View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16706_low_17 (Length: 240)

Name: NF16706_low_17
Description: NF16706
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16706_low_17
NF16706_low_17
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (33-240)||(19773600-19773807)
chr6 (26-240)||(22805779-22806002)
chr6 (26-196)||(17743276-17743447)
chr6 (32-199)||(15705500-15705668)
chr6 (20-161)||(27415984-27416125)
chr6 (31-161)||(23414819-23414949)
chr6 (31-161)||(27556577-27556707)
chr6 (26-195)||(28103949-28104119)
chr6 (31-161)||(18917403-18917533)
chr6 (41-218)||(18913813-18914000)
chr6 (41-218)||(18937071-18937258)
chr6 (33-199)||(17377855-17378022)
chr6 (32-161)||(31477948-31478077)
chr6 (41-218)||(15174163-15174350)
chr6 (33-199)||(15817579-15817744)
chr6 (33-199)||(15875279-15875446)
chr6 (31-161)||(1644547-1644677)
chr6 (31-161)||(16760134-16760264)
chr6 (31-158)||(18955900-18956027)
chr6 (30-139)||(8243722-8243831)
chr6 (31-139)||(11566723-11566831)
chr6 (31-139)||(19870451-19870559)
chr6 (31-139)||(23394929-23395037)
chr6 (31-158)||(22948950-22949077)
chr6 (31-139)||(23989781-23989889)
chr6 (31-158)||(14472113-14472240)
chr6 (31-158)||(22952906-22953033)
chr6 (31-158)||(23871394-23871521)
chr6 (31-158)||(23875350-23875477)
chr6 (31-132)||(22862814-22862915)
chr6 (31-131)||(14979443-14979543)
chr6 (31-139)||(12618981-12619087)
chr6 (31-103)||(18696480-18696552)
chr6 (74-199)||(19656111-19656237)
chr6 (31-100)||(18706301-18706370)
chr6 (125-178)||(23538745-23538798)
chr6 (83-178)||(17105771-17105865)
chr6 (41-99)||(23956148-23956206)
chr6 (74-187)||(22376656-22376772)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (26-240)||(125802-126025)
scaffold0011 (183-218)||(125760-125795)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (26-240)||(23069334-23069557)
chr2 (26-199)||(24918006-24918180)
chr2 (31-240)||(18358789-18359001)
chr2 (32-199)||(27472315-27472483)
chr2 (26-199)||(23707339-23707513)
chr2 (31-199)||(24670891-24671060)
chr2 (31-199)||(34874268-34874437)
chr2 (26-199)||(21081787-21081961)
chr2 (31-199)||(22459618-22459787)
chr2 (26-199)||(24681312-24681484)
chr2 (31-161)||(30345128-30345258)
chr2 (31-161)||(31345051-31345181)
chr2 (31-161)||(1283228-1283358)
chr2 (41-218)||(21914779-21914966)
chr2 (41-218)||(34492200-34492387)
chr2 (31-161)||(41531141-41531271)
chr2 (31-139)||(24628616-24628724)
chr2 (31-139)||(27601657-27601765)
chr2 (80-238)||(24316190-24316356)
chr2 (31-139)||(12901649-12901757)
chr2 (31-131)||(27379570-27379670)
chr2 (31-131)||(27383616-27383716)
chr2 (31-139)||(24649218-24649326)
chr2 (31-138)||(10101782-10101889)
chr2 (100-199)||(20320723-20320823)
chr2 (26-104)||(9784673-9784751)
chr2 (56-137)||(39827955-39828036)
chr2 (184-218)||(13101739-13101773)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (26-218)||(16796362-16796555)
chr3 (26-199)||(324130-324304)
chr3 (26-240)||(18700358-18700581)
chr3 (26-199)||(43889677-43889851)
chr3 (26-199)||(52989773-52989947)
chr3 (26-199)||(12469796-12469970)
chr3 (26-199)||(14966064-14966238)
chr3 (26-240)||(17691759-17691982)
chr3 (31-161)||(12339640-12339770)
chr3 (35-240)||(54876450-54876664)
chr3 (32-199)||(11914073-11914241)
chr3 (41-218)||(35961596-35961783)
chr3 (31-161)||(4588910-4589040)
chr3 (31-161)||(5223238-5223368)
chr3 (31-161)||(11300567-11300697)
chr3 (26-240)||(21837271-21837494)
chr3 (31-161)||(37439773-37439903)
chr3 (31-161)||(19775607-19775737)
chr3 (31-139)||(4111386-4111494)
chr3 (31-139)||(7109562-7109670)
chr3 (31-139)||(7113497-7113605)
chr3 (31-139)||(11165666-11165774)
chr3 (31-139)||(22321528-22321636)
chr3 (31-139)||(22336583-22336691)
chr3 (31-139)||(27409781-27409889)
chr3 (31-139)||(28949588-28949696)
chr3 (31-139)||(55022731-55022839)
chr3 (31-158)||(15964814-15964941)
chr3 (31-158)||(15968738-15968865)
chr3 (31-158)||(15972662-15972789)
chr3 (41-180)||(22652036-22652174)
chr3 (31-139)||(4107534-4107642)
chr3 (31-139)||(11069932-11070040)
chr3 (31-161)||(11854575-11854705)
chr3 (31-138)||(30065811-30065918)
chr3 (31-138)||(15617239-15617346)
chr3 (36-135)||(16643132-16643231)
chr3 (113-218)||(16979092-16979207)
chr3 (74-199)||(17046206-17046332)
chr3 (34-139)||(14499189-14499294)
chr3 (38-178)||(14569023-14569163)
chr3 (26-104)||(14670914-14670992)
chr3 (31-102)||(15465068-15465139)
chr3 (26-104)||(14682413-14682491)
chr3 (152-218)||(36527737-36527804)
chr3 (41-99)||(41813-41871)
chr3 (41-99)||(16325249-16325307)
chr3 (191-240)||(17685744-17685793)
chr3 (152-218)||(3265075-3265142)
chr3 (145-199)||(24513836-24513891)
chr3 (74-168)||(13026427-13026521)
chr3 (74-168)||(13030019-13030113)
chr3 (183-218)||(324049-324084)
chr3 (183-218)||(18700588-18700623)
chr3 (183-216)||(10542484-10542517)
chr3 (124-161)||(15465039-15465076)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (32-240)||(699-916)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (31-240)||(119855-120073)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (26-240)||(14258297-14258520)
chr7 (26-240)||(16579605-16579828)
chr7 (26-240)||(16585835-16586058)
chr7 (26-240)||(16460816-16461039)
chr7 (33-240)||(15719842-15720058)
chr7 (26-199)||(8940145-8940319)
chr7 (26-199)||(16998488-16998662)
chr7 (26-199)||(46580726-46580900)
chr7 (31-199)||(32301183-32301352)
chr7 (31-161)||(13918581-13918711)
chr7 (31-161)||(1858887-1859017)
chr7 (31-160)||(2530192-2530320)
chr7 (31-199)||(8468613-8468782)
chr7 (31-199)||(15112839-15113008)
chr7 (26-240)||(14273361-14273584)
chr7 (31-161)||(25927304-25927434)
chr7 (31-199)||(16323947-16324115)
chr7 (41-199)||(32160910-32161068)
chr7 (41-199)||(17232814-17232973)
chr7 (41-187)||(16550712-16550858)
chr7 (31-161)||(39722105-39722235)
chr7 (31-139)||(32968-33076)
chr7 (31-139)||(12704796-12704904)
chr7 (31-139)||(12714725-12714833)
chr7 (31-139)||(12718529-12718637)
chr7 (31-139)||(16907338-16907446)
chr7 (31-139)||(18283227-18283335)
chr7 (31-158)||(45170143-45170270)
chr7 (26-218)||(15116352-15116550)
chr7 (33-187)||(17060482-17060635)
chr7 (31-139)||(12723440-12723548)
chr7 (31-139)||(18279264-18279372)
chr7 (31-138)||(70902-71009)
chr7 (31-138)||(75011-75118)
chr7 (81-199)||(14981541-14981660)
chr7 (81-199)||(15411017-15411136)
chr7 (56-161)||(15084035-15084140)
chr7 (34-139)||(26292256-26292361)
chr7 (31-139)||(16114102-16114210)
chr7 (31-139)||(16117255-16117363)
chr7 (41-166)||(16614825-16614950)
chr7 (74-240)||(1490153-1490328)
chr7 (26-104)||(20487533-20487611)
chr7 (152-218)||(10501483-10501550)
chr7 (152-218)||(14157164-14157231)
chr7 (183-218)||(16461046-16461081)
chr7 (183-218)||(32301102-32301137)
chr7 (191-240)||(16185935-16185984)
chr7 (31-91)||(14270082-14270142)
chr7 (183-215)||(16579566-16579598)
chr7 (183-215)||(16586065-16586097)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (26-240)||(48603299-48603522)
chr1 (28-199)||(48520407-48520579)
chr1 (32-240)||(51326638-51326856)
chr1 (26-199)||(12271450-12271624)
chr1 (26-240)||(27653273-27653496)
chr1 (20-161)||(33797456-33797597)
chr1 (41-197)||(46198433-46198590)
chr1 (41-218)||(29764346-29764533)
chr1 (41-199)||(50000658-50000817)
chr1 (31-161)||(1925266-1925396)
chr1 (31-161)||(20924280-20924410)
chr1 (31-240)||(22130962-22131169)
chr1 (31-161)||(20228946-20229076)
chr1 (31-139)||(21407216-21407324)
chr1 (31-139)||(1010584-1010692)
chr1 (31-139)||(16375596-16375704)
chr1 (31-132)||(13881437-13881538)
chr1 (31-139)||(52639402-52639510)
chr1 (113-199)||(20316532-20316619)
chr1 (26-104)||(41781639-41781718)
chr1 (191-240)||(636090-636139)
chr1 (26-91)||(43543133-43543198)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (26-199)||(22107485-22107659)
chr5 (26-199)||(33895696-33895870)
chr5 (31-199)||(6765724-6765893)
chr5 (41-187)||(17010923-17011069)
chr5 (31-161)||(18356131-18356261)
chr5 (31-161)||(20910972-20911102)
chr5 (41-199)||(263042-263201)
chr5 (31-161)||(10753203-10753333)
chr5 (31-199)||(29447899-29448068)
chr5 (31-161)||(40723724-40723854)
chr5 (31-139)||(20295708-20295816)
chr5 (31-139)||(15236972-15237080)
chr5 (31-139)||(19472857-19472965)
chr5 (20-104)||(18356308-18356391)
chr5 (32-104)||(20910854-20910925)
chr5 (114-161)||(11220587-11220634)
chr5 (114-161)||(11225173-11225220)
chr5 (114-161)||(11228996-11229043)
chr5 (41-99)||(33473272-33473330)
chr5 (114-161)||(11230985-11231032)
chr5 (114-159)||(11227008-11227053)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (26-199)||(17048185-17048359)
chr4 (26-199)||(14746634-14746808)
chr4 (26-198)||(13591977-13592149)
chr4 (25-161)||(43256208-43256344)
chr4 (43-218)||(40619694-40619872)
chr4 (41-187)||(15008163-15008309)
chr4 (26-187)||(15497086-15497247)
chr4 (41-187)||(10694955-10695101)
chr4 (41-187)||(10908721-10908867)
chr4 (31-161)||(10712695-10712825)
chr4 (31-161)||(10926465-10926595)
chr4 (41-187)||(15884123-15884269)
chr4 (31-161)||(12487550-12487680)
chr4 (31-158)||(14954304-14954431)
chr4 (31-158)||(27533868-27533995)
chr4 (31-139)||(9556391-9556499)
chr4 (31-158)||(25689712-25689839)
chr4 (32-200)||(19857416-19857585)
chr4 (31-139)||(14757559-14757667)
chr4 (31-132)||(4561471-4561572)
chr4 (31-132)||(5757075-5757176)
chr4 (31-138)||(17810134-17810241)
chr4 (74-199)||(53631355-53631481)
chr4 (56-218)||(14650697-14650863)
chr4 (31-139)||(33742241-33742347)
chr4 (81-199)||(26013377-26013498)
chr4 (26-84)||(10056650-10056708)
chr4 (41-99)||(28385529-28385587)
chr4 (152-218)||(14184973-14185040)
chr4 (74-168)||(15990254-15990348)
chr4 (32-72)||(52873199-52873239)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (26-240)||(2764-2987)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (26-197)||(21064-21236)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (26-199)||(53889-54063)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (31-240)||(17461108-17461326)
chr8 (26-198)||(37515602-37515775)
chr8 (26-199)||(18833458-18833632)
chr8 (32-199)||(19808419-19808587)
chr8 (33-199)||(22238077-22238243)
chr8 (26-199)||(23409691-23409865)
chr8 (41-187)||(26453908-26454054)
chr8 (43-187)||(23478278-23478422)
chr8 (41-187)||(19880026-19880172)
chr8 (31-161)||(21410789-21410919)
chr8 (31-161)||(21805281-21805411)
chr8 (31-161)||(21828151-21828281)
chr8 (31-158)||(18862782-18862909)
chr8 (56-218)||(19929572-19929736)
chr8 (31-139)||(21976807-21976915)
chr8 (31-139)||(22111792-22111900)
chr8 (31-139)||(19278420-19278528)
chr8 (31-139)||(43251674-43251782)
chr8 (31-161)||(14397918-14398040)
chr8 (31-135)||(23659368-23659472)
chr8 (113-199)||(22352932-22353019)
chr8 (74-199)||(5760577-5760703)
chr8 (26-123)||(16402053-16402150)
chr8 (31-139)||(21972722-21972826)
chr8 (31-104)||(23914029-23914102)
chr8 (127-199)||(44384821-44384894)
chr8 (41-99)||(8414418-8414476)
chr8 (41-99)||(11775008-11775066)
chr8 (26-91)||(1327058-1327123)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (32-199)||(6998-7166)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (26-199)||(169800-169974)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (20-161)||(71236-71377)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (32-240)||(384-601)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (26-199)||(3378-3552)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (26-199)||(313-487)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (26-199)||(85441-85615)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (29-240)||(15588-15809)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (31-199)||(24653-24820)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (32-187)||(468-623)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (26-199)||(1925-2099)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (32-199)||(1349-1517)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (41-218)||(5615-5802)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (37-180)||(1227-1370)
scaffold0017 (37-180)||(7978-8121)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (31-161)||(20266-20396)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (26-232)||(10135-10350)
scaffold0107 (20-121)||(15459-15560)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (31-161)||(31058-31188)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (31-199)||(7731-7899)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (41-218)||(33074-33261)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (33-195)||(67161-67324)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (26-199)||(6953-7127)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (31-161)||(207639-207769)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (41-218)||(10378-10564)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (41-218)||(22477-22664)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (89-240)||(13490-13650)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (31-161)||(234-364)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (31-161)||(11638-11768)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (31-161)||(36223-36353)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (31-161)||(189514-189644)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (31-143)||(39205-39317)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (41-199)||(4215-4374)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (41-199)||(4215-4374)
scaffold0306 (31-187)||(14906-15062)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (31-161)||(32797-32927)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (31-199)||(49-224)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (31-161)||(14224-14354)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (31-161)||(80554-80684)
scaffold0029 (31-139)||(65665-65773)
scaffold0029 (31-139)||(61749-61857)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (41-199)||(70536-70689)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (31-139)||(58856-58964)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (74-199)||(6851-6977)
scaffold0741 (31-89)||(4325-4383)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (31-139)||(5238-5346)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (31-139)||(12283-12391)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (31-162)||(36079-36208)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (56-218)||(7544-7710)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (56-218)||(56842-57008)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (31-139)||(311-419)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (31-130)||(4012-4111)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (56-204)||(15470-15622)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (124-237)||(20652-20774)
scaffold0018 (26-77)||(20769-20820)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (31-139)||(67439-67546)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (31-123)||(80472-80564)
scaffold0037 (102-161)||(80562-80621)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (74-199)||(1349-1475)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (83-161)||(6854-6932)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (56-218)||(166429-166595)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (31-110)||(17559-17638)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (113-199)||(78299-78386)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (26-107)||(6210-6291)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (26-98)||(105078-105150)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (152-218)||(10467-10534)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (41-99)||(176078-176136)
scaffold0001 (41-99)||(168724-168782)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (191-240)||(3550-3599)
scaffold0165 (191-240)||(7614-7663)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (152-215)||(8028-8092)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (56-168)||(8934-9048)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (74-195)||(11567-11692)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (33-91)||(36088-36146)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (170-218)||(126896-126945)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (153-199)||(21847-21894)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 33 - 240
Target Start/End: Original strand, 19773600 - 19773807
Alignment:
Q  33 tatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773600 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 19773699  T
Q  133 aaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggag 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19773700 gaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgtaggtgttgtctaagttgtaagttatcgttccaaagtattccaaagtattggag 19773799  T
Q  233 tcttaagt 240  Q
    ||||||||    
T  19773800 tcttaagt 19773807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22806002 - 22805779
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22806002 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgtt 22805903  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22805902 atgttgtgaattgctcgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagta 22805803  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  22805802 tcccaaagtattggagtcttaagt 22805779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17743447 - 17743276
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17743447 tgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttctcattaatattgtt 17743348  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17743347 atgttgtgaattgcttgtgttgtttctattgctgttgaagattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttg 17743276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 15705500 - 15705668
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15705500 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtataagttgatgatgcttctcattaatattgttatgttg 15705599  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15705600 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtttaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 15705668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 27415984 - 27416125
Alignment:
Q  20 tttgaatgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat 119  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat 27416083  T
Q  120 attgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416084 attgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27416125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23414949 - 23414819
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414949 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 23414850  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414849 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 23414819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27556707 - 27556577
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556707 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 27556608  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556607 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27556577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Original strand, 28103949 - 28104119
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  28103949 tgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 28104048  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 195  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28104049 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagtttcaggtgttggtctaagtt 28104119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 18917403 - 18917533
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917403 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 18917502  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917503 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 18917533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18914000 - 18913813
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  18914000 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18913901  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18913900 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18913813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18937258 - 18937071
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  18937258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18937159  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937158 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18937071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Original strand, 17377855 - 17378022
Alignment:
Q  33 tatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||    
T  17377855 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgttcttcattaatattgttatgttgt 17377954  T
Q  133 aaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
     ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17377955 gaattgcttgtattgtttctgttgttgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17378022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 161
Target Start/End: Original strand, 31477948 - 31478077
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31477948 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttg 31478047  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478048 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31478077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 15174163 - 15174350
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  15174163 tgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattact 15174262  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15174263 tgtgctatttatgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 15174350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Original strand, 15817579 - 15817744
Alignment:
Q  33 tatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 132  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15817579 tatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtagttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 15817678  T
Q  133 aaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
     |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15817679 gaattgcttttg-tgtttct-atgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 15817744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15875446 - 15875279
Alignment:
Q  33 tatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  15875446 tatgttgctgatgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgataattttcattaatattgttatgttgt 15875347  T
Q  133 aaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15875346 gaattgcttgtgttgtttctgttgctgttacatattgatcaagttgcaagtgttggtctatgttgtaa 15875279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1644677 - 1644547
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  1644677 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgtt 1644578  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644577 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1644547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16760264 - 16760134
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16760264 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 16760165  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760164 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 16760134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Original strand, 18955900 - 18956027
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18955900 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgtt 18955999  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||| || |||||||||||||||    
T  18956000 gtgaattgcatgcgctgtttctgttgct 18956027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8243831 - 8243722
Alignment:
Q  30 acctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243831 acctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 8243732  T
Q  130 tgtaaattgc 139  Q
    ||| ||||||    
T  8243731 tgtgaattgc 8243722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11566831 - 11566723
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566831 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 11566732  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  11566731 gtgaattgc 11566723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19870559 - 19870451
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870559 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 19870460  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  19870459 gtgaattgc 19870451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23395037 - 23394929
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395037 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 23394938  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  23394937 gtgaattgc 23394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22949077 - 22948950
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22949077 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 22948978  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  22948977 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 22948950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23989889 - 23989781
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989889 cctatgttgctgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 23989790  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  23989789 gtgaattgc 23989781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14472240 - 14472113
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  14472240 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtataatgttgaagttattgatacttcataataatattgttatgtt 14472141  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||    
T  14472140 gtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 14472113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22953033 - 22952906
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22953033 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 22952934  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  22952933 gagaattgcttgtgctgtttctgttgct 22952906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23871521 - 23871394
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  23871521 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 23871422  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  23871421 gagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23871394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23875477 - 23875350
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  23875477 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 23875378  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  23875377 gagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23875350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22862915 - 22862814
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862915 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 22862816  T
Q  131 gt 132  Q
    ||    
T  22862815 gt 22862814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 14979443 - 14979543
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  14979443 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgattttcattaatattgttatgtt 14979542  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  14979543 g 14979543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 12618981 - 12619087
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12618981 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgct 12619078  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  12619079 gtgaattgc 12619087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18696552 - 18696480
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18696552 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 199
Target Start/End: Original strand, 19656111 - 19656237
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 173  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656111 atgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcatgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatca 19656210  T
Q  174 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19656211 agttgcaagtgttggtcaaagttgtaa 19656237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18706370 - 18706301
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18706370 cctatgttgctgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23538798 - 23538745
Alignment:
Q  125 tatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 178  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538798 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 23538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17105865 - 17105771
Alignment:
Q  83 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 178  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17105865 atgtatgatgttaaagt-gttgatgtttgtcattattattgatatgttgagaattgcctgtgttgtttctgttgctgttgaacattgatcaagttg 17105771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23956206 - 23956148
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23956206 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 187
Target Start/End: Original strand, 22376656 - 22376772
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat-attgttatgttgtaaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatattga 170  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||  |||| || ||||||||||||| | ||||||  ||||||  |||| || |||||||||||||    
T  22376656 atgtgaaaaatgtatgatgttgaggttgttgttgattaccattgattattgttatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgctgttgttgaatattga 22376755  T
Q  171 tcaagttgcaggtgttg 187  Q
    | |||||||| ||||||    
T  22376756 ttaagttgcaagtgttg 22376772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 126025 - 125802
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  126025 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgtt 125926  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||    
T  125925 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagta 125826  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  125825 ttccaaagtattggagtcttaagt 125802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 125795 - 125760
Alignment:
Q  183 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  125795 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 125760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 23069334 - 23069557
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23069334 tgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgtt 23069433  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23069434 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagctgtcgttccaaagta 23069533  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23069534 ttccaaagtattggagtcttaagt 23069557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24918180 - 24918006
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  24918180 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 24918081  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24918080 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 24918006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 18358789 - 18359001
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  18358789 cctatgttgctgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattattatgtt 18358888  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgtcgttctaaagt-attccaaagtat 227  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||  |||| ||||||    
T  18358889 gtgaatttcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgtaaagttgtctttccaaagtgtttccgaagtat 18358988  T
Q  228 tggagtcttaagt 240  Q
    |||||||||||||    
T  18358989 tggagtcttaagt 18359001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27472483 - 27472315
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  27472483 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttg 27472384  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27472383 tgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 27472315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 23707339 - 23707513
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23707339 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 23707438  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23707439 atgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 23707513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24671060 - 24670891
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  24671060 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgggttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 24670961  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24670960 gtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 24670891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Original strand, 34874268 - 34874437
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34874268 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 34874367  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34874368 gtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 34874437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 21081787 - 21081961
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  21081787 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttattgatgctcttcattaatattgtt 21081886  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21081887 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 21081961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Original strand, 22459618 - 22459787
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22459618 cctatgttgctgttgtcggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgttgaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 22459717  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22459718 gtgaattgcttgtactgtttcggttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22459787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24681484 - 24681312
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||    
T  24681484 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcgtcattagtattgtt 24681385  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24681384 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttg--tattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 24681312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 30345128 - 30345258
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30345128 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 30345227  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345228 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 30345258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31345181 - 31345051
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31345181 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttaatgcttcacactaatattgttatgtt 31345082  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31345081 gtgaattacttgtgctgtttctgttgctgtt 31345051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1283358 - 1283228
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1283358 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 1283259  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1283258 gtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 1283228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21914966 - 21914779
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||    
T  21914966 tgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttgagaattgct 21914867  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21914866 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 21914779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 34492200 - 34492387
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||    
T  34492200 tgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatgttgagaattgct 34492299  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt----------gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34492300 tctgatgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagtcgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 34492387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 41531141 - 41531271
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  41531141 cctatgttactgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 41531240  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41531241 gtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 41531271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 24628616 - 24628724
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628616 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 24628715  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  24628716 gtgaattgc 24628724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27601765 - 27601657
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601765 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 27601666  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  27601665 gtgaattgc 27601657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 238
Target Start/End: Original strand, 24316190 - 24316356
Alignment:
Q  80 aaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24316190 aaaatgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgc 24316288  T
Q  180 aggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaa 238  Q
    ||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24316289 aggtgttggtctaagttacaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaa 24316356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 12901649 - 12901757
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901649 cctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 12901748  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  12901749 gtgaattgc 12901757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 27379570 - 27379670
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379570 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 27379669  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  27379670 g 27379670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 27383616 - 27383716
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383616 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 27383715  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  27383716 g 27383716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24649326 - 24649218
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649326 cctaggttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgcttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 24649227  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  24649226 gtgaattgc 24649218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Original strand, 10101782 - 10101889
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10101782 cctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgtt 10101881  T
Q  131 gtaaattg 138  Q
    || |||||    
T  10101882 gtgaattg 10101889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 20320723 - 20320823
Alignment:
Q  100 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 198  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20320723 tgttgatgcttttcattaatattgtcatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgaatactgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgta 20320822  T
Q  199 a 199  Q
    |    
T  20320823 a 20320823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9784751 - 9784673
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9784751 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaaattgttg 9784673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 39827955 - 39828036
Alignment:
Q  56 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaatt 137  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  |||| |||| |||||| ||| ||||    
T  39827955 gaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttaattcttatcattgatatggttatgctgtgaatt 39828036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 218
Target Start/End: Original strand, 13101739 - 13101773
Alignment:
Q  184 gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13101739 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 13101773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16796555 - 16796362
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796555 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 16796456  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16796455 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 16796362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 324304 - 324130
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  324304 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtt 324205  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  324204 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 324130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 18700358 - 18700581
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  18700358 tgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttctcattaatattgtt 18700457  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18700458 atgttgtgaattgctagtgctgtttctgttgctgttgaatatagatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagta 18700557  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18700558 ttccaaagtattggagtcttaagt 18700581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 43889677 - 43889851
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  43889677 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtctctcattaatattgtt 43889776  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43889777 atgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 43889851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 52989773 - 52989947
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  52989773 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 52989872  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52989873 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 52989947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12469970 - 12469796
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12469970 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgtt 12469871  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12469870 atgttgtgaattggttgtgttgtttttgttgctgttgaatatttataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 12469796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14966238 - 14966064
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  14966238 tgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 14966139  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14966138 atgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 14966064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 17691759 - 17691982
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||    
T  17691759 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttcgttaatattgtt 17691858  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||| ||| |||||     
T  17691859 atgtgttgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtg 17691958  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17691959 ttccaaagtattggagtcttaagt 17691982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12339770 - 12339640
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339770 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 12339671  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339670 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 12339640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 240
Target Start/End: Original strand, 54876450 - 54876664
Alignment:
Q  35 tgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaa 134  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||||    
T  54876450 tgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttccttaatattgttatgttgtaa 54876549  T
Q  135 attgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagt--------tgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |    
T  54876550 attgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaaat 54876649  T
Q  226 attggagtcttaagt 240  Q
    |||| ||||||||||    
T  54876650 attgaagtcttaagt 54876664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 11914073 - 11914241
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11914073 ctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 11914172  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11914173 tgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 11914241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 35961596 - 35961783
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  35961596 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttgagaattgct 35961695  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35961696 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 35961783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 4588910 - 4589040
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588910 cctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 4589009  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589010 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 4589040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5223368 - 5223238
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223368 cctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 5223269  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5223268 gtgaattgtttgtgctgtttttgttgctgtt 5223238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 11300567 - 11300697
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11300567 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 11300666  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11300667 gtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11300697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21837494 - 21837271
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  21837494 tgctgcctatgttgttgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttttcatgaatattatt 21837395  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||| |     
T  21837394 atgttgtgaatgacttgtactgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgttgatgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaaatg 21837295  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21837294 ttccaaagtattggagtcttaagt 21837271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 37439773 - 37439903
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37439773 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 37439872  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37439873 gtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 37439903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19775737 - 19775607
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19775737 cctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgtt 19775638  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19775637 gtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 19775607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 4111386 - 4111494
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111386 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 4111485  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  4111486 gtgaattgc 4111494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7109670 - 7109562
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109670 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 7109571  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  7109570 gtgaattgc 7109562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7113605 - 7113497
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113605 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 7113506  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  7113505 gtgaattgc 7113497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 11165666 - 11165774
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165666 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 11165765  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  11165766 gtgaattgc 11165774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22321636 - 22321528
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321636 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 22321537  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  22321536 gtgaattgc 22321528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22336691 - 22336583
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336691 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 22336592  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  22336591 gtgaattgc 22336583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 27409781 - 27409889
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409781 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 27409880  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  27409881 gtgaattgc 27409889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28949696 - 28949588
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949696 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 28949597  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  28949596 gtgaattgc 28949588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 55022839 - 55022731
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022839 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 55022740  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  55022739 gtgaattgc 55022731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15964941 - 15964814
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  15964941 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgtt 15964842  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  15964841 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15964814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15968865 - 15968738
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  15968865 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgtt 15968766  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  15968765 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15968738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15972789 - 15972662
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  15972789 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgtt 15972690  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  15972689 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15972662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22652174 - 22652036
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22652174 tgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatactgttatgttgtgaattgct 22652076  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 180  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22652075 tgtgttgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgca 22652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 4107534 - 4107642
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4107534 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgtt 4107633  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  4107634 gtgaattgc 4107642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11070040 - 11069932
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11070040 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 11069941  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  11069940 gtgaattgc 11069932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11854705 - 11854575
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  11854705 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatgaggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctccgtattaatattgttatgtt 11854606  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11854605 gtgaattgcttgagctgtttatgttgctgtt 11854575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30065918 - 30065811
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30065918 cctatgctgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 30065819  T
Q  131 gtaaattg 138  Q
    || |||||    
T  30065818 gtgaattg 30065811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15617346 - 15617239
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617346 cctatgctgctgctgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 15617247  T
Q  131 gtaaattg 138  Q
    || |||||    
T  15617246 gtgaattg 15617239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16643231 - 16643132
Alignment:
Q  36 gttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaa 135  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  16643231 gttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcagtaatattgttatgttgtaaa 16643132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16979207 - 16979092
Alignment:
Q  113 cattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagtt 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||    
T  16979207 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagtt 16979108  T
Q  203 gtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16979107 gtcgttccaaagtatt 16979092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17046332 - 17046206
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 173  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046332 atgtggaatatatatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgattgtactgtttctgttgctgttgaatattgatca 17046233  T
Q  174 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046232 agttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17046206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14499294 - 14499189
Alignment:
Q  34 atgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgta 133  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14499294 atgtggctgttgtgggttatgtaaaatattaatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagtggttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 14499195  T
Q  134 aattgc 139  Q
    ||||||    
T  14499194 aattgc 14499189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 178
Target Start/End: Original strand, 14569023 - 14569163
Alignment:
Q  38 tgctgttgttggttatgggaaa-tatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||  ||||| ||||  |||||||| |||    
T  14569023 tgctgttgttggttatggtaaaatatgtatataccttatgtggaaaatgtatgatgttaaaga-gttgatgtttgtcattattattcatatgttgtgaat 14569121  T
Q  137 tgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 178  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569122 tacttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 14569163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14670992 - 14670914
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14670992 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 14670914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15465139 - 15465068
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15465139 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14682491 - 14682413
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  14682491 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaattgacgatgtttaagttgttg 14682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36527804 - 36527737
Alignment:
Q  152 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36527804 tgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 36527737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41813
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41871 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Original strand, 16325249 - 16325307
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16325249 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgatgtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Original strand, 17685744 - 17685793
Alignment:
Q  191 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17685744 aagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 17685793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Original strand, 3265075 - 3265142
Alignment:
Q  152 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3265075 tgttgttgttgcatattgatcaattcgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 3265142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24513891 - 24513836
Alignment:
Q  145 ctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24513891 ctgttgctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaa 24513836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Original strand, 13026427 - 13026521
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 168  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13026427 atgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13026521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Original strand, 13030019 - 13030113
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 168  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13030019 atgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13030113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 324084 - 324049
Alignment:
Q  183 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  324084 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 324049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Original strand, 18700588 - 18700623
Alignment:
Q  183 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18700588 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18700623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 216
Target Start/End: Original strand, 10542484 - 10542517
Alignment:
Q  183 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10542484 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagta 10542517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15465076 - 15465039
Alignment:
Q  124 ttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15465076 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 15465039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 916 - 699
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  916 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 817  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaa 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  816 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaa 717  T
Q  223 agtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||    
T  716 agtattggagtcttaagt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 120073 - 119855
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  120073 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattattatgtt 119974  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtcta--------agttgtaagttgtcgttctaaagtattcca 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  119973 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtatagttgtaagttgtcgttccaaagtattcca 119874  T
Q  222 aagtattggagtcttaagt 240  Q
    |||||||||||||||||||    
T  119873 aagtattggagtcttaagt 119855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14258520 - 14258297
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14258520 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttgagttgttgatgcttctcattaatattgtt 14258421  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14258420 atgttgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagta 14258321  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14258320 ttccaaagtattggagtcttaagt 14258297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16579828 - 16579605
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16579828 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgtt 16579729  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16579728 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagta 16579629  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16579628 ttccaaagtattggagtcttaagt 16579605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 16585835 - 16586058
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16585835 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgtt 16585934  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16585935 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagta 16586034  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16586035 ttccaaagtattggagtcttaagt 16586058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 16460816 - 16461039
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16460816 tgctgcctatgttgttgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcatcaatattgtt 16460915  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16460916 atgttgtgaattgcttttgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagta 16461015  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16461016 ttccaaagtattggagtcttaagt 16461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15720058 - 15719842
Alignment:
Q  33 tatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 132  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15720058 tatgtttctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 15719959  T
Q  133 aaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaa 223  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  15719958 gaattgcttgtactgtttctgttgctgatgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaa 15719859  T
Q  224 gtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15719858 gtattggagtcctaagt 15719842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8940319 - 8940145
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  8940319 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 8940220  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8940219 atgttgtgaattgcttgtactgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 8940145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16998662 - 16998488
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16998662 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgttgaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtt 16998563  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16998562 atgttgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 16998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 46580726 - 46580900
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  46580726 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 46580825  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46580826 atgctgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 46580900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32301352 - 32301183
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  32301352 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatacttttcattaatattgttatgtt 32301253  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt-gttgtctaagttgtaa 199  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32301252 gtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtggtggtctaagttgtaa 32301183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 13918581 - 13918711
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918581 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatatggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 13918680  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918681 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 13918711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 1858887 - 1859017
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1858887 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgtt 1858986  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858987 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1859017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Original strand, 2530192 - 2530320
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530192 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt-atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 2530290  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgt 160  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2530291 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgt 2530320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8468782 - 8468613
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8468782 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 8468683  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8468682 gtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaa 8468613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15113008 - 15112839
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15113008 cctatgttgatgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 15112909  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15112908 gtgaatttcttgtactgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 15112839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14273584 - 14273361
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  14273584 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgtt 14273485  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||  |||   |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||| ||| |||||     
T  14273484 atgttgcgaatattttgtactatttctgttgctattgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtg 14273385  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14273384 ttccaaagtattggagtcttaagt 14273361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 25927304 - 25927434
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927304 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 25927403  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25927404 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgatgtt 25927434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16324115 - 16323947
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  16324115 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtt-atatgccttttgtggaaaatgcatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 16324017  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16324016 gtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcgggtgttggtctaagttgtaa 16323947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 32160910 - 32161068
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32160910 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaat-tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 32161008  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32161009 tgtgctgtttctgttgctgttgcatattgattaagttacaggtgttggtctaagttgtaa 32161068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232814
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttataaattgct 17232874  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17232873 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaa 17232814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 16550712 - 16550858
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  16550712 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16550811  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16550812 tgtgttgtttctattgatgttgaataatgatcaagttgcagatgttg 16550858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 39722235 - 39722105
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  39722235 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgtt 39722136  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39722135 gtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 39722105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33076 - 32968
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33076 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 32977  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  32976 gtgaattgc 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 12704796 - 12704904
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704796 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 12704895  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  12704896 gtgaattgc 12704904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12714833 - 12714725
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714833 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 12714734  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  12714733 gtgaattgc 12714725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12718637 - 12718529
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718637 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 12718538  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  12718537 gtgaattgc 12718529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 16907338 - 16907446
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907338 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 16907437  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  16907438 gtgaattgc 16907446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18283335 - 18283227
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283335 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 18283236  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  18283235 gtgaattgc 18283227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Original strand, 45170143 - 45170270
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  45170143 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 45170242  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  45170243 gtgaattgtttgtactgtttctgttgct 45170270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15116550 - 15116352
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  15116550 tgctgcctatgttgctgttgtttgttatgtgaaatgtgcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttacgttgttgatgtttttcattaatattgtt 15116451  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct-----aagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    || |||| |||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||     ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15116450 attttgtgaatttcttgtattgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaagtgttggtctttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 15116352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 187
Target Start/End: Original strand, 17060482 - 17060635
Alignment:
Q  33 tatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 132  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | | ||||    
T  17060482 tatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatgttggtct-ttgt 17060580  T
Q  133 aaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  17060581 gaattgcttgtactgtttctattgctgttgaatattgatcaaattacaagtgttg 17060635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12723548 - 12723440
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723548 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagctgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 12723449  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  12723448 gtgaattgc 12723440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18279372 - 18279264
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279372 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 18279273  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
     | ||||||    
T  18279272 ttgaattgc 18279264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Original strand, 70902 - 71009
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  70902 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgtt 71001  T
Q  131 gtaaattg 138  Q
    || |||||    
T  71002 gtgaattg 71009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Original strand, 75011 - 75118
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  75011 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgtt 75110  T
Q  131 gtaaattg 138  Q
    || |||||    
T  75111 gtgaattg 75118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 14981541 - 14981660
Alignment:
Q  81 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14981541 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgca 14981640  T
Q  181 ggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  14981641 ggtgttggtctaagttgtaa 14981660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 15411017 - 15411136
Alignment:
Q  81 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15411017 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgca 15411116  T
Q  181 ggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15411117 ggtgttggtctaagttgtaa 15411136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15084140 - 15084035
Alignment:
Q  56 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgtt 155  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15084140 gaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgtt 15084041  T
Q  156 gctgtt 161  Q
    ||||||    
T  15084040 gctgtt 15084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26292361 - 26292256
Alignment:
Q  34 atgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgta 133  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26292361 atgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 26292262  T
Q  134 aattgc 139  Q
    ||||||    
T  26292261 aattgc 26292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16114210 - 16114102
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114210 cctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 16114111  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  16114110 gtgaattgc 16114102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16117363 - 16117255
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117363 cctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 16117264  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  16117263 gtgaattgc 16117255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16614950 - 16614825
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  16614950 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16614851  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaata 166  Q
    |||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  16614850 tgtgttgtttctattgatgttaaata 16614825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Original strand, 1490153 - 1490328
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 173  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1490153 atgtggaatatatatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtactttttctgttgttgttgaatattgatca 1490252  T
Q  174 agttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1490253 agttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 1490328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20487611 - 20487533
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20487611 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 20487533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Original strand, 10501483 - 10501550
Alignment:
Q  152 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10501483 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctgagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Original strand, 14157164 - 14157231
Alignment:
Q  152 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14157164 tgttgctgttgcatattgatcaagttccaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttgcaaagtatt 14157231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Original strand, 16461046 - 16461081
Alignment:
Q  183 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16461046 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 16461081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32301137 - 32301102
Alignment:
Q  183 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32301137 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 32301102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16185984 - 16185935
Alignment:
Q  191 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16185984 aagttgtaagttatctttccaaagtgttccaaagtattggagtcctaagt 16185935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 14270082 - 14270142
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgat 91  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  14270082 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatgttcatatgctttatgtggagaatatatgat 14270142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16579598 - 16579566
Alignment:
Q  183 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16579598 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16579566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 16586065 - 16586097
Alignment:
Q  183 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16586065 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16586097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48603522 - 48603299
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603522 tgctgcctatgttgctgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 48603423  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtc--------taagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48603422 atgatggaaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgttaagttgtaagttgtcgttccaaagta 48603323  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  48603322 ttcaaaagtattggagtcttaagt 48603299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 48520579 - 48520407
Alignment:
Q  28 ctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  48520579 ctacctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgatat 48520480  T
Q  128 gttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48520479 gttgtgaattgcttgtgctgtttctattgccgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgtaa 48520407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51326856 - 51326638
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51326856 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 51326757  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagt-attcca 221  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |        ||||||||||||||| ||| |||||  |||||    
T  51326756 tgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtataagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgtttcca 51326657  T
Q  222 aagtattggagtcttaagt 240  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51326656 aagtattggagtcttaagt 51326638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12271624 - 12271450
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  12271624 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaattttgtt 12271525  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12271524 atgctgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 12271450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 27653273 - 27653496
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27653273 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtt 27653372  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||        ||||||||||||||| ||| |||||     
T  27653373 atgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagatgcagatgttggtctaagttataaagttgtaagttgtctttccaaagtg 27653472  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  27653473 tttcaaagtattggagtcttaagt 27653496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33797597 - 33797456
Alignment:
Q  20 tttgaatgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat 119  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaat 33797498  T
Q  120 attgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33797497 attgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 33797456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Original strand, 46198433 - 46198590
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46198433 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgaggcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 46198532  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt 197  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46198533 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 46198590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 29764346 - 29764533
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29764346 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgttttcaattaatattgttatgttgtgaattgct 29764445  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29764446 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 29764533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50000817 - 50000658
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  50000817 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgtgaattgct 50000718  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50000717 tgtgctatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaa 50000658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 1925266 - 1925396
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1925266 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 1925365  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925366 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1925396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 20924280 - 20924410
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20924280 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 20924379  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924380 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20924410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 22130962 - 22131169
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatg-tttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            | ||||    
T  22130962 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgcttc------------tcatgt 22131049  T
Q  130 tgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22131050 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttctcgttccaaagtattcc 22131149  T
Q  221 aaagtattggagtcttaagt 240  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22131150 aaagtactggagtcttaagt 22131169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 20228946 - 20229076
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  20228946 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgtt 20229045  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229046 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20229076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21407324 - 21407216
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407324 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 21407225  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  21407224 gtgaattgc 21407216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1010692 - 1010584
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010692 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 1010593  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  1010592 gtgaattgc 1010584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 16375596 - 16375704
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375596 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 16375695  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  16375696 gtgaattgc 16375704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Original strand, 13881437 - 13881538
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  13881437 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgtt 13881536  T
Q  131 gt 132  Q
    ||    
T  13881537 gt 13881538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 52639510 - 52639402
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639510 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaagatgtttgatgtctaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 52639411  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  52639410 gtgaattgc 52639402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20316619 - 20316532
Alignment:
Q  113 cattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  20316619 cattgatattgacatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagtttcaggtgttggtctaaattgtaa 20316532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Original strand, 41781639 - 41781718
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtgg-aaaatgtatgatgtttaagttgttg 104  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41781639 tgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaaatgtacgatgtttaagttgttg 41781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Original strand, 636090 - 636139
Alignment:
Q  191 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  636090 aagttgtaagttgtctttctaaagtattccaaagtattggattcttaagt 636139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43543198 - 43543133
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgat 91  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  43543198 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgat 43543133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 22107485 - 22107659
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22107485 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgtt 22107584  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22107585 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22107659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 33895696 - 33895870
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33895696 tgctgcctatgttgctgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 33895795  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33895796 atgttgtgaactgcttgtgctgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtattggtctaagttgtaa 33895870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6765893 - 6765724
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  6765893 cctatgttgctgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgtt 6765794  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  6765793 gtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcatgtgttggtctaagttgtaa 6765724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17011069 - 17010923
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17011069 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17010970  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17010969 tgtgctgcttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 17010923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18356261 - 18356131
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356261 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 18356162  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18356161 gtgaattgtttgtgatgtttctgttgctgtt 18356131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 20910972 - 20911102
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20910972 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 20911071  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20911072 gtgaattgtttgtgttgtttctgttgctgtt 20911102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 263201 - 263042
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  263201 tgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 263102  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt-tgtctaagttgtaa 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  263101 tgtgctgtttctgttgttgttgcatatagatcaagttgcaggtataggtctaagttgtaa 263042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10753333 - 10753203
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10753333 cctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgtt 10753234  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10753233 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgtt 10753203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29448068 - 29447899
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg-ttgatgcttcacattaatattgttatgt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  29448068 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaa-tgtataatgtttaaattgattgatgcttttcattaatattgttatgt 29447970  T
Q  130 tgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||| ||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29447969 tgtgaattgcttgtgttgctcctgttgatgttgagtattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 29447899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 40723724 - 40723854
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  40723724 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataatagtattgttatgtt 40723823  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40723824 gtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 40723854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20295816 - 20295708
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295816 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 20295717  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  20295716 gtgaattgc 20295708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 15236972 - 15237080
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236972 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 15237071  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  15237072 gtgaattgc 15237080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 19472857 - 19472965
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472857 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 19472956  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  19472957 gtgaattgc 19472965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18356391 - 18356308
Alignment:
Q  20 tttgaatgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356391 tttgtatgctgcctatgttgctgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 18356308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 104
Target Start/End: Original strand, 20910854 - 20910925
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20910854 ctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttg 20910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11220634 - 11220587
Alignment:
Q  114 attaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220634 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11220587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11225220 - 11225173
Alignment:
Q  114 attaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11225220 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11225173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11229043 - 11228996
Alignment:
Q  114 attaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11229043 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11228996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Original strand, 33473272 - 33473330
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33473272 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11231032 - 11230985
Alignment:
Q  114 attaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11231032 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11230985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11227053 - 11227008
Alignment:
Q  114 attaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctg 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||    
T  11227053 attaatattgttatgttgtgaatttcatgtgctgtatctgttgctg 11227008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 17048185 - 17048359
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048185 tgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 17048284  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17048285 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17048359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 14746634 - 14746808
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  14746634 tgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 14746733  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14746734 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 14746808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Original strand, 13591977 - 13592149
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |    
T  13591977 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgatgatgcttttcattaatattgat 13592075  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13592076 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgaaggtgttggtctaagttgta 13592149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Original strand, 43256208 - 43256344
Alignment:
Q  25 atgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgt 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43256208 atgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattga 43256307  T
Q  125 tatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256308 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 43256344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40619872 - 40619694
Alignment:
Q  43 ttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttg 142  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40619872 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 40619773  T
Q  143 tgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  40619772 tgctgtttctgttactgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtcgttccaaagtatt 40619694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15008309 - 15008163
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15008309 tgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 15008210  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008209 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 15008163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 15497086 - 15497247
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15497086 tgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtt 15497185  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15497186 atgttgagaattgattgtgatgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttg 15497247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 10694955 - 10695101
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10694955 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10695054  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10695055 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 10695101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 10908721 - 10908867
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10908721 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10908820  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10908821 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 10908867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10712825 - 10712695
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10712825 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgtt 10712726  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712725 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10712695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10926595 - 10926465
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10926595 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgtt 10926496  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926495 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10926465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 15884123 - 15884269
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  15884123 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgagaattgct 15884222  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15884223 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 15884269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12487680 - 12487550
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12487680 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgtt 12487581  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487580 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 12487550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Original strand, 14954304 - 14954431
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14954304 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 14954403  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  14954404 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 14954431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27533995 - 27533868
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  27533995 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgtt 27533896  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||    
T  27533895 gtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 27533868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9556499 - 9556391
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556499 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 9556400  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  9556399 gtgaattgc 9556391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25689839 - 25689712
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  25689839 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 25689740  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  25689739 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 25689712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19857585 - 19857416
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  19857585 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtggagaatatatgatatttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttg 19857486  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaag 200  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  19857485 tgaattacttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaggatgcaggtgttggtttaagttgtaag 19857416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 14757559 - 14757667
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757559 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 14757658  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  14757659 gtgaattgc 14757667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Original strand, 4561471 - 4561572
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4561471 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaataatgttatgtt 4561570  T
Q  131 gt 132  Q
    ||    
T  4561571 gt 4561572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Original strand, 5757075 - 5757176
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5757075 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttggtgcttcacattaatattgttatgtt 5757174  T
Q  131 gt 132  Q
    ||    
T  5757175 gt 5757176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17810241 - 17810134
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810241 cctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 17810142  T
Q  131 gtaaattg 138  Q
    || |||||    
T  17810141 gtgaattg 17810134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 199
Target Start/End: Original strand, 53631355 - 53631481
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 173  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53631355 atgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 53631454  T
Q  174 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53631455 agttgcaagtgttggtctaagttgtaa 53631481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14650863 - 14650697
Alignment:
Q  56 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct--tgtgctgttt-ct 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||| ||    
T  14650863 gaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctatttcct 14650764  T
Q  153 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14650763 gttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 14650697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33742347 - 33742241
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33742347 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgct 33742250  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  33742249 gtgaattgc 33742241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26013498 - 26013377
Alignment:
Q  81 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgct--gttgaatattgatcaagttg 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  26013498 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgggttgcatattgatcaagttg 26013399  T
Q  179 caggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||| |||| || ||||||||||    
T  26013398 cagatgttggtttaagttgtaa 26013377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 10056708 - 10056650
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaat 84  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10056708 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaat 10056650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 28385587 - 28385529
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28385587 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14185040 - 14184973
Alignment:
Q  152 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  14185040 tgttgctgttgtatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaagttatctttccaaagtatt 14184973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15990348 - 15990254
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 168  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  15990348 atgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttataatgtgaattgcttgtgttgtttctgctgttgttgattatt 15990254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 52873199 - 52873239
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcct 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  52873199 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcct 52873239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 2764 - 2987
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  2764 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgtt 2863  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| |||||     
T  2864 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctcttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtg 2963  T
Q  217 ttccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  2964 ttccaaagtattggattcttaagt 2987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21236 - 21064
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21236 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcagtaatattgtt 21137  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt 197  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21136 atgttgtgaattgcttgtgctatttttgttgctgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 21064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 53889 - 54063
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  53889 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 53988  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53989 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 54063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 17461108 - 17461326
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  17461108 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgtt 17461207  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcca 221  Q
    || |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  17461208 gtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttcca 17461307  T
Q  222 aagtattggagtcttaagt 240  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17461308 aagtattggagtcttaagt 17461326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37515775 - 37515602
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  37515775 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatgtggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgat 37515676  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 198  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37515675 atgttgtgaattgcttgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta 37515602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18833632 - 18833458
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  18833632 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttttttatgcttctcattaatattgat 18833533  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18833532 atgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgttgttgaatattgatcaagttgtaggagttggtctaagttgtaa 18833458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 19808419 - 19808587
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  19808419 ctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatatttttatgttg 19808518  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19808519 tgaattgcttgtaatggttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 19808587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Original strand, 22238077 - 22238243
Alignment:
Q  33 tatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 132  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  22238077 tatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgttgatcctcttcattaatattgttatgttgt 22238175  T
Q  133 aaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22238176 gaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22238243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23409865 - 23409691
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  23409865 tgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatatttaagttgttgatgttcttcattaatattgtt 23409766  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23409765 atgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 23409691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26454054 - 26453908
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26454054 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 26453955  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26453954 tgtgttgtttctgttgcagttgaatattgatcaagttgcagatgttg 26453908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23478422 - 23478278
Alignment:
Q  43 ttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttg 142  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23478422 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 23478323  T
Q  143 tgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23478322 tgctgtttcttttgatgttgaatattgatcaagttggagatgttg 23478278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19880172 - 19880026
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  19880172 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgagaattgct 19880073  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19880072 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgaccaagttgcagatgttg 19880026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21410919 - 21410789
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21410919 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 21410820  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410819 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21410789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21805411 - 21805281
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21805411 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 21805312  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21805311 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21805281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 21828151 - 21828281
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21828151 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 21828250  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828251 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21828281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Original strand, 18862782 - 18862909
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18862782 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 18862881  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgct 158  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  18862882 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 18862909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Original strand, 19929572 - 19929736
Alignment:
Q  56 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctg-tttctgt 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||    
T  19929572 gaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatgctgtgaattgcttgtgctgttttatgt 19929671  T
Q  155 tgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  19929672 tgctgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtccaagttgtaagttgttgttccaaaatatt 19929736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 21976807 - 21976915
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976807 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 21976906  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  21976907 gtgaattgc 21976915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22111900 - 22111792
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111900 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 22111801  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  22111800 gtgaattgc 22111792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 19278420 - 19278528
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278420 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 19278519  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
     | ||||||    
T  19278520 ctgaattgc 19278528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43251782 - 43251674
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251782 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 43251683  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  43251682 gtgaattgc 43251674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 14397918 - 14398040
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14397918 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgc--------gaagatgtatgatgtttaagttgttgttgcttcacattaatattgttatgtt 14398009  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14398010 gtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 14398040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23659472 - 23659368
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  23659472 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgtt 23659373  T
Q  131 gtaaa 135  Q
    |||||    
T  23659372 gtaaa 23659368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22353019 - 22352932
Alignment:
Q  113 cattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22353019 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22352932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5760703 - 5760577
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 173  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5760703 atgtggaatatgtatgatgttgaagttgtagttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgttgtttctgttgttgttgaatattgatca 5760604  T
Q  174 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5760603 agttgcaagtgttggtctaagttgtaa 5760577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 16402053 - 16402150
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  16402053 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatactcttcattaatattg 16402150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 21972722 - 21972826
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21972722 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa----ttaatgcttcacataaatattgttatgtt 21972817  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  21972818 gtgaattgc 21972826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23914102 - 23914029
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23914102 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 23914029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 44384821 - 44384894
Alignment:
Q  127 tgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44384821 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 44384894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Original strand, 8414418 - 8414476
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8414418 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11775066 - 11775008
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11775066 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Original strand, 1327058 - 1327123
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgat 91  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  1327058 tgctgcctaagttgctgttgtaggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgat 1327123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 6998 - 7166
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6998 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatgtatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 7097  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7098 tgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 7166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 169800 - 169974
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  169800 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 169899  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  169900 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttactgttacatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 169974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 71377 - 71236
Alignment:
Q  20 tttgaatgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat 119  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat 71278  T
Q  120 attgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  71277 attgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 71236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 601 - 384
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  601 ctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 502  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaa 222  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  501 tgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagctgtaaagttgtaagttgtctttcaaaagtgttccaa 402  T
Q  223 agtattggagtcttaagt 240  Q
    | ||||||||||||||||    
T  401 actattggagtcttaagt 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 3378 - 3552
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  3378 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtt 3477  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3478 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgtaa 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 313
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  487 tgctccctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtt 388  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    | || || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  387 acgtcgtgaatttcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 85615 - 85441
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  85615 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtt 85516  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  85515 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaa 85441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15809 - 15588
Alignment:
Q  29 tacctatgttgctgttgttggttatgggaaatat-ttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  15809 tacctatgttgctgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttat 15710  T
Q  128 gttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtc--------taagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||         ||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  15709 gttgtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaagtgttggtcgaatttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgtt 15610  T
Q  219 ccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15609 ccaaagtattggagtcttaagt 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Original strand, 24653 - 24820
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24653 cctatgttgatgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatctggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt-cattaatattgttatgtt 24751  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgtctaagttgtaa 199  Q
     | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24752 ctgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttgtttaagttgtaa 24820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 623 - 468
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  623 ctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttg 524  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  523 tgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttg 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 1925 - 2099
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  1925 tgctgcctttgttgctgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgtt 2024  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2025 atgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttacaggtgttggtctaagttgtaa 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 1349 - 1517
Alignment:
Q  32 ctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 131  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1349 ctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 1448  T
Q  132 taaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1449 tgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5615
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5802 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatagttatgttgtgaattgct 5703  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5702 tgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 5615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Original strand, 1227 - 1370
Alignment:
Q  37 ttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  1227 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 1326  T
Q  137 tgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 180  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1327 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Original strand, 7978 - 8121
Alignment:
Q  37 ttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  7978 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 8077  T
Q  137 tgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 180  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8078 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 8121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 20266 - 20396
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20266 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 20365  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20366 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Original strand, 10135 - 10350
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  10135 tgctgcctatgtttctgctattggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaattttgtt 10234  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagta 216  Q
    || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| |||||     
T  10235 attttgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgcaaagttgtaagttgtctttccaaagtg 10334  T
Q  217 ttccaaagtattggag 232  Q
    ||||||||||||||||    
T  10335 ttccaaagtattggag 10350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Original strand, 15459 - 15560
Alignment:
Q  20 tttgaatgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat 119  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcgcattaat 15558  T
Q  120 at 121  Q
    ||    
T  15559 at 15560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31188 - 31058
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31188 cctatgttgctgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 31089  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088 ttgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7899 - 7731
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  7899 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgaagtt-aagtggttgatgcttctcattaatattgacatgtt 7801  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaa 199  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7800 gtgaattgtttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgctctaaattgtaa 7731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33261 - 33074
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||    
T  33261 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttgagaattgct 33162  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33161 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 67324 - 67161
Alignment:
Q  33 tatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  67324 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 67225  T
Q  133 aaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 195  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  67224 gaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatccagttgcaggtgttggtctaagtt 67161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7127
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 125  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  6953 tgctgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatttttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatactgtt 7052  T
Q  126 atgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    | | |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7053 acgatgtgtattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 207639 - 207769
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  207639 cctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatctt 207738  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  207739 gtgaattgcttgtgctgtttttgttgctgtt 207769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10564 - 10378
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10564 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta-gtttttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10466  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10465 tgtgctatttctgttgctgttgaatattcatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 10378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 22477 - 22664
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22477 tgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 22576  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22577 tgtgctgtttttgttgctgttgaatatttatcaagttgcagatgtttgtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 22664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 240
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13650
Alignment:
Q  89 gatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-g 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcatgtgttgg 13589  T
Q  188 tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    |||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13590 tctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtctaaagt 13650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 364 - 234
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  364 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 265  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  264 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 11638 - 11768
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11638 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgtt 11737  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11738 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 36223 - 36353
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  36223 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 36322  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36323 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 36353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 189514 - 189644
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  189514 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 189613  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  189614 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 189644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39317 - 39205
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39317 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 39218  T
Q  131 gtaaattgcttgt 143  Q
    || ||||||||||    
T  39217 gtgaattgcttgt 39205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15062 - 14906
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||   ||| ||||||| |||| |    
T  15062 cctatgttggtgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgggaaaaatgtatgatgttaaagttgtagacgctctccataaatattgatatgat 14963  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 187  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  14962 gaaaattgcttgcactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagtcgcacgtgttg 14906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 32797 - 32927
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32797 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgtt 32896  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32897 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 32927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 224 - 49
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  224 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttaggtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgtt 125  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttc------tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    || ||||| |||| |||||||      ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  124 gtgaattgtttgtactgtttctgtttctgttgctgttgcatattaagcaagttgcaggtgttggtctaatttgtaa 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 14224 - 14354
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14224 cctatgttcctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgtt 14323  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14324 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 80684 - 80554
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  80684 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgtt 80585  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  80584 gtgaattgattgtgctatttctgttgctgtt 80554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 65665 - 65773
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65665 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 65764  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  65765 gtgaattgc 65773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 61749 - 61857
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61749 cctatgttgctgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 61848  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  61849 gtgaattgc 61857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 70536 - 70689
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct 140  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  70536 tgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 70635  T
Q  141 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70636 tgtgttgtttctgttgc------atattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 70689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 58856 - 58964
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58856 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 58955  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  58956 gtgaattgc 58964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 199
Target Start/End: Original strand, 6851 - 6977
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgatgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatca 6950  T
Q  174 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6951 agttgcaggtgttggtctaagttgtaa 6977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 4325 - 4383
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatg 89  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  4325 cctattttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatacgttatgtggaaaatgtatg 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 5238 - 5346
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238 cctatgttgctgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 5337  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  5338 gtgaattgc 5346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12391 - 12283
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12391 cctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 12292  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  12291 gtgaattgc 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 36079 - 36208
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  36079 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgtt 36178  T
Q  131 gtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttg 162  Q
    || |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  36179 gtgaattgcatgtgctgtt--tgttgctgttg 36208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7710 - 7544
Alignment:
Q  56 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct--tgtgctgttt-ct 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| ||    
T  7710 gaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgttgtttcct 7611  T
Q  153 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7610 attgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctgagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 7544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 57008 - 56842
Alignment:
Q  56 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct--tgtgctgttt-ct 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||| |  |||| ||||| ||    
T  57008 gaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgtttatgtgttgtttcct 56909  T
Q  153 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56908 gttgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 56842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 419 - 311
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  419 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaagatgtttgatgtttaagttattgatgcttcacattaatattgttatgtt 320  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  319 gtgaattgc 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Original strand, 4012 - 4111
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4012 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttaatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 4111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15622 - 15470
Alignment:
Q  56 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct--tgtgctgttt-ct 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15622 gaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgatgtgaattgcttatgtgctgtttcct 15523  T
Q  153 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgt 204  Q
      || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15522 aatgttgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgt 15470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20774 - 20652
Alignment:
Q  124 ttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||    
T  20774 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaag 20675  T
Q  215 tattccaaagtattggagtctta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20674 tattccaaagtattggagtctta 20652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20820 - 20769
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgt 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20820 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 20769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 67439 - 67546
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67439 cctatgttgttgttgttggttatgt-aaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 67537  T
Q  131 gtaaattgc 139  Q
    || ||||||    
T  67538 gtgaattgc 67546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 123
Target Start/End: Original strand, 80472 - 80564
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80472 cctatgttgctgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 161
Target Start/End: Original strand, 80562 - 80621
Alignment:
Q  102 ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  80562 ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 80621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 199
Target Start/End: Original strand, 1349 - 1475
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 173  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1349 atgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 1448  T
Q  174 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1449 agttgcaagtgttggtctaagttgtaa 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6854
Alignment:
Q  83 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Original strand, 166429 - 166595
Alignment:
Q  56 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct--tgtgctgttt-ct 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||| ||    
T  166429 gaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctatttcct 166528  T
Q  153 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  166529 gttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 166595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 17638 - 17559
Alignment:
Q  31 cctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17638 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 17559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 78386 - 78299
Alignment:
Q  113 cattaatattgttatgttgtaaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  78386 cattaatattgctatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 78299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 107
Target Start/End: Original strand, 6210 - 6291
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatg 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6210 tgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatatacgatgtttaagttgttgatg 6291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 105150 - 105078
Alignment:
Q  26 tgctacctatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaag 98  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  105150 tgctgcctatgttgttgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaag 105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10534 - 10467
Alignment:
Q  152 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10534 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 176136 - 176078
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  176136 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 168782 - 168724
Alignment:
Q  41 tgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 99  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  168782 tgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3599 - 3550
Alignment:
Q  191 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3599 aagttgtaagttgtcgttccaaagtattcgaaagtattggagtcttaagt 3550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7663 - 7614
Alignment:
Q  191 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 240  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7663 aagttgtaagttgtctttccaaagtattctaaagtattggagtcttaagt 7614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8092 - 8028
Alignment:
Q  152 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 215  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8092 tgttgctgttgcatattgataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagt 8028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9048 - 8934
Alignment:
Q  56 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtaaattgct--tgtgctgtttctg 153  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||  || |||  |||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||    
T  9048 gaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgttgtgaattacttatgtgctgcctatg 8949  T
Q  154 ttgctgttgaatatt 168  Q
    ||||||||| |||||    
T  8948 ttgctgttgtatatt 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 195
Target Start/End: Original strand, 11567 - 11692
Alignment:
Q  74 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat-attgttatgttgtaaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatattga 170  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || ||  |||| || |||| |||||||| | ||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  11567 atgtgaaaagtgtatgatgttgaagttgttgttgattatcattgattattgatatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgttgttgttgaatattga 11666  T
Q  171 tcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 195  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||    
T  11667 ttaagttgcaagtgttggtctaagtt 11692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 91
Target Start/End: Original strand, 36088 - 36146
Alignment:
Q  33 tatgttgctgttgttggttatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgat 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  36088 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgat 36146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 126945 - 126896
Alignment:
Q  170 atcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  126945 atcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 126896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21894 - 21847
Alignment:
Q  153 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21894 gttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 21847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University