View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16659_high_3 (Length: 647)

Name: NF16659_high_3
Description: NF16659
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16659_high_3
NF16659_high_3
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (8-631)||(4678316-4678938)
chr1 (85-597)||(34466585-34467089)
chr1 (46-594)||(15594859-15595414)
chr1 (67-132)||(52549269-52549334)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (35-631)||(8659177-8659773)
chr7 (32-594)||(8654261-8654823)
chr7 (32-597)||(13333248-13333813)
chr7 (10-594)||(1301249-1301837)
chr7 (32-597)||(10494166-10494731)
chr7 (67-597)||(8667265-8667795)
chr7 (32-594)||(8585501-8586063)
chr7 (31-602)||(8646687-8647258)
chr7 (49-602)||(3147092-3147653)
chr7 (40-584)||(17267758-17268302)
chr7 (40-584)||(17260060-17260604)
chr7 (298-594)||(8628609-8628905)
chr7 (47-567)||(27830697-27831217)
chr7 (46-594)||(6789337-6789885)
chr7 (413-597)||(8671422-8671606)
chr7 (248-603)||(8636129-8636484)
chr7 (188-602)||(29581628-29582042)
chr7 (46-431)||(8545458-8545843)
chr7 (188-602)||(8576293-8576707)
chr7 (296-602)||(8590713-8591019)
chr7 (46-602)||(8570136-8570692)
chr7 (284-602)||(8602037-8602355)
chr7 (188-588)||(8382677-8383077)
chr7 (188-432)||(29577629-29577873)
chr7 (250-602)||(7877520-7877872)
chr7 (511-597)||(8640339-8640425)
chr7 (32-304)||(8616492-8616764)
chr7 (31-116)||(8673894-8673979)
chr7 (453-597)||(39985878-39986022)
chr7 (284-602)||(8581763-8582081)
chr7 (467-576)||(8538282-8538391)
chr7 (283-564)||(8559395-8559676)
chr7 (45-177)||(8664159-8664289)
chr7 (463-582)||(8610159-8610278)
chr7 (284-419)||(39985709-39985844)
chr7 (470-602)||(8017200-8017332)
chr7 (528-597)||(8102974-8103043)
chr7 (265-345)||(8609961-8610041)
chr7 (464-567)||(29577491-29577594)
chr7 (31-127)||(8537846-8537942)
chr7 (80-132)||(8664919-8664971)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (30-602)||(16657304-16657876)
chr2 (40-597)||(43625231-43625788)
chr2 (31-594)||(16661787-16662350)
chr2 (67-602)||(7542072-7542607)
chr2 (31-602)||(14703218-14703789)
chr2 (31-597)||(12234499-12235065)
chr2 (97-597)||(12245198-12245698)
chr2 (272-597)||(12258373-12258698)
chr2 (456-597)||(17716485-17716626)
chr2 (45-168)||(12258802-12258925)
chr2 (456-595)||(17717748-17717887)
chr2 (97-597)||(11999283-11999770)
chr2 (389-419)||(17716657-17716687)
chr2 (389-419)||(17717918-17717948)
chr2 (506-595)||(17703843-17703932)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (67-597)||(9335683-9336213)
chr4 (34-582)||(30775065-30775613)
chr4 (67-602)||(35132303-35132829)
chr4 (453-597)||(23596377-23596521)
chr4 (453-597)||(23587525-23587669)
chr4 (527-600)||(54396729-54396802)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (47-348)||(28219744-28220045)
chr5 (369-602)||(28220099-28220332)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (31-341)||(43744626-43744936)
chr8 (369-602)||(43744997-43745228)
chr8 (188-417)||(12528471-12528700)
chr8 (464-602)||(12528747-12528885)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (289-597)||(28910650-28910958)
chr6 (466-515)||(11314610-11314659)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 4678938 - 4678316
Alignment:
Q  8 acatcatcaatatcactcccgcgcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaact 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678938 acatcatcaatattactcccgcgcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaact 4678839  T
Q  108 tggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678838 tggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctac-tcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctc 4678740  T
Q  208 gcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgtta 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678739 gcaggcagttctcaacctccttaagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgtta 4678640  T
Q  308 tcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678639 tcaaagtcctctccacctaggtgagtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccac 4678540  T
Q  408 caaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4678539 caaggtcaaagacaaatatatttcgtttacaatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcaacagtaggttcgttgattatttgaat 4678440  T
Q  508 gacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaa 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4678439 gacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgttgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacgacattcttcacagacgaa 4678340  T
Q  608 gttagatatgtttcagcaacttct 631  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  4678339 gttagatatgtttcggcaacttct 4678316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 34467089 - 34466585
Alignment:
Q  85 gtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaa 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||   ||||| ||| ||| | ||||||||||||  |||||||| | ||||||           
T  34467089 gtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaatggaagtcaattacctcatataaagaatctatttcaacagtagcgacaaa------- 34466997  T
Q  185 gagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctcta 284  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  || | | | | |||   |||||| |||  ||||| |||| | |||||||||| |     
T  34466996 -agagtgtcctctttgcattctcgcacgcagttctcaacctcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgcttcctcttgaactcctttg 34466898  T
Q  285 caaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggat 384  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||||  | |||| ||| ||||||     
T  34466897 caaagtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaaggag 34466798  T
Q  385 agacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtt-tacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagc 483  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || | | | ||   |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34466797 agacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacgaaaatatttccttcttcca-caaagtcagctctcttgtcaagtccatatgcaatagctgcagc 34466699  T
Q  484 agtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagta 583  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||     
T  34466698 agtgggttcattgattatttgcaaaacattaaggccagcaatagtaccagcatccacagtagcttttcgctgagaatcattaaaataagcaggcacggtg 34466599  T
Q  584 acaacggcattctt 597  Q
    | ||| ||||||||    
T  34466598 ataactgcattctt 34466585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 594
Target Start/End: Original strand, 15594859 - 15595414
Alignment:
Q  46 aagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctga 145  Q
    ||||||||||| |||  | | |||||| || || |||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||  |||||| | ||||| || || | |    
T  15594859 aagacaactctcaactatcttcatacaatccttaaaaaagtccatgttgatttcttcaaacttggaacgagtaaccgatgaaaagaagtcaataccgtta 15594958  T
Q  146 aataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttct 245  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||||   |  |||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||   ||| ||||     
T  15594959 aataaacaatctacctcaatggtagtgacagtagtaaaagagagtaccctttttgccctttcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcccttgggttcc 15595058  T
Q  246 tactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagt 345  Q
     | |||| ||||| || |||||| | ||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||    
T  15595059 cagtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgt 15595158  T
Q  346 ggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactt 445  Q
    ||| || ||||  |||||     |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | | |||      
T  15595159 ggccttaacttggaagaccttgtccttaattgttaggatagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttctccaacacag 15595258  T
Q  446 tcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctg-------cagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatct 538  Q
    | | | ||||||||||  ||||||||||||||||       |||| || ||||| |||||||   | || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15595259 ttaatcctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagctgtcagctgtcggttcattgattacccgtataacattaaggccagcaatggcacctgcatct 15595358  T
Q  539 atggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcatt 594  Q
    || || |||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||    
T  15595359 atagtggcttttcgttgagaatcattgagataagcaggcacggtaacaactgcatt 15595414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52549334 - 52549269
Alignment:
Q  67 catacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaa 132  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||||||    
T  52549334 catacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaa 52549269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 631
Target Start/End: Original strand, 8659177 - 8659773
Alignment:
Q  35 tttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagt 134  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | ||||    
T  8659177 tttgaatcgctaagacaactctcaacagttttcatacactcattaaaaagatccatattcatttcctcaaacctggcacgagtgattaatgaacagaagt 8659276  T
Q  135 ctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataaggg 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  8659277 ctattccctgaaataaagaatcgacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaagga 8659376  T
Q  235 ttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtg 334  Q
    ||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  8659377 ttttgggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtg 8659476  T
Q  335 tttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||    
T  8659477 tttccagaagtggcttttacttcaaagacatcacccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaagaccaaaatattttgtt 8659576  T
Q  435 tacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagc 534  Q
    ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  8659577 taccatcacagtcacctctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaatggcaccgga 8659676  T
Q  535 atctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttct 631  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||| || |||||||||    
T  8659677 atctatggtggcttttcgctgagaatcattgaactatgcaggcactgtaacaacagcattcttcacaggtgacattagatatgtctctgcaacttct 8659773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 32 - 594
Target Start/End: Original strand, 8654261 - 8654823
Alignment:
Q  32 atctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaa 131  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| | |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  8654261 atctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaa 8654360  T
Q  132 agtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataa 231  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8654361 agtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 8654460  T
Q  232 gggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgg 331  Q
    || ||||| |||    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  8654461 ggattttgggttaccgctaatttccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgc 8654560  T
Q  332 gtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |    
T  8654561 gtgtttccagcagtggcttttacgtcaaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattcc 8654660  T
Q  432 gtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcacc 531  Q
    |||||| ||||   | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8654661 gtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcacc 8654760  T
Q  532 agcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcatt 594  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8654761 agcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatt 8654823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 32 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 13333813 - 13333248
Alignment:
Q  32 atctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaa 131  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| | | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  13333813 atctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaa 13333714  T
Q  132 agtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataa 231  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  || |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13333713 agtcgattcccataaataaagcatctacttcaacagtggtgacaaaagaaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 13333614  T
Q  232 gggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgg 331  Q
    || ||||| ||||  ||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  13333613 ggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtga 13333514  T
Q  332 gtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttc 431  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  13333513 gtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagacatcacccataattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttc 13333414  T
Q  432 gtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcacc 531  Q
    | |||| |||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||    
T  13333413 gcttaccatcacaatcacgtctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattattcgaatgatattaaggccagcaatagcacc 13333314  T
Q  532 agcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13333313 agcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagccggcacagtaacaacggcattctt 13333248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 10 - 594
Target Start/End: Original strand, 1301249 - 1301837
Alignment:
Q  10 atcatcaatatcactcccgcgcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttg 109  Q
    |||||| |||||||||  ||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||   ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1301249 atcatcgatatcactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacggtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttg 1301348  T
Q  110 gcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgc 209  Q
    |||||||| ||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1301349 gcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgaaataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcac 1301448  T
Q  210 aggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatc 309  Q
    | ||| |||||||||||| ||||| |||   |||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1301449 acgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttctgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatc 1301548  T
Q  310 aaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccacca 409  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1301549 aaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgcca 1301648  T
Q  410 aggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcag----taggttcgttgattatttga 505  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||| || ||||| |||    
T  1301649 aggtcaaagaccaaaatattccgtttaccatcacagtcacttctcttgtcaaaaccatacgcaatagctgcagcagtagctaggttcattaattatctga 1301748  T
Q  506 atgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcatt 594  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  1301749 atgacattaaggccagcaattgcaccggcatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaaatgtgcaggcacagtaacaacagcatt 1301837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 32 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10494731 - 10494166
Alignment:
Q  32 atctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaa 131  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| | | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  10494731 atctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaa 10494632  T
Q  132 agtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataa 231  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  10494631 agtcgattcccataaataaagcatcgacctcaacggtggtgacaaaagaaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 10494532  T
Q  232 gggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgg 331  Q
    || |||||  |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||     
T  10494531 ggattttggattcccactgatgtccacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattctgttatcgaagtcctctcccccaaggtga 10494432  T
Q  332 gtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttc 431  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  10494431 gtgttacctgcagtggcttttacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttc 10494332  T
Q  432 gtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcacc 531  Q
    | ||||  ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10494331 ggttaccctcacaatcacttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagcacc 10494232  T
Q  532 agcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  10494231 agcatcaatagtagcctttcgttgagaatcgttgaagtaagccggcacagtaacaacagcattctt 10494166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 67 - 597
Target Start/End: Original strand, 8667265 - 8667795
Alignment:
Q  67 catacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaaca 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  8667265 catacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttagcacgagtaattgatgaacaaaagtcgattcccgtaaataaagcatctacctcaaca 8667364  T
Q  167 gtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattct 266  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  8667365 gtggtaacaaaagcaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgactgatgtccactttattct 8667464  T
Q  267 tctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacacc 366  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  8667465 tcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgagtgtttcctgcagtggctttcacttcaaagacatc 8667564  T
Q  367 acccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaacca 466  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||  ||| |||||  ||| ||||||||||||  |||    
T  8667565 acccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggctaccatcacagtcatttctcttgtcaaggcca 8667664  T
Q  467 tatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattga 566  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8667665 tatgcaatagctgccgcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattga 8667764  T
Q  567 agtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8667765 agtaagctggcacagtaacaacggcattctt 8667795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 8586063 - 8585501
Alignment:
Q  32 atctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaa 131  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||| |    
T  8586063 atcttagaatcggtaagacaactctcaacagtatttatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgcgtgattgatgaagaga 8585964  T
Q  132 agtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataa 231  Q
    | || |  |||| | ||||| |||| |  |||| ||| ||||| ||   |||||| |||||||| |||||| | || || || ||||| |||| ||  ||    
T  8585963 aatcgacgccctcacataaataatcaatttcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttcttaaccgcctcaa 8585864  T
Q  232 gggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgg 331  Q
     | | ||| ||||||| |||| |||||||| |||||  | || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||     
T  8585863 agctcttgggttcttagtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaaggtga 8585764  T
Q  332 gtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttc 431  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  8585763 gtatttccagcggttgctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttc 8585664  T
Q  432 gtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcacc 531  Q
    ||| || |||||  | || | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    || |||||||| ||||||||||||||    
T  8585663 gttcaccatcacagttacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcacc 8585564  T
Q  532 agcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcatt 594  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  8585563 agcatccatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacagtcacaactgcatt 8585501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 602
Target Start/End: Original strand, 8646687 - 8647258
Alignment:
Q  31 catctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaa 130  Q
    |||||| | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| || ||||||  |    
T  8646687 catcttggcatcattatgacaactctcaacagtttccaaacattcgatgaacagatccatattgattgcgtcaaatttggcacgagtgattgatgaaata 8646786  T
Q  131 aagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccata 230  Q
    ||||| || || | ||||||||||||||  ||||  ||||||  | | || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  8646787 aagtcaatgccattaaataaagaatctaattcaatggtggtgcaagaagcaaaagatagtgtcctttttgctctctcgcatgccgttctcaacctcctta 8646886  T
Q  231 agggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtg 330  Q
    ||| | ||| |||   | |||||||||| || |||||||| || || || | | |||||| || |||||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  8646887 aggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgcaaagtggtccaccattctactatcaaagtcctctcctccgaggtg 8646986  T
Q  331 ggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatattt 430  Q
     ||||||||||| |||||||| || | ||||||   | |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8646987 agtgtttccagcggtggctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagttccaccaccaaggtcgaagatgaatatattt 8647086  T
Q  431 cgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcac 530  Q
    ||||    | |||  |   ||||||||||||  |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||||||| |    
T  8647087 cgttcttcagcacaatttgttctcttgtcaaggccatatgcgagagcagcagctgttggttcattgattatccggatgatattaaggccagcaatggccc 8647186  T
Q  531 cagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    | |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8647187 cggcatctatagtggcttttcgctgataatcattgaagtatgcaggcacagtaacaactgcattctttacag 8647258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 602
Target Start/End: Original strand, 3147092 - 3147653
Alignment:
Q  49 acaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| | ||||||||||    
T  3147092 acaactcttaacagtttccaaacactcagtgaaaagatccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgatgaaaataagtcaaatccctgaaat 3147191  T
Q  149 aaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttac 248  Q
    |||||||||| |||||  |||||||  |  || ||||| ||| | |  ||||| || || || || ||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||    
T  3147192 aaagaatctatctcaatggtggtgatgacagcaaaagatagtattcgttttgctctttcacacgccgttttcaacctccttaaggctcttgagttctcac 3147291  T
Q  249 taatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggc 348  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||  | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||    
T  3147292 taatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcctgcgatggc 3147391  T
Q  349 ttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcg------tttacgat-- 440  Q
     || |||| ||||||   | |||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||| ||      |  || ||      
T  3147392 cttaacttgaaagaccttatccttaattgtaagaagagacacatcaaaagtcccaccacccaagtcaaagataaaaatattacgctcctctacacaatta 3147491  T
Q  441 cactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctat 540  Q
    |||  | | |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || | |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  3147492 cacaattagttctcttgtccagtccatacgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgcataatattaaggccagcaataacaccagcatctat 3147591  T
Q  541 ggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
     || ||||| ||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  3147592 tgtcgctttccgctgagcatcattgaaataagcaggtacggtaacaactgcattcttgacag 3147653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 584
Target Start/End: Original strand, 17267758 - 17268302
Alignment:
Q  40 atcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctatt 139  Q
    ||||||||||||  ||| |||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |      
T  17267758 atcactaagacacttctcaacaatctccatgcactcatcaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaatcaaca 17267857  T
Q  140 ccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttg 239  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||  | || || ||||||||||||||||  | || |||||    
T  17267858 cccttaaataaagcgtctacctcaacattggtcacagaggcgaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggcttttg 17267957  T
Q  240 cgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttcc 339  Q
     ||||  |  ||| | ||  || || ||| ||||||  ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || || || || |||| |||    
T  17267958 ggttcccaacaattttcaatttttttttccttttgatttcctcaacaaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctcc 17268057  T
Q  340 agcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacga 439  Q
    | | ||||| || ||||| |||||   | |||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    |    
T  17268058 accggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgttcttca 17268157  T
Q  440 tcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgatta-tttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatct 538  Q
     |||  | | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17268158 acacagttagttctcttgccaaggccatatgcaatagctgcagcagttggttcattgattaccttcaat-acattaaggccagcaatgacaccagcatct 17268256  T
Q  539 atggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaa 584  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  17268257 atggtggcttttcgctgagaatcgttgaagtaagccgggacagtaa 17268302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 584
Target Start/End: Original strand, 17260060 - 17260604
Alignment:
Q  40 atcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctatt 139  Q
    ||||||||||||  ||| |||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |  |      
T  17260060 atcactaagacacttctcaacaatctccatgcactcataaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaattaaca 17260159  T
Q  140 ccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttg 239  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||  | || || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17260160 cccttaaataaagcgtctacctcaacattggtcacagaggcaaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggcttttg 17260259  T
Q  240 cgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttcc 339  Q
     ||||  | |||||||||  || ||| |  |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || || || || |||| |||    
T  17260260 ggttcccaataatgtccaattttttcgttcttttgatctcctctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctcc 17260359  T
Q  340 agcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacga 439  Q
    | | ||||| || ||||| |||||   | |||| ||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||     |    
T  17260360 accggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgagagacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgtacttaa 17260459  T
Q  440 tcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatcta 539  Q
     |||  | | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  |  |  |||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17260460 acacaattagttctcttgacaaggccatatgcaatagctgcagcaataggttcattaattaacttcaaaacataaaggccagcaataacaccagcatcta 17260559  T
Q  540 tggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaa 584  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  17260560 tggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggaacagtaa 17260604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 298 - 594
Target Start/End: Original strand, 8628609 - 8628905
Alignment:
Q  298 cattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||    
T  8628609 cattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaa 8628708  T
Q  398 gtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttga 497  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||    || | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  8628709 gtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtggggtcattga 8628808  T
Q  498 ttatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcatt 594  Q
    ||||    || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  8628809 ttatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcattcatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatt 8628905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 27831217 - 27830697
Alignment:
Q  47 agacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaa 146  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||   |||| | ||||| || |||| ||    
T  27831217 agacaactctcaacagtctccatacattcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagtcaatgccctcaa 27831118  T
Q  147 ataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttctt 246  Q
    |||| | ||||| ||||| ||| ||| |||  |  |||||||||||||| |||||| |||| ||    ||||||| |||||  |||| | ||| ||||      
T  27831117 ataaggcatctatctcaatagtagtgtcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggctcttgggttccc 27831018  T
Q  247 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 346  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  27831017 actaatgtccactcttttcttcttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagcagtt 27830918  T
Q  347 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcacttt 446  Q
    || || ||||  |||||   | |||| ||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  | |  |  ||    
T  27830917 gccttaacttggaagaccttatccttaattgtaacaagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaacacaaaaatattccgttctccagtatatt 27830818  T
Q  447 cacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagc 546  Q
       ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| | |||||  || ||    
T  27830817 ttgttcccgtgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggctcgcttattatccgcataacattaaggccagcaatggcaccggaatctacagtggc 27830718  T
Q  547 ttttcgctgagaatcattgaa 567  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  27830717 ttttcgttgagagtcattgaa 27830697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 594
Target Start/End: Original strand, 6789337 - 6789885
Alignment:
Q  46 aagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctga 145  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||   ||||| || ||||||    
T  6789337 aagacaactctcaacggtcttcatacactcattaaaaatatccatattgatttcctcaaacttggcccgagtaagtgatgaaatgaagtcgatgccctga 6789436  T
Q  146 aataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttct 245  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| |   | |||||||||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| | |||||   ||| |||      
T  6789437 aataaagagtctacctcaatagtagtgacgacaacaaaagagagtacccttttggccctttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttc 6789536  T
Q  246 tactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagt 345  Q
     | |||| ||||| || |||||| | || ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||    
T  6789537 cagtaatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggt 6789636  T
Q  346 ggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactt 445  Q
    ||| || ||||  |||||   | | |||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||  ||  | | |        
T  6789637 ggccttaacttggaagaccttatctttgattgttaagatagacacatcgaaagtgccaccaccaaggtcgaagacgaaaatatttttttctccaccgtaa 6789736  T
Q  446 tcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtag 545  Q
    | | ||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  6789737 ttagttctcttatcaaggccatatgcaagagcagcagctgttggttcattgattattcgtataacattaagaccagcaatggcaccagcatctaaagtgg 6789836  T
Q  546 cttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcatt 594  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  6789837 ctttccgttgagaatcattgaaataagcaggcacagtaataactgcatt 6789885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 413 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 8671606 - 8671422
Alignment:
Q  413 tcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacat 512  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  8671606 tcaaagacaaaaatatttcggttaccttcacggtcatttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacat 8671507  T
Q  513 taagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  8671506 taagtccagcaatagtaccagcatcaatggtggccgttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggcattctt 8671422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 248 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 8636484 - 8636129
Alignment:
Q  248 ctaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtgg 347  Q
    |||||||| || || |||||| | ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||    
T  8636484 ctaatgtctaccttgttcttcctcttgatttcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtgg 8636385  T
Q  348 cttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttc 447  Q
    |||| |||||||||||  |||| || ||||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||  |    | |||  |     
T  8636384 ctttaacttcaaagacttcacctttaattttgagtatagacacgtcgaatgtaccaccaccaagatcaaatacgaaaatgtttctctctttaacacagtt 8636285  T
Q  448 acttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagct 547  Q
    || |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |    
T  8636284 acctctcttttgaagtccatacgcaaaagctgcagcagttggttcattgattatccgaattacattaaggccggcaatggcaccagcatctttggtggat 8636185  T
Q  548 tttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacaga 603  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || |||||||| |||||    
T  8636184 ttacgctgagaatcattgaaataagcgggcacagtaatgactgcattcttgacaga 8636129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 188 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 29582042 - 29581628
Alignment:
Q  188 agtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||| | || ||||| |   |||    
T  29582042 agtgtcctctttgccctctcacaagctgttctcagcttccttaaagcttttgggttcccactaatgtccaaattgttcttcctcttcaactcattcgcaa 29581943  T
Q  288 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggataga 387  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||||||   | || |||||| | | || | |||    
T  29581942 agtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagtatcgccagcagtggccttcacttcaaacttatcatccttgagtgtgagaagaga 29581843  T
Q  388 cacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagta 487  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | | ||   | || || ||| | || |||||||||||  || ||||||||     
T  29581842 cacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaatatatttcgttttccaacaaaattacctcccttttgaataccatatgcaagtgcagcagcagtt 29581743  T
Q  488 ggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaa 587  Q
    ||||||||||||||    || ||||| || ||||| ||    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |    
T  29581742 ggttcgttgattatcctcattacattgaggccagctataatgccagcatctttggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtaatca 29581643  T
Q  588 cggcattcttcacag 602  Q
    | |||||||| ||||    
T  29581642 ctgcattctttacag 29581628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 431
Target Start/End: Original strand, 8545458 - 8545843
Alignment:
Q  46 aagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctga 145  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| || || |||    
T  8545458 aagacaacaattaacagtgtccatacacttttcaaagaggtccatattcaattgctcaaacttggcccgagtgatgcatgaacaaaagtcaataccttga 8545557  T
Q  146 aataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttct 245  Q
     |||||| |||||  ||||  ||||   ||  | || | || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| || || ||||     
T  8545558 tataaagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcctcaaggcttctgggttcc 8545657  T
Q  246 tactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagt 345  Q
     |||||| ||| |||| |||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||||    
T  8545658 gactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaaagtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagtgtctccagcagt 8545757  T
Q  346 ggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttc 431  Q
    ||| || || ||||||||   |   || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  8545758 ggccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttc 8545843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 602
Target Start/End: Original strand, 8576293 - 8576707
Alignment:
Q  188 agtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaa 287  Q
    |||||||| |||||| | || || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||| ||| | || | ||| ||  |||||||||  ||||    
T  8576293 agtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaacctccttaaggcttttgaattctcactaatatcctctttgtacttgttcctgaactccttaacaa 8576392  T
Q  288 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggataga 387  Q
    |||  | ||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| ||||||     ||| | | | || |||||    
T  8576393 agtgatccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattgttcttaactgtgagaataga 8576492  T
Q  388 cacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagta 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||  | |||  | |  |||||| | ||  ||||| |||| |||||| |||||     
T  8576493 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttcttttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatacgcaagagctgccgcagtc 8576592  T
Q  488 ggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaa 587  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || ||| |||| || |||||||| || || |||||||||| ||  |    
T  8576593 ggttcattgattatctgcatgacattgagaccagcaattgcacctgcatctttagtggctcttcgttgggaatcattaaaataagcaggcacagaaatca 8576692  T
Q  588 cggcattcttcacag 602  Q
    | |||||||| ||||    
T  8576693 ctgcattcttaacag 8576707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 296 - 602
Target Start/End: Original strand, 8590713 - 8591019
Alignment:
Q  296 accattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaa 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||  | |||| |||| | | || | |||||||||||    
T  8590713 accattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaagtggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagagacacatcaa 8590812  T
Q  396 aagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcg-tttacga--tcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttc 492  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  || | |||||| ||| |||  | ||||||   |||||| | ||  ||||||||||   | || ||||| |||||    
T  8590813 aagtgccaccaccaagatcaaagatgaacacatttcgttttccgatgttactttc---tctcttttgaaggccatatgcaaggccagcggcagttggttc 8590909  T
Q  493 gttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggca 592  Q
     || |||||  | || ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  8590910 attaattatccgcattacattcaagccagcaatgacaccagcatctttggtagctttcctctgagaatcattaaaataagctggcacagtaacaactgca 8591009  T
Q  593 ttcttcacag 602  Q
    ||||| ||||    
T  8591010 ttcttgacag 8591019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 602
Target Start/End: Original strand, 8570136 - 8570692
Alignment:
Q  46 aagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctga 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |  || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||   ||||| ||||||| |    
T  8570136 aagacaactattaacagtttccatacacttttcaaagaggttcatattcatttcctcaaacttggcccgggttattgatgaactgaagtcaattccctta 8570235  T
Q  146 aataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttct 245  Q
     ||| || ||||| |||||  ||||   ||    |  | || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||  |||| ||||| ||||     
T  8570236 tatatagcatctagctcaattgtggcctcagtatcatatgaaagtgtcctttttgccctctcacaagctgttcttaacctcctcaaggcttttgggttcc 8570335  T
Q  246 tactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagt 345  Q
    ||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||  |||||||   ||| ||||||||||||||| || || || || ||||| |||| |||||||||    
T  8570336 tactaatatcctcgttgttcttcttcttgaacttcttcacaaagtgagtcaacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggtgagtgtctccagcagt 8570435  T
Q  346 ggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactt 445  Q
    ||| || |||||| ||     | |||| | | | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||  | ||       
T  8570436 ggccttgacttcatagttgttatccttaactgtgagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacaaaa 8570535  T
Q  446 tcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtag 545  Q
    | |  |||||| | ||  |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||  | || ||||| || ||||||||  |||| |||||| | || |    
T  8570536 ttagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagtcggttcattgattatccgcattacattgagaccagcaatttcacctgcatctttagtgg 8570635  T
Q  546 cttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    || |||| || |||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| ||||    
T  8570636 ctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacag 8570692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 284 - 602
Target Start/End: Original strand, 8602037 - 8602355
Alignment:
Q  284 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagga 383  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | |||||| || |||||||||| |  |  ||| ||| | || |    
T  8602037 acaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaa 8602136  T
Q  384 tagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagc 483  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||  |    | |||  | |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || ||    
T  8602137 gagaaacatcaaaagttccaccaccaagatcaaatatgaaaatatttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagcagctgc 8602236  T
Q  484 agtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagta 583  Q
    ||| || || ||||||||  | || ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || || || |||||||||    
T  8602237 agttggctcattgattatccgcattacattgagaccagcaatggcaccagcatcttttgtggcttttcgctgagaatcattaaaataagccggcacagta 8602336  T
Q  584 acaacggcattcttcacag 602  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  8602337 acaactgcattcttgacag 8602355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 8383077 - 8382677
Alignment:
Q  188 agtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggt-tttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctaca 286  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| |  |||| ||||  ||||||||||  ||||| |||| | |||||||| || |||    
T  8383077 agtgtcctttttgccctctcgcaagccgttcttaaccttc-taagagcctttgggttcccactaatgtccttattatgcttcctcttgaactcgtcaaca 8382979  T
Q  287 aagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatag 386  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||| ||| |||||||| || ||  ||||||||  |  ||| ||| | |||| ||    
T  8382978 aagtacttcacgattctgttatctaagtcttcacctcctagatgagtgtctccggcagtggccttcacaacaaagacattattcttaattgtgaggagag 8382879  T
Q  387 acacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagt 486  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||  |    |  ||  | |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || |||||    
T  8382878 acacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaatatttctctcttcaagacaattagctctcttctgaaggccatatgcaagagcagcggcagt 8382779  T
Q  487 aggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaaca 586  Q
     || || ||||||||  | || ||||| || |||||||| |||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8382778 tggctcattgattatccgcattacattgaggccagcaatcgcaccagcatcttttgtggctttccgttgagaatcattgaaatatgcaggcacggtaaca 8382679  T
Q  587 ac 588  Q
    ||    
T  8382678 ac 8382677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29577873 - 29577629
Alignment:
Q  188 agtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaa 287  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||    
T  29577873 agtgccctctttgccctctcacaagcagttctcagcttccttaaagcttttgggttcaaactaatgtccacattgttcttcctcttcaactcattcacaa 29577774  T
Q  288 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggataga 387  Q
    ||| | |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||   | || |||| | | | || | |||    
T  29577773 agtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtggcctttacttcaaaactatcatccttaagtgtgagaagaga 29577674  T
Q  388 cacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcg 432  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  29577673 cacatcaaaggtgccaccaccaagatcaaagatgaatacatttcg 29577629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 7877872 - 7877520
Alignment:
Q  250 aatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggct 349  Q
    ||||||||| ||||||||| | || ||||||   || || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||    
T  7877872 aatgtccactttattcttcctcttaaactccatcactaaatggttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtagct 7877773  T
Q  350 tttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttac-gatcactttca 448  Q
     |||| ||||||  | || | || | | | || | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||  || | ||||||||| | |||    || |    
T  7877772 attacatcaaagctatcatcttttagtgtgagaagagacacatcgaaagtgccaccaccaagatcaatgatgaacacatttcgttttccgatgttattta 7877673  T
Q  449 cttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagctt 548  Q
     ||||||| | ||  ||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||  | || ||||| || || ||||  |||||||||||| | || ||||    
T  7877672 -ttctcttttgaaggccatatgcaagggcagcagcagttggttcattaattatccgcataacattgaggccggcaactgcaccagcatcttttgtggctt 7877574  T
Q  549 ttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7877573 ttcgttgagaatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacag 7877520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 511 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 8640425 - 8640339
Alignment:
Q  511 attaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8640425 attaaggccagcaatggccccggcatctatggtggctttttgctgataatcattgaagtaagcaggcatagtaacaactgcattctt 8640339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 304
Target Start/End: Original strand, 8616492 - 8616764
Alignment:
Q  32 atctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaa 131  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |    
T  8616492 atcttagaatcattaaaacaactctcaacagtctttatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgatgaagaga 8616591  T
Q  132 agtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataa 231  Q
    | || || |||| | ||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||   ||| || ||  |||  || ||| | ||||| |||||| |||||| ||  ||    
T  8616592 aatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaatgaaagcatccgtttcgccttttcgcatgcagttttcaaccgcctcaa 8616691  T
Q  232 gggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctg 304  Q
     | | ||| |||| || |||| |||||||| |||||| | || || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8616692 cgatcttgggttcctagtaatatccacattgttcttcctcttaaaatcctcaacaaagtagttcaacattctg 8616764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 8673979 - 8673894
Alignment:
Q  31 catctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgag 116  Q
    |||||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8673979 catcttggcatcaataagacaattctcaacagtttccaaacactcgttgaaaagattgatattgatttcctcaaacttggcacgag 8673894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 597
Target Start/End: Original strand, 39985878 - 39986022
Alignment:
Q  453 tcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcg 552  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||||  ||    
T  39985878 tcttgtcaagaccataagcaatggcagcagcagtgggctcattgataattcgcatgacattaagaccggcaataactccagcatccttggtagcttgacg 39985977  T
Q  553 ctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39985978 ctgggagtcattaaagtaagcagggacagtaacaacagcattctt 39986022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 602
Target Start/End: Original strand, 8581763 - 8582081
Alignment:
Q  284 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagga 383  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||| |||||||||||| || |||||| || |   |  ||| | | | || |    
T  8581763 acaaagtgattcaccattctgttatcaaaatcttcccctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagtcgttattcttaactgtgagaa 8581862  T
Q  384 tagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagc 483  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||  | |||  | |  |||||| | ||  |||||||||| |||||| ||    
T  8581863 tagacacatcaaaagttccacctccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgc 8581962  T
Q  484 agtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagta 583  Q
    ||| ||||| ||||||||  | || ||||| || || |||||  |||| |||||| | || ||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||    
T  8581963 agtcggttcattgattatccgcattacattgagacctgcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagta 8582062  T
Q  584 acaacggcattcttcacag 602  Q
    |  || |||||||| ||||    
T  8582063 atcactgcattcttaacag 8582081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 576
Target Start/End: Original strand, 8538282 - 8538391
Alignment:
Q  467 tatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattga 566  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||  | || ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  8538282 tatgcaagagcagcagctgtaggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaatgacaccagcatctttggtggctcttcgctgtgaatcattga 8538381  T
Q  567 agtatgcagg 576  Q
    | || |||||    
T  8538382 aataagcagg 8538391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 564
Target Start/End: Original strand, 8559395 - 8559676
Alignment:
Q  283 tacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagg 382  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | |||||| || |||||||||| |  |  ||| ||| | ||     
T  8559395 tacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgaga 8559494  T
Q  383 atagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcag 482  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  || |||||||  |    | |||  | |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || |    
T  8559495 agagaaacatcaaaagttccaccaccgagatcaaagatgaaaatatttctctctttaacacaattagatctcttttgaagtccatatgcaagagcagctg 8559594  T
Q  483 cagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcatt 564  Q
    |||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||  |||| |||||| |||| ||| |||  |||||||||||    
T  8559595 cagttggttcattgattatctgcattacattaagaccagcaatttcacctgcatctttggtggctcttctttgagaatcatt 8559676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 8664159 - 8664289
Alignment:
Q  45 taagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctg 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |  ||| || | |||| ||  | |||    
T  8664159 taagacaactctcaacagtttccaaacac--gttgaaaagatccatattgatttcatcatacttggcacgagcgaaggataaaaagaagtttaagcgctg 8664256  T
Q  145 aaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaa 177  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8664257 aaacaaagaatctaccttaatagtggtgacaaa 8664289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 582
Target Start/End: Original strand, 8610159 - 8610278
Alignment:
Q  463 accatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatca 562  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  8610159 accatatgcaagagccgcagccgttggttcattgataatccggattacattaaggccagaaatgacaccagcatcttttgtggctttccgctgagaatca 8610258  T
Q  563 ttgaagtatgcaggcacagt 582  Q
    || || || |||||||||||    
T  8610259 ttaaaataagcaggcacagt 8610278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 419
Target Start/End: Original strand, 39985709 - 39985844
Alignment:
Q  284 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagga 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||| ||| || |||||||| || ||||||| |||  | |  ||  | || |    
T  39985709 acaaagtggttcaccattctgttgtcaaaatcctcacctccaagatgggtgtctccggctgtggctttcacctcaaagataccctcttcaatagttagca 39985808  T
Q  384 tagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 419  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39985809 aagagacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 39985844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 8017332 - 8017200
Alignment:
Q  470 gcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagt 569  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||   |  ||||| ||||| |||||| |||| |||||  | || ||||  ||||| |||||||||||||    
T  8017332 gcaatagctgcagctgttggctcgttgataattctcaaaacattgagtcctgcaatgacaccggcatcctttgtggcttgacgctgcgaatcattgaagt 8017233  T
Q  570 atgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||||    
T  8017232 aagctggaactgtaacaacggcattcttcacag 8017200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 528 - 597
Target Start/End: Original strand, 8102974 - 8103043
Alignment:
Q  528 caccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    ||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  8102974 caccagcatctttagttgcttgacgctgagaatcattgaagtaagcagggacagtgacgacggcattctt 8103043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 8609961 - 8610041
Alignment:
Q  265 cttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagt 345  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||  || |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  8609961 cttccttttgaactccttcacaaagtgattaaccattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccagcagt 8610041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 29577594 - 29577491
Alignment:
Q  464 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcat 563  Q
    ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| || ||||||||    || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29577594 ccatatgcaagtgcagcagcagttggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaataatgccggcatctttggtggcttttcgctgagaatcat 29577495  T
Q  564 tgaa 567  Q
    ||||    
T  29577494 tgaa 29577491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 127
Target Start/End: Original strand, 8537846 - 8537942
Alignment:
Q  31 catctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaa 127  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  |  || |||||||| || | || |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  8537846 catcttagcatcattaaaacaactcttaacagttttcatacacttttcaaagaggtccatgttgagttgctcaaacttggcccgagtgattgatgaa 8537942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 132
Target Start/End: Original strand, 8664919 - 8664971
Alignment:
Q  80 aaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaa 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||| ||||    
T  8664919 aaaaggtccatattgatttcctcaaacctcgcacgagttattgatgaacaaaa 8664971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 16657876 - 16657304
Alignment:
Q  30 gcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaaga 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16657876 gcatctttgaatcacgaagacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaaga 16657777  T
Q  130 aaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccat 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||      
T  16657776 aaagtcaattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctc 16657677  T
Q  230 aagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggt 329  Q
    |||| | ||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16657676 aaggctcttgagttcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggt 16657577  T
Q  330 gggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatt 429  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16657576 gagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatatt 16657477  T
Q  430 tcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggca 529  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16657476 ccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaagaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaatgacattaaggccagcgatggca 16657377  T
Q  530 ccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16657376 ccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttgacag 16657304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 597
Target Start/End: Original strand, 43625231 - 43625788
Alignment:
Q  40 atcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctatt 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | ||||| ||     
T  43625231 atcaataagacaactcttaacagttttcaaacactcgttgaaaagatccatatttatttcatcaaatttggcacgagtgattgatgaaaagaagtcaata 43625330  T
Q  140 ccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttg 239  Q
    ||  | ||||||||||||||||||| |||| |||   | || ||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| | || || | |||    
T  43625331 ccacggaataaagaatctacctcaatagtgctgaacgaagcaaaagacagtgtcctttttcctctctcgcatgccgttctcaaccttcttatggctcttg 43625430  T
Q  240 cgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttcc 339  Q
     |||   | |||| |||||||| |||||||| |  || || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  43625431 agtttccaataatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttcc 43625530  T
Q  340 agcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacga 439  Q
    |||||||||||| ||    |||||     |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  | |    
T  43625531 agcagtggctttaacacggaagaccttgtccttaattgtaagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatgaaaatatttcgttctcca 43625630  T
Q  440 tcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatcta 539  Q
     |||  | | ||||||||| ||  || ||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||| | | |  |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||    
T  43625631 acacaattaattctcttgttaaggccgtatgctagagcagcagctgttggttcattgattactcgtaaaacattaaggccgacaatgacaccaacatcta 43625730  T
Q  540 tggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  43625731 tggtggcttttcgctgagaatcattgaagtaagcaggcacggtaacaactgcattctt 43625788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 16662350 - 16661787
Alignment:
Q  31 catctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaa 130  Q
    ||||||||||||   || |||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||     
T  16662350 catctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggcccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagag 16662251  T
Q  131 aagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccata 230  Q
    ||||| ||  |||   ||||| |||| | ||||| || |||||| ||   ||||||||||||||| || ||| | || || | ||||||||||||||  |    
T  16662250 aagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctca 16662151  T
Q  231 agggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtg 330  Q
    ||| | |||  ||| || | || ||||| || |||||| | || || || |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16662150 aggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtg 16662051  T
Q  331 ggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatattt 430  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16662050 agtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattt 16661951  T
Q  431 cgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcac 530  Q
    | || || |||||  | |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |  || ||||| |||||||||||||    
T  16661950 ctttcaccatcacaattacttcttttgtcaaggccatatgcaatagctgctgcagtgggttcattgattatcctcacaacgttaaggccagcaatggcac 16661851  T
Q  531 cagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcatt 594  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16661850 cagcatccatggtggcttttcgctgagaatcgttaaaataagcaggaacagtgacaactgcatt 16661787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 602
Target Start/End: Original strand, 7542072 - 7542607
Alignment:
Q  67 catacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaaca 166  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | | | || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  7542072 catacactcgttaaaaagatccatattcatctcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaata 7542171  T
Q  167 gtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattct 266  Q
    ||||  ||||    |||||| ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||  |||  |||||||||||| || ||||    
T  7542172 gtggcaacaacaaggaaagaaagtgatctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttct 7542271  T
Q  267 tctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacacc 366  Q
    |  | |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||  |||         
T  7542272 ttctcttgaactcttgtacaaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtggccttaacttggaagttgtt 7542371  T
Q  367 acccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaacca 466  Q
     ||||| ||  | || | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  | ||||   ||| ||||||||||||  |||    
T  7542372 gcccttaatcgttagtaaagacacatcaaaagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttcgctctccatcataatcagttctcttgtcaaggcca 7542471  T
Q  467 tatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattga 566  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| || |||      || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  7542472 tatgcaacagctgcggcagtaggttcattcattgccctcataacattgaggccagcaatggcacccgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattaa 7542571  T
Q  567 agtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  7542572 aataagcaggtacagtaacaactgcattcgtcacag 7542607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 602
Target Start/End: Original strand, 14703218 - 14703789
Alignment:
Q  31 catctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaa 130  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| |||| | | || |||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | | || |||||||||    
T  14703218 catcttagcatcaataagacaactctcaacaatcttcacacactcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaa 14703317  T
Q  131 aagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccata 230  Q
    ||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    |||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| ||    
T  14703318 aagtcaatgcattgaaataaagcatctacctcaatagtggcgacaacttggaaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctcctta 14703417  T
Q  231 agggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtg 330  Q
    ||| |||||  ||   |||||||||||   | || ||  | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14703418 aggcttttggatttccactaatgtccaatctgttttttctcttgaactcttgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtg 14703517  T
Q  331 ggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatattt 430  Q
     |||||||||||||| || || | ||  |||||    ||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14703518 agtgtttccagcagtagccttaatttggaagacggtgcccttaattgttaggagagacacgtcaaaagtaccaccaccaagatcaaagacaaatatatta 14703617  T
Q  431 cgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcac 530  Q
    ||||  | | ||   ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||     || ||||| || || |||||  |||    
T  14703618 cgttctccaccataatcagttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagctgtaggttcattcattaccctcataacattgaggccggcaataacac 14703717  T
Q  531 cagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    ||||||| || || |||||||  ||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14703718 cagcatccatagtggcttttctttgagaatcactaaaataagcaggcaccgtaacaactgcattcttaacag 14703789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 597
Target Start/End: Original strand, 12234499 - 12235065
Alignment:
Q  31 catctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaa 130  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||  | | ||| |||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||||    
T  12234499 catcttagcatcactaagacaactctcaacaatcttcatacactcaataagaagatccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaa 12234598  T
Q  131 aagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccata 230  Q
    || || || || | ||||||||||||||||||||  || |  ||||    |||||| | ||  || ||||||||||| || |||||||| |||||||  |    
T  12234599 aaatcaatgccttcaaataaagaatctacctcaatggttgcaacaacaaggaaagacaatgatctttttgccctctcacaagcagttcttaacctcctca 12234698  T
Q  231 agggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtg 330  Q
    ||| |||||  ||   ||| |||||||| || |||||  | |||||||| |   ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12234699 aggcttttggatttccactcatgtccacttttttctttctattgaactcttgagcaaggtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtg 12234798  T
Q  331 ggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatattt 430  Q
     |||||||| || |||||||| ||||  ||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||    
T  12234799 agtgtttccggctgtggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggagagacacatcaaaagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatattt 12234898  T
Q  431 cgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcac 530  Q
    ||||  | | |||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||  | |||||||| ||||     || ||||| || ||||||||| |||    
T  12234899 cgttctccaacacaatcagttctcttgtcaagaccatatgcaacagcggctgccatgggttcgttcattaccctcataacattgaggccagcaatgacac 12234998  T
Q  531 cagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  12234999 cagcatctatagttgcttttcgttgagaatcattgaaataagcaggcacggtaacaactgcattctt 12235065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 12245698 - 12245198
Alignment:
Q  97 ttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctc 196  Q
    |||||||||||| || ||| | || ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||     || || ||| | ||     
T  12245698 ttcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttgcaacaacaagaaacgaaagtattctt 12245599  T
Q  197 tttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttca 296  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| |||||   |   |||||| ||||  || |||||  | |||||||||| | |||||||||| |    
T  12245598 tttgccctctcacaagcagttctcaatctcctcaaggcttttgaacttgcactaatatccaatttgttctttctcttgaactcctgtgcaaagtagttta 12245499  T
Q  297 ccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaa 396  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||    | |||| ||  | |||||||| || |||||    
T  12245498 ccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggccttaacttggaagatgttatccttaatagttaggatagaaacgtcaaa 12245399  T
Q  397 agtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttg 496  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||  | | |||  |||  |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||     
T  12245398 agtgccaccaccaagatcaaacacaaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttttcaaggccatatgcaacagctgcagcagtgggttcattc 12245299  T
Q  497 attatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattct 596  Q
    ||||     || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  12245298 attaccctcataacattgagaccagcaattgagccagcatctatcgttgcttttcgctgagaatcactaaaataagcaggtacagtaacaacagcattct 12245199  T
Q  597 t 597  Q
    |    
T  12245198 t 12245198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 272 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 12258698 - 12258373
Alignment:
Q  272 ttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccaccct 371  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||  | |||    
T  12258698 ttgaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatcct 12258599  T
Q  372 tgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcg-tttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatg 470  Q
    | ||  | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||| |||  | | |||| |||||||  |||||||    
T  12258598 taatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatattccgtttttcga-cacaattaattcttttgtcaaggccatatg 12258500  T
Q  471 caatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagta 570  Q
    ||| |||||||||||||||||| || | ||| |  || ||||| || ||| ||||   |||  ||||||| || ||||| |  || |||||| | || ||    
T  12258499 caaaagctgcagcagtaggttcatttaatatcttcataacattcaggccaacaatattacccacatctatagtggctttcctttgtgaatcactaaaata 12258400  T
Q  571 tgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12258399 tgcaggcacagtaacaactgcattctt 12258373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17716626 - 17716485
Alignment:
Q  456 tgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctg 555  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||   |||| |||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||| || |||    
T  17716626 tgtcaaaaccataagcaatggctgcagcagtgggctcattaataattctcatgaaattaagaccagcaatagcaccagcatgcttagtagcttgtctctg 17716527  T
Q  556 agaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    ||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17716526 agaaaaattaaagtaagcagggacagtaacaacggcattctt 17716485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12258925 - 12258802
Alignment:
Q  45 taagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctg 144  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| || || || |     
T  12258925 taagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccaaatttatttcctcaaacttggcacgattgattgatgcagaaaaatcaatgccatc 12258826  T
Q  145 aaataaagaatctacctcaacagt 168  Q
    | |||||||||||| ||||| |||    
T  12258825 acataaagaatctatctcaatagt 12258802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 17717887 - 17717748
Alignment:
Q  456 tgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctg 555  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||| ||||  ||||||||||| |||||||    | | |||||  | ||| ||| |  |||    
T  17717887 tgtcaaaaccataagcaatggctgcagcagtgggctcatcgataatttccatgacattaagaccagcaaaaagagcggcatccttagtaacttgtatctg 17717788  T
Q  556 agaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattc 595  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17717787 agaatcattaaagtaagcagggacagtaacaacggcattc 17717748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 597
Target Start/End: Original strand, 11999283 - 11999770
Alignment:
Q  97 ttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctc 196  Q
    |||||||||||| || ||| | || ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||     || || ||| | ||     
T  11999283 ttcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttgcaacaacaagaaatgatagtattctt 11999382  T
Q  197 tttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttca 296  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||   |   |||||| ||||| |  |||||  | |||||||| | |||||||||         
T  11999383 tttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttgaacttccactaatatccacttcgttctttatcttgaactcttgtacaaagta----- 11999477  T
Q  297 ccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaa 396  Q
            |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||    |||| ||| | || ||||||| ||||||    
T  11999478 --------ttatcaaaatcctctcctccgaagtgagtgtttccagctgtggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaa 11999569  T
Q  397 agtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttg 496  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| || || |||| ||  | | |||  |||  |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||| ||     
T  11999570 agtgccaccgccaagatcaaagactaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttgtcaaggccatatgcaacagttgcagcagtgggttcattc 11999669  T
Q  497 attatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattct 596  Q
    ||||     || ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || || || || |||||||||||  ||||||    
T  11999670 attacccttataacattgatgccagcaattgcaccggcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagctggtacagtaacaacaacattct 11999769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17716687 - 17716657
Alignment:
Q  389 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17716687 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 17716657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17717948 - 17717918
Alignment:
Q  389 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17717948 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 17717918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 17703932 - 17703843
Alignment:
Q  506 atgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattc 595  Q
    |||||||||||| |||||||  || |||||||  | ||||||| || |||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  17703932 atgacattaagttcagcaataacagcagcatccttagtagcttgtctctgagaattattaaagtaaacagggacagtaacaacagcattc 17703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 67 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 9336213 - 9335683
Alignment:
Q  67 catacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaaca 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9336213 catacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaaca 9336114  T
Q  167 gtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattct 266  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   | |||||||| |||||||    
T  9336113 gtggtaacaaaagcaaaagacagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgcttgatgtccactttattct 9336014  T
Q  267 tctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacacc 366  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | | |    
T  9336013 tcttttttaactcttccacaaaatagttaaccattctgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggcttttacttcaaatagatc 9335914  T
Q  367 acccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaacca 466  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| ||||||| ||||  |||    
T  9335913 acccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccatcacagtcatttctcttatcaaggcca 9335814  T
Q  467 tatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattga 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9335813 tatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattga 9335714  T
Q  567 agtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  9335713 agtaagctggcacggtaacaacggcattctt 9335683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 582
Target Start/End: Original strand, 30775065 - 30775613
Alignment:
Q  34 ctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaag 133  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  30775065 ctttgaatcagtaagacaactctcaacagtctgtatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgagtgattgatgaagaaaag 30775164  T
Q  134 tctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagg 233  Q
    || ||  | |||||||||  ||||| |||||||   |||| |||   ||| ||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||   |  || |    
T  30775165 tcaatgtcttgaaataaattatctatctcaacaaatgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaag 30775264  T
Q  234 gttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggt 333  Q
     | |||  |||    |||||||||| || |||||| | || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||    
T  30775265 ctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagt 30775364  T
Q  334 gtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgt 433  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| || |  | ||  | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |      
T  30775365 gtttccagcagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctc 30775464  T
Q  434 ttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccag 533  Q
    | |  |||||    || |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||   || |||||||| ||||||||||||||||    
T  30775465 tcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccag 30775564  T
Q  534 catctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagt 582  Q
    |||| || || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  30775565 catccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcacagt 30775613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 602
Target Start/End: Original strand, 35132303 - 35132829
Alignment:
Q  67 catacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctacctcaaca 166  Q
    ||||||||| || ||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| |    
T  35132303 catacactcattaaaaaggtctgcattcatttcctcaaacttggcgcgattgattgatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacttcaata 35132402  T
Q  167 gtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattct 266  Q
     |||  ||||    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||         || |||||  |||  ||||||||| || || ||||    
T  35132403 ttggcaacaacaaggaaagaaagtgatctctttgccctctagcaggcagttctcaa---------ggcttttgaattcccactaatgtctactttgttct 35132493  T
Q  267 tctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacacc 366  Q
    |  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||  ||||||      
T  35132494 ttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccgagatgagtgtttccggcagtggccttaacttggaagacatt 35132593  T
Q  367 acccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaacca 466  Q
    | |||| ||  |||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||  | | |||  |||  |||||||||||  |||    
T  35132594 atccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccaccaagatcgaagacaaaaatattttgttctccagcacaatcagatctcttgtcaaggcca 35132693  T
Q  467 tatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattga 566  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| || |||| |   || |||||  | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |    
T  35132694 tatgcaaccgctgcggcagtaggttcattcattactctcataacattgggaccagcaatagcaccagcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaa 35132793  T
Q  567 agtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35132794 aataagcaggcacagtaacaactgcattcttaacag 35132829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 23596521 - 23596377
Alignment:
Q  453 tcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcg 552  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||   || ||||| ||||||| |||| ||||||||||  | |||||||  ||    
T  23596521 tcttatcaagaccataagcaatagcggcagcagtgggctcgttaataattctcatcacattgagtccagaaatgacaccagcatccttagtagcttgacg 23596422  T
Q  553 ctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23596421 ttgtgaatcgttgaagtatgcaggcacggttacaacggcattctt 23596377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 23587669 - 23587525
Alignment:
Q  453 tcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcg 552  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||   |  ||||| ||||||| |||| |||| |||||| | |||||||  ||    
T  23587669 tcttatcaagaccataagcaatagcagcagcggtaggttcattaataattctcaacacattgagtccagaaatgacaccggcatcttttgtagcttgacg 23587570  T
Q  553 ctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 597  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23587569 ttgtgaatcgttgaagtaagcaggcacagttacaacggcattctt 23587525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 527 - 600
Target Start/End: Original strand, 54396729 - 54396802
Alignment:
Q  527 gcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcac 600  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  54396729 gcaccagcatctttcgtagcttgacgttgagaatcattgaaataagcaggaacagtaacaacagcattcttcac 54396802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Original strand, 28219744 - 28220045
Alignment:
Q  47 agacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaa 146  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || || || || | ||    
T  28219744 agacacctctcaacagttttcaaacactcattgaaaagatccatattgatttcctcaaacttagcacgagtaattgatgaaaagaaatcaatgccttcaa 28219843  T
Q  147 ataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttctt 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||  || ||||| |||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| | ||| |||       
T  28219844 ataaagaatctacctcaatggtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgctctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagtttcc 28219943  T
Q  247 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 346  Q
    | |||||||||| || |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  28219944 agtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcggtg 28220043  T
Q  347 gc 348  Q
    ||    
T  28220044 gc 28220045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 369 - 602
Target Start/End: Original strand, 28220099 - 28220332
Alignment:
Q  369 ccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtt-tacgat-cactttcacttctcttgtcaaaacca 466  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||| | | || || ||  | |||| ||||| || |||    
T  28220099 cctttattctaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcgttctcccatgcagtt--agttcttttgtccaatcca 28220196  T
Q  467 tatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattga 566  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||    |  ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  28220197 tatgcaatagcagcagcagtgggttcattgactatccttagaacatttagaccagcaatggtacctgcatctatggtggctttccgctgataatcattga 28220296  T
Q  567 agtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    | || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  28220297 aataagcaggcacagtaataactgcattcttgacag 28220332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 341
Target Start/End: Original strand, 43744626 - 43744936
Alignment:
Q  31 catctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaa 130  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||| || | || | |     
T  43744626 catcttggcatcagtaagacaactctcaacaattttcaaacactcgttgaagagatccatattgatttcctcaaacttagtacgagtgattgttgtaaag 43744725  T
Q  131 aagtctattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccata 230  Q
    || || || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||    
T  43744726 aaatcaatgccctcaaataaagaatctacctcaatagtggtgacaacagcaaaagataatgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctcctta 43744825  T
Q  231 agggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtg 330  Q
    | | | ||| |||   | |||||||||| || |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  43744826 atgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtg 43744925  T
Q  331 ggtgtttccag 341  Q
     ||||||||||    
T  43744926 agtgtttccag 43744936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 369 - 602
Target Start/End: Original strand, 43744997 - 43745228
Alignment:
Q  369 ccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccata 468  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| |   ||  ||   | | ||||||| || | ||||||    
T  43744997 ccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcttcctcgcacagagttagttctcttttccagaccata 43745096  T
Q  469 tgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaag 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  || |||| ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||     
T  43745097 tgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatcta--gtggctttccgctgataatcattgaaa 43745194  T
Q  569 tatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    || || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43745195 taagccggcacagtaacaactgcattcttgacag 43745228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 417
Target Start/End: Original strand, 12528471 - 12528700
Alignment:
Q  188 agtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccataagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaa 287  Q
    |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||| |||| || || ||||| ||||  | ||||||| || || |||||| | || ||||| |  ||||    
T  12528471 agtgtccttttcgccttctcgcagttagttctcaatctccttagggcttttgagttcccaataatgtcaactttgttcttcctcttaaactctttcacaa 12528570  T
Q  288 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggataga 387  Q
    |||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| || ||||| ||||||  |  ||| | | |||| | |||    
T  12528571 agtgattcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattattctttactgtaagaagaga 12528670  T
Q  388 cacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaa 417  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12528671 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaa 12528700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 602
Target Start/End: Original strand, 12528747 - 12528885
Alignment:
Q  464 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcat 563  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| |||  |||||| |||||||    
T  12528747 ccatatgcaagagcagctgcagttggttcgttgattatccgtattacattgaggccagcaatgacaccagcatccttggtggctcgtcgctgcgaatcat 12528846  T
Q  564 tgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 602  Q
    |||| || || ||||| ||||  || |||||||| ||||    
T  12528847 tgaaatacgctggcaccgtaatcactgcattcttaacag 12528885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 597
Target Start/End: Original strand, 28910650 - 28910958
Alignment:
Q  289 gtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagac 388  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |||||   | |||  ||| |||||| |||     
T  28910650 gtagttcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaa 28910749  T
Q  389 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtag 488  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||  ||  |||||||||  | | |||  |||  ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||      
T  28910750 acatcaaaagtcccactacccaggtcgaagatgaaagtatttcgttctccagcacactcagctctcttgtcgaggccatatgaaatagctacagcagtga 28910849  T
Q  489 gttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaac 588  Q
    | || ||||||||  | || |||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||  ||| || ||||||||     
T  28910850 gctcattgattatccgcataacattaagcctgacaatggcaccagcatctatggtggctttcctctaagaatcattgaaataaccagtcaaagtaacaat 28910949  T
Q  589 ggcattctt 597  Q
     ||||||||    
T  28910950 tgcattctt 28910958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11314659 - 11314610
Alignment:
Q  466 atatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaa 515  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11314659 atatgcaatggctgcagcactaggttcattgattatttgcatgacattaa 11314610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University