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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16710_low_12 (Length: 209)

Name: NF16710_low_12
Description: NF16710
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16710_low_12
NF16710_low_12
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (20-191)||(24470824-24470994)
chr4 (26-191)||(24420632-24420797)
chr4 (20-191)||(24421208-24421379)
chr4 (20-191)||(24470536-24470707)
chr4 (20-186)||(24420877-24421043)
chr4 (26-191)||(24470925-24471090)
chr4 (20-191)||(24421064-24421235)
chr4 (20-186)||(24470344-24470510)
chr4 (38-191)||(24420536-24420689)
chr4 (26-183)||(24470686-24470843)
chr4 (24-93)||(24476990-24477059)
chr4 (20-141)||(24477395-24477516)
chr4 (20-191)||(24421112-24421283)
chr4 (20-191)||(24421256-24421427)
chr4 (24-191)||(24420920-24421087)
chr4 (20-191)||(24470488-24470659)
chr4 (32-175)||(24477457-24477600)
chr4 (20-190)||(24470296-24470466)
chr4 (20-191)||(24420824-24420995)
chr4 (20-191)||(24470632-24470803)
chr4 (20-183)||(24477497-24477660)
chr4 (65-191)||(24421160-24421286)
chr4 (20-165)||(24420466-24420611)
chr4 (20-189)||(24420730-24420899)
chr4 (83-191)||(24477633-24477741)
chr4 (74-191)||(24420344-24420461)
chr4 (29-186)||(24420493-24420650)
chr4 (20-177)||(24420598-24420755)
chr4 (20-165)||(24420706-24420851)
chr4 (20-189)||(24470728-24470896)
chr4 (20-165)||(24470871-24471016)
chr4 (26-165)||(24471021-24471160)
chr4 (29-191)||(24420968-24421130)
chr4 (74-184)||(24471165-24471275)
chr4 (56-189)||(24470476-24470609)
chr4 (29-186)||(24470976-24471133)
chr4 (35-191)||(24420776-24420932)
chr4 (35-189)||(24421306-24421460)
chr4 (20-191)||(24476988-24477150)
chr4 (65-123)||(24477095-24477153)
chr4 (74-183)||(24421360-24421469)
chr4 (74-183)||(24470254-24470363)
chr4 (104-165)||(24481334-24481395)
chr4 (62-189)||(24406481-24406608)
chr4 (20-191)||(24421016-24421187)
chr4 (107-190)||(24481477-24481559)
chr4 (35-189)||(24470263-24470417)
chr4 (62-156)||(24476975-24477069)
chr4 (149-183)||(24481582-24481616)
chr4 (134-191)||(24421400-24421457)
chr4 (134-191)||(24470266-24470323)
chr4 (110-171)||(24476897-24476958)
chr4 (26-102)||(24420337-24420413)
[»] scaffold0879 (8 HSPs)
scaffold0879 (20-191)||(4539-4710)
scaffold0879 (20-191)||(4491-4662)
scaffold0879 (50-191)||(4425-4566)
scaffold0879 (20-117)||(4731-4828)
scaffold0879 (24-191)||(4687-4854)
scaffold0879 (65-191)||(4488-4614)
scaffold0879 (29-191)||(4644-4806)
scaffold0879 (20-191)||(4587-4758)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (35-191)||(41899897-41900053)
chr2 (29-191)||(41900233-41900395)
chr2 (26-191)||(41900425-41900590)
chr2 (68-186)||(41899950-41900068)
chr2 (65-189)||(41899851-41899975)
chr2 (29-191)||(41900281-41900443)
chr2 (65-168)||(41899824-41899927)
chr2 (137-186)||(41900574-41900623)
chr2 (74-174)||(41900346-41900446)
chr2 (74-174)||(41900538-41900638)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (74-189)||(11879442-11879557)
chr1 (26-191)||(11904905-11905070)
chr1 (29-191)||(11904956-11905118)
chr1 (20-162)||(11879484-11879626)
chr1 (26-159)||(52818902-52819035)
chr1 (26-141)||(11905049-11905164)
chr1 (20-150)||(11902080-11902210)
chr1 (74-191)||(11902038-11902155)
chr1 (26-191)||(11905097-11905262)
chr1 (29-165)||(11879445-11879581)
chr1 (29-189)||(11902041-11902201)
chr1 (62-138)||(52821569-52821645)
chr1 (26-189)||(11882108-11882271)
chr1 (26-165)||(11882300-11882439)
chr1 (26-189)||(11891342-11891505)
chr1 (26-165)||(11891534-11891673)
chr1 (74-189)||(52821323-52821438)
chr1 (125-191)||(11879445-11879511)
chr1 (26-191)||(11905193-11905358)
chr1 (20-165)||(11902128-11902273)
chr1 (74-159)||(52821305-52821390)
chr1 (101-189)||(11879661-11879749)
chr1 (125-177)||(11902377-11902429)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 24470824 - 24470994
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470824 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccc-accatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 24470922  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470923 tttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 24470994  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24420797 - 24420632
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24420797 tataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 24420698  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24420697 aatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 24420632  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24421379 - 24421208
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  24421379 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatg 24421280  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | || ||||| ||||||||||| || || ||||| || || || ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  24421279 tctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccat 24421208  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 24470536 - 24470707
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  24470536 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatg 24470635  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  24470636 tctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccat 24470707  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24421043 - 24420877
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  24421043 tatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatg 24420944  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccacc 186  Q
    | || || || || || ||||| || |||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  24420943 tctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacc 24420877  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 24470925 - 24471090
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| || || || |||||| | |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||    
T  24470925 tataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctata 24471024  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || || |||||||    
T  24471025 agtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccat 24471090  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24421235 - 24421064
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatata 24421136  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  24421135 tttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccat 24421064  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 24470344 - 24470510
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  24470344 tatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatg 24470443  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccacc 186  Q
    | || ||||| |||||||||||  | || ||||| || || || ||| | |||||||||||||||||    
T  24470444 tctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacc 24470510  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24420689 - 24420536
Alignment:
Q  38 cctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctc 137  Q
    ||||| ||||||||||| || || || |||||| | |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  24420689 cctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctc 24420590  T
Q  138 caccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || || |||||||    
T  24420589 ctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccat 24420536  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Original strand, 24470686 - 24470843
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |    
T  24470686 tataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctaca 24470785  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccacc 183  Q
    | || || || ||||| || |||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||    
T  24470786 aatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacc 24470843  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24477059 - 24476990
Alignment:
Q  24 tatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccacc 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24477059 tatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgtatacaagtcaccacctccacc 24476990  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24477516 - 24477395
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  24477516 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctccatatg 24477417  T
Q  120 tttataagtcacctcctccacc 141  Q
    | || ||||| |||||||||||    
T  24477416 tctacaagtctcctcctccacc 24477395  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24421283 - 24421112
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| |    
T  24421283 tatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatg 24421184  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | || |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24421183 tctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccat 24421112  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24421427 - 24421256
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |    
T  24421427 tatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24421328  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | ||||||   || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  24421327 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccat 24421256  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24421087 - 24420920
Alignment:
Q  24 tatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgttta 123  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||    
T  24421087 tatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtcta 24420988  T
Q  124 taagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
     |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  24420987 caagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccat 24420920  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470659
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |    
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | ||||||   || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccat 24470659  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24477600 - 24477457
Alignment:
Q  32 tcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcac 131  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||    
T  24477600 tcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcac 24477501  T
Q  132 ctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaag 175  Q
    | ||||| || ||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  24477500 cacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 24477457  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 24470296 - 24470466
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || ||||| |    
T  24470296 tatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatg 24470395  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacca 190  Q
    | ||||||   || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  24470396 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccacca 24470466  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24420995 - 24420824
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || || || || ||||| |    
T  24420995 tatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatg 24420896  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  24420895 tatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccat 24420824  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 24470632 - 24470803
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| |    
T  24470632 tatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatg 24470731  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | || |||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  24470732 tctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccat 24470803  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24477660 - 24477497
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| || || ||||| |    
T  24477660 tatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatg 24477561  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccacc 183  Q
    | ||||||   || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24477560 tctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacc 24477497  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24421286 - 24421160
Alignment:
Q  65 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccat 164  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || || || || || ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||||||||    
T  24421286 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccat 24421187  T
Q  165 atatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  24421186 atgtctacaagtcaccaccaccaccat 24421160  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24420611 - 24420466
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || || || || || || |    
T  24420611 tatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatg 24420512  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata 165  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  24420511 tctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24420466  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24420899 - 24420730
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || || || || ||      
T  24420899 tatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctata 24420800  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    |||||||||| || || || || ||||| || || || || |||||| | |||||||||||||| |||||    
T  24420799 tttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccacc 24420730  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477633
Alignment:
Q  83 ccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccac 182  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  183 caccaccat 191  Q
    |||| ||||    
T  24477641 cacctccat 24477633  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24420461 - 24420344
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctaca 173  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24420461 tacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttaca 24420362  T
Q  174 agtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  24420361 agtctccacctccaccat 24420344  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24420650 - 24420493
Alignment:
Q  29 aagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagt 128  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||| || |    
T  24420650 aagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaat 24420551  T
Q  129 cacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccacc 186  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||| |||||    
T  24420550 ctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacc 24420493  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24420755 - 24420598
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||      
T  24420755 tatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatata 24420656  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtc 177  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  24420655 tctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtc 24420598  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24420851 - 24420706
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| |    
T  24420851 tatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatg 24420752  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24420751 tttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccata 24420706  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 24470728 - 24470896
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || || || || ||||| |    
T  24470728 tatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatg 24470827  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||| | |||||||||||||| |||||    
T  24470828 tatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcc-ccaccatatgtttacaagtcaccacctccacc 24470896  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Original strand, 24470871 - 24471016
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| || ||||| ||||||||      
T  24470871 tatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatata 24470970  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata 165  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24470971 tctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 24471016  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 24471021 - 24471160
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || || || || || || ||  |||    
T  24471021 tataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccata 24471120  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata 165  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  24471121 agtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24471160  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24421130 - 24420968
Alignment:
Q  29 aagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagt 128  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||||| | |||||||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  24421130 aagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaat 24421031  T
Q  129 cacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||| || || || ||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24421030 caccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccat 24420968  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 184
Target Start/End: Original strand, 24471165 - 24471275
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctaca 173  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || |||| |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24471165 tacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttaca 24471264  T
Q  174 agtcaccacca 184  Q
    |||| ||||||    
T  24471265 agtctccacca 24471275  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 189
Target Start/End: Original strand, 24470476 - 24470609
Alignment:
Q  56 cctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccac 155  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  24470476 cctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctc 24470575  T
Q  156 ctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    | || |||||| |||| |||   |||||||||||    
T  24470576 ccccaccatatgtctataagagtccaccaccacc 24470609  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Original strand, 24470976 - 24471133
Alignment:
Q  29 aagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagt 128  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||| || |    
T  24470976 aagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaat 24471075  T
Q  129 cacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccacc 186  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| || | |||||||| |||||    
T  24471076 ctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacc 24471133  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24420932 - 24420776
Alignment:
Q  35 ccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctc 134  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |    
T  24420932 ccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccac 24420833  T
Q  135 ctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  24420832 ccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccat 24420776  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24421460 - 24421306
Alignment:
Q  35 ccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctc 134  Q
    |||||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || || |||||||| |    
T  24421460 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24421361  T
Q  135 ctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    |||| || ||||||||||| || || |||||| |||| |||   |||||||||||    
T  24421360 ctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccacc 24421306  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24477150 - 24476988
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Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| |||      |||||||| |||   |||||      
T  24477150 tatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccaccccca------ccatcccctcca---ccatatc 24477060  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  24477059 tatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgtatacaagtcaccacctccaccat 24476988  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24477153 - 24477095
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Q  65 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgttta 123  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24477153 ccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgttta 24477095  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24421469 - 24421360
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctaca 173  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || || || || ||||| || || |||||||||||| ||||||    
T  24421469 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24421370  T
Q  174 agtcaccacc 183  Q
    ||||||||||    
T  24421369 agtcaccacc 24421360  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 24470254 - 24470363
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctaca 173  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || || || || ||||| || || |||||||||||| ||||||    
T  24470254 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24470353  T
Q  174 agtcaccacc 183  Q
    ||||||||||    
T  24470354 agtcaccacc 24470363  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24481395 - 24481334
Alignment:
Q  104 ccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata 165  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  24481395 ccaccaccaccttatgtttatgagtcacctcctccaccctcaccatcaccacctcctccata 24481334  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24406608 - 24406481
Alignment:
Q  62 ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctc 161  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || || || || | ||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||    
T  24406608 ccaccgtatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctc 24406509  T
Q  162 catatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    | |||||||||||| | ||||| |||||    
T  24406508 cttatatctacaagactccacctccacc 24406481  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24421187 - 24421016
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || |||||      
T  24421187 tatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatata 24421088  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | || ||||| ||||||||||| || || || || || || |||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  24421087 tatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccat 24421016  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481477
Alignment:
Q  107 ccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacca 190  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacctccacca 24481477  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 24470263 - 24470417
Alignment:
Q  35 ccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctc 134  Q
    |||||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || || |||||||| |    
T  24470263 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24470362  T
Q  135 ctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    |||| || || |||||||| || || |||||| |||| |||   |||||||||||    
T  24470363 ctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccacc 24470417  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24477069 - 24476975
Alignment:
Q  62 ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacc 156  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| || ||||| || || || || ||||| || || |||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24477069 ccaccatatctatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgtatacaagtcaccacctccaccatctacttcaccacc 24476975  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24481616 - 24481582
Alignment:
Q  149 tcaccacctcctccatatatctacaagtcaccacc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24481616 tcaccacctcctccatatatctacaagtcgccacc 24481582  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24421457 - 24421400
Alignment:
Q  134 cctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  24421457 cctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccat 24421400  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Original strand, 24470266 - 24470323
Alignment:
Q  134 cctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  24470266 cctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccat 24470323  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24476958 - 24476897
Alignment:
Q  110 cctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatcta 171  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24476958 cctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtcta 24476897  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24420413 - 24420337
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatc 102  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24420413 tataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttacaagtctccacctccaccatctccatc 24420337  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 8)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 4539 - 4710
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  4539 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatata 4638  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  4639 tttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccat 4710  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 4491 - 4662
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| |    
T  4491 tatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatg 4590  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | || |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4591 tctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccat 4662  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 191
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4566
Alignment:
Q  50 ccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctcctt 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 4524  T
Q  150 caccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||| || || |||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  4525 cacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccat 4566  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Original strand, 4731 - 4828
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccata 117  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  4731 tatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccata 4828  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 4687 - 4854
Alignment:
Q  24 tatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgttta 123  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||    
T  4687 tatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtcta 4786  T
Q  124 taagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
     |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  4787 caagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccat 4854  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 4488 - 4614
Alignment:
Q  65 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccat 164  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || || || ||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||||||||    
T  4488 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccat 4587  T
Q  165 atatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  4588 atgtctacaagtcaccaccaccaccat 4614  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 4644 - 4806
Alignment:
Q  29 aagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagt 128  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||||| | |||||||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  4644 aagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaat 4743  T
Q  129 cacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||| || || || ||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4744 caccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccat 4806  T

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Target: scaffold0879; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 4587 - 4758
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || |||||      
T  4587 tatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatata 4686  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | || ||||| ||||||||||| || || || || || || |||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  4687 tatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccat 4758  T

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Target: chr2 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41900053 - 41899897
Alignment:
Q  35 ccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctc 134  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  41900053 ccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccac 41899954  T
Q  135 ctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | || ||||| || ||||| ||||||||||||   |||||||| || || |||||||    
T  41899953 caccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccat 41899897  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41900395 - 41900233
Alignment:
Q  29 aagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagt 128  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||||||||| || || ||||    
T  41900395 aagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagt 41900296  T
Q  129 cacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | ||||||||||| ||| | |||| ||| | | | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  41900295 ctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccat 41900233  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41900590 - 41900425
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||| ||||   || || ||||    
T  41900590 tataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccatcaccacaacctaagtatgtctata 41900491  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||| ||| | | | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  41900490 agtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccat 41900425  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41900068 - 41899950
Alignment:
Q  68 tatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatata 167  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||     
T  41900068 tatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatg 41899969  T
Q  168 tctacaagtcaccaccacc 186  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  41899968 tttacaagtccccaccacc 41899950  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41899975 - 41899851
Alignment:
Q  65 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccat 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || || || || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  41899975 ccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccat 41899876  T
Q  165 atatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    || | |||||||| ||||| |||||    
T  41899875 atgtttacaagtctccacctccacc 41899851  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41900443 - 41900281
Alignment:
Q  29 aagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagt 128  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||| || |  || || ||||| || || || |    
T  41900443 aagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaat 41900344  T
Q  129 cacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  41900343 ctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccat 41900281  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41899927 - 41899824
Alignment:
Q  65 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccat 164  Q
    |||||||  |||||||| || || ||||| || || || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  41899927 ccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccat 41899828  T
Q  165 atat 168  Q
    ||||    
T  41899827 atat 41899824  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41900623 - 41900574
Alignment:
Q  137 ccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccacc 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  41900623 ccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacc 41900574  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900346
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctaca 173  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || || |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  174 a 174  Q
    |    
T  41900346 a 41900346  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900538
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctaca 173  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||  ||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctaca 41900539  T
Q  174 a 174  Q
    |    
T  41900538 a 41900538  T

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Target: chr1 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 189
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879557
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctaca 173  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  174 agtcaccaccaccacc 189  Q
    ||||||||||||||||    
T  11879542 agtcaccaccaccacc 11879557  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 11904905 - 11905070
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||  ||| |    
T  11904905 tataagtcaccacccccaccatccccatcacctcctccaccatactattacaagtccccccctccaccatcaccatctccaccaccaccatactattaca 11905004  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata-tatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||    
T  11905005 agtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactat-tataagtcaccacctccaccat 11905070  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 11904956 - 11905118
Alignment:
Q  29 aagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagt 128  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||  ||||||||    
T  11904956 aagtccccccctccaccatcaccatctccaccaccaccatactattacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactattataagt 11905055  T
Q  129 cacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||| |||||||| || || || || ||||| ||||||  ||| ||||||||| | |||||||    
T  11905056 caccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagtcaccagctccaccat 11905118  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Original strand, 11879484 - 11879626
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||     
T  11879484 tatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccatact 11879583  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctcc 162  Q
      || |||   ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11879584 actacaagagtcctccaccaccttctccttcacctccacctcc 11879626  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 52819035 - 52818902
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||  |||||    
T  52819035 tataagtcaccaccaccaccatcaccatcccctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatcaccatcccctccccctccatactattata 52818936  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcc 159  Q
    | || ||||| ||||| || || || ||||||||    
T  52818935 aatctcctccaccaccctcaccatccccacctcc 52818902  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 141
Target Start/End: Original strand, 11905049 - 11905164
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||   || ||||||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||  |||||    
T  11905049 tataagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagtcaccagctccaccatccccatcccctcctccaccatactattata 11905148  T
Q  126 agtcacctcctccacc 141  Q
    |||| || ||||||||    
T  11905149 agtccccacctccacc 11905164  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Original strand, 11902080 - 11902210
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  | || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||    
T  11902080 tatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacg 11902179  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttc 150  Q
    | || |||||||| || ||||| || |||||    
T  11902180 tgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttc 11902210  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902155
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctaca 173  Q
    |||||||||||||| |||||  || | || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| |||||||||||  | ||||| ||| | ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  174 agtcaccaccaccaccat 191  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccat 11902155  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 11905097 - 11905262
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || || ||||| ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| || |||  |||||    
T  11905097 tataagtcaccagctccaccatccccatcccctcctccaccatactattataagtccccacctccaccgtcaccagctccaccaccaccttactattata 11905196  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    ||||||| || ||||| || || || || || |||||||||   ||||| || || ||||||||||    
T  11905197 agtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatattattacaaatctcctccaccaccat 11905262  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 11879445 - 11879581
Alignment:
Q  29 aagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagt 128  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||    
T  11879445 aagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagt 11879544  T
Q  129 cacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata 165  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11879545 caccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Original strand, 11902041 - 11902201
Alignment:
Q  29 aagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagt 128  Q
    ||||||||||| || ||| || |||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  ||||||| || || || ||||    
T  11902041 aagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagt 11902140  T
Q  129 cacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    |||| || || || || || ||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  11902141 caccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccacc 11902201  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 52821645 - 52821569
Alignment:
Q  62 ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctcc 138  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||    
T  52821645 ccaccatatgagtacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacctcc 52821569  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Original strand, 11882108 - 11882271
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||   |||||    
T  11882108 tataagtcaccacccccaccatcaccatcacctcctccaccatactattataagtctccacctccaccatcaccatctcccccaccaccttattattata 11882207  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    ||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||   ||||||||| ||||| |||||    
T  11882208 agtcaccacccccaccatccccgtcccctcctccaccatactactacaagtctccacctccacc 11882271  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 11882300 - 11882439
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||   |||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||  ||| |    
T  11882300 tataagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactattaca 11882399  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata 165  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  11882400 aatcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11882439  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Original strand, 11891342 - 11891505
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||   |||||    
T  11891342 tataagtcaccacccccaccatcaccatcacctcctccaccatactattataagtctccacctccaccatcaccatctcccccaccaccttattattata 11891441  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
    ||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||   ||||||||| ||||| |||||    
T  11891442 agtcaccacccccaccatccccgtcccctcctccaccatactactacaagtctccacctccacc 11891505  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 11891534 - 11891673
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||   |||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||  ||| |    
T  11891534 tataagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactattaca 11891633  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata 165  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  11891634 aatcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11891673  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52821438 - 52821323
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctaca 173  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||   || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||   |||||    
T  52821438 tacaagtccccaccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccctctccctcacctccacctccttactactaca 52821339  T
Q  174 agtcaccaccaccacc 189  Q
    ||||||| ||||||||    
T  52821338 agtcacctccaccacc 52821323  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 11879445 - 11879511
Alignment:
Q  125 aagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  11879445 aagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccat 11879511  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 11905193 - 11905358
Alignment:
Q  26 tataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 125  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||  |||||| || || || ||||| || ||||| |||| || ||| |||  ||| |    
T  11905193 tataagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatattattacaaatctcctccaccaccatccccatcaccacaacatccctactattaca 11905292  T
Q  126 agtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata-tatctacaagtcaccaccaccaccat 191  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  11905293 aatcacctccaccaccatcgccatcaccaccacctccctactat-tacaaatcacctccaccaccat 11905358  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Original strand, 11902128 - 11902273
Alignment:
Q  20 tatgtatataagtcaccacctcctccatctccttctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 119  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||     
T  11902128 tatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccatact 11902227  T
Q  120 tttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccata 165  Q
     ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11902228 attacaagtctcctccaccaccctcgccttccccaccgccaccata 11902273  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 52821390 - 52821305
Alignment:
Q  74 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcc 159  Q
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T  52821390 tacaagtcacctccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccttcaccttcacctcctcc 52821305  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 189
Target Start/End: Original strand, 11879661 - 11879749
Alignment:
Q  101 tccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 189  Q
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T  11879661 tccccaccaccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtctcccccaccacc 11879749  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Original strand, 11902377 - 11902429
Alignment:
Q  125 aagtcacctcctccaccttctccttcaccacctcctccatatatctacaagtc 177  Q
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T  11902377 aagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatattactacaagtc 11902429  T

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