View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16669_low_3 (Length: 520)

Name: NF16669_low_3
Description: NF16669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16669_low_3
NF16669_low_3
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (152-335)||(24253382-24253565)
chr5 (152-334)||(43326379-43326561)
chr5 (153-333)||(15398483-15398663)
chr5 (152-334)||(35626038-35626220)
chr5 (152-334)||(39932579-39932761)
chr5 (152-334)||(43262183-43262365)
chr5 (152-332)||(6901799-6901979)
chr5 (152-335)||(27501054-27501237)
chr5 (152-334)||(27938897-27939080)
chr5 (152-335)||(40886027-40886209)
chr5 (152-334)||(3466681-3466863)
chr5 (152-334)||(5184972-5185154)
chr5 (152-334)||(7722049-7722231)
chr5 (148-334)||(12648793-12648979)
chr5 (153-335)||(18479667-18479849)
chr5 (147-334)||(739704-739891)
chr5 (152-334)||(25831521-25831702)
chr5 (149-334)||(15683788-15683973)
chr5 (153-335)||(2484291-2484473)
chr5 (163-337)||(31938908-31939082)
chr5 (152-333)||(27278474-27278659)
chr5 (163-335)||(40278857-40279029)
chr5 (152-334)||(890906-891087)
chr5 (152-334)||(28424795-28424975)
chr5 (152-334)||(5137715-5137897)
chr5 (154-335)||(13504741-13504922)
chr5 (152-316)||(40110234-40110397)
chr5 (189-334)||(29789295-29789440)
chr5 (160-334)||(38756487-38756662)
chr5 (152-334)||(763723-763905)
chr5 (194-335)||(34451292-34451433)
chr5 (152-337)||(19295730-19295904)
chr5 (152-336)||(27503379-27503552)
chr5 (143-315)||(4149685-4149847)
chr5 (152-334)||(33617585-33617756)
chr5 (153-334)||(38015514-38015684)
chr5 (152-334)||(23195248-23195419)
chr5 (152-296)||(40632499-40632634)
chr5 (152-333)||(9424593-9424763)
chr5 (152-320)||(42658676-42658833)
chr5 (152-334)||(5497273-5497444)
chr5 (152-334)||(6973063-6973234)
chr5 (152-334)||(13957670-13957841)
chr5 (153-335)||(31293988-31294170)
chr5 (153-334)||(9374502-9374672)
chr5 (152-317)||(36365462-36365616)
chr5 (152-263)||(12558090-12558200)
chr5 (169-337)||(14971995-14972152)
chr5 (179-335)||(3656567-3656712)
chr5 (152-311)||(6206884-6207032)
chr5 (152-335)||(18327172-18327344)
chr5 (152-335)||(24167783-24167955)
chr5 (152-334)||(2585462-2585633)
chr5 (152-259)||(36472348-36472455)
chr5 (152-334)||(38637910-38638081)
chr5 (152-240)||(42247865-42247953)
chr5 (163-260)||(5120036-5120132)
chr5 (152-334)||(1402505-1402676)
chr5 (160-334)||(27390605-27390768)
chr5 (186-317)||(38492647-38492767)
chr5 (178-332)||(36948492-36948633)
chr5 (153-334)||(40686900-40687069)
chr5 (155-237)||(9171111-9171193)
chr5 (157-333)||(33623940-33624105)
chr5 (153-219)||(9527124-9527190)
chr5 (178-334)||(612757-612900)
chr5 (176-243)||(3940411-3940478)
chr5 (163-234)||(15300962-15301033)
chr5 (271-334)||(3940336-3940399)
chr5 (260-334)||(9171035-9171108)
chr5 (185-251)||(20207088-20207154)
chr5 (297-335)||(21785995-21786033)
chr5 (156-212)||(28756082-28756138)
chr5 (152-212)||(27584385-27584447)
[»] chr1 (107 HSPs)
chr1 (152-335)||(45538153-45538336)
chr1 (152-334)||(31308001-31308183)
chr1 (152-335)||(3611136-3611319)
chr1 (152-334)||(44661970-44662152)
chr1 (151-335)||(21139411-21139595)
chr1 (152-335)||(25678258-25678441)
chr1 (152-334)||(17994951-17995133)
chr1 (152-336)||(25058688-25058872)
chr1 (152-336)||(47671586-47671770)
chr1 (154-328)||(4068689-4068863)
chr1 (152-334)||(5981170-5981352)
chr1 (154-332)||(43251713-43251891)
chr1 (152-337)||(24245022-24245207)
chr1 (152-335)||(26277177-26277360)
chr1 (152-334)||(6327548-6327729)
chr1 (152-334)||(23984755-23984937)
chr1 (152-334)||(31040709-31040891)
chr1 (153-334)||(38790197-38790378)
chr1 (152-337)||(46967038-46967223)
chr1 (152-335)||(26085397-26085579)
chr1 (152-334)||(23932509-23932691)
chr1 (152-334)||(33112818-33112999)
chr1 (152-334)||(37620192-37620374)
chr1 (152-334)||(39646568-39646750)
chr1 (149-337)||(46784420-46784608)
chr1 (151-334)||(33884087-33884270)
chr1 (151-334)||(33959982-33960165)
chr1 (152-335)||(36566330-36566513)
chr1 (152-334)||(41999815-41999997)
chr1 (153-335)||(47317316-47317498)
chr1 (152-336)||(47383730-47383914)
chr1 (152-334)||(5980068-5980250)
chr1 (152-334)||(24885501-24885683)
chr1 (152-334)||(26524889-26525071)
chr1 (152-330)||(26794304-26794482)
chr1 (152-334)||(38331859-38332041)
chr1 (152-322)||(49253987-49254157)
chr1 (153-334)||(50774218-50774399)
chr1 (152-335)||(23220934-23221111)
chr1 (152-336)||(51057071-51057255)
chr1 (152-335)||(35273596-35273779)
chr1 (152-334)||(35692663-35692846)
chr1 (152-334)||(46616549-46616731)
chr1 (152-333)||(3285402-3285582)
chr1 (152-301)||(31844376-31844525)
chr1 (154-321)||(42863867-42864034)
chr1 (152-334)||(47187105-47187287)
chr1 (152-336)||(49398986-49399170)
chr1 (153-331)||(28888582-28888760)
chr1 (152-334)||(48373504-48373677)
chr1 (153-290)||(25518815-25518952)
chr1 (153-334)||(36003131-36003315)
chr1 (187-336)||(2450529-2450678)
chr1 (152-334)||(42313361-42313547)
chr1 (152-337)||(27983600-27983769)
chr1 (152-335)||(41467631-41467803)
chr1 (152-334)||(2657303-2657474)
chr1 (152-268)||(51403074-51403189)
chr1 (152-334)||(33073211-33073382)
chr1 (152-333)||(6626025-6626195)
chr1 (149-271)||(31979998-31980120)
chr1 (193-335)||(51045595-51045737)
chr1 (152-334)||(10928067-10928238)
chr1 (147-320)||(26472193-26472355)
chr1 (206-334)||(4808699-4808827)
chr1 (152-334)||(29770670-29770841)
chr1 (154-311)||(45475866-45476014)
chr1 (146-271)||(2556909-2557034)
chr1 (152-334)||(42234840-42235010)
chr1 (155-335)||(30289909-30290078)
chr1 (148-320)||(34752328-34752489)
chr1 (152-334)||(2954855-2955026)
chr1 (152-334)||(4243490-4243661)
chr1 (152-334)||(26685856-26686027)
chr1 (153-334)||(4953053-4953223)
chr1 (155-335)||(1388476-1388645)
chr1 (152-335)||(10920200-10920372)
chr1 (154-337)||(41895161-41895333)
chr1 (203-334)||(4156438-4156576)
chr1 (152-334)||(5961267-5961438)
chr1 (149-308)||(13281588-13281736)
chr1 (152-334)||(38716247-38716418)
chr1 (152-259)||(27924722-27924829)
chr1 (202-334)||(47772172-47772304)
chr1 (152-334)||(51155590-51155760)
chr1 (241-336)||(13312529-13312624)
chr1 (152-248)||(13313249-13313347)
chr1 (152-335)||(33187340-33187506)
chr1 (152-337)||(39475780-39475953)
chr1 (154-244)||(32448650-32448740)
chr1 (154-317)||(35991616-35991768)
chr1 (152-243)||(24649802-24649893)
chr1 (153-244)||(44544125-44544216)
chr1 (153-335)||(7561527-7561712)
chr1 (152-337)||(52323938-52324113)
chr1 (152-244)||(46428332-46428424)
chr1 (152-251)||(39637900-39637996)
chr1 (152-259)||(52367883-52367990)
chr1 (176-334)||(48683330-48683477)
chr1 (163-334)||(44293455-44293615)
chr1 (152-211)||(4156188-4156247)
chr1 (195-311)||(24215806-24215911)
chr1 (187-335)||(38718166-38718309)
chr1 (152-204)||(10919313-10919365)
chr1 (278-337)||(32448754-32448813)
chr1 (215-334)||(31286504-31286612)
chr1 (273-301)||(39359502-39359530)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (152-334)||(39556-39738)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (152-334)||(32984077-32984259)
chr8 (152-336)||(24079899-24080083)
chr8 (153-330)||(31830959-31831136)
chr8 (153-335)||(10646124-10646306)
chr8 (152-334)||(13356120-13356302)
chr8 (152-334)||(40435153-40435335)
chr8 (152-334)||(43328707-43328889)
chr8 (150-334)||(9303574-9303758)
chr8 (153-336)||(2714550-2714732)
chr8 (152-334)||(5946047-5946229)
chr8 (152-334)||(33730641-33730823)
chr8 (152-334)||(37956421-37956603)
chr8 (152-334)||(41862220-41862402)
chr8 (152-335)||(41653895-41654078)
chr8 (152-334)||(6365986-6366168)
chr8 (152-334)||(9734255-9734435)
chr8 (152-334)||(33981663-33981845)
chr8 (153-334)||(17718722-17718903)
chr8 (152-333)||(37301326-37301507)
chr8 (152-335)||(37419940-37420123)
chr8 (152-334)||(2275913-2276094)
chr8 (152-334)||(45236565-45236747)
chr8 (150-334)||(9013682-9013865)
chr8 (155-322)||(25185902-25186069)
chr8 (157-332)||(32114254-32114429)
chr8 (152-334)||(41231946-41232128)
chr8 (152-334)||(35628777-35628959)
chr8 (152-334)||(13760646-13760830)
chr8 (152-311)||(29048426-29048585)
chr8 (148-322)||(45066604-45066778)
chr8 (152-333)||(22878391-22878572)
chr8 (153-317)||(44088460-44088624)
chr8 (152-334)||(25248039-25248215)
chr8 (151-317)||(45258509-45258675)
chr8 (152-333)||(41639914-41640095)
chr8 (208-334)||(12032986-12033112)
chr8 (153-324)||(42701299-42701471)
chr8 (201-336)||(3904126-3904260)
chr8 (152-335)||(41843253-41843425)
chr8 (218-335)||(41981534-41981651)
chr8 (152-334)||(4447295-4447466)
chr8 (153-337)||(117326-117499)
chr8 (152-335)||(31940315-31940486)
chr8 (152-334)||(10378309-10378480)
chr8 (153-334)||(3211207-3211376)
chr8 (146-259)||(39915887-39916000)
chr8 (152-335)||(9713689-9713858)
chr8 (152-335)||(2379140-2379312)
chr8 (221-334)||(31336163-31336276)
chr8 (152-335)||(40458771-40458943)
chr8 (154-329)||(4975412-4975576)
chr8 (173-254)||(41981454-41981535)
chr8 (157-317)||(32373744-32373892)
chr8 (152-334)||(9509400-9509571)
chr8 (152-244)||(27243218-27243310)
chr8 (152-244)||(27254793-27254885)
chr8 (152-334)||(33896843-33897013)
chr8 (152-334)||(3490399-3490570)
chr8 (164-320)||(40649845-40649990)
chr8 (152-261)||(31148953-31149061)
chr8 (148-244)||(38631648-38631744)
chr8 (153-336)||(33622465-33622635)
chr8 (152-334)||(26196317-26196487)
chr8 (158-243)||(164728-164812)
chr8 (269-335)||(39901674-39901740)
chr8 (259-336)||(41425427-41425503)
chr8 (152-188)||(12032952-12032988)
chr8 (153-196)||(39901574-39901617)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (152-334)||(33839715-33839897)
chr7 (152-335)||(25893916-25894099)
chr7 (152-333)||(33423276-33423457)
chr7 (152-335)||(22979646-22979829)
chr7 (152-335)||(33695820-33696003)
chr7 (152-334)||(17855429-17855611)
chr7 (153-335)||(23393050-23393232)
chr7 (152-334)||(35355889-35356071)
chr7 (152-334)||(40670564-40670746)
chr7 (152-334)||(47066977-47067159)
chr7 (152-334)||(46913110-46913294)
chr7 (153-334)||(49171362-49171543)
chr7 (154-334)||(45690097-45690277)
chr7 (147-335)||(47740330-47740518)
chr7 (152-335)||(27018117-27018300)
chr7 (153-335)||(20165813-20165995)
chr7 (152-334)||(35328069-35328251)
chr7 (152-334)||(2341661-2341844)
chr7 (152-335)||(33411261-33411444)
chr7 (172-334)||(36389377-36389539)
chr7 (152-337)||(10028489-10028676)
chr7 (152-335)||(48609676-48609859)
chr7 (152-334)||(31586849-31587031)
chr7 (152-334)||(37846016-37846198)
chr7 (152-334)||(45482659-45482841)
chr7 (154-322)||(15877553-15877721)
chr7 (152-335)||(5712169-5712352)
chr7 (152-334)||(33332790-33332971)
chr7 (152-334)||(26579717-26579899)
chr7 (173-334)||(5183825-5183986)
chr7 (152-337)||(19563448-19563633)
chr7 (153-334)||(31625706-31625886)
chr7 (335-507)||(41405324-41405494)
chr7 (152-334)||(35757020-35757202)
chr7 (153-323)||(41990869-41991039)
chr7 (152-336)||(45063355-45063537)
chr7 (152-335)||(31429474-31429657)
chr7 (152-335)||(43499486-43499669)
chr7 (152-300)||(33720070-33720218)
chr7 (152-333)||(33870246-33870424)
chr7 (176-334)||(29446863-29447020)
chr7 (152-334)||(10618299-10618474)
chr7 (152-334)||(35767482-35767657)
chr7 (152-334)||(35752034-35752205)
chr7 (203-334)||(30076527-30076658)
chr7 (197-337)||(28233933-28234073)
chr7 (152-337)||(43489219-43489393)
chr7 (152-335)||(36816844-36817016)
chr7 (152-334)||(24923024-24923195)
chr7 (152-334)||(46817421-46817592)
chr7 (153-334)||(37127939-37128109)
chr7 (19-150)||(41405193-41405332)
chr7 (165-299)||(44564352-44564486)
chr7 (152-320)||(48085859-48086016)
chr7 (152-320)||(26941546-26941703)
chr7 (156-334)||(7876328-7876495)
chr7 (152-334)||(24228542-24228713)
chr7 (152-334)||(46898016-46898187)
chr7 (215-334)||(44405412-44405531)
chr7 (149-335)||(29098749-29098920)
chr7 (152-334)||(29610636-29610807)
chr7 (152-333)||(33393329-33393499)
chr7 (150-333)||(45502817-45502989)
chr7 (152-334)||(21718118-21718288)
chr7 (218-334)||(41904272-41904388)
chr7 (152-334)||(44003370-44003541)
chr7 (153-334)||(45237533-45237703)
chr7 (152-336)||(498186-498359)
chr7 (152-320)||(25037522-25037679)
chr7 (152-300)||(32556640-32556777)
chr7 (152-335)||(2332020-2332192)
chr7 (152-332)||(39453484-39453646)
chr7 (169-335)||(26371067-26371222)
chr7 (152-337)||(7257382-7257556)
chr7 (152-259)||(16482847-16482954)
chr7 (152-334)||(47906758-47906930)
chr7 (153-317)||(41855061-41855214)
chr7 (152-244)||(39323617-39323709)
chr7 (152-334)||(44659845-44660015)
chr7 (153-335)||(47460771-47460942)
chr7 (152-259)||(15644010-15644117)
chr7 (153-244)||(39866667-39866758)
chr7 (157-333)||(46103127-46103291)
chr7 (153-252)||(29863017-29863116)
chr7 (152-320)||(35484637-35484795)
chr7 (153-244)||(33455098-33455189)
chr7 (150-252)||(7720574-7720676)
chr7 (152-216)||(30077043-30077107)
chr7 (163-263)||(38448508-38448608)
chr7 (152-219)||(35557731-35557798)
chr7 (191-334)||(37443602-37443734)
chr7 (152-214)||(35823291-35823353)
chr7 (199-260)||(26456157-26456218)
chr7 (266-334)||(39323712-39323779)
chr7 (269-343)||(42272180-42272253)
chr7 (152-259)||(21649442-21649550)
chr7 (146-188)||(42272146-42272188)
chr7 (276-320)||(39866762-39866806)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (152-334)||(5882506-5882688)
chr6 (155-335)||(18101494-18101674)
chr6 (152-335)||(22551060-22551243)
chr6 (147-337)||(8615235-8615425)
chr6 (152-330)||(14891383-14891561)
chr6 (152-334)||(24168091-24168273)
chr6 (152-334)||(26377204-26377386)
chr6 (153-332)||(2892189-2892368)
chr6 (152-334)||(19415533-19415715)
chr6 (152-332)||(7345114-7345294)
chr6 (146-334)||(7393586-7393774)
chr6 (149-335)||(959903-960089)
chr6 (152-334)||(34527862-34528044)
chr6 (146-334)||(1970705-1970893)
chr6 (152-320)||(16703366-16703534)
chr6 (152-335)||(28947087-28947270)
chr6 (169-334)||(11988974-11989139)
chr6 (169-334)||(22341788-22341955)
chr6 (152-334)||(2593852-2594034)
chr6 (152-335)||(599892-600075)
chr6 (149-335)||(24224069-24224256)
chr6 (152-334)||(10507908-10508090)
chr6 (153-335)||(33452571-33452753)
chr6 (152-333)||(19281056-19281237)
chr6 (153-322)||(30743460-30743629)
chr6 (153-334)||(5294801-5294982)
chr6 (153-334)||(5299353-5299534)
chr6 (152-281)||(30467656-30467785)
chr6 (152-337)||(28948842-28949016)
chr6 (184-334)||(23261929-23262079)
chr6 (152-320)||(13329381-13329538)
chr6 (152-334)||(15965433-15965604)
chr6 (152-334)||(7167582-7167753)
chr6 (171-334)||(4487546-4487698)
chr6 (153-334)||(3291009-3291179)
chr6 (152-336)||(3786749-3786922)
chr6 (152-334)||(1398553-1398724)
chr6 (152-234)||(929659-929741)
chr6 (152-250)||(375797-375895)
chr6 (169-248)||(1939579-1939658)
chr6 (259-334)||(24913096-24913171)
chr6 (259-336)||(18661830-18661907)
chr6 (152-208)||(11743070-11743126)
chr6 (163-259)||(13844847-13844943)
chr6 (176-334)||(34262261-34262401)
chr6 (275-332)||(375729-375786)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (152-337)||(746465-746650)
chr2 (154-337)||(23901780-23901963)
chr2 (152-339)||(26710344-26710531)
chr2 (152-335)||(45370989-45371172)
chr2 (152-334)||(4034591-4034773)
chr2 (152-334)||(6594458-6594640)
chr2 (152-334)||(17600835-17601017)
chr2 (152-334)||(38997100-38997282)
chr2 (152-335)||(13815217-13815400)
chr2 (152-334)||(2324889-2325071)
chr2 (152-334)||(11184971-11185153)
chr2 (152-334)||(14660445-14660627)
chr2 (152-334)||(27651034-27651216)
chr2 (152-334)||(34518366-34518548)
chr2 (152-334)||(40635217-40635399)
chr2 (152-328)||(6430472-6430648)
chr2 (152-331)||(10424594-10424773)
chr2 (152-335)||(27400402-27400585)
chr2 (152-334)||(10244582-10244764)
chr2 (153-335)||(32327361-32327543)
chr2 (147-335)||(5726123-5726311)
chr2 (152-334)||(27024414-27024596)
chr2 (150-335)||(32948443-32948627)
chr2 (153-336)||(4609626-4609809)
chr2 (152-334)||(1091951-1092133)
chr2 (152-335)||(14697536-14697719)
chr2 (152-335)||(40735463-40735646)
chr2 (152-334)||(7892688-7892870)
chr2 (152-334)||(40037142-40037323)
chr2 (153-334)||(33427647-33427828)
chr2 (153-335)||(2914137-2914319)
chr2 (152-336)||(37620865-37621052)
chr2 (152-300)||(32608379-32608527)
chr2 (153-334)||(9444683-9444874)
chr2 (152-334)||(37255337-37255514)
chr2 (169-334)||(32856436-32856601)
chr2 (156-334)||(11159625-11159802)
chr2 (152-328)||(15925079-15925255)
chr2 (146-301)||(8432949-8433104)
chr2 (153-300)||(12842103-12842250)
chr2 (204-331)||(25294886-25295013)
chr2 (154-300)||(41172459-41172605)
chr2 (152-277)||(42899914-42900039)
chr2 (153-336)||(35158048-35158220)
chr2 (152-337)||(28641289-28641463)
chr2 (152-337)||(29687040-29687214)
chr2 (152-333)||(39103046-39103216)
chr2 (152-332)||(145281-145450)
chr2 (148-337)||(19428423-19428602)
chr2 (152-334)||(21734900-21735071)
chr2 (152-334)||(27764863-27765033)
chr2 (152-337)||(12333494-12333666)
chr2 (152-335)||(4258489-4258660)
chr2 (163-334)||(13543624-13543784)
chr2 (153-334)||(27331298-27331472)
chr2 (153-334)||(39301197-39301367)
chr2 (201-319)||(1229675-1229793)
chr2 (152-335)||(43898970-43899141)
chr2 (227-335)||(447632-447740)
chr2 (152-334)||(44481827-44481998)
chr2 (152-334)||(12730060-12730231)
chr2 (152-329)||(28566703-28566869)
chr2 (147-334)||(2688729-2688905)
chr2 (152-232)||(12814613-12814693)
chr2 (153-244)||(3266296-3266387)
chr2 (169-334)||(34249281-34249435)
chr2 (152-259)||(35126779-35126886)
chr2 (152-335)||(43356098-43356267)
chr2 (224-296)||(28014856-28014928)
chr2 (147-244)||(40544155-40544252)
chr2 (184-334)||(3711664-3711803)
chr2 (150-317)||(8056623-8056779)
chr2 (152-334)||(2000339-2000508)
chr2 (227-334)||(12827137-12827243)
chr2 (152-249)||(30545820-30545917)
chr2 (160-259)||(38985342-38985439)
chr2 (152-196)||(28019959-28020003)
chr2 (152-219)||(10176558-10176625)
chr2 (276-332)||(3266399-3266455)
chr2 (276-336)||(40544083-40544143)
chr2 (235-284)||(17799296-17799345)
[»] chr4 (126 HSPs)
chr4 (154-337)||(21366606-21366789)
chr4 (151-334)||(34276546-34276729)
chr4 (152-337)||(9798465-9798650)
chr4 (152-335)||(23437592-23437775)
chr4 (152-335)||(31532134-31532317)
chr4 (152-334)||(42085207-42085389)
chr4 (153-333)||(6019929-6020109)
chr4 (152-335)||(53854429-53854611)
chr4 (152-334)||(237477-237659)
chr4 (152-334)||(39077545-39077727)
chr4 (152-334)||(42765842-42766023)
chr4 (154-336)||(44984763-44984945)
chr4 (152-338)||(54607962-54608148)
chr4 (150-335)||(18462012-18462197)
chr4 (152-333)||(32366661-32366842)
chr4 (147-344)||(54574930-54575127)
chr4 (152-335)||(51363007-51363189)
chr4 (152-334)||(2826682-2826863)
chr4 (152-334)||(53461816-53461998)
chr4 (152-337)||(29478360-29478545)
chr4 (150-334)||(146429-146613)
chr4 (152-332)||(41702461-41702641)
chr4 (152-337)||(41949382-41949569)
chr4 (148-331)||(6285303-6285486)
chr4 (152-335)||(26091257-26091440)
chr4 (152-334)||(19387688-19387870)
chr4 (152-334)||(31914198-31914379)
chr4 (152-334)||(43471695-43471877)
chr4 (152-334)||(45797479-45797661)
chr4 (152-334)||(47344656-47344838)
chr4 (152-334)||(55056259-55056441)
chr4 (152-317)||(27373076-27373241)
chr4 (152-332)||(397402-397582)
chr4 (155-338)||(31972332-31972515)
chr4 (152-335)||(56022997-56023180)
chr4 (153-334)||(22618514-22618693)
chr4 (152-334)||(38591668-38591846)
chr4 (153-330)||(50534632-50534809)
chr4 (146-343)||(54086404-54086599)
chr4 (152-336)||(41560328-41560512)
chr4 (153-337)||(42222292-42222476)
chr4 (152-335)||(407754-407935)
chr4 (152-335)||(55519827-55520010)
chr4 (152-334)||(3170626-3170808)
chr4 (152-334)||(29777257-29777439)
chr4 (152-335)||(49881058-49881245)
chr4 (152-334)||(55776045-55776226)
chr4 (152-334)||(55840223-55840404)
chr4 (152-337)||(23609087-23609272)
chr4 (148-336)||(35446502-35446689)
chr4 (152-332)||(50457812-50457992)
chr4 (152-334)||(14017376-14017556)
chr4 (152-334)||(2243458-2243640)
chr4 (152-334)||(3692210-3692392)
chr4 (152-334)||(31070074-31070255)
chr4 (152-334)||(50234000-50234182)
chr4 (152-337)||(42033175-42033360)
chr4 (152-335)||(41632006-41632188)
chr4 (152-334)||(47662102-47662284)
chr4 (153-333)||(53834055-53834235)
chr4 (152-335)||(48313557-48313738)
chr4 (152-334)||(1932763-1932945)
chr4 (154-334)||(48657826-48658000)
chr4 (153-316)||(22468788-22468951)
chr4 (152-330)||(50536628-50536806)
chr4 (152-334)||(54424982-54425163)
chr4 (152-317)||(39587796-39587961)
chr4 (152-334)||(54805614-54805800)
chr4 (154-322)||(33897507-33897675)
chr4 (153-334)||(48654815-48655002)
chr4 (153-317)||(48259528-48259691)
chr4 (192-334)||(52728307-52728448)
chr4 (152-334)||(45633779-45633950)
chr4 (152-334)||(36532830-36533002)
chr4 (148-311)||(5117461-5117613)
chr4 (152-335)||(9997930-9998102)
chr4 (152-337)||(15060286-15060460)
chr4 (153-332)||(51951683-51951861)
chr4 (152-334)||(37239090-37239261)
chr4 (152-337)||(34552319-34552493)
chr4 (153-334)||(43890929-43891099)
chr4 (151-334)||(54715034-54715206)
chr4 (153-334)||(20351842-20352012)
chr4 (152-337)||(22620593-22620767)
chr4 (152-337)||(54216313-54216487)
chr4 (152-334)||(31881314-31881485)
chr4 (152-311)||(4486604-4486752)
chr4 (152-334)||(34835177-34835348)
chr4 (152-334)||(38547601-38547772)
chr4 (156-334)||(46708741-46708908)
chr4 (152-334)||(52688349-52688520)
chr4 (153-334)||(27580120-27580290)
chr4 (152-262)||(27398664-27398774)
chr4 (152-320)||(33289703-33289860)
chr4 (237-335)||(35595772-35595870)
chr4 (150-334)||(47811904-47812077)
chr4 (152-311)||(27873571-27873719)
chr4 (152-335)||(49014098-49014270)
chr4 (152-335)||(54216735-54216907)
chr4 (153-259)||(14335165-14335271)
chr4 (207-337)||(42509351-42509481)
chr4 (152-334)||(52461366-52461534)
chr4 (152-330)||(46720025-46720195)
chr4 (152-259)||(1662323-1662430)
chr4 (200-290)||(52396774-52396865)
chr4 (153-236)||(42557583-42557666)
chr4 (152-251)||(43231503-43231601)
chr4 (152-244)||(3293102-3293194)
chr4 (152-334)||(6371249-6371420)
chr4 (152-244)||(11972208-11972300)
chr4 (156-335)||(573807-573975)
chr4 (153-316)||(33557960-33558112)
chr4 (180-337)||(27872607-27872753)
chr4 (232-333)||(35344868-35344968)
chr4 (261-333)||(33048990-33049062)
chr4 (153-258)||(49057933-49058038)
chr4 (189-320)||(51981493-51981613)
chr4 (163-336)||(18206510-18206682)
chr4 (257-334)||(48259704-48259780)
chr4 (229-334)||(42558270-42558367)
chr4 (152-203)||(17555617-17555668)
chr4 (266-334)||(3291805-3291873)
chr4 (282-334)||(1662261-1662313)
chr4 (152-240)||(43478060-43478147)
chr4 (152-199)||(35195078-35195125)
chr4 (202-242)||(47105108-47105148)
[»] chr3 (111 HSPs)
chr3 (152-334)||(43612047-43612229)
chr3 (152-334)||(47257793-47257975)
chr3 (152-334)||(49330037-49330219)
chr3 (152-337)||(41464352-41464537)
chr3 (152-334)||(7855114-7855296)
chr3 (152-334)||(40130959-40131141)
chr3 (153-334)||(38416724-38416905)
chr3 (152-333)||(51170034-51170215)
chr3 (152-335)||(22399097-22399279)
chr3 (152-335)||(24100283-24100465)
chr3 (152-335)||(28048391-28048574)
chr3 (152-334)||(47809596-47809779)
chr3 (152-334)||(27066978-27067160)
chr3 (149-334)||(39634572-39634756)
chr3 (152-322)||(29625839-29626009)
chr3 (152-334)||(32234398-32234579)
chr3 (152-334)||(40419835-40420017)
chr3 (152-334)||(42291842-42292024)
chr3 (152-334)||(48739233-48739415)
chr3 (149-334)||(51452751-51452935)
chr3 (152-337)||(52628954-52629138)
chr3 (152-335)||(40643800-40643983)
chr3 (152-334)||(2666000-2666182)
chr3 (152-334)||(7755307-7755488)
chr3 (152-334)||(35748311-35748493)
chr3 (152-337)||(37313399-37313584)
chr3 (152-333)||(55453245-55453426)
chr3 (152-334)||(39053394-39053576)
chr3 (152-334)||(51102378-51102560)
chr3 (153-334)||(40804510-40804691)
chr3 (152-337)||(44222829-44223014)
chr3 (153-345)||(46134357-46134549)
chr3 (161-332)||(48609732-48609903)
chr3 (152-334)||(37324541-37324723)
chr3 (152-334)||(43125831-43126012)
chr3 (152-334)||(44806684-44806866)
chr3 (153-334)||(52215077-52215258)
chr3 (152-334)||(20754393-20754575)
chr3 (152-334)||(53943588-53943769)
chr3 (153-333)||(43021715-43021896)
chr3 (154-334)||(41293319-41293498)
chr3 (152-336)||(41732528-41732712)
chr3 (152-332)||(53832486-53832666)
chr3 (157-332)||(43183917-43184092)
chr3 (175-334)||(46126010-46126168)
chr3 (147-334)||(52638837-52639024)
chr3 (152-330)||(35594121-35594299)
chr3 (152-301)||(24376573-24376722)
chr3 (149-302)||(53637838-53637991)
chr3 (152-319)||(36368939-36369105)
chr3 (153-334)||(18946904-18947085)
chr3 (152-335)||(51146214-51146397)
chr3 (152-334)||(5560025-5560214)
chr3 (152-332)||(47894822-47895002)
chr3 (152-334)||(41216455-41216637)
chr3 (152-332)||(54159000-54159170)
chr3 (152-334)||(25641646-25641817)
chr3 (152-334)||(42589830-42590001)
chr3 (152-298)||(37758929-37759075)
chr3 (152-335)||(34279720-34279892)
chr3 (151-334)||(38156632-38156804)
chr3 (156-317)||(46949379-46949538)
chr3 (152-334)||(51415969-51416140)
chr3 (152-334)||(54707220-54707391)
chr3 (152-320)||(54401187-54401344)
chr3 (152-317)||(39141141-39141297)
chr3 (152-332)||(48546842-48547011)
chr3 (152-334)||(55000178-55000349)
chr3 (152-335)||(47510939-47511111)
chr3 (152-331)||(49130578-49130746)
chr3 (152-335)||(55379985-55380157)
chr3 (152-334)||(41635800-41635971)
chr3 (153-334)||(31286793-31286963)
chr3 (152-334)||(25353554-25353725)
chr3 (147-337)||(37028718-37028897)
chr3 (152-334)||(53115447-53115618)
chr3 (152-309)||(17665549-17665695)
chr3 (219-334)||(33550467-33550582)
chr3 (153-329)||(40022075-40022240)
chr3 (152-332)||(45058883-45059052)
chr3 (212-334)||(52864550-52864671)
chr3 (152-334)||(24688114-24688285)
chr3 (152-334)||(30251501-30251672)
chr3 (152-334)||(51224038-51224208)
chr3 (152-333)||(42998790-42998959)
chr3 (153-251)||(41882063-41882161)
chr3 (201-283)||(47182049-47182131)
chr3 (153-333)||(51143818-51143987)
chr3 (152-334)||(21597148-21597319)
chr3 (152-263)||(2227995-2228106)
chr3 (152-251)||(28576184-28576283)
chr3 (153-334)||(43176738-43176908)
chr3 (149-251)||(50731986-50732088)
chr3 (149-251)||(50780768-50780870)
chr3 (152-251)||(48726070-48726169)
chr3 (152-334)||(44945935-44946100)
chr3 (180-335)||(52756066-52756214)
chr3 (161-263)||(47402810-47402911)
chr3 (208-334)||(48534007-48534122)
chr3 (148-228)||(48752081-48752161)
chr3 (183-335)||(40165682-40165823)
chr3 (183-334)||(41609098-41609238)
chr3 (152-228)||(52434139-52434216)
chr3 (153-259)||(177162-177268)
chr3 (154-263)||(8847718-8847827)
chr3 (152-204)||(37741435-37741487)
chr3 (247-334)||(30429227-30429314)
chr3 (152-196)||(51942543-51942587)
chr3 (283-336)||(50731912-50731965)
chr3 (283-336)||(50780891-50780944)
chr3 (282-334)||(40688431-40688483)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (152-334)||(13762-13944)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (154-339)||(1871-2056)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (154-337)||(11130-11312)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (152-337)||(2429-2614)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (152-334)||(75244-75426)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (152-334)||(278006-278190)
scaffold0007 (164-334)||(176666-176836)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (152-334)||(18854-19036)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (152-301)||(32561-32710)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (153-337)||(4593-4771)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (153-334)||(3089-3261)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (152-337)||(7090-7265)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (152-336)||(14744-14917)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (151-334)||(20477-20649)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (152-259)||(102-209)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (152-259)||(4618-4726)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (152-259)||(3392-3500)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (152-300)||(17906-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (163-258)||(19228-19327)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 24253382 - 24253565
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253382 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24253481  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24253482 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 24253565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43326561 - 43326379
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326561 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 43326462  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43326461 cttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15398663 - 15398483
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398663 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15398564  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15398563 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 35626038 - 35626220
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35626038 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 35626137  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35626138 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 35626220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 39932579 - 39932761
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932579 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 39932678  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39932679 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 39932761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43262365 - 43262183
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262365 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 43262266  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43262265 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43262183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Original strand, 6901799 - 6901979
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6901799 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 6901898  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6901899 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27501237 - 27501054
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501237 gttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 27501138  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27501137 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 27501054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 27938897 - 27939080
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27938897 gttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 27938996  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatggg-taccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27938997 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40886209 - 40886027
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40886209 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 40886110  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40886109 ctt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcacca 40886027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3466863 - 3466681
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3466863 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 3466764  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  3466763 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 3466681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 5184972 - 5185154
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5184972 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 5185071  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5185072 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 7722049 - 7722231
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722049 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 7722148  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7722149 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 7722231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 12648793 - 12648979
Alignment:
Q  148 aaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 247  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12648793 aaaagttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggat 12648892  T
Q  248 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12648893 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18479849 - 18479667
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18479849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 18479750  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||| |||||||    
T  18479749 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcacca 18479667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 739891 - 739704
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739891 taaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 739792  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  739791 taccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 739704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 25831521 - 25831702
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25831521 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggatacca 25831619  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25831620 attaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacc 25831702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Original strand, 15683788 - 15683973
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683788 aaagttttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 15683887  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  15683888 ccacttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2484473 - 2484291
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2484473 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactac 2484374  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2484373 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 2484291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939082
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 262  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  263 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccaaa 31939082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27278659 - 27278474
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatag----ttcatggat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  27278659 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggat 27278560  T
Q  248 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27278559 accacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 163 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278857
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  263 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcacca 40278857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 890906 - 891087
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  890906 gttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggatacca 891005  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  891006 ctt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 891087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28424975 - 28424795
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28424975 gttttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 28424878  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  28424877 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 28424795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 5137715 - 5137897
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137715 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 5137814  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||| | | |||||||||||   |||| |||||||||||    
T  5137815 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtcacc 5137897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13504922 - 13504741
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504922 tttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 13504823  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13504822 taaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcacca 13504741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Original strand, 40110234 - 40110397
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40110234 gttttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatagatacca 40110332  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40110333 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatg 40110397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789295
Alignment:
Q  189 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  289 ggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756487
Alignment:
Q  160 tagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  260 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt-ccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |  |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacc 38756487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 763723 - 763905
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  763723 gttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatca 763822  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||    
T  763823 cttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcacc 763905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 335
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451433
Alignment:
Q  194 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  294 aaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacca 34451433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 19295730 - 19295904
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||        
T  19295730 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat---- 19295825  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  19295826 -------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 19295904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 27503379 - 27503552
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  27503379 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 27503471  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  27503472 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaa 27503552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 315
Target Start/End: Original strand, 4149685 - 4149847
Alignment:
Q  143 aagttaaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 242  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          | |    
T  4149685 aagtaaaaggttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggg----------tta 4149774  T
Q  243 tggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  4149775 tggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 33617585 - 33617756
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           
T  33617585 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg------- 33617677  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33617678 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 33617756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38015684 - 38015514
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  38015684 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 38015593  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  38015592 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 38015514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23195419 - 23195248
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  23195419 gttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 23195327  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  23195326 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 23195248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 296
Target Start/End: Original strand, 40632499 - 40632634
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  40632499 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc- 40632597  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 296  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632598 --------ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9424763 - 9424593
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||           
T  9424763 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 9424671  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
        || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  9424670 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42658833 - 42658676
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  42658833 gttttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 42658741  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
        || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42658740 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 42658676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 5497273 - 5497444
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||           
T  5497273 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------- 5497365  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  5497366 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 5497444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 6973063 - 6973234
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           
T  6973063 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 6973155  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  6973156 ----aatatgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacc 6973234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 13957670 - 13957841
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  13957670 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 13957762  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  13957763 ----aatatgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13957841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31294170 - 31293988
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||| |||| |||||||    
T  31294170 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccac 31294071  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||| |||||| |||  | |||  |||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31294070 ttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcacca 31293988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9374672 - 9374502
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||            
T  9374672 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 9374581  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
       || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  9374580 ---aatatgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36365616 - 36365462
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           
T  36365616 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 36365524  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  36365523 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatgg 36365462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12558200 - 12558090
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  12558200 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gatacca 12558102  T
Q  252 cttaaaaatgtg 263  Q
    ||||||||||||    
T  12558101 cttaaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 337
Target Start/End: Original strand, 14971995 - 14972152
Alignment:
Q  169 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||||||||||    
T  14971995 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgtgcttat 14972083  T
Q  269 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    ||| ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  14972084 gtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 14972152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656567
Alignment:
Q  179 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  279 tgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3656567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Original strand, 6206884 - 6207032
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||           
T  6206884 gttttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg------- 6206976  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 311  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6206977 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18327344 - 18327172
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18327344 gttttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 18327245  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18327244 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagttatcacca 18327172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24167955 - 24167783
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24167955 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 24167856  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24167855 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcacca 24167783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 2585462 - 2585633
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2585462 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 2585561  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
      ||||||  ||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  2585562 tctaaaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36472455 - 36472348
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36472455 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 36472356  T
Q  252 cttaaaaa 259  Q
    ||| ||||    
T  36472355 ctttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38638081 - 38637910
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38638081 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38637982  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
      |||||| |||           ||||| |||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  38637981 actaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacc 38637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42247953 - 42247865
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 240  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42247953 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1402676 - 1402505
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1402676 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 1402577  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |  ||||| |||           ||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  1402576 cccaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcacc 1402505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 334
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390768
Alignment:
Q  160 tagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 259  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27390704  T
Q  260 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     |||           |||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27390705 ggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 27390768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 317
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492767
Alignment:
Q  186 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattg 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  286 gttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcatgg 38492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948492
Alignment:
Q  178 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 277  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggat-----------atgtgcttatgtggctaat 36948546  T
Q  278 gtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  36948545 gtgtattgg-tagggtaaattacccaccattcttgcatgagtaccctagctgtca 36948492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 40686900 - 40687069
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  40686900 ttttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 40686999  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  40687000 ctaaaaa-gtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacc 40687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171111
Alignment:
Q  155 ttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagata 237  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623940
Alignment:
Q  157 ttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 256  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| |             
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggt--------- 33624015  T
Q  257 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||| |||| |||| || |||||||    
T  33624014 --atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9527190 - 9527124
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 219  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527190 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612757
Alignment:
Q  178 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 277  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||             ||||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaat 612815  T
Q  278 gtgtattggttggg-gtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  612814 gtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacc 612757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940411
Alignment:
Q  176 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300962
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag 234  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaag 15300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3940399 - 3940336
Alignment:
Q  271 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3940399 ggctaatgtgtattggttcgaataaattactcatcattcttccatagataccttagttgtcacc 3940336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9171108 - 9171035
Alignment:
Q  260 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  9171108 tgtgcttatgtggttaatgtgtattgatt-gggtaaattacttgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 9171035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207088
Alignment:
Q  185 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggatacca 20207088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 335
Target Start/End: Original strand, 21785995 - 21786033
Alignment:
Q  297 ttacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21785995 ttacctatcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 21786033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756138
Alignment:
Q  156 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 212  Q
    ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Original strand, 27584385 - 27584447
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtggg--taatttacccaccaaccaatgaaaatga 212  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  27584385 gttttttctatatttcctttgaagaatggtgggtatagtttacccaccaaccagtgaaaatga 27584447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 107)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 45538153 - 45538336
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538153 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 45538252  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45538253 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 45538336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 31308001 - 31308183
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308001 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 31308100  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31308101 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31308183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 3611136 - 3611319
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611136 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 3611235  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3611236 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 3611319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 44661970 - 44662152
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44661970 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 44662069  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44662070 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44662152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 151 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21139595 - 21139411
Alignment:
Q  151 agttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139595 agttttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 21139496  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21139495 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacca 21139411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25678441 - 25678258
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678441 gttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 25678342  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25678341 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacca 25678258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17995133 - 17994951
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17995133 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacca 17995034  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17995033 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 17994951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 25058688 - 25058872
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25058688 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggatacca 25058787  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25058788 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 25058872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 47671586 - 47671770
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47671586 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggatacca 47671685  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47671686 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 47671770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 154 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4068863 - 4068689
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068863 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 4068764  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagtt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  4068763 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 5981170 - 5981352
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981170 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 5981269  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5981270 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5981352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 154 - 332
Target Start/End: Original strand, 43251713 - 43251891
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43251713 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 43251812  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43251813 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24245207 - 24245022
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245207 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24245108  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24245107 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcaccaaa 24245022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 26277177 - 26277360
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277177 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 26277276  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26277277 cttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 26277360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6327729 - 6327548
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327729 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 6327630  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6327629 cttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 6327548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 23984755 - 23984937
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984755 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 23984854  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23984855 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23984937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 31040709 - 31040891
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31040709 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 31040808  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31040809 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacc 31040891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38790378 - 38790197
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38790378 ttttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 38790279  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38790278 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38790197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 46967223 - 46967038
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967223 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 46967124  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  46967123 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcaccaaa 46967038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26085579 - 26085397
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26085579 gtttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 26085481  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26085480 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 26085397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23932691 - 23932509
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23932691 gttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacacca 23932592  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23932591 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23932509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33112999 - 33112818
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112999 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33112900  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  33112899 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37620374 - 37620192
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37620374 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 37620275  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37620274 cttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 39646568 - 39646750
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39646568 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggatacca 39646667  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39646668 cttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39646750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 149 - 337
Target Start/End: Original strand, 46784420 - 46784608
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  46784420 aaagttttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggata 46784519  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46784520 ccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcaccaaa 46784608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 151 - 334
Target Start/End: Original strand, 33884087 - 33884270
Alignment:
Q  151 agttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33884087 agttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 33884186  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  33884187 atttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33884270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 151 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33960165 - 33959982
Alignment:
Q  151 agttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33960165 agttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 33960066  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  33960065 atttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33959982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 36566330 - 36566513
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566330 gttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 36566429  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36566430 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 36566513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 41999815 - 41999997
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41999815 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatacca 41999914  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41999915 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 41999997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Original strand, 47317316 - 47317498
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47317316 ttttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 47317415  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47317416 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcacca 47317498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47383914 - 47383730
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47383914 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47383815  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  47383814 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcaccaa 47383730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 5980068 - 5980250
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5980068 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggatacca 5980167  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  5980168 cttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 24885501 - 24885683
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885501 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24885600  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  24885601 cttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 24885683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26525071 - 26524889
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26525071 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagatacca 26524972  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26524971 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacc 26524889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 330
Target Start/End: Original strand, 26794304 - 26794482
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26794304 gttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 26794403  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgt 330  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  26794404 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38332041 - 38331859
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38332041 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 38331942  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38331941 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 38331859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49254157 - 49253987
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49254157 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 49254058  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtacc 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  49254057 cttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatacc 49253987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 50774218 - 50774399
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50774218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 50774317  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  50774318 ttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacc 50774399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23221111 - 23220934
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221111 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 23221012  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || | | |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23221011 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgtgacca 23220934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 51057071 - 51057255
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  51057071 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggatacca 51057170  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51057171 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 51057255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 35273596 - 35273779
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273596 gttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 35273695  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35273696 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 35273779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35692846 - 35692663
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692846 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35692747  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||  |||||||||||    
T  35692746 gcttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcacc 35692663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 46616549 - 46616731
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  46616549 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 46616648  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  46616649 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 46616731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Original strand, 3285402 - 3285582
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285402 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 3285501  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  3285502 ctt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Original strand, 31844376 - 31844525
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31844376 gttttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatacca 31844475  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844476 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 31844525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 321
Target Start/End: Original strand, 42863867 - 42864034
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42863867 tttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 42863966  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtac 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  42863967 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 47187105 - 47187287
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47187105 gttttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 47187204  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47187205 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacc 47187287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 49399170 - 49398986
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  49399170 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggatacca 49399071  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  49399070 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcaccaa 49398986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 331
Target Start/End: Original strand, 28888582 - 28888760
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28888582 ttttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 28888681  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtc 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28888682 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 48373504 - 48373677
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373504 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 48373603  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48373604 cttaaaaatgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacc 48373677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 290
Target Start/End: Original strand, 25518815 - 25518952
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518815 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25518914  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518915 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 36003131 - 36003315
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36003131 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccac 36003230  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttc---catgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||   ||| |||||| |||||||||||    
T  36003231 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacc 36003315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 336
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450678
Alignment:
Q  187 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  287 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcaccaa 2450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42313547 - 42313361
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgg----gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  42313547 gttttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaat 42313448  T
Q  248 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42313447 accacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 42313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27983769 - 27983600
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||    
T  27983769 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg----------------atacca 27983686  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27983685 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 27983600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41467803 - 41467631
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  41467803 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 41467711  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  41467710 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 41467631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 2657303 - 2657474
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  2657303 gttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 2657395  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  2657396 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51403189 - 51403074
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51403189 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 51403090  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttat 268  Q
    ||| |||||||||||||    
T  51403089 ctt-aaaatgtgcttat 51403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 33073211 - 33073382
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||           
T  33073211 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg------- 33073303  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33073304 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33073382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6626195 - 6626025
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  6626195 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 6626103  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  6626102 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31980120 - 31979998
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31980120 aaaggtttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggata 31980021  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtg 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  31980020 ccacttaaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045595
Alignment:
Q  193 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggg 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  293 taaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcacca 51045595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 10928067 - 10928238
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||           
T  10928067 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg------- 10928159  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  10928160 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 10928238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26472355 - 26472193
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||      
T  26472355 taaaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-- 26472258  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
             || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  26472257 ---------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggta 26472193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 206 - 334
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808827
Alignment:
Q  206 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 305  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  306 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacc 4808827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 29770670 - 29770841
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  29770670 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 29770762  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||||| ||||    
T  29770763 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacc 29770841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45476014 - 45475866
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45476014 tttttctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccact 45475923  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  45475922 tacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2557034 - 2556909
Alignment:
Q  146 ttaaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  2557034 ttaaaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatga 2556935  T
Q  246 ataccacttaaaaatgtgcttatgtg 271  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  2556934 ataccacttaaaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 42234840 - 42235010
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  42234840 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 42234932  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  42234933 ----aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 42235010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30290078 - 30289909
Alignment:
Q  155 ttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 254  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||              
T  30290078 ttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg---------- 30289989  T
Q  255 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30289988 -aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcacca 30289909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34752489 - 34752328
Alignment:
Q  148 aaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 247  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||       
T  34752489 aaaagttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg--- 34752393  T
Q  248 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34752392 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggta 34752328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 2954855 - 2955026
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2954855 gttttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggatacca 2954954  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||| |||           | ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2954955 cttaaaaaggtg-----------attgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 2955026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4243661 - 4243490
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||           
T  4243661 gttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatg------- 4243569  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  4243568 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 26685856 - 26686027
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26685856 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 26685955  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26685956 cctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 26686027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 4953053 - 4953223
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  4953053 ttttctctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 4953144  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
       || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | || ||||||||    
T  4953145 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 4953223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 335
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388645
Alignment:
Q  155 ttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  255 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1388576 aaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 1388645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 10920200 - 10920372
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10920200 gttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 10920299  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10920300 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcacca 10920372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895161
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||         
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaata----- 41895239  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  41895238 ------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 41895161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 203 - 334
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156576
Alignment:
Q  203 atgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-------tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  296 attacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacc 4156576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5961438 - 5961267
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5961438 gttttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 5961339  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5961338 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 5961267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13281736 - 13281588
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||        
T  13281736 aaagttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg---- 13281641  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcatt 308  Q
           || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  13281640 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38716418 - 38716247
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38716418 gttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 38716319  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  38716318 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27924829 - 27924722
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27924829 gttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 27924730  T
Q  252 cttaaaaa 259  Q
    | ||||||    
T  27924729 cctaaaaa 27924722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772172
Alignment:
Q  202 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  302 tatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtcacc 47772172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51155760 - 51155590
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||           
T  51155760 gttttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg------- 51155668  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51155667 ----aatatgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccttagctgtcacc 51155590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312529
Alignment:
Q  241 catggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccaa 13312529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13313347 - 13313249
Alignment:
Q  152 gttttttctagattaca--tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13313347 gttttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 33187340 - 33187506
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  33187340 gttttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagatacca 33187439  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||                 ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33187440 cttaaa-----------------aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 33187506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39475953 - 39475780
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39475953 gttttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtttatggatacca 39475855  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    | ||||||||||           || || ||||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  39475854 cctaaaaatgtg-----------aacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccaaa 39475780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 32448650 - 32448740
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32448650 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35991768 - 35991616
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||             
T  35991768 tttttttaaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 35991678  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
      || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35991677 --aatatatgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24649893 - 24649802
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 243  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24649893 gttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44544216 - 44544125
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44544216 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7561712 - 7561527
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa-gatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |    | ||  |||       
T  7561712 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagtt 7561613  T
Q  252 cttaaaaatgtgctta--tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    | | || |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7561612 catgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacca 7561527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 52323938 - 52324113
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  52323938 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaatacca 52324037  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    | |||||| |||           |||||  |||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52324038 cctaaaaaggtg----------aaatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 52324113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46428424 - 46428332
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46428424 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 39637900 - 39637996
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc-atggatacc 250  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39637900 gttttttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacc 39637995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Original strand, 52367883 - 52367990
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  52367883 gttttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 52367982  T
Q  252 cttaaaaa 259  Q
    | ||||||    
T  52367983 cctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48683477 - 48683330
Alignment:
Q  176 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||           |    
T  48683477 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg-----------a 48683389  T
Q  276 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  48683388 atgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293455
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 262  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 44293527  T
Q  263 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  44293526 acttatgtggctaatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccacc 44293455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4156247 - 4156188
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156247 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 311
Target Start/End: Original strand, 24215806 - 24215911
Alignment:
Q  195 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||           | || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24215806 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaata-----------tatgtttatgtgactaatgtgtattggttggggta 24215894  T
Q  295 aattacctatcattctt 311  Q
    ||||||| |||||||||    
T  24215895 aattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38718309 - 38718166
Alignment:
Q  187 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg 286  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||  |||     | || ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38718309 atttatccaccgaccaataaaaatgaacaatttatttgtggcatcaagatagttcataaata-----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtatatcgg 38718215  T
Q  287 ttggg-gtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||    
T  38718214 ttgggagtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacca 38718166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10919365 - 10919313
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 204  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10919365 gttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 337
Target Start/End: Original strand, 32448754 - 32448813
Alignment:
Q  278 gtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  32448754 gtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcgccaaa 32448813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286504
Alignment:
Q  215 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttcca 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||| |    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttcta 31286524  T
Q  315 tgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  31286523 tgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 301
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359530
Alignment:
Q  273 ctaatgtgtattggttggggtaaattacc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacc 39359530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39738 - 39556
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39738 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 39639  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39638 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32984259 - 32984077
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984259 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 32984160  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32984159 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32984077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24080083 - 24079899
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24080083 gttttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24079984  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24079983 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccaa 24079899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31831136 - 31830959
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831136 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31831037  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  31831036 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Original strand, 10646124 - 10646306
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646124 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10646223  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10646224 ttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 10646306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13356302 - 13356120
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13356302 gttttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 13356203  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13356202 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacc 13356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40435335 - 40435153
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40435335 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatacca 40435236  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40435235 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 43328707 - 43328889
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328707 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 43328806  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43328807 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 43328889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9303758 - 9303574
Alignment:
Q  150 aagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303758 aagttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 9303659  T
Q  250 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9303658 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9303574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Original strand, 2714550 - 2714732
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2714550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2714649  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2714650 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtactttagttgtcaccaa 2714732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 5946047 - 5946229
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946047 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 5946146  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  5946147 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 5946229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33730823 - 33730641
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730823 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33730724  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33730723 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33730641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 37956421 - 37956603
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956421 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 37956520  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  37956521 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacc 37956603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 41862220 - 41862402
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41862220 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 41862319  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  41862320 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 41653895 - 41654078
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41653895 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggatacca 41653994  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41653995 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 41654078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 6365986 - 6366168
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6365986 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggatacca 6366085  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  6366086 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacc 6366168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 9734255 - 9734435
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9734255 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ca 9734353  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9734354 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33981845 - 33981663
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33981845 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33981746  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33981745 cttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 33981663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17718903 - 17718722
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718903 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccac 17718804  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17718803 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 17718722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37301507 - 37301326
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37301507 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggatacca 37301408  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37301407 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 37419940 - 37420123
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37419940 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacta 37420039  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37420040 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacca 37420123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 2275913 - 2276094
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2275913 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2276012  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  2276013 ctt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcacc 2276094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45236747 - 45236565
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236747 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 45236648  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  45236647 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacc 45236565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Original strand, 9013682 - 9013865
Alignment:
Q  150 aagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9013682 aagttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatac 9013781  T
Q  250 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9013782 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9013865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 155 - 322
Target Start/End: Original strand, 25185902 - 25186069
Alignment:
Q  155 ttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 254  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25185902 ttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactt 25186001  T
Q  255 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtacc 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  25186002 aaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtacc 25186069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 157 - 332
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  157 ttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  257 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 41231946 - 41232128
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41231946 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 41232045  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  41232046 cttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacc 41232128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 35628777 - 35628959
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35628777 gttttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaatacca 35628876  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  35628877 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13760830 - 13760646
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13760830 gttttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 13760731  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg--gtaccttagttgtcacc 334  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13760730 tttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacc 13760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29048585 - 29048426
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048585 gttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatacca 29048486  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29048485 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 148 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45066778 - 45066604
Alignment:
Q  148 aaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 247  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45066778 aaaagttttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 45066679  T
Q  248 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtacc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45066678 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtacc 45066604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Original strand, 22878391 - 22878572
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22878391 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggatacca 22878490  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22878491 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44088624 - 44088460
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44088624 ttttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 44088525  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44088524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 44088460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 25248039 - 25248215
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248039 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 25248132  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25248133 ctttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 151 - 317
Target Start/End: Original strand, 45258509 - 45258675
Alignment:
Q  151 agttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45258509 agttttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggatacc 45258608  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    | ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  45258609 atttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Original strand, 41639914 - 41640095
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41639914 gttttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccg 41640013  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  41640014 cttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 208 - 334
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033112
Alignment:
Q  208 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  308 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcacc 12033112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42701471 - 42701299
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42701471 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccac 42701372  T
Q  253 tta---aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtacctt 324  Q
    |||   ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  42701371 ttaaaaaaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacctt 42701299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 201 - 336
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904260
Alignment:
Q  201 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  301 ctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcaccaa 3904260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 41843253 - 41843425
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||           
T  41843253 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg------- 41843345  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  41843346 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcttagttatcacca 41843425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 335
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981651
Alignment:
Q  218 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  318 gtaccttagttgtcacca 335  Q
     |||| ||||||||||||    
T  41981634 ataccctagttgtcacca 41981651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4447466 - 4447295
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||           
T  4447466 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg------- 4447374  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4447373 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4447295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 117499 - 117326
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  117499 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 117408  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  117407 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 117326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 31940315 - 31940486
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  31940315 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 31940407  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  31940408 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 31940486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 10378309 - 10378480
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||           
T  10378309 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg------- 10378401  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10378402 ----aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 3211207 - 3211376
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||            
T  3211207 ttttttctaaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg-------- 3211297  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3211298 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 3211376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39916000 - 39915887
Alignment:
Q  146 ttaaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 245  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39916000 ttaatagttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgg 39915901  T
Q  246 ataccacttaaaaa 259  Q
    ||||||||||||||    
T  39915900 ataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 9713689 - 9713858
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  9713689 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccca---accaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 9713778  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  9713779 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 9713858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 2379140 - 2379312
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||           
T  2379140 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg------- 2379232  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  2379233 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacca 2379312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336276
Alignment:
Q  221 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  321 ccttagttgtcacc 334  Q
    || |||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacc 31336276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40458943 - 40458771
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  40458943 gttttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 40458851  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  40458850 ----aatatgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 40458771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4975576 - 4975412
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||             
T  4975576 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 4975486  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttg 329  Q
      || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  4975485 --aatatgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 4975412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 254
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981535
Alignment:
Q  173 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373744
Alignment:
Q  157 ttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 256  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           |    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------a 32373804  T
Q  257 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32373803 atatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaattacc-accattcttccatgg 32373744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9509571 - 9509400
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||           
T  9509571 gttttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg------- 9509479  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  9509478 ----aatatgtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacc 9509400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27243310 - 27243218
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27243310 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27254885 - 27254793
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27254885 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33897013 - 33896843
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33897013 gttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 33896915  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | ||||||  ||           ||||| |||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||| |||||||||||    
T  33896914 cctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 33896843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3490570 - 3490399
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  3490570 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttacca 3490471  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           ||||| |||||||||||||||| |||| | |||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  3490470 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 3490399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649845
Alignment:
Q  164 ttacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 263  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||| |||           ||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaata-----------tgtg 40649902  T
Q  264 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggta 40649845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31149061 - 31148953
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  31149061 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gatacca 31148963  T
Q  252 cttaaaaatg 261  Q
    ||||||||||    
T  31148962 cttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 244
Target Start/End: Original strand, 38631648 - 38631744
Alignment:
Q  148 aaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38631648 aaaagttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg 38631744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 33622635 - 33622465
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||||||||            
T  33622635 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttat-gggtcaaaatagttcatg-------- 33622545  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
       || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||    
T  33622544 ---aatatgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcat-ggtagcctagttgtcaccaa 33622465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26196487 - 26196317
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26196487 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 26196389  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || | |||||||||||    
T  26196388 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacc 26196317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 243
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164812
Alignment:
Q  158 tctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 243  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtctaaatagttcat 164812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 335
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901740
Alignment:
Q  269 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcacca 39901740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425427
Alignment:
Q  259 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||  ||||||| | |||||| ||||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttgccaccaa 41425427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 188
Target Start/End: Original strand, 12032952 - 12032988
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaat 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12032952 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 12032988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 196
Target Start/End: Original strand, 39901574 - 39901617
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccac 196  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39901574 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttacccac 39901617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33839897 - 33839715
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839897 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33839798  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839797 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 33839715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25894099 - 25893916
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894099 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 25894000  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25893999 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25893916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33423457 - 33423276
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423457 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33423358  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33423357 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22979829 - 22979646
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22979829 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 22979730  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22979729 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 22979646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33696003 - 33695820
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33696003 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33695904  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33695903 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacca 33695820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 17855429 - 17855611
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17855429 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacta 17855528  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17855529 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17855611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23393232 - 23393050
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393232 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23393133  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23393132 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 23393050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 35355889 - 35356071
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35355889 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 35355988  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35355989 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 35356071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 40670564 - 40670746
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40670564 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 40670663  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40670664 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 40670746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47067159 - 47066977
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47067159 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47067060  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47067059 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 47066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 46913110 - 46913294
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913110 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 46913209  T
Q  252 cttaaaaa--tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46913210 cttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 46913294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 49171543 - 49171362
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49171543 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49171444  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  49171443 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 49171362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45690277 - 45690097
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690277 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45690178  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45690177 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47740518 - 47740330
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47740518 taaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaa 47740419  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47740418 tatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacca 47740330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 27018117 - 27018300
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27018117 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggatacca 27018216  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27018217 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 27018300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20165995 - 20165813
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20165995 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 20165896  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20165895 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 20165813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35328251 - 35328069
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35328251 gttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 35328152  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35328151 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 35328069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2341844 - 2341661
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2341844 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaa 2341745  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccat-gggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2341744 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacc 2341661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 33411261 - 33411444
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411261 gttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33411360  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  33411361 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcacca 33411444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 172 - 334
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389539
Alignment:
Q  172 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  272 gctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36389539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 10028489 - 10028676
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10028489 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 10028588  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatggg--taccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  10028589 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcaccaaa 10028676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48609859 - 48609676
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48609859 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtatacca 48609760  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48609759 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 48609676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 31586849 - 31587031
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586849 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 31586948  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  31586949 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcacc 31587031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37846198 - 37846016
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  37846198 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggatacca 37846099  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37846098 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37846016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 45482659 - 45482841
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45482659 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 45482758  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45482759 cttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 45482841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 322
Target Start/End: Original strand, 15877553 - 15877721
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877553 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15877652  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtacc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15877653 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 15877721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 5712169 - 5712352
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5712169 gttttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggatacca 5712268  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  5712269 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacca 5712352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 33332790 - 33332971
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33332790 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatacca 33332888  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33332889 cttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 33332971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26579899 - 26579717
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26579899 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtatacca 26579800  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26579799 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 26579717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 173 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5183986 - 5183825
Alignment:
Q  173 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5183986 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtgg 5183887  T
Q  273 ctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5183886 ctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcacc 5183825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 19563448 - 19563633
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19563448 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 19563547  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19563548 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcaccaaa 19563633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 31625706 - 31625886
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31625706 ttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 31625805  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31625806 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattacc-accattcttccatgggtatcctagttgtcacc 31625886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 335 - 507
Target Start/End: Original strand, 41405324 - 41405494
Alignment:
Q  335 aaagttaaatagttgatccatcaccaaattatctcaccatcactatttttctcgnnnnnnnnnnctctctctttaaataaaacctttcatttgcttaatt 434  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41405324 aaagttaaatagttgattcatcaccaaattatctcaccatcactatttttctcgtttttttt--ctctctctttaaataaaacctttcatttgcttaatt 41405421  T
Q  435 tgaaaaataaaaagatcctcacctgttattgttagaggttacaaaatggttgttttgtgcttggattcttctc 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41405422 tgaaaaataaaaagatcctcacctgttattgttagaggttacaaaatggttgttttgtgcttggattcttctc 41405494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35757202 - 35757020
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35757202 gttttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatacca 35757104  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35757103 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35757020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 153 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41991039 - 41990869
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41991039 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 41990940  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtacct 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  41990939 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggtacct 41990869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 45063537 - 45063355
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45063537 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggatacca 45063438  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | | ||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  45063437 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcaccaa 45063355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31429657 - 31429474
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31429657 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggatacca 31429558  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31429557 cttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcacca 31429474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 43499486 - 43499669
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43499486 gttttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 43499585  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  43499586 cttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcacca 43499669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33720218 - 33720070
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33720218 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggatacca 33720119  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33720118 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Original strand, 33870246 - 33870424
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33870246 gttttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 33870345  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||  ||||||||||    
T  33870346 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 334
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  176 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  276 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 10618299 - 10618474
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||    
T  10618299 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-------gatagttcatgaatacca 10618391  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10618392 cttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 10618474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 35767482 - 35767657
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||       | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35767482 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 35767574  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35767575 cttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 35767657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35752205 - 35752034
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  35752205 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 35752113  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  35752112 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35752034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 203 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076527
Alignment:
Q  203 atgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacct 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  303 atcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacc 30076527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233933
Alignment:
Q  197 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  297 ttacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
     |||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcaccaaa 28233933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 43489219 - 43489393
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  43489219 gttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 43489311  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  43489312 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcaccaaa 43489393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36817016 - 36816844
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  36817016 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 36816924  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  36816923 ----aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 36816844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24923195 - 24923024
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||           
T  24923195 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg------- 24923103  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  24923102 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacc 24923024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46817592 - 46817421
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||           
T  46817592 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 46817500  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  46817499 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 46817421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 37127939 - 37128109
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              
T  37127939 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 37128028  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  37128029 -taaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 37128109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Original strand, 41405193 - 41405332
Alignment:
Q  19 gatgcttactggaagctacctaatatcaacacttcagttgttggttgtag--------gttgcgcaaacttcttttgaaattgaattataggctgttttt 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41405193 gatgcttaccggaagctacctaatatcaacacttcatttgttggttgtagacatttaggttgcgcaaacttcttttgagattgaattataggctgttttt 41405292  T
Q  111 gaaggcaagcttttcgagatagatagacacaaaagttaaa 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41405293 gaaggcaagcttttcaagatagatagacacaaaagttaaa 41405332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 165 - 299
Target Start/End: Original strand, 44564352 - 44564486
Alignment:
Q  165 tacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  44564352 tacatttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgc 44564451  T
Q  265 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44564452 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatta 44564486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Original strand, 48085859 - 48086016
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  48085859 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 48085951  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  48085952 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 48086016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26941703 - 26941546
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  26941703 gttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 26941611  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  26941610 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggta 26941546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7876495 - 7876328
Alignment:
Q  156 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 255  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||               
T  7876495 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------- 7876407  T
Q  256 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  7876406 aatatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacc 7876328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 24228542 - 24228713
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  24228542 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 24228634  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  24228635 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 24228713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46898187 - 46898016
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||       
T  46898187 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata--- 46898091  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46898090 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 46898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 215 - 334
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405531
Alignment:
Q  215 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttcca 314  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  315 tgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||   |||||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcacc 44405531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 335
Target Start/End: Original strand, 29098749 - 29098920
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||         
T  29098749 aaagttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat----- 29098843  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
              || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||| || | ||||||| ||||    
T  29098844 ----------atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgttacca 29098920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 29610636 - 29610807
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||           
T  29610636 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg------- 29610728  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  29610729 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcatagttgccacc 29610807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Original strand, 33393329 - 33393499
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33393329 gttttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 33393428  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    | ||||||           || ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33393429 cctaaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45502989 - 45502817
Alignment:
Q  150 aagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||           |||||    
T  45502989 aagttttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gatac 45502901  T
Q  250 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45502900 catttaaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 21718118 - 21718288
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  21718118 gttttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 21718210  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  21718211 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 334
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904388
Alignment:
Q  218 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  318 gtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| | |||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacc 41904388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44003541 - 44003370
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44003541 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 44003442  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  44003441 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 44003370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45237703 - 45237533
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||            
T  45237703 ttttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatg-------- 45237612  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
       || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  45237611 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacc 45237533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 498359 - 498186
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||           
T  498359 gttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 498267  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
        || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| || | |||||| ||||||    
T  498266 ----aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccaccaa 498186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25037679 - 25037522
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||           
T  25037679 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg------- 25037587  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
        || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  25037586 ----aatatgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggta 25037522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32556777 - 32556640
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||           
T  32556777 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg------- 32556685  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 300  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32556684 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 2332020 - 2332192
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||           
T  2332020 gttttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg------- 2332112  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  2332113 ----aatatgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcacca 2332192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39453646 - 39453484
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||               
T  39453646 gttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt----------- 39453558  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
           ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  39453557 -------atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 335
Target Start/End: Original strand, 26371067 - 26371222
Alignment:
Q  169 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||    
T  26371067 tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgcttat 26371155  T
Q  269 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  26371156 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 26371222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 7257382 - 7257556
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7257382 gttttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 7257481  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    | |||||| |||           ||||  ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7257482 cctaaaaaggtg-----------aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcaccaaa 7257556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16482954 - 16482847
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16482954 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggatacca 16482855  T
Q  252 cttaaaaa 259  Q
    | ||||||    
T  16482854 cctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47906930 - 47906758
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  47906930 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 47906838  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||| || ||||| || | |||||| ||||    
T  47906837 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttgccacc 47906758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 317
Target Start/End: Original strand, 41855061 - 41855214
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||              
T  41855061 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca---------- 41855150  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  41855151 -taaatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatgg 41855214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Original strand, 39323617 - 39323709
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39323617 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 44659845 - 44660015
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||           
T  44659845 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------- 44659936  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||| ||||    
T  44659937 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 44660015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47460942 - 47460771
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47460942 ttttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 47460843  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  47460842 ctaaaaagatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacca 47460771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15644117 - 15644010
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15644117 gttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 15644018  T
Q  252 cttaaaaa 259  Q
    | ||||||    
T  15644017 cctaaaaa 15644010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 39866667 - 39866758
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39866667 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 333
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103291
Alignment:
Q  157 ttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 256  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||           |    
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------a 46103214  T
Q  257 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  46103215 atatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 252
Target Start/End: Original strand, 29863017 - 29863116
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  29863017 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Original strand, 35484637 - 35484795
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||          
T  35484637 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------ 35484730  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
         || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  35484731 -----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggta 35484795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 33455098 - 33455189
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33455098 ttttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7720676 - 7720574
Alignment:
Q  150 aagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| | | | |||| ||||||||||||||||||    
T  7720676 aagttttttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggatac 7720577  T
Q  250 cac 252  Q
    |||    
T  7720576 cac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30077107 - 30077043
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 216  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077107 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 262  Q
    ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  263 g 263  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Original strand, 35557731 - 35557798
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 219  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557731 gttttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443602
Alignment:
Q  191 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 290  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgg 37443646  T
Q  291 ggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||| | |||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  37443645 ggtaaattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtcacc 37443602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 214
Target Start/End: Original strand, 35823291 - 35823353
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 214  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823291 gttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 260
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  199 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 334
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323779
Alignment:
Q  266 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 39323779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272253
Alignment:
Q  269 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagttaaa 343  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcaccaaaattaaa 42272253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21649550 - 21649442
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| || || |  | ||||||||| |||||||||    
T  21649550 gttttttttagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggatacc 21649451  T
Q  251 acttaaaaa 259  Q
    || ||||||    
T  21649450 acctaaaaa 21649442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 188
Target Start/End: Original strand, 42272146 - 42272188
Alignment:
Q  146 ttaaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaat 188  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  42272146 ttaaaggttttttctagattacctttgaagaatggtggctaat 42272188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 320
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866806
Alignment:
Q  276 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggta 39866806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 5882506 - 5882688
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882506 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 5882605  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5882606 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5882688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 155 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101494
Alignment:
Q  155 ttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  255 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcacca 18101494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22551243 - 22551060
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22551243 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 22551144  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22551143 cctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 22551060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 147 - 337
Target Start/End: Original strand, 8615235 - 8615425
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615235 taaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 8615334  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8615335 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 8615425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14891561 - 14891383
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891561 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 14891462  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  14891461 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 24168091 - 24168273
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168091 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24168190  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24168191 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24168273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26377386 - 26377204
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377386 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 26377287  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26377286 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26377204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 332
Target Start/End: Original strand, 2892189 - 2892368
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2892189 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2892288  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2892289 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19415715 - 19415533
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19415715 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggatacca 19415616  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19415615 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19415533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7345294 - 7345114
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7345294 gttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 7345195  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7345194 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtctaccttagttgtca 7345114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7393774 - 7393586
Alignment:
Q  146 ttaaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7393774 ttaaaggttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 7393675  T
Q  246 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7393674 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacc 7393586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 149 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 960089 - 959903
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  960089 aaagttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagata 959990  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  959989 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 959903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34528044 - 34527862
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34528044 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacca 34527945  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34527944 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34527862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 334
Target Start/End: Original strand, 1970705 - 1970893
Alignment:
Q  146 ttaaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1970705 ttaaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatga 1970804  T
Q  246 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1970805 atatcacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacc 1970893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Original strand, 16703366 - 16703534
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16703366 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 16703465  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16703466 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggta 16703534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 28947087 - 28947270
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28947087 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtatacca 28947186  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28947187 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 28947270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11989139 - 11988974
Alignment:
Q  169 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11989139 tttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttat 11989040  T
Q  269 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11989039 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11988974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22341955 - 22341788
Alignment:
Q  169 tttgaagaatggtgggtaatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341955 tttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 22341856  T
Q  267 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341855 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 22341788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2594034 - 2593852
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2594034 gttttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2593935  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2593934 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 2593852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 599892 - 600075
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599892 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 599991  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  599992 cttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 600075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 149 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24224256 - 24224069
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagatt-acatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 247  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24224256 aaagttttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggat 24224157  T
Q  248 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  24224156 accacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcacca 24224069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10508090 - 10507908
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10508090 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 10507991  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  10507990 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacc 10507908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33452753 - 33452571
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33452753 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccac 33452654  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33452653 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 33452571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19281237 - 19281056
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19281237 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 19281138  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  19281137 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 153 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30743629 - 30743460
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  30743629 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccac 30743530  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  30743529 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggatacc 30743460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5294982 - 5294801
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5294982 ttttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 5294883  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5294882 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5294801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5299534 - 5299353
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5299534 ttttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 5299435  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5299434 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30467785 - 30467656
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30467785 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 30467686  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgt 281  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30467685 cttaaacatgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28949016 - 28948842
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||           
T  28949016 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg------- 28948924  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
        || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  28948923 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 28948842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261929
Alignment:
Q  184 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  284 tggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||| | | | ||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacc 23261929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Original strand, 13329381 - 13329538
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||             
T  13329381 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca--------- 13329471  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13329472 --taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 13329538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 15965433 - 15965604
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||           
T  15965433 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatg------- 15965525  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  15965526 ----aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15965604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 7167582 - 7167753
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7167582 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggatacca 7167681  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7167682 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Original strand, 4487546 - 4487698
Alignment:
Q  171 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || |||| || ||||    
T  4487546 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtactcatgt 4487634  T
Q  271 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  4487635 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 3291009 - 3291179
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||              
T  3291009 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 3291098  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || | || ||||||||    
T  3291099 -taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 3786749 - 3786922
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||           
T  3786749 gttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg------- 3786841  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
        || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  3786842 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccaa 3786922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 1398553 - 1398724
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||           
T  1398553 gttttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatg------- 1398645  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  1398646 ----aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 929659 - 929741
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  929659 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 375895 - 375797
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  375895 gttttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc 375797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1939658 - 1939579
Alignment:
Q  169 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  1939658 tttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913096
Alignment:
Q  259 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtcacc 24913096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 336
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661907
Alignment:
Q  259 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaa 18661907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11743126 - 11743070
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaa 208  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11743126 gttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 259
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844943
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 259  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 334
Target Start/End: Original strand, 34262261 - 34262401
Alignment:
Q  176 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||       || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||           |    
T  34262261 aatggtgggtaatttacccaccaatcaat-------agtaatttattggtggggtcaacatagtttatggataccatctaaaaaggtg-----------a 34262342  T
Q  276 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34262343 atgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34262401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375729
Alignment:
Q  275 aatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 746465 - 746650
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  746465 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 746564  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  746565 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 746650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Original strand, 23901780 - 23901963
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901780 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23901879  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23901880 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 23901963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 152 - 339
Target Start/End: Original strand, 26710344 - 26710531
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710344 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 26710443  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26710444 cttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccaaagt 26710531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 45370989 - 45371172
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45370989 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggatacca 45371088  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45371089 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 45371172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 4034591 - 4034773
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4034591 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 4034690  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4034691 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4034773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6594640 - 6594458
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594640 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 6594541  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6594540 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 6594458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 17600835 - 17601017
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17600835 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 17600934  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17600935 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17601017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 38997100 - 38997282
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997100 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 38997199  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38997200 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13815400 - 13815217
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815400 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 13815301  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13815300 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacca 13815217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2325071 - 2324889
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325071 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2324972  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  2324971 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 2324889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 11184971 - 11185153
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11184971 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 11185070  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11185071 cttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 14660445 - 14660627
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660445 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 14660544  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14660545 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 14660627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27651216 - 27651034
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651216 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 27651117  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27651116 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27651034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 34518366 - 34518548
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34518366 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 34518465  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34518466 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34518548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 40635217 - 40635399
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40635217 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 40635316  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40635317 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40635399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 328
Target Start/End: Original strand, 6430472 - 6430648
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430472 gttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 6430571  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagtt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  6430572 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 6430648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Original strand, 10424594 - 10424773
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424594 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 10424693  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10424694 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 27400402 - 27400585
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400402 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 27400501  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27400502 cttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 27400585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10244764 - 10244582
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244764 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 10244665  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10244664 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Original strand, 32327361 - 32327543
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32327361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 32327460  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32327461 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcacca 32327543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 335
Target Start/End: Original strand, 5726123 - 5726311
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5726123 taaaagttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggt 5726222  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5726223 taccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacca 5726311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 27024414 - 27024596
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024414 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 27024513  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27024514 cttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27024596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 150 - 335
Target Start/End: Original strand, 32948443 - 32948627
Alignment:
Q  150 aagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32948443 aagttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggatac 32948541  T
Q  250 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  32948542 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcacca 32948627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Original strand, 4609626 - 4609809
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609626 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 4609725  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4609726 ttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 4609809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1092133 - 1091951
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092133 gttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 1092034  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1092033 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1091951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14697719 - 14697536
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14697719 gttttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggatacca 14697620  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14697619 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacca 14697536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 40735463 - 40735646
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40735463 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 40735562  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  40735563 cttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcacca 40735646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7892870 - 7892688
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7892870 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggatacca 7892771  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  7892770 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcacc 7892688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 40037142 - 40037323
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40037142 gttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 40037241  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  40037242 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacc 40037323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33427828 - 33427647
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33427828 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 33427729  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  33427728 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 33427647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2914319 - 2914137
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2914319 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 2914220  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  2914219 ttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcacca 2914137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37621052 - 37620865
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggt---caagatagttcatggata 248  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  37621052 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggata 37620953  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37620952 ccacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcaccaa 37620865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 300
Target Start/End: Original strand, 32608379 - 32608527
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32608379 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtatacca 32608478  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608479 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 32608527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 9444683 - 9444874
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttac-------ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9444683 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgg 9444782  T
Q  246 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac---ctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9444783 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacc 9444874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37255514 - 37255337
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37255514 gttttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 37255420  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37255419 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 37255337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32856601 - 32856436
Alignment:
Q  169 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32856601 tttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgcttat 32856502  T
Q  269 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  32856501 gtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 32856436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159802
Alignment:
Q  156 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 255  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  256 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 328
Target Start/End: Original strand, 15925079 - 15925255
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15925079 gttttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 15925178  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagtt 328  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| | |||| |||||    
T  15925179 cttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8433104 - 8432949
Alignment:
Q  146 ttaaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8433104 ttaaaggttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatgg 8433005  T
Q  246 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 301  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8433004 ataccactttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 8432949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 300
Target Start/End: Original strand, 12842103 - 12842250
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  12842103 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaa 12842202  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12842203 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 12842250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 204 - 331
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  204 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  304 tcattcttccatgggtaccttagttgtc 331  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 41172459 - 41172605
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||    
T  41172459 tttttttaaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccact 41172558  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172559 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 277
Target Start/End: Original strand, 42899914 - 42900039
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42899914 gttttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 42900013  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaat 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  42900014 cttaaaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35158220 - 35158048
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  35158220 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 35158129  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  35158128 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaa 35158048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28641463 - 28641289
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  28641463 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 28641371  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
        || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  28641370 ----aatatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 28641289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 29687040 - 29687214
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  29687040 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 29687132  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  29687133 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 29687214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Original strand, 39103046 - 39103216
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||           
T  39103046 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg------- 39103138  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39103139 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Original strand, 145281 - 145450
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||      
T  145281 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-- 145378  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  145379 ---------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19428602 - 19428423
Alignment:
Q  148 aaaagttttttctagattaca-tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||      
T  19428602 aaaagttttttctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatg-- 19428505  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||||    
T  19428504 ---------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccaaa 19428423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21735071 - 21734900
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||           
T  21735071 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg------- 21734979  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21734978 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 21734900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27765033 - 27764863
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           
T  27765033 gttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------- 27764941  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| | |||||| ||||    
T  27764940 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagcctagttgccacc 27764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12333666 - 12333494
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||        
T  12333666 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat---- 12333571  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  12333570 -------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcaccaaa 12333494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 4258489 - 4258660
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           
T  4258489 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgt-gggtcaagatagttcatg------- 4258580  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  4258581 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacca 4258660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543624
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 13543696  T
Q  263 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  13543695 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 27331298 - 27331472
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |          
T  27331298 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa------ 27331391  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  27331392 -tatatatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 27331472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39301367 - 39301197
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  39301367 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 39301276  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
       || |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  39301275 ---aatatgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 319
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229793
Alignment:
Q  201 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  301 ctatcattcttccatgggt 319  Q
    | | |||||||||||||||    
T  1229775 ccaccattcttccatgggt 1229793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43899141 - 43898970
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||           
T  43899141 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------- 43899049  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  43899048 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 43898970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447632
Alignment:
Q  227 gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttag 326  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  327 ttgtcacca 335  Q
    |||||||||    
T  447640 ttgtcacca 447632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 44481827 - 44481998
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44481827 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 44481926  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           || || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  44481927 cctaaaaaggtg-----------aaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 44481998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 12730060 - 12730231
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||             
T  12730060 gttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca--------- 12730150  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
      |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  12730151 --taaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 12730231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28566869 - 28566703
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||           
T  28566869 gttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg------- 28566777  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttg 329  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  28566776 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2688905 - 2688729
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||      
T  2688905 taaaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-- 2688808  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  2688807 ---------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2688729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 232
Target Start/End: Original strand, 12814613 - 12814693
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814613 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 3266296 - 3266387
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  3266296 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Original strand, 34249281 - 34249435
Alignment:
Q  169 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||||||||||    
T  34249281 tttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgtgcttat 34249369  T
Q  269 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  34249370 gtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34249435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Original strand, 35126779 - 35126886
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35126779 gttttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 35126878  T
Q  252 cttaaaaa 259  Q
    | ||||||    
T  35126879 cctaaaaa 35126886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 43356098 - 43356267
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  43356098 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 43356187  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  43356188 ----aatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacca 43356267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 224 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  224 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40544252 - 40544155
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40544252 taaaggttttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711803
Alignment:
Q  184 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 283  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||| |||||||||||||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtat 3711752  T
Q  284 tggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  3711753 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3711803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Original strand, 8056623 - 8056779
Alignment:
Q  150 aagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| || |||||||||||||         
T  8056623 aagttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg----- 8056717  T
Q  250 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
          || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||    
T  8056718 ------aatatgcgcttatgtagctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2000508 - 2000339
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||             
T  2000508 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttca--------- 2000418  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
      |||| ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  2000417 --taaatatgtgcttacgtggctcatatgtatt-gttggggtaaattactcatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 2000339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 334
Target Start/End: Original strand, 12827137 - 12827243
Alignment:
Q  227 gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttag 326  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||| |  |||    
T  12827137 gggttaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccacaggtgctctag 12827235  T
Q  327 ttgtcacc 334  Q
    ||||||||    
T  12827236 ttgtcacc 12827243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Original strand, 30545820 - 30545917
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30545820 gttttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatac 30545917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38985439 - 38985342
Alignment:
Q  160 tagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 259  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38985439 tagattacatttga-gaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28020003 - 28019959
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccac 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020003 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Original strand, 10176558 - 10176625
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 219  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10176558 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 332
Target Start/End: Original strand, 3266399 - 3266455
Alignment:
Q  276 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  3266399 atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 40544143 - 40544083
Alignment:
Q  276 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  40544143 atgtgtattggttgaggtaaattacacatcattctttcatgggtagtctagttgtcaccaa 40544083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17799345 - 17799296
Alignment:
Q  235 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  17799345 atagttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 126)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21366789 - 21366606
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366789 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 21366690  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21366689 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 21366606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 151 - 334
Target Start/End: Original strand, 34276546 - 34276729
Alignment:
Q  151 agttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276546 agttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 34276645  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34276646 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34276729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 9798465 - 9798650
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798465 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 9798564  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9798565 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 9798650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 23437592 - 23437775
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437592 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 23437691  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23437692 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 23437775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31532317 - 31532134
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532317 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 31532218  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31532217 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 31532134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 42085207 - 42085389
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42085207 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 42085306  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42085307 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 42085389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 333
Target Start/End: Original strand, 6019929 - 6020109
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6019929 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6020028  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6020029 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53854611 - 53854429
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854611 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 53854512  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  53854511 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacca 53854429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 237477 - 237659
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  237477 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataaca 237576  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  237577 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 237659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 39077545 - 39077727
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39077545 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 39077644  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39077645 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39077727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42766023 - 42765842
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42766023 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatacca 42765925  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42765924 cttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 42765842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Original strand, 44984763 - 44984945
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984763 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 44984862  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44984863 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 44984945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 338
Target Start/End: Original strand, 54607962 - 54608148
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54607962 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtatacca 54608061  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaag 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  54608062 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcaccaaag 54608148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18462197 - 18462012
Alignment:
Q  150 aagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18462197 aagttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatat 18462098  T
Q  250 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18462097 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacca 18462012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32366842 - 32366661
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366842 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 32366743  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32366742 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 54575127 - 54574930
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54575127 taaaggttttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatgga 54575028  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagttaaat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  54575027 taccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatagataaat 54574930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 51363007 - 51363189
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51363007 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 51363106  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51363107 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacca 51363189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2826863 - 2826682
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2826863 gttttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2826764  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2826763 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 2826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 53461998 - 53461816
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53461998 gttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 53461899  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53461898 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 53461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 29478360 - 29478545
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478360 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 29478459  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29478460 cttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccaaa 29478545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 146613 - 146429
Alignment:
Q  150 aagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146613 aagttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 146514  T
Q  250 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  146513 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacc 146429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41702641 - 41702461
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41702641 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 41702542  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41702541 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 41949382 - 41949569
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949382 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 41949481  T
Q  252 cttaaaaatgtgct--tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  41949482 cttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcaccaaa 41949569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 331
Target Start/End: Original strand, 6285303 - 6285486
Alignment:
Q  148 aaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 247  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6285303 aaaagttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggat 6285402  T
Q  248 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6285403 accacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26091440 - 26091257
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091440 gttttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 26091341  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26091340 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 26091257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19387870 - 19387688
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19387870 gttttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatacca 19387771  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19387770 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 31914198 - 31914379
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31914198 gttttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 31914297  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31914298 cttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31914379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43471877 - 43471695
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43471877 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggatacca 43471778  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43471777 cttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 43471695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 45797479 - 45797661
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45797479 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 45797578  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45797579 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 45797661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 47344656 - 47344838
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344656 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47344755  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47344756 cttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 55056441 - 55056259
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55056441 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaa 55056342  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  55056341 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacc 55056259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 152 - 317
Target Start/End: Original strand, 27373076 - 27373241
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27373076 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 27373175  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27373176 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 27373241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Original strand, 397402 - 397582
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  397402 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 397501  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  397502 cttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 155 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972332
Alignment:
Q  155 ttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 254  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  255 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcaccaaag 31972332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 56023180 - 56022997
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56023180 gttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatacca 56023081  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  56023080 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacca 56022997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22618693 - 22618514
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22618693 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccac 22618595  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22618594 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 38591668 - 38591846
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591668 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 38591767  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     |    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38591768 tt----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38591846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 153 - 330
Target Start/End: Original strand, 50534632 - 50534809
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50534632 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 50534731  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgt 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  50534732 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 343
Target Start/End: Original strand, 54086404 - 54086599
Alignment:
Q  146 ttaaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54086404 ttaaaggttttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatgg 54086501  T
Q  246 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagttaaa 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  54086502 ataccgcttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaatttaaa 54086599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 41560328 - 41560512
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41560328 gttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 41560427  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41560428 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcaccaa 41560512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 337
Target Start/End: Original strand, 42222292 - 42222476
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42222292 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccac 42222391  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  42222392 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcaccaaa 42222476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 407754 - 407935
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  407754 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ca 407852  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  407853 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 407935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 55519827 - 55520010
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55519827 gttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggatacca 55519926  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  55519927 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 55520010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 3170626 - 3170808
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3170626 gttttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 3170725  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3170726 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 3170808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29777439 - 29777257
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  29777439 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggatacca 29777340  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29777339 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 29777257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49881245 - 49881058
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49881245 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 49881146  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggg----taaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49881145 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacca 49881058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 55776045 - 55776226
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55776045 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatacca 55776143  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  55776144 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55776226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 55840223 - 55840404
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55840223 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatacca 55840321  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  55840322 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55840404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 23609087 - 23609272
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609087 gttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggatacca 23609186  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23609187 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcaccaaa 23609272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 148 - 336
Target Start/End: Original strand, 35446502 - 35446689
Alignment:
Q  148 aaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35446502 aaaagttttttctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggat 35446600  T
Q  248 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35446601 atcacttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgttaccaa 35446689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 50457992 - 50457812
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50457992 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 50457893  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50457892 cttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14017556 - 14017376
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14017556 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 14017457  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14017456 ctt--aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 14017376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 2243458 - 2243640
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2243458 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggatacca 2243557  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2243558 cttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 2243640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3692392 - 3692210
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  3692392 gttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgatacca 3692293  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3692292 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3692210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31070255 - 31070074
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31070255 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gatacca 31070157  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31070156 cttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31070074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 50234000 - 50234182
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50234000 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggatacca 50234099  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  50234100 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacc 50234182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 42033175 - 42033360
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42033175 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 42033274  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42033275 cttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 42033360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41632188 - 41632006
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  41632188 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatatcg 41632090  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  41632089 cttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcacca 41632006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47662284 - 47662102
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  47662284 gttttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggatacca 47662185  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47662184 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47662102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 53834235 - 53834055
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53834235 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccac 53834136  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  53834135 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 48313557 - 48313738
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48313557 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggatacca 48313655  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48313656 ctt-aaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 48313738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 1932763 - 1932945
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1932763 gttttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagatacca 1932862  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  1932863 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacc 1932945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 334
Target Start/End: Original strand, 48657826 - 48658000
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48657826 tttttttagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 48657919  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48657920 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48658000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22468951 - 22468788
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22468951 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccac 22468852  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatg 316  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  22468851 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 50536806 - 50536628
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50536806 gttttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggatacca 50536707  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgt 330  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  50536706 cttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 54424982 - 54425163
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54424982 gttttatctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 54425081  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  54425082 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39587961 - 39587796
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587961 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 39587862  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  39587861 cttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 54805800 - 54805614
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  54805800 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagatacca 54805701  T
Q  252 cttaaaaatgtg----cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  54805700 cttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33897675 - 33897507
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33897675 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33897576  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtacc 322  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  33897575 taaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtacc 33897507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 48654815 - 48655002
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  48654815 ttttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccac 48654914  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggcta------atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  48654915 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacc 48655002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 48259691 - 48259528
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48259691 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccac 48259592  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||    
T  48259591 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728307
Alignment:
Q  192 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  292 gtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45633950 - 45633779
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  45633950 gttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 45633858  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  45633857 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36533002 - 36532830
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36533002 gttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaattta--cacc--------acaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 36532913  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36532912 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 36532830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5117613 - 5117461
Alignment:
Q  148 aaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||       
T  5117613 aaaagttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--- 5117517  T
Q  248 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 311  Q
            || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5117516 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 5117461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9998102 - 9997930
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||       
T  9998102 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata--- 9998006  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9998005 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 9997930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15060460 - 15060286
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  15060460 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 15060368  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
        || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  15060367 ----aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 15060286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 332
Target Start/End: Original strand, 51951683 - 51951861
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||     
T  51951683 ttttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcag 51951782  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  51951783 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 51951861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37239261 - 37239090
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  37239261 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 37239169  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  37239168 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37239090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 34552319 - 34552493
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||           
T  34552319 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg------- 34552411  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
        || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  34552412 ----aatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 34552493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 43890929 - 43891099
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||            
T  43890929 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatg-------- 43891020  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43891021 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacc 43891099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 334
Target Start/End: Original strand, 54715034 - 54715206
Alignment:
Q  151 agttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||          
T  54715034 agttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg------ 54715127  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
         || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  54715128 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 54715206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20352012 - 20351842
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  20352012 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 20351921  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  20351920 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 20351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 22620593 - 22620767
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  22620593 gttttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 22620685  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||| |||||||    
T  22620686 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccaccaaa 22620767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 54216313 - 54216487
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  54216313 gttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 54216405  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
        || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||    
T  54216406 ----aatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtcatcaaa 54216487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31881485 - 31881314
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  31881485 gttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 31881393  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  31881392 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4486752 - 4486604
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||           
T  4486752 gttttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg------- 4486660  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 311  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4486659 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 4486604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 34835177 - 34835348
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34835177 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 34835276  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
      |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34835277 tctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34835348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38547772 - 38547601
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38547772 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38547673  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  38547672 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 38547601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46708908 - 46708741
Alignment:
Q  156 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 255  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||               
T  46708908 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 46708820  T
Q  256 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  46708819 aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacc 46708741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 52688349 - 52688520
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||           
T  52688349 gttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg------- 52688441  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  52688442 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 27580120 - 27580290
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27580120 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27580219  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  27580220 ctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccatcatttttccatgggtatcttatttgtcacc 27580290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27398774 - 27398664
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27398774 gttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27398675  T
Q  252 cttaaaaatgt 262  Q
    |||||||||||    
T  27398674 cttaaaaatgt 27398664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Original strand, 33289703 - 33289860
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||      
T  33289703 gttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac-- 33289800  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33289801 ---------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 33289860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 335
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595870
Alignment:
Q  237 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacca 35595870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Original strand, 47811904 - 47812077
Alignment:
Q  150 aagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 249  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||         
T  47811904 aagttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatg----- 47811998  T
Q  250 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
          || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  47811999 ------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacc 47812077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27873719 - 27873571
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||           
T  27873719 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg------- 27873627  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 311  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27873626 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 27873571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 49014098 - 49014270
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||           
T  49014098 gttttttttaaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 49014190  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  49014191 ----aatatgtacttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 49014270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 54216907 - 54216735
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||           
T  54216907 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg------- 54216815  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  54216814 ----aatatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcacca 54216735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14335271 - 14335165
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14335271 ttttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccac 14335172  T
Q  253 ttaaaaa 259  Q
     ||||||    
T  14335171 ctaaaaa 14335165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 337
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509481
Alignment:
Q  207 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatca 306  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | | ||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  307 ttcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcaccaaa 42509481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 52461366 - 52461534
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  52461366 gttttttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 52461455  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  52461456 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 52461534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 330
Target Start/End: Original strand, 46720025 - 46720195
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46720025 gttttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggatacca 46720124  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgt 330  Q
    | |||||| |||  |||       |||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  46720125 cctaaaaaggtg-atat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1662430 - 1662323
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1662430 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 1662331  T
Q  252 cttaaaaa 259  Q
    | ||||||    
T  1662330 cctaaaaa 1662323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 290
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  200 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa-gatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 236
Target Start/End: Original strand, 42557583 - 42557666
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagat 236  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42557583 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 43231503 - 43231601
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43231503 gttttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3293194 - 3293102
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3293194 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6371420 - 6371249
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||    
T  6371420 gttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttacca 6371321  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  6371320 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 6371249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11972300 - 11972208
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 244  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11972300 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 335
Target Start/End: Original strand, 573807 - 573975
Alignment:
Q  156 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 255  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  573807 tttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 573906  T
Q  256 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  573907 aaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcacca 573975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33558112 - 33557960
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||            
T  33558112 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-------- 33558021  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatg 316  Q
       || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33558020 ---aatatgtatttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 33557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 337
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872753
Alignment:
Q  180 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgt 27872695  T
Q  280 gtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27872696 ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcaccaaa 27872753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 232 - 333
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  232 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-tggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T
Q  332 ac 333  Q
    ||    
T  35344967 ac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 333
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049062
Alignment:
Q  261 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 49058038 - 49057933
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| || ||||||||| |||||||     
T  49058038 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccat 49057939  T
Q  253 ttaaaa 258  Q
    ||||||    
T  49057938 ttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981493
Alignment:
Q  189 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 51981525  T
Q  289 ggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  51981524 ggggtaaattactcatcattctttcattggta 51981493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206510
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag----atagttcatggataccacttaaaa 258  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T
Q  259 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
       |    |||||   |||||  ||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18206582 --ttaaaaatgtg---aatgttcattggttgaaataaattacccatcatttttccatgggtaccttagttgtcaccaa 18206510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259704
Alignment:
Q  257 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 48259704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 334
Target Start/End: Original strand, 42558270 - 42558367
Alignment:
Q  229 gtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagtt 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  42558270 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt--------ggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagtt 42558361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17555668 - 17555617
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17555668 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291805
Alignment:
Q  266 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || | || ||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1662313 - 1662261
Alignment:
Q  282 attggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1662313 attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 1662261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Original strand, 43478060 - 43478147
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 240  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||   ||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  43478060 gttttttctagattactttcaaagaaccatgggtaatttatcgatcaaccaatgaaa-tgagcaatttattagtgtggtcaagatagtt 43478147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 199
Target Start/End: Original strand, 35195078 - 35195125
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  35195078 gttttttctagattacatttaaagaatggtggctaccttacccaccaa 35195125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47105148 - 47105108
Alignment:
Q  202 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 242  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47105148 aatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttca 47105108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 111)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43612229 - 43612047
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43612229 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggatacca 43612130  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43612129 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43612047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 47257793 - 47257975
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47257793 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 47257892  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47257893 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47257975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 49330037 - 49330219
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330037 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 49330136  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49330137 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 49330219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 41464352 - 41464537
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41464352 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 41464451  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41464452 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcaccaaa 41464537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7855296 - 7855114
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7855296 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggatacca 7855197  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7855196 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 7855114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40131141 - 40130959
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131141 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggatacca 40131042  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40131041 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 40130959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38416905 - 38416724
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38416905 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 38416806  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38416805 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38416724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 51170215 - 51170034
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51170215 gttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 51170116  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51170115 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 22399097 - 22399279
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22399097 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaacca 22399196  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22399197 ctt-aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 22399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 24100283 - 24100465
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24100283 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatacca 24100381  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24100382 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 24100465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28048574 - 28048391
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048574 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 28048475  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28048474 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 28048391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47809779 - 47809596
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47809779 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47809680  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47809679 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47809596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27067160 - 27066978
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27067160 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 27067061  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27067060 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 27066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39634756 - 39634572
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39634756 aaagttttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggata 39634658  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39634657 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39634572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29626009 - 29625839
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29626009 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 29625910  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtacc 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29625909 cttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtacc 29625839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32234579 - 32234398
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234579 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 32234480  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32234479 ctt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32234398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 40419835 - 40420017
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419835 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 40419934  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40419935 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40420017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 42291842 - 42292024
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42291842 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 42291941  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42291942 cttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 42292024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48739415 - 48739233
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48739415 gttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatacca 48739316  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48739315 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48739233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51452935 - 51452751
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452935 aaagttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggata 51452836  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  51452835 ccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcacc 51452751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 52628954 - 52629138
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52628954 gtttattctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 52629053  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  52629054 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccaaa 52629138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 40643800 - 40643983
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40643800 gttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatca 40643899  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40643900 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 40643983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 2666000 - 2666182
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2666000 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2666099  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  2666100 cttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacc 2666182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7755488 - 7755307
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7755488 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggatacca 7755389  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7755388 ctt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacc 7755307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35748493 - 35748311
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35748493 gttttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 35748394  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35748393 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 35748311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 37313399 - 37313584
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37313399 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 37313498  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  37313499 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcaccaaa 37313584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 55453426 - 55453245
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55453426 gttttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 55453327  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  55453326 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 39053394 - 39053576
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39053394 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatacca 39053493  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||  |||||||||||    
T  39053494 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacc 39053576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51102560 - 51102378
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51102560 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 51102461  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  51102460 cttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40804691 - 40804510
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40804691 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccac 40804592  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40804591 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 40804510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 44222829 - 44223014
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  44222829 gttttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaatacca 44222928  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44222929 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 44223014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 46134357 - 46134549
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134357 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46134456  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagttaaata 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||||| |||| || ||||||||| | |||||||    
T  46134457 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcaccatatttaaata 46134549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 161 - 332
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609903
Alignment:
Q  161 agattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 260  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  261 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 37324541 - 37324723
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37324541 gttttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtatacca 37324640  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37324641 cttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 43125831 - 43126012
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43125831 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 43125930  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||| |||||||||||    
T  43125931 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggtacc-tagttgtcacc 43126012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 44806684 - 44806866
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44806684 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggatacca 44806783  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44806784 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacc 44806866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 52215077 - 52215258
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52215077 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 52215176  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  52215177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggtgccttaattatcacc 52215258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20754575 - 20754393
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  20754575 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatca 20754476  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  20754475 cttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcacc 20754393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 53943769 - 53943588
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53943769 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 53943670  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  53943669 cttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacc 53943588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 153 - 333
Target Start/End: Original strand, 43021715 - 43021896
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg-tcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  43021715 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaatacca 43021814  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  43021815 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293319
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  41293398 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacc 41293319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 41732528 - 41732712
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41732528 gttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatacca 41732627  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  41732628 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcaccaa 41732712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 53832666 - 53832486
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53832666 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggatacca 53832567  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || || |||||||||    
T  53832566 attaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 332
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  157 ttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  257 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 175 - 334
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126168
Alignment:
Q  175 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  275 aatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 46126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 52638837 - 52639024
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  52638837 taaaggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatgga 52638936  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  52638937 taccacttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcacc 52639024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 330
Target Start/End: Original strand, 35594121 - 35594299
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  35594121 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatca 35594220  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgt 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  35594221 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Original strand, 24376573 - 24376722
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24376573 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 24376672  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24376673 cttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacc 24376722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 149 - 302
Target Start/End: Original strand, 53637838 - 53637991
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  53637838 aaagttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggata 53637937  T
Q  249 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53637938 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacct 53637991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 319
Target Start/End: Original strand, 36368939 - 36369105
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36368939 gttttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 36369038  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  36369039 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggt 36369105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 18946904 - 18947085
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18946904 ttttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccag 18947003  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18947004 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacc 18947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51146397 - 51146214
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51146397 gttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 51146298  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  51146297 cttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccacca 51146214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5560214 - 5560025
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaat-----gagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5560214 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatgga 5560115  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggc--taatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5560114 taccacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47895002 - 47894822
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47895002 gttttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47894903  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| | | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47894902 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 41216455 - 41216637
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41216455 gttttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggatacca 41216554  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |  |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  41216555 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacc 41216637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 54159170 - 54159000
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  54159170 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagatacca 54159071  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    ||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54159070 cttaaaaatgtgctta---------tgtgtattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 25641646 - 25641817
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||             
T  25641646 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca--------- 25641736  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  25641737 --taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 25641817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 42589830 - 42590001
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  42589830 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 42589922  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  42589923 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 42590001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 298
Target Start/End: Original strand, 37758929 - 37759075
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  37758929 gttttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagatacca 37759028  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759029 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34279892 - 34279720
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  34279892 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 34279800  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| |||||    
T  34279799 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacca 34279720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38156804 - 38156632
Alignment:
Q  151 agttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||          
T  38156804 agttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 38156711  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
         || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38156710 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  156 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 255  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  256 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 51415969 - 51416140
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||        
T  51415969 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat---- 51416064  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  51416065 -------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 51416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 54707391 - 54707220
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           
T  54707391 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 54707299  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  54707298 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 54707220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Original strand, 54401187 - 54401344
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  54401187 gttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 54401279  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 320  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54401280 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 54401344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39141297 - 39141141
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||        
T  39141297 gttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat---- 39141202  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 317  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39141201 -----atatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatgg 39141141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48547011 - 48546842
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  48547011 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaa-atagttcatggatacca 48546914  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
    |||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  48546913 cttaaaaatgtgctt---------atgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 48546842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 55000349 - 55000178
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           
T  55000349 gttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg------- 55000257  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  55000256 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 55000178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47511111 - 47510939
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  47511111 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 47511019  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  47511018 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 47510939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Original strand, 49130578 - 49130746
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||           
T  49130578 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatg------- 49130670  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtc 331  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49130671 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 49130746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 55379985 - 55380157
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55379985 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 55380084  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  55380085 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 55380157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41635971 - 41635800
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           
T  41635971 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 41635879  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  41635878 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacc 41635800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31286963 - 31286793
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  31286963 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 31286872  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  31286871 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 31286793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 25353554 - 25353725
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25353554 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 25353653  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25353654 cctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25353725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 337
Target Start/End: Original strand, 37028718 - 37028897
Alignment:
Q  147 taaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 246  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||      
T  37028718 taaaggttttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg-- 37028815  T
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
             || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||||    
T  37028816 ---------aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccaaa 37028897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 53115447 - 53115618
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53115447 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 53115546  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  53115547 cttaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcacc 53115618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17665695 - 17665549
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  17665695 gttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 17665603  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattc 309  Q
        || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17665602 ----aatatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550467
Alignment:
Q  219 tgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatggg 318  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  319 taccttagttgtcacc 334  Q
    |||| |||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacc 33550467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 40022075 - 40022240
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  40022075 ttttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 40022166  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttg 329  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  40022167 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcgtagttg 40022240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 332
Target Start/End: Original strand, 45058883 - 45059052
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  45058883 gttttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 45058975  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 332  Q
        || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  45058976 ----aatatgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 334
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864671
Alignment:
Q  212 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattctt 52864648  T
Q  312 ccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcacc 52864671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 24688114 - 24688285
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           
T  24688114 gttttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------- 24688206  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  24688207 ----aatatgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30251672 - 30251501
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30251672 gttttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 30251573  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    | |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30251572 cctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 30251501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51224208 - 51224038
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  51224208 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 51224117  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||| ||||    
T  51224116 ----aatatgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 51224038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42998959 - 42998790
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42998959 gttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 42998861  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
    | |||||| |||           ||||  ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42998860 cctaaaaaggtg-----------aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41882161 - 41882063
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41882161 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182131
Alignment:
Q  201 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 333
Target Start/End: Original strand, 51143818 - 51143987
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51143818 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccac 51143917  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 333  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||    
T  51143918 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21597319 - 21597148
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21597319 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
      |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21597219 actaaaaaggtg-----------aatgtttattggtttgggtaaattatccactatttttccatgggtactttagttgtcacc 21597148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2228106 - 2227995
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  2228106 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatca 2228007  T
Q  252 cttaaaaatgtg 263  Q
    ||| ||||||||    
T  2228006 cttcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28576283 - 28576184
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28576283 gttttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43176908 - 43176738
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  43176908 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccac 43176809  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
     |||||| |||            |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43176808 ctaaaaaggtg-----------gatgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 50732088 - 50731986
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  50732088 aaaggtttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggata 50731989  T
Q  249 cca 251  Q
    |||    
T  50731988 cca 50731986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 251
Target Start/End: Original strand, 50780768 - 50780870
Alignment:
Q  149 aaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 248  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  50780768 aaaggtttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggata 50780867  T
Q  249 cca 251  Q
    |||    
T  50780868 cca 50780870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48726169 - 48726070
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  48726169 gttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44946100 - 44945935
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||                 
T  44946100 gttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag------------- 44946014  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  44946013 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacc 44945935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52756214 - 52756066
Alignment:
Q  180 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc----ta 275  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||    ||    
T  52756214 gtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatta 52756126  T
Q  276 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  52756125 atgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 52756066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  161 agattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 260  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  261 gtg 263  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48534122 - 48534007
Alignment:
Q  208 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 307  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48534122 aatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcat 48534034  T
Q  308 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||    
T  48534033 tctttcatgggtagcctagttgccacc 48534007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 48752081 - 48752161
Alignment:
Q  148 aaaagttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 228  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  48752081 aaaagttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 335
Target Start/End: Original strand, 40165682 - 40165823
Alignment:
Q  183 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||    
T  40165682 ggtaatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgttta 40165770  T
Q  283 ttggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 335  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  40165771 ttggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacca 40165823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 334
Target Start/End: Original strand, 41609098 - 41609238
Alignment:
Q  183 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgta 282  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||           |||||  |    
T  41609098 ggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg-----------aatgttca 41609186  T
Q  283 ttggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41609187 ttggttgaggtaaattatccgtcattcttccatgggtacattagttgtcacc 41609238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 52434139 - 52434216
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 228  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  52434139 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Original strand, 177162 - 177268
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  177162 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatacaac 177261  T
Q  253 ttaaaaa 259  Q
     ||||||    
T  177262 ctaaaaa 177268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8847827 - 8847718
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  8847827 tttttttaaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccact 8847728  T
Q  254 taaaaatgtg 263  Q
    ||||||||||    
T  8847727 taaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 204
Target Start/End: Original strand, 37741435 - 37741487
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 204  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37741435 gttttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429227
Alignment:
Q  247 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| | | ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacc 30429227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 51942587 - 51942543
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccac 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51942587 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 50731965 - 50731912
Alignment:
Q  283 ttggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50731965 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 50731912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 336
Target Start/End: Original strand, 50780891 - 50780944
Alignment:
Q  283 ttggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50780891 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 50780944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 282 - 334
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688483
Alignment:
Q  282 attggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 40688483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13944 - 13762
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13944 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 13845  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13844 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 13762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 154 - 339
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2056
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagt 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaagt 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11312 - 11130
Alignment:
Q  154 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 253  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312 tttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 11214  T
Q  254 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11213 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 11130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2614 - 2429
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2614 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacca 2515  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2514 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcaccaaa 2429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 75426 - 75244
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  75426 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcatacca 75327  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  75326 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacc 75244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Original strand, 278006 - 278190
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata--c 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  278006 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccc 278105  T
Q  250 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  278106 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 278190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 164 - 334
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176836
Alignment:
Q  164 ttacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  264 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacc 176836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19036 - 18854
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19036 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacca 18937  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18936 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 18854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Original strand, 32561 - 32710
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32561 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 32660  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 301  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32661 tttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacc 32710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4771 - 4593
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||      ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4771 ttttttctagattaactttgaataatggtgggtaa------caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccac 4678  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4677 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 3089 - 3261
Alignment:
Q  153 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3089 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcac 3179  T
Q  253 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3180 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtcacc 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 7090 - 7265
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          
T  7090 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 7183  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 337  Q
         || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  7184 -----aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 7265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 14744 - 14917
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14744 gttttgtctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 14843  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 336  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14844 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccaa 14917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20649 - 20477
Alignment:
Q  151 agttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20649 agttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacc 20550  T
Q  251 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 334  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20549 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Original strand, 102 - 209
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  102 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaatacca 201  T
Q  252 cttaaaaa 259  Q
    | ||||||    
T  202 cctaaaaa 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4726 - 4618
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4726 gttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacc 4627  T
Q  251 acttaaaaa 259  Q
    | |||||||    
T  4626 atttaaaaa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3500
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 250  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3392 gttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacc 3491  T
Q  251 acttaaaaa 259  Q
    | |||||||    
T  3492 atttaaaaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 300
Target Start/End: Original strand, 17906 - 18043
Alignment:
Q  152 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||| ||| || ||| ||||      
T  17906 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac-- 18003  T
Q  252 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 300  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004 ---------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 258
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19327
Alignment:
Q  163 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag----atagttcatggataccacttaaaa 258  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University