View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16676_low_38 (Length: 261)

Name: NF16676_low_38
Description: NF16676
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16676_low_38
NF16676_low_38
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-250)||(99039-99286)
scaffold0035 (1-236)||(19318-19553)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (1-250)||(3334-3584)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (1-250)||(36105217-36105467)
chr8 (1-250)||(22663138-22663388)
chr8 (1-236)||(22673800-22674036)
chr8 (1-236)||(40845281-40845516)
chr8 (1-248)||(15335969-15336217)
chr8 (1-248)||(15425034-15425282)
chr8 (1-248)||(15516338-15516586)
chr8 (1-250)||(24551296-24551546)
chr8 (1-250)||(1237659-1237909)
chr8 (1-236)||(9320590-9320828)
chr8 (1-220)||(14989369-14989580)
chr8 (1-220)||(23185135-23185355)
chr8 (1-220)||(6407748-6407958)
chr8 (1-236)||(17797444-17797680)
chr8 (1-220)||(45538348-45538568)
chr8 (1-200)||(16207328-16207530)
chr8 (1-236)||(39693557-39693794)
chr8 (1-220)||(18151574-18151775)
chr8 (1-236)||(43639805-43640032)
chr8 (1-220)||(19156218-19156440)
chr8 (111-228)||(3598247-3598364)
chr8 (1-220)||(21301044-21301255)
chr8 (1-220)||(24832965-24833186)
chr8 (1-220)||(12757670-12757892)
chr8 (1-220)||(13430545-13430757)
chr8 (1-236)||(21932905-21933143)
chr8 (1-225)||(33082879-33083103)
chr8 (4-228)||(17914484-17914710)
chr8 (1-220)||(602627-602849)
chr8 (1-192)||(16189006-16189200)
chr8 (1-203)||(30421354-30421558)
chr8 (3-203)||(18121033-18121236)
chr8 (1-236)||(24646360-24646597)
chr8 (1-236)||(29693337-29693574)
chr8 (1-203)||(17441732-17441936)
chr8 (1-228)||(19943257-19943488)
chr8 (1-236)||(16681197-16681432)
chr8 (1-220)||(21288425-21288636)
chr8 (3-250)||(45567778-45568028)
chr8 (1-236)||(23263505-23263741)
chr8 (1-236)||(20382288-20382523)
chr8 (1-59)||(33560295-33560353)
chr8 (1-93)||(18679837-18679929)
chr8 (113-228)||(22745622-22745738)
chr8 (1-235)||(17525623-17525858)
chr8 (1-228)||(17701767-17701996)
chr8 (1-88)||(18719023-18719110)
chr8 (41-236)||(20255460-20255654)
chr8 (162-236)||(43774052-43774127)
chr8 (19-76)||(21540984-21541041)
chr8 (1-59)||(1745181-1745240)
chr8 (1-88)||(18722688-18722775)
chr8 (1-88)||(18731033-18731120)
chr8 (1-203)||(18321083-18321288)
chr8 (1-80)||(17267496-17267575)
chr8 (1-88)||(18685439-18685526)
chr8 (111-250)||(21541078-21541216)
chr8 (166-220)||(1745339-1745393)
chr8 (1-62)||(43644918-43644979)
chr8 (190-250)||(23263506-23263565)
chr8 (1-29)||(45292848-45292876)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-219)||(9185-9403)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (1-236)||(21618274-21618510)
chr6 (1-250)||(16336157-16336403)
chr6 (1-236)||(22076290-22076526)
chr6 (1-250)||(19832901-19833152)
chr6 (1-220)||(15954733-15954953)
chr6 (1-189)||(12349023-12349211)
chr6 (1-220)||(16877243-16877463)
chr6 (1-236)||(20487800-20488037)
chr6 (1-145)||(12423291-12423435)
chr6 (1-220)||(33351828-33352045)
chr6 (1-220)||(19065926-19066137)
chr6 (1-220)||(32544295-32544517)
chr6 (1-220)||(20730603-20730823)
chr6 (1-220)||(22802171-22802391)
chr6 (1-203)||(9717873-9718078)
chr6 (20-236)||(26972109-26972328)
chr6 (1-236)||(18435586-18435824)
chr6 (4-220)||(12715318-12715536)
chr6 (1-233)||(15531509-15531743)
chr6 (1-220)||(29918047-29918266)
chr6 (1-203)||(21625131-21625333)
chr6 (1-236)||(13435562-13435799)
chr6 (50-228)||(25597558-25597738)
chr6 (4-184)||(19688799-19688980)
chr6 (1-156)||(15302230-15302386)
chr6 (5-220)||(16265049-16265265)
chr6 (4-236)||(23284597-23284831)
chr6 (132-220)||(139267-139355)
chr6 (132-220)||(147288-147376)
chr6 (4-236)||(13602205-13602439)
chr6 (1-220)||(20112596-20112819)
chr6 (1-184)||(14100373-14100559)
chr6 (113-220)||(21235256-21235363)
chr6 (1-59)||(19482782-19482840)
chr6 (1-220)||(19086188-19086399)
chr6 (179-247)||(19482933-19483001)
chr6 (1-59)||(17316586-17316644)
chr6 (1-79)||(24116858-24116936)
chr6 (1-220)||(34451568-34451787)
chr6 (1-45)||(17381551-17381595)
chr6 (166-250)||(26589789-26589873)
chr6 (1-88)||(18378344-18378431)
chr6 (113-220)||(17608222-17608331)
chr6 (1-62)||(15987263-15987324)
chr6 (1-62)||(21235155-21235216)
chr6 (113-236)||(22386928-22387053)
chr6 (166-236)||(17381610-17381680)
chr6 (1-70)||(26943606-26943675)
chr6 (123-250)||(19482895-19483019)
chr6 (116-192)||(19624125-19624203)
chr6 (1-42)||(26589629-26589671)
chr6 (183-220)||(12423434-12423471)
chr6 (179-224)||(17316448-17316493)
chr6 (116-236)||(24116974-24117095)
chr6 (195-236)||(26589833-26589874)
chr6 (210-250)||(17381639-17381679)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (1-236)||(29138283-29138517)
chr5 (1-250)||(26759175-26759425)
chr5 (1-220)||(15516995-15517215)
chr5 (1-250)||(30743006-30743256)
chr5 (1-220)||(3245333-3245552)
chr5 (1-250)||(11993914-11994164)
chr5 (1-236)||(42243706-42243943)
chr5 (1-220)||(4887048-4887268)
chr5 (1-220)||(28464240-28464450)
chr5 (1-250)||(33933293-33933547)
chr5 (1-220)||(33022690-33022910)
chr5 (1-151)||(26765524-26765674)
chr5 (1-220)||(41566323-41566545)
chr5 (1-203)||(9088995-9089188)
chr5 (1-220)||(14086428-14086650)
chr5 (1-189)||(25930087-25930267)
chr5 (12-236)||(35986116-35986331)
chr5 (3-236)||(32160794-32161029)
chr5 (1-123)||(28139633-28139755)
chr5 (1-220)||(10848799-10849010)
chr5 (2-184)||(31117904-31118088)
chr5 (1-220)||(35931905-35932117)
chr5 (1-192)||(89339-89533)
chr5 (1-220)||(26784380-26784602)
chr5 (1-220)||(6512322-6512539)
chr5 (1-94)||(30115855-30115948)
chr5 (1-250)||(7745555-7745804)
chr5 (1-220)||(23412865-23413085)
chr5 (1-192)||(21910582-21910776)
chr5 (1-236)||(17814994-17815229)
chr5 (134-220)||(5430044-5430130)
chr5 (1-236)||(21660238-21660466)
chr5 (1-88)||(13545536-13545623)
chr5 (1-88)||(21072264-21072351)
chr5 (1-59)||(23391656-23391714)
chr5 (134-220)||(30115767-30115853)
chr5 (1-88)||(20550921-20551007)
chr5 (1-88)||(19536325-19536412)
chr5 (175-236)||(28139773-28139834)
chr5 (169-236)||(12352692-12352758)
chr5 (1-62)||(642757-642818)
chr5 (165-210)||(9398644-9398689)
chr5 (163-203)||(21072147-21072187)
chr5 (165-236)||(642582-642652)
chr5 (4-87)||(11208011-11208093)
chr5 (118-220)||(23391505-23391604)
chr5 (165-224)||(23478545-23478604)
chr5 (186-236)||(23391504-23391554)
chr5 (165-235)||(23881259-23881328)
chr5 (210-250)||(23391505-23391545)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (1-250)||(14955456-14955706)
chr3 (1-250)||(2785093-2785344)
chr3 (1-250)||(24775412-24775664)
chr3 (1-235)||(21640896-21641130)
chr3 (1-184)||(5213606-5213789)
chr3 (1-203)||(20627358-20627561)
chr3 (1-236)||(21636573-21636800)
chr3 (1-236)||(53056621-53056857)
chr3 (1-250)||(33583258-33583510)
chr3 (1-220)||(46796287-46796497)
chr3 (1-236)||(49666309-49666535)
chr3 (1-220)||(11223592-11223812)
chr3 (1-236)||(46349738-46349974)
chr3 (1-236)||(28582135-28582373)
chr3 (1-236)||(21605557-21605784)
chr3 (1-236)||(29855438-29855675)
chr3 (1-220)||(14969356-14969578)
chr3 (1-203)||(47207735-47207939)
chr3 (1-220)||(40850997-40851208)
chr3 (1-235)||(18121515-18121752)
chr3 (1-236)||(20646183-20646421)
chr3 (1-220)||(30054136-30054347)
chr3 (1-233)||(49642658-49642892)
chr3 (1-220)||(2561217-2561439)
chr3 (1-236)||(13948365-13948602)
chr3 (4-174)||(22140796-22140967)
chr3 (34-220)||(11869130-11869317)
chr3 (1-203)||(40799903-40800106)
chr3 (1-203)||(47405348-47405551)
chr3 (1-220)||(12962995-12963215)
chr3 (1-192)||(37467362-37467556)
chr3 (1-151)||(41495028-41495179)
chr3 (1-236)||(15903227-15903465)
chr3 (1-203)||(16658543-16658748)
chr3 (1-203)||(38177568-38177773)
chr3 (1-156)||(13824098-13824254)
chr3 (134-250)||(33598014-33598130)
chr3 (1-192)||(49553425-49553619)
chr3 (1-236)||(6090761-6090998)
chr3 (1-192)||(12726166-12726360)
chr3 (1-184)||(18142696-18142882)
chr3 (1-228)||(29951339-29951568)
chr3 (1-228)||(30000493-30000722)
chr3 (1-236)||(52920435-52920671)
chr3 (1-88)||(13780627-13780714)
chr3 (5-76)||(45858804-45858875)
chr3 (1-235)||(31303415-31303651)
chr3 (142-236)||(50300373-50300467)
chr3 (3-76)||(11909079-11909152)
chr3 (1-86)||(14393049-14393134)
chr3 (1-86)||(16032554-16032639)
chr3 (1-236)||(1727919-1728145)
chr3 (4-59)||(9700108-9700163)
chr3 (111-250)||(12752509-12752646)
chr3 (103-250)||(37412726-37412871)
chr3 (111-250)||(51341143-51341283)
chr3 (1-192)||(17238858-17239052)
chr3 (1-88)||(25398298-25398385)
chr3 (1-220)||(19888854-19889075)
chr3 (118-250)||(45858630-45858760)
chr3 (19-62)||(51341050-51341093)
chr3 (174-236)||(41495179-41495240)
chr3 (1-39)||(50300252-50300290)
chr3 (210-250)||(1727920-1727960)
chr3 (1-41)||(11868298-11868338)
chr3 (4-88)||(22804066-22804150)
chr3 (169-216)||(512493-512540)
chr3 (20-62)||(12752697-12752739)
chr3 (111-175)||(11908977-11909042)
chr3 (1-62)||(12388941-12389002)
chr3 (175-236)||(25398168-25398228)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-236)||(48570047-48570282)
chr1 (1-220)||(44821376-44821596)
chr1 (1-250)||(25448365-25448617)
chr1 (1-235)||(21702843-21703077)
chr1 (1-250)||(2327240-2327491)
chr1 (1-236)||(46089018-46089245)
chr1 (1-236)||(10251015-10251241)
chr1 (1-220)||(35040195-35040415)
chr1 (1-189)||(30572226-30572414)
chr1 (1-235)||(22599997-22600233)
chr1 (1-236)||(22427172-22427408)
chr1 (1-220)||(2834719-2834938)
chr1 (2-236)||(22464623-22464859)
chr1 (1-220)||(28492233-28492455)
chr1 (1-203)||(29215826-29216029)
chr1 (1-220)||(32785767-32785988)
chr1 (1-235)||(35401838-35402072)
chr1 (1-220)||(39200823-39201043)
chr1 (1-203)||(1900374-1900579)
chr1 (1-220)||(42284657-42284867)
chr1 (1-250)||(12284452-12284704)
chr1 (1-220)||(21120903-21121115)
chr1 (1-220)||(16235127-16235347)
chr1 (1-250)||(7744891-7745141)
chr1 (1-236)||(21204745-21204974)
chr1 (1-233)||(33256170-33256402)
chr1 (1-233)||(33276342-33276574)
chr1 (1-225)||(20954298-20954524)
chr1 (1-220)||(21984625-21984836)
chr1 (7-235)||(38282601-38282831)
chr1 (1-220)||(21134999-21135211)
chr1 (1-236)||(19717553-19717788)
chr1 (1-193)||(22153886-22154081)
chr1 (1-250)||(48704233-48704482)
chr1 (1-106)||(36134219-36134323)
chr1 (1-235)||(23036344-23036578)
chr1 (1-174)||(2267118-2267292)
chr1 (1-59)||(37642277-37642335)
chr1 (1-86)||(14263417-14263502)
chr1 (1-106)||(22201682-22201787)
chr1 (1-160)||(23024817-23024966)
chr1 (1-203)||(7309848-7310052)
chr1 (123-236)||(34255343-34255453)
chr1 (1-220)||(10757450-10757671)
chr1 (1-156)||(2268560-2268713)
chr1 (166-235)||(17371221-17371290)
chr1 (117-220)||(26701958-26702063)
chr1 (188-250)||(34255344-34255406)
chr1 (1-106)||(1577896-1578001)
chr1 (1-59)||(19215641-19215699)
chr1 (1-71)||(21191846-21191916)
chr1 (179-236)||(17024795-17024852)
chr1 (179-220)||(21029003-21029044)
chr1 (1-88)||(17024928-17025015)
chr1 (165-224)||(19170177-19170236)
chr1 (114-209)||(37642382-37642477)
chr1 (179-236)||(19215792-19215849)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (1-250)||(34321762-34322012)
chr2 (1-236)||(33074250-33074486)
chr2 (1-236)||(35743842-35744076)
chr2 (1-250)||(31327791-31328042)
chr2 (1-250)||(31334512-31334763)
chr2 (1-250)||(45087008-45087260)
chr2 (1-220)||(28550784-28550994)
chr2 (1-220)||(28711553-28711774)
chr2 (4-235)||(22785506-22785728)
chr2 (6-220)||(6392662-6392879)
chr2 (1-236)||(22802484-22802718)
chr2 (1-220)||(1586898-1587109)
chr2 (1-223)||(28701081-28701305)
chr2 (1-250)||(30557145-30557397)
chr2 (1-220)||(31967909-31968119)
chr2 (1-220)||(20151890-20152111)
chr2 (1-220)||(40332111-40332322)
chr2 (1-220)||(44840458-44840665)
chr2 (1-220)||(6573978-6574200)
chr2 (1-184)||(22776190-22776364)
chr2 (1-184)||(22781568-22781742)
chr2 (1-236)||(23235031-23235268)
chr2 (1-220)||(3277054-3277265)
chr2 (1-220)||(31800743-31800963)
chr2 (1-236)||(22187941-22188178)
chr2 (1-236)||(38781423-38781658)
chr2 (1-236)||(30667013-30667250)
chr2 (1-142)||(14581539-14581671)
chr2 (1-236)||(22317617-22317856)
chr2 (1-220)||(13963832-13964054)
chr2 (1-220)||(18376760-18376982)
chr2 (1-228)||(20568597-20568826)
chr2 (1-236)||(25037098-25037335)
chr2 (1-236)||(25041205-25041442)
chr2 (1-192)||(25829158-25829352)
chr2 (1-220)||(24377125-24377347)
chr2 (3-236)||(22260432-22260665)
chr2 (1-250)||(24576059-24576309)
chr2 (4-203)||(30621243-30621445)
chr2 (4-203)||(30623864-30624066)
chr2 (11-236)||(9015210-9015436)
chr2 (1-192)||(19540440-19540634)
chr2 (1-236)||(21537087-21537324)
chr2 (1-88)||(40782501-40782588)
chr2 (1-228)||(24850512-24850742)
chr2 (111-203)||(1084142-1084235)
chr2 (1-236)||(10009590-10009826)
chr2 (3-88)||(28140608-28140693)
chr2 (177-220)||(39037496-39037539)
chr2 (116-228)||(7609102-7609213)
chr2 (4-88)||(24779370-24779454)
chr2 (20-62)||(1084049-1084091)
chr2 (179-220)||(23184184-23184225)
chr2 (179-220)||(23595441-23595482)
chr2 (210-250)||(44840625-44840665)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (1-250)||(21962-22212)
scaffold0217 (1-220)||(9590-9809)
scaffold0217 (1-220)||(19061-19283)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (1-250)||(6571-6821)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (1-220)||(6517509-6517729)
chr4 (1-220)||(10692875-10693095)
chr4 (1-220)||(10906641-10906861)
chr4 (1-220)||(17398551-17398761)
chr4 (1-250)||(29121394-29121633)
chr4 (1-203)||(54679954-54680155)
chr4 (1-184)||(3105323-3105506)
chr4 (1-250)||(37435373-37435622)
chr4 (1-220)||(413026-413246)
chr4 (1-144)||(16940040-16940183)
chr4 (8-216)||(3483752-3483963)
chr4 (1-236)||(17247268-17247503)
chr4 (1-250)||(3395614-3395868)
chr4 (1-250)||(8105661-8105913)
chr4 (1-220)||(19884726-19884947)
chr4 (1-145)||(25651046-25651191)
chr4 (33-234)||(55731836-55732036)
chr4 (1-156)||(9140936-9141092)
chr4 (4-203)||(13575998-13576198)
chr4 (7-247)||(14904190-14904437)
chr4 (1-220)||(22190870-22191082)
chr4 (1-203)||(22675404-22675607)
chr4 (1-220)||(15475018-15475230)
chr4 (113-220)||(14571161-14571268)
chr4 (1-236)||(45833418-45833655)
chr4 (1-203)||(29680426-29680631)
chr4 (30-203)||(14833449-14833625)
chr4 (1-236)||(40860691-40860918)
chr4 (20-218)||(56034617-56034816)
chr4 (1-156)||(12601125-12601281)
chr4 (113-220)||(16853620-16853727)
chr4 (1-203)||(19911762-19911968)
chr4 (1-236)||(12811028-12811262)
chr4 (1-106)||(37985594-37985699)
chr4 (1-157)||(56532990-56533149)
chr4 (123-236)||(3499514-3499624)
chr4 (1-192)||(16632464-16632658)
chr4 (1-88)||(19621061-19621148)
chr4 (1-88)||(55380314-55380401)
chr4 (1-59)||(9751569-9751627)
chr4 (1-59)||(20977481-20977539)
chr4 (1-59)||(38513902-38513960)
chr4 (140-220)||(3793287-3793367)
chr4 (1-201)||(10072959-10073161)
chr4 (1-220)||(39419611-39419821)
chr4 (179-250)||(3499515-3499586)
chr4 (118-236)||(17700662-17700777)
chr4 (179-250)||(17700663-17700734)
chr4 (4-59)||(27188667-27188722)
chr4 (1-58)||(3499682-3499739)
chr4 (1-236)||(14604758-14604994)
chr4 (1-106)||(19666396-19666501)
chr4 (1-59)||(16853527-16853585)
chr4 (179-215)||(14153874-14153910)
chr4 (142-203)||(23123597-23123660)
chr4 (1-48)||(1672413-1672460)
chr4 (1-48)||(1674888-1674935)
chr4 (165-236)||(40846290-40846360)
chr4 (1-71)||(6641708-6641778)
chr4 (113-232)||(33378531-33378651)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-220)||(60833-61053)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-236)||(215342-215578)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-236)||(7001-7237)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (1-203)||(2265448-2265651)
chr7 (12-186)||(15704445-15704620)
chr7 (1-234)||(35952585-35952820)
chr7 (1-236)||(4821500-4821735)
chr7 (1-236)||(8182956-8183191)
chr7 (1-236)||(12174236-12174473)
chr7 (1-184)||(14426573-14426757)
chr7 (1-234)||(48062727-48062952)
chr7 (1-220)||(16542932-16543152)
chr7 (1-220)||(16622510-16622730)
chr7 (1-220)||(48236814-48237034)
chr7 (1-250)||(21283256-21283505)
chr7 (1-220)||(16111796-16112016)
chr7 (1-184)||(30944271-30944455)
chr7 (1-184)||(30945304-30945488)
chr7 (1-217)||(19339174-19339382)
chr7 (1-220)||(27871744-27871956)
chr7 (1-220)||(33605711-33605932)
chr7 (1-236)||(9069588-9069826)
chr7 (1-220)||(14425473-14425683)
chr7 (1-219)||(44467090-44467312)
chr7 (1-214)||(23279875-23280090)
chr7 (1-236)||(19710907-19711145)
chr7 (1-220)||(28622268-28622488)
chr7 (1-220)||(2913518-2913740)
chr7 (1-220)||(15088546-15088768)
chr7 (4-203)||(9709731-9709931)
chr7 (1-228)||(10883076-10883305)
chr7 (1-235)||(13880130-13880366)
chr7 (4-218)||(33691624-33691841)
chr7 (1-142)||(1293056-1293188)
chr7 (1-220)||(21695427-21695649)
chr7 (1-195)||(13302836-13303033)
chr7 (1-189)||(32264669-32264850)
chr7 (1-236)||(15467942-15468179)
chr7 (1-236)||(16316454-16316689)
chr7 (9-220)||(21381349-21381552)
chr7 (1-220)||(2500064-2500286)
chr7 (1-220)||(30025931-30026153)
chr7 (112-254)||(4428964-4429107)
chr7 (1-174)||(24794681-24794847)
chr7 (1-88)||(29935403-29935490)
chr7 (1-198)||(13137827-13138027)
chr7 (1-236)||(11319431-11319668)
chr7 (1-192)||(22577959-22578153)
chr7 (1-236)||(28409065-28409301)
chr7 (1-220)||(331671-331894)
chr7 (1-154)||(19237022-19237175)
chr7 (1-156)||(13648755-13648911)
chr7 (1-188)||(12366690-12366880)
chr7 (1-88)||(14193140-14193227)
chr7 (1-79)||(16309961-16310039)
chr7 (1-88)||(5000867-5000954)
chr7 (1-88)||(21692313-21692400)
chr7 (1-88)||(24788167-24788254)
chr7 (1-250)||(48805769-48806011)
chr7 (16-106)||(16556665-16556755)
chr7 (16-106)||(16608907-16608997)
chr7 (1-233)||(4411870-4412094)
chr7 (113-185)||(7339821-7339893)
chr7 (1-88)||(11792933-11793020)
chr7 (1-88)||(13730720-13730807)
chr7 (165-220)||(39284475-39284530)
chr7 (142-236)||(14193242-14193337)
chr7 (1-62)||(39284635-39284696)
chr7 (1-59)||(13260689-13260747)
chr7 (113-203)||(11793046-11793138)
chr7 (179-236)||(39284474-39284533)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-220)||(78227-78447)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (1-228)||(211428-211654)
scaffold0004 (1-236)||(377403-377640)
scaffold0004 (163-236)||(220432-220504)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (26-220)||(65290-65484)
scaffold0011 (26-220)||(144335-144529)
scaffold0011 (3-250)||(164776-165025)
[»] scaffold0527 (2 HSPs)
scaffold0527 (2-189)||(7963-8150)
scaffold0527 (113-189)||(11-87)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-234)||(5446-5683)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (1-184)||(552-736)
scaffold1359 (1-220)||(1626-1836)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (1-236)||(22706-22944)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-220)||(17636-17846)
[»] scaffold1331 (2 HSPs)
scaffold1331 (1-174)||(1606-1780)
scaffold1331 (179-220)||(472-513)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-213)||(7733-7948)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-236)||(25519-25746)
scaffold0056 (1-220)||(34674-34885)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (73-220)||(2573-2720)
scaffold0473 (1-35)||(2738-2772)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (3-236)||(189-424)
scaffold0084 (1-203)||(49362-49567)
scaffold0084 (1-220)||(32515-32737)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-220)||(89916-90136)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (1-236)||(4791-5028)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (1-236)||(505-742)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-236)||(18465-18702)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-106)||(2707-2811)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (29-220)||(143146-143340)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-220)||(9999-10219)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-220)||(691-902)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (1-97)||(25384-25480)
scaffold0247 (93-220)||(23424-23551)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-236)||(12239-12476)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-192)||(60046-60240)
scaffold0026 (1-192)||(7956-8150)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (1-203)||(25851-26056)
scaffold0083 (4-110)||(44676-44782)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-220)||(27290-27510)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-236)||(20815-21052)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (113-220)||(246108-246215)
scaffold0005 (30-203)||(6074-6250)
scaffold0005 (1-236)||(212384-212620)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (3-203)||(9983-10187)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (30-203)||(30283-30459)
scaffold0047 (4-62)||(9936-9994)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-236)||(87456-87681)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (1-192)||(1690-1884)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-236)||(36619-36856)
scaffold0120 (1-236)||(42149-42386)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-250)||(14678-14927)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-236)||(5536-5771)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-250)||(1720-1969)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (111-218)||(17089-17197)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (114-219)||(39569-39676)
scaffold0022 (114-219)||(137629-137736)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (3-228)||(37937-38164)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (1-106)||(13601-13706)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (1-59)||(7411-7469)
scaffold0387 (166-223)||(7568-7625)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (5-187)||(103606-103791)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (1-59)||(754-812)
scaffold0016 (118-220)||(864-963)
scaffold0016 (186-236)||(914-964)
scaffold0016 (210-250)||(923-963)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (3-76)||(1803-1876)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (3-87)||(15617-15701)
scaffold0211 (194-236)||(15462-15504)
scaffold0211 (180-250)||(15463-15533)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (13-203)||(5211-5393)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (163-250)||(9238-9322)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-192)||(15147-15341)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (113-236)||(4837-4961)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (41-228)||(640-827)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (111-236)||(1521-1649)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-85)||(9825-9909)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (140-217)||(5801-5880)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (166-250)||(11557-11641)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-79)||(15823-15902)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (1-71)||(6037-6107)
scaffold0364 (165-220)||(6203-6256)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (3-62)||(3915-3974)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (165-236)||(13377-13447)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-62)||(9986-10047)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (209-250)||(74805-74846)


Alignment Details
Target: scaffold0035 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 99286 - 99039
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  99286 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcagcgct--ttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccgg 99189  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  99188 tcatctgcaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 99089  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  99088 gataaacttgcttctgatgaacttacttttgatgaccttgcttctgatga 99039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19553 - 19318
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||| |     
T  19553 ttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctag 19454  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||| | |||| |||  || ||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19453 tcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaactacaacttctggtgatctt--gct 19356  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||| ||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19355 tcttat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 19318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 3334 - 3584
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3334 ttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgttatacttttccaa 3433  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  3434 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttc 3533  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3534 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 3584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 36105217 - 36105467
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36105217 ttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgttatacttttccaa 36105316  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  36105317 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttc 36105416  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36105417 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 36105467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 22663138 - 22663388
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  22663138 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatctttccaaaatagttgttgctatatttttccag 22663237  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22663238 tcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctaatgaactacaacttctagtgatcttcagcttc 22663337  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  22663338 taataaacttgcttctgatgaacttgcatctgattaccttgcttctgatga 22663388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22673800 - 22674036
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |     
T  22673800 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatccttccaaaatagatgttgctatacttttctag 22673899  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22673900 tcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctccggatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 22673999  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22674000 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 22674036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40845516 - 40845281
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40845516 ttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccag 40845417  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtga-tcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  40845416 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaagctgcatctcctgatgaactatagcttctggtgagtctt-agctt 40845319  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40845318 ctgataaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgac 40845281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15336217 - 15335969
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||     
T  15336217 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcag 15336118  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  15336117 tcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttc 15336018  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgat 248  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  15336017 tgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgaccttgcttctgat 15335969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15425282 - 15425034
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||     
T  15425282 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcag 15425183  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  15425182 tcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttc 15425083  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgat 248  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  15425082 tgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgaccttgcttctgat 15425034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15516586 - 15516338
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||     
T  15516586 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcag 15516487  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  15516486 tcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttc 15516387  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgat 248  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  15516386 tgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgaccttgcttctgat 15516338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24551296 - 24551546
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||  |||||||||     
T  24551296 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 24551395  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||   | ||||||||| || ||||||||||| ||  |||||    
T  24551396 tcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgatttttggcttc 24551495  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  24551496 tgataaacttgcttctaatgaactcgcttatgatgaactcgcttctgatga 24551546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 1237659 - 1237909
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||      
T  1237659 ttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccgg 1237758  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||| | || |||||||| || ||  |||||    
T  1237759 tcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaattgcagcttctggtaatttttggcttc 1237858  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||    
T  1237859 tgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgaacttgtttcagatga 1237909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 9320590 - 9320828
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||    
T  9320590 ttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaataattgttgcttcacttttcca 9320689  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccg-ttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     |||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  9320690 gtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttagct 9320789  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9320790 tctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 9320828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14989580 - 14989369
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  14989580 ttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt---------ccaaattagccgttgttatacttttccaa 14989490  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||   |||||||    
T  14989489 tcttcagcaatcttcagacgagtttgaatcctttaaacggcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaattgcagcttctggtgattcacagcttc 14989390  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  14989389 tgatgaacttgcttctgatga 14989369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23185355 - 23185135
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||     
T  23185355 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccag 23185256  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  23185255 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 23185156  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  23185155 tgatgaacttgcttctgatga 23185135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6407748 - 6407958
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||| |||||  |||||||||||     
T  6407748 ttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgcctt---------ccaaaatagccgttgtaatacttttccag 6407838  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   || |||||    
T  6407839 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacaacttct 6407938  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  6407939 gatgaacttgcttttgatga 6407958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17797444 - 17797680
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||   |||||||||     
T  17797444 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaattcctttcaaactagccgttgcatcacttttccag 17797543  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    ||||||  ||   ||||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  17797544 tcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaagttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattttcagcttc 17797643  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17797644 tgatgaacttgcttctgatgaatttgcttctgatgac 17797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45538568 - 45538348
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  45538568 ttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccag 45538469  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||   | ||||||||| || ||||||||||| ||  ||||     
T  45538468 tcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgatttttggctta 45538369  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  45538368 tgataaactcgcttctgatga 45538348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 16207328 - 16207530
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||     
T  16207328 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgctttactcttccag 16207427  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  16207428 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagct 16207527  T
Q  198 tct 200  Q
    |||    
T  16207528 tct 16207530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 39693557 - 39693794
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||     
T  39693557 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccag 39693656  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39693657 tcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctacaacttctggtgatcttcagct 39693756  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  39693757 tctgat-gacatgcttttgatgaacttgtttctgatgac 39693794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18151775 - 18151574
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  18151775 ttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatg---------ccttccaaattagtcgttgttatacttttccag 18151685  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||          |||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  18151684 tcttctgcaatcttcagacgagtttgaatc----------cttttgaagctttaagttgcatcttctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttc 18151595  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  18151594 tgatgaacttgcttctgatga 18151574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 43639805 - 43640032
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||          ||||||||||||||  |||||||||||     
T  43639805 ttgtacacttcgtgcaaacgtaacatgtcaacgctctttgaaaaataagcattcaatgccttt---------caaaatagtcgttgtcatacttttccag 43639895  T
Q  101 tcttctacaacttt-agacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| | ||| ||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||   |||||||    
T  43639896 tcttttgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcatgatgaactgcatcttctggtgatacacagcttc 43639995  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43639996 tgatgattttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 43640032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19156218 - 19156440
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||| ||| |     
T  19156218 ttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctag 19156317  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||    |||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19156318 tcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatctcttgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 19156417  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  19156418 tctgatgaacttgcttctgatga 19156440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3598364 - 3598247
Alignment:
Q  111 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttg 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  3598364 ctttagacgagtttgaatctgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgatgaacttg 3598265  T
Q  211 cttctgatgaacttgctt 228  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  3598264 cttatgatgaccttgctt 3598247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21301044 - 21301255
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||          |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21301044 ttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaggagtaagcatccaatgcattt---------caaaatagccgttgccatacttttccaa 21301134  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || ||  | |||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||| || |||||||||||   |||||||    
T  21301135 tcttctgcaatctttaggcgagttagagtcattgaaacagcttttgaaactttgagttcaatttcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttc 21301234  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  21301235 tgatgaacttgcttctgatga 21301255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24833186 - 24832965
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||| | |||||  ||||||| |    
T  24833186 ttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaagtagccattgcttcacttttc-a 24833088  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccg-ttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     |||||| ||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  24833087 gtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttagct 24832988  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  24832987 tctaataaacttgcttctgatga 24832965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12757892 - 12757670
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| || ||     
T  12757892 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctttcag 12757793  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  12757792 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagctactggtgatcttcagct 12757693  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  12757692 tctgatcaacttgcttctgatga 12757670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13430757 - 13430545
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         | || |||||||| |||||  ||||||||| ||    
T  13430757 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatg---------cgtttcaaaatagccgttgtcatacttttctaa 13430667  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttg-aagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| || ||| |||||| || ||| | |||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  | |||||||||||   ||||||    
T  13430666 tcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaaactttaagttccatctcctgatgaactgtagcttctggtgatacacagctt 13430567  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  13430566 ctgatgaacttgcttctgatga 13430545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21932905 - 21933143
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |  ||| || ||     
T  21932905 ttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaatcctttcaaaatagccgttgtttcactctttcag 21933004  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||| | |||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  |||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  21933005 tcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagct 21933104  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  21933105 tctgatgaacttgcttctgataaacttccttctgatgac 21933143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 33082879 - 33083103
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||  |    
T  33082879 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctga 33082978  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  33082979 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gct 33083076  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttg 225  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  33083077 tctgat-gagttgcttcagatgaacttg 33083103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 17914484 - 17914710
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| || || |||    
T  17914484 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtct 17914583  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa--gttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    ||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||   |||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17914584 tctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaactcctaatgagctacaacttctagtgatcttcagcttct 17914683  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||    
T  17914684 gat-gagatgcttctgatgaacttgctt 17914710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 602849 - 602627
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||  ||| ||| |     
T  602849 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaag 602750  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| ||||||||  | |||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  602749 tcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatttcctgatgaactttagcttcttgtgatctttagct 602650  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  602649 tttgatgaacttgcttctgatga 602627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16189006 - 16189200
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  16189006 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 16189105  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| |||   || |||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||  |||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  16189106 tcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcggcttctggtgatctt 16189200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30421558 - 30421354
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaa--gaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcc 98  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||  ||||||||    
T  30421558 ttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaactagtcgttgcttcacttttcc 30421460  T
Q  99 aatcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    | |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  30421459 agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgttgcatcttctgatgaactgcagcttctggtgattttgagct 30421360  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  30421359 tctgat 30421354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18121236 - 18121033
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatc 102  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||  ||| ||| | ||    
T  18121236 gtacacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtc 18121137  T
Q  103 ttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||| |||||||  |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  18121136 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttc 18121037  T
Q  200 tgat 203  Q
    ||||    
T  18121036 tgat 18121033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 24646360 - 24646597
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||  |     
T  24646360 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaatcctttcaaaatagctgttgctacactcttttag 24646459  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||| | |||   ||||||||| || ||||  || |||| | ||||||||||||| |  ||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24646460 tcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcttgatgaactagagcttctggtgatcttcagct 24646559  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24646560 tctgat-aagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 24646597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 29693337 - 29693574
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| || ||     
T  29693337 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaatcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcag 29693436  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||| | ||||||||  |||| |||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29693437 tcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatctcctaatgaactacaacttatggtgatcttcagct 29693536  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | ||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29693537 tatgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 29693574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17441936 - 17441732
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| || | |||||     
T  17441936 ttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatg-cttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctttagtcttccag 17441838  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||| ||| || | ||| || |||| | ||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17441837 tcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagct 17441738  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  17441737 tctgat 17441732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19943257 - 19943488
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaag-aataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||    
T  19943257 ttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcca 19943356  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacag-cttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcag 195  Q
     |||||| |||   ||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  19943357 gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctagtgatctttag 19943456  T
Q  196 cttctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  19943457 cttctgat-gagatgcttctgatgaacttgctt 19943488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16681432 - 16681197
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  ||| |||||     
T  16681432 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcactcttccag 16681333  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||  | ||||| ||||||||  |||    
T  16681332 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctagtgatctt--gct 16681235  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | ||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16681234 tatgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 16681197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21288425 - 21288636
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||          | || |||||||| |||||| |||||||||||     
T  21288425 ttgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctctttgaggagtaagcatccaat---------acatttcaaaatagccgttgccatacttttccag 21288515  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || ||  | |||||  ||||||| |||| ||||  | ||||||||||||| || ||| |||||||   |||||||    
T  21288516 tcttctgcaatctttaggcgagttagagtcaatgaaacaaattttgaatctttgagttcaatttcctgatgaactgcagcttgtggtgatacacagcttc 21288615  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  21288616 tgatgaacttgcttctgatga 21288636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45568028 - 45567778
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatc 102  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||  |  | || ||    
T  45568028 gtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgctattatacttcagtc 45567929  T
Q  103 -ttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaacta-caacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
     |||     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  | ||||||||||| |   |||| ||||| | |||||||    
T  45567928 tttcgctttctttagacgagtttgaatccattaaacagctatttgaaactttaggttgcatctactgatgaactatcgctttctagtgatatacagcttc 45567829  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||  || | |||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  45567828 tgaggaaatagcttctgatagacttgcttctgatgaacttacttctgatga 45567778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23263741 - 23263505
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |  ||| ||| |     
T  23263741 ttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgtttcactcttctag 23263642  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagct-ttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||||| ||   |||||||||| || ||||  || |||| | ||||||| | |||||  |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||  ||    
T  23263641 tcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatgatctt--gc 23263544  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23263543 ttctgat-gaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 23263505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20382523 - 20382288
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| || |||||| | | ||  ||||||| || ||||| |||||||  |||  || |     
T  20382523 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaatcctttcagaatagccgttgcttcactcctctag 20382424  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||| | |||    | |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  20382423 tcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gct 20382326  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20382325 tctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttttgatgac 20382288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 33560353 - 33560295
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33560353 ttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 33560295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 18679837 - 18679929
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatact 93  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  18679837 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctatcaaaatagtcgttgctttact 18679929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 22745622 - 22745738
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttg 210  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  22745622 ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatg 22745720  T
Q  211 cttctgatgaacttgctt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22745721 cttctgatgaacttgctt 22745738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17525858 - 17525623
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||| |  ||| |||||     
T  17525858 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccag 17525759  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaac-agcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||||| ||    ||||||||  || ||||| || ||| | ||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||  ||    
T  17525758 tcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactacagtttctggtgatctt--gc 17525661  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    |||||||  |  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17525660 ttctgat-gagatgcttctgacgaacttgcttctgatga 17525623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17701767 - 17701996
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||  | |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||  |    
T  17701767 ttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctga 17701866  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttc--ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||| | || |||| | |||||||||||||||  | | ||  |||||||||| || |||||||||||| || |||    
T  17701867 tcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcatctgct 17701966  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    ||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  17701967 tctga-agaggtgcttctgatgaacttgctt 17701996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 18719023 - 18719110
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  18719023 ttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctatcaaaatagtcgttgct 18719110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20255654 - 20255460
Alignment:
Q  41 aagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacag 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||   ||||||||| || ||||| || |||||    
T  20255654 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccattgaacag 20255555  T
Q  140 cttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | ||||| ||||||||  |||||    || |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||| ||| |||||||    
T  20255554 cctttgacgctttaagtcttgca---tctaatgagctttatcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatacttctgatgaacttccttatgatgac 20255460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 236
Target Start/End: Original strand, 43774052 - 43774127
Alignment:
Q  162 ttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaac-ttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43774052 ttcctgatgaactacagcttctggtgatacatagcttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatgac 43774127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Original strand, 21540984 - 21541041
Alignment:
Q  19 cgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaa 76  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  21540984 cgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttctattcctttcaaa 21541041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 1745181 - 1745240
Alignment:
Q  1 ttgtacactt-cgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  1745181 ttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgcactttgaagtattagcatccaatgc 1745240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18722775 - 18722688
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||  || |||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18722775 ttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgct 18722688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18731120 - 18731033
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||  || |||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18731120 ttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgct 18731033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18321288 - 18321083
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |  |||||||  |||||||  ||||||  ||| ||        
T  18321288 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcctttgaaaatagctgttgcttcactcttttgg 18321189  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||  | |||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  |||||||||||| || |||||||||||||||  ||    
T  18321188 tctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctact 18321089  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  18321088 tctgat 18321083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 17267496 - 17267575
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatag 80  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  17267496 ttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcctttcaaaatag 17267575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18685526 - 18685439
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||  || |||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  18685526 ttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagttgttgct 18685439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Original strand, 21541078 - 21541216
Alignment:
Q  111 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagct-ttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaact 208  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||| || ||| || || ||| ||||||  ||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||| || |    
T  21541078 ctttagacaaggttgaatccattaaacaactatttaaaactcttaggttgcatctcctgatgaactatagtttctggtgatatacagcttctgatgaaat 21541177  T
Q  209 tgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
     ||||   |||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  21541178 agctt---atgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 21541216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 1745339 - 1745393
Alignment:
Q  166 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||||| || |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1745339 tgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatga 1745393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 43644918 - 43644979
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  43644918 ttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctt 43644979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23263565 - 23263506
Alignment:
Q  190 cttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23263565 cttcagcttctgatgatcttgcttctgatg-aggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 23263506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 45292848 - 45292876
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45292848 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 45292876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 9185 - 9403
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 9284  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9285 tcttctgcaatctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttct 9384  T
Q  201 gataaacttgcttctgatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9385 gataaacttgcttctgatg 9403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21618274 - 21618510
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21618274 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctttacttttccag 21618373  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  21618374 tcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatcttctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttc 21618473  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21618474 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 21618510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16336157 - 16336403
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16336157 ttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccag 16336256  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16336257 tcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaagttgcatctcctgatgatctacaacttctggtgattctcagcttc 16336356  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16336357 tgataaa----cttctgatgaacttgcttaagatgaccttgcttctgatga 16336403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22076526 - 22076290
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22076526 ttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcgag 22076427  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||    
T  22076426 tcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaagttgcatctcctgatgaactacatcttctggtgattcacagcttc 22076327  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22076326 tgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgac 22076290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19833152 - 19832901
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  19833152 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 19833053  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
     |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  19833052 gtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaagttgcatctcctgatgaactacatcttctggtgattctcagctt 19832953  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19832952 ctgataatcttgctttggatgaacttgtttctgatgaccttgcttctgatga 19832901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15954733 - 15954953
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  | |||||||     
T  15954733 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcatttttccag 15954832  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  15954833 tcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcttgatgaactacagcttctggtaattctcagcttc 15954932  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15954933 tgataaacttgcttctgatga 15954953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 12349023 - 12349211
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12349023 ttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccag 12349122  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgat 189  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||    
T  12349123 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatgat 12349211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16877243 - 16877463
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||  || ||||||||||||  |||||  ||     
T  16877243 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaatccttttaagatagtcgttgcttcactttctcag 16877342  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  16877343 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttttggtgattcacagcttc 16877442  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  16877443 tgatgaacttgcttctgatga 16877463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20488037 - 20487800
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||     
T  20488037 ttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttacag 20487938  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaa-tccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||    |||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  20487937 tcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcaacttctagtgatttttagctt 20487838  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | || |||||||    
T  20487837 ctgataaacttgcttctgattaactcgtttctgatgac 20487800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12423291 - 12423435
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12423291 ttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccag 12423390  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttg 145  Q
    |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12423391 tcttctgcattcttagacgagtttgaatccattaaacagcttttg 12423435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33352045 - 33351828
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||     
T  33352045 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt-gaagaataaacatccaatgtttttcaatcctttcaaaatagcc-ttgctatacttttccag 33351948  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| | ||  ||||||||||   ||||||||    
T  33351947 tcttctgcactcttagacgagtgtgaatccttgaaacagcttttgaggctttaagttgcatctcccgatgaaatgcagtttctggtgattcacagcttct 33351848  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  33351847 gatgaacttgcttctgatga 33351828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19066137 - 19065926
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||| |||||||||||     
T  19066137 ttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatagccgttgccatacttttccag 19066047  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| || ||| |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| || ||||||||||| | |||||||    
T  19066046 tcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaagctttaagatccatctcctgatgaactgcagcttctggtgatatacagcttc 19065947  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  19065946 tgatgaacttgcttctgatga 19065926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 32544295 - 32544517
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||     
T  32544295 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccag 32544394  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  32544395 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttatggtgattttcagct 32544494  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||    
T  32544495 tctgatgaacttgcatctgatga 32544517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20730823 - 20730603
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||     
T  20730823 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccag 20730724  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||| ||| || ||||| || |||||| |||||||||||  ||| ||  |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||     
T  20730723 tcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagctttttgttacatctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagctta 20730624  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  20730623 tgatgaacttgcttctgatga 20730603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 22802171 - 22802391
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||| | ||||||| |  |||||||||     
T  22802171 ttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaacttgtcgttgtttcacttttccag 22802270  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    || ||| |||   |||||| |  || ||||| || |||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22802271 tcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattttcagcttc 22802370  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  22802371 tgatgaacttgcttctaatga 22802391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 9717873 - 9718078
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  9717873 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 9717972  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||    
T  9717973 tcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctagtgatctttaact 9718072  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  9718073 tctgat 9718078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26972328 - 26972109
Alignment:
Q  20 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa-ctttagac 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||| |||   ||||||    
T  26972328 gtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagac 26972229  T
Q  119 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctg 216  Q
    ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||     
T  26972228 gagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttctgcttctgatgaacttgcttcta 26972129  T
Q  217 atgaacttgcttttgatgac 236  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  26972128 ataaacttgcttctgatgac 26972109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 18435586 - 18435824
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |     
T  18435586 ttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttctag 18435685  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||| |  || | ||||||||| || ||||| || || | | ||  ||||||||||  |||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  18435686 tcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctagtgatcttcagct 18435785  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||||||||  || ||| |||| |||||||    
T  18435786 tctgatgaacttgcttctagtggactagcttctgatgac 18435824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12715536 - 12715318
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||  |||| || ||||||||||||||||  ||| || ||||||    
T  12715536 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatct 12715437  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacag-cttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    ||| |||   ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  12715436 tctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctagtgatctt--gcttc 12715339  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  12715338 tgatgaacttccttctgatga 12715318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15531743 - 15531509
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| | |||| ||| |     
T  15531743 ttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataaccgttgttttactcttctag 15531644  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||| | || |||| | ||| ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  15531643 tcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactacaacttctggtgatcttatgat 15531544  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgat 233  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  15531543 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgat 15531509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 29918047 - 29918266
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| || |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  29918047 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaatcttttcaaactagtcgttgcttcacttttccaa 29918146  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || |||||  | |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||    
T  29918147 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc-atgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctgatgaactt--gct 29918243  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||  |||||||||| ||||    
T  29918244 tctgatggacttgcttctaatga 29918266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 21625131 - 21625333
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| ||| | |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  21625131 ttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgctttc-aaatagccgttgctttactcttccaa 21625229  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||| ||||  |||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  21625230 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatga--gacaacttctggtgatcttcagct 21625327  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  21625328 tctgat 21625333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 13435562 - 13435799
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  13435562 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaa 13435661  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||| ||||| || ||||| || || | | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||    
T  13435662 tcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttatggtgatcttctgct 13435761  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13435762 tctgat-gagatgcttttgatgaacttgcttctgatgac 13435799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 25597558 - 25597738
Alignment:
Q  50 catccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaag 148  Q
    |||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| |||  ||| ||||| ||||||||||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||    
T  25597558 catccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaag 25597657  T
Q  149 ctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  25597658 ctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgat-gagatgcttctgatgaacttgctt 25597738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 19688799 - 19688980
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||| | |    
T  19688799 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcactcttccagttt 19688898  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    |||||||   || ||||||  | ||||| || |||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||    
T  19688899 tctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcgcatctcctgatgaacttcagcttctg 19688980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 15302230 - 15302386
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||     
T  15302230 ttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccag 15302329  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 156  Q
    |||||| |||  |||||||||| || ||||| || |||| | ||||| |||||||||    
T  15302330 tcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagt 15302386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16265265 - 16265049
Alignment:
Q  5 acacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatctt 104  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||| |||  || ||||||||  ||||||||| || |    
T  16265265 acacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaaacctttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcct 16265166  T
Q  105 ctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
     | |||   ||||| ||| || ||||| || |||| | ||| |||||||| ||||||  || ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16265165 gtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagctttatgttgcatctcttgacgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgat 16265066  T
Q  204 aaacttgcttctgatga 220  Q
     ||||||||||||||||    
T  16265065 gaacttgcttctgatga 16265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 23284597 - 23284831
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||   |||    
T  23284597 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtct 23284696  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    ||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||    
T  23284697 tctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctagcgatcttctgcttct 23284796  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||  |  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23284797 gat-gagatgcttctaatgaacttgcttctgatgac 23284831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 139355 - 139267
Alignment:
Q  132 ttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  139355 ttaaacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaacgacaatttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatga 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 147376 - 147288
Alignment:
Q  132 ttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  147376 ttaaacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaacgacaatttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatga 147288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 13602205 - 13602439
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    |||||||| |||||  ||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||    
T  13602205 tacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaattcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtct 13602304  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    ||| |||   |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| |    
T  13602305 tctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactatagcttcttgtgatcttcggctttt 13602404  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13602405 gat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 13602439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20112819 - 20112596
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  | | ||||      
T  20112819 ttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccgg 20112720  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaac-agcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||||| |||   ||||| ||| || ||||| || ||| | ||||| ||||||||||  |||||  || ||||||||| || |||| ||||||||| |||    
T  20112719 tcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttcaggtgatctttagc 20112620  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||  ||||||||||||||||    
T  20112619 ttctgaagaacttgcttctgatga 20112596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14100559 - 14100373
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||  ||| |||||     
T  14100559 ttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtttcttcactcttccag 14100460  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    ||||||||||   ||||| ||| || ||||| || |||| | |||||| |||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||    
T  14100459 tcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Original strand, 21235256 - 21235363
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgct 212  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| | ||| |||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21235256 ttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagcttctgatgaacttgct 21235355  T
Q  213 tctgatga 220  Q
    ||||||||    
T  21235356 tctgatga 21235363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 19482782 - 19482840
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19482782 ttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 19482840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19086188 - 19086399
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||          ||| ||||||||||||||||  ||| | |||     
T  19086188 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg----------ctttcaaaatagtcgttgcttcactctcccag 19086277  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgtt-aaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || || ||||  ||| |||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19086278 tcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagc 19086376  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
T  19086377 -tctgatgaacttgcttctgatga 19086399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Original strand, 19482933 - 19483001
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctga 247  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  19482933 cttctggtgatctgcagcttctaatgaacttgcttctgatgaacttgcatctgatgaacttgcttctga 19483001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 17316644 - 17316586
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  17316644 ttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccgatgc 17316586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 24116858 - 24116936
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaata 79  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  24116858 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaata 24116936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451568
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| ||  ||||||  |||| |||||||||||  ||| || ||     
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||   ||||||| || |||||| |||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| | ||||||||||   ||| ||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga---tcaact 34451591  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| || ||||||||||||||||    
T  34451590 tctaatgaacttgcttctgatga 34451568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 17381551 - 17381595
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17381551 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaa 17381595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 250
Target Start/End: Original strand, 26589789 - 26589873
Alignment:
Q  166 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||| || |||||||||||    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26589789 tgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttcagatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgaacttgcttctgatga 26589873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 18378344 - 18378431
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  18378344 ttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 18378431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17608331 - 17608222
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagctt--ttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttg 210  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||||||  ||||| ||| | ||||||  | ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  17608331 ttagatgaggttgaatccaataaacagcttatttgaaacttcaggttgcatcttctgatgaactatagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttg 17608232  T
Q  211 cttctgatga 220  Q
    ||||||||||    
T  17608231 cttctgatga 17608222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 15987263 - 15987324
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  15987263 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctt 15987324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 21235155 - 21235216
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21235155 ttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgcctt 21235216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 236
Target Start/End: Original strand, 22386928 - 22387053
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgc 211  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||||  | ||||||||||  | |||||||||||   |||||| |||| |||||||    
T  22386928 ttagaagaggttgaatccaataaacagctatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttatgatgaacttgc 22387027  T
Q  212 ttctgatgaac-ttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22387028 ttctgatgaactttgcttctgatgac 22387053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 17381610 - 17381680
Alignment:
Q  166 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17381610 tgatgaactgcaggttctggtgatttttggcttttgataaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgac 17381680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 26943606 - 26943675
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatcct 70  Q
    |||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26943606 ttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaatcct 26943675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 250
Target Start/End: Original strand, 19482895 - 19483019
Alignment:
Q  123 ttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaac 222  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||  |||| || ||| || || |||||  ||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19482895 ttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaggttgagcttc-tggtgatctgcagcttctaatgaactt--gcttctgatgaacttgcatctgatgaac 19482991  T
Q  223 ttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  19482992 ttgcttctgacgaacttgcttctaatga 19483019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 19624125 - 19624203
Alignment:
Q  116 gacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19624125 gacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt 19624203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 26589629 - 26589671
Alignment:
Q  1 ttgtacactt-cgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaa 42  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26589629 ttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaa 26589671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 220
Target Start/End: Original strand, 12423434 - 12423471
Alignment:
Q  183 tggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12423434 tggtgatcctcggcttctgataaacttgcttctgatga 12423471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17316493 - 17316448
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaactt 224  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17316493 cttctgatgatctgcagcttctggtgaacttgcttctgatgaactt 17316448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 236
Target Start/End: Original strand, 24116974 - 24117095
Alignment:
Q  116 gacgagtttgaatccgttaaacagc-ttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgct 212  Q
    |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||  | |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |   |  ||||    
T  24116974 gacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaacttcatcttctggtgatctt--gcttctaaccgagatgct 24117071  T
Q  213 tctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  24117072 tctgatgaacttgtttctgatgac 24117095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 236
Target Start/End: Original strand, 26589833 - 26589874
Alignment:
Q  195 gcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26589833 gcttctgatgaccttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 26589874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 250
Target Start/End: Original strand, 17381639 - 17381679
Alignment:
Q  210 gcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17381639 gcttttgataaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 17381679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29138517 - 29138283
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  29138517 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaaatagttgttgctatacttt-ccag 29138419  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29138418 tcttctgcaatcttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttct 29138319  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29138318 gataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 29138283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 26759175 - 26759425
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26759175 ttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgttatacttttccag 26759274  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26759275 tcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttc 26759374  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26759375 tgataaatttgcttctgatgaatttgcttctgatgaccttgcctctgatga 26759425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15516995 - 15517215
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15516995 ttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgctatacttttccag 15517094  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  15517095 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaagttgcatcttctgatgaactacaacttctggtgattctcaacttc 15517194  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15517195 tgataaacttgcttctgatga 15517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 30743006 - 30743256
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||     
T  30743006 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaataatcgttgctttgcctttccag 30743105  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || ||  |||||||     
T  30743106 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcaacttctcgtaattctcagctta 30743205  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30743206 tgataaatttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttacttttgatga 30743256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3245552 - 3245333
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  3245552 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattctttcaaaatagccgttgctatacttttccag 3245453  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||    
T  3245452 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttct 3245353  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  3245352 gatgaacttgcttctaatga 3245333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 11993914 - 11994164
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||| |||||||  ||| |||||     
T  11993914 ttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaatcccttcaaattagccgttgcttcactattccag 11994013  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||    
T  11994014 tcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattcacagcttc 11994113  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  11994114 tgataaacttgcttctgatgaactatcttatgatgaacttgcttctgatga 11994164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 42243706 - 42243943
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaag-aataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || || |||| |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  42243706 ttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttcca 42243805  T
Q  100 atcttctacaacttt-agacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
     |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||    
T  42243806 gtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagttt 42243905  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  42243906 ttgataaatttgcttctgatgaccttgcatctgatgac 42243943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 4887048 - 4887268
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  4887048 ttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccag 4887147  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| | ||| ||| |||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  4887148 tcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttgcatatcttgatgaactgcagcttctggtgattctcagcttc 4887247  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    | || ||||||||||||||||    
T  4887248 taatgaacttgcttctgatga 4887268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28464450 - 28464240
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| ||||| |||||||||  |     
T  28464450 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt---------caaaatagccgttgttatacttttttag 28464360  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||    
T  28464359 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgtatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttct 28464260  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28464259 gataaacttgcttctgatga 28464240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 33933293 - 33933547
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  33933293 ttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttcca 33933392  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccg-ttaaacagctttt--gaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcag 195  Q
     |||| | ||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||  ||||    
T  33933393 gtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaacttttttgaagctttaagttgcatcctctgatgaactgcaacttatggtgattctcag 33933492  T
Q  196 cttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  33933493 cttctgataaacttgcttctgatgaactgtcttctgatgaacttgcttctgatga 33933547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 33022690 - 33022910
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||     
T  33022690 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccag 33022789  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||| ||| || ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  33022790 tcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcaaattctggtgattttcagcttc 33022889  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  33022890 tgatgaacttgcttctgatga 33022910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 26765524 - 26765674
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26765524 ttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagttgttgctatacttttccag 26765623  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctt 151  Q
    |||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26765624 tcttctgcaatctttaggcgaatttgaat-cgttaaacagcttttgaagctt 26765674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41566545 - 41566323
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |     
T  41566545 ttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctag 41566446  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41566445 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagct 41566346  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  41566345 tctgatgaacttgcttctgatga 41566323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 9088995 - 9089188
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||  |||||||||||     
T  9088995 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgcctt---------ccaaaatagtcgttgtaatacttttccag 9089085  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||    
T  9089086 tcttcttcaatcatagacgagtttgattcctttaaacagcttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttct 9089185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14086650 - 14086428
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctc-tttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||  | |||||||| |||||||  |||||||||    
T  14086650 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaaatcacttcaaaatagccgttgcttcacttttcca 14086551  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaat-ccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||| || |||||||| || || ||||    
T  14086550 gtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtaatttttagct 14086451  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  14086450 tttgataaacttgcttctgatga 14086428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25930267 - 25930087
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||         | ||| ||||| ||||||||||||     
T  25930267 ttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgccttctaa---------attagccgttgttatacttttccag 25930177  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgat 189  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||    
T  25930176 tcttatgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaattgcagcttctggtgat 25930087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35986331 - 35986116
Alignment:
Q  12 gtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaac 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||          ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||     
T  35986331 gtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaataggcatccaatgcattt---------caaaatagtcgttgccacacttttccagtcttctgcaat 35986241  T
Q  112 tttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgc 211  Q
    ||||| |||||| || ||| | ||||| |||||||| |||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  35986240 tttaggcgagttagagtccttgaaacatcttttgaaactttaagttcaatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgc 35986141  T
Q  212 ttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||| | |||| |||||||    
T  35986140 ttctgatgaattagcttctgatgac 35986116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 32160794 - 32161029
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatc 102  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||||||   |  | || ||    
T  32160794 gtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagctgttgctactatacttcagtc 32160893  T
Q  103 ttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    ||   |   |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  32160894 tttcgctttctttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaactacagtttctggtgatatacagcttct 32160993  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32160994 gatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 32161029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 28139633 - 28139755
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  28139633 ttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatactttttcag 28139732  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtt 123  Q
    |||||||||   |||||||||||    
T  28139733 tcttctacattcttagacgagtt 28139755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 10848799 - 10849010
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||| ||||||||  | ||| |||||||||||     
T  10848799 ttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatg---------cctttcaaaatagctgatgccatacttttccag 10848889  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    | |||| |||  ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||   ||||||     
T  10848890 ttttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcatgatgaactgcagcttctggtgatacacagctta 10848989  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  10848990 tgatgaacttgcttttgatga 10849010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 31117904 - 31118088
Alignment:
Q  2 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaat 101  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||  ||||||||| |    
T  31117904 tgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagt 31118003  T
Q  102 cttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaac-agcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    ||||| |||   |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  31118004 cttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctg 31118088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35932117 - 35931905
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         | || ||||||||||||||| |||||||||||     
T  35932117 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatg---------cgtttcaaaatagtcgttgccatacttttccag 35932027  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttg-aagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| || ||| |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| ||| || |||||||||  | |||||||||||   || |||    
T  35932026 tcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacaacttttgaaaactttaagttccacctcttgatgaactgtaccttctggtgatacacaactt 35931927  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  35931926 ctgatgaactagcttctgatga 35931905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 89533 - 89339
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||       
T  89533 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctgg 89434  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| ||| | ||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89433 tcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatctt 89339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 26784380 - 26784602
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |   ||||||| ||||||||||||||||  |||  ||       
T  26784380 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctgg 26784479  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||| | |||   || |||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| |  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26784480 tcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatctcctgctgaactacagcttctggtgatcttcagct 26784579  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  26784580 tctgatgaacttgcttctgatga 26784602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6512539 - 6512322
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||   |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  6512539 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc---caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 6512443  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||  |||   ||||||||| || |||||  | |||| | |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  6512442 tcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctagtgatctt--gct 6512345  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  6512344 tctgatgaacttgcttctgatga 6512322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30115948 - 30115855
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatactt 94  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30115948 ttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaatcctttcaaaatagtcgttgttatactt 30115855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7745804 - 7745555
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||| |     
T  7745804 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctag 7745705  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   || || | | || ||||| || |||| | ||||||||||||||  || ||  |||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||    
T  7745704 tcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatctcctgatgtacttcagcttcttgtgatctt--gct 7745607  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||  |  ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7745606 tctgat-gagatgcttttgatgaacttgcttcttatgaccttgcttctgatga 7745555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23413085 - 23412865
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||       
T  23413085 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctgg 23412986  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   || || ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  23412985 tcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gct 23412888  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  23412887 tctgatgaacttgcttctgatga 23412865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 21910582 - 21910776
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||     
T  21910582 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccag 21910681  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||| |  ||   ||||||||| || ||||  || |||||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  21910682 tcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt 21910776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17814994 - 17815229
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||||||||  ||| |||||     
T  17814994 ttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccag 17815093  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  || ||||||| |  | ||||||||||||||  |||    
T  17815094 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaatttagcttctggtgatctt--gct 17815191  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  17815192 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgctactgatgac 17815229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 220
Target Start/End: Original strand, 5430044 - 5430130
Alignment:
Q  134 aaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  5430044 aaacagcttttgaagccttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatttttaccttctgatgaacttgcttctgatga 5430130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21660238 - 21660466
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||         | ||  |||||||| ||||| ||||||||||      
T  21660238 ttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgatctttgaggactaagcatccaatg---------catttgaaaatagttgttgccatacttttccgg 21660328  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||| ||||  | ||||  |||||||  | |||||||||||    | ||||    
T  21660329 tcttctgcaatctttagacgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttgagttcaatttccaaatgaactgtagcttctggtgatacataacttc 21660428  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaac-ttgcttttgatgac 236  Q
    |||| | || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21660429 tgatgacctagcttctgatgaactttgcttctgatgac 21660466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13545623 - 13545536
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  13545623 ttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagttgttgct 13545536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 21072351 - 21072264
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  21072351 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 21072264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 23391714 - 23391656
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23391714 ttgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 23391656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30115853 - 30115767
Alignment:
Q  134 aaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30115853 aaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctaatga 30115767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 20550921 - 20551007
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  20550921 ttgtacacttcgtacaattgtatt-tgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgct 20551007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19536412 - 19536325
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||    
T  19536412 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatccattcaaaaaagtcgttgct 19536325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Original strand, 28139773 - 28139834
Alignment:
Q  175 acaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  28139773 acaacttttggtgattctcagcttctgataaacttacttctgatgaacttggttctgatgac 28139834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12352758 - 12352692
Alignment:
Q  169 tgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12352758 tgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttttgatgaacttgcttttgatgac 12352692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 642818 - 642757
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||    
T  642818 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgcctt 642757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9398689 - 9398644
Alignment:
Q  165 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9398689 ctgatgaacttcaacttctggtgatcttgagcttctgatgaacttg 9398644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21072187 - 21072147
Alignment:
Q  163 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21072187 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgat 21072147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 642652 - 642582
Alignment:
Q  165 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  642652 ctgatgaactgcaatttctggtgatcttcagcatctcat-gaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 642582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 11208093 - 11208011
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgc 87  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||  ||||  | |||||||||||||||    
T  11208093 tacacttcgtacata-gtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatccaatgcattcaaatctcttcaaaatagtcgttgc 11208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23391604 - 23391505
Alignment:
Q  118 cgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctga 217  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||| || || |||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  23391604 cgagcttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaggttgatctt-ttgatgatctgcagcttctggtgaactt--gcttatgatgaacttgcttctga 23391508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Original strand, 23478545 - 23478604
Alignment:
Q  165 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaactt 224  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23478545 ctgatgaactgtagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgttgaactt 23478604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23391554 - 23391504
Alignment:
Q  186 tgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23391554 tgatctgcagcttctggtgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatgac 23391504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 235
Target Start/End: Original strand, 23881259 - 23881328
Alignment:
Q  165 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23881259 ctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgat-gaggtgcttctgatgaccttgcttctgatga 23881328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23391545 - 23391505
Alignment:
Q  210 gcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23391545 gcttctggtgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatga 23391505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 14955456 - 14955706
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||     
T  14955456 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaaatagttgttgctttacctttccag 14955555  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  14955556 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgagttacatctcctgatgaactgcaacttctggtgattctcagcttc 14955655  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14955656 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 14955706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 2785093 - 2785344
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  2785093 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttcca 2785192  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2785193 gtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagctt 2785292  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2785293 ctaataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttcagatga 2785344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24775664 - 24775412
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  24775664 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccag 24775565  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaact--acaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   || |||||||||||  ||||||    
T  24775564 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcgcagcttctggtgattctcagct 24775465  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  24775464 tgtgataaacttggttctgatgaactggcttctgatgaacttgcttctgatga 24775412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21640896 - 21641130
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21640896 ttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatccttccaaaatagccgttgctatacttttccag 21640995  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  21640996 tcttctacaatcttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaagttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttct 21641095  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21641096 gatgaacttgcttatgctgaacttgcttctgatga 21641130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 5213606 - 5213789
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  5213606 ttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgct-tttgaataataagcatctaatgccttcaaatccttccaaaatagttgttgctatacttttccag 5213704  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  5213705 tcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctg 5213789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20627561 - 20627358
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  20627561 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaaatagttgttgcttcacttttccag 20627462  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20627461 tcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattttcagcttc 20627362  T
Q  200 tgat 203  Q
    ||||    
T  20627361 tgat 20627358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21636800 - 21636573
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||| |||||||||||     
T  21636800 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatagtcgttgccatacttttccag 21636710  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| || ||| |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||   |||||||    
T  21636709 tcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaagctttaagttccaactcctgatgaactgccacttctggtgatacacagcttc 21636610  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21636609 tgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgac 21636573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 53056857 - 53056621
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  53056857 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 53056758  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||   | ||||||||| || ||||| ||||| ||  |||||    
T  53056757 tcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaaccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctagtgatttttggcttc 53056658  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||    
T  53056657 tgataaacttgtttttgatgaactaacttctgatgac 53056621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 33583258 - 33583510
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  33583258 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttcca 33583357  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaa-cagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     |||||||||| | |||||| || ||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  33583358 gtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactacaacttttggtgatttttagct 33583457  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||    
T  33583458 tctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctgacgaacttgtttctgatga 33583510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46796497 - 46796287
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||          |||| ||| |||||  |||||||||||     
T  46796497 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatctaatgccttt---------caaattagccgttgtaatacttttccag 46796407  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||   ||||||||    
T  46796406 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttcttgtgattcacagcttct 46796307  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  46796306 gatgaacttgcttctgatga 46796287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 49666535 - 49666309
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||         || |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  49666535 ttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaatgctctttgaagaata---------tgtctttcaatcctttcaaaatagtcgttgttatacttttccag 49666445  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   || ||| |    
T  49666444 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacaacttat 49666345  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49666344 gatgaaattgcttctgatgaacttgcttctgatgac 49666309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 11223592 - 11223812
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||     
T  11223592 ttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcag 11223691  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||    |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||    
T  11223692 tcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaagttgtatctcctgatgaactgctgcttctggtgattttcagattc 11223791  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  11223792 tgatgaacttgcttctgatga 11223812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46349974 - 46349738
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||     
T  46349974 ttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttccag 46349875  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||||||| ||| |||  || |||| |||||||||  |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46349874 tcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaagttgcttctcctgatgaactgcaacttctggtgattttcagcttc 46349775  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  46349774 taatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 46349738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 28582135 - 28582373
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  28582135 ttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaa 28582234  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||    |||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  28582235 tcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagct 28582334  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28582335 tctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 28582373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21605784 - 21605557
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||  |||||||||||     
T  21605784 ttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatagtcgttgtcatacttttccag 21605694  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| || ||| |||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||   || ||||    
T  21605693 tcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacaacttttgaagctttaagttccatctcctgatgaactgcaacttctggtgatacacaacttc 21605594  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  21605593 tgatgaacttgcttatgatgaccttgcttctgatgac 21605557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 29855438 - 29855675
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||| |||||||  ||||||   |    
T  29855438 ttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaactagccgttgcttcacttttttta 29855537  T
Q  101 -tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
     |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   | ||||||||| ||  || ||||||| ||  ||||    
T  29855538 gtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtcttaagttgcatcccatgatgaactgcaggttttggtgatttttggctt 29855637  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29855638 ccgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 29855675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 14969356 - 14969578
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||     
T  14969356 ttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgctttactcttccag 14969455  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||     
T  14969456 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttctggtgatcttcagca 14969555  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||||    
T  14969556 tctgatgaacttgcttatgatga 14969578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 47207735 - 47207939
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||| ||| |||||||  |||||||||     
T  47207735 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaactagccgttgcttcacttttccag 47207834  T
Q  101 tcttctacaa--ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| |||  ||||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| |||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  47207835 tcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagttttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagctt 47207934  T
Q  199 ctgat 203  Q
    |||||    
T  47207935 ctgat 47207939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 40850997 - 40851208
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||| |||||||||||     
T  40850997 ttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatagtcgttgccatacttttccag 40851087  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| || ||| |||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  | |||||||||||   || ||||    
T  40851088 tcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaccagcttttgaagctttaagttccatctcctgatgaactgtagcttctggtgatacacaacttc 40851187  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  40851188 tgatgaacttgcttctgatga 40851208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18121752 - 18121515
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  18121752 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 18121653  T
Q  101 tcttctacaacttt-agacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   | | ||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  18121652 tcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagct 18121553  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18121552 tatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 18121515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 20646183 - 20646421
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||  ||| |||       
T  20646183 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctgg 20646282  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagc-ttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    ||||||||||   || |||||| |  ||| | || |||||| |||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646283 tcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 20646382  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20646383 ttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 20646421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30054347 - 30054136
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||          |||| |||||||||||||||||||| |    
T  30054347 ttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgttgaataagcacccaatgccttt---------caaagtagtcgttgctatacttttcaa 30054257  T
Q  100 atcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
     |||||| ||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  |  ||||||||||   |||||||    
T  30054256 gtcttctgcaattttaggcgagtttgaattcttgaaacagcttttgaagctttgaattgcatctcctgatgaactgaagtttctggtgattcacagcttc 30054157  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  30054156 tgatgaacttgcttctgatga 30054136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49642892 - 49642658
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  49642892 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 49642793  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||  || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49642792 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 49642693  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgat 233  Q
    ||| ||  |  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  49642692 tctaat-gagatgcttctgatgaccttgcttctgat 49642658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 2561217 - 2561439
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  2561217 ttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 2561316  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  2561317 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgattctcagct 2561416  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  2561417 tctgatgaacttgcttctgatga 2561439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 13948365 - 13948602
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  13948365 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactattccag 13948464  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||  || |||| | ||||| ||||||||  |||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  13948465 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctggtgatcttcagct 13948564  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13948565 tctgat-gagatgcttctgataaacttgcttctgatgac 13948602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 22140796 - 22140967
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  || || | |||||||||||||| |  |||| || | |||    
T  22140796 tacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaaacccttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtct 22140895  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaact 174  Q
    ||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22140896 tctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaact 22140967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 11869130 - 11869317
Alignment:
Q  34 ctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgt 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||  |  | ||||||||| |||||| | |    
T  11869130 ctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcat 11869229  T
Q  133 taaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11869230 taaacaaattttgaagccttaagttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaaattgcttctgatga 11869317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 40799903 - 40800106
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||| ||| |||| |||||||||||   ||||||||     
T  40799903 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaatactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccag 40800002  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||| | ||||  || ||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  40800003 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgatgcatctcttgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 40800102  T
Q  200 tgat 203  Q
    ||||    
T  40800103 tgat 40800106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 47405551 - 47405348
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||  | |||||||     
T  47405551 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaatcctttcaaactagttgttgcttcatttttccag 47405452  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  47405451 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgttgcatctcgtgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 47405352  T
Q  200 tgat 203  Q
    ||||    
T  47405351 tgat 47405348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12963215 - 12962995
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||  || ||||| |||||||| ||||||  ||| | |||     
T  12963215 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccttctaaaatagttgttgcttcactctcccag 12963116  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||    |||||| || || ||||| || |||| |  ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12963115 tcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatctt--gct 12963018  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  12963017 tctgatgaacttgcttctgatga 12962995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 37467362 - 37467556
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  37467362 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 37467461  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    ||||||||||   ||||| ||| || ||||| || ||||   ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37467462 tcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatctcctgatgaactactgcttctggtgatctt 37467556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 41495028 - 41495179
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  41495028 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 41495127  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctt 151  Q
    |||||| |||  |||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||    
T  41495128 tcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 15903227 - 15903465
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataa-gcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  15903227 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttcta 15903326  T
Q  100 atcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
     ||||||  ||   ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  15903327 gtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctgataaattacagcttttggtgatcttcagc 15903426  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||  |  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  15903427 ttctgat-gagatggttctgatgaacttgcttctgatgac 15903465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16658748 - 16658543
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||  ||       
T  16658748 ttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctgg 16658649  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||| |  ||   || |||||| |||||||  || |||| | ||||||| || |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16658648 tcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 16658549  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  16658548 tctgat 16658543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38177773 - 38177568
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||    
T  38177773 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccaa 38177674  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||    | ||||||| || ||| | || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||| || ||||| | |||||| |||||||| |||    
T  38177673 tcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagagcttctgatgatcttctgct 38177574  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  38177573 tctgat 38177568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 13824098 - 13824254
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  13824098 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 13824197  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 156  Q
    |||||| ||   |||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  13824198 tcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 13824254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 250
Target Start/End: Original strand, 33598014 - 33598130
Alignment:
Q  134 aaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgat 233  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||     
T  33598014 aaacaacttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactacaacttttggtgatttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctgac 33598113  T
Q  234 gaccttgcttctgatga 250  Q
    || |||| |||||||||    
T  33598114 gaacttgtttctgatga 33598130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49553619 - 49553425
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||  ||| || |||    
T  49553619 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcactgcttcactctttcaa 49553520  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| |||   ||||||||  || ||||  ||||||||| |||||| |||||||  |||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  49553519 tcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcggcttctggtgatctt 49553425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 6090761 - 6090998
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||| |||| |||  ||||||  ||| ||| |     
T  6090761 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaattagatgttgcttcactcttctag 6090860  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || | || | ||||||| ||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  6090861 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgct 6090960  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6090961 tctgat-gagatgcttttgatgaacttgcttctgatgac 6090998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12726360 - 12726166
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |     
T  12726360 ttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctag 12726261  T
Q  101 tcttctac-aactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| | ||  ||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12726260 tcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatctcctgatgaacttcaacttcttgtgatctt 12726166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18142882 - 18142696
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  18142882 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 18142783  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa--gttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    |||||| |||   | | ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||   |||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  18142782 tcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctg 18142696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29951568 - 29951339
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| ||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||       
T  29951568 ttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctgg 29951469  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttc--ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    ||||||||||   ||||||||| || ||||| || || | | |||||||||||||||  | | ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  29951468 tcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagct 29951369  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  29951368 tctgat-aaggtgcttctgatgaacttgctt 29951339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30000722 - 30000493
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| ||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||       
T  30000722 ttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctgg 30000623  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttc--ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    ||||||||||   ||||||||| || ||||| || || | | |||||||||||||||  | | ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  30000622 tcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagct 30000523  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  30000522 tctgat-aaggtgcttctgatgaacttgctt 30000493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 52920435 - 52920671
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||| |||||||||||   || | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||| |||  ||| |||| ||||||  ||| ||| |     
T  52920435 ttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatacttt-aaattagttgttgcttcactcttctag 52920533  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || | |||| |||||| ||||||||  ||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52920534 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagct 52920633  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  52920634 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 52920671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13780714 - 13780627
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13780714 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 13780627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 45858875 - 45858804
Alignment:
Q  5 acacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaa 76  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  45858875 acacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45858804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31303415 - 31303651
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || |||| |||| |||  ||||||| ||||||||| ||| ||  ||| || ||     
T  31303415 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttccttcactctttcag 31303514  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||| | || |||| | ||| ||||||||||  || ||  ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  31303515 tcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatctcctgagtaactagagcttctggtgatcttcagct 31303614  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31303615 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 31303651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Original strand, 50300373 - 50300467
Alignment:
Q  142 tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||| ||||||||||    |||||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50300373 tttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttaacttatgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 50300467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 11909152 - 11909079
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaa 76  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  11909152 gtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14393134 - 14393049
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttg 86  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14393134 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttg 14393049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 16032554 - 16032639
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttg 86  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16032554 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttg 16032639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1728145 - 1727919
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||| || ||||| | |     
T  1728145 ttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaatgttccttgaggaataagcatccaatgctttt---------caaaatagccgttgtta-actttccaag 1728056  T
Q  101 tcttctacaacttta-gacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| | ||| |||  | |||| |||||||| | ||||| |||||||| || ||||||  |  |||||||||||| || |||||||||||   |||||||    
T  1728055 tcttttgcaattttctggcgagattgaatccttgaaacaacttttgaaactataagttcaatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttc 1727956  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  1727955 tgatgaacttgcttttgatgaactagcttctgatgac 1727919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 9700163 - 9700108
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9700163 tacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 9700108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12752646 - 12752509
Alignment:
Q  111 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaactt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  12752646 ctttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaattacagtttctggtgttatacagcttctgatagactt 12752547  T
Q  210 gcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||| |   ||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  12752546 gctac---tgaacttgcttctaatgaactcgcttctgatga 12752509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 37412726 - 37412871
Alignment:
Q  103 ttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctga 202  Q
    |||| |||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||  |||  |||| |||| | || || ||| |||||| ||  |||||||||    
T  37412726 ttctgcaacttcaggcgagcttgaatccttgaaacagcttttgaaactttagattgatcttc-tgataatctgcagcttttggtgaact--agcttctga 37412822  T
Q  203 taaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga-ccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  37412823 taaacttgcttctgatgaacttgcttctgacgagctttgcttctgatga 37412871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Original strand, 51341143 - 51341283
Alignment:
Q  111 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttt-tgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaactt 209  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||| ||||| ||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||| || |     
T  51341143 ctttagacgaggttgaatccattaaacaactatatgaaactttaggttgcatcttctgatgaactacagtttctagtgatatacagcttctgatgaaata 51341242  T
Q  210 gcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  51341243 gcttctgatagacttgcttctgataaacttgcttctaatga 51341283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17239052 - 17238858
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||       
T  17239052 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgatgcttcactcttctgg 17238953  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || | |||| ||||||||||||||  |||||  |||| ||| ||| || ||||||||||||||    
T  17238952 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgcacttcatcttctggtgatctt 17238858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 25398385 - 25398298
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||  ||  || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  25398385 ttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 25398298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19889075 - 19888854
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||  || ||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||  ||       
T  19889075 ttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcatctgg 19888976  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacag-cttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||| | |||   || |||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |||||  || |||||||||  | ||||| ||||||||  ||    
T  19888975 tcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactttagcttctagtgatctt--gc 19888878  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  19888877 ttctgatgaacttgcttctgatga 19888854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45858760 - 45858630
Alignment:
Q  118 cgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctg 216  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||| | ||||| |      
T  45858760 cgagtttaaatccattaaacagctatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaactacagtttctggtgatatactgcttctgatagaattgctac-- 45858663  T
Q  217 atgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
     ||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  45858662 -tgaacttgcttctgataaactcgcttctgatga 45858630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 51341050 - 51341093
Alignment:
Q  19 cgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51341050 cgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgcctt 51341093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Original strand, 41495179 - 41495240
Alignment:
Q  174 tacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41495179 tacaacttctggtgatcttcagtttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 41495240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 50300252 - 50300290
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50300252 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttt 50300290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1727960 - 1727920
Alignment:
Q  210 gcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1727960 gcttctgatgaacttgcttttgatgaactagcttctgatga 1727920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 11868298 - 11868338
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttga 41  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11868298 ttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttga 11868338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22804150 - 22804066
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  22804150 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaagtcctttcaaaatagccgttgct 22804066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 216
Target Start/End: Original strand, 512493 - 512540
Alignment:
Q  169 tgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctg 216  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  512493 tgaacttcagcttctggtgatcttcagcttatgatgaacttgcttctg 512540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 12752739 - 12752697
Alignment:
Q  20 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12752739 gtactttgtcaacgctctttgaaggataagtatccaatgcctt 12752697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11909042 - 11908977
Alignment:
Q  111 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaacta 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||  | |||||||||||    
T  11909042 ctttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaacta 11908977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 12389002 - 12388941
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    |||||||||||||||||  || || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12389002 ttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgcctt 12388941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25398228 - 25398168
Alignment:
Q  175 acaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25398228 acaacttctgatgatcttcagcttctaat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25398168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48570282 - 48570047
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  48570282 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaatccttccaaaatagtcgttgttatacttttctag 48570183  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  48570182 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaattacagcttctggtgattctcagcttct 48570083  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  48570082 gataaaattgcttatgatgaacttgtttctgatgac 48570047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44821596 - 44821376
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  44821596 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatactttttcag 44821497  T
Q  101 tcttctac-aactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  44821496 tcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttatggtgattctcagcttc 44821397  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44821396 tgataaacttgcttctgatga 44821376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25448617 - 25448365
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||     
T  25448617 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcacttttccag 25448518  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaact--acaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   || ||||| |||||  ||||||    
T  25448517 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatcttctgatgaactgcgcagcttctagtgattctcagct 25448418  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  25448417 tctgataaacttgcttttgatgaactggcttctaatgaacttgcttctgatga 25448365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21702843 - 21703077
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |     
T  21702843 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaatcctttcaaaatagccgttgctatacttttcaag 21702942  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||    
T  21702943 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttct 21703042  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21703043 gatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 21703077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2327491 - 2327240
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||  |||||| ||    
T  2327491 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcgaatcctttcaaaatagtttttgcttcactttttca 2327392  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
     || ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||    
T  2327391 gtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatttttggctt 2327292  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2327291 ctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatgaacttgcttctgatga 2327240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 46089018 - 46089245
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||||||||     
T  46089018 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt---------caaaatagtcgttgccatacttttccag 46089108  T
Q  101 tcttctacaacttt-agacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||   || |||     
T  46089109 tcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcatgatgaactgcagcttctggtgatacacaactta 46089208  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46089209 tgatgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 46089245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 10251015 - 10251241
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||| ||||| ||||||||||||     
T  10251015 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgcctt---------ccaaattagccgttgttatacttttccag 10251105  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    |||||||    
T  10251106 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcatagcttct 10251205  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10251206 gatgaacttgctttcgatgaacttgcttttgatgac 10251241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 35040195 - 35040415
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |     
T  35040195 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctttacttttctag 35040294  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||   | ||||||| | || ||||||||||| ||  |||||    
T  35040295 tcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaattgcagcttctggtgatttttggcttc 35040394  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35040395 tgataaacttgcttctgatga 35040415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 30572226 - 30572414
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  30572226 ttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaatcctttcaaaatagccgttgctatacttttccag 30572325  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgat 189  Q
    |||||| |||  | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30572326 tcttctgcaatctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagctttaagttgtatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 30572414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22600233 - 22599997
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||     
T  22600233 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccag 22600134  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  22600133 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagct 22600034  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    ||||||  |  |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22600033 tctgat-gagatgcttctgataaacttgcttctgatga 22599997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22427408 - 22427172
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||     
T  22427408 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccag 22427309  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  22427308 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactggagcttctggtgattttcagcttc 22427209  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  22427208 tgatgaacttgcttctggtagacttgcttctgatgac 22427172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 2834719 - 2834938
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  |||||| ||     
T  2834719 ttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttcactttttcag 2834818  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    ||||| ||||   ||||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  2834819 tcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaagttgcatctcccgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 2834918  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    | ||  |||||||||||||||    
T  2834919 taat-gacttgcttctgatga 2834938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22464859 - 22464623
Alignment:
Q  2 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaat 101  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||||||  ||||||||| |    
T  22464859 tgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaattagtcgttgcttcacttttccagt 22464760  T
Q  102 cttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaac-agcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    ||||| |||   ||||| ||| || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||    
T  22464759 cttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagctttatgttacatctcctgatgaactgtagcatctggtgattttcagcttc 22464660  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | || |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  22464659 ttatgaacttgcttctggtggacttgcttctgatgac 22464623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28492455 - 28492233
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||| |     
T  28492455 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctag 28492356  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||  || ||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28492355 tcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgaagatcttcagct 28492256  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  28492255 tctgatgaacttgcttctgatga 28492233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 29215826 - 29216029
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  ||||||| |     
T  29215826 ttgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagccgttgcttcacttttctag 29215925  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| | |||   ||||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  29215926 tcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagttgcatctcctgatgaattgcaacttctggtgattttcagcttc 29216025  T
Q  200 tgat 203  Q
    ||||    
T  29216026 tgat 29216029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32785988 - 32785767
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||     
T  32785988 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccag 32785889  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || |||||  | |||| | ||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32785888 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc-atgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactacaacttctagtgattttcagct 32785790  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| || ||||||||||| ||||    
T  32785789 tctaatgaacttgcttctaatga 32785767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 35401838 - 35402072
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  35401838 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 35401937  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    ||||||  |   |||| ||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||  |||||  | |||||||   ||| |||||||||||||||||||    
T  35401938 tcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagcttctggtgatcttcagct 35402035  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35402036 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 35402072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39201043 - 39200823
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||| ||| |||||||  ||| || ||     
T  39201043 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaactagccgttgcttcactctttcag 39200944  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||| | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||     
T  39200943 tcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagctttatgttgcatctcctaatgaactgcagcttttggtgattttcagcttt 39200844  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  39200843 tgatgaacttgcttttgatga 39200823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 1900374 - 1900579
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  1900374 ttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 1900473  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  1900474 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagatcttctggcgatctttagct 1900573  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  1900574 tctgat 1900579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 42284657 - 42284867
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         | || ||||||||||| ||| | | |||||||     
T  42284657 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatg---------catttcaaaatagtcg-tgccacaattttccag 42284746  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  ||||||||  |  | |||||||||| || |||||||||||   |||||||    
T  42284747 tcttctgcaatctttaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaaatttaagttcaatcttctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttc 42284846  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  42284847 tgatgaacttgcttctgatga 42284867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 12284452 - 12284704
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||  ||       
T  12284452 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctgg 12284551  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||| | |||   || |||||| |||||||| || |||| | ||||||||| ||||  |||||  | |||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  12284552 tcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gct 12284649  T
Q  198 tctgataaactt--gcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12284650 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaacttgcttctgatga 12284704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21121115 - 21120903
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | || || |||||||||||| ||| |||||||     
T  21121115 ttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catttcagaatagtcgttgccatatttttccag 21121025  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttg-aagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| | | || |||  ||||| || ||| | |||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||    
T  21121024 tcttctgcgatttctaggtgagttagagtccttgaaacagcttttgaaaactttaagttccatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagctt 21120925  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  21120924 ctgatgaatttgcttctgatga 21120903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16235347 - 16235127
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  16235347 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16235248  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa--gttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||   |||||||||| || ||||  || |||| | ||||||| |||||   |||||  |  ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  16235247 tcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatcttatgatga--gacaacttctggtgatcttcagct 16235150  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  16235149 tctgatgaacttacttctgatga 16235127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7745141 - 7744891
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||| ||   |||||||  ||| | ||     
T  7745141 ttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaactgttgctactcttcttcag 7745042  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| | ||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||  | |||||||||| || ||||||||||| |   |||||    
T  7745041 tcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaaactgtaggttgcatcttctgatgaactgcagcttctggtgatatatggcttc 7744942  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||| ||   |||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  7744941 tgatgaaacagcttctaataaacttgcttctgatgaacttacttctgatga 7744891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21204974 - 21204745
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||         | || |||||||| |||||| |||||||||||     
T  21204974 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatg---------catttcaaaatagccgttgccatacttttccag 21204884  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagctttt-gaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| || ||| |||||| || ||| | ||||| |||||  || ||||||||| ||  || ||||||||| || |||||||||||   || |||    
T  21204883 tcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacaacttttaaaaactttaagttccatctcttgatgaactgcagcttctggtgatacacaactt 21204784  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaac-ttgcttttgatgac 236  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  21204783 ctgatgaacttgcttctgacgaactttgcttctgatgac 21204745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33256402 - 33256170
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||  ||| |||||     
T  33256402 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccag 33256303  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||  |||    
T  33256302 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgttgaactttagcttctggtgatctt--gct 33256205  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgat 233  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  33256204 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgat 33256170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33276574 - 33276342
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||  ||| |||||     
T  33276574 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccag 33276475  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||  |||    
T  33276474 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctggtgaactttagcttctggtgatctt--gct 33276377  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgat 233  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  33276376 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgat 33276342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20954524 - 20954298
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||| | | |||||  ||| ||||      
T  20954524 ttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaatcctttcaaaatggccattgcttcactcttcctg 20954425  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20954424 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagct 20954325  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttg 225  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||    
T  20954324 tctgat-gagatgcttctgatgaacttg 20954298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21984625 - 21984836
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | || ||||||||  ||| | |||||||||||     
T  21984625 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catttcaaaatagctgtttccatacttttccag 21984715  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    | |||| |||  | ||| |||||| || ||| | ||||| |||||||  ||||||||| |   ||||||||||||  | |||||||||||   |||||||    
T  21984716 tgttctgcaatatctaggcgagttagagtccttgaaacaacttttgacactttaagttccctctcctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttc 21984815  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  21984816 tgatgaacttgcttctgatga 21984836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 38282601 - 38282831
Alignment:
Q  7 acttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttct 106  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| |||||||  |||||||  ||| ||||| ||||||    
T  38282601 acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttct 38282700  T
Q  107 ac-aactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
     | |   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  38282701 gcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttttggtgatctttagcatctgat 38282800  T
Q  204 aaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
      |  |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38282801 -gagatgcttctgataaacttgcttctgatga 38282831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21135211 - 21134999
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         | || || |||||  ||||| ||| |||||||     
T  21135211 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatg---------catttcagaatagctgttgccatatttttccag 21135121  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttg-aagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    ||||||  || || |||  ||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||   || |||    
T  21135120 tcttctgtaatttctaggtgagttagattccttgaaacaacttttgaaaactttaagttccatctcctgatgaactgcaacttctggtgatacacaactt 21135021  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  21135020 ctgatgaacttgcttctgatga 21134999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 19717553 - 19717788
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  19717553 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 19717652  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    || ||| |||   || |||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||  |||||||  | ||||||||||||||  |||    
T  19717653 tcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccatatgaactttagcttctggtgatctt--gct 19717750  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19717751 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttatgatgac 19717788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22153886 - 22154081
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||  ||||||| |||| |||| ||||||  ||| ||| |     
T  22153886 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactattctag 22153985  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttc 193  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22153986 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttc 22154081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 48704233 - 48704482
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||| |  ||| |||||     
T  48704233 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccag 48704332  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||    ||| ||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  | ||||||||||  | |||||||||||||  ||||    
T  48704333 tcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtgatct--agct 48704430  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||  |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  48704431 tctgat-gagatgcttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 48704482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 36134219 - 36134323
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  36134219 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg-cttcaaatcctttcaaaatagttgttgctccacttttccag 36134317  T
Q  101 tcttct 106  Q
    ||||||    
T  36134318 tcttct 36134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23036578 - 23036344
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  || || |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| |||| |  ||||||  |     
T  23036578 ttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcacttttttag 23036479  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||   |||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||||  |||||  | |||||||   ||| |||||||||||||||||||    
T  23036478 tcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagcttctggtgatcttcagct 23036381  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    ||||||  |  ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23036380 tctgat-gagatgcttctgatgaaattgcttctgatga 23036344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 2267118 - 2267292
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  | ||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||| |||| |||| ||||||  |||||||||     
T  2267118 ttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattctttcaaactagttgttgcttcacttttccag 2267217  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaact 174  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  2267218 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaact 2267292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 37642277 - 37642335
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37642277 ttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 37642335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14263502 - 14263417
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttg 86  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14263502 ttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttg 14263417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22201787 - 22201682
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||     
T  22201787 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgctttactttttcag 22201688  T
Q  101 tcttct 106  Q
    ||||||    
T  22201687 tcttct 22201682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 23024817 - 23024966
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||         | || ||||||||||||||||| ||||| | |     
T  23024817 ttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatg---------cttttcaaaatagtcgttgcta-actttccaag 23024906  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgca 160  Q
    |||||| ||| ||  | |||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23024907 tcttctgcaatttctggcgagattaaatccttgaaacagcttttgaagctttaggttgca 23024966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 7309848 - 7310052
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||| | ||||||   |||||||  ||| ||  |     
T  7309848 ttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgct-tttgaagaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgaccgttgcttcactcttatag 7309946  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||| | ||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||    
T  7309947 tcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttatggtgatcttcagct 7310046  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  7310047 tctgat 7310052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34255453 - 34255343
Alignment:
Q  123 ttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaac 222  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||  |||| | || || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34255453 ttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaggttgatctta-tgataatctgcagcttctggtgaactt--gcttctgataaacttgcttctgatgaac 34255357  T
Q  223 ttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||||    
T  34255356 ttgcttctgatgac 34255343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 10757450 - 10757671
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||| || |||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||  |    
T  10757450 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctga 10757549  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaac-agcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    | |||| |||   ||||||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||| || |||||||  ||    
T  10757550 ttttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttttgatgatctt--gc 10757647  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||| |||||||| |||||||    
T  10757648 ttctgatgaacttgctcctgatga 10757671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 2268560 - 2268713
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| || |||||||   ||||||  ||| |||||     
T  2268560 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaatcatttcaaaata---gttgcttaactcttccag 2268656  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 156  Q
    ||||||||||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||| ||||||    
T  2268657 tcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagt 2268713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 235
Target Start/End: Original strand, 17371221 - 17371290
Alignment:
Q  166 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    |||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17371221 tgatgaactgtagcttctggtgatatgcagcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 17371290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26702063 - 26701958
Alignment:
Q  117 acgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttc--ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttc 214  Q
    ||||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||||  | | ||  ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26702063 acgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatcttctgatgaactttagcttctggtgatcttcagtttctgatgaacttgcttc 26701964  T
Q  215 tgatga 220  Q
    ||||||    
T  26701963 tgatga 26701958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34255406 - 34255344
Alignment:
Q  188 atcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34255406 atctgcagcttctggtgaacttgcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 34255344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 1577896 - 1578001
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  1577896 ttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 1577995  T
Q  101 tcttct 106  Q
    ||||||    
T  1577996 tcttct 1578001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 19215641 - 19215699
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  19215641 ttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgctccttgaggaataagcatcaaatgc 19215699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21191916 - 21191846
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatcctt 71  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  21191916 ttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 21191846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17024852 - 17024795
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17024852 cttctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 17024795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 21029003 - 21029044
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21029003 cttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttttgatga 21029044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 17025015 - 17024928
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||   || |||||||||||    
T  17025015 ttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgct 17024928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19170236 - 19170177
Alignment:
Q  165 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaactt 224  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19170236 ctgatgaactgtagcttctggtgatataaagcttctgatgaacttgcttctgatgaactt 19170177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 209
Target Start/End: Original strand, 37642382 - 37642477
Alignment:
Q  114 tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaactt 209  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  37642382 taggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttgagttcaatttcctgatgaactgcagcttctggtgatatatagcttctgatgaactt 37642477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 236
Target Start/End: Original strand, 19215792 - 19215849
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19215792 cttctgatgatctgcagcttctggtgaatttgcttctgatgaatttgcttctgatgac 19215849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34322012 - 34321762
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  34322012 ttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccag 34321913  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||    
T  34321912 gcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaagttgcatctcctgatgaattacagcttctagtgattctcagcttc 34321813  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  34321812 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttatgatgatctcgcttctgatga 34321762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 33074250 - 33074486
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33074250 ttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaatctgtccaaaatagtcgttgctatacttttccag 33074349  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  33074350 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctagtgattctcagcttc 33074449  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33074450 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 33074486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35744076 - 35743842
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744076 ttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 35743977  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    | |||| ||| ||||||||  |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35743976 tattctgcaatctttagac--gtttgagtctgttaaacaacttttgacgctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattttcagcttc 35743879  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35743878 cgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 35743842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31328042 - 31327791
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||||  |||| || |     
T  31328042 ttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagtcgttgcttcacttctctag 31327943  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagctttt-gaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||    
T  31327942 tcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagctt 31327843  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31327842 ctgataaacttgcttctgatgaactagcttatgatgaacttgcttatgatga 31327791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31334763 - 31334512
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||||  |||| || |     
T  31334763 ttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagtcgttgcttcacttctctag 31334664  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagctttt-gaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||    
T  31334663 tcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagctt 31334564  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31334563 ctgataaacttgcttctgatgaactagcttatgatgaacttgcttatgatga 31334512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45087260 - 45087008
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  45087260 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 45087161  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaat-ccgttaaacagc-ttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||| | ||||||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||  | ||||| ||||| || ||||    
T  45087160 tcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaagttgcatcctctgatgaactgtagcttctagtgatatttagct 45087061  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  45087060 tctgataaacttgcttcttatgaacttgcttctggtgaccttgtttctgatga 45087008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28550994 - 28550784
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||| |||||||||||||     
T  28550994 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt---------caaaatagttgtttctatacttttccag 28550904  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||    
T  28550903 tcttctgcaattttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggttttaaattgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttct 28550804  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  28550803 gatgaacttgcttatgatga 28550784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28711774 - 28711553
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | | |||||||||||||| ||||||||||     
T  28711774 ttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattcattcgaaatagtcgttgctttacttttccag 28711675  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtga-tcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   | | ||||||| || |||||||||| | ||  ||||    
T  28711674 tcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcccattatgaactgcagcttctggtgattttttggctt 28711575  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28711574 ctgataaacttgcttctgatga 28711553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22785728 - 22785506
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  22785728 tacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt---------caaaatagtcgttgctatacatttccagttt 22785638  T
Q  104 tctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||   |||||||||||    
T  22785637 tctgcaattttaggcgagtttgaaatcttgaaatagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgtagcttctggtgattcacagcttctgat 22785538  T
Q  204 aaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22785537 gaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 22785506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Original strand, 6392662 - 6392879
Alignment:
Q  6 cacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatctt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  6392662 cacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtctt 6392761  T
Q  105 ctacaa-ctttagacgagtttgaatc-cgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctga 202  Q
    || ||| | ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  6392762 ctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaagatgcatcctctgatgaactgcaacttatggtgatttttagcttctga 6392861  T
Q  203 taaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6392862 taaacttgcttctgatga 6392879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22802484 - 22802718
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||| | ||||| ||| |||| |     
T  22802484 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaatcctttcaaaatagccattgctttacctttctag 22802583  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||| | | |||  |||||    
T  22802584 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaagttgcatctcctgatgaactgcaggttctgataaactt--gcttc 22802681  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| || || |||||||||| ||||||| |||||||    
T  22802682 tgatgaattttcttctgatgaccttgcttctgatgac 22802718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1587109 - 1586898
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||||| |||||  |||||||| ||     
T  1587109 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttt---------caaaatagccgttgtaatactttttcag 1587019  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  1587018 tcttctgcaatcttcagatgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagttccatctcctgatgaactccagcttctggtgattctcagcttc 1586919  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  1586918 tgatgaacttgtttctgatga 1586898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28701305 - 28701081
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||   |||||| ||||||||||     
T  28701305 ttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatatctgttgctttacttttccag 28701206  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtga-tcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||| || |||||||||| | ||  ||||    
T  28701205 tcttctgcaatcttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgattttttggctt 28701106  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaact 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  28701105 ctgataaacttgtttctgatgaact 28701081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30557397 - 30557145
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||  ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  30557397 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaattctttcaaaatagtcgatgcttcactttttca 30557298  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccg-ttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     || ||| ||| | ||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||    |||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  30557297 gtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatatttagct 30557198  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30557197 tctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttttgatgaacttgcttctgatga 30557145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31968119 - 31967909
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||| |||||||||||||||||     
T  31968119 ttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatagttgttgctatacttttccag 31968029  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||   || |||||    
T  31968028 tcttctgcaattttatgcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaggctttaagttgcatcttctgatgaactgcagcttctggtgattcacaacttct 31967929  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
     || ||||||||||||||||    
T  31967928 tatgaacttgcttctgatga 31967909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20152111 - 20151890
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||  |||||||  |||||||||     
T  20152111 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcacttttccag 20152012  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa-gttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  20152011 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaatgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattttcagctt 20151912  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  20151911 ctgatgaacttgtttctgatga 20151890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 40332111 - 40332322
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  40332111 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cctttcaaaatagccgttgctatacttttccag 40332201  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaa-cagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||   ||| |||||||  |||||||  ||| ||  |||||||||||| || |||||||||||   |||||||    
T  40332202 tcttctgcaattttaggcgagtttgaatcctagaaagcagctttgaaagctttgggttacatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttc 40332301  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  40332302 tgatgaacttgcttatgatga 40332322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 44840458 - 44840665
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||| |||||||| ||     
T  44840458 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cctttcaaaatagtcgttgccatactttttcag 44840548  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    || ||| |||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||| |||  ||  ||||||    
T  44840549 tc-tctgcaatgttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcttgatgaactgcagcttctgatgaattt--gcttct 44840645  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  44840646 gatgatcttgcttctgatga 44840665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6574200 - 6573978
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaac-gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  6574200 ttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttcca 6574101  T
Q  100 atcttctacaa--ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     |||||| |||  | ||||||||| || ||||  || |||| | |||||||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  6574100 gtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttatgttgcatcttctgatgaactgcaacttctagtgattttcagct 6574001  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  6574000 tctgatgaacttgcttctgatga 6573978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22776364 - 22776190
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||| |||||||||||||||| |     
T  22776364 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cctttcaaaatagccgttgctatacttttcaag 22776274  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  22776273 tcttttgcaattttaggcgagtctgaaaccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctg 22776190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22781742 - 22781568
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||| |||||||||||||||| |     
T  22781742 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cctttcaaaatagccgttgctatacttttcaag 22781652  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  22781651 tcttttgcaattttaggcgagtctgaaaccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctg 22781568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 23235031 - 23235268
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||     
T  23235031 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgctttactcttccag 23235130  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  || |||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  23235131 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactagagcttctggtgattttcagct 23235230  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23235231 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 23235268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 3277054 - 3277265
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||     
T  3277054 ttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------ccttccaaattagccgttgttatactttttcag 3277144  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||| |||||   |||||||    
T  3277145 tcttctgcaatcttcagacaagtttgaattctttaaacaacttttgaagctttaagttccatctcctaatgaactccagcttctagtgattcccagcttc 3277244  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  3277245 tgatgaacttgcttctaatga 3277265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31800963 - 31800743
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||     
T  31800963 ttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccag 31800864  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||  ||||||||||  |  |||||    
T  31800863 tcttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaagttgcatcccatgatgaactgcagtttctggtgattatttgcttc 31800764  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31800763 tgataaacttgcttctgatga 31800743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22188178 - 22187941
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||  | ||||||||| ||||||  ||| || ||     
T  22188178 ttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatctattcaaaatagttgttgcttcactctttcag 22188079  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22188078 tcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgtcctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagct 22187979  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22187978 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 22187941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 38781423 - 38781658
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  38781423 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccag 38781522  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||||||   |||||||||| || ||||  || |||| | ||||||||||||||  |||||    |||||||   ||| |||||||||||||||||||    
T  38781523 tcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatga--gacatcttctggtgatcttcagct 38781620  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38781621 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 38781658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 30667013 - 30667250
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  | | |||||     
T  30667013 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccag 30667112  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa--gttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  30667113 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatattcttcagct 30667212  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30667213 tctgat-gagatgcttctgacgaacttgcttctgatgac 30667250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 14581539 - 14581671
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||| ||| |||||||     
T  14581539 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cctttcaaaatagtcgttgccatatttttccag 14581629  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagctt 142  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||    
T  14581630 tcttctgcaattttaggcgagttttaatccttgaaacagctt 14581671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22317617 - 22317856
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatcc-ttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||| |    
T  22317617 ttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttcta 22317716  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
     |||| | |||   ||||| ||| || |||||  | || ||| ||||||||||||||  |||||  || ||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  22317717 gtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaatagagcttctggtgattttcagc 22317816  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22317817 ttctgatgtacttgcttatgatgaacttgcttatgatgac 22317856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13964054 - 13963832
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||  ||| || ||     
T  13964054 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcag 13963955  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa--gttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    ||||||||||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||   |||||  | ||||||||||| | ||||| |||||||| | ||    
T  13963954 tcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctactgatgaactagagcttctagtgatctttaact 13963855  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  13963854 tctgaggaacttgcttctgatga 13963832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18376982 - 18376760
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |  ||| ||  ||    
T  18376982 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaa 18376883  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttc--ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||  | | ||  |  ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  18376882 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatcttcaaatgaacttcaacttctggtgatcttctgct 18376783  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  18376782 tctgatgaacttacttctgatga 18376760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20568826 - 20568597
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||  ||| |||||     
T  20568826 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaattgttgttgcttcactcttccag 20568727  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| |  |||||| ||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  20568726 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgatcttgaact 20568627  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    ||| ||  |  ||||||||||||||||||||    
T  20568626 tcttat-gagatgcttctgatgaacttgctt 20568597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25037335 - 25037098
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||| |   ||| |||||     
T  25037335 ttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaattagtcgttacatcactcttccag 25037236  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   || ||| || |||||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25037235 tcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 25037136  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25037135 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25037098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25041442 - 25041205
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||| |   ||| |||||     
T  25041442 ttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaattagtcgttacatcactcttccag 25041343  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   || ||| || |||||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25041342 tcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 25041243  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25041242 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25041205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 25829158 - 25829352
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  25829158 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 25829257  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  25829258 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt 25829352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24377125 - 24377347
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |  || |||| ||||||||||||||||  ||| |||       
T  24377125 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaaacctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctgg 24377224  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaac-agcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||| || | || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||  || ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  24377225 tcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctggtgatctttagct 24377324  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  24377325 tctgatgaactttcttctgatga 24377347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260665
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatc 102  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  103 ttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||    
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatcttc--cttc 22260629  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||  |  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22260630 tgat-gagatgcttttgatgaacttgcttctgatgac 22260665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24576059 - 24576309
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  | ||| || || ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  24576059 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccag 24576158  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgag-tttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||||| |||   ||||| ||| ||| ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||  ||    
T  24576159 tcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatctcctaatgaactttagcttctggtgatctt--gc 24576256  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    || ||||  |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24576257 ttatgat-gatatgcttctgatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatga 24576309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 30621243 - 30621445
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  30621243 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtct 30621342  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa--gttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    ||| |||   ||| ||||| || ||||| || |||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30621343 tctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctgatgcactacaacttctagtgatattcagcttct 30621442  T
Q  201 gat 203  Q
    |||    
T  30621443 gat 30621445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 30623864 - 30624066
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  30623864 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtct 30623963  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa--gttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    ||| |||   ||| ||||| || ||||| || |||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30623964 tctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctgatgcactacaacttctagtgatattcagcttct 30624063  T
Q  201 gat 203  Q
    |||    
T  30624064 gat 30624066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9015436 - 9015210
Alignment:
Q  11 cgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa 110  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||| |  ||| ||||| |||||| |||    
T  9015436 cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaa 9015337  T
Q  111 -ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaac 207  Q
       |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||||||  |     
T  9015336 tgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagtttctgg-gatcttctgcttctgat-gag 9015239  T
Q  208 ttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9015238 ttgtttctgatgaacttgcttctgatgac 9015210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 19540440 - 19540634
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||| | |||||| |||||||  ||| | | |     
T  19540440 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaaacctttcgaaatagccgttgcttcactctcctag 19540539  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| |||   ||||| ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  19540540 tcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaacttcagcttctggtgatctt 19540634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21537324 - 21537087
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||  ||| |||       
T  21537324 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaaacctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctgg 21537225  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||  |||| ||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| | ||    
T  21537224 tcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcatcttctagtgatctttaact 21537125  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  21537124 tctgat-gaggtgcttctggtgagcttgcttctgatgac 21537087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 40782501 - 40782588
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  40782501 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 40782588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24850742 - 24850512
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||       
T  24850742 ttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaatcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctgg 24850643  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaac-agcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||||  |||    |||||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||| || | |||||||||||| |||    
T  24850642 tcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgtacttcagcatctggtgatctttagc 24850543  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    |||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  24850542 ttctgat-gaggtgcttctgatgaacttgctt 24850512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 1084142 - 1084235
Alignment:
Q  111 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||  | |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  1084142 ctttagacgagtttgaatcctttaaacagctatttgaaagtttaggttgcatcttctgatgaactacagtttctggtgatatacagcttctgat 1084235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10009826 - 10009590
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttc-ca 99  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||       
T  10009826 ttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttg 10009727  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
     |||| | |||   || |||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||   |    
T  10009726 gtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--tc 10009629  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10009628 ttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 10009590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 28140693 - 28140608
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  28140693 gtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 28140608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39037539 - 39037496
Alignment:
Q  177 aacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39037539 aacttccggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 39037496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Original strand, 7609102 - 7609213
Alignment:
Q  116 gacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgctt 213  Q
    |||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||  |||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||  |  |||||    
T  7609102 gacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgctt 7609198  T
Q  214 ctgatgaacttgctt 228  Q
    |||||||||||||||    
T  7609199 ctgatgaacttgctt 7609213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Original strand, 24779370 - 24779454
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||| || ||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24779370 tacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 24779454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Original strand, 1084049 - 1084091
Alignment:
Q  20 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1084049 gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatctaatgcctt 1084091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23184225 - 23184184
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23184225 cttctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatga 23184184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23595482 - 23595441
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23595482 cttctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatga 23595441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 250
Target Start/End: Original strand, 44840625 - 44840665
Alignment:
Q  210 gcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  44840625 gcttctgatgaatttgcttctgatgatcttgcttctgatga 44840665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22212 - 21962
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| ||||     
T  22212 ttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaatccttcaaagatagtcgttgctatacttctccag 22113  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  22112 tcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaagttgcatcttctaatgaactacaacttctggtgattcacagcttc 22013  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22012 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 21962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 9590 - 9809
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  9590 ttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatactttcccag 9689  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   |||||| |    
T  9690 tcttctgcaatcttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttat 9789  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  9790 gatgaacttgcttctgatga 9809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19061 - 19283
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||     
T  19061 ttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatccttccaaaatagccgttgcttcactcttccag 19160  T
Q  101 tcttctacaa--ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||||| |||  |||| |||||| || ||||| || |||||| ||| ||||||||||  ||| |   ||||||||| || | |||||||||||||||| |    
T  19161 tcttctgcaatgcttt-gacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatcacctgatgaaatagagcttctggtgatcttcaac 19259  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19260 ttctgataaacttgcttctgatga 19283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6821 - 6571
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||  |||||||||     
T  6821 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcggtgcttcacttttccag 6722  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  6721 tcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttc 6622  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  6621 tgataaacttgcttctgatgaactagcttttgatgaacttgctcctgatga 6571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6517509 - 6517729
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6517509 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccag 6517608  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6517609 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttc 6517708  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  6517709 tgatgaacttgcttctgatga 6517729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 10692875 - 10693095
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  10692875 ttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccag 10692974  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  10692975 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttc 10693074  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  10693075 tgatgaacttgcttctgatga 10693095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 10906641 - 10906861
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  10906641 ttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccag 10906740  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  10906741 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttc 10906840  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  10906841 tgatgaacttgcttctgatga 10906861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17398761 - 17398551
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||     
T  17398761 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt---------caaaatagtcgttgctatacttttccag 17398671  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||    |||||||    
T  17398670 tcttctgcaattttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaaccgcagcttctggtgattcatagcttct 17398571  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17398570 gatgaacttgcttctgatga 17398551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 29121394 - 29121633
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||     
T  29121394 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcag 29121493  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||           | ||||||||||||||||| || || |||    
T  29121494 tcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagttgc-----------atctacaacttctggtgatttttagattc 29121582  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  29121583 tgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgaacttgctactgatga 29121633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 54679954 - 54680155
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  54679954 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccag 54680053  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  54680054 tcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 54680151  T
Q  200 tgat 203  Q
    ||||    
T  54680152 tgat 54680155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3105506 - 3105323
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||     
T  3105506 ttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaatcctttcaaaatagccgttggaatacttttccag 3105407  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  3105406 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctg 3105323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37435622 - 37435373
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  37435622 ttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaa 37435523  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   || |||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  ||     
T  37435522 tcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcc 37435425  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37435424 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 37435373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 413026 - 413246
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  ||||||| |     
T  413026 ttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttcacttttcgag 413125  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  413126 tcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagttgaatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 413225  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  413226 tgatgaacttgcttctgatga 413246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 16940040 - 16940183
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16940040 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccag 16940139  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagctttt 144  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16940140 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatccattaagcagctttt 16940183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 3483752 - 3483963
Alignment:
Q  8 cttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttcta 107  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||     
T  3483752 cttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctg 3483851  T
Q  108 caa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgata 204  Q
    |||   ||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||  |||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3483852 caatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatg 3483951  T
Q  205 aacttgcttctg 216  Q
    ||||||||||||    
T  3483952 aacttgcttctg 3483963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17247268 - 17247503
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||    
T  17247268 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttt-ccaa 17247366  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  17247367 tcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagattcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 17247466  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17247467 tgatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 17247503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 3395614 - 3395868
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||     
T  3395614 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcag 3395713  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    | |||| |||   ||||||||  || ||||| || |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  3395714 ttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactatagcttctagtgatcttcaact 3395813  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaactt--gcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  3395814 tctgataaacttgcttctgatgaacttcagcttttgataaacttgcttctgatga 3395868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 8105661 - 8105913
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||  | |||||||    
T  8105661 ttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcaattttcca 8105760  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccg-ttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     |||||| ||| | ||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    || ||||||  |||||||||||||| || | ||    
T  8105761 gtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagccttaagttgcatcctctaatgaacggcaacttctggtgatttttaact 8105860  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  8105861 tctgataaacttgcttctgatgaactcacttctgatgaacttgcttctgatga 8105913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19884726 - 19884947
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||     
T  19884726 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccag 19884825  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || |||||  | |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  19884826 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc-atgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattgtcagct 19884924  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  19884925 tctgatgaacttgcttctgatga 19884947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25651191 - 25651046
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |     
T  25651191 ttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgcttcacttttcaag 25651092  T
Q  101 tcttctac-aactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttg 145  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25651091 tcttctgcgatctttagacaagtttgaatccgttaaacaacttttg 25651046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Original strand, 55731836 - 55732036
Alignment:
Q  33 gctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaact-ttagacgagtttgaatccg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| | ||| | |||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||     
T  55731836 gctctttgaagaataagcatccaat-ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatcca 55731934  T
Q  132 ttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttg 231  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  55731935 ttaaacaacttttgaagttttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttccggtgattctcagcttct-aaaaacttgtttctgatgaccttgcttctg 55732033  T
Q  232 atg 234  Q
    |||    
T  55732034 atg 55732036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 9140936 - 9141092
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  9140936 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctttacttttccag 9141035  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 156  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  9141036 tcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagt 9141092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13576198 - 13575998
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  ||| ||||| |||    
T  13576198 tacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtct 13576099  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctga 202  Q
    ||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  13576098 tctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctga 13575999  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  13575998 t 13575998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14904437 - 14904190
Alignment:
Q  7 acttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttct 106  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| | |||||||  ||||||||| ||||||    
T  14904437 acttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttct 14904338  T
Q  107 acaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
     |||    |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14904337 gcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagattttgat 14904238  T
Q  204 aaactt--gcttctgatgaactt--gcttttgatgaccttgcttctga 247  Q
     | |||   |||||||||| |||  |||| |||||| |||||||||||    
T  14904237 gatcttcaacttctgatgaccttcagcttctgatgaacttgcttctga 14904190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 22190870 - 22191082
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         | || ||||||||| ||||| |||||||||||     
T  22190870 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaatcagcatccaatg---------catttcaaaatagttgttgccatacttttccag 22190960  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttg-aagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| || ||  | |||| || ||| | |||||||||||| || ||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||   ||||||    
T  22190961 tcttctgcaatttctaagcaagttagagtccttgaaacagcttttgaaaactttaagttccacctcttgatgaactgcagcttctggtgatacacagctt 22191060  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  22191061 ctgatgaacttgcttctgatga 22191082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22675607 - 22675404
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |     
T  22675607 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttctag 22675508  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||| || ||||||| ||| ||  |||||    
T  22675507 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgttgcatctcctaatgaactgcagcttctggggattttttgcttc 22675408  T
Q  200 tgat 203  Q
    ||||    
T  22675407 tgat 22675404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15475230 - 15475018
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||         | || |||||||| |||||| ||||||||| |     
T  15475230 ttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaggagtaagcatccaatg---------catttcaaaatagccgttgccatacttttctac 15475140  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||  | |||||||||||   ||||||     
T  15475139 tcttctgcaatctttagacgagttaaaatccttgaaacagcttttgaaactttgagttcaatttcctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttt 15475040  T
Q  200 tgataaac-ttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  15475039 tgatgaactttgcttctgatga 15475018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Original strand, 14571161 - 14571268
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgct 212  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  14571161 ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgct 14571260  T
Q  213 tctgatga 220  Q
    ||||||||    
T  14571261 tctgatga 14571268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 45833418 - 45833655
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||  ||||||  ||| |||||     
T  45833418 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaatactttcaaaatagaagttgcttaactcttccag 45833517  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  45833518 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagct 45833617  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  45833618 tctgat-gagatgcttatgataaacttgcttctgatgac 45833655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29680631 - 29680426
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  29680631 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 29680532  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   |||||| || || ||||| || |||| | |||| |||||||||  |||||  ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  29680531 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatctcctggtaaactagagcttctggtgatcttcagct 29680432  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  29680431 tctgat 29680426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833625
Alignment:
Q  30 aacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa-ctttagacgagtttgaat 128  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||   ||||||||| ||||||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  129 ccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
    |  || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgat 14833625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 40860691 - 40860918
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | || |||| ||| | |||| |||||||||||     
T  40860691 ttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catttcaaattagccattgccatacttttccag 40860781  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||  | ||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  | |||||||||||   || ||||    
T  40860782 tcttctgcaatttctaggcgagttatagtccttgaaacaacttttgaaactttaagttccatctcctgatgaactgtagcttctggtgatacacaacttc 40860881  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  40860882 tgatgaacctgcttatgatgaactagcttctgatgac 40860918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 56034617 - 56034816
Alignment:
Q  20 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa-ctttagac 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||   || |||    
T  56034617 gtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggac 56034716  T
Q  119 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctg 216  Q
    ||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||  |||||  | |||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  56034717 gagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctg 56034814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 12601125 - 12601281
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |  ||| ||| |     
T  12601125 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgattcactattcaag 12601224  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 156  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  12601225 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagt 12601281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Original strand, 16853620 - 16853727
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgct 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||  |  |||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16853620 ttagacgagtttgaatctgttaaacaacttttgaaccttgaagttgcatcttttgatcaactacaacttatggtgattcacagcttctgataaacttgct 16853719  T
Q  213 tctgatga 220  Q
    ||||||||    
T  16853720 tctgatga 16853727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19911968 - 19911762
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaa-gaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||  ||      
T  19911968 ttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctg 19911869  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
     |||| | |||   || |||||| |||||||  || |||| | ||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19911868 gtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagc 19911769  T
Q  197 ttctgat 203  Q
    |||||||    
T  19911768 ttctgat 19911762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12811262 - 12811028
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||     
T  12811262 ttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcag 12811166  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||   | ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| | |||||||||||||||  ||    
T  12811165 tcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaactagagcttctggtgatcttctact 12811066  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
     |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12811065 actgat-gagatgcttctgatgaacttgcttttgatgac 12811028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 37985699 - 37985594
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||     
T  37985699 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcag 37985600  T
Q  101 tcttct 106  Q
    ||||||    
T  37985599 tcttct 37985594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 56533149 - 56532990
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctc-tttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||  | |||| ||    
T  56533149 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcattttttca 56533050  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaat-ccgttaaacagcttttgaagctttaagtt 157  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||| || | |||||||||||||||| |||||||    
T  56533049 gtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaagtt 56532990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3499624 - 3499514
Alignment:
Q  123 ttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaac 222  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||| || || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3499624 ttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaggttgatcttc-tgatgatctgcagcttctggtgaactt--gcttctgataaacttgcttctgatgaac 3499528  T
Q  223 ttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||||    
T  3499527 ttgcttctgatgac 3499514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16632464 - 16632658
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |  ||| |||||     
T  16632464 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccag 16632563  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| |||   ||| ||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  16632564 tcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctagtgatctt 16632658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19621148 - 19621061
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  19621148 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 19621061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 55380314 - 55380401
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  55380314 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 55380401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 9751627 - 9751569
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9751627 ttgtacacttcgtgcaaacatactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 9751569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 20977481 - 20977539
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20977481 ttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 20977539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 38513902 - 38513960
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38513902 ttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 38513960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Original strand, 3793287 - 3793367
Alignment:
Q  140 cttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  3793287 cttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagcttctggtgaacttgcttttgatga 3793367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10072959 - 10073161
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||  ||||||| |||| |||  ||||||  |||||||||     
T  10072959 ttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaactagcagttgcttcacttttccag 10073058  T
Q  101 tcttctac-aactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| | |   ||| ||||| || |||||  | |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  10073059 tcttctgctatgcttaaacgagattaaatcc-atgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactactgcttctggtaattttcagct 10073157  T
Q  198 tctg 201  Q
    ||||    
T  10073158 tctg 10073161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39419821 - 39419611
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||         | ||||||| ||| |||||| | ||| || ||     
T  39419821 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct-tttgaagaattagcatcaaatg---------cattccaaactagccgttgccacactctttcag 39419732  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| |  || || ||| |||||| || ||| | |||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||| || |||||||||||   || ||||    
T  39419731 tcttttgtaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttgagttcaatttcctgatgaactgcagcttctggtgatacacaacttc 39419632  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| |||| |||||||||||    
T  39419631 tgatgaactagcttctgatga 39419611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3499586 - 3499515
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3499586 cttctgatgatctgcagcttctggtgaacttgcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 3499515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17700777 - 17700662
Alignment:
Q  118 cgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctga 217  Q
    |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||  |||| |||||| || || |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  17700777 cgagcttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaggttgatcttc-tgatgatctgcagcttctggtgaactt--gcttctgatgaacttgcttctga 17700681  T
Q  218 tgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  17700680 taaacttgcttctgatgac 17700662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17700734 - 17700663
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  17700734 cttctgatgatctgcagcttctggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgataaacttgcttctgatga 17700663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 27188722 - 27188667
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27188722 tacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 27188667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3499739 - 3499682
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg 58  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  3499739 ttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctcattgaagaaatagcatccaatg 3499682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14604994 - 14604758
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatcc-ttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||  |||||||| ||||||  ||| ||| |    
T  14604994 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatagttgttgcttcactcttcta 14604895  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
     |||||| |||   ||||||||| |||||||| |  || ||| ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| |  | |||||| |||||||  ||    
T  14604894 gtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagtttagcttctgatgatctt--gc 14604797  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14604796 ttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 14604758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 19666396 - 19666501
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| ||| || |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  19666396 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 19666495  T
Q  101 tcttct 106  Q
    ||||||    
T  19666496 tcttct 19666501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 16853527 - 16853585
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16853527 ttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgc 16853585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14153910 - 14153874
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14153910 cttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttct 14153874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Original strand, 23123597 - 23123660
Alignment:
Q  142 tttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  23123597 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgat 23123660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 1672413 - 1672460
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataa 48  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||    
T  1672413 ttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctttgaaggataa 1672460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 1674888 - 1674935
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataa 48  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||    
T  1674888 ttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctttgaaggataa 1674935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Original strand, 40846290 - 40846360
Alignment:
Q  165 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  40846290 ctgatgaacttcagcttccggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgtttctgatgac 40846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 6641708 - 6641778
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatcctt 71  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||  |||||||    
T  6641708 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaatcctt 6641778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Original strand, 33378531 - 33378651
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgc 211  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||||| |||||| ||| | ||||||  | |||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||| || | ||    
T  33378531 ttagacgaggttgaatccaatagacagctatttgaaacttcaggttgcatcttctgatgaacttcagtttctggtgatatacagcttctgatcaaatggc 33378630  T
Q  212 ttctgatgaacttgcttttga 232  Q
    |||||| | ||||||| ||||    
T  33378631 ttctgaaggacttgctattga 33378651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 60833 - 61053
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  60833 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatccttccaaaatagccgttgctatacttttccag 60932  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  60933 tcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcaacttc 61032  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  61033 tgataaacttgcttctgatga 61053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 215578 - 215342
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |     
T  215578 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttctag 215479  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  215478 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaagttgcatctcctgataaactgcagcttctggtgattttcggcttc 215379  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  215378 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 215342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7237 - 7001
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7237 ttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccag 7138  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||    
T  7137 tcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattcacagcttc 7038  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  7037 tgatgaacttgcttctgataacattgcttctgatgac 7001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2265651 - 2265448
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  2265651 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaaatagccgttgctatactttttcag 2265552  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2265551 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaagttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttc 2265452  T
Q  200 tgat 203  Q
    ||||    
T  2265451 tgat 2265448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15704620 - 15704445
Alignment:
Q  12 gtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa- 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  15704620 gtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat 15704521  T
Q  111 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15704520 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagtttcatcttctgatgaactacaacttctggt 15704445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35952820 - 35952585
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  35952820 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 35952721  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaat-ccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||||| ||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  35952720 tcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaagttgcatcctctgatgaactgcaacttctggtgatttttagctt 35952621  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35952620 ctgataaacttgcttctgatgaatttgcttctgatg 35952585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 4821500 - 4821735
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||  ||||||| |     
T  4821500 ttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatctttc-aaaatagccgttgctccacttttctag 4821598  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  4821599 tcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagctttaagttgtatctccggatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 4821698  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4821699 tgacgaacttgcttctgatgaccttgcttttgatgac 4821735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 8182956 - 8183191
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  8182956 ttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttcaatcctttcaaaatagttgttgctatacttttccag 8183055  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||||||||   |||||| |    
T  8183056 tcttctgcaatcttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagctttt 8183155  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8183156 gatgaacttgcttctaatgaacttgcttctgatgac 8183191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12174473 - 12174236
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt-gaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  12174473 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 12174374  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaa-cagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     |||||| ||| | ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  12174373 gtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagctt-aagttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttagct 12174275  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12174274 tctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatgac 12174236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 14426573 - 14426757
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  14426573 ttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 14426672  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  14426673 tcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcaccttctg 14426757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48062952 - 48062727
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||||||||     
T  48062952 ttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt---------caaaatagtcgttgccatacttttccag 48062862  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||   |||||||    
T  48062861 tcttcgacaatttctaggcgagtttgaattcttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcttgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttc 48062762  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatg 234  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48062761 tgatggacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 48062727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16543152 - 16542932
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||  |||||||||     
T  16543152 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16543053  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||    
T  16543052 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcattatgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagtttc 16542953  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  16542952 tgatgaactttcttctgatga 16542932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16622510 - 16622730
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||  |||||||||     
T  16622510 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16622609  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||    
T  16622610 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcattatgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagtttc 16622709  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  16622710 tgatgaactttcttctgatga 16622730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48237034 - 48236814
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||     
T  48237034 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaatcctttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcag 48236935  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| | |||   ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  48236934 tcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 48236835  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  48236834 tgatgaacttgcttctgatga 48236814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21283505 - 21283256
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||| |||| |||||     
T  21283505 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatggacgttgctttactcttccag 21283406  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  21283405 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctgatgaacttcaacttctggtgatctt--gct 21283308  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21283307 tctgatgagatt-cttctgatgaacttgattctgatgaccttgcttctgatga 21283256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16112016 - 16111796
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||  |||||| |      
T  16112016 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaatttcttccaaaaaagtcgttgcttcactttttccg 16111917  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    ||||| |||| || ||||||||||| || | ||||    
T  16111916 tcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaagttgcatcctctgatcaactgcagcttctggtgatttttatcttc 16111817  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  16111816 taataaacttgcttctgatga 16111796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30944455 - 30944271
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30944455 ttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaa 30944356  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    |||||| |||   ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  30944355 tcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctg 30944271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30945488 - 30945304
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30945488 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaa 30945389  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    ||||||||||   ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  30945388 tcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctg 30945304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19339382 - 19339174
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  19339382 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catttcaaaatagtcgttgccacacttttccag 19339292  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || ||| | |||||| ||||||| |||||||||  |  |||||||||||| || |||||||||||   |||||||    
T  19339291 tcttctgcaatctttaggcgagttagagtccttgaaacaggttttgaaactttaagttcaatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttc 19339192  T
Q  200 tgataaacttgcttctga 217  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19339191 tgatgaacttgcttctga 19339174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 27871744 - 27871956
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct-ctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  27871744 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatagccgttgccatactattcca 27871834  T
Q  100 atcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
      ||||| ||| || |||  || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||   ||||||    
T  27871835 gacttctgcaatttctaggtgaatttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatttcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagctt 27871934  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  27871935 ctgatgaacttgcttctgatga 27871956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 33605711 - 33605932
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||  | |||||||     
T  33605711 ttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcaattttccag 33605810  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacag-cttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    || ||| ||    ||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  33605811 tcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagctt 33605910  T
Q  199 ctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| || | | |||||||||    
T  33605911 ctgatgaattcgattctgatga 33605932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 9069588 - 9069826
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  9069588 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 9069687  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||  || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  9069688 tcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagct 9069787  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  9069788 tctgatgaacttgtttctgataaacttgcttctgatgac 9069826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 14425473 - 14425683
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||| |||||| ||||     
T  14425473 ttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatagccgttgccatacttntccag 14425563  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||    || ||| |    
T  14425564 tcttctgcaatgttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactntagcttctggtgaaacacanctttt 14425663  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  14425664 gntgaacttgcttctgatga 14425683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 44467090 - 44467312
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |     
T  44467090 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctag 44467189  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaac-agcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  44467190 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttttggtgatcttcagc 44467289  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatg 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  44467290 ttctgatgaacttgcttctgatg 44467312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23280090 - 23279875
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||     
T  23280090 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagccgttgctccacttttccag 23279991  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    ||||||||||   |||||| || || |||||  | || ||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  23279990 tcttctacaatgcttagacaagattaaatcc-atgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattttcacct 23279892  T
Q  198 tctgataaacttgcttc 214  Q
    |||||  ||||||||||    
T  23279891 tctgacgaacttgcttc 23279875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19711145 - 19710907
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttc--c 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||  |    
T  19711145 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcca-ccttttcttc 19711047  T
Q  99 aatcttctac-aactttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    | ||||  ||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||  |||||||||| | |||     
T  19711046 agtctttcactctctttagacgagtttgaatccattaaacagctatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaactacagtttctggtgatatacagt 19710947  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||||    
T  19710946 ttctgatgaaatagcttctgatagacttgcttctgatgac 19710907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28622488 - 28622268
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  ||||||| |     
T  28622488 ttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttcacttttctag 28622389  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    | |||| |||   ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || |||||     
T  28622388 tattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatttttagctta 28622289  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  28622288 tgatgaacttgcttctgatga 28622268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2913740 - 2913518
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |     
T  2913740 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctag 2913641  T
Q  101 tcttctaca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||   |||||| ||| || ||| | || |||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  2913640 tcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactacagtttctggtgatcttcatct 2913541  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||||    
T  2913540 tctgatgaacttgcttttgatga 2913518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15088546 - 15088768
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||     
T  15088546 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcag 15088645  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||| |  |||||  |||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  15088646 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctcctgatgaattagagcttctggtgatcttcagct 15088745  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  15088746 tatgatgaacttgcttctgatga 15088768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9709931 - 9709731
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  ||| ||||| |||    
T  9709931 tacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtct 9709832  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctga 202  Q
    ||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9709831 tctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagctttatgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctga 9709732  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  9709731 t 9709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10883305 - 10883076
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  10883305 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 10883206  T
Q  101 tcttct-acaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| | |   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10883205 tcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgatcttcagct 10883106  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    ||||||     ||||||||||||||||||||    
T  10883105 tctgat-gggatgcttctgatgaacttgctt 10883076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13880130 - 13880366
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||  || |     
T  13880130 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgag 13880229  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || | ||| || |||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  13880230 tcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaattcctgatgaactagagcttctcatgatcttcagct 13880329  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatga 235  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13880330 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13880366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33691841 - 33691624
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||    
T  33691841 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtct 33691742  T
Q  104 tctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    ||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||| |  |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||    
T  33691741 tctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgattttcaacttct 33691642  T
Q  201 gataaacttgcttctgat 218  Q
     || ||||||||||||||    
T  33691641 aatgaacttgcttctgat 33691624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 1293056 - 1293188
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  1293056 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cctttcaaaatagttgttgctatacttttccag 1293146  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagctt 142  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  1293147 tcttttgcaattttagtcgagtttgaatccttgaaacagctt 1293188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21695427 - 21695649
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||| ||   ||||||||||||||  ||| |||       
T  21695427 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctgg 21695526  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||  || ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21695527 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctggtgatcttcagct 21695626  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||||    
T  21695627 tctgatgaacttgcttatgatga 21695649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 13302836 - 13303033
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |     
T  13302836 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctag 13302935  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcag 195  Q
    ||||||||||   ||||||||  || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13302936 tcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaactacagcttctggtgatcttcag 13303033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32264850 - 32264669
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct-ctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||          |||||||| |||||| |||||||||||    
T  32264850 ttgtacactctgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataaacatccaatgcattt---------caaaatagccgttgccatacttttcca 32264760  T
Q  100 atcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgat 189  Q
     |||||| ||| || ||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  32264759 gtcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaataacttttgaagctttaagtcgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 32264669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 15467942 - 15468179
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |  ||| |||||     
T  15467942 ttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgattcactcttccag 15468041  T
Q  101 tcttctacaactt---tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcag 195  Q
    |||||| ||  ||   |||||||| || ||||  || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  15468042 tcttctgca--ttgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtaatcttcag 15468139  T
Q  196 cttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | ||||||  |  ||| | |||||||||||||| |||||||    
T  15468140 catctgat-gagatgcatatgatgaacttgcttctgatgac 15468179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16316689 - 16316454
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||       
T  16316689 ttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctgg 16316590  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| ||| | ||||||| | || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  16316589 tcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcccctgatgaacttcaacttctggtgatctt--gct 16316492  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16316491 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 16316454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21381552 - 21381349
Alignment:
Q  9 ttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||          |||||||| |||||| | ||||||||| |||||| |    
T  21381552 ttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaataggcatccaatgcattt---------caaaatagccgttgccacacttttccagtcttctgc 21381462  T
Q  109 aa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaac 207  Q
    || |||||| |||||| || ||| | ||||| |||||||| || ||||||  |  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||| |||    
T  21381461 aatctttaggcgagttagagtccttgaaacaacttttgaaactataagttcaatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaac 21381362  T
Q  208 ttgcttctgatga 220  Q
    | |||||||||||    
T  21381361 tagcttctgatga 21381349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 2500064 - 2500286
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  2500064 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 2500163  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||  ||| | | |||||||||||| ||||||    
T  2500164 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgaaaaacaagagcttctggtgatcctcagct 2500263  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||||    
T  2500264 tctgatgaacttgcttatgatga 2500286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 30025931 - 30026153
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  | || || |||||||| |||||||  ||| || ||     
T  30025931 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaattcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcag 30026030  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| | |   ||| |||||  | ||||| || | |||| |||||||||||||||  ||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30026031 tcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttctggtgatcttcagct 30026130  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  30026131 tctgatgaacttgcttctgatga 30026153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4429107 - 4428964
Alignment:
Q  112 tttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgc 211  Q
    ||||| |||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||  |  ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  4429107 tttaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttaagttcaatctccagatgaactgcagcttctggtgataaacagcttctgatgaatttgc 4429008  T
Q  212 ttctgatgaacttgcttttgatg-accttgcttctgatgatgtc 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  4429007 ttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatgatgtc 4428964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24794847 - 24794681
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgc-tctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||         | || |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24794847 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaggaataagcatccaatg---------catttcaaaatagccgttgccatacttttcca 24794757  T
Q  100 atcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaact 174  Q
     |||||| ||| || ||| |||||| || ||| | ||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||||||    
T  24794756 gtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacaacttttgaaactttgagttccaattcctgatgaact 24794681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 29935490 - 29935403
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  29935490 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 29935403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13138027 - 13137827
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||  ||| || ||     
T  13138027 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcag 13137928  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |  | | ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13137927 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgaactagagcttctggtgatcttcagct 13137828  T
Q  198 t 198  Q
    |    
T  13137827 t 13137827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 11319431 - 11319668
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||  || || | ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||| ||  ||| || ||     
T  11319431 ttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcctttcaaaatagttgttacttcactctttcag 11319530  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   |||||| || || ||||| || |||| | |||||||||| ||||  ||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11319531 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctcttgatgacctacaacttctggtgatcttcagct 11319630  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11319631 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttttaatgac 11319668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22578153 - 22577959
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| || ||     
T  22578153 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacag 22578054  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| |||   ||| ||||| || ||||  || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22578053 tcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt 22577959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 28409065 - 28409301
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| |     
T  28409065 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaataattgttgcttcactcttctag 28409164  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||  |||||||||| || ||||| || |||| | |||||||| ||| |  |||||  || |||||||||  | |||||||||| ||   |||    
T  28409165 tcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctcttgatgaactttagcttctggtga-ctgttgct 28409263  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28409264 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 28409301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 331671 - 331894
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaa-tagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||  ||||||  ||| |||||    
T  331671 ttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgct-tttgagcaataagcatccaatgccttcagatcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttcca 331769  T
Q  100 atcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagtt-gcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     |||||| |||   || |||||  |||||||| | ||||| | |||||||||||||||  |||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  331770 gtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtccgcatctcctgatggacttcagcttctggtgatcttcagct 331869  T
Q  198 tctgataaac--ttgcttctgatga 220  Q
    |||||| |||  |||||||||||||    
T  331870 tctgatgaacttttgcttctgatga 331894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19237175 - 19237022
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||  ||| |||       
T  19237175 ttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagccgttgcttcactcttctgg 19237076  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa 154  Q
    |||||| |||   |||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  19237075 tcttctgcaatgctagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 19237022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 13648755 - 13648911
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||  ||| || ||     
T  13648755 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaatcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcag 13648854  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 156  Q
    |||||| |||   ||||||| | || ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  13648855 tcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagt 13648911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12366880 - 12366690
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||     
T  12366880 ttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccag 12366781  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtga 188  Q
    |||||| |||   ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  12366780 tcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 12366690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 14193140 - 14193227
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  14193140 ttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 14193227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16310039 - 16309961
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaata 79  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  16310039 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 5000954 - 5000867
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  5000954 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 5000867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 21692313 - 21692400
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  21692313 ttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaacagtcgttgct 21692400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 24788167 - 24788254
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  24788167 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcctttcaaaatattcgttgct 24788254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48806011 - 48805769
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||         | || |||| ||| |||||| ||| |  ||||     
T  48806011 ttgtacactttgtacgaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaatagcatccaatg---------catttcaaactagccgttgccatattcctccag 48805921  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| |  || || ||| |||||| || ||| | ||||||||||||||   || |||| ||  || ||||||||| || |||||||||||    ||||||    
T  48805920 tcttatgtaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaaacttgagttccatctcttgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttc 48805821  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatg-accttgcttctgatga 250  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  48805820 tgatgaactttcttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatga 48805769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16556755 - 16556665
Alignment:
Q  16 aaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttct 106  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  16556755 aaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttct 16556665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Original strand, 16608907 - 16608997
Alignment:
Q  16 aaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttct 106  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  16608907 aaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttct 16608997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4412094 - 4411870
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||         | || |||  ||| |||||  |||||| ||||     
T  4412094 ttgtacagttcgtacagacgcacaatgtcaacgctctttgagaattaagcatccaatg---------cttttcaagttagccgttgtcatacttctccag 4412004  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| || ||| |||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||  |  ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||    
T  4412003 tcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttaagttcaatctccagatgaactgcagcttctggtgataaacagcttc 4411904  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgat 233  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4411903 tgatgaatttgcttctaatgaacttgcttctgat 4411870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7339893 - 7339821
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctgg 185  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  7339893 ttagacgagtttaaatccattaaacaatttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctgg 7339821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 11792933 - 11793020
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  11792933 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaatgctttcaaaatagtcgttgct 11793020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13730807 - 13730720
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgct 88  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||| |||||||    
T  13730807 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatcttttcaaaatagccgttgct 13730720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39284530 - 39284475
Alignment:
Q  165 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39284530 ctgatgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 39284475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Original strand, 14193242 - 14193337
Alignment:
Q  142 tttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||||||  ||||  || |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14193242 tttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgat-aagatgcttatgatgaacttgcttctgatgac 14193337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 39284696 - 39284635
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  39284696 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgcctt 39284635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 13260747 - 13260689
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  13260747 ttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgc 13260689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Original strand, 11793046 - 11793138
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
    ||||||||| || | ||| || |||| | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  11793046 ttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgat 11793138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39284533 - 39284474
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaactt--gcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  39284533 cttctgatgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgac 39284474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 78447 - 78227
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  78447 ttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 78348  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||  |||| |||    
T  78347 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaagctgcatctcatgatgaactacagcttctggtgattctcagattc 78248  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  78247 tgatgaacttgcttctgatga 78227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 211428 - 211654
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  211428 ttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaatccttacaaaatagtcgttgctatacttttccag 211527  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||| | | |||  |||||    
T  211528 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaagctgcatctcctgatgagctacagcttctgataaactt--gcttc 211625  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    |||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  211626 tgatgaacttgcgtctgaggaccttgctt 211654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 377640 - 377403
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||      
T  377640 ttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccgg 377541  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  377540 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactataacttctggtgatcttcagct 377441  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  377440 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 377403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 220432 - 220504
Alignment:
Q  163 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  220432 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgat-gaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 220504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 65484 - 65290
Alignment:
Q  26 tgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaactttagacgagtttg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  65484 tgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaatcttagacgagtttg 65385  T
Q  126 aatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65384 aatccttgaaatagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 65290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 144529 - 144335
Alignment:
Q  26 tgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaactttagacgagtttg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  144529 tgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttagacgagtttg 144430  T
Q  126 aatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  144429 aatccttgaaatagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 144335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 165025 - 164776
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||   |  | || ||    
T  165025 gtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgctactatactacagtc 164926  T
Q  103 -ttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
     |||     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||    
T  164925 tttcgctttctttagacgagtttgaatccattaaacagctatttgaaactttaggttgcatctactgatgaactacagtttctagtgatatacagcttct 164826  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||  || | |||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  164825 gaggaaatagcttctgatagacttggttctgatgaacttgcttctgatga 164776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8150
Alignment:
Q  2 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  102 cttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgat 189  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || |||||||||||    
T  8063 cttctgcaatcttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgat 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 11 - 87
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgat 189  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || |||||||||||    
T  11 ttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgat 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5683 - 5446
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  5683 ttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgctttacttttccag 5584  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaa---ctacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||  | ||||||||   |  || |||||||||||  |||||    
T  5583 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaaattgcatcttctgatgaacagcagcagcttctggtgattctcagc 5484  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5483 ttctgataaacttgcttctgatgaccttgcttctgatg 5446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 736 - 552
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  736 ttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 637  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctg 184  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  636 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcaccttctg 552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1626
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||| |||||||||||     
T  1836 ttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatagccgttgccatacttttccag 1746  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||    |||||| |    
T  1745 tcttctgcaatgttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgtagcttctggtgaaacacagctttt 1646  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  1645 ggtgaacttgcttctgatga 1626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22706 - 22944
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||| |||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  22706 ttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 22805  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22806 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcctctggtgatcttcagct 22905  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  22906 tctgatgaacttgcttctggtggacttgattctgatgac 22944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17846 - 17636
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||  |     
T  17846 ttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttt---------caaaatagacgttgctatacttttgtag 17756  T
Q  101 tcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |  | |||||||||||   ||||||||    
T  17755 tcttctgcaatcttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgtatctcctgatgaattgaagcttctggtgattcacagcttct 17656  T
Q  201 gataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17655 gatgaacttgcttctgatga 17636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1606
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |     
T  1780 ttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcaag 1681  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaact 174  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  1680 tcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgagttgcatctcctgatgaact 1606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 513 - 472
Alignment:
Q  179 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  513 cttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 7733 - 7948
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||     
T  7733 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgtggcttcactcttccag 7832  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||| | |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  7833 tcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgatcttcagct 7932  T
Q  198 tctgataaacttgctt 213  Q
    |||||| |||||||||    
T  7933 tctgatgaacttgctt 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25746 - 25519
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||   ||||| |||||||||||     
T  25746 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatatctgttgccatacttttccag 25656  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||| | ||| || ||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    ||||||    
T  25655 tcttttgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaaactttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttc 25556  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25555 tgatgaagttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34885 - 34674
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||| ||||||| |||||||||||     
T  34885 ttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcattt---------caaaatattcgttgccatacttttccag 34795  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| |||||   |||||||    
T  34794 tcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaaactttaagttgcatctcctgaagaactgcagcttctagtgatacacagcttc 34695  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  34694 tgatgaacttgcttctgatga 34674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2720 - 2573
Alignment:
Q  73 caaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  2720 caaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaattttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaaactttaggttgcatttcctgatgaa 2621  T
Q  173 ctacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    || ||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2620 ctgcagtttctggtgatttacagcttctgatgaacttgcttctgatga 2573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 2772 - 2738
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 35  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2772 ttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 424 - 189
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgcta---tacttttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||   |    
T  424 gtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgctactttacttt---a 328  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
     ||||   |   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||  |||||||||| | |||||    
T  327 gtctttcgctctctttagacgagtttgaatccattaaacagctatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaagtacagtttctggtgatatacagct 228  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  227 tctgatagacttgcttctgataaacttgcttctgatgac 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 49362 - 49567
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||| ||    
T  49362 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaa 49461  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || ||||   ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49462 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 49561  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  49562 tctgat 49567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 32515 - 32737
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||     
T  32515 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccag 32614  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  32615 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaagttgtggtgatctttagct 32714  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  32715 tctgatgaacttacttctgatga 32737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 90136 - 89916
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |  ||| |||||     
T  90136 ttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagccgttggttcactcttccag 90037  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    ||||||  ||   ||||||||| || ||| | || | || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  90036 tcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttc 89937  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  89936 tgatgaacttgcttctgatga 89916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5028 - 4791
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||  ||| || ||     
T  5028 ttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgcttcactctttcag 4929  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    ||||||||||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4928 tcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctggtgatcttcagct 4829  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | ||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4828 tatgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 4791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 505 - 742
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  505 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactattccag 604  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||  || |||| | ||||| ||||||||  |||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  605 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctggtgatcttcagct 704  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  705 tctgat-gagatgcttctgataaacttgcttctgatgac 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18702 - 18465
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  18702 ttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccag 18603  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaa--gttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||   |||    |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18602 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcctgatgaactgcagcttctggtgatcttcagct 18503  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    | ||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18502 tatgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 18465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2811 - 2707
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  2811 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa-ccttccaaaatagtcgttgcaatacttttccag 2713  T
Q  101 tcttct 106  Q
    ||||||    
T  2712 tcttct 2707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 220
Target Start/End: Original strand, 143146 - 143340
Alignment:
Q  29 caacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa--ctttagacgagtttga 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||  |||| |||||| || |    
T  143146 caacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttt-gacgagattaa 143244  T
Q  127 atccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| || || ||| ||| ||||||| ||  |||||  || ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  143245 atccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatctcgtgatgaaatagagcttctagtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 143340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 9999 - 10219
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||| |     
T  9999 ttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctag 10098  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  10099 tcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcaacttcttgtgatctt--gct 10196  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  10197 tctgatgaacttgcttctgatga 10219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 902 - 691
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          | || ||||||||  ||||| ||||||||| |     
T  902 ttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaat---------acatttcaaaatagctgttgccatacttttctag 812  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| || |||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||  |||||||||    |||||||    
T  811 tcttctgcaatttatagacgagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttaagtttcatctcctgatgaactgcagtttctggtgaaacacagcttc 712  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  711 tgatgaacttgcttctaatga 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 25480 - 25384
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25480 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttc 25384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23551 - 23424
Alignment:
Q  93 ttttccaatcttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||       
T  23551 ttttccagtcttctgcaatcttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattca 23452  T
Q  193 cagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23451 cagcttctgatgaacttgcttttgatga 23424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 12239 - 12476
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  12239 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaattctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 12338  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||| | || |||||| ||||||||||||||  |||    ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  12339 tcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtctcctgatgaactagagcttctggtgatcctcaact 12438  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12439 tctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 12476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 60046 - 60240
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  60046 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 60145  T
Q  101 tcttctacaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| ||| | || |||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  60146 tcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtgatctt 60240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8150
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||     
T  7956 ttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttacag 8055  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    ||||||||||   || |||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  8056 tcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaactttagcttctggttatctt 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26056 - 25851
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  26056 ttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 25957  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||| | |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||| ||||||||  |||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  25956 tcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctggtgatcttcagct 25857  T
Q  198 tctgat 203  Q
    ||||||    
T  25856 tctgat 25851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44676
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatct 103  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtct 44683  T
Q  104 tctacaa 110  Q
    |||||||    
T  44682 tctacaa 44676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27510 - 27290
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||  ||| || ||     
T  27510 ttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaatcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcag 27411  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||| | || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || | ||||||||||||  |||    
T  27410 tcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcatctggtgatctt--gct 27313  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  27312 tctgatgaacttgcttctgatga 27290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21052 - 20815
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||   |||||||  ||| ||| |     
T  21052 ttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctag 20953  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||  || |||| | ||||||||||||||  |||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20952 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcaacttttggtgatcttcagct 20853  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||| ||  |  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  20852 tctaat-gagatgcttctgatgaacttgtttctgatgac 20815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 246215 - 246108
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgct 212  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  246215 ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgct 246116  T
Q  213 tctgatga 220  Q
    ||||||||    
T  246115 tctgatga 246108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6074
Alignment:
Q  30 aacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaact-ttagacgagtttgaat 128  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||   ||||||||| ||||||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  129 ccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
    |  || |||| | |||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgat 6074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 212384 - 212620
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatcc-ttccaaaatagtcgttgctatacttttcca 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||  |||||||| ||||||  ||| ||| |    
T  212384 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatagttgttgcttcactcttcta 212483  T
Q  100 atcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 196  Q
     |||||| |||   ||||||||| |||||||| |  || ||| ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| |  | |||||| |||||||  ||    
T  212484 gtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagtttagcttctgatgatctt--gc 212581  T
Q  197 ttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  212582 ttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 212620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10187 - 9983
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatc 102  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| | ||    
T  10187 gtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtc 10088  T
Q  103 ttctac-aactttagacgagtttgaatccgttaaac-agcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagctt 198  Q
    |||| | ||  ||||| ||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  10087 ttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgattttcagttt 9988  T
Q  199 ctgat 203  Q
    |||||    
T  9987 ctgat 9983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30459
Alignment:
Q  30 aacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa-ctttagacgagtttgaat 128  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||   ||||||||| ||||||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  129 ccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
    |  || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgat 30459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 9936 - 9994
Alignment:
Q  4 tacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  9936 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgcctt 9994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 87681 - 87456
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||         | || ||||||||||||||| |||||||| ||     
T  87681 ttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaatttgcatccaatg---------catttcaaaatagtcgttgccatactttttcag 87591  T
Q  101 tcttctacaactt-tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttc 199  Q
    |||||| ||| || ||| | |||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||||||  ||||| ||| |||  ||||     
T  87590 tcttctgcaatttctaggcaagttagagtccttgaaacagcttttgaaactttaagttcaatctcctgataaactacagtttctgatgaactt--gcttt 87493  T
Q  200 tgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  87492 tgatgaacttgcttatgatgaactagcttctgatgac 87456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 1690 - 1884
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |  ||| ||| |     
T  1690 ttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctag 1789  T
Q  101 tcttctac-aactttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| | ||  ||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1790 tcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36856 - 36619
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |     
T  36856 ttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctag 36757  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    || ||| |||   ||||||||| || ||| | || | |||| ||||||||||||||  |||||  || ||||||||| || ||||| ||||||||| |||    
T  36756 tcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgct 36657  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36656 tctgat-gagatgcttctaatgaacttgcttctgatgac 36619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 42149 - 42386
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |     
T  42149 ttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctag 42248  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    || ||| |||   ||||||||| || ||| | || | |||| ||||||||||||||  |||||  || ||||||||| || ||||| ||||||||| |||    
T  42249 tcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgct 42348  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||  |  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42349 tctgat-gagatgcttctaatgaacttgcttctgatgac 42386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 14678 - 14927
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  14678 ttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 14777  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||  |  | ||||||||||||||  |||    
T  14778 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatttcctaatgatttttagcttctggtgatctt--gct 14875  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||  |  || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14876 tctgat-gagatgtttctaatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatga 14927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5771 - 5536
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||  ||||||  ||| ||||||    
T  5771 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcatatcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaa 5672  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    ||||||||||   || |||||| || ||||| || |||| | ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  5671 tcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttcaggtgatctt--gct 5574  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||| |   |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5573 tct-agtgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 5536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 1720 - 1969
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||||     
T  1720 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccag 1819  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagct 197  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||  |  | ||||| ||||||||  |||    
T  1820 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatttcctaatgatttttagcttctagtgatctt--gct 1917  T
Q  198 tctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||  |  || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1918 tctgat-gagatgtttctaatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatga 1969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 17089 - 17197
Alignment:
Q  111 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaactt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || |     
T  17089 ctttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttaggttgcattttctgatgaactacaatttctggtgatatacagcttctgatgaaata 17188  T
Q  210 gcttctgat 218  Q
    |||||||||    
T  17189 gcttctgat 17197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 219
Target Start/End: Original strand, 39569 - 39676
Alignment:
Q  114 tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgc 211  Q
    |||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39569 tagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgc 39668  T
Q  212 ttctgatg 219  Q
    ||||||||    
T  39669 ttctgatg 39676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 219
Target Start/End: Original strand, 137629 - 137736
Alignment:
Q  114 tagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgc 211  Q
    |||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  137629 tagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgc 137728  T
Q  212 ttctgatg 219  Q
    ||||||||    
T  137729 ttctgatg 137736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38164 - 37937
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatc 102  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||| |   || | || ||    
T  38164 gtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcattgccaattttcttcagtc 38065  T
Q  103 -ttctacaactttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttct 200  Q
     |||     |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| ||||||  ||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||     
T  38064 tttcgctttctttagacgaatttgaatcctttaaatagctatttaaaactttaggttgcatctcctgatgaactatagtttctggtgatatacagcttcc 37965  T
Q  201 gataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
    ||| || | |||||||||  ||||||||    
T  37964 gatgaaatagcttctgatagacttgctt 37937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 13601 - 13706
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||    
T  13601 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaa 13700  T
Q  101 tcttct 106  Q
    ||||||    
T  13701 tcttct 13706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 7411 - 7469
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7411 ttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgatgaattagcatccaatgc 7469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Original strand, 7568 - 7625
Alignment:
Q  166 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaact 223  Q
    |||||||||| | |||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7568 tgatgaactaaagcttctggtgatacatagcttctgatgaacttgcttctgatgaact 7625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 103606 - 103791
Alignment:
Q  5 acacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatctt 104  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||||| |||||||  ||| ||||| ||||    
T  103606 acacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaaatagccgttgcttcactcttccagtctt 103705  T
Q  105 ctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtg 187  Q
    || |||  ||||||| |  || ||| | || |||| | ||| ||||||||||  |||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  103706 ctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtg 103791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 754 - 812
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 59  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  754 ttgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Original strand, 864 - 963
Alignment:
Q  118 cgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctga 217  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||| || || |||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  864 cgagcttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaggttgatctt-ttgatgatctgcagcttctggtgaactt--gcttatgatgaacttgcttctga 960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Original strand, 914 - 964
Alignment:
Q  186 tgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  914 tgatctgcagcttctggtgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatgac 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 250
Target Start/End: Original strand, 923 - 963
Alignment:
Q  210 gcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  923 gcttctggtgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatga 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 1876 - 1803
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaa 76  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  1876 gtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15701 - 15617
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgc 87  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||    
T  15701 gtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagccgttgc 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15504 - 15462
Alignment:
Q  194 agcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15504 agcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 15462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15533 - 15463
Alignment:
Q  180 ttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15533 ttctggtgatatacagcttctgatgaaatagcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 15463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5393 - 5211
Alignment:
Q  13 tacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa-c 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         | || ||||||||  ||||| | || |||||| |||||| ||| |    
T  5393 tacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaataggcatccaatg---------catttcaaaatagctgttgccacacatttccagtcttctgcaatc 5303  T
Q  112 tttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgat 203  Q
    ||||| |||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||  |  |||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||    
T  5302 tttaggcgagttagagtccttaaaacagcttttgaaactataagttcaatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgat 5211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9322 - 9238
Alignment:
Q  163 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| |  | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9322 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgagat-gcttctgatgaactttcttctgatgaccttgcttctgatga 9238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 15147 - 15341
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||       
T  15147 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgatgcttcactcttctgg 15246  T
Q  101 tcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatctt 192  Q
    |||||| |||   ||||||||| || ||||| || | |||| ||||||||||||||  |||||  |||| ||| ||| || ||||||||||||||    
T  15247 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgcacttcatcttctggtgatctt 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4961 - 4837
Alignment:
Q  113 ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttg 210  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  || ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||  | |    
T  4961 ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaattaaaacttttggtgatctccagcttctaataagat-g 4863  T
Q  211 cttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4862 cttttgatgaacttgcttttgatgac 4837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 640
Alignment:
Q  41 aagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctacaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacag 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||  ||| ||||| |||||| |||   ||||||||| || ||| | || |||||    
T  827 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacag 728  T
Q  140 cttttgaagctttaag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 228  Q
      ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  727 tctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgctt 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1649 - 1521
Alignment:
Q  111 ctttagacgagtttgaatccgttaaacagct-tttgaagctttaagttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaac-t 208  Q
    |||| ||||||  |||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||||  | ||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||| ||| |    
T  1649 ctttggacgaggctgaatccaataaacagctatttgaaactttaggttgcatcttctgatgaactatagcttctggtgatacacagcttctgatgaactt 1550  T
Q  209 tgcttctgatgaac-ttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1549 tgcttctgatgaactttgcttctgatgac 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 9825 - 9909
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagtcgtt 85  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgtt 9909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5880 - 5801
Alignment:
Q  140 cttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctga 217  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  5880 cttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgaacttacttctga 5801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 250
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11641
Alignment:
Q  166 tgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||||||| || |||||||||||    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  11557 tgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgaactagcttctgatga 11641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 15823 - 15902
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaac-gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaata 79  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  15823 ttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaagtcctttcaaaata 15902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 6037 - 6107
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatcctt 71  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  6037 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 6107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Original strand, 6203 - 6256
Alignment:
Q  165 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 220  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6203 ctgatgaacttcaacttctagtgatatt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 6256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3974 - 3915
Alignment:
Q  3 gtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || || ||||||||| |||||    
T  3974 gtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctctttgtaggatgagcatccaaagcctt 3915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13447 - 13377
Alignment:
Q  165 ctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttttgatgac 236  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13447 ctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacatgcttttaatgac 13377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 9986 - 10047
Alignment:
Q  1 ttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 62  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  9986 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgcctt 10047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Original strand, 74805 - 74846
Alignment:
Q  209 tgcttctgatgaacttgcttttgatgaccttgcttctgatga 250  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  74805 tgcttatgatgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatga 74846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University