View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16662_low_7 (Length: 570)

Name: NF16662_low_7
Description: NF16662
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16662_low_7
NF16662_low_7
[»] chr6 (118 HSPs)
chr6 (1-551)||(34963379-34963929)
chr6 (1-454)||(30676413-30676866)
chr6 (1-454)||(24422553-24423005)
chr6 (1-454)||(33861800-33862252)
chr6 (1-454)||(33864284-33864736)
chr6 (1-454)||(12742323-12742776)
chr6 (1-454)||(18334296-18334748)
chr6 (1-454)||(26924344-26924796)
chr6 (1-454)||(19858626-19859075)
chr6 (1-454)||(1540615-1541067)
chr6 (1-454)||(2290884-2291336)
chr6 (1-454)||(8055035-8055488)
chr6 (1-454)||(22782233-22782685)
chr6 (1-454)||(25688508-25688961)
chr6 (179-551)||(23992604-23992978)
chr6 (229-551)||(25535641-25535964)
chr6 (1-280)||(19005052-19005330)
chr6 (1-454)||(19847675-19848107)
chr6 (1-263)||(25656635-25656897)
chr6 (288-551)||(19847385-19847648)
chr6 (158-452)||(28289042-28289334)
chr6 (288-551)||(19005637-19005900)
chr6 (204-454)||(1598266-1598515)
chr6 (191-429)||(17377576-17377814)
chr6 (288-551)||(1598735-1598998)
chr6 (288-551)||(31629954-31630217)
chr6 (157-452)||(12942363-12942646)
chr6 (205-454)||(18914142-18914391)
chr6 (205-454)||(19005361-19005610)
chr6 (1-209)||(1595555-1595763)
chr6 (292-551)||(18914615-18914874)
chr6 (1-187)||(25754815-25755001)
chr6 (205-454)||(31630244-31630493)
chr6 (288-551)||(30676132-30676386)
chr6 (11-174)||(18456735-18456898)
chr6 (1-187)||(20556864-20557048)
chr6 (1-169)||(16448514-16448683)
chr6 (1-173)||(3852001-3852173)
chr6 (11-144)||(18461895-18462028)
chr6 (288-451)||(1871-2034)
chr6 (288-451)||(8830-8993)
chr6 (288-454)||(1598542-1598708)
chr6 (289-454)||(27557016-27557181)
chr6 (288-454)||(25688988-25689154)
chr6 (442-551)||(17027957-17028066)
chr6 (289-454)||(23415258-23415423)
chr6 (292-454)||(18914422-18914584)
chr6 (1-157)||(25629310-25629467)
chr6 (1-154)||(29060549-29060703)
chr6 (178-280)||(31630524-31630626)
chr6 (1-157)||(18409782-18409939)
chr6 (335-454)||(15892112-15892231)
chr6 (162-280)||(18913994-18914111)
chr6 (292-454)||(26924151-26924313)
chr6 (1-157)||(20593782-20593939)
chr6 (1-140)||(17287768-17287908)
chr6 (6-157)||(20360915-20361067)
chr6 (7-157)||(25644335-25644487)
chr6 (158-280)||(15875469-15875590)
chr6 (8-157)||(16496260-16496410)
chr6 (1-157)||(19303496-19303652)
chr6 (288-451)||(79-242)
chr6 (11-157)||(18821801-18821946)
chr6 (1-157)||(20076709-20076862)
chr6 (1-172)||(22780166-22780339)
chr6 (205-331)||(15875621-15875737)
chr6 (363-452)||(17883203-17883292)
chr6 (288-417)||(25689181-25689310)
chr6 (7-172)||(20109153-20109322)
chr6 (288-407)||(25737128-25737247)
chr6 (1-142)||(20638253-20638395)
chr6 (490-551)||(16198293-16198354)
chr6 (489-551)||(25689320-25689382)
chr6 (8-174)||(8227448-8227616)
chr6 (162-227)||(18937252-18937317)
chr6 (381-454)||(25737028-25737101)
chr6 (1-53)||(25714426-25714478)
chr6 (288-383)||(22981321-22981416)
chr6 (288-383)||(23806992-23807087)
chr6 (11-153)||(23019425-23019567)
chr6 (7-153)||(9098473-9098620)
chr6 (389-454)||(9020-9085)
chr6 (506-551)||(25721009-25721054)
chr6 (1-53)||(27333277-27333330)
chr6 (1-53)||(27394017-27394070)
chr6 (11-157)||(35245605-35245749)
chr6 (7-106)||(19668386-19668488)
chr6 (1-104)||(23992436-23992540)
chr6 (9-106)||(28496477-28496575)
chr6 (9-106)||(29808888-29808986)
chr6 (6-113)||(19652209-19652316)
chr6 (19-140)||(15041522-15041644)
chr6 (411-454)||(22981443-22981486)
chr6 (411-454)||(23806922-23806965)
chr6 (11-45)||(11185524-11185558)
chr6 (308-406)||(19984130-19984228)
chr6 (1-39)||(22080799-22080837)
chr6 (205-279)||(35056707-35056781)
chr6 (8-45)||(1561319-1561356)
chr6 (308-417)||(16240296-16240405)
chr6 (308-417)||(16556945-16557054)
chr6 (308-417)||(16633501-16633610)
chr6 (308-417)||(16650175-16650284)
chr6 (13-53)||(22831524-22831565)
chr6 (324-417)||(27654597-27654690)
chr6 (288-356)||(18334201-18334269)
chr6 (288-356)||(24423032-24423100)
chr6 (13-53)||(33443068-33443108)
chr6 (288-356)||(33864763-33864831)
chr6 (367-406)||(10905416-10905455)
chr6 (15-142)||(16920602-16920728)
chr6 (213-243)||(17883303-17883333)
chr6 (308-417)||(25904474-25904584)
chr6 (221-279)||(32259078-32259136)
chr6 (308-378)||(35016043-35016113)
chr6 (202-263)||(15875565-15875626)
chr6 (122-174)||(23076862-23076915)
chr6 (6-53)||(4185880-4185928)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (4-454)||(4703-5153)
scaffold0716 (288-551)||(5180-5443)
[»] chr8 (127 HSPs)
chr8 (1-454)||(16413019-16413472)
chr8 (1-454)||(14409148-14409600)
chr8 (1-454)||(1484408-1484860)
chr8 (1-454)||(5852996-5853448)
chr8 (1-454)||(20045899-20046351)
chr8 (1-454)||(22001759-22002211)
chr8 (1-448)||(4483287-4483733)
chr8 (1-454)||(4542077-4542529)
chr8 (1-454)||(14823780-14824233)
chr8 (8-454)||(15070571-15071019)
chr8 (108-454)||(24485747-24486093)
chr8 (1-280)||(20403233-20403511)
chr8 (205-551)||(1326538-1326884)
chr8 (1-280)||(15203109-15203387)
chr8 (1-280)||(19896271-19896553)
chr8 (1-280)||(45290572-45290851)
chr8 (178-454)||(27472120-27472395)
chr8 (288-551)||(20403765-20404028)
chr8 (288-551)||(27471830-27472093)
chr8 (288-551)||(32122214-32122477)
chr8 (1-454)||(32121741-32122187)
chr8 (1-454)||(18677768-18678214)
chr8 (288-551)||(16412728-16412992)
chr8 (1-279)||(19936882-19937162)
chr8 (288-551)||(15071046-15071309)
chr8 (288-551)||(15202399-15202662)
chr8 (288-551)||(19897000-19897263)
chr8 (288-551)||(38549226-38549488)
chr8 (216-454)||(16198115-16198353)
chr8 (225-454)||(24048841-24049069)
chr8 (205-454)||(38549708-38549957)
chr8 (207-454)||(16401628-16401875)
chr8 (296-551)||(24049104-24049359)
chr8 (310-551)||(11361024-11361266)
chr8 (1-174)||(41598194-41598367)
chr8 (202-454)||(15202882-15203134)
chr8 (205-454)||(19936611-19936850)
chr8 (216-417)||(25657893-25658094)
chr8 (198-454)||(19896524-19896780)
chr8 (202-454)||(20403486-20403738)
chr8 (288-526)||(19936347-19936584)
chr8 (118-280)||(32810054-32810215)
chr8 (11-172)||(19801367-19801527)
chr8 (1-174)||(26223925-26224098)
chr8 (1-187)||(25484245-25484424)
chr8 (287-454)||(15202689-15202856)
chr8 (363-526)||(32810264-32810427)
chr8 (288-454)||(19896807-19896973)
chr8 (202-414)||(45290385-45290597)
chr8 (288-454)||(38549515-38549681)
chr8 (289-454)||(14397444-14397609)
chr8 (320-453)||(45290252-45290385)
chr8 (1-157)||(16092297-16092454)
chr8 (288-452)||(16401437-16401601)
chr8 (288-454)||(16401243-16401408)
chr8 (1-157)||(6759267-6759421)
chr8 (1-172)||(18818348-18818521)
chr8 (1-145)||(7372787-7372932)
chr8 (1-157)||(28648999-28649156)
chr8 (178-280)||(38549988-38550090)
chr8 (1-157)||(20536217-20536374)
chr8 (4-137)||(26219726-26219858)
chr8 (422-551)||(37609815-37609943)
chr8 (1-157)||(22875074-22875230)
chr8 (1-158)||(23406388-23406548)
chr8 (8-142)||(21918969-21919105)
chr8 (1-140)||(21923900-21924040)
chr8 (1-137)||(26225268-26225403)
chr8 (1-157)||(22626745-22626901)
chr8 (178-280)||(20982604-20982710)
chr8 (10-174)||(13508022-13508188)
chr8 (10-174)||(13597554-13597720)
chr8 (478-551)||(20457354-20457427)
chr8 (205-280)||(13425336-13425411)
chr8 (205-280)||(20982498-20982573)
chr8 (158-280)||(1326915-1327042)
chr8 (1-157)||(18879191-18879343)
chr8 (169-280)||(16401908-16402020)
chr8 (11-174)||(20498581-20498746)
chr8 (205-269)||(13425241-13425305)
chr8 (10-163)||(17612059-17612213)
chr8 (8-142)||(31971273-31971407)
chr8 (1-153)||(38855212-38855363)
chr8 (1-113)||(21285606-21285719)
chr8 (11-91)||(45131019-45131098)
chr8 (11-174)||(37116366-37116532)
chr8 (1-106)||(6520377-6520483)
chr8 (1-157)||(23648562-23648719)
chr8 (11-91)||(16199666-16199746)
chr8 (7-106)||(983410-983512)
chr8 (11-106)||(5866280-5866376)
chr8 (11-174)||(17266930-17267096)
chr8 (8-94)||(17140932-17141019)
chr8 (8-106)||(21491011-21491110)
chr8 (11-157)||(17439461-17439609)
chr8 (11-106)||(21389458-21389552)
chr8 (11-106)||(21395988-21396082)
chr8 (205-276)||(21513636-21513707)
chr8 (11-106)||(21778784-21778878)
chr8 (11-106)||(21790481-21790575)
chr8 (7-53)||(23760903-23760950)
chr8 (205-279)||(18815609-18815683)
chr8 (308-406)||(24717722-24717820)
chr8 (308-417)||(15319989-15320098)
chr8 (308-417)||(15500358-15500467)
chr8 (308-377)||(29759429-29759498)
chr8 (6-45)||(26355766-26355805)
chr8 (8-42)||(21249400-21249434)
chr8 (8-42)||(21255238-21255272)
chr8 (158-204)||(35026849-35026895)
chr8 (205-279)||(36733302-36733376)
chr8 (205-279)||(38988730-38988804)
chr8 (205-279)||(39019827-39019901)
chr8 (205-270)||(5083003-5083068)
chr8 (6-113)||(21673718-21673826)
chr8 (288-356)||(1484887-1484955)
chr8 (288-356)||(5852901-5852969)
chr8 (288-356)||(14409053-14409121)
chr8 (288-356)||(20045804-20045872)
chr8 (158-204)||(2418860-2418906)
chr8 (320-378)||(17150655-17150713)
chr8 (308-377)||(13663129-13663198)
chr8 (308-357)||(18611952-18612001)
chr8 (202-263)||(19936845-19936906)
chr8 (308-377)||(22007126-22007195)
chr8 (202-267)||(32810190-32810255)
chr8 (215-279)||(38549936-38550000)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (1-454)||(3515013-3515466)
chr4 (3-454)||(14970410-14970861)
chr4 (1-454)||(15118056-15118508)
chr4 (1-454)||(44615294-44615747)
chr4 (1-454)||(50222043-50222495)
chr4 (1-454)||(19242705-19243159)
chr4 (1-454)||(44772787-44773243)
chr4 (1-454)||(1837223-1837665)
chr4 (1-454)||(7640890-7641338)
chr4 (1-327)||(18239250-18239575)
chr4 (1-280)||(18215152-18215430)
chr4 (1-280)||(19618050-19618328)
chr4 (1-280)||(12185-12463)
chr4 (1-280)||(52312516-52312794)
chr4 (202-551)||(11861-12210)
chr4 (1-280)||(15355202-15355481)
chr4 (157-452)||(15534343-15534638)
chr4 (158-452)||(36038033-36038327)
chr4 (288-551)||(14970120-14970383)
chr4 (158-452)||(49547479-49547773)
chr4 (205-454)||(52872776-52873025)
chr4 (158-452)||(14048740-14049034)
chr4 (288-551)||(18214617-18214880)
chr4 (288-526)||(52872511-52872749)
chr4 (205-452)||(362390-362637)
chr4 (288-551)||(3515493-3515756)
chr4 (288-551)||(19617480-19617743)
chr4 (288-551)||(362859-363122)
chr4 (205-452)||(19617772-19618019)
chr4 (288-551)||(52313240-52313503)
chr4 (205-451)||(15495880-15496126)
chr4 (288-526)||(19858064-19858302)
chr4 (212-454)||(29267570-29267812)
chr4 (205-454)||(14746215-14746464)
chr4 (1-187)||(51463838-51464024)
chr4 (1-187)||(23803235-23803421)
chr4 (202-454)||(52312769-52313020)
chr4 (205-446)||(19857798-19858029)
chr4 (1-174)||(44102220-44102393)
chr4 (1-187)||(12610956-12611135)
chr4 (380-551)||(12778290-12778460)
chr4 (1-163)||(44928873-44929036)
chr4 (11-174)||(21815568-21815731)
chr4 (10-174)||(15367708-15367873)
chr4 (10-174)||(15402721-15402886)
chr4 (10-174)||(15371220-15371385)
chr4 (10-174)||(15373501-15373666)
chr4 (10-174)||(15370036-15370200)
chr4 (396-551)||(15489562-15489717)
chr4 (10-171)||(16223550-16223712)
chr4 (1-169)||(20149835-20150004)
chr4 (290-454)||(362668-362832)
chr4 (205-334)||(18214992-18215121)
chr4 (409-551)||(14745789-14745931)
chr4 (288-454)||(14746022-14746188)
chr4 (288-454)||(52313047-52313213)
chr4 (1-137)||(54798729-54798866)
chr4 (1-113)||(14280322-14280434)
chr4 (1-157)||(16377478-16377633)
chr4 (1-172)||(7798783-7798956)
chr4 (1-157)||(14038657-14038814)
chr4 (1-157)||(7088886-7089043)
chr4 (8-157)||(12902773-12902923)
chr4 (288-422)||(15495716-15495850)
chr4 (158-280)||(15496949-15497070)
chr4 (11-168)||(22353852-22354010)
chr4 (272-454)||(30147192-30147374)
chr4 (413-526)||(15354956-15355069)
chr4 (1-157)||(22636444-22636601)
chr4 (159-280)||(52873056-52873176)
chr4 (1-157)||(7893712-7893869)
chr4 (205-306)||(15355070-15355171)
chr4 (1-104)||(52873375-52873479)
chr4 (1-157)||(16270191-16270347)
chr4 (1-137)||(8574844-8574979)
chr4 (11-174)||(13788-13953)
chr4 (158-280)||(14746495-14746618)
chr4 (1-157)||(44052838-44052995)
chr4 (1-157)||(6899900-6900056)
chr4 (7-174)||(52243131-52243302)
chr4 (1-155)||(16239927-16240081)
chr4 (288-394)||(14185621-14185727)
chr4 (8-157)||(23374314-23374464)
chr4 (7-172)||(43198492-43198661)
chr4 (198-280)||(19857685-19857767)
chr4 (178-246)||(362268-362336)
chr4 (8-77)||(3096309-3096379)
chr4 (367-455)||(14185507-14185595)
chr4 (288-406)||(22725284-22725401)
chr4 (395-454)||(18214907-18214966)
chr4 (66-155)||(15464888-15464977)
chr4 (1-101)||(39706299-39706400)
chr4 (6-117)||(12774021-12774132)
chr4 (7-106)||(12288214-12288316)
chr4 (11-174)||(46640393-46640558)
chr4 (292-357)||(14745926-14745991)
chr4 (308-405)||(14951270-14951367)
chr4 (308-409)||(43281694-43281795)
chr4 (11-174)||(53082089-53082254)
chr4 (11-144)||(6190481-6190616)
chr4 (158-210)||(19857607-19857659)
chr4 (8-53)||(15551833-15551879)
chr4 (310-378)||(55377225-55377293)
chr4 (11-91)||(14053323-14053403)
chr4 (11-53)||(17046506-17046549)
chr4 (308-406)||(25120046-25120144)
chr4 (6-53)||(8846370-8846418)
chr4 (288-356)||(15117961-15118029)
chr4 (517-549)||(19858327-19858359)
chr4 (308-378)||(18293695-18293765)
chr4 (308-357)||(5683416-5683465)
chr4 (84-172)||(8846465-8846553)
chr4 (367-404)||(11940069-11940106)
chr4 (308-377)||(14995644-14995713)
chr4 (320-417)||(16731688-16731785)
chr4 (324-417)||(18247755-18247848)
chr4 (202-263)||(19618014-19618075)
chr4 (308-357)||(19698033-19698082)
chr4 (308-357)||(19708618-19708667)
chr4 (200-257)||(26922388-26922445)
chr4 (288-325)||(44772723-44772760)
chr4 (324-417)||(47357199-47357292)
chr4 (13-53)||(17333298-17333338)
chr4 (205-257)||(26922437-26922489)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (1-454)||(21840773-21841225)
chr1 (1-454)||(13988872-13989324)
chr1 (1-454)||(21922995-21923447)
chr1 (1-454)||(21474790-21475243)
chr1 (1-454)||(23593437-23593891)
chr1 (1-454)||(16361923-16362377)
chr1 (1-454)||(15859712-15860165)
chr1 (1-280)||(29776694-29776972)
chr1 (202-551)||(22050443-22050792)
chr1 (1-280)||(29298143-29298420)
chr1 (1-280)||(31612319-31612597)
chr1 (1-280)||(22122945-22123224)
chr1 (1-280)||(16275240-16275520)
chr1 (288-551)||(22122427-22122691)
chr1 (295-551)||(9044611-9044867)
chr1 (288-551)||(15859408-15859672)
chr1 (205-454)||(16274959-16275209)
chr1 (288-551)||(29298727-29298990)
chr1 (288-551)||(16274666-16274932)
chr1 (215-453)||(29298461-29298699)
chr1 (215-452)||(27161292-27161529)
chr1 (288-526)||(31613044-31613282)
chr1 (298-551)||(40129387-40129640)
chr1 (288-531)||(16401407-16401651)
chr1 (202-454)||(29776947-29777199)
chr1 (202-454)||(22122718-22122970)
chr1 (363-551)||(43543269-43543457)
chr1 (202-454)||(31612572-31612824)
chr1 (288-526)||(29777226-29777465)
chr1 (1-174)||(13212844-13213018)
chr1 (1-174)||(21346967-21347141)
chr1 (261-454)||(13227129-13227322)
chr1 (11-187)||(45574812-45574989)
chr1 (1-174)||(21342102-21342276)
chr1 (1-174)||(21707173-21707346)
chr1 (1-174)||(21711715-21711888)
chr1 (261-454)||(29535317-29535510)
chr1 (1-174)||(433018-433190)
chr1 (1-169)||(40389160-40389329)
chr1 (288-452)||(31612851-31613015)
chr1 (402-531)||(43630215-43630344)
chr1 (1-157)||(50210168-50210325)
chr1 (1-157)||(34509789-34509946)
chr1 (8-157)||(27250684-27250834)
chr1 (180-280)||(22050767-22050866)
chr1 (1-157)||(22532278-22532435)
chr1 (288-433)||(27161118-27161263)
chr1 (11-174)||(21896193-21896358)
chr1 (478-551)||(41231033-41231106)
chr1 (11-171)||(21861510-21861672)
chr1 (1-157)||(22468651-22468808)
chr1 (8-157)||(21026696-21026846)
chr1 (191-279)||(27161518-27161605)
chr1 (11-174)||(35261018-35261180)
chr1 (8-93)||(20847173-20847259)
chr1 (7-163)||(16758664-16758822)
chr1 (288-357)||(10812613-10812682)
chr1 (1-155)||(20135196-20135351)
chr1 (1-53)||(20454613-20454665)
chr1 (7-172)||(33681022-33681188)
chr1 (500-551)||(22122260-22122311)
chr1 (6-117)||(21754059-21754170)
chr1 (11-174)||(41049973-41050138)
chr1 (12-174)||(14295493-14295652)
chr1 (158-211)||(43543214-43543267)
chr1 (7-153)||(22237642-22237788)
chr1 (8-172)||(20918620-20918782)
chr1 (6-113)||(22921868-22921976)
chr1 (336-454)||(10812709-10812827)
chr1 (7-45)||(52928038-52928076)
chr1 (1-50)||(21714551-21714600)
chr1 (68-157)||(22354527-22354616)
chr1 (215-280)||(29298408-29298473)
chr1 (6-106)||(20248293-20248394)
chr1 (73-170)||(50686695-50686792)
chr1 (79-163)||(12271642-12271725)
chr1 (288-356)||(13989351-13989419)
chr1 (11-174)||(16368224-16368388)
chr1 (308-378)||(21858592-21858662)
chr1 (308-406)||(44035830-44035928)
chr1 (198-279)||(12710130-12710211)
chr1 (18-53)||(38801447-38801483)
[»] chr3 (147 HSPs)
chr3 (1-454)||(12567566-12568018)
chr3 (1-454)||(17463184-17463636)
chr3 (1-454)||(13544031-13544482)
chr3 (1-454)||(34159332-34159784)
chr3 (1-454)||(45606610-45607063)
chr3 (1-454)||(7781050-7781503)
chr3 (1-454)||(55476497-55476949)
chr3 (1-454)||(16453984-16454437)
chr3 (1-454)||(6468838-6469290)
chr3 (1-454)||(13153959-13154412)
chr3 (1-454)||(10247427-10247879)
chr3 (1-454)||(28848325-28848767)
chr3 (1-454)||(13151494-13151947)
chr3 (1-454)||(8499524-8499979)
chr3 (1-448)||(15412435-15412884)
chr3 (1-454)||(53301207-53301663)
chr3 (1-454)||(27165256-27165711)
chr3 (1-280)||(9707484-9707763)
chr3 (1-280)||(8899100-8899378)
chr3 (1-280)||(16282689-16282967)
chr3 (205-498)||(12119313-12119606)
chr3 (3-280)||(38961769-38962045)
chr3 (1-280)||(41123896-41124171)
chr3 (229-549)||(24513910-24514230)
chr3 (158-452)||(54520985-54521279)
chr3 (1-454)||(46822274-46822720)
chr3 (158-454)||(15977696-15977991)
chr3 (291-551)||(8500009-8500269)
chr3 (288-551)||(27165738-27166001)
chr3 (288-551)||(46822747-46823010)
chr3 (178-454)||(10557091-10557367)
chr3 (288-549)||(53300919-53301180)
chr3 (160-452)||(29544547-29544839)
chr3 (288-551)||(41124425-41124688)
chr3 (285-551)||(10379617-10379888)
chr3 (288-551)||(20629605-20629868)
chr3 (288-551)||(38961251-38961514)
chr3 (288-551)||(55318717-55318980)
chr3 (216-454)||(13436520-13436758)
chr3 (1-198)||(17446614-17446810)
chr3 (3-187)||(50242830-50243014)
chr3 (288-526)||(10557394-10557633)
chr3 (288-551)||(16282171-16282434)
chr3 (288-551)||(13937387-13937649)
chr3 (1-174)||(29172565-29172739)
chr3 (202-454)||(38961541-38961794)
chr3 (202-454)||(41124146-41124398)
chr3 (202-454)||(16282461-16282714)
chr3 (1-174)||(17672632-17672805)
chr3 (288-552)||(17444175-17444440)
chr3 (202-454)||(17444467-17444719)
chr3 (165-357)||(12305315-12305507)
chr3 (215-454)||(25237063-25237302)
chr3 (215-454)||(20629895-20630138)
chr3 (11-174)||(53070636-53070799)
chr3 (1-174)||(12119707-12119881)
chr3 (215-454)||(25229476-25229715)
chr3 (11-187)||(43550448-43550625)
chr3 (289-454)||(15465448-15465613)
chr3 (289-454)||(5223677-5223842)
chr3 (1-126)||(15977521-15977646)
chr3 (289-454)||(26054968-26055133)
chr3 (288-451)||(55319010-55319173)
chr3 (1-157)||(14972863-14973020)
chr3 (1-157)||(40213676-40213832)
chr3 (388-526)||(8899418-8899556)
chr3 (1-106)||(55500948-55501053)
chr3 (1-137)||(36166604-36166739)
chr3 (10-173)||(42386428-42386593)
chr3 (1-157)||(17487865-17488022)
chr3 (1-157)||(17499347-17499504)
chr3 (1-157)||(25476340-25476497)
chr3 (1-172)||(43840941-43841114)
chr3 (5-137)||(21618459-21618590)
chr3 (7-172)||(26686902-26687069)
chr3 (287-409)||(36528447-36528569)
chr3 (1-157)||(13442283-13442440)
chr3 (288-417)||(14567432-14567561)
chr3 (1-157)||(18438543-18438700)
chr3 (1-157)||(23083316-23083473)
chr3 (6-157)||(14576788-14576939)
chr3 (8-142)||(12399225-12399360)
chr3 (288-466)||(17393201-17393380)
chr3 (1-142)||(20698405-20698547)
chr3 (1-98)||(10556991-10557088)
chr3 (1-157)||(24153164-24153320)
chr3 (1-94)||(44494815-44494908)
chr3 (10-174)||(24340660-24340826)
chr3 (158-280)||(11913928-11914051)
chr3 (423-531)||(45220313-45220421)
chr3 (6-138)||(14572603-14572735)
chr3 (1-93)||(17737242-17737337)
chr3 (1-157)||(11424718-11424871)
chr3 (11-172)||(52523666-52523831)
chr3 (10-174)||(23274705-23274871)
chr3 (200-280)||(17444694-17444773)
chr3 (287-394)||(3264324-3264431)
chr3 (364-454)||(15007868-15007961)
chr3 (367-454)||(16358371-16358458)
chr3 (10-174)||(37642202-37642368)
chr3 (288-394)||(16358238-16358344)
chr3 (373-455)||(36528340-36528422)
chr3 (73-172)||(2051138-2051238)
chr3 (111-174)||(17248224-17248287)
chr3 (7-153)||(15470939-15471085)
chr3 (6-172)||(16097342-16097509)
chr3 (6-172)||(16103794-16103960)
chr3 (66-163)||(22147474-22147571)
chr3 (6-117)||(32307691-32307802)
chr3 (213-280)||(25237009-25237075)
chr3 (1-48)||(45577947-45577994)
chr3 (11-174)||(37251105-37251270)
chr3 (1-53)||(28194699-28194752)
chr3 (8-106)||(13210333-13210432)
chr3 (288-352)||(15007988-15008052)
chr3 (1-106)||(14234496-14234602)
chr3 (387-433)||(10555766-10555812)
chr3 (6-106)||(12174265-12174366)
chr3 (398-452)||(12305525-12305579)
chr3 (11-155)||(43925977-43926123)
chr3 (1-106)||(12511066-12511172)
chr3 (7-120)||(30029855-30029968)
chr3 (6-97)||(49668091-49668183)
chr3 (373-452)||(3264459-3264538)
chr3 (397-455)||(14567587-14567645)
chr3 (205-279)||(25201323-25201397)
chr3 (308-378)||(51158683-51158753)
chr3 (6-97)||(9512934-9513026)
chr3 (6-97)||(9520909-9521001)
chr3 (421-454)||(13937676-13937709)
chr3 (308-377)||(16934851-16934920)
chr3 (296-377)||(25058286-25058367)
chr3 (13-53)||(13919350-13919390)
chr3 (288-356)||(17463663-17463731)
chr3 (288-356)||(34159811-34159879)
chr3 (288-327)||(55476976-55477015)
chr3 (205-235)||(11913867-11913897)
chr3 (221-279)||(15025934-15025992)
chr3 (308-357)||(14263640-14263689)
chr3 (320-417)||(14528625-14528722)
chr3 (167-204)||(15977663-15977700)
chr3 (215-280)||(17044330-17044395)
chr3 (308-377)||(49231768-49231837)
chr3 (1-53)||(856145-856197)
chr3 (1-53)||(14665406-14665458)
chr3 (1-53)||(23077537-23077589)
chr3 (308-376)||(30152450-30152518)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (1-454)||(94417-94869)
scaffold0023 (1-454)||(17143-17596)
scaffold0023 (288-551)||(16853-17116)
scaffold0023 (1-154)||(44460-44614)
scaffold0023 (6-153)||(100388-100534)
scaffold0023 (6-153)||(40135-40281)
scaffold0023 (8-53)||(119891-119937)
scaffold0023 (288-356)||(94896-94964)
scaffold0023 (6-45)||(101513-101552)
[»] chr7 (136 HSPs)
chr7 (1-454)||(16213690-16214143)
chr7 (1-454)||(15376417-15376869)
chr7 (1-454)||(20384827-20385279)
chr7 (1-454)||(32125497-32125949)
chr7 (1-454)||(41522923-41523376)
chr7 (1-454)||(41525385-41525838)
chr7 (1-454)||(456327-456780)
chr7 (1-454)||(14948826-14949278)
chr7 (1-454)||(16232526-16232979)
chr7 (1-454)||(27216866-27217319)
chr7 (1-451)||(21189302-21189751)
chr7 (1-454)||(16410065-16410517)
chr7 (1-454)||(18640278-18640730)
chr7 (1-454)||(24702244-24702687)
chr7 (1-454)||(18430718-18431170)
chr7 (1-403)||(11393041-11393443)
chr7 (1-448)||(13869352-13869801)
chr7 (1-454)||(24704694-24705134)
chr7 (1-454)||(26355685-26356150)
chr7 (1-454)||(26358137-26358602)
chr7 (205-551)||(8468945-8469291)
chr7 (1-280)||(11972502-11972780)
chr7 (202-551)||(11972755-11973104)
chr7 (157-452)||(11303409-11303704)
chr7 (158-452)||(16108394-16108688)
chr7 (288-551)||(14269177-14269440)
chr7 (146-454)||(18627717-18628024)
chr7 (288-551)||(38897641-38897904)
chr7 (158-452)||(23664658-23664952)
chr7 (205-454)||(14269660-14269909)
chr7 (288-551)||(16214170-16214433)
chr7 (205-454)||(15081545-15081794)
chr7 (158-452)||(29796771-29797067)
chr7 (158-452)||(29800590-29800886)
chr7 (205-454)||(8940489-8940742)
chr7 (294-551)||(15081255-15081512)
chr7 (288-551)||(8940962-8941223)
chr7 (207-454)||(45847358-45847605)
chr7 (1-174)||(44116515-44116688)
chr7 (11-187)||(13647344-13647521)
chr7 (1-173)||(3386339-3386511)
chr7 (288-551)||(21189018-21189272)
chr7 (1-144)||(24275177-24275320)
chr7 (1-174)||(17061898-17062071)
chr7 (88-280)||(15081825-15082019)
chr7 (1-172)||(20110562-20110723)
chr7 (11-174)||(12756654-12756817)
chr7 (1-174)||(38898359-38898533)
chr7 (215-387)||(13841274-13841446)
chr7 (288-454)||(8940769-8940934)
chr7 (289-454)||(25926833-25926998)
chr7 (425-551)||(45846858-45846984)
chr7 (288-454)||(10501097-10501263)
chr7 (289-454)||(13918106-13918272)
chr7 (289-454)||(1856933-1857097)
chr7 (288-501)||(14156545-14156755)
chr7 (288-454)||(14269467-14269633)
chr7 (1-114)||(48273398-48273512)
chr7 (1-157)||(3564319-3564476)
chr7 (288-454)||(14156782-14156944)
chr7 (1-121)||(13831379-13831499)
chr7 (158-280)||(14269940-14270061)
chr7 (321-501)||(10500887-10501064)
chr7 (140-254)||(13841157-13841270)
chr7 (1-157)||(18456368-18456524)
chr7 (1-157)||(12698840-12698998)
chr7 (1-157)||(38227490-38227646)
chr7 (7-174)||(2280056-2280225)
chr7 (178-280)||(45847638-45847739)
chr7 (1-157)||(9509198-9509355)
chr7 (158-280)||(38898106-38898229)
chr7 (288-450)||(17985092-17985254)
chr7 (158-280)||(8940335-8940458)
chr7 (8-163)||(26212012-26212168)
chr7 (158-246)||(8468803-8468891)
chr7 (7-157)||(15143993-15144143)
chr7 (205-283)||(38897997-38898075)
chr7 (8-106)||(10589055-10589154)
chr7 (484-551)||(23461726-23461793)
chr7 (471-543)||(14317616-14317688)
chr7 (1-114)||(67754-67868)
chr7 (10-174)||(19486681-19486847)
chr7 (1-113)||(22072922-22073036)
chr7 (287-375)||(11310239-11310327)
chr7 (14-172)||(12255730-12255892)
chr7 (288-406)||(45847213-45847331)
chr7 (11-174)||(16495421-16495581)
chr7 (505-551)||(5294525-5294571)
chr7 (505-551)||(5295698-5295744)
chr7 (505-551)||(5296871-5296917)
chr7 (373-455)||(11310133-11310214)
chr7 (6-153)||(18005660-18005806)
chr7 (11-142)||(40443410-40443541)
chr7 (7-174)||(1867932-1868101)
chr7 (7-153)||(16056343-16056488)
chr7 (8-91)||(16386268-16386353)
chr7 (385-458)||(23461791-23461864)
chr7 (79-163)||(15113031-15113114)
chr7 (8-106)||(34200802-34200901)
chr7 (1-45)||(47831816-47831860)
chr7 (10-174)||(10063760-10063921)
chr7 (6-101)||(811142-811238)
chr7 (79-163)||(15116568-15116651)
chr7 (7-153)||(16219677-16219823)
chr7 (6-104)||(44014192-44014291)
chr7 (11-174)||(20220127-20220290)
chr7 (513-551)||(9945103-9945141)
chr7 (1-89)||(28505321-28505410)
chr7 (1-97)||(14932749-14932846)
chr7 (15-174)||(15008436-15008597)
chr7 (1-97)||(15356184-15356281)
chr7 (1-97)||(15360298-15360395)
chr7 (1-53)||(18154901-18154953)
chr7 (200-279)||(13745569-13745648)
chr7 (205-280)||(15119918-15119993)
chr7 (308-378)||(11286976-11287046)
chr7 (320-406)||(16202766-16202852)
chr7 (308-377)||(125965-126034)
chr7 (8-45)||(15754955-15754992)
chr7 (288-356)||(15376322-15376390)
chr7 (288-356)||(20384732-20384800)
chr7 (288-356)||(27217346-27217414)
chr7 (215-279)||(38294567-38294631)
chr7 (419-454)||(11393003-11393038)
chr7 (367-406)||(13475728-13475767)
chr7 (7-38)||(14044761-14044792)
chr7 (7-38)||(14354791-14354822)
chr7 (288-327)||(16410544-16410583)
chr7 (288-327)||(18628051-18628090)
chr7 (288-327)||(18640757-18640796)
chr7 (288-327)||(26355619-26355658)
chr7 (288-327)||(26358071-26358110)
chr7 (11-106)||(27847838-27847932)
chr7 (8-45)||(11996095-11996132)
chr7 (7-97)||(12901338-12901431)
chr7 (385-417)||(20110747-20110779)
[»] chr2 (126 HSPs)
chr2 (1-454)||(32214634-32215077)
chr2 (1-454)||(18808949-18809401)
chr2 (1-454)||(23709236-23709688)
chr2 (1-454)||(23711717-23712169)
chr2 (1-454)||(39682319-39682772)
chr2 (1-454)||(571403-571856)
chr2 (1-448)||(23130868-23131315)
chr2 (1-448)||(23133335-23133782)
chr2 (1-448)||(34402231-34402678)
chr2 (1-454)||(28577105-28577557)
chr2 (1-454)||(24897899-24898352)
chr2 (1-454)||(24905336-24905789)
chr2 (1-454)||(26505385-26505837)
chr2 (1-454)||(26507863-26508315)
chr2 (1-454)||(24900382-24900835)
chr2 (1-454)||(24902859-24903312)
chr2 (1-454)||(24907811-24908264)
chr2 (1-454)||(23135596-23136038)
chr2 (1-454)||(32039202-32039654)
chr2 (1-451)||(24529253-24529685)
chr2 (1-280)||(6726001-6726279)
chr2 (1-276)||(21154942-21155216)
chr2 (3-280)||(24367782-24368058)
chr2 (1-280)||(22105418-22105697)
chr2 (157-452)||(20261381-20261676)
chr2 (288-551)||(22105951-22106214)
chr2 (205-454)||(23706920-23707169)
chr2 (1-280)||(38967380-38967658)
chr2 (288-551)||(24528960-24529223)
chr2 (292-551)||(41523293-41523552)
chr2 (158-452)||(10684468-10684764)
chr2 (205-454)||(24918350-24918599)
chr2 (288-551)||(24368312-24368575)
chr2 (288-551)||(24671511-24671774)
chr2 (1-227)||(45029784-45030010)
chr2 (288-551)||(24918626-24918889)
chr2 (205-454)||(24642452-24642701)
chr2 (290-551)||(32214343-32214604)
chr2 (291-551)||(23931949-23932209)
chr2 (288-551)||(6726533-6726796)
chr2 (288-551)||(21154228-21154491)
chr2 (288-551)||(24681930-24682193)
chr2 (205-454)||(24671235-24671484)
chr2 (205-453)||(38967689-38967937)
chr2 (205-452)||(24681654-24681901)
chr2 (221-454)||(45027608-45027840)
chr2 (202-454)||(22105672-22105924)
chr2 (202-454)||(24368033-24368285)
chr2 (288-551)||(23706439-23706702)
chr2 (1-394)||(25616194-25616580)
chr2 (202-454)||(21154711-21154963)
chr2 (290-551)||(45027313-45027579)
chr2 (202-454)||(6726254-6726506)
chr2 (202-454)||(41523776-41524028)
chr2 (80-280)||(24642732-24642933)
chr2 (1-173)||(43137305-43137477)
chr2 (288-453)||(41523584-41523749)
chr2 (310-454)||(23931775-23931919)
chr2 (288-454)||(21154518-21154684)
chr2 (1-157)||(22337124-22337281)
chr2 (1-157)||(23060522-23060679)
chr2 (1-157)||(23076451-23076608)
chr2 (288-454)||(23709043-23709209)
chr2 (293-454)||(23706728-23706889)
chr2 (10-172)||(19671848-19672010)
chr2 (1-157)||(22731189-22731346)
chr2 (158-280)||(23707200-23707323)
chr2 (158-280)||(24918196-24918319)
chr2 (1-157)||(22738135-22738291)
chr2 (1-157)||(298769-298927)
chr2 (1-157)||(23285874-23286027)
chr2 (158-277)||(24671081-24671201)
chr2 (1-157)||(23660032-23660188)
chr2 (158-280)||(24681500-24681623)
chr2 (7-172)||(23708558-23708725)
chr2 (1-73)||(24643034-24643106)
chr2 (8-157)||(23654341-23654491)
chr2 (8-91)||(38136-38219)
chr2 (11-157)||(7688-7835)
chr2 (11-140)||(23103369-23103497)
chr2 (118-187)||(22173799-22173868)
chr2 (6-113)||(28405990-28406099)
chr2 (386-454)||(31345570-31345638)
chr2 (1-53)||(23040249-23040301)
chr2 (289-353)||(31345490-31345554)
chr2 (11-142)||(20309127-20309257)
chr2 (11-174)||(20520130-20520295)
chr2 (11-174)||(23207296-23207461)
chr2 (1-68)||(8946666-8946734)
chr2 (87-163)||(22459511-22459587)
chr2 (11-144)||(32451896-32452031)
chr2 (1-153)||(7679594-7679745)
chr2 (73-174)||(23791357-23791458)
chr2 (6-153)||(25175864-25176010)
chr2 (288-340)||(24642373-24642425)
chr2 (134-174)||(29601478-29601518)
chr2 (7-45)||(18786971-18787009)
chr2 (205-279)||(21368365-21368439)
chr2 (296-377)||(16900803-16900884)
chr2 (296-377)||(16994194-16994275)
chr2 (13-53)||(22134266-22134306)
chr2 (308-379)||(67339-67410)
chr2 (367-406)||(44584588-44584627)
chr2 (205-279)||(23799457-23799531)
chr2 (73-174)||(24697543-24697644)
chr2 (336-394)||(34135071-34135129)
chr2 (308-417)||(24686598-24686707)
chr2 (288-356)||(18809428-18809496)
chr2 (198-270)||(22686145-22686217)
chr2 (13-53)||(23287384-23287424)
chr2 (288-356)||(23711622-23711690)
chr2 (13-53)||(26392403-26392443)
chr2 (288-356)||(26505864-26505932)
chr2 (288-356)||(26508342-26508410)
chr2 (288-356)||(27920373-27920441)
chr2 (288-356)||(32039107-32039175)
chr2 (8-43)||(23072019-23072054)
chr2 (288-327)||(23131347-23131386)
chr2 (288-327)||(23133814-23133853)
chr2 (288-327)||(34402160-34402199)
chr2 (237-280)||(41524003-41524045)
chr2 (308-378)||(27261332-27261402)
chr2 (336-417)||(6483113-6483194)
chr2 (308-377)||(12727711-12727780)
chr2 (324-417)||(19887275-19887368)
chr2 (308-377)||(34823750-34823819)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-452)||(11294-11746)
[»] scaffold0230 (6 HSPs)
scaffold0230 (1-454)||(13953-14406)
scaffold0230 (204-451)||(23237-23484)
scaffold0230 (288-551)||(22793-23047)
scaffold0230 (404-551)||(20617-20764)
scaffold0230 (288-374)||(23121-23207)
scaffold0230 (410-454)||(23074-23118)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (1-454)||(37827-38280)
scaffold0134 (288-356)||(38307-38375)
[»] chr5 (99 HSPs)
chr5 (1-454)||(264472-264924)
chr5 (1-454)||(20909018-20909470)
chr5 (1-454)||(10732644-10733096)
chr5 (1-448)||(39363390-39363837)
chr5 (1-454)||(39245142-39245594)
chr5 (1-454)||(29345986-29346438)
chr5 (1-454)||(42245069-42245521)
chr5 (1-454)||(29348459-29348911)
chr5 (1-454)||(29350932-29351384)
chr5 (1-448)||(38619440-38619889)
chr5 (1-454)||(2154335-2154770)
chr5 (1-454)||(23064517-23064972)
chr5 (1-280)||(32027399-32027677)
chr5 (1-280)||(29329940-29330215)
chr5 (179-452)||(17516869-17517142)
chr5 (1-280)||(20917830-20918104)
chr5 (288-551)||(17516383-17516647)
chr5 (205-454)||(20901624-20901873)
chr5 (158-451)||(37804609-37804902)
chr5 (7-280)||(20901904-20902159)
chr5 (288-551)||(2154045-2154308)
chr5 (288-551)||(20917260-20917523)
chr5 (288-551)||(32028511-32028774)
chr5 (288-512)||(20901373-20901597)
chr5 (288-551)||(295688-295951)
chr5 (202-454)||(32027652-32027904)
chr5 (215-454)||(20917550-20917789)
chr5 (288-526)||(29330468-29330706)
chr5 (158-417)||(9776521-9776780)
chr5 (202-454)||(29330190-29330441)
chr5 (1-174)||(36154766-36154936)
chr5 (1-172)||(11581184-11581355)
chr5 (1-169)||(18319021-18319190)
chr5 (1-174)||(10775659-10775832)
chr5 (1-174)||(31061074-31061248)
chr5 (1-169)||(24067113-24067282)
chr5 (288-454)||(295978-296144)
chr5 (288-454)||(32028124-32028291)
chr5 (288-454)||(32027931-32028097)
chr5 (288-454)||(17516674-17516840)
chr5 (1-157)||(1096476-1096633)
chr5 (1-157)||(9077961-9078118)
chr5 (1-157)||(23390451-23390608)
chr5 (1-157)||(25421541-25421698)
chr5 (288-454)||(32028318-32028484)
chr5 (1-157)||(24529229-24529386)
chr5 (8-157)||(21729019-21729169)
chr5 (8-157)||(21808344-21808494)
chr5 (12-157)||(25431414-25431560)
chr5 (1-157)||(24493578-24493734)
chr5 (1-99)||(21997547-21997646)
chr5 (1-157)||(8286797-8286955)
chr5 (1-137)||(22412193-22412329)
chr5 (1-157)||(13025320-13025476)
chr5 (1-157)||(13095504-13095660)
chr5 (8-157)||(22075035-22075185)
chr5 (11-157)||(22144068-22144215)
chr5 (6-172)||(21565556-21565723)
chr5 (50-137)||(20766095-20766181)
chr5 (10-174)||(40725871-40726037)
chr5 (11-140)||(37723922-37724050)
chr5 (11-106)||(20026945-20027043)
chr5 (11-91)||(21292992-21293071)
chr5 (1-53)||(21329556-21329609)
chr5 (2-90)||(18418590-18418678)
chr5 (1-101)||(21502167-21502268)
chr5 (6-106)||(22959538-22959639)
chr5 (1-54)||(20806845-20806898)
chr5 (11-170)||(22178161-22178323)
chr5 (1-144)||(17517169-17517313)
chr5 (7-153)||(26011995-26012141)
chr5 (205-276)||(18743965-18744036)
chr5 (8-53)||(19660894-19660940)
chr5 (308-378)||(27183208-27183278)
chr5 (308-417)||(22883904-22884013)
chr5 (11-53)||(36314596-36314639)
chr5 (205-279)||(1628169-1628243)
chr5 (202-280)||(20917777-20917855)
chr5 (11-53)||(26740705-26740747)
chr5 (324-417)||(11919-12012)
chr5 (324-417)||(25426193-25426286)
chr5 (1-50)||(26704080-26704129)
chr5 (8-53)||(26732892-26732937)
chr5 (1-50)||(26973813-26973862)
chr5 (320-417)||(43444009-43444106)
chr5 (288-356)||(264377-264445)
chr5 (288-356)||(20909497-20909565)
chr5 (205-277)||(21399896-21399968)
chr5 (308-404)||(23511127-23511223)
chr5 (6-45)||(19668912-19668951)
chr5 (520-551)||(24473792-24473823)
chr5 (288-327)||(39245621-39245660)
chr5 (288-327)||(39363869-39363908)
chr5 (368-406)||(23280293-23280331)
chr5 (308-377)||(1220384-1220453)
chr5 (308-377)||(10778832-10778901)
chr5 (324-377)||(21074249-21074302)
chr5 (19-91)||(21873277-21873350)
chr5 (67-163)||(18356389-18356485)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-454)||(20753-21207)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-454)||(9248-9700)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-454)||(13398-13851)
scaffold0444 (288-328)||(13878-13918)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-454)||(136686-137138)
scaffold0028 (1-454)||(139155-139607)
scaffold0028 (1-454)||(144093-144545)
scaffold0028 (1-454)||(134217-134669)
scaffold0028 (1-454)||(141624-142076)
scaffold0028 (6-117)||(132672-132784)
scaffold0028 (10-96)||(62216-62303)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-454)||(40406-40858)
scaffold0044 (296-417)||(37848-37968)
scaffold0044 (288-328)||(40885-40925)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-551)||(38262-38814)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (1-357)||(10779-11134)
scaffold0454 (420-454)||(1-35)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-453)||(501090-501522)
scaffold0001 (288-551)||(501550-501813)
scaffold0001 (1-174)||(85562-85736)
scaffold0001 (6-172)||(160698-160864)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (205-551)||(129-476)
scaffold0494 (1-212)||(12194-12405)
scaffold0494 (205-280)||(507-582)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (118-454)||(6070-6405)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (288-551)||(18423-18686)
scaffold0322 (410-454)||(18352-18396)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (158-452)||(3186-3480)
[»] scaffold0278 (4 HSPs)
scaffold0278 (291-551)||(8421-8681)
scaffold0278 (252-452)||(7996-8196)
scaffold0278 (288-454)||(8225-8391)
scaffold0278 (6-153)||(5657-5803)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (158-454)||(4006-4304)
scaffold0741 (288-454)||(3813-3979)
scaffold0741 (292-454)||(3620-3782)
scaffold0741 (288-340)||(3541-3593)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (288-551)||(30505-30768)
scaffold0149 (205-454)||(30229-30478)
scaffold0149 (9-278)||(29946-30196)
scaffold0149 (460-551)||(34154-34245)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (288-551)||(6937-7200)
scaffold0574 (216-454)||(6682-6910)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (158-454)||(6639-6937)
scaffold0317 (288-551)||(6350-6612)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (288-551)||(1740-2003)
scaffold1296 (375-454)||(1634-1713)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (205-454)||(799-1048)
scaffold0747 (320-551)||(1227-1457)
scaffold0747 (288-437)||(1075-1224)
scaffold0747 (158-280)||(645-768)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (205-452)||(10001-10248)
scaffold0043 (288-551)||(10470-10733)
scaffold0043 (288-452)||(10277-10441)
scaffold0043 (246-280)||(9936-9970)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (288-551)||(43225-43487)
scaffold0040 (258-454)||(43002-43198)
scaffold0040 (213-405)||(13379-13571)
scaffold0040 (460-551)||(20502-20593)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (158-417)||(53612-53873)
scaffold0022 (1-137)||(116436-116571)
scaffold0022 (11-174)||(128907-129072)
scaffold0022 (15-174)||(78345-78505)
[»] scaffold1792 (4 HSPs)
scaffold1792 (204-451)||(416-663)
scaffold1792 (288-551)||(853-1107)
scaffold1792 (288-374)||(693-779)
scaffold1792 (410-454)||(782-826)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (158-425)||(15083-15352)
scaffold0306 (288-551)||(10753-11016)
scaffold0306 (288-534)||(15398-15643)
scaffold0306 (246-454)||(11043-11251)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (1-280)||(9755-10016)
scaffold0145 (1-157)||(32951-33107)
scaffold0145 (1-157)||(38770-38926)
scaffold0145 (216-278)||(10005-10067)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (158-394)||(1591-1827)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-187)||(82078-82264)
scaffold0037 (7-172)||(22610-22776)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-174)||(158433-158606)
scaffold0003 (7-157)||(339905-340053)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (1-187)||(112-298)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-174)||(16790-16963)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-174)||(4303-4476)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (1-187)||(12070-12250)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (261-454)||(68227-68420)
scaffold0064 (11-91)||(47014-47093)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-187)||(1250-1437)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (11-174)||(79267-79430)
scaffold0056 (1-157)||(17170-17329)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (11-174)||(20363-20524)
scaffold0031 (1-157)||(128760-128916)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (1-174)||(4220-4393)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (374-551)||(398-575)
scaffold0021 (11-140)||(174785-174913)
scaffold0021 (1-53)||(121775-121827)
scaffold0021 (81-157)||(124675-124751)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (3-174)||(2111-2283)
scaffold0247 (10-174)||(17964-18130)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (289-452)||(17947-18110)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-174)||(161072-161246)
scaffold0007 (74-174)||(164573-164674)
[»] scaffold0711 (5 HSPs)
scaffold0711 (289-453)||(7395-7558)
scaffold0711 (462-551)||(6990-7079)
scaffold0711 (288-454)||(7201-7367)
scaffold0711 (290-383)||(7079-7172)
scaffold0711 (419-454)||(7586-7621)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-157)||(22892-23048)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (289-454)||(39626-39791)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (289-454)||(31497-31662)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (289-454)||(19792-19957)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (222-379)||(57708-57865)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (289-452)||(33465-33628)
scaffold0138 (84-173)||(18176-18265)
scaffold0138 (7-106)||(12954-13054)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (288-454)||(8311-8477)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (442-551)||(60576-60685)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-137)||(44682-44819)
scaffold0122 (1-157)||(26020-26177)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (437-551)||(7419-7533)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-157)||(3106-3262)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (442-551)||(107115-107224)
scaffold0035 (363-406)||(15910-15953)
scaffold0035 (308-417)||(110065-110174)
scaffold0035 (308-417)||(118566-118675)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (6-157)||(4522-4673)
scaffold0228 (6-157)||(12104-12255)
scaffold0228 (6-157)||(22056-22207)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-163)||(51922-52085)
scaffold0011 (8-142)||(167948-168083)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (202-340)||(28048-28186)
scaffold0114 (164-280)||(27958-28073)
scaffold0114 (8-157)||(15420-15568)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (453-551)||(43261-43359)
scaffold0042 (10-157)||(24257-24406)
scaffold0042 (373-454)||(75608-75689)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-157)||(16555-16712)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-157)||(13220-13377)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-157)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-157)||(75170-75326)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-157)||(3141-3298)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (1-157)||(1860-2017)
scaffold0016 (511-551)||(184978-185018)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (296-531)||(113317-113550)
scaffold0014 (13-53)||(206584-206624)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (8-142)||(1018-1153)
[»] scaffold0151 (3 HSPs)
scaffold0151 (288-451)||(36905-37068)
scaffold0151 (288-414)||(36749-36875)
scaffold0151 (503-551)||(36692-36740)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (158-280)||(10765-10886)
scaffold0513 (205-292)||(10647-10734)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (8-157)||(4865-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-157)||(3479-3636)
scaffold0292 (1-157)||(352-508)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (1-157)||(32913-33068)
scaffold0120 (1-157)||(45937-46092)
scaffold0120 (1-156)||(16122-16278)
scaffold0120 (1-54)||(17388-17441)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-157)||(25905-26061)
scaffold0026 (1-157)||(39867-40023)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (7-172)||(8481-8650)
scaffold0621 (6-153)||(6549-6695)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-172)||(8472-8641)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (158-280)||(15150-15273)
scaffold0106 (1-53)||(15298-15350)
scaffold0106 (205-254)||(15070-15119)
scaffold0106 (11-106)||(1308-1402)
scaffold0106 (11-106)||(7285-7379)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-157)||(6076-6236)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (7-174)||(27686-27855)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (1-106)||(28423-28529)
scaffold0046 (8-106)||(11308-11407)
scaffold0046 (8-45)||(2013-2050)
scaffold0046 (8-45)||(4568-4605)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (56-157)||(3485-3586)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-140)||(8488-8628)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (158-268)||(35955-36065)
scaffold0100 (7-97)||(23898-23989)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (11-174)||(53486-53651)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (79-152)||(13092-13165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (11-142)||(1971-2103)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (10-174)||(11482-11648)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (11-174)||(13147-13313)
scaffold0357 (7-174)||(16037-16206)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (10-174)||(38193-38359)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-157)||(39922-40078)
scaffold0080 (11-112)||(19883-19987)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (11-174)||(12587-12751)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (44-172)||(13144-13274)
scaffold0175 (1-48)||(282-329)
scaffold0175 (8-106)||(34139-34238)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (66-174)||(225482-225590)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (8-82)||(4728-4803)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (158-269)||(1215-1327)
scaffold0599 (205-235)||(1143-1173)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (8-157)||(10381-10528)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (7-172)||(10481-10647)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (8-91)||(13513-13596)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (8-91)||(11464-11548)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (8-142)||(32083-32216)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (101-174)||(12039-12112)
scaffold0503 (11-71)||(11982-12042)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (72-157)||(27911-27996)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (11-174)||(60652-60818)
scaffold0010 (6-153)||(129919-130066)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (13-174)||(7996-8161)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-106)||(15670-15776)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (6-153)||(19278-19424)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (11-174)||(6220-6386)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (6-172)||(45732-45899)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (10-157)||(20928-21077)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (7-174)||(25121-25289)
scaffold0123 (215-278)||(16263-16326)
scaffold0123 (73-174)||(620-720)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (11-174)||(1011-1171)
scaffold0184 (308-406)||(32118-32216)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-101)||(6134-6235)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (13-142)||(4545-4675)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (6-153)||(143-290)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (6-113)||(2805-2913)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (506-551)||(3524-3569)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (6-113)||(14696-14804)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (11-174)||(97024-97190)
scaffold0006 (11-174)||(106302-106468)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (11-93)||(1051-1134)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-45)||(1091-1135)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-45)||(1102-1146)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-45)||(6620-6664)
scaffold0333 (1-45)||(14000-14044)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (7-113)||(32551-32657)
scaffold0034 (11-157)||(51839-51985)
scaffold0034 (308-378)||(79003-79073)
scaffold0034 (308-378)||(39965-40035)
scaffold0034 (308-378)||(45448-45518)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-45)||(15845-15889)
scaffold0020 (1-50)||(178903-178952)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (11-106)||(16301-16395)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (68-157)||(918-1006)
scaffold0395 (1-53)||(4893-4945)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (308-417)||(6196-6305)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (66-153)||(8090-8176)
scaffold0556 (6-106)||(6826-6927)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (6-45)||(2713-2752)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (15-157)||(38339-38483)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (11-106)||(51601-51695)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (56-142)||(6675-6761)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (7-174)||(8011-8180)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (11-174)||(267679-267844)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (308-409)||(12489-12590)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (308-417)||(8566-8675)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-50)||(23848-23897)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (6-117)||(32112-32224)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (308-417)||(30470-30579)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (1-45)||(36459-36503)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (7-113)||(10542-10649)
scaffold0078 (308-406)||(40628-40726)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (6-45)||(12780-12819)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (200-279)||(15282-15361)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (11-45)||(5196-5230)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (6-44)||(28839-28877)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (308-417)||(725-834)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (1-97)||(29563-29660)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (73-174)||(1735-1835)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (11-142)||(1021-1151)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (310-357)||(15780-15827)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (73-174)||(88-189)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (308-406)||(1267-1365)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (308-377)||(1375-1444)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (308-377)||(6970-7039)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 479; Significance: 0; HSPs: 118)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 551
Target Start/End: Original strand, 34963379 - 34963929
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963379 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 34963478  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963479 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 34963578  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34963579 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatc 34963678  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34963679 tatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgtt 34963778  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattca 500  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34963779 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacatatattattca 34963878  T
Q  501 acttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963879 acttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 34963929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 30676866 - 30676413
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30676866 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtc 30676767  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676766 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 30676667  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30676666 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 30676567  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30676566 tacgtgaagtaattttaccataactcaagttctataaattattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 30676467  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676466 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 30676413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 24422553 - 24423005
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422553 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 24422652  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24422653 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 24422752  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24422753 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 24422851  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  24422852 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 24422951  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24422952 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 24423005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 33861800 - 33862252
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861800 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 33861899  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33861900 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 33861999  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33862000 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 33862098  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  33862099 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 33862198  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33862199 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 33862252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 33864284 - 33864736
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864284 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 33864383  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33864384 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 33864483  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33864484 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 33864582  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  33864583 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 33864682  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33864683 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 33864736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 12742323 - 12742776
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742323 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 12742422  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12742423 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 12742522  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12742523 tatacatataacacttcatcaatcatggacaaggtcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 12742622  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  12742623 tacttgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 12742722  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12742723 tacacctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 12742776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 18334748 - 18334296
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334748 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18334649  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18334648 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 18334549  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18334548 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 18334450  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  18334449 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 18334350  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18334349 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 18334296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26924796 - 26924344
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924796 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 26924697  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26924696 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 26924597  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||     
T  26924596 tgtacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacg 26924498  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26924497 tacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 26924398  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26924397 tacacctaagaacaattctgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcgg 26924344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19859075 - 19858626
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859075 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 19858976  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  19858975 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataacaatcaacatcttaaaacatcata 19858876  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19858875 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-agcatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 19858777  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  19858776 tatgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaag---acattcatacctacaacttttgtgtt 19858680  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19858679 tacacctaagatcaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 19858626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1541067 - 1540615
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1541067 tcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaagtc 1540968  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1540967 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 1540868  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1540867 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 1540769  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  1540768 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 1540669  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1540668 tacacctaagaccaattctataccaatcaataccagtttgcatttcaaattcgg 1540615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2291336 - 2290884
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291336 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 2291237  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2291236 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 2291137  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2291136 tatacatataacacttcatcagtcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 2291038  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  2291037 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatatctacaactttcgtgtt 2290938  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2290937 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 2290884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 8055035 - 8055488
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055035 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 8055134  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8055135 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 8055234  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  8055235 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcattgtgacc 8055334  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    ||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  8055335 tacattcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 8055434  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8055435 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 8055488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 22782233 - 22782685
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782233 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 22782332  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22782333 aacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcata 22782432  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782433 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 22782531  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |  |    
T  22782532 tatgtgcagtaatttgaccataactcaaattctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcctact 22782631  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  22782632 tacacctaagaccaattctgtaccaattaataccatttttcatttcaaattcgg 22782685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 25688508 - 25688961
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25688508 tcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtc 25688607  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25688608 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcacaatataacaacaccaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatt 25688707  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25688708 tatacatataacacttcctcaatcatggacaatatcgtattcacaaaaatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtcacc 25688807  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25688808 tacgtgcagtaatttgaccataactcaatttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattacaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 25688907  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25688908 tacagctaagaccaattcggtaccaataaataccagttttgatttcaaattcgg 25688961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 179 - 551
Target Start/End: Original strand, 23992604 - 23992978
Alignment:
Q  179 atcaacatcttaaaacatcat---atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaa 275  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23992604 atcaacatcttaaaacatcatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaa 23992702  T
Q  276 tcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaa 375  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     ||||||||||| |    
T  23992703 tcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaaattgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacaacattagaaagctga 23992802  T
Q  376 catccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaat 475  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23992803 catccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccggatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaat 23992902  T
Q  476 cagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992903 cagaaaaagcaacctatactattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 23992978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 229 - 551
Target Start/End: Original strand, 25535641 - 25535964
Alignment:
Q  229 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  25535641 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacatgcagtaatttgaccataactcaa 25535740  T
Q  329 gttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatc 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25535741 gttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctctaccaatc 25535840  T
Q  429 aataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcag-aaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcaca 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535841 aataccagttttcatttcaaattcggggcaaagatgaaaagaaaaatcagaaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcaca 25535940  T
Q  528 atcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  25535941 atcatcactcttaaccataattct 25535964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 19005052 - 19005330
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005052 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 19005151  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19005152 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 19005251  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19005252 tatacatataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 19005330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19848107 - 19847675
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || || |||  ||||  |||||||  |||||| |||||||| ||||| |    
T  19848107 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaattgcaatt 19848008  T
Q  100 caacaacgtctcaattatt-cacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                   |||||    
T  19848007 caacaatatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catca 19847927  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19847926 tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtga 19847827  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||     ||||||||||||||| |||    
T  19847826 cctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatcta----gcatacctacaactttcgtg 19847731  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19847730 tttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 19847675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 25656635 - 25656897
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25656635 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtt 25656734  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25656735 aataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcacaatataaaaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatctta 25656834  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25656835 tatacatataacacttcatcaatcttggacaatatcgtagtcacaaatatatacatacatata 25656897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19847648 - 19847385
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19847648 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgacgataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagactaatggcattagaaagctaacatccataccta 19847549  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19847548 caactttcgtgtttatacctaggaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatttggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 19847449  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847448 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 19847385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28289334 - 28289042
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||    
T  28289334 atataacgacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgc--tcacaaatatatacata 28289237  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28289236 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacca 28289137  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28289136 acgacattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctgagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 28289042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 19005637 - 19005900
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19005637 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaacataactcaagttctataaatcgttttgaagtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 19005736  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19005737 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtactaatcaataccaaatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcataaaaagcaa 19005836  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005837 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 19005900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 204 - 454
Target Start/End: Original strand, 1598266 - 1598515
Alignment:
Q  204 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1598266 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 1598364  T
Q  304 gtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttac 403  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1598365 gtgcagtaatttgactatgactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 1598464  T
Q  404 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1598465 acctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 1598515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 191 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17377814 - 17377576
Alignment:
Q  191 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  17377814 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactatttcatcaatcatattcaattatt 17377715  T
Q  291 cactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaa 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377714 cactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatacttttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacatccatacctacaa 17377615  T
Q  391 cttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatca 429  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17377614 ctttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatca 17377576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 1598735 - 1598998
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598735 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttaacgtcagaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 1598834  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1598835 caactttaatgtttacacttatgaccaattctggacctatcaataccagttttcatttcaaattcggggtagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 1598934  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1598935 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccataattct 1598998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31630217 - 31629954
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||||||||||| |||    
T  31630217 attcgctgtgacatacatgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataacta 31630118  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31630117 caactttcgtgtttacacctaagaccaactatgtacttatcaataccagatttcattttaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 31630018  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630017 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 31629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 157 - 452
Target Start/End: Original strand, 12942363 - 12942646
Alignment:
Q  157 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12942363 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 12942462  T
Q  257 acatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12942463 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaattcgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 12942562  T
Q  357 attggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |  |  |||||||||||            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12942563 aacgacattagaaagct------------tacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 12942646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Original strand, 18914142 - 18914391
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18914142 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtatttacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 18914241  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  18914242 tgcagtaatttgaccataactcaagttctatacatccttttgaagttaaaccaacagcattagaaagttaacatccatacctacaactttcgtgtttacc 18914341  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18914342 cctaagaccaattatgtaccaataaataccagttttcatttcaaattcgg 18914391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Original strand, 19005361 - 19005610
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  19005361 catataacatttcatcaattatgaacaatatcgcattcacaaacatatacatacctatagtaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctaca 19005460  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19005461 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaatttttgtgtttaca 19005560  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19005561 cctaagactaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 19005610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1595555 - 1595763
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1595555 tcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaattc 1595654  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1595655 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 1595754  T
Q  201 tatacatat 209  Q
    |||||||||    
T  1595755 tatacatat 1595763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 292 - 551
Target Start/End: Original strand, 18914615 - 18914874
Alignment:
Q  292 actgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaac 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  |  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  18914615 actgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatttttttgatgtcagaccaacgacattagaaatctaacatttatacctacaac 18914714  T
Q  392 ttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaaccta 491  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18914715 tttcgtgtttacacctaagaccaattctggacttatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaaccta 18914814  T
Q  492 tattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18914815 tattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaacccttattct 18914874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 25754815 - 25755001
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25754815 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatc 25754914  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25754915 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 25755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31630493 - 31630244
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  31630493 catataacactttatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatatttaattattcattgtgacatacg 31630394  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||    
T  31630393 tgcaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacgtctatacctacaaatttcgtgtttaca 31630294  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31630293 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 31630244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 30676386 - 30676132
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676386 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagagcaacggaattagaaagctaacatccataccta 30676287  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||    
T  30676286 caactttagtcttatcacctaagaccaattatgtaccattcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaa---------aagaaaaagcaa 30676196  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30676195 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaactctaattct 30676132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456898
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18456834  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456835 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 18456898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20557048 - 20556864
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20557048 tcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaagtc 20556949  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20556948 aacaacgtctcaat--ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 20556864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16448683 - 16448514
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448683 tcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 16448584  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 169  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448583 aatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 16448514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3852173 - 3852001
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3852173 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaatgcaagtc 3852074  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3852073 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 3852001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18461994  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatata 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461995 caattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 288 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 2034 - 1871
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  2034 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 1935  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1934 caactttcgtgtgtacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 288 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 8993 - 8830
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  8993 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 8894  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8893 caactttcgtgtgtacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 8830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 1598542 - 1598708
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  1598542 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgatgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 1598641  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1598642 caactttcgtgtttatacctaagaccatttatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 1598708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Original strand, 27557016 - 27557181
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27557016 ttcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttaacgtcagaccaatggcattagaaagctaacatccatacctac 27557115  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27557116 aactttcatgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatagcagttttcatttcaaattcgg 27557181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 25688988 - 25689154
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  25688988 attcactatgacctacgtgcagtaatatgaccataacgcaagttctataaatttttttgacgtccgaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 25689087  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25689088 caacttttgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 25689154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17028066 - 17027957
Alignment:
Q  442 atttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaa 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17028066 atttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaa 17027967  T
Q  542 ccctaattct 551  Q
    ||||||||||    
T  17027966 ccctaattct 17027957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Original strand, 23415258 - 23415423
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23415258 ttcacagtgacctacgtgcagtaacttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaatggcattagaaaactaacatccatacctac 23415357  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23415358 aactttcgtgtttacacctaagacaaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 23415423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 292 - 454
Target Start/End: Original strand, 18914422 - 18914584
Alignment:
Q  292 actgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaac 391  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18914422 actgtgacctacgtgcagtactttgaccataactcaagttctatcaatcgttttgacttcagaccaacggtattagaaagctaacttccatacctacaac 18914521  T
Q  392 ttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  18914522 tttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtattaatttaaaattcgg 18914584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25629467 - 25629310
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25629467 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagt 25629368  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25629367 caacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 25629310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 29060549 - 29060703
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29060549 tcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 29060648  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatc 154  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  29060649 caacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatc 29060703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31630626 - 31630524
Alignment:
Q  178 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31630626 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 31630527  T
Q  278 ata 280  Q
    |||    
T  31630526 ata 31630524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18409939 - 18409782
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18409939 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 18409840  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  18409839 caacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcaca 18409782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 335 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15892231 - 15892112
Alignment:
Q  335 taaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatacc 434  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892231 taaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctagcatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatacc 15892132  T
Q  435 agtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15892131 agttttcatttcaaattcgg 15892112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 162 - 280
Target Start/End: Original strand, 18913994 - 18914111
Alignment:
Q  162 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 261  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18913994 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattca-taacatatacatacata 18914092  T
Q  262 tactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  18914093 tactaattcatcaatcata 18914111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 292 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26924313 - 26924151
Alignment:
Q  292 actgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaac 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26924313 actgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatttatacctacaac 26924214  T
Q  392 ttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||  |||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26924213 tttcatgtttacaccaaaggctaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 26924151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 20593782 - 20593939
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593782 tcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 20593881  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  20593882 caacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcaca 20593939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17287908 - 17287768
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17287908 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaagt 17287809  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 140  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  17287808 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 17287768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20361067 - 20360915
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  20361067 atcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 20360968  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20360967 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 20360915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644487
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcaca 25644487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Original strand, 15875469 - 15875590
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15875469 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacatttcattaatcatttacaatatcgtattcac-aacatatacata 15875567  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  15875568 catataataattcatcaatcata 15875590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 16496260 - 16496410
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16496260 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 16496359  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  16496360 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcaca 16496410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19303652 - 19303496
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagca-gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19303652 tcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagt 19303554  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  19303553 caacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcaca 19303496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 288 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 242 - 79
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||| |||||||||||||||     
T  242 attcactatgacctacgtgcagtactttgaccataactcaagttatataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaaactaacatccatacctt 143  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  142 caactttcgtgtatacacctaagaccaattttgtacaactcaataccagttttcattttaaatt 79  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821801
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cgtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||| | ||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcatc 18821848  T
Q  110 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||||||||  || | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18821847 tcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata-cattatatcaca 18821801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 20076709 - 20076862
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20076709 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 20076807  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||   ||| ||  |||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20076808 caaca---tcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcaca 20076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22780339 - 22780166
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22780339 tcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaattgcaagt 22780240  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 172  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||||   |  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  22780239 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaa 22780166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Original strand, 15875621 - 15875737
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15875621 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattatttactgtgacctacg 15875710  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagtt 331  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||    
T  15875711 tgcagtaatttgaccataactcaagtt 15875737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 363 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17883292 - 17883203
Alignment:
Q  363 attagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17883292 attagaatgctaacatccatacctacaactttcgtgtttacaccaaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 17883203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 417
Target Start/End: Original strand, 25689181 - 25689310
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  |  ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  25689181 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgatgtcagaccaacgtcattagaatgctgacatccacaccta 25689280  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25689281 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 25689310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 20109153 - 20109322
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20109153 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatcaaatgcaagtcatca 20109251  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatata--attatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20109252 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 25737128 - 25737247
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  25737128 attcactgtgacctacatgcagtaatatgaccataactcatgttctataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 25737227  T
Q  388 caacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25737228 caacttttgtgtttacacct 25737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20638395 - 20638253
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20638395 tcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaatt 20638296  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
     | |||| |||  | |||||| | ||  |||||||||||||||    
T  20638295 tatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcata 20638253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 490 - 551
Target Start/End: Original strand, 16198293 - 16198354
Alignment:
Q  490 tatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198293 tatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 16198354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 25689320 - 25689382
Alignment:
Q  489 ctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25689320 ctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaactctaattct 25689382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8227616 - 8227448
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||  || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |||| |||||    
T  8227616 caacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaa 8227518  T
Q  106 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8227517 catctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 8227448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Original strand, 18937252 - 18937317
Alignment:
Q  162 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 227  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18937252 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 18937317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 454
Target Start/End: Original strand, 25737028 - 25737101
Alignment:
Q  381 atacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25737028 atacctacaactttcgtgtttacacctaagacgaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 25737101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 25714426 - 25714478
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714426 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22981416 - 22981321
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccata 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  22981416 attcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgcccgaccaacggcattagaaagctaacatccata 22981321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 383
Target Start/End: Original strand, 23806992 - 23807087
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccata 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  23806992 attcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgcccgaccaacggcattagaaagctaacatccata 23807087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 23019425 - 23019567
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23019425 cttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 23019523  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    |||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  23019524 ctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 23019567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098473
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |   ||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| || |||    ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9098520 aacttcacaa--catcaaacataattcatgtaatgtatatataattatat 9098473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 389 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9085 - 9020
Alignment:
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  9085 aactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcattaccagttttcatttaaaattcgg 9020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 25721009 - 25721054
Alignment:
Q  506 actttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25721009 actttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 25721054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27333330 - 27333277
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27333330 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 27333277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27394070 - 27394017
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27394070 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 27394017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 35245605 - 35245749
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |    
T  35245605 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacat 35245701  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35245702 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 35245749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668488
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  103 caac 106  Q
    ||||    
T  19668485 caac 19668488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 23992436 - 23992540
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  23992436 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaatt 23992535  T
Q  100 caaca 104  Q
    |||||    
T  23992536 caaca 23992540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 28496575 - 28496477
Alignment:
Q  9 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  28496575 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac 28496477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 29808986 - 29808888
Alignment:
Q  9 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29808986 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac 29808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 19652209 - 19652316
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  19652209 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 19652306  T
Q  104 aacgtctcaa 113  Q
    ||| ||||||    
T  19652307 aacatctcaa 19652316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041522
Alignment:
Q  19 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | || || |||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  118 tcacatataat-tcaagtaatgca 140  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  15041544 tca-ataaaatctcaagtaatgca 15041522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 22981486 - 22981443
Alignment:
Q  411 accaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22981486 accaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 22981443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 454
Target Start/End: Original strand, 23806922 - 23806965
Alignment:
Q  411 accaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23806922 accaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 23806965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 45
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185558
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 11185558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19984228 - 19984130
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |   |||||| ||||||  ||||||||||    
T  19984228 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaggtcaaaccaaagtcattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 19984130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 22080837 - 22080799
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 39  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080837 tcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Original strand, 35056707 - 35056781
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  35056707 catataataattcatcaatcatgaacaacatcataatcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 35056781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Original strand, 1561319 - 1561356
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1561319 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 1561356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Original strand, 16240296 - 16240405
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  16240296 agtaatttgatcataactcaagtcctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacaccg 16240395  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  16240396 aagtccaatt 16240405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16557054 - 16556945
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  16557054 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 16556955  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  16556954 aaggccaatt 16556945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16633610 - 16633501
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  16633610 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 16633511  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  16633510 aaggccaatt 16633501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16650284 - 16650175
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  16650284 agtaatttgatcataactcaagttctaaaattcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 16650185  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  16650184 aaggccaatt 16650175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 22831524 - 22831565
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22831524 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 22831565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27654690 - 27654597
Alignment:
Q  324 ctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||    || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  27654690 ctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaagtccaatt 27654597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18334269 - 18334201
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  18334269 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 18334201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 24423032 - 24423100
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  24423032 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 24423100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443108
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 33443108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 33864763 - 33864831
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  33864763 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 33864831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10905455 - 10905416
Alignment:
Q  367 gaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10905455 gaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttacacc 10905416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16920728 - 16920602
Alignment:
Q  15 gaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||||  ||||||||| | | ||| |||| ||| |    
T  16920728 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatac---aacatcatgacataagtatatcaaattccattcatcaacatctta 16920632  T
Q  113 attattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
      ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  16920631 tgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 16920602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17883333 - 17883303
Alignment:
Q  213 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattca 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883333 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattca 17883303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Original strand, 25904474 - 25904584
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaa-tcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||    
T  25904474 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 25904573  T
Q  407 taagaccaatt 417  Q
     ||| ||||||    
T  25904574 aaaggccaatt 25904584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 279
Target Start/End: Original strand, 32259078 - 32259136
Alignment:
Q  221 aatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  32259078 aatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 32259136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35016113 - 35016043
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  35016113 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaagcaaagccattagaaagctaacat 35016043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Original strand, 15875565 - 15875626
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 263  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  15875565 atacatataataattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatata 15875626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 174
Target Start/End: Original strand, 23076862 - 23076915
Alignment:
Q  122 atataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  23076862 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 23076915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185880
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaaca 53  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaaca 4185880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 454
Target Start/End: Original strand, 4703 - 5153
Alignment:
Q  4 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4703 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 4802  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4803 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacaacatatat 4902  T
Q  204 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4903 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctac 5002  T
Q  304 gtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttac 403  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5003 gtgctgtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 5102  T
Q  404 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5103 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 5153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 5180 - 5443
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||  || || ||||| ||||||||||||||||    
T  5180 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctatatatcgttttgacgtcagaccaacggcataagaaaactaacatccataccta 5279  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280 caactttcatgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 5379  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5380 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcagtcttaaccctaattct 5443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 127)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16413472 - 16413019
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413472 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 16413373  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413372 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 16413273  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16413272 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatc 16413173  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16413172 tacgtgaagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagcaagctaacatccatacctacaactgtcgtgtt 16413073  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16413072 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 16413019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14409600 - 14409148
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409600 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 14409501  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14409500 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 14409401  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14409400 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 14409302  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  14409301 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 14409202  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14409201 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14409148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 1484408 - 1484860
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484408 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 1484507  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1484508 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 1484607  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1484608 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 1484706  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  1484707 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 1484806  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1484807 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 1484860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 5853448 - 5852996
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853448 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 5853349  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5853348 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 5853249  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5853248 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 5853150  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  5853149 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 5853050  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5853049 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 5852996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20046351 - 20045899
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046351 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 20046252  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20046251 aacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 20046152  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20046151 tatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactcattcatcaatcatattcaattattcactatgacc 20046053  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  20046052 tacatgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtgaaaccaacggcattagaaatctaacatttatacctacaactttcgtgtt 20045953  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045952 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 20045899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 22001759 - 22002211
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001759 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 22001858  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22001859 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 22001958  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  22001959 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcaatgttacc 22002057  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  22002058 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatttatacctacaactttcatgtt 22002157  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22002158 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 22002211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 4483287 - 4483733
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483287 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 4483385  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4483386 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 4483485  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  4483486 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcagtgtgacc 4483585  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4483586 tacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 4483685  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaa 448  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4483686 tatacctaagaccaattatgtaccaataaataccagttttcatttcaa 4483733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 4542529 - 4542077
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542529 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 4542430  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4542429 aacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 4542330  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  4542329 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgcgacc 4542231  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  4542230 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatcattttgaagtcaagcgaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 4542131  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4542130 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 4542077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 14823780 - 14824233
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823780 tcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 14823878  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc--a 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  14823879 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcata 14823978  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14823979 tatatacatataacacttcatcaatcatggataatatcgtatttac-aacatatacattcatatactaattaatcaatcatattcaattattcactgtga 14824077  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14824078 cctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtg 14824177  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14824178 tttacacctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14824233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 454
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15071019
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaac 15070670  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 205  Q
    |||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15070671 gtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatctgaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcataaatac 15070770  T
Q  206 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgt 305  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  15070771 atataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgacctacgt 15070870  T
Q  306 gaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacac 405  Q
      ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15070871 tcagtaatttgaccataactcaagttgtataaatcatttttaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttatac 15070970  T
Q  406 ctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15070971 ctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 15071019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 108 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24486093 - 24485747
Alignment:
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24486093 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttagaacatcatatatacat 24485994  T
Q  208 ataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24485993 ataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgc 24485894  T
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  24485893 agtaatttgactataactcaagttttataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacaccc 24485794  T
Q  408 aagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24485793 aagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 24485747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 20403233 - 20403511
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403233 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20403332  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20403333 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 20403432  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20403433 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 20403511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 205 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1326884 - 1326538
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1326884 catataacacttcatcaatcataaacaatatcgtatttacaaacatgtacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 1326785  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  1326784 tgcagtaatttgaccataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagataacattcatacctacaactttcgtttttaca 1326685  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaactt 504  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1326684 cttaagaccaattctgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcggggcaaagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaattt 1326585  T
Q  505 cactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326584 tactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 1326538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15203387 - 15203109
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15203387 tcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtc 15203288  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15203287 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 15203188  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15203187 tatacatataacacttcatcaatcatggataatatcttattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 15203109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 19896271 - 19896553
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataa---taatatcaaatgcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19896271 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacggtatacaaaaacagcatgacataataataatatcaaatgcaa 19896370  T
Q  98 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatctt-aaaacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||    
T  19896371 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaaatat 19896470  T
Q  197 catatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19896471 catatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatatatacatatactaattcatcaatcata 19896553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45290851 - 45290572
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  45290851 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagcc 45290752  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45290751 aatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcacagtataacaacgtcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 45290652  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45290651 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 45290572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 178 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 27472395 - 27472120
Alignment:
Q  178 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatc 277  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27472395 aatcaacatcttaaa-catcatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 27472297  T
Q  278 atattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||    
T  27472296 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaatctaaca 27472197  T
Q  378 tccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27472196 tccatacctacaactttcgtgtttacagctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaactcgg 27472120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 20403765 - 20404028
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  20403765 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacattcataccta 20403864  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20403865 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtagcaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaataagaaaaagcaa 20403964  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403965 tctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 20404028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27472093 - 27471830
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27472093 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 27471994  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27471993 caactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 27471894  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471893 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 27471830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 32122214 - 32122477
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  32122214 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 32122313  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32122314 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 32122413  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122414 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 32122477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 32121741 - 32122187
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || || |||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  32121741 tcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaatt 32121840  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatata-attatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    ||||||| ||| || ||||||   |||  |||||||||||| ||| | | | |||||||   ||      ||||    | ||||||||||||||||||||    
T  32121841 caacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataaacaatgtatcacatcttat-----tcaa----tcatcaacatcttaaaacatca 32121931  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32121932 tacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatgcatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtga 32122031  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  32122032 cctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacattcgtg 32122131  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  32122132 tttacacctaagaacaattctgtaccaatcaatatcagtttacatttcaaattcgg 32122187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 18678214 - 18677768
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || || |||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  18678214 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaatt 18678115  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatata-attatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    ||||||| ||| || ||||||   |||  |||||||||||| ||| | | | |||||||   ||      ||||    | ||||||||||||||||||||    
T  18678114 caacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataaacaatgtatcacatcttat-----tcaa----tcatcaacatcttaaaacatca 18678024  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18678023 tacataaatataacacttcatcaatcatggataatatcgtattcacaaacatatacatatacatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtga 18677924  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18677923 cctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 18677824  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18677823 tttatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttaaaattcgg 18677768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16412992 - 16412728
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412992 attcactgtgacctacgtatagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacatcagaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 16412893  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcaga-aaaagca 486  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16412892 caactttcgtgtttacacctaagaccagttctgtaccaatcaataccaattttcatttcaaattcgcggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaaagca 16412793  T
Q  487 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412792 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 16412728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19937162 - 19936882
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19937162 tcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaatgcaagtc 19937063  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc--ttaaaacatc 197  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||    
T  19937062 aatcaacgtctcaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacagttatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatc 19936963  T
Q  198 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19936962 atatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 19936882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 15071046 - 15071309
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  15071046 attcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 15071145  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15071146 caactttcgtgtttacccctaagatcaattctttaccgatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 15071245  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15071246 cttatattattcaacttcacttttattcaaaatcatcacaatcatcactcttatctctaattct 15071309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15202662 - 15202399
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  15202662 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggtattagaaagctaacatccataccta 15202563  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15202562 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctggatctatcaataccagatttcatttcaaattcggggtagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 15202463  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202462 cccatattattcaacttcactttcattctaaataatcacaatcatcactcttaaccctaattct 15202399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 19897000 - 19897263
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  19897000 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggcattagaaatctaacattcataccta 19897099  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19897100 caacttttgtatttacagctaagaccaattttggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 19897199  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19897200 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcataacaatcatcactcttaactctaattct 19897263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38549488 - 38549226
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||| ||    
T  38549488 attcactgtg-cctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcataccaacgacattagaaagctaacatccatacata 38549390  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38549389 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtacctatcaataccagatttcatttcaaattcgggggagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 38549290  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38549289 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcacttttaagcctaattct 38549226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 216 - 454
Target Start/End: Original strand, 16198115 - 16198353
Alignment:
Q  216 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaattt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  16198115 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaattg 16198214  T
Q  316 gactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaa 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16198215 gaccataactcaagttctataaatatttttaaagtcaaaccaacggcattagaaagctaatatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 16198314  T
Q  416 ttatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198315 ttctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 16198353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Original strand, 24048841 - 24049069
Alignment:
Q  225 atgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataac 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24048841 atgnacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac-tgcagtaatttgaccataac 24048939  T
Q  325 tcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtacc 424  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048940 tcaagttctataaattgttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtacc 24049039  T
Q  425 aatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049040 aatcaataccagtttttatttcaaattcgg 24049069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 38549957 - 38549708
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38549957 catataaaaattcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacatacg 38549858  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38549857 tgcagtattttgaccataactcaagttctataaatctttttgaagtcaaaccaacgacattagaaaactaacatccatacctacaacttttgtgtttata 38549758  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38549757 cctaagaccaattctttaccaatcaataccagatttcatttcaaattcgg 38549708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 207 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16401875 - 16401628
Alignment:
Q  207 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16401875 tataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacctg 16401776  T
Q  307 aagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
      ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16401775 ctgtaatctgactataactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatcaatacctacaactttcgtgtttacacc 16401676  T
Q  407 taagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16401675 taagaccaattatgtatcaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 16401628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 296 - 551
Target Start/End: Original strand, 24049104 - 24049359
Alignment:
Q  296 tgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaactttt 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  24049104 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctataactttc 24049203  T
Q  396 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatatt 495  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24049204 gtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccatatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcataaaaaacaacctatatt 24049303  T
Q  496 attcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049304 attcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 24049359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 310 - 551
Target Start/End: Original strand, 11361024 - 11361266
Alignment:
Q  310 taatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaa 409  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11361024 taatttaactataacttaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacagtattagaaagctaacatccatacctacaagttttgtgtttacacctaa 11361123  T
Q  410 gaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagat-gaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcact 508  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11361124 gaccaattatgcacctatcaatactagatttcatttcaaattcggggcagagatggaaaaaaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcact 11361223  T
Q  509 ttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11361224 ttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccttaattct 11361266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 41598194 - 41598367
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598194 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 41598293  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598294 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 41598367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15203134 - 15202882
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| || || ||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15203134 atacatatactaattcatcaatcataaataacatcatactcataaacatatacattcatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 15203035  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203034 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaacttttgtgttt 15202935  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15202934 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcgtttcaaattcgg 15202882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19936850 - 19936611
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||          |||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  19936850 catataacacttcatcaatcatgaacaatataatattcacaaacatatac----------taattcatcaatcataaacaattattcactgtgacctacg 19936761  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19936760 tgcagtaatttgactatacctcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatgacattagaaatctaacattcatacctacaactttcgtgtttaca 19936661  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19936660 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 19936611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 216 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25658094 - 25657893
Alignment:
Q  216 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaattt 315  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25658094 tcatcaatcatgaacaatatcaaattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaattt 25657995  T
Q  316 gactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaa 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25657994 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacaaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttacaccaaagaccaa 25657895  T
Q  416 tt 417  Q
    ||    
T  25657894 tt 25657893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 198 - 454
Target Start/End: Original strand, 19896524 - 19896780
Alignment:
Q  198 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtg 297  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  19896524 atatatacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatcctaattcatcaatcacattcaattattcactgtg 19896623  T
Q  298 acctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgt 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   ||||||| ||| || ||||||||||| ||| ||    
T  19896624 acctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcgctagaaagttaaaattcatacctacaattttcgt 19896723  T
Q  398 gtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19896724 gtttacacctaagaccaattctctaccaatcaataccagttttcatttaaaattcgg 19896780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 20403486 - 20403738
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20403486 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacct 20403585  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  20403586 acgcgcagtaatatgacaataactcaagttctataaatccttttcaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattaatacctacaactttcgtgttt 20403685  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20403686 acacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 20403738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 288 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 19936584 - 19936347
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19936584 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgagcataactcaagttctataaatcgttttaacgccagaccaacggaattagaaagctaatatccatagcta 19936485  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19936484 caactttcatgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagag-taaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 19936386  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 526  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936385 cttatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 19936347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 118 - 280
Target Start/End: Original strand, 32810054 - 32810215
Alignment:
Q  118 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32810054 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatgtaacacttc 32810153  T
Q  218 atcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32810154 atcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 32810215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801367
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtct 19801429  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19801428 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataacaacatcaa 19801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 26223925 - 26224098
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26223925 tcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 26224024  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224025 aacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 26224098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25484424 - 25484245
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25484424 tcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta-------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatc 25484332  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25484331 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaatcataatcaacatc 25484245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 287 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15202856 - 15202689
Alignment:
Q  287 tattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacct 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  15202856 tattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaatagcattagaaagctaacatccatacct 15202757  T
Q  387 acaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15202756 acaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 15202689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 363 - 526
Target Start/End: Original strand, 32810264 - 32810427
Alignment:
Q  363 attagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagaga 462  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  32810264 attacaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaatattagatttcatttcaaattcggggcagaga 32810363  T
Q  463 tgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 526  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810364 tgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 32810427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 19896807 - 19896973
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  19896807 attcactgtgacctacttgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 19896906  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19896907 caactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttaaaattcgg 19896973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 202 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45290597 - 45290385
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  45290597 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatattcaattattcactatgatct 45290498  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290497 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 45290398  T
Q  402 acacctaagacca 414  Q
    |||||||||||||    
T  45290397 acacctaagacca 45290385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 38549681 - 38549515
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38549681 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggaattaaaaagctaacatccataccta 38549582  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38549581 caacttccgtgtttatacctaagatcaattctgtaccaatcaataccagttttcattttaaattcgg 38549515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14397609 - 14397444
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  14397609 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctacaaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctac 14397510  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14397509 agctttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14397444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 320 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 45290385 - 45290252
Alignment:
Q  320 ataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattat 419  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45290385 ataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatttt 45290286  T
Q  420 gtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcg 453  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45290285 gtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcg 45290252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16092454 - 16092297
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092454 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16092355  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16092354 caacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcaca 16092297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 288 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16401601 - 16401437
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| |||| | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||    
T  16401601 attcattgtggcatacgtgctgtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcgttggaaagctaacatccataccta 16401502  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16401501 caactttcgtgtttacacctaagaccaattacgtaccaatcaataccagtttgcatttcaaattc 16401437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16401408 - 16401243
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  16401408 attcactgtgacctacgtgctgtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 16401309  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16401308 caactttcgtgtttacacctaa-accaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcgg 16401243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 6759267 - 6759421
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6759267 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 6759366  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||   |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  6759367 caaca---tctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcaca 6759421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18818521 - 18818348
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18818521 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 18818422  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 172  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  18818421 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 18818348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 7372787 - 7372932
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7372787 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 7372886  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatat 145  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  7372887 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcttatat 7372932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28649156 - 28648999
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649156 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 28649057  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  28649056 caacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 28648999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38550090 - 38549988
Alignment:
Q  178 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38550090 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacgtatactaattcatcaatc 38549991  T
Q  278 ata 280  Q
    |||    
T  38549990 ata 38549988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 20536217 - 20536374
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20536217 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 20536316  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  20536317 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 20536374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Original strand, 26219726 - 26219858
Alignment:
Q  4 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219726 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 26219824  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    ||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  26219825 aacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26219858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 422 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 37609943 - 37609815
Alignment:
Q  422 accaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatc 521  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37609943 accaataaataccagatttcatttcaaattcggg-cagagatgaaaagaaaaataagaaaaagcaacctatattattcaacttcactcttattcaaaatc 37609845  T
Q  522 atcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37609844 atcacaatcatcacccttaaccctaattct 37609815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 22875074 - 22875230
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22875074 tcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagt 22875172  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22875173 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22875230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 23406388 - 23406548
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23406388 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagt 23406487  T
Q  100 caac--aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaa 158  Q
    ||||  | | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  23406488 caacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaa 23406548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21919105 - 21918969
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21919105 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 21919006  T
Q  107 gtctcaattattcacat-ataattcaagtaatgcata 142  Q
     ||| || |||||| || ||  |||||||||||||||    
T  21919005 atcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata 21918969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21924040 - 21923900
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  21924040 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagt 21923941  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 140  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  21923940 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 21923900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26225403 - 26225268
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26225403 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaatacaagtc 26225305  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    |||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  26225304 aacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 22626745 - 22626901
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22626745 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatacaaat 22626843  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  22626844 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcaca 22626901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 178 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20982710 - 20982604
Alignment:
Q  178 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatata----acacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20982710 aatcaacatcttaaaacatcatatatatatatatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatc 20982611  T
Q  274 aatcata 280  Q
    |||||||    
T  20982610 aatcata 20982604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508022
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || ||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13508090  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13508089 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13508022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597554
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13597622  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13597621 tcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13597554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 478 - 551
Target Start/End: Original strand, 20457354 - 20457427
Alignment:
Q  478 gaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20457354 gaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 20457427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13425411 - 13425336
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13425411 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 13425336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20982573 - 20982498
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20982573 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 20982498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1327042 - 1326915
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatata------acacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacata 251  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1327042 atataacaacatcaaataataatcaacatctcaaaacatcgtatatacatatatatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacata 1326944  T
Q  252 tacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1326943 tacatacatataccaattcatcaatcata 1326915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18879343 - 18879191
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||| |    
T  18879343 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatcaattgcaatt 18879249  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  18879248 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 18879191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16402020 - 16401908
Alignment:
Q  169 tcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatacta 266  Q
    ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16402020 tcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatacta 16401922  T
Q  267 attcgtcaatcata 280  Q
    |||| |||||||||    
T  16401921 attcatcaatcata 16401908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498746
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || ||||||  ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 20498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13425305 - 13425241
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425305 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatt 13425241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17612213 - 17612059
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |||| ||||||     
T  17612213 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 17612115  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17612114 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 17612059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Original strand, 31971273 - 31971407
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  31971273 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaattccaattcatcaac 31971371  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
     ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  31971372 atcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 31971407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38855363 - 38855212
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  38855363 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaa 38855265  T
Q  99 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  38855264 tcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 38855212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 21285606 - 21285719
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  21285606 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaa 21285704  T
Q  99 tcaacaacgtctcaa 113  Q
    |||||||| ||||||    
T  21285705 tcaacaacatctcaa 21285719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 45131098 - 45131019
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45131098 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaa 45131019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116532
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  37116465 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 37116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 6520377 - 6520483
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  6520377 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 6520475  T
Q  99 tcaacaac 106  Q
    ||| ||||    
T  6520476 tcatcaac 6520483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 23648562 - 23648719
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||      
T  23648562 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcatttgcaata 23648661  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataa-ttcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  23648662 caacaacatcttaaatattca-ataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcaca 23648719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16199746 - 16199666
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  16199746 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatcaa 16199666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983410
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||   ||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  104 aac 106  Q
    |||    
T  983412 aac 983410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5866376 - 5866280
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  5866376 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266930
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||| | |||| | |  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaa-cggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17266998  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  | ||| |||||||||  |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  17266997 atctcaaaca-tcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 17266930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 94
Target Start/End: Original strand, 17140932 - 17141019
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  17140932 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatcgaatg 17141019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 21491011 - 21491110
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||  |||| || |||||||    
T  21491011 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa 21491109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439461
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  17439510 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcaca 17439461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21389552 - 21389458
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  21389552 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaac 21389458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21396082 - 21395988
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  21396082 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaac 21395988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 276
Target Start/End: Original strand, 21513636 - 21513707
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaat 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  21513636 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaat 21513707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21778878 - 21778784
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  21778878 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaac 21778784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21790575 - 21790481
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  21790575 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaac 21790481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23760950 - 23760903
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23760950 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 23760903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18815683 - 18815609
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  18815683 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcacataataattcatcaatcat 18815609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24717820 - 24717722
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  || |||||||| |||||||   |||||| ||||||  ||||||||||    
T  24717820 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaaggcattagaaatctaacataattacctaaaactttcatgtttacacc 24717722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15320098 - 15319989
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  15320098 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacatagttatctaaaactttcatgtttacacca 15319999  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  15319998 aaggccaatt 15319989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15500467 - 15500358
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  15500467 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacatagttatctaaaactttcatgtttacacca 15500368  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  15500367 aaggccaatt 15500358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 29759429 - 29759498
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  29759429 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 29759498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 26355805 - 26355766
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26355805 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaa 26355766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 42
Target Start/End: Original strand, 21249400 - 21249434
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249400 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 42
Target Start/End: Original strand, 21255238 - 21255272
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255238 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35026895 - 35026849
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 204  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35026895 atataacaatatcaaacgataatcaacatcttaaaacatcatatata 35026849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36733376 - 36733302
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  36733376 catataatacttcatcaatcatgaaaaacatcatattcatcaacatatacattcatataataaatcatcaatcat 36733302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Original strand, 38988730 - 38988804
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  38988730 catataataattcatcaatcatgaacatcatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 38988804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Original strand, 39019827 - 39019901
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  39019827 catataataattcatcaatcatgaacatcatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 39019901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5083068 - 5083003
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattc 270  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  5083068 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattc 5083003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673826
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 21673816  T
Q  104 aacgtctcaa 113  Q
    ||| ||||||    
T  21673817 aacatctcaa 21673826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 1484887 - 1484955
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  1484887 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 1484955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5852969 - 5852901
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  5852969 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 5852901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14409121 - 14409053
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  14409121 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 14409053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20045872 - 20045804
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  20045872 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 20045804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2418906 - 2418860
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 204  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2418906 atataacaatatcaaacgataatcaacatcttgaaacatcatatata 2418860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17150713 - 17150655
Alignment:
Q  320 ataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |  ||||||||||||||||    
T  17150713 ataactcaagttctaaaaatcatttggaagtccaaccaaagccattagaaagctaacat 17150655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13663198 - 13663129
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  13663198 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 13663129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Original strand, 18611952 - 18612001
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  18611952 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaacca 18612001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19936906 - 19936845
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 263  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  19936906 atacatatactaattcatcaatcatgaacaacatcatactcataaacatatacattcatata 19936845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22007195 - 22007126
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  22007195 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 22007126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 267
Target Start/End: Original strand, 32810190 - 32810255
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaa 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32810190 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaa 32810255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38550000 - 38549936
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  38550000 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataaaaattcatcaatcat 38549936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 3515013 - 3515466
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3515013 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaatgcaagtc 3515112  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515113 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 3515212  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3515213 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaaaatatacatacatataataattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 3515312  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515313 tacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 3515412  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3515413 tacacctaagaccaattttgtaccgatcaataccagttttcatttcaaattcgg 3515466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14970861 - 14970410
Alignment:
Q  3 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970861 ttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacagcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 14970762  T
Q  103 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970761 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatata 14970662  T
Q  203 tacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgaccta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14970661 tacatataacacttcatcaattatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgaccta 14970562  T
Q  303 cgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttta 402  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14970561 tgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttta 14970462  T
Q  403 cacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14970461 cacctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14970410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15118508 - 15118056
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118508 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 15118409  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15118408 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 15118309  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15118308 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 15118210  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  15118209 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 15118110  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15118109 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 15118056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 44615294 - 44615747
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615294 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 44615393  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44615394 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 44615493  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44615494 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 44615593  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  44615594 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaaatttcgtgtt 44615693  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44615694 tacacttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 44615747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 50222495 - 50222043
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222495 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 50222396  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50222395 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaatatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 50222296  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50222295 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 50222197  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  50222196 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacatcttttgtgtt 50222097  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50222096 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 50222043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 19242705 - 19243159
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242705 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 19242804  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242805 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaactccaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 19242904  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  19242905 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgac 19243004  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  19243005 ctacgttcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatacatacctacaactttcttgt 19243104  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19243105 ttatacctaagactaattctgtaccaatcaataccagttttcgtttcaaattcgg 19243159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 44773243 - 44772787
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773243 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 44773144  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc--- 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||       
T  44773143 aacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatcata 44773044  T
Q  198 -atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgt 296  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  44773043 tatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcgtatactaattcatcaatcatattcaattattcattgt 44772945  T
Q  297 gacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttg 396  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  44772944 gacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatctttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctacaactttcg 44772845  T
Q  397 tgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  44772844 tgtttacacctaagaccaattctctaccaataaataccagttttcatttaaaattcgg 44772787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1837665 - 1837223
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1837665 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtc 1837566  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1837565 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 1837466  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||           |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1837465 tatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgttttcaca-----------acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacc 1837377  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  1837376 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatcctttttaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcatgtt 1837277  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1837276 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 1837223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7641338 - 7640890
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641338 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 7641249  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  7641248 aacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatcata 7641149  T
Q  201 tatacatata------acacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcact 294  Q
    |||| |||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7641148 tatatatatatatataacacttcatcaatcatgaaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactcattcatcaatcatattcaattattcact 7641050  T
Q  295 gtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttt 394  Q
    |||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7641049 gtgacctacaggcagtaatttaactataactcaagttctataaatccttttgaagtgaaaccaatggcattagaaagctaacatttatacctacaacttt 7640950  T
Q  395 tgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7640949 cgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 7640890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18239575 - 18239250
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239575 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18239476  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18239475 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 18239376  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  18239375 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactcattcatcaatcatattcaaaaattcactgtgacc 18239277  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18239276 tacgtgaagtaatttgacaataactca 18239250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18215430 - 18215152
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215430 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18215331  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18215330 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcata 18215231  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18215230 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 18215152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19618328 - 19618050
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618328 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtc 19618229  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618228 aacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 19618129  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19618128 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatataccaattcatcaatcata 19618050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12463 - 12185
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12463 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 12364  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12363 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatccaataataatcaacatcttaaaacatcata 12264  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12263 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 52312516 - 52312794
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312516 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 52312615  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52312616 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 52312715  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52312716 tatacatataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 52312794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 202 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12210 - 11861
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||  ||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12210 atacatatactaattcatcaatcataaacaacataatacacataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 12111  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12110 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattgatacctacaactttcgtgttt 12011  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaa 501  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12010 acacctaagaccaattctgtacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagataaaaagaaaaatcagaaaaagcaacccatattattcaa 11911  T
Q  502 cttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11910 cttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 11861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15355481 - 15355202
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355481 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 15355382  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15355381 aatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 15355282  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15355281 atatacatataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 15355202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 157 - 452
Target Start/End: Original strand, 15534343 - 15534638
Alignment:
Q  157 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15534343 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 15534442  T
Q  257 acatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15534443 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 15534542  T
Q  357 attggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15534543 aacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 15534638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Original strand, 36038033 - 36038327
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36038033 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 36038132  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||  |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36038133 catatcttaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacca 36038232  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36038233 acggtattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaaggccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 36038327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14970383 - 14970120
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  14970383 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 14970284  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14970283 caacttttgtgttatcacctaagaccaattgtgtacaaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 14970184  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970183 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 14970120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 49547773 - 49547479
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49547773 atataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatagatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 49547674  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||| |||||||||    ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49547673 catatattaattcatcaatcataaataattcttcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacca 49547574  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49547573 acggcattagaaagctaacatccatacctacaaatttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 49547479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 52873025 - 52872776
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52873025 catataacacatcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 52872926  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52872925 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctagcatccatacctacaactttcgtgtttaca 52872826  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52872825 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 52872776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Original strand, 14048740 - 14049034
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048740 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacctcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaacatatacata 14048839  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||  |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14048840 catatattaatttatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataacacaagttctgtaaatccttttgaagtcaaacca 14048939  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
      || |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14048940 acggcattagaaagctaacattcatacccacaactttcatgtttacacctaaaaccaattatgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattc 14049034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18214880 - 18214617
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  18214880 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 18214781  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18214780 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaatttggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 18214681  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214680 cctatattattcaacttcactttccttcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 18214617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 288 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 52872749 - 52872511
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  52872749 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacagaattagaaagctaacatccataccta 52872650  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52872649 caactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 52872550  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872549 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 52872511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 205 - 452
Target Start/End: Original strand, 362390 - 362637
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  362390 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 362489  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  362490 tgcagtaatttgaccataaatcaagttctataaatcgttttgaagtcaaactaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 362589  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  362590 cctaagactaattttgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattc 362637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 3515493 - 3515756
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  3515493 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtgagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 3515592  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  3515593 caactttcgtgtttacgcctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcagggtagagatgaaaagaaaaatcagaaaaaacaa 3515692  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515693 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 3515756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19617743 - 19617480
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  19617743 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttcaataaatcattttggcgttagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 19617644  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  19617643 caactttcgtgtctacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcatagaaagcaa 19617544  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19617543 cctatattattcaacttcactttcattcgaaatcatcaaaatcatcactcttaacccaaattct 19617480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 362859 - 363122
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  362859 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaaattctataaatctttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 362958  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  362959 caactttcgggtttacacctaagaccaattctatacaaatcaataccacatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcataaaaagcaa 363058  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  363059 catatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 363122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 205 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19618019 - 19617772
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19618019 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 19617920  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19617919 tgcagtaatttgaccataactcaacttctataaatccttttgaagtcacaccaacagcattagaaagctaacatccatacctataacttttgtgttaaca 19617820  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19617819 cctaagaccaactctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 19617772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 52313240 - 52313503
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  52313240 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 52313339  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  52313340 taactttcgtgtttacacctaagatcaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcac 52313439  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52313440 cccatattatttaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccttaattct 52313503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 205 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15496126 - 15495880
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15496126 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcagaaacatatacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttacg 15496027  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496026 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaaacctttcgaatttaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 15495927  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15495926 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcattccaaatt 15495880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 288 - 526
Target Start/End: Original strand, 19858064 - 19858302
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19858064 attcactgtgacctacgtgcaataatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 19858163  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19858164 caacttttgtgtttgcacctaagaccaattctgtaccaatcaataccatttttcatttcaaattcggggtagagatgaaaagaaaaattagaaaaagcaa 19858263  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858264 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 19858302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 212 - 454
Target Start/End: Original strand, 29267570 - 29267812
Alignment:
Q  212 cacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagta 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  29267570 cacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgttcagta 29267669  T
Q  312 atttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaaga 411  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29267670 atttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaaga 29267769  T
Q  412 ccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29267770 ccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 29267812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14746464 - 14746215
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14746464 catataacacttcatcaatcatgaacataatagtattcacaaacatatacatatatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacctacg 14746365  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  14746364 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttaaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtccttaca 14746265  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14746264 ccgaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14746215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51464024 - 51463838
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51464024 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatc 51463925  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51463924 aacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 51463838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23803421 - 23803235
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23803421 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatc 23803322  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23803321 aacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacataaaatcataatcaacatc 23803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 52312769 - 52313020
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52312769 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 52312868  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52312869 gcgtgcagtaatt-gactataactcaagttctataaatccttttgaagtaaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 52312967  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52312968 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 52313020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 205 - 446
Target Start/End: Original strand, 19857798 - 19858029
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19857798 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 19857887  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19857888 tgcagtaatttgaccataaatcaagttctataaattattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatacatacctacaactttcgtgtttaca 19857987  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttc 446  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19857988 cctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttc 19858029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 44102220 - 44102393
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44102220 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagta 44102319  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44102320 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 44102393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 12610956 - 12611135
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12610956 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-------acaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatc 12611048  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12611049 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 12611135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 380 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12778460 - 12778290
Alignment:
Q  380 catacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcaga 479  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12778460 catacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaa-tcaga 12778362  T
Q  480 aaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778361 aaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaattatcacaatcatcactcttaaccctaattct 12778290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44929036 - 44928873
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44929036 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaagt 44928937  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44928936 caataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 44928873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815568
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaactgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtct 21815632  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21815631 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcataatataacaacatcaaat 21815568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 15367708 - 15367873
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15367708 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgt 15367807  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367808 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15367873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 15402721 - 15402886
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15402721 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgt 15402820  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402821 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15402886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 15371220 - 15371385
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15371220 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaatgt 15371319  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371320 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15371385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 15373501 - 15373666
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15373501 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaatgt 15373600  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373601 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15373666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 15370036 - 15370200
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15370036 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgt 15370135  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370136 ctcaattattcacatataattcaact-acgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15370200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15489717 - 15489562
Alignment:
Q  396 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatatt 495  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15489717 gtgtttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagacttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatatt 15489618  T
Q  496 attcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15489617 attcaacttcactttcattcaaaatcttcacaatcatcacttttaaccctaattct 15489562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 16223550 - 16223712
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16223550 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgcaagtcaatcaacgt 16223649  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16223650 ctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataacaacatca 16223712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 20149835 - 20150004
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149835 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20149934  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 169  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20149935 aatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 20150004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 290 - 454
Target Start/End: Original strand, 362668 - 362832
Alignment:
Q  290 tcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctaca 389  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  362668 tcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgatgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctaca 362767  T
Q  390 acttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  362768 actttagtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 362832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18215121 - 18214992
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18215121 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattaataaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 18215022  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttcta 334  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18215021 tgcagtaatttgaccataactcaagttcta 18214992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 409 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14745931 - 14745789
Alignment:
Q  409 agaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcact 508  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745931 agaccaattctggacctatcaataccaaatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaattagaaaaagcaacctatattattcaacttcact 14745832  T
Q  509 ttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14745831 ttcattcaaaatcatcacaatcattactcttaaccttaattct 14745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14746188 - 14746022
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  14746188 attcactatgatctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagataacatccataccta 14746089  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14746088 caactttcttgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14746022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 52313047 - 52313213
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  52313047 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataaatcaagttctataaatcgttttgacgtcataccaaaggcattagaaatctaacatccataccta 52313146  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  52313147 caacttttgtgtttacacctaagatcaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcgg 52313213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 54798866 - 54798729
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798866 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 54798767  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  54798766 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 54798729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 14280322 - 14280434
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280322 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 14280421  T
Q  101 aacaacgtctcaa 113  Q
    |||||| ||||||    
T  14280422 aacaacatctcaa 14280434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16377633 - 16377478
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377633 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16377536  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16377535 caacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16377478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 7798783 - 7798956
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7798783 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 7798882  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 172  Q
    || |||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7798883 catcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaa 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 14038657 - 14038814
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14038657 tcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagt 14038756  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  14038757 caacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcaca 14038814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 7088886 - 7089043
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7088886 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 7088985  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| |  |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  7088986 catcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 7089043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 12902773 - 12902923
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||    
T  12902773 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaattcatcaac 12902872  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  12902873 atcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 12902923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15495850 - 15495716
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15495850 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 15495751  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgta 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15495750 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctgta 15495716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15497070 - 15496949
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15497070 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacata 15496972  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  15496971 catatattaattcatcaatcata 15496949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 22353852 - 22354010
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||  |  |  |||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  22353852 cttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaattacaattcaacaacgtc 22353951  T
Q  110 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaaca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22353952 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaaca 22354010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 272 - 454
Target Start/End: Original strand, 30147192 - 30147374
Alignment:
Q  272 tcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaag 371  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| ||  |||   ||     
T  30147192 tcaatcatattcaattattcactgtgacctatgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgttgtcataccaatgtcatttttaat 30147291  T
Q  372 ctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
     | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  30147292 tttatatccatacttacaacttttgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaattccatttttcatttcaaattcgg 30147374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 413 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15355069 - 15354956
Alignment:
Q  413 caattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttca 512  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15355069 caattatgtagcaatcgataccagttttcatttcaaattcggggcagagatggaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatgttattcaacttcactttca 15354970  T
Q  513 ttcaaaatcatcac 526  Q
    ||||||||||||||    
T  15354969 ttcaaaatcatcac 15354956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 22636444 - 22636601
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22636444 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 22636543  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22636544 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 22636601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52873176 - 52873056
Alignment:
Q  159 tataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatac 258  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52873176 tataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatac 52873078  T
Q  259 atatactaattcgtcaatcata 280  Q
     |||| |||||| |||||||||    
T  52873077 gtatattaattcatcaatcata 52873056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 7893712 - 7893869
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7893712 tcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 7893811  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  7893812 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcaca 7893869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15355171 - 15355070
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15355171 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatatatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 15355072  T
Q  305 tg 306  Q
    ||    
T  15355071 tg 15355070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 52873479 - 52873375
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52873479 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 52873380  T
Q  100 caaca 104  Q
    |||||    
T  52873379 caaca 52873375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16270347 - 16270191
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270347 tcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16270249  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  16270248 taacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 16270191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8574979 - 8574844
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  8574979 tcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgtaattc 8574881  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    |||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  8574880 aacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13788
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14746618 - 14746495
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14746618 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcgc-aacatataca 14746520  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  14746519 tacatatactaattcatcaatcata 14746495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 44052838 - 44052995
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44052838 tcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 44052937  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  44052938 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 44052995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 6899900 - 6900056
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  6899900 tcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagt 6899998  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  6899999 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 6900056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243131
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||  |||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  103 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 52243131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16240081 - 16239927
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16240081 tcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16239983  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 155  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| || |||||||||| |||  |||||||||    
T  16239982 caacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatca 16239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 288 - 394
Target Start/End: Original strand, 14185621 - 14185727
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  14185621 attcactgtgacctacgttcaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgacgtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 14185720  T
Q  388 caacttt 394  Q
    |||||||    
T  14185721 caacttt 14185727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23374464 - 23374314
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  23374464 caacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 23374365  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23374364 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23374314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||||||||||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Original strand, 19857685 - 19857767
Alignment:
Q  198 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19857685 atatatatataaaatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 19857767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 362268 - 362336
Alignment:
Q  178 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  362268 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcacaa 362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 77
Target Start/End: Original strand, 3096309 - 3096379
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatga 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3096309 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 367 - 455
Target Start/End: Original strand, 14185507 - 14185595
Alignment:
Q  367 gaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggg 455  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14185507 gaaagctaacacacttatctacaactttcatgttaacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggg 14185595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22725401 - 22725284
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||    || |||    
T  22725401 attcagtgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagtcctataaatcattttgatgtcaaaccaacgg-attagaaagctaacacaattatcta 22725303  T
Q  388 caacttttgtgtttacacc 406  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  22725302 caactttcatgtttacacc 22725284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 395 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 18214966 - 18214907
Alignment:
Q  395 tgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18214966 tgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 18214907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15464977 - 15464888
Alignment:
Q  66 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 155  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15464977 aaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatca 15464888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 39706400 - 39706299
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  39706400 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 39706302  T
Q  99 tca 101  Q
    |||    
T  39706301 tca 39706299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Original strand, 12774021 - 12774132
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||    
T  12774021 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatacaa-tcaac 12774118  T
Q  104 aacgtctcaattat 117  Q
    ||| ||||||||||    
T  12774119 aacatctcaattat 12774132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288214
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  103 caac 106  Q
    ||||    
T  12288217 caac 12288214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640393
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||  |||||||  ||||| |||| ||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||    ||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  46640459 atctcaa--catcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaat 46640393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14745991 - 14745926
Alignment:
Q  292 actgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14745991 actgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagtgctataaatcgttttgacgtcagacca 14745926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 405
Target Start/End: Original strand, 14951270 - 14951367
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacac 405  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||   || ||||||||||  |||||||||    
T  14951270 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctacaactttcatgtttacac 14951367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 43281795 - 43281694
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||| |||  |||| ||||||    
T  43281795 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtaaaaccatagccattagaaagctaacatcttaacctacaattttcatgttaacacct 43281696  T
Q  408 aa 409  Q
    ||    
T  43281695 aa 43281694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082089
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| | |||| |||  ||||| |||| ||||||||| |||| |||| |||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataac 53082157  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  53082156 atctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 53082089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190616
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||  ||||| |     
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 144  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata 6190616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Original strand, 19857607 - 19857659
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatata 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19857607 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatatata 19857659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Original strand, 15551833 - 15551879
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15551833 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 15551879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 55377293 - 55377225
Alignment:
Q  310 taatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  55377293 taatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 55377225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 14053403 - 14053323
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14053403 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac--aaacagcatgacataataatatcaa 14053323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 17046506 - 17046549
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17046506 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 17046549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25120144 - 25120046
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |   |||||| ||||||  ||||||||||    
T  25120144 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 25120046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 8846370 - 8846418
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8846370 atcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaaca 8846418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15118029 - 15117961
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  15118029 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 15117961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 517 - 549
Target Start/End: Original strand, 19858327 - 19858359
Alignment:
Q  517 aaatcatcacaatcatcactcttaaccctaatt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858327 aaatcatcacaatcatcactcttaaccctaatt 19858359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18293765 - 18293695
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||| |||||||    
T  18293765 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaatctaacat 18293695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5683465 - 5683416
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  5683465 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaacca 5683416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 172
Target Start/End: Original strand, 8846465 - 8846553
Alignment:
Q  84 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  8846465 aatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 8846553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 404
Target Start/End: Original strand, 11940069 - 11940106
Alignment:
Q  367 gaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11940069 gaaagcttacatccatacctacaacttttatgtttaca 11940106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 14995644 - 14995713
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  14995644 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttagacctcaaaccaacgacattagaaagctaaca 14995713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 417
Target Start/End: Original strand, 16731688 - 16731785
Alignment:
Q  320 ataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||| |||||||||   || ||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  16731688 ataactcaagttcaaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagagagctaacataattatctaaaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 16731785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 417
Target Start/End: Original strand, 18247755 - 18247848
Alignment:
Q  324 ctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||||    || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  18247755 ctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaagtccaatt 18247848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19618075 - 19618014
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 263  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  19618075 atacatataccaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatata 19618014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19698082 - 19698033
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  19698082 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaacca 19698033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19708667 - 19708618
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  19708667 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaacca 19708618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26922445 - 26922388
Alignment:
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  26922445 atatacatataataattcatcagtcatgaacaacatcatattcatcaacatatacata 26922388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44772760 - 44772723
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataact 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44772760 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataact 44772723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 417
Target Start/End: Original strand, 47357199 - 47357292
Alignment:
Q  324 ctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||||    || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  47357199 ctcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaggccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaagtccaatt 47357292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333338
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 17333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26922489 - 26922437
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  26922489 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacata 26922437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 21840773 - 21841225
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840773 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtc 21840872  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840873 aacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 21840972  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21840973 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacc 21841071  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21841072 tacatgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtt 21841171  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21841172 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 21841225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 13988872 - 13989324
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988872 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 13988971  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13988972 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 13989071  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13989072 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 13989170  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  13989171 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 13989270  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13989271 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 13989324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21923447 - 21922995
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923447 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 21923348  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21923347 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 21923248  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21923247 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 21923149  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  21923148 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 21923049  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21923048 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 21922995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21475243 - 21474790
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475243 tcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 21475144  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21475143 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 21475044  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21475043 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 21474944  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  21474943 tacgtttagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 21474844  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21474843 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccggttttcatttcatattcgg 21474790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23593891 - 23593437
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593891 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23593792  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593791 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 23593692  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  23593691 atatacatataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgac 23593592  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  23593591 ctacgttcagtaatttaactataacgcaagttctataaattattttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatacatacctacaactttcttgt 23593492  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23593491 ttacacctaagactaattatgcaccaatcaataccagttttcatttcaaactcgg 23593437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 16361923 - 16362377
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361923 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaacagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 16362022  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362023 aacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 16362122  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  16362123 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattaacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataataaattattcactgtgac 16362222  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16362223 ctacgttcagtaatttgaccataacttaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaaccgcattagaaagctaacttccatacctacaactttcgtgt 16362322  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16362323 ttacacccaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 16362377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15860165 - 15859712
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15860165 tcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatattaaatgcaagtc 15860066  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15860065 aatcaacgtcttaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacaattatatcacaatataacaacatcagatggtaatcaacatcttaagacatcat 15859966  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15859965 atatacatataacacttcatcaaccatggacaatatcgtattcgcaag-atatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgac 15859867  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  15859866 ctacgtgcagttatttgaccataactcaagttgtataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaaactaacatccatacctacaactttcgtgc 15859767  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15859766 ttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 15859712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 29776694 - 29776972
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776694 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaagtc 29776793  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29776794 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 29776893  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29776894 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 29776972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 202 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22050792 - 22050443
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22050792 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22050693  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22050692 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacattagaccattgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 22050593  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaa 501  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050592 acacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaatttggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaa 22050493  T
Q  502 cttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22050492 cttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcgctcttaaccctaattct 22050443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 29298143 - 29298420
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29298143 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaagtc 29298241  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29298242 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 29298341  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29298342 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatatatatactaattcatcaatcata 29298420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 31612319 - 31612597
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612319 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 31612418  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  31612419 aacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatcata 31612518  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31612519 tatacatataatacttcatcaatcatggacaatattgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 31612597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22123224 - 22122945
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123224 tcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaacagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagt 22123125  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22123124 caacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatcat 22123025  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22123024 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacataaacatacatataccaattcatcaatcata 22122945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16275520 - 16275240
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16275520 tcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtc 16275421  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  16275420 aatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttgaaacatcat 16275321  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16275320 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 16275240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22122691 - 22122427
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  22122691 attcactgtgatctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctacaaatcgttttgaagtaaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 22122592  T
Q  388 caactttt-gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagca 486  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22122591 caacttttagtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagca 22122492  T
Q  487 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122491 acccatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 22122427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 295 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9044867 - 9044611
Alignment:
Q  295 gtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttt 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9044867 gtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgttagaccaacggcattagaaaactaacatacatacctacaacttt 9044768  T
Q  395 tgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatat 494  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9044767 cgtgtttacacctaagactaattctgtaccgatcaataccagtttttatttcaaatttggggcagagatgaaaagaaaaaacagaaaaagcaacctatat 9044668  T
Q  495 tattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9044667 tattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 9044611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15859672 - 15859408
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  15859672 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatagttttgaggtcagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 15859573  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatag-aaaaatcagaaaaagca 486  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15859572 caactttcgtgtatacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgggatagagatgaaaagaaaaaatcagaaaaagca 15859473  T
Q  487 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859472 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 15859408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16275209 - 16274959
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16275209 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgaattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatcgtattcaattattcactgtgacctacg 16275110  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattg-gaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttac 403  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16275109 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtgaaaccaatgacatttagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 16275010  T
Q  404 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16275009 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttccaattcgg 16274959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 29298727 - 29298990
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  29298727 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaacaacggcattagaaagctaacatccataccta 29298826  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29298827 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggtgcagagatgaaaagaaaaatcataaaaagcaa 29298926  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29298927 cccatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccataattct 29298990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16274932 - 16274666
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16274932 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatagttttgacgtcagaccaatgatattagaaagctaacatccataccta 16274833  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatag---aaaaatcagaaaaag 484  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  16274832 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaacaccagattccatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaaaaatcagaaaaag 16274733  T
Q  485 caacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274732 caacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 16274666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 215 - 453
Target Start/End: Original strand, 29298461 - 29298699
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatt 314  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  29298461 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttatgtgcagtaatt 29298560  T
Q  315 tgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagacca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29298561 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 29298660  T
Q  415 attatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29298661 attatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcg 29298699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 215 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 27161529 - 27161292
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatt 314  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27161529 ttcatcaatcattaacaatattttattcataaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatt 27161430  T
Q  315 tgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagacca 414  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27161429 tgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 27161330  T
Q  415 attatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27161329 attttgtaccaatcaatacctgttttcatttcaaattc 27161292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 288 - 526
Target Start/End: Original strand, 31613044 - 31613282
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  31613044 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggtattagaaacctaacatccataccta 31613143  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31613144 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgaacctatcaataccatatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 31613243  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31613244 cccatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 31613282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 298 - 551
Target Start/End: Original strand, 40129387 - 40129640
Alignment:
Q  298 acctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgt 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||  |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  40129387 acctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcgttttgatgccagaccaacgacattagaaatctaacattcatacctacaactttagt 40129486  T
Q  398 gtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattat 497  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40129487 gtttacacctaagatcaattctggacctatcaataccatatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcataaaaagcaacccatattat 40129586  T
Q  498 tcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40129587 tcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 40129640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 288 - 531
Target Start/End: Original strand, 16401407 - 16401651
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  | || | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16401407 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttatataaatcctttccacgttagaccaatggaaatagaaagctaacatccataccta 16401506  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatc-agaaaaagca 486  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  16401507 caacttttgtgtctacacctaagaccaattctgtaccgatcaataccagtttttatttcaaattcggagcagagatgaaaagaaaaatcgggaaaaagca 16401606  T
Q  487 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatca 531  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401607 atctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatca 16401651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 29776947 - 29777199
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29776947 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 29777046  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29777047 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaacccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgatt 29777146  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29777147 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 29777199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 22122970 - 22122718
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22122970 atacatataccaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22122871  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  22122870 acgtgcagtaatttgactataacccaagttctataaatcgttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctagcatccatacctacaactttcatgttt 22122771  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22122770 acacctaagaccaattctggacctatcaataccagttttcatttcaaattcgg 22122718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 363 - 551
Target Start/End: Original strand, 43543269 - 43543457
Alignment:
Q  363 attagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagaga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43543269 attagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagaga 43543368  T
Q  463 tgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43543369 tgaaaagaaaaatcagaaaaatcaacttatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaacccaaattct 43543457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 31612572 - 31612824
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31612572 atacatatactaattcatcaatcataaacaatatcatactgataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactttgacct 31612671  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31612672 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacatttgaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 31612771  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31612772 acacctaagaccaattcggtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 31612824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 288 - 526
Target Start/End: Original strand, 29777226 - 29777465
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  29777226 attcattgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttaacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatacataccta 29777325  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcag-aaaaagca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  29777326 caacttttgtgtttacacctaagactaattctgtaccgatcaataccagtttttatttcaaattcagggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaaagga 29777425  T
Q  487 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 526  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29777426 acctatattattccacttcacttttattcaaaatcatcac 29777465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13213018 - 13212844
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213018 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgcaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 13212919  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212918 aatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 13212844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 21346967 - 21347141
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346967 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 21347066  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347067 aatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 21347141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 261 - 454
Target Start/End: Original strand, 13227129 - 13227322
Alignment:
Q  261 atactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattg 360  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  13227129 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacg 13227228  T
Q  361 gaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    | | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13227229 gcactagaaagctaacatccatacataaaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 13227322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45574989 - 45574812
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45574989 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtc 45574890  T
Q  110 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  45574889 tcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataagaacatcaaatcataatcaacatc 45574812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 21342102 - 21342276
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342102 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 21342201  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21342202 aatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaat 21342276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 21707173 - 21707346
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21707173 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagtc 21707272  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21707273 aacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 21707346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 21711715 - 21711888
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21711715 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagtc 21711814  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21711815 aacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 21711888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 261 - 454
Target Start/End: Original strand, 29535317 - 29535510
Alignment:
Q  261 atactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattg 360  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |    
T  29535317 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacg 29535416  T
Q  361 gaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
      | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29535417 acactagaaagctaacatccatacatacaactttcgtgtttatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 29535510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 433018 - 433190
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  433018 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagt 433114  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  433115 caacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 433190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 40389160 - 40389329
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389160 tcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 40389259  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 169  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40389260 aatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 40389329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 288 - 452
Target Start/End: Original strand, 31612851 - 31613015
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||    
T  31612851 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagcttaaatccataccta 31612950  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31612951 taactttagtgtttacacctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcagttcaaattc 31613015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 402 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 43630344 - 43630215
Alignment:
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaa 501  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43630344 acacctgagaccaattctgtaccaatcaataccatatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaa 43630245  T
Q  502 cttcactttcattcaaaatcatcacaatca 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43630244 cttcactttcattcaaaatcatcacaatca 43630215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 50210325 - 50210168
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50210325 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 50210226  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  50210225 caacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 50210168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 34509789 - 34509946
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34509789 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaagt 34509888  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| |||||| ||   |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34509889 caacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 34509946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27250834 - 27250684
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  27250834 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 27250735  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  27250734 atcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 27250684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22050866 - 22050767
Alignment:
Q  180 tcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22050866 tcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 22050768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 22532278 - 22532435
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  22532278 tcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaatt 22532377  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22532378 caacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 22532435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 288 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 27161263 - 27161118
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  27161263 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataattcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacagtattagaaagctaacatccataccta 27161164  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatac 433  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  27161163 caactttcctgtttacacctaagaccaattctggacctatcaatac 27161118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896193
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 21896193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 478 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41231106 - 41231033
Alignment:
Q  478 gaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41231106 gaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 41231033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatca 171  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22468808 - 22468651
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  22468808 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaattgcaatt 22468709  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| |||||||||   |||  |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22468708 caacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcaca 22468651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 21026696 - 21026846
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  21026696 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaac 21026795  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21026796 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21026846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27161605 - 27161518
Alignment:
Q  191 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27161605 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatatatatactaattcatcaatcat 27161518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261018
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||   |    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca---t 35261085  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
    |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaat 35261018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20847259 - 20847173
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  20847259 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758822
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  103 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    |||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16758763 caacatcacaac-attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 16758822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10812682 - 10812613
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10812682 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttttataaatcattttgaagtcaaacca 10812613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 20135196 - 20135351
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| || | ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |    
T  20135196 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcatgtgcaatt 20135295  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataa-ttcaagtaatgcatatataattatatca 155  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20135296 caacaacatcttaagtattca-ataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatca 20135351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 20454665 - 20454613
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454665 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 20454613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 33681022 - 33681188
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||  ||    
T  33681022 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtca 33681120  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  33681121 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 500 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22122311 - 22122260
Alignment:
Q  500 aacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122311 aacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 22122260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754170
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaac 21754156  T
Q  104 aacgtctcaattat 117  Q
    ||| ||||||||||    
T  21754157 aacatctcaattat 21754170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049973
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| || ||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
    ||||||    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  41050038 tctcaaca--tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaat 41049973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14295652 - 14295493
Alignment:
Q  12 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||   |    
T  14295652 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---c 14295557  T
Q  110 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    ||||||| ||| |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14295556 tcaatta-tcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 14295493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 43543214 - 43543267
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataa 211  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543214 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataa 43543267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 22237642 - 22237788
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22237642 tcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22237740  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  22237741 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 22237788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918782
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  106 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 172  Q
       |||||||| ||| |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  20918719 ---ctcaatta-tcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaa 20918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22921976 - 22921868
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  22921976 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 22921878  T
Q  104 aacgtctcaa 113  Q
    ||| ||||||    
T  22921877 aacatctcaa 22921868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10812827 - 10812709
Alignment:
Q  336 aaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatacca 435  Q
    |||||||||  |||||||||||  || | | |||||||||||    || |||| |||||  ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  10812827 aaatcatttctaagtcaaaccaaaggcactggaaagctaacacaattatctacgactttcatgtttacacctaagatcaattcagtaccgatcaatacca 10812728  T
Q  436 gtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  10812727 gttttaatttcaaattcgg 10812709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52928038
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 52928038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 21714551 - 21714600
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21714551 tcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 21714600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354527
Alignment:
Q  68 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 22354527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Original strand, 29298408 - 29298473
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29298408 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcata 29298473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 106
Target Start/End: Original strand, 20248293 - 20248394
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  20248293 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 20248391  T
Q  104 aac 106  Q
    |||    
T  20248392 aac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 170
Target Start/End: Original strand, 50686695 - 50686792
Alignment:
Q  73 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatc 170  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  50686695 catgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 50686792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 12271642 - 12271725
Alignment:
Q  79 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| | |||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  12271642 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tatttacgtataactaaagtaatatatatacaattatatcacattataa 12271725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 13989351 - 13989419
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  13989351 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 13989419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368224
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||| ||||  |  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
    ||||||    ||   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  16368289 tctcaaca--tcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 16368224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Original strand, 21858592 - 21858662
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |   |||||||||||||||    
T  21858592 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccgttagaaagctaacat 21858662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44035928 - 44035830
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |   |||||| ||||||  ||||||||||    
T  44035928 agtaatttgatcataactcaagttataaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttgatgtttacacc 44035830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 279
Target Start/End: Original strand, 12710130 - 12710211
Alignment:
Q  198 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    |||||| ||||||| | | || ||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12710130 atatattcatataataatccagcaatcgtgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 12710211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 38801483 - 38801447
Alignment:
Q  18 cgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38801483 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 38801447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 147)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 12567566 - 12568018
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567566 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtc 12567665  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12567666 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcata 12567765  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12567766 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacc 12567864  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12567865 tacatgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtt 12567964  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12567965 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcgg 12568018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 17463184 - 17463636
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463184 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 17463283  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17463284 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 17463383  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17463384 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 17463482  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  17463483 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 17463582  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17463583 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 17463636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 13544031 - 13544482
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544031 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtc 13544130  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13544131 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcata 13544230  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13544231 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacc 13544329  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13544330 tacgtgcagt-atttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtt 13544428  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13544429 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcgg 13544482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 34159332 - 34159784
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159332 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 34159431  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34159432 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 34159531  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34159532 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 34159630  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  34159631 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 34159730  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34159731 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 34159784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 45607063 - 45606610
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607063 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 45606964  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45606963 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 45606864  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45606863 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 45606764  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    ||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  45606763 tacattcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 45606664  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45606663 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 45606610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7781503 - 7781050
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7781503 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatc 7781404  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7781403 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 7781304  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||    
T  7781303 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcgatcataatcaattattcactgtgacc 7781204  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  7781203 tatgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacgtttatacctacaacttttgtgtt 7781104  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7781103 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 7781050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 55476497 - 55476949
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476497 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 55476596  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  55476597 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 55476696  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55476697 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 55476795  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  55476796 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 55476895  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  55476896 tacacctaagaccaattctgtaccagtcaataccagttttaatttcaaattcgg 55476949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16454437 - 16453984
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454437 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 16454338  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16454337 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 16454238  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16454237 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 16454139  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaat-cattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16454138 tacgtgcagtaatttgactataactatagttctataaatccattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgt 16454039  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16454038 ttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 16453984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6469290 - 6468838
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469290 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 6469191  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6469190 aacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 6469091  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6469090 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 6468992  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  6468991 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctccaactttcgtgtt 6468892  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6468891 tacagctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 6468838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13154412 - 13153959
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154412 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 13154313  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13154312 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 13154213  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  13154212 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttac 13154114  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  13154113 ctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctaaaactttcgtgt 13154014  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13154013 ttacacctatgaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 13153959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10247879 - 10247427
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247879 tcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 10247780  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10247779 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 10247680  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  10247679 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacc 10247581  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10247580 tacgtgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 10247481  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10247480 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 10247427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 28848767 - 28848325
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848767 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 28848668  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28848667 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 28848568  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||           |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28848567 tatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcaca-----------acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 28848479  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  28848478 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 28848379  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28848378 tacacctaagaccaattcagtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 28848325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13151947 - 13151494
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151947 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 13151848  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13151847 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 13151748  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  13151747 atatacatatcacacttcatcaggcatggacaatatcgtattcac-aacatataccttcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttac 13151649  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  13151648 ctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctaaaactttcgtgt 13151549  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13151548 ttacacctatgaccaattctgttccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 13151494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 8499524 - 8499979
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499524 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 8499623  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8499624 aatcaatgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatca 8499723  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  8499724 tatatacatataaaacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtga 8499823  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  8499824 cctatgttccgtaatttcaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacttccatatctacaactttcgtg 8499923  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8499924 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 8499979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 15412435 - 15412884
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412435 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 15412534  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15412535 aatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacttca 15412634  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||    
T  15412635 tatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcgatcataatcaattatacactgtga 15412734  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15412735 cctacgttcagtaatttgaccataaatcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 15412834  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaa 448  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15412835 tttatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaa 15412884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 53301663 - 53301207
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  53301663 tcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaag 53301565  T
Q  99 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacat 196  Q
    |||  |||  |||||| |||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53301564 tcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacataaaatggtaatcaacatcttaaaacat 53301465  T
Q  197 catatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  53301464 catatatacatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgt 53301365  T
Q  297 gacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttg 396  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  53301364 gacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaatatccatacctacaactttcg 53301265  T
Q  397 tgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301264 tgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 53301207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 27165256 - 27165711
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| || ||||| |||  |||||||||||||||    
T  27165256 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaatgcaag 27165354  T
Q  99 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc 197  Q
    ||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165355 tcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc 27165454  T
Q  198 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  27165455 atatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtg 27165554  T
Q  298 acctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgt 397  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27165555 acctacgttcagtaatttgatcataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaagatccatacctacaactttcgt 27165654  T
Q  398 gtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27165655 gtttacccctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaaatcgg 27165711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9707763 - 9707484
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9707763 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagtc 9707664  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9707663 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 9707564  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9707563 tatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 9707484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 8899100 - 8899378
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899100 tcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 8899199  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8899200 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcata 8899299  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8899300 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 8899378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16282967 - 16282689
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16282967 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaagtc 16282868  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16282867 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 16282768  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16282767 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 16282689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 205 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12119606 - 12119313
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12119606 catataatacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 12119507  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12119506 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 12119407  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattatt 498  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119406 cctaagaccaattctgtactgatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattatt 12119313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38962045 - 38961769
Alignment:
Q  3 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962045 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 38961946  T
Q  103 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961945 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatata 38961846  T
Q  203 tacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38961845 tacatataatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 38961769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 41123896 - 41124171
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123896 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca---acacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 41123992  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41123993 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 41124092  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41124093 tatacatataacacttcaccaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 41124171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 229 - 549
Target Start/End: Original strand, 24513910 - 24514230
Alignment:
Q  229 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaa 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24513910 acaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccataactcaa 24514009  T
Q  329 gttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatc 428  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | | |||    
T  24514010 gttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctggagctatc 24514109  T
Q  429 aataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaa 528  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514110 aataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacttatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaa 24514209  T
Q  529 tcatcactcttaaccctaatt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  24514210 tcatcactcttaatcctaatt 24514230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Original strand, 54520985 - 54521279
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54520985 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 54521084  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54521085 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacca 54521184  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54521185 acggcattagaaagctaacatccatacccacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 54521279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 46822274 - 46822720
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || || |||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| ||||| |    
T  46822274 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaatt 46822373  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatata-attatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    ||||||| ||| || ||||||   |||  |||||||||||| ||| | | | |||||||   ||      ||||    | ||||||||||||||||||||    
T  46822374 caacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataaacaatgtatcacatcttat-----tcaa----tcatcaacatcttaaaacatca 46822464  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  46822465 tacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtga 46822564  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46822565 cctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 46822664  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  46822665 tttacacctaagaccaattgtttaccaatcaataccacttttcatttcaaaatcgg 46822720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 158 - 454
Target Start/End: Original strand, 15977696 - 15977991
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  15977696 atataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatatatacatataacactttatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatt 15977794  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15977795 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaacca 15977894  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
      || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15977895 acggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 15977991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 291 - 551
Target Start/End: Original strand, 8500009 - 8500269
Alignment:
Q  291 cactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaa 390  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8500009 cactgtgacctacgtgcagtaacttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatctatacctacaa 8500108  T
Q  391 cttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacct 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8500109 cttttgtgtttacacctaagaccaattctatatcgatcaataccagtttttatttcaaattcggggaagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacct 8500208  T
Q  491 atattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8500209 atattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 8500269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 27165738 - 27166001
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  27165738 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatacataccta 27165837  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27165838 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccgatcaatactagtttttatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaattagaaaaagcaa 27165937  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165938 tctatactattcaacttcacttttattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 27166001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 46822747 - 46823010
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  46822747 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgacgataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 46822846  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46822847 caacttccgtgtttacacctaagaccaattatgtagcaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcacagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 46822946  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822947 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 46823010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 178 - 454
Target Start/End: Original strand, 10557091 - 10557367
Alignment:
Q  178 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatc 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10557091 aatcaacatctcaaaacatcatatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgaattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatc 10557190  T
Q  278 atattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  || |||||||||||||||    
T  10557191 atattcaattattcacagtgacctatgtgcagtaatctgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtaaaactaacggcattagaaagctaaca 10557290  T
Q  378 tccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10557291 tccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatttaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 10557367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 288 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 53301180 - 53300919
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  53301180 attcactgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatacataccta 53301081  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53301080 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccgatcaatacttgtttttatttcaaattcggggcaaagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 53300981  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaatt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53300980 cctatattattcaacttcacttttattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaatt 53300919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 160 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 29544839 - 29544547
Alignment:
Q  160 ataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacataca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||| |||||    
T  29544839 ataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcattttaacaaatatatagataca 29544740  T
Q  260 tatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccatt 359  Q
    |||| |||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||      
T  29544739 tatattaattcatcaatcataaacaattcttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaaatcaaaccaac 29544640  T
Q  360 ggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29544639 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataacagttttcatttcaaattc 29544547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 41124425 - 41124688
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  41124425 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 41124524  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||    
T  41124525 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctttaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagataaaaagaaaaataaaaaaaaacaa 41124624  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124625 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 41124688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 285 - 551
Target Start/End: Original strand, 10379617 - 10379888
Alignment:
Q  285 attattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatac 384  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  10379617 attattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatac 10379716  T
Q  385 ctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcag-----a 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     |    
T  10379717 ctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagtttttatttcatattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaagaaa 10379816  T
Q  480 aaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379817 aaaaaaaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 10379888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20629868 - 20629605
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  20629868 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgctttaatgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 20629769  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20629768 taacttttgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 20629669  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20629668 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcataaccctaattct 20629605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38961514 - 38961251
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  38961514 attcactgtgacctacgtgcagcaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 38961415  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38961414 caactttcgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccatatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 38961315  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961314 catatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 38961251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 55318980 - 55318717
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  55318980 attcactgcgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgatgtcataccaacggcattagaaagctaccatccataccta 55318881  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  55318880 caactttcgtgtttacacctaagaccagttctggacctatcaataccagatttcatttcaaatttggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaaataa 55318781  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55318780 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 55318717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 216 - 454
Target Start/End: Original strand, 13436520 - 13436758
Alignment:
Q  216 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaattt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13436520 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatatatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaattg 13436619  T
Q  316 gactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaa 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  13436620 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtatttatacctaagaccaa 13436719  T
Q  416 ttatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  13436720 ttatgtaccaatcaatacaagttttcatttcaaactcgg 13436758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17446810 - 17446614
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446810 tcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 17446712  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17446711 aacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 17446614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 50242830 - 50243014
Alignment:
Q  3 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50242830 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaa 50242929  T
Q  103 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50242930 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 50243014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 288 - 526
Target Start/End: Original strand, 10557394 - 10557633
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  10557394 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtccgaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 10557493  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatag-aaaaatcagaaaaagca 486  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  10557494 caacttttgtgtttacaactaagaccaattctgtaccaatcaataccatatttcgtttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaaataagaaaaagca 10557593  T
Q  487 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557594 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 10557633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16282434 - 16282171
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || |     |||| |||| ||||||| |||||||    
T  16282434 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagactaacaacattaaaaagataacatctataccta 16282335  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16282334 caactttcgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcattttaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 16282235  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282234 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 16282171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13937649 - 13937387
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  13937649 attcaccgtggcctacgtgcagtaatttgaccataacacaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 13937550  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13937549 caactttcgtgtttacacctaagaccaattcttgtcctatcaataccagatttcatttcaaattcagggcaaagatgaaaagaaaaatcag-aaaagcaa 13937451  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937450 cctatattattcaacttcactttcatccaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 13937387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29172739 - 29172565
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172739 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 29172640  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29172639 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaaat 29172565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 38961794 - 38961541
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38961794 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 38961695  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattgg-aattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38961694 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggccattagaaggctaacattcatacctacaactttcgtgtt 38961595  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38961594 tacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 38961541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 41124146 - 41124398
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41124146 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactagttcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 41124245  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41124246 acgtgcaataatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaatcaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 41124345  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41124346 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcacattcgg 41124398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16282714 - 16282461
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaa-caatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    |||||||||  | |||||||||||| || ||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16282714 atacatatactaattcatcaatcataaaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacc 16282615  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16282614 tacgtgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatggcattagaaatctaacattcatacctacaactttcgtgtt 16282515  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16282514 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcgg 16282461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 17672632 - 17672805
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17672632 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatc 17672731  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17672732 aacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaat 17672805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 288 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 17444440 - 17444175
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| || | ||||  |  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  17444440 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttgtataaattgttttgacgttagaccaacgacattagaaagataacatccatactta 17444341  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaat-cagaaaaagca 486  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||    
T  17444340 caactttcctgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaataaaaaaaaagca 17444241  T
Q  487 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattctt 552  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444240 acccatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattctt 17444175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17444719 - 17444467
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17444719 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacct 17444620  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17444619 acgtgcaaaaatttgactataactcaagttcaataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 17444520  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17444519 acacttaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 17444467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 357
Target Start/End: Original strand, 12305315 - 12305507
Alignment:
Q  165 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatac 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12305315 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacatatat 12305414  T
Q  265 taattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12305415 taattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacca 12305507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 215 - 454
Target Start/End: Original strand, 25237063 - 25237302
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatt 314  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25237063 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatt 25237162  T
Q  315 tgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagacca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    || |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25237163 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagttaaacacacggcattagaaacctaacattcataccaacaactttcgtgtttacacctaagacca 25237262  T
Q  415 attatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25237263 attctgtatcaatcaataccaattttcatttcaaattcgg 25237302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 215 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20630138 - 20629895
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattc----gtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagt 310  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| || |||  | |||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20630138 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcagataacacttcatcaatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagt 20630039  T
Q  311 aatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaag 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630038 aatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaag 20629939  T
Q  411 accaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20629938 accaattctgtaccaatcaatacaagttttcatttcaaattcgg 20629895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070636
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 53070700  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53070699 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatctaacaacatcaaat 53070636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12119881 - 12119707
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119881 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 12119782  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119781 aatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 12119707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 215 - 454
Target Start/End: Original strand, 25229476 - 25229715
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatt 314  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  25229476 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttatgtgtagtaatt 25229575  T
Q  315 tgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagacca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    || |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25229576 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagttaaacacacggcattagaaacctaacattcataccaacaactttcgtgtttacacctaagacca 25229675  T
Q  415 attatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25229676 attctgtatcaatcaataccaattttcatttcaaattcgg 25229715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43550625 - 43550448
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550625 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 43550526  T
Q  110 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43550525 tcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 43550448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Original strand, 15465448 - 15465613
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15465448 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacattcatacctac 15465547  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15465548 aactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccaattttcatttcaaattcgg 15465613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Original strand, 5223677 - 5223842
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  5223677 ttcactgtgacctacgtggagtaatttgatcataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacatccatacctat 5223776  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5223777 aactttcgtgtttacacctaagacgaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 5223842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 15977521 - 15977646
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977521 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 15977620  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatata 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15977621 aacaacgtctcaattattcacatata 15977646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26055133 - 26054968
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26055133 ttcactgtgacctacgtgcagtaattttaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaaaggcattagaaagctaacatccatacctac 26055034  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  26055033 aactttcatgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccaattttcctttcaaattcgg 26054968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 288 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 55319173 - 55319010
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  55319173 attcactgtgacttacgtgcagtaatttgaccataattcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 55319074  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  55319073 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccaattttcatttcaaatt 55319010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 14972863 - 14973020
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14972863 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 14972962  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14972963 caacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 14973020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40213832 - 40213676
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213832 tcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacagcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtc 40213733  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||| |||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40213732 aacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcaca 40213676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Original strand, 8899418 - 8899556
Alignment:
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8899418 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaattagaaaaagcaa 8899517  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899518 cccatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 8899556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 55500948 - 55501053
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55500948 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 55501047  T
Q  101 aacaac 106  Q
    ||||||    
T  55501048 aacaac 55501053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 36166604 - 36166739
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166604 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 36166702  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    |||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  36166703 aacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386593
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaa 173  Q
    ||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaa 42386593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 17487865 - 17488022
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17487865 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 17487964  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17487965 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17488022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 17499347 - 17499504
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17499347 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 17499446  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17499447 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17499504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25476497 - 25476340
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476497 tcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 25476398  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  25476397 caacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcaca 25476340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 43840941 - 43841114
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43840941 tcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 43841040  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 172  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  43841041 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 43841114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Original strand, 21618459 - 21618590
Alignment:
Q  5 aatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618459 aatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    || |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  21618558 acatctcaaatatacattcataattcaagtaat 21618590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 26686902 - 26687069
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26686902 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 26687001  T
Q  106 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 172  Q
    | ||| || |||||   |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26687002 catcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 26687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 409
Target Start/End: Original strand, 36528447 - 36528569
Alignment:
Q  287 tattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacct 386  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36528447 tattcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataattcatttagacgtcaaaccaatggcattagaaagctaacatccatacct 36528546  T
Q  387 acaacttttgtgtttacacctaa 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  36528547 acaactttcgtgtttacacctaa 36528569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 13442283 - 13442440
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13442283 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaatt 13442382  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  13442383 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 13442440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14567561 - 14567432
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||  |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14567561 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgatgttagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 14567462  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14567461 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 14567432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 18438543 - 18438700
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18438543 tcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagt 18438642  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||   |||| ||   |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18438643 caacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcaca 18438700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23083473 - 23083316
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23083473 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaagt 23083374  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  | || ||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  23083373 caacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcaca 23083316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576788
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 14576841  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14576840 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 14576788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Original strand, 12399225 - 12399360
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12399225 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaac 12399324  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
     ||| || |||||| |||    ||||||||||||||    
T  12399325 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcata 12399360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 466
Target Start/End: Original strand, 17393201 - 17393380
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  17393201 attcactatgacctatgtgtagtaatttgactataactaatgttctaaaaatcattttggagtcaaaccaacgccattggaaaggtaacatccataccta 17393300  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc-ggggcagagatgaa 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||  || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  17393301 caacttttgtgtttacatctaagaccaattctgtaccgatcaatagaagagttcatttgaaattcgggggcagagatgaa 17393380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20698547 - 20698405
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  20698547 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaattgcaatt 20698448  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
    || |||| ||| |  |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  20698447 catcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata 20698405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 10556991 - 10557088
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10556991 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacatcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaatgcaag 10557088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24153320 - 24153164
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153320 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24153222  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  || ||||||||    
T  24153221 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcaca 24153164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 44494815 - 44494908
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 94  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494815 tcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatg 44494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24340826 - 24340660
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  24340826 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 24340728  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24340727 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 24340660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11914051 - 11913928
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||    
T  11914051 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatgtaca 11913953  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  11913952 tacatatactaattcatcaatcata 11913928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 423 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 45220421 - 45220313
Alignment:
Q  423 ccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatca 522  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45220421 ccaatcaataccatatttcatttcaaattctgggcagagatgaaaagaaaaataagaaaaagcaacctatattatttaacttcactttcattcaaaatca 45220322  T
Q  523 tcacaatca 531  Q
    ||| |||||    
T  45220321 tcataatca 45220313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 138
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572735
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 138  Q
    || ||| || ||||||  |||| ||||| |||||    
T  14572702 acatcttaaatattcaattatacttcaaataatg 14572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 17737242 - 17737337
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagta---tacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17737242 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatactacaacaacagcatgacataataatatcaaat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11424871 - 11424718
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |    
T  11424871 tcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatcaatagcaaat 11424773  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||   |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11424772 caaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 11424718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523666
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
     ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 52523666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274871
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaat 23274871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17444773 - 17444694
Alignment:
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17444773 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 17444694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 287 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3264431 - 3264324
Alignment:
Q  287 tattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacct 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||  ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  3264431 tattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataattcatttagacgtcaaatcaacggccttagaaatctaacatccatacct 3264332  T
Q  387 acaacttt 394  Q
    ||||||||    
T  3264331 acaacttt 3264324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 364 - 454
Target Start/End: Original strand, 15007868 - 15007961
Alignment:
Q  364 ttagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccag---tttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  15007868 ttagaaagctaacatccatacctataactttcgtgtttacacctaaaaccaattttgtaccaatcaataccagtacttttcatttcaaattcgg 15007961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 367 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16358458 - 16358371
Alignment:
Q  367 gaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16358458 gaaagctaacatctatatctaaaactttcatgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 16358371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 37642368 - 37642202
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||| ||||||     
T  37642368 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 37642270  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37642269 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 37642202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 288 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16358344 - 16358238
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  16358344 attcaatgtgacctatgcgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccgtttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 16358245  T
Q  388 caacttt 394  Q
    |||||||    
T  16358244 caacttt 16358238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 373 - 455
Target Start/End: Original strand, 36528340 - 36528422
Alignment:
Q  373 taacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggg 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36528340 taacatccatacctacaactttcgtgtttacatctaagaccaattctgtacttatcaataccagttttcatttcaaattcggg 36528422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
Q  73 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatca 171  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
Q  172 a 172  Q
    |    
T  2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17248287 - 17248224
Alignment:
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248287 caattattcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 17248224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 15470939 - 15471085
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  15470939 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 15471037  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    || ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  15471038 acatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 15471085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 16097342 - 16097509
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||| | |||| |||||| ||||||||||| |    
T  16097342 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatc 16097440  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16097441 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 16103794 - 16103960
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  16103794 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 16103891  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    ||| |||||| || ||| | ||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16103892 aacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22147571 - 22147474
Alignment:
Q  66 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  | | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22147571 aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 22147474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307802
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 32307788  T
Q  104 aacgtctcaattat 117  Q
    ||| ||||||||||    
T  32307789 aacatctcaattat 32307802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 280
Target Start/End: Original strand, 25237009 - 25237075
Alignment:
Q  213 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25237009 acttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcata 25237075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 45577994 - 45577947
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577994 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251105
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||    ||| | |||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  37251171 atctcaa--catcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 37251105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 28194699 - 28194752
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194699 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 28194752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13210432 - 13210333
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13210432 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa 13210334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Original strand, 15007988 - 15008052
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15007988 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtca 15008052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 14234496 - 14234602
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  14234496 tcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 14234594  T
Q  99 tcaacaac 106  Q
    ||| ||||    
T  14234595 tcatcaac 14234602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 433
Target Start/End: Original strand, 10555766 - 10555812
Alignment:
Q  387 acaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatac 433  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555766 acaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatac 10555812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12174366 - 12174265
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||  ||||    
T  12174366 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaaacaac 12174268  T
Q  104 aac 106  Q
    |||    
T  12174267 aac 12174265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 398 - 452
Target Start/End: Original strand, 12305525 - 12305579
Alignment:
Q  398 gtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12305525 gtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattc 12305579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926123
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| | |||| ||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 155  Q
     ||||||  | ||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  43926076 atctcaaaca-tcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatca 43926123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 12511066 - 12511172
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| ||||| |    
T  12511066 tcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaatt 12511165  T
Q  100 caacaac 106  Q
    |||||||    
T  12511166 caacaac 12511172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30029968
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || || |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||    
T  30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattc-acaa 30029953  T
Q  106 cgtctcaattattca 120  Q
    ||||| || ||||||    
T  30029954 cgtcttaaatattca 30029968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 49668183 - 49668091
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  49668183 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 49668091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3264538 - 3264459
Alignment:
Q  373 taacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| | |||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  3264538 taacatccatacctacaactttcgtgaagacacctaagatcaattctatacttatcaataccaattttcatttcaaattc 3264459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14567645 - 14567587
Alignment:
Q  397 tgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggg 455  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14567645 tgtttacaccaaaggccaattctgtacctaccaataccagttttcatttcaaattcggg 14567587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Original strand, 25201323 - 25201397
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  25201323 catataataattcattaatcatgaacaatatcatattcatcaatatatacattcatataataattcatcaatcat 25201397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51158753 - 51158683
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  51158753 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 51158683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Original strand, 9512934 - 9513026
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  9512934 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Original strand, 9520909 - 9521001
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  9520909 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13937709 - 13937676
Alignment:
Q  421 taccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937709 taccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 13937676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16934920 - 16934851
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||||    
T  16934920 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaaca 16934851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 377
Target Start/End: Original strand, 25058286 - 25058367
Alignment:
Q  296 tgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  25058286 tgacctatgtgtagtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 25058367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919390
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 13919390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 17463663 - 17463731
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  17463663 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 17463731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 34159811 - 34159879
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  34159811 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 34159879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Original strand, 55476976 - 55477015
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  55476976 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 55477015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11913897 - 11913867
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913897 catataacacttcatcaatcatgaacaatat 11913867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15025992 - 15025934
Alignment:
Q  221 aatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  15025992 aatcatgaacaatatcatattcatcatcatatacattcatataataattcatcaatcat 15025934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Original strand, 14263640 - 14263689
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  14263640 agtaatttgaccataactcaagttctagaaatcataatggagtcaaacca 14263689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14528722 - 14528625
Alignment:
Q  320 ataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||   || ||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  14528722 ataactaaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaatccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 14528625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Original strand, 15977663 - 15977700
Alignment:
Q  167 catcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 204  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977663 catcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatata 15977700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Original strand, 17044330 - 17044395
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||   || |||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  17044330 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcgtcaatatatacattcatataataattcatcaatcata 17044395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 49231768 - 49231837
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  49231768 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 49231837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 856145 - 856197
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  856145 tcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaaca 856197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 14665406 - 14665458
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14665406 tcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaaca 14665458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23077589 - 23077537
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||| |||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23077589 tcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaaca 23077537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 376
Target Start/End: Original strand, 30152450 - 30152518
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaac 376  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||    
T  30152450 agtaatttgatcataactcaaattctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaac 30152518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 94417 - 94869
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94417 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 94516  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  94517 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 94616  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  94617 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 94715  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  94716 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtt 94815  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  94816 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 94869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17596 - 17143
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17596 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 17497  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17496 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 17397  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  17396 tatacatatgacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaagcatatacatacatatactaattcatcgatcatattcaactattcactgtgacc 17297  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  17296 tacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacaaaaatacctacaactttcgtgtt 17197  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17196 tacacctaagaccaattctataccaatcaatacaagttttcatttcaaattcgg 17143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17116 - 16853
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  17116 attcactatgacctacgtgcattaatttgatcataactcaagttctataaacctttttgatatcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 17017  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||  | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17016 caactttcgtgttatcccctaacacaaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatttggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 16917  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16916 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 16853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 44460 - 44614
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44460 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 44559  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatc 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44560 caacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 100388 - 100534
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  100388 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaac 100486  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||||| |||| ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  100487 aacatctcaaatattaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 100534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40281 - 40135
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||  | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  40281 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 40183  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  40182 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 40135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Original strand, 119891 - 119937
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  119891 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 119937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 94896 - 94964
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  94896 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 94964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Original strand, 101513 - 101552
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  101513 atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaa 101552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 136)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 16213690 - 16214143
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16213690 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatccaagtc 16213789  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16213790 aacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataacaacatcaaatggtaatcaacatatgaaaacatcata 16213889  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16213890 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcttattcaattattcactgtgacc 16213989  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213990 tacgtgcagtcatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 16214089  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16214090 tacacgtaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 16214143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15376869 - 15376417
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376869 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 15376770  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15376769 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 15376670  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15376669 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 15376571  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  15376570 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 15376471  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15376470 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 15376417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20385279 - 20384827
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385279 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20385180  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20385179 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 20385080  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20385079 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 20384981  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  20384980 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 20384881  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20384880 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 20384827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 32125497 - 32125949
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125497 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 32125596  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32125597 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 32125696  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32125697 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 32125795  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  32125796 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggtattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 32125895  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32125896 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 32125949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 41522923 - 41523376
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522923 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 41523022  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41523023 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 41523122  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41523123 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 41523222  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  41523223 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaacttttatgtt 41523322  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41523323 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 41523376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 41525385 - 41525838
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525385 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 41525484  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41525485 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 41525584  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41525585 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 41525684  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  41525685 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaacttttatgtt 41525784  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41525785 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 41525838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 456327 - 456780
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456327 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 456426  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  456427 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 456526  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  456527 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 456626  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  456627 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 456726  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  456727 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccggttttcatttcaaattcgg 456780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14949278 - 14948826
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949278 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 14949179  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14949178 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 14949079  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14949078 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 14948980  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  14948979 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 14948880  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14948879 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14948826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 16232526 - 16232979
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232526 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 16232625  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16232626 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 16232725  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16232726 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 16232825  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  16232826 tacgttcagtaatttgacaataactcaaattctataaatccttttgaattcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 16232925  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16232926 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 16232979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 27216866 - 27217319
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216866 tcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 27216965  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27216966 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 27217065  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27217066 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 27217165  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  27217166 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 27217265  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27217266 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 27217319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 21189751 - 21189302
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189751 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 21189652  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21189651 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 21189552  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21189551 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaac-tatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 21189453  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  21189452 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattaaaaagctaacattcatacctacaactttcttgtt 21189353  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21189352 tacacctaagaccaactctgtaccaataaataccagttttcatttcaaatt 21189302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 16410065 - 16410517
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410065 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 16410164  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16410165 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcatagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 16410264  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16410265 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattgatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 16410363  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  16410364 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 16410463  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16410464 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 16410517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 18640278 - 18640730
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640278 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18640377  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18640378 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacataaaataataatcaacatcttaaaacatcata 18640477  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18640478 tatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacattcatatagtaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 18640576  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  18640577 tacgtgcagtaatttgactataaatcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattataaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 18640676  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18640677 tacacctaagaccaattctgtgccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 18640730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 24702244 - 24702687
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702244 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 24702343  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24702344 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 24702443  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24702444 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa----------acatatactaattcatgaatcatattcaattattcactgtgacc 24702533  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  24702534 tacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaaccttcgtgtt 24702633  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24702634 tacacctaagaccaattctgtaccaaccaataccagttttcatttcaaattcgg 24702687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 18430718 - 18431170
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430718 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18430817  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18430818 aacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 18430917  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||  |    
T  18430918 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcagattcaattattcactatgttc 18431016  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  18431017 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaacctaagattcatacctacaactttcgtgtt 18431116  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18431117 tacacctaagaccagttctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 18431170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11393443 - 11393041
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393443 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 11393344  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11393343 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 11393244  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  11393243 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgacc 11393144  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  11393143 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 11393044  T
Q  401 tac 403  Q
    |||    
T  11393043 tac 11393041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 13869352 - 13869801
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869352 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 13869451  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||  || | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13869452 aatcaacgtctcaattattcaaagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatca 13869551  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  13869552 tatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtga 13869651  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13869652 cctacgttcagtaatttaaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 13869751  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaa 448  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13869752 tttatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaa 13869801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 24704694 - 24705134
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  24704694 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaa---gacataataatatcaaatgcaagtc 24704790  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24704791 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 24704890  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24704891 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa----------acatatactaattcatgaatcatattcaattattcactgtgacc 24704980  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  24704981 tacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaaccttcgtgtt 24705080  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24705081 tacacctaagaccaattctgtaccaaccaataccagttttcatttcaaattcgg 24705134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26356150 - 26355685
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagca-----------gtatacaaaaacagcatgacataataatatc 89  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||           ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26356150 tcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataataatatc 26356051  T
Q  90 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  26356050 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatctt 26355951  T
Q  190 aaaacatcatatata--catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctatt 287  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  26355950 aaaacatcatatatatacatataacacttcatcaattatggacaatatcgtatttacaa-catatacattcatatactaattaatcaatcatattcaatt 26355852  T
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26355851 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcataccta 26355752  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355751 caactttcgtgttaacacataagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 26355685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26358602 - 26358137
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagca-----------gtatacaaaaacagcatgacataataatatc 89  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||           ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26358602 tcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataataatatc 26358503  T
Q  90 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  26358502 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatctt 26358403  T
Q  190 aaaacatcatatata--catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctatt 287  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  26358402 aaaacatcatatatatacatataacacttcatcaattatggacaatatcgtatttacaa-catatacattcatatactaattaatcaatcatattcaatt 26358304  T
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26358303 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcataccta 26358204  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358203 caactttcgtgttaacacataagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 26358137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 205 - 551
Target Start/End: Original strand, 8468945 - 8469291
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  8468945 catataacatttcatcaatcatgaacaatatcgtattcaaaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctaca 8469044  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8469045 tgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgtcattagaaaactaacatctatacctacaactttcgtgtttaca 8469144  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaactt 504  Q
     |||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8469145 gctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacttatattattcaactt 8469244  T
Q  505 cactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469245 cactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 8469291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 11972502 - 11972780
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972502 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 11972601  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  11972602 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatcata 11972701  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11972702 tatacatgtaacacttcatcaatcatgggcaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 11972780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 202 - 551
Target Start/End: Original strand, 11972755 - 11973104
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972755 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatgcattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 11972854  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  11972855 acgtacagtaatttgactataactcaagttctatagatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgttt 11972954  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaa 501  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972955 acacctaagacaaattctggacctatcaataccagatttcattttaagttcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaa 11973054  T
Q  502 cttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11973055 cttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 11973104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 157 - 452
Target Start/End: Original strand, 11303409 - 11303704
Alignment:
Q  157 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11303409 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 11303508  T
Q  257 acatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11303509 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaacc 11303608  T
Q  357 attggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11303609 aacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacatctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 11303704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16108688 - 16108394
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16108688 atataacaacatcaaacggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatattgtattcacaaatatatacata 16108589  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||| |||||||||  | ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108588 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacgtacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 16108489  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
       | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16108488 acagcattagaaaactaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 16108394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14269440 - 14269177
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269440 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatcgttttgacatcaaaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 14269341  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14269340 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcagggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcac 14269241  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14269240 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcacccttaaccctaattct 14269177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 146 - 454
Target Start/End: Original strand, 18627717 - 18628024
Alignment:
Q  146 aattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcaca 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  18627717 aattatatcacaatataacaagatcaaatactaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcacggaaaatatcgtattcaca 18627816  T
Q  246 aacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcatttt 345  Q
    | ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18627817 a-catatacattcatataataattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataaatcaagttctataaatcctttt 18627915  T
Q  346 gaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttattt 445  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  18627916 gaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtgccaatcaatatcagttttcattt 18628015  T
Q  446 caaattcgg 454  Q
     ||||||||    
T  18628016 taaattcgg 18628024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38897904 - 38897641
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  38897904 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 38897805  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38897804 caactttcgagtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaatttggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 38897705  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897704 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 38897641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 23664952 - 23664658
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23664952 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacctttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 23664853  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||| ||||||||   | ||| ||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23664852 catatattaattcatcaatcatcaacaattcttcactgtgacctacatgcaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacca 23664753  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23664752 acggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccatttttcatttcaaattc 23664658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14269909 - 14269660
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14269909 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 14269810  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || |  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14269809 tgcaaaaatttgaccataactcaatttctataaatccttttgaagtcgaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 14269710  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14269709 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14269660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 16214170 - 16214433
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  16214170 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 16214269  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16214270 caacctttgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccaaatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 16214369  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16214370 cctatattattcaacatcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctgattct 16214433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15081794 - 15081545
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15081794 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcacttagacctacg 15081695  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15081694 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaacttttgtgtttaca 15081595  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15081594 cctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 15081545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Original strand, 29796771 - 29797067
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatat--atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29796771 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 29796870  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 355  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29796871 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaattcttttgaagtcaaac 29796970  T
Q  356 cattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29796971 caacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattc 29797067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Original strand, 29800590 - 29800886
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatat--atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29800590 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 29800689  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 355  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29800690 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaattcttttgaagtcaaac 29800789  T
Q  356 cattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29800790 caacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattc 29800886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Original strand, 8940489 - 8940742
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8940489 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 8940588  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttt----tgtgtt 400  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||    
T  8940589 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtgtgtt 8940688  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8940689 tacacctaagaccaattttgtaccaatcaatagcagttttcatttcaaattcgg 8940742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 294 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15081512 - 15081255
Alignment:
Q  294 tgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaactt 393  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081512 tgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactt 15081413  T
Q  394 ttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctata 493  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15081412 tcgtgtttacttctaagaccaattatggacctatcaataccatatttcatttcaaattcggggcatagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctata 15081313  T
Q  494 ttattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081312 ttattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 15081255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 8940962 - 8941223
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  8940962 attcactgcgacctatgtgcagtagtttgagcataactcaagttctataaatcattttgacttcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 8941061  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  8941062 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcag--aaagcaa 8941159  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8941160 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 8941223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 207 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 45847605 - 45847358
Alignment:
Q  207 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45847605 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacagacatatacatacatataccaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtg 45847506  T
Q  307 aagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45847505 caataatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaactaacagagttagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttatacc 45847406  T
Q  407 taagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  45847405 taagaccaattttgtaccaatcaatattatttttcatttcaaattcgg 45847358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 44116515 - 44116688
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116515 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 44116614  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116615 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 44116688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 13647344 - 13647521
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647344 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 13647443  T
Q  110 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13647444 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 13647521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 3386339 - 3386511
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3386339 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaagtc 3386438  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386439 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 3386511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21189272 - 21189018
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  || |||| |||||||| |||||||||||    
T  21189272 attcactctgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacggcattaaaaagctaatatccataccta 21189173  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||    
T  21189172 caactttcgtgtttacacctaagaccaattgttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaa---------aagaaaaagcaa 21189082  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21189081 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcaatcttaaccctaattct 21189018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 24275177 - 24275320
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275177 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 24275276  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275277 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17062071 - 17061898
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062071 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcagcagtatacaaaat-agcatgacataataatatcaaatgcaagt 17061973  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061972 cagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 17061898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15082019 - 15081825
Alignment:
Q  88 tcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacat 186  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15082019 tcaaatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacat 15081920  T
Q  187 c--ttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15081919 caacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 15081825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 20110562 - 20110723
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110562 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20110651  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 172  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20110652 aataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 20110723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756654
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtct 12756718  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756717 caattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 12756654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38898533 - 38898359
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898533 tcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 38898434  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898433 aatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataacaacgtcaaat 38898359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 387
Target Start/End: Original strand, 13841274 - 13841446
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatt 314  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13841274 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatt 13841373  T
Q  315 tgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13841374 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcataccta 13841446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 8940769 - 8940934
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  8940769 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 8940868  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8940869 caactttt-tgtttacacctaagaccaattatgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 8940934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25926998 - 25926833
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25926998 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataactctttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaatatccatacctac 25926899  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25926898 aactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 25926833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 425 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 45846984 - 45846858
Alignment:
Q  425 aatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatc 524  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45846984 aatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatc 45846885  T
Q  525 acaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  45846884 acaatcatcactcttaaccctaattct 45846858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10501263 - 10501097
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  10501263 attcactatgaccttcgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccatttgaagtcaaaccaacgacattagaaatctaacatccataccta 10501164  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10501163 caacttttgtgtttacacctaagaccaactctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 10501097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13918272 - 13918106
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13918272 ttcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggaattagaaagctaacattcatacctac 13918173  T
Q  389 aacttttgtgtttacacct-aagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |  ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13918172 agttttcgtgtttacacctaaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 13918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1857097 - 1856933
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  1857097 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttatataaatcgttttgacgtcagaccaatgacattagaaagctaacattcatacctac 1856998  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1856997 aac-ttcgtgtttacacctaagaccaattcggtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 1856933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14156755 - 14156545
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  14156755 attcactgtgacctacatgcggtaatttgatcataagtcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 14156656  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||    ||||||||||| |||| |||    
T  14156655 caactttcgtgttatcacctaagaccaattctgtaccgatcaataccagtttttgtttcaaatttgagacagaaat---aagaaaaatcaggaaaaacaa 14156559  T
Q  488 cctatattattcaa 501  Q
    | ||||||||||||    
T  14156558 cttatattattcaa 14156545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14269633 - 14269467
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  14269633 attcactctgacctgcgtgcaataatttgatgataactcaagttctataaatttttttgacgtcataccaaaggcattagaaagctaacatccataccta 14269534  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14269533 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14269467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 48273398 - 48273512
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48273398 tcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 48273497  T
Q  100 caacaacgtctcaat 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  48273498 caacaacatctcaat 48273512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3564476 - 3564319
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3564476 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaagt 3564377  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  3564376 caacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcaca 3564319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14156944 - 14156782
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14156944 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaacataactcacgttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 14156845  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14156844 caactttagtgt----acctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14156782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 13831379 - 13831499
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13831379 tcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaagtc 13831478  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcac 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13831479 aacaacgtctcaattattcac 13831499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14270061 - 14269940
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14270061 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacata 14269963  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  14269962 catatattaattcatcaatcata 14269940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 321 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 10501064 - 10500887
Alignment:
Q  321 taactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatg 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||    
T  10501064 taactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgttatcacctaagaccaattctg 10500965  T
Q  421 taccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaa 501  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  10500964 taccgatcaataccagtttttgtttcaaattagagacagaaat---aagaaaaatcaggaaaaacaacttatattattcaa 10500887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Original strand, 13841157 - 13841270
Alignment:
Q  140 atatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgta 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13841157 atatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgta 13841256  T
Q  240 ttcacaaacatatac 254  Q
    |||| ||||||||||    
T  13841257 ttca-aaacatatac 13841270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18456524 - 18456368
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18456524 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagt 18456426  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  18456425 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 18456368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 12698840 - 12698998
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12698840 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattgcaat 12698939  T
Q  99 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  12698940 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 12698998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 38227490 - 38227646
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227490 tcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 38227588  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  38227589 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcaca 38227646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2280225 - 2280056
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2280225 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaaca 2280127  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2280126 acatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaat 2280056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45847739 - 45847638
Alignment:
Q  178 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatc 277  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45847739 aatcaacatcttaaa-catcatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatc 45847641  T
Q  278 ata 280  Q
    |||    
T  45847640 ata 45847638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 9509198 - 9509355
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9509198 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaatt 9509297  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  9509298 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcaca 9509355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38898229 - 38898106
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  38898229 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 38898131  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  38898130 tacatatactaattcatcaatcata 38898106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 288 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17985254 - 17985092
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||     ||||||||  |||||||| ||||||    
T  17985254 attcactatgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctaaatatcattttggaatcaaaccaactccattagaaatttaacatccttaccta 17985155  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaat 450  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  17985154 caactttcatgtttacacctaagaccaattctgtaccgatcaataccagatttcatttgaaat 17985092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Original strand, 8940335 - 8940458
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  8940335 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 8940433  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  8940434 taaatatactaattcatcaatcata 8940458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 26212012 - 26212168
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26212012 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 26212111  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  26212112 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataa 26212168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 246
Target Start/End: Original strand, 8468803 - 8468891
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8468803 atataacaacatcaaataataatcaacatcataaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa 8468891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143993
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaac 15144044  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     |||||| ||| ||   |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15144043 atctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcaca 15143993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38898075 - 38897997
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38898075 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattc 38897997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 10589055 - 10589154
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  10589055 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaac 10589154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 484 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23461793 - 23461726
Alignment:
Q  484 gcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461793 gcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 23461726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 471 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 14317688 - 14317616
Alignment:
Q  471 aaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaacc 543  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14317688 aaaatcagaaaaaacaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcgtcactcttaacc 14317616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 67754 - 67868
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  67754 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaa 67852  T
Q  99 tcaacaacgtctcaat 114  Q
    |||||||| |||||||    
T  67853 tcaacaacatctcaat 67868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19486847 - 19486681
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||| ||||||     
T  19486847 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 19486749  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19486748 tctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 19486681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 22072922 - 22073036
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  22072922 tcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaag 22073021  T
Q  99 tcaacaacgtctcaa 113  Q
    |||||||| ||||||    
T  22073022 tcaacaacatctcaa 22073036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 375
Target Start/End: Original strand, 11310239 - 11310327
Alignment:
Q  287 tattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaa 375  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11310239 tattcactctgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttatataattcatttagacgtcaaaccaatggcattagaaagctaa 11310327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255730
Alignment:
Q  14 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||   |  ||||| |||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 45847331 - 45847213
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||| |||||    || |||    
T  45847331 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcataccaacgacattagaaagttaacacaattatcta 45847232  T
Q  388 caacttttgtgtttacacc 406  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  45847231 caactttcatgtttacacc 45847213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 16495421 - 16495581
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||      
T  16495421 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaac-catcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac-- 16495517  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
     |||||||| || |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16495518 -tcaattat-cagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 16495581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5294571 - 5294525
Alignment:
Q  505 cactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294571 cactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 5294525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5295744 - 5295698
Alignment:
Q  505 cactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5295744 cactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 5295698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5296917 - 5296871
Alignment:
Q  505 cactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5296917 cactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 5296871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 455
Target Start/End: Original strand, 11310133 - 11310214
Alignment:
Q  373 taacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggg 455  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11310133 taacatctatacctacaacttttgtgaaaacacctaagaccaattatgtacttatcaata-cagttttcatttcaaattcggg 11310214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 18005660 - 18005806
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  18005660 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 18005758  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  18005759 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 18005806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 40443410 - 40443541
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |    
T  40443410 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaatttcaattcatcaacat 40443507  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  40443508 cttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata 40443541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867932
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaa 1868004  T
Q  103 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
    |||| ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1868003 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 1867932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056488
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||| |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    || ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  16056441 acatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 16056488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16386353 - 16386268
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  16386353 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 16386268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 23461864 - 23461791
Alignment:
Q  385 ctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggca 458  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  23461864 ctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagacttcatttcaaattcggggca 23461791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113114
Alignment:
Q  79 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaat-attcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15113114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 34200802 - 34200901
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  34200802 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 34200900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 47831816 - 47831860
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831816 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 47831860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063760
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || | |||| || || || ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||     
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaaca 10063823  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10063822 tctcaaatattcacatataattcaa-----acatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 10063760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 811238 - 811142
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  811238 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 811142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 15116568 - 15116651
Alignment:
Q  79 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  15116568 ataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaat-attcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15116651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16219823 - 16219677
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  16219823 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 16219725  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    || ||| ||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  16219724 acatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 16219677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 104
Target Start/End: Original strand, 44014192 - 44014291
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  44014192 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 44014290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220127
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||      
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca-- 20220194  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20220193 -tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaat 20220127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9945141 - 9945103
Alignment:
Q  513 ttcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9945141 ttcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 9945103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 28505410 - 28505321
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 89  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28505410 tcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14932846 - 14932749
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14932846 tcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaa 14932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008436
Alignment:
Q  15 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagc-agtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||  |||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||  ||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacct 15008500  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
    |||  || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  15008499 caaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 15008436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15356281 - 15356184
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15356281 tcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaa 15356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15360395 - 15360298
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15360395 tcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaa 15360298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18154953 - 18154901
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18154953 tcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaaca 18154901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13745648 - 13745569
Alignment:
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13745648 atattcatataataattcattaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 13745569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15119993 - 15119918
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  15119993 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcataaatcata 15119918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Original strand, 11286976 - 11287046
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |  ||||||||||||||||    
T  11286976 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagacaaaccaaagccattagaaagctaacat 11287046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16202852 - 16202766
Alignment:
Q  320 ataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||  |  |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16202852 ataactcaaattctagaaatcatcatgaagtaaaaccaaagccattagaaatctaacatcactacctacaacttttatgtttacacc 16202766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 125965 - 126034
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  125965 agtaatttgatcataactcaagttctaaaactcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 126034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 15754992 - 15754955
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15754992 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15754955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15376390 - 15376322
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  15376390 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 15376322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20384800 - 20384732
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  20384800 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 20384732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 27217346 - 27217414
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  27217346 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 27217414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 279
Target Start/End: Original strand, 38294567 - 38294631
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  38294567 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcgccaacatatacattcatagaataattcatcaatcat 38294631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 11393038 - 11393003
Alignment:
Q  419 tgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11393038 tgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 11393003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13475767 - 13475728
Alignment:
Q  367 gaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13475767 gaaagctaacatacatacctacaacctttgtgtttacacc 13475728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 38
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044792
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14044792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 38
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354822
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14354822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Original strand, 16410544 - 16410583
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16410544 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 16410583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Original strand, 18628051 - 18628090
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18628051 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 18628090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Original strand, 18640757 - 18640796
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18640757 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 18640796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26355658 - 26355619
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26355658 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 26355619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26358110 - 26358071
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26358110 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 26358071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27847932 - 27847838
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||   ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  27847932 cttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtac---aacagtatgacataattatatcaaattcaattcatcaac 27847838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 11996132 - 11996095
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11996132 caacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaa 11996095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901431
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||||||||| |   ||||| |||| ||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaa 12901431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 417
Target Start/End: Original strand, 20110747 - 20110779
Alignment:
Q  385 ctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20110747 ctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 20110779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 126)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 32215077 - 32214634
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215077 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 32214978  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214977 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 32214878  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32214877 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtatacacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 32214788  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214787 tacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 32214688  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32214687 tacacctaagaacaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 32214634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 18808949 - 18809401
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808949 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18809048  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18809049 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 18809148  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18809149 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 18809247  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  18809248 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 18809347  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18809348 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 18809401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23709688 - 23709236
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709688 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23709589  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23709588 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 23709489  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  23709488 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattcttcattgtgacc 23709390  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709389 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaactgcattagaaagctaacattcatacctacaacttttgtgtt 23709290  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23709289 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtatttatttcaaattcgg 23709236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23712169 - 23711717
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712169 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23712070  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23712069 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 23711970  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23711969 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 23711871  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  23711870 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 23711771  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23711770 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 23711717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 39682319 - 39682772
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682319 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 39682418  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39682419 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 39682518  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39682519 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 39682618  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  39682619 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 39682718  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39682719 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 39682772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 571403 - 571856
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571403 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 571502  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  571503 aacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 571602  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  571603 tatacatataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 571702  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  571703 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgacgtcaaaccaacgacattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 571802  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571803 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 571856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 23130868 - 23131315
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130868 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23130967  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23130968 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 23131067  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23131068 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 23131167  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23131168 tacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 23131267  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaa 448  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23131268 tatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaa 23131315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 23133335 - 23133782
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133335 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23133434  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23133435 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 23133534  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23133535 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 23133634  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23133635 tacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 23133734  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaa 448  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23133735 tatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaa 23133782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34402678 - 34402231
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402678 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 34402579  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34402578 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 34402479  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34402478 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 34402379  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34402378 tacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 34402279  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaa 448  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34402278 tatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaa 34402231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 28577105 - 28577557
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28577105 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaacagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagcc 28577204  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28577205 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 28577304  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28577305 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 28577403  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28577404 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtt 28577503  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28577504 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 28577557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24898352 - 24897899
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898352 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24898253  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24898252 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 24898153  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  24898152 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttac 24898054  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24898053 ctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgt 24897954  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24897953 ttacacctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 24897899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24905789 - 24905336
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905789 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24905690  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24905689 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 24905590  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  24905589 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttac 24905491  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24905490 ctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgt 24905391  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24905390 ttacacctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 24905336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 26505385 - 26505837
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505385 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 26505484  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26505485 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 26505584  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26505585 tatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 26505683  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  26505684 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 26505783  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26505784 tacacctaagatcaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 26505837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 26507863 - 26508315
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507863 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 26507962  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26507963 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 26508062  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26508063 tatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 26508161  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  26508162 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaattcttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 26508261  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26508262 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 26508315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24900835 - 24900382
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900835 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24900736  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24900735 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 24900636  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  24900635 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatataaattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttac 24900537  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24900536 ctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgt 24900437  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24900436 ttacacctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 24900382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24903312 - 24902859
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903312 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24903213  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24903212 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 24903113  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  24903112 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatataaattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttac 24903014  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24903013 ctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgt 24902914  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24902913 ttacacctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 24902859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24908264 - 24907811
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908264 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24908165  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24908164 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 24908065  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  24908064 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttac 24907966  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  24907965 ctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcatgt 24907866  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24907865 ttacacctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 24907811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 23135596 - 23136038
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135596 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23135695  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23135696 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaatgataatcagcatcttaaaacatcata 23135795  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23135796 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcaca-----------acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 23135884  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  23135885 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgggattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 23135984  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23135985 tacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 23136038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 32039654 - 32039202
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039654 tcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 32039555  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32039554 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcata 32039455  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32039454 tatacatataacacttcatcgatcatggacaatatcagattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 32039356  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  32039355 tacgttcagtaatttgaccataacttaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaaatttatacctacaactttcgtgtt 32039256  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32039255 tacacctaagaccaatcctttaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 32039202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 24529685 - 24529253
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24529685 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtt 24529586  T
Q  101 aacaacgtctcaattatt-cacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  24529585 aacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catcat 24529505  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24529504 atacacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgac 24529405  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24529404 ctacgtttagtaatttcaccatatctcaagtgctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaaggtaacatccatacctacaacttttgtgt 24529305  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  24529304 ttacacctaagaccaattttgtaccaatcaatacaagttttcattttaaatt 24529253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 6726001 - 6726279
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6726001 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtc 6726100  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6726101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 6726200  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6726201 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 6726279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21155216 - 21154942
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21155216 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtc 21155117  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21155116 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 21155017  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21155016 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 21154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 24367782 - 24368058
Alignment:
Q  3 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367782 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 24367881  T
Q  103 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24367882 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatata 24367981  T
Q  203 tacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24367982 tacatataatacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 24368058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 22105418 - 22105697
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105418 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 22105517  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22105518 caacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaattataatcaacatcttaaaacatcat 22105617  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105618 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatttacatacatatactaattcatcaatcata 22105697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 157 - 452
Target Start/End: Original strand, 20261381 - 20261676
Alignment:
Q  157 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20261381 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 20261480  T
Q  257 acatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20261481 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 20261580  T
Q  357 attggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20261581 aacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 20261676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 22105951 - 22106214
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  22105951 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 22106050  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22106051 caacttttgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaataaaaatcagaaaaagcaa 22106150  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22106151 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 22106214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23707169 - 23706920
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23707169 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 23707070  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707069 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 23706970  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23706969 cctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 23706920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 38967380 - 38967658
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38967380 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacacaacaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaatgcaagtc 38967479  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  38967480 aatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaataataatcaacatcttaagacatcat 38967578  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38967579 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcata 38967658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24529223 - 24528960
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  24529223 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 24529124  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24529123 caactttcgtgtttacacctaagaccaattaaggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcaaagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 24529024  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529023 tctatattatttaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 24528960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 292 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41523552 - 41523293
Alignment:
Q  292 actgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaac 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523552 actgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaac 41523453  T
Q  392 ttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaaccta 491  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41523452 tttcgtgtttacacgtaagaccaattatggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaaaaaaaatcagaaaaagcaaccta 41523353  T
Q  492 tattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523352 tattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 41523293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10684764 - 10684468
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata--catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10684764 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 10684665  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 355  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10684664 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaatccttttgaagtcaaac 10684565  T
Q  356 cattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10684564 caacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattc 10684468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Original strand, 24918350 - 24918599
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24918350 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 24918449  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24918450 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttaca 24918549  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24918550 cttaagaccaattctctaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 24918599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 24368312 - 24368575
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  24368312 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataacttaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 24368411  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24368412 caactttcgtgtttacacctaagaccaactattgacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 24368511  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368512 cttatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 24368575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 24671511 - 24671774
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24671511 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatatttttgatgtcaaataaatggcattagaaagctaacatccacaccta 24671610  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24671611 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctggacatatcaataccagatttcattccaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 24671710  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671711 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 24671774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45030010 - 45029784
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030010 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 45029911  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  45029910 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcacaatataacaacatgaaataataatcatcatcttaaaacatcata 45029811  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  45029810 tatacatataacacttcatcaatcatg 45029784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 24918626 - 24918889
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||| |||||||||||||||    
T  24918626 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaacggtattagaaagataacatccataccta 24918725  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  24918726 caactttcgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcagggcagagatgaaaagaaaaatccgaaaaggcaa 24918825  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918826 cttatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 24918889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24642701 - 24642452
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24642701 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctaca 24642602  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642601 tgcagtaatttgaccataacttaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaacttttgggtttaca 24642502  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24642501 cctaagagcaattctgtaccaatcaataccagttttcttttcaaattcgg 24642452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 290 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32214604 - 32214343
Alignment:
Q  290 tcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctaca 389  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32214604 tcactgtgacctacgtgctgtaatttgaccataacttaagttctataaattgttttgacgtcagagcaacggcattagaaagctaacatccatacctaca 32214505  T
Q  390 acttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacc 489  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  32214504 actttcgtgttatcacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcattttaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaatc 32214405  T
Q  490 tatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214404 tatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 32214343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 291 - 551
Target Start/End: Original strand, 23931949 - 23932209
Alignment:
Q  291 cactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaa 390  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931949 cactgtgacctaagtgaagtaaattgaccataactaaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgaaattagaaagctaacatccatacctacaa 23932048  T
Q  391 cttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacct 490  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23932049 ctttcgtgtttacacctaagaccaattctataccaatcaataccagctttcatttcaaattcagggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacct 23932148  T
Q  491 atattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23932149 atattattcaacttcactttcattcaaactcatcaaaatcatcactattaaccctaattct 23932209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 6726533 - 6726796
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  6726533 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 6726632  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6726633 caactttcgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaatatgagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 6726732  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726733 cctatatttttcaacttcaatttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 6726796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21154491 - 21154228
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  21154491 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgactaaaagtcaagttctataaatcattttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 21154392  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21154391 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctagacctatcaatactagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 21154292  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21154291 cccatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcgctcttaaccctaattct 21154228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 24681930 - 24682193
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |  || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  24681930 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatctttttgatgtcagactaacggcattagaatgctaacatccacaccta 24682029  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24682030 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcgggggagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 24682129  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24682130 cctatattattcaacttcacttttattcaaaattatcacaatcatcactcttaaccctaattct 24682193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Original strand, 24671235 - 24671484
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24671235 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacg 24671334  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24671335 tgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacaacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtttttaca 24671434  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  24671435 cctaagaccaattctgtaccaataaataccagtttgcatttcaaattcgg 24671484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 205 - 453
Target Start/End: Original strand, 38967689 - 38967937
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  38967689 catataacacttcaacaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgagctgcg 38967788  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  38967789 tgcagtaatttcactataactcaagttctataaatacttttgaagtcaaaccaacgacattagaaacctaacatccatatctacaactttcgtatttaca 38967888  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38967889 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcg 38967937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 205 - 452
Target Start/End: Original strand, 24681654 - 24681901
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24681654 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacg 24681753  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24681754 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcctttggaagcccaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 24681853  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24681854 gctaagaccaattctgtaccaaccaataccagttttcatttcaaattc 24681901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 221 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 45027840 - 45027608
Alignment:
Q  221 aatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgacta 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  45027840 aatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgacta 45027742  T
Q  321 taactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatg 420  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  45027741 taattcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctg 45027642  T
Q  421 taccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45027641 taccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 45027608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 22105672 - 22105924
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22105672 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22105771  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22105772 acgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 22105871  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22105872 acacctaagaccaattctgcaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 22105924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 24368033 - 24368285
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24368033 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatgatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 24368132  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24368133 acgtgcagtaatttaactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 24368232  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24368233 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 24368285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23706702 - 23706439
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |  |||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  23706702 attcactgtgacctacgtgcagtaacttgaccataactcaagttctataaattgttttgacatagaaccaacaccattagaaagctaacatccataccta 23706603  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23706602 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcgggccagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 23706503  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706502 cctagattatttaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 23706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 25616194 - 25616580
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| || || |||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  25616194 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaatt 25616293  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata-taattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    ||||||| ||| || ||||||   |||  |||||||||||| ||| | | | |||||||   ||      ||||    | ||||||||||||||||||||    
T  25616294 caacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataatcaatgtatcacatcttat-----tcaa----tcatcaacatcttaaaacatca 25616384  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  25616385 tacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtga 25616484  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttt 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616485 cctacgtgaagtaatttgacgataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaacttt 25616580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21154963 - 21154711
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | ||||||||| || ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21154963 atacatatactaattcatcaattataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 21154864  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21154863 atgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 21154764  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21154763 acccctaagacaaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 21154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 290 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 45027579 - 45027313
Alignment:
Q  290 tcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctaca 389  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45027579 tcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactaaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattcgaaatctaacatccatacctaca 45027480  T
Q  390 acttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatag-----aaaaatcagaaaaag 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||     |||||||||||||||    
T  45027479 acttttgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaacaccagattccatttcaaatttggggcagagatgaaaagaaaaaaaaaatcagaaaaag 45027380  T
Q  485 caacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45027379 caacttatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 45027313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 6726254 - 6726506
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6726254 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatgctaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 6726353  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6726354 atgtgcagtaatttgactataacttaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 6726453  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6726454 acacctaagaccacttatgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 6726506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41524028 - 41523776
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41524028 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcgtatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacct 41523929  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41523928 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacgttagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 41523829  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41523828 acacctaagactaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 41523776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 80 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642732
Alignment:
Q  80 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataa 24642834  T
Q  180 tcaacatc--ttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatc 277  Q
    ||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24642833 tcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatc 24642735  T
Q  278 ata 280  Q
    |||    
T  24642734 ata 24642732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 43137305 - 43137477
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137305 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 43137404  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43137405 aacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 43137477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 288 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41523749 - 41523584
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||||||||||    
T  41523749 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaagggcattataaagataacatccataccta 41523650  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcg 453  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523649 caaccttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcg 41523584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 310 - 454
Target Start/End: Original strand, 23931775 - 23931919
Alignment:
Q  310 taatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaa 409  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23931775 taatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatcaatacctacaactttagtgtttacacctaa 23931874  T
Q  410 gaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23931875 gaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 23931919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21154684 - 21154518
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  21154684 attcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccgtaactcaaattctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 21154585  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21154584 caactttcgtgtttacacctaggaccaattctataacaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 21154518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 22337124 - 22337281
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22337124 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaga 22337223  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22337224 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22337281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 23060522 - 23060679
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23060522 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagt 23060621  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23060622 caacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23060679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 23076451 - 23076608
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23076451 tcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 23076550  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||  ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23076551 caacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23076608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23709209 - 23709043
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  23709209 attcactgtgacctatgtgcagtaattagaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaatctaacatccataccta 23709110  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23709109 caacttacgtgtttacacctaggacgaattctgtgccaatcaataccagttttcatttcaaaatcgg 23709043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 293 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23706889 - 23706728
Alignment:
Q  293 ctgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaact 392  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||   || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23706889 ctgtgacttacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataattcgttttgacgtcagacctacggcattagaaaggtaacatccataactataact 23706790  T
Q  393 tttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  23706789 ttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatagccgttttcatttcaaattcgg 23706728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 19671848 - 19672010
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  19671848 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 19671946  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19671947 tctcaat-attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataacaacatcaa 19672010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22731346 - 22731189
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22731346 tcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 22731247  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| | | || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22731246 catcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22731189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23707323 - 23707200
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  23707323 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 23707225  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  23707224 tacatatactaattcatcaatcata 23707200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Original strand, 24918196 - 24918319
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||    
T  24918196 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatgca 24918294  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  24918295 tacatatactaattcatcaatcata 24918319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22738291 - 22738135
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22738291 tcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaaataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattc 22738192  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    | |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22738191 atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22738135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 298927 - 298769
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||     
T  298927 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaat 298828  T
Q  99 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  298827 tcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 298769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 23285874 - 23286027
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||| |    
T  23285874 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatcaattgcaatt 23285969  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| || |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23285970 catcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23286027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 277
Target Start/End: Original strand, 24671081 - 24671201
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  24671081 atataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 24671179  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatc 277  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  24671180 tacatatactaattcatcaatc 24671201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 23660032 - 23660188
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23660032 tcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatcaaatgcaaat 23660130  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23660131 caacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 23660188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Original strand, 24681500 - 24681623
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  24681500 atataacaacatcaaatgatgatcaacatcaacttaaacatcatatatacatctaatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 24681598  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  24681599 tacatatactaattcatcaatcata 24681623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23708725 - 23708558
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |     
T  23708725 tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcg 23708627  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23708626 acatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 23708558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 24643106 - 24643034
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagc 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24643106 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaaacagc 24643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23654491 - 23654341
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  23654491 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 23654392  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || ||||||  ||| | |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23654391 atcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23654341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 38219 - 38136
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38219 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 38136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7688
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7736 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23103497 - 23103369
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  23103497 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaacatc 23103400  T
Q  110 tcaattattcacatataattcaagtaatgca 140  Q
    ||||| |||||   ||||||||||| |||||    
T  23103399 tcaatcattcattcataattcaagtcatgca 23103369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22173868 - 22173799
Alignment:
Q  118 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22173868 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 22173799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Original strand, 28405990 - 28406099
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  28405990 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 28406089  T
Q  104 aacgtctcaa 113  Q
    ||| ||||||    
T  28406090 aacatctcaa 28406099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 454
Target Start/End: Original strand, 31345570 - 31345638
Alignment:
Q  386 tacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31345570 tacaactttcgtgtttacacctaagatcaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 31345638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23040301 - 23040249
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040301 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 23040249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 353
Target Start/End: Original strand, 31345490 - 31345554
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaa 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31345490 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcaa 31345554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 20309127 - 20309257
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |    
T  20309127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 20309223  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  20309224 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 20309257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520130
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||||    
T  20520197 atctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaat 20520130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207461
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  ||| | | |||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  23207395 atctcaa-catt-ataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 23207461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 8946666 - 8946734
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaa 68  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8946666 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22459587 - 22459511
Alignment:
Q  87 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  22459587 atcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 22459511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451896
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |     
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 144  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata 32451896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 7679594 - 7679745
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |||    
T  7679594 tcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aatgtaag 7679691  T
Q  99 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||| ||  ||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7679692 tcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatataattatat 7679745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Original strand, 23791357 - 23791458
Alignment:
Q  73 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 171  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  23791357 catgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 23791455  T
Q  172 aat 174  Q
    |||    
T  23791456 aat 23791458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 25175864 - 25176010
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  25175864 atcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 25175962  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  25175963 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataacgtatatataattatat 25176010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24642425 - 24642373
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatc 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24642425 attcactgtgacctacgtgtagttatttgaccataactcaagttctataaatc 24642373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 174
Target Start/End: Original strand, 29601478 - 29601518
Alignment:
Q  134 taatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601478 taatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 29601518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786971
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18786971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Original strand, 21368365 - 21368439
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  21368365 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 21368439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 377
Target Start/End: Original strand, 16900803 - 16900884
Alignment:
Q  296 tgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||||    
T  16900803 tgacccacgtgtagtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagtcattagaaagctaaca 16900884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 377
Target Start/End: Original strand, 16994194 - 16994275
Alignment:
Q  296 tgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||||    
T  16994194 tgacccacgtgtagtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagtcattagaaagctaaca 16994275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22134306 - 22134266
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22134306 tagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaaca 22134266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 379
Target Start/End: Original strand, 67339 - 67410
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatc 379  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||| ||||||||    
T  67339 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaatctaacatc 67410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44584627 - 44584588
Alignment:
Q  367 gaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44584627 gaaagctaacatacatacctacaacttttgtgtttacacc 44584588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Original strand, 23799457 - 23799531
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  23799457 catataataattcatcaatcatgaataacatcatattcaacaacatatacattcatataataattcatcaatcat 23799531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24697644 - 24697543
Alignment:
Q  73 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 171  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |    
T  24697644 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaa-acttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
Q  172 aat 174  Q
    |||    
T  24697545 aat 24697543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34135129 - 34135071
Alignment:
Q  336 aaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttt 394  Q
    ||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34135129 aaatcatatggaagtcaaaccaaagcaattagaaagctaacttccatacctacaacttt 34135071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24686707 - 24686598
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  24686707 agtaatttgatcataacgcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattatctaaaactttcatgtttacacca 24686608  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||||||||||    
T  24686607 aagaccaatt 24686598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 18809428 - 18809496
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  18809428 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 18809496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 270
Target Start/End: Original strand, 22686145 - 22686217
Alignment:
Q  198 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattc 270  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  22686145 atatattcatataataattcatcaatcatgaaaaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattc 22686217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287424
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 23287424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23711690 - 23711622
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  23711690 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 23711622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392443
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26392443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 26505864 - 26505932
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  26505864 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 26505932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 26508342 - 26508410
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  26508342 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 26508410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27920441 - 27920373
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  27920441 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 27920373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32039175 - 32039107
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  32039175 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 32039107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 23072054 - 23072019
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 43  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23072054 caacttagtccgactcatgcagcttagttaaataac 23072019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Original strand, 23131347 - 23131386
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23131347 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 23131386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Original strand, 23133814 - 23133853
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23133814 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactca 23133853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34402199 - 34402160
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34402199 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 34402160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41524045 - 41524003
Alignment:
Q  237 gtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41524045 gtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcata 41524003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Original strand, 27261332 - 27261402
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  27261332 agtaatttgatcataactcaagttataaaaattatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 27261402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 417
Target Start/End: Original strand, 6483113 - 6483194
Alignment:
Q  336 aaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  6483113 aaatcattttgaagtcaaaccaaagccattggaaagctaacaaaattatctacaacttttatgtttacaccaaaggccaatt 6483194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 12727711 - 12727780
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||  |  |||||||||||||||    
T  12727711 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaacccaaggccattagaaagctaaca 12727780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19887368 - 19887275
Alignment:
Q  324 ctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||||    || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  19887368 ctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaagtccaatt 19887275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 34823750 - 34823819
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  34823750 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgtcattagaaagctaaca 34823819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 11294 - 11746
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11294 tcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 11393  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11394 aacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaaaatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaat 11493  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11494 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattaactgtgac 11593  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  11594 ctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaacccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaagtatcgtgt 11693  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11694 ttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 11746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 13953 - 14406
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13953 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 14052  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14053 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 14152  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14153 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 14252  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  14253 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaacgttcgtgtt 14352  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14353 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 14406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 204 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23484 - 23237
Alignment:
Q  204 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23484 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctac 23385  T
Q  304 gtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttac 403  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23384 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatctatacctacaacttttgtgtttac 23285  T
Q  404 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    |||| |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23284 accttagactaattctatatcaataaataccagttttcatttcaaatt 23237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23047 - 22793
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||    
T  23047 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcatgttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatatcta 22948  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||          ||    
T  22947 caacttttgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaat---------aaa 22857  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22856 cctatattatgcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 22793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 404 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20764 - 20617
Alignment:
Q  404 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaact 503  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20764 acctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagatttcatttccaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaaacaacctatattattcaact 20665  T
Q  504 tcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20664 tcactttgattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccttaattct 20617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23207 - 23121
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagcta 374  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  23207 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagcta 23121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23118 - 23074
Alignment:
Q  410 gaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23118 gaccaattttgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcgg 23074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 37827 - 38280
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37827 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 37926  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37927 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 38026  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38027 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 38126  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  38127 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 38226  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38227 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 38280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 38307 - 38375
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  38307 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 264924 - 264472
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264924 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 264825  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  264824 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 264725  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  264724 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacc 264626  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  264625 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatttatacctacaacttttgtgtt 264526  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  264525 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 264472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 20909018 - 20909470
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909018 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20909117  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20909118 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 20909217  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20909218 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactctgacc 20909316  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  20909317 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 20909416  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20909417 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 20909470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10733096 - 10732644
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733096 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 10732997  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10732996 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaccgtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 10732897  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10732896 tatacatataacacttcatcaatcatggacaaaatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatc 10732798  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10732797 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 10732698  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10732697 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 10732644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 39363390 - 39363837
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363390 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 39363489  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39363490 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 39363589  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  39363590 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcagtgtgacc 39363689  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39363690 tacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaatcaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 39363789  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaa 448  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39363790 tatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaa 39363837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 39245142 - 39245594
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245142 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 39245241  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39245242 aataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 39245341  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39245342 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 39245440  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  39245441 tacgtgcagtaatttaactataaatcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 39245540  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39245541 tacacataagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 39245594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 29345986 - 29346438
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29345986 tcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 29346085  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29346086 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 29346185  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  29346186 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacc 29346284  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  29346285 tacgtgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 29346384  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29346385 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 29346438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 42245521 - 42245069
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245521 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 42245422  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42245421 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 42245322  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42245321 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 42245223  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  42245222 tacgtgcagtaatttgactataactatagttctataaatccatttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatttatacctacaactttcgtgtt 42245123  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42245122 tacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 42245069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 29348459 - 29348911
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348459 tcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 29348558  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29348559 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 29348658  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  29348659 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacc 29348757  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  29348758 tacgtgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcatttgaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 29348857  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29348858 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 29348911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 29350932 - 29351384
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350932 tcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 29351031  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29351032 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 29351131  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  29351132 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacc 29351230  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  29351231 tacgtgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcatttgaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 29351330  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29351331 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 29351384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 38619440 - 38619889
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619440 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 38619539  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38619540 aatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatattccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatca 38619639  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  38619640 tatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtga 38619739  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38619740 cctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaatctaacatccatacctacaactttcgtg 38619839  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaa 448  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619840 tttatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaa 38619889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2154770 - 2154335
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2154770 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtc 2154671  T
Q  101 aacaacgtctcaattatt-cacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  2154670 aacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catcat 2154590  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2154589 atatacatataacacttcatcaatcatggacagtatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgac 2154490  T
Q  300 ctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgt 399  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  2154489 ctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaatattcatacctacaactttagtgt 2154390  T
Q  400 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2154389 ttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 2154335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 23064517 - 23064972
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23064517 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatgcaagtc 23064616  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 198  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  23064617 aatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacataa 23064716  T
Q  199 tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtga 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23064717 tatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataataaattattcactgtga 23064816  T
Q  299 cctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtg 398  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23064817 cctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacgaacggcactagaaagctgacatccatacctacaactttcgtg 23064916  T
Q  399 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23064917 tttatatctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttaatttcaaattcgg 23064972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 32027399 - 32027677
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32027399 tcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatccaagtc 32027498  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32027499 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 32027598  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32027599 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 32027677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 29329940 - 29330215
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329940 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 29330039  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||    
T  29330040 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa---taataatcatcttaaaacatcata 29330136  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29330137 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 29330215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 179 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17517142 - 17516869
Alignment:
Q  179 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatca 278  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17517142 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 17517043  T
Q  279 tattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  17517042 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgacgataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 17516943  T
Q  379 ccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17516942 ccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 17516869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20918104 - 20917830
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    ||||    
T  20918104 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaaa----agtc 20918009  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20918008 aacaacgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 20917909  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20917908 tatacatataacacttcatcaatcatggacaagatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 20917830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17516647 - 17516383
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  17516647 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 17516548  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatca-gaaaaagca 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17516547 caactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccggttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcaggaaaaagca 17516448  T
Q  487 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516447 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 17516383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20901873 - 20901624
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20901873 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcacagtgacctacg 20901774  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20901773 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatccatacctacaactttcatgtttaca 20901674  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20901673 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaaatcgg 20901624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 158 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 37804902 - 37804609
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37804902 atataacaacatcaaattctaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacgcttcattaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 37804803  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37804802 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcattaatttgaccataactcaagttttataaatccttttgaagtcaaacca 37804703  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
      || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37804702 acggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatgccagttttcatttcaaatt 37804609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20902159 - 20901904
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20902159 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaac 20902060  T
Q  107 gtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||    
T  20902059 gtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catcatatatac 20901979  T
Q  206 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20901978 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 20901904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 2154308 - 2154045
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  2154308 attcaccgtgacatacgtgcagtaatttgactataacttaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattaaaaagctaacatccataccta 2154209  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154208 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaatttggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 2154109  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154108 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 2154045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20917523 - 20917260
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  20917523 attcattgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttttataaatgattttgacgtcagaccagcggcattagaaagctaacattcataccta 20917424  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20917423 caactttcgtgtttacacctaagatcaattatggacctatcaatacctgatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 20917324  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917323 cccatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 20917260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 32028511 - 32028774
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32028511 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatcgttttgatgtcagaccaacgatattagaaagctaacatccataccta 32028610  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32028611 caactttcgtgtttacacctaagaccaatttttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcagggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 32028710  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32028711 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcaccactcttaaccctaattct 32028774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 288 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20901597 - 20901373
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  20901597 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactaaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctgacatccataccta 20901498  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20901497 caacgttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 20901398  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20901397 cctatattattcaacttcactttca 20901373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 295951 - 295688
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||  |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  295951 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgatgtcagatcaacgacattagaaagctaacattcataccta 295852  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||  || |||||||||||||| |||  | ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  295851 caactttcatggttacacctaagacctattccggacttatcaataccagatttcatttcaaattcgggacagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 295752  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295751 cttatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 295688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 32027652 - 32027904
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32027652 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcacagtgacct 32027751  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  32027752 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacattcatacctacaactttcttgttt 32027851  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32027852 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 32027904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 215 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20917789 - 20917550
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatt 314  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  20917789 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcaccgtgacttacgtgcagtaatt 20917690  T
Q  315 tgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagacca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20917689 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 20917590  T
Q  415 attatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20917589 attctgtaccaatcaataccagttttcatttcgaattcgg 20917550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 288 - 526
Target Start/End: Original strand, 29330468 - 29330706
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29330468 attcactgtgacatacgtgcattaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggccttagaaagctaacatccataccta 29330567  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29330568 caacttttgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagtaa 29330667  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcac 526  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29330668 cctatattattcaactttactttcattcaaaatcatcac 29330706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 158 - 417
Target Start/End: Original strand, 9776521 - 9776780
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9776521 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacccttcaccaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 9776620  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9776621 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaatccttttgaagtcaaacca 9776720  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
      || ||||||||||||||||   || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  9776721 acggtattagaaagctaacataattatctacaactttcatgtttacaccaaagaccaatt 9776780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 29330190 - 29330441
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  29330190 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcgtaaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaatt-ttcactgttacct 29330288  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgttt 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29330289 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaaatcaaaccaacagcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 29330388  T
Q  402 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330389 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 29330441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36154936 - 36154766
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154936 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca---acacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 36154840  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36154839 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 36154766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11581355 - 11581184
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581355 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 11581256  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 172  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11581255 aataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 11581184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18319190 - 18319021
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319190 tcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18319091  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 169  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319090 aatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 18319021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10775832 - 10775659
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775832 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacacagcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 10775733  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10775732 aatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaat 10775659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 31061074 - 31061248
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061074 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 31061173  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061174 aatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcacaatataacaacatcaaat 31061248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 24067113 - 24067282
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24067113 tcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 24067212  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 169  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24067213 aatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 296144 - 295978
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  296144 attcagtgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacgtcattagaaagctaacatccataccta 296045  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  296044 caacttttgtgtatacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 295978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 32028124 - 32028291
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaa-ccattggaattagaaagctaacatccatacct 386  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  32028124 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatcgttttgacgtcaaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacct 32028223  T
Q  387 acaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32028224 acaactttcgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcgg 32028291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 32027931 - 32028097
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  32027931 attcattgtgacttacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatcgttttgacgtccgaccaatggcattagaaagctaacatccataaata 32028030  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  32028031 caatttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataacaattttcatttcaaattcgg 32028097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17516840 - 17516674
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  17516840 attcactgtgacctatgtgcagtaattcgacgataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 17516741  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  17516740 caactttcgtgtttacacctaggaccaattctgtgccaatcaataccatttttcatttaaaaatcgg 17516674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 1096476 - 1096633
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1096476 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaaat 1096575  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1096576 caacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 1096633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 9077961 - 9078118
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9077961 tcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagt 9078060  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9078061 caacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 9078118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23390608 - 23390451
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23390608 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaatt 23390509  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23390508 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23390451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 25421541 - 25421698
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25421541 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagt 25421640  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25421641 caacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25421698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 32028318 - 32028484
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||   | | ||||||||||||||  |||||||    
T  32028318 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaattgttttgacgtcagaccaacagcactagaaagctaacatatataccta 32028417  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32028418 caactttcgtgttttcacctaaaaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 32028484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 24529229 - 24529386
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24529229 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaagt 24529328  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| |||||| ||   |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24529329 caacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 24529386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21729169 - 21729019
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21729169 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 21729070  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21729069 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcaca 21729019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21808494 - 21808344
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21808494 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 21808395  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21808394 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21808344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Original strand, 25431414 - 25431560
Alignment:
Q  12 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25431414 ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 25431513  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     || | ||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25431514 taaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25431560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 24493578 - 24493734
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493578 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24493676  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  24493677 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcaca 24493734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21997646 - 21997547
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21997646 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8286955 - 8286797
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatac-aaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8286955 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 8286856  T
Q  99 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||| |||| ||| || || ||| | ||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  8286855 tcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 8286797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 22412193 - 22412329
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412193 tcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 22412291  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  22412292 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 22412329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 13025320 - 13025476
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13025320 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagt 13025418  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
T  13025419 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13025476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 13095504 - 13095660
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13095504 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagt 13095602  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
T  13095603 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13095660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 22075035 - 22075185
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22075035 caacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 22075134  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  22075135 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 22075185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144215
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22144215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 21565556 - 21565723
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  21565556 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 21565654  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    ||| | |||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21565655 aacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20766181 - 20766095
Alignment:
Q  50 aacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  20766181 aacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 20766095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 40725871 - 40726037
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||  || |||||| ||||  || ||||| |||||||||||  | | |||| ||||||     
T  40725871 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaag-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 40725969  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  40725970 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 40726037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 140
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37724050
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||| || |||||||||  || ||| |||| |    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattaaattcatcaacat 37724018  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgca 140  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  37724019 ctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 37724050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026945
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-ccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21293071 - 21292992
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21293071 cttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatcaa 21292992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21329609 - 21329556
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21329609 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 21329556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418678
Alignment:
Q  2 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 90  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21502268 - 21502167
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  21502268 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaag 21502170  T
Q  99 tca 101  Q
    |||    
T  21502169 tca 21502167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22959639 - 22959538
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  22959639 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaac 22959541  T
Q  104 aac 106  Q
    |||    
T  22959540 aac 22959538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 20806898 - 20806845
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 54  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20806898 tcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagcgacac 20806845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178161
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| || ||||||| |||| ||||  |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatc 170  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  22178224 atctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 22178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17517313 - 17517169
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||  |||| |    
T  17517313 tcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaatcgcaatt 17517214  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 144  Q
    ||||||| ||| || ||||||   |||  |||||||||||| |||    
T  17517213 caacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacata 17517169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26012141 - 26011995
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||  | ||||||    
T  26012141 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatcaaatgtgaatcaaca 26012043  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    || ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  26012042 acatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 26011995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 276
Target Start/End: Original strand, 18743965 - 18744036
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaat 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  18743965 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaat 18744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19660940 - 19660894
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19660940 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 19660894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27183278 - 27183208
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  27183278 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 27183208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22884013 - 22883904
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||  |  ||||||||||||||||   |||||| ||||||  ||||||||||     
T  22884013 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttgaacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattacctaaaactttcatgtttacaccc 22883914  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  22883913 aaggccaatt 22883904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 36314596 - 36314639
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36314596 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 36314639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1628243 - 1628169
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  1628243 catataatacttcatcaatcattaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataatagttcatcaatcat 1628169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20917855 - 20917777
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20917855 atacatatactaattcatcaatcataaacaacataatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcata 20917777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740705
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26740705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 417
Target Start/End: Original strand, 11919 - 12012
Alignment:
Q  324 ctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||    || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  11919 ctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaagtccaatt 12012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 417
Target Start/End: Original strand, 25426193 - 25426286
Alignment:
Q  324 ctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||    || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  25426193 ctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaagtccaatt 25426286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 26704080 - 26704129
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 50  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26704080 tcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26704129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732892
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26732892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 26973813 - 26973862
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 50  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26973813 tcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26973862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 320 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43444106 - 43444009
Alignment:
Q  320 ataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||||    || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  43444106 ataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaagttatctacaactttcatgtttacaccaaagtccaatt 43444009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 264445 - 264377
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  264445 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 264377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 20909497 - 20909565
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||    
T  20909497 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaacc 20909565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21399968 - 21399896
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatc 277  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  21399968 catataataattcatcaaccatgaacaacatcatattcattaacatatacattcatataataattcatcaatc 21399896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 404
Target Start/End: Original strand, 23511127 - 23511223
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||| ||||||||| |   |||||| ||||||| ||||||||    
T  23511127 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaagccattaaaaagctaacttaattacctaaaacttttatgtttaca 23511223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Original strand, 19668912 - 19668951
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19668912 atcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaa 19668951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 551
Target Start/End: Original strand, 24473792 - 24473823
Alignment:
Q  520 tcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24473792 tcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 24473823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Original strand, 39245621 - 39245660
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39245621 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 39245660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Original strand, 39363869 - 39363908
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactca 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39363869 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 39363908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23280331 - 23280293
Alignment:
Q  368 aaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23280331 aaagctaacatcaatatctacaacttttgtgtttacacc 23280293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1220453 - 1220384
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  1220453 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 1220384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10778901 - 10778832
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  10778901 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 10778832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21074302 - 21074249
Alignment:
Q  324 ctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  21074302 ctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaaca 21074249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873350
Alignment:
Q  19 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaa 21873350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Original strand, 18356389 - 18356485
Alignment:
Q  67 aaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||| ||||   | |||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  18356389 aaacagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgcataaaacattatatcacattataa 18356485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 20753 - 21207
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20753 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20852  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20853 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 20952  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20953 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 21052  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  21053 tacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcttgtt 21152  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttt-tatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21153 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttctatttcaaattcgg 21207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 9248 - 9700
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9248 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtc 9347  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9348 aacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaaa 9447  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  9448 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacc 9546  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9547 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagagagctaacattcatacctacaactttcgtgtt 9646  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9647 tacacctaagaccaattctgtaccaataaataccagttttcatttcaaattcgg 9700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 13398 - 13851
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13398 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 13497  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13498 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 13597  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13598 tatacatgtaacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 13697  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13698 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagataacatttatacctacaacttttgtgtt 13797  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13798 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 13851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 328
Target Start/End: Original strand, 13878 - 13918
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaa 328  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  13878 attcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaa 13918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 136686 - 137138
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136686 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 136785  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  136786 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 136885  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  136886 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 136984  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  136985 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 137084  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  137085 tacacttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 137138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 139155 - 139607
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139155 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 139254  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  139255 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 139354  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  139355 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 139453  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  139454 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 139553  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  139554 tacacttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 139607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 144093 - 144545
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144093 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 144192  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  144193 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 144292  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  144293 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 144391  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  144392 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 144491  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  144492 tacacttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 144545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 134217 - 134669
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134217 tcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 134316  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  134317 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 134416  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  134417 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 134515  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  134516 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 134615  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  134616 tacacttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 134669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 141624 - 142076
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141624 tcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 141723  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  141724 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcata 141823  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  141824 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 141922  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  141923 tacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtt 142022  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  142023 tacacttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 142076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Original strand, 132672 - 132784
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| || ||||| | || |||||| |||| || ||| |    
T  132672 atcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatgtaa-tcatc 132770  T
Q  104 aacgtctcaattat 117  Q
    ||||||||||||||    
T  132771 aacgtctcaattat 132784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 96
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62303
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca 62303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 40406 - 40858
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40406 tcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaagtc 40505  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  40506 aacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacttcata 40605  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40606 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactctgacc 40704  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  40705 tacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatatctacaactttcgtgtt 40804  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40805 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttaatttcaaattcgg 40858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 417
Target Start/End: Original strand, 37848 - 37968
Alignment:
Q  296 tgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaactttt 395  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||| ||||||||||||   || ||| ||||||     
T  37848 tgacctatgtgtagtaatttgatcataactcaagttcta-aaatcatttggaagtcaaaccaaagccatttgaaagctaacataattatctaaaactttc 37946  T
Q  396 gtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
     |||||||||| ||| ||||||    
T  37947 atgtttacaccaaaggccaatt 37968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 328
Target Start/End: Original strand, 40885 - 40925
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaa 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40885 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaa 40925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38814 - 38262
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  38814 tcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaag 38716  T
Q  99 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc 197  Q
    ||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38715 tcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc 38616  T
Q  198 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||    
T  38615 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcaatatg 38516  T
Q  298 acctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgt 397  Q
    ||  || |  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38515 acaaacatacagtaatttgaacataactcaaattctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 38416  T
Q  398 gtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattat 497  Q
    |||||  ||||||| ||||| | |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38415 gtttagccctaagatcaattctttacggatcaatactaatttttatttcaaattcggggcagagatgaaaagagaaatcagaaaaagcaacctatattat 38316  T
Q  498 tcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38315 tcaacttcacttttattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 38262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 10779 - 11134
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10779 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtc 10878  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10879 aacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 10978  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  10979 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacc 11077  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11078 tacatgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 11134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 454
Target Start/End: Original strand, 1 - 35
Alignment:
Q  420 gtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1 gtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Original strand, 501090 - 501522
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  501090 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 501189  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  501190 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatagtaatcaacatcttaaaacattata 501289  T
Q  201 tatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacc 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||| ||||||||||||||||    
T  501290 tatacatataacacatcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata-------------------catattcaattattcactgtgacc 501370  T
Q  301 tacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  501371 tacgtgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatctat-cctacaactttcgtgtt 501469  T
Q  401 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcg 453  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  501470 tacacataagaccaattctgtaacaatcaatatcacttttcatttcaaattcg 501522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 501550 - 501813
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  501550 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 501649  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  501650 caactttcgtgtttacacctaagaccagttcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 501749  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501750 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 501813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 85736 - 85562
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85736 tcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 85637  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  85636 aatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 85562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 160698 - 160864
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  160698 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaac 160795  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    ||| | |||| || ||| | |||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  160796 aacatgtcaaata-tcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaa 160864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 205 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 129
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  476 catataacactttatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcactgtgacctacg 377  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  376 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctataactttcttgtttaca 277  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatag-aaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaact 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  276 cctaagaccatttatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaaattagaaaaagcaacctatattattcaact 177  T
Q  504 tcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176 tcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12405 - 12194
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12405 tcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtc 12306  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305 aacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcata 12206  T
Q  201 tatacatataac 212  Q
    ||||||||||||    
T  12205 tatacatataac 12194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 507
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  582 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 118 - 454
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6405
Alignment:
Q  118 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6070 tcacatataattcaagtaatgcatatgcaattaaatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttc 6169  T
Q  218 atcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttga 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6170 atcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttga 6268  T
Q  318 ctataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6269 ctataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 6368  T
Q  418 atgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6369 ctgtaccaatgaataccagttttcatttcaaattcgg 6405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 18423 - 18686
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18423 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatgacattagaaagctaacatccataccta 18522  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18523 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 18622  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18623 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 18686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 454
Target Start/End: Original strand, 18352 - 18396
Alignment:
Q  410 gaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18352 gaccatttctgtaccaatcaatgccagttttcatttcaaattcgg 18396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 158 - 452
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3480
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3186 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatctacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaacatatacata 3285  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3286 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacca 3385  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3386 acggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacaactaagaacaattatgtaacaatcaataccagttttcatttcaaattc 3480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 291 - 551
Target Start/End: Original strand, 8421 - 8681
Alignment:
Q  291 cactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaa 390  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8421 cactgtgacctacgtgcagtaatttcaccataactcaagttgtataaatctttttgacgtcataccaatggaattagaaagctaacatccatatctacaa 8520  T
Q  391 cttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacct 490  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8521 cttttgtgtttacacgtaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttccatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaattagaaaaagcaacct 8620  T
Q  491 atattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8621 atattattcaacttcacattcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 8681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 252 - 452
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8196
Alignment:
Q  252 tacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtc 351  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7996 tacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataattcaaattctataaatccttttgaagtc 8095  T
Q  352 aaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8096 aaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtactaatcaataccagttttcatttcaaatt 8195  T
Q  452 c 452  Q
    |    
T  8196 c 8196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 8225 - 8391
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||    
T  8225 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcaaaccaaggggattagaaagctaacatccatatcta 8324  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8325 caacttttgtgtttacacctaagaccagttatgtaccaatcaataccagttttcatttcacattcgg 8391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5803
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||  |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 5755  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  5756 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 5803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 158 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 4304 - 4006
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  4304 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatataatattcacaaacatataca 4205  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4204 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacccacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaac 4105  T
Q  356 cattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4104 caacgacattagaaagctaacatccatacctacacctttcatgtttacacctatgaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 4006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3979 - 3813
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3979 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagtttcataaatcgttttgacatcagaccaacggaattagaaagctaacatcaataccta 3880  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3879 caactttcgtgtttccacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 3813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 292 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3782 - 3620
Alignment:
Q  292 actgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaac 391  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3782 actgtgacctacgttcagtaatttgagcataactcaagttacataaatcgttttgacctcataccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaac 3683  T
Q  392 ttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3682 tttcatgtttacagctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3541
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatc 340  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3593 attcacagtgacctacgtgcagtattttgaccataactcaagttctataaatc 3541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 30505 - 30768
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30505 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactaaagttttataaatcgttttgacgtcacaccaatggcattggaaagctaacatccataccta 30604  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  30605 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggagcagagatgaaaagaaaaatatgaaaaagcaa 30704  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30705 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 30768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Original strand, 30229 - 30478
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30229 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 30328  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30329 tgcagtaatttgaccataactcaagtactacaaatccttttgaagtgaaaccaacggtattagaaagctaacatccatacctacaactttaatgtttaca 30428  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30429 ccgaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaaatcgg 30478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 278
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30196
Alignment:
Q  9 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgt 30045  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||    
T  30046 ctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catcatatatacata 30126  T
Q  209 taacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatca 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30127 taacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaagcatatacatacatatactaattcatcaatca 30196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 460 - 551
Target Start/End: Original strand, 34154 - 34245
Alignment:
Q  460 agatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34154 agatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 34245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 6937 - 7200
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  6937 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 7036  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7037 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatagcaattttcatttcatattcgggacagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 7136  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7137 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaaatatcactcttaaccctaattct 7200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 216 - 454
Target Start/End: Original strand, 6682 - 6910
Alignment:
Q  216 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaattt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6682 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaattt 6771  T
Q  316 gactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaa 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6772 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 6871  T
Q  416 ttatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6872 ttctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 6910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 158 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6937 - 6639
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6937 atataacaacattaaatgatactcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatagtattcacaaacatataca 6838  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  6837 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcggac 6738  T
Q  356 cattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6737 caacggcattggaaatctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccaattttcatttcaaattcgg 6639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6612 - 6350
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  6612 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaacggcattagaaaactaacatccataccta 6513  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  6512 caactttcgtgtttacagctaagaccaattctggacctatcaataccacatttcatttcaaattcggggcggagatgaa-aaaaaattcagaaaaagcaa 6414  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6413 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 6350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 1740 - 2003
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  1740 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 1839  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1840 caactttcttgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcagggcagagatgaaaagaaaaatcag-aaaagcaa 1938  T
Q  488 cctatattattcaac-ttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1939 cctatattattcaactttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctgattct 2003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 375 - 454
Target Start/End: Original strand, 1634 - 1713
Alignment:
Q  375 acatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1634 acatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccaattttcatttcaaattcgg 1713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 205 - 454
Target Start/End: Original strand, 799 - 1048
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  799 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatacaaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 898  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  899 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaataattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttact 998  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  999 cctaagacgaatgctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 320 - 551
Target Start/End: Original strand, 1227 - 1457
Alignment:
Q  320 ataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattat 419  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1227 ataactcaagttctataaatcgtttagacgtcagaccaacggcat-agaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattct 1325  T
Q  420 gtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaa 519  Q
    | ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326 ggacctatcaatatgagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaatgaaaaatcagaaaaagcaacatatattattcaacttcactttcattcaaaa 1425  T
Q  520 tcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1426 tcatcacaatcatcactcttaaccataattct 1457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 288 - 437
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1224
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1075 attcactatgacctgcgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacatcagaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 1174  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1175 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagt 1224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Original strand, 645 - 768
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  645 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 743  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    
T  744 tacatatactaattaatcaatcata 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 205 - 452
Target Start/End: Original strand, 10001 - 10248
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10001 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacacacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctaca 10100  T
Q  305 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 404  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10101 tgaaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 10200  T
Q  405 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10201 cctaagaccaacactgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattc 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 10470 - 10733
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  10470 attcattgtgacctacatgcagtaatttgaccataacgcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggtattagaaagctaacatccataccta 10569  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||    
T  10570 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatggacctatcaataccagatttcagttcaaatttggggcaaacatgaaaagaaaaataagaaaaaacaa 10669  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10670 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcgtcactcttaagcctaattct 10733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 288 - 452
Target Start/End: Original strand, 10277 - 10441
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  10277 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatcgttttgatgtcagaccaacggcattagaaatctaacatccataccta 10376  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10377 caactttcgtgttgacacataagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcattttaaattc 10441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 280
Target Start/End: Original strand, 9936 - 9970
Alignment:
Q  246 aacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9936 aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 9970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 43225 - 43487
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  43225 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 43324  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43325 caacttttgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatca-aaaaagcaa 43423  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43424 cccatattattcaactccactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 43487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 258 - 454
Target Start/End: Original strand, 43002 - 43198
Alignment:
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43002 catatactaattcatcaatcatattcagttattcactgtgacctacgtgcactaatttgactataactcaagttctataaacccttttgaagtcaaacca 43101  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
      || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43102 acggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaaaaatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 43198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 213 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13379
Alignment:
Q  213 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  13571 acttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcattgtgacctacgttcagtaa 13472  T
Q  313 tttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacac 405  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13471 tttgaccataactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagtaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 460 - 551
Target Start/End: Original strand, 20502 - 20593
Alignment:
Q  460 agatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502 agatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 20593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 158 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 53873 - 53612
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53873 atataacaacatcaaatgataatcaacatctacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatataatattcacaaacatataca 53774  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 355  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  53773 tacatatactaatttatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccatatctcaagttctataaatccctttgacgtcaaac 53674  T
Q  356 cattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 417  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  53673 caatggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacagctaagaccaatt 53612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 116436 - 116571
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  116436 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaatgcaagtc 116534  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    |||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  116535 aacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128907
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | ||||  |  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
    ||||||  | ||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  128973 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78505
Alignment:
Q  15 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
    |||    ||   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  78443 caaca--tcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 78505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 4)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 204 - 451
Target Start/End: Original strand, 416 - 663
Alignment:
Q  204 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  416 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacttacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctac 515  T
Q  304 gtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttac 403  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  516 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatctatacctacaacttttgtgtttac 615  T
Q  404 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    |||| |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  616 accttagactaattctatatcaataaataccagttttcatttcaaatt 663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Original strand, 853 - 1107
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||    
T  853 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatatcta 952  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||          ||    
T  953 caacttttgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaat---------aaa 1043  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1044 cctatattatgcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 1107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Original strand, 693 - 779
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagcta 374  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  693 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagcta 779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 454
Target Start/End: Original strand, 782 - 826
Alignment:
Q  410 gaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  782 gaccaattttgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcgg 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 158 - 425
Target Start/End: Original strand, 15083 - 15352
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15083 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatagtattcacaaacatataaa 15182  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  15183 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagac 15282  T
Q  356 cattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtacca 425  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  15283 cagcggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtggttacacctaagaccaaatctgtacca 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 288 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11016 - 10753
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  11016 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaacggcattagaaaactaacatccataccta 10917  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt-cggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagca 486  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  10916 caactttcgtgtttacagctaagaccaattctggacctatcaataccacatttcatttcaaattccggggcggagatgaa-aaaaaattcagaaaaagca 10818  T
Q  487 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10817 acctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 10753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 288 - 534
Target Start/End: Original strand, 15398 - 15643
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15398 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgatgtcagaccaacgacattagaaagctaacgtccataccta 15497  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaa 487  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15498 caactttcgtgtttacac-taagaccaattctggacctattaataccagatttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaa 15596  T
Q  488 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatca 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15597 cctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatca 15643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 246 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 11251 - 11043
Alignment:
Q  246 aacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcatttt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11251 aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagtactataaatcgtttt 11152  T
Q  346 gaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttattt 445  Q
    || |||  ||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11151 gacgtcggaccaacggcattggaaatctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccaattttcattt 11052  T
Q  446 caaattcgg 454  Q
    |||||||||    
T  11051 caaattcgg 11043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 9755 - 10016
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9755 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagtgcaagtc 9854  T
Q  101 aacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                   | ||||    
T  9855 aacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------cgtcat 9935  T
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9936 atatacatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcacaaacttatacatacatatactaactcatcaatcata 10016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 32951 - 33107
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32951 tcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 33049  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  33050 taacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 33107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 38770 - 38926
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38770 tcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaaat 38868  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38869 aaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 278
Target Start/End: Original strand, 10005 - 10067
Alignment:
Q  216 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatca 278  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10005 tcatcaatcataaacaacatcgtactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatca 10067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 158 - 394
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1827
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1591 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataaata 1690  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    |||||| |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1691 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacca 1790  T
Q  358 ttggaattagaaagctaacatccatacctacaacttt 394  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1791 acggcattagaaagctaacatccatacctacaacttt 1827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 82078 - 82264
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  82078 tcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatc 82177  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  82178 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 82264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22677 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 158606 - 158433
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158606 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 158507  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  158506 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 158433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 340053 - 339905
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340053 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-acaacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat-caagtcaacaa 339957  T
Q  106 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    | |||||| ||| ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  339956 catctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 339905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 112 - 298
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  112 tcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatc 211  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  212 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 16790 - 16963
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16790 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 16889  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16890 aacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 16963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 4303 - 4476
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4303 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaaatc 4402  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4403 aacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaat 4476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 12070 - 12250
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12070 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacagcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 12163  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12164 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 12250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 261 - 454
Target Start/End: Original strand, 68227 - 68420
Alignment:
Q  261 atactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattg 360  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  68227 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatg 68326  T
Q  361 gaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  68327 gcactagaaagctaacatccatacatacaactttcgtgtttacacataagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 68420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 47014 - 47093
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| |||   | ||||||||||||||||||||||    
T  47014 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttac---agcagcatgacataataatatcaa 47093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1437 - 1250
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1437 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatgagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 1338  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 187  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1337 aatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79267
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtct 79331  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  79330 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataacaacatcaaat 79267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17329 - 17170
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaa--cagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17329 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17230  T
Q  98 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  17229 gtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 17170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20363
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 20426  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20425 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-aacatcaaat 20363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 128760 - 128916
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128760 tcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 128859  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  128860 aacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 128916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 4220 - 4393
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacacagcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 4319  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4320 aatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaat 4393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 374 - 551
Target Start/End: Original strand, 398 - 575
Alignment:
Q  374 aacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaa 473  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  398 aacatccatacgtacgactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagattttatttcaaattcggggcatagatgaaaagaaaa 497  T
Q  474 atcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  498 atgagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaataatcacaatcatcactcttaaccctaattct 575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 140
Target Start/End: Original strand, 174785 - 174913
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||   ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |    
T  174785 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacat 174881  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgca 140  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  174882 ctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 174913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 121775 - 121827
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  121775 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca 121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124751
Alignment:
Q  81 aataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 124751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2283 - 2111
Alignment:
Q  3 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2283 ttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 2184  T
Q  103 -caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2183 ttaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 2111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18130 - 17964
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  18130 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 18032  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18031 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 17964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 289 - 452
Target Start/End: Original strand, 17947 - 18110
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17947 ttcactgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaatggtattagaaagctaacatccatacctac 18046  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18047 aacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 18110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 161246 - 161072
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  161246 tcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacacagcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagtc 161147  T
Q  101 aa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  161146 aatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaatatcaaat 161072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164573
Alignment:
Q  74 atgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 164575  T
Q  173 at 174  Q
    ||    
T  164574 at 164573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 5)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 289 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7558 - 7395
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7558 ttcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgatgtcagaccaacggtattagaaagctaacatccatacctac 7459  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcg 453  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7458 aacttttgtgtttacacccaagaccaattctgtaccaatcaataccag-tttcatttcaaattcg 7395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 462 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 7079 - 6990
Alignment:
Q  462 atgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079 atgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaatttcacttttattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 6990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7367 - 7201
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||  |  ||||||| | ||||||  |||||||    
T  7367 attcactgtgacctacgtgcaataatttgaccataactcaagttttataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaggataacatttataccta 7268  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  7267 caactttcgtgtttacacctaagacatattctttaccaatcaataccagattgcatttcaaattcgg 7201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7172 - 7079
Alignment:
Q  290 tcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccata 383  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||  || |||||||||||||||||||||    
T  7172 tcactgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacggcagagcaacggcattagaaagctaacatccata 7079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7621 - 7586
Alignment:
Q  419 tgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7621 tgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 7586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 22892 - 23048
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 22991  T
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22992 aacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Original strand, 39626 - 39791
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39626 ttcactgtgacctacgtgtaataatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgttagaccaatggcattagaaagctaacatccataactac 39725  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39726 aacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 39791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Original strand, 31497 - 31662
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  31497 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacattaatacctac 31596  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31597 aactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 31662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 289 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19957 - 19792
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19957 ttcactatgacctacgtgtagtaatttgacgataactcaagttatataattcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacatccatacctac 19858  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19857 aacttttgcgtttacacctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 222 - 379
Target Start/End: Original strand, 57708 - 57865
Alignment:
Q  222 atcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacctacgtgaagtaatttgactat 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  57708 atcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcactcatattcaagtattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccat 57807  T
Q  322 aactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatc 379  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  57808 aactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatc 57865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 289 - 452
Target Start/End: Original strand, 33465 - 33628
Alignment:
Q  289 ttcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctac 388  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||  |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  33465 ttcaccgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgtttttacgtcagaccaacgacattagaaatctaacatccatacctac 33564  T
Q  389 aacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33565 aacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 33628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18265 - 18176
Alignment:
Q  84 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaat-ataacaacatcaaa 173  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  18265 aatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaa 18176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Original strand, 12954 - 13054
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  12954 tcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 13052  T
Q  105 ac 106  Q
    ||    
T  13053 ac 13054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 8311 - 8477
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  8311 attcactgtgaccaacgtgcagtaattttaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatagcattagaaagctaacatccataccta 8410  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8411 caactttcatgtttacacctaagagcaattctataccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgg 8477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Original strand, 60576 - 60685
Alignment:
Q  442 atttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaa 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60576 atttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaa 60675  T
Q  542 ccctaattct 551  Q
    ||||||||||    
T  60676 ccctaattct 60685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 44819 - 44682
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44819 tcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 44720  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 137  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  44719 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26177 - 26020
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26177 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaatt 26078  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  26077 caacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 26020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 437 - 551
Target Start/End: Original strand, 7419 - 7533
Alignment:
Q  437 tttttatttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcact 536  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7419 ttttcatttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaatagcaacctatattactcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcact 7518  T
Q  537 cttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||    
T  7519 cttaaccctaattct 7533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3106
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3262 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagt 3164  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3163 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 3106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Original strand, 107115 - 107224
Alignment:
Q  442 atttcaaattcggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaa 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  107115 atttcaaattcggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaatttcactttcattcaaaatcaccacaatcatcactcttaa 107214  T
Q  542 ccctaattct 551  Q
    ||||||||||    
T  107215 ccctaattct 107224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15953 - 15910
Alignment:
Q  363 attagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15953 attagaaagctaacttccatacctacaacttttatgtgtacacc 15910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 110174 - 110065
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||  |  |||||||||||||| |   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  110174 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaatcaaagccattagaaagctaacgtaattatctaaaactttcatgtttacacca 110075  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  110074 aaggccaatt 110065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 118675 - 118566
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||  |  |||||||||||||| |   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  118675 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaatcaaagccattagaaagctaacgtaattatctaaaactttcatgtttacacca 118576  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  118575 aaggccaatt 118566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 4522 - 4673
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522 atcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 4620  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4621 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 4673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 12104 - 12255
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12104 atcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 12202  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12203 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 22056 - 22207
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22056 atcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 22154  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22155 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 51922 - 52085
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51922 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 52021  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 163  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  52022 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataa 52085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 168083 - 167948
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  168083 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 167984  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
     ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  167983 atcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata 167948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 340
Target Start/End: Original strand, 28048 - 28186
Alignment:
Q  202 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattcactgtgacct 301  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28048 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 28147  T
Q  302 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28148 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatc 28186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 280
Target Start/End: Original strand, 27958 - 28073
Alignment:
Q  164 caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 263  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27958 caacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatata 28056  T
Q  264 ctaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||| |||||||||    
T  28057 ctaattcatcaatcata 28073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15568 - 15420
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  15568 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatcaac 15470  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| |  |||  | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15469 atcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcataaat-attatatcaca 15420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43359 - 43261
Alignment:
Q  453 ggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43359 ggggcagagatgaaaagaaaaatcagaaaaagcaacctatattattcaacttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 43261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24257
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||     
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 24257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 373 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 75689 - 75608
Alignment:
Q  373 taacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  75689 taacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcgg 75608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16712 - 16555
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16712 tcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagt 16613  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||| | |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16612 caacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 13220 - 13377
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13220 tcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 13319  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13320 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 13377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 39486 - 39642
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 39584  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  39585 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 39642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 75326 - 75170
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75326 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 75228  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  75227 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 75170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3298 - 3141
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  3298 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaatt 3199  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  3198 caacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 3141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 1860 - 2017
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1860 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaatt 1959  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  1960 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 551
Target Start/End: Original strand, 184978 - 185018
Alignment:
Q  511 cattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  184978 cattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 185018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 296 - 531
Target Start/End: Original strand, 113317 - 113550
Alignment:
Q  296 tgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaactttt 395  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |  ||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  113317 tgacctacgtttagtaatttgaccataactcaagttctaaaactcattttggagtcaaaccaacgtcattagaaatgtaacatccatacctacaacttcc 113416  T
Q  396 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc-ggggcagagatgaatagaaaaatcagaaaaagcaacctatat 494  Q
     |||||||| | ||| |||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||| ||| |||||||||| ||  |    
T  113417 atgtttacatcaaaggccaaatccgcaccgatcaataccagtttttatttcaaattcgggggtagagatga----aaaagtcaaaaaaagcaacttaact 113512  T
Q  495 tattc-aacttcactttcattcaaaatcatcacaatca 531  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  113513 tattcaaacttcacattcattcaaaatcatcacaatca 113550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206584
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1153 - 1018
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  1153 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 1054  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
     ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1053 atcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata 1018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 37068 - 36905
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  37068 attcactatgatctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 36969  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaatt 451  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| |||| | | ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  36968 caactttcgtgtttacatctatgactaatttttttccaatcaatattagttttcatttcaaatt 36905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 288 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 36875 - 36749
Alignment:
Q  288 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccataccta 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     ||||||||| |||||||||||||||    
T  36875 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacaacattagaaagttaacatccataccta 36776  T
Q  388 caacttttgtgtttacacctaagacca 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36775 caactttcgtgtttacacctaagacca 36749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 503 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36740 - 36692
Alignment:
Q  503 ttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36740 ttcactttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 36692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10886 - 10765
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 257  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10886 atataacaacatcaaataatactcaacattttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaattatggacagtatcgtattcac-aacatatacata 10788  T
Q  258 catatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  10787 catatactaattcatcaatcata 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10734 - 10647
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcatattctattattca 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10734 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattca 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 4865 - 5015
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4865 caacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaac 4964  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4965 atcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 3479 - 3636
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  3479 tcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 3578  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3579 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcaca 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 352 - 508
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||    
T  352 tctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatac-aaaatagcatgacgtaataatatcaattggaagt 450  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || |||||   |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  451 caacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33068 - 32913
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  33068 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 32970  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  32969 caacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 32913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 45937 - 46092
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  45937 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 46035  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  46036 caacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 46092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 16122 - 16278
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||     
T  16122 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaagc 16221  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcac 156  Q
    ||||| | |||||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16222 caacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcac 16278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 17441 - 17388
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 54  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17441 tcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacac 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 25905 - 26061
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25905 tcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaagt 26003  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  26004 aaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 26061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 39867 - 40023
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39867 tcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaagt 39965  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
     |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  39966 aaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 40023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatata--attatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 6549 - 6695
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  6549 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 6647  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  6648 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8641 - 8472
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8641 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 8546  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 172  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8545 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15273 - 15150
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  15273 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcgc-aacatataca 15175  T
Q  256 tacatatactaattcgtcaatcata 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  15174 tacatatactaattcatcaatcata 15150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15350 - 15298
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15350 tcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaaca 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15119 - 15070
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15119 catataacacttcatcaattatgaacaatatagtattcacaaacatatac 15070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1402
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  1308 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatcaaattcaattcatcaac 1402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 7285 - 7379
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  7285 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatcaaattcaattcatcaac 7379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6236 - 6076
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 96  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6236 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgca 6137  T
Q  97 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    | ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  6136 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 6076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27686
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | | ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 174  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 27686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 28423 - 28529
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28423 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaatt 28522  T
Q  100 caacaac 106  Q
    |||||||    
T  28523 caacaac 28529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 11308 - 11407
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  11308 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Original strand, 2013 - 2050
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2013 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Original strand, 4568 - 4605
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4568 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3586 - 3485
Alignment:
Q  56 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  3586 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatatca 3487  T
Q  156 ca 157  Q
    ||    
T  3486 ca 3485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8628
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8488 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaattgcaagt 8587  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 140  Q
    ||||||| ||| ||  |||||  | || |||||||||||||    
T  8588 caacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgca 8628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36065 - 35955
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacac-ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 256  Q
    |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36065 atataagaacatcaaaaaataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacactttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacat 35967  T
Q  257 acatatactaat 268  Q
    ||||||||||||    
T  35966 acatatactaat 35955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23989 - 23898
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  23989 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53486
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53552 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 53486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13165
Alignment:
Q  79 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattata 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatatataattata 13165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2103
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  1971 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaattcaacaacatc 2070  T
Q  110 tcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  2071 ttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 11482 - 11648
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |||| ||||||     
T  11482 acttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 11580  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11581 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 11648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13313
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  109 ctcaatt-attcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 174  Q
    || ||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 13313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16037
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||  ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 174  Q
    || ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 16037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38359 - 38193
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |||| ||||||     
T  38359 acttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 38261  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38260 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 38193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 39922 - 40078
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  39922 tcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcatgt 40020  T
Q  100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||| ||| ||| || ||||    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  40021 caataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 40078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19883
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| || ||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  107 gtctca 112  Q
     |||||    
T  19888 atctca 19883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12751
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    ||||| || | | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 12751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 172
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13274
Alignment:
Q  44 aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  143 tataattatatcacaatataa-caacatcaa 172  Q
    ||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaa 13274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 282 - 329
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 48  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  282 tcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 34139 - 34238
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  34139 caacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac-aacccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 34237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 174
Target Start/End: Original strand, 225482 - 225590
Alignment:
Q  66 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aac 164  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  225482 aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 225580  T
Q  165 aacatcaaat 174  Q
    ||||||||||    
T  225581 aacatcaaat 225590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4803
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataa 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4728 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1327 - 1215
Alignment:
Q  158 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| || |    
T  1327 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcttattctc-aacatttata 1229  T
Q  256 tacatatactaatt 269  Q
    | ||||||||||||    
T  1228 ttcatatactaatt 1215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1173 - 1143
Alignment:
Q  205 catataacacttcatcaatcatgaacaatat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1173 catataacacttcatcaatcatgaacaatat 1143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10528 - 10381
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  10528 caacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaa 10432  T
Q  106 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    | ||| || ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10431 catcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 10381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10481
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  105 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  10548 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 13513 - 13596
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  13513 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatcaa 13596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11548 - 11464
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11548 caacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Original strand, 32083 - 32216
Alignment:
Q  8 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  32083 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatcaac 32180  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
     ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  32181 atcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 12039 - 12112
Alignment:
Q  101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12039 aacaacgcctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacagtatcaaat 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12042
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaaca 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtataccaaaaca 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27996
Alignment:
Q  72 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 27996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60652
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||  |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaac 60721  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca-atataacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  60720 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaat 60652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130066
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 130017  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  130018 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 130066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7996
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || || |||||| ||||  ||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||| |    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaat-cagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    || ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8062 cttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaat 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 15670 - 15776
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||| ||     
T  15670 tcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaa 15768  T
Q  99 tcaacaac 106  Q
    ||||||||    
T  15769 tcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 19278 - 19424
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  19278 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 19376  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19377 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 19424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6220
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||  |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaat-ataacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6287 atctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaat 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 45899 - 45732
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |||||| |    
T  45899 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatc 45801  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 172  Q
    ||| ||||||||| ||| | |||||||| || ||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  45800 aacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 20928 - 21077
Alignment:
Q  10 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 107  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  20928 acttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaaca 21027  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||| |  |||||| || |  | ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21028 tcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcaca 21077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25289
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  103 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
    |||| ||||||  | ||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25219 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattattacaacatcaaat 25289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 278
Target Start/End: Original strand, 16263 - 16326
Alignment:
Q  215 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatca 278  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  16263 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatca 16326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Original strand, 620 - 720
Alignment:
Q  73 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 171  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  172 aat 174  Q
    |||    
T  718 aat 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1171 - 1011
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||      
T  1171 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaac-catcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac-- 1075  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 174  Q
     |||||||| || |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1074 -tcaattat-cagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 1011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32118
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||  |  |||||||||||||| |   |||||| ||||||  ||||||||||    
T  32216 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 32118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 6235 - 6134
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  6235 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 6137  T
Q  99 tca 101  Q
    |||    
T  6136 tca 6134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4675
Alignment:
Q  13 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||  || |||||||| |||     
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  112 aattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
    || ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcata 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 143 - 290
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  143 atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 241  T
Q  104 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  242 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2913 - 2805
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  2913 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 2815  T
Q  104 aacgtctcaa 113  Q
    ||| ||||||    
T  2814 aacatctcaa 2805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 3524 - 3569
Alignment:
Q  506 actttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3524 actttcattcaaaatcatcacaatcatcactcttaaccctaattct 3569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14804 - 14696
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| | |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  14804 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaac 14706  T
Q  104 aacgtctcaa 113  Q
    ||| ||||||    
T  14705 aacatctcaa 14696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97190
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  97123 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 97190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106468
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  106401 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 106468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 93
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1134
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaat 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1135
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1091 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 1146 - 1102
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1146 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 6620 - 6664
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6620 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 14000 - 14044
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14000 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 14044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 32551 - 32657
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  32551 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaaca 32648  T
Q  105 acgtctcaa 113  Q
    || ||||||    
T  32649 acatctcaa 32657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51839
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |     
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagca-cataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatc-aatgcaagccaacaatca 51888  T
Q  108 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata-cattatatcaca 51839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Original strand, 79003 - 79073
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  79003 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaagcaattagaaagctaacat 79073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Original strand, 39965 - 40035
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||| ||||    
T  39965 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtaaaaccaaagccattagaaagctgacat 40035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Original strand, 45448 - 45518
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacat 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||    
T  45448 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaattatttggaagtaaaaccaaagccattagaaagctaacat 45518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 15889 - 15845
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 178903 - 178952
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 50  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  178903 tcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 178952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 16301 - 16395
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  16301 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaac 16395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 918
Alignment:
Q  68 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  1006 aacagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 4945 - 4893
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 53  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4945 tcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 4893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6305 - 6196
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  6305 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttagaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctataactttcatgtttacacca 6206  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  6205 aaggccaatt 6196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8176
Alignment:
Q  66 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 153  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 106
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6927
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaac 6924  T
Q  104 aac 106  Q
    |||    
T  6925 aac 6927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 2752 - 2713
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2752 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38483
Alignment:
Q  15 gaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  111 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 157  Q
    |||  | ||| |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  38438 caaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcaca 38483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 51601 - 51695
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||    
T  51601 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataacaaattcaattcatcaac 51695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 6675 - 6761
Alignment:
Q  56 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||| || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  6675 gcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8011
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||  ||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  103 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 174  Q
    |||| || |||    ||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  8081 caacatcacaa--catcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaat 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267844
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| | |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  107 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 174  Q
     ||||||    ||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  267778 atctcaaca--tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaat 267844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12590 - 12489
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  |  |||||||||||||||||   |||||||| ||||  ||| ||||||    
T  12590 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaacccaaagccattagaaagctaacatcttaacctacaatttttaggttaacacct 12491  T
Q  408 aa 409  Q
    ||    
T  12490 aa 12489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Original strand, 8566 - 8675
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  8566 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatctagaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 8665  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  8666 aaggccaatt 8675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 23848 - 23897
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23848 tcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Original strand, 32112 - 32224
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||| || ||| |    
T  32112 atcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaa-tcatc 32210  T
Q  104 aacgtctcaattat 117  Q
    ||||||||||||||    
T  32211 aacgtctcaattat 32224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Original strand, 30470 - 30579
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||   || ||| ||||||  ||||||||||     
T  30470 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 30569  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  30570 aaggccaatt 30579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 36459 - 36503
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36459 tcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10649
Alignment:
Q  7 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  105 acgtctcaa 113  Q
    || ||||||    
T  10641 acatctcaa 10649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Original strand, 40628 - 40726
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||  |  |||||||||||||| |   |||||| ||||||  ||||||||||    
T  40628 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 40726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Original strand, 12780 - 12819
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12780 atcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaa 12819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Original strand, 15282 - 15361
Alignment:
Q  200 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcgtcaatcat 279  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  15282 atattcatataataattcatcaatcatgaacaatatcatattcatcgacatatacattcaaataataattcatcaatcat 15361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 5230 - 5196
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5230 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 28877 - 28839
Alignment:
Q  6 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28877 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaaca 28839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 417
Target Start/End: Original strand, 725 - 834
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 407  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||  |  |||||||||||||| |   || ||||||||||  ||||||||||     
T  725 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcagaccaaagccattagaaagctaacgtaattatctacaactttcatgtttacacca 824  T
Q  408 aagaccaatt 417  Q
    ||| ||||||    
T  825 aagtccaatt 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 29563 - 29660
Alignment:
Q  1 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29563 tcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattgcaa 29660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1835 - 1735
Alignment:
Q  73 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 171  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    ||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||    
T  1835 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa--catcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtca 1738  T
Q  172 aat 174  Q
    |||    
T  1737 aat 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1021
Alignment:
Q  11 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||| |    
T  1151 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattatatcaatttcaattcatcaacat 1055  T
Q  109 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 142  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  1054 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 357
Target Start/End: Original strand, 15780 - 15827
Alignment:
Q  310 taatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 357  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15780 taatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaacca 15827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Original strand, 88 - 189
Alignment:
Q  73 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 171  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||    
T  88 catgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatataacattattaacaacatca 186  T
Q  172 aat 174  Q
    |||    
T  187 aat 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1365 - 1267
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacc 406  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||     |||||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||    
T  1365 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaaatcaaaccaaaaccattagaaagctaacacaattatctaaaacttttatgtttacacc 1267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1444
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| || |||||||||  |  |||||||||||||||    
T  1375 agtaatttgatcataactcaagttctaaaactcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7039 - 6970
Alignment:
Q  308 agtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaaca 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  7039 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 6970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University