View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16699_low_19 (Length: 221)

Name: NF16699_low_19
Description: NF16699
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16699_low_19
NF16699_low_19
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (18-221)||(42805449-42805652)
chr7 (47-221)||(47716413-47716587)
chr7 (47-201)||(46354148-46354302)
chr7 (47-221)||(21172018-21172188)
chr7 (46-221)||(2541028-2541202)
chr7 (47-221)||(42798623-42798795)
chr7 (47-221)||(43557426-43557601)
chr7 (45-221)||(48735131-48735304)
chr7 (46-221)||(32758214-32758385)
chr7 (65-221)||(11617597-11617751)
chr7 (54-217)||(10693086-10693245)
chr7 (67-218)||(33871922-33872070)
chr7 (55-221)||(27629596-27629760)
chr7 (45-221)||(35334825-35334997)
chr7 (75-221)||(42391109-42391251)
chr7 (47-221)||(22698976-22699151)
chr7 (46-218)||(42476826-42476994)
chr7 (65-221)||(19426899-19427052)
chr7 (94-221)||(7879639-7879764)
chr7 (53-219)||(40463837-40464000)
chr7 (47-220)||(47077865-47078034)
chr7 (69-221)||(16341254-16341405)
chr7 (51-220)||(14732831-14732999)
chr7 (69-221)||(23419683-23419833)
chr7 (69-221)||(28362155-28362304)
chr7 (45-213)||(34626225-34626390)
chr7 (69-221)||(29907393-29907544)
chr7 (43-166)||(12473254-12473377)
chr7 (69-221)||(19265791-19265939)
chr7 (48-151)||(18326989-18327091)
chr7 (84-220)||(38262206-38262340)
chr7 (47-220)||(2662946-2663112)
chr7 (48-216)||(5180169-5180337)
chr7 (47-151)||(7193039-7193143)
chr7 (48-190)||(8148985-8149126)
chr7 (94-217)||(18512466-18512586)
chr7 (79-221)||(18747472-18747613)
chr7 (97-221)||(21566439-21566562)
chr7 (65-171)||(1423967-1424073)
chr7 (56-209)||(19266414-19266564)
chr7 (46-211)||(28078151-28078313)
chr7 (69-206)||(48123508-48123643)
chr7 (69-215)||(3469190-3469338)
chr7 (94-221)||(31591118-31591241)
chr7 (45-148)||(42495916-42496018)
chr7 (69-186)||(14099050-14099165)
chr7 (69-186)||(14409067-14409182)
chr7 (76-221)||(32233144-32233286)
chr7 (68-185)||(7644931-7645047)
chr7 (68-218)||(39123865-39124018)
chr7 (115-221)||(38604549-38604653)
chr7 (72-221)||(11741774-11741919)
chr7 (68-210)||(13805077-13805216)
chr7 (52-150)||(7794582-7794682)
chr7 (47-139)||(21447544-21447636)
chr7 (94-185)||(35203440-35203531)
chr7 (70-166)||(6736867-6736962)
chr7 (123-220)||(1408487-1408582)
chr7 (69-215)||(42101899-42102044)
chr7 (69-150)||(5814447-5814528)
chr7 (145-221)||(27889325-27889399)
chr7 (118-221)||(35787278-35787378)
chr7 (136-215)||(33500556-33500635)
chr7 (123-219)||(23231587-23231681)
chr7 (56-165)||(44123685-44123792)
chr7 (68-160)||(22065563-22065654)
chr7 (50-150)||(29140438-29140538)
chr7 (145-218)||(45018935-45019010)
chr7 (115-221)||(27697459-27697565)
chr7 (129-219)||(13792161-13792250)
chr7 (50-221)||(25198679-25198852)
chr7 (136-221)||(39093448-39093532)
chr7 (130-186)||(17048859-17048914)
chr7 (124-219)||(25434050-25434144)
chr7 (124-217)||(21139761-21139851)
chr7 (183-221)||(36602535-36602573)
chr7 (168-217)||(45811920-45811969)
[»] chr1 (84 HSPs)
chr1 (47-221)||(20004099-20004273)
chr1 (53-219)||(30395737-30395903)
chr1 (47-221)||(46991781-46991953)
chr1 (47-221)||(18944620-18944795)
chr1 (46-221)||(34725107-34725278)
chr1 (65-216)||(23768334-23768483)
chr1 (47-218)||(32632569-32632737)
chr1 (47-221)||(10668197-10668376)
chr1 (47-221)||(46247962-46248134)
chr1 (46-216)||(27201623-27201793)
chr1 (45-221)||(14617013-14617187)
chr1 (47-218)||(47214488-47214655)
chr1 (89-221)||(35005142-35005274)
chr1 (47-221)||(45812546-45812716)
chr1 (52-221)||(18741966-18742137)
chr1 (44-218)||(19932765-19932936)
chr1 (66-219)||(6925096-6925247)
chr1 (47-221)||(38478291-38478461)
chr1 (53-217)||(12126850-12127010)
chr1 (69-210)||(18724565-18724704)
chr1 (52-221)||(45402077-45402245)
chr1 (69-221)||(35117774-35117927)
chr1 (41-217)||(41319819-41319993)
chr1 (51-221)||(19414420-19414586)
chr1 (46-220)||(27474257-27474428)
chr1 (72-221)||(9939463-9939613)
chr1 (46-221)||(8197019-8197192)
chr1 (70-208)||(25468285-25468421)
chr1 (70-218)||(19701570-19701717)
chr1 (94-218)||(45264411-45264534)
chr1 (69-220)||(2435796-2435946)
chr1 (84-220)||(35253197-35253329)
chr1 (69-221)||(35019229-35019378)
chr1 (131-221)||(4349699-4349787)
chr1 (69-220)||(27136661-27136811)
chr1 (69-210)||(11596512-11596650)
chr1 (102-218)||(22324925-22325039)
chr1 (70-221)||(44485119-44485267)
chr1 (47-185)||(22930114-22930248)
chr1 (115-221)||(23796510-23796614)
chr1 (70-221)||(39214967-39215117)
chr1 (50-200)||(25290143-25290300)
chr1 (56-185)||(17470390-17470517)
chr1 (68-221)||(15511157-15511311)
chr1 (72-176)||(22327101-22327204)
chr1 (69-181)||(33222983-33223093)
chr1 (67-166)||(4430088-4430187)
chr1 (68-221)||(6983820-6983969)
chr1 (135-221)||(10378744-10378828)
chr1 (68-221)||(20036218-20036369)
chr1 (115-221)||(31382223-31382326)
chr1 (134-220)||(42304217-42304303)
chr1 (136-221)||(43768205-43768288)
chr1 (156-221)||(50606487-50606552)
chr1 (123-221)||(1517320-1517417)
chr1 (115-216)||(43207540-43207640)
chr1 (69-217)||(50811938-50812085)
chr1 (46-121)||(34714599-34714674)
chr1 (48-166)||(24564322-24564440)
chr1 (69-167)||(50760287-50760385)
chr1 (133-221)||(31442398-31442485)
chr1 (56-138)||(2435983-2436064)
chr1 (49-111)||(40424721-40424783)
chr1 (134-214)||(6358185-6358264)
chr1 (126-221)||(20999859-20999952)
chr1 (170-217)||(33594144-33594191)
chr1 (138-219)||(15505632-15505710)
chr1 (115-221)||(19656114-19656219)
chr1 (117-210)||(20169109-20169200)
chr1 (168-221)||(4587572-4587625)
chr1 (89-221)||(23371143-23371271)
chr1 (116-221)||(34679224-34679331)
chr1 (142-218)||(7074588-7074663)
chr1 (115-221)||(34148969-34149073)
chr1 (56-218)||(52910204-52910370)
chr1 (168-221)||(30555211-30555264)
chr1 (80-157)||(31272446-31272522)
chr1 (89-217)||(19974087-19974213)
chr1 (133-221)||(46859129-46859216)
chr1 (168-218)||(1693222-1693273)
chr1 (134-186)||(21910693-21910743)
chr1 (116-157)||(25027989-25028030)
chr1 (177-218)||(28894570-28894611)
chr1 (48-160)||(18335914-18336026)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (47-221)||(7136536-7136710)
chr8 (46-218)||(36720749-36720919)
chr8 (45-221)||(6760775-6760950)
chr8 (46-221)||(28817635-28817808)
chr8 (45-221)||(39461003-39461179)
chr8 (47-217)||(26954086-26954257)
chr8 (47-221)||(44530103-44530275)
chr8 (47-221)||(12670259-12670429)
chr8 (45-221)||(25250474-25250650)
chr8 (47-221)||(29521694-29521866)
chr8 (47-221)||(35261633-35261805)
chr8 (46-221)||(30454106-30454277)
chr8 (51-221)||(20284078-20284250)
chr8 (46-221)||(13160655-13160827)
chr8 (45-218)||(2626471-2626645)
chr8 (51-221)||(21070706-21070879)
chr8 (47-221)||(45071219-45071390)
chr8 (69-217)||(44781517-44781665)
chr8 (65-218)||(8897776-8897927)
chr8 (65-221)||(12625861-12626016)
chr8 (115-221)||(20869945-20870051)
chr8 (46-221)||(17823529-17823702)
chr8 (123-221)||(16225049-16225147)
chr8 (47-207)||(20869523-20869677)
chr8 (97-221)||(8483947-8484069)
chr8 (46-221)||(18164769-18164941)
chr8 (48-221)||(44742527-44742698)
chr8 (115-218)||(29877116-29877217)
chr8 (69-218)||(22598133-22598279)
chr8 (99-221)||(5135299-5135418)
chr8 (70-219)||(24365071-24365218)
chr8 (48-186)||(11748254-11748392)
chr8 (75-220)||(31457155-31457297)
chr8 (56-221)||(28407379-28407529)
chr8 (94-220)||(389644-389770)
chr8 (123-217)||(17250888-17250982)
chr8 (72-185)||(35105902-35106014)
chr8 (117-190)||(43942348-43942421)
chr8 (47-211)||(24245405-24245565)
chr8 (69-216)||(42083712-42083858)
chr8 (123-220)||(5689661-5689756)
chr8 (46-219)||(40604917-40605087)
chr8 (123-221)||(10857858-10857955)
chr8 (154-221)||(16013515-16013582)
chr8 (135-217)||(19729382-19729462)
chr8 (69-209)||(14017989-14018128)
chr8 (79-186)||(23000263-23000365)
chr8 (153-221)||(26102577-26102643)
chr8 (71-166)||(36918102-36918197)
chr8 (72-152)||(30962849-30962929)
chr8 (69-182)||(11000997-11001109)
chr8 (140-221)||(26457776-26457853)
chr8 (170-221)||(27507985-27508036)
chr8 (117-221)||(33866973-33867078)
chr8 (68-111)||(40607841-40607884)
chr8 (45-87)||(23286434-23286476)
chr8 (168-221)||(35107320-35107373)
chr8 (181-221)||(27468101-27468141)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (47-221)||(13730611-13730785)
chr3 (46-221)||(40272821-40272994)
chr3 (47-220)||(46421044-46421218)
chr3 (45-221)||(13628799-13628976)
chr3 (48-217)||(29366733-29366902)
chr3 (45-211)||(8247706-8247872)
chr3 (46-213)||(9607178-9607345)
chr3 (45-221)||(1217064-1217236)
chr3 (47-221)||(12914044-12914216)
chr3 (115-221)||(49013482-49013588)
chr3 (47-219)||(6411833-6412002)
chr3 (46-221)||(5173728-5173903)
chr3 (46-221)||(22609742-22609913)
chr3 (69-221)||(53996574-53996725)
chr3 (46-221)||(39203491-39203662)
chr3 (129-221)||(353358-353450)
chr3 (70-217)||(34420656-34420802)
chr3 (82-221)||(45139487-45139624)
chr3 (115-221)||(14987001-14987107)
chr3 (69-218)||(26573125-26573272)
chr3 (92-220)||(45948848-45948974)
chr3 (51-221)||(22122926-22123092)
chr3 (79-221)||(516417-516560)
chr3 (47-221)||(52926228-52926391)
chr3 (65-221)||(26869701-26869854)
chr3 (89-218)||(54374357-54374485)
chr3 (46-217)||(16735416-16735584)
chr3 (42-180)||(4495714-4495850)
chr3 (117-221)||(45786223-45786327)
chr3 (99-218)||(10795435-10795554)
chr3 (46-221)||(7696901-7697067)
chr3 (74-217)||(7942993-7943134)
chr3 (82-180)||(54032609-54032705)
chr3 (47-152)||(10870028-10870132)
chr3 (70-218)||(25944468-25944615)
chr3 (115-221)||(54484734-54484839)
chr3 (100-221)||(31592878-31592995)
chr3 (48-221)||(25517179-25517353)
chr3 (73-210)||(30928167-30928302)
chr3 (82-214)||(33926094-33926224)
chr3 (44-167)||(45620889-45621012)
chr3 (135-221)||(34771373-34771457)
chr3 (123-221)||(15797274-15797368)
chr3 (69-221)||(19731000-19731150)
chr3 (46-218)||(12525385-12525552)
chr3 (116-220)||(829452-829555)
chr3 (123-211)||(9276316-9276401)
chr3 (117-192)||(47624088-47624160)
chr3 (117-221)||(55401222-55401325)
chr3 (168-221)||(24851310-24851363)
chr3 (50-163)||(21874999-21875106)
chr3 (50-166)||(26782345-26782461)
chr3 (69-145)||(53062036-53062112)
chr3 (77-210)||(8410887-8411016)
chr3 (170-221)||(30452892-30452943)
chr3 (123-221)||(44403564-44403661)
chr3 (69-221)||(19751576-19751726)
chr3 (115-218)||(31904868-31904970)
chr3 (168-221)||(35417999-35418052)
chr3 (73-162)||(39211992-39212081)
chr3 (115-216)||(43114882-43114983)
chr3 (79-166)||(52428539-52428627)
chr3 (54-218)||(33235513-33235676)
chr3 (69-143)||(35417914-35417988)
chr3 (116-221)||(50624962-50625065)
chr3 (168-220)||(24577930-24577982)
chr3 (123-221)||(26292384-26292478)
chr3 (115-166)||(31831243-31831292)
chr3 (168-216)||(40968613-40968661)
chr3 (175-221)||(10484625-10484671)
chr3 (45-86)||(9276248-9276289)
chr3 (168-221)||(24578020-24578073)
chr3 (77-166)||(29106555-29106644)
chr3 (43-111)||(4537003-4537071)
chr3 (108-180)||(16130312-16130383)
chr3 (70-178)||(32418221-32418329)
chr3 (168-216)||(46169981-46170029)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (50-221)||(4619113-4619284)
chr5 (46-221)||(38879534-38879709)
chr5 (42-221)||(41014268-41014444)
chr5 (47-221)||(24448844-24449016)
chr5 (50-221)||(43334159-43334330)
chr5 (73-219)||(12006339-12006485)
chr5 (50-216)||(27328709-27328875)
chr5 (47-221)||(35710267-35710437)
chr5 (47-221)||(8169993-8170163)
chr5 (102-221)||(13801776-13801895)
chr5 (115-221)||(20135626-20135732)
chr5 (80-221)||(32703411-32703548)
chr5 (46-210)||(22600407-22600569)
chr5 (47-221)||(1565385-1565557)
chr5 (46-152)||(23974734-23974839)
chr5 (69-214)||(28516449-28516593)
chr5 (46-158)||(37024626-37024736)
chr5 (69-221)||(208936-209086)
chr5 (69-221)||(39301099-39301249)
chr5 (46-216)||(22187238-22187408)
chr5 (96-221)||(43574609-43574732)
chr5 (97-190)||(41425952-41426043)
chr5 (115-221)||(7368420-7368522)
chr5 (118-221)||(16880656-16880757)
chr5 (68-217)||(19142956-19143102)
chr5 (89-220)||(42924840-42924973)
chr5 (76-220)||(1405170-1405312)
chr5 (48-207)||(2838733-2838890)
chr5 (115-221)||(29334417-29334522)
chr5 (77-220)||(1850624-1850764)
chr5 (139-221)||(34154823-34154903)
chr5 (117-218)||(7097772-7097870)
chr5 (159-220)||(25622524-25622585)
chr5 (65-221)||(30006297-30006451)
chr5 (115-210)||(24323725-24323818)
chr5 (115-210)||(24360349-24360442)
chr5 (135-220)||(9794388-9794471)
chr5 (154-221)||(16957375-16957440)
chr5 (50-219)||(22861680-22861844)
chr5 (97-221)||(11657708-11657835)
chr5 (115-221)||(12575669-12575775)
chr5 (78-190)||(22907904-22908014)
chr5 (133-221)||(3771379-3771465)
chr5 (170-221)||(39801591-39801642)
chr5 (171-221)||(16028633-16028683)
chr5 (89-151)||(22025539-22025601)
chr5 (129-218)||(31694120-31694207)
chr5 (155-211)||(10306493-10306548)
chr5 (115-221)||(5873331-5873434)
chr5 (166-221)||(30877573-30877628)
chr5 (144-218)||(12477132-12477205)
chr5 (73-221)||(34074573-34074717)
chr5 (73-150)||(10634224-10634301)
chr5 (117-221)||(24903705-24903807)
chr5 (68-109)||(31362454-31362495)
chr5 (71-186)||(24313617-24313732)
chr5 (71-186)||(24355954-24356069)
chr5 (166-218)||(29297862-29297914)
chr5 (174-221)||(10943854-10943900)
chr5 (168-219)||(21784343-21784394)
chr5 (52-87)||(31299591-31299626)
chr5 (168-218)||(4654427-4654477)
chr5 (47-85)||(19438703-19438741)
chr5 (69-111)||(39079883-39079925)
chr5 (130-183)||(2432342-2432395)
chr5 (45-85)||(41956884-41956924)
[»] chr4 (94 HSPs)
chr4 (47-221)||(21646918-21647092)
chr4 (54-221)||(16408610-16408777)
chr4 (47-221)||(23501747-23501915)
chr4 (47-221)||(13256408-13256578)
chr4 (46-221)||(20224937-20225108)
chr4 (46-221)||(6430635-6430807)
chr4 (46-217)||(5648212-5648380)
chr4 (45-221)||(48598834-48599006)
chr4 (47-221)||(47528539-47528709)
chr4 (50-213)||(16911519-16911682)
chr4 (46-217)||(30639333-30639501)
chr4 (47-216)||(37494805-37494972)
chr4 (47-211)||(10660358-10660521)
chr4 (47-211)||(10874503-10874666)
chr4 (66-221)||(44363139-44363294)
chr4 (68-220)||(19027823-19027973)
chr4 (47-216)||(20405047-20405210)
chr4 (43-221)||(5306669-5306848)
chr4 (69-221)||(35567146-35567296)
chr4 (47-221)||(11054157-11054327)
chr4 (73-211)||(17043413-17043549)
chr4 (66-220)||(40915802-40915953)
chr4 (115-221)||(20639667-20639772)
chr4 (50-214)||(14983791-14983953)
chr4 (138-221)||(20225119-20225202)
chr4 (73-221)||(54175043-54175191)
chr4 (65-221)||(8473629-8473783)
chr4 (79-210)||(25463108-25463237)
chr4 (94-217)||(47443958-47444079)
chr4 (69-219)||(54730225-54730376)
chr4 (48-221)||(54966977-54967145)
chr4 (71-218)||(30690188-30690340)
chr4 (124-221)||(48327772-48327869)
chr4 (115-221)||(9987843-9987947)
chr4 (52-219)||(30352591-30352767)
chr4 (89-221)||(29207907-29208035)
chr4 (71-221)||(9832322-9832468)
chr4 (71-214)||(30581481-30581624)
chr4 (46-179)||(14590790-14590922)
chr4 (115-221)||(25629071-25629175)
chr4 (69-212)||(39029078-39029220)
chr4 (56-221)||(487135-487306)
chr4 (68-218)||(25343162-25343312)
chr4 (72-212)||(49938611-49938746)
chr4 (117-220)||(51865048-51865149)
chr4 (69-217)||(20908649-20908797)
chr4 (72-219)||(30496333-30496476)
chr4 (74-221)||(39077805-39077948)
chr4 (47-221)||(55766475-55766647)
chr4 (71-221)||(32478801-32478942)
chr4 (135-221)||(16494259-16494345)
chr4 (76-217)||(41018807-41018945)
chr4 (50-155)||(17315372-17315476)
chr4 (153-221)||(33836496-33836564)
chr4 (69-153)||(43035224-43035308)
chr4 (69-152)||(42164225-42164307)
chr4 (115-217)||(21489109-21489210)
chr4 (47-218)||(55830733-55830902)
chr4 (76-207)||(7385499-7385628)
chr4 (69-192)||(47441568-47441689)
chr4 (70-210)||(3580860-3580994)
chr4 (45-109)||(5313113-5313177)
chr4 (115-221)||(7909289-7909393)
chr4 (169-221)||(32484307-32484359)
chr4 (165-221)||(38755917-38755973)
chr4 (115-209)||(49796820-49796911)
chr4 (71-184)||(23580253-23580365)
chr4 (168-221)||(28494224-28494277)
chr4 (168-221)||(38786682-38786735)
chr4 (73-165)||(51420553-51420646)
chr4 (68-192)||(44357195-44357318)
chr4 (130-220)||(10277767-10277855)
chr4 (117-218)||(12711461-12711561)
chr4 (115-221)||(36589765-36589870)
chr4 (168-221)||(11394925-11394978)
chr4 (168-221)||(11404652-11404705)
chr4 (44-101)||(29879624-29879681)
chr4 (137-220)||(2813169-2813253)
chr4 (81-217)||(7038041-7038174)
chr4 (102-185)||(17079696-17079777)
chr4 (78-214)||(32629285-32629418)
chr4 (169-221)||(40553946-40553998)
chr4 (169-221)||(44718641-44718693)
chr4 (165-216)||(8820578-8820629)
chr4 (170-221)||(19027986-19028037)
chr4 (127-186)||(35894505-35894563)
chr4 (134-221)||(36816393-36816479)
chr4 (162-216)||(47482864-47482918)
chr4 (179-221)||(56322984-56323026)
chr4 (168-221)||(25388249-25388302)
chr4 (69-138)||(54640429-54640498)
chr4 (165-221)||(50555665-50555721)
chr4 (50-87)||(18969698-18969735)
chr4 (180-221)||(35532077-35532118)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (46-221)||(14530271-14530446)
chr2 (42-221)||(10543647-10543826)
chr2 (47-219)||(5840982-5841154)
chr2 (47-221)||(8455325-8455497)
chr2 (48-221)||(24200632-24200805)
chr2 (49-220)||(11514392-11514560)
chr2 (39-221)||(21779270-21779448)
chr2 (46-221)||(25079726-25079900)
chr2 (45-221)||(23397718-23397890)
chr2 (47-221)||(9671134-9671305)
chr2 (47-220)||(12023929-12024099)
chr2 (65-221)||(17667974-17668128)
chr2 (45-221)||(25249747-25249920)
chr2 (68-221)||(40416880-40417031)
chr2 (65-217)||(17623536-17623686)
chr2 (67-221)||(39914315-39914467)
chr2 (84-221)||(10546153-10546289)
chr2 (44-192)||(22371008-22371151)
chr2 (71-218)||(31158451-31158598)
chr2 (68-210)||(32781308-32781448)
chr2 (49-216)||(17896215-17896381)
chr2 (47-218)||(7214488-7214659)
chr2 (84-218)||(14444720-14444851)
chr2 (47-165)||(17705449-17705567)
chr2 (49-218)||(19977726-19977893)
chr2 (69-210)||(33795261-33795400)
chr2 (69-219)||(21377085-21377232)
chr2 (48-218)||(14544018-14544189)
chr2 (69-221)||(4516360-4516510)
chr2 (53-221)||(27573581-27573746)
chr2 (71-185)||(5450263-5450376)
chr2 (82-218)||(19614981-19615116)
chr2 (65-220)||(24859998-24860149)
chr2 (69-211)||(44521392-44521532)
chr2 (70-214)||(99281-99421)
chr2 (115-221)||(36871515-36871617)
chr2 (115-221)||(40762243-40762347)
chr2 (68-221)||(44643497-44643649)
chr2 (133-217)||(24890451-24890533)
chr2 (69-192)||(23145736-23145857)
chr2 (69-192)||(23557526-23557647)
chr2 (64-147)||(44604825-44604907)
chr2 (73-221)||(17380247-17380391)
chr2 (47-220)||(26684630-26684803)
chr2 (69-166)||(29419947-29420048)
chr2 (115-218)||(30826059-30826158)
chr2 (87-220)||(17471542-17471675)
chr2 (78-220)||(25641487-25641626)
chr2 (128-221)||(25632544-25632635)
chr2 (156-221)||(23488544-23488609)
chr2 (117-218)||(44449395-44449495)
chr2 (169-221)||(41409936-41409988)
chr2 (176-219)||(3633719-3633762)
chr2 (170-221)||(34080176-34080227)
chr2 (58-214)||(45235833-45235988)
chr2 (102-215)||(15296421-15296533)
chr2 (169-221)||(40579758-40579810)
chr2 (170-221)||(34766330-34766381)
chr2 (179-221)||(39189513-39189555)
chr2 (46-92)||(39189557-39189603)
chr2 (142-214)||(13245111-13245181)
chr2 (168-217)||(31523304-31523353)
chr2 (168-220)||(31525779-31525831)
chr2 (166-220)||(1289093-1289148)
chr2 (168-217)||(4794875-4794924)
chr2 (136-213)||(19185760-19185837)
chr2 (94-166)||(12315714-12315785)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (65-221)||(12221923-12222080)
chr6 (46-221)||(29355864-29356040)
chr6 (47-221)||(1346918-1347088)
chr6 (47-221)||(1354766-1354936)
chr6 (65-221)||(2166419-2166575)
chr6 (65-221)||(2178052-2178208)
chr6 (44-218)||(9161074-9161247)
chr6 (41-221)||(14975099-14975267)
chr6 (47-181)||(1941809-1941941)
chr6 (65-198)||(6024205-6024338)
chr6 (49-221)||(3815086-3815256)
chr6 (45-161)||(8409195-8409311)
chr6 (48-166)||(13905041-13905158)
chr6 (50-218)||(32728169-32728334)
chr6 (89-217)||(7947384-7947511)
chr6 (157-221)||(12892071-12892135)
chr6 (51-163)||(20400625-20400737)
chr6 (58-208)||(14553477-14553626)
chr6 (47-217)||(15866052-15866218)
chr6 (115-221)||(26097182-26097284)
chr6 (115-221)||(25557747-25557849)
chr6 (69-220)||(2755430-2755583)
chr6 (123-221)||(19340858-19340954)
chr6 (98-219)||(33138838-33138957)
chr6 (65-214)||(24097553-24097696)
chr6 (149-221)||(12885967-12886039)
chr6 (69-221)||(12889402-12889553)
chr6 (94-221)||(18277202-18277327)
chr6 (71-220)||(28007604-28007750)
chr6 (46-158)||(22967124-22967235)
chr6 (46-158)||(23821158-23821269)
chr6 (142-213)||(32579474-32579543)
chr6 (51-219)||(23930138-23930303)
chr6 (51-212)||(24734591-24734760)
chr6 (117-221)||(9671093-9671196)
chr6 (115-186)||(11849075-11849145)
chr6 (89-221)||(17432336-17432474)
chr6 (175-214)||(20906802-20906841)
chr6 (89-220)||(3116139-3116262)
chr6 (167-221)||(6808467-6808521)
chr6 (121-183)||(32068121-32068182)
chr6 (50-111)||(12063424-12063485)
chr6 (94-158)||(17448325-17448389)
chr6 (79-217)||(23240837-23240971)
chr6 (156-221)||(13267788-13267851)
chr6 (154-221)||(383769-383834)
chr6 (150-221)||(16895706-16895778)
chr6 (153-220)||(16915996-16916064)
chr6 (115-183)||(31990096-31990163)
chr6 (47-111)||(33922945-33923009)
chr6 (170-221)||(10734914-10734965)
chr6 (170-220)||(11395836-11395886)
chr6 (126-184)||(24751119-24751176)
chr6 (65-121)||(8417444-8417500)
chr6 (132-164)||(14341134-14341166)
chr6 (134-190)||(18254559-18254613)
chr6 (175-211)||(29016301-29016337)
[»] scaffold0057 (4 HSPs)
scaffold0057 (68-221)||(46806-46957)
scaffold0057 (45-216)||(24786-24950)
scaffold0057 (140-216)||(46721-46796)
scaffold0057 (115-217)||(43681-43780)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (56-217)||(10773-10932)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (52-221)||(58936-59105)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (47-221)||(30533-30703)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (49-221)||(13033-13202)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (68-218)||(1599-1745)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (50-221)||(10059-10226)
scaffold0187 (50-221)||(20387-20554)
scaffold0187 (46-111)||(8898-8963)
scaffold0187 (46-111)||(19226-19291)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (65-192)||(4129-4257)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (54-218)||(11093-11252)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (102-221)||(48643-48758)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (46-179)||(226456-226588)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (141-220)||(24143-24220)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (124-218)||(72879-72971)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (47-185)||(35062-35200)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (45-111)||(83827-83893)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (100-191)||(23606-23695)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (69-180)||(32906-33016)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (67-137)||(8865-8935)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (123-219)||(3574-3668)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (48-111)||(24619-24682)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (65-137)||(43101-43173)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 42805449 - 42805652
Alignment:
Q  18 ttaattttattagggaaaattataaaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgaggga 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  42805449 ttaattttattagtgaaaattataaaaatgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgga 42805548  T
Q  118 aacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805549 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 42805648  T
Q  218 cggg 221  Q
    ||||    
T  42805649 cggg 42805652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 47716413 - 47716587
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47716413 gaggggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 47716512  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47716513 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccggg 47716587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 46354148 - 46354302
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46354148 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46354247  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46354248 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21172188 - 21172018
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  21172188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 21172091  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21172090 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 21172018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2541202 - 2541028
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaa-ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2541202 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 2541103  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2541102 aaggctgcgtactatacacca--aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 2541028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 42798623 - 42798795
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  42798623 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaa 42798722  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42798723 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcggg 42798795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 43557426 - 43557601
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43557426 gaggggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaa 43557525  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43557526 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccggg 43557601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48735304 - 48735131
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgag-ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 143  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  48735304 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgtaaaacac--gg 48735207  T
Q  144 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48735206 taaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 48735131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 32758214 - 32758385
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  32758214 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 32758311  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32758312 aggctgtgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 32758385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11617751 - 11617597
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11617751 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 11617652  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  11617651 a--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccggg 11617597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10693245 - 10693086
Alignment:
Q  54 aaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 153  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||     
T  10693245 aaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaagagggtaaggctgcg 10693148  T
Q  154 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10693147 tacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 10693086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871922
Alignment:
Q  67 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaggataaggctgcgtacaatacacca- 33871973  T
Q  167 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  33871972 -aatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcacc 33871922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 221
Target Start/End: Original strand, 27629596 - 27629760
Alignment:
Q  55 accttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcat 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27629596 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgt 27629695  T
Q  155 acaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27629696 aaaatacacca--aatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccggg 27629760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35334997 - 35334825
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  35334997 atgagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaaca--gtctcgtgtaaaaaacagggt 35334900  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| |||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  35334899 aagactgtgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 35334825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391109
Alignment:
Q  75 gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtg 174  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtg 42391156  T
Q  175 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42391155 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 42391109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22699151 - 22698976
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22699151 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 22699052  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  22699051 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 22698976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 218
Target Start/End: Original strand, 42476826 - 42476994
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||   |||||||  |||||||||  |||||| ||||    
T  42476826 tgaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgt--aaaacaaggta 42476923  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  42476924 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagctctagtgcacc 42476994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19427052 - 19426899
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  19427052 aactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacacc 19426953  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |  |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19426952 a--aatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccggg 19426899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 221
Target Start/End: Original strand, 7879639 - 7879764
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 193  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||     
T  7879639 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccct 7879736  T
Q  194 gcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  7879737 gcgtatgcgggagcttcagtgcaccggg 7879764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 219
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464000
Alignment:
Q  53 taaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 152  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgt-aaaaactgggtaaggctgc 40463935  T
Q  153 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
     || |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  40463936 gtataatacacca--aatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccg 40464000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47078034 - 47077865
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||  |||| || ||||    
T  47078034 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaatagagtaa 47077937  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
     | ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  47077936 agttgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgg 47077865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341405
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaa-a 16341352  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| || |||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16341353 atggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccggg 16341405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732831
Alignment:
Q  51 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 150  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||   ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggct 14732900  T
Q  151 gcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    || | ||||||||||| |||||||  || |||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  14732899 gcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcaccgg 14732831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23419833 - 23419683
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |    
T  23419833 ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca--a 23419736  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || | |||||| ||||||||||| ||||    
T  23419735 atggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgcatcggg 23419683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28362304 - 28362155
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  28362304 ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgtacaatacacca--a 28362207  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28362206 atggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagcttt-gtgcaccggg 28362155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34626390 - 34626225
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| | |||||||   ||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  34626390 atgaggggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgt-aaaaacagggt 34626292  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 213  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  34626291 aaggctgcgttcaatacacca--aatggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagt 34626225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907544
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgt--catgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  167 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  29907493 -aatggtgggaccccatcccggaccctg--tatgcgggagctttagtgcaccggg 29907544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 166
Target Start/End: Original strand, 12473254 - 12473377
Alignment:
Q  43 aaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagg 142  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||    
T  12473254 aaatgaggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagg 12473353  T
Q  143 gtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
T  12473354 gtaaggatgcgtacaatacaccaa 12473377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 19265791 - 19265939
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  19265791 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgt-aaaaagagggtaaggctgcgtacaatacacca--a 19265887  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19265888 atggtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccggg 19265939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 151
Target Start/End: Original strand, 18326989 - 18327091
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18326989 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaag 18327087  T
Q  148 gctg 151  Q
    ||||    
T  18327088 gctg 18327091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262206
Alignment:
Q  84 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacacca--aatgatgggacccctt 38262243  T
Q  184 cccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||  || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  38262242 cccgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 38262206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2663112 - 2662946
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  2663112 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 2663017  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2663016 ggctgcgtacaatacacca--aatggtggga-cccttttcagaccctgcatatgcgggagctctagcgcaccgg 2662946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5180337 - 5180169
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5180337 aggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaag 5180238  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
     |||  ||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||| | ||  | ||||| ||||||||| ||||    
T  5180237 actgtgtacaacacaccaaaaatgattggacccctttccaaatcctacgtatgcaggagctttaatgca 5180169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 151
Target Start/End: Original strand, 7193039 - 7193143
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| || | |||||    
T  7193039 gaggggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaacaatatggtaa 7193138  T
Q  147 ggctg 151  Q
    |||||    
T  7193139 ggctg 7193143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8149126 - 8148985
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtg-taaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||   | |||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  8149126 aggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaa 8149027  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac 190  Q
    || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8149026 ggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccagac 8148985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18512586 - 18512466
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 193  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||     
T  18512586 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaat-agggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttcccggaccct 18512490  T
Q  194 gcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    || |||||||||||||| ||||||    
T  18512489 gcgtatgcgggagctttggtgcac 18512466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747613
Alignment:
Q  79 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 177  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaat--tggtggga 18747569  T
Q  178 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18747570 ccccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 18747613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 221
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566562
Alignment:
Q  97 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgca 196  Q
    ||||| |||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||    
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaa-aatggtaggaccccttcccgaaccctgca 21566537  T
Q  197 tatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21566538 tatgcgggagctttagtgcaccggg 21566562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1424073 - 1423967
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |   |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1424073 aactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgcatacactacacc 1423974  T
Q  165 aataatg 171  Q
    |||||||    
T  1423973 aataatg 1423967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 19266414 - 19266564
Alignment:
Q  56 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 155  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||   | ||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19266414 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 19266512  T
Q  156 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctt 209  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19266513 caatacacca--aattgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 19266564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28078313 - 28078151
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    ||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  28078313 tgaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgta-aaaaaacagggta 28078215  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||||||||| ||||||||    
T  28078214 aggttgcatgcaatacacca--aatggtgggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagcttta 28078151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48123643 - 48123508
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |    
T  48123643 ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcatacaatacacca--a 48123546  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggag 206  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||    
T  48123545 atggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggag 48123508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3469338 - 3469190
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa--cagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||    ||||||  |||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  3469338 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcgtacaatacaccaa 3469239  T
Q  167 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 215  Q
     ||||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  3469238 aaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgc 3469190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31591241 - 31591118
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 193  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||      
T  31591241 aaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa--cagagtaaggctgcgtacaatacaataa--atggtgggaccccttcccggacctt 31591146  T
Q  194 gcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31591145 gcatatgcgggagctctagtgcaccggg 31591118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 42496018 - 42495916
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  42496018 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtat-aaaaacagggt 42495920  T
Q  145 aagg 148  Q
    ||||    
T  42495919 aagg 42495916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099050
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   ||||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacca--a 14099068  T
Q  169 atggtgggaccccttccc 186  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14099067 atggtgggaccccttccc 14099050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409067
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   ||||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacca--a 14409085  T
Q  169 atggtgggaccccttccc 186  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14409084 atggtgggaccccttccc 14409067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32233286 - 32233144
Alignment:
Q  76 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 175  Q
    |||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||  |||||||    
T  32233286 ttgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggcagcgtatattacaccaa--atggtgg 32233190  T
Q  176 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||  |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32233189 gattccttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccggg 32233144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 185
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645047
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    ||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||     
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaa- 7645029  T
Q  168 aatggtgggaccccttcc 185  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  7645030 aattgtgggaccccttcc 7645047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Original strand, 39123865 - 39124018
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta----aggctgcatacaatacac 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||    |||||   |||||||||||||| |||||||    ||||||| || |||||||    
T  39123865 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaa-cagggtagggaaggctgcgtaaaatacac 39123963  T
Q  164 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||    
T  39123964 caaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcacc 39124018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 38604549 - 38604653
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||    
T  38604549 ggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttaagt 38604645  T
Q  214 gcaccggg 221  Q
    ||||||||    
T  38604646 gcaccggg 38604653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741919
Alignment:
Q  72 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 171  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   | ||||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgt--aaaatagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatg 11741869  T
Q  172 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11741870 gtgggatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccggg 11741919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 13805077 - 13805216
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||      
T  13805077 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaaca-ggggtaaggctgtgtacaatacacca-- 13805173  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  13805174 aatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt 13805216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794582
Alignment:
Q  52 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaaaaaacagggtaaggc 7794583  T
Q  150 t 150  Q
    |    
T  7794582 t 7794582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 139
Target Start/End: Original strand, 21447544 - 21447636
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaac 139  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   | ||||| |||||||||||||||||    
T  21447544 gaggggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaac 21447636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 35203440 - 35203531
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 185  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  35203440 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcc 35203531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 166
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736962
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtat-aaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaa 6736962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Original strand, 1408487 - 1408582
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||||||| ||||||    
T  1408487 cctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcagaatctttagttcaccgg 1408582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||   ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||| |||| ||| | || |    
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtactctaa-a 42101946  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 215  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||    
T  42101945 gtggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 5814447 - 5814528
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 150  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5814447 ggtaaagttgttgttatgtgattggaaagtcacgggttcaagttttggaaagaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggct 5814528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27889399 - 27889325
Alignment:
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  27889399 aaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccggg 27889325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787278
Alignment:
Q  118 aacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | |||||    
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaa-catggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcac 35787282  T
Q  218 cggg 221  Q
    ||||    
T  35787281 cggg 35787278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500635
Alignment:
Q  136 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 215  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggatcttcagtgc 33500635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 23231587 - 23231681
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  23231587 cctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccga--atgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccg 23231681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44123792 - 44123685
Alignment:
Q  56 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 155  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||     
T  44123792 ccttggtgcaac-ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggttgcatg 44123695  T
Q  156 caatacacca 165  Q
     |||||||||    
T  44123694 aaatacacca 44123685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 160
Target Start/End: Original strand, 22065563 - 22065654
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaata 160  Q
    ||||||||||||||||| || | || || |||| | ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22065563 tggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgt-aaaaatagggtaaagctgcatacaata 22065654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 29140538 - 29140438
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||   | |||||| |||||  |||||||| | ||||||||    
T  29140538 gggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacacattcaagttttgaaaacaatctcttaggtaaaaaataaggtaaggc 29140439  T
Q  150 t 150  Q
    |    
T  29140438 t 29140438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45019010 - 45018935
Alignment:
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataa--tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45019010 aaggctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 45018935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 27697459 - 27697565
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggt--gggacccctt-cccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |    
T  27697459 ggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggcaaggctg--tgtaatacaccaa-aatggtgggggaccctttccccagaccctgcgtatgcgggagcttaa 27697555  T
Q  212 gtgcaccggg 221  Q
     |||||||||    
T  27697556 atgcaccggg 27697565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13792250 - 13792161
Alignment:
Q  129 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |  |||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  13792250 gtgtaaaaaacttggtaagactgcatacaatacaccca-aatggcgggaccccttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgcaccg 13792161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198852
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttc---aagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||| ||   ||||   |||||||  || |||||| |||||||| ||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    || | || || ||| ||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||    
T  25198779 agaccgcgtataatgcacta--aatggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccggg 25198852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39093532 - 39093448
Alignment:
Q  136 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |  |||||||| | |||||||||||||||||    
T  39093532 aaacagggtaagactgtgtacaatacacca-taatagtgggaacccttcccggaacttgcatatgcagaagctttagtgcaccggg 39093448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17048914 - 17048859
Alignment:
Q  130 tgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 186  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17048914 tgtaaaaaacagggtaaggttacgtacaatacaccaa-aatggtggaaccccttccc 17048859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 219
Target Start/End: Original strand, 25434050 - 25434144
Alignment:
Q  124 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25434050 ctcttgtgcaaaaaacatggtaagagtgcatacaacacaccaa-aatggtatgacttcttcttggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 25434144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21139851 - 21139761
Alignment:
Q  124 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  || | |  ||||||| |||||||||||||    
T  21139851 ctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttggatacagtacaccaa--atggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Original strand, 36602535 - 36602573
Alignment:
Q  183 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36602535 tcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 36602573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 45811920 - 45811969
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  45811920 aatggtgggatccctttccagaccctgcttatgcaggagctttagtgcac 45811969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 84)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20004273 - 20004099
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  20004273 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggtaa 20004174  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20004173 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 20004099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395737
Alignment:
Q  53 taaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 152  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  153 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 30395737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 46991781 - 46991953
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991781 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46991880  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  46991881 ggctgtgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggg 46991953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 18944620 - 18944795
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18944620 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 18944719  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18944720 ggctgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccggg 18944795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34725278 - 34725107
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  34725278 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 34725181  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34725180 aggctgcgtacaatacacta--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 34725107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23768483 - 23768334
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23768483 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 23768384  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23768383 a--aatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 23768334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32632737 - 32632569
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32632737 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 32632639  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32632638 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcacc 32632569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 10668197 - 10668376
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaa-----ctggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacag 141  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |     ||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||     
T  10668197 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaa 10668296  T
Q  142 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10668297 ggtaaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10668376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46248134 - 46247962
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46248134 gaggggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46248035  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  46248034 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccggg 46247962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 216
Target Start/End: Original strand, 27201623 - 27201793
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  27201623 tgaggggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggta 27201722  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  27201723 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgca 27201793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 14617013 - 14617187
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  14617013 atgaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggt 14617112  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14617113 aaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 14617187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Original strand, 47214488 - 47214655
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||| |  ||||||||||||    
T  47214488 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgttt--aaaacagggtaa 47214585  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47214586 ggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 47214655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Original strand, 35005142 - 35005274
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35005142 actgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccgg 35005241  T
Q  189 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  35005242 accctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccggg 35005274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45812716 - 45812546
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   | |||||  ||||||||||||| |  ||||||    
T  45812716 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaaga--gggtaa 45812619  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45812618 ggctgcatacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 45812546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741966
Alignment:
Q  52 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt-gagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |   ||||||||  || |||| | |||||||||||||||||    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 18741966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19932936 - 19932765
Alignment:
Q  44 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 143  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19932936 aatgaggggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtt--ggatacaacct-ttgtgtaaaaaacaggg 19932840  T
Q  144 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  || | ||||||||||    
T  19932839 taaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagatcattagtgcacc 19932765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 219
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925247
Alignment:
Q  66 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacacc- 6925194  T
Q  166 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
      ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6925195 -gaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6925247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38478461 - 38478291
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  38478461 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 38478364  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38478363 ggctgcgtacaatacacca--aatggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 38478291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126850
Alignment:
Q  53 taaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 152  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||   ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgt--aaaacagggtaaggctgc 12126913  T
Q  153 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
     ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12126912 gtacaatacacca--aattgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcac 12126850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18724704 - 18724565
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  18724704 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacca--a 18724607  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    ||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18724606 atcttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagcttt 18724565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402245
Alignment:
Q  52 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt--aagg- 148  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||      
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggttcaagtt 45402174  T
Q  149 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45402175 ctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 45402245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117774
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcat-atgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccggg 35117774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41319993 - 41319819
Alignment:
Q  41 aaaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca 140  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||   |||||||  |||||||||||||||||    
T  41319993 aaaattgaggggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaaca 41319894  T
Q  141 gggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||| || |||||||    
T  41319893 gggtaaggctgcgtacaatacacca--aatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcac 41319819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414586
Alignment:
Q  51 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 150  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    |||| | |||||| |||  |||||||| |||||||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgt--aaaacaggttaaggct 19414517  T
Q  151 gcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19414518 gcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 19414586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 220
Target Start/End: Original strand, 27474257 - 27474428
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  27474257 tgaggggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgt-aaaaacagggca 27474355  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    | ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27474356 aagctgcgtacaatacac--tgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 27474428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Original strand, 9939463 - 9939613
Alignment:
Q  72 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 171  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  9939463 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttgcgtgcaatacaccaaaaatg 9939562  T
Q  172 gtggga-ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9939563 gtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 9939613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 8197019 - 8197192
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   || ||   |||||||||||||||||| ||||    
T  8197019 tgaggggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggta 8197118  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||| | |||| |||||||  |||||| |||||||||| | ||||| || ||||  |||||||||||| ||||||    
T  8197119 aggctacgtacagtacacca--aatggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccggg 8197192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468285
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacacca--aa 25468324  T
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagct 208  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  25468323 tggttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagct 25468285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701717
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacaccaa-aa 19701668  T
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19701669 tggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 19701717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45264534 - 45264411
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 193  Q
    ||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  45264534 aaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaa-aatggtgggaccccttctcagaccct 45264436  T
Q  194 gcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45264435 gcatatgcgggagctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2435946 - 2435796
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  2435946 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgtacaatacaccaa-a 2435848  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  2435847 atggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcaccgg 2435796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253197
Alignment:
Q  84 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 183  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacccctt 35253234  T
Q  184 cccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35253233 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 35253197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 35019229 - 35019378
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  35019229 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcatacaatacaccaat- 35019327  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  35019328 -tggtgggacccc-tcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 35019378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Original strand, 4349699 - 4349787
Alignment:
Q  131 gtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4349699 gtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 4349787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136661
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaa-a 27136713  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||||  ||||||||||    
T  27136712 atggtgggaccccttcctagatcatgtgtatgcgggagctccagtgcaccgg 27136661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 210
Target Start/End: Original strand, 11596512 - 11596650
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||      
T  11596512 ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtataatacaccaa-- 11596608  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  11596609 atggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt 11596650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 218
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325039
Alignment:
Q  102 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 201  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||| || |||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtccc-gaccctgcgtatgc 22325022  T
Q  202 gggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  22325023 gggagctttagtgcacc 22325039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44485267 - 44485119
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||   |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  44485267 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aa 44485170  T
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  44485169 tggttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagcttt-gtgcaccggg 44485119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22930248 - 22930114
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22930248 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgta-aaaacagggtaa 22930150  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 185  Q
    || ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22930149 ggttg-tgacaatacacca--aatggtgggaccccttcc 22930114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 23796510 - 23796614
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23796510 ggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagtg 23796607  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  23796608 caccggg 23796614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214967
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    |||||||| |||||| || |||  |||||| |  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaa-aa 39215019  T
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  39215018 tggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccggg 39214967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Original strand, 25290143 - 25290300
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaa--acaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25290143 gggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 25290242  T
Q  148 gc-----tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatg 200  Q
    ||     ||  ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  25290243 gcaaggttgtgtacaatacaccaaaaatgataggaccccttcccagactctgcatatg 25290300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17470517 - 17470390
Alignment:
Q  56 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 155  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17470517 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 17470419  T
Q  156 caatacaccaataatggtgggaccccttcc 185  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  17470418 caatacaccaa-aatagtgggacccgttcc 17470390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15511311 - 15511157
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc--atacaatacacca 165  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||   || ||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15511311 tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggatacaatacacca 15511212  T
Q  166 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | |||||||| |||||||||  ||||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  15511211 a-aatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccggg 15511157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Original strand, 22327101 - 22327204
Alignment:
Q  72 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 171  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||    
T  22327101 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacgatgcaccaa-aatg 22327199  T
Q  172 gtggg 176  Q
    |||||    
T  22327200 gtggg 22327204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Original strand, 33222983 - 33223093
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |    
T  33222983 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggaaaggttgcgtacaatacaccaa-a 33223080  T
Q  169 atggtgggacccc 181  Q
    |||||||||||||    
T  33223081 atggtgggacccc 33223093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4430187 - 4430088
Alignment:
Q  67 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   | |||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4430187 ctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 4430088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6983969 - 6983820
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||  || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||      
T  6983969 tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctc--gtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaatacacca-- 6983874  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||    
T  6983873 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccggg 6983820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10378828 - 10378744
Alignment:
Q  135 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10378828 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 10378744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 20036218 - 20036369
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaa-aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| | | ||||||||  ||| | ||||||||||     
T  20036218 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttcaatacacca- 20036316  T
Q  167 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  20036317 -aatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggag-ttttgtgcaccggg 20036369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31382326 - 31382223
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  31382326 ggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagctttactg 31382230  T
Q  215 caccggg 221  Q
     ||||||    
T  31382229 taccggg 31382223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42304303 - 42304217
Alignment:
Q  134 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  42304303 aaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 42304217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768288
Alignment:
Q  136 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccggg 43768288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 50606487 - 50606552
Alignment:
Q  156 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50606487 caatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 50606552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1517417 - 1517320
Alignment:
Q  123 cctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  1517417 cctcttgtgttaaaaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 1517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 43207540 - 43207640
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||    
T  43207540 ggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagacggcatacaatacaccaa-attggtgggacctcttcccagaccctatgtatgcgagagctttagtg 43207638  T
Q  215 ca 216  Q
    ||    
T  43207639 ca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Original strand, 50811938 - 50812085
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||| ||   ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  50811938 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaa- 50812036  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||| ||||||||||||   ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  50812037 aatggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcac 50812085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 34714599 - 34714674
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaaca 121  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  34714599 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaaca 34714674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 166
Target Start/End: Original strand, 24564322 - 24564440
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||| |||| ||| | || |||||| | | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24564322 aggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24564421  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaa 166  Q
    | ||| |||||| ||||||    
T  24564422 ggtgcgtacaattcaccaa 24564440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760287
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaat 50760287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31442485 - 31442398
Alignment:
Q  133 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  31442485 aaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgggagctttggtgcaccggg 31442398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2436064 - 2435983
Alignment:
Q  56 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa 138  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  2436064 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaa 2435983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 111
Target Start/End: Original strand, 40424721 - 40424783
Alignment:
Q  49 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  40424721 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagt 40424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 6358185 - 6358264
Alignment:
Q  134 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  6358185 aaaatcagggtaaagctgcgtacaaaacaccaa-aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcaggatctttagtg 6358264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20999952 - 20999859
Alignment:
Q  126 cttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||||   |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  20999952 cttgtgtaaaaaacaaggcaaggctgcgtacaatacacca--aatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccggg 20999859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33594191 - 33594144
Alignment:
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33594191 tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 33594144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 219
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505710
Alignment:
Q  138 acagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt-gtgcaccg 15505710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19656219 - 19656114
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||| |||||| |||||| |||   ||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  19656219 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaacgctatgtacaatacaccaa-aatggtaggaccctttcttggaccctgcatatgcaagagctttaatg 19656121  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  19656120 caccggg 19656114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20169200 - 20169109
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||  |||||||| |||||   |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20169200 aaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaatc--ggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagcttt 20169109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4587625 - 4587572
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4587625 aatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccggg 4587572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Original strand, 23371143 - 23371271
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||    |||||| || |||| ||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||    
T  23371143 actgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaac-gggcaaggttgtgtacaatacaccaa--atgctgggaccccttcc-ag 23371238  T
Q  189 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  23371239 accctgcgtatgtggtagctttagtgcaccggg 23371271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34679331 - 34679224
Alignment:
Q  116 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac----cccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  ||||||||  |||| | ||||||    || || |||||||||||||||    
T  34679331 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtactatacatca--aatggtggagccccgttccagacccggcctgcgtatgcgggagcttta 34679234  T
Q  212 gtgcaccggg 221  Q
    || |||||||    
T  34679233 gtacaccggg 34679224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 218
Target Start/End: Original strand, 7074588 - 7074663
Alignment:
Q  142 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7074588 ggtatggctgcgtacaatacaccaa-aattgtgggacctctttctagaccctgcatatccgggagctttagtgcacc 7074663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34149073 - 34148969
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||    
T  34149073 ggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagacca--aatggtgagaccccttcctggaccctgcatatgcaggagcgctagtg 34148976  T
Q  215 caccggg 221  Q
    || ||||    
T  34148975 caacggg 34148969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Original strand, 52910204 - 52910370
Alignment:
Q  56 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcat 154  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |   ||||||| ||||||  || ||||||||||||| | |||  |    
T  52910204 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgt 52910302  T
Q  155 acaatacaccaa----taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||||| |    | |||||||||||||||||  || ||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  52910303 acaatacacctaatggttatggtgggaccccttcctggaacctccgtatgtgggaactttagtgcacc 52910370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 30555211 - 30555264
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  30555211 aatggtgggaccccttcacggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 30555264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272446
Alignment:
Q  80 tgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcataca 157  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacatggtaaggctgcgtaca 31272446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19974213 - 19974087
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 188  Q
    |||| ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||  |||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  19974213 actgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaat-agggcaaggttgcgtacaatacaccaa-aatgatgggacccattcccgg 19974116  T
Q  189 accccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    || |    |||||||||||||||||||||    
T  19974115 actctatgtatgcgggagctttagtgcac 19974087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Original strand, 46859129 - 46859216
Alignment:
Q  133 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||| ||  || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  46859129 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa-aatggtgggactcattttcaggccttgcgtatgtgggagttttagtgcaccggg 46859216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Original strand, 1693222 - 1693273
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcacc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1693222 aatggtgggaccccttcccagacccggcagatgcaggagcttttagtgcacc 1693273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21910743 - 21910693
Alignment:
Q  134 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 186  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21910743 aaaaatagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttccc 21910693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 25027989 - 25028030
Alignment:
Q  116 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcataca 157  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25027989 gaaacagcctcttgtgtaaaaaacgaggtaaggctgcataca 25028030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28894611 - 28894570
Alignment:
Q  177 accccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28894611 accccttcctagaccctgcatatgcgagagctttagtgcacc 28894570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18336026 - 18335914
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    |||||||| ||||| | || || ||||||||||| |||||  ||| ||||||||  ||||||||   | ||| || || |||| |||| |||||||||||    
T  18336026 aggggtaatcttggcgcaagtgataaagttgttgccatgtgtctgaaaggtcacatgttcaagttctgaaaataatctattgtttaaagaacagggtaag 18335927  T
Q  148 gctgcatacaata 160  Q
    ||||| |||||||    
T  18335926 gctgcgtacaata 18335914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7136710 - 7136536
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7136710 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaa 7136611  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7136610 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 7136536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 218
Target Start/End: Original strand, 36720749 - 36720919
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36720749 tgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 36720848  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  36720849 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacc 36720919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 6760775 - 6760950
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6760775 atgaggggtaac-ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 6760873  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6760874 aaggcttcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 6760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28817808 - 28817635
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28817808 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 28817709  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  28817708 aggctgcgtacaatacacc--caatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 28817635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39461179 - 39461003
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39461179 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagt 39461080  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39461079 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 39461003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 26954086 - 26954257
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggta 145  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26954086 gaggggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 26954185  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26954186 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcac 26954257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 44530103 - 44530275
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44530103 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 44530202  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44530203 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 44530275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12670429 - 12670259
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  12670429 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 12670332  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12670331 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 12670259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 25250474 - 25250650
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  25250474 atgagaggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggt 25250573  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25250574 atggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccggg 25250650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29521866 - 29521694
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29521866 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaa 29521767  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29521766 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 29521694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 35261633 - 35261805
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35261633 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 35261732  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35261733 ggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 35261805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30454277 - 30454106
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  30454277 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaaggta 30454180  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30454179 aggctgcgtacgatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 30454106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20284250 - 20284078
Alignment:
Q  51 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca--gggtaagg 148  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  20284250 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaagg 20284151  T
Q  149 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  20284150 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccggg 20284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 13160655 - 13160827
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13160655 tgaggggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggta 13160753  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  13160754 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccggg 13160827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 2626471 - 2626645
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt---aaaaaacag 141  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||   |||||||||    
T  2626471 atgaggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacag 2626570  T
Q  142 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2626571 ggtaagactgcgtacaatacacca--aatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcacc 2626645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21070879 - 21070706
Alignment:
Q  51 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca---gggtaag 147  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| |   |||||||    
T  21070879 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaag 21070780  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  21070779 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccggg 21070706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 45071219 - 45071390
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  45071219 gaggggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 45071317  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  45071318 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggg 45071390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44781665 - 44781517
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  44781665 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 44781566  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44781565 atgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8897927 - 8897776
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  8897927 aactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggctacgtacaatacacc 8897828  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8897827 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacc 8897776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Original strand, 12625861 - 12626016
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12625861 aactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaatacac 12625960  T
Q  164 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||  |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12625961 ca--aatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 12626016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 20869945 - 20870051
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20869945 ggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagctttagtg 20870044  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  20870045 caccggg 20870051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 17823529 - 17823702
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  17823529 tgaggggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggata 17823628  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    || |||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17823629 agactgcgtaaaatacacca--aatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccggg 17823702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 16225049 - 16225147
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225049 cctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 16225147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20869677 - 20869523
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  20869677 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 20869580  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 207  Q
    |||||  |||||||||||||    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20869579 ggctgtgtacaatacaccaa----ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8484069 - 8483947
Alignment:
Q  97 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgca 196  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||     
T  8484069 gtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccatcccagaccctgcg 8483972  T
Q  197 tatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  8483971 tatgcgggagctttagggcaccggg 8483947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18164941 - 18164769
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18164941 tgaggggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggta 18164843  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||  | | || ||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18164842 aggttgcgtacaatacaccaa--aggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 18164769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44742698 - 44742527
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  || | || ||||||| | ||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44742698 agggggaaccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||  |  |||||||||| |||||||||||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcttggaccctacggatgcgggagcattagtgcaccggg 44742527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 29877116 - 29877217
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  29877116 ggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgttagtg 29877213  T
Q  215 cacc 218  Q
    ||||    
T  29877214 cacc 29877217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598279
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaat- 22598231  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||    
T  22598232 -tggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcacc 22598279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5135418 - 5135299
Alignment:
Q  99 cacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcata 198  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  5135418 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgta 5135321  T
Q  199 tgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  5135320 tgcaggagcttt-gtgcaccggg 5135299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365071
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||      
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaa-- 24365121  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  24365120 atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagcttt-gtgcaccg 24365071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Original strand, 11748254 - 11748392
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  11748254 aggggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaag 11748353  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 186  Q
     | || ||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  11748354 acagcgtacaatatacaaaaaatggtaggaccccttccc 11748392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 220
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457297
Alignment:
Q  75 gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtg 174  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||     
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgt-aaaaataggaaaaggctgcgtacaatacatca--aatggta 31457251  T
Q  175 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  31457252 ggaccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccgg 31457297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 28407379 - 28407529
Alignment:
Q  56 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 155  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||          
T  28407379 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggc------ 28407471  T
Q  156 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
          |||||  |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  28407472 ------accaa--atggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccggg 28407529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 220
Target Start/End: Original strand, 389644 - 389770
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacc 191  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||| || ||||    
T  389644 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatgatgggatccctttcctgacc 389741  T
Q  192 ccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||    
T  389742 ctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgg 389770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17250982 - 17250888
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||  |||||||||||||||    
T  17250982 cctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaaggagctttagtgcac 17250888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106014
Alignment:
Q  72 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 171  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacacc-agaatg 35106000  T
Q  172 gtgggaccccttcc 185  Q
    |||||||| |||||    
T  35106001 gtgggacctcttcc 35106014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 190
Target Start/End: Original strand, 43942348 - 43942421
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac 190  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43942348 aaacagcctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagac 43942421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 24245405 - 24245565
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||   ||||| |||    ||||||||||    
T  24245405 gaggggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttatgt----aacagggtaa 24245499  T
Q  147 ggctgcatacaatacacc-aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    | || | |||||| |||| || ||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  24245500 gactacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttta 24245565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42083858 - 42083712
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||| || ||||| |    
T  42083858 ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgtacagtataccaa-a 42083760  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |  || | |||||||||||||||    
T  42083759 atggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgca 42083712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Original strand, 5689661 - 5689756
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  5689661 cctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 5689756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40605087 - 40604917
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||  || ||    
T  40605087 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggata 40604988  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    ||| ||| |||||||||| |  |||| | ||| ||||||| | ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  40604987 aggttgcgtacaatacacta--aatgat-ggatcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccg 40604917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 10857858 - 10857955
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  10857858 cctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaat--tggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10857955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 16013515 - 16013582
Alignment:
Q  154 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16013515 tacaatacactaaaaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccggg 16013582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 19729382 - 19729462
Alignment:
Q  135 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  19729382 aaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagtgcac 19729462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14018128 - 14017989
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||| |||||||||| || | || ||||||| ||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || |    
T  14018128 ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgtacaatacactaa-a 14018030  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctt 209  Q
     |||||||||| |||||  ||||| ||| |||||| |||||    
T  14018029 ttggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagctt 14017989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000263
Alignment:
Q  79 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggac 178  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cacggtaaggttccatacaatacacca--aatggtgggac 23000271  T
Q  179 cccttccc 186  Q
    ||||||||    
T  23000270 cccttccc 23000263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 221
Target Start/End: Original strand, 26102577 - 26102643
Alignment:
Q  153 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  26102577 atacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccggg 26102643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 166
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918197
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||   ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaa 36918197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 30962929 - 30962849
Alignment:
Q  72 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 152  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||  |||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30962929 aaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggttaggctgc 30962849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000997
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |   | |||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||      
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacacca-- 11001012  T
Q  168 aatggtgggacccct 182  Q
    |||||||||||||||    
T  11001011 aatggtgggacccct 11000997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Original strand, 26457776 - 26457853
Alignment:
Q  140 agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||  || |||| ||||||||||||||||||||    
T  26457776 agggtaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggacccct--cctgaccttgcgtatgagggagctttagtgcaccggg 26457853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508036
Alignment:
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27507985 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 27508036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Original strand, 33866973 - 33867078
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 215  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||  ||  ||||||  |||| || ||||| | |||||||||||    
T  33866973 aaacaactttttgtgtaaaaaagcagggtaagactgcatacaatacataaaaaatggtgacacttcttcccgaaccctgcgtatgcagaagctttagtgc 33867072  T
Q  216 accggg 221  Q
    ||||||    
T  33867073 accggg 33867078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 40607884 - 40607841
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  40607884 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaatgtcatgagttcaagt 40607841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23286476 - 23286434
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgt 87  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  23286476 atgaggggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 23286434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35107373 - 35107320
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  35107373 aatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccggg 35107320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27468141 - 27468101
Alignment:
Q  181 cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27468141 cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 27468101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13730785 - 13730611
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13730785 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13730686  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13730685 ggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 13730611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40272994 - 40272821
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40272994 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 40272895  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40272894 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 40272821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46421218 - 46421044
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46421218 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46421119  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  46421118 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccgg 46421044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13628976 - 13628799
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaa-gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 143  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13628976 atgaggggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacaggg 13628877  T
Q  144 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13628876 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 13628799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29366902 - 29366733
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29366902 aggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaag 29366803  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  29366802 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcac 29366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8247872 - 8247706
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8247872 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 8247773  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  8247772 aaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 8247706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 9607178 - 9607345
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9607178 tgaggggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggta 9607277  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 213  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9607278 aggctgcgtagaatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 9607345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 1217064 - 1217236
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1217064 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 1217161  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1217162 aaggctgcgtacaatacacca--aatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 1217236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12914216 - 12914044
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12914216 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 12914117  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  12914116 ggcggcgtacaatacacca--aatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccggg 12914044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49013588 - 49013482
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49013588 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagtg 49013489  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  49013488 caccggg 49013482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6412002 - 6411833
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6412002 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 6411904  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  6411903 ggctgcgtacaatacacca--aatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6411833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5173903 - 5173728
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaa-gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  5173903 tgaggggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-caaagt 5173805  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  5173804 aaggttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 5173728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 22609742 - 22609913
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22609742 tgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggta 22609839  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22609840 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggg 22609913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53996725 - 53996574
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  53996725 ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcttacaatacaccaa-a 53996627  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||    
T  53996626 atggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccggg 53996574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 39203491 - 39203662
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  39203491 tgaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 39203588  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203589 aggttgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 39203662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 353450 - 353358
Alignment:
Q  129 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  353450 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 353358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420656
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacaccaa-aa 34420704  T
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  34420703 tggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcac 34420656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139487
Alignment:
Q  82 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 181  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  182 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  45139524 ttcccaga-cctgcgtatgcgggaacttt-gtgcaccggg 45139487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 14987001 - 14987107
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  14987001 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcgggagctttagtg 14987100  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  14987101 caccggg 14987107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Original strand, 26573125 - 26573272
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26573125 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat- 26573223  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
     |||||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  26573224 -tggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcacc 26573272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45948974 - 45948848
Alignment:
Q  92 ggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacc 191  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  45948974 ggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcggacc 45948877  T
Q  192 ccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  45948876 ctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 45948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122926
Alignment:
Q  51 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 150  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaa--cagggtaaggct 22122995  T
Q  151 gcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22122994 gcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccggg 22122926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516560
Alignment:
Q  79 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc-aataatggtggga 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  178 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 516560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52926391 - 52926228
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||         ||||    
T  52926391 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta---------gtaa 52926301  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  52926300 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccggg 52926228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Original strand, 26869701 - 26869854
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26869701 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 26869799  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |  |||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26869800 a--aatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 26869854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 54374485 - 54374357
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 188  Q
    |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  54374485 actgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaa-aatggtgggaccccttcccgg 54374387  T
Q  189 accccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  54374386 accctgcatatgcgggagctttagttcacc 54374357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Original strand, 16735416 - 16735584
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    |||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  16735416 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 16735514  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||| |||||||    
T  16735515 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcac 16735584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4495850 - 4495714
Alignment:
Q  42 aaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacag 141  Q
    |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| | ||| |||||||||||||||    
T  4495850 aaaaggaggggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacag 4495751  T
Q  142 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccc 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4495750 ggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccc 4495714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45786327 - 45786223
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  45786327 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgca 45786228  T
Q  217 ccggg 221  Q
    |||||    
T  45786227 ccggg 45786223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10795554 - 10795435
Alignment:
Q  99 cacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcata 198  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || ||    
T  10795554 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgta 10795455  T
Q  199 tgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  10795454 tgcgggagcttcagtgcacc 10795435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7697067 - 7696901
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  7697067 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggta 7696970  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||     ||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7696969 aggctgcgtacaatacacca--aatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccggg 7696901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943134
Alignment:
Q  74 agttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggt 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatca--aatggt 7943090  T
Q  174 gggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  7943091 gggatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcac 7943134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032609
Alignment:
Q  82 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccc 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc--gaatggtgggaccc 54032609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10870132 - 10870028
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10870132 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 10870034  T
Q  147 ggctgc 152  Q
    ||||||    
T  10870033 ggctgc 10870028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944615
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||   ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacaccaa-aa 25944566  T
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  25944567 tggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcacc 25944615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 54484734 - 54484839
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  54484734 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagt 54484831  T
Q  214 gcaccggg 221  Q
    ||||||||    
T  54484832 gcaccggg 54484839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 221
Target Start/End: Original strand, 31592878 - 31592995
Alignment:
Q  100 acgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatat 199  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  31592878 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggactccttcccggaccctgcatat 31592973  T
Q  200 gcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  31592974 gcgggagctctagtgcaccggg 31592995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25517353 - 25517179
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgag--ggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggt 144  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | | ||   ||||||| |||||||||||||||| || | |    
T  25517353 agggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagat 25517254  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  25517253 atggctgcgtacaatacacaaa--atggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccggg 25517179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928167
Alignment:
Q  73 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 172  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||  |||    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaat--tgg 30928205  T
Q  173 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  30928204 cgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttt 30928167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926224
Alignment:
Q  82 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 181  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgtgtacaatacacca-taatggtgggacccc 33926191  T
Q  182 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33926192 ttcctggaccctgcatatgcgagagctttagtg 33926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45621012 - 45620889
Alignment:
Q  44 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagg 142  Q
    ||||||||| | |||||| | ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45621012 aatgagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagg 45620914  T
Q  143 gtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  45620913 gtaaggctgcgtacaatacaccaat 45620889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34771457 - 34771373
Alignment:
Q  135 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34771457 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 34771373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 15797274 - 15797368
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15797274 cctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccggg 15797368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731150
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||| ||||||||| || | || |||||||||| | |||||   ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19731097  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     ||||||||||| ||||||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  19731098 ttggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccggg 19731150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 218
Target Start/End: Original strand, 12525385 - 12525552
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||| | |||| |||||||| ||||| |||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12525385 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgt---catatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggta 12525481  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||    | |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |  ||| ||||||||| | ||||||    
T  12525482 aggctgc--gaagtacaccaaaaatggtgggacaccttcctagaccctgtgtatacgggagcttcactgcacc 12525552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 829555 - 829452
Alignment:
Q  116 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 215  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  829555 gaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgc 829457  T
Q  216 accgg 220  Q
    |||||    
T  829456 accgg 829452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 211
Target Start/End: Original strand, 9276316 - 9276401
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  9276316 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggt-ggaccctttcccggaccctgcgtatgcgggaacttta 9276401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 192
Target Start/End: Original strand, 47624088 - 47624160
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccc 192  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  47624088 aaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccc 47624160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Original strand, 55401222 - 55401325
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||   | ||||||||||||||  ||||    
T  55401222 aaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaa-aatggtgggaccccttctcggaccttccgtatgcgggagcttttttgca 55401320  T
Q  217 ccggg 221  Q
    |||||    
T  55401321 ccggg 55401325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24851363 - 24851310
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851363 aatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 24851310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 163
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875106
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaagg 148  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-------acgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  149 ctgcatacaatacac 163  Q
    |||| ||||||||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacac 21875106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 166
Target Start/End: Original strand, 26782345 - 26782461
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||  | || |||||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26782345 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaaatagggtaatgc 26782444  T
Q  150 tgcatacaatacaccaa 166  Q
    || ||| ||||||||||    
T  26782445 tgtataaaatacaccaa 26782461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410887
Alignment:
Q  77 tgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggg 176  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||   ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||    
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctc--gtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacacca--actggtggg 8410921  T
Q  177 accccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    ||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  8410920 acctcttctcagaccctgcataggcggaagcttt 8410887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452943
Alignment:
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 30452943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44403661 - 44403564
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||| | |||||||||||||||||    
T  44403661 cctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaataccacaa-aatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccggg 44403564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751726
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||| || |||||| || | || |||||||||| | |||||   ||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  ||    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19751673  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     ||||||||||| |||||||||   |  |||||  ||||||||||||||||||    
T  19751674 ttggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcaccggg 19751726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31904970 - 31904868
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga-ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |   | | |||||||||||||||    
T  31904970 ggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacacca--aatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagctttagt 31904873  T
Q  214 gcacc 218  Q
    |||||    
T  31904872 gcacc 31904868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 35417999 - 35418052
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  35417999 aatggtgggaccccttcccggaccccgcaaatgcgagagctttagtgcatcggg 35418052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 162
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212081
Alignment:
Q  73 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 162  Q
    ||||||| || |||| |||| || |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43114983 - 43114882
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagg-ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc-gcatatgcgggagcttta 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  43114983 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaa--atggtgggaccc-ttcctggacccctgcgtatgcgggagcttta 43114887  T
Q  212 gtgca 216  Q
    |||||    
T  43114886 gtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 52428627 - 52428539
Alignment:
Q  79 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgag-ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52428627 ttgtcacgtagctgaaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 52428539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 33235513 - 33235676
Alignment:
Q  54 aaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaac-tggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctg 151  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||| |   | ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33235513 aaccttgatgcagctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactg 33235612  T
Q  152 catacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
      |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||   | ||||||| ||||||||||||||    
T  33235613 tgtacaatacacta--aatggtgggacccc-tcgcagaccttacgtatgcggaagctttagtgcacc 33235676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 143
Target Start/End: Original strand, 35417914 - 35417988
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 143  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35417914 ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 35417988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50625065 - 50624962
Alignment:
Q  116 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 215  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||| |  ||||||||| ||||||  | ||| || || | ||||||||||||||    
T  50625065 gaaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatt--tggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagctttagtgc 50624968  T
Q  216 accggg 221  Q
    ||||||    
T  50624967 accggg 50624962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 24577930 - 24577982
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24577930 aatggtgggatcctttcccagaccctgcatatacgggagctctagtgcaccgg 24577982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 26292384 - 26292478
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | || ||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  26292384 cctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacgatacaccaa--atgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcaccggg 26292478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Original strand, 31831243 - 31831292
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31831243 ggaaacagcctcttgtgtaaaata--gggtaaggctgcatacaatacaccaa 31831292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Original strand, 40968613 - 40968661
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40968613 aatggtgagaccccttcctagaccctacatatgcgggagctttagtgca 40968661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10484671 - 10484625
Alignment:
Q  175 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10484671 ggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10484625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 86
Target Start/End: Original strand, 9276248 - 9276289
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatg 86  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  9276248 atgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatg 9276289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 24578020 - 24578073
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  24578020 aatggtgggactctttcccagaccctacatatgcgggaactctagtgcaccggg 24578073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 166
Target Start/End: Original strand, 29106555 - 29106644
Alignment:
Q  77 tgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    |||||||||||  ||  ||| |||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||    
T  29106555 tgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggataaggttacgtacaatacaccaa 29106644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 111
Target Start/End: Original strand, 4537003 - 4537071
Alignment:
Q  43 aaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  4537003 aaatgaggggtaaccttggcataatcggtaatgttgtggtcatgtgattgaaaggtcacgggtttaagt 4537071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 180
Target Start/End: Original strand, 16130312 - 16130383
Alignment:
Q  108 aagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccc 180  Q
    |||||| | ||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16130312 aagtgatgaaaacatcgtcttctgtaaaaagcaggataaggctgcgaacaatacaccaa-aatggtgggaccc 16130383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 178
Target Start/End: Original strand, 32418221 - 32418329
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||||   ||| |||| |  |||||||||||||   |||||| |||| |||| |||||||||||| || || ||    
T  32418221 gtaaagttgttgtcaagtgactgaaatgtcattagtttaagtcatagaaacaacctcttacataaaaatcaggataagactgcatacaataaacaaaaaa 32418320  T
Q  170 tggtgggac 178  Q
    |||||||||    
T  32418321 tggtgggac 32418329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46170029 - 46169981
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  46170029 aatggtaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttcagtgca 46169981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4619284 - 4619113
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4619284 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 4619185  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4619184 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccggg 4619113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 38879534 - 38879709
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38879534 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggta 38879633  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38879634 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 38879709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 41014268 - 41014444
Alignment:
Q  42 aaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacag 141  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  41014268 aaaatgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacag 41014366  T
Q  142 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41014367 ggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 41014444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 24448844 - 24449016
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  24448844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 24448943  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24448944 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 24449016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Original strand, 43334159 - 43334330
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaagg 148  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43334159 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaagg 43334258  T
Q  149 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43334259 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgc-gatgcgggagctttagtgcaccggg 43334330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12006485 - 12006339
Alignment:
Q  73 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacggg-ttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 171  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12006485 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtctgg-aaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggctccatacaatacaccaataatg 12006387  T
Q  172 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12006386 gtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccg 12006339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 27328709 - 27328875
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27328709 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 27328808  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||    
T  27328809 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgca 27328875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 35710267 - 35710437
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  35710267 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 35710364  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35710365 ggctgcgttcaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 35710437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8170163 - 8169993
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  8170163 gagggctaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgt--aaaacagggtaa 8170066  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  8170065 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccggg 8169993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801776
Alignment:
Q  102 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 201  Q
    ||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 13801796  T
Q  202 gggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  13801795 gagagctttagtgcaccggg 13801776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 20135626 - 20135732
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20135626 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttcagtg 20135725  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  20135726 caccggg 20135732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703548
Alignment:
Q  80 tgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacc 179  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacc 32703506  T
Q  180 ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32703507 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 32703548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 22600407 - 22600569
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  22600407 tgaggggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggta 22600506  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||    
T  22600507 aggctgtgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagcttt 22600569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 1565385 - 1565557
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||   ||    
T  1565385 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatatta 1565484  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1565485 aggctgcgtacaatgcacca--aatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagc-ttagtgcaccggg 1565557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 152
Target Start/End: Original strand, 23974734 - 23974839
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23974734 tgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggta 23974832  T
Q  146 aggctgc 152  Q
    |||||||    
T  23974833 aggctgc 23974839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516449
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaa-a 28516495  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  28516494 atggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtg 28516449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 37024736 - 37024626
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  37024736 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 37024639  T
Q  146 aggctgcatacaa 158  Q
    ||||||| |||||    
T  37024638 aggctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208936
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcattcaatacaccaa-a 208989  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||||||    
T  208988 atggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccggg 208936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 39301099 - 39301249
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||| |    
T  39301099 ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgtataatgcaccaa-a 39301197  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | |||||||||||||||| |||||  | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  39301198 aaggtgggaccccttcccggaccctccgtatgtgggag-tttagtgcaccggg 39301249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 216
Target Start/End: Original strand, 22187238 - 22187408
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  22187238 tgaggggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgata 22187337  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    || |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  22187338 agactgcgtacaatacaccaaaaacaatgagaccccttcccaaaccctacatatgcaggagctttagtgca 22187408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Original strand, 43574609 - 43574732
Alignment:
Q  96 ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgc 195  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43574609 ggtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatatacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgc 43574706  T
Q  196 atatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     |||||||||||||||| ||||||||    
T  43574707 gtatgcgggagctttagagcaccggg 43574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 41425952 - 41426043
Alignment:
Q  97 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac 190  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41425952 gtcacgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccagac 41426043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 7368420 - 7368522
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  7368420 ggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtg 7368515  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  7368516 caccggg 7368522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16880757 - 16880656
Alignment:
Q  118 aacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  16880757 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcac 16880660  T
Q  218 cggg 221  Q
    ||||    
T  16880659 cggg 16880656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19143102 - 19142956
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    ||||||| ||||||||| || |||  || | ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  19143102 tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacagtacaccaa- 19143005  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
     |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||||    
T  19143004 -atggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcac 19142956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42924973 - 42924840
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 188  Q
    |||| ||||||||| ||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||    
T  42924973 actgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttcccag 42924874  T
Q  189 --accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
      |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  42924873 acaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccgg 42924840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405312
Alignment:
Q  76 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 175  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||| || |||||  ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacacca--aatggtgg 1405267  T
Q  176 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||||| ||||   |||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1405268 gaccctttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccgg 1405312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 207
Target Start/End: Original strand, 2838733 - 2838890
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactg-gaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||    |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  2838733 aggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgt-aaaaacagggtaa 2838831  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 207  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||    
T  2838832 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 29334417 - 29334522
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||| ||    
T  29334417 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc-agaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaatg 29334515  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  29334516 caccggg 29334522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850764
Alignment:
Q  77 tgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggg 176  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgt-aaaaacagaataagggtgcgtacaatacatca--aatggtggg 1850720  T
Q  177 accccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||| |||||  ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1850721 accacttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcaccgg 1850764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34154903 - 34154823
Alignment:
Q  139 cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34154903 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccggg 34154823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7097870 - 7097772
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  7097870 aaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 7097774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 220
Target Start/End: Original strand, 25622524 - 25622585
Alignment:
Q  159 tacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25622524 tacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 25622585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Original strand, 30006297 - 30006451
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||  | |||||||  || |||||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||| |||||     
T  30006297 aactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgtgtacattacact 30006396  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |  ||||||||||||||||||| |  ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  30006397 a--aatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccggg 30006451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24323818 - 24323725
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24323818 ggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaa--atagtgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt 24323725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24360442 - 24360349
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24360442 ggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaa--atagtgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt 24360349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794388
Alignment:
Q  135 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaa--atagtgggatcccttcacagacccagcatatgcagaagctttagtgcaccgg 9794388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 16957375 - 16957440
Alignment:
Q  154 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16957375 tacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 16957440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22861844 - 22861680
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    ||| ||  ||||||||||||| |    ||||| |    
T  22861844 gggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaaca---agtaagac 22861748  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||  |||||||| ||  ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22861747 tgctcacaatacatca--aatggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 22861680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11657835 - 11657708
Alignment:
Q  97 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagg----gtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccc 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| |  |     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  11657835 gtcacgggttcaagttatggaaacaacctattatgtaaaatagtgtaactgtaaggctgcatacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccc 11657737  T
Q  193 cgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  11657736 tgcacacgcgggaactttagttcaccggg 11657708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12575775 - 12575669
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaa-aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 213  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  12575775 ggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagctttggt 12575677  T
Q  214 gcaccggg 221  Q
    ||||||||    
T  12575676 gcaccggg 12575669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907904
Alignment:
Q  78 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 177  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttgcatacaatacacca--aatggtggga 22907918  T
Q  178 cccct-tcccagac 190  Q
    ||||| ||||||||    
T  22907917 cccctctcccagac 22907904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Original strand, 3771379 - 3771465
Alignment:
Q  133 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  3771379 aaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccggg 3771465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 39801591 - 39801642
Alignment:
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  39801591 tggtgggaccccttcccagaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccggg 39801642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028633
Alignment:
Q  171 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 16028633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 22025539 - 22025601
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 151  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22025539 actgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 22025601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31694207 - 31694120
Alignment:
Q  129 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||    
T  31694207 gtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaatacacctat--tgatgggactccttcccagaccttgcgtatgcgggagatttagtgcacc 31694120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10306548 - 10306493
Alignment:
Q  155 acaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  10306548 acaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 10306493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5873434 - 5873331
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   |||| |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  5873434 ggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggctaagtacactacaccaat--tggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagctttagtg 5873338  T
Q  215 caccggg 221  Q
    || ||||    
T  5873337 catcggg 5873331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30877628 - 30877573
Alignment:
Q  166 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  30877628 ataaaggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccggg 30877573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12477205 - 12477132
Alignment:
Q  144 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | || |||||  |||||||||||||||    
T  12477205 taaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggattctgcgtatgcaagagctttagtgcacc 12477132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074573
Alignment:
Q  73 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 172  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||  ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacacca--aatgg 34074620  T
Q  173 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
      || |||||||||| |||| || |||| ||||||  ||||||||||||    
T  34074619 cagggccccttcccaaaccctgcgtatgggggagc--tagtgcaccggg 34074573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10634301 - 10634224
Alignment:
Q  73 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 150  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  10634301 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaaggct 10634224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24903807 - 24903705
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||| |||||    
T  24903807 aaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaat--tggtgagaccccttcccggacactgcatacgcgggaactttggtgca 24903710  T
Q  217 ccggg 221  Q
    |||||    
T  24903709 ccggg 24903705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 31362495 - 31362454
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31362495 tggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaa 31362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24313732 - 24313617
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctc-ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||||||||   |||||||||| | || |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  24313732 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaa-aa 24313634  T
Q  170 tggtgggaccccttccc 186  Q
    |||||||||||||||||    
T  24313633 tggtgggaccccttccc 24313617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24356069 - 24355954
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctc-ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||||||||   |||||||||| | || |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  24356069 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaa-aa 24355971  T
Q  170 tggtgggaccccttccc 186  Q
    |||||||||||||||||    
T  24355970 tggtgggaccccttccc 24355954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 29297862 - 29297914
Alignment:
Q  166 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  29297862 ataatggtgggatcccttcccggaccccgcaaatacgggtgctttagtgcacc 29297914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10943900 - 10943854
Alignment:
Q  174 gggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10943900 gggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccggg 10943854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21784394 - 21784343
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  21784394 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggaggtttagtgcaccg 21784343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 87
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299626
Alignment:
Q  52 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgt 87  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgt 31299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4654477 - 4654427
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4654477 aatggtgggatcccttctcgaaccctgcatatgcgggagctttagtgcacc 4654427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 19438703 - 19438741
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcat 85  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19438703 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcat 19438741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 39079925 - 39079883
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  39079925 ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagt 39079883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2432395 - 2432342
Alignment:
Q  130 tgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 183  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  2432395 tgtaaaaaacaaggcaagggtgcatataatacaccaaaaatggtggaacccctt 2432342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 85
Target Start/End: Original strand, 41956884 - 41956924
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcat 85  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  41956884 atgaggggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcat 41956924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 94)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 21646918 - 21647092
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21646918 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaa 21647017  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21647018 ggctgcgtacaatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 21647092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16408777 - 16408610
Alignment:
Q  54 aaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 153  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16408777 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 16408678  T
Q  154 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408677 tacaatacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 16408610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 23501747 - 23501915
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |      || ||||||||||||||||||||||||    
T  23501747 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtca------cagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 23501840  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23501841 ggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 23501915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13256578 - 13256408
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||   |||     ||||||||||||||||||||||||    
T  13256578 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctggag----cctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13256483  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13256482 ggctgcgtacaatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccggg 13256408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 20224937 - 20225108
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20224937 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt--aaaacagggta 20225034  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20225035 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 20225108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6430807 - 6430635
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6430807 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggta 6430709  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  6430708 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccggg 6430635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Original strand, 5648212 - 5648380
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5648212 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggta 5648310  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  5648311 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcac 5648380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48599006 - 48598834
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  48599006 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 48598909  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  48598908 aaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccggg 48598834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47528709 - 47528539
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  47528709 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 47528612  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47528611 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccggg 47528539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 16911519 - 16911682
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16911519 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggc 16911618  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  16911619 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagt 16911682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Original strand, 30639333 - 30639501
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  30639333 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgt-aaaaacagggta 30639431  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30639432 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcac 30639501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Original strand, 37494805 - 37494972
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37494805 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 37494904  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  37494905 ggttgcatacaatatacca--aatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 10660358 - 10660521
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  10660358 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10660457  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  10660458 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagcttta 10660521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 10874503 - 10874666
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  10874503 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10874602  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  10874603 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagcttta 10874666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363139
Alignment:
Q  66 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||    
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  166 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 44363139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Original strand, 19027823 - 19027973
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19027823 tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 19027922  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
      |||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  19027923 --tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 19027973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Original strand, 20405047 - 20405210
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggta 145  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |       |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20405047 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggccta-------gaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 20405139  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20405140 agattgcgtacaatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgca 20405210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5306848 - 5306669
Alignment:
Q  43 aaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagg 142  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  5306848 aaatgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatcagg 5306750  T
Q  143 gtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatg----cgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||    ||||||||||| |||||||||    
T  5306749 gtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccggg 5306669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567296
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacacca--a 35567243  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  35567244 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccggg 35567296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11054327 - 11054157
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  11054327 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaa 11054230  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11054229 gactgcgtacaatacacca--aatggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 11054157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043413
Alignment:
Q  73 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 172  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatgg 17043452  T
Q  173 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17043451 tgggaccccttcccagaccctgcatatgctggagcttta 17043413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 220
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915953
Alignment:
Q  66 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca 40915900  T
Q  166 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
      |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  40915901 --aatggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgg 40915953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20639772 - 20639667
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  20639772 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtg 20639674  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  20639673 caccggg 20639667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 14983791 - 14983953
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  14983791 gggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggt 14983890  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  14983891 tgcctacaatacactaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtg 14983953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 221
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225202
Alignment:
Q  138 acagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 20225202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175191
Alignment:
Q  73 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaa-caacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 171  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatg 54175140  T
Q  172 gtgggaccccttcccag-accccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54175141 gtgggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 54175191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8473783 - 8473629
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||   ||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8473783 aactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--ttaacagggtaaggctgcatacaatacacc 8473686  T
Q  165 aataatggtgggacccctt-cccagacccc-gcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8473685 a--aatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 8473629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463237
Alignment:
Q  79 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggac 178  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacacca--aatggtgggac 25463205  T
Q  179 cccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25463206 cccttcccggaccctgcatatgcgggagcttt 25463237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 217
Target Start/End: Original strand, 47443958 - 47444079
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 193  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||     
T  47443958 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccct 47444055  T
Q  194 gcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
T  47444056 gcatatgcaggagcttcagtgcac 47444079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 219
Target Start/End: Original strand, 54730225 - 54730376
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  54730225 ggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataaggctgcgtataatacaccaat 54730324  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54730325 aatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 54730376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Original strand, 54966977 - 54967145
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54966977 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 54967075  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  54967076 gttgc-tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctacatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 54967145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690188
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-------cagggtaaggctgcatacaatacac 163  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  164 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30690240 caat--tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 30690188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48327869 - 48327772
Alignment:
Q  124 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  48327869 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtgggacctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccggg 48327772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9987947 - 9987843
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||    
T  9987947 ggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacacca--aatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggagctttaatg 9987850  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  9987849 caccggg 9987843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352591
Alignment:
Q  52 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-----cagggtaa 146  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||||     ||||||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  147 g----gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 30352591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29208035 - 29207907
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||   ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  29208035 actgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgg 29207940  T
Q  189 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29207939 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 29207907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832322
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 170  Q
    |||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--at 9832373  T
Q  171 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||    
T  9832372 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccggg 9832322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30581624 - 30581481
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    ||||||||||||||  | |||  ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  30581624 taaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtacaatacaccaa-aa 30581526  T
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  30581525 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagctttagtg 30581481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Original strand, 14590790 - 14590922
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggt 144  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14590790 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 14590889  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacc 179  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  14590890 aaggctgcatacaatacatca--aatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 25629071 - 25629175
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  25629071 ggaaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtg 25629168  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  25629169 caccggg 25629175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029078
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaa-a 39029122  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttag 212  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  39029121 atggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagctttag 39029078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 487306 - 487135
Alignment:
Q  56 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 155  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  487306 ccttggcgtaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgta 487208  T
Q  156 caatacaccaata-------atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| || |       |||| ||||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  487207 caatacactaaaatggtgggatggcgggaccccttcccggattctgcgaatgcgggagctttagtgcaccggg 487135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Original strand, 25343162 - 25343312
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||   ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25343162 tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 25343261  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    || ||| ||||||||||| ||| || || |||| | ||||||||| |||||    
T  25343262 aagggttggaccccttcctagatcctgcgtatgtgagagctttagagcacc 25343312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49938746 - 49938611
Alignment:
Q  72 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 171  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  49938746 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cggggtaagg-tg--tacaatacaccaa-aatg 49938652  T
Q  172 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttag 212  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49938651 gtgggaccccttcccataccctgcatatgcgggagctttag 49938611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865048
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgca 51865052  T
Q  217 ccgg 220  Q
    ||||    
T  51865051 ccgg 51865048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908649
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaag-gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  || ||  |||||||| | ||||||| | |||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa- 20908699  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  20908698 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 20908649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30496476 - 30496333
Alignment:
Q  72 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 171  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  30496476 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaca--cgggtaaggctgcatacaatacacca--aatg 30496381  T
Q  172 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    | ||||| ||||||| ||||  || ||||  |||||||||||||||||    
T  30496380 gggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcaccg 30496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077805
Alignment:
Q  74 agttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggt 173  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggttgcgtacaatatacca--aatggt 39077853  T
Q  174 gggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | |||  ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39077852 gagacatctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 39077805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 55766647 - 55766475
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcac-gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||   |||||||   ||||||||   ||||||||||    
T  55766647 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgt-gtaaacagggta 55766549  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||    |||||||| ||||| |||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  55766548 aggctgcgtacaatacac--tgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 55766475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478801
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 170  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     ||||||||||  ||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaa-cagggtaaggctg-----aatacaccaa--at 32478851  T
Q  171 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  32478850 ggtgggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagcttt-gtgcaccggg 32478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 16494259 - 16494345
Alignment:
Q  135 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16494259 aaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtgtaccggg 16494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018807
Alignment:
Q  76 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 175  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaattagggtaaggctacgtacaatacacca--aatagtgg 41018849  T
Q  176 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||||    
T  41018848 gaccccttcccagaccttgcgtatggaggggctttagtgcac 41018807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315372
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggc 17315378  T
Q  150 tgcata 155  Q
    ||||||    
T  17315377 tgcata 17315372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33836564 - 33836496
Alignment:
Q  153 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33836564 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacggg 33836496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 153
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035308
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 153  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgca 43035308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42164307 - 42164225
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 152  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42164307 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgc 42164225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 21489109 - 21489210
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||    
T  21489109 ggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttcgtg 21489207  T
Q  215 cac 217  Q
    |||    
T  21489208 cac 21489210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55830902 - 55830733
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgg-gttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||   |||||||  |||||||||   ||||||||||    
T  55830902 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgt-gtaaacagggta 55830804  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    | ||||| ||||||||||    |||||||| ||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  55830803 atgctgcgtacaatacac--tgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcacc 55830733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  76 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 175  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||  ||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacacca--aatggtgg 7385531  T
Q  176 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 207  Q
    ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  7385530 gaccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 47441689 - 47441568
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||    ||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  47441689 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtacaatacacca--a 47441592  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccc 192  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  47441591 atggttggaccccttcccggaccc 47441568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580860
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||  || ||    ||||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||  ||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtctggaaa----cctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacacca--aa 3580901  T
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    || | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  3580900 tgctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttt 3580860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5313177 - 5313113
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaa 109  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  5313177 atgacgggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaa 5313113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7909393 - 7909289
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc-gggagctttagt 213  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||    
T  7909393 ggaaacagtctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctttagt 7909297  T
Q  214 gcaccggg 221  Q
    ||| ||||    
T  7909296 gcatcggg 7909289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484359
Alignment:
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 32484359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38755973 - 38755917
Alignment:
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38755973 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 38755917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 49796820 - 49796911
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctt 209  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  49796820 ggaaacagcctcttgtgttaaaa-catggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 49796911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580253
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 170  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||| |||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaa-aat 23580267  T
Q  171 ggtgggaccccttc 184  Q
    || | |||||||||    
T  23580266 ggcgagaccccttc 23580253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 28494224 - 28494277
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28494224 aatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 28494277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 38786682 - 38786735
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38786682 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 38786735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 165
Target Start/End: Original strand, 51420553 - 51420646
Alignment:
Q  73 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacggg-ttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 165  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||   | ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51420553 aagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggtacaatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 192
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357318
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    |||||||||| |||||||| ||| || ||||| |  | |||||||||||||     
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaa- 44357293  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccc 192  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  44357294 aatggcgggacctcttcccagaccc 44357318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10277855 - 10277767
Alignment:
Q  130 tgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  10277855 tgtataaaataggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgaaaccccttcccagaccctgcatatgcgggagttctagtgaaccgg 10277767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12711561 - 12711461
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  || ||||||| | |||||||||    
T  12711561 aaacaacatcttgtgtaaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgc 12711464  T
Q  216 acc 218  Q
    |||    
T  12711463 acc 12711461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 36589765 - 36589870
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||    |||||||||||||| |||    
T  36589765 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttgacagtacaccaa-aatggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtg 36589863  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  36589864 caccggg 36589870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 11394925 - 11394978
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11394925 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 11394978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 11404652 - 11404705
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11404652 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 11404705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29879681 - 29879624
Alignment:
Q  44 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcac 101  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29879681 aatgaggggtaacattggtgcaactgataaagttgttgtcatgtgactagaaggtcac 29879624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Original strand, 2813169 - 2813253
Alignment:
Q  137 aacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2813169 aacagggtaagactgcgtacaatacatcaataatggtgggaccctttcccgaacgatgcgtatgcgggagctttaagtgcaccgg 2813253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 217
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038174
Alignment:
Q  81 gtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccc 180  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||   | ||||| | |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| | |    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctg-aaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaa-aatggtggggcac 7038138  T
Q  181 cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    || ||| ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  7038139 ctacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcac 7038174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17079777 - 17079696
Alignment:
Q  102 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 185  Q
    ||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||    
T  17079777 gggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgcta--aatggtgggaccctttcc 17079696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629285
Alignment:
Q  78 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 177  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||| ||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgt-aaaaaaacagggtaaggccgcctac-atacaccaa-attggcggga 32629322  T
Q  178 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||||| ||||  || |||| ||||| |||||||    
T  32629321 ccccttcccggaccttgcgtatgtgggagttttagtg 32629285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553946
Alignment:
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 40553946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718693
Alignment:
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccggg 44718693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Original strand, 8820578 - 8820629
Alignment:
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  8820578 aataatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagttttagtgca 8820629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 19027986 - 19028037
Alignment:
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19027986 tggtgggactccttcccggaccccacttatgcgggagctttagtgcaccggg 19028037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35894563 - 35894505
Alignment:
Q  127 ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 186  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35894563 ttgtgtaaaaaacacggtaagtgtgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttccc 35894505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36816479 - 36816393
Alignment:
Q  134 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  36816479 aaaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaa-ggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccggg 36816393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47482918 - 47482864
Alignment:
Q  162 accaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  47482918 accaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 47482864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 221
Target Start/End: Original strand, 56322984 - 56323026
Alignment:
Q  179 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56322984 cccttcccggaccccggatatgcgggagctttagtgcaccggg 56323026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388302
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccggg 25388302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 54640498 - 54640429
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa 138  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  54640498 ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaa 54640429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50555721 - 50555665
Alignment:
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  50555721 aataatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttagtgcaccggg 50555665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 87
Target Start/End: Original strand, 18969698 - 18969735
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgt 87  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18969698 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 18969735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 221
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532118
Alignment:
Q  180 ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 35532118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 14530271 - 14530446
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14530271 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggta 14530370  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14530371 aggctacgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 14530446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 10543647 - 10543826
Alignment:
Q  42 aaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacag 141  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||    
T  10543647 aaaataaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacag 10543746  T
Q  142 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10543747 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10543826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 219
Target Start/End: Original strand, 5840982 - 5841154
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  5840982 gaggggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 5841081  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5841082 ggatgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 5841154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8455497 - 8455325
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8455497 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaa 8455398  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  8455397 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccggg 8455325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24200805 - 24200632
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24200805 aggggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24200706  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |  |||| | ||||||||||||||||||    
T  24200705 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccggg 24200632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Original strand, 11514392 - 11514560
Alignment:
Q  49 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 148  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  11514392 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaagg 11514491  T
Q  149 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11514492 ctgcgtacaatacacca--aatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 11514560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21779448 - 21779270
Alignment:
Q  39 ataaaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa 138  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||  ||||    
T  21779448 ataaaagtgaggggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgt--aaaa 21779351  T
Q  139 cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21779350 cagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 21779270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25079900 - 25079726
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggt 144  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25079900 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggt 25079801  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  25079800 aaggatgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccggg 25079726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 23397718 - 23397890
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||    
T  23397718 atgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggt 23397815  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23397816 aaggctacgtacaatacacca--aatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggg 23397890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 9671134 - 9671305
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaag-gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  9671134 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 9671231  T
Q  146 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9671232 aggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 9671305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12024099 - 12023929
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12024099 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 12024001  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| || |||  || ||||||| ||||||||    
T  12024000 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatttggaagctttaatgcaccgg 12023929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Original strand, 17667974 - 17668128
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17667974 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacc 17668073  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |  |||||||| |||||||| |  |||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  17668074 a--aatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccggg 17668128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25249920 - 25249747
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  25249920 atgatgggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgt-acaaacagggt 25249822  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  25249821 aaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccggg 25249747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416880
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
      || |||||||| ||    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40416931 --tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccggg 40416880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 17623536 - 17623686
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17623536 aactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacc 17623635  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |  |||||||| ||||||||||  | || || |||| || |||||||||||||    
T  17623636 a--aatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcac 17623686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39914467 - 39914315
Alignment:
Q  67 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  39914467 ctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtacaatacacc- 39914369  T
Q  166 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
      |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  39914368 -gaatggtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 39914315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 221
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546289
Alignment:
Q  84 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccct 182  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacccct 10546250  T
Q  183 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10546251 tcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10546289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 22371008 - 22371151
Alignment:
Q  44 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 143  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| |||   ||||||||||    
T  22371008 aatgaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt---aaaaacaggg 22371104  T
Q  144 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccc 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  22371105 taaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccc 22371151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158451
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 170  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||     ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  171 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtacacc 31158451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32781448 - 32781308
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  32781448 tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca-- 32781351  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  32781350 aatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagcttt 32781308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 17896215 - 17896381
Alignment:
Q  49 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaag 147  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17896215 ggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaag 17896314  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  17896315 gctgcgtacaatatacca--aatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgca 17896381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Original strand, 7214488 - 7214659
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   |||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  7214488 gaggggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaa 7214587  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| || |||||| | ||| | || |||||| ||| |||||||||||    
T  7214588 ggctgcgtacaatacacaaaaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcacc 7214659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444851
Alignment:
Q  84 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgtgtacgatacaccaa--atggtgggacccctt 14444816  T
Q  184 cccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14444817 cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 14444851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 17705449 - 17705567
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  17705449 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaa 17705548  T
Q  147 ggctgcatacaatacacca 165  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  17705549 ggctgtgtacaatacacca 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19977893 - 19977726
Alignment:
Q  49 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 148  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  19977893 ggggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataagg 19977794  T
Q  149 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
     ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  19977793 ttgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcacc 19977726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 210
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795400
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatac-aatacaccaat 167  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||       
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc--- 33795357  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  33795358 tatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagcttt 33795400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377085
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcacca--a 21377135  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  21377134 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagcttt-gtgcaccg 21377085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Original strand, 14544018 - 14544189
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgta-aaaaacagggtaa 146  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || ||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14544018 aggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaa 14544117  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    | |||| | |||||  | || |||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14544118 gactgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 14544189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4516510 - 4516360
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||   |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  4516510 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgtacaatacaccaat- 4516412  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || |||| || |||||||||| ||||||    
T  4516411 -tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccggg 4516360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573746
Alignment:
Q  53 taaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 152  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||  ||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgt-ataaacatggtaaggctgc 27573679  T
Q  153 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     ||||||||||||  |||||||| |||  |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  27573680 gtacaatacacca--aatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcggg 27573746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450376
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aa 5450360  T
Q  170 tggtgggaccccttcc 185  Q
     |||||||||||||||    
T  5450361 gggtgggaccccttcc 5450376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615116
Alignment:
Q  82 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 181  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  182 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 19615116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24860149 - 24859998
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  24860149 aactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgt-aaaaacatggt-aggctgcgtacaatacacc 24860052  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |  |||||| | |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24860051 a--aatggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 24859998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521392
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacacca--a 44521435  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    |||| |||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  44521434 atggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagcttta 44521392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  70 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||  ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||    
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctct--tgtaaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacacca--aa 99326  T
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  99325 tggtggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 36871515 - 36871617
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  36871515 ggaaacagcctcttgtgtgaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccgga-cctgcgtatgcgggagctttagtg 36871610  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  36871611 caccggg 36871617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40762347 - 40762243
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||| || |||| |||||||||||||    
T  40762347 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacacca--aatggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 40762250  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  40762249 caccggg 40762243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 44643497 - 44643649
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||    |||| | ||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||     
T  44643497 tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatgtacca- 44643595  T
Q  167 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  44643596 -aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccggg 44643649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Original strand, 24890451 - 24890533
Alignment:
Q  133 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  24890451 aaaaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145736
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaat- 23145759  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccc 192  Q
     ||||||||||| ||||| |||||    
T  23145758 -tggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557526
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaat- 23557549  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccc 192  Q
     ||||||||||| ||||| |||||    
T  23557548 -tggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 44604825 - 44604907
Alignment:
Q  64 taactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44604825 taactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaaacagggtaag 44604907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17380391 - 17380247
Alignment:
Q  73 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 172  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||     
T  17380391 aagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgt-ataaacagggtaaggttgtgtgcaatacacca--aatga 17380295  T
Q  173 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  17380294 tggaaccccttcctggaccctgcggatgcgggagcttt-gtgcaccggg 17380247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26684803 - 26684630
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaaca-acctcttgtgtaaaaaac-agggt 144  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||| ||||   | ||||| |||||||||||||||||  | |||    
T  26684803 gaggggtaactttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggt 26684704  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||||||| ||||||| || ||  ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  26684703 aaggctgcgtacaatatactaa--atggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccgg 26684630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419947
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg----taaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T
Q  165 aa 166  Q
    ||    
T  29419948 aa 29419947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 30826059 - 30826158
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30826059 ggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtggaaccc-ttcccagaccctacatatgcgggagctttagtg 30826154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Original strand, 17471542 - 17471675
Alignment:
Q  87 taactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 185  Q
    |||||| || ||||| |||||||||    |||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  17471542 taactgaaatgtcacaggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaa-aatgatgagaccccttcc 17471640  T
Q  186 cagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  17471641 ctgaccctgcctatgcgggagttttagtgcaccgg 17471675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 220
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641626
Alignment:
Q  78 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 177  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgt-gaaaacagggtaaagttgcgtacaatacacca--aattgtggga 25641583  T
Q  178 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||||||||  | || || |||||| ||||||||||| |||||    
T  25641584 ccccttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccgg 25641626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Original strand, 25632544 - 25632635
Alignment:
Q  128 tgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||  |||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  25632544 tgtgtaaaaaacaggataaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccggg 25632635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 23488544 - 23488609
Alignment:
Q  156 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  23488544 caatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 23488609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44449495 - 44449395
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || | || ||||| |||| ||||    
T  44449495 aaacaacctcttgaatgaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaa-aatagtgggaccccttcccggaccctgcgtttgtgggagttttaatgca 44449397  T
Q  217 cc 218  Q
    ||    
T  44449396 cc 44449395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41409988
Alignment:
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccggg 41409988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3633762 - 3633719
Alignment:
Q  176 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3633762 gaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 3633719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080227
Alignment:
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccggg 34080227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45235988 - 45235833
Alignment:
Q  58 ttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctgcatac 156  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    ||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| | |      
T  45235988 ttggtgtaaccagtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgt 45235889  T
Q  157 aatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  45235888 aatacacaaa--atggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtg 45235833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296421
Alignment:
Q  102 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 201  Q
    ||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||| | ||||| || ||||     
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaa-aatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgt 15296435  T
Q  202 gggagctttagtgc 215  Q
    || |||||| ||||    
T  15296434 ggaagctttggtgc 15296421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579758
Alignment:
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccggg 40579758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766381
Alignment:
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacggg 34766381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39189555 - 39189513
Alignment:
Q  179 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39189555 cccttcccggaccccgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 39189513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 39189603 - 39189557
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactg 92  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39189603 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg 39189557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13245181 - 13245111
Alignment:
Q  142 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  13245181 ggtaaggctgcgtacattacactaa--atggtgggaccccttcccggaccatgcatatacgggagctttagtg 13245111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 31523304 - 31523353
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31523304 aatggtggaaccctttcccaaaccctgcatatgcgggagctttagtgcac 31523353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 31525779 - 31525831
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31525779 aatgatgggaccctttgccagaccctgcatatgcgggagctttagtgtaccgg 31525831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 1289093 - 1289148
Alignment:
Q  166 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1289093 ataatggtgggaccccttcccggatcatgcatatgcgggagcttttagtgcaccgg 1289148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 4794875 - 4794924
Alignment:
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  4794875 aatgatgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctctagtgcac 4794924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19185837 - 19185760
Alignment:
Q  136 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 213  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  19185837 aaacatggtaaagttgcgtacaatgcacaaaaaatggtggaaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagt 19185760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12315785 - 12315714
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 166  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  12315785 aaggtcacgagttcaagtcatggaaacagcttcttat-taaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaa 12315714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12222080 - 12221923
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12222080 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 12221981  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12221980 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccggg 12221923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29356040 - 29355864
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaag-ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29356040 tgaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggt 29355941  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29355940 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 29355864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 1346918 - 1347088
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  1346918 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgt--aaaacagggtaa 1347015  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1347016 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 1347088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1354936 - 1354766
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  1354936 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 1354839  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1354838 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 1354766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2166575 - 2166419
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  2166575 aactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacacc 2166476  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  2166475 aataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccggg 2166419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2178208 - 2178052
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  2178208 aactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacacc 2178109  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  2178108 aataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccggg 2178052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 218
Target Start/End: Original strand, 9161074 - 9161247
Alignment:
Q  44 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 143  Q
    |||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  9161074 aatgaggggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagag 9161172  T
Q  144 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  9161173 taaggctgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacc 9161247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14975267 - 14975099
Alignment:
Q  41 aaaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca 140  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14975267 aaaaatgagggataaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaca 14975168  T
Q  141 gggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     ||            |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14975167 agg------------caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccggg 14975099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 181
Target Start/End: Original strand, 1941809 - 1941941
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1941809 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 1941908  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 181  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  1941909 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggacccc 1941941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Original strand, 6024205 - 6024338
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |    |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  6024205 aactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaagactgcgtacaatacacc 6024304  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcata 198  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  6024305 aataatgatgggacctcttcccggaccccgcata 6024338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3815256 - 3815086
Alignment:
Q  49 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 148  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   |||||||  || |||||||||||| | |||| |     
T  3815256 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacga 3815157  T
Q  149 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  3815156 ctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccggg 3815086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 161
Target Start/End: Original strand, 8409195 - 8409311
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8409195 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggt 8409294  T
Q  145 aaggctgcatacaatac 161  Q
    |||||||| ||||||||    
T  8409295 aaggctgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13905158 - 13905041
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 147  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13905158 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 13905060  T
Q  148 gctgcatacaatacaccaa 166  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  13905059 gctgcatacaattcaccaa 13905041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32728334 - 32728169
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32728334 gggtaaccttggtggaacgagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagac 32728235  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||  ||||||| |||||  || ||||  ||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  32728234 tgtgtacaatataccaa--atagtggt-ccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgcacc 32728169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7947511 - 7947384
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 188  Q
    |||| |||||||| ||||||| |   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  7947511 actgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggcccccttcccgg 7947413  T
Q  189 accccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||    
T  7947412 accttgcgtatgtgggagctttagtgcac 7947384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 221
Target Start/End: Original strand, 12892071 - 12892135
Alignment:
Q  157 aatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12892071 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 12892135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 163
Target Start/End: Original strand, 20400625 - 20400737
Alignment:
Q  51 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 150  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20400625 ggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 20400724  T
Q  151 gcatacaatacac 163  Q
    || |||| |||||    
T  20400725 gcgtacagtacac 20400737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Original strand, 14553477 - 14553626
Alignment:
Q  58 ttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcataca 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||   ||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  14553477 ttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtata 14553575  T
Q  158 atacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagct 208  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||    
T  14553576 atacaccaaaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggagct 14553626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15866218 - 15866052
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||| |   ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  15866218 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaa 15866119  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
     ||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| || ||||||||    
T  15866118 agctgcgt--aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcac 15866052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 26097182 - 26097284
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26097182 ggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 26097277  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  26097278 caccggg 26097284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 25557747 - 25557849
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25557747 ggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 25557842  T
Q  215 caccggg 221  Q
    |||||||    
T  25557843 caccggg 25557849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755430
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||   | ||||| |||||| |   ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatat--gcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||||||||  |||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2755483 atggtgggagtccttcccaaatcctgcatatgcgcgggagctttagtgcaccgg 2755430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 19340858 - 19340954
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19340858 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgca-acaatacaccaa-aatgatgggaccccttcctggacccggcgtatgcggaagctttagtgcaacggg 19340954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Original strand, 33138838 - 33138957
Alignment:
Q  98 tcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcat 197  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||| |  |    
T  33138838 tcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacacca--aatggtgggacccttttccggaccctgtgt 33138935  T
Q  198 atgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  33138936 atgcagtagctttagtgcaccg 33138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 214
Target Start/End: Original strand, 24097553 - 24097696
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    |||    
T  24097553 aactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttaca----acc 24097648  T
Q  165 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  24097649 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtg 24097696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 221
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886039
Alignment:
Q  149 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggg 12886039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889553
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||||   | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacaccta-a 12889500  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | | ||||||||||| || |||||    | || ||||||||||||||| ||||    
T  12889501 acgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcggg 12889553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18277327 - 18277202
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 193  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||| |     
T  18277327 aaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacacca--aatggtgggaccccttcctagactct 18277230  T
Q  194 gcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||    
T  18277229 acgtatgcgggagctttactgcaccggg 18277202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 220
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007750
Alignment:
Q  71 taaagttgttgtcatgtaactggaa--ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaa--cagggtcaggctgcgtacaatacacca--a 28007699  T
Q  169 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  28007700 atgctgggaccccttccctaacctc-catatgcggaagctctagtgcaccgg 28007750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Original strand, 22967124 - 22967235
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||| | | | ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  22967124 tgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgt-aaaaataggata 22967222  T
Q  146 aggctgcatacaa 158  Q
    |||||||||||||    
T  22967223 aggctgcatacaa 22967235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23821269 - 23821158
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 145  Q
    |||||||||||||| | | | ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  23821269 tgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgta-aaaataggata 23821171  T
Q  146 aggctgcatacaa 158  Q
    |||||||||||||    
T  23821170 aggctgcatacaa 23821158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Original strand, 32579474 - 32579543
Alignment:
Q  142 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 213  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32579474 ggtaagcctgcgtacaataccccaa--atggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctttagt 32579543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23930303 - 23930138
Alignment:
Q  51 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttc-aagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    ||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||  ||  ||||||||| |||| |||| | |||||||  ||| ||||||||||||| | ||  |     
T  23930303 ggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagata--gt 23930206  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    ||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23930205 tgcgtacaatacaccag--atggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccg 23930138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Original strand, 24734591 - 24734760
Alignment:
Q  51 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa---------aacag 141  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||| |    |||||||||||||||||||||         |||||    
T  24734591 ggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaaaacag 24734690  T
Q  142 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttag 212  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  24734691 ggtaaggttgcgtacaatacaacaaaaaaggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgc-ggagctttag 24734760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9671196 - 9671093
Alignment:
Q  117 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  9671196 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcctactttacatcaa-aatggtaggacccctttccgaaccctgcaaatacgggagctttaatgca 9671098  T
Q  217 ccggg 221  Q
     ||||    
T  9671097 tcggg 9671093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Original strand, 11849075 - 11849145
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11849075 ggaaacaacctcttgtgttaaaaacaggataaagttgcccacaatacaccaa-aatggtgggaccccttccc 11849145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Original strand, 17432336 - 17432474
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaac------agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccct 182  Q
    |||| |||||||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||  |||||||||| || ||||||| ||||  |    
T  17432336 actgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagaccttt 17432435  T
Q  183 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| || || |   ||||||||||||||||||||||||    
T  17432436 tcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccggg 17432474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20906841 - 20906802
Alignment:
Q  175 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20906841 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 20906802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3116262 - 3116139
Alignment:
Q  89 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 188  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |        ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  3116262 actgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaatga--------ctgcgcacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcgg 3116171  T
Q  189 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||  || ||||||||||||||||| ||||||    
T  3116170 accttgcgtatgcgggagctttagtacaccgg 3116139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 221
Target Start/End: Original strand, 6808467 - 6808521
Alignment:
Q  167 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  6808467 taatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccggg 6808521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 183
Target Start/End: Original strand, 32068121 - 32068182
Alignment:
Q  121 aacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32068121 aacctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacaccaa-aatggtgggacccctt 32068182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 111
Target Start/End: Original strand, 12063424 - 12063485
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  12063424 gggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagt 12063485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 158
Target Start/End: Original strand, 17448325 - 17448389
Alignment:
Q  94 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaa 158  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17448325 aaggtcacgggttcaagttttgaaaacaacattttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaa 17448389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240837
Alignment:
Q  79 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggac 178  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaat--tggtgggac 23240876  T
Q  179 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||   |||   || |||||||||||||||||||||    
T  23240875 cccttctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcac 23240837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267851
Alignment:
Q  156 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  13267788 caatacaccaa--atggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggg 13267851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 383834 - 383769
Alignment:
Q  154 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  383834 tacaatacaccaa--attgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccggg 383769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16895778 - 16895706
Alignment:
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtggga-ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| || || ||||||||||||||    
T  16895778 tgcatacaatacactaaaaatggtgggacccccttcccggaccctacatatgtggaagttttagtgcaccggg 16895706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16916064 - 16915996
Alignment:
Q  153 atacaatacaccaataatggtgggacc-ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16916064 atacaatacactaaaaatggtaggacctccttcctagaccctacatatgtgggagctttagtgcaccgg 16915996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 183
Target Start/End: Original strand, 31990096 - 31990163
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31990096 ggaaacaatctcttgtgtaaaaaacggagcaagcttgcatacaatacaccaa-aatggcgggacccctt 31990163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 33923009 - 33922945
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||    
T  33923009 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagt 33922945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10734965 - 10734914
Alignment:
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10734965 tggtgggcccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtccaccggg 10734914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Original strand, 11395836 - 11395886
Alignment:
Q  170 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  11395836 tggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgggagctttagtccaccgg 11395886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24751176 - 24751119
Alignment:
Q  126 cttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttc 184  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  24751176 cttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacactaa-aatggtgagaccccttc 24751119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 8417444 - 8417500
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| || | |||||||    
T  8417444 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaaca 8417500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14341166 - 14341134
Alignment:
Q  132 taaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14341166 taaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 14341134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Original strand, 18254559 - 18254613
Alignment:
Q  134 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  18254559 aaaaacagggtaaagctgcatacaatac-ccaa-aatagtgggaccccttcacagac 18254613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29016337 - 29016301
Alignment:
Q  175 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 211  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29016337 ggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagcttta 29016301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 46806 - 46957
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||      
T  46806 tggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacacca-- 46903  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  46904 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 46957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24950 - 24786
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |     ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24950 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtca-----acagcctcttgtgtaaaaaacagggt 24856  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  24855 aaggctgcgtacaacacacca--aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 24786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46796 - 46721
Alignment:
Q  140 agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  46796 agggtaaggatgcatacaatataccaa-aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttaatgca 46721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 43681 - 43780
Alignment:
Q  115 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc-ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 213  Q
    ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43681 ggaaacagcgtcttgtgtaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggagctctagt 43776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Original strand, 10773 - 10932
Alignment:
Q  56 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  10773 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtc 10872  T
Q  156 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 217  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10873 caatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59105
Alignment:
Q  52 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 151  Q
    |||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  152 catacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 59105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 30533 - 30703
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||     
T  30533 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtag 30630  T
Q  147 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30631 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 30703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13202 - 13033
Alignment:
Q  49 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 148  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||    
T  13202 ggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgt-aaaaacaaggtaagg 13104  T
Q  149 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  13103 ctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccggg 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1745 - 1599
Alignment:
Q  68 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  1745 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgt--aaaacaggataaggctgcatacaatacacca-- 1650  T
Q  168 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1649 aatgatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcacc 1599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10226 - 10059
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  10226 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagac 10129  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  10128 tgcgtacaatacacca--aatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccggg 10059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20387
Alignment:
Q  50 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 149  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  20554 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagac 20457  T
Q  150 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20456 tgcgtacaatacacca--aatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccggg 20387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 111
Target Start/End: Original strand, 8898 - 8963
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  8898 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagt 8963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 111
Target Start/End: Original strand, 19226 - 19291
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  19226 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagt 19291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 192
Target Start/End: Original strand, 4129 - 4257
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 164  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  4129 aactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacacc 4228  T
Q  165 aataa-tggtgggaccccttcccagaccc 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4229 aataattggtgggaccccttcccggaccc 4257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 11093 - 11252
Alignment:
Q  54 aaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 153  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||     
T  11093 aaccttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaag--taaggctgct 11189  T
Q  154 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11190 tacaatacaccaa--atggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 11252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48643
Alignment:
Q  102 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 201  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 48663  T
Q  202 gggagctttagtgcaccggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  48662 gggagctctagtgcaccggg 48643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 226588 - 226456
Alignment:
Q  46 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggt 144  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  226588 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 226489  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacc 179  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  226488 aaggctgcatacaatacatca--aatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24143
Alignment:
Q  141 gggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 24143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 72971 - 72879
Alignment:
Q  124 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  72971 ctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcctacaatacacca--aatggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 72879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35200 - 35062
Alignment:
Q  47 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttg-ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggt 144  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||   ||||||||||    
T  35200 gagggataactttggtgcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggt 35101  T
Q  145 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  35100 aaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccctttcc 35062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 111
Target Start/End: Original strand, 83827 - 83893
Alignment:
Q  45 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  83827 atgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagt 83893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 191
Target Start/End: Original strand, 23606 - 23695
Alignment:
Q  100 acgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacc 191  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23606 acgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtacaatgtagca--aatggtgggaccccttcccagacc 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 180
Target Start/End: Original strand, 32906 - 33016
Alignment:
Q  69 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 168  Q
    |||| |||||||| || || |||  ||||||| ||||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |    
T  32906 ggtatagttgttgccacgtgacttaaaggtcatgggttcaagtccgcgaaaaaacctcttctgtaaaaaacagagtaagactgtatacaatacaccaa-a 33004  T
Q  169 atggtgggaccc 180  Q
     |||||||||||    
T  33005 ttggtgggaccc 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 137
Target Start/End: Original strand, 8865 - 8935
Alignment:
Q  67 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||    
T  8865 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaaa 8935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 3574 - 3668
Alignment:
Q  123 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 219  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  3574 cctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccga--atgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccg 3668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 111
Target Start/End: Original strand, 24619 - 24682
Alignment:
Q  48 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 111  Q
    ||||||||||||||   || || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  24619 aggggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagt 24682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 43101 - 43173
Alignment:
Q  65 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaa 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| ||    |||||| |||||||||||||||    
T  43101 aactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaa 43173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University