View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16700_high_4 (Length: 249)

Name: NF16700_high_4
Description: NF16700
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16700_high_4
NF16700_high_4
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (1-245)||(31651476-31651721)
chr5 (1-245)||(9811429-9811673)
chr5 (1-244)||(12703571-12703814)
chr5 (1-245)||(12764686-12764930)
chr5 (1-245)||(26245463-26245707)
chr5 (10-244)||(39535562-39535796)
chr5 (9-245)||(20099941-20100176)
chr5 (1-245)||(7865126-7865370)
chr5 (1-245)||(25805082-25805325)
chr5 (1-245)||(20941389-20941632)
chr5 (1-245)||(5098012-5098254)
chr5 (1-245)||(31097178-31097421)
chr5 (1-245)||(22941612-22941856)
chr5 (1-245)||(32261-32503)
chr5 (1-245)||(12789361-12789603)
chr5 (1-245)||(23546284-23546526)
chr5 (1-245)||(24933004-24933246)
chr5 (1-67)||(26129568-26129634)
chr5 (142-238)||(24694986-24695081)
chr5 (142-238)||(24701750-24701845)
chr5 (142-238)||(19706747-19706842)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-245)||(8781571-8781815)
chr8 (1-245)||(18835707-18835951)
chr8 (1-245)||(20534906-20535150)
chr8 (1-245)||(6431248-6431492)
chr8 (1-245)||(22659191-22659434)
chr8 (9-245)||(2962628-2962864)
chr8 (1-245)||(8370950-8371193)
chr8 (1-245)||(26240846-26241090)
chr8 (1-245)||(21969695-21969938)
chr8 (1-245)||(25611557-25611800)
chr8 (9-237)||(27098700-27098928)
chr8 (9-136)||(12562493-12562620)
chr8 (1-245)||(27007215-27007457)
chr8 (1-245)||(27014358-27014600)
chr8 (1-245)||(45533971-45534213)
chr8 (1-245)||(21917038-21917280)
chr8 (1-245)||(22130307-22130549)
chr8 (1-245)||(27880185-27880427)
chr8 (1-245)||(28020366-28020608)
chr8 (114-238)||(28548603-28548726)
chr8 (142-238)||(15326782-15326877)
chr8 (142-238)||(15507151-15507246)
chr8 (114-238)||(6094679-6094802)
chr8 (114-238)||(21941221-21941344)
chr8 (114-203)||(22172042-22172131)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (1-245)||(9538320-9538564)
chr4 (1-245)||(32636845-32637089)
chr4 (1-239)||(19362772-19363009)
chr4 (11-245)||(30040186-30040420)
chr4 (2-245)||(5616758-5617001)
chr4 (9-245)||(4546432-4546668)
chr4 (1-197)||(11421368-11421559)
chr4 (1-245)||(34975913-34976157)
chr4 (1-136)||(1942086-1942221)
chr4 (52-245)||(19373759-19373951)
chr4 (1-245)||(9487913-9488153)
chr4 (2-245)||(15461864-15462106)
chr4 (9-164)||(23055840-23055995)
chr4 (1-245)||(2677375-2677617)
chr4 (1-245)||(3368721-3368963)
chr4 (1-245)||(15815383-15815625)
chr4 (1-245)||(18110741-18110983)
chr4 (1-245)||(20244299-20244541)
chr4 (1-245)||(26531975-26532217)
chr4 (1-245)||(4675681-4675923)
chr4 (105-237)||(5524695-5524825)
chr4 (1-245)||(5870779-5871021)
chr4 (1-245)||(18163524-18163766)
chr4 (1-245)||(17299657-17299899)
chr4 (150-245)||(10677098-10677192)
chr4 (150-245)||(10890738-10890832)
chr4 (114-238)||(26964196-26964319)
chr4 (1-68)||(5528352-5528419)
chr4 (114-238)||(8845759-8845882)
chr4 (114-238)||(8858723-8858846)
chr4 (114-238)||(10689835-10689958)
chr4 (114-238)||(10903475-10903598)
chr4 (114-238)||(18262768-18262891)
chr4 (114-238)||(18269629-18269752)
chr4 (114-238)||(19926288-19926411)
chr4 (114-238)||(26971019-26971142)
chr4 (114-238)||(55613239-55613362)
chr4 (1-56)||(19365882-19365937)
chr4 (114-203)||(869153-869242)
chr4 (114-238)||(5707876-5707998)
chr4 (114-238)||(5714504-5714626)
chr4 (114-238)||(10620861-10620984)
chr4 (114-238)||(10627940-10628063)
chr4 (114-238)||(28392662-28392785)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (1-245)||(29800833-29801077)
chr2 (1-245)||(15341698-15341942)
chr2 (9-245)||(19616804-19617040)
chr2 (1-237)||(24763376-24763612)
chr2 (1-239)||(20687117-20687356)
chr2 (9-245)||(24228911-24229147)
chr2 (14-238)||(41315559-41315783)
chr2 (1-245)||(24249730-24249972)
chr2 (1-245)||(30174739-30174981)
chr2 (41-121)||(21627153-21627233)
chr2 (114-238)||(21329776-21329899)
chr2 (114-238)||(22791386-22791509)
chr2 (9-168)||(40300709-40300869)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (4-245)||(28130926-28131167)
chr7 (9-245)||(19388929-19389166)
chr7 (4-245)||(16011806-16012047)
chr7 (2-245)||(18257263-18257505)
chr7 (1-245)||(18258820-18259064)
chr7 (9-245)||(19393123-19393358)
chr7 (1-245)||(19231250-19231493)
chr7 (1-245)||(8465361-8465604)
chr7 (21-245)||(15168991-15169213)
chr7 (9-245)||(34128943-34129179)
chr7 (28-238)||(24443081-24443291)
chr7 (1-245)||(47166556-47166799)
chr7 (1-133)||(31190248-31190380)
chr7 (1-245)||(41680665-41680908)
chr7 (88-245)||(25845220-25845377)
chr7 (1-245)||(10668598-10668841)
chr7 (4-149)||(14592215-14592362)
chr7 (1-245)||(48808194-48808436)
chr7 (1-244)||(30254500-30254741)
chr7 (9-203)||(12409897-12410091)
chr7 (1-245)||(15730113-15730355)
chr7 (1-245)||(18139036-18139278)
chr7 (1-245)||(18400466-18400708)
chr7 (1-245)||(18407450-18407692)
chr7 (1-245)||(2204914-2205156)
chr7 (2-168)||(8836551-8836717)
chr7 (107-245)||(31190102-31190241)
chr7 (86-245)||(12393076-12393234)
chr7 (1-135)||(5982519-5982653)
chr7 (114-238)||(29328340-29328463)
chr7 (114-238)||(12751382-12751505)
chr7 (114-238)||(15152999-15153122)
chr7 (114-238)||(18561554-18561677)
chr7 (114-237)||(11535591-11535713)
chr7 (144-238)||(13392734-13392828)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (1-245)||(26816653-26816897)
chr3 (1-239)||(15537897-15538135)
chr3 (1-245)||(21034600-21034843)
chr3 (1-245)||(21399154-21399397)
chr3 (1-245)||(14147382-14147625)
chr3 (1-245)||(15846233-15846476)
chr3 (2-245)||(11787950-11788193)
chr3 (9-245)||(15316872-15317108)
chr3 (1-245)||(25978424-25978668)
chr3 (1-245)||(28088468-28088711)
chr3 (1-245)||(12300272-12300514)
chr3 (1-115)||(14890753-14890867)
chr3 (1-245)||(55427383-55427625)
chr3 (1-245)||(20147252-20147494)
chr3 (114-238)||(6110620-6110743)
chr3 (114-238)||(10572120-10572243)
chr3 (114-238)||(10578884-10579007)
chr3 (114-238)||(16482011-16482134)
chr3 (142-236)||(1647051-1647144)
chr3 (102-168)||(16241014-16241080)
chr3 (114-238)||(13211858-13211981)
chr3 (114-238)||(13517363-13517486)
chr3 (114-238)||(15341747-15341870)
chr3 (114-238)||(17780646-17780769)
chr3 (80-127)||(30464445-30464491)
chr3 (114-238)||(13249163-13249286)
chr3 (114-238)||(15357114-15357237)
chr3 (114-238)||(15600412-15600535)
chr3 (114-238)||(15606957-15607080)
chr3 (114-238)||(18520531-18520654)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (9-245)||(8728032-8728268)
chr1 (1-245)||(634300-634544)
chr1 (1-245)||(19706136-19706379)
chr1 (1-245)||(28134420-28134663)
chr1 (1-245)||(43802062-43802305)
chr1 (1-245)||(47667182-47667425)
chr1 (9-245)||(22612862-22613097)
chr1 (1-245)||(20390937-20391179)
chr1 (1-245)||(9456478-9456720)
chr1 (1-245)||(20779343-20779585)
chr1 (1-245)||(42816687-42816929)
chr1 (1-245)||(22669955-22670197)
chr1 (9-154)||(29097092-29097238)
chr1 (52-168)||(51997681-51997797)
chr1 (88-245)||(14482339-14482494)
chr1 (114-238)||(27130938-27131061)
chr1 (1-167)||(19819493-19819654)
chr1 (114-238)||(18252586-18252709)
chr1 (114-222)||(16358579-16358686)
chr1 (114-238)||(18532042-18532165)
chr1 (114-238)||(27310105-27310228)
chr1 (2-61)||(28145603-28145662)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-245)||(20736026-20736270)
chr6 (1-245)||(22559892-22560135)
chr6 (9-232)||(4073945-4074168)
chr6 (1-245)||(33317227-33317471)
chr6 (1-245)||(10358751-10358991)
chr6 (1-245)||(8613281-8613525)
chr6 (1-245)||(18019526-18019769)
chr6 (1-245)||(14074842-14075085)
chr6 (8-149)||(19218792-19218933)
chr6 (1-132)||(17120315-17120446)
chr6 (1-245)||(19735216-19735458)
chr6 (107-245)||(21995426-21995564)
chr6 (1-245)||(1585806-1586048)
chr6 (1-245)||(27508045-27508287)
chr6 (1-245)||(16789433-16789675)
chr6 (1-245)||(22859586-22859828)
chr6 (1-115)||(21994949-21995063)
chr6 (9-245)||(27525259-27525493)
chr6 (114-238)||(27297185-27297308)
chr6 (114-238)||(16559000-16559123)
chr6 (114-238)||(17690968-17691091)
chr6 (114-238)||(27380780-27380903)
chr6 (114-238)||(27471163-27471286)
chr6 (114-238)||(29309446-29309569)
chr6 (114-238)||(29316405-29316528)
chr6 (114-238)||(11652279-11652402)
chr6 (114-238)||(17683997-17684120)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (9-196)||(26911-27098)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (1-245)||(12646-12890)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (52-239)||(54175-54362)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-245)||(39684-39929)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-136)||(348-483)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-136)||(67179-67314)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-245)||(545-788)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (1-245)||(3373-3615)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (1-136)||(11331-11466)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-245)||(120092-120334)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (1-168)||(11597-11763)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (64-238)||(81510-81684)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (88-163)||(15342-15416)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (9-146)||(9101-9238)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (114-238)||(6462-6585)
scaffold0390 (142-238)||(13478-13573)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (114-238)||(1849-1972)
scaffold0234 (114-238)||(10740-10863)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (127-239)||(108826-108938)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (114-238)||(7663-7786)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (113-205)||(6077-6169)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31651721 - 31651476
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||    
T  31651721 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgaatggccatgccgaattaagtcaatatgagatattggacttattcgttactaaatatatttcggg 31651622  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtgga-caagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||   || ||| ||| ||||| |||| || ||||    
T  31651621 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgacacaacatatgtcttgtgttcaatatagatataaagagcaaatgactaattatacatataaaca 31651522  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  31651521 ttatcatggaaaaggtttcgtcggatcacttgacattcttgtcact 31651476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9811673 - 9811429
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  9811673 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 9811574  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||  ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||||||| |  ||    
T  9811573 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcattggggtcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacataattat 9811474  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9811473 tatcatggaaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 9811429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12703814 - 12703571
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  12703814 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 12703715  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||  ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||||||| |  ||    
T  12703714 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcattggggtcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacataattat 12703615  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcac 244  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12703614 tatcatgaaaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcac 12703571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12764930 - 12764686
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  12764930 tttaggcctcttgatgaaatatgactgaaaaattgcatggccaggccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 12764831  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||  ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||||||| | |||    
T  12764830 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacgatatctatgcattgggatcaataaagatattgagacaaaggagtaattgtacacataatcat 12764731  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12764730 tatcatggaaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 12764686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26245463 - 26245707
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |     
T  26245463 tttaggcctcttgatgacatatgactgtaaaattgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatatttgacttattcgttattcaatatatttcaga 26245562  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||| || ||    
T  26245563 atcaggaaatataaatattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgagatcaatatagatattaggacaaaggagtaattgtacacataaatat 26245662  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26245663 tatcatggaaaaagtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 26245707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 39535562 - 39535796
Alignment:
Q  10 cttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39535562 cttgatgaaatatgactgtaaagttgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatattagacttattcgttattcattatatttcgggatcaagaaa 39535661  T
Q  110 tataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgga 209  Q
    |||||||||||  | ||||||||| || |  ||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||  |||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  39535662 tataaatattgttcaatacaagggggacaatatctatgccttgtgatcaatataaatacgaggacaaaagagtaattgtacaaatgaatattatcatgga 39535761  T
Q  210 aaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcac 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39535762 aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcac 39535796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20100176 - 20099941
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20100176 tcttgatcaaatatgactataaaattgcatggccatgtcgaagtaagtcaatatgagatattggacttattcgttatttagtatatttcgggattaagaa 20100077  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  20100076 atataaatattgatctatacaagggtgatataatatatgccttgtgatcaatataaatatgaggacaaaggagtgattgtgcacatgaacattatcatgg 20099977  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
     |||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  20099976 -aaagatttcgtcagatcatatgacattcttgtcact 20099941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7865370 - 7865126
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  7865370 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggttatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 7865271  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||  ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||||||| |  ||    
T  7865270 atcaagaaatataaacattgatctatacaaaggtgacaatatctatgcattgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacataattat 7865171  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7865170 tatcatggaaaatgtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 7865126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25805325 - 25805082
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  25805325 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 25805226  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| |  | |||||||||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  25805225 atcaagaaatataataattgatctatacaaaggtgacaatacctatgtcttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattatacacatgaata 25805126  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25805125 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 25805082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 20941389 - 20941632
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  20941389 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttatttgttattcagtatatttcgga 20941488  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  20941489 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaata 20941588  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20941589 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 20941632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 5098012 - 5098254
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||     
T  5098012 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcgatataagatattggacttattcgttattcagtatattt-gga 5098110  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | ||   |||||||||||||  || |||  ||| |||| ||||||| ||  |    
T  5098111 atcaagaaaaataaatattgatctgtacaagggtgacaaaatctatgccatgatatcaatatagatattagggcaaaggagaaattgtacacat-aaatt 5098209  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5098210 tatcatgaaaaaggttccgtcagatcacttgacattcttgtcact 5098254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 31097178 - 31097421
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  31097178 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattca-tatatttcgga 31097276  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   ||||| ||||||||| |||||||||  |    
T  31097277 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaatgagtaattgtacacatgagta 31097376  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  31097377 ttatcatggaaaa-gtttcatcatatcacttgacattcttgtcact 31097421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22941612 - 22941856
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  22941612 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgatctaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 22941711  T
Q  101 atc-aagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaac 198  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| ||||||||||     
T  22941712 atcaaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaat 22941811  T
Q  199 attattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  22941812 attatcatg--aaaggtttcgtcagatcactttacattcttgtcact 22941856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 32261 - 32503
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  32261 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 32360  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  32361 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 32460  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32461 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 32503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12789603 - 12789361
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  12789603 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 12789504  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  12789503 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 12789404  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12789403 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 12789361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 23546284 - 23546526
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  23546284 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 23546383  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  23546384 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 23546483  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23546484 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 23546526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24933246 - 24933004
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||||||||| |     
T  24933246 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcaga 24933147  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  24933146 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 24933047  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24933046 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 24933004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26129634 - 26129568
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagat 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||| |||||||||| ||||    
T  26129634 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggtcatgctgaatcaagtcaatatgagat 26129568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24695081 - 24694986
Alignment:
Q  142 tctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24695081 tctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaaggtttcgtcagatcacatgacattct 24694986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24701845 - 24701750
Alignment:
Q  142 tctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24701845 tctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaaggtttcgtcagatcacatgacattct 24701750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19706842 - 19706747
Alignment:
Q  142 tctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19706842 tctatggcttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaaggtttcatcagatcacatgacattct 19706747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8781815 - 8781571
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  8781815 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaaattgcatgaccatgccgaattaagtcaatatgagatattgggcttattcgttattcaatatattttggg 8781716  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| | ||||| |||||    
T  8781715 atcaagaaatataaatattgatatatacaagggtgacaaaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgaggacaaaaaagtaattgtgcacatcaacat 8781616  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  8781615 tatcaaggaaaatgtttcgttagatcacttgacattcttgtcact 8781571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 18835707 - 18835951
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  18835707 tttaggcctcttgatgaaatatgaccgtaaaattgcatggccatgccaaactaagtcaatatgagatattggacttatttgttattcagtatatttcggg 18835806  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||| ||    
T  18835807 atcaagaaatataaatattgatctatacaatggtgacaaaatctatgtcatttgatcaatatagatatgaagacagaggagtaattgtacacatgaatat 18835906  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  18835907 tatcatgaaaaaggtttcgtcaaatcacttgacattcttgtcact 18835951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20535150 - 20534906
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  20535150 tttaggcctattgatgaaatatgactgtaaaattgcaaggccatgctgaattaagtcaatatgagatattgggcttattcgttattcagtatatttcggg 20535051  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  || ||||| | |||||||||||    
T  20535050 atcaagaaatataaatattgatctatatagggatgacaaaatctatgccttgtgatcaatatagatatgaggacaaaggaataattatgcacatgaacat 20534951  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20534950 tatcatggaaaatgtttcgtcagatcatttgacattcttgtcact 20534906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 6431248 - 6431492
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||     
T  6431248 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggtcatgccggactaagtcaatatgagatattggacttattcgttatttagtatatttcgga 6431347  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  |||||||||||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||| |  ||    
T  6431348 atcaagaaatataaacattgatccatacaagggtgacaatatctatgtcttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattttacacataattat 6431447  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6431448 tatcatgaaaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 6431492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22659434 - 22659191
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||     
T  22659434 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaatcagtatatttcgga 22659335  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| |||||||||  ||    
T  22659334 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatattgagacaaaggagtaattgtacacatgagtat 22659235  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22659234 tatcatggaaaa-gtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 22659191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2962864 - 2962628
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2962864 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaa 2962765  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||  ||  | |||||| ||||||   || ||  |||||||| ||||||| |  ||||| ||||    
T  2962764 atataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcatttggatcaataaagatatcgagaaaaaggagtaattgtacacataattattatcatgg 2962665  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  2962664 aaaaggtttcgttagatcacttgacattcttgtcact 2962628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8371193 - 8370950
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  8371193 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcaatatatttcgga 8371094  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatat-agatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |  ||||||| |||| | ||||||| || |||   || ||  |||||||| |||||||||| |    
T  8371093 atcaagaaatataattattgatctatacaaggatgacaatatctatgccttgggatcaatataaggtatcgagataaaggagtaattgtacacatgaata 8370994  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||  |||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8370993 ttaccatg--agaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 8370950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26240846 - 26241090
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  26240846 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggctatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgctgttcagtatatttcggg 26240945  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || ||||  |||||  |||||||| |||||||||  |    
T  26240946 atcaaaaaatataattattgatctacacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatggagacaaaggagtaattgtacacatgagta 26241045  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26241046 ttatcatgg-aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 26241090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21969695 - 21969938
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |     
T  21969695 tttaggcctcttgatgaaatatgattgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttatccagtatatttccga 21969794  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| ||||| |||| |    
T  21969795 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgtcttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacgtgaata 21969894  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  21969895 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgatattcttgtcact 21969938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 25611557 - 25611800
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  25611557 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatagccatgacgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 25611656  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |  |||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| ||| |||||| |    
T  25611657 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacatatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacgcatgaata 25611756  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25611757 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 25611800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27098928 - 27098700
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||||||| || | | ||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  27098928 tcttgatgaaatgtgactgtaaaattgcatgatcatgccggattaagtcaatatgggatattggatttattcattactcaatatattttaggatcaagaa 27098829  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||      || || |||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  27098828 atattactattgagctatacaagggtgacacaatctatgtcttgtgttcaatatagttataaaagaaaatgtgtaattatacacatgatcattatcacgg 27098729  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattc 237  Q
    |||| ||||| | || |||| ||||||||    
T  27098728 aaaaagtttcattagatcacatgacattc 27098700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Original strand, 12562493 - 12562620
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12562493 tcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaa 12562592  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtga 136  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12562593 atataattattgatctatacaagggtga 12562620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27007457 - 27007215
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  27007457 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 27007358  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  27007357 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 27007258  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27007257 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 27007215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27014600 - 27014358
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  27014600 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 27014501  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  27014500 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 27014401  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27014400 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 27014358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45534213 - 45533971
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  45534213 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 45534114  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  45534113 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 45534014  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45534013 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 45533971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21917038 - 21917280
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  21917038 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 21917137  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  21917138 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 21917237  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21917238 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 21917280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22130549 - 22130307
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  22130549 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 22130450  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  | |||||| |||||||    ||    
T  22130449 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggggtaattatacacatatgtat 22130350  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  22130349 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacactcttgtcact 22130307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27880427 - 27880185
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||| |||||||     
T  27880427 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcgga 27880328  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  27880327 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 27880228  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27880227 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 27880185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28020608 - 28020366
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||| |||||||     
T  28020608 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcgga 28020509  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  28020508 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 28020409  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28020408 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 28020366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 28548603 - 28548726
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| |||||||||||||||| | || ||||    
T  28548603 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgaacattatcacgg-aaag 28548701  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||  |||||||||    
T  28548702 gtttcgtcagatcaaatgacattct 28548726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 15326782 - 15326877
Alignment:
Q  142 tctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  15326782 tctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgaacattatcacgg-aaatgtttcgtcagatcacatgacattct 15326877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 15507151 - 15507246
Alignment:
Q  142 tctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  15507151 tctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgaacattatcacgg-aaatgtttcgtcagatcacatgacattct 15507246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 6094679 - 6094802
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||    |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  6094679 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaaaggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 6094777  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  6094778 gtttcgtcagatcacatgacattct 6094802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 21941221 - 21941344
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  21941221 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 21941319  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||    
T  21941320 gtttcgacagatcacatgacattct 21941344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Original strand, 22172042 - 22172131
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattat 203  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| ||||||    
T  22172042 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattat 22172131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9538320 - 9538564
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  9538320 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgtatggccatgccgaattaagtcaatatgagatattagacttattagttattcaatatatttcggg 9538419  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  9538420 atcaacaaatataaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgccttgtgatcaatatagatatgaggagaaatgagtaatcgtacacatgaacat 9538519  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  9538520 tatcatggaaaaggtttcgtcagatcagttgacgttcttgtcact 9538564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 32636845 - 32637089
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  32636845 tttaggcctcttgatgaattatgactgtaaaattgcatggccatgccaaattaagtcaatatgagatattgggctcattcgttattcagtatatttcggg 32636944  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  32636945 atcaagaaataaaaatattgatctatacaggggtgacaaaatctatgtcttgtgatcaatatagatatgaggacaaatgagtaattgtacacatgaacaa 32637044  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| || ||||| |||||||||  ||| || |||||||| |||||    
T  32637045 tatcatagaaaaagtttcgtcaaatcatttaacattcttgtcact 32637089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 19362772 - 19363009
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||| |    
T  19362772 tttaggcctcttgatgaaatgtgactgtaaaattgcatggccatgccaaactaagtcaatatgagatattggacttagtcgttattcaatatatttcgag 19362871  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19362872 atcaagaaatataaatattgatctatacaa-ggtgacaaaatctatgtcttgtgatcaatatagatataaggacaaatgagtaattgtacacatgaacat 19362970  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattctt 239  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  19362971 tatcatggaaaagatttcgttagagcacttgacattctt 19363009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30040420 - 30040186
Alignment:
Q  11 ttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30040420 ttgatgaaatatgactgtaaaattgcatgaccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacatattagttattcagtatatttcaagatcaagaaat 30040321  T
Q  111 ataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  30040320 ataaatattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgtgatcaatatagatattaggacaaaggagtaattgtacacataaatattatcatggaa 30040221  T
Q  211 aaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30040220 aaagtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 30040186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 245
Target Start/End: Original strand, 5616758 - 5617001
Alignment:
Q  2 ttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggga 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  5616758 ttaggcctcttgatgaaatatgattgcaaaattgcatggtcatgccaaattaagtcaatatgagatattgggcttattcgttattcaatatattttggga 5616857  T
Q  102 tcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  5616858 tcaagaaatataaatattgatctatacaaggatgccaaaatctatgtcttgtgatcaatatagacatgaggacaaaggagtaattgtacacatgaacatt 5616957  T
Q  202 attatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    || |||||||||||   ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  5616958 atcatggaaaaggtagtgtcagatcactttacattcttgtcact 5617001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Original strand, 4546432 - 4546668
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| || |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  4546432 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccgtgccgaactaagtcaatatgggatattggacttattcgttattcagtatattttgtaatcaagaa 4546531  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||||||| |  ||||| ||||    
T  4546532 atataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcaagacaaaggagtaattgtacacataattattatcatgg 4546631  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  4546632 aaaaggtttcgttagatcacttgacattcttgtcact 4546668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 11421368 - 11421559
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |     |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11421368 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaagttgcatgaccatgccga-----gtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggg 11421462  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  11421463 atcaagaaatataaatattgatctatacaagggtggtaatatctatgccttgtgattaatatagatatgaggacaaataagtaattgtacacatgaa 11421559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 34975913 - 34976157
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  34975913 tttaggcctcttgatgaaatatgcctgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 34976012  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| | ||||| | || ||    |||||  |||||||| |||||||||  |    
T  34976013 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaaaggtaccgagacaaaggagtaattgtacacatgagta 34976112  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34976113 ttatcatgg-aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 34976157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 1942086 - 1942221
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  1942086 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 1942185  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtga 136  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1942186 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtga 1942221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Original strand, 19373759 - 19373951
Alignment:
Q  52 taagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtctt 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||    
T  19373759 taagtcaatatgagatattggactaagtcgttattcaatatatttcgagattaagaaatataaatattgatctatacaagg-tgacaaaatctatgcctt 19373857  T
Q  152 gtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||||||||| |||||   ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  19373858 gtgatcaatatagatatgaggacataggaggaattgtacacatgaacattatcatggaaaaggtttcgttagagcacttgacattcttgtcact 19373951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9487913 - 9488153
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||| || |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  9487913 tttaggcgtcttgatgaaatatgactgtaaaattgt-----catgccgaactaagtcaatatgggatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 9488007  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||| ||| |  ||    
T  9488008 atcaagaaatataaacattgatcgatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacgcataattat 9488107  T
Q  201 tattatg-gaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9488108 tatcatgcaaaaagttttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 9488153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 245
Target Start/End: Original strand, 15461864 - 15462106
Alignment:
Q  2 ttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggga 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  15461864 ttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatcgccatgccgaactaagtcaatataagattttggacttattcgttattcagtatatttcggaa 15461963  T
Q  102 tcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| ||||||||||  |    
T  15461964 tcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatgt 15462063  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  15462064 tatcatg--aaaggtttcatcagatcacttgacatttttgtcact 15462106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23055995 - 23055840
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23055995 tcttgacgaaatatgactataaaattgaatgaccatgccgaattaagtaaatatgggatatttgacttattcgttactcaggatatttcgggatcaagaa 23055896  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatag 164  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23055895 atataaatactgagatatacaaagatgacacaatttatgtcttgtcttcaatatag 23055840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 2677375 - 2677617
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  2677375 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 2677474  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  2677475 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 2677574  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2677575 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 2677617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3368963 - 3368721
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||| ||     
T  3368963 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatattttgga 3368864  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  3368863 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 3368764  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3368763 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 3368721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 15815383 - 15815625
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  15815383 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 15815482  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  15815483 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 15815582  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15815583 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 15815625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18110983 - 18110741
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  18110983 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 18110884  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  18110883 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 18110784  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18110783 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 18110741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 20244299 - 20244541
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  20244299 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 20244398  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  20244399 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 20244498  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20244499 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 20244541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26531975 - 26532217
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  26531975 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 26532074  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  26532075 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 26532174  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26532175 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 26532217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4675923 - 4675681
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  4675923 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 4675824  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||  ||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  4675823 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgctttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 4675724  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4675723 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 4675681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5524825 - 5524695
Alignment:
Q  105 agaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattatt 204  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |     
T  5524825 agaaatataaatat--agctatacaagggtggcaccatttatgcattgtgttcaatatagatatgaggacaaatgagtaattatacacatgaacattgtc 5524728  T
Q  205 atggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattc 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5524727 atggaaaaggtttcgtcagatcacttgaaattc 5524695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 5870779 - 5871021
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  5870779 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 5870878  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| ||||| |     |    
T  5870879 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacttatgtgt 5870978  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5870979 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 5871021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 18163524 - 18163766
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  18163524 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 18163623  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  18163624 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactaactatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 18163723  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18163724 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 18163766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17299899 - 17299657
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  17299899 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 17299800  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| | ||| |     |    
T  17299799 atcaagataaattaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatgcacctatgtgt 17299700  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17299699 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 17299657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10677192 - 10677098
Alignment:
Q  150 ttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||    
T  10677192 ttgtgttcaatatagatatgaggacaaatgagtaattatacacatgatcattatca-cgaaaaggttttgtcagatcacatgacattcttgtcact 10677098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10890832 - 10890738
Alignment:
Q  150 ttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||    
T  10890832 ttgtgttcaatatagatatgaggacaaatgagtaattatacacatgatcattatca-cgaaaaggttttgtcagatcacatgacattcttgtcact 10890738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 26964196 - 26964319
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  26964196 aatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 26964294  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  26964295 gtttcgtcagatcacatgacattct 26964319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 5528419 - 5528352
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagata 68  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5528419 tttaggtttcttggtgaaatatgactgtaaaactacatgaccatgccgaattaagtcaatatgagata 5528352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 8845759 - 8845882
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| || |||||| |||||| |  | ||||    
T  8845759 aatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatatacatgatcattatcacag-aaag 8845857  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  8845858 gtttcgtcagatcacatgacattct 8845882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 8858723 - 8858846
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  8858723 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 8858821  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  8858822 gtttcgtcagatcacatgacattct 8858846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 10689835 - 10689958
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||    
T  10689835 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgcattgtgttcaatatagatatgaggataaaatagtaattatacacatgatcattatca-cgaaaag 10689933  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||    
T  10689934 gttttgtcagatcacatgacattct 10689958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 10903475 - 10903598
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||    
T  10903475 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgcattgtgttcaatatagatatgaggataaaatagtaattatacacatgatcattatca-cgaaaag 10903573  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||    
T  10903574 gttttgtcagatcacatgacattct 10903598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 18262768 - 18262891
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  18262768 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 18262866  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  18262867 gtttcgtcagatcacatgacattct 18262891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 18269629 - 18269752
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  18269629 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 18269727  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  18269728 gtttcgtcagatcacctgacattct 18269752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19926411 - 19926288
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  19926411 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 19926313  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  19926312 gtttcgtcagatcacatgacattct 19926288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 26971019 - 26971142
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  26971019 aatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 26971117  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  26971118 gtttcgtcagatcacataacattct 26971142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 55613239 - 55613362
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  55613239 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 55613337  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  55613338 gtttcgtcagatcacatgacattct 55613362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 19365882 - 19365937
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagt 56  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  19365882 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgctaaactaagt 19365937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Original strand, 869153 - 869242
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattat 203  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  869153 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagagtaattatacacatgatcattat 869242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 5707876 - 5707998
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |   | |||    
T  5707876 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatca--aagaag 5707973  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  5707974 gtttcgtcagatcacatgacattct 5707998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 5714504 - 5714626
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |   | |||    
T  5714504 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatca--aagaag 5714601  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  5714602 gtttcgtcagatcacatgacattct 5714626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10620984 - 10620861
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  10620984 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttatgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 10620886  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  10620885 gtttcgtcagatcacatgacattct 10620861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10628063 - 10627940
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  10628063 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttatgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 10627965  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  10627964 gtttcgtcagatcacatgacattct 10627940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28392785 - 28392662
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  28392785 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 28392687  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||    
T  28392686 gtttcatcagatcacatgacattct 28392662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 29800833 - 29801077
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  29800833 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatagtcatgccgaattaagtcaatataagatattgaacttattcgttattcagtatatttcggg 29800932  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  29800933 atcaggaaatataaatattgatctatacaagagtgacaaaatatatgtcttgtgatcgatttagatatgaggacaacggagtaattgtacacatgaacat 29801032  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  29801033 tatcatggaaaaggtttcgtcagatcaattgacattcttgtcact 29801077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15341942 - 15341698
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | || || | || |||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |    
T  15341942 tttaggcctcatgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccctgtcgaactaagtccatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttagag 15341843  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||||| ||    
T  15341842 ataaagaaatataaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgccttgtgagaaatatagatatgaggataaatgagtaattgtgcacatgaatat 15341743  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15341742 tatcatggaaaatgtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 15341698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Original strand, 19616804 - 19617040
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19616804 tcttgatgaaatatgactgtaaagttgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcattattcagtatatttcgggataaagaa 19616903  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||| ||||| || |    
T  19616904 ctataaatattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgtgatcaatatagatatgaggacaaaggagtatttgtacacatgaatattatcatcg 19617003  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  19617004 aaaaagtttcgtcatatcacttgacattcttgtcact 19617040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24763612 - 24763376
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |  ||| |||||||||||||| |    
T  24763612 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtatagttgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatcttggacttatttgttgttcagtatatttcgag 24763513  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |   ||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||| | |||||||||| ||    
T  24763512 atcaagaaatataaatattgatatatacaagggtgacaatgtctatatcttgtgatcaatattgatataaggacaaaggagtaagtatacacatgaatat 24763413  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattc 237  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  24763412 tatcatggaaaaggtttcatcagatcatatgacattc 24763376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20687356 - 20687117
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||   ||    
T  20687356 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaagatgcatggccatgccgaattaagtcagtatgagatattggacttatttgttattcagtatattctagg 20687257  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    || || |||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||| | ||| | |||||||    
T  20687256 ataaaaaaatataaatattgatatatacaaggataataaaatatatgtcttgtattcaatatagatatgagaacaaaggagtaaatgtacccgtgaacat 20687157  T
Q  201 tattatgg-aaaaggtttcgtcagttcacttgacattctt 239  Q
    | | |||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20687156 tttcatggaaaaaggtttcgtaagatcacttgacattctt 20687117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24229147 - 24228911
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24229147 tcttggtgaaatatgactgtaaaaccgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaa 24229048  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatg 207  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| | ||||| | || ||    |||||  |||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  24229047 atataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaaaggtaccgagacaaaggagtaattgtacacatgagtattatcatg 24228948  T
Q  208 gaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24228947 g-aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 24228911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41315783 - 41315559
Alignment:
Q  14 atgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaatata 113  Q
    |||||||||||| || |||||||| |  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||   ||  ||||||   |||||||||||||||    
T  41315783 atgaaatatgacggttaaattgcatgggcttgccaaattgagtcaatataagatattggacttattcgtagctcgatatattctaggatcaagaaatata 41315684  T
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| |||| |||| | |||| | | ||||     
T  41315683 aatattggactatataagggtgacacaatctatgtcttgtgttcaatatagatataaggaaaaatgagtaattatacatatgacctttatcacgaaaaaa 41315584  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  41315583 gtttcgtcagatcacatgacattct 41315559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24249972 - 24249730
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  24249972 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 24249873  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  24249872 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 24249773  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24249772 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 24249730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 30174739 - 30174981
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  30174739 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 30174838  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  30174839 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 30174938  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30174939 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 30174981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Original strand, 21627153 - 21627233
Alignment:
Q  41 ccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattga 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  21627153 ccatgccgaattatgtcaatatgagatattggatttattcgttactcagtatatttcaagatcaaggaatataaatattga 21627233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21329899 - 21329776
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  21329899 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 21329801  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  21329800 gtttcgtcagatcacatgacattct 21329776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22791509 - 22791386
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  22791509 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcactg-aaag 22791411  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  22791410 gtttcgtcagatcacatgacattct 22791386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40300869 - 40300709
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatca-aga 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||| | ||||||| || || | ||||| ||  |||||||  |||| | | |    
T  40300869 tcttgatggaatatgactgtaaaattacatggccatgccgaactaagtcaatgtgagatattagatttattcgttactctatatatttaaggataacaaa 40300770  T
Q  108 aatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatat 168  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||||||||||||||    
T  40300769 aatataagtattgggttatacaagggtgacacgattcataccttatgttcaatatagatat 40300709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Original strand, 28130926 - 28131167
Alignment:
Q  4 aggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatc 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  28130926 aggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatgttggacttattcgttattcagtatatttcggaatc 28131025  T
Q  104 aagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||| |  |||||    
T  28131026 aagaaatataaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgccttgagatcaatatagatattaggacaaatgagtaatcatacacataagtattat 28131125  T
Q  204 tatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  28131126 catggaaaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcact 28131167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Original strand, 19388929 - 19389166
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  19388929 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggttatgccgaattaagtcaatatcatatatttgacttattcgttattcggtatattttgggatcaataa 19389028  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  19389029 atacaaatattgagccatacaagggtgacacaatctatgtcttatgttcaatatagatattaggagaaatgagtaattttaaacatgaacattatcttgg 19389128  T
Q  209 -aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  19389129 aaaaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcact 19389166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Original strand, 16011806 - 16012047
Alignment:
Q  4 aggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  16011806 aggcctcttgatgaaatatgactgtaaagttgcacggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatc 16011905  T
Q  104 aagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||   | ||| | |||||||||| |||||    
T  16011906 aagaaatataaatattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgtgatcaatatatatatgaggacaaagaaataactatacacatgaatattat 16012005  T
Q  204 tatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
     ||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||    
T  16012006 catggaaaaggtttccacatatcacttgacatacttgtcact 16012047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18257505 - 18257263
Alignment:
Q  2 ttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggga 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||    
T  18257505 ttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaagatgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattgggcttattcattattcggtatatttcggga 18257406  T
Q  102 tcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacatt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||  |||||  |||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  18257405 tcaagaaatataaatattgatctatacaaggatgacaaaatctataccttgtaatcaatatagatacgaggacaaaggagtaattgtacacatgaatatt 18257306  T
Q  202 attatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18257305 attatgg-aaaggttttgtcagatcacttgacattcttgtcact 18257263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18259064 - 18258820
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  18259064 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatgtgggatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 18258965  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||| ||| |  ||    
T  18258964 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaacggagtaattgtacgcataattat 18258865  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18258864 tatcatggaaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 18258820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19393358 - 19393123
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||| |||||||||| || | |  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19393358 tcttgatgaaatatgac-gtaaagttgcatggccatgccaacctaagtcaatatgagatattggagttattctatattcagtatacttcggaatcaagaa 19393260  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  19393259 atataaatattgatatatacaagggtgaaaaaatctatgccttgtgatcaatatagatattaggacaaaggagtaattatacacatgaatattatcatgg 19393160  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  19393159 aaaaggtttcatcagatcacttgacattcttctcact 19393123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19231250 - 19231493
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||     
T  19231250 tttaggcctcttgatgaaatatgaatgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttattcagtatattttgga 19231349  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| || ||||||  ||    
T  19231350 atcaagaaatataaatattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaaaagagtaattgtagacatgagtat 19231449  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19231450 tatcatgg-aaaggttttgtcagatcacttgacattcttgtcact 19231493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8465361 - 8465604
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  8465361 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcaaggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 8465460  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  8465461 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattatacacatgaata 8465560  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8465561 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 8465604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15169213 - 15168991
Alignment:
Q  21 atgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattg 120  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15169213 atgactgtaaaattgcatggtcatgccaagttaagtcaatatgagatattaggcttatttgttattcagtatatttcgagatcaagaaatataaatattg 15169114  T
Q  121 agctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgt 220  Q
    |  | ||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  15169113 a--tctacaaggatgacaaaatctatgccttgtgttcagtataaatatgaggacaaaggagtaattgtacacattaatattatcatggaaaaagtttcgt 15169016  T
Q  221 cagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||    
T  15169015 cagatcacttgacattcttgtcact 15168991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Original strand, 34128943 - 34129179
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34128943 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatattagacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaa 34129042  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||  ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| || |||| |  ||||| ||||    
T  34129043 atataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcattgagatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtaaacataattattatcatgg 34129142  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  34129143 aaaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcact 34129179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24443291 - 24443081
Alignment:
Q  28 taaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctata 127  Q
    |||||||||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24443291 taaaattgcatggtcatgccgtattaagtcaatatgagatattgagcttattcgttattcactatatttcgggatccagaaatataaatattgatctata 24443192  T
Q  128 caagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttca 227  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  24443191 caagggtgaaaaaatctatgccttgtgatcaatatagatacgaagacaaaagagtaattgtacacattaacattatcatggaaaatgtttcgtcagatca 24443092  T
Q  228 cttgacattct 238  Q
    ||| |||||||    
T  24443091 cttaacattct 24443081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47166799 - 47166556
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||     
T  47166799 tttaggcctcttgatgaaatat-actgtaaaattgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatattttgga 47166701  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||  ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||||||| |  ||    
T  47166700 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatttatgctttgggatcaataaagatatcgagacaaaagagtaattgtacacataattat 47166601  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  47166600 tatcatggaaaaggtttcgttagatcacttgacattcttgtcact 47166556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31190380 - 31190248
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31190380 tttaggcctcttgatgaaatatgattgtaaaatttcatggccatgccgaatcaagtcaatattagatattggacttgttcgttattcagtatattttggg 31190281  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaaggg 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31190280 atcaagaaatataaatattgatctatacaaggg 31190248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41680908 - 41680665
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||      
T  41680908 tttaggcctcttgatgaaatatgtctgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtctatatgagatattggacttattcgttatttagtatatttcgta 41680809  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| |||||||||  ||    
T  41680808 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatatcttgggatcaataaagatatagagacaaaggagtaattgtacacatgagtat 41680709  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||| ||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  41680708 tatcatgg-aaagtcttcgtcatatcacttgacattcttgtcact 41680665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25845377 - 25845220
Alignment:
Q  88 agtatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattt 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| |     
T  25845377 agtatatttcggaatcaagaaatataaatattgagctatacaaggatgacacaagctatgtcttgtgttcgatataaatatgaggacaaaggagtaacta 25845278  T
Q  188 tacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  25845277 tacgcatgaacattatcatggaaaaagtttcgtcatatcacttgactttcttgtcact 25845220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10668841 - 10668598
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  10668841 tttaggcctcttgatggaatacgactataaaattgcatgtccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcaatatatttcgga 10668742  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |  ||||||| |||| | |||| | ||||||   |||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  10668741 atcaagaaatataaacattgatctagacaaggatgacaatatctatgccttgggatcaacaaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatat 10668642  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| || ||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  10668641 tatcat-gaaaaagtttcgtcagatcacaagacattcttgtcact 10668598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 14592215 - 14592362
Alignment:
Q  4 aggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14592215 aggcctcttgatgaaatatgactgtaaagttgcatggccatgctgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgggatc 14592314  T
Q  104 aagaaatataaatattgagctatac--aagggtgatacaatctatgtc 149  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||  |||||||||    
T  14592315 aagaaatataaatattgatatatacaaaagggtgataatatctatgtc 14592362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48808436 - 48808194
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  48808436 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 48808337  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  48808336 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 48808237  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  48808236 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 48808194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 30254500 - 30254741
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||| |||    
T  30254500 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatattttggg 30254599  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  30254600 atcaagataaatagacattgatctatacaagggtgacaccatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 30254699  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcac 244  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30254700 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcac 30254741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 12409897 - 12410091
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||| || |||||||   |||||||||| ||| |||||||| | || | ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12409897 tcttgatgaaatatgattttactatttcatgaccatgttgaattaagtcagtatgagatattgaatttattcgttaatcagtatattttgggatcaagaa 12409996  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatat-gt-ggacaagtgagtaattttacacatgaacattat 203  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  12409997 atataaatattgagctat--aagggtgacacaatatatgtcttgtattcaatatagatatagtagggcaaaggagtaattatacacatgagcattat 12410091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 15730113 - 15730355
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  15730113 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 15730212  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  15730213 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacgctatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 15730312  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15730313 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 15730355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18139278 - 18139036
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||| ||     
T  18139278 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttagga 18139179  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  18139178 atcaagataaatagacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 18139079  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18139078 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 18139036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 18400466 - 18400708
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  18400466 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 18400565  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  | |||||| |||||||    ||    
T  18400566 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggggtaattatacacatatgtat 18400665  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18400666 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 18400708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 18407450 - 18407692
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  18407450 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 18407549  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  | |||||| |||||||    ||    
T  18407550 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggggtaattatacacatatgtat 18407649  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18407650 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 18407692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 2204914 - 2205156
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||| |||||||     
T  2204914 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcgga 2205013  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  2205014 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 2205113  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2205114 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 2205156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8836717 - 8836551
Alignment:
Q  2 ttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggga 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||  | | ||||||||  ||    
T  8836717 ttaggcctcttgatgaaatatgactgtgaaattgtatggtcatgccgaattaagttgatatgagatattggacttattcgttggttaatatatttcaaga 8836618  T
Q  102 tcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatat 168  Q
    | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  || |||||||||| ||||||||||||||    
T  8836617 taaggaaatataaatatcgagctattcaagggtgaaaatatatatgtcttgtattcaatatagatat 8836551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31190241 - 31190102
Alignment:
Q  107 aaatataaatattgagctatacaaggg-tgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattatta 205  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  31190241 aaatataaacattgatttatacaaggggtgacaaaatatatgacttttgatcaatatagatatgaggacaaaggagtaattgtacacatgaatattatca 31190142  T
Q  206 tggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  31190141 tggaaaagatttcgtcggatcacttgacattcttgtcact 31190102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Original strand, 12393076 - 12393234
Alignment:
Q  86 tcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatat--gtggacaagtgagta 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||    ||  || ||||||    
T  12393076 tcagtatatttcgggatccagaaatataaatattgagctat--aagggtgacataatgtatgtcttgtattcaatatatatatcatagggaaaatgagta 12393173  T
Q  184 attttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||  |||||| | |||||| |||||    
T  12393174 attatacacatgaacattatca-cgaaaatgtttcgtcatatcacttaagattcttgtcact 12393234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5982653 - 5982519
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaa-ttaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgg 99  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| | | ||| |||||||||||| |    
T  5982653 tttaggcctcttgatgacatatgattgcgaaattgcatgaccatgtcaaaattaagtcaatatgagatattgaacttattcattactcagtatatttcag 5982554  T
Q  100 gatcaagaaatataaatattgagctatacaagggtg 135  Q
     || |||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  5982553 aattaagaaatat-gatattgaactttacaagggtg 5982519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 29328340 - 29328463
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  29328340 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 29328438  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  29328439 gtttcgtcagatcacatgacattct 29328463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 12751382 - 12751505
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  |  ||||| |||||||||  ||||| || | ||||    
T  12751382 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaaggataattatacacatgattattatcatag-aaag 12751480  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  12751481 gtttcgtcagatcacatgacattct 12751505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 15152999 - 15153122
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  15152999 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 15153097  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||    
T  15153098 gtttcgtcagatcacatgactttct 15153122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 18561554 - 18561677
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||  || |||  | |||||| |||| ||||||||||| |  |||||     
T  18561554 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacataagggcaaaagggtaattatacatatgaacattatcacagaaaa- 18561652  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  18561653 gtttcgtcagatcacatgacattct 18561677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11535713 - 11535591
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  11535713 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtattcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 11535615  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattc 237  Q
    |||||||||| |||| ||||||||    
T  11535614 gtttcgtcagatcacatgacattc 11535591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 13392734 - 13392828
Alignment:
Q  144 tatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || | |  | |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13392734 tatgtcctgtgttcaatatagacatgagggcgaaagggtaattatacacacaaacattatcacagaaaaggtttcgtcagatcacatgacattct 13392828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26816653 - 26816897
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||     
T  26816653 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaattaagtcaacatgagatattaggcttatccgtttttcagtatatttcgga 26816752  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||    
T  26816753 atcaaaaaatataaatattgatctatacaagggtgataaaaacaatgtcttgtgatcaatataaatatgaggacaaaggagtaagcgtacacatgaacat 26816852  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||    
T  26816853 tatcatggaaaaggttttgtcatatcacttgacattcttgtcact 26816897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 15537897 - 15538135
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||| | | ||||||| ||||||| |||    
T  15537897 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaatttcatggtcatgctgaattaagtcaatatgagacattgggcttattcattattcaatatattttggg 15537996  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  15537997 atctagaaatataaatattgatttatataagggtgacaaaatctatgtcttgtgatcaatatagatatgaggacaaatgcgtaattgtacacatgaacat 15538096  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattctt 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15538097 tatcatggaaaaggtttcgtcatatcacttgacattctt 15538135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21034600 - 21034843
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  21034600 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 21034699  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  21034700 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaata 21034799  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21034800 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 21034843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21399154 - 21399397
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  21399154 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 21399253  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| ||||||||||      
T  21399254 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaagagtaattgtacacatgaatt 21399353  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21399354 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 21399397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14147382 - 14147625
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |  |||||| ||| ||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14147382 tttaggcctcttgatgaaatataacagtaaaatttcatggtcatgccgaatcaagtcacaatgagatattgggcttgttcgttattcagtatattttggg 14147481  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaat-tttacacatgaaca 199  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||  ||||||| | |||||||||| |    
T  14147482 atcaaaaaatataaatattgatctatacaagggtgaaaaaatctatgccttgtgatcaatatagatatgagcacaaaggagtaatatgtacacatgaata 14147581  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||||    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  14147582 ttat--ctgaaaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcact 14147625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15846476 - 15846233
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  15846476 tttaggcctcctgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 15846377  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  15846376 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattatacacatgaata 15846277  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15846276 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 15846233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 245
Target Start/End: Original strand, 11787950 - 11788193
Alignment:
Q  2 ttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggga 101  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  11787950 ttaggcatcttaatgaaatatgactgtaaaattgtatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattagacttattcgttattcagtatatttcggaa 11788049  T
Q  102 tcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacatt 201  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| |  ||||||| |||| | |||||| ||||||   || ||  |||||||| ||||||| |  |||    
T  11788050 tcaataaatataaacattggtctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatattgagaaaaaggagtaattgtacacataattatt 11788149  T
Q  202 attatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  11788150 atcatggaaaaggtttcgtcagatcacttgacattattgtcact 11788193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15317108 - 15316872
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15317108 tcttgatgaaatatgactgtaaaaaagcatggccatgccgaactaagtaaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaa 15317009  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||  ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||||||| |  | ||| ||||    
T  15317008 atataaacattgatctatacaagggtgacaatatttatgcattgagatcaataaagatatcgagacaatggagtaattgtacacataattaatatcatgg 15316909  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  15316908 aaaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcact 15316872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25978668 - 25978424
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||  ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||     
T  25978668 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgggatattgaacttatttgttattcagtatatttcgga 25978569  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||| ||| |  ||    
T  25978568 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacgcataattat 25978469  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||  ||||||||  |||||||| |||||| |||||    
T  25978468 tatcatggaaaatatttcgtcaaatcacttgatattcttgtcact 25978424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28088468 - 28088711
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  28088468 tttaggctgcttgatgaaatatgattgtaaaactgcatggccatgctgaactaagtaaatataagatattggacttattcattattcagtatatttcgga 28088567  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| | |||||| ||||||   |||||  |||||  | |||||||||  ||    
T  28088568 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtagctgtacacatgagtat 28088667  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28088668 tatcatgg-aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 28088711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12300272 - 12300514
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  12300272 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccaaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 12300371  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| ||||| |     |    
T  12300372 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacttatgtgt 12300471  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12300472 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 12300514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 14890753 - 14890867
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  14890753 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 14890852  T
Q  101 atcaagaaatataaa 115  Q
    ||||| |||||||||    
T  14890853 atcaataaatataaa 14890867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 55427383 - 55427625
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  55427383 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggtcatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 55427482  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  55427483 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 55427582  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  55427583 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 55427625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20147494 - 20147252
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||| |||||||     
T  20147494 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcgga 20147395  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  20147394 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 20147295  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20147294 tatcatg--aaatgtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 20147252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 6110620 - 6110743
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  6110620 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgggggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 6110718  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  6110719 gtttcgtcagatcacatgacattct 6110743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10572243 - 10572120
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  10572243 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 10572145  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  10572144 gtttcgtcagatcacatgacattct 10572120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10579007 - 10578884
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  10579007 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 10578909  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  10578908 gtttcgtcagatcacatgacattct 10578884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16482134 - 16482011
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  16482134 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 16482036  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  16482035 gtttcgtcagatcacatgacattct 16482011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1647144 - 1647051
Alignment:
Q  142 tctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacatt 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| |||| |||||||    
T  1647144 tctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagagtaattatacacatgatcattatcacag-aaaggtttcgtcagatcacatgacatt 1647051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 168
Target Start/End: Original strand, 16241014 - 16241080
Alignment:
Q  102 tcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatat 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  16241014 tcaagaaatataaatattggactacacaaggatgacactatatatgtcttatgttcaatatagatat 16241080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 13211858 - 13211981
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  13211858 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 13211956  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
     ||||||||| |||| |||||||||    
T  13211957 atttcgtcagatcacatgacattct 13211981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 13517363 - 13517486
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  13517363 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 13517461  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  13517462 gtttcgtcagatcacatggcattct 13517486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15341870 - 15341747
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  15341870 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggaaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 15341772  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  15341771 gtttcgtcagatcacatgacattct 15341747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17780769 - 17780646
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| |||| |||| |||||| |    ||||    
T  17780769 aatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacatatgatcattatca-cataaag 17780671  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  17780670 gtttcgtcagatcacatgacattct 17780646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 127
Target Start/End: Original strand, 30464445 - 30464491
Alignment:
Q  80 cgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  30464445 cgttattcagtatatttcgggat-aaaaaatataaatattgatctata 30464491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 13249163 - 13249286
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  13249163 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggaaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 13249261  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
     ||||||||| |||| |||||||||    
T  13249262 atttcgtcagatcacatgacattct 13249286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15357237 - 15357114
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  | |||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |    ||||    
T  15357237 aatattgaactagacaaggatgacacggtttatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatca-cataaag 15357139  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  15357138 gtttcgtcagatcacatgacattct 15357114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15600535 - 15600412
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| || ||| |  | ||||    
T  15600535 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttatgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcactatcacag-aaag 15600437  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  15600436 gtttcgtcagatcacatgacattct 15600412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15607080 - 15606957
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| || ||| |  | ||||    
T  15607080 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttatgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcactatcacag-aaag 15606982  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  15606981 gtttcgtcagatcacatgacattct 15606957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 18520531 - 18520654
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| |||||||| |||||||| ||| || |||  |  ||||| ||||||||| |||||| |  |||| |    
T  18520531 aatattgaactacacaaggatgacacggtctatgccttgtgtttaatatagacatgagggcaaaaggataattatacacatgatcattatcacagaaa-g 18520629  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  18520630 gtttcgtcagatcacatgacattct 18520654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Original strand, 8728032 - 8728268
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8728032 tcttaatgaaatatgattgtaaagttgcatggccatgtcgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttccggataaagaa 8728131  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||  |||||||| || | ||||| ||||| ||||    
T  8728132 atataaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgtcttgtgatcaatatagatattagaacaaaggagtaattgtatagatgaatattatcatgg 8728231  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8728232 aaaatgtttcgtcagatcacttgacattcttttcact 8728268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 634300 - 634544
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||     
T  634300 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgcagaactaagtcaatatgagatattggactgattcgttactcagtatattttgga 634399  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  634400 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatttatgtcttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatat 634499  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  634500 tatcatggaaaatgtttcgtcagatcacatgacattcttgtcact 634544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19706379 - 19706136
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||     
T  19706379 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatattttgga 19706280  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  19706279 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaata 19706180  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19706179 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 19706136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28134663 - 28134420
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||     
T  28134663 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaacgaagtcaatatgagatattgaacttattcgttattcagtatatttcgga 28134564  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  28134563 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattatacacatgaata 28134464  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28134463 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 28134420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43802305 - 43802062
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  43802305 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgtcgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 43802206  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||  | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  43802205 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttaagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaata 43802106  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  ||||||||||| || |||||| |||||||| |||||    
T  43802105 ttatcatg--aaaggtttcgttagatcacttaacattcttgtcact 43802062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47667425 - 47667182
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  47667425 tttaggcctctcgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaattcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 47667326  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  ||||||||  |||| |||| |    
T  47667325 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgcacacgtgaata 47667226  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  47667225 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 47667182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Original strand, 22612862 - 22613097
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22612862 tcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaa 22612961  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatg 207  Q
    |||| | | || | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  ||||| || ||||||| || ||||| |||    
T  22612962 atatgattttttatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtacttgtacacataaatattatcatg 22613061  T
Q  208 gaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22613062 --aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 22613097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20391179 - 20390937
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  20391179 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 20391080  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  20391079 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 20390980  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20390979 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 20390937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9456478 - 9456720
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  9456478 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 9456577  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  9456578 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 9456677  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9456678 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 9456720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20779585 - 20779343
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  20779585 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 20779486  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  20779485 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 20779386  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20779385 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 20779343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42816929 - 42816687
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  42816929 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 42816830  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  42816829 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 42816730  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42816729 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 42816687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22670197 - 22669955
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||| |||||||     
T  22670197 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcgga 22670098  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  22670097 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 22669998  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22669997 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 22669955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 154
Target Start/End: Original strand, 29097092 - 29097238
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||| |||||||||| || |||| ||||| |  |||||| |||||||||||| | ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29097092 tcttaatgaaatatgtctataaagttgcatggtcatgccgaattaagtcaatttgagatattgagcttattcgttattcagtatatttcgggatcaataa 29097191  T
Q  109 atat-aaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtg 154  Q
    |||| |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  29097192 atataaaatattgagttatacgagtgtgacacaatctatgtcttgtg 29097238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Original strand, 51997681 - 51997797
Alignment:
Q  52 taagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtctt 151  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| | | ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  51997681 taagttaatatgagatatttgacttattcattacttagtatatttcagaatcaagaaatataaatattgaactatacaagagtgacacaatctatacttt 51997780  T
Q  152 gtgttcaatatagatat 168  Q
    |||||||||||| ||||    
T  51997781 gtgttcaatataaatat 51997797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Original strand, 14482339 - 14482494
Alignment:
Q  88 agtatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattt 187  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  ||||||||     
T  14482339 agtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaatta 14482438  T
Q  188 tacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||||||     |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14482439 tacacatatgtgttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 14482494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27131061 - 27130938
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| |||||||||||||||| | || ||||    
T  27131061 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgtcttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgaacattatcacgg-aaag 27130963  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||| ||||  |||| |||||||||    
T  27130962 gttttgtcatatcacatgacattct 27130938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 19819493 - 19819654
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||| |||  |||||| | || ||  |||| | ||||||||| |||    
T  19819493 tttaggcctcttgattaaatatgactgtaaatttgcatggtcatgccgaattaagtcattatgggatatttggctcgtttgttacttagtatattttggg 19819592  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagata 167  Q
    || | ||| || || |||     ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  19819593 ataaggaagtacaagtat-----tatacaagggtgacacaatctattcctagtgttcaatatagata 19819654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 18252586 - 18252709
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  18252586 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 18252684  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  18252685 gtttcgtcagatcacatgacattct 18252709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16358686 - 16358579
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| | || ||||    
T  16358686 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagagatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacgg-aaag 16358588  T
Q  214 gtttcgtca 222  Q
    |||||||||    
T  16358587 gtttcgtca 16358579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18532165 - 18532042
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| |||||||| |||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  |||| |    
T  18532165 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgtttaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacagaaa-g 18532067  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  18532066 gtttcgtcagatcacatgacattct 18532042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27310228 - 27310105
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |   |||||    
T  27310228 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatca-caaaaag 27310130  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||  |||| |||||||||    
T  27310129 gtttcgtcatatcacatgacattct 27310105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 28145662 - 28145603
Alignment:
Q  2 ttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaata 61  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| || ||||||||||    
T  28145662 ttaggcctcttgatgaaatatgactataaaactgcatggccatgccgaactaagtcaata 28145603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20736270 - 20736026
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| | | ||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20736270 tttaggcctctttatgaaatatgattgtaaagttgtatggccatgccgaactaagtcaatatgagataatagacttattcgttattcagtatatttcggg 20736171  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||| | |||||||||||   |||||  || ||||| |||||||||| ||    
T  20736170 atcaagaaatataaatattgatctatacaaggatgacaaaatctatgccttgtgataaatatagatattatgacaaaggaataattgtacacatgaatat 20736071  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20736070 tatcatggaaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 20736026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22560135 - 22559892
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||    
T  22560135 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaaattgcatggccgtgccaaatcaagtcaatatgagatattgggcttgttctttattcagtatatttcagg 22560036  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| ||| | ||| ||||||   ||||||| |||||||||| ||    
T  22560035 atcaagaaatataaatattgatctatacaagggtgacaaaatctttgccttgtgatcaacataaacatgaggacaaagaagtaattgtacacatgaatat 22559936  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  22559935 tatcat-gaaaaggtttcgtcagatcatgtgacattcttgtcact 22559892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Original strand, 4073945 - 4074168
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||  || || ||    
T  4073945 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcataaccatgtcaaattaaggcaatattagatattagacttattcgttactcagtatatttcgaaataaaaaa 4074044  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  4074045 atataaatattgagttatacaagggtagcacaatctatgtcttgtgttcgatatagatacgaggacaacagagtaattgtacgcatgaacattatcatgg 4074144  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttga 232  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||    
T  4074145 aaaatatttcgtcacatcacttga 4074168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 33317227 - 33317471
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  33317227 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 33317326  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||  ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||||||  |  ||    
T  33317327 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcattgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacaaaattat 33317426  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  33317427 tatcatggaaaatgtttcgtcagatcacttgacatttttgtcact 33317471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10358991 - 10358751
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||| ||||||||   || | | ||||||||||||||| |||    
T  10358991 tttaggcctattgatgaaatatgattgtaaaattgcatggctatgctaaattaagtcattatgagatattgagattattcattattcagtatattt-ggg 10358893  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||   |  |||| |||||||||||||    
T  10358892 atcaagaaatataaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgcattgtgttcaatatagatatgatgacaa---aagaattgtacacatgaacat 10358796  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  10358795 tatcatggaaaaggtttcgtcagatcacttggcattcttgtcact 10358751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8613281 - 8613525
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  8613281 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggttatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 8613380  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||  ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||| ||||||| |  ||    
T  8613381 atcaagaaatataaacattgatctatacaatggtgacaatatctatgcattgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacataattat 8613480  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8613481 tatcatggaaaatgtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 8613525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18019769 - 18019526
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  18019769 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcaatatatttcgga 18019670  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  18019669 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaata 18019570  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18019569 ttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 18019526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14074842 - 14075085
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||| |     
T  14074842 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaaaatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattatttattcagtatatttcaga 14074941  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |  ||||||| |||| | ||||||  |||||   |||||  |||||||| |||||||||  ||    
T  14074942 atcaagaaatataaatattgatctaaacaaggctgaaaatatctatgccttgggatcaataatgatatcgagacaaaggagtaattgtacacatgagtat 14075041  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14075042 tatcatgg-aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 14075085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 19218792 - 19218933
Alignment:
Q  8 ttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaaga 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19218792 ttcttgatgaaatatgactataaaattgcatggccaggccaaatgaagtcaatatcagatattgggcttattcgttattcagtatattttgggatcaaga 19218891  T
Q  108 aatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtc 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  19218892 aatataaatattgatctatacaaggttgacaaaatctatgtc 19218933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17120446 - 17120315
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  17120446 tttaggcttcttgatgaaatatgattgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagattttgaacttattcgttattcagtatatttcggg 17120347  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17120346 atcaagaaatataaatattgatctttacaagg 17120315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19735458 - 19735216
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| || || | ||||| | ||  |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  19735458 tttaggccttttaatgaaatatgactgtaaagtttcatg-ccatgtcgaaccaagtcaatatgagatattagacttattagttattcagtatatttcggg 19735360  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||| ||| | | ||||  |||||||| |||||||||  ||    
T  19735359 atcaagaaatattaagattgatctatacaagggtgacaaaatatatgccttgtgatcaatatatatacgagtacaaaggagtaattgtacacatgagtat 19735260  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| ||  |||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||||    
T  19735259 tatcat-aaaaatgttttgtcaaatcacttgacattcttgtcact 19735216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 245
Target Start/End: Original strand, 21995426 - 21995564
Alignment:
Q  107 aaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattat 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||  |||| ||    
T  21995426 aaatataaatattgacctatacaagggtgacaaaatctatgccttgtgatcaatatagatatgaggacaaaagagtaattgaacacatgaatgttatgat 21995525  T
Q  207 ggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  21995526 ggaaaaggttttgtcagatcacttaacattcttgtcact 21995564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1586048 - 1585806
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  1586048 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 1585949  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  1585948 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacgctatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 1585849  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1585848 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 1585806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27508287 - 27508045
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  27508287 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 27508188  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  27508187 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 27508088  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  27508087 tatcatg--aaaggtttcgtcggatcacttgacattcttgtcact 27508045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16789433 - 16789675
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  16789433 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 16789532  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| ||||| |     |    
T  16789533 atcatgataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgt 16789632  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16789633 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 16789675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22859828 - 22859586
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||| |||||||     
T  22859828 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcgga 22859729  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||    
T  22859728 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtat 22859629  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22859628 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 22859586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 21994949 - 21995063
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  21994949 tttaggcctcttgatgagatataactataaagttgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattagacttattcgttattcagtatattttggg 21995048  T
Q  101 atcaagaaatataaa 115  Q
    |||||||||||||||    
T  21995049 atcaagaaatataaa 21995063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27525493 - 27525259
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || | | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||||||||||| |||||||     
T  27525493 tcttgatgaaatatgactataaatatgaatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagat 27525394  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatgg 208  Q
    | || || ||||| ||||| || ||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||    ||||| |||     
T  27525393 aaatgaacattgatctatataaaggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatg- 27525295  T
Q  209 aaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27525294 -aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 27525259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 27297185 - 27297308
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  27297185 aatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 27297283  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  27297284 gtttcgtcagatcacatgacattct 27297308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16559123 - 16559000
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  16559123 aatattgaactaaacaaggatgacacagtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 16559025  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
     ||||||||| |||| |||||||||    
T  16559024 atttcgtcagatcacatgacattct 16559000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17691091 - 17690968
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  17691091 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 17690993  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  17690992 gtttcgtcagatcacatgacattct 17690968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27380903 - 27380780
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  27380903 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 27380805  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  27380804 gtttcgtcagatcacatgacattct 27380780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27471286 - 27471163
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  27471286 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 27471188  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  27471187 gtttcgtcagatcacatgacattct 27471163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 29309446 - 29309569
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  29309446 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 29309544  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  29309545 gtttcgtcagatcacatgacattct 29309569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 29316405 - 29316528
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  29316405 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 29316503  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  29316504 gtttcgtcagatcacatgacattct 29316528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 11652279 - 11652402
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||  | |||||| ||||||| | ||||||||  | ||||    
T  11652279 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagagcaaaagggtaattatacacataatcattattacag-aaag 11652377  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  11652378 gtttcgtcagatcacatgacattct 11652402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17684120 - 17683997
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||  || |||  | |||||| |||| ||||||||||| |  |||||     
T  17684120 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacataagggcaaaagggtaattatacaaatgaacattatcacagaaaa- 17684022  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  17684021 gtttcgtcagatcacatgacattct 17683997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27098
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26911 tcttgatgaaatatgactgtaaagttgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatatttgacttattcgttattcagtatatttcgggatcaagaa 27010  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatga 196  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||    
T  27011 atataaatattgatttatacaagggtgaaaaaatctatgccttgtgatcaatatagatatgaagacaaaggagtaattatacacatga 27098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12890 - 12646
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||     
T  12890 tttaggcctattcatgaaatatgactttaaaattgcatggccatgccgaactaggtcaatatgagatattggacttattcgttattcaatatattccgga 12791  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||| |||| | ||||||| |||||  ||||||  |||||||| ||||||| || ||    
T  12790 atcaaggaatataaatattcatctatacaagagtgacaaaatctatgccttgagatcaatatcgatattaggacaaaggagtaattgtacacataaatat 12691  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12690 tatcatagaaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 12646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 54175 - 54362
Alignment:
Q  52 taagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtctt 151  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  54175 taagtcgatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatatcaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgtctt 54274  T
Q  152 gtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattctt 239  Q
      | |||||||| ||||  ||||||  |||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54275 aagatcaatataaatattaggacaaaggagtaatcgtacacataaatattatcatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattctt 54362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39929 - 39684
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    |||||| ||| |||| ||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39929 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaaattgcattgtcatgccgaatcaagtaaatatgagatatccggcttgttcgttattcagtatatttcggg 39830  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacac--atgaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||   |||||  |||||     
T  39829 atcaagaaatataaatattgatctatacaaggatgacaaaatctatgacttgtgatcaatatagatatgaggacaaaggagtaacagtacacatatgaat 39730  T
Q  199 attattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  39729 attatcat-gaaaaagtttcatcagatcacttgacattcttgtcact 39684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 348 - 483
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  348 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 447  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtga 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  448 atcaagaaatataaatattgatctatacaagggtga 483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 67314 - 67179
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  67314 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 67215  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtga 136  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  67214 atcaagaaatataaacattgatctatacaagggtga 67179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 545 - 788
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  545 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 644  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaat-atagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaaca 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    ||||| |||  | ||||| | || |||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  645 atcaagaaatataattattgatctatacaagggtgacaatgcctatgcctttggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaata 744  T
Q  200 ttattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    |||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  745 ttatcatg--aaaggtttcgtaagatcacttgacattcttgtcact 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3615 - 3373
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  3615 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 3516  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  |||||||| |||||||     |    
T  3515 atcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgt 3416  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3415 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 3373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11466 - 11331
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  11466 tttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaaattgcattgttatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgga 11367  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtga 136  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  11366 atcaaaaaatataaacattgatctgtacaagggtga 11331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 120092 - 120334
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  120092 tttaggcctcttgatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcgga 120191  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacat 200  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||  ||||||   |||||  | |||||| |||||||    ||    
T  120192 atcaagataaatgaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggggtaattatacacatatgtat 120291  T
Q  201 tattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattcttttcact 245  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  120292 tatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcact 120334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 11597 - 11763
Alignment:
Q  1 tttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcggg 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| | ||||| | ||||||||  |||    
T  11597 tttaggcatcttgatggaatatgactgtaacat-gcatggccatgccaagctaagtcaatatgtgatagtggacttattcgttacttagtatattctggg 11695  T
Q  101 atcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatat 168  Q
    |||| | ||||||| ||| |  |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11696 atcaggtaatataactatcggactatacaagggtgacataatcaatgtcttgtgttcaatatatatat 11763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 81684 - 81510
Alignment:
Q  64 agatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaata-ttgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatat 162  Q
    ||||||| ||||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||   |||||||||||||    
T  81684 agatattagacttatccgttacttagtatatttcaggatcaagaaatataaatatttgagctatacaagggtgagaaaatatatactttgtgttcaatat 81585  T
Q  163 agatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    ||||||  || ||| || |||||| || |||||| | |||| | |||||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  81584 agatattagggcaattgggtaattataaacatgatcgttatcacggaaaa-gtttcgttagatcacatgacattct 81510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 163
Target Start/End: Original strand, 15342 - 15416
Alignment:
Q  88 agtatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatata 163  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||    
T  15342 agtatatttagggattaagaaatataaatattgagctatacaagggtgacataatctatg-cttgtcttcaatata 15416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 146
Target Start/End: Original strand, 9101 - 9238
Alignment:
Q  9 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcacgaccatgccaaattaagtcaatattagatattggacttgtacgttattcagtatatttcgggatcaagaa 108  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| |   ||| |||||||||| || |||||| ||    
T  9101 tcttgatgaaatataattgtaaaattgcatgaccatgtcaaattaagtcaatatgggatattaaacttatttattactcagtatattccgagatcaaaaa 9200  T
Q  109 atataaatattgagctatacaagggtgatacaatctat 146  Q
    ||||   ||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  9201 atatccttattgagttctactagggtgacacaatctat 9238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6585 - 6462
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  6585 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 6487  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  6486 gtttcgtcagatcacatgacattct 6462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13573 - 13478
Alignment:
Q  142 tctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13573 tctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaaggtttcgtcagatcacatgacattct 13478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1972 - 1849
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  1972 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 1874  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  1873 gtttcgtcagatcacatgacattct 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10863 - 10740
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  10863 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 10765  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  10764 gtttcgtcagatcacatgacattct 10740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 108938 - 108826
Alignment:
Q  127 acaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaaggtttcgtcagttc 226  Q
    |||| ||||| | |||||||  |||||| |||||||||||| | |||||   |||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||| || | ||    
T  108938 acaaaggtgacaaaatctattccttgtgatcaatatagataggaggacagaggagtaattgtgcacattaacactatcatggaaaaggtttcctcggatc 108839  T
Q  227 acttgacattctt 239  Q
    |||||||||||||    
T  108838 acttgacattctt 108826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 7663 - 7786
Alignment:
Q  114 aatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattattatggaaaag 213  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||  ||| || |||  | |||||| ||||||||| |||||| |  | ||||    
T  7663 aatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatataggcatgagggcaaaagggtaattatacacatgatcattatcacag-aaag 7761  T
Q  214 gtttcgtcagttcacttgacattct 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  7762 gtttcgtcagatcacatgacattct 7786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 205
Target Start/End: Original strand, 6077 - 6169
Alignment:
Q  113 aaatattgagctatacaagggtgatacaatctatgtcttgtgttcaatatagatatgtggacaagtgagtaattttacacatgaacattatta 205  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||  | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  6077 aaatattcaactagacaaggatgagacgatctatgccttgtgttcaatatagaaataagggcaaaagtgtaattatacacatgatcattatta 6169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University