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 424
Target Start/End: Original strand, 3318 - 3379
Alignment:
Q  363 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 424  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  3318 atgttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattttttattgtgaaatg 3379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 201
Alignment:
Q  448 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  233 aattgttgaattatgacatgttgttgttgaaat 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 480
Target Start/End: Original strand, 1629 - 1661
Alignment:
Q  448 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaat 480  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1629 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaaat 1661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University