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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16722_high_2 (Length: 654)

Name: NF16722_high_2
Description: NF16722
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16722_high_2
NF16722_high_2
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (10-635)||(5800364-5800990)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 561; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 635
Target Start/End: Original strand, 5800364 - 5800990
Alignment:
Q  10 tgagatgaaccattcaagaatattcttccaggaactctatgcaaccccatttccacaccggaatcacgtttatgtgtataggatgaaaatgaaggagatt 109  Q
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T  5800364 tgagatgaaccattcaagaatattcttccaggaactctatgcaaccccatttccacgcccgaatcacgtttatgtgtataggatgaaaatgaaggagatt 5800463  T
Q  110 cataataataatttgtatcagtagaaggagctaaagaagctcctgagatgcacaatcccatcgatcccgacacgacaatgaacacaacaataacacacac 209  Q
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T  5800464 cataataataatttgtatcagtagaaggagctaaagaagctcctgagatgcacaatcccatcgatcccgacacgacaatgaacacaacaataacacacac 5800563  T
Q  210 aactcaattcaaatcaatgacattttttcatatggataatgannnnnnn-aaagattttcatacggataatgataaggtataatattttccagaaatagt 308  Q
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T  5800564 aactcaattcaaatcaatgacattttttcatatggataatgattttttttaaagattttcatacggataatgataaggtataatattttccagaaatagt 5800663  T
Q  309 aacaacaataaccgtctatcaaaaatagcnnnnnnnttcaactgaatatatgatatggatatatttttaatttgataagaagttaagcatatatgattgc 408  Q
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T  5800664 aacaacaataaccgtctatcaaaaatagcaaaaaaattcaactgaatatatgatatggatatatttttaatttgataagaagttaagcatatgtgattgc 5800763  T
Q  409 acaagtggcacttcacatacactacatcacacaccaaacaaagagatagagaaaggaattcgtcaaaaactttcagttgtttttgtttacaaccaatggt 508  Q
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T  5800764 acaagtggcacttcacatacactacatcacacaccaaacaaagagatagagaaaggaattcgtcaaaaactttcagttgtttttgtttacaaccaatggt 5800863  T
Q  509 taattgataggtagatagataatccattccaattcaccctcttatctctcacattcacacctacttacctataattacgccaaatccaattatctttcta 608  Q
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T  5800864 taattgataggtagatagataatccattccaattcaccttcttatctctcacattcacacctacttacctataattacgccaaatccaattatctttcta 5800963  T
Q  609 atatatgataagcattcatgatctatg 635  Q
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T  5800964 atatatgataagcattcatgatctatg 5800990  T

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