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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16697_low_3 (Length: 861)

Name: NF16697_low_3
Description: NF16697
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16697_low_3
NF16697_low_3
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (13-852)||(3767202-3768042)
chr4 (505-852)||(45499030-45499379)
chr4 (512-842)||(28115791-28116121)
chr4 (573-852)||(37910520-37910797)
chr4 (514-846)||(34940259-34940591)
chr4 (537-817)||(34513651-34513924)
chr4 (598-852)||(5787159-5787410)
chr4 (14-228)||(3781187-3781398)
chr4 (635-852)||(34513934-34514149)
chr4 (14-228)||(3776874-3777082)
chr4 (629-784)||(44290091-44290246)
chr4 (17-218)||(3762802-3763000)
chr4 (553-783)||(17702135-17702365)
chr4 (760-852)||(36198672-36198763)
chr4 (23-147)||(3751823-3751947)
chr4 (14-124)||(3745997-3746107)
chr4 (14-125)||(3755681-3755789)
chr4 (14-147)||(3771439-3771569)
chr4 (513-600)||(21342155-21342242)
chr4 (779-835)||(44289502-44289558)
chr4 (697-763)||(11138750-11138816)
chr4 (512-584)||(37911176-37911248)
chr4 (809-852)||(34512183-34512226)
chr4 (525-601)||(53923655-53923731)
chr4 (565-608)||(11138663-11138706)
chr4 (691-742)||(53923864-53923915)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (512-852)||(28622768-28623108)
chr1 (505-767)||(49549473-49549734)
chr1 (512-841)||(19909968-19910297)
chr1 (506-745)||(37346974-37347213)
chr1 (738-852)||(37346214-37346330)
chr1 (513-740)||(10306758-10306987)
chr1 (539-608)||(48527377-48527446)
chr1 (553-614)||(52267631-52267692)
chr1 (796-844)||(10306673-10306720)
chr1 (809-852)||(17702919-17702962)
chr1 (732-768)||(49549853-49549889)
chr1 (731-846)||(52267876-52267989)
chr1 (798-849)||(4714337-4714388)
chr1 (687-756)||(12856822-12856892)
chr1 (526-651)||(35508891-35509016)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (512-852)||(29860834-29861173)
chr5 (513-852)||(33007853-33008189)
chr5 (549-852)||(33134090-33134392)
chr5 (513-852)||(15922041-15922379)
chr5 (551-845)||(25346915-25347219)
chr5 (513-852)||(7883647-7883969)
chr5 (507-803)||(31077809-31078101)
chr5 (506-846)||(5868150-5868472)
chr5 (729-852)||(21091119-21091242)
chr5 (506-834)||(42683807-42684114)
chr5 (550-717)||(21092372-21092537)
chr5 (525-651)||(2498915-2499041)
chr5 (796-852)||(31078118-31078174)
chr5 (741-826)||(2499105-2499188)
chr5 (805-849)||(39705925-39705969)
chr5 (798-849)||(8096097-8096148)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (506-852)||(40619551-40619897)
chr2 (544-852)||(41595239-41595546)
chr2 (525-852)||(27338700-27339017)
chr2 (505-789)||(13996071-13996355)
chr2 (629-852)||(19695769-19695990)
chr2 (506-779)||(13349429-13349702)
chr2 (730-846)||(37485757-37485873)
chr2 (506-693)||(37485562-37485746)
chr2 (506-620)||(19695466-19695580)
chr2 (688-852)||(15665253-15665417)
chr2 (807-846)||(13349393-13349432)
chr2 (628-723)||(34355880-34355975)
chr2 (781-823)||(13995630-13995672)
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (504-852)||(28457639-28457982)
chr3 (505-852)||(40700882-40701228)
chr3 (531-852)||(21748263-21748571)
chr3 (706-846)||(4384895-4385035)
chr3 (506-712)||(33072584-33072790)
chr3 (512-660)||(7818464-7818611)
chr3 (512-738)||(45853075-45853299)
chr3 (513-639)||(21495053-21495178)
chr3 (732-842)||(45852779-45852889)
chr3 (694-740)||(21495222-21495268)
chr3 (505-601)||(46663163-46663259)
chr3 (556-596)||(27488469-27488509)
chr3 (778-846)||(43462845-43462913)
chr3 (778-846)||(46663420-46663488)
chr3 (511-614)||(41865803-41865906)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (544-852)||(9314806-9315113)
chr6 (509-852)||(23404450-23404792)
chr6 (505-852)||(12255070-12255418)
chr6 (513-852)||(10789279-10789618)
chr6 (512-844)||(32329317-32329638)
chr6 (506-820)||(29979287-29979597)
chr6 (563-852)||(24660649-24660938)
chr6 (747-852)||(391141-391246)
chr6 (514-611)||(12267316-12267413)
chr6 (687-723)||(391253-391289)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (513-852)||(43596799-43597138)
chr8 (513-852)||(16295305-16295642)
chr8 (513-852)||(16303007-16303344)
chr8 (512-852)||(37246131-37246466)
chr8 (512-852)||(15268592-15268932)
chr8 (580-852)||(40953263-40953535)
chr8 (562-852)||(27696248-27696536)
chr8 (506-711)||(32962016-32962221)
chr8 (600-846)||(11656210-11656454)
chr8 (756-852)||(42180522-42180616)
chr8 (506-740)||(16456456-16456690)
chr8 (544-608)||(11657003-11657067)
chr8 (549-846)||(8490895-8491176)
chr8 (505-568)||(42180461-42180524)
chr8 (796-846)||(16456728-16456778)
chr8 (545-590)||(511650-511695)
chr8 (676-723)||(35010687-35010734)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (544-852)||(34703033-34703344)
chr7 (512-845)||(18502936-18503274)
chr7 (513-831)||(15672839-15673149)
chr7 (704-855)||(34866296-34866447)
chr7 (565-666)||(6110160-6110261)
chr7 (770-846)||(6110323-6110398)
chr7 (527-846)||(3480606-3480908)
chr7 (510-631)||(32585825-32585946)
chr7 (512-614)||(25102600-25102707)
chr7 (537-763)||(28428933-28429160)
chr7 (506-608)||(24429348-24429450)
chr7 (696-740)||(6110261-6110305)
chr7 (691-757)||(17508667-17508733)
chr7 (691-757)||(17544481-17544547)
chr7 (14-72)||(25985271-25985329)
chr7 (532-621)||(15524263-15524351)
chr7 (687-744)||(31804759-31804816)
chr7 (796-846)||(15841585-15841635)
chr7 (805-846)||(25102990-25103031)
[»] scaffold0702 (1 HSPs)
scaffold0702 (553-745)||(3936-4127)
[»] scaffold0662 (1 HSPs)
scaffold0662 (553-745)||(3975-4166)
[»] scaffold0817 (1 HSPs)
scaffold0817 (512-573)||(1-62)
[»] scaffold0957 (2 HSPs)
scaffold0957 (549-625)||(1659-1735)
scaffold0957 (704-759)||(1816-1871)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 788; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 788; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 852
Target Start/End: Original strand, 3767202 - 3768042
Alignment:
Q  13 agaagtagggttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattgga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3767202 agaagtagggttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattgga 3767301  T
Q  113 cgaacaaaatcaactgtgtcttgtttttctgatgaagttgaagcagagagtgtgttgcaagatatgagaaggaagaagaacaaagtgatgaggaaatgtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3767302 cgaacaaaatcaactgtgtcttgtttttctgatgaagttgaagcagagagtgtgttgcaagatatgagaaggaagaagaacaaagtgatgaggaaatgtt 3767401  T
Q  213 tggaaggcattatggtggatgcaagagattgttgtgatgctaactgtggagacagtaaagtagtggaggactaggagagaagacaataatagtggaagct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3767402 tggaaggcattatggtggatgcaagagattgttgtgatgctaactgtggagacagtaaagtagtggaggactaggagagaagacaataatagtggaagct 3767501  T
Q  313 taatgaagtgaagttaaagaaagtgaggaacaaaattataagaagaggaaagtgaaggaaaaatgacaaatggagtgggatgtagggtacgtatttttct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3767502 taatgaagtgaagttaaagaaagtgaggaacaaaattataagaagaggaaagtgaaggaaaaatgacaaatggagtgggatgtagggtacgtatttttct 3767601  T
Q  413 aactatttcannnnnnnaacaagtaaaaatgagattatatataaacaccaacgaagaggccttaaaagcacccggtgtacc-acaaagacctcaagggtt 511  Q
    ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  3767602 aactatttcatttttttaacaagtaaaaatgagattatatataaacaccaacgaagaggccttaaaagcacccggtgtaccaacaaagacctcaagggtc 3767701  T
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3767702 cgtttgatggtcaggatagggagatatgatatgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 3767801  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3767802 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 3767901  T
Q  712 tatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3767902 tatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgtattttctattataatcaataacataccatttttacaatattt 3768001  T
Q  812 aattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
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T  3768002 aattaattatgagagcaattttttcatttaataataatgat 3768042  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 505 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 45499379 - 45499030
Alignment:
Q  505 aagggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaa 604  Q
    |||||| ||| ||||| || ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45499379 aagggtccgtgtgatgatcaggatagggaggcaagatatgatatattaatcatattcttcttaaatcacatgtttgatgcaccaaaatgataggataaaa 45499280  T
Q  605 taaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcct 704  Q
    |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||| |||| ||| ||||  |||| |||||||| ||||||| |    
T  45499279 taaaccatttctctatcctatcctgactttcctttgtaatttatatcctgaatataggctgggttagaaactatcatgatgggattagaagatcattctt 45499180  T
Q  705 tatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagc--atgcattttctattataatcaataacataccattttt 802  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45499179 tatttattatcttgatattctgccattttgaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatatgtattttctattataattaataacataccattttt 45499080  T
Q  803 acaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45499079 acaatatttaattaattatgagagcaaatttttcatttaattataatgat 45499030  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 512 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 28116121 - 28115791
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    ||||| |||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  28116121 cgtttaatggtgaggatagggagccatgatatgatacattaatcatattatgcttaaatctcatatttgatgcacctaagtgataagataaaataaacca 28116022  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 711  Q
    |||  ||||| |||  | |||||||||||| |||| |||| | |||||||| || |||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  28116021 ttttcctatcctatcctaactttcctttgtaatttctatcctgagtataagttgtgttagaaattatcctgatggaattagaagatcattctttatttat 28115922  T
Q  712 tatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattt 811  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  28115921 tatcttgagattttgccatttttaaaatattgtcattttttaaattatgatagcatgcattttctattataattaataacatgtcatttttacaatattt 28115822  T
Q  812 aattaattatgagagcaattttttcatttaa 842  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28115821 aattaattatgagagcaagtttttcatttaa 28115791  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 573 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 37910797 - 37910520
Alignment:
Q  573 catgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttata 672  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  37910797 catgtttgatgcaccaaagggatacgataaaataaatcattttcctatcatatcctgactttcgtttgtaatttatatcatgagtataagctgggttaga 37910698  T
Q  673 aattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcatt 772  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  37910697 aattatcctgatgggattagaagatcattccttatttattattttgatattctgcca-ttttaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtatt 37910599  T
Q  773 ttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37910598 ttctattataattaataacatgtca-ttttacaatatttaattaattatggaagcaatattttcatttaattataatgat 37910520  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 514 - 846
Target Start/End: Original strand, 34940259 - 34940591
Alignment:
Q  514 tttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatt 613  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  |||  ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  34940259 tttgatggtcaggatagggagacagaatataatacattaatcatgttctctttaaatctcatgtttgatgcaccaaaaggataggataaaataaaccatt 34940358  T
Q  614 tctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttatta 713  Q
    |   |||| |||  |||||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||    
T  34940359 ttcatatcctatcctgactttcctttgtaatttctatcctgagtatatgctgatttataaattatcctgatgggattagaaaatcaattcttatttatta 34940458  T
Q  714 tcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaa 813  Q
    ||||||||||||    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34940459 tcttgatattcttcctttttaaaaatattatcatttttaaaataatgataacatgtattttctgttataattaataacatgtcatttttacaatatttaa 34940558  T
Q  814 ttaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34940559 ttaatgatgagaacaattttttcatttaattat 34940591  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 537 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 34513924 - 34513651
Alignment:
Q  537 atgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcc 636  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||    
T  34513924 atgatatgatacattaattatatcctgcttaaatctcatgtttgatgcaccaaatggataggataaaataaaccatttttctatcatatcctgactttcc 34513825  T
Q  637 tttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaa 736  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34513824 tttgtaatttctatcctgagtataagctgggttagaaattatcctgatgggattagaaaatcatttcttatttattatcttgatattctgccatttttaa 34513725  T
Q  737 aatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaa 817  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||       || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34513724 aatattgtcatttttaaaataatgataacatgtattttc-------attaataacattccatttttacaatatttaattaa 34513651  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 5787410 - 5787159
Alignment:
Q  598 gataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatat 697  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||  ||| |||||||||| |||| |||    |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||    
T  5787410 gataaaataaatcattttcctatcctatcatgattttcctttgtaatttctatgtcgagtatatgctgagttagaaattatcctgatgggattaaaagat 5787311  T
Q  698 cattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacatacca 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||    
T  5787310 cattccttatttattatcttgatattctgccatttttaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtattttctattataat---taacatatca 5787214  T
Q  798 tttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5787213 tttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattataatgat 5787159  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 3781187 - 3781398
Alignment:
Q  14 gaagtagggttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattggac 113  Q
    ||||| || |||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3781187 gaagttggattttttccactcaagacgtcatgccaatagaatctgaaatgacttagcttttctttcttgtttaggcctaacaatttgcgatctatcggac 3781286  T
Q  114 gaacaaaatcaactgtgtcttgtttttctgatgaagttgaagcagagagtgtgttgcaagatatgagaaggaagaagaacaaagtgatgaggaaatgttt 213  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||     
T  3781287 gaacaaaatcgaaagtgtcttgtttttctgatgaagttgaagtagtgagtgtgttgcaagatatgagaaggaagaagaacaaag---tgaggaaatgttg 3781383  T
Q  214 ggaaggcattatggt 228  Q
    |||||||||| ||||    
T  3781384 ggaaggcattgtggt 3781398  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 635 - 852
Target Start/End: Original strand, 34513934 - 34514149
Alignment:
Q  635 cctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttattttt 734  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34513934 cctttgtaatttctatcttgagtataagatgagttagaaattatccggacgagattagaagatcatttcttatttattatcttgatattctgccattttt 34514033  T
Q  735 aaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttt 834  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34514034 aaaatattgtc-attttaaaataatgatagcatgtattttccattataattaataacatgccatttttacaatatttaattaa-tatgagatcaattttt 34514131  T
Q  835 tcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||| |||||    
T  34514132 tcatttaattataatgat 34514149  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 3776874 - 3777082
Alignment:
Q  14 gaagtagggttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattggac 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3776874 gaagttggattttttccactaactatgtcatgccaatataatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattggac 3776973  T
Q  114 gaacaaaatcaactgtgtcttgtttttctgatgaagttgaagcagagagtgtgttgcaagatatgagaaggaagaagaacaaagtgatgaggaaatgttt 213  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||||| ||   ||||||| || ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  3776974 gaacaaaatcaaaggtatcttctttttctaat---gttgaagaagtgagtgtgttacaagagataagaaggaagaagaacaaag---tgaggaaatgttt 3777067  T
Q  214 ggaaggcattatggt 228  Q
    ||||| |||| ||||    
T  3777068 ggaagacattgtggt 3777082  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 629 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 44290246 - 44290091
Alignment:
Q  629 gactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgtt 728  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||      
T  44290246 gactttcctttgtaatttatatcctgagtataggctgagttagaagttatcctaatgagattagaagatcattaattatttattatcttgatattctgcc 44290147  T
Q  729 atttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataat 784  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44290146 atttttaaaatattatcatttttaaaataatgatagcatgtattttctattataat 44290091  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 3762802 - 3763000
Alignment:
Q  17 gtagggttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattggacgaa 116  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3762802 gtagggttatttccacttagtatgtcatgccagtagaatctaaaatggcttagtttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcggtctattggacgaa 3762901  T
Q  117 caaaatcaactgtgtcttgtttttctgatgaagttgaagcagagagtgtgttgcaagatatgagaaggaagaagaacaaagtgatgaggaaatgtttgga 216  Q
    |||||||||  || ||||  ||||||||||| |  |  |  | ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3762902 caaaatcaaaagtttcttcattttctgatgatgaagttgatgtgagggtgttgcaagaaagtagaaggaagaagaacaaag---tgaggaaatgtttgga 3762998  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 553 - 783
Target Start/End: Original strand, 17702135 - 17702365
Alignment:
Q  553 atcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaa-tcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatc 651  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  17702135 atcatatctttcttaaatctcatgtttgatgcaccaaagagataagataaaataaactgttttct-tatcctatcttgtctttcctttgtaatttttatc 17702233  T
Q  652 ataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgttttt 751  Q
     | |||||||  ||||||| ||| ||||| |||   ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||| |||||    
T  17702234 ctgagtataaattgagttagaaactatcctgatagaattagaagataatttcttatttattatcatgatattcttccatttttaaaatgttgtcattttt 17702333  T
Q  752 aaaataatgatagcatgcattttctattataa 783  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  17702334 aaaataatgatatcatgtatttgttattataa 17702365  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 760 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 36198763 - 36198672
Alignment:
Q  760 gatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36198763 gatagcatgtattttctattataattaataacatagcatttttacaatatttaattaattatgagagcaat-ttttcatttaattataatgat 36198672  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Original strand, 3751823 - 3751947
Alignment:
Q  23 ttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattggacgaacaaaat 122  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3751823 tttttcccactcaagatatcatgccaatagaatctgaaatgacttagtttttctttcttgtttaggcttaacaatttgcggtctattggacgaacaaaat 3751922  T
Q  123 caactgtgtcttgtttttctgatga 147  Q
    |||  || |||||||||||| ||||    
T  3751923 caaaagtttcttgtttttctaatga 3751947  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 3745997 - 3746107
Alignment:
Q  14 gaagtagggttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattggac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||| ||| | ||||||| ||    
T  3745997 gaagtagggttttttccactcatgatgtcatgccaaaagaatctgaaatgacttagcttttcttggttgtttaggtgtaacaatttggggtctattgaac 3746096  T
Q  114 gaacaaaatca 124  Q
    |||||||||||    
T  3746097 gaacaaaatca 3746107  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Original strand, 3755681 - 3755789
Alignment:
Q  14 gaagtagggttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattggac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||    
T  3755681 gaagtagggttttttccactcactatgtcgtgccagtagaatctgaaatgacttagtttttccttc---tttaggcttaataatttgcggtctataggac 3755777  T
Q  114 gaacaaaatcaa 125  Q
    ||||||| ||||    
T  3755778 gaacaaattcaa 3755789  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 3771439 - 3771569
Alignment:
Q  14 gaagtagggttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagcttttccttcttgtttaggcctaacaacttgcgatctattggac 113  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||    
T  3771439 gaaggagggttttttccactcgctatctcgtgccagtagaatctgaaatgacttagtttttccttc---tttaggcttaataatttgcggtctataggac 3771535  T
Q  114 gaacaaaatcaactgtgtcttgtttttctgatga 147  Q
    ||||||| ||||  ||||| |  |||||||||||    
T  3771536 gaacaaattcaaaagtgtcatcattttctgatga 3771569  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 513 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 21342242 - 21342155
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggat 600  Q
    ||||||||| |  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  21342242 gtttgatggccaagatagagagacaggatatgatacattaatcatatcctgcttaaatctcatgtttgatgcacaaaatggataggat 21342155  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 779 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 44289558 - 44289502
Alignment:
Q  779 tataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaatttttt 835  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44289558 tataattaataacatgtcatttttacaatatttaattaattatgagagcattttttt 44289502  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 697 - 763
Target Start/End: Original strand, 11138750 - 11138816
Alignment:
Q  697 tcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgata 763  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11138750 tcatttcttgtttattatcatgatattctttcatttttaaaatgttgtcatttttaaaataatgata 11138816  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 37911248 - 37911176
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgc 584  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  37911248 cgtttgatggtcaggatagggagacgggatatgatacattaaccatatcctactgaaatctcatgtttgatgc 37911176  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 809 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 34512226 - 34512183
Alignment:
Q  809 tttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34512226 tttaattaattatgacagcaattttttcatttaattataatgat 34512183  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 525 - 601
Target Start/End: Original strand, 53923655 - 53923731
Alignment:
Q  525 ggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggata 601  Q
    ||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53923655 ggataaggagataaaatatgatatattaatcatattcgacttaattatcatgtttgatgcaccaaagagataggata 53923731  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 608
Target Start/End: Original strand, 11138663 - 11138706
Alignment:
Q  565 ttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaa 608  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11138663 ttaaatatcatgtttgatacatcaaagtgataggataaaataaa 11138706  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 691 - 742
Target Start/End: Original strand, 53923864 - 53923915
Alignment:
Q  691 agaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatatt 742  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  53923864 agaagatcattccttaattattatcatgatattctgtcatttttataatatt 53923915  T

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Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 512 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 28623108 - 28622768
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |    
T  28623108 cgtttgatggtcaggatagggagacatgatatgatacattaatcatatcctatttaaattccatgtttgatgcaccaaagggatagaataaaataaacta 28623009  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 711  Q
    ||| |||||| |||  |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28623008 tttttctatcctatcctgactttcctttgtaatttttatcctgagtataagctgtgttagaaattatcctgatgagattagaagatcattccttatttat 28622909  T
Q  712 tatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattt 811  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28622908 tatcttgatattctgcgatttttaaaatattgtcattttttaaataatgatagcatgtattttctattataattaataacatgccatttttacaatattt 28622809  T
Q  812 aattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28622808 aattaattatgagagcaattttttcatttaattataatgat 28622768  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 505 - 767
Target Start/End: Original strand, 49549473 - 49549734
Alignment:
Q  505 aagggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaa 604  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49549473 aagggtccgtttgatggtcaggatagtgaggcaagatatgatacattaatcatatcctgcttaaatctcatatttgatgcaccaaagggataggataaaa 49549572  T
Q  605 taaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcct 704  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||   || |||| || ||||||  ||| |||| ||| |||||||||    
T  49549573 taaatcatttccctatcatatcctgactttcctttgtaatttatat-atgagtatagattgggttaaaagttatcctaatgggatttgaagatcattcct 49549671  T
Q  705 tatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49549672 tatttattatcttgatattctgccatttttaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcat 49549734  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 512 - 841
Target Start/End: Original strand, 19909968 - 19910297
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |  ||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||    
T  19909968 cgtttgatggttaggatagagagaca--atatgatacattaattatattgtgcttaaatatcatgtttgatgcatcaaagagataagataaaataaacca 19910065  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagat--gagattagaatatcattccttattt 709  Q
    ||| |||||| |||  |||||||||||| | |||  |||| | |||||    || |||| |||||||||  ||  |||||||||| ||||| |||||||     
T  19910066 tttttctatcgtatactgactttcctttataattgttatcctgagtatttaatgggttagaaattatcctaataagagattagaagatcatgccttatta 19910165  T
Q  710 attatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctatta-taatcaataacataccatttttacaata 808  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  19910166 attatcttgatattttgcaatttttaaaatatttatatttttaaaataataatagcatgtattttctattaataatta-taacatgccatttttataata 19910264  T
Q  809 tttaattaattatgagagcaattttttcattta 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19910265 tttaattaattatgagagcaattttttcattta 19910297  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 506 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 37347213 - 37346974
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37347213 agggtgcgtttgatggtcaggatagggagacagaatatgatacattaatcatatcttgcttaaatcttatgtttgatgcaccaaagggatatgataaaat 37347114  T
Q  606 aaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcctt 705  Q
    ||| ||||| |||||| |||  ||| |||||||||| |||| |||| | |||||| | || |||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  37347113 aaaccatttttctatcctatcctgattttcctttgtaatttctatcctgagtatacgatgggttagaaattatcatgatgggattagaagatcattcctt 37347014  T
Q  706 atttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtc 745  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  37347013 atttattatcctgatattctgccattttaaaaatattgtc 37346974  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 738 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 37346330 - 37346214
Alignment:
Q  738 atattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttct--attataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaatttttt 835  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37346330 atattgtcatttttaaaataatgatcacatgtattttctctattataattaataacatgtcatttttataatatttaattaattatgagagcaatttttt 37346231  T
Q  836 catttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||| |||||    
T  37346230 catttaattataatgat 37346214  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 513 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 10306987 - 10306758
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcat 612  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||||||  ||| |||||||||||  | | ||||| |||||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||    
T  10306987 gtttgatggtcagtataggaaaatatgatataatatattaatcatattattcataaatctcatgtttgatgcatcaaatagagagaataaaataaaccat 10306888  T
Q  613 ttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagat--tagaatatcattccttattta 710  Q
    ||  ||||  |||  ||| ||||||| || |||| |||| | |||||||||||  ||| ||| ||||  |||  |||  || || |||||| ||||||||    
T  10306887 tttcctattatatcatgattttccttcgtaatttttatcttgagtataagctgcattagaaactatcatgataggattataaaagatcatttcttattta 10306788  T
Q  711 ttatcttgatattctgttatttttaaaata 740  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  10306787 ttatcatgatattttgtcatttttaaaata 10306758  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 539 - 608
Target Start/End: Original strand, 48527377 - 48527446
Alignment:
Q  539 gatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaa 608  Q
    |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  48527377 gatatgatatatttatcatatcttgcttaaatttcatgtttgatgcatcaaaaagatatgataaaataaa 48527446  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 553 - 614
Target Start/End: Original strand, 52267631 - 52267692
Alignment:
Q  553 atcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcattt 614  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  52267631 atcatattctacttaaatttcatgttcgatgtaccaaagagatatgataaaataaatcattt 52267692  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 796 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 10306720 - 10306673
Alignment:
Q  796 catttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaatt 844  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10306720 catttttacaatatttaattaattatgagagtaa-tttttcatttaatt 10306673  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 809 - 852
Target Start/End: Original strand, 17702919 - 17702962
Alignment:
Q  809 tttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17702919 tttaattaattatgagagaaattttttcatttaattataatgat 17702962  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 732 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 49549889 - 49549853
Alignment:
Q  732 tttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatg 768  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49549889 tttaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatg 49549853  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 731 - 846
Target Start/End: Original strand, 52267876 - 52267989
Alignment:
Q  731 ttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaat 830  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||  |||||  || ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||  |||| |||    
T  52267876 ttttaaactgttgtcatttttaaaataatgatattatgtatttgttatta--attaattacatgccgtttttaaaatatttaattaattactagagtaat 52267973  T
Q  831 tttttcatttaattat 846  Q
    ||| | ||||||||||    
T  52267974 tttcttatttaattat 52267989  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 798 - 849
Target Start/End: Original strand, 4714337 - 4714388
Alignment:
Q  798 tttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgat 849  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  4714337 tttttaaaatatttaattaattacgagagtaattttgtaatttaattatgat 4714388  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 12856892 - 12856822
Alignment:
Q  687 gattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaa-aatattgtcgtttttaaaat 756  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  12856892 gattagaaaatcattctttatttattatcatgatattatgctatttttaagacgtttgtcgtttttaaaat 12856822  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 35509016 - 35508891
Alignment:
Q  526 gatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttat 625  Q
    |||||||||| |  ||| |||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| |||||   |||| |||    
T  35509016 gatagggagacagtatatgatatatttatcatattatacttaaatctcatgtttgatccactaaatagataggataaaataaaccattttcttatcctat 35508917  T
Q  626 tttgactttcctttgtcatttatatc 651  Q
    |  ||||| ||||||| |||| ||||    
T  35508916 tacgacttgcctttgtaatttttatc 35508891  T

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Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 512 - 852
Target Start/End: Original strand, 29860834 - 29861173
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    |||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  29860834 cgtttgatggccagtatagggagacatgatatgatacattaatcatattctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagagataggataaaataaacca 29860933  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 711  Q
    |||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29860934 tttccctatcatatcatgactttcctttgtaatttatatcctgagtataggctaagttagaaattatcctgatgggattagaagatcattccttatttat 29861033  T
Q  712 tatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattt 811  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29861034 tatcttgatattctgccattttt-aaatattgtcatttttaaaatagttatagcatgtattttctattataattaataacataccatttttacaatattt 29861132  T
Q  812 aattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29861133 aattaattatgaaagcaattttttcatttaattataatgat 29861173  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 513 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 33008189 - 33007853
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcat 612  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33008189 gtttgatggtcaggatagggagacaggatatgatacattaattatatcctgcttaaatatcacgtttgatagaccaaagggataggataaaataaatcat 33008090  T
Q  613 ttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttatt 712  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33008089 tt-tctatcatatcctgactttcctttgtaatttttatcctgagtataagctgggttagaaattatcctgatgggattagaagatcattccttatttatt 33007991  T
Q  713 atcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattta 812  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33007990 atcttgatattctgtcattattaaaatattgtcatttttaaaataatgataggatg--tattctattataattaataacgtgccatttttataatattta 33007893  T
Q  813 attaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33007892 attaaatatgagagcaattttttcatttaattataatgat 33007853  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 549 - 852
Target Start/End: Original strand, 33134090 - 33134392
Alignment:
Q  549 attaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttat 648  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||  |||||||||||||| |||| |    
T  33134090 attaatcatatcctgcttaaatcttatgtttaatgcaccaaagggataggataaaataaaccattttcctatcctatcctgactttcctttgtaatttct 33134189  T
Q  649 atcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtt 748  Q
    ||||| |||||| |||  |||| |||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33134190 atcatgagtataggctaggttagaaattatcct-atggaattagaagatcattccttatttattatcttgatattctgtcatttttaaaatattgtcatt 33134288  T
Q  749 tttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatga 848  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33134289 tttaaaataatgatagcatgtattttctattataattaataacatgcaatttttataatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattataa 33134388  T
Q  849 tgat 852  Q
    ||||    
T  33134389 tgat 33134392  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 513 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 15922379 - 15922041
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcat 612  Q
    ||||||||||| |||||| || | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  15922379 gtttgatggtcaggatagagatacaggatatgatacattaatcatatcttgcttaaatctcatgtttgatgcatcaaagtgatatgataaaataaattat 15922280  T
Q  613 ttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttatt 712  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||| |||| |||  | |||||  | || |||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||    
T  15922279 ttttctatcatatcatgactttcctttgtaatttctattttgagtatcggttgggttagaaattatcctgatgggattagaagatcaatccttattaatt 15922180  T
Q  713 atcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattta 812  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  15922179 atcttgatattctgcctttttttaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtattttctattataattaataatatgtcatttttacaatattta 15922080  T
Q  813 attaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15922079 attaattatgagagcaatttttt-atttaattataatgat 15922041  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 551 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 25347219 - 25346915
Alignment:
Q  551 taatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatat 650  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||| |||||||||| |||| |||    
T  25347219 taatcatatcctccttaaatctcatgtttgatgcaccaaagggataggataaaataaaccattttcctatcatatcctgattttcctttgtaatttctat 25347120  T
Q  651 cataagtataagct----------gagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaata 740  Q
    ||| ||||||||||          | |||| ||||||||| || | |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  25347119 cattagtataagctagtataagatgggttagaaattatcctgacgggattagaacatcattttttatttactatcttgatattatgccatttttaaaata 25347020  T
Q  741 ttgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcattt 840  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25347019 ttgtcatttttaaaataatgatagcatgtattttccattgtaattaataacatgccatttttacaatatttaaataattatgagagcaattttttcattt 25346920  T
Q  841 aatta 845  Q
    |||||    
T  25346919 aatta 25346915  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 513 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 7883969 - 7883647
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcat 612  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  7883969 gtttgatggtcaggatagggagacaggatatgatacattaatcatatcctgcttaaatcttatgtttgatgcatcaaagggataggataaaataaaccat 7883870  T
Q  613 ttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttatt 712  Q
    ||  ||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||  | |||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7883869 tttcctatcctattctgaatttcctttgtaatttctattctgagtataggctggattagaaattatcctgatgggattagaagatcattccttatttatt 7883770  T
Q  713 atcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattta 812  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||                 |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||    
T  7883769 atctttatattctgccatttttaa-----------------aataatgataacatgtattttctattataattaataggatgccaattttacaatattta 7883687  T
Q  813 attaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    || |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  7883686 atcaattatgagagcaattttttaataaaattataatgat 7883647  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 507 - 803
Target Start/End: Original strand, 31077809 - 31078101
Alignment:
Q  507 gggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaata 606  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31077809 gggtccgtttaatggtcaggatagacagataggatatgatacattaatcatattctacttaaatctaatgtttgatgcaccaaagggttaggataaaata 31077908  T
Q  607 aatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcctta 706  Q
    ||  ||||   |||  |||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  31077909 aactattttcttattctatcatgactttcctttgtaatttatatcctgagtataagctgagttagaaattatcctgatg-gattagaagatcattcctta 31078007  T
Q  707 tttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccattttta 803  Q
    ||||||||   |||||| | | ||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31078008 tttattat---gatattttatcattcttaaaatattttcatatttaaaataacgatagcatgtattttctattataattaataacatatcattttta 31078101  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 506 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 5868472 - 5868150
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5868472 agggtccgtttgatggtcaggatagggagacaagatatgatatattaatcacatcctacttaaatctcatgtttgatgcaccaaagagataggataaaat 5868373  T
Q  606 aaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcctt 705  Q
    ||| |||||  ||||| |||   ||||||||||||| |||| |||| | |||||  |||| |||| ||| ||||| |||| | |||||| ||||||| ||    
T  5868372 aaaccattttcctatcctatcccgactttcctttgtaatttctatcttgagtattggctgggttagaaactatcctgatg-ggttagaagatcattcgtt 5868274  T
Q  706 atttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttaca 805  Q
    |||||||||| ||||||||                 || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  5868273 atttattatcgtgatattc-----------------tgccatttttaaaataatgatatcatgtattttctattataattaattatatgccatttttaca 5868191  T
Q  806 atatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5868190 atatttcattaattatgagagtaattttttcatttaattat 5868150  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 729 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 21091242 - 21091119
Alignment:
Q  729 atttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagca 828  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21091242 atttttgaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtattttctattataattaataacatgtcacttttacaatatttaattaattatgagagca 21091143  T
Q  829 attttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  21091142 attttttcatttaattataatgat 21091119  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 506 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 42684114 - 42683807
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||    
T  42684114 agggttcgtttgatggttaggatagggagacatgatatgatacattaatcatatcctgcttaaatctcatgtttcaagcatcaaagggataagataaaat 42684015  T
Q  606 aaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcctt 705  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||| |||             || |||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||          
T  42684014 aaatcatttttctatcatatcctgactttcctttgtaatttctat-------------tgggttaaaaattatcctgatgaaattggaagacca------ 42683934  T
Q  706 atttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttaca 805  Q
      || |||||  ||||||||   |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  42683933 --tttttatcaggatattctaccatttttaaaatattgtcaatttcaaaataataataacatatattttctattataattaataacatgccatttttata 42683836  T
Q  806 atatttaattaattatgagagcaattttt 834  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||    
T  42683835 atatttaattaattatgagaacatttttt 42683807  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 550 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 21092537 - 21092372
Alignment:
Q  550 ttaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttata 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||  |||| ||||  | |||||||| ||| |||| ||    
T  21092537 ttaatcatatcctgtttaaatttcatgtttgatgcaccaaatggataggataaaatc--tcattttcctatattatcctcactttcctatgtaatttcta 21092440  T
Q  650 tcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatctt 717  Q
    || | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21092439 tcctgaatataaactgagttataaattatcctgatgagattagaatatcatttcttattcattatctt 21092372  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 525 - 651
Target Start/End: Original strand, 2498915 - 2499041
Alignment:
Q  525 ggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatctta 624  Q
    |||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  2498915 ggatagagagacgtgatatgatatattaatcatattctacttaaatatcatgtttgatgcacccaagagatatggtaaaataaatcatttttctatctta 2499014  T
Q  625 ttttgactttcctttgtcatttatatc 651  Q
    | |||||| | |||||| |||| ||||    
T  2499015 tcttgactattctttgtaatttttatc 2499041  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 796 - 852
Target Start/End: Original strand, 31078118 - 31078174
Alignment:
Q  796 catttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31078118 catttttacaatatttaattaattatgagaacaattttttcatttaattataatgat 31078174  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 741 - 826
Target Start/End: Original strand, 2499105 - 2499188
Alignment:
Q  741 ttgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagag 826  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2499105 ttgtcatttttaaaataatgatatcatgtatttgttatt-taattaattacatgccattttt-caatatttaattaattatgagag 2499188  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 805 - 849
Target Start/End: Original strand, 39705925 - 39705969
Alignment:
Q  805 aatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgat 849  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  39705925 aatatttaattaattatgagagtaattttgtcttttaattatgat 39705969  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 798 - 849
Target Start/End: Original strand, 8096097 - 8096148
Alignment:
Q  798 tttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgat 849  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8096097 tttttaaaatatttaattaataacgagagtaattttctcatttaattatgat 8096148  T

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Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 506 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 40619897 - 40619551
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40619897 agggtgcgtttgatggtcaggatagagagataggatatgatacattaatcatatcctgcttaaatctcatgtttgatgcaccaaagggatatgataaaat 40619798  T
Q  606 aaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcctt 705  Q
    ||| ||||| |||||| |||  ||||||||||| || |||| |||| | |||||| | || |||| ||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||    
T  40619797 aaaccatttttctatcatatcctgactttccttcgtaatttctatcctgagtataggttgggttagaaattatacttatgggattagaagatcattcctt 40619698  T
Q  706 atttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttaca 805  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |    
T  40619697 atttattaccttgatattctgttatttttaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtattttttattataattaataacttgccatttttata 40619598  T
Q  806 atatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40619597 atatttaattaactatgagagcaattttttcatttaattataatgat 40619551  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 544 - 852
Target Start/End: Original strand, 41595239 - 41595546
Alignment:
Q  544 gatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtca 643  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  41595239 gatacattaatcatatcgtgcttaaatctcatgtttgatgcaccaaagagattggataaaataaaccatatttctatcatattctgactttccattgtaa 41595338  T
Q  644 tttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattg 743  Q
    ||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41595339 tttctatcctgagtataagttgagttagaaattatcctgatgggattagaagatcattttttatttattatcttgatattctttcatttttaaaatattg 41595438  T
Q  744 tcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaat 843  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41595439 tcatttttaaaataatgatagcatgtattttctattataattaataacatgtcatttttataatatttaattaattatgagagcaa-tttttcatttgat 41595537  T
Q  844 tatgatgat 852  Q
    ||| |||||    
T  41595538 tataatgat 41595546  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 525 - 852
Target Start/End: Original strand, 27338700 - 27339017
Alignment:
Q  525 ggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatctta 624  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  27338700 ggatagggagataggatatgatacattaatcatatcctacttaaatctcatgtttgatgcactaaaatgatatgataaaataaaccatttttctatccta 27338799  T
Q  625 ttttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattc 724  Q
    |  |||||||||||||| |||| ||            ||||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338800 tcctgactttcctttgtaatttttag-----------gctgagttagaaatgatcctgatgggattataatatcattccttatttattatcttgatattc 27338888  T
Q  725 tgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctatt-ataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatga 823  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27338889 tgtcatttttaaaatattatcatttttaaaataatgatagcatgtattttctattaataattaataacatgtcatttttataatatttaattaattatga 27338988  T
Q  824 gagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27338989 gagcaattttttcatttaattataatgat 27339017  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 505 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 13996355 - 13996071
Alignment:
Q  505 aagggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaa 604  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  13996355 aagggtgcgtttgatggtcaggataggaagacgggatatgatacattaattatatcctccttaaatctcatgtttgatgcaccaaagggacatgataaaa 13996256  T
Q  605 taaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcct 704  Q
    |||||||| | |||||| |||  |||||||||||||| |||| |||| | |||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  13996255 taaatcatgtttctatcatatcctgactttcctttgtaatttctatcctgagtataagttgggttagaaattatcctgatgggattagaagatcattcct 13996156  T
Q  705 tatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaata 789  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  13996155 tatttattattttgatattcttccattttaaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtatttcctattataattaata 13996071  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 629 - 852
Target Start/End: Original strand, 19695769 - 19695990
Alignment:
Q  629 gactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgtt 728  Q
    |||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  19695769 gacttttctttgtaatttctatcttgagtataagctgagttagaaattatcctgatggaattagaagatcatcccttatttattatcttgatattctc-- 19695866  T
Q  729 atttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagca 828  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19695867 atttttaaaatattgtcacttttaaaataatgatagcatatattttctattataattaataacatatcatttttatactatttaattaattatgagagca 19695966  T
Q  829 attttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  19695967 attttttcatttaattataatgat 19695990  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 506 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 13349702 - 13349429
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13349702 agggtccgtttgatagtcaggataggaagacaggatatgatacattaattatatcctacttaaatctcatgtttgatgcaccaaatggataggataaaat 13349603  T
Q  606 aaatcat-ttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcct 704  Q
    |||  || |||| |||| | |  | |||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  13349602 aaacaatattct-tatcctctcctaactttcctttgtaatttctatcctaagtatatgatgagttagaaattatcctgatgcgattagaagatcattcct 13349504  T
Q  705 tatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctatt 779  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13349503 tatttattatcttgatattctgccattttttaaatattatcatttttaaaataatgatagaatgtattttctatt 13349429  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 730 - 846
Target Start/End: Original strand, 37485757 - 37485873
Alignment:
Q  730 tttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaa 829  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37485757 ttttttaaatattttcatttttaaaataatgataacatgtattttctattataattaataacatgtcatttttacgatctttaattaattatgagagcaa 37485856  T
Q  830 ttttttcatttaattat 846  Q
    |||||||||||||||||    
T  37485857 ttttttcatttaattat 37485873  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 506 - 693
Target Start/End: Original strand, 37485562 - 37485746
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  37485562 agggttcgtttgatggta-ggatagagagacaagatataatatattaatcatatcctgcttaaatctcatgtttgatgcaccaaaaagatatgataaaat 37485660  T
Q  606 aaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattaga 693  Q
    ||| |||||  ||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||  | ||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  37485661 aaaccattttcctatcatatcctgactttcctttgtaatttctatcat--gaatatgctgagttagaaattatcctgatgggattaga 37485746  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 620
Target Start/End: Original strand, 19695466 - 19695580
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  19695466 agggtgcgtttgatgatcaggatagagagacaggatatgatacattaatcatatcctacgtaaatctcatgtttgatgcaccaaatggataggctagaat 19695565  T
Q  606 aaatcatttctctat 620  Q
    ||| ||||| |||||    
T  19695566 aaaccatttttctat 19695580  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 688 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 15665417 - 15665253
Alignment:
Q  688 attagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgc-attttctattataatca 786  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||    ||||  ||||||||| |    
T  15665417 attagaagataattctttatttattatcatgattttttgtcatttttaaaatgttgacatttttaaaataacgatatcaaaatatttgttattataatta 15665318  T
Q  787 ataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  15665317 attacatgc-atttttacaatatttaattaattatgatagtaatttattcatttaaatataatgat 15665253  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 807 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 13349432 - 13349393
Alignment:
Q  807 tatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13349432 tatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 13349393  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 628 - 723
Target Start/End: Original strand, 34355880 - 34355975
Alignment:
Q  628 tgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatatt 723  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||| ||  |||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34355880 tgacttgcctttgtaatttttatcccgagtataagttggattataaattacccagataggattagaaattcattccttatttattatcatgatatt 34355975  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 781 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 13995672 - 13995630
Alignment:
Q  781 taatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatga 823  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13995672 taattaataacatgccatttttataatatttaattaattatga 13995630  T

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Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-99; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 504 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 28457982 - 28457639
Alignment:
Q  504 caagggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaa 603  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28457982 caagggtccgtttgatggtcaggatagggagacaggatatgatacattaatcatatcctgcttaaatcttgtgtttgatgcaccaaagtgatatgataaa 28457883  T
Q  604 ataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcc 703  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    |||||||||||| |||| |||| | ||      ||| |||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  28457882 ataaaccatttttctatcttatcccaactttcctttgtaatttctatcctgaga-----ctgggttagaagttatcctgatgggattagaagatcattcc 28457788  T
Q  704 ttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccattttta 803  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  28457787 ttatttattatcttgatatattgccatttttaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgcattttctattataattactaacatgtcattttta 28457688  T
Q  804 caatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28457687 caatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattataatgat 28457639  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 505 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 40701228 - 40700882
Alignment:
Q  505 aagggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaa 604  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||| |||||||    
T  40701228 aagggtccgtttgatggtcaggatagaaagacaggatatgatacattaatcatatcctgcttaaatctcatgtttgatgctccaaaagtatatgataaaa 40701129  T
Q  605 taaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcct 704  Q
    |||| ||||| ||| || |||  |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||| || |||||||||    
T  40701128 taaaccatttttctgtcatatcctgactttcctttgtaatttttatcctgagtataagctgtgttagaaattatcctgataggattataagatcattcct 40701029  T
Q  705 tatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttac 804  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||    
T  40701028 tatttatcatcttgatattatgacattttaaaaatattgtc-attttaaattaatgatagcatgtattttctattataattaataacatgtcatatttac 40700930  T
Q  805 aatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40700929 aatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattataatgat 40700882  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 531 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 21748571 - 21748263
Alignment:
Q  531 ggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttga 630  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  ||||| |||| |||    
T  21748571 ggagacatgatatgatacattaatcatattctgcttaaatctcatgtttgatgcaccaaaatgatatgataaaattaaccattttcctatcctattatga 21748472  T
Q  631 ctttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttat 730  Q
     |||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21748471 ttttcctttgtaatttctatcctaagtataggctgggttaaaaattatcctgatgagattagaagaccattccttatttattatcttgatattctgccat 21748372  T
Q  731 ttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaa----taacataccatttttacaatatttaattaattatgagag 826  Q
    ||||||                 ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  21748371 ttttaa-----------------aataatgatagcatgtattttctattataattaataattaacatgccatttttaaaatatttaattaattatgagaa 21748289  T
Q  827 caattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  21748288 caattttttcatttaattataatgat 21748263  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 706 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 4385035 - 4384895
Alignment:
Q  706 atttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttaca 805  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||| || ||||||||||| |    
T  4385035 atttattatcatgatattatgttatttttaaaatgttgtcatttttaaaataatgatatcatgtatttgatattataattaattacctaccatttttaaa 4384936  T
Q  806 atatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  4384935 atatttaaataattatgagagtaattgttttatttaattat 4384895  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 506 - 712
Target Start/End: Original strand, 33072584 - 33072790
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  33072584 agggtgcgtttgatagtcaggatagggagacaaaatatgatacattaatcatatcctatttaaatttcatgtttgatgcacctaaggaatatgataaaat 33072683  T
Q  606 aaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcctt 705  Q
    ||| |||||  ||||| |||  | | |||||||||| |||| |||| | |||||| |||  |||| ||||||||  |||  ||||| || ||||||||||    
T  33072684 aaaccattttcctatcatatcctaagtttcctttgtaatttctatcctgagtataggctaggttagaaattatcatgataggattataagatcattcctt 33072783  T
Q  706 atttatt 712  Q
    |||||||    
T  33072784 atttatt 33072790  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 512 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 7818611 - 7818464
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||    
T  7818611 cgtttgatggtcaagatagggatatatgatatgatacattaatcatattctgcttaaatctcatgtttgatacactaaagagatagaataaaataaa-ca 7818513  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtata 660  Q
    |||  ||||| |||| | |||||||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  7818512 ttttactatcctattctaactttcctttgtaatttctatcctaaatata 7818464  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 512 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 45853299 - 45853075
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||| ||||||||||  |||  |||||||||| ||    
T  45853299 cgtttgatggtcagga--gggagacagaatatgatacattaattatatccttcttaaatctcttatttgctgcaccaaagatatataataaaataaacca 45853202  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 711  Q
    |||   | || |||| ||||||||| |||| |||| |||| | |||||| |||| |||||||  ||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  45853201 ttttcttttcctattatgactttccattgtaatttttatcgtgagtataggctgggttataatctatcttgattggattaaaatatcattccttatttat 45853102  T
Q  712 tatcttgatattctgttatttttaaaa 738  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45853101 tatcgtgatattctgtcatttttaaaa 45853075  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 513 - 639
Target Start/End: Original strand, 21495053 - 21495178
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcat 612  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  21495053 gtttgatgatcacgatagggagacatgatatgatatattaatcatatcttg-ttaaatctcatgtttgatgcaccaaattgataggataaaataaacgat 21495151  T
Q  613 ttctctatcttattttgactttccttt 639  Q
    || |||||| ||| ||| |||||||||    
T  21495152 ttttctatcatatcttggctttccttt 21495178  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 732 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 45852889 - 45852779
Alignment:
Q  732 tttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaatt 831  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||  ||||  ||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45852889 tttaaaatgttttcattttttaaataatgatatcatatatttgttattataagtaattacatgtcatttttacaatatttaattaattatgagagtaata 45852790  T
Q  832 ttttcatttaa 842  Q
    |||| ||||||    
T  45852789 tttttatttaa 45852779  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 740
Target Start/End: Original strand, 21495222 - 21495268
Alignment:
Q  694 atatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaata 740  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21495222 atatcattccttatttattatcatgatattctgtcatttttaaaata 21495268  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 601
Target Start/End: Original strand, 46663163 - 46663259
Alignment:
Q  505 aagggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggata 601  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  46663163 aaggggtcgttagatggtcgggataaggagacaatatatgatacatttatcatatcatgtttaaatctcatatttgatgcaccaaacagataggata 46663259  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 596
Target Start/End: Original strand, 27488469 - 27488509
Alignment:
Q  556 atatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgata 596  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27488469 atatcctggttaaatttcatgtttgatgcaccaaagagata 27488509  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 778 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 43462913 - 43462845
Alignment:
Q  778 ttataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  43462913 ttataattaattacatgtcatttttaaaatatttaattaattacgagagtaaatttctcatttaattat 43462845  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 778 - 846
Target Start/End: Original strand, 46663420 - 46663488
Alignment:
Q  778 ttataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  46663420 ttataattaattacatgtcatttttaaaatatttaattaattacgagaataattttctcatttaattat 46663488  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 41865906 - 41865803
Alignment:
Q  511 tcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatc 610  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||  |||| ||||  ||| ||||||||    
T  41865906 tcgtttgatggcaaggatagggagataagatatgataaaattatcatatcccgcttaaatctcatatttgattcataaaagggatataatataataaatc 41865807  T
Q  611 attt 614  Q
    ||||    
T  41865806 attt 41865803  T

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Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 544 - 852
Target Start/End: Original strand, 9314806 - 9315113
Alignment:
Q  544 gatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtca 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||  ||||| |||  |||||||||||||| |    
T  9314806 gatacattaatcatatcctgcttaaatctcatgtttgatgcaccaaatggataggataaa-taaaccattttcctatcctatcctgactttcctttgtaa 9314904  T
Q  644 tttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattg 743  Q
    |||  ||| | |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||      
T  9314905 tttcaatcctgagtataggctgaattagaaattatcctggtgagattagaagatcattccttatttattatcttgatattctgccatttttaaaatatca 9315004  T
Q  744 tcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaat 843  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9315005 tcatttttaaaataatgatagcatgtattttctattataattaataaaatgccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaat 9315104  T
Q  844 tatgatgat 852  Q
    ||| |||||    
T  9315105 tataatgat 9315113  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 509 - 852
Target Start/End: Original strand, 23404450 - 23404792
Alignment:
Q  509 gttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaa 608  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23404450 gttcgattgatggccaggatagggagacatgatatgatacattaataatatcctgcataaatttcatgtttgatgcaccaaagagataggataaaataaa 23404549  T
Q  609 tcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatt 708  Q
     ||||||  |||| |||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||| ||||||||| |||    ||| || || |||||| |||    
T  23404550 ccatttccatatcatatcctgactttcctttgtaatttatatcttgagtataggctaagttagaaattatcctgattgacttaaaagattattcctaatt 23404649  T
Q  709 tattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaata 808  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23404650 tattatcttgatattctgccattttt-aaatattgtcatttttaaaatagttatagcatgtattttctattataattaataacataccatttttacaata 23404748  T
Q  809 tttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23404749 tttaatttattatgatagcaattttttcatttaattataatgat 23404792  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 505 - 852
Target Start/End: Original strand, 12255070 - 12255418
Alignment:
Q  505 aagggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaa 604  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12255070 aagggtgcgtttgatggtcaggatagggagacagaatatgatacattaatcatatcctgcttaaatctcatgtttgatgcaccaaagggatgggataaaa 12255169  T
Q  605 taaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcct 704  Q
    |||| |||||  ||||| |||| || ||||||||||| |||| ||   | |||||| |||| |||| ||||||||  |||| |||||||| || ||||||    
T  12255170 taaaccattttcctatcctattctgtctttcctttgtaatttctaatctgagtataggctgggttaaaaattatcatgatgggattagaagataattcct 12255269  T
Q  705 tatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgca-ttttctattataatcaataacataccattttta 803  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  12255270 tatttattatcttgatattctgtcctttttaaaatattgttacttttaaaataatgatagcatgtatttttttattgtaattaataacatgtcattttta 12255369  T
Q  804 caatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12255370 taatatttaattaattatgagagtaattttttcatttaattataatgat 12255418  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 513 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 10789618 - 10789279
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaa-taaatca 611  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||| |||| ||    
T  10789618 gtttgatggtcaggataaagagacagaatatgatacattaatcatattctgcttaaatttcatatttgatgcacgagagagataagataaaaataaacca 10789519  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 711  Q
    |||   ||| ||||  ||| |||||||||| |||| ||||   |||||| | || |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10789518 ttttcttattttatcctgattttcctttgtaatttctatccagagtataggttgggttataaattattctgatgggattataatatcattccttatttat 10789419  T
Q  712 tatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattt 811  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  10789418 tatcttgatattctgctatttttaaaatattgtcatttttaaaataataatagcatgtattttctattataattaataacatgccatttttataatactt 10789319  T
Q  812 aattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10789318 aattaattatgagagcaat-ttttcatttaattataatgat 10789279  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 512 - 844
Target Start/End: Original strand, 32329317 - 32329638
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  32329317 cgtttgatggtcaggatagggaggcagaatatgatacattaatcgtattctgtttaaatcgcatgtttgatgcaccaaag-gatatgataaaataaacca 32329415  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 711  Q
    |||   ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||| |||| |||||||          |||||| ||||||||||||||||    
T  32329416 ttttcatatcttatcctgactttcctttgtaatttatatcctgaatatatgctgggttagaaattat----------ttagaagatcattccttatttat 32329505  T
Q  712 tatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattt 811  Q
    ||| ||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  32329506 tatgttgatattctaccattttgaaaatattgtcatttttaaaatgatgatagcatgtattttctattataattaataacataccgtttttacaatattg 32329605  T
Q  812 aattaattatgagagcaattttttcatttaatt 844  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32329606 aattaattatgagagcaattttttcatttaatt 32329638  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 506 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 29979597 - 29979287
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| | || | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29979597 agggtccgtttgatggtcaggatcgggagaca-gaaatgatacattaatcatatcatgtttaaatctcatgtttgatgcaccaaagggatatgataaaat 29979499  T
Q  606 aaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcctt 705  Q
    ||| |||||  ||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| | ||||   |||| |||| ||||||| |   |||||||| || ||||||||||    
T  29979498 aaaccattttcctatcatattatgattttcctttgtaatttctatcctgagtaccggctgggttagaaattattc---tgagattaaaagatcattcctt 29979402  T
Q  706 atttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttaca 805  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  29979401 atttattatcttgatattctaccatttttaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtattttctatcataattaataacatgcaatttttaca 29979302  T
Q  806 atatttaattaatta 820  Q
    | |||||||||||||    
T  29979301 acatttaattaatta 29979287  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 563 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 24660938 - 24660649
Alignment:
Q  563 gcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgacttt-cctttgtcatttatatcataagtataa 661  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||  ||| |||  ||| ||||||| |||| |||| | |||||||    
T  24660938 gcttaaatctcatatttgatacaccaaagagatatgataaattaaaccatttttctatactatcttggtttttcctttgtaatttgtatcctgagtataa 24660839  T
Q  662 gctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatga 761  Q
    |||||||||  || ||||| ||   |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24660838 gctgagttaggaactatcctgaaaggattagaaaat-ataccttatttattatcatgatattctatcatttttaaaatgttgtcatttttaaaataatga 24660740  T
Q  762 tagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    || |||  ||||  ||||| ||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24660739 tatcatatatttgttattaaaattaattacatgacttttttacaatatttaattaattatgagagtaattttttcatttaattataatgat 24660649  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 747 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 391246 - 391141
Alignment:
Q  747 tttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391246 tttttaaaataattatagcatgtattttctattataattaataacatgtcatttttataatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 391147  T
Q  847 gatgat 852  Q
     |||||    
T  391146 aatgat 391141  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 514 - 611
Target Start/End: Original strand, 12267316 - 12267413
Alignment:
Q  514 tttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    |||||| ||| | ||| ||||| ||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  12267316 tttgattgtcagaatatggagacatgatattatatattaattatatcctgtttaaattttatgtttgatgcaccaaacagatatgatgaaataaatca 12267413  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 687 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 391289 - 391253
Alignment:
Q  687 gattagaatatcattccttatttattatcttgatatt 723  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  391289 gattagaagatcattccttatttattatcttgatatt 391253  T

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Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 9e-97; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 513 - 852
Target Start/End: Original strand, 43596799 - 43597138
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcat 612  Q
    ||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43596799 gtttgatggccaggatagggagtcaggatatgatacattaatcatatccgacttaaatatcatgtttgatgcacgaaagagataggataaaataaatcat 43596898  T
Q  613 ttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttatt 712  Q
    || |||||| |||   ||||||||||||| ||||||||| | ||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  43596899 ttttctatcatatcccgactttcctttgtaatttatatcctgagtatagattgagttaaaaattatcctgatgagattagaagatcactccttatttata 43596998  T
Q  713 atcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattta 812  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43596999 atctttatattctgccatttttaaaatattgtcattttaaaaataatcatagcatgtattttctattataattaataacatgccatttttaaaatattta 43597098  T
Q  813 attaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43597099 attagttatgagaacaattttttcatttaattataatgat 43597138  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 513 - 852
Target Start/End: Original strand, 16295305 - 16295642
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcat 612  Q
    |||||||||||  ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||    
T  16295305 gtttgatggtcaagatagagagacataatatgatacattaatcatatcctgcttaaatatcatgtttgatgcactaaagagatagcatacaataaacaat 16295404  T
Q  613 ttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttatt 712  Q
    ||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||  |||| ||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  16295405 ttccctatcatatcctgactttcctttgtaatttatatcctgagtatagactaggttagaaattatct-gatgggattggaagatcattccttatttatt 16295503  T
Q  713 atcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattta 812  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16295504 atcttgatattctaccatttttaaa-tattgtcatttttaaaatagttatagcatgtattttctattataattaataacataccatttttacaatattta 16295602  T
Q  813 attaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16295603 attaattatgagagcaattttttcatttaattataatgat 16295642  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 513 - 852
Target Start/End: Original strand, 16303007 - 16303344
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcat 612  Q
    |||||||||||  ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||    
T  16303007 gtttgatggtcaagatagagagacataatatgatacattaatcatatcctgcttaaatatcatgtttgatgcactaaagagatagcatacaataaacaat 16303106  T
Q  613 ttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttatt 712  Q
    ||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||  |||| ||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  16303107 ttccctatcatatcctgactttcctttgtaatttatatcctgagtatagactaggttagaaattatct-gatgggattggaagatcattccttatttatt 16303205  T
Q  713 atcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattta 812  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16303206 atcttgatattctaccatttttaaa-tattgtcatttttaaaatagttatagcatgtattttctattataattaataacataccatttttacaatattta 16303304  T
Q  813 attaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16303305 attaattatgagagcaattttttcatttaattataatgat 16303344  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 512 - 852
Target Start/End: Original strand, 37246131 - 37246466
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||    
T  37246131 cgtttgatggtaaagatagggagacatgatatgatacattaatcatatcctgcttaaatatcatgtttgatgcactaaaaagataggataaaataaccca 37246230  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 711  Q
    |||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||  |||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  37246231 tttcccta-catattctgactttcctttgtaatttatatcttgagtataggctaggttagaaattatcctgaggggattagaagatcattccttatttat 37246329  T
Q  712 tatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatattt 811  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  37246330 tatcttgatattctgccattttt-aaatattgttatttttaaaatagttataacatgtattttctattataattaataacatac---ttttacaatattt 37246425  T
Q  812 aattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37246426 aattaattatgagagcaatttattcatttaattataatgat 37246466  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 512 - 852
Target Start/End: Original strand, 15268592 - 15268932
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||    
T  15268592 cgtttgatggtcaggataaggagacaggatatgatacattaatcatatcctgctgaaatctcatgtttgatacaacaaatggataggataaaataaacca 15268691  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttat 711  Q
    |||  ||||| |||   ||||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||| |||||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  15268692 ttttcctatcctatcccgactttcctttgtaatttttattctaagtatatgctgggttagaaattatcctaatg-gattaaaagatcgttccttatttat 15268790  T
Q  712 tatcttgatattctgttatttttaaaatattgtc-gtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatt 810  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  15268791 tatcttgatattctaccatttataaaatactgtcagtgtttaaaataatgatagcatgtattttctattataattaatcacatgccatttctacaatatt 15268890  T
Q  811 taattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15268891 taattaattatgagtgcaatttttccatttaattataatgat 15268932  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 580 - 852
Target Start/End: Original strand, 40953263 - 40953535
Alignment:
Q  580 gatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatc 679  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| |||| |||||||     
T  40953263 gatgcaccaaagagatatgatgaaataaatcatttttctatcatatcctgactttcctttgtaatttttatcctgagtataggctgggttagaaattatt 40953362  T
Q  680 cagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctatt 779  Q
       ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40953363 ataatgggattagaagatcattccttatttattaccttgatattctgccctttttaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtattttttatt 40953462  T
Q  780 ataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40953463 ataattaataacatgtcatttttataatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 40953535  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 562 - 852
Target Start/End: Original strand, 27696248 - 27696536
Alignment:
Q  562 tgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataa 661  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||  ||||||||| |||| |   |||||| ||||||||| |  ||||||    
T  27696248 tgcttaaatctcatgtttgatgcaccaaatggatatgataaaataaactattttcctatcttatcttgatt---ctttgtaatttatatcctgtgtataa 27696344  T
Q  662 gctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatga 761  Q
    |||  |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27696345 gctaggttagaaattatcttgatgggattaggagatcattccttatttattatcttgatattctgtcatttttaaaatattgttatttttaaaataatga 27696444  T
Q  762 tagcatgcattttctattataatcaataacatacca-tttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27696445 tagcatgtattttctattataattaataatatgccattttttataatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattataatgat 27696536  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 506 - 711
Target Start/End: Original strand, 32962016 - 32962221
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  32962016 agggtgcgtttgatggtcaggatagggagatatgatatgatacattaatcatatcctgcttaaatctcatgtttgatgcaccaatgggatagaataaaat 32962115  T
Q  606 aaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattcctt 705  Q
    |||  ||||  ||||| |||  |||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  32962116 aaactattttcctatcatatcctgactttcctttgtaatttctatcctgagtacaagctgagttataaattatcctgatgagattagaagatcattcctc 32962215  T
Q  706 atttat 711  Q
    ||||||    
T  32962216 atttat 32962221  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 600 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 11656454 - 11656210
Alignment:
Q  600 taaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatca 699  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||| |||| | | |||| | || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||    
T  11656454 taaaataaaccatttttctatcctatcctgactttcctttgtaatttctatcctgaatataggttgggttagaaattatcctaatgagattagaagatca 11656355  T
Q  700 ttccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatt 799  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  11656354 ttccttatttattgtcttaatattctaccattttgaaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtaatttctattataat-tataacatgccatt 11656256  T
Q  800 tttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11656255 tttacaatatttaatcaattatgaaagcaa-tttttcatttaattat 11656210  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 756 - 852
Target Start/End: Original strand, 42180522 - 42180616
Alignment:
Q  756 taatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgat 852  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42180522 taatgatagcatgtattttttattataattaataacattccattttta--atatttaattaattaagagagcaatttttttatttaattataatgat 42180616  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 740
Target Start/End: Original strand, 16456456 - 16456690
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||    ||| |||| || |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16456456 agggttcgtttgatggtcaggataaggagacgaaatatgatatatcaatcatattctacttaaatatcatgtttgatgcaccaaagagataagataaaat 16456555  T
Q  606 aaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagatt-agaatatcattcct 704  Q
    |||  |||| | |||| |||  ||| || | ||||| |||  |||| | ||||||||||  |||| ||||||||  |||  |||| | ||||| ||| ||    
T  16456556 aaactatttttttatcctatcctgatttgcttttgtaattcttatcttgagtataagctacgttagaaattatcttgataggattaaaaatat-atttct 16456654  T
Q  705 tatttattatcttgatattctgttatttttaaaata 740  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  16456655 tatttatgatcatgacattctgtcatttttaaaata 16456690  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 544 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 11657067 - 11657003
Alignment:
Q  544 gatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaa 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  11657067 gatacattaatcatatcctgcttaaatctcatgtttgatgtaccaaagggatatgataaaataaa 11657003  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 549 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 8491176 - 8490895
Alignment:
Q  549 attaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttat 648  Q
    |||||||||||| || |||||| |||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| | ||||| |||| |    
T  8491176 attaatcatatcttgtttaaatatcatatttgatgtatcaaagagatatgataaaataaatcattt-tctatcttactctcacttgcatttgtaattttt 8491078  T
Q  649 atcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtt 748  Q
    ||| | || ||||| ||||||| ||||||| | |||  ||||| ||  |  |||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||                  
T  8491077 atcttgagaataagttgagttagaaattattctgataggattataaattttttccttgtttattatcatggtattatgtcattttt-------------- 8490992  T
Q  749 tttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagag-caattttttcatttaattat 846  Q
      ||||||||||||| |||| ||||  | ||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  8490991 --taaaataatgataacatggatttgttgttataattaattacatgtcatttttataatatttaattaattatgagagtaaatttttttatttaattat 8490895  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 568
Target Start/End: Original strand, 42180461 - 42180524
Alignment:
Q  505 aagggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaa 568  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  42180461 aagggtgcgtttgatggtcaggatagggagacagaatatgatacattaatcatatccagcttaa 42180524  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 796 - 846
Target Start/End: Original strand, 16456728 - 16456778
Alignment:
Q  796 catttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16456728 catttttaaaatatttaaataattatgagagtaatttttttatttaattat 16456778  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 545 - 590
Target Start/End: Original strand, 511650 - 511695
Alignment:
Q  545 atacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaa 590  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  511650 atacatttattatatcctgcttgaatttcatgtttgatgcaccaaa 511695  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 35010734 - 35010687
Alignment:
Q  676 tatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatatt 723  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35010734 tatcccgatgagattaaaagatcattccttatttattatcttgctatt 35010687  T

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Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 544 - 852
Target Start/End: Original strand, 34703033 - 34703344
Alignment:
Q  544 gatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtca 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||  ||||  ||||| |||  |||||||||||||| |    
T  34703033 gatacattaatcatatcctgcttaaatcacatgtttgatgcaccaaaagtatatgataaaataaactattttcctatcatatcctgactttcctttgtaa 34703132  T
Q  644 tttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatc-ttgatattctgttatttttaaaatatt 742  Q
    |||||||||| || ||| | || |||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  34703133 tttatatcatgaggataggttgggttagaaactatcctgatgggattagaagatcattccttatttattatctttgatattctactattttgaaaatatt 34703232  T
Q  743 gtcgtttttaaaataatgatagc--atgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcattt 840  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34703233 gtcatttttaaaataatgatagcatatgtattttctattataattaatagcataccatttttacaatatttcattaattatgagagcaattttttcattt 34703332  T
Q  841 aattatgatgat 852  Q
    |||||| |||||    
T  34703333 aattataatgat 34703344  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 512 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 18503274 - 18502936
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatca 611  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18503274 cgtttgatggtcatgatagagagatcggatatgatacattaatcatatcctgcttaaatatcatgtttgatgcaccaaagagataggataaaataaacca 18503175  T
Q  612 tttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataa--gctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttattt 709  Q
    |||  ||||| |||  ||| |||| ||||| |||| |||| | ||||||   |||| |||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||     
T  18503174 ttttcctatcctatcctgattttcatttgtaatttctatcttgagtatataggctgtgttagaaattatgctgatgggattagaagatcattctttatta 18503075  T
Q  710 attatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaata- 808  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  18503074 attatcttgatattctgccatttttgaaatattgtcatttttaaaataatgatagcatgtattttctattataattaataacatgccatttttacaatat 18502975  T
Q  809 --tttaattaattatgagagcaattttttcatttaatta 845  Q
      |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18502974 tttttaattaattatgagataatttttttcatttaatta 18502936  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 513 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 15673149 - 15672839
Alignment:
Q  513 gtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatat--cctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatc 610  Q
    |||||||||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15673149 gtttgatggtcaagatagggaggcaggatatgatacattaatcatatatcctgcttaaatctcatgtttgatgcaccaaagagataggataaaataaacc 15673050  T
Q  611 atttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttattta 710  Q
    ||||  ||||| |||  |||||||||||||  ||||||||       ||| |||| |||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15673049 attttcctatcatatcctgactttcctttgcaatttatat-------ataggctgggttagaaattatcc---tgagattagaagatcattccttattta 15672960  T
Q  711 ttatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatt 810  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15672959 ttatcttgatattctaacattttgaaaatattgttatttttaaaataatgatagcatgtattttctattataattaataacatatcatttttacaatatt 15672860  T
Q  811 taattaattatgagagcaatt 831  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15672859 taattaattatgagagcaatt 15672839  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 704 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 34866447 - 34866296
Alignment:
Q  704 ttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccattttta 803  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34866447 ttatttattatattgatattctgccatttttataatattgttatttttaaaataatgattgcatgtattttctattataattaataacatgccattttta 34866348  T
Q  804 caatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattatgatgatgtc 855  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34866347 taatatttaattaattatgagagcaattttttaatttaattataatgatgtc 34866296  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 565 - 666
Target Start/End: Original strand, 6110160 - 6110261
Alignment:
Q  565 ttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagct 664  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  6110160 ttaaatctcatgtttgatgcatcaaagggataagataaaataaatcatttttctatcctatcttaactttcctttgtaatttatatcctgagtataagct 6110259  T
Q  665 ga 666  Q
    ||    
T  6110260 ga 6110261  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 770 - 846
Target Start/End: Original strand, 6110323 - 6110398
Alignment:
Q  770 attttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6110323 attttctattataattaataacatattatttttacaatatttaattaattatgagagcaa-tttctcatttaattat 6110398  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 527 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 3480908 - 3480606
Alignment:
Q  527 atagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggata-aaataaatcatttctctatcttat 625  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  3480908 atagagagatatgatatgatatattaatcatatcatgcataaatctcatgtttaatgcatcatagtgataatatagaaataaatcattttcctatcttat 3480809  T
Q  626 tttgactttcctttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattct 725  Q
      ||| || || |||| |||| |||| | || |||| ||  |||| ||  ||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3480808 cgtgatttgccattgtaatttttatcttgagcataaactatgttagaatctatcttgatgagattagcaattcattccttatttattatcataatattct 3480709  T
Q  726 gttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataatgatagcatgcattttctattataatcaataacataccatttttacaatatttaattaattatgaga 825  Q
     | |||||                  ||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3480708 ttcatttt------------------aaaataatggtatcatgtatttgttattataattaattacatgtcatttttaaaatatttaatcaattatgaga 3480627  T
Q  826 gcaattttttcatttaattat 846  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  3480626 gtacttttttcatttaattat 3480606  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 32585946 - 32585825
Alignment:
Q  510 ttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaat 609  Q
    |||||||||||| |  |||||||||  |  ||| ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  32585946 ttcgtttgatggccacgatagggaggcaaaatatgatacaagaatcatatcctgtttaaatctcatgtttgatgcaacaaaatgatatgataaaataaat 32585847  T
Q  610 catttctctatcttattttgac 631  Q
     ||||  |||||||||| ||||    
T  32585846 aattttcctatcttattctgac 32585825  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 614
Target Start/End: Original strand, 25102600 - 25102707
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggaga-----tatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaata 606  Q
    |||||||||||| |||||||||||     ||||||| |||| ||| |||| || || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25102600 cgtttgatggtcgggatagggagacatgatatgatatgatatatttatcacattctacttaaatctcatgtttgatgcaccaaatagataggataaaata 25102699  T
Q  607 aatcattt 614  Q
    ||| ||||    
T  25102700 aattattt 25102707  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 537 - 763
Target Start/End: Original strand, 28428933 - 28429160
Alignment:
Q  537 atgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcc 636  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    |||||||  | ||||  |    
T  28428933 atgatatgataaatttatcacatcatgtttaaatcttatgtttaatgcaccaaagaaataggataaaataaattattttgtaatcttatcctaacttatc 28429032  T
Q  637 tttgtcatttatatcataagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaa 736  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||| | |  |||  |||||||||  ||  ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  28429033 tttgtaatttatattttaaatatatgttaggtttgaaattatcctaataggattataaattcattccttagttattatcatgatattctgccatttttaa 28429132  T
Q  737 aata-ttgtcgtttttaaaataatgata 763  Q
    |||| || || |||||||||||||||||    
T  28429133 aatatttctcatttttaaaataatgata 28429160  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 506 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24429450 - 24429348
Alignment:
Q  506 agggttcgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaat 605  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| || |||| || | ||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24429450 agggtttgtttgatggtcaggatagagagttaagatatgacatatctatcatatcctgtttaaatcacatgtttgatgcactaaagggataggataaaat 24429351  T
Q  606 aaa 608  Q
    |||    
T  24429350 aaa 24429348  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 696 - 740
Target Start/End: Original strand, 6110261 - 6110305
Alignment:
Q  696 atcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaata 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6110261 atcattccttatttattatcttgatattctgtcatttttaaaata 6110305  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 17508733 - 17508667
Alignment:
Q  691 agaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaata 757  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  17508733 agaagatcattccttatttattatcatgatgttctgccatttttaaaatgttgtcatttttataata 17508667  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 757
Target Start/End: Original strand, 17544481 - 17544547
Alignment:
Q  691 agaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaata 757  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  17544481 agaagatcattccttatttattatcatgatgttctgccatttttaaaatgttgtcatttttataata 17544547  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25985329 - 25985271
Alignment:
Q  14 gaagtagggttttttccactcactatgtcatgccaataaaatttgaaatgacttagctt 72  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25985329 gaagaagggttgtttccactaactatgtcatgccaatagaattttaaatggcttagctt 25985271  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 532 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 15524351 - 15524263
Alignment:
Q  532 gagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatc 621  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  15524351 gagataagatatgatatattaatcatatcttatttaaatctcatgtttggtgcaccagagtgagaggat-aaataaaccatttttctatc 15524263  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 31804816 - 31804759
Alignment:
Q  687 gattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgt 744  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31804816 gattagaaattcattccttatttattatcctgatattatgtcatttttaaaatgttgt 31804759  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 796 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 15841635 - 15841585
Alignment:
Q  796 catttttacaatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  15841635 catttataaaatatttaattaattacgagagtaattttctcatttaattat 15841585  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 805 - 846
Target Start/End: Original strand, 25102990 - 25103031
Alignment:
Q  805 aatatttaattaattatgagagcaattttttcatttaattat 846  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25102990 aatattttattgattatgagagtaattttttcatttaattat 25103031  T

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Target: scaffold0702 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 553 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 4127 - 3936
Alignment:
Q  553 atcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatca 652  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  ||||  |||||||||  | ||||  |||||| |||| ||||     
T  4127 atcatatccggcttaaatatcatgtttgatgcaccaaagaggt-ggataaaataaactatttacctatcttatcctaacttatctttgtaatttttatct 4029  T
Q  653 taagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtc 745  Q
    |||||||||| ||||||  ||| ||||  |||  ||||| ||  ||||||||| ||||||| | ||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  4028 taagtataagatgagttggaaactatcatgataggattacaaattcattccttctttattaccatgatattatatcgtttttaaaatattgtc 3936  T

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Target: scaffold0662 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:

Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 553 - 745
Target Start/End: Original strand, 3975 - 4166
Alignment:
Q  553 atcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttattttgactttcctttgtcatttatatca 652  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  ||||  |||||||||  | ||||  |||||| |||| ||||     
T  3975 atcatatccggcttaaatatcatgtttgatgcaccaaagaggt-ggataaaataaactatttacctatcttatcctaacttatctttgtaatttttatct 4073  T
Q  653 taagtataagctgagttataaattatccagatgagattagaatatcattccttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtc 745  Q
    |||||||||| ||||||  ||| ||||  |||  ||||| ||  ||||||||| ||||||| | ||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  4074 taagtataagatgagttggaaactatcatgataggattacaaattcattccttctttattaccatgatattatatcgtttttaaaatattgtc 4166  T

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Target: scaffold0817 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0817
Description:

Target: scaffold0817; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 62 - 1
Alignment:
Q  512 cgtttgatggtccggatagggagatatgatacgatacattaatcatatcctgcttaaatttc 573  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  62 cgtttgatggccaggatagggagacatgatatgatacattaatcatattctgcttaaatttc 1  T

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Target: scaffold0957 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 549 - 625
Target Start/End: Original strand, 1659 - 1735
Alignment:
Q  549 attaatcatatcctgcttaaatttcatgtttgatgcaccaaagtgataggataaaataaatcatttctctatcttat 625  Q
    |||||||||||| |  |||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1659 attaatcatatcttatttaaatcttatgtttggtgcaccaaagagataggatgaaataaatcatttttctatcttat 1735  T

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Target: scaffold0957; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 704 - 759
Target Start/End: Original strand, 1816 - 1871
Alignment:
Q  704 ttatttattatcttgatattctgttatttttaaaatattgtcgtttttaaaataat 759  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1816 ttatttattttcatgatattctatcatttttaaaattttgtcatttttaaaataat 1871  T

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