View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16652_low_16 (Length: 322)

Name: NF16652_low_16
Description: NF16652
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16652_low_16
NF16652_low_16
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (14-303)||(34128152-34128442)
chr4 (15-229)||(34279480-34279695)
chr4 (13-229)||(18670838-18671067)
chr4 (15-229)||(54859144-54859361)
chr4 (15-222)||(32429267-32429487)
chr4 (15-123)||(18737162-18737270)
chr4 (15-190)||(47071408-47071583)
chr4 (15-222)||(14643719-14643934)
chr4 (15-123)||(18716489-18716597)
chr4 (15-123)||(30019946-30020054)
chr4 (15-123)||(35096028-35096136)
chr4 (40-227)||(3409577-3409781)
chr4 (15-123)||(35090915-35091023)
chr4 (15-202)||(3424704-3424904)
chr4 (134-229)||(30019815-30019909)
chr4 (142-222)||(35091065-35091145)
chr4 (142-222)||(35096178-35096258)
chr4 (133-199)||(22118846-22118912)
chr4 (43-99)||(34602065-34602121)
chr4 (73-121)||(25618387-25618435)
chr4 (175-222)||(34602012-34602059)
chr4 (237-291)||(34601886-34601940)
chr4 (136-181)||(25618315-25618360)
chr4 (210-290)||(47071668-47071752)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (15-227)||(35368870-35369095)
chr5 (15-227)||(2022964-2023188)
chr5 (50-229)||(43540749-43540928)
chr5 (15-123)||(9877635-9877743)
chr5 (15-123)||(13556401-13556509)
chr5 (15-123)||(39903845-39903953)
chr5 (15-123)||(39908958-39909066)
chr5 (15-202)||(4555653-4555830)
chr5 (15-123)||(9872520-9872628)
chr5 (142-227)||(13556273-13556358)
chr5 (142-222)||(9872398-9872478)
chr5 (142-222)||(9877513-9877593)
chr5 (142-222)||(39909108-39909188)
chr5 (142-222)||(39903995-39904075)
chr5 (39-89)||(25184116-25184166)
chr5 (160-227)||(43379556-43379618)
chr5 (15-69)||(43378437-43378491)
chr5 (138-229)||(43402100-43402191)
chr5 (240-296)||(35368679-35368735)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (15-229)||(18608617-18608832)
chr8 (13-123)||(10341053-10341163)
chr8 (17-121)||(43956947-43957051)
chr8 (15-123)||(34108229-34108337)
chr8 (15-123)||(14315007-14315115)
chr8 (15-123)||(14318711-14318819)
chr8 (15-123)||(18494272-18494380)
chr8 (15-123)||(26981972-26982080)
chr8 (15-123)||(26987085-26987193)
chr8 (15-123)||(25953255-25953363)
chr8 (45-229)||(1781869-1782055)
chr8 (16-87)||(18885065-18885136)
chr8 (142-227)||(43956819-43956904)
chr8 (142-222)||(14314885-14314965)
chr8 (142-222)||(14318589-14318669)
chr8 (142-223)||(18494150-18494230)
chr8 (142-223)||(34108381-34108462)
chr8 (142-222)||(26986963-26987043)
chr8 (142-222)||(26981849-26981929)
chr8 (150-229)||(25953142-25953221)
chr8 (240-302)||(43956681-43956743)
chr8 (142-227)||(10340936-10341021)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (43-225)||(4181374-4181558)
chr7 (13-272)||(37459783-37460047)
chr7 (15-229)||(5440267-5440492)
chr7 (15-229)||(5449277-5449502)
chr7 (15-123)||(14610364-14610472)
chr7 (15-121)||(12851674-12851780)
chr7 (15-123)||(12856789-12856897)
chr7 (15-123)||(26051021-26051129)
chr7 (15-123)||(26056134-26056242)
chr7 (15-123)||(26060380-26060488)
chr7 (15-123)||(26065493-26065601)
chr7 (15-110)||(11056625-11056720)
chr7 (15-187)||(35352330-35352495)
chr7 (142-223)||(12851826-12851907)
chr7 (142-222)||(12856939-12857019)
chr7 (142-222)||(26051171-26051251)
chr7 (142-222)||(26056284-26056364)
chr7 (142-222)||(26060530-26060610)
chr7 (142-222)||(26065643-26065723)
chr7 (13-57)||(5436692-5436736)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (15-229)||(20752105-20752322)
chr6 (13-229)||(21936653-21936886)
chr6 (15-229)||(24508827-24509032)
chr6 (15-121)||(2887490-2887596)
chr6 (15-121)||(2889212-2889318)
chr6 (15-128)||(11183257-11183370)
chr6 (15-123)||(21275773-21275881)
chr6 (15-121)||(24509703-24509809)
chr6 (133-237)||(24509841-24509946)
chr6 (13-111)||(21937568-21937666)
chr6 (142-222)||(21275923-21276003)
chr6 (133-237)||(21937707-21937812)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (15-229)||(44523998-44524226)
chr1 (15-229)||(16051206-16051422)
chr1 (15-208)||(17414556-17414740)
chr1 (17-226)||(19310826-19311047)
chr1 (17-227)||(43358755-43358978)
chr1 (15-130)||(35626172-35626287)
chr1 (15-229)||(13654335-13654546)
chr1 (26-229)||(21431648-21431865)
chr1 (13-237)||(1187826-1188057)
chr1 (15-123)||(10186675-10186783)
chr1 (15-123)||(3465473-3465581)
chr1 (15-123)||(3468067-3468175)
chr1 (15-123)||(28574297-28574405)
chr1 (15-123)||(28598309-28598417)
chr1 (136-229)||(10186548-10186641)
chr1 (142-222)||(28574447-28574527)
chr1 (142-222)||(28598459-28598539)
chr1 (142-223)||(3468218-3468299)
chr1 (138-229)||(35653220-35653311)
chr1 (146-202)||(3701492-3701548)
chr1 (13-57)||(29681588-29681632)
chr1 (13-57)||(48366213-48366257)
chr1 (237-290)||(19311121-19311174)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (13-227)||(49784494-49784721)
chr3 (39-227)||(29827448-29827638)
chr3 (13-202)||(18024174-18024354)
chr3 (15-202)||(20891059-20891237)
chr3 (13-127)||(3187546-3187660)
chr3 (15-123)||(5458108-5458216)
chr3 (15-123)||(5481584-5481692)
chr3 (15-123)||(6858151-6858259)
chr3 (15-123)||(8458311-8458419)
chr3 (15-123)||(8464750-8464858)
chr3 (15-123)||(31081603-31081711)
chr3 (15-123)||(4049807-4049915)
chr3 (15-123)||(6853048-6853156)
chr3 (15-123)||(10591391-10591499)
chr3 (15-123)||(10673034-10673142)
chr3 (15-123)||(10678149-10678257)
chr3 (15-123)||(31076498-31076606)
chr3 (15-121)||(1302343-1302449)
chr3 (15-121)||(33703299-33703405)
chr3 (15-123)||(4054941-4055049)
chr3 (15-123)||(33702696-33702804)
chr3 (15-123)||(10584954-10585062)
chr3 (142-223)||(5457984-5458065)
chr3 (142-223)||(5481461-5481542)
chr3 (142-222)||(4049958-4050038)
chr3 (142-222)||(10584832-10584912)
chr3 (142-223)||(8464900-8464981)
chr3 (142-222)||(1302218-1302298)
chr3 (142-222)||(4055092-4055172)
chr3 (142-222)||(6852926-6853006)
chr3 (142-222)||(6858029-6858109)
chr3 (142-222)||(10591269-10591349)
chr3 (142-222)||(10672912-10672992)
chr3 (142-222)||(33702573-33702653)
chr3 (151-222)||(8458471-8458542)
chr3 (142-222)||(31076376-31076456)
chr3 (142-222)||(31081481-31081561)
chr3 (142-198)||(33703450-33703506)
chr3 (142-222)||(10678025-10678107)
chr3 (240-290)||(29827773-29827823)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (15-229)||(144096-144307)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (15-230)||(716267-716492)
chr2 (15-130)||(16284437-16284553)
chr2 (15-229)||(42780184-42780410)
chr2 (15-229)||(30283417-30283645)
chr2 (15-123)||(14917478-14917586)
chr2 (15-123)||(17720622-17720730)
chr2 (15-123)||(45120386-45120494)
chr2 (142-222)||(14917356-14917436)
chr2 (136-224)||(20892321-20892409)
chr2 (142-223)||(45120537-45120618)
chr2 (142-222)||(17720500-17720580)
chr2 (175-226)||(16286004-16286055)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (15-222)||(173358-173573)
[»] scaffold0223 (2 HSPs)
scaffold0223 (15-123)||(2115-2223)
scaffold0223 (142-222)||(1993-2073)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34128442 - 34128152
Alignment:
Q  14 atattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34128442 atattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagaaaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgca 34128343  T
Q  114 acaaaattcttgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaactt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34128342 acaaaattcttgtttcttagtgtcaaattaatggccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacattagagaaaacactcatttgactt 34128243  T
Q  214 gaatcaatgttat-ggtcattaaaccctttgccaaagattccaatatatatgaaagattctcacggagaattacaacttttgattctaaaa 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  34128242 gaatcaatgttatagttcattaagccttttgccaaaggttccaatatatatgaaagattctcacagagagttacaacttttggttctaaaa 34128152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34279695 - 34279480
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||    
T  34279695 tattttacagatttatggtttcaggaattcactcatgcattagagaattgatggttgatttagagtaagagaacgaggaagaattatgttgttaatgtaa 34279596  T
Q  115 caaaattcttgtt-tcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaactt 213  Q
    |||||||| |||| | |  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34279595 caaaattcatgttctgtgtgtgtcaaattaatgctcaaatgtcgagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgactt 34279496  T
Q  214 gaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  34279495 gaatcaatgttatggt 34279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 18670838 - 18671067
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18670838 aatattttacagatttatggttccaacaagtcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 18670937  T
Q  113 aacaaaattcttgtttct----------tagtgt---caaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaa 199  Q
    |||| |||||| ||||||          | ||||   ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||     
T  18670938 aacataattctggtttctattgtctttgttgtgtgtccaaattaattcccaaatgccaagcatttatagtccattatatgacccttcacatgagagaaag 18671037  T
Q  200 cactcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18671038 cacccatttgacttgaatcaatgctatggt 18671067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54859361 - 54859144
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |    
T  54859361 tattttacggatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagagcaagagaatgagggagaatcatgttgttaatgtga 54859262  T
Q  115 caaaatt-cttgtttcttagtgt-caaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaaca-ctcatttaac 211  Q
    ||||||| | | |||  | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||| ||    
T  54859261 caaaattccatttttggttgtgtccaaattaatgcccaaatatcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccctttgac 54859162  T
Q  212 ttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54859161 ttgaatcaatgttatggt 54859144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32429487 - 32429267
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  32429487 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatccaa 32429388  T
Q  115 caaaattct-------------tgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaaca 201  Q
    |||||||||             ||||  |  ||||| || |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  32429387 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtgtccaactaatgcacaaatgccaagcatttatagtgcattatatgactcttcaaatgagagaaaaca 32429288  T
Q  202 ctcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    | | ||| |||||||||||||    
T  32429287 cccctttgacttgaatcaatg 32429267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 18737162 - 18737270
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18737162 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 18737261  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  18737262 caaaattct 18737270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 47071408 - 47071583
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  47071408 tattttacaaatttatggttcaaacaattcactcattcattagagaattgatagataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 47071507  T
Q  115 caaaattcttgtttcttagtgt-caaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacat 190  Q
    |||||||  || |||||  ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47071508 caaaatttctg-ttcttgttgtccaaattaatgcccaaatgttaaacatttatagtacattatatgacccttcacat 47071583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14643934 - 14643719
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  14643934 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 14643835  T
Q  115 caaaattcttgtttct--------tagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcat 206  Q
    |||||||||| |||||        |  ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  14643834 caaaattcttttttctgtattttgttatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacacccat 14643735  T
Q  207 ttaacttgaatcaatg 222  Q
    || |||||||||||||    
T  14643734 ttgacttgaatcaatg 14643719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 18716489 - 18716597
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18716489 tattttacagatttatggttccagcaattcactcttgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgggggagaattatgttgttaatgcaa 18716588  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  18716589 caaaattct 18716597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 30020054 - 30019946
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  30020054 tatttcacatatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 30019955  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  30019954 caaaattct 30019946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 35096028 - 35096136
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  35096028 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 35096127  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  35096128 caaaattct 35096136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3409781 - 3409577
Alignment:
Q  40 aattcactcatgcattagagaattgat----ggatgatttagagtaagagaatgagggagaa-ttatgatgttaatgcaacaaaattcttgtt------- 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | | ||||||| |||||           
T  3409781 aattcactcatgcattagagaattaatatatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagtatcaaaatttttgttcatgttg 3409682  T
Q  128 ----tcttagtgtc-aaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
        |||  ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3409681 ttgttctgtgtgtctaaattaatgcccaaatgtcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcctttgacttgaatcaatg 3409582  T
Q  223 ttatg 227  Q
     ||||    
T  3409581 ctatg 3409577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 35090915 - 35091023
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |  |||||||| |||||||| ||    
T  35090915 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattttgatgaattatgttgttaatgtaa 35091014  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  35091015 caaaattct 35091023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3424904 - 3424704
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggaga-attatgatgttaatgca 113  Q
    ||||||||||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  3424904 tattttacagatttatgtttccagtaactcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagta 3424805  T
Q  114 acaaaattcttgt-----------ttcttagtgtc-aaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaaca 201  Q
    |||||| | ||||           ||||   |||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3424804 acaaaaattttgttcatgttgttgttctgtttgtctaaattaatgcccaaatatcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaaca 3424705  T
Q  202 c 202  Q
    |    
T  3424704 c 3424704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30019909 - 30019815
Alignment:
Q  134 tgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30019909 tgtcaaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatc-atgttatggt 30019815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 35091065 - 35091145
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  35091065 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 35091145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 35096178 - 35096258
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  35096178 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 35096258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 22118846 - 22118912
Alignment:
Q  133 gtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaa 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  22118846 gtgtcaaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtatattatatgacccttcacatgagagaaaa 22118912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 34602121 - 34602065
Alignment:
Q  43 tcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaatt 99  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34602121 tcactcatgcataagaaaattgatggatgatttagagtaaaagaatgagggagaatt 34602065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 25618435 - 25618387
Alignment:
Q  73 tttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaacaaaatt 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25618435 tttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaacaaaatt 25618387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34602059 - 34602012
Alignment:
Q  175 atatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34602059 atatgaccattcacatgagaaaaaacactcatttgacttgaatcaatg 34602012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34601940 - 34601886
Alignment:
Q  237 ccctttgccaaagattccaatatatatgaaagattctcacggagaattacaactt 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  34601940 ccctttgccaaagattcaaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactt 34601886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25618360 - 25618315
Alignment:
Q  136 tcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgac 181  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25618360 tcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 25618315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Original strand, 47071668 - 47071752
Alignment:
Q  210 acttgaatcaatgttatgg-tcattaa--accc-tttgccaaagattccaatatatatgaaagattctcacggagaattacaact 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||    
T  47071668 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccatttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattttcatgaagagttacaact 47071752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35369095 - 35368870
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  35369095 tattttacagatttatggttacaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaggaagaattatgtttttgatgcaa 35368996  T
Q  115 caaaattcttgttt-------------cttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaaca 201  Q
    ||||||||||||||              |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  35368995 caaaattcttgtttttgttgtgtgttgttgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacttttcacatgagagaaaaca 35368896  T
Q  202 ctcatttaacttgaatcaatgttatg 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35368895 ctcatttgacttgaatcaatgttatg 35368870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 2022964 - 2023188
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  2022964 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 2023063  T
Q  115 caaaattct-------------tgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaaca 201  Q
    |||||||||             ||||  |  ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  2023064 caaaattctgtccaaaattatgtgttgttgtgtgtccaactaatgcccatatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagca 2023163  T
Q  202 ctcatttaacttgaatcaatgttatg 227  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||    
T  2023164 c-cctttgacttgaatcaatgttatg 2023188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43540928 - 43540749
Alignment:
Q  50 tgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaacaaaattcttgtt--tcttagtgt-caaattaatg 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||  | ||  | ||| ||| ||||||||||    
T  43540928 tgcattagagaattgatagatgatttagagtaagagaatgatggagaactatgttgttaatgtaacaaaatttctattcatgtta-tgtccaaattaatg 43540830  T
Q  147 ccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43540829 cccagatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacat--gagagaacactcatttgacttgagtcaatgttatggt 43540749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9877743 - 9877635
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  9877743 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 9877644  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  9877643 caaaattct 9877635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13556509 - 13556401
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  13556509 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 13556410  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||| ||||    
T  13556409 caaacttct 13556401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 39903845 - 39903953
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  39903845 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39903944  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  39903945 caaaattct 39903953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 39908958 - 39909066
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  39908958 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39909057  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  39909058 caaaattct 39909066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Original strand, 4555653 - 4555830
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  4555653 tattttacagatttatggtaccaataattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4555752  T
Q  115 caaaattcttgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacac 202  Q
    |||||   |||| ||       |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||||||||    
T  4555753 caaaa---ttgtgtc-------caaatcgatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactattaacatgagagaaaacac 4555830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9872628 - 9872520
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   | ||||||||| |||||||| ||    
T  9872628 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattgtgaagaattatgttgttaatgtaa 9872529  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  9872528 caaaattct 9872520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13556358 - 13556273
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatg 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  13556358 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatg 13556273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9872478 - 9872398
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  9872478 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatg 9872398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9877593 - 9877513
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  9877593 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatg 9877513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 39909108 - 39909188
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  39909108 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatg 39909188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 39903995 - 39904075
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  39903995 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatg 39904075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 89
Target Start/End: Original strand, 25184116 - 25184166
Alignment:
Q  39 caattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatg 89  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184116 caattcactaatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatg 25184166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 43379556 - 43379618
Alignment:
Q  160 catttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43379556 catttatagtgcattatatgacccttcacat-----aaaacactcattttacttgaatcaatgttatg 43379618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 43378437 - 43378491
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatgga 69  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43378437 tattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattaaagaattgatgga 43378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43402191 - 43402100
Alignment:
Q  138 aaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  43402191 aaattaatgcctcaatgacaaacatttatagtgcattatatgatccttcatatgaaagaaaacatcaatttgattcgaatcaatgttatggt 43402100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35368735 - 35368679
Alignment:
Q  240 tttgccaaagattccaatatatatgaaagattctcacggagaattacaacttttgat 296  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||    
T  35368735 tttgccaaaggttccaatgtatatgaaagattctcataaagagttacaactcttgat 35368679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18608832 - 18608617
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18608832 tattttacagatttatcgttccgtcaattaactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 18608733  T
Q  115 caaaattcttgtttcttagtgt---caaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaac 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  18608732 caaaattcttgtttctt-gtgtgcccaaattaatgcctaaatgccaaacatttgtagtgcattatatga-ccttcacatgagagaaaacacccctttaac 18608635  T
Q  212 ttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18608634 ttgaatcaatgttatggt 18608617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10341163 - 10341053
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10341163 aatattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagaatttatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 10341064  T
Q  113 aacaaaattct 123  Q
    |||||||||||    
T  10341063 aacaaaattct 10341053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43957051 - 43956947
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaaca 116  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  43957051 ttttacaaatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgcaaca 43956952  T
Q  117 aaatt 121  Q
    |||||    
T  43956951 aaatt 43956947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 34108229 - 34108337
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  34108229 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 34108328  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  34108329 caaaattct 34108337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14315115 - 14315007
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  14315115 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14315016  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  14315015 caaaattct 14315007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14318819 - 14318711
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  14318819 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14318720  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  14318719 caaaattct 14318711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18494380 - 18494272
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  18494380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 18494281  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  18494280 caaaattct 18494272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 26982080 - 26981972
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  26982080 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26981981  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  26981980 caaaattct 26981972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 26987193 - 26987085
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  26987193 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26987094  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  26987093 caaaattct 26987085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25953363 - 25953255
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  25953363 tattgtacatatttatggttcaagcaattcactcatgcattagacaattgatggatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 25953264  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  25953263 caaaattct 25953255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Original strand, 1781869 - 1782055
Alignment:
Q  45 actcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaacaaaattcttgtttcttagtgt----caaa 140  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||  ||||   | ||||    ||||    
T  1781869 actcatgaattagagaattggtggatgattttgagtaagagaatgagggataattatgttgttaatgtaacggaatttctgtt--gttgtgtcctccaaa 1781966  T
Q  141 ttaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1781967 ttaatgtccaaatgtcaaacatttatagtgcagtatacgacctttcacatgagagaaaatactattttgacttgaatcaatgttatggt 1782055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 18885065 - 18885136
Alignment:
Q  16 attttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaa 87  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18885065 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaa 18885136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43956904 - 43956819
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatg 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43956904 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatg 43956819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14314965 - 14314885
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14314965 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatg 14314885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14318669 - 14318589
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14318669 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatg 14318589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18494230 - 18494150
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  18494230 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcac-cttttaacttgaatcaatgt 18494150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Original strand, 34108381 - 34108462
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  34108381 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgt 34108462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26987043 - 26986963
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  26987043 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 26986963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26981929 - 26981849
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  26981929 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 26981849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25953221 - 25953142
Alignment:
Q  150 taatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||    
T  25953221 taatgccaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagagaaaacacccatttgacttaaatcaattttatggt 25953142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43956743 - 43956681
Alignment:
Q  240 tttgccaaagattccaatatatatgaaagattctcacggagaattacaacttttgattctaaa 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||| |||||||| |||||||||||    
T  43956743 tttgccaaagattccaatgtatatgaaagatttccatgaagagttacaactcttgattctaaa 43956681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10341021 - 10340936
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatg 227  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||   ||| ||||||||||||| ||||    
T  10341021 taatgcccaaatgccaagcatttatggtgcattatatgactcttcacatgagaaaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatg 10340936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4181558 - 4181374
Alignment:
Q  43 tcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaacaaaattcttgtt--tcttagtgtcaaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||    
T  4181558 tcactcatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctcgtttatgtgtgtgtcaaa 4181459  T
Q  141 ttaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgtta 225  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  4181458 ttaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcatatgagagaaaacaccattttgacttgaatcaatgtta 4181374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37460047 - 37459783
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||     
T  37460047 aatattttacagatatatggtttcagcaattcgctaatgcatcagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgtgggagaattatgttgttcatgt 37459948  T
Q  113 aacaaaattcttgtttcttagtgt-caaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaac 211  Q
    |||| ||||| | | | |   ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  37459947 aacataattcctatatttgtatgtccatattaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgtccattcacatgagagaaaacacgcatttgat 37459848  T
Q  212 ttgaatcaatgttatgg-tcattaaac---cctttgccaaagattccaatatatatgaaagattc 272  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||   | |||||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  37459847 ttgaattgatgttatggttcattaaacactcatttgccaaaggttacaatgtatatgaatgattc 37459783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5440492 - 5440267
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5440492 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5440393  T
Q  115 caaaa-------ttcttgtt-tcttagtgt---caaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacact 203  Q
     ||||       |||||||| | || ||||   |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  5440392 taaaaattcttgttcttgttgtttttgtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacc 5440293  T
Q  204 catttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5440292 catttgacttgaatcaatgttatggt 5440267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5449502 - 5449277
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5449502 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5449403  T
Q  115 caaaa-------ttcttgtt-tcttagtgt---caaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacact 203  Q
     ||||       |||||||| | || ||||   |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  5449402 taaaaattcttgttcttgttgtttttgtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacc 5449303  T
Q  204 catttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5449302 catttgacttgaatcaatgttatggt 5449277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 14610364 - 14610472
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  14610364 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14610463  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  14610464 caaaattct 14610472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 12851674 - 12851780
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  12851674 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 12851773  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  12851774 caaaatt 12851780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 12856789 - 12856897
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  12856789 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 12856888  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  12856889 caaaattct 12856897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 26051021 - 26051129
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  26051021 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26051120  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  26051121 caaaattct 26051129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 26056134 - 26056242
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  26056134 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26056233  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  26056234 caaaattct 26056242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 26060380 - 26060488
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  26060380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26060479  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  26060480 caaaattct 26060488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 26065493 - 26065601
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  26065493 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26065592  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  26065593 caaaattct 26065601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 11056625 - 11056720
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaat 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  11056625 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgataaagaattatgttgttaat 11056720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35352495 - 35352330
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||          |||||||| ||||||||  |    
T  35352495 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatggtttatagtaaga----------gaattatgttgttaatgtga 35352406  T
Q  115 caaaattcttgt-ttct-tagtgt-caaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttca 187  Q
    |||||||||||| || | | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  35352405 caaaattcttgtattgtgttgtgtccaaattaatgcccaaatgtcaagcatatatggtgcattatatgacccttca 35352330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Original strand, 12851826 - 12851907
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgt 223  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  12851826 taatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgt 12851907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 12856939 - 12857019
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  12856939 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 12857019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 26051171 - 26051251
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  26051171 taatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 26051251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 26056284 - 26056364
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  26056284 taatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 26056364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 26060530 - 26060610
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  26060530 taatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 26060610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 26065643 - 26065723
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  26065643 taatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 26065723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5436736 - 5436692
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  5436736 aatattttacagatttatggttcaagcaattcactaatgcattag 5436692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20752322 - 20752105
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  20752322 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcatcagagaattgatggatgacttatagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 20752223  T
Q  115 caaaattctt---gtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaac 211  Q
    ||||||||||       ||  ||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20752222 caaaattctttccaaaactgtgtgtcaagttaatgcctaaatgccaagtatttatagtgcattagatgacctttcacatgagagaaaacactcatttgac 20752123  T
Q  212 ttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20752122 ttgaatcaatgttatggt 20752105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21936886 - 21936653
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  21936886 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatagatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgt 21936787  T
Q  113 aacaaaattc----------------ttgtt-tcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagag 195  Q
    |||||| |||                ||||| |  | |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21936786 aacaaagttcagtccaaaattgtgtgttgttgttgttgtgttaaactaatgcccaaatgttaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagag 21936687  T
Q  196 aaaacactcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  21936686 aaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggt 21936653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24509032 - 24508827
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  24509032 tattttacaaatttatgattccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24508933  T
Q  115 caaaattcttgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttg 214  Q
    || |||         || ||   |||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||    
T  24508932 cataat---------tttgtacaaaattaatgcccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttg 24508842  T
Q  215 aatcaatgttatggt 229  Q
    |||||||||||||||    
T  24508841 aatcaatgttatggt 24508827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2887490 - 2887596
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  2887490 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2887589  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2887590 caaaatt 2887596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2889212 - 2889318
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  2889212 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2889311  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2889312 caaaatt 2889318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11183370 - 11183257
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||    
T  11183370 tattttacaggtttatggtttcagcaatttactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaatgagagagaattatgttattattgtaa 11183271  T
Q  115 caaaattcttgttt 128  Q
    |||||||| |||||    
T  11183270 caaaattcatgttt 11183257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 21275773 - 21275881
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  21275773 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 21275872  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  21275873 caaaattct 21275881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 24509703 - 24509809
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  24509703 tattttacaaatttatggttccaacaattcactaatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24509802  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    || ||||    
T  24509803 cataatt 24509809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Original strand, 24509841 - 24509946
Alignment:
Q  133 gtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatgg-tca 231  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  24509841 gtgttaaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgaaccttcacatgagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttca 24509940  T
Q  232 ttaaac 237  Q
    ||||||    
T  24509941 ttaaac 24509946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 21937568 - 21937666
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatg 111  Q
    |||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21937568 aatattatacaaatttatggttccagcaattcactcatgcatttgagaattgatggatgttttagaataagagagtgatggaaaattatgttgttaatg 21937666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 21275923 - 21276003
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  21275923 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 21276003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Original strand, 21937707 - 21937812
Alignment:
Q  133 gtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatgg-tca 231  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  21937707 gtgttaaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcgttatatgacccttcacatgagagaaaatacccctttgacttgaatcaatgtgatggttca 21937806  T
Q  232 ttaaac 237  Q
    ||||||    
T  21937807 ttaaac 21937812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44524226 - 44523998
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44524226 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgcaa 44524127  T
Q  115 caaaattc--------ttgtttcttagtg----tcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcac--attagagaaaac 200  Q
    ||| ||||        |||| | ||  ||    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||    
T  44524126 caatattctgttcaaattgtgtgttgttgttgttcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacatatgagggaaaac 44524027  T
Q  201 actcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44524026 acccatttgacttgaatcaatgttatggt 44523998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 16051206 - 16051422
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatga-tgttaatgca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||  ||||  ||||||| |    
T  16051206 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagaaaatgagtaagaa-aatgagggttaatgta 16051304  T
Q  114 acaaaattcttgtt-tcttagtgt-caaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaac 211  Q
    |||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||    
T  16051305 acaaaattcttgttcttgttgtgtccaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagtgaaaacacccttttgac 16051404  T
Q  212 ttgaatcaatgttatggt 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  16051405 ttgaatcaatgatatggt 16051422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17414740 - 17414556
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17414740 tattttccagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 17414641  T
Q  115 caaaattcttgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcattt 208  Q
    |||||||| |||          |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  17414640 caaaattcatgt---------ccaaattgatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgaccattcacatgagagaaaccacccattt 17414556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 19310826 - 19311047
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaaca 116  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  19310826 ttttacagatttatggttccagcaattcattcatgcattagagaattgatggatgatttatagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgtaaca 19310925  T
Q  117 aaattct-----------tgtttc-ttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactc 204  Q
    ||| |||           |||| | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  19310926 aaactctgtccaaaattatgttgcttttgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattacatgacccttcacatgagagaaagcaccc 19311025  T
Q  205 atttaacttgaatcaatgttat 226  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  19311026 ctttgacttgaatcaatgttat 19311047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 227
Target Start/End: Original strand, 43358755 - 43358978
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaaca 116  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43358755 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaaca 43358854  T
Q  117 aaattc---------ttgtttctt----agtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacact 203  Q
    ||||||         |||| | ||     ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  43358855 aaattcagtccaaaattgtgtgttgtagtgtgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattataggactcttcacatgagagaaagcact 43358954  T
Q  204 catttaacttgaatcaatgttatg 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  43358955 catttgacttgaatcaatgctatg 43358978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 35626172 - 35626287
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  35626172 tattttatagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 35626271  T
Q  115 caaaattcttgtttct 130  Q
    ||||||||| ||||||    
T  35626272 caaaattctggtttct 35626287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 13654335 - 13654546
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgattt--agagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13654335 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 13654434  T
Q  113 aacaaaattcttgtttc-----ttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatt 207  Q
    |||||||||||   | |     |  |||||||||||||||        |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  13654435 aacaaaattct--atccaaaattgtgtgtcaaattaatgc--------caagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctt 13654524  T
Q  208 taacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  13654525 tgacttgaatcaatgttatggt 13654546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21431865 - 21431648
Alignment:
Q  26 tttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaacaaaattcttg 125  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21431865 tttatggttccatcaattcactgatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttg 21431766  T
Q  126 -------tttct-tag-----tgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaaca-ctcatttaac 211  Q
           ||||| | |     |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | | ||| ||    
T  21431765 ttcttgttttctgttgttctctgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcaccccctttgac 21431666  T
Q  212 ttgaatcaatgttatggt 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  21431665 ttaaatcaatgttatggt 21431648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 1187826 - 1188057
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  1187826 aatattttacagatttatggttctaccaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatga-ggagatttatgttgttaatgt 1187924  T
Q  113 aacaaaattct-------tgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactca 205  Q
    |||||||||||       |||||  | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  || || ||||||| || ||||| |||| |||||| |     
T  1187925 aacaaaattcttgttctgtgttttgttgtgtcaaattaatgcccaaatggcaagcacttattatggattatatgactctacacatgagagtaaacacccc 1188024  T
Q  206 tttaacttgaatcaatgttatgg-tcattaaac 237  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1188025 tttgacttgaattaatgttatggttcattaaac 1188057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10186783 - 10186675
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  10186783 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 10186684  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  10186683 caaaattct 10186675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 3465473 - 3465581
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  3465473 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3465572  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  3465573 caaaattct 3465581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 3468067 - 3468175
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  3468067 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3468166  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  3468167 caaaattct 3468175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 28574297 - 28574405
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  28574297 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28574396  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  28574397 caaaattct 28574405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 28598309 - 28598417
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  28598309 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28598408  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  28598409 caaaattct 28598417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10186641 - 10186548
Alignment:
Q  136 tcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  10186641 tcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaaccaatgctatggt 10186548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 28574447 - 28574527
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28574447 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatg 28574527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 28598459 - 28598539
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28598459 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatg 28598539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Original strand, 3468218 - 3468299
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  3468218 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacatctttaacttgaatcaatgt 3468299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35653311 - 35653220
Alignment:
Q  138 aaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  35653311 aaattaatgcccaaatgtcaagtgtttataaggctatatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgaattgaatcaatgatatggt 35653220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3701548 - 3701492
Alignment:
Q  146 gccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacac 202  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||    
T  3701548 gcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatgtgactcttcacatgagagaaaacac 3701492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 29681588 - 29681632
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattag 57  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  29681588 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 29681632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 48366257 - 48366213
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattag 57  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  48366257 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 48366213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 290
Target Start/End: Original strand, 19311121 - 19311174
Alignment:
Q  237 ccctttgccaaagattccaatatatatgaaagattctcacggagaattacaact 290  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  19311121 ccctttgccaaaggttccaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaact 19311174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 49784494 - 49784721
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  49784494 aatattttccagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatagatgatttaaagtaaaagaatgagggggaattatgttgttaatgc 49784593  T
Q  113 aacaaaattct-------------tgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaa 199  Q
    |||||||||||             ||||  |   |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  49784594 aacaaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaa 49784693  T
Q  200 cactcatttaacttgaatcaatgttatg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49784694 cactcatttgacttgaatcaatgttatg 49784721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 227
Target Start/End: Original strand, 29827448 - 29827638
Alignment:
Q  39 caattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaacaaaattcttgttt---cttagtg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    ||  ||    
T  29827448 caattcactcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattaggttattaatgcaacaaaattcttgtttatgttttttg 29827547  T
Q  136 tcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttatg 227  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  29827548 tcaaactaatgcccaaatgccaagcatttataatgcattatatga-ctttcacatgatagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatg 29827638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18024354 - 18024174
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  18024354 aatattttacagatttattgttctaacaattcattcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 18024255  T
Q  113 aacaaaattcttgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacac 202  Q
    ||||||||  | || ||       |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18024254 aacaaaat--tagtatc-------caaattgatgaccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacac 18024174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Original strand, 20891059 - 20891237
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  20891059 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagcgaatgagggagaattatgttgtttatgtaa 20891158  T
Q  115 caaaattcttgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacac 202  Q
    |||| ||| |||         ||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20891159 caaagttcgtgt---------tcaaattgatacccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacac 20891237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3187660 - 3187546
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3187660 aatattttacagatttatggttcgagcaattcactcatgcattaaagaattgatagatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 3187561  T
Q  113 aacaaaattcttgtt 127  Q
     ||||||||| ||||    
T  3187560 cacaaaattcgtgtt 3187546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5458216 - 5458108
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  5458216 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5458117  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  5458116 caaaattct 5458108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5481692 - 5481584
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  5481692 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5481593  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  5481592 caaaattct 5481584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6858259 - 6858151
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  6858259 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6858160  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  6858159 caaaattct 6858151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 8458311 - 8458419
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  8458311 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8458410  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  8458411 caaaattct 8458419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 8464750 - 8464858
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  8464750 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8464849  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  8464850 caaaattct 8464858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31081711 - 31081603
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  31081711 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31081612  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  31081611 caaaattct 31081603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 4049807 - 4049915
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  4049807 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4049906  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  4049907 caaaattct 4049915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6853156 - 6853048
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  6853156 tattttacagatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6853057  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  6853056 caaaattct 6853048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10591499 - 10591391
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||||| ||    
T  10591499 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10591400  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  10591399 caaaattct 10591391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10673142 - 10673034
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  10673142 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10673043  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  10673042 caaaattct 10673034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10678257 - 10678149
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  10678257 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10678158  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  10678157 caaaattct 10678149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31076606 - 31076498
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  31076606 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31076507  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  31076506 caaaattct 31076498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1302449 - 1302343
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  1302449 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 1302350  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  1302349 caaaatt 1302343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 33703299 - 33703405
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  33703299 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33703398  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  33703399 caaaatt 33703405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 4054941 - 4055049
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  4054941 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4055040  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  4055041 caaaattct 4055049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33702804 - 33702696
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  33702804 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33702705  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  33702704 caaaattct 33702696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10585062 - 10584954
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||||| ||    
T  10585062 tattttacagatttatggttctagctattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10584963  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  10584962 caaaattct 10584954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5458065 - 5457984
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  5458065 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgt 5457984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5481542 - 5481461
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  5481542 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgt 5481461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 4049958 - 4050038
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4049958 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatg 4050038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10584912 - 10584832
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  10584912 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatg 10584832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Original strand, 8464900 - 8464981
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  8464900 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgt 8464981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1302298 - 1302218
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1302298 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 1302218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 4055092 - 4055172
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  4055092 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 4055172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6853006 - 6852926
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  6853006 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 6852926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6858109 - 6858029
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  6858109 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaatcacctctttaacttgaatcaatg 6858029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10591349 - 10591269
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  10591349 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 10591269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10672992 - 10672912
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  10672992 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 10672912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33702653 - 33702573
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  33702653 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 33702573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 222
Target Start/End: Original strand, 8458471 - 8458542
Alignment:
Q  151 aatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  8458471 aatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatg 8458542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31076456 - 31076376
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  31076456 taatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 31076376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31081561 - 31081481
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  31081561 taatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 31081481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 33703450 - 33703506
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  33703450 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaa 33703506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10678107 - 10678025
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgata--tgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| | ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  10678107 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgtgactcttcacatgaaagaaagcacctttttaacttgaatcaatg 10678025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 290
Target Start/End: Original strand, 29827773 - 29827823
Alignment:
Q  240 tttgccaaagattccaatatatatgaaagattctcacggagaattacaact 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  29827773 tttgccaaaggttccaatctatatgaaagattcccatgcagaattacaact 29827823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 144096 - 144307
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgattt--agagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  144096 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 144195  T
Q  113 aacaaaattcttgtttc-----ttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatt 207  Q
    |||||||||||   | |     |  |||||||||||||||        |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  144196 aacaaaattct--atccaaaattgtgtgtcaaattaatgc--------caagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctt 144285  T
Q  208 taacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  144286 tgacttgaatcaatgttatggt 144307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 716267 - 716492
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |     
T  716267 tattttacagatttagggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaaggagaattatgttgttaaagaag 716366  T
Q  115 caaaattcttgtttct--------tagt--gtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactc 204  Q
    |||||||||||||| |        | ||  |||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||  |    
T  716367 caaaattcttgtttatgttttctgttgtcagtcacactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacctttcatatgagagaaaacatcc 716466  T
Q  205 atttaacttgaatcaatgttatggtc 230  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||    
T  716467 ctttgacttgaatcaatgttacggtc 716492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 16284437 - 16284553
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgattt-agagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgca 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16284437 tattttactgatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgattttagagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgca 16284536  T
Q  114 acaaaattcttgtttct 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  16284537 acaaaattcttgtttct 16284553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 42780184 - 42780410
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |  ||||| ||    
T  42780184 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatg-tagtaatgtaa 42780282  T
Q  115 caaaattct-------------tgtttcttagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaaca 201  Q
    |||||||||             ||||  |  ||||| || |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42780283 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtgtccaactaatgcccaactgtcaatcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaaca 42780382  T
Q  202 ctcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  42780383 cccctttgacttgaatcaatgttatggt 42780410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30283645 - 30283417
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  30283645 tattttacagatttatggttctagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaaggatggagaattatgttgttaatgtaa 30283546  T
Q  115 caaaattct----------tgtttcttagtg----tcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaac 200  Q
    |||||||||          |||||  | |||    |  || |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  30283545 caaaattctgtccaaattgtgtttagttgtgtgttttcaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatgaaagaaaac 30283446  T
Q  201 actcatttaacttgaatcaatgttatggt 229  Q
    || | |||||||||||||||| |||||||    
T  30283445 acccctttaacttgaatcaatattatggt 30283417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14917586 - 14917478
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  14917586 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14917487  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  14917486 caaaattct 14917478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17720730 - 17720622
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||    
T  17720730 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 17720631  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  17720630 caaaattct 17720622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 45120386 - 45120494
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  45120386 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattggagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 45120485  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  45120486 caaaattct 45120494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14917436 - 14917356
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14917436 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacagctatttaacttgaatcaatg 14917356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20892409 - 20892321
Alignment:
Q  136 tcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgtt 224  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20892409 tcaaactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacacgagagaaaacactcatttgatttgaatcaatgtt 20892321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Original strand, 45120537 - 45120618
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  45120537 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgt 45120618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17720580 - 17720500
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  17720580 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatg 17720500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 16286004 - 16286055
Alignment:
Q  175 atatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatgttat 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  16286004 atatgacccttcacatgagagaaaacacccatttaacttcaatcaacgttat 16286055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 173358 - 173573
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  173358 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 173457  T
Q  115 caaaattcttgtttct--------tagtgtcaaattaatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcat 206  Q
    |||||||||| |||||        |  ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  173458 caaaattcttttttctgtattttgttatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacacccat 173557  T
Q  207 ttaacttgaatcaatg 222  Q
    || |||||||||||||    
T  173558 ttgacttgaatcaatg 173573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2223 - 2115
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  2223 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 2124  T
Q  115 caaaattct 123  Q
     ||||||||    
T  2123 taaaattct 2115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2073 - 1993
Alignment:
Q  142 taatgccctaatgtcaagcatttatagtgcatgatatgacccttcacattagagaaaacactcatttaacttgaatcaatg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  2073 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatg 1993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University