View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16687_high_4 (Length: 250)

Name: NF16687_high_4
Description: NF16687
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16687_high_4
NF16687_high_4
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (1-240)||(18369300-18369538)
chr5 (1-240)||(30174620-30174859)
chr5 (1-236)||(11555509-11555742)
chr5 (1-240)||(33881281-33881519)
chr5 (1-240)||(3795693-3795932)
chr5 (1-240)||(28655397-28655636)
chr5 (1-240)||(40467321-40467559)
chr5 (2-240)||(8659240-8659477)
chr5 (1-240)||(18494536-18494773)
chr5 (1-240)||(37761137-37761376)
chr5 (1-237)||(9544478-9544715)
chr5 (1-240)||(13180561-13180794)
chr5 (1-240)||(30158189-30158427)
chr5 (1-240)||(32590044-32590281)
chr5 (1-240)||(37352412-37352650)
chr5 (1-240)||(23632124-23632364)
chr5 (1-240)||(6880459-6880697)
chr5 (1-240)||(43084413-43084651)
chr5 (29-240)||(13318596-13318806)
chr5 (1-240)||(37746090-37746334)
chr5 (1-240)||(41680859-41681098)
chr5 (1-240)||(13436442-13436685)
chr5 (1-240)||(22894571-22894808)
chr5 (21-240)||(2517238-2517459)
chr5 (29-240)||(34622701-34622912)
chr5 (1-240)||(9323633-9323869)
chr5 (1-240)||(11329792-11330032)
chr5 (1-240)||(12138332-12138568)
chr5 (1-240)||(33298688-33298930)
chr5 (21-240)||(24730143-24730363)
chr5 (1-240)||(28953548-28953786)
chr5 (21-217)||(30035599-30035795)
chr5 (1-240)||(37665254-37665492)
chr5 (1-240)||(31820178-31820414)
chr5 (21-240)||(15752626-15752840)
chr5 (27-240)||(26486566-26486778)
chr5 (1-240)||(33522537-33522776)
chr5 (1-240)||(5643955-5644191)
chr5 (29-237)||(31437646-31437847)
chr5 (1-240)||(18122184-18122422)
chr5 (1-233)||(25206433-25206670)
chr5 (1-233)||(25270589-25270826)
chr5 (29-240)||(15652528-15652737)
chr5 (29-240)||(22992892-22993095)
chr5 (1-240)||(23898029-23898261)
chr5 (29-240)||(24608428-24608634)
chr5 (1-240)||(33783642-33783875)
chr5 (29-240)||(30940819-30941023)
chr5 (29-240)||(24976031-24976236)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-240)||(27284177-27284415)
chr6 (1-240)||(27623522-27623762)
chr6 (1-240)||(13518009-13518247)
chr6 (1-240)||(27355926-27356164)
chr6 (1-240)||(16755965-16756204)
chr6 (1-240)||(4763908-4764146)
chr6 (1-240)||(34458323-34458559)
chr6 (1-240)||(8899514-8899752)
chr6 (1-240)||(27063627-27063864)
chr6 (1-240)||(27491278-27491516)
chr6 (1-240)||(33370246-33370484)
chr6 (1-240)||(28166639-28166878)
chr6 (1-240)||(16680284-16680523)
chr6 (1-240)||(22928696-22928936)
chr6 (12-240)||(4539573-4539801)
chr6 (29-240)||(29507590-29507801)
chr6 (1-240)||(26791961-26792199)
chr6 (29-240)||(26110226-26110436)
chr6 (12-240)||(28213610-28213838)
chr6 (12-240)||(29555713-29555941)
chr6 (21-240)||(26666473-26666692)
chr6 (21-240)||(26772444-26772663)
chr6 (11-240)||(27200341-27200569)
chr6 (11-240)||(27248664-27248892)
chr6 (1-240)||(4779026-4779264)
chr6 (1-240)||(30551815-30552053)
chr6 (1-240)||(13292766-13292998)
chr6 (1-240)||(29579160-29579397)
chr6 (29-237)||(14139218-14139420)
chr6 (1-240)||(16937840-16938077)
chr6 (29-237)||(27013905-27014106)
chr6 (1-240)||(4531433-4531671)
chr6 (1-240)||(26926913-26927135)
chr6 (1-240)||(27209049-27209283)
chr6 (1-240)||(27239945-27240179)
chr6 (1-240)||(27031168-27031403)
chr6 (1-240)||(24869855-24870087)
chr6 (29-240)||(27025317-27025524)
chr6 (87-240)||(24299575-24299721)
chr6 (123-240)||(15406348-15406464)
chr6 (123-240)||(15418135-15418251)
chr6 (1-228)||(20174694-20174930)
chr6 (1-228)||(22161061-22161297)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-240)||(37945723-37945962)
chr2 (1-240)||(39896215-39896452)
chr2 (1-240)||(254510-254748)
chr2 (1-240)||(12661685-12661922)
chr2 (1-240)||(37383824-37384061)
chr2 (1-240)||(27809847-27810087)
chr2 (1-240)||(3788640-3788877)
chr2 (1-240)||(22922001-22922241)
chr2 (1-240)||(27122671-27122907)
chr2 (1-240)||(12592956-12593198)
chr2 (1-240)||(13930402-13930642)
chr2 (1-240)||(16167624-16167862)
chr2 (1-240)||(19410342-19410582)
chr2 (1-240)||(34867829-34868066)
chr2 (1-240)||(9343845-9344083)
chr2 (1-240)||(31868644-31868881)
chr2 (1-240)||(39045680-39045918)
chr2 (1-240)||(21671028-21671268)
chr2 (1-240)||(37931518-37931763)
chr2 (1-240)||(37679749-37679988)
chr2 (1-240)||(37695014-37695253)
chr2 (1-240)||(27782378-27782616)
chr2 (29-240)||(34161017-34161230)
chr2 (21-240)||(31882451-31882670)
chr2 (21-240)||(32055966-32056185)
chr2 (1-240)||(40239655-40239892)
chr2 (21-240)||(12710459-12710679)
chr2 (1-240)||(16823195-16823433)
chr2 (1-240)||(16898047-16898285)
chr2 (28-240)||(21697031-21697246)
chr2 (1-240)||(11629043-11629280)
chr2 (29-240)||(34297329-34297533)
chr2 (1-240)||(27396469-27396717)
chr2 (103-240)||(23117044-23117180)
chr2 (1-240)||(19450276-19450523)
chr2 (1-240)||(34268784-34269017)
chr2 (1-240)||(23122436-23122668)
chr2 (29-240)||(28888452-28888658)
chr2 (48-240)||(20844108-20844296)
chr2 (1-236)||(27428315-27428542)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-240)||(40099504-40099743)
chr4 (1-240)||(20332290-20332529)
chr4 (1-240)||(39856796-39857032)
chr4 (1-240)||(24586229-24586467)
chr4 (1-240)||(27157180-27157420)
chr4 (1-240)||(14104702-14104939)
chr4 (1-240)||(18794485-18794723)
chr4 (1-240)||(30759923-30760159)
chr4 (1-240)||(33667671-33667907)
chr4 (12-240)||(54839560-54839787)
chr4 (21-240)||(5700718-5700937)
chr4 (1-240)||(34182832-34183068)
chr4 (11-240)||(14753362-14753590)
chr4 (1-240)||(5012037-5012275)
chr4 (1-237)||(21975863-21976098)
chr4 (1-240)||(1906411-1906654)
chr4 (1-240)||(31120378-31120617)
chr4 (1-240)||(36324185-36324415)
chr4 (1-240)||(36338394-36338624)
chr4 (1-240)||(15233975-15234217)
chr4 (12-236)||(24118832-24119055)
chr4 (1-240)||(15380106-15380344)
chr4 (29-240)||(6576048-6576251)
chr4 (1-240)||(1674019-1674258)
chr4 (1-240)||(15276497-15276738)
chr4 (29-240)||(14671203-14671410)
chr4 (36-240)||(17019247-17019445)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (1-240)||(5717179-5717418)
chr3 (1-240)||(5728089-5728328)
chr3 (1-240)||(5764040-5764279)
chr3 (1-240)||(47029564-47029803)
chr3 (1-240)||(4790544-4790782)
chr3 (1-240)||(32296740-32296979)
chr3 (1-240)||(31958366-31958606)
chr3 (1-240)||(10649182-10649420)
chr3 (1-240)||(29658879-29659117)
chr3 (1-240)||(5603224-5603464)
chr3 (1-240)||(24334284-24334524)
chr3 (1-240)||(5473099-5473336)
chr3 (1-240)||(28109862-28110104)
chr3 (1-240)||(4340587-4340825)
chr3 (1-240)||(4423029-4423267)
chr3 (13-240)||(18248860-18249087)
chr3 (1-240)||(48472038-48472280)
chr3 (1-240)||(51788133-51788371)
chr3 (11-240)||(10402269-10402497)
chr3 (1-240)||(20072144-20072384)
chr3 (1-240)||(8217743-8217983)
chr3 (1-240)||(17970777-17971013)
chr3 (1-240)||(16422293-16422532)
chr3 (22-240)||(22864759-22864976)
chr3 (22-240)||(22879818-22880035)
chr3 (1-237)||(5590275-5590510)
chr3 (1-240)||(22381492-22381729)
chr3 (21-240)||(28027420-28027638)
chr3 (1-240)||(4629896-4630133)
chr3 (1-240)||(5019824-5020061)
chr3 (11-240)||(18286266-18286494)
chr3 (11-240)||(18301567-18301795)
chr3 (1-240)||(20570757-20570995)
chr3 (1-240)||(29142665-29142906)
chr3 (1-240)||(11104272-11104511)
chr3 (41-240)||(7079376-7079576)
chr3 (1-240)||(21680812-21681049)
chr3 (1-240)||(28345282-28345519)
chr3 (29-240)||(18057399-18057612)
chr3 (29-240)||(6536654-6536865)
chr3 (1-240)||(18231304-18231542)
chr3 (1-240)||(17978861-17979100)
chr3 (1-240)||(31030156-31030387)
chr3 (1-240)||(16618400-16618642)
chr3 (1-237)||(18336740-18336968)
chr3 (1-240)||(6208012-6208245)
chr3 (48-240)||(19700654-19700847)
chr3 (29-240)||(4727771-4727976)
chr3 (29-240)||(32445292-32445494)
chr3 (22-240)||(15735011-15735225)
chr3 (29-240)||(8283369-8283591)
chr3 (22-240)||(4689782-4689994)
chr3 (1-240)||(5658247-5658480)
chr3 (29-240)||(35886903-35887109)
chr3 (123-240)||(15886652-15886768)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-240)||(9360770-9361007)
chr8 (1-240)||(18796855-18797093)
chr8 (1-240)||(28355780-28356020)
chr8 (1-240)||(31360676-31360914)
chr8 (1-240)||(33248514-33248751)
chr8 (1-240)||(31483700-31483940)
chr8 (1-240)||(19680597-19680833)
chr8 (1-240)||(29835471-29835708)
chr8 (29-240)||(15773749-15773960)
chr8 (29-240)||(21342000-21342211)
chr8 (1-240)||(18715628-18715868)
chr8 (1-240)||(44567129-44567369)
chr8 (12-240)||(12086553-12086781)
chr8 (1-240)||(19910992-19911232)
chr8 (27-240)||(19202205-19202417)
chr8 (21-203)||(33264897-33265079)
chr8 (1-240)||(22074759-22074998)
chr8 (1-237)||(19655180-19655410)
chr8 (1-111)||(16260371-16260480)
chr8 (1-240)||(22139055-22139286)
chr8 (29-240)||(27602744-27602948)
chr8 (1-240)||(2131098-2131330)
chr8 (29-240)||(19694271-19694477)
chr8 (123-240)||(14569424-14569540)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-240)||(3647296-3647534)
chr1 (1-240)||(10968815-10969054)
chr1 (1-218)||(51644370-51644588)
chr1 (1-240)||(41787177-41787416)
chr1 (1-240)||(28155876-28156116)
chr1 (1-240)||(10951241-10951480)
chr1 (1-240)||(20334283-20334523)
chr1 (29-240)||(28591260-28591470)
chr1 (1-240)||(16201895-16202141)
chr1 (1-240)||(20466927-20467173)
chr1 (48-240)||(21891630-21891818)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-240)||(9510-9747)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-240)||(12184-12421)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (1-240)||(4471-4710)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (14-240)||(24586289-24586514)
chr7 (1-240)||(26595813-26596053)
chr7 (1-240)||(5164529-5164767)
chr7 (1-240)||(26678858-26679097)
chr7 (1-240)||(4138999-4139239)
chr7 (1-218)||(26509471-26509688)
chr7 (1-240)||(26441398-26441637)
chr7 (1-240)||(26663666-26663905)
chr7 (1-240)||(31558148-31558386)
chr7 (1-240)||(39206893-39207131)
chr7 (29-240)||(5154256-5154466)
chr7 (1-240)||(5141088-5141327)
chr7 (1-240)||(26518938-26519174)
chr7 (1-240)||(16745274-16745513)
chr7 (1-240)||(45737446-45737686)
chr7 (1-240)||(2160715-2160955)
chr7 (1-240)||(16443757-16443996)
chr7 (1-240)||(4205535-4205772)
chr7 (1-240)||(11418533-11418771)
chr7 (1-240)||(31084376-31084614)
chr7 (1-240)||(26268839-26269081)
chr7 (1-240)||(45393364-45393602)
chr7 (1-240)||(26313603-26313839)
chr7 (21-240)||(3451481-3451702)
chr7 (21-240)||(11447051-11447271)
chr7 (29-237)||(2779424-2779626)
chr7 (29-240)||(31130077-31130282)
chr7 (1-240)||(16047460-16047695)
chr7 (12-240)||(10847738-10847968)
chr7 (1-240)||(10910680-10910912)
chr7 (123-240)||(16512194-16512311)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-240)||(3047-3287)
scaffold0159 (1-240)||(17954-18194)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-240)||(18734-18973)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (21-240)||(8797-9016)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-240)||(10062-10299)
scaffold0143 (1-240)||(33446-33680)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (12-240)||(14108-14336)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-240)||(1806-2043)
scaffold0322 (48-240)||(12252-12443)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-240)||(15717-15962)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-240)||(25263-25509)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (67-240)||(1-173)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-240)||(6215-6449)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (29-240)||(24774-24980)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (133-240)||(40497-40606)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18369538 - 18369300
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18369538 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttga 18369439  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18369438 aaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 18369340  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18369339 atatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18369300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 30174620 - 30174859
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30174620 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 30174719  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  30174720 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 30174818  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30174819 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30174859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 11555509 - 11555742
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11555509 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 11555607  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11555608 aaattgaaaacttctt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 11555706  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 236  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  11555707 atatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 11555742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 33881281 - 33881519
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33881281 cttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 33881380  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33881381 aaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 33881479  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  33881480 atatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 33881519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 3795693 - 3795932
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3795693 cttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 3795792  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3795793 aaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 3795891  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3795892 aatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3795932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 28655397 - 28655636
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  28655397 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacatttttt 28655494  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28655495 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 28655594  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28655595 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28655636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40467559 - 40467321
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40467559 cttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 40467461  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40467460 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 40467362  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  40467361 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 40467321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8659477 - 8659240
Alignment:
Q  2 ttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-ga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8659477 ttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttga 8659379  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  8659378 aaattgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttca 8659280  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8659279 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8659240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18494773 - 18494536
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18494773 cttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 18494675  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18494674 aaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 18494576  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  18494575 atatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 18494536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 37761137 - 37761376
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  37761137 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttg 37761235  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37761236 aaaattgaaaacttttt-gtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 37761334  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  37761335 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagactgtg 37761376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9544715 - 9544478
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  9544715 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 9544618  T
Q  99 --gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9544617 ttgaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 9544519  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 237  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  9544518 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 9544478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13180794 - 13180561
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  13180794 cttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttga 13180695  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||  |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13180694 aaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 13180601  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  13180600 atatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtg 13180561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 30158189 - 30158427
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30158189 cttttgttt-aaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 30158287  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  30158288 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttc 30158386  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30158387 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30158427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32590281 - 32590044
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |    
T  32590281 cttttgttt-aaaactctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttg 32590184  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32590183 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 32590085  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  32590084 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 32590044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37352650 - 37352412
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37352650 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 37352552  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  37352551 aaaattgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttc 37352453  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  37352452 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtg 37352412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 23632124 - 23632364
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  23632124 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttga 23632222  T
Q  101 aaattg-aaaacttttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  23632223 aaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctattt 23632322  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||    
T  23632323 caatatgtgttataagccggttctcctccaggatagtctgtg 23632364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 6880459 - 6880697
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6880459 cttttgttt-aagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 6880557  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  6880558 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttc 6880656  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  6880657 aatgtgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 6880697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 43084413 - 43084651
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43084413 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 43084511  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  43084512 aaagttgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttc 43084610  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||| | || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  43084611 aatgtatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 43084651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13318806 - 13318596
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13318806 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt-gtctgttttga 13318708  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  13318707 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 13318608  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
     |||| ||||||    
T  13318607 agataatctgtg 13318596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37746334 - 37746090
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37746334 cttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttga 37746235  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagt------acgttgatgtct 194  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      | ||| ||||||    
T  37746234 aaattgaaaact-ttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtct 37746136  T
Q  195 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37746135 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37746090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 41680859 - 41681098
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41680859 cttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 41680958  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||    
T  41680959 aaaattgaaaac-tttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 41681056  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41681057 caatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 41681098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13436685 - 13436442
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  13436685 cttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacatttt 13436587  T
Q  99 ----gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtct 194  Q
        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13436586 ttttgaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 13436488  T
Q  195 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  13436487 atttcaatatatattacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 13436442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 22894571 - 22894808
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  22894571 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttga 22894669  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||     
T  22894670 aaattgaaaaggtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcg 22894768  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22894769 atatgtgttacaagcagactcttccccaggatagtctgtg 22894808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 2517238 - 2517459
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |    
T  2517238 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttt-t 2517336  T
Q  118 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2517337 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttacaagcag 2517436  T
Q  218 gctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    | ||| | |||||||||||||||    
T  2517437 gttctcctccaggatagtctgtg 2517459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 34622701 - 34622912
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  34622701 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaac-tttttgtctgttttg 34622799  T
Q  128 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |     
T  34622800 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctca 34622899  T
Q  228 aggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||    
T  34622900 aggatagtctgtg 34622912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 9323633 - 9323869
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9323633 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 9323730  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||    
T  9323731 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttca 9323829  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  9323830 atatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 9323869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 11329792 - 11330032
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttt 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  11329792 cttttgttttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttt 11329890  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11329891 taaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 11329989  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11329990 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 11330032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12138332 - 12138568
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12138332 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 12138429  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||    
T  12138430 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttca 12138528  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  12138529 atatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 12138568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 33298688 - 33298930
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttctt-ctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33298688 cttttgtttgaaaactccatttttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 33298787  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttg--aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||    
T  33298788 gaaaattgaaaacttttt-gtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 33298886  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33298887 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33298930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 24730143 - 24730363
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaacttttttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  24730143 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttt-tg 24730241  T
Q  119 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24730242 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 24730341  T
Q  219 ctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
     ||| |  ||||||||||||||    
T  24730342 ttctccttcaggatagtctgtg 24730363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28953786 - 28953548
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28953786 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 28953688  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
      |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||    
T  28953687 ggaattgaaaac-tttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 28953590  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28953589 caatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28953548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 30035599 - 30035795
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttttttgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  30035599 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaacttttt-gt 30035697  T
Q  120 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30035698 ttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcag 30035795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37665492 - 37665254
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttg 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37665492 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 37665394  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||    
T  37665393 aaaattgaaaac-cttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 37665296  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  37665295 caatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtg 37665254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31820414 - 31820178
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31820414 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 31820317  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||    
T  31820316 aaattgaaaac-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttca 31820218  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  31820217 atatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 31820178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15752840 - 15752626
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15752840 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt-gtc 15752746  T
Q  121 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  15752745 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggtt 15752646  T
Q  221 cttccccaggatagtctgtg 240  Q
    || | ||| |||| ||||||    
T  15752645 ctcctccaagataatctgtg 15752626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 26486566 - 26486778
Alignment:
Q  27 tctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctatttt 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26486566 tctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt-gtctatttt 26486664  T
Q  127 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |    
T  26486665 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 26486764  T
Q  227 caggatagtctgtg 240  Q
    || |||| ||||||    
T  26486765 caagataatctgtg 26486778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 33522537 - 33522776
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33522537 cttttgtttgaaa-ctctgttttcttttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 33522635  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||    
T  33522636 gaaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattt 33522734  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33522735 caatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33522776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5643955 - 5644191
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttg 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5643955 cttttgtttgaaa-ctctatttt-cttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttg 5644052  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  5644053 aaaatcgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttc 5644150  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  5644151 aatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtg 5644191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 31437646 - 31437847
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||       ||||    
T  31437646 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt-------ttga 31437738  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  31437739 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 31437838  T
Q  229 ggatagtct 237  Q
    |||||||||    
T  31437839 ggatagtct 31437847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18122422 - 18122184
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttctt-ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-tttt 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18122422 cttttgttt-aaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttt 18122324  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||    
T  18122323 gaaaattgagaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 18122226  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  18122225 caatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtg 18122184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 25206433 - 25206670
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgac-agtgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  25206433 cttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatct 25206531  T
Q  98 tgaaaattgaaaa----cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtc 193  Q
    |||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  25206532 tgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtc 25206630  T
Q  194 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 233  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  25206631 tatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccctaggata 25206670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 25270589 - 25270826
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgac-agtgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  25270589 cttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatct 25270687  T
Q  98 tgaaaattgaaaa----cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtc 193  Q
    |||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  25270688 tgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtc 25270786  T
Q  194 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 233  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  25270787 tatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccctaggata 25270826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15652737 - 15652528
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |    |    
T  15652737 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt-tttttaaaaa 15652639  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  15652638 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 15652540  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||    
T  15652539 ggatagtctgtg 15652528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22993095 - 22992892
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||       ||||    
T  22993095 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttttt-------ttga 22993003  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  22993002 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 22992904  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||    
T  22992903 ggatagtctgtg 22992892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 23898029 - 23898261
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacag-tgcttgaaacaaacat 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  23898029 cttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacat 23898127  T
Q  96 tttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtcta 195  Q
     ||||||||||||||  ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  23898128 cttgaaaattgaaaaagttttg-----------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtcta 23898216  T
Q  196 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  23898217 tttcaatatatgttgcaagcagattcttctccaggatagtctgtg 23898261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 24608428 - 24608634
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||            
T  24608428 tactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-------- 24608519  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |     
T  24608520 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcct 24608619  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  24608620 ccaggatagtctgtg 24608634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 33783642 - 33783875
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttg--ataatgacag-tgcttgaaacaaacatt 96  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||     
T  33783642 cttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatc 33783740  T
Q  97 ttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
    ||||||||||||||  |||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  |||| |||||||    
T  33783741 ttgaaaattgaaaaagttttt--------tgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 33783831  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33783832 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33783875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 30940819 - 30941023
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||           
T  30940819 tactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttg------- 30940911  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |     
T  30940912 --aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaagaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 30941008  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  30941009 ccaggatagtctgtg 30941023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 24976031 - 24976236
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||  |||||            
T  24976031 tactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagttttt-------- 24976122  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |     
T  24976123 -gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcct 24976221  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||| ||||    
T  24976222 ccaggatagtatgtg 24976236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27284415 - 27284177
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27284415 cttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 27284317  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27284316 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 27284218  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27284217 aatatgtgttacaaacaggctcttccccaggatagtctgtg 27284177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27623762 - 27623522
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27623762 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 27623663  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  27623662 aaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctattt 27623564  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623563 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27623522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13518247 - 13518009
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13518247 cttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 13518148  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13518147 aaattgaaaact-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 13518049  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  13518048 atatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 13518009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27356164 - 27355926
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27356164 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 27356066  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27356065 aaaattgaaaacctttg-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 27355967  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27355966 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27355926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16755965 - 16756204
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacat--ttt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  16755965 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatatttt 16756063  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16756064 gacaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 16756162  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16756163 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16756204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 4763908 - 4764146
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4763908 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 4764006  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4764007 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 4764105  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  4764106 aatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 4764146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34458559 - 34458323
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34458559 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttga 34458461  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  34458460 aaattgaaaactttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttca 34458363  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  34458362 atatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 34458323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8899752 - 8899514
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8899752 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 8899654  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  8899653 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttc 8899555  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  8899554 aatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtg 8899514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27063627 - 27063864
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27063627 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 27063724  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27063725 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 27063823  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27063824 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27063864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27491278 - 27491516
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27491278 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 27491376  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27491377 aaaattgaaaacctttg-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 27491475  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  27491476 aatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtg 27491516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33370484 - 33370246
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  33370484 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 33370386  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  33370385 aaaattgaaat-ttttttgtctattttgaaaagcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 33370287  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33370286 aatatatgttacaagcaggctctcctccaggatagtctgtg 33370246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 28166639 - 28166878
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  28166639 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 28166737  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28166738 gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 28166836  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28166837 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28166878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16680284 - 16680523
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16680284 cttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 16680382  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16680383 gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 16680481  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  16680482 caatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 16680523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22928936 - 22928696
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22928936 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt 22928838  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  22928837 gaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctattt 22928738  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928737 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 22928696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4539801 - 4539573
Alignment:
Q  12 aaactctatttttcttct-actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 110  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539801 aaactctatttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 4539702  T
Q  111 cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgtta 210  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  4539701 cttttt-gtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgtta 4539603  T
Q  211 caagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  4539602 caagcaggttctcctccaagataatctgtg 4539573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 29507590 - 29507801
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttttttgtctattttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29507590 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttt-tgtctattttg 29507688  T
Q  128 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  29507689 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 29507788  T
Q  228 aggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||    
T  29507789 aggatagtctgtg 29507801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 26791961 - 26792199
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26791961 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 26792059  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||    
T  26792060 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttc 26792158  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  26792159 aatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 26792199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26110436 - 26110226
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26110436 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt-gtctgttttga 26110338  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  26110337 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaagcaggttctcctcca 26110238  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
     |||| ||||||    
T  26110237 agataatctgtg 26110226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 28213610 - 28213838
Alignment:
Q  12 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28213610 aaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa 28213709  T
Q  111 cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgtta 210  Q
    | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  28213710 c-tttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgtta 28213808  T
Q  211 caagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  28213809 caagcaggttctcctccaagataatctgtg 28213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 29555713 - 29555941
Alignment:
Q  12 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaa 110  Q
    ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29555713 aaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaatt-aaaa 29555811  T
Q  111 cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgtta 210  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29555812 gctttttgtctattttgaaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtta 29555911  T
Q  211 caagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  29555912 caagcaggttcccctccaggatagtctgtg 29555941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26666692 - 26666473
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttttttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  26666692 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaacttttt-gt 26666594  T
Q  120 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||||     
T  26666593 ctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggt 26666494  T
Q  220 tcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  26666493 tctcctccaggatagtctgtg 26666473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26772663 - 26772444
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttttttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  26772663 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaacttttt-gt 26772565  T
Q  120 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||||     
T  26772564 ctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggt 26772465  T
Q  220 tcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  26772464 tctcctccaggatagtctgtg 26772444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 27200341 - 27200569
Alignment:
Q  11 aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27200341 aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaa 27200439  T
Q  109 aacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgt 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| | |||    
T  27200440 aactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgt 27200538  T
Q  209 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  27200539 tacaagcaggttctcctccagg-tagtctgtg 27200569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27248892 - 27248664
Alignment:
Q  11 aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27248892 aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaa 27248794  T
Q  109 aacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgt 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| | |||    
T  27248793 aacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgt 27248695  T
Q  209 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  27248694 tacaagcaggttctcctccagg-tagtctgtg 27248664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 4779026 - 4779264
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaa-gctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  4779026 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttt 4779124  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||    
T  4779125 gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 4779222  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  4779223 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4779264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30552053 - 30551815
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30552053 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 30551955  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||    
T  30551954 aaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttc 30551856  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30551855 aatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30551815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13292998 - 13292766
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  13292998 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttga 13292900  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  |||| |||||||||||    
T  13292899 aaattgaaaaagtttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctatttca 13292806  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  13292805 atatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 13292766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 29579160 - 29579397
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg- 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29579160 cttttgtttgaaa-ctctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 29579257  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||    
T  29579258 aaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttc 29579356  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  29579357 aatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 29579397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14139420 - 14139218
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||      |||||    
T  14139420 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt------tttga 14139327  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  14139326 aaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 14139227  T
Q  229 ggatagtct 237  Q
    |||||||||    
T  14139226 ggatagtct 14139218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16938077 - 16937840
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  16938077 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttg 16937980  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  16937979 aaaactgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttc 16937881  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  16937880 aatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtg 16937840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 27013905 - 27014106
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||       ||||    
T  27013905 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt-------ttga 27013997  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  27013998 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 27014097  T
Q  229 ggatagtct 237  Q
    |||||||||    
T  27014098 ggatagtct 27014106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 4531433 - 4531671
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttg 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4531433 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 4531531  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat-tt 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  || | ||||||| ||    
T  4531532 aaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatctt 4531629  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  4531630 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4531671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 26926913 - 26927135
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttg 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26926913 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 26927010  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||| |||||||||||||||    
T  26927011 aaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg---------------agagtatgttgatgtctatttc 26927094  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  26927095 aatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtg 26927135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27209049 - 27209283
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttg---ataatgacag-tgcttgaaacaaacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||  |||| |||||||||||    
T  27209049 cttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacat 27209147  T
Q  96 tttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtcta 195  Q
     ||||||||||||||  |||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27209148 cttgaaaattgaaaaagttttt--------tgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaa-cgtgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 27209238  T
Q  196 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209239 tttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27209283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27240179 - 27239945
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttg---ataatgacag-tgcttgaaacaaacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||  |||| |||||||||||    
T  27240179 cttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacat 27240081  T
Q  96 tttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtcta 195  Q
     ||||||||||||||  |||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27240080 cttgaaaattgaaaaagttttt--------tgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaa-cgtgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 27239990  T
Q  196 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27239989 tttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27239945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27031168 - 27031403
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  27031168 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatct 27031266  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    |||||||||||||  |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||    
T  27031267 tgaaaattgaaaaagttttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 27031360  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27031361 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27031403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 24869855 - 24870087
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  24869855 cttttgtttgaaa-ctctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatct 24869953  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    |||||||||||||  |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||    
T  24869954 tgaaaattgaaaaagttttt--------tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 24870044  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  24870045 tcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtg 24870087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 27025317 - 27025524
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctatt 124  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||           
T  27025317 tactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttt------- 27025409  T
Q  125 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  27025410 -tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcc 27025508  T
Q  225 cccaggatagtctgtg 240  Q
     |||||||||||||||    
T  27025509 tccaggatagtctgtg 27025524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24299721 - 24299575
Alignment:
Q  87 aacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgt 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||  ||    
T  24299721 aacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagtaacagggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgt 24299629  T
Q  187 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24299628 tggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24299575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15406464 - 15406348
Alignment:
Q  123 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  15406464 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttct 15406366  T
Q  223 tccccaggatagtctgtg 240  Q
     | |||||||||||||||    
T  15406365 cctccaggatagtctgtg 15406348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15418251 - 15418135
Alignment:
Q  123 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  15418251 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttct 15418153  T
Q  223 tccccaggatagtctgtg 240  Q
     | |||||||||||||||    
T  15418152 cctccaggatagtctgtg 15418135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20174694 - 20174930
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttct--actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaa-caaacatt 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  20174694 cttttgtttgaaa-ctctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaacatt 20174792  T
Q  97 ttgaaaa------ttgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgat 190  Q
     | ||||      |  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || |  | |  ||    
T  20174793 ctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaat 20174892  T
Q  191 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20174893 gtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 20174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22161297 - 22161061
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttct--actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaa-caaacatt 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  22161297 cttttgtttgaaa-ctctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaacatt 22161199  T
Q  97 ttgaaaa------ttgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgat 190  Q
     | ||||      |  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || |  | |  ||    
T  22161198 ctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaat 22161099  T
Q  191 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22161098 gtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 22161061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37945962 - 37945723
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37945962 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 37945863  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37945862 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttc 37945764  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37945763 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37945723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 39896215 - 39896452
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39896215 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 39896313  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39896314 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 39896412  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39896413 atatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 254748 - 254510
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  254748 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 254649  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  254648 aaaattgaaaactttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 254551  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  254550 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 254510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12661685 - 12661922
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12661685 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttga 12661783  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12661784 aaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 12661882  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  12661883 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12661922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 37383824 - 37384061
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37383824 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 37383922  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37383923 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 37384021  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37384022 atatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37384061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27809847 - 27810087
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt--cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27809847 cttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 27809946  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  27809947 gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctattt 27810045  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27810046 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27810087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 3788640 - 3788877
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3788640 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttga 3788738  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  3788739 aaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttca 3788837  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    || | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3788838 atgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3788877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22922241 - 22922001
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22922241 cttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 22922142  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22922141 gaaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 22922043  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22922042 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22922001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27122671 - 27122907
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27122671 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 27122768  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27122769 aaattgaaaactttt-tgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 27122867  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27122868 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27122907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12592956 - 12593198
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  12592956 cttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 12593055  T
Q  99 --gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  12593056 ttgaaaattgaaaactttt-tgtctattttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 12593154  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  12593155 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12593198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13930642 - 13930402
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13930642 cttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttt 13930543  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  13930542 gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctattt 13930444  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  13930443 caatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtg 13930402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16167624 - 16167862
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16167624 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 16167722  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16167723 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttc 16167821  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16167822 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16167862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19410582 - 19410342
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19410582 cttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 19410483  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19410482 gaaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 19410384  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  19410383 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 19410342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 34867829 - 34868066
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34867829 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 34867926  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34867927 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 34868025  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  34868026 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 34868066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9344083 - 9343845
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9344083 cttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 9343985  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9343984 aaaattgaaaacttttt-gtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 9343886  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9343885 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9343845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31868881 - 31868644
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31868881 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 31868784  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  31868783 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttc 31868685  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31868684 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31868644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39045918 - 39045680
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  39045918 cttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttg 39045820  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39045819 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 39045721  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39045720 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39045680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21671268 - 21671028
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  21671268 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttt 21671171  T
Q  99 -gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21671170 tgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 21671071  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21671070 tcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 21671028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 37931518 - 37931763
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt------cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37931518 cttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 37931617  T
Q  95 tttt-gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtc 193  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  37931618 tttttgaaaattgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 37931716  T
Q  194 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  37931717 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 37931763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37679988 - 37679749
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  37679988 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttt 37679891  T
Q  99 -gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37679890 tgaaaattgaaat-ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 37679792  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37679791 tcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37679749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37695253 - 37695014
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  37695253 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttt 37695156  T
Q  99 -gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37695155 tgaaaattgaaat-ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 37695057  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37695056 tcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37695014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27782378 - 27782616
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27782378 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 27782476  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  27782477 aaaattgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttc 27782575  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  27782576 aatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtg 27782616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 34161017 - 34161230
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34161017 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttt-tgtctattt 34161115  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  34161116 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcacaagcaggttctcct 34161215  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  34161216 ccaggatagtctgtg 34161230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 31882451 - 31882670
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttttgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  31882451 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttt-t 31882549  T
Q  120 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  31882550 ctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggt 31882649  T
Q  220 tcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  31882650 tctcctccaggatagtctgtg 31882670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 32055966 - 32056185
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttttttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  32055966 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaacttttt-gt 32056064  T
Q  120 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  32056065 ttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggt 32056164  T
Q  220 tcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||| | ||| |||| ||||||    
T  32056165 tctcctccaagataatctgtg 32056185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 40239655 - 40239892
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40239655 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 40239753  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  40239754 aaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttc 40239851  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    || || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  40239852 aacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 40239892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12710679 - 12710459
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaacttttttg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  12710679 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttt-g 12710581  T
Q  119 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12710580 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 12710481  T
Q  219 ctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
     ||| |  ||||||||||||||    
T  12710480 ttctccttcaggatagtctgtg 12710459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16823433 - 16823195
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16823433 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 16823335  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||    
T  16823334 aaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttc 16823236  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16823235 aatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16823195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16898047 - 16898285
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16898047 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 16898145  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||    
T  16898146 aaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttc 16898244  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16898245 aatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16898285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21697246 - 21697031
Alignment:
Q  28 ctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttttgtctat 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21697246 ctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctat 21697147  T
Q  124 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctctt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697146 tttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctt 21697048  T
Q  224 ccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  21697047 ccccaggatagtctgtg 21697031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11629280 - 11629043
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  11629280 cttttgttt-aaaactctatttt-cttttattttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacattttt 11629183  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||    
T  11629182 gaaaattgaaaactcttt-gtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 11629085  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11629084 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 11629043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 34297329 - 34297533
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||       ||||    
T  34297329 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttttt-------ttga 34297421  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||    
T  34297422 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctcca 34297521  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||    
T  34297522 ggatagtctgtg 34297533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27396469 - 27396717
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27396469 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatctt 27396567  T
Q  99 gaaaattgaaaac---------ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttga 189  Q
    ||||||||||||          |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||    
T  27396568 gaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtcctttttgaaa-gcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcga 27396666  T
Q  190 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396667 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27396717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 240
Target Start/End: Original strand, 23117044 - 23117180
Alignment:
Q  103 attgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23117044 attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaat 23117142  T
Q  203 atgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  23117143 atgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 23117180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19450523 - 19450276
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-----cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19450523 cttttgtttgaaa-ctctattttctctctactttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 19450425  T
Q  96 tttgaaaattgaaaact-----tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgat 190  Q
     ||||||||||||||       ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||  || ||| || |||    
T  19450424 cttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgttttgaaa-gtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgat 19450326  T
Q  191 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19450325 gtctatttcaatatgtgttataagcaggctcttccccaggatagtctgtg 19450276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34269017 - 34268784
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  34269017 cttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatct 34268919  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    | |||||||||||  |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  34268918 taaaaattgaaaaagttttt--------tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatt 34268827  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  34268826 tcaatatatgttacaagcagattcttctctaggatagtctgtg 34268784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23122668 - 23122436
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacag-tgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||    
T  23122668 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctt 23122570  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||  |||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||    
T  23122569 gaaaattgaaaaagttttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 23122478  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  23122477 caatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 23122436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 28888452 - 28888658
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||       |    
T  28888452 tactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-------t 28888544  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |     
T  28888545 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 28888643  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  28888644 ccaggatagtctgtg 28888658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 240
Target Start/End: Original strand, 20844108 - 20844296
Alignment:
Q  48 aaaacattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||      ||||||||||||||||||||||    
T  20844108 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagcaa 20844201  T
Q  146 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20844202 cagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20844296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27428542 - 27428315
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  || | ||||||||||| |    
T  27428542 cttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatct 27428444  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    ||||||||| |||  ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  27428443 tgaaaattgcaaaagtttttg---------aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-cgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatt 27428354  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 236  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27428353 tcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtc 27428315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40099743 - 40099504
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40099743 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 40099644  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  40099643 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 40099545  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  40099544 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 40099504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20332529 - 20332290
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20332529 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 20332430  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20332429 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 20332331  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20332330 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20332290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 39856796 - 39857032
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39856796 cttttgttt-aaaactct-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 39856893  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39856894 aaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 39856992  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39856993 atatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39857032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24586467 - 24586229
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  24586467 cttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttga 24586368  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24586367 aaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 24586269  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24586268 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24586229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27157420 - 27157180
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27157420 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 27157321  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  27157320 gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctattt 27157222  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27157221 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27157180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 14104702 - 14104939
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14104702 cttttgttt-aaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttga 14104800  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  14104801 aaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttca 14104899  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14104900 atatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 14104939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18794723 - 18794485
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatt-ttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18794723 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttg 18794625  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  18794624 aaaattgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttc 18794526  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18794525 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18794485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 30759923 - 30760159
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30759923 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 30760020  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30760021 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 30760119  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30760120 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30760159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33667907 - 33667671
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33667907 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 33667810  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33667809 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 33667711  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33667710 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33667671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 54839560 - 54839787
Alignment:
Q  12 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54839560 aaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa 54839658  T
Q  111 cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgtta 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  54839659 ctttt-tgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtta 54839757  T
Q  211 caagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  54839758 caagcaggttctcctccaggatagtctgtg 54839787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 5700718 - 5700937
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  5700718 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaac-tttttgt 5700816  T
Q  120 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5700817 ctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggt 5700916  T
Q  220 tcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  5700917 tctcctccaggatagtctgtg 5700937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34183068 - 34182832
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34183068 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 34182970  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  34182969 aaaattgaaaac--ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttc 34182873  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  34182872 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtg 34182832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14753590 - 14753362
Alignment:
Q  11 aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14753590 aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaa 14753492  T
Q  109 aacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgt 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  14753491 aac-tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgt 14753394  T
Q  209 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14753393 tacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 14753362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5012037 - 5012275
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttg 99  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  5012037 cttttgttt-aaaactctacttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttg 5012135  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  5012136 aaaattaaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttc 5012234  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5012235 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5012275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21975863 - 21976098
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21975863 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 21975961  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||    
T  21975962 aaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttc 21976060  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 237  Q
    ||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21976061 aatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 21976098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 1906411 - 1906654
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacag-tgcttgaaacaaacat 95  Q
    ||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1906411 cttttgtttgaaa-ctctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacat 1906509  T
Q  96 tttgaaaattgaaaac-ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtct 194  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  1906510 cttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 1906608  T
Q  195 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1906609 atttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtg 1906654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31120617 - 31120378
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31120617 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 31120519  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||    
T  31120518 aaaattgaaaacctttt-gtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattt 31120420  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31120419 caatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31120378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36324415 - 36324185
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  36324415 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttga 36324317  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||  |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  36324316 aaattgaaaaagttt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttca 36324225  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  36324224 atatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 36324185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36338624 - 36338394
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  36338624 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttga 36338526  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||  |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  36338525 aaattgaaaaagttt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttca 36338434  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  36338433 atatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 36338394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 15233975 - 15234217
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  15233975 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttga 15234073  T
Q  101 aaattgaaaac-----ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtcta 195  Q
    || |||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  15234074 aacttgaaaaagttttttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtcta 15234172  T
Q  196 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15234173 tttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtg 15234217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 24118832 - 24119055
Alignment:
Q  12 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaa 110  Q
    ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24118832 aaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaa 24118931  T
Q  111 cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgtta 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  | || |||||||||||| || |||||    
T  24118932 c-tttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgtta 24119029  T
Q  211 caagcaggctcttccccaggatagtc 236  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||    
T  24119030 caagcaggttctcctccaggatagtc 24119055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15380344 - 15380106
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15380344 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt 15380246  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||| || ||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| || ||||||| |||    
T  15380245 gaaa-ttaaaaaagtttttgtctgttttgaaa-gcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtcttttt 15380148  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380147 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 15380106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 6576048 - 6576251
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||        |||||    
T  6576048 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt-------ctttga 6576140  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  6576141 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 6576239  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||    
T  6576240 ggatagtctgtg 6576251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 1674019 - 1674258
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacat--tttctttctattttgataatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  1674019 cttttgtttgaaa-ctctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatct 1674117  T
Q  98 tgaaaattgaaaac-ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  1674118 tgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacttgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtctat 1674216  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1674217 ttca--atgtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtg 1674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15276738 - 15276497
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15276738 cttttgtttgaaa-ctctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt 15276640  T
Q  99 gaaaattgaaaact--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
    ||||||||||||    ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||  || ||| || |||||||||    
T  15276639 gaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttgaaa-gtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctat 15276541  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15276540 ttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccaggatagtctgtg 15276497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 14671203 - 14671410
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaa-aacattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||       |    
T  14671203 tactttcaaagttatgtacaagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-------t 14671295  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |     
T  14671296 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 14671395  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    | |||||||||||||    
T  14671396 ctaggatagtctgtg 14671410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 240
Target Start/End: Original strand, 17019247 - 17019445
Alignment:
Q  36 aaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagc 133  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||       |||||||||    
T  17019247 aaagctatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttttt-------ttgaaaagc 17019339  T
Q  134 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  17019340 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggata 17019438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5717179 - 5717418
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5717179 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 5717278  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5717279 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 5717377  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5717378 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5717418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5728089 - 5728328
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5728089 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 5728188  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5728189 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 5728287  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5728288 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5728328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5764279 - 5764040
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5764279 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 5764180  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5764179 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 5764081  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5764080 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5764040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 47029564 - 47029803
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47029564 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 47029663  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47029664 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 47029762  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  47029763 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 47029803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4790782 - 4790544
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4790782 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 4790684  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4790683 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 4790585  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4790584 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 4790544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 32296740 - 32296979
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296740 cttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 32296839  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  32296840 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 32296938  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  32296939 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 32296979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31958606 - 31958366
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31958606 cttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 31958507  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31958506 gaaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 31958408  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31958407 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31958366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10649182 - 10649420
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10649182 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 10649280  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10649281 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 10649379  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10649380 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10649420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29659117 - 29658879
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29659117 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 29659019  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  29659018 aaaattgaaaacctttg-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 29658920  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  29658919 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 29658879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5603464 - 5603224
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5603464 cttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 5603365  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5603364 gaaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 5603266  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5603265 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5603224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 24334284 - 24334524
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24334284 cttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 24334383  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24334384 gaaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 24334482  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24334483 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24334524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5473099 - 5473336
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5473099 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 5473197  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5473198 aaaattgaaaactttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 5473295  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5473296 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5473336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28110104 - 28109862
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaac----att 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||    
T  28110104 cttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgtttttt 28110005  T
Q  97 ttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  28110004 ttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctat 28109906  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  28109905 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 28109862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4340825 - 4340587
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4340825 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 4340727  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4340726 aaaattgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 4340628  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4340627 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 4340587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 4423029 - 4423267
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  4423029 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttg 4423127  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4423128 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 4423226  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  4423227 aatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 4423267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 240
Target Start/End: Original strand, 18248860 - 18249087
Alignment:
Q  13 aactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18248860 aactctatttttcttctactttcaaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 18248959  T
Q  112 ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttac 211  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18248960 ctttg-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttac 18249058  T
Q  212 aagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18249059 aagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18249087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 48472038 - 48472280
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg- 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  48472038 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 48472136  T
Q  100 ----aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtcta 195  Q
        ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  48472137 tttaaaaattgaaaactttct-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 48472235  T
Q  196 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  48472236 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 48472280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 51788133 - 51788371
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51788133 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 51788231  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  51788232 aaaattgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttc 51788330  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  51788331 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 51788371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 10402269 - 10402497
Alignment:
Q  11 aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaa 109  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10402269 aaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaa 10402367  T
Q  110 acttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgtt 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10402368 actttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtt 10402466  T
Q  210 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10402467 acaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10402497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 20072144 - 20072384
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  20072144 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 20072241  T
Q  99 --gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20072242 ttgaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 20072340  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20072341 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20072384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 8217743 - 8217983
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  8217743 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttt 8217841  T
Q  99 -gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8217842 tgaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 8217940  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8217941 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8217983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17971013 - 17970777
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17971013 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 17970916  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17970915 aaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 17970817  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  17970816 atatgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 17970777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16422293 - 16422532
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16422293 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt 16422391  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  16422392 gaaaattgaaaaagtttttgtgtattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctattt 16422490  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422491 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 16422532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22864976 - 22864759
Alignment:
Q  22 tttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtct 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22864976 tttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt-gtct 22864878  T
Q  122 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  22864877 gttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttc 22864778  T
Q  222 ttccccaggatagtctgtg 240  Q
    | | ||||| |||||||||    
T  22864777 tcctccagggtagtctgtg 22864759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22880035 - 22879818
Alignment:
Q  22 tttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtct 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22880035 tttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt-gtct 22879937  T
Q  122 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  22879936 gttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttc 22879837  T
Q  222 ttccccaggatagtctgtg 240  Q
    | | ||||| |||||||||    
T  22879836 tcctccagggtagtctgtg 22879818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5590510 - 5590275
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5590510 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 5590412  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5590411 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 5590313  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 237  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  5590312 aataggtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 5590275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22381729 - 22381492
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22381729 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 22381631  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  22381630 aaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttc 22381533  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22381532 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22381492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 28027420 - 28027638
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28027420 ttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt-tgtc 28027518  T
Q  121 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  28027519 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggtt 28027618  T
Q  221 cttccccaggatagtctgtg 240  Q
    || | |||||||||||||||    
T  28027619 ctcctccaggatagtctgtg 28027638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 4629896 - 4630133
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4629896 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 4629994  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  4629995 aaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttc 4630092  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    || || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4630093 aacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 4630133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5019824 - 5020061
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |    
T  5019824 cttttgttt-aaaactctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttg 5019921  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5019922 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 5020020  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  5020021 aatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 5020061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18286494 - 18286266
Alignment:
Q  11 aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18286494 aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaa 18286396  T
Q  109 aacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgt 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  18286395 aac-tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgt 18286298  T
Q  209 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18286297 tacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18286266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18301795 - 18301567
Alignment:
Q  11 aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18301795 aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaa 18301697  T
Q  109 aacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgt 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  18301696 aac-tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgt 18301599  T
Q  209 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18301598 tacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18301567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20570995 - 20570757
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  20570995 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttg 20570897  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  20570896 aaaattgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttc 20570798  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  20570797 aatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtg 20570757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29142906 - 29142665
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29142906 cttttgtttgaaaactccattttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 29142807  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttg--aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||    
T  29142806 aaaattgaaaacttttt-gtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 29142708  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  29142707 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 29142665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11104511 - 11104272
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11104511 cttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttt 11104413  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11104412 gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 11104314  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11104313 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 11104272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Original strand, 7079376 - 7079576
Alignment:
Q  41 tatatacaaaacattttctttctatt-ttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacct 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7079376 tatatacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 7079475  T
Q  140 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  7079476 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgt 7079575  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  7079576 g 7079576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 21680812 - 21681049
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21680812 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 21680910  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  21680911 aaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttc 21681008  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    || || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21681009 aacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 21681049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 28345282 - 28345519
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28345282 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 28345379  T
Q  101 aaa-ttgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  28345380 aaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtctatttc 28345478  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  28345479 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 28345519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 18057399 - 18057612
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctatttt-gataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctatttt 126  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18057399 tactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttt 18057498  T
Q  127 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 226  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057499 tgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 18057598  T
Q  227 caggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||    
T  18057599 caggatagtctgtg 18057612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6536865 - 6536654
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttttttgtctattttg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  6536865 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaacttttt-gtctgttttg 6536767  T
Q  128 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |     
T  6536766 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctca 6536667  T
Q  228 aggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||    
T  6536666 aggatagtctgtg 6536654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 18231304 - 18231542
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18231304 cttttgttt-aaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 18231402  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||    
T  18231403 aaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttc 18231501  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18231502 aatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18231542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17979100 - 17978861
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17979100 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 17979002  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  17979001 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctattt 17978903  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  17978902 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 17978861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31030387 - 31030156
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  31030387 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttga 31030289  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  31030288 aaattgaaaaagtttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttca 31030196  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    | || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31030195 agatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31030156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16618642 - 16618400
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16618642 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatct 16618544  T
Q  98 tgaaaattgaaaact--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtcta 195  Q
    |||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||||||||    
T  16618543 tgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtcta 16618445  T
Q  196 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16618444 tttcaatatgtgttacaaggaggctcttccccaggatagtctgtg 16618400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 18336740 - 18336968
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  18336740 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttga 18336838  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  18336839 aaattgaaaaagtttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttca 18336931  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 237  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  18336932 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 18336968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 6208012 - 6208245
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga-taatgacagtg-cttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  | || ||||||||||| ||    
T  6208012 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatctt 6208111  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||  |||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||| |||||||||    
T  6208112 gaaaattgaaaaagttttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 6208203  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6208204 caatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtg 6208245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 240
Target Start/End: Original strand, 19700654 - 19700847
Alignment:
Q  48 aaaacattttctttctattttgataatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19700654 aaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaa 19700752  T
Q  146 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  19700753 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattcttccccaggatagtctgtg 19700847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 4727771 - 4727976
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctatttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||       ||    
T  4727771 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-------tt 4727863  T
Q  127 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4727864 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccc 4727962  T
Q  227 caggatagtctgtg 240  Q
    |||||| |||||||    
T  4727963 caggatggtctgtg 4727976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 32445292 - 32445494
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||        |||    
T  32445292 tactttcaaagttatatacaaaacattttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt--------tga 32445383  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  32445384 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 32445482  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||    
T  32445483 ggatagtctgtg 32445494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15735225 - 15735011
Alignment:
Q  22 tttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttg 118  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||     
T  15735225 tttcttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttt- 15735127  T
Q  119 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 218  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15735126 -----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 15735033  T
Q  219 ctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
     ||| | |||||||||||||||    
T  15735032 ttctcctccaggatagtctgtg 15735011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8283591 - 8283369
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--------tttttt 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||         ||||||    
T  8283591 tactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttt 8283492  T
Q  118 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 217  Q
     | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8283491 tttttttttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcag 8283392  T
Q  218 gctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    | ||| | |||||||||||||||    
T  8283391 gttctcctccaggatagtctgtg 8283369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 4689782 - 4689994
Alignment:
Q  22 tttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttg 118  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||     
T  4689782 tttcttttactttctaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt- 4689880  T
Q  119 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 218  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||     
T  4689881 -------tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcaga 4689972  T
Q  219 ctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
     ||| | |||||||||||||||    
T  4689973 ttctcctccaggatagtctgtg 4689994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5658247 - 5658480
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  5658247 cttttgtttgaaa-ctctattttccttttactttcaacgttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatct 5658345  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    | |||||||||||  |||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  5658346 taaaaattgaaaaagttttt-------ttgaaaagcaaacctaagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatt 5658437  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||    ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  5658438 tcaacgcatgttacaagcaggttctcctcaaggatagtctgtg 5658480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 35886903 - 35887109
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||       |    
T  35886903 tactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-------t 35886995  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |     
T  35886996 tgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacgaa-catacatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 35887094  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  35887095 ccaggatagtctgtg 35887109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15886768 - 15886652
Alignment:
Q  123 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15886768 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttct 15886670  T
Q  223 tccccaggatagtctgtg 240  Q
     | || ||||||||||||    
T  15886669 cctcccggatagtctgtg 15886652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 9360770 - 9361007
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9360770 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 9360868  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9360869 aaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 9360967  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9360968 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9361007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 18796855 - 18797093
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18796855 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 18796953  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18796954 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 18797052  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18797053 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18797093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28356020 - 28355780
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt--cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28356020 cttttgtttgaaaattctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 28355921  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  28355920 gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctattt 28355822  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28355821 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28355780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 31360676 - 31360914
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31360676 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 31360774  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31360775 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 31360873  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31360874 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 33248514 - 33248751
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33248514 cttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 33248612  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  33248613 aaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttca 33248711  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33248712 atatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33248751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31483940 - 31483700
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31483940 cttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 31483841  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31483840 gaaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 31483742  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31483741 caatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31483700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 19680597 - 19680833
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19680597 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 19680694  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19680695 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttca 19680793  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  19680794 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 19680833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 29835471 - 29835708
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29835471 cttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 29835569  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  29835570 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttca 29835668  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  29835669 atatgtgttacgagcaggttctcctccaagataatctgtg 29835708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 15773749 - 15773960
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttttttgtctattttg 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15773749 tactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttt-tgtctattttg 15773847  T
Q  128 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  15773848 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 15773947  T
Q  228 aggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||    
T  15773948 aggatagtctgtg 15773960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21342211 - 21342000
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttttttgtctattttg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21342211 tactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaacttttt-gtctattttg 21342113  T
Q  128 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  21342112 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcc 21342013  T
Q  228 aggatagtctgtg 240  Q
    || ||||||||||    
T  21342012 agaatagtctgtg 21342000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 18715628 - 18715868
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg- 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  18715628 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 18715725  T
Q  100 ---aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  18715726 tgaaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactat 18715824  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  18715825 ttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 18715868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 44567129 - 44567369
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  44567129 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 44567226  T
Q  99 --gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  44567227 ttgaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctat 44567325  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  44567326 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 44567369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12086781 - 12086553
Alignment:
Q  12 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12086781 aaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa 12086682  T
Q  111 cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgtta 210  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  12086681 cttttt-gtctgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgtta 12086583  T
Q  211 caagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  12086582 caagcaggttctcctccaagataatctgtg 12086553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19911232 - 19910992
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19911232 cttttgttt-aaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt 19911134  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  19911133 gaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctattt 19911034  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  19911033 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaagatagtctgtg 19910992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19202417 - 19202205
Alignment:
Q  27 tctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctatttt 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19202417 tctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt-gtctatttt 19202319  T
Q  127 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | |    
T  19202318 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 19202219  T
Q  227 caggatagtctgtg 240  Q
    || |||| ||||||    
T  19202218 caagataatctgtg 19202205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 33264897 - 33265079
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttttgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  33264897 ttttcttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaac-tttttgt 33264995  T
Q  120 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaata 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  33264996 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatttcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22074998 - 22074759
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  22074998 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttct 22074900  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    |||||||  |||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| || ||||||||||    
T  22074899 tgaaaataaaaaagttttt-gtctgttttgaaa-gcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatt 22074802  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22074801 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccctaggatagtctgtg 22074759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19655410 - 19655180
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  19655410 cttttgtttgaaa-ctctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatct 19655312  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  19655311 tgaaaattgaaaagtttttt-------ttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatt 19655220  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 237  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19655219 tcaatatatgttacaagcagactcttccccaggatagtct 19655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 16260371 - 16260480
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16260371 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttga 16260469  T
Q  101 aaattgaaaac 111  Q
    |||| ||||||    
T  16260470 aaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 22139055 - 22139286
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| | |    
T  22139055 cttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtct 22139153  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    |||||||||||||  ||||||          ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  22139154 tgaaaattgaaaaagtttttg----------aaagcaaacttgagcaacagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatt 22139243  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22139244 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22139286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27602948 - 27602744
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||           
T  27602948 tactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagttttttg------- 27602856  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  27602855 --aaaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcct 27602759  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  27602758 ccaggatagtctgtg 27602744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2131330 - 2131098
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  2131330 cttttgtttgaaa-ctctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatct 2131232  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    |||||||||||||  || ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  |||| ||||||||    
T  2131231 tgaaaattgaaaaagttctt--------tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 2131141  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  2131140 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 2131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 19694271 - 19694477
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||       |    
T  19694271 tactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttt-------t 19694363  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |     
T  19694364 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcct 19694462  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  19694463 ccaggatagtctgtg 19694477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 14569424 - 14569540
Alignment:
Q  123 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctct 222  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  14569424 ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatacatgttacaagcaggttct 14569522  T
Q  223 tccccaggatagtctgtg 240  Q
     | |||||||| ||||||    
T  14569523 cctccaggatattctgtg 14569540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 3647296 - 3647534
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3647296 cttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 3647395  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3647396 aaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 3647494  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3647495 atatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3647534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10968815 - 10969054
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10968815 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 10968914  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10968915 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 10969013  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||    
T  10969014 aatatatgttacaaacaggttctcctccaggatggtctgtg 10969054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 51644370 - 51644588
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51644370 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 51644469  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  51644470 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttc 51644569  T
Q  200 aatatgtgttacaagcagg 218  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  51644570 aatatatgttacaagcagg 51644588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41787416 - 41787177
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  41787416 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttt 41787319  T
Q  99 -gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41787318 tgaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 41787220  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41787219 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 41787177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 28155876 - 28156116
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  28155876 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 28155973  T
Q  99 --gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28155974 ttgaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 28156072  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28156073 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28156116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10951241 - 10951480
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10951241 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 10951340  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  10951341 aaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttc 10951439  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  10951440 aatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 10951480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20334523 - 20334283
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20334523 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatct 20334425  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20334424 tgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatt 20334326  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334325 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 20334283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 28591260 - 28591470
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28591260 tactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt-tgtctattttga 28591358  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  28591359 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 28591458  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||    
T  28591459 ggatagtctgtg 28591470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16202141 - 16201895
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-agtgcttgaaacaaac 93  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| || |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16202141 cttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaac 16202043  T
Q  94 attttgaaaattgaaaa--cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatg 191  Q
    || ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16202042 atcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatg 16201944  T
Q  192 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16201943 tctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctccaggatagtctgtg 16201895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 20466927 - 20467173
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  20466927 cttttgtttgaaa-ctctactttctttccactttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatctt 20467025  T
Q  99 gaaaattg-------aaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatg 191  Q
     ||||||        ||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  20467026 caaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctattttgaaa-gcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatg 20467124  T
Q  192 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20467125 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccatgatagtctgtg 20467173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21891818 - 21891630
Alignment:
Q  48 aaaacattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||   ||||     |||||||||||||||||||||||    
T  21891818 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaa 21891724  T
Q  146 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21891723 cagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 21891630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9747 - 9510
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9747 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 9649  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9648 aaattgaaaact-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 9550  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9549 atatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12184 - 12421
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12184 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatataaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 12282  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12283 aaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 12381  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  12382 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4710 - 4471
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  4710 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttg 4612  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  4611 aaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttc 4512  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4511 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24586514 - 24586289
Alignment:
Q  14 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586514 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 24586415  T
Q  114 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586414 ttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 24586316  T
Q  214 gcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24586315 gcaggttctcctccaggatagtctgtg 24586289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 26595813 - 26596053
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26595813 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttt 26595912  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  26595913 gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctattt 26596011  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26596012 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26596053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5164529 - 5164767
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc-tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5164529 cttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttg 5164627  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5164628 aaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 5164726  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5164727 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5164767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26679097 - 26678858
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  26679097 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttg 26678998  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26678997 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 26678899  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26678898 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26678858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4139239 - 4138999
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4139239 cttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 4139140  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  4139139 gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctattt 4139041  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  4139040 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4138999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26509688 - 26509471
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26509688 cttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttga 26509589  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  26509588 aaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttca 26509489  T
Q  201 atatgtgttacaagcagg 218  Q
    |||  ||| |||||||||    
T  26509488 atacatgtcacaagcagg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 26441398 - 26441637
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26441398 cttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 26441497  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  26441498 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttc 26441596  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26441597 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26441637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26663905 - 26663666
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  26663905 cttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttg 26663806  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26663805 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttc 26663707  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  26663706 aatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtg 26663666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31558386 - 31558148
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  31558386 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttg 31558288  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31558287 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttc 31558189  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  31558188 aatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 31558148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39207131 - 39206893
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39207131 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 39207033  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  39207032 aaaattgaaaacttttt-gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttc 39206934  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39206933 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39206893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 5154256 - 5154466
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5154256 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt-gtctattttga 5154354  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  5154355 aaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 5154454  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||    
T  5154455 ggatagtctgtg 5154466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5141327 - 5141088
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5141327 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg 5141229  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  5141228 aaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctattt 5141130  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5141129 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5141088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 26518938 - 26519174
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26518938 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 26519035  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26519036 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttca 26519134  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26519135 atatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26519174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16745513 - 16745274
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  16745513 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 16745415  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  16745414 gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctattt 16745316  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||    
T  16745315 caatatgtgttacaagcaagttctccttcaggatagtctgtg 16745274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 45737446 - 45737686
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  45737446 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttt 45737543  T
Q  99 --gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  45737544 ttgaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctat 45737642  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  45737643 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 45737686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 2160715 - 2160955
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  2160715 cttttgttt-aaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt 2160813  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  2160814 gaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctattt 2160913  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160914 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 2160955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16443996 - 16443757
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16443996 cttttgttt-aaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt 16443898  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  16443897 gaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctattt 16443799  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443798 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 16443757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 4205535 - 4205772
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4205535 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 4205632  T
Q  101 aaa-ttgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  4205633 aaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttc 4205731  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  4205732 aatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4205772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11418771 - 11418533
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11418771 cttttgtttgaaa-ctctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 11418673  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  11418672 aaaattgaaaactttct-gtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttc 11418574  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  11418573 aatatgtgttacaagcaggtcctcctccaggatagtctgtg 11418533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31084614 - 31084376
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  31084614 cttttgtttgaaat-tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttg 31084516  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  31084515 aaaattgaaat-ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttc 31084417  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  31084416 aatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 31084376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26269081 - 26268839
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26269081 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttt 26268983  T
Q  99 ---gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtcta 195  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26268982 tttgaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 26268884  T
Q  196 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26268883 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26268839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 45393364 - 45393602
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  45393364 cttttgttt-aaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttg 45393462  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  45393463 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatttc 45393561  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    | ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  45393562 agtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 45393602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26313839 - 26313603
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26313839 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 26313742  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||    
T  26313741 aaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttca 26313643  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  26313642 atatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 26313603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 3451481 - 3451702
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |    
T  3451481 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttt-t 3451579  T
Q  118 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3451580 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttacaagcag 3451679  T
Q  218 gctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    | ||| | |||||||||| ||||    
T  3451680 gttctcctccaggatagtatgtg 3451702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 11447051 - 11447271
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttg--aaaattgaaaacttttttg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||    
T  11447051 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttt-tg 11447149  T
Q  119 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11447150 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 11447249  T
Q  219 ctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
     ||| |  ||||||||||||||    
T  11447250 ttctccttcaggatagtctgtg 11447271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 2779424 - 2779626
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||      |||||    
T  2779424 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt------tttga 2779517  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  2779518 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 2779617  T
Q  229 ggatagtct 237  Q
    |||||||||    
T  2779618 ggatagtct 2779626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 31130077 - 31130282
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||      |||||    
T  31130077 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt------tttga 31130170  T
Q  129 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  31130171 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 31130270  T
Q  229 ggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||    
T  31130271 ggataatctgtg 31130282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16047460 - 16047695
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttga 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  16047460 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctga 16047557  T
Q  101 aaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttca 200  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  16047558 aaattgaaaagttttt-gtctattttgaaa-gcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttca 16047655  T
Q  201 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16047656 atatgtgttacaagcaggttcttccccgggatagtctgtg 16047695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 10847738 - 10847968
Alignment:
Q  12 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattg-- 106  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      
T  10847738 aaactctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaa 10847837  T
Q  107 aaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgt 206  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||  || ||| || |||||||||||||  ||||    
T  10847838 aaaagttttttgtctgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttca--atgt 10847934  T
Q  207 gttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847935 gttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 10847968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10910912 - 10910680
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |    
T  10910912 cttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatct 10910814  T
Q  98 tgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
    |||||||||||||  |||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  10910813 tgaaaattgaaaaagttttt--------tgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatt 10910723  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10910722 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10910680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16512311 - 16512194
Alignment:
Q  123 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctct 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16512311 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttct 16512212  T
Q  223 tccccaggatagtctgtg 240  Q
     | |||||||||||||||    
T  16512211 cctccaggatagtctgtg 16512194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3287 - 3047
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3287 cttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 3188  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3187 gaaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 3089  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3088 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17954 - 18194
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17954 cttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 18053  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18054 gaaaattgaaaacctttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 18152  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18153 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 18734 - 18973
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-- 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  18734 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttt 18831  T
Q  99 -gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatt 197  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18832 tgaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18930  T
Q  198 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18931 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9016 - 8797
Alignment:
Q  21 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttttttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  9016 ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaacttttt-gt 8918  T
Q  120 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8917 ctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggt 8818  T
Q  220 tcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  8817 tctcctccaggatagtctgtg 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10062 - 10299
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  10062 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttg 10159  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  10160 aaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttc 10258  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10259 aatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 33446 - 33680
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacag-tgcttgaaacaaacatttt 98  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||    
T  33446 cttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctt 33544  T
Q  99 gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctattt 198  Q
    ||||||||||||  |||||     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||| |||||||||    
T  33545 gaaaattgaaaaagttttt-----tttgtaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 33638  T
Q  199 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33639 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 14108 - 14336
Alignment:
Q  12 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14108 aaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa 14207  T
Q  111 cttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgtta 210  Q
    | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  14208 c-tttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgtta 14306  T
Q  211 caagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  14307 caagcaggttctcctccaagataatctgtg 14336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 1806 - 2043
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacatttt-g 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1806 cttttgtttgaaa-ctctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 1903  T
Q  100 aaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttc 199  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  1904 aaaattgaaaacttttt-gtttactttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttc 2002  T
Q  200 aatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  2003 aatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 240
Target Start/End: Original strand, 12252 - 12443
Alignment:
Q  48 aaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12252 aaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaaca 12350  T
Q  148 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12351 gggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttctccaggatagtctgtg 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 15717 - 15962
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgata-atgacagtgcttgaaacaaacatttt- 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||| |||| ||||||||||||||     
T  15717 cttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttt 15815  T
Q  99 -----gaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgt 192  Q
         |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15816 tttttgaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 15914  T
Q  193 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15915 ctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 25263 - 25509
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacagtgcttgaaacaaacattt 97  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25263 cttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatct 25361  T
Q  98 tgaaaattgaaaac------ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatg 191  Q
    |||||||||||||       |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||||    
T  25362 tgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatg 25460  T
Q  192 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25461 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 25509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Original strand, 1 - 173
Alignment:
Q  67 ttgataatgacagtgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  167 atgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtg 173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6449
Alignment:
Q  1 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacatt 96  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| ||| | |||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||     
T  6215 cttttgtttgaaa-ctctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatc 6313  T
Q  97 ttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctat 196  Q
    ||||||||||||||  |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||    
T  6314 ttgaaaattgaaaaagttttt--------tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 6405  T
Q  197 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  6406 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 6449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24980 - 24774
Alignment:
Q  29 tactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacag-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattt 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||       |    
T  24980 tactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttttt-------t 24888  T
Q  126 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |     
T  24887 tgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcct 24789  T
Q  226 ccaggatagtctgtg 240  Q
    |||||||||||||||    
T  24788 ccaggatagtctgtg 24774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40497
Alignment:
Q  133 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcaagagtacgttgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcaggctcttccccagg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| || ||  |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  231 atagtctgtg 240  Q
    ||||| ||||    
T  40506 atagtatgtg 40497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University