View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16638_low_8 (Length: 572)

Name: NF16638_low_8
Description: NF16638
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16638_low_8
NF16638_low_8
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (16-559)||(32796705-32797240)
chr3 (250-482)||(50347658-50347891)
chr3 (250-484)||(11180035-11180269)
chr3 (250-484)||(16811291-16811526)
chr3 (250-456)||(39640875-39641082)
chr3 (250-484)||(28561656-28561891)
chr3 (250-484)||(13150100-13150334)
chr3 (250-488)||(39653070-39653309)
chr3 (250-485)||(14813858-14814094)
chr3 (257-473)||(30529608-30529825)
chr3 (252-457)||(20885120-20885325)
chr3 (256-457)||(25230712-25230914)
chr3 (256-457)||(25238299-25238501)
chr3 (250-471)||(32227222-32227444)
chr3 (252-479)||(16810840-16811068)
chr3 (250-484)||(37044944-37045180)
chr3 (250-457)||(25230249-25230457)
chr3 (250-457)||(25237836-25238044)
chr3 (255-484)||(25803010-25803240)
chr3 (250-442)||(32227453-32227645)
chr3 (250-396)||(31284277-31284423)
chr3 (250-355)||(25238685-25238790)
chr3 (250-484)||(2911005-2911240)
chr3 (250-380)||(25239078-25239208)
chr3 (253-396)||(41472300-41472442)
chr3 (250-352)||(13150555-13150657)
chr3 (252-473)||(29224245-29224467)
chr3 (250-343)||(4067361-4067454)
chr3 (253-396)||(25248110-25248253)
chr3 (250-413)||(25802549-25802712)
chr3 (250-441)||(14820107-14820299)
chr3 (252-359)||(7493917-7494024)
chr3 (254-396)||(8067279-8067421)
chr3 (250-359)||(32386735-32386844)
chr3 (252-359)||(7477227-7477334)
chr3 (250-380)||(27187331-27187461)
chr3 (250-396)||(41473996-41474142)
chr3 (252-359)||(31103961-31104070)
chr3 (403-484)||(39653530-39653612)
chr3 (250-346)||(26309990-26310086)
chr3 (347-485)||(13155302-13155438)
chr3 (437-484)||(25238860-25238907)
chr3 (434-481)||(14814318-14814365)
chr3 (416-485)||(970875-970944)
chr3 (280-327)||(3890046-3890093)
chr3 (280-327)||(3899868-3899915)
chr3 (288-346)||(47518358-47518416)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (250-484)||(33174868-33175103)
chr2 (250-485)||(29804591-29804827)
chr2 (250-481)||(1706955-1707186)
chr2 (254-485)||(18098883-18099116)
chr2 (250-484)||(41754199-41754434)
chr2 (250-484)||(33174415-33174648)
chr2 (250-484)||(8256436-8256671)
chr2 (250-485)||(25337998-25338234)
chr2 (250-485)||(25434057-25434293)
chr2 (250-484)||(16379302-16379538)
chr2 (250-484)||(38898913-38899148)
chr2 (252-484)||(27882929-27883162)
chr2 (285-480)||(18447954-18448150)
chr2 (250-484)||(33770920-33771146)
chr2 (250-457)||(1912462-1912669)
chr2 (252-485)||(15619807-15620041)
chr2 (250-357)||(16378975-16379082)
chr2 (250-398)||(11388186-11388332)
chr2 (250-396)||(24818325-24818471)
chr2 (254-380)||(30966249-30966375)
chr2 (250-380)||(30966705-30966835)
chr2 (273-398)||(1953152-1953277)
chr2 (250-414)||(82999-83162)
chr2 (254-359)||(13191010-13191115)
chr2 (252-485)||(15639649-15639877)
chr2 (257-396)||(29259628-29259767)
chr2 (250-376)||(11394554-11394678)
chr2 (257-330)||(5399825-5399898)
chr2 (254-380)||(8073907-8074033)
chr2 (250-380)||(30963721-30963851)
chr2 (279-362)||(16542018-16542101)
chr2 (292-385)||(8181394-8181487)
chr2 (252-357)||(20502061-20502165)
chr2 (274-346)||(30963288-30963360)
chr2 (250-397)||(30961884-30962039)
chr2 (279-344)||(36924452-36924519)
chr2 (274-389)||(9909098-9909213)
chr2 (355-484)||(18098667-18098798)
chr2 (250-373)||(37552590-37552710)
chr2 (274-326)||(26864841-26864893)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (250-484)||(6330913-6331148)
chr6 (253-484)||(20896692-20896924)
chr6 (252-484)||(20126185-20126418)
chr6 (250-482)||(3652398-3652631)
chr6 (250-484)||(20850231-20850466)
chr6 (250-483)||(23986318-23986552)
chr6 (252-484)||(2681219-2681452)
chr6 (250-484)||(11062196-11062430)
chr6 (250-485)||(14771720-14771956)
chr6 (254-484)||(21311881-21312112)
chr6 (250-485)||(2720564-2720801)
chr6 (252-483)||(23776352-23776584)
chr6 (250-484)||(15929492-15929727)
chr6 (261-422)||(31821704-31821865)
chr6 (250-396)||(16519967-16520113)
chr6 (250-395)||(9352062-9352207)
chr6 (250-395)||(13191514-13191659)
chr6 (256-482)||(15929111-15929338)
chr6 (250-396)||(7911877-7912023)
chr6 (250-376)||(13492808-13492934)
chr6 (250-486)||(21311422-21311660)
chr6 (250-395)||(17027532-17027677)
chr6 (250-484)||(2890840-2891073)
chr6 (250-485)||(17850827-17851063)
chr6 (254-394)||(20735696-20735836)
chr6 (252-482)||(17851286-17851517)
chr6 (323-484)||(3652889-3653051)
chr6 (254-396)||(7912309-7912451)
chr6 (255-450)||(27334105-27334301)
chr6 (255-450)||(27394845-27395041)
chr6 (252-396)||(17731112-17731260)
chr6 (250-456)||(12194268-12194473)
chr6 (250-485)||(33775003-33775241)
chr6 (254-397)||(17205337-17205479)
chr6 (250-414)||(9440310-9440475)
chr6 (250-330)||(13492397-13492477)
chr6 (250-359)||(1991589-1991698)
chr6 (254-359)||(32292921-32293024)
chr6 (256-359)||(20732614-20732717)
chr6 (251-345)||(28583013-28583107)
chr6 (250-350)||(9440858-9440958)
chr6 (250-413)||(33470819-33470982)
chr6 (252-359)||(10964340-10964447)
chr6 (252-330)||(28065838-28065919)
chr6 (257-357)||(30729847-30729947)
chr6 (306-396)||(9440485-9440575)
chr6 (250-296)||(28780209-28780255)
chr6 (257-356)||(3885098-3885194)
chr6 (310-391)||(9441054-9441135)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (254-484)||(50398537-50398768)
chr4 (250-484)||(1645744-1645979)
chr4 (250-484)||(4127432-4127668)
chr4 (250-485)||(50398988-50399224)
chr4 (250-484)||(12691994-12692229)
chr4 (257-484)||(4127891-4128120)
chr4 (250-484)||(23942784-23943016)
chr4 (250-485)||(29628663-29628898)
chr4 (250-482)||(51331276-51331509)
chr4 (252-484)||(3169116-3169349)
chr4 (250-485)||(21220326-21220563)
chr4 (274-484)||(8467819-8468029)
chr4 (250-484)||(27029188-27029422)
chr4 (252-484)||(1464057-1464290)
chr4 (250-484)||(14351705-14351940)
chr4 (250-456)||(53996110-53996317)
chr4 (250-482)||(24628972-24629208)
chr4 (250-396)||(44471320-44471466)
chr4 (250-480)||(23943237-23943464)
chr4 (250-484)||(24629428-24629662)
chr4 (250-395)||(49998636-49998781)
chr4 (257-484)||(27026414-27026640)
chr4 (257-485)||(31817854-31818083)
chr4 (281-396)||(14572176-14572291)
chr4 (259-484)||(9423862-9424088)
chr4 (250-379)||(7678617-7678746)
chr4 (280-473)||(31817423-31817617)
chr4 (250-484)||(21067648-21067876)
chr4 (250-396)||(35871627-35871772)
chr4 (250-396)||(14571716-14571862)
chr4 (250-392)||(15306086-15306234)
chr4 (252-456)||(21067220-21067425)
chr4 (250-484)||(4185624-4185860)
chr4 (280-467)||(17028801-17028989)
chr4 (257-396)||(23350285-23350424)
chr4 (250-329)||(50814820-50814899)
chr4 (306-431)||(53854858-53854984)
chr4 (257-376)||(42838642-42838763)
chr4 (279-393)||(23976243-23976357)
chr4 (250-355)||(13613893-13613997)
chr4 (252-379)||(33764876-33765003)
chr4 (250-345)||(44470870-44470964)
chr4 (252-385)||(43928961-43929093)
chr4 (250-346)||(17628560-17628656)
chr4 (256-359)||(24271552-24271654)
chr4 (250-398)||(27578904-27579052)
chr4 (280-356)||(41869957-41870033)
chr4 (250-357)||(4186205-4186312)
chr4 (250-357)||(17029368-17029475)
chr4 (250-359)||(52048662-52048770)
chr4 (274-457)||(26200304-26200491)
chr4 (254-329)||(27578456-27578531)
chr4 (250-328)||(23091506-23091584)
chr4 (285-330)||(20306191-20306236)
chr4 (257-330)||(34554494-34554567)
chr4 (308-380)||(2499647-2499719)
chr4 (279-414)||(17628948-17629084)
chr4 (250-357)||(44831035-44831142)
chr4 (279-392)||(9882612-9882723)
chr4 (274-396)||(13266085-13266207)
chr4 (280-320)||(39902478-39902518)
chr4 (273-357)||(53391925-53392009)
chr4 (296-391)||(17506389-17506484)
chr4 (344-486)||(33987160-33987303)
chr4 (277-356)||(45682242-45682321)
chr4 (249-299)||(33294886-33294936)
chr4 (430-484)||(10165873-10165927)
chr4 (336-398)||(20309599-20309661)
chr4 (310-410)||(17505916-17506016)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (250-484)||(6747599-6747834)
chr7 (250-484)||(34405592-34405827)
chr7 (250-484)||(42515455-42515689)
chr7 (254-484)||(2611657-2611888)
chr7 (250-484)||(35474122-35474357)
chr7 (250-484)||(679727-679961)
chr7 (250-483)||(36422163-36422397)
chr7 (250-422)||(46425713-46425886)
chr7 (250-484)||(2189054-2189289)
chr7 (274-484)||(43233323-43233534)
chr7 (250-458)||(28495790-28495999)
chr7 (250-396)||(42515091-42515237)
chr7 (250-441)||(2193209-2193401)
chr7 (250-396)||(2941758-2941904)
chr7 (254-398)||(6719079-6719223)
chr7 (295-485)||(26957603-26957794)
chr7 (250-370)||(2465949-2466069)
chr7 (250-413)||(28495609-28495772)
chr7 (250-380)||(13125137-13125267)
chr7 (256-484)||(29039027-29039248)
chr7 (250-476)||(35527122-35527348)
chr7 (250-396)||(9124958-9125104)
chr7 (250-351)||(2465777-2465878)
chr7 (250-414)||(25182341-25182506)
chr7 (250-485)||(29357457-29357692)
chr7 (250-396)||(11517390-11517535)
chr7 (280-441)||(22529266-22529428)
chr7 (311-485)||(3305374-3305549)
chr7 (250-393)||(26421306-26421449)
chr7 (353-487)||(2463549-2463684)
chr7 (250-358)||(5406589-5406697)
chr7 (250-397)||(31406585-31406732)
chr7 (250-357)||(26421761-26421868)
chr7 (250-396)||(18833285-18833431)
chr7 (250-355)||(9623248-9623352)
chr7 (259-355)||(31743834-31743930)
chr7 (250-357)||(36015412-36015519)
chr7 (352-484)||(10430673-10430806)
chr7 (303-484)||(16811900-16812074)
chr7 (257-329)||(16192385-16192457)
chr7 (250-370)||(20966076-20966196)
chr7 (254-365)||(11372481-11372592)
chr7 (274-393)||(11372901-11373020)
chr7 (437-484)||(2189510-2189557)
chr7 (254-346)||(1628765-1628854)
chr7 (274-356)||(6585647-6585731)
chr7 (250-323)||(7461352-7461424)
chr7 (250-311)||(13122506-13122567)
chr7 (291-359)||(33316764-33316832)
chr7 (305-380)||(13124757-13124832)
chr7 (250-393)||(37672162-37672305)
chr7 (250-299)||(7646479-7646528)
chr7 (435-485)||(16812143-16812193)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (250-485)||(16451934-16452170)
chr1 (250-485)||(16461087-16461323)
chr1 (250-484)||(43057524-43057759)
chr1 (250-484)||(20054081-20054316)
chr1 (250-484)||(20054537-20054772)
chr1 (250-484)||(20054993-20055228)
chr1 (250-484)||(20055449-20055684)
chr1 (250-484)||(20055905-20056140)
chr1 (250-484)||(20056361-20056596)
chr1 (250-484)||(20057264-20057499)
chr1 (250-484)||(52250116-52250351)
chr1 (250-484)||(20845662-20845897)
chr1 (250-484)||(20057720-20057955)
chr1 (250-484)||(43057066-43057300)
chr1 (252-487)||(30872953-30873190)
chr1 (250-484)||(38340816-38341051)
chr1 (250-484)||(20056817-20057043)
chr1 (250-484)||(31822664-31822899)
chr1 (254-449)||(50002712-50002908)
chr1 (250-480)||(12883438-12883669)
chr1 (252-484)||(7548003-7548234)
chr1 (250-398)||(50002286-50002434)
chr1 (250-484)||(50003076-50003311)
chr1 (250-396)||(20061192-20061338)
chr1 (250-398)||(12727988-12728137)
chr1 (255-396)||(35760920-35761061)
chr1 (250-484)||(51372875-51373110)
chr1 (250-359)||(2328351-2328460)
chr1 (279-485)||(10820501-10820708)
chr1 (257-396)||(35759616-35759755)
chr1 (250-454)||(2634864-2635069)
chr1 (254-453)||(16907175-16907375)
chr1 (250-330)||(20060341-20060421)
chr1 (250-345)||(46693736-46693831)
chr1 (257-357)||(16440587-16440687)
chr1 (252-380)||(23180745-23180873)
chr1 (257-360)||(2739557-2739660)
chr1 (257-412)||(2634448-2634604)
chr1 (262-326)||(31823097-31823161)
chr1 (278-385)||(842962-843069)
chr1 (274-484)||(16410748-16410960)
chr1 (250-297)||(52250641-52250688)
chr1 (250-297)||(52250978-52251025)
chr1 (449-485)||(9189351-9189387)
chr1 (274-362)||(42066114-42066202)
chr1 (254-313)||(7229948-7230007)
chr1 (288-343)||(46411173-46411228)
chr1 (440-484)||(50002443-50002487)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (250-484)||(2193726-2193961)
chr5 (250-485)||(20039476-20039711)
chr5 (250-484)||(39146849-39147084)
chr5 (250-484)||(10926947-10927183)
chr5 (250-485)||(17445456-17445692)
chr5 (254-484)||(34867700-34867931)
chr5 (250-485)||(42788647-42788882)
chr5 (250-472)||(10927404-10927628)
chr5 (250-484)||(34371978-34372213)
chr5 (250-484)||(27646836-27647072)
chr5 (250-485)||(34371521-34371757)
chr5 (252-484)||(15513015-15513249)
chr5 (254-484)||(21886151-21886382)
chr5 (250-484)||(18304341-18304576)
chr5 (250-473)||(4657994-4658217)
chr5 (250-396)||(8642035-8642181)
chr5 (252-485)||(5066894-5067127)
chr5 (252-359)||(1821942-1822049)
chr5 (250-396)||(189067-189213)
chr5 (254-398)||(8391327-8391470)
chr5 (250-396)||(2473958-2474104)
chr5 (250-356)||(2474444-2474550)
chr5 (274-457)||(16370733-16370917)
chr5 (250-396)||(3887058-3887204)
chr5 (250-396)||(22556535-22556681)
chr5 (280-465)||(42429083-42429260)
chr5 (250-396)||(3886602-3886748)
chr5 (250-396)||(22556968-22557114)
chr5 (250-350)||(4673472-4673572)
chr5 (250-380)||(29680108-29680231)
chr5 (252-398)||(30719808-30719954)
chr5 (250-485)||(1879990-1880221)
chr5 (281-395)||(24182277-24182391)
chr5 (257-398)||(2058664-2058805)
chr5 (262-362)||(11160694-11160794)
chr5 (254-346)||(18750201-18750293)
chr5 (254-341)||(20858546-20858633)
chr5 (279-373)||(43356650-43356743)
chr5 (250-315)||(11757282-11757347)
chr5 (250-330)||(30684557-30684637)
chr5 (274-454)||(32574683-32574864)
chr5 (315-396)||(22975076-22975157)
chr5 (285-357)||(39801498-39801571)
chr5 (307-484)||(4102723-4102895)
chr5 (274-396)||(5549343-5549466)
chr5 (438-485)||(8391477-8391524)
chr5 (521-556)||(35695187-35695222)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (250-485)||(2651-2887)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (250-485)||(27022339-27022575)
chr8 (250-484)||(10844793-10845028)
chr8 (250-484)||(22026289-22026524)
chr8 (250-484)||(22548996-22549231)
chr8 (250-486)||(12827255-12827492)
chr8 (250-485)||(8080343-8080579)
chr8 (250-484)||(27925809-27926044)
chr8 (252-484)||(33852261-33852493)
chr8 (249-484)||(22840529-22840765)
chr8 (250-485)||(41659106-41659341)
chr8 (250-484)||(6464911-6465146)
chr8 (250-484)||(32292307-32292542)
chr8 (273-476)||(27021903-27022111)
chr8 (250-484)||(22548550-22548785)
chr8 (250-484)||(2043965-2044203)
chr8 (274-484)||(28375079-28375290)
chr8 (250-484)||(28453249-28453483)
chr8 (254-395)||(25147536-25147677)
chr8 (253-380)||(17103096-17103223)
chr8 (250-380)||(10844616-10844746)
chr8 (250-398)||(27819247-27819395)
chr8 (252-396)||(34308482-34308626)
chr8 (250-365)||(41913000-41913115)
chr8 (256-362)||(3744671-3744777)
chr8 (250-396)||(25144771-25144917)
chr8 (250-396)||(25147966-25148112)
chr8 (254-395)||(1297007-1297148)
chr8 (250-351)||(3745145-3745246)
chr8 (250-396)||(34308936-34309086)
chr8 (250-396)||(12100691-12100836)
chr8 (298-476)||(29971450-29971629)
chr8 (256-355)||(15819022-15819121)
chr8 (285-457)||(6466648-6466820)
chr8 (285-380)||(22705187-22705282)
chr8 (250-380)||(21316110-21316240)
chr8 (280-397)||(30334939-30335056)
chr8 (250-346)||(15567557-15567653)
chr8 (250-357)||(30527483-30527589)
chr8 (250-317)||(31283652-31283719)
chr8 (279-344)||(15568035-15568100)
chr8 (254-457)||(6466194-6466397)
chr8 (284-356)||(17429539-17429611)
chr8 (288-345)||(36968434-36968491)
chr8 (252-299)||(10729689-10729736)
chr8 (250-361)||(28912851-28912962)
chr8 (367-485)||(44041799-44041918)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (250-484)||(1130-1365)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (250-485)||(4470-4706)
scaffold0333 (250-484)||(4926-5166)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (250-484)||(154668-154902)
scaffold0002 (347-485)||(151550-151686)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (250-457)||(18136-18343)
scaffold0047 (250-457)||(17599-17807)
scaffold0047 (387-484)||(17817-17916)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (283-484)||(23583-23785)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (250-398)||(2052-2200)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (281-396)||(245085-245200)
scaffold0005 (250-396)||(245514-245660)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (250-380)||(162679-162809)
scaffold0022 (250-401)||(69816-69967)
scaffold0022 (250-296)||(163135-163181)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (250-395)||(18966-19111)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (256-396)||(2217-2357)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (250-396)||(107464-107610)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (250-396)||(10299-10445)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (250-395)||(105720-105865)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (250-350)||(2150-2250)
scaffold0557 (346-484)||(660-799)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (278-396)||(142303-142421)
[»] scaffold0664 (2 HSPs)
scaffold0664 (274-396)||(4007-4129)
scaffold0664 (447-482)||(4172-4207)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (250-473)||(14663-14886)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (353-484)||(2414-2547)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (284-356)||(45425-45497)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (250-309)||(13534-13593)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (254-380)||(26085-26211)
scaffold0036 (279-391)||(16038-16152)
[»] scaffold1138 (1 HSPs)
scaffold1138 (286-360)||(734-808)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (250-296)||(14703-14749)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (250-327)||(7009-7087)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 471; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 559
Target Start/End: Original strand, 32796705 - 32797240
Alignment:
Q  16 caaaggtctagattgtagtttctggatacttgtatttatcgtcatccgaccaatgtagtgatcaacatgcaatcatgcatatataatgtttgacgtgcat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32796705 caaaggtctagattgtagtttctggatacttgtatttatcgtcatccgaccaatgtagtgatcaacatgcaatcatgcatatataatgtttgacgtgcat 32796804  T
Q  116 ggtgtgagtgttgttgtttcagaattccagttttaatttccacttataaaaataaataatacttgactcacatatataagtgatttttaggtgaatgaaa 215  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32796805 ggtgtgagtgtt---gtttcagaattccagttttaatttccacttataaaaataaataatacttgactcacatatataagtgatttttaggtgaatgaaa 32796901  T
Q  216 gttgaatatagctcctatacataaaattaatgatactgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32796902 gttgaatatagctcctatacataaaattaatgatactgtggagttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 32797001  T
Q  316 aacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-c 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32797002 aacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtttcatacctacatggtctcaggatccctcttatttcgatgtgattcggcttgtctagaagctgtc 32797101  T
Q  415 gggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaacaaattaaacaaggtcttacacaaatttg 514  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  32797102 gggagccgttcattgtcata-cttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgttagccttgggtgttacaac-----aaacaaggtcttacacaaatttg 32797195  T
Q  515 acaccatattctatactatatataaaggaaatacatggtttttga 559  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32797196 acaccatattctatactatatgtaaaggaaatacatggtttttga 32797240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 250 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 50347891 - 50347658
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  50347891 actgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccaagtag 50347792  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| |||  |  ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  50347791 tctcatacatacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgttccttgtgcaccggc 50347692  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgtta 482  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50347691 gatcactccccgccctcgtcagccttgggtgtta 50347658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 11180035 - 11180269
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11180035 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 11180134  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||  |   |||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11180135 tcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccg-gctgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtaccttgtgcaccggc 11180233  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11180234 gaccactccccgccctcttcagccttgggtgttaca 11180269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16811526 - 16811291
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  16811526 actgtggaattcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgaaataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatggag 16811427  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || || ||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  16811426 tcccaaacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 16811327  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16811326 gaccactccccaccctcgtcagccttgggtgttaca 16811291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 250 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 39641082 - 39640875
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39641082 actgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttattgatataggtagtaccaaacaactcttataagtcttccttcaaccatgtag 39640983  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  39640982 tctcatacctacacggcctcaggatctctctcattctgatgtgattcgattcttctaaaagctgtcgggagccgttcattgtcatgtcttgtgcaccgac 39640883  T
Q  449 gaccactc 456  Q
    ||||||||    
T  39640882 gaccactc 39640875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 28561891 - 28561656
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  28561891 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 28561792  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||| | |  |||||||| || | | ||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  28561791 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagttgtcagtagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 28561692  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28561691 gaccactccccgccctcgtcagtcttgggtgttaca 28561656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 13150100 - 13150334
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13150100 actgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 13150199  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || ||||||| |||||| |||  |  ||||||||| |  ||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  13150200 tcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgagagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 13150299  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13150300 ga-cactccccgccctcatcagccttgggtgttaca 13150334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 250 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 39653309 - 39653070
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  39653309 actgtggagttctcatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatccaacaattcttataagctttccttcaaccatgcag 39653210  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||| | |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  39653209 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 39653110  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaacaa 488  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39653109 gaccactccccgtcctcgtcagccttgggtgttacaacaa 39653070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 14814094 - 14813858
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  14814094 actgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggtagtaccaaacaattattataagccttcctttaaccatgcag 14813995  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||  | | ||||| | |||||| | ||||||||||||||    
T  14813994 tctcatacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctctcagaagccgctaattgtcgtgccttgtgcaccggc 14813895  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14813894 gaccactcctcgccctcgtcagccttgtgtgttacaa 14813858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 257 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30529825 - 30529608
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30529825 agttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaaaattcttataagccttacttcaaccatgtagtctcata 30529726  T
Q  357 cctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccact 455  Q
    ||||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||| | |  |||||||| || ||||||| | | |||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  30529725 cctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagttgtcgggagctgcttattgtcgtgccttgtgcactgacgaccact 30529626  T
Q  456 ccacgccctcgtcagcct 473  Q
    |  |||||||||||||||    
T  30529625 catcgccctcgtcagcct 30529608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 457
Target Start/End: Original strand, 20885120 - 20885325
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20885120 tgtggagttcttatggaatgtgctactaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtagtc 20885219  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
     |||||||||| |  |||| ||||||||| |||  ||||||||| || |  |||||||| || ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||    
T  20885220 acatacctacacgacctcaagatccctctcattgcgatgtgatt-ggttcctctagaagttgtcgggagccgctcattggcgtgccttgtgcaccggcga 20885318  T
Q  451 ccactcc 457  Q
     ||||||    
T  20885319 tcactcc 20885325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 457
Target Start/End: Original strand, 25230712 - 25230914
Alignment:
Q  256 gagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25230712 gagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaaccttccttcaaccatgtagtctcat 25230811  T
Q  356 acctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccac 454  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||| |||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||| || |||    
T  25230812 acctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatttggttcctctataagctgtcgggagctgctcattgtcgtgccttgtgcaccggagatcac 25230911  T
Q  455 tcc 457  Q
    |||    
T  25230912 tcc 25230914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 457
Target Start/End: Original strand, 25238299 - 25238501
Alignment:
Q  256 gagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25238299 gagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaaccttccttcaaccatgtagtctcat 25238398  T
Q  356 acctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccac 454  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||| |||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||| || |||    
T  25238399 acctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatttggttcctctataagctgtcgggagctgctcattgtcgtgccttgtgcaccggagatcac 25238498  T
Q  455 tcc 457  Q
    |||    
T  25238499 tcc 25238501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 250 - 471
Target Start/End: Original strand, 32227222 - 32227444
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32227222 actgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 32227321  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || || ||||||||||| |||  |  ||||||||| |  |||||||| ||  |||||||| |||||||  | |||||||||| |||    
T  32227322 tcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagttgttgggagccgctcattgttgtgccttgtgcactggc 32227421  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagc 471  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  32227422 gaccactccccgccctcgtcagc 32227444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 252 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16811068 - 16810840
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  16811068 tgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtagatatagttagtacgcaacaattcttataagccttccatcaaccatgcagtc 16810969  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
     |||| ||||| || |||| ||||||||| |||  |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  16810968 ccatatctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 16810869  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtg 479  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16810868 ccactccccgccctcgtcagccttcggtg 16810840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 37045180 - 37044944
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||    
T  37045180 actgtggagttcttatggaatagggtaccaaaaagaagatgcaccttgttgatataggtattaccaaacaattcttataagcattccttcattcatgtag 37045081  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || || ||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||     
T  37045080 tcccacacctacacggcctcaggatccctctcattcagatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattggcgtgccttgtgcaccggt 37044981  T
Q  449 gaccactccac-gccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||    
T  37044980 gaccactcccctgccctcgtcagctgtgggtgttaca 37044944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 457
Target Start/End: Original strand, 25230249 - 25230457
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25230249 actgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaataattcttataagccttccttcaaccatgtag 25230348  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| |  ||||||||||||||  ||  ||||||||| || |  |||| ||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  25230349 tcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatttggttcctctataagatgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 25230448  T
Q  449 gaccactcc 457  Q
     | ||||||    
T  25230449 tatcactcc 25230457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 457
Target Start/End: Original strand, 25237836 - 25238044
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25237836 actgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaataattcttataagccttccttcaaccatgtag 25237935  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| |  ||||||||||||||  ||  ||||||||| || |  |||| ||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  25237936 tcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatttggttcctctataagatgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 25238035  T
Q  449 gaccactcc 457  Q
     | ||||||    
T  25238036 tatcactcc 25238044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 484
Target Start/End: Original strand, 25803010 - 25803240
Alignment:
Q  255 ggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctca 354  Q
    |||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  25803010 ggagttcttatgaaatgggataccgaaaagaagatacatcttgtttttataggtagtaccaaacaattcttacaagtcttacttcaaccatgcagtccca 25803109  T
Q  355 tacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacca 453  Q
    |||||||| |   | |||| ||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||  || ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  25803110 tacctacacgacattaggaaccctcttattccgatatgattcggttcatctagaagctgttggaagccgctcattgttatgccttgtgcaccagcgacca 25803209  T
Q  454 ctccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  25803210 ctccccgtcctagtcagccttgggtgttaca 25803240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 32227645 - 32227453
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32227645 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 32227546  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgc 442  Q
    || |||||||||| || |||| ||||||||| |||  |  ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  32227545 tcccatacctacaaggcctca-gatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgc 32227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 31284277 - 31284423
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  31284277 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 31284376  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||||| || |  |||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  31284377 tcccatacctgcacgacctcaagatccctctcattccgatgtgattc 31284423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 250 - 355
Target Start/End: Original strand, 25238685 - 25238790
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25238685 actgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgataaagatagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtag 25238784  T
Q  350 tctcat 355  Q
    ||||||    
T  25238785 tctcat 25238790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2911240 - 2911005
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||  ||||||||||| |    
T  2911240 actgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttgatataggtaatatcaaacaatttttataaccattctttcaaccatgtgg 2911141  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||| |||||||||| |||  | |||||||||| | ||||||||||||   ||| ||| | ||| || |  |||||||||||||    
T  2911140 tcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattcaggtgtgattcggttcgtctagaagctgttaggatccgcttattatcgtgtcttgtgcaccggc 2911041  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  2911040 gaccactccccgtcctcgtcaatcttgggtgttaca 2911005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 25239078 - 25239208
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||    
T  25239078 actgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaaaattcttataagcgttccttcaaccatatag 25239177  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    || |||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  25239178 tcccatacctacacgacctcagaatccctct 25239208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 253 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41472442 - 41472300
Alignment:
Q  253 gtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtct 352  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  41472442 gtggagttcttatggaatgatctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttataag-cttccttcaaccatgcagtct 41472344  T
Q  353 catacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||||||  | |  |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  41472343 catacctgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgattc 41472300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 352
Target Start/End: Original strand, 13150555 - 13150657
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13150555 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 13150654  T
Q  350 tct 352  Q
    |||    
T  13150655 tct 13150657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29224467 - 29224245
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29224467 tgtgaagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttagtataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtc 29224368  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtg-attcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcg 449  Q
    ||||| |||||||| |||| || |||| | ||| ||||||| |||||| |||   | |||||| | ||||||| |||||||||| |||| || || |||     
T  29224367 tcatatctacatggcctcatgaaccctttcattctgatgtgaattcgg-ttgctgaaaagctgccaggagccgctcattgtcatgccttctgaactggca 29224269  T
Q  450 accactccacgccctcgtcagcct 473  Q
    |||||||| || |||| |||||||    
T  29224268 accactccccgtcctcatcagcct 29224245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 250 - 343
Target Start/End: Original strand, 4067361 - 4067454
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaacc 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4067361 actgtggagttcttatgtaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataagtcttccttcaacc 4067454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25248253 - 25248110
Alignment:
Q  253 gtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtct 352  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||     
T  25248253 gtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattcctttaaccatgcagtcc 25248154  T
Q  353 catacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||||||| || || || || |||||||| |||  ||||||||||    
T  25248153 catacctgcacggccttagaatccctctcattccgatgtgattc 25248110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 413
Target Start/End: Original strand, 25802549 - 25802712
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | | ||||||| ||    
T  25802549 actgtggatttcttatggaatgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaccattcttatcagccttccgttaaccatgcag 25802648  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg 413  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||| |||   ||| || ||||||  |||||||||||    
T  25802649 tctcatacctacatggccacatgatccctctcattccaatgagactcggctcctctagaagctg 25802712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14820299 - 14820107
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || || ||    
T  14820299 actgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaataagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataagccttcctttagccgtgcag 14820200  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtg 441  Q
     | |||||||||| || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| ||||| || | |||||||    
T  14820199 ccccatacctacacgggctcaggaaccctctcattgcggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattatcgtgccttgtg 14820107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7494024 - 7493917
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7494024 tgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaaaaattcttataagccttccttcaaccatgcagtc 7493925  T
Q  352 tcatacct 359  Q
    ||||||||    
T  7493924 tcatacct 7493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8067421 - 8067279
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||| | || |    
T  8067421 tggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcttataagccggccttcaaccatgcaatccc 8067322  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||||| || || |||||| ||||||| |||  ||||||||||    
T  8067321 atacctgcacggcctcagggtccctctcattccgatgtgattc 8067279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 359
Target Start/End: Original strand, 32386735 - 32386844
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||    
T  32386735 actgtggagttcttatggaattagctactgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatacag 32386834  T
Q  350 tctcatacct 359  Q
    || |||||||    
T  32386835 tcccatacct 32386844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7477334 - 7477227
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7477334 tgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgtatcttgttgatataagtagtaccaaaaaattcttataagccttccttcaaccatgcagtc 7477235  T
Q  352 tcatacct 359  Q
    ||||||||    
T  7477234 tcatacct 7477227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 27187331 - 27187461
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||    
T  27187331 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttagtgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttcatttaaccatgcag 27187430  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    || ||||| | ||  | ||||||||||||||    
T  27187431 tcccatacatgcacagcctcaggatccctct 27187461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41474142 - 41473996
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| |||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||    
T  41474142 actgtggagtttttatagaatgatccaccaaaaagaatatcaatcttgttgatataggaagtatcaaacaattcttataagtcttcctttaaccatccag 41474043  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || |||||||  | |  |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  41474042 tcacatacctgaacgacctcaagatccctctcatttcgatgtgattc 41473996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Original strand, 31103961 - 31104070
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgta--ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     
T  31103961 tgtgaagttcttatggaatgagagctaccaaaaagaaaatgcatctagttggtatagatagtatcaaacaattcttataagtcttccttgaaccatgcaa 31104060  T
Q  350 tctcatacct 359  Q
    ||||||||||    
T  31104061 tctcatacct 31104070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 403 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 39653612 - 39653530
Alignment:
Q  403 tctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39653612 tctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccccaccctcgtcagccttgggtgttaca 39653530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 346
Target Start/End: Original strand, 26309990 - 26310086
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatg 346  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||| || | |||||||||||    
T  26309990 actgtcgagttctaatggaatgagctaccataaagaagatgcatctttttggtatatgtagtaacaaaaaattcttataaatcgtccttcaaccatg 26310086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 485
Target Start/End: Original strand, 13155302 - 13155438
Alignment:
Q  347 tagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcacc 445  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||| ||| |||| |  ||||||||| |  ||||||||||| || || ||| |||||||| | |||||||||||    
T  13155302 tagtcccatacctacaaggcctcaggatcc-tctcatttcggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgaga-ccgctcattgtcgtgccttgtgcacc 13155399  T
Q  446 ggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13155400 ggcgac-actccccgccctcgtcagcattgggtgttacaa 13155438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 484
Target Start/End: Original strand, 25238860 - 25238907
Alignment:
Q  437 ttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25238860 ttgtgcaccggcgaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 25238907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14814365 - 14814318
Alignment:
Q  434 accttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgtt 481  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14814365 accttgtgcaccggtgaccactccccgccctcgtcagccttgggtgtt 14814318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 970944 - 970875
Alignment:
Q  416 ggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  970944 ggagccgctcattgtcgtaccttgtgccctggcaaccactccccgccctcgccggccttgggtgttacaa 970875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3890093 - 3890046
Alignment:
Q  280 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttat 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3890093 aaaaaaagatgcatcttgttgatatatgtagtagcaaacaattcttat 3890046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3899915 - 3899868
Alignment:
Q  280 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttat 327  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3899915 aaaaaaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaacaattcttat 3899868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 346
Target Start/End: Original strand, 47518358 - 47518416
Alignment:
Q  288 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatg 346  Q
    ||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  47518358 atgcatcttgttggtagagatagtttcaaacaattcttataagttttccttcaaccatg 47518416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 33175103 - 33174868
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33175103 actgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 33175004  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  33175003 tcccatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcgggagccactcattgtcatgccttgtgcaccggc 33174904  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33174903 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 33174868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 29804827 - 29804591
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  29804827 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagcctgccttcaaccatgtag 29804728  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  29804727 tcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgctcattatcgtgccttgtgcaccggc 29804628  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29804627 gaccactccccgtcctcgtcagccttgggtgttacaa 29804591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 250 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1707186 - 1706955
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1707186 actgtggagttcttatgagatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaatcatgtag 1707087  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||  |||||||||||| |  |||||||  || ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  1707086 tctcatacctacacagtctcaggat-cctctcattccgatgtgattcggttcctctagaaattgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccgac 1706988  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgtt 481  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1706987 gaccactccccgccctcgttagccttgggtgtt 1706955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 254 - 485
Target Start/End: Original strand, 18098883 - 18099116
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  18098883 tggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaaccatgtagtctc 18098982  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacc 452  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||  |||||||||||| |  |||| |||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||||| |    
T  18098983 atacctacacggcctcaggattcctctcattccgatgtgattcggttcctctataagctgtcgggagctgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgatc 18099082  T
Q  453 actccac-gccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18099083 actcccctgccctcgtcagccgtgggtgttacaa 18099116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 41754434 - 41754199
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  41754434 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 41754335  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |||||||||| || || |||| || |||||| |||  | |||||||| | |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  41754334 tctcatacctgcacggcctcaagaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 41754235  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41754234 gaccactccccgccctcgtcatccttgggtgttaca 41754199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 33174648 - 33174415
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||    
T  33174648 actgcggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaac--tgtag 33174551  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||   |||||||||    
T  33174550 tcccatacctacacggcatcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcgtctagaagctgtcgggagccgctcattgtcatgccccttgcaccggc 33174451  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||    
T  33174450 gaccactccccgccttcgttagccttgggtattaca 33174415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8256671 - 8256436
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8256671 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 8256572  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| ||  ||| ||||||||| |||  |  |||||| |  |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  8256571 tcccatacctacaaggcttcaagatccctctcattccggcgtgatttgattcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 8256472  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8256471 gactactccccaccctcgtcagccttgggtgttaca 8256436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 25337998 - 25338234
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  25337998 actgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 25338097  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || |  ||||||| |||||| |||  | |||||||| | |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  25338098 tcccatacctgcacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 25338197  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25338198 gaccactcctcgccctcgtcagccttgggtgttacaa 25338234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 25434057 - 25434293
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  25434057 actgtggagttcttatggaatgggctaccagaaaggagatgcatcttgttgataaaggttgtatcaaacaattcttataagccttccttcaaccatgaag 25434156  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||  || || |||||||||||||| |||  | |||||||||| | || ||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  25434157 tcccataccagcacggcctcaggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtttagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 25434256  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25434257 ggccactccccgccctcgtcagccttgtgtgttacaa 25434293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16379538 - 16379302
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  16379538 actgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcgtataagtcttccttcaaccatgcag 16379439  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||| |||||||||| |||   || |||||||| | || || || |||  |||||| | |||||||| | ||||||||||||||    
T  16379438 tcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattccaatttgattcggttcgtttataaactgttgggagctgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 16379339  T
Q  449 gaccact-ccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||    
T  16379338 gaccactcccttgctctcgtcagccgtgggtgttaca 16379302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 38898913 - 38899148
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  38898913 actgtggagttcttatgaaatgtgttaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctctccttcaaccatgtag 38899012  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||| ||||||||| || |||| |||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||  ||| ||||||  |    
T  38899013 tctgatacctacacggcctcaagatcactctccttccgatgtgatttggcttgtctagaagttgtcgggagccactcattttcatgtcttatgcaccaac 38899112  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  38899113 gaccactccccgccctcgtcagtcttgagtgttaca 38899148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 484
Target Start/End: Original strand, 27882929 - 27883162
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||    
T  27882929 tgtggagttcttatggaacggcctacaaaaaagaagatgcatcttattgatatagataataccaaacaattcttataagcattccttcaacaatgcagtc 27883028  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
    |||||| | || || |||||||||||||| |||| | ||||||||||   || ||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  27883029 tcatacatgcacggcctcaggatccctctcatttcggtgtgattcggtacgtgtagaatctgacgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 27883128  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  27883129 ccactccccgtcctcgtcagccttggatgttaca 27883162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 285 - 480
Target Start/End: Original strand, 18447954 - 18448150
Alignment:
Q  285 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttatt 384  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||    
T  18447954 aagatgcatcttgttgatacaagtagtaccaaacaattcttataagtcttacttcaaccatgtagtcacatacctacacggcctcaggatccctatcatt 18448053  T
Q  385 ttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgt 480  Q
      |||||||||||| |  |||| |||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  18448054 ccgatgtgattcggttcctctaaaagctgtcgggaaccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccccgccctcgccagccttaggtgt 18448150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 33771146 - 33770920
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||    
T  33771146 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctttcttcaaccctgcag 33771047  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||         ||||||| |||||| |||  | |||||||| | |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  33771046 tcccatac---------ctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 33770956  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33770955 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 33770920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 1912669 - 1912462
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  1912669 actgtggagttcttatggaatgggctaccaaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaatctactttcaaccatgtag 1912571  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||| |||  |||||||||| | |  |||| ||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  1912570 tctcatacctacataacctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctaaaagctgttgagagccgctcattgtcgtaccttgtgcactggc 1912471  T
Q  449 gaccactcc 457  Q
    || ||||||    
T  1912470 gatcactcc 1912462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15620041 - 15619807
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttg-cttcaaccatgtagt 350  Q
    ||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||    
T  15620041 tgtggagttcttatggattgggtttccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag-cttgccttcaactatgcagt 15619943  T
Q  351 ctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcg 449  Q
    ||||||| | || ||  || |||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||| |||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  15619942 ctcatacttgcacggcatcgggatccctctcattctgatgtaattcggttcgtctataagctatcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcg 15619843  T
Q  450 accactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  15619842 accactccccgctctcatcagtcttgggtgttacaa 15619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16379082 - 16378975
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||    
T  16379082 actgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcgtataagacttccttcaaccatgcag 16378983  T
Q  350 tctcatac 357  Q
    ||||||||    
T  16378982 tctcatac 16378975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11388332 - 11388186
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  11388332 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccatgtag 11388234  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  11388233 tctcatacctacacggcatcaggat-cctctcattccgatgtgattcgg 11388186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24818471 - 24818325
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  24818471 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcttataagccttccttgaaccatgcag 24818372  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||| | || || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  24818371 tcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 24818325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 254 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30966375 - 30966249
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  30966375 tggagttcttatggaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtccc 30966276  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    ||||||  | || ||||||||||||||    
T  30966275 atacctgtacggcctcaggatccctct 30966249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30966835 - 30966705
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  30966835 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttcaaccatgcag 30966736  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    || ||||| |  | || ||||||||||||||    
T  30966735 tcccatacatgtacggcctcaggatccctct 30966705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1953277 - 1953152
Alignment:
Q  273 actaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |   |||||    
T  1953277 actaccaaaaagaagatgcatctagttgatataggtagtaccaaacaattcttataggtcttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgacttcagg 1953178  T
Q  373 atccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||    
T  1953177 atccctctcattccgatgtgattcgg 1953152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 250 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 83162 - 82999
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  83162 actgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaagattcatcttgttggtataggtagtaccaaacgattcttataagcataccttcaaccatgtag 83063  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgc 414  Q
    |||||||||| ||   ||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||| |||||||||||    
T  83062 tctcatacctgcacaatctcaggatccctctcatttcgacgtgattcag-ttgcctagaagctgc 82999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13191115 - 13191010
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||     
T  13191115 tggagttcttataaaatggactaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaacaattcttataagtcttccttgaaccatgcagtctt 13191016  T
Q  354 atacct 359  Q
    ||||||    
T  13191015 atacct 13191010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15639877 - 15639649
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||||||||||| |||| ||   | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||| |||         
T  15639877 tgtggagttcttgtggattgggtttccaaaaagaagatgtatgttgttgatataggtagtaccaaacaattcctataagcgtgccttcaactatg----- 15639783  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
     ||||| | ||  | ||| |||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||| |||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  15639782 -catacttccacagcctcgggatccctctcattctgatgtaattcggttcgtctataagctatcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 15639684  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  15639683 ccactccccgctctcatcagtcttgggtgttacaa 15639649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 396
Target Start/End: Original strand, 29259628 - 29259767
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  29259628 agttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattttaataagccttccttcaaccatgcagtcccata 29259727  T
Q  357 cctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    | |  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  29259728 cttgtacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattc 29259767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11394678 - 11394554
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  11394678 actgtgaagttcttatggaatag-ctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccatgtag 11394581  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatcc 376  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  11394580 tctcatacctacacggcatcaggatcc 11394554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 330
Target Start/End: Original strand, 5399825 - 5399898
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 330  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5399825 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 5399898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8074033 - 8073907
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| | |    
T  8074033 tggagttcttatgaaatgggctacaagaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagtctcccttcaaccttatagaccc 8073934  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    |||||| ||   ||||| |||||||||    
T  8073933 atacctgcacaatctcatgatccctct 8073907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 30963721 - 30963851
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| ||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |     
T  30963721 actgtggagttattatggtttgggctaccagaaagaagatgcatcttgttgatataggtagaaccatacaattcttataagttttccttcaaccatgcat 30963820  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    |||| ||||| || ||  ||| |||||||||    
T  30963821 tctcttacctgcacggcttcatgatccctct 30963851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16542101 - 16542018
Alignment:
Q  279 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctaca 362  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16542101 aaaaaaaagatacatcttgttgatataggtagtacaaaacaattattataagtcttccttcaaccatgtagagtcatacctaca 16542018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 385
Target Start/End: Original strand, 8181394 - 8181487
Alignment:
Q  292 atcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattt 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||||    
T  8181394 atcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttaaaagtcttccttcaaccacaaagtcccatacctataaggtctcgggatccctctcattt 8181487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20502165 - 20502061
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||| |||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  20502165 tgtgaagttcttatgaaatgggctaccaaaaa-aagaagcatcttgttgatatagaaagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtc 20502067  T
Q  352 tcatac 357  Q
     |||||    
T  20502066 ccatac 20502061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 274 - 346
Target Start/End: Original strand, 30963288 - 30963360
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatg 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  30963288 ctaccaaaaataagatgcatcttgttgatataggtagtacctaacaattcttataagccttccttcaatcatg 30963360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 397
Target Start/End: Original strand, 30961884 - 30962039
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtct--------tgcttcaa 341  Q
    ||||||||||||||||||  |   ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||        | ||||||    
T  30961884 actgtggagttcttatggtttcggctaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtagtaccaatcaaatcttataagacttccttaaatccttcaa 30961983  T
Q  342 ccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcg 397  Q
    ||||| | || |||||||||| ||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  30961984 ccatgcaatcccatacctacacggcttcaggatctctctcattctgatgtgattcg 30962039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Original strand, 36924452 - 36924519
Alignment:
Q  279 aaaaagaagatgcatcttgttgatatag--gtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaacca 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36924452 aaaaagaagatgcatcttgttgatatataagtaataccaaacaattcttataagccttccttcaacca 36924519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 9909213 - 9909098
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | | |||||||||| ||||||||||| || | | | ||||||    
T  9909213 ctaccaaaaagaagttgaatcttgttggtataggtagtaccaattaatcattataaaccctccttcaaccatatagtctcatacttatacgatttcagga 9909114  T
Q  374 tccctcttattttgat 389  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  9909113 tccctctcattctgat 9909098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 484
Target Start/End: Original strand, 18098667 - 18098798
Alignment:
Q  355 tacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacca 453  Q
    |||||||| || |||||| | ||||| |||  |||||||||||  |  |||| |||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||    
T  18098667 tacctacacggcctcagggttcctctcattccgatgtgattcgattcctctataagctgtcgggagccgctcaatgtcgtgccttgtgcaccggcgatca 18098766  T
Q  454 ctccac-gccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  18098767 ctcccctgccctcgtcagccgtgggtgttaca 18098798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37552710 - 37552590
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  37552710 actgtggaattcttacggaatgcgctgccaaaaagaaga-gcatcattttg-tatatgtagtaccaaacaattcttataagtctcg-tttgaccatgcag 37552614  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    || ||||| | |||||||||||||    
T  37552613 tcccatacttgcatggtctcagga 37552590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 326
Target Start/End: Original strand, 26864841 - 26864893
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 326  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  26864841 ctaccaaatggaagatgcatcttgtcgatgtaggtagtaccaaagagttctta 26864893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 6330913 - 6331148
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6330913 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtag 6331012  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6331013 tctcatacctacacggcctcaggatccatctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcgggagccgctcattgtcatgccttgtgcaccggc 6331112  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6331113 gaccactccccaccctcgtcagccttgggtgttaca 6331148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 253 - 484
Target Start/End: Original strand, 20896692 - 20896924
Alignment:
Q  253 gtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtct 352  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20896692 gtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtct 20896791  T
Q  353 catacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgac 451  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20896792 catacctacacggcctaaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcgggagccgctcattgtcatgccttgtgcaacggcgac 20896891  T
Q  452 cactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  20896892 cactctccgtcctcgtcagccttgggtgttaca 20896924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 252 - 484
Target Start/End: Original strand, 20126185 - 20126418
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20126185 tgtggaattcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaaccattcttataagccttccttcaaccatgtagtc 20126284  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20126285 tcatacctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgattcagcttgtctagaagttgtcaggagccgctcattgtcatgccttgtgcaccggcga 20126384  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20126385 ccactccccgccctcgtcggccttgggtgttaca 20126418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 250 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3652631 - 3652398
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3652631 actgtggagttcttatggaatgaactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcagacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 3652532  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  3652531 tcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccgac 3652432  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgtta 482  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3652431 gaccactccccgccctcatcagccttgggtgtta 3652398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 20850466 - 20850231
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20850466 actgtagagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacaaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 20850367  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || |||| || |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20850366 tcccatacctgcacggcctcatgaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20850267  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20850266 gaccactcctcgccctcgtcagccttgggtgttaca 20850231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 250 - 483
Target Start/End: Original strand, 23986318 - 23986552
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  23986318 actgtgaagttcttatggtttgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttcatataggtagtaccaaacaattcttataagcctaccttcaaccatgtag 23986417  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || ||| |||||||||| |||  |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  23986418 tcccatacctacacggcctccggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcatgccttgtgcaccgac 23986517  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttac 483  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23986518 gaccactccccgccctcgtcagccttaggtattac 23986552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 252 - 484
Target Start/End: Original strand, 2681219 - 2681452
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  2681219 tgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatgggtagtaccaaacaattcttataagtcttcattcaaccatgcagtc 2681318  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
     || ||||||| || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||| ||| | ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  2681319 ccaaacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaaactgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgtaccggcga 2681418  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2681419 ccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 2681452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 11062430 - 11062196
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11062430 actgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacaaaacacttcttataagccttccttcaaccatgtag 11062331  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    | |||||||||||  | |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||     
T  11062330 tttcatacctacacagcctcaggat-cctctcatgtcgatgtgattcggttcctctagaaactgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggt 11062232  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  11062231 gaccactccccgccttcgtaagccttgggcgttaca 11062196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 14771720 - 14771956
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14771720 actgtggagttcttatggaatagattaccaaaaagaatatggatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcag 14771819  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||||||| |||  |  ||||||||  |  || |||||||| |||||| || |||||||| | ||||| ||||||||    
T  14771820 tctcatacctacacggcttcgggatccctctcattccggcgtgattcgcttcatcaagaagctgtcgggagtcgctcattgtcgtgccttgcgcaccggc 14771919  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14771920 gatcactccctgccctcgtcagccgtgggtgttacaa 14771956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 254 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 21312112 - 21311881
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  21312112 tggatttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacctaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtctc 21312013  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacc 452  Q
    |||||| ||  | |||| || |||||| ||| || |||||||| | |  | ||||||||  |||||| || |||||||  | |||||||||| |||||||    
T  21312012 atacctgcacagcctcatgaaccctctcattctggtgtgattcagttcctttagaagctatcgggagtcgctcattgttgtgccttgtgcactggcgacc 21311913  T
Q  453 actccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21311912 acttcccgccctcgtcagccttgggtgttaca 21311881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 2720564 - 2720801
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaa-gatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2720564 actgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaaagatgtgtcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgca 2720663  T
Q  349 gtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccgg 447  Q
    ||||||||||| || |  ||  |||||||||| |||  | | ||||| || | |||||||||||| | | || || |||||||| |  ||||||||||||    
T  2720664 gtctcatacctgcacgaccttgggatccctctcattccggtatgatttggttcgtctagaagctgtccgaagtcgctcattgtcgtgacttgtgcaccgg 2720763  T
Q  448 cgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2720764 cgaccactccccgccctcgtcagccttaggtgttacaa 2720801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 23776584 - 23776352
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23776584 tgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccagacgattcttataagtcttccttcaaccatgtagtc 23776485  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
     |||||||||| || |||||||| ||||| |||  |  ||||||| | |  ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  23776484 ccatacctacaaggcctcaggatacctctcattccggcgtgattcagttcctctagaagctgtcggaagccgctcattgtcgtaccttgtacatcggcga 23776385  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttac 483  Q
    ||||||  |  |||||||||| || ||||||||    
T  23776384 ccactctccatcctcgtcagctttcggtgttac 23776352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 15929727 - 15929492
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  15929727 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaataattcttataagccttcattcaaccatgtag 15929628  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||  |||| |||| ||  | |||||| |||||||| ||||||||||||  |  |||||||| || | ||||||| |||||||||| |||| ||||||  |    
T  15929627 tccaatacatacaaggcattaggatctctcttattctgatgtgattcgattcatctagaagttgtccggagccgctcattgtcatgccttatgcaccaac 15929528  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||    
T  15929527 gaccacacccggccctcgtcatccttgggtattaca 15929492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 422
Target Start/End: Original strand, 31821704 - 31821865
Alignment:
Q  261 cttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcataccta 360  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  31821704 cttatggaatgagctaccaaaaaaaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaataattcttataagcattccttcaaccatgtagtctcataccta 31821803  T
Q  361 catggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgcgggagccg 422  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  31821804 catggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggtttctctagaagctgtcggagccg 31821865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16520113 - 16519967
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  16520113 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaaatctcataagccttccttcgaccatgtag 16520014  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16520013 tctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 16519967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9352207 - 9352062
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||    
T  9352207 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtaccaaacaaatattataagtctcccttcgaccatgtag 9352108  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgatt 395  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9352107 tctcatacctacacagcctcaggatccctctcatttcgatgtgatt 9352062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 395
Target Start/End: Original strand, 13191514 - 13191659
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  13191514 actgtgaagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 13191613  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgatt 395  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  13191614 tcccatacctacatagtcttaggatccctctcattccgatgtgatt 13191659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15929338 - 15929111
Alignment:
Q  256 gagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    
T  15929338 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttattgatataggcattaccaaacaattcttataagcttttcttcaaccttgtagtctcat 15929239  T
Q  356 acctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccac 454  Q
    ||||| | || |||||||||| ||||||| || |||||||||| |  |||||||| |  | | || || |||||||||| |||||| || | ||||||||    
T  15929238 acctaaacggcctcaggatccatcttattatgttgtgattcggttaatctagaagatatctgaagtcgctcattgtcatgccttgtacatcagcgaccac 15929139  T
Q  455 tccacgccctcgtcagccttgggtgtta 482  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  15929138 tccccaccctcatcagccttgggtgtta 15929111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7912023 - 7911877
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  7912023 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagttttccttcaaccatgcag 7911924  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||  |||||| || || |||  ||||||||| |||  ||||||||||    
T  7911923 tcctatacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattc 7911877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13492934 - 13492808
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  13492934 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattattataagccttccttcaaccatgcag 13492835  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatcc 376  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||    
T  13492834 tctcatacctgcacagcctcaggatcc 13492808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21311660 - 21311422
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  21311660 actgcggagttcttatggaatgagcttccaaaaagaagatggatcttgtttatctaggtaataccaaacaattcttataaggcttccttcaaccatgcag 21311561  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||| |  | || |||| || |||||| |||  |||||||||||  || ||||||||||  || || ||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  21311560 tcccatacttgtacggcctcatgaaccctctcattccgatgtgattcgttttctctagaagctttcgagaacctctcattgtcgttccttgtgcaccggc 21311461  T
Q  449 gaccactcc-acgccctcgtcagccttgggtgttacaac 486  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21311460 gaccactcctatgcccttgtcagccgtgggtgttacaac 21311422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 395
Target Start/End: Original strand, 17027532 - 17027677
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  17027532 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 17027631  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgatt 395  Q
    || ||||||| || || ||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  17027632 tcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatt 17027677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 2890840 - 2891073
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  2890840 actgtggagttcttatggaatgggctactgaaaagaagaagcatctttttgatataggtagtccctaacaattcttataaaccttccttcaaccatgcag 2890939  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||| |||| ||||| ||| | ||||||||||  |  ||||||| ||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  2890940 tcccatacctgcacggcctcgggat-cctctcattctaatgtgattcgattcctctagaa-ctgtcaggagccgctcattgtcgtggcttgtgcaccggc 2891037  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
     |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2891038 aaccagtccctgccctcgtcagccttgggtgttaca 2891073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17851063 - 17850827
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||  ||  || ||||||| ||    
T  17851063 actgtggagttcttatagaatgggctaccagaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacatatcttatcagcattcttttaaccatgcag 17850964  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||| | || |  |||||||||||||| |||  | |||||||||| | ||||||||| || ||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||    
T  17850963 tcccatacttgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaagttgtcggaagccgctaattgtcgtgccttgtgcaccggc 17850864  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||| || ||||||    
T  17850863 gaccacttcccgcccttgttagccttgagtattacaa 17850827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20735836 - 20735696
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |    
T  20735836 tggagtttttatagaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtatcaaacaattcttataagccttcctacaatcatgtagtcac 20735737  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgat 394  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  20735736 atacctacacagtctcaagatccctctcattatgatgtgat 20735696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17851517 - 17851286
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||  || ||||||| ||||    
T  17851517 tgtggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacatatcttataagccttcttttaaccatgcagtc 17851418  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
     ||||| | || || ||| |||||||||| |||  | |||||||||| | ||||||||| || |   ||||| | ||| || | ||||||||||||||||    
T  17851417 ccatacttgcacggcctcgggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaagttgtctaaagccgctaattatcgtgccttgtgcaccggcga 17851318  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgtta 482  Q
     |||| | ||||||||  ||||||||||||||    
T  17851317 acacttcccgccctcggtagccttgggtgtta 17851286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 323 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 3653051 - 3652889
Alignment:
Q  323 cttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagcc 421  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||  ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  3653051 cttataagccttcgttcaaccatgcagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgagtcggttcatctagaagctgtcgggagcc 3652952  T
Q  422 gttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3652951 gctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccccgccctcgtcagtcttgggtgttaca 3652889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7912451 - 7912309
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |    
T  7912451 tggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcatataagttttccttcaaccatgcagtccc 7912352  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||||| || || |||  ||||||||| |||  ||||||||||    
T  7912351 atacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattc 7912309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 255 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27334301 - 27334105
Alignment:
Q  255 ggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctca 354  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||  ||    
T  27334301 ggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagttcca 27334202  T
Q  355 tacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
    ||||| || |  ||||||| ||||||  ||  | |||||||| | |  |||| ||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27334201 tacctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattcagttcctctataagctgttgggagtcgttcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 27334105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 255 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27395041 - 27394845
Alignment:
Q  255 ggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctca 354  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||  ||    
T  27395041 ggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagttcca 27394942  T
Q  355 tacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
    ||||| || |  ||||||| ||||||  ||  | |||||||| | |  |||| ||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27394941 tacctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattcagttcctctataagctgttgggagtcgttcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 27394845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 396
Target Start/End: Original strand, 17731112 - 17731260
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatct----tgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgt 347  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  17731112 tgtggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatctatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttcctttaaccatgc 17731211  T
Q  348 agtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||| |||||||  | || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  17731212 agtcccatacctgaacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 17731260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12194473 - 12194268
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  12194473 actgtggagttcttatggaatgaattataaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtgccaaaaaaat-ttataagtctttcttcaatcatgcag 12194375  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    | ||||| || || ||||||||||| ||||| |||   ||||||||||| ||| ||||||| || | ||||| | ||||  || || |||||||||| ||    
T  12194374 t-tcatatctgcacggtctcaggattcctctcattccaatgtgattcggtttgactagaagatgtcaggagcagctcatcctcttaacttgtgcaccagc 12194276  T
Q  449 gaccactc 456  Q
    ||||||||    
T  12194275 gaccactc 12194268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 33775003 - 33775241
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgca--tcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgt 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  33775003 actgtggagttcttatggaatggactatcaaaaagaagatgcatctcttgttgatataggtagcaccagacaattcttataatccttccttcaaccatgc 33775102  T
Q  348 agtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccg 446  Q
     ||| ||||| | || || |||  |||| |||| |||    |||||||||  |||| ||||| |||  |||||| | ||||| || | ||||||||||||    
T  33775103 ggtcacatacttgcacggcctcgcgatcactctcattccagtgtgattcgttttgtgtagaaactgttgggagctgctcattatcgtgccttgtgcaccg 33775202  T
Q  447 gcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
     |||||||| |  | |||| ||| |||||||||||||||    
T  33775203 acgaccactacctgtcctcatcaaccttgggtgttacaa 33775241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17205479 - 17205337
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||    
T  17205479 tggagttcttatggaatgggctaccaaaac-aagatgaatcttgttggtaaaggtagtaccaaacaattcttataattcttcattcaatcatgcagtttc 17205381  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcg 397  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||    
T  17205380 ataccaccatggtctcaaaatccctctaattccgatgtgattcg 17205337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 414
Target Start/End: Original strand, 9440310 - 9440475
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||| ||    
T  9440310 actgtgaagttcttatggagtgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgttgatataagtagtaccgaacaattcttataagctttcattcaaccatgcag 9440409  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg-cttgtctagaagctgc 414  Q
    |  ||||||| || |   ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  9440410 ttccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattcggtcttccctagaagctgc 9440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13492477 - 13492397
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 330  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13492477 actgtggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaatatcaaacaattcttataag 13492397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1991698 - 1991589
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||    
T  1991698 actgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttagatatgtaataccaaacaattcttgtaagccttcttccaaccatgtag 1991599  T
Q  350 tctcatacct 359  Q
    ||||||||||    
T  1991598 tctcatacct 1991589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32293024 - 32292921
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||  |||||  ||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  32293024 tggagttcttat--aatgtgttactaaaaacaagatgtattttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccatgcagtctc 32292927  T
Q  354 atacct 359  Q
    ||||||    
T  32292926 atacct 32292921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20732717 - 20732614
Alignment:
Q  256 gagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    ||||| |||| |||||  ||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||    
T  20732717 gagtttttattgaatgggctaccgaaaagaatatgcatattattaatataggtagtaccaaataattcttataagccttcctacaaccatgtagtcacat 20732618  T
Q  356 acct 359  Q
    ||||    
T  20732617 acct 20732614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28583107 - 28583013
Alignment:
Q  251 ctgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccat 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  28583107 ctgtggatttcttatggaatgaactaccggaaagatgatgcatcttgttgatatagatcgtatcaaataattcttataagccttcattcaaccat 28583013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 350
Target Start/End: Original strand, 9440858 - 9440958
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||  ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9440858 actgtgaagttcttatggtttgggctactgaaaagaaaatgcatcttgttgataaaagtagtaccaaagaattcttataagcattccttcaaccatgtag 9440957  T
Q  350 t 350  Q
    |    
T  9440958 t 9440958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33470982 - 33470819
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||  || ||| ||||||||| ||| ||||||| ||    
T  33470982 actgtggaattcttatgtaatgaactacaaaaaagaatatgcatcttgttagtataggtaataccaagtaa-tctaataagtcttcctttaaccatgaag 33470884  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtg-attcggcttgtctagaagctg 413  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||| |||| || ||| |||| || |||||  | ||||||||||||    
T  33470883 tctcttaccaacatgatcttagggtcccactcattctgatatgaattcgattcgtctagaagctg 33470819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10964447 - 10964340
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| ||  || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||    
T  10964447 tgtggagtttttatggattaagctaccaaaaagaatatttattttattgatatatgtagtaccaaacaattcttgtaagtctttcttctaccatacagtc 10964348  T
Q  352 tcatacct 359  Q
    ||||||||    
T  10964347 tcatacct 10964340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 28065838 - 28065919
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaa---gatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 330  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| ||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28065838 tgtggagttcttatggaataagctaccaaaaaaaaaaagatgcatcttgttgatagagatagtaccaaacaattcttataag 28065919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 357
Target Start/End: Original strand, 30729847 - 30729947
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||  ||||||||    
T  30729847 agttcttatagaattgactacccaaaagaagatcaatcatgtttatatacgtagtaccaaacaatttttatgagtcctccttcaaccatgctgtctcata 30729946  T
Q  357 c 357  Q
    |    
T  30729947 c 30729947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 396
Target Start/End: Original strand, 9440485 - 9440575
Alignment:
Q  306 ggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||| || |   ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  9440485 ggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccatgaagtcccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattc 9440575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28780255 - 28780209
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatctt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  28780255 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 28780209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Original strand, 3885098 - 3885194
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||   || || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| |||||||||    
T  3885098 agttcttatggaataagctaccaaaaaga---tgtattttgttagtatatgtagtaccaaacaattcttttaagcattccttcaactatgcagtctcata 3885194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9441135 - 9441054
Alignment:
Q  310 gtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||| || || ||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  9441135 gtaccaaacaattcttataagctttccttcaatcatgtagtcacatatctgcacggctttaggattcctctcattttgatgt 9441054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 254 - 484
Target Start/End: Original strand, 50398537 - 50398768
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||      
T  50398537 tggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcct 50398636  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacc 452  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50398637 atacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcgggagccgctcattgtcatgccttgtgcaccggcgacc 50398736  T
Q  453 actccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50398737 actccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 50398768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 1645744 - 1645979
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1645744 actgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtag 1645843  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||| ||| ||||| |||  |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  1645844 tcccatacctacacggcctcaagattcctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 1645943  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1645944 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 1645979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 4127432 - 4127668
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4127432 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaactatgtag 4127531  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtc-tagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccgg 447  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |  || |||||| || ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  4127532 tcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctcttagaagttgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccgg 4127631  T
Q  448 cgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4127632 cgaccactccccgccctcgtcagtcttgggtgttaca 4127668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 50398988 - 50399224
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  50398988 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcgtgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtaa 50399087  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  50399088 tctcatacctacacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcagaagccgctcattgtcatgccttgtgcactggc 50399187  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttggg-tgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50399188 gaccactcc-cgccctcgtcagccctgggatgttacaa 50399224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 12691994 - 12692229
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  12691994 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 12692093  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  12692094 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 12692193  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12692194 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 12692229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 257 - 484
Target Start/End: Original strand, 4127891 - 4128120
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||     
T  4127891 agttcttatggaattggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatatagtctcatg 4127990  T
Q  357 cctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtc-tagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccac 454  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||  |  || |||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4127991 cctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctcttagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccac 4128090  T
Q  455 tccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4128091 tcctcgccctcgtcagccttgggtgttaca 4128120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 23942784 - 23943016
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  23942784 actgtggagttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgtag 23942883  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |  |||||||||| || | |||||||||||| |||  |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||   |||||||| | ||||||||||||||    
T  23942884 ttccatacctacacggccccaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagc---tcattgtcgtgccttgtgcaccggc 23942980  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  23942981 gaccactccccgccctcgtcatccttaggtgttaca 23943016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 29628663 - 29628898
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29628663 actgtggagttcttatggaatgggctaccaaaca-aagacacatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtag 29628761  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| | | ||||  |||||| | | ||||||||||||||    
T  29628762 tctcatacctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattcggttcctctagaagctgtcagaagccactcattggcgtgccttgtgcaccggc 29628861  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  29628862 gaccactccccgtcctcgtccgccttggatgttacaa 29628898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 250 - 482
Target Start/End: Original strand, 51331276 - 51331509
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51331276 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgtatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 51331375  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   |||| ||| ||||| |||| |||||||||||| |    
T  51331376 tcccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttatagggaaccgctcattatcatgccttgtgcaccgac 51331475  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgtta 482  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51331476 aaccactccccgccctcatcagccttgggtgtta 51331509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 3169349 - 3169116
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3169349 tgtggagttcttatggattgggttaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataagtcttccttcaaccatgtagtc 3169250  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
     |||||||||| || |||| ||| ||||| |||  |||||||||||| |  |||| |||||| | |||| || |||||||| |  |||||||||||| ||    
T  3169249 ccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattcggttcctctataagctgtcaggagtcgctcattgtcgtgtcttgtgcaccggtga 3169150  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  3169149 ccactccccgtcctcgtcaaccttgggtgttaca 3169116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 21220326 - 21220563
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||    
T  21220326 actgtgtagttcttatagaatgagttaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaaccatatag 21220425  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |     
T  21220426 tttcatacctacatggcctcatgatccctctcattctgatgtgattcggttcctctagaagctgccgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccagt 21220525  T
Q  449 gaccact-ccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||| ||| || ||||| || | ||||||||||||    
T  21220526 gaccactcccatgctctcgttagtcgtgggtgttacaa 21220563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 274 - 484
Target Start/End: Original strand, 8467819 - 8468029
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  8467819 ctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtagtctcatacctgcacagtctcagga 8467918  T
Q  374 tccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagcc 472  Q
    ||||| | ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8467919 tccctttcattctgatgtggttcgg-ttgcctagaagctgccaggagccgcgcaatgtcatgccttgtgcactggcgaccactccccgccctcgtcaacc 8468017  T
Q  473 ttgggtgttaca 484  Q
    | ||| ||||||    
T  8468018 tcgggcgttaca 8468029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 27029422 - 27029188
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  27029422 actgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaataattcttataagtcttccttcaatcgtgtag 27029323  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||| ||  ||| |||||  | | ||||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  27029322 tctcattcctgcatggtc-ccgaatccctctcattctgatgtaattcggttttcctataagctaccagaagccgctcattgtcatacattgtgcattggc 27029224  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27029223 gaccactccccgccctcgtcagcctcgggtgttaca 27029188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 1464290 - 1464057
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||    
T  1464290 tgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagttttctttcaactatgtattc 1464191  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||| || ||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  1464190 tcatacctacacggtcgcatgatccctctcattctgatgtgattcggttcgtctaaaaggtgtcgaaagccgttcattgtcatgtcttatgcaccggcga 1464091  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||  || | |||| || |||||||||||||    
T  1464090 ccactctccgtcttcgttagtcttgggtgttaca 1464057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14351940 - 14351705
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| ||    
T  14351940 actgtggagttcttatggaataggataccaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaaaaactcttacaagccttccttcaaccatgcag 14351841  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
     ||||||| | || |  |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  14351840 actcatacatgcacgacctcaggatccctctcattctggtgtgattcggtttgtctagaagttgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 14351741  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
     ||||||||    |||  ||||||||||||||||||    
T  14351740 aaccactccctagccttatcagccttgggtgttaca 14351705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 250 - 456
Target Start/End: Original strand, 53996110 - 53996317
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  53996110 actgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataagcattccttcaaccatgtag 53996209  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||| |||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||| |  |||| ||| ||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  53996210 tcccatatctacatagcctcaggatccttctcattccgatgtgattcggttcctctaaaagttgttgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 53996309  T
Q  449 gaccactc 456  Q
    ||||||||    
T  53996310 gaccactc 53996317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 250 - 482
Target Start/End: Original strand, 24628972 - 24629208
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtc---ttgcttcaaccatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||| |||||||    
T  24628972 actgtggagttcttatggaacgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctaattcctttaaccatg 24629071  T
Q  347 tagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcacc 445  Q
     |||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  || |||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  24629072 cagtcccatacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctcaagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcacc 24629171  T
Q  446 ggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgtta 482  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||    
T  24629172 ggcgaccactcctgtccctcgttagccttaggtgtta 24629208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 44471320 - 44471466
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44471320 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtag 44471419  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||||||||||  | || |||| |||| |||| |||  ||||||||||    
T  44471420 tctcatacctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattc 44471466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 480
Target Start/End: Original strand, 23943237 - 23943464
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||   |    
T  23943237 actgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaatattttttataagtcttccttcaaccat---g 23943333  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |  ||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||||| |||||||| | |||  | |||||||    
T  23943334 tgacatacctaca-cgcctcaggatccctatcattttgatgtgattcggttcctctagaagctgtcaagagccgctcattgtcgtgcctcatacaccggc 23943432  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgt 480  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||    
T  23943433 gaccactctccgtcctcgtcatccttaggtgt 23943464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 24629428 - 24629662
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||| ||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||    
T  24629428 actgtggaattcttatggaacgaggtaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcattcctttaaccatgcag 24629527  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| |  ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| |  |||||| |||||||| | ||||||| ||||||    
T  24629528 tcccatacctacacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaagagccgctcattgtcgtgccttgtgaaccggc 24629627  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  24629628 gaccactcc-ccacctcgttagccttgggtgttaca 24629662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 49998781 - 49998636
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  49998781 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcag 49998682  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgatt 395  Q
    || ||| ||||||  | || ||||||||||| |||  |||||||||    
T  49998681 tcccatgcctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgatt 49998636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 257 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 27026640 - 27026414
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||    
T  27026640 agttcttatggaatgggctaccaaaaa-aagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagccttccttcaatcgtgtagtcccata 27026542  T
Q  357 cctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccact 455  Q
    ||| ||  ||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  | |||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27026541 cctgcaccgtc-caatatccctctcattctgatgtgattcggtttgcctaaaagctaccaggagtcgctcattgtcatgccttgtgcaccgacgaccact 27026443  T
Q  456 ccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    || ||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  27026442 ccccgttctcgtcagcctcgggcgttaca 27026414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 257 - 485
Target Start/End: Original strand, 31817854 - 31818083
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  31817854 agttcttatgaaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccgaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccata 31817953  T
Q  357 cctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagc-tgcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccact 455  Q
    | | ||||  ||||  ||||||||||||  |||||||||||  | | | |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  31817954 catgcatgacctcataatccctcttattccgatgtgattcgattcgaccagaagctttcgggatccgtttattgtcatgccttgtgcatcggcgatcact 31818053  T
Q  456 ccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    || | || ||||||  || |||||||||||    
T  31818054 ccccaccatcgtcaatctcgggtgttacaa 31818083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 14572176 - 14572291
Alignment:
Q  281 aaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14572176 aaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctcccttcaaccatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctct 14572275  T
Q  381 tattttgatgtgattc 396  Q
     |||  ||||||||||    
T  14572276 cattccgatgtgattc 14572291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 259 - 484
Target Start/End: Original strand, 9423862 - 9424088
Alignment:
Q  259 ttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacc 358  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||| |||||     
T  9423862 ttcttatggaatgggctactagaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattattataagccttctttcaaccatgcagtcccataca 9423961  T
Q  359 tacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactcc 457  Q
    | || |  |||||||||||||| |||  | |||||||||| | |||||||||  | ||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  9423962 tgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaagtcgtcgggagccactctttgtcgtgccttgtgcaccgacgaccactcc 9424061  T
Q  458 acgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
     ||||||||||  |  |||||||||||    
T  9424062 ccgccctcgtcttctgtgggtgttaca 9424088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 379
Target Start/End: Original strand, 7678617 - 7678746
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7678617 actgtggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 7678716  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctc 379  Q
     | |||||||||| || |||| ||||||||    
T  7678717 ccccatacctacaaggcctcaagatccctc 7678746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 280 - 473
Target Start/End: Original strand, 31817423 - 31817617
Alignment:
Q  280 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctc 379  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||| |||||||||| | || |  |||| ||||||||    
T  31817423 aaaagaagatgcattttgttggtataggtagtaccaaacaattattataaacgttccttcaaccatgaagtctcatacatgcacgacctcatgatccctc 31817522  T
Q  380 ttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagcct 473  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||  || ||||| ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  31817523 ttatttcgatgtgattctccttgtctaaaaattgtcgggaaccgctcattgtcatgccttgtgcactggtgaccactccccggcctcgtcagcct 31817617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 21067876 - 21067648
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21067876 actgtgaagttcttatggaatggactaccaaaaaaa---tgtatcttgttgatataggtagcaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcag 21067780  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||| ||||   |   ||| || |||||||||| | ||||| ||  || ||||||||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  21067779 tcccatacctgcacggcctcgggat---ttccattctggtgtgattcggttcgtctataatttgtcgggagccgctcattgtcgtgccttctgcaccggc 21067683  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  21067682 gaccactccccgccctcatca-acttgggtgttaca 21067648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35871772 - 35871627
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||    
T  35871772 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaa-atgcatcttgttgatataggtggtaccaaacaattcatataagccttccttcaaccatgaag 35871674  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || |||||||  | || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  35871673 tcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 35871627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 14571716 - 14571862
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||  |   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||    
T  14571716 actgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaaccatgaag 14571815  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || |||||||||| || |||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  14571816 tcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattc 14571862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 250 - 392
Target Start/End: Original strand, 15306086 - 15306234
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa------caattcttataagtcttgcttcaacc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||| |||||||||||||  ||| |||    
T  15306086 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtaccaaaattgctcaaatcttataagtcttctttcgacc 15306185  T
Q  344 atgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtg 392  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||    
T  15306186 atgtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattctgatgtg 15306234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 21067425 - 21067220
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||||||| ||| | |||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  21067425 tgtggagtacttttagaatgagctaccggaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaataattattattagtcttccttcaaccatgcagtc 21067326  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
    |||||| | || |  ||| |||||||||| |||  | |||||||||  | ||||| ||| || ||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||    
T  21067325 tcatacatgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattcgattcgtctataagttgtcgggagccgctcattatcgtgccttgtgcatcggcga 21067226  T
Q  451 ccactc 456  Q
    ||||||    
T  21067225 ccactc 21067220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4185860 - 4185624
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||  |    
T  4185860 actgtagagttcttgtagaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtggtatcaaacaattcttatatgtattcctttaaccatgccg 4185761  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtg-attcggcttgtctagaagctgc-gggagccgttcattgtcataccttgtgcaccgg 447  Q
    |||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||| |   |||||||||||   |||||  ||||| ||||  |||||||| ||     
T  4185760 tctcatacctgcatggcctcatgaaccctctcattttgatgtgaattcggttcacctagaagctgctatgagccactcattttcatgtcttgtgcaacga 4185661  T
Q  448 cgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||| |||||| | |||| |||||||| ||| ||||||    
T  4185660 cgatcactcccctcccttgtcagcctcgggcgttaca 4185624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17028989 - 17028801
Alignment:
Q  280 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctc 379  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || | ||||||| ||| |||| ||||| | || ||  ||||||||||||    
T  17028989 aaaataagacgcatcttgttgatataggtagcacctaacaattcttacaaatcctccttcaactatgcagtcccatacatgcaaggcttcaggatccctc 17028890  T
Q  380 ttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgc-gggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgt 467  Q
    | |||  |||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17028889 tcattccgatgtgattcagtttgcctagaagctgcaaggagcctctcattgtcatgccttgtgcaccgccgaccactacacgtcctcgt 17028801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 396
Target Start/End: Original strand, 23350285 - 23350424
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||    
T  23350285 agttcttatggaaggagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggaagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtccccta 23350384  T
Q  357 cctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||  | || |||| |||| |||| |||  ||||||||||    
T  23350385 cctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattc 23350424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 329
Target Start/End: Original strand, 50814820 - 50814899
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 329  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50814820 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataa 50814899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 306 - 431
Target Start/End: Original strand, 53854858 - 53854984
Alignment:
Q  306 ggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtct 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||| |||  |||||||||||| | ||||    
T  53854858 ggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatatagtctcatacctacactgcttcatgatccctctcattccgatgtgattcggttcgtct 53854957  T
Q  406 agaagctg-cgggagccgttcattgtc 431  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  53854958 ataagctgtcgggagccgctcattgtc 53854984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42838763 - 42838642
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactacc-aaaaagaa-gatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctca 354  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42838763 agttcttatggaatgaactatcgaaaaagaaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaacaatttttatacgtcttccttgaactatgtagtctca 42838664  T
Q  355 tacctacatggtctcaggatcc 376  Q
    ||| ||||  ||||||||||||    
T  42838663 tacttacacagtctcaggatcc 42838642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 279 - 393
Target Start/End: Original strand, 23976243 - 23976357
Alignment:
Q  279 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccct 378  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || | ||||||||||||| | |||||  |||    
T  23976243 aaaaagaagatgcatcttgttagtataggtagtaccaaacaattcttataactcttccttcaatcatgcagacccatacctacatggccccaggaaacct 23976342  T
Q  379 cttattttgatgtga 393  Q
    || |||| |||||||    
T  23976343 ctcatttcgatgtga 23976357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 355
Target Start/End: Original strand, 13613893 - 13613997
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||    
T  13613893 actgtggagttcttatagaatgaactaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtggtatcaaacaattcttataagtactccttctaccatggag 13613991  T
Q  350 tctcat 355  Q
    ||||||    
T  13613992 tctcat 13613997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33765003 - 33764876
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||| |||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  33765003 tgtgaagttcttataaaatgagctacaaaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagcaccaaacaattcttaaaagtcttcatccaaccatgtagtc 33764904  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctc 379  Q
    | ||||   || |||| |||||||||||    
T  33764903 ttatacacgcacggtcccaggatccctc 33764876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 345
Target Start/End: Original strand, 44470870 - 44470964
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccat 345  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  44470870 actgtggagttcttatggaatgagttacgaaca-gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccat 44470964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 385
Target Start/End: Original strand, 43928961 - 43929093
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||  |||||    
T  43928961 tgtggatttcttatgaaata-actaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaacaattcttgtaagctttccttcgaccaaatagtc 43929059  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattt 385  Q
    |||||||| || ||  |||||| |||||| ||||    
T  43929060 tcatacctgcacggcttcaggaaccctctcattt 43929093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17628656 - 17628560
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatg 346  Q
    |||||||| |||||||||  ||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17628656 actgtggaattcttatgggttgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagcctaccttcaaccatg 17628560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 359
Target Start/End: Original strand, 24271552 - 24271654
Alignment:
Q  256 gagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24271552 gagttcttatggaatgggctacccaaaa-aatatgcatcttgttcgtataggtagtatcaaataattcttatatgtcttactttaaccatgtagtctcat 24271650  T
Q  356 acct 359  Q
    ||||    
T  24271651 acct 24271654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 398
Target Start/End: Original strand, 27578904 - 27579052
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||||||||||  |  ||||  |||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  27578904 actgtgtagttcttatggatagggctactgaaaagaagatgtgtctaattgatatatgtagtaccaaacaattcttataagtcttcagtcaaccaagtag 27579003  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    | ||||||||||| |   | | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  27579004 tgtcatacctacacgactttaagatccctcttattccgatgtgattcgg 27579052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41870033 - 41869957
Alignment:
Q  280 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  41870033 aaaagaagatgcgtcttgttgatataggtagtatcatacaattcttataagtcttccttcaatcatgcagtcccata 41869957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4186312 - 4186205
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||  || ||| || ||| |||    
T  4186312 actgtgtagttcttatgcaatgggctaccaaaaagaagatgaatcttgttcatgtaggtagtaccaaatcattcttataagcattcctttaaacatttag 4186213  T
Q  350 tctcatac 357  Q
    ||||||||    
T  4186212 tctcatac 4186205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17029475 - 17029368
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||| ||    
T  17029475 actgtggagttcttatggaataaggtaccaaaagtaatatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattattacaagtcttcattcaactatgcag 17029376  T
Q  350 tctcatac 357  Q
    || |||||    
T  17029375 tcccatac 17029368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 359
Target Start/End: Original strand, 52048662 - 52048770
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||| | ||| ||    
T  52048662 actgtggagttcttatggaatg-acttacaaaatgaagatgcatcttgttagtatacgtagtatcaaacaattcttataaattttccttcagctatgcag 52048760  T
Q  350 tctcatacct 359  Q
    | ||||||||    
T  52048761 tttcatacct 52048770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 457
Target Start/End: Original strand, 26200304 - 26200491
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag--tcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcag 371  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||  ||| ||||||||||   | ||||    
T  26200304 ctaccacaaagaatatgcatcttgtttgtatagttagtatcaaacaattgttataagcctcttccttcaaccatgatgtcccatacctacacaatatcag 26200403  T
Q  372 gatccctcttattttgatgtg-attcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactcc 457  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||   | ||||  || || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26200404 gatccctctcattctgatgtgaattcagtttgcctagaagctgttagaagccactctttatcatgccttgtgcaccgacgaccactcc 26200491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Original strand, 27578456 - 27578531
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 329  Q
    ||||||||||||||  ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27578456 tggagttcttatggtttgggataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagcaccaaataattcttataa 27578531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Original strand, 23091506 - 23091584
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttata 328  Q
    ||||||||||| |||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23091506 actgtggagtttttatagaataagctaccagaaagaagatgcatcttgttaatatatgtagtaccaaacaatttttata 23091584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 330
Target Start/End: Original strand, 20306191 - 20306236
Alignment:
Q  285 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20306191 aagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataag 20306236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34554567 - 34554494
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 330  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34554567 agttcttatggaatggtctaccaaaaataaaatgcatcttgctggtataggtagtgtcaaacaattcttataag 34554494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Original strand, 2499647 - 2499719
Alignment:
Q  308 tagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||| | || ||||||||    
T  2499647 tagtaccaaacaatttttataagtgttgcttcaaccatgaagtctcatacctgcacggttttagaatccctct 2499719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17629084 - 17628948
Alignment:
Q  279 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccct 378  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  | || ||||||| || |  || ||||||||     
T  17629084 aaaaagaagaggcatcttattagtataggtagtaccaaacaattcttataagtttttattcaaccatacattcacatacctgcacgaccttaggatccca 17628985  T
Q  379 cttattttgatgt-gattcggcttgtctagaagctgc 414  Q
    || ||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  17628984 ctcattctgatgtggattcgatttgcctagaagctgc 17628948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44831142 - 44831035
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||| |||| ||||  ||||| ||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||     
T  44831142 actgtgaagttcatatgaaatgggctaccgaaaagaatatacatcttgttagtttaggtagtaccaaacaatttttataagcttcccttcaaccatgtaa 44831043  T
Q  350 tctcatac 357  Q
    ||||||||    
T  44831042 tctcatac 44831035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9882723 - 9882612
Alignment:
Q  279 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccct 378  Q
    ||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| | ||||||| | | || ||||||| ||||| |    
T  9882723 aaaaagaagatgcattttattaggataggtagtaccaaa--attcttataagtttttcttcaaccatcttgtctcatgcttgcacggtctcatgatccgt 9882626  T
Q  379 cttattttgatgtg 392  Q
    || |||||||||||    
T  9882625 ctcattttgatgtg 9882612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13266207 - 13266085
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||| || ||  | | ||    
T  13266207 ctaccgaaaataagatgcatcttattgatatagggagtactaaaaaattattataagccttccttcaaccatgcattcccatacctgcacggctttaaga 13266108  T
Q  374 tccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||||||| ||| | |||||||||    
T  13266107 tccctctcattctaatgtgattc 13266085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 320
Target Start/End: Original strand, 39902478 - 39902518
Alignment:
Q  280 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39902478 aaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaa 39902518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 53392009 - 53391925
Alignment:
Q  273 actaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatac 357  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  53392009 actaccgaaaaaaatatgtatcttgttgatatagatggtatcaaacaatttttataagcatttcttcaaccatgcagtctcatac 53391925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17506484 - 17506389
Alignment:
Q  296 tgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || || |||| | |||||||| | ||||  |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  17506484 tgttgatataggtagtactatacaattcttataagtcttcttttaatcatgcactctcatacatgcatgacctcatgatccctctcattctgatgt 17506389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 486
Target Start/End: Original strand, 33987160 - 33987303
Alignment:
Q  344 atgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgc 442  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||| |||  |||||||||| | ||| |||||||||| |  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  33987160 atgtagtcacatacctgcacgatctcatgatccctctcattccgatgtgattcagtttgcctagaagctgccaagagtcgctcattgtcatgccttgtgc 33987259  T
Q  443 accggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaac 486  Q
    || | |||||||||| |  ||||| |||||| ||  ||||||||    
T  33987260 actgacgaccactcctcatcctcgccagcctcggacgttacaac 33987303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45682321 - 45682242
Alignment:
Q  277 ccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||||||| ||||    
T  45682321 ccaaaaagaaaatgcatcttgttggtatagataataccaaataattcttataaaccttcattcaatcatgtagtcccata 45682242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Original strand, 33294886 - 33294936
Alignment:
Q  249 tactgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgtt 299  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33294886 tactgtggagttcttatggagtgaactacaaaaaagaagatgcattttgtt 33294936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 10165927 - 10165873
Alignment:
Q  430 tcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  10165927 tcatgccttgtgcatccgcgaccactccccaccctcgtcagccttgagtgttaca 10165873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 398
Target Start/End: Original strand, 20309599 - 20309661
Alignment:
Q  336 cttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  20309599 cttcaaccatgtagtcacatacctgcaaagtctcatgatccctctcattccgatgtgattcgg 20309661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 310 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 17506016 - 17505916
Alignment:
Q  310 gtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaa 409  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||  || ||||||  |||||||||| | |||| ||||| ||||  ||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  17506016 gtactaaacaatttttataagacttcatttaaccatacagtctcatacgtgcatgatctcatgatctatcttattttgatgtggtttggttcgtctagaa 17505917  T
Q  410 g 410  Q
    |    
T  17505916 g 17505916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 6747599 - 6747834
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  6747599 actgtggagtttttatggaataggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttcaaccatgtag 6747698  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6747699 tatcatacctacacggcctcaggatccctctcattccaatgtgattcagcttgtctagaagttgtcgggagccgctcattgtcatgccttgtgcaccggc 6747798  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6747799 gaccactccctgccctcgtcagccttgggtgttaca 6747834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 34405592 - 34405827
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34405592 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcctgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 34405691  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || || ||||||||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  34405692 tcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 34405791  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34405792 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 34405827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 42515689 - 42515455
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42515689 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacacttcttataagccttccttcaaccatgtag 42515590  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||   |||||||||    
T  42515589 tctcatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattcggttcgtctagaagctgtcgggagctgctcattgtcacgccccttgcaccggc 42515490  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  42515489 ga-cactccctgccctcgtcagccttgggtattaca 42515455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 254 - 484
Target Start/End: Original strand, 2611657 - 2611888
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  2611657 tggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgttatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttccaccatatagtctc 2611756  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacc 452  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| |||  |||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2611757 atacctacatgacctcaggacccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgacc 2611856  T
Q  453 actccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  2611857 actccccaccctcgtcagcctttggtgttaca 2611888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 35474122 - 35474357
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35474122 actgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtactaaacaattcttataagtctttcttcaaccatgtag 35474221  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| |  || ||||||||||| |||  | ||||||||| ||  |||||||| || ||||| ||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  35474222 tctcatacctacacgacctaaggatccctctcattccggtgtgattcgactgttctagaagttgtcgggaaccgctcattgtcgtgccttgtgcaccgac 35474321  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  35474322 gaccactccccgcactcatcagccttaggtgttaca 35474357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 679961 - 679727
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  679961 actgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtacc-aacaattcttataagccttccttcagccatgtac 679863  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||| | |||||||| | | ||||||| ||||    
T  679862 tcccatacctacacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattcagttcctctagaagctgtcgggagcagctcattgtcgtgctttgtgcatcggc 679763  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  679762 gaccactccccgtcctcgtcagccttaggtgttaca 679727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 250 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 36422397 - 36422163
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36422397 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 36422298  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || || ||||||||||| |||  |  ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  36422297 tcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 36422198  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttac 483  Q
    ||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  36422197 gaccactccccatcctcgtcggtcttgggtgttac 36422163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 250 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 46425886 - 46425713
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  46425886 actgtggagttcttatggaataagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattcttataagccttatttcaaccatgtag 46425787  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccg 422  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46425786 tcccatacctacatggtctcaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagctgtcgggagccg 46425713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2189289 - 2189054
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  2189289 actgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtgccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgcag 2189190  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || || |||| ||  | ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  2189189 tcccacacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 2189090  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2189089 gaccactccccgccctcgtcatccttgagtgttaca 2189054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 274 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 43233534 - 43233323
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||| || |||| ||    
T  43233534 ctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagtcttcctttaaccatacagtcacatacctacacggcctcatga 43233435  T
Q  374 tccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagcc 472  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| |  |||||||||||   ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43233434 tccctctcatttcggtgtgattcggttcctctagaagctgttaggagccgctcattgtcgtgccttatgcaccggcgaccactcctcgcactcgtcagcc 43233335  T
Q  473 ttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||||||    
T  43233334 ttgggtgttaca 43233323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28495999 - 28495790
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28495999 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacagttcttataagccttccttcaaccatgtag 28495900  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||| ||||||||| |||  |||||||||||  |  |||||||| ||  |||||||| | |||||  | ||||||||||||||    
T  28495899 tcccatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagttgttgggagccgctaattgttgtgccttgtgcaccggc 28495800  T
Q  449 gaccactcca 458  Q
    ||||||||||    
T  28495799 gaccactcca 28495790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 42515237 - 42515091
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  42515237 actgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaatcatgcag 42515138  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  42515137 tctcatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 42515091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2193401 - 2193209
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  2193401 actgtggagttcctatgaaatgagctaccgaatagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 2193302  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtg 441  Q
    || ||||||| || |||||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  2193301 tcccatacctgcacggtctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgttcattgtcgtgccttgtg 2193209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 2941758 - 2941904
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||    
T  2941758 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttatcagccttccttcaaccatgcag 2941857  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || |||||||  | || |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2941858 tcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattc 2941904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 398
Target Start/End: Original strand, 6719079 - 6719223
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |    
T  6719079 tggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaaccatgtagtccc 6719178  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  6719179 atacctacacagcctcaggatccctctcattccaatgtgattcgg 6719223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 485
Target Start/End: Original strand, 26957603 - 26957794
Alignment:
Q  295 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgat 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  26957603 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgtagttccatacctacacagcctcaagatccctctcattccgatgtgat 26957702  T
Q  395 tcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||| |  |||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26957703 tcggttcctctagaagttgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccgacgaccacttcccgccctcgtcggcctttggtgttacaa 26957794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 250 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2466069 - 2465949
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2466069 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcaacttgttgatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccatgtag 2465970  T
Q  350 tctcatacctacatggtctca 370  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  2465969 tcccatacctacatggcctca 2465949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 413
Target Start/End: Original strand, 28495609 - 28495772
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28495609 actgtggagttcttatggaatgagctacctaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaaaactcaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtag 28495708  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg 413  Q
    || |||||||||| |  |||||||||||||| |||  |||| ||||||  |  |||||||||||    
T  28495709 tcccatacctacacgacctcaggatccctctcattccgatgggattcgattcctctagaagctg 28495772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 13125137 - 13125267
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  13125137 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 13125236  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    || ||||||| || || |||| |||||||||    
T  13125237 tcccatacctgcagggcctcaagatccctct 13125267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 256 - 484
Target Start/End: Original strand, 29039027 - 29039248
Alignment:
Q  256 gagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||    
T  29039027 gagttcttatggaatggattatcaaaaagaagatgcatgttgttgatataggtagtaccaaacaattcttgtaagcctccattcaaccatgtagtcacat 29039126  T
Q  356 acctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccact 455  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |||  |||||||||||| || | |        ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  29039127 atctacacggcctcaggatgcctctcattccgatgtgattcggtttctgt--------cgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgatcact 29039218  T
Q  456 ccac-gccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    || | |||| | |||||| |||||||||||    
T  29039219 cccctgcccccatcagccgtgggtgttaca 29039248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 250 - 476
Target Start/End: Original strand, 35527122 - 35527348
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||   ||    
T  35527122 actgtggagttcctatggaatggactactgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagcaccaaacaattcttataagccttctttcaaccaaccag 35527221  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||  | || |  ||| |||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||| | |  ||||||||||| |    
T  35527222 tcccatatttgcacgacctcgggatccctctcatttcggtgtgattcggttcgtctagaagctgttgggagccgctcattg-cgtgtcttgtgcaccgac 35527320  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgg 476  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  35527321 gaccactccccgtcctcgtcagccttgg 35527348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 9125104 - 9124958
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||  ||    
T  9125104 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttcctttaaccatacag 9125005  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||||||||| || || |||| |||| |||| |||  ||||||||||    
T  9125004 tctcatacctgcacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattc 9124958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2465878 - 2465777
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2465878 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccatgtag 2465779  T
Q  350 tc 351  Q
    ||    
T  2465778 tc 2465777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 25182506 - 25182341
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  25182506 actgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaataagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcag 25182407  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggc-ttgtctagaagctgc 414  Q
    |||||||| | ||  ||||||||||| |||| |||  ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  25182406 tctcatacttgcacagtctcaggatctctctcattccgatgtgactcgtctttgcctagaagctgc 25182341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 29357457 - 29357692
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||| || |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||    
T  29357457 actgtgtagttcttatgaaacgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaacaattcttataaacattccttcaaccatgcag 29357556  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || |  ||| |||| ||||| | || | |||||||| | |  |||||||| || ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||||    
T  29357557 tcccatacctgcacgacctcgggatacctctca-ttcggtgtgattcagttcatctagaagttgtcgggagccgctcattgtcgtgccttatgcatcggc 29357655  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29357656 gaccattttacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 29357692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 11517390 - 11517535
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||    
T  11517390 actgcggagttcttatggaatgagctaccgaaaagtagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttc-accatgcag 11517488  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || |||||||  | || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  11517489 tcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 11517535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 280 - 441
Target Start/End: Original strand, 22529266 - 22529428
Alignment:
Q  280 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctc 379  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22529266 aaaagaagatgcatcttgtttatatagatagtaccaaacatttcttataagccttccttcaaccatgtaggcccatacttacatgacctcaggatccctc 22529365  T
Q  380 ttattttgatgtgattcggcttgtctagaagc-tgcgggagccgttcattgtcataccttgtg 441  Q
    | |||  ||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  22529366 tcattcggatatgattcggttcgtctagaagcaggcgggagccgctcattgtcacgccttgtg 22529428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 311 - 485
Target Start/End: Original strand, 3305374 - 3305549
Alignment:
Q  311 taccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaag 410  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  3305374 taccaaacaattctcataagccttcattcaaccatgtagtcccatacttacacggcctcaggatccccctcatttcgatgtgattcggttcctctagaag 3305473  T
Q  411 ctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||| ||||||| | |||||||| | |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  3305474 ctgtcgggagctgctcattgtcgtgccttatccaccggcgaccactctccgccctcgtcagccttatgtgttacaa 3305549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 393
Target Start/End: Original strand, 26421306 - 26421449
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  26421306 actgtggagttcttatggaatggactaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtagtatcaagcaattcttataagtcttccttcaaccatactg 26421405  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtga 393  Q
     | ||||||||||||| |||| || |||| | ||| ||||||||    
T  26421406 acccatacctacatggcctcaagaaccctatcattctgatgtga 26421449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 353 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2463684 - 2463549
Alignment:
Q  353 catacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgcg-ggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgac 451  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||| ||||| |  |||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2463684 catacctacatggcctcaggaaccctctcattccggtgtgtttcggttcctctagaagctgttaggagccgttcattgtcgtgccttgtgcaccggcgac 2463585  T
Q  452 cactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaaca 487  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2463584 cactccccgccctcgtcagccttgggtgttacaaca 2463549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 358
Target Start/End: Original strand, 5406589 - 5406697
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  5406589 actgtggagttcttatggtttgggcaaccaaaaataagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattcttataaatcttccttcaaccatgcag 5406688  T
Q  350 tctcatacc 358  Q
    || ||||||    
T  5406689 tcccatacc 5406697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 397
Target Start/End: Original strand, 31406585 - 31406732
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||  ||    
T  31406585 actgtggagttcttatgaaacgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaacaccaaacaattctaataagtcatctttcaaccattcag 31406684  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcg 397  Q
    || || | || || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31406685 tcccagatctgcacggcttcaggatccctctcattttgatgtgattcg 31406732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 357
Target Start/End: Original strand, 26421761 - 26421868
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| ||    
T  26421761 actgtgtagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagattcatcttgttggtatagggagtacctaacaattcttatgagccttacttcaaccatgcag 26421860  T
Q  350 tctcatac 357  Q
    ||||||||    
T  26421861 tctcatac 26421868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18833431 - 18833285
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||| ||    
T  18833431 actgtggagttcttatgtaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcatataagctttccctcaaccatgcag 18833332  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |  |||||||  | || ||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  18833331 ttccatacctgtacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgattc 18833285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9623352 - 9623248
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||    
T  9623352 actgtggagttcttatagaatgaactaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtggtatcaaacaattcttataagtactccttctaccatggag 9623254  T
Q  350 tctcat 355  Q
    ||||||    
T  9623253 tctcat 9623248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Original strand, 31743834 - 31743930
Alignment:
Q  259 ttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  31743834 ttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagcaccaaaccattcttataagcattccttcaaccatgcagtctcat 31743930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 357
Target Start/End: Original strand, 36015412 - 36015519
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||    
T  36015412 actgtgaagttcttatggaatgggctatttaaaagaagaggcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttttaagctttccttcaaccatggag 36015511  T
Q  350 tctcatac 357  Q
    ||||||||    
T  36015512 tctcatac 36015519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 10430806 - 10430673
Alignment:
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||| ||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  10430806 tcatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgatacggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 10430707  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10430706 ccactccccgccctcatcagccttgggtgttaca 10430673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 484
Target Start/End: Original strand, 16811900 - 16812074
Alignment:
Q  303 ataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttg 402  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||        ||| ||| ||||||||||||| ||     
T  16811900 atagatagtacaaaacaattcttataagcattccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcatc--------tctcattctgatgtgattcggtttc 16811991  T
Q  403 tctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  16811992 tttagaagccgtcgggagccgctcattggcgtgtcttgtgcaccggcaaccactccccgccctagtcagccttggatgttaca 16812074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16192457 - 16192385
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 329  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16192457 agttcttatggaatgggctaccaaaacgaagatgcatcttgttgatgtaggtaataccaaacaattcttataa 16192385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20966196 - 20966076
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||| || || |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||| ||    
T  20966196 actgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaataatatacatcttgttggtataggtattacaaaataattcttataagtcatccttcaatcatgcag 20966097  T
Q  350 tctcatacctacatggtctca 370  Q
    ||||||||||| |||| ||||    
T  20966096 tctcatacctagatggcctca 20966076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11372592 - 11372481
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | | ||    
T  11372592 tggagttcttatggtttgagctaccaaaaataacatgcatcatgttggtacaggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatacaatttc 11372493  T
Q  354 atacctacatgg 365  Q
    ||||||||||||    
T  11372492 atacctacatgg 11372481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11373020 - 11372901
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||    
T  11373020 ctacgaaaaagaagactcatcttgttggtatagatactatgaaacaattcttacaagtcttcattcaaccatgcaatctcatacctacatggccttagga 11372921  T
Q  374 tccctcttattttgatgtga 393  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  11372920 accctctcattttgatgtga 11372901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2189557 - 2189510
Alignment:
Q  437 ttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2189557 ttgtgcaccggcgaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 2189510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1628854 - 1628765
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatg 346  Q
    |||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||    
T  1628854 tggagttcttatggtatgggcttcaaaaaagaagatgcatcttgttgatatcgatagtaccaaacaa---ttataagcctttcttcaaccatg 1628765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6585731 - 6585647
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatctt--gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||    
T  6585731 ctaccaaaaggaagatgtatcttttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataagtcttctttcaatcatgcaatctcata 6585647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 323
Target Start/End: Original strand, 7461352 - 7461424
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 323  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  7461352 actgtagagttcttatg-aatgaactaccaaaaagaagatgtatcttgtttatatagttagtatcaaacaattc 7461424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 311
Target Start/End: Original strand, 13122506 - 13122567
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13122506 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatatatgtagt 13122567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33316832 - 33316764
Alignment:
Q  291 catcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacct 359  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  33316832 catcttgttgatataagtattgtcaaacaattcttataatttttccttcaaccatgtagtctcatacct 33316764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 380
Target Start/End: Original strand, 13124757 - 13124832
Alignment:
Q  305 aggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| || || |||| |||||||||    
T  13124757 aggtagtaccacacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaagatccctct 13124832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37672305 - 37672162
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| | |||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||  |||  | |||||||| ||    
T  37672305 actgtgtatttcttatgaaatcaactaacaaaaagaagttgcatcttgttggtacaagtagtaccaaacaattattataaacctttttgcaaccatgcag 37672206  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtga 393  Q
    ||| |||||| || ||| | | || |||||| ||| ||||||||    
T  37672205 tcttatacctgcacggtgtgatgacccctctcattatgatgtga 37672162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Original strand, 7646479 - 7646528
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgtt 299  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7646479 actgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 7646528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16812193 - 16812143
Alignment:
Q  435 ccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  16812193 ccttgtgcaccggcaaccactccccgccctagtcaaccttggatgttacaa 16812143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 16451934 - 16452170
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16451934 actgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagctttccttcaaccatgtag 16452033  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || | |||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  16452034 tcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 16452133  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16452134 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttacaa 16452170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 16461087 - 16461323
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16461087 actgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagctttccttcaaccatgtag 16461186  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || | |||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  16461187 tcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 16461286  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16461287 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttacaa 16461323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 43057524 - 43057759
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43057524 actgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 43057623  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  43057624 tctcatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctaaaagctgtcgggagccgctcattggcatgccttgtgcaccggc 43057723  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43057724 gaccattccccgccctcttcagccttgggtgttaca 43057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20054081 - 20054316
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20054081 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 20054180  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20054181 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20054280  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20054281 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 20054316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20054537 - 20054772
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20054537 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 20054636  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20054637 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20054736  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20054737 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 20054772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20054993 - 20055228
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20054993 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 20055092  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20055093 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20055192  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20055193 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 20055228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20055449 - 20055684
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20055449 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 20055548  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20055549 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20055648  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20055649 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 20055684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20055905 - 20056140
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20055905 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 20056004  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20056005 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20056104  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20056105 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 20056140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20056361 - 20056596
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20056361 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 20056460  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20056461 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20056560  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20056561 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 20056596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20057264 - 20057499
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20057264 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 20057363  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20057364 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20057463  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20057464 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 20057499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 52250351 - 52250116
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  52250351 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcgaccatgtag 52250252  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||| ||||||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  52250251 tcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 52250152  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  52250151 gaccgctccccgccctcgtcagccttgggtattaca 52250116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20845662 - 20845897
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20845662 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaacaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 20845761  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |||||||||| || || ||||||| || ||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20845762 tctcatacctgcacggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20845861  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20845862 gaccactccccgtcctcgtcagccttgggtgttaca 20845897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20057720 - 20057955
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  20057720 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgcag 20057819  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||| | |||||||| | |  |||||||||||   ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20057820 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcatttcggtgtgattcagttcctctagaagctgttaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20057919  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20057920 gaccactccccgccctcgtcaaccttgggtgttaca 20057955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 43057066 - 43057300
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  43057066 actgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttctaagccttccttcaaccatgtag 43057165  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || || |||||||| || ||| ||||||||||||| |  |||||||  || |||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  43057166 tcacatacctacacggccttaggatccc-ctcattctgatgtgattcggttcctctagaaattgtcgggagtcgctcattgtcatgccttgtgcaccggc 43057264  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43057265 aaccactccccgtcctcgtcagccttgggtgttaca 43057300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 252 - 487
Target Start/End: Original strand, 30872953 - 30873190
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||    
T  30872953 tgtggagttcttatagaatggactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttaaaagtcttccttcaaccatacagtc 30873052  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgac 451  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||  | |||||||||| | ||||||||  ||  | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  30873053 tcatacctgcacggcctcagaatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaaattgtcgaagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccgacgac 30873152  T
Q  452 cactcca--cgccctcgtcagccttgggtgttacaaca 487  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30873153 cactccacgcgccctcgtcagccttggatgttacaaca 30873190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 38341051 - 38340816
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  38341051 actgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaatgaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 38340952  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| || ||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | | ||||| |||||||| | |||||||||||||     
T  38340951 tcccatacctgcacggcctcaggaaccatctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcagtagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggt 38340852  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38340851 gaccactccccaccctcgtcagccttgggtgttaca 38340816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 20056817 - 20057043
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||    
T  20056817 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctcataagccttccttcaaccctgcag 20056916  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||         ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20056917 tcccatac---------ctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 20057007  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20057008 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 20057043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 31822664 - 31822899
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31822664 actgtggagttcttttggattgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatatatgtagtaccaaataattcttataaatcttccttcaaccatgtag 31822763  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||| || |  |||||||||||  |||||||| ||||| || | |||| |||||| ||    
T  31822764 tctcatacctacacggcctcatgatccctctcattctgatgtgatttggttgctctagaagctgttgggagccgctcattatcgtgccttctgcaccagc 31822863  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  31822864 gaccgctcctcgccatcgtcagccgtgggtgttaca 31822899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 449
Target Start/End: Original strand, 50002712 - 50002908
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    |||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  50002712 tggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtccc 50002811  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcg 449  Q
    || |||||| || ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  50002812 atgcctacacggcctcaggatctctctcattccgatgtgattcggctcctctagaagatgtcgggagccgctcattgtcatgccttgtgcatcggcg 50002908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 250 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 12883669 - 12883438
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  12883669 actgtggagtttttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtattccttcaatcatgcag 12883570  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| ||  | ||| |||||| ||| |||  | |||||||||| | |||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  12883569 tcccatacctgcacagcctcgggatccatctcattccggtgtgattcggttcgtctagaagctgtcgagagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccgac 12883470  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgt 480  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||| ||||    
T  12883469 gaccactcaccaccctcgttagccttgagtgt 12883438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 7548234 - 7548003
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||    
T  7548234 tgtggagttcttatcaaatgggctaccaaaaagaatatgcatcttgttgatatagttaataccaaacaatttttataagtcttcctttaatcatgtagtc 7548135  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||| |||   ||||||||| | |||||  |||| || | |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  7548134 tcatacctacacggcctcatgatccctctcattgcaatgtgattcagtttgtc--gaagttgtcaggagccgttcattgtcgtgccttgtgcaccggtga 7548037  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
     ||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  7548036 tcaccccccgccctcgtcagtcctgggtgttaca 7548003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 398
Target Start/End: Original strand, 50002286 - 50002434
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50002286 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 50002385  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    || ||| |||||| || |||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  50002386 tcccatgcctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcgg 50002434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 50003076 - 50003311
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  50003076 actgtgaagttcttttggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattattataagtctccctttaaccatgcag 50003175  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||||| |    
T  50003176 tcctatacctgcatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctttagaagctgtcgggagccgcacattatcatgccttttgcaccgac 50003275  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||    
T  50003276 gaccactctctgccctcgtcagccttaggtattaca 50003311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 20061192 - 20061338
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  20061192 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcag 20061291  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20061292 tcccatacctgcacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattc 20061338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12728137 - 12727988
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagt-accaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12728137 actgtggagttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggcagtaaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtt 12728038  T
Q  349 gtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    ||| ||||||||||  ||||||| |||||| | ||||  |||||||||||    
T  12728037 gtcccatacctacacagtctcagaatccctttcatttcaatgtgattcgg 12727988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 396
Target Start/End: Original strand, 35760920 - 35761061
Alignment:
Q  255 ggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctca 354  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||    
T  35760920 ggagttctcatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagtctca 35761019  T
Q  355 tacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||||| || || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  35761020 tacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 35761061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 51372875 - 51373110
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||    
T  51372875 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaataagatgcatcttgtcgatataggtagtactaaacaattcttataagccttccttcaaccatacag 51372974  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||  |||| ||| |||||||||| ||| |  ||||||| ||   ||||||||| || |||||| || |||||||| | |||| ||||| |||    
T  51372975 tcacatacctgtatggcctcgggatccctctcattctagtgtgatttggtacgtctagaagatgtcgggagtcgctcattgtcgtgccttatgcactggc 51373074  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
     |||||||  || ||||||||| |||||||||||||    
T  51373075 aaccactcttcgtcctcgtcagtcttgggtgttaca 51373110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 250 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2328460 - 2328351
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  2328460 actgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 2328361  T
Q  350 tctcatacct 359  Q
    || |||||||    
T  2328360 tcccatacct 2328351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 279 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10820708 - 10820501
Alignment:
Q  279 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccct 378  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| ||||  | ||||  ||||||    
T  10820708 aaaaaaaagatgtatcttattgatataggtagtaccaaacaattcttataaatcttccttcaaccatgtagtccaatacatacaccgcctcataatccct 10820609  T
Q  379 cttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttggg 477  Q
    || | |  |||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  10820608 ctcactccgatgtgattcggttcatctagaagttgtcggtagccgttcattgtcatgctttgtgcaccggcgaccacttcccatcctcgtcagccttggg 10820509  T
Q  478 tgttacaa 485  Q
    || |||||    
T  10820508 tggtacaa 10820501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 257 - 396
Target Start/End: Original strand, 35759616 - 35759755
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||    
T  35759616 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagtcccata 35759715  T
Q  357 cctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  35759716 cctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 35759755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2635069 - 2634864
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||    
T  2635069 actgtggagttcttattgaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttatgagttatccttcaaccatgcag 2634970  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgc-gggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| ||    |||| ||||||||| |||  |||||||||||  ||| ||||||| |||  ||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  2634969 tcccatacctgcacaacctcatgatccctctcattccgatgtgattcgatttgcctagaagttgctaggagccacacattgtcatgccttgtgcaccggc 2634870  T
Q  449 gaccac 454  Q
    ||||||    
T  2634869 gaccac 2634864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16907375 - 16907175
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    |||||||||| | ||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||    
T  16907375 tggagttcttgtagaatggaccactgaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgcagtttc 16907276  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacc 452  Q
    |||||| ||  ||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  16907275 atacctgcacagtctcaaaatccctctcattttgatatgatttggtttgcctagaagctgccaggagccgctgattgtcatgtcttgtgcactggcgacc 16907176  T
Q  453 a 453  Q
    |    
T  16907175 a 16907175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Original strand, 20060341 - 20060421
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 330  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060341 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20060421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 345
Target Start/End: Original strand, 46693736 - 46693831
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccat 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  46693736 actgtggagttattatgaaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataagccttccttcaaccat 46693831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 357
Target Start/End: Original strand, 16440587 - 16440687
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  16440587 agttattatagaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttgttatcggtagtagcaaacagttcttataagtctttcttcaaccatgtattcccata 16440686  T
Q  357 c 357  Q
    |    
T  16440687 c 16440687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 23180873 - 23180745
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||    
T  23180873 tgtggaattcttatggaatgggctagcgaatagaagatacatcttgttgatataggtagtaccaagcaattcttataatcattccttcaaccacgtagtc 23180774  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
     ||| |||||| ||  ||| |||||||||    
T  23180773 ccattcctacacggcttcaagatccctct 23180745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2739660 - 2739557
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||    
T  2739660 agttcttatggaatagactataaaaaagaagatacatattgttgatatatgtagtgctaaacaattcttataagtctttccttaaccatacagtctcata 2739561  T
Q  357 ccta 360  Q
    ||||    
T  2739560 ccta 2739557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 2634604 - 2634448
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    ||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||| || |||| | |||||||    
T  2634604 agttcttattgaatagactatcgaaaagaagatgcatcttgtttgtatagctagtaccaaacaattcttgcaagccttcctttaatcatgcaatctcata 2634505  T
Q  357 cctacatggtctcaggat-ccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct 412  Q
    | ||||    |||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  2634504 catacacaacctcaggatcccctctcatttcgatgtgattcggttttcctagaagct 2634448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Original strand, 31823097 - 31823161
Alignment:
Q  262 ttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 326  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31823097 ttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcattttattgatataggtagtaccaaataattctta 31823161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 385
Target Start/End: Original strand, 842962 - 843069
Alignment:
Q  278 caaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccc 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| | | ||| |||||| |||| || | |||||||||| | ||||| ||||||    
T  842962 caaaaagaacatgcatcttgttggaatggatagtaccaaacaattcttacacgacttccttcaatcatgcagacacatacctacacgatctcatgatccc 843061  T
Q  378 tcttattt 385  Q
    ||| ||||    
T  843062 tctcattt 843069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 484
Target Start/End: Original strand, 16410748 - 16410960
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||  || ||||||| ||| | || |||||  ||| | |||||| |    
T  16410748 ctaccaaaaacaagatgcatcttgttggtattggtagtagtaaataattcttataagctttccttcaacaatgcattcccatactcacacgatctcagaa 16410847  T
Q  374 tccctcttattttgatg-tgattcggcttgtctagaagctgc-gggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagc 471  Q
    ||||||| ||| ||| | | ||| || ||| ||||||| |||  |||| || | |||||||| ||||||| ||||  ||| ||||| || |||||||||     
T  16410848 tccctctcattctgaagttaatttggtttgactagaagttgctaggagtcgattattgtcatgccttgtgtaccgatgactactcctcgtcctcgtcagt 16410947  T
Q  472 cttgggtgttaca 484  Q
    ||  |||||||||    
T  16410948 ctcaggtgttaca 16410960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 52250688 - 52250641
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  52250688 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 52250641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 52251025 - 52250978
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  52251025 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 52250978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 9189387 - 9189351
Alignment:
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9189387 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttacaa 9189351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42066202 - 42066114
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctaca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||  | |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  42066202 ctaccaaaaagaagatacattttgttagtatagaaaataccaaacaattatttcaagtctttcttcaaccatggagtcacatacataca 42066114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 313
Target Start/End: Original strand, 7229948 - 7230007
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtac 313  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7229948 tggagttcttatgtaatgaactaccgaaatgaagatgcttcgtgttgatatagttagtac 7230007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 343
Target Start/End: Original strand, 46411173 - 46411228
Alignment:
Q  288 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaacc 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||||    
T  46411173 atgcatcttattgatataggtagtaccaaataattcttaaaaatttttcttcaacc 46411228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 484
Target Start/End: Original strand, 50002443 - 50002487
Alignment:
Q  440 tgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  50002443 tgcaccggcgacaactccccgccctcgtcatccgtgggtgttaca 50002487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2193961 - 2193726
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2193961 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 2193862  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||| ||||||||| |||  |  ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  2193861 tcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 2193762  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2193761 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 2193726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 20039476 - 20039711
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  20039476 actgtagagttcttatggaatgggctaccaaaa-gaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaactatgtag 20039574  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||  ||||||||| || |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  20039575 tcctatacctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggtttgtctagaagctgtcgggagctgctcattgtcatgccttgtgcaccggc 20039674  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20039675 gaccattccccgccctcgtcagccttgggtgttacaa 20039711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 39147084 - 39146849
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39147084 actgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataagtagtatcaaacaattcttataagtctaccttcaaccatgtag 39146985  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||| || | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  39146984 tcccatacctacacggcctcatgatccctctcatttcgatgtgattcagttcctctagaagttgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 39146885  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39146884 gatcactccccaccctcgtcagccttgggtgttaca 39146849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 10926947 - 10927183
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10926947 actgtggagttcttatggaatggactaccaaaaggaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 10927046  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||   |||||||| | |||||||||||| |    
T  10927047 tcccatacctacacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattcggttcctctataagctgtcgggagctactcattgtcgtgccttgtgcaccgac 10927146  T
Q  449 gaccactccac-gccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    || |||||| | ||||||||||||  |||||||||||    
T  10927147 gatcactcccctgccctcgtcagctgtgggtgttaca 10927183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 17445456 - 17445692
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17445456 actgtggatttcttatggaatgagctaccgataagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 17445555  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||| ||  |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |    
T  17445556 tcccatgcctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattcggttcctctagaagttgttgggagccgctcattgccatgccttgtgcaccgtc 17445655  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  17445656 gaccactccccgtccttgttagccttgggtgttacaa 17445692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 254 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 34867931 - 34867700
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  34867931 tggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtccc 34867832  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacc 452  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||     
T  34867831 atacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcttctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgact 34867732  T
Q  453 actccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34867731 actcctcgccctcgtcagccttgggtgttaca 34867700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 42788647 - 42788882
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42788647 actgtggagttcttgtggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttctttcaaccatgtag 42788746  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||  |||||| || |||||||||||||| |||  | |||||||||| |  |||||||| || || |||||| ||| |||  | ||||||||||||||    
T  42788747 tcccaatcctacacggcctcaggatccctctcattccgttgtgattcggttcctctagaagttgtcgagagccgctca-tgttgtgccttgtgcaccggc 42788845  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42788846 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttacaa 42788882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 250 - 472
Target Start/End: Original strand, 10927404 - 10927628
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10927404 actgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 10927503  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |  |||| ||| ||  |||||| | |||||||| | |||||||||||| |    
T  10927504 tctcatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcggttcctctataagttgttgggagctgctcattgtcgtgccttgtgcaccgac 10927603  T
Q  449 gaccactccac-gccctcgtcagcc 472  Q
    || |||||| | |||||||||||||    
T  10927604 gatcactcccctgccctcgtcagcc 10927628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 34372213 - 34371978
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  34372213 actgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttttaagcattccttcaaccatgtag 34372114  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||| |  | || ||  ||| |||||| ||| || |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  34372113 tcccatacttgtacggccttgggaaccctctcattctggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcctgccttgtgcaccggc 34372014  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34372013 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 34371978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 27646836 - 27647072
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27646836 actgtggagttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgttataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 27646935  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
     | |||||||||| || |  ||||||||||| |||  |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||||||||||||||    
T  27646936 ccccatacctacacggccctaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgcacattggcgtgccttgtgcaccggc 27647035  T
Q  449 gaccactccac-gccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
     |||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||    
T  27647036 aaccactcccctgccctcgtcagctgtgggcgttaca 27647072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 34371757 - 34371521
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||    
T  34371757 actgtggtgttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttttaagcattccttcaaccatgcag 34371658  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || || ||||  | || ||  ||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  34371657 tcccacacctgtacggccttgggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 34371558  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34371557 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttacaa 34371521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 252 - 484
Target Start/End: Original strand, 15513015 - 15513249
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag--tcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  15513015 tgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgcatcttgttgatattggtagtacc-aacaattcttataagcatattccttcaaccatgtag 15513113  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||||||  | || | ||||||||| |||  |||||||||||| |  |||| || ||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  15513114 tcccatacctacacagcctaatgatccctctcattccgatgtgattcggttcctctaaaaactgtcgggagccgctcattatcgtgccttgtgcaccggc 15513213  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15513214 gaccactccccgtcctcgtcagccttgggtgttaca 15513249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 484
Target Start/End: Original strand, 21886151 - 21886382
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  21886151 tggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtccc 21886250  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacc 452  Q
    |||||| ||    ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21886251 atacctgcacaacctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctaccaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgacc 21886350  T
Q  453 actccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||  ||||||| |||||||| |||||||||    
T  21886351 actctccgccctcatcagccttcggtgttaca 21886382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 18304576 - 18304341
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || | ||| ||||||||    
T  18304576 actgtggaattcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttatataagcttttcatcatccatgtag 18304477  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| |  |||||||||| ||| |||  | ||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  18304476 tcccatacctacacgacctcaggatccttctcattccgttgtgatttggttcgtctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgtcttgtgcaccggc 18304377  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    || |||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  18304376 gatcactccccgtcctcgtcagtcttgggtgttaca 18304341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 473
Target Start/End: Original strand, 4657994 - 4658217
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||    
T  4657994 actgtgaagttcttatggaatggactaccaaaaagaagatgcatgttgttgttataggtagtatcaaacaagtcttataa-tcttcgttcaaccatgaag 4658092  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||| | |||| || |||||||||| | || ||||| |||    
T  4658093 tctcatacctgcacggtttcaagatccctcttatttcgatgtgattcagtttgcctagaggctgtcaggagtcggtcattgtcatgcattatgcactggc 4658192  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagcct 473  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||    
T  4658193 gaccactccccgtccttgtcagcct 4658217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 8642035 - 8642181
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  8642035 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcttataagccttccttcaaccatgcag 8642134  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||||| || || || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8642135 tcccatacctgcacggccttaggatccctctcattctgatgtgattc 8642181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 252 - 485
Target Start/End: Original strand, 5066894 - 5067127
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| || |||  ||||    
T  5066894 tgtggagtttttatgaaatagactaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatatagataataccaaacaattcttataagttttcctttaatcatacagtc 5066993  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgac 451  Q
    |||||| | || || ||| ||||| |||| ||| || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||  |  |||| |||||||||||    
T  5066994 tcatacatgcacggcctcgggatctctctcattctggtgtgattcgatttgtctagaagttgcgagagccgctcattgttgtgtcttgcgcaccggcgac 5067093  T
Q  452 cactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  5067094 cactccccatcctcgtcagccatgggtgttacaa 5067127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1822049 - 1821942
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1822049 tgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtc 1821950  T
Q  352 tcatacct 359  Q
    ||||||||    
T  1821949 tcatacct 1821942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 189213 - 189067
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  189213 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 189114  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||| |  | || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  189113 tcccatacatgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 189067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 398
Target Start/End: Original strand, 8391327 - 8391470
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8391327 tggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatacagg-agtaccaaacaattcttataagtcttccttcaatcatgtagtctc 8391425  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    || |||||| || ||||| |||||||| |||  ||||||||||||    
T  8391426 atgcctacacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattcgg 8391470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2474104 - 2473958
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  2474104 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggcagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 2474005  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||||| |||  | |  || ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2474004 tctcatgcctgtacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 2473958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2474550 - 2474444
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  2474550 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttttaagtcttccttcaaccatgcag 2474451  T
Q  350 tctcata 356  Q
    || ||||    
T  2474450 tcccata 2474444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 274 - 457
Target Start/End: Original strand, 16370733 - 16370917
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  16370733 ctaccaaaaagaagatacgtcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataagttttccttcaaccatgcagtcttatacctacatggcatcagga 16370832  T
Q  374 tccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactcc 457  Q
     |||||| |||| ||||||| |  | |||   | |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16370833 accctctcatttcgatgtgaattcgattgatgaaaagctgtcagaagccattcattgtcataccttgtgcaccgacaaccactcc 16370917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 3887058 - 3887204
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  3887058 actgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataagtcttccttcaaccatgcag 3887157  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || |||||||  | || ||||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  3887158 tcccatacctgtacggcctcaggatcactctcattccgatgtgattc 3887204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22556681 - 22556535
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||    
T  22556681 actgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcatataagccttccttcaaccatgcag 22556582  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  22556581 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgattc 22556535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 42429260 - 42429083
Alignment:
Q  280 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctc 379  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42429260 aaaagaatatgcatattgttgataaaggtagtaccaaacaattcttataagtcctccttcaaccatgtgttcacatacctacacggtctcaggat-cctc 42429162  T
Q  380 ttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctc 465  Q
    |||||  |||||||||||| | ||||| |||||       |||  |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42429161 ttattccgatgtgattcggttcgtctaaaagct-------ccgcccattgttatgcattgtgcaccggcgaccactcctcgccctc 42429083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 3886602 - 3886748
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||| ||    
T  3886602 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcatataagcattccttctaccatgcag 3886701  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||| |  | |  |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  3886702 tcccatacttgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgattc 3886748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22557114 - 22556968
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||    
T  22557114 actgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatattggtagtaccaaacaattcatataagccttccttcaaccatgcag 22557015  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||||| || || |||| || | |||| |||  ||||||||||    
T  22557014 tcccatacctgcacggcctcatgaactctctcattccgatgtgattc 22556968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 350
Target Start/End: Original strand, 4673472 - 4673572
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  4673472 actgtggagttcttatggaatgaaataccaaaaagaatatgcatcttgttgatacaggtgctaccaaataattcttataagacttccttcaatcatgtag 4673571  T
Q  350 t 350  Q
    |    
T  4673572 t 4673572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 29680108 - 29680231
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  29680108 actgtggagttcttatgtaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtattacca-------cttataagccttccttcaaccatgtag 29680200  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    || |||||||||| || |||| |||| ||||    
T  29680201 tcccatacctacacggcctcaagatctctct 29680231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 398
Target Start/End: Original strand, 30719808 - 30719954
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||  |||    
T  30719808 tgtggagttcttatggtttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtttttataggtagtaccaaacaattcatataagccttccttcaacaatgatgtc 30719907  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
     ||||| | ||    |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  30719908 ccatacttgcacaacctcaggatccctctcattctgatgtgattcgg 30719954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1880221 - 1879990
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||||||     ||| ||||||||||| ||    
T  1880221 actgtagagttcttgtggaatagactaccaaaaagaatatgcat-ttgttaatataggaagtactggacaattcttaa----cttccttcaaccatgcag 1880127  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctgc-gggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||| || || ||||||  ||||||||| ||| || ||||||| || ||||||||||| ||  ||||| |  |||||||| | |||| |||||||||    
T  1880126 tcacataactgcacggtctcgagatccctctcattctggtgtgatttggtttgtctagaagttgttgggagtcactcattgtcgtgccttatgcaccggc 1880027  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||| || | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  1880026 gaccgcttcccgtcctcgtcagcctttggtgttacaa 1879990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 395
Target Start/End: Original strand, 24182277 - 24182391
Alignment:
Q  281 aaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||    
T  24182277 aaagaagatgcatcttgttggtatagatagtaccaaataattcttataagccttccttcaaccatttcgtctcatacttgcacgttctcaagatccctct 24182376  T
Q  381 tattttgatgtgatt 395  Q
     ||| | ||||||||    
T  24182377 cattctaatgtgatt 24182391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 398
Target Start/End: Original strand, 2058664 - 2058805
Alignment:
Q  257 agttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||||||||||||| |||   || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  2058664 agttcttatggaatgtgctatttaacagaatttgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcatataagtcttccttcaatcatccagtctcata 2058763  T
Q  357 cctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
     || ||||   |||||||| |||| | |  ||||||||||||    
T  2058764 gctgcatgacttcaggatctctctcaatccgatgtgattcgg 2058805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 11160694 - 11160794
Alignment:
Q  262 ttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctac 361  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11160694 ttatggaatgaactacgtgaaagaatatgcatcttgttgacatagatagtaccaaacaattattataagccttccttcaactatgtagtgtcatacctac 11160793  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  11160794 a 11160794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Original strand, 18750201 - 18750293
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatg 346  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  18750201 tggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatctttttggtataggtagtaccaaacaattgttataatccttccttcaaccatg 18750293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 341
Target Start/End: Original strand, 20858546 - 20858633
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaa 341  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20858546 tggagttcttatggaatgagctacagaaaagaagaagcatcttgttgatatagaaaataccaaacaattcttataagcctttcttcaa 20858633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 373
Target Start/End: Original strand, 43356650 - 43356743
Alignment:
Q  279 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  43356650 aaaaagaagatgcatattgttggtttaggttgtaccaaacaattcttataagtcat-cctcaatcatgcagtctcatacctgcatgatctcagga 43356743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Original strand, 11757282 - 11757347
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 315  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11757282 actgtggagttcttatggattgaactaccgaaaagaagatgcattttgttgatataagtagtacca 11757347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Original strand, 30684557 - 30684637
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 330  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30684557 actgtggagttcttatggtttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtttttatagatagtaccaaacaattcatataag 30684637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 454
Target Start/End: Original strand, 32574683 - 32574864
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |   || | |    
T  32574683 ctaccaaaagaaagatgcattttgtttgtataggtagtaccaaacaattcctataagcctt-ctttaaccgtgcagtctcatacctacacgacatctgaa 32574781  T
Q  374 tccctcttattttgatgt-gattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccac 454  Q
     |||| | ||| |||| | |||| || | |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  32574782 accctttcattctgatttggatttggttcgtctagaagctgtcaggagccgctcattgttataccttgtgcatcggagaccac 32574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 396
Target Start/End: Original strand, 22975076 - 22975157
Alignment:
Q  315 aaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22975076 aaacaattcttataagcttttcttcaaccatgcagtcacatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 22975157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 357
Target Start/End: Original strand, 39801498 - 39801571
Alignment:
Q  285 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta-taagtcttgcttcaaccatgtagtctcatac 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||  || |||||| |||||||||||    
T  39801498 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacgatttttagaaagtcttcttttaaccatatagtctcatac 39801571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4102895 - 4102723
Alignment:
Q  307 gtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtcta 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||     |||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||  |||||||||| | ||| |||    
T  4102895 gtagtaccaaacaattcttataagcattctttcaac-----agtctcatacctgcacggtatcagaatccctctcattcagatgtgattc-gattgccta 4102802  T
Q  407 gaagctgcg-ggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| |||||||   ||| |||| ||||||||| || ||| |||||| |  |||| ||||||| || |||||||    
T  4102801 gaagctgcgaggagccgcatattatcatgccttgtgcatcgacgatcactccccatcctcatcagcctcggatgttaca 4102723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5549466 - 5549343
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa-ttcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagg 372  Q
    ||||||||||||| |  ||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||  ||  | ||||||||||||||||| ||| |    
T  5549466 ctaccaaaaagaataaacatattgttggtatacgtagtaccaaacaattttttataagttttccttcaattatacaatctcatacctacatggtttcatg 5549367  T
Q  373 atccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    | || ||| |||  ||||||||||    
T  5549366 aaccatctcattccgatgtgattc 5549343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 485
Target Start/End: Original strand, 8391477 - 8391524
Alignment:
Q  438 tgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  8391477 tgtgcaccggcgaccactccccgccctcttcagctgtgggtgttacaa 8391524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 521 - 556
Target Start/End: Original strand, 35695187 - 35695222
Alignment:
Q  521 tattctatactatatataaaggaaatacatggtttt 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35695187 tattctatactatatataaaggaaatatatggtttt 35695222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 2887 - 2651
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2887 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 2788  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||  |  |||||||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| |||||    
T  2787 tcccatacctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattcgattcctctagaagttgtcgggagccactcattgtcgtgccttgtgctccggc 2688  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2687 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttacaa 2651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 27022339 - 27022575
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  27022339 actgtggagttcttatggaatgagctgccgaaaataagatgcatgttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgtag 27022438  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  27022439 tcccatacctacatggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcggctcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 27022538  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  27022539 gaccactccccgtcctcgtcagccttgggtattacaa 27022575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 10845028 - 10844793
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  10845028 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcag 10844929  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  10844928 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 10844829  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10844828 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 10844793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 22026524 - 22026289
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  22026524 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccatgcag 22026425  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || |||| || |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22026424 tcccatacctgcacggcctcacgaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcatgccttgtgcaccggc 22026325  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22026324 gaccactcctcgccctcgtcagccttgggtgttaca 22026289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 22548996 - 22549231
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22548996 actgtggagtttttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcag 22549095  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| ||  | |||||||  ||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  22549096 tcacatacctgcacagcctcaggaagcctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 22549195  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22549196 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 22549231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 250 - 486
Target Start/End: Original strand, 12827255 - 12827492
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  12827255 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccaagtag 12827354  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||  |  ||||||||| |  ||||||||| | | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  12827355 tcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgattcggttcttctagaagcagtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 12827454  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaac 486  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12827455 gatcactccccaccctcgtcagccttgggtgttacaac 12827492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 8080343 - 8080579
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  8080343 actgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttatcagctttccttcaaccatgtag 8080442  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||||||| | |  |||||||||||    |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  8080443 tcccatacctacacggcttcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttaagagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 8080542  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8080543 gaccactcctcgccctcgtcagccttgggtgttacaa 8080579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 27926044 - 27925809
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  27926044 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttcaaccatgcag 27925945  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||    
T  27925944 tcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccagc 27925845  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27925844 gaccactccccgtcctcgtcagccttgggtgttaca 27925809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 252 - 484
Target Start/End: Original strand, 33852261 - 33852493
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  33852261 tgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatacatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagttttccttcaaccatacagtc 33852360  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcga 450  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||| ||| || |||||||| | |  ||| |||| |  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  33852361 tcatacctgcacggtctcgggatccctctcattctggtgtgattcagttcctcttgaagttatcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 33852460  T
Q  451 ccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33852461 ccact-cacgccctcgtcagccttgggtgttaca 33852493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 249 - 484
Target Start/End: Original strand, 22840529 - 22840765
Alignment:
Q  249 tactgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  22840529 tactgtggagttcttatggaatgagctaacaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagtcttcattcgaccatgta 22840628  T
Q  349 gtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccgg 447  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||  |||||||||| | |  |||||||| |  ||||||||| ||||| || |  ||| ||||||||    
T  22840629 gtctcatacctacaaagcctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttactctagaagttatcgggagccgctcattatcgtgtcttatgcaccgg 22840728  T
Q  448 cgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22840729 cgaccactccccgcccttgtcagccttgggtgttaca 22840765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Original strand, 41659106 - 41659341
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41659106 actgtggagttcttatgtaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcag 41659205  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| || |   |||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||  |||||||| |  |||||||||||||    
T  41659206 tcccatacctgcacgacatcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccactcattgtcgt-gcttgtgcaccggc 41659304  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41659305 gaccactccccgccctcgtcagccttaggtgttacaa 41659341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 6464911 - 6465146
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6464911 actgtggagttgttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 6465010  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |  |||||||||| || |||| ||| ||||| |||   ||||||||||  |  |||||||| ||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  6465011 ttccatacctacacggcctcatgattcctctcattccaatgtgattcgattactctagaagttgttgggagccgctcattatcgtgccttgtgcaccggc 6465110  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  6465111 gaccactcctcgccctcgtcagacgtgggtgttaca 6465146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 32292542 - 32292307
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  32292542 actgtggagttcttatggaatgggctagcaaaaagaagatgcaacttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagcattccttcaaccatgcag 32292443  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||| | || || ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  32292442 tcccatacttgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaaactatcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 32292343  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32292342 gatcactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 32292307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 273 - 476
Target Start/End: Original strand, 27021903 - 27022111
Alignment:
Q  273 actaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagg 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  27021903 actaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcttatacctacatggcctcagg 27022002  T
Q  373 atccctcttatt--tt--gatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgt 467  Q
    |||||||| |||  ||  ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  27022003 atccctctcattcattccgatgtgattcggctcctctagaagttgtcgggagccactcattgtcgtgccttgtgcacccgcgaccactccccaccctcgt 27022102  T
Q  468 cagccttgg 476  Q
    |||||||||    
T  27022103 cagccttgg 27022111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Original strand, 22548550 - 22548785
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  22548550 actgtggagttattatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaaacttccttcaaccatgcag 22548649  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| ||  | ||||||| |||||| |||  | ||||||| || |  ||||||||||| | ||||||| |||||||  | |||||||||| |||    
T  22548650 tcacatacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgattaggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtagtgccttgtgcactggc 22548749  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  22548750 gaccactccccaccctcatcagccttgggtgttaca 22548785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2044203 - 2043965
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2044203 actgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 2044104  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||| | |  |||||||| || ||| ||||||| ||| || |   ||||||||||||    
T  2044103 tctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattctgttcctctagaagttgtcggaagccgttaattatcgtgttttgtgcaccggc 2044004  T
Q  449 gaccactccacgccc---tcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||| | | || ||   |||||||||||||||||||||    
T  2044003 gaccatttcccgtcctcgtcgtcagccttgggtgttaca 2043965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 274 - 484
Target Start/End: Original strand, 28375079 - 28375290
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| || || |||||||    
T  28375079 ctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatgtaggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaatcatgcagtctcatacctgcacggcctcagga 28375178  T
Q  374 tccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagcc 472  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  | |||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||||   |||||||| |||     
T  28375179 tccctctcattatggtgtgattcgtttcgtctagaagctgtcgggagccgctaattgtcgtgccttgtgcaccgacgaccactctctgccctcgttagct 28375278  T
Q  473 ttgggtgttaca 484  Q
    |||| |||||||    
T  28375279 ttggttgttaca 28375290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 28453483 - 28453249
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||    
T  28453483 actgtagagttcttatggaatgggctaccataaagaagatgcatcttgttaatataggtagtataaaacaattcttataagttttctttcaaccatgaag 28453384  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    |||||||||| || |  ||| |||||||||| |||  | |||||||| | |  |||| ||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  28453383 tctcatacctgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattcag-tcatctaaaagttgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 28453285  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28453284 aaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 28453249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25147677 - 25147536
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  25147677 tggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagcaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtctc 25147578  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgatt 395  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||| |||  |||||||||    
T  25147577 atacctacacagtcttaggatctctctcattccgatgtgatt 25147536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 253 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17103223 - 17103096
Alignment:
Q  253 gtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtct 352  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17103223 gtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcagcttgttgatataggcagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtct 17103124  T
Q  353 catacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    |||||||  | || ||||||||| ||||    
T  17103123 catacctgtacggcctcaggatctctct 17103096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 10844616 - 10844746
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  10844616 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccatgcag 10844715  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    || ||||||| || || ||||||| ||||||    
T  10844716 tcccatacctgcaaggcctcaggaaccctct 10844746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 250 - 398
Target Start/End: Original strand, 27819247 - 27819395
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||    
T  27819247 actgtggagtttttatggaatgagctattgaaaagaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaacaattcttattagccttccttcaaccatgaag 27819346  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    |||||||| | ||||   ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27819347 tctcatacttgcatgacttcatgatccctctcattctgatgtgattcgg 27819395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 252 - 396
Target Start/End: Original strand, 34308482 - 34308626
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtc 351  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||    
T  34308482 tgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacagttcttataagccttccttcaaccatacagtc 34308581  T
Q  352 tcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||||| |  | || |||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  34308582 tcatacttgtacggcctcaggatccctttcattccgatgtgattc 34308626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41913115 - 41913000
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||    
T  41913115 actgcggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagacgcatcttgttgatataggtagcaccaaacaattcttataagccttctttcaaacatgcag 41913016  T
Q  350 tctcatacctacatgg 365  Q
    || ||||||| |||||    
T  41913015 tcccatacctgcatgg 41913000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3744777 - 3744671
Alignment:
Q  256 gagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  3744777 gagttcttatgaaatgtgctaccaaaaagaaggtgcatattgttggtataggtagtgtcaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtcccat 3744678  T
Q  356 acctaca 362  Q
    |||||||    
T  3744677 acctaca 3744671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25144917 - 25144771
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |     
T  25144917 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgctgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctgccttcaatcatgcaa 25144818  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||||| || |  |||  |||| |||| ||| |||||||||||    
T  25144817 tcccatacctgcacgacctcgagatctctctcattctgatgtgattc 25144771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25148112 - 25147966
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |   ||    
T  25148112 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtaagaccaaacaattcttataagccttccttcaacgacacag 25148013  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || |||||||||| |  ||| |||||||||| ||| | |||||||||    
T  25148012 tcccatacctacacgacctcgggatccctctcattcttatgtgattc 25147966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1297148 - 1297007
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||  ||||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  1297148 tggagttcttatataatgggataccgaaaagaatataaatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagttttacttcaaccatgcagtctc 1297049  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgatt 395  Q
    |||||| |||| |||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  1297048 atacctgcatgatctcagaacccctctcactttgatgtgatt 1297007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3745246 - 3745145
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3745246 actgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatattgttggtataggtagtactaaacagttcttataagttttccttcaaccatgtag 3745147  T
Q  350 tc 351  Q
    ||    
T  3745146 tc 3745145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 34308936 - 34309086
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatat----aggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccat 345  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  34308936 actgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatataggtagtaccaaacagttcttataagccttccttcaaccat 34309035  T
Q  346 gtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
      |||||||||| |  | || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  34309036 acagtctcatacttgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 34309086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12100836 - 12100691
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgc-ttcaaccatgta 348  Q
    |||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  12100836 actgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggtagtaccaaacaaatcttataag-cttgccttcaaccatgca 12100738  T
Q  349 gtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||||||||||  | || |||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  12100737 gtctcatacctgtacggcctcaggat-cttctcatttcgatgtgattc 12100691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 298 - 476
Target Start/End: Original strand, 29971450 - 29971629
Alignment:
Q  298 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcg 397  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  ||| |||||||||||     
T  29971450 ttgatatagatagtatcaaacaattcttataaatcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccttccaattctgatgtgattca 29971549  T
Q  398 gcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgg 476  Q
    | | ||||| || ||| ||||| ||  |||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| || || ||||||||    
T  29971550 gttcgtctaaaaactgtcgggaaccactcattgccatgccttatgcaccggtgaccattccccgcacttgtgagccttgg 29971629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 355
Target Start/End: Original strand, 15819022 - 15819121
Alignment:
Q  256 gagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||| |||||||    
T  15819022 gagttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcatgttgatatatgtagtaccaaacaatttttctaagcattccttcaaccatgttgtctcat 15819121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 285 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6466820 - 6466648
Alignment:
Q  285 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttatt 384  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||  ||||||  ||  ||||||| |||||||| |||    
T  6466820 aagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaatttttataagtc-tcctttaaccatgcagttccatacccgcacagtctcagaatccctctcatt 6466722  T
Q  385 ttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactcc 457  Q
     |||| ||||| || ||| || ||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  6466721 ctgatatgatttggtttgcctggaagctgtcaggagctgctcattgtcatgccttgtgcactggcaaccactcc 6466648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22705282 - 22705187
Alignment:
Q  285 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||  |||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22705282 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataacccttccttcaatcatccagtcccatacctacacggcttcaggatccctct 22705187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 21316110 - 21316240
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  || ||||||  ||    
T  21316110 actgtggagttcttatgaaatgagctactgaaaagacgatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttttaagcgctcatttaaccatacag 21316209  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||    
T  21316210 tctcatacctgcacggccttaggatccctct 21316240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 397
Target Start/End: Original strand, 30334939 - 30335056
Alignment:
Q  280 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctc 379  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||    
T  30334939 aaaagaagatgtatcttgttggtataggtagtatcaaacaatttttataagtcttctttcaaccttgcagtcgcatacctgcacagtctcaggatccatc 30335038  T
Q  380 ttattttgatgtgattcg 397  Q
    | |||  |||||||||||    
T  30335039 taattccgatgtgattcg 30335056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 346
Target Start/End: Original strand, 15567557 - 15567653
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatg 346  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  15567557 actgcggagttcttatgaaatgaactaccaaaaagaagatgtatcttgttggtatatgtagtgtcaaacaattcttataagccttccttccaccatg 15567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 357
Target Start/End: Original strand, 30527483 - 30527589
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  30527483 actgtggagttcttatgaaatgggctacccaaaagaagatgtatcttattgatgtaagtggtaccaaacaattcttataagtc-tggttcaaacatgcag 30527581  T
Q  350 tctcatac 357  Q
    ||||||||    
T  30527582 tctcatac 30527589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 317
Target Start/End: Original strand, 31283652 - 31283719
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31283652 actgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaa 31283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Original strand, 15568035 - 15568100
Alignment:
Q  279 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaacca 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15568035 aaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtcataccaaacaattgttataagtcttccttcaacca 15568100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6466397 - 6466194
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |   || || ||||||||| |    
T  6466397 tggatttcttatgaaatg-actaccaaaaggaagatgcaacttgttggtataagtagtaccaaacaattcatattagtatacttttaaacatgtagtccc 6466299  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagct-gcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgacc 452  Q
    |||| | ||   |||||| || ||||| ||| |||||||||||   ||| |||||  ||  | ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  6466298 atacatgcactctctcagaattcctctcattctgatgtgattcaatttgcctagacactatcaggagccgctcactgtcatgctttgtgcaccggcgacc 6466199  T
Q  453 actcc 457  Q
    |||||    
T  6466198 actcc 6466194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17429611 - 17429539
Alignment:
Q  284 gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  17429611 gaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaataatactcataagtcttccttcaacaatgcagtcacata 17429539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 345
Target Start/End: Original strand, 36968434 - 36968491
Alignment:
Q  288 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccat 345  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36968434 atgcatcttgttgatataagtagcaccaatcaattcttataagtcatccttcaaccat 36968491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 10729689 - 10729736
Alignment:
Q  252 tgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgtt 299  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  10729689 tgtggagtccttatggaataggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 10729736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 361
Target Start/End: Original strand, 28912851 - 28912962
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||| |||| |||||   || |||||| |||||||||||||| |||| || || || || |||||||||||| | |||  ||||| |||| ||    
T  28912851 actgtggagttattatagaatgggatatcaaaaataagatgcatcttgtcgatacagataatatcagacaattcttatatgacttctttcaatcatgcag 28912950  T
Q  350 tctcatacctac 361  Q
    | ||||||||||    
T  28912951 tgtcatacctac 28912962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 44041918 - 44041799
Alignment:
Q  367 ctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctc 465  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| | ||| |||  ||||||||| |||| ||| ||| | |||||| | || ||||    
T  44041918 ctcatgatccctctcattctgatgtgattcggtttgcctataagctgccaggaaccgcacattgtcatgccttatgccccgacaaccacttctcgtcctc 44041819  T
Q  466 gtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||||||| ||| |||||||    
T  44041818 gtcagcctcgggcgttacaa 44041799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 1365 - 1130
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  1365 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 1266  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||  | |||||||||| |  |||||||| || | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  1265 tcccatacctgcatggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattcggttcctctagaagttgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 1166  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1165 gaccactccccgccctcgtcagccttgggtgttaca 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4706 - 4470
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||    
T  4706 actgtggagttcttataaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttctaaaccttccttcaaccatgcag 4607  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || ||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||  |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  4606 tcccatacctgcatggcctcaggaaccctctccttccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 4507  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4506 ggccactcctcgccctcgtcagccttgggtgttacaa 4470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5166 - 4926
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttat-----aagtcttgcttcaacca 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     ||  ||| |||||||||    
T  5166 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttctcttttaaaccttccttcaacca 5067  T
Q  345 tgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgca 443  Q
    || |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||||| |  |||||||| || | ||||||| | |||||| | |||||||||    
T  5066 tgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagttgtcaggagccgctaattgtcgtgccttgtgca 4967  T
Q  444 ccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4966 ccggcgaccactcctcgccctcgtcagccttaggtgttaca 4926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 250 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 154902 - 154668
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  154902 actgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 154803  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || ||||||| |||||| |||  |  ||||||||| |  ||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  154802 tcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgagagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggc 154703  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  154702 ga-cactccccgccctcatcagccttgggtgttaca 154668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 151686 - 151550
Alignment:
Q  347 tagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcacc 445  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||| ||| |||| |  ||||||||| |  ||||||||||| || || ||| |||||||| | |||||||||||    
T  151686 tagtcccatacctacaaggcctcaggatcc-tctcatttcggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgaga-ccgctcattgtcgtgccttgtgcacc 151589  T
Q  446 ggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttacaa 485  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  151588 ggcgac-actccccgccctcgtcagcattgggtgttacaa 151550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 457
Target Start/End: Original strand, 18136 - 18343
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18136 actgtggagttcttatggaattagctaccaaaaa-aagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagtcttccttcaactatgtag 18234  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||    
T  18235 tcacatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgcctggtgcaccagc 18334  T
Q  449 gaccactcc 457  Q
    |||||||||    
T  18335 gaccactcc 18343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 250 - 457
Target Start/End: Original strand, 17599 - 17807
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17599 actgtggagttcttatgaattgagctaccaaaaagaagatacatcctgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgtag 17698  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||| |||||| |  || ||||| || ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  17699 tcccatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtcattcggttcctcaagaagttgtcgggagccgctcattgtcgtgcctggtgcaccggc 17798  T
Q  449 gaccactcc 457  Q
    |||||||||    
T  17799 gaccactcc 17807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 484
Target Start/End: Original strand, 17817 - 17916
Alignment:
Q  387 gatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccac-gccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  17817 gatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgcctcgtgcaccggcgaccactccccttccctcgtcagccgtgggtgttaca 17916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 283 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23785 - 23583
Alignment:
Q  283 agaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctctta 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| || || |||| || |||||| |    
T  23785 agaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaagaaccctctca 23686  T
Q  383 ttttgatgtgattcggcttgtctagaag-ctgcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgtt 481  Q
    ||| | |||||||||| |  |||||| | |  | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23685 tttcggtgtgattcggttcctctagatgccatcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccattccccgccctcgtcagccttgggtgtt 23586  T
Q  482 aca 484  Q
    |||    
T  23585 aca 23583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 398
Target Start/End: Original strand, 2052 - 2200
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  2052 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 2151  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcgg 398  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| | ||| || ||||||||||    
T  2152 tctcatacctgcacggcctcaggaaccctttcattctggtgtgattcgg 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 245200 - 245085
Alignment:
Q  281 aaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  245200 aaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctcccttcaaccatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctct 245101  T
Q  381 tattttgatgtgattc 396  Q
     |||  ||||||||||    
T  245100 cattccgatgtgattc 245085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 245660 - 245514
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||  |   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||    
T  245660 actgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaaccatgaag 245561  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || |||||||||| || |||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  245560 tcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattc 245514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 162679 - 162809
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  162679 actgcggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcag 162778  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    || |||||||  | || ||||||||||||||    
T  162779 tcacatacctgtacggcctcaggatccctct 162809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 250 - 401
Target Start/End: Original strand, 69816 - 69967
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| ||| ||    
T  69816 actgtggagttcttatggaatgagctaatgaaaaaaagatgcatcatgttgatataggtagtaccaaacaattattataagcattccttcaacgatgcag 69915  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggctt 401  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  69916 tctcatacctgcatagtcttaggatccctctcattatgatgtgaatcggctt 69967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 296
Target Start/End: Original strand, 163135 - 163181
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatctt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  163135 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 163181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19111 - 18966
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  19111 actgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 19012  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgatt 395  Q
    || ||||||| || || ||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  19011 tcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatt 18966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 256 - 396
Target Start/End: Original strand, 2217 - 2357
Alignment:
Q  256 gagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcat 355  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  2217 gagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccat 2316  T
Q  356 acctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    |||| || || || ||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  2317 acctgcacggccttaggatccttctcattccgatgtgattc 2357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Original strand, 107464 - 107610
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  107464 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatattggtagtatcaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcag 107563  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || |||||||  | || ||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  107564 tcccatacctgtacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattc 107610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10445 - 10299
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  10445 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcttataagccttccttgaaccatgcag 10346  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    || ||||| | || || |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  10345 tcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 10299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 105865 - 105720
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||    
T  105865 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccctgcag 105766  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgatt 395  Q
    |  |||||||  | || |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  105765 ttccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgatt 105720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 250 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2250 - 2150
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2250 actgtggagttcttaaggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgtttatatagggagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtag 2151  T
Q  350 t 350  Q
    |    
T  2150 t 2150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 346 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 799 - 660
Alignment:
Q  346 gtagtctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagctg-cgggagccgttcattgtcataccttgtgcac 444  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |  |||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  799 gtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctataagttgtcgggagccgctcattgtcgtaccttgtgcac 700  T
Q  445 cggcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    | |||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  699 cagcggtcactcccctgcctcgtcagccttaggtgttaca 660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 142303 - 142421
Alignment:
Q  278 caaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcaggatccc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||||    
T  142303 caaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattccttcaaccatgaagtcccatacctgcacggcctcaggatccc 142402  T
Q  378 tcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||| |||  ||||||||||    
T  142403 tctcattccgatgtgattc 142421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 4007 - 4129
Alignment:
Q  274 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcatacctacatggtctcagga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||| ||||||| || || ||| |||    
T  4007 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaacaatgcagtcccatacctgcacggcctcggga 4106  T
Q  374 tccctcttattttgatgtgattc 396  Q
    ||||||| ||| || ||||||||    
T  4107 tccctctcattctggtgtgattc 4129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 482
Target Start/End: Original strand, 4172 - 4207
Alignment:
Q  447 gcgaccactccacgccctcgtcagccttgggtgtta 482  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4172 gcgaccactccccgccctcgtcagccttgggtgtta 4207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 14886 - 14663
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 349  Q
    |||||| |||||||||  |||| | |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||  || ||    
T  14886 actgtgaagttcttattcaatgaattaccgaaaagacgatgcatcttattgatataggtattaccaaacaattcttataagcattccttcaacactgcag 14787  T
Q  350 tctcatacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaagc-tgcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggc 448  Q
    ||  |||| | || | | | |||||||||||| ||  |||||||||| ||||  ||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  14786 tcctatacatgcacgatattaggatccctcttgttccgatgtgattc-gctttcctaaaagcttccaggagccgctcattgtcatgccttttgcaccggc 14688  T
Q  449 gaccactccacgccctcgtcagcct 473  Q
    ||||||||  || ||||||||||||    
T  14687 gaccactctccgtcctcgtcagcct 14663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 353 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2547 - 2414
Alignment:
Q  353 catacctacatggtctcaggatccctcttattttgatgtgattcggcttgtctagaag-ctgcgggagccgttcattgtcataccttgtgcaccggcgac 451  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||| |||  | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||     
T  2547 catacctacatggcctcaggatccctctcattctgatgtgattcggttcctctataagttttcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgat 2448  T
Q  452 cact-ccacgccctcgtcagccttgggtgttaca 484  Q
    |||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  2447 cactcccttgcccttgtcagccttaggtgttaca 2414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 284 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45497 - 45425
Alignment:
Q  284 gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcata 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  45497 gaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaataattctcataagtcttccttcaacaatgtagtcacata 45425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 309
Target Start/End: Original strand, 13534 - 13593
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13534 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 13593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26211 - 26085
Alignment:
Q  254 tggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctc 353  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| | |  | |||||||| ||||||    
T  26211 tggagttcttataaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcatgttgatatatgtagtaccaaaaaatttgtataagccattatgcaaccatgaagtctc 26112  T
Q  354 atacctacatggtctcaggatccctct 380  Q
    | |||| || || || |||||||||||    
T  26111 acacctgcacggccttaggatccctct 26085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16152 - 16038
Alignment:
Q  279 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcataccta--catggtctcaggatcc 376  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||| ||| | |||||||||||  || | | |||||||||    
T  16152 aaaaaaaagaggcatcatgttgatatagatagcaccaaacaattcttacaagtcatcattcaactatgcaatctcatacctatgcacgatatcaggatcc 16053  T
Q  377 ctcttattttgatgt 391  Q
    |||| ||| ||||||    
T  16052 ctctcattctgatgt 16038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1138
Description:

Target: scaffold1138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 360
Target Start/End: Original strand, 734 - 808
Alignment:
Q  286 agatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtctcataccta 360  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |  ||| | |||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  734 agatgcatcttgttgatgtatgtagtaccgattaatccatataagtcctccttcaaccatataatctcataccta 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 296
Target Start/End: Original strand, 14703 - 14749
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatctt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  14703 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 14749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7087 - 7009
Alignment:
Q  250 actgtggagttcttatggaatgtactaccaaaaagaagatgcatcttgttgata-taggtagtaccaaacaattcttat 327  Q
    ||||||||||||||||||  || | |  |||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  7087 actgtggagttcttatggtttggattgtcaaaaaaaaggtgcatcttgttggtaatatgtagtaccaaacaattcttat 7009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University