View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16732_low_17 (Length: 422)

Name: NF16732_low_17
Description: NF16732
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16732_low_17
NF16732_low_17
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (1-418)||(2064623-2065040)
chr4 (1-404)||(49951097-49951500)
chr4 (1-408)||(28537787-28538192)
chr4 (13-408)||(21321307-21321704)
chr4 (1-407)||(37245852-37246262)
chr4 (1-408)||(29655666-29656072)
chr4 (1-408)||(55734789-55735196)
chr4 (1-406)||(18442147-18442549)
chr4 (1-418)||(32577048-32577463)
chr4 (1-316)||(41835311-41835626)
chr4 (1-418)||(49119400-49119804)
chr4 (1-408)||(56065409-56065820)
chr4 (1-399)||(51734972-51735370)
chr4 (1-418)||(28425965-28426370)
chr4 (1-408)||(51259529-51259937)
chr4 (1-344)||(43840306-43840650)
chr4 (1-157)||(47226330-47226486)
chr4 (1-154)||(26422602-26422755)
chr4 (1-95)||(24989934-24990027)
chr4 (1-155)||(44936082-44936236)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (1-408)||(88339-88746)
chr2 (1-406)||(12130638-12131043)
chr2 (4-408)||(34695907-34696309)
chr2 (4-408)||(34718319-34718721)
chr2 (69-406)||(18345555-18345879)
chr2 (1-341)||(44017318-44017658)
chr2 (1-408)||(26198471-26198869)
chr2 (1-124)||(22845600-22845723)
chr2 (1-178)||(1417981-1418158)
chr2 (1-138)||(13109869-13110006)
chr2 (1-96)||(11292063-11292157)
chr2 (1-142)||(14827126-14827267)
chr2 (104-207)||(9709910-9710013)
chr2 (1-107)||(9710036-9710142)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (1-404)||(16731717-16732120)
chr7 (1-404)||(17709851-17710254)
chr7 (1-418)||(9328602-9329018)
chr7 (1-408)||(1581395-1581803)
chr7 (1-408)||(22289021-22289428)
chr7 (2-295)||(16098383-16098676)
chr7 (1-408)||(29200955-29201356)
chr7 (1-351)||(17877245-17877585)
chr7 (1-344)||(30493610-30493952)
chr7 (83-295)||(30824557-30824768)
chr7 (1-80)||(24139139-24139218)
chr7 (1-98)||(3601742-3601839)
chr7 (1-127)||(3275095-3275221)
chr7 (329-408)||(16098263-16098342)
chr7 (165-251)||(34578442-34578528)
chr7 (313-409)||(11745953-11746049)
chr7 (16-95)||(44480893-44480972)
chr7 (1-59)||(30824494-30824552)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (49-417)||(22767305-22767673)
chr5 (1-408)||(15988749-15989156)
chr5 (1-408)||(20204735-20205142)
chr5 (2-408)||(4267891-4268285)
chr5 (2-318)||(27292304-27292620)
chr5 (1-408)||(8387866-8388273)
chr5 (1-308)||(25730688-25730995)
chr5 (1-328)||(26597457-26597784)
chr5 (1-394)||(41940737-41941130)
chr5 (1-294)||(12660210-12660503)
chr5 (1-408)||(27532906-27533314)
chr5 (25-284)||(11375537-11375796)
chr5 (190-408)||(30222988-30223206)
chr5 (1-255)||(34652254-34652507)
chr5 (83-267)||(37448046-37448230)
chr5 (1-158)||(32632545-32632702)
chr5 (274-417)||(34653865-34654007)
chr5 (46-256)||(42989242-42989452)
chr5 (11-93)||(30222848-30222930)
chr5 (325-408)||(12660124-12660207)
chr5 (249-327)||(16074597-16074675)
chr5 (305-341)||(37447990-37448026)
chr5 (373-406)||(25730623-25730656)
chr5 (372-408)||(27292226-27292262)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (2-408)||(44527045-44527439)
chr1 (1-408)||(4394939-4395345)
chr1 (1-408)||(5609119-5609526)
chr1 (1-408)||(36733473-36733883)
chr1 (1-408)||(51113095-51113502)
chr1 (1-392)||(48949724-48950115)
chr1 (1-408)||(25682431-25682838)
chr1 (1-294)||(16816797-16817092)
chr1 (2-318)||(52109324-52109639)
chr1 (48-272)||(48166153-48166377)
chr1 (165-418)||(24538279-24538533)
chr1 (1-175)||(44602765-44602939)
chr1 (1-105)||(2885306-2885410)
chr1 (1-90)||(21031247-21031336)
chr1 (297-338)||(17507308-17507349)
chr1 (1-86)||(24538589-24538674)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (1-408)||(14679939-14680349)
chr6 (1-408)||(28106919-28107326)
chr6 (1-327)||(15605994-15606320)
chr6 (2-408)||(29368057-29368443)
chr6 (1-256)||(15053175-15053430)
chr6 (5-341)||(11731673-11731989)
chr6 (1-209)||(30801991-30802199)
chr6 (1-155)||(19690879-19691033)
chr6 (241-408)||(30802210-30802377)
chr6 (274-408)||(19364219-19364352)
chr6 (1-86)||(27443033-27443117)
chr6 (1-78)||(34104465-34104542)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (1-404)||(8451123-8451526)
chr8 (1-408)||(478056-478463)
chr8 (2-406)||(23853726-23854118)
chr8 (1-407)||(7127004-7127410)
chr8 (1-408)||(40588730-40589122)
chr8 (1-295)||(13414916-13415210)
chr8 (1-208)||(185591-185797)
chr8 (1-100)||(598237-598336)
chr8 (1-264)||(37712003-37712260)
chr8 (1-117)||(3606739-3606855)
chr8 (1-106)||(33642764-33642869)
chr8 (1-86)||(11870366-11870451)
chr8 (82-173)||(9496797-9496887)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (2-408)||(53496824-53497218)
chr3 (1-407)||(42340277-42340682)
chr3 (1-341)||(55199358-55199698)
chr3 (1-341)||(46007148-46007486)
chr3 (52-295)||(48227306-48227550)
chr3 (1-340)||(2615341-2615670)
chr3 (97-268)||(647307-647478)
chr3 (4-144)||(647166-647306)
chr3 (1-181)||(11020180-11020360)
chr3 (136-256)||(27941129-27941249)
chr3 (1-97)||(27608903-27608999)
chr3 (1-97)||(34497372-34497468)
chr3 (313-408)||(36310808-36310903)
chr3 (1-97)||(24176861-24176957)
chr3 (1-140)||(2121129-2121268)
chr3 (241-351)||(1070850-1070960)
chr3 (1-62)||(19117720-19117781)
chr3 (1-55)||(27747685-27747739)
chr3 (1-100)||(31341725-31341828)
chr3 (189-254)||(36310728-36310793)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (1-351)||(23-377)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (1-86)||(264-349)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-86)||(44244-44328)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2065040 - 2064623
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2065040 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttgggctagagtagatgagtccgactcaaagacaacccgac 2064941  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2064940 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatactgtcatatttgcccgctgtcattttgtttgagcccg 2064841  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2064840 aataaattatccgcgggagtctctaacacaacacgcagaggatgtaatatggttacggtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 2064741  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||  | |||| || |||||| |||||||||||||||| || |    
T  2064740 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattttgtccgtgttgcacaaccgatggtgaaggttgtttacgaacctcttgccattgttgtc 2064641  T
Q  401 atgcatctgatgatgtcc 418  Q
    |||||||| | |||||||    
T  2064640 atgcatctaaagatgtcc 2064623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49951500 - 49951097
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| | || | ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  49951500 ataatactagaaacaatagcagagaattctgaatcaccacggcccgaagatgataaagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggt 49951401  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  49951400 tccatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccg 49951301  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  49951300 aataaattggccgcgagaatctctaacacagcatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 49951201  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||  || ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49951200 ctcggtttctccaaaactgagttgttaccttgcactctattatgcctgtgttgcacaactggtggtgagcgttgtttatgaacctcttgccattgttgcc 49951101  T
Q  401 atgc 404  Q
    ||||    
T  49951100 atgc 49951097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 28537787 - 28538192
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  28537787 ataatactagaaacaatagcatagaattttgaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactaaagtagatgagtcggacttgaacacaacccggt 28537886  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  28537887 cccatctgttcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccct-caa-actatcatattttcccgctgccatttcgtttgagcccg 28537984  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28537985 aataaattgcccgtgggagtctctaacacaacacgcaaaatatgtaatatggttacgatcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacgtctcg 28538084  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||   |||| | || ||||  | ||||||||||||||||||||||| || |    
T  28538085 ttcggtttctcccaaactgaattgttaccttgcactctactgtgcccgtgttgtacaatcggtggtgagtggtgtttatgaacctcttgccattgttgac 28538184  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  28538185 atgcatct 28538192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21321704 - 21321307
Alignment:
Q  13 acaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagc--ttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttccatctgtt 110  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21321704 acaataacatagaattctgaatcaccatgaccctgagacaatagagcaattgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgtt 21321605  T
Q  111 ctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgt 210  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||      
T  21321604 agcatcagaaaagtgaagggcctcgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaatttc 21321505  T
Q  211 ccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttct 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  21321504 ccgcgagagtctctaatacaacatgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcaacatccacattgcacttcaaccacgtttcgctcgatttct 21321405  T
Q  311 cccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatct 408  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||   |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21321404 cccaaactgtgttgttgccttgcactctattatgctcgtgttgtacaaccggtagtgagggatgtttatgaacatcttgccattgctgccaagcatct 21321307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 37245852 - 37246262
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37245852 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccagagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgaagacaacccggt 37245951  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||    
T  37245952 cccatctgttcacataagcaaagtgaatagcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgtgcccg 37246051  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  37246052 aataaatttccctcgggagtctctaacacaacatgcagaggatgtaagacgattacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 37246151  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttac----cttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgc 396  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||    ||||||| |||||  || | |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37246152 ctcggtttctcccaaactaagttgttacgtaccttgcaccctattccggtcatgttgcacaaccggtagtgagggatgtttatgaacctcatgccattgc 37246251  T
Q  397 tgccatgcatc 407  Q
    |||||||||||    
T  37246252 tgccatgcatc 37246262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 29655666 - 29656072
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||   |||| ||||| |||||||| ||||    
T  29655666 ataatactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatggcccgaagatgatagagcttgcactagagtagcgtagtcagactcgaagacaacacggt 29655765  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29655766 tccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctactgcctctccctccaaaacagtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccg 29655865  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||     
T  29655866 aataaattgcccacgggagcctctaacacaaca-acaaaagatgtaagagggttacgatcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctca 29655964  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||  |||| || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29655965 ctcggtttcttccaaactgagatattaccttgcattctattatgcccatgttgcacacccggtggtgatgaatgtttatgaacctctttccattgctgcc 29656064  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  29656065 atgcatct 29656072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 55735196 - 55734789
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | ||||||||    
T  55735196 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggtccgaagacgatagagcttgcactagagtagatgaatcggactcgaaaataacccggt 55735097  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  55735096 tccatgtgttcgcaacaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgctcgcttccatttcgtttgagcccg 55734997  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    || ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||| || | | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  55734996 aacaaattgctcatgggagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttgagatcatggagcgcgacatccacattgcacttcaaccacatctcg 55734897  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |  |||||||  |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  55734896 ctcggtttctcccaaaccgagttgttaccttgcactctattttgtctgtattgcacaaccgatgatgatggttgtttatgaacatcttgccattgttgcc 55734797  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    || |||||    
T  55734796 atacatct 55734789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 18442147 - 18442549
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |   |||||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||| || | ||||||||    
T  18442147 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgggccaaagacgatatagcttgcactag--tagatgagtcgcactcgaaaataacccggt 18442244  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||| |||||||||||    
T  18442245 tccatctgttcgcaacagcaaagtgtagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatattttcccgcttccatttcgtttgagcccg 18442344  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18442345 aataaattgcccatgggagtctctaacacaacacgcaaaagttgtaatatggttgcggtcatggaacgcgacatccgcattgcacttcaaccacgtctcg 18442444  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |  ||||||| ||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18442445 ctcggtttctcccaaacagagttgttaccttgcactctattttgtctgtattgcacaaccggtgatga-ggttgtttatgaacatcttgccattgttgcc 18442543  T
Q  401 atgcat 406  Q
    ||||||    
T  18442544 atgcat 18442549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 32577048 - 32577463
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  32577048 ataatactataaacaatcgcatagaattctgaatcaccatgtcccgctgacgattgagcttgcactagagtagcagagtcagactcgaagacaacccagt 32577147  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||| ||||  |||||||||||| ||  ||  |||||||||||| | ||||||||| ||| |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  32577148 cccatatgtttacatcagcaaagtaaatagcagcgagtaaggctagtacctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccg 32577247  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||| | |||     
T  32577248 aataaattgccc-cgggaatctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttaaggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctc- 32577345  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32577346 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactatattctggccgtgttgcacaaacggtagtgacggatgtttatgaacctcttgccattgccgcc 32577445  T
Q  401 atgcatctgatgatgtcc 418  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  32577446 atgcatctaatgttgtcc 32577463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 41835311 - 41835626
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  41835311 ataatactagaaacaatagcataggattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgtttgcactagagtagatgaatcgaactcgaagacaacccggt 41835410  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||  |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  41835411 cccatctgtttgcatccgcaaaatgaagggtctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaactgtcatatttgccagctgtcattttgtttgagcccg 41835510  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41835511 aataaattgtctgcgagagtctctaacacaacacgcaaaagttgtaatatggttacgttcaaggaacgtggcatccacattgcacttcaaccacgtctcg 41835610  T
Q  301 ctcagtttctcccaaa 316  Q
    |||  |||||||||||    
T  41835611 ctcgatttctcccaaa 41835626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 49119400 - 49119804
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||| || |  |||||||||||| | |||||||||   ||||| ||||  |||||||||||||    
T  49119400 ataatactagaaacaatcgcatataattctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggt 49119499  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  49119500 cccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccg 49119599  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||             ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||    
T  49119600 aa-------------ggaatctctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcg 49119686  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49119687 cttggtttatcccaaactgggttgttaccttacactctattctggccgtgtggcacaaccaatagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 49119786  T
Q  401 atgcatctgatgatgtcc 418  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  49119787 atgcatctaatgctgtcc 49119804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 56065820 - 56065409
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaat----caccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacc 96  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||    |||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  56065820 ataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatcaccatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacc 56065721  T
Q  97 cggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgag 196  Q
    |||| |||| | ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||    
T  56065720 cggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgag 56065621  T
Q  197 cccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacga 296  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | || |||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||     
T  56065620 cccgaatgaattgcccacgggagtctctaaaacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacgacatccacattgcacttcaaccacgt 56065521  T
Q  297 ctcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgc 396  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| |  |   || || |||||||||||||| |||||||||    
T  56065520 ctcacacagtttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgacgagggttgtttatgaacctcctgccattgc 56065421  T
Q  397 tgccatgcatct 408  Q
    ||||||||||||    
T  56065420 tgccatgcatct 56065409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 51734972 - 51735370
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || |    
T  51734972 ataatactagaaacaatatcatagaattatgaatcaccatggtccagagacgatagagcttgcactagagtagaggagcctgactcgaagacaactcg-t 51735070  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     | |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||    
T  51735071 cctatctattcacatcagcaaagtgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcacgctgtcatttcgtttaagcccg 51735170  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51735171 aataaattgtcaacggaagtctctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacaatcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctcg 51735270  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaa-ccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgc 399  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |  |||  ||||| | |   | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51735271 ctcggtttcgcccaaactgagatgttacattgcaccctattctgcctatgttgcacaatcgatgggggagggatgtttatgaacctcttgccattgctgc 51735370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28426370 - 28425965
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||| || |  |||||||||||| | |||||||||   ||||| ||||  |||||||||||||    
T  28426370 ataatactagaaacaatcgcatataattctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggt 28426271  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  28426270 cccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccg 28426171  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||             ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||    
T  28426170 aa-------------ggaatctctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcg 28426084  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgag-ttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgc 399  Q
    ||  |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28426083 cttggtttatcccaaactggggttgttaccttacactctattctggccgtgtggcacaaccaatagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgc 28425984  T
Q  400 catgcatctgatgatgtcc 418  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  28425983 catgcatctaatgctgtcc 28425965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 51259529 - 51259937
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||    
T  51259529 ataatactagaaacaataacataaaattctgaatcaccatggcccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacctggt 51259628  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttc-aatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagccc 199  Q
     | | ||| || || |||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| || || | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  51259629 ccgaactgatcccaacagcaaagtgaatgacatcgagtaaggcaactgcctcccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagccc 51259728  T
Q  200 gaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactc 299  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||||  | || ||||||||||| | || |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  51259729 gaatgaattgcccacgagagtctctaacacaacatacgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcagttcaaccacgtctc 51259828  T
Q  300 gctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgc 399  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  | ||| |  |  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51259829 acgcggtttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcgcaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgccattgctgc 51259928  T
Q  400 catgcatct 408  Q
    |||||||||    
T  51259929 catgcatct 51259937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 43840306 - 43840650
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||    
T  43840306 ataatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggtccgaagacgatagagcttgcattagagtagctgagtcgaactcgaagacaaaccggt 43840405  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaa-ggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagccc 199  Q
      ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |  || |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||    
T  43840406 ctcatttgttcacatcagcaaagtgaatggcatcgagtaaaggttgttgtctccccctccaacactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgacccc 43840505  T
Q  200 gaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactc 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||   |||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  43840506 gaataaattgtccacgggagtctctaacacaaaacgcaaaagatgtaagatggttatgctcatagaacgcggcatccacgttgaacttcaaccacgtctc 43840605  T
Q  300 gctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatg 344  Q
    |  | || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  43840606 gtgcggtctctcccaaactaagttgttgtcttgcactctattatg 43840650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 47226330 - 47226486
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || |    
T  47226330 ataatactagaaacaatagcatataaatctgaatcaccatggcctgaagacgatagagcttgctctaaagtagatgagtcggactcgaacacaactcgat 47226429  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctccccct 157  Q
      ||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||| | |||||||||    
T  47226430 ctcatctgttcgcatcagcaaagtgaaaagcctcgagtaagactattacctccccct 47226486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 26422602 - 26422755
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| || |  |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  26422602 ataatactaaaaacaatcgcatagaattctgaatcactatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactcgaagacaacccgat 26422701  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctccc 154  Q
     |||||||||  |||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  26422702 cccatctgtttacatcagcaaagtaaatagcatcgagtaaggctactgcctccc 26422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 24989934 - 24990027
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaac 95  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24989934 ataatactagaaaca-taacatagaattttgaatcaccgtggcccagagacggtagagcttgcactagagtagctgagtcagactcaaagacaac 24990027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 44936082 - 44936236
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||| || || | | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  |    
T  44936082 ataataatagaaacaataacatagaattctaaatcaccgtggcccgaaaacgatagagtttgcactagagtaaatgagtcggactcgaacacaacccaat 44936181  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccc 155  Q
    | ||||||||  ||| |||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||    
T  44936182 ttcatctgtttgcattagcaaagtaaaggatctcgagtaaggctattgcctcccc 44936236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 88746 - 88339
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  88746 ataatactggaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgatcttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggt 88647  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  88646 cccatctgttagcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccattgccatttcatttgagcccg 88547  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||    
T  88546 aataaattgcccgcgagagtctctaacacaacatgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 88447  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||   |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  88446 ctcggtttctcccaaactgtgttgttgccttgcactctattatgctcgtgttgtacaaccggtagtgagggatgtttatgaacatcttgccattgttgtc 88347  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  88346 atgcatct 88339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 12130638 - 12131043
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  12130638 ataatactagaaataatagcatagaattctgaatcaccatgtcccgaagatgatagagcttggactagagtagatgagtcagactcgaagataacccgat 12130737  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  12130738 tccatctatttgcatcagcaaagtgaagagcctcaagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttgctcgctgtcatttcgtttgagcccg 12130837  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12130838 aataatttgcccgcgggagtctctaacacaacacccaaaagatagaatatggttacggtcatggaacggggcatccacattgcacttcaaccacgtctcg 12130937  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12130938 ctcgatttctcccaaattgagttgttaccttgcactctgtttgtcccgtgttgcacaaccggtggtgatggttgtttatgaacctcttgccattgttgcc 12131037  T
Q  401 atgcat 406  Q
    ||||||    
T  12131038 atgcat 12131043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 408
Target Start/End: Original strand, 34695907 - 34696309
Alignment:
Q  4 atactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttcc 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  34695907 atactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttccc 34696006  T
Q  104 atctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaat 203  Q
    |||| ||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||    
T  34696007 atctattgacatcagcaaagtgaatggccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccatc--gattgagcccgaat 34696104  T
Q  204 aaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctc 303  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  34696105 aaattgcccacgggagtctctaacgcaacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgc 34696204  T
Q  304 agtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||   |||   || | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34696205 agtttctcccaaactgagttgttaccttgcattctattatgttcgtgatgcaccggcaatggtgatggttgtgtatgaacctcttgccattgttgccatg 34696304  T
Q  404 catct 408  Q
    |||||    
T  34696305 catct 34696309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 408
Target Start/End: Original strand, 34718319 - 34718721
Alignment:
Q  4 atactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttcc 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  34718319 atactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttccc 34718418  T
Q  104 atctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaat 203  Q
    |||| ||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||    
T  34718419 atctattgacatcagcaaagtgaatggccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccatc--gattgagcccgaat 34718516  T
Q  204 aaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctc 303  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  34718517 aaattgcccacgggagtctctaacgcaacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgc 34718616  T
Q  304 agtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||   |||   || | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34718617 agtttctcccaaactgagttgttaccttgcattctattatgttcgtgatgcaccggcaatggtgatggttgtgtatgaacctcttgccattgttgccatg 34718716  T
Q  404 catct 408  Q
    |||||    
T  34718717 catct 34718721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 406
Target Start/End: Original strand, 18345555 - 18345879
Alignment:
Q  69 agtagatgagtccgactcaaagacaacccggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtc 168  Q
    |||||||||||| || || |||||||  || | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  18345555 agtagatgagtcggattcgaagacaattcgatcccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccct-caaaactgtc 18345653  T
Q  169 atatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacg 268  Q
    ||||||| ||  | |||||| |||||||  | ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  18345654 atatttgtccgttaccatttcgtttgagttcaaataaattacccacggaagtctctaacacaacacgcaaaagaagtaatatggttacgctcatggaacg 18345753  T
Q  269 tggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtga 368  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| |||||            ||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||||    
T  18345754 ttgcgtccacattgcacttcaaccatgtctcgttcggtttcttccaaa------------cttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccggtggtga 18345841  T
Q  369 tggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcat 406  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18345842 atgatgtttatgaacctcttgccattactgccatgcat 18345879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 44017318 - 44017658
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||    ||||||||||||||||| |||| ||||   ||||| ||||| ||||||||  |||    
T  44017318 ataatacaagaaacaatggcatataattcttaatgaccatgtttcggagacgatagagcttgcactaaagtaacggagtcagactcgaagacaacttggt 44017417  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
      ||| ||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |  || |||||||| ||| | |||||||||||| |  || |||||| ||||||||||    
T  44017418 ctcatatgttcacattagcaacgtgaatggcatcgagtaaggttgttgtctccccctccaaaactgtcatatttgcacggtgtcattttatttgagcccg 44017517  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |   |||  ||||| ||  | | |||||||||||||||| | ||||    
T  44017518 aataaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaagatggtcatgatcacagaacgcggaattcgcattgcacttcaaccatgtctcg 44017617  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctatt 341  Q
    ||| | |||| | ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  44017618 ctcggcttcttcaaaacttagctgttaccttgcactttatt 44017658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26198869 - 26198471
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||     
T  26198869 ataatactagaaacaatagcatagaatttcaattcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagac--cccgg- 26198773  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
           |||| ||| |||||||| || ||| || || ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||  | || ||||||| ||||||| ||    
T  26198772 -------gttcacattagcaaagtaaatggcatcaag-aaggctactgcatccccctccaaaactgtcatatttgttcgctaccattttatttgagctcg 26198681  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagt------catggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccac 294  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| |||  ||       |||||||| | | |||||| | ||||||||||||    
T  26198680 aataaattgcccacatgagtctctaacacagcacacaaaagatgcaatatgattatggtaatgaaaatggaacgcgacatccacaatacacttcaaccac 26198581  T
Q  295 gactcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccatt 394  Q
    | ||||  || |||||||| |||| || |||||| ||||| |||||| ||  |||||  |||| ||||| |||| |||   |||||||||||||| ||||    
T  26198580 gtctcgtgcaatttctcccgaactaagctgttactttgcattctattctgttcgtgttgcacacccagtggtga-gga---ttatgaacctcttgtcatt 26198485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22845723 - 22845600
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  22845723 ataatactagaaacaatagcctagaattctgaatcaccatgatctggagacgatagagcttgcactagagtagattagttggactcgaagacaacccggt 22845624  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagt 124  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  22845623 cccatctgttcgcatcagcaaagt 22845600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 1417981 - 1418158
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||   |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  1417981 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatagtccagagacaatagagcttgaactagagtagatgagtcagactcgaagacaacccagt 1418080  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgccc 178  Q
     |||||||||  ||||||||||   ||   | |||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||||||||    
T  1418081 cccatctgtttgcatcagcaaatcaaattacctcgagtaaggctactgtctctcccttcataaccgtcatatttgccc 1418158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 13109869 - 13110006
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||    
T  13109869 ataatactggaaacaatagcttataattccaaatcaccatggcccgaagacgatagagcttccactagagtagaagagtcggactcgaagacaaccatgt 13109968  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagt 138  Q
     ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13109969 cccatctgatcgcatcagctaagtgaagggcctcgagt 13110006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 11292063 - 11292157
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacc 96  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11292063 ataatactataaacaataacataaaattttgaatcatcatggcc-gaaaacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaacc 11292157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14827267 - 14827126
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||| || |    
T  14827267 ataatattataaataatagcatagaatttcgaatcaccatgacccaaacacgatagagcttgcactagagtagctaagtcagattcaaagacaactcgat 14827168  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaagg 142  Q
      ||||| |||  ||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  14827167 ctcatctattcatatcagtaaagtgaatgacatcgagtaagg 14827126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9710013 - 9709910
Alignment:
Q  104 atctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaat 203  Q
    |||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||  |  |||||||| ||||||||| ||||    
T  9710013 atctgttcccaaccgcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctgaat 9709914  T
Q  204 aaat 207  Q
    ||||    
T  9709913 aaat 9709910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 9710142 - 9710036
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||| || |  |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| |||||||||||||    
T  9710142 ataatactagaaacaattgcatagaattatgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcaaagtcagactcgaagacaacccggt 9710043  T
Q  101 tccatct 107  Q
     ||||||    
T  9710042 cccatct 9710036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16732120 - 16731717
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16732120 ataatactagaaacaatagcagagaattctgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggt 16732021  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16732020 tccatctgttcgcatcagcagagtgaatggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccg 16731921  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  16731920 aataaattgcccgcgggaatctctaacacaacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 16731821  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||  || ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16731820 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgcatgtgttgcacaactggtggtgagtgttgtttatgaacctcttgccattgttgcc 16731721  T
Q  401 atgc 404  Q
    ||||    
T  16731720 atgc 16731717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17710254 - 17709851
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  17710254 ataatactagaaacaatagcagagaattctgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggt 17710155  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17710154 tccatctgttcgcatcagcagagtgaatggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccg 17710055  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  17710054 aataaattgcccgcgggaatctctaacacaacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 17709955  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||  || ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17709954 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgcatgtgttgcacaactggtggtgagtgttgtttatgaacctcttgccattgttgcc 17709855  T
Q  401 atgc 404  Q
    ||||    
T  17709854 atgc 17709851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 9328602 - 9329018
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||  |||| |||||| || |  |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9328602 ataatactagaaacaaacgcatagaattctgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactccaagacaacccggt 9328701  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||    
T  9328702 cccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatattttcccgttgccatttcgtttgagctcg 9328801  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  9328802 aataaattgtcc-cgggaatctctaacacaacacgcaaatgatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctcg 9328900  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9328901 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattctagccgtgtggcacaaccagtagtgatggatgtttatgaacatcttgccattgctgcc 9329000  T
Q  401 atgcatctgatgatgtcc 418  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  9329001 atgcatctaatgttgtcc 9329018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1581803 - 1581395
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||| || | |||||| |    
T  1581803 ataatattataaacaatggcatagaatttcgaatcaccatggtccggagacgatagagtttgcattagtgtagatgagttggactccaatagaacccgat 1581704  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatat-tgtcatatttgcccactgccattttgtttgagccc 199  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |  | | |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1581703 ctcatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcatcccccctcaaaaactataatatttgccctctgccatttcgtttgagccc 1581604  T
Q  200 gaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactc 299  Q
    | ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||||  |||    
T  1581603 ggataaactatccgctggagtctctagcacaacacgcaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacatctc 1581504  T
Q  300 gctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||  |||||   ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1581503 gctcagtttctcccaaactgagttgttacgttgcactatactttgttcgtgttgtacaaccgatggtgagggatgtttatgaacctcttgccattgttgc 1581404  T
Q  400 catgcatct 408  Q
    || ||||||    
T  1581403 caagcatct 1581395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22289428 - 22289021
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  22289428 ataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacagcccggt 22289329  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||| ||||| || | |||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||||||| |  |||||||| || |||| |||    
T  22289328 cccatttgttcccaacggcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaaccacctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtctgagtccg 22289229  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | || |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||     
T  22289228 aatgaattgcccacgggaatctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcacttaaaccacgtctca 22289129  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||  |  ||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  22289128 cgcggcttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccgatgatgagggttgtttatgaacctcctgtcattgctgcc 22289029  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  22289028 atgcatct 22289021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16098676 - 16098383
Alignment:
Q  2 taatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggtt 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  16098676 taatactagaaacaatatcatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatggagcttgtactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtc 16098577  T
Q  102 ccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccga 201  Q
    |||| ||||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||  |  | |||||| ||||||||||||    
T  16098576 ccatttgttagcatcagcaaattgaagggcctctagtaaggctactacctctccctccaaaattgtcatatttgttcgtttccatttcgtttgagcccga 16098477  T
Q  202 ataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacg 295  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16098476 ataaattgcctatgggagtctctaacacaacacgcaaaagaagtaatatggttacggtcatggaacgatgcgtccacattgcacttcaaccacg 16098383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 29200955 - 29201356
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |    
T  29200955 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgaagacaacccgtt 29201054  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | | || |||||   | || ||||||||| ||| | ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  29201055 tccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcaagtaaacatgctacctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgtcatttcgtttgagcccg 29201154  T
Q  201 aataaattgtc--cgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgact 298  Q
    |||||| || |  | |  |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||        |||||| | ||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  29201155 aataaactggccacacatgagtctctaatacaacatgcaaaagatataatatgg--------atggaaagcggcatcaacattgcacttcaaccacgtct 29201246  T
Q  299 cgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctg 398  Q
    ||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||  |||||||  | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29201247 cgtgcggtttctcccaaactgagctattaccttgcactgtattttgtccgtgttgcacaaccgatggtgagggctgtttatgaacctcttgtcattgctg 29201346  T
Q  399 ccatgcatct 408  Q
     |||||||||    
T  29201347 tcatgcatct 29201356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17877585 - 17877245
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||||||| ||          ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  17877585 ataatactagaaacaatagcatagaattacgaatcaccatgacccataaacgatagagcttgcac----------gagtcagactcgaagacaacccgat 17877496  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||| |||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||    
T  17877495 tccatctgttcgcatttgtaaagtgaagggccttgagtaaggctacttcctccccctccaatactgtcatatttccccgctgcgatttcgtttgagcacg 17877396  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||| || |  ||  |||||||| |||| | ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17877395 aatgaacttcccatgggagtctataacgccacacgcaacaaatgtaatatggttacaatcatggaacgcgacatccacattgcatttcaaccacgtctcg 17877296  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgt 351  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17877295 ctcggtttctcccaaattgagttgttaccttgcactcgattatgcccgtgt 17877245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 30493610 - 30493952
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||    
T  30493610 ataatactataaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcccgaagacgatagagcttgcactagagtaattgagtcggactcgaagacaacctggt 30493709  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
      |||||||||  |||||| ||||||| | | || |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||| |    
T  30493710 ctcatctgttcatatcagctaagtgaacgacatcaagtaaggctactgcct-cccctccaaaactgtcatacttgtctgctgccatttcgtttgagcctg 30493808  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    | ||||||| ||  | || | ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| | | | |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  30493809 agtaaattgcccatgagaatttctaacacaacacgcaaaatatgtaagttggttacagtcatggaatgcgacatccatattgcactttaaccacgtttcg 30493908  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatg 344  Q
     ||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  30493909 ttcgatttcttccaaactgtgttgttatcttgcactttattatg 30493952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 295
Target Start/End: Original strand, 30824557 - 30824768
Alignment:
Q  83 actcaaagacaacccggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactg 182  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||  || |||    
T  30824557 actcgaagacaacctgatcccatctgttcgcattagaaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcct--cccttcaaaactgtcatatttatccgctg 30824654  T
Q  183 -ccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacatt 281  Q
     |  |||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || || || ||||||||    
T  30824655 tctttttttttttagcccgaataaattattcgcggcagtctctaacacaacatgcaaaagatgtaatatgactacagtcatgaaatgtagcatccacatt 30824754  T
Q  282 gcacttcaaccacg 295  Q
    ||||||||| ||||    
T  30824755 gcacttcaatcacg 30824768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24139218 - 24139139
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtc 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24139218 ataatactagaaacaatagcataaaatttcaaatcaacatgacccggagacgacagagcttgcactagagtagctgagtc 24139139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3601839 - 3601742
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  3601839 ataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggtccagagacgataaagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaaacaacccg 3601742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3275221 - 3275095
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| | || ||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||    
T  3275221 ataatactaaaaacaatagcataaaattatgaatcatcgtggcctagagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccagt 3275122  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaa 127  Q
     | || ||||| || ||||||||||||    
T  3275121 cctatatgttcccaacagcaaagtgaa 3275095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16098342 - 16098263
Alignment:
Q  329 cttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatct 408  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16098342 cttgcactctattatgcccgtgttgcacaaccggtggtgaatgatgtttaggaacctcttgccattgatgccatgcatct 16098263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 34578442 - 34578528
Alignment:
Q  165 tgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatg 251  Q
    |||||||||||| |  || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34578442 tgtcatatttgctcgttgtcatttcgtctgagcccgaataaattgcccacgggaatttcgaacacaacacgcaaaagatgtaatatg 34578528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 409
Target Start/End: Original strand, 11745953 - 11746049
Alignment:
Q  313 caaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatctg 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||  ||||||| || |||| || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||    
T  11745953 caaactgagttgttactttgcactctattctgtctgtgttgcacaaccggtggtgagggttgtttatgcacctgttgccattattgtcatgcatctg 11746049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 44480972 - 44480893
Alignment:
Q  16 atagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaac 95  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  | ||| | ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  44480972 atagcataaaattccgaatcaccatgacccggagacgataacgtttgcagtagagtagcggagtcggactcgaagacaac 44480893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 30824494 - 30824552
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagc 59  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30824494 ataagactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatgacccagagacgatagagc 30824552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 49 - 417
Target Start/End: Original strand, 22767305 - 22767673
Alignment:
Q  49 gacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactg 148  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||||  |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  22767305 gacgatagagcttgcactagagtatcagagtcaaactcgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcgagtaaggctactg 22767404  T
Q  149 cctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaat 248  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  22767405 cctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccccgggaatctctaacacaacacgcaaaagatgtaag 22767504  T
Q  249 atggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccg 348  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22767505 atgattactgtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattttggccg 22767604  T
Q  349 tgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatctgatgatgtc 417  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22767605 tgtggcacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatctaatgttgtc 22767673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 15988749 - 15989156
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||  |||||||||||||    
T  15988749 ataatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggcctgaagacgatagagattgcactagagtagctgagacggacttgaagacaacccggt 15988848  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  15988849 cccatatgttcgcatcagcaaagtaaagggcctcgagtaaggttactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccg 15988948  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    |||||||||  ||||  ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | | |||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  15988949 aataaattgctcgcgaaagtctctgacataacacgcaaaagttgtaatatggttgcggtcatggaacgcgacatccatatttcacttcaacaacgtctcg 15989048  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15989049 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgctcgtgttgcacaaccgctagtgaaggttgtttatgaacctcttgccattgttgcc 15989148  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  15989149 atgcatct 15989156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20205142 - 20204735
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  20205142 ataatactagaaacaatagcatagaattttgaatcaccatgacccggagaggatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcggt 20205043  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |    
T  20205042 tccatctgttcgcaacaacaaagtgaatggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcctg 20204943  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
     |||||||  ||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||     
T  20204942 gataaatttcccgcgggagtctctagcacaaaatgtaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctca 20204843  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
     |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||   ||||  ||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20204842 tttggtttctcccaaactgagttattaccttacactctattttgcttgtgttgcacaaccaagggtgagggttgtttatgaacctcttgccattgttgcc 20204743  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  20204742 atgcatct 20204735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4268285 - 4267891
Alignment:
Q  2 taatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggtt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  4268285 taatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagaaaacccggtc 4268186  T
Q  102 ccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccga 201  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4268185 ccacctgttagcatcagcaaagtgaagggcctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcctga 4268086  T
Q  202 ataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgc 301  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  4268085 ataaattgcccacgagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacaatcaagaaacgcggcgtccacgttgcactttaaccatgactcgt 4267986  T
Q  302 tcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcca 401  Q
    || ||||||||||||            ||||||||||||| || ||||||  |||||||  | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4267985 tcggtttctcccaaa------------cttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccgatggtgaacgatttttatgaacctcttgccattgctgcca 4267898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27292620 - 27292304
Alignment:
Q  2 taatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggtt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||     
T  27292620 taatactagaaacaatagcataaaattccaaatcaccatggcctggagacgatagagtttgcactagagcagatgagtcgaactcgaagacaacccggtc 27292521  T
Q  102 ccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |   | ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27292520 ccatctgttatcatcagcaaagtgaagggcatctagtaaggctattgcctcccccttcaaaacaataatatttgtccgctgccattttgtttgagcccga 27292421  T
Q  202 ataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgc 301  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||     
T  27292420 ataaattgcccacgagagtctctaacacaacatgcaaaatatgtaatatggttactatcatggaacgtgacatccacattgcacttcaaccatgactcgt 27292321  T
Q  302 tcagtttctcccaaact 318  Q
    || ||||||||||||||    
T  27292320 tcggtttctcccaaact 27292304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8388273 - 8387866
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  8388273 ataatactggaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggt 8388174  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||  |  |||||||| ||||||||| |    
T  8388173 cccatctgttcccaaccgcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctg 8388074  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || |||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||     
T  8388073 aatgaattgcccacgagagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatattttaacggtcatgaaacgcggcatccacattgtacttcaaccacgtctca 8387974  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| |  |  ||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  8387973 cgcggtttctcccagactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgtcattgctgcc 8387874  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  8387873 atgcatct 8387866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25730995 - 25730688
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||    
T  25730995 ataatactagaaacaataacatagaattcttaatcaccatgaccctgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcagt 25730896  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  25730895 cccatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagctcg 25730796  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  ||   |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25730795 aataaatttcccgcgtgagactctaacacaacacgtgaaaattgtaatatggttacggtcatggaacgcggaatccacattgcacttcaaccacgtctcg 25730696  T
Q  301 ctcagttt 308  Q
    ||| ||||    
T  25730695 ctcggttt 25730688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 26597457 - 26597784
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26597457 ataatactagaaacaataacataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggt 26597556  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
      ||||| ||| || | |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  26597557 ctcatctattcccaactgcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaattgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 26597656  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |   ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  26597657 aatgaattgtccacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgatgatcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctta 26597756  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttac 328  Q
    | |  |||||||||||||| ||||||||    
T  26597757 cacgatttctcccaaactgtgttgttac 26597784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 41940737 - 41941130
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||  |  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  41940737 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcacaatggtccagagacgatagagtttgcactagagtagttgagtcggactcgaagacaacccggt 41940836  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccac-tgccattttgtttgagccc 199  Q
     |||  ||||| ||| ||||||||||| | | | ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||  | |  || ||||| |||||||| |    
T  41940837 -ccagttgttcacatgagcaaagtgaatgacattgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttttctatatgtcatttcgtttgagctc 41940935  T
Q  200 gaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactc 299  Q
    |||||||||  || ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  41940936 gaataaatttcccacgggagtctttaacactacacacaaaagatgtaagatagttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccacatctc 41941035  T
Q  300 gctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccatt 394  Q
    |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || | || || ||||||||||||||||||||||    
T  41941036 gctcggtttctcccaaattgggttgataccttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccggtggcgagggttgtttatgaacctcttgccatt 41941130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12660503 - 12660210
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | || ||| ||||    
T  12660503 ataatactagaaacaatatcatagaattctgaatcaccgtggcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgacgataacacggt 12660404  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
      ||| ||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12660403 ctcatttgttcacattagcaaagtgaatgacatcgagtaagactactgcctcccgctctaacactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccg 12660304  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccac 294  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12660303 aataaattgtccatgaaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttacgttcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccac 12660210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 27532906 - 27533314
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||  || |||| || ||   |||| ||||| || ||||||||||    
T  27532906 ataatacttgaaacaatagcaaagaattctgaatcaccatgacccggagacgataaagtctgcactaaagaagcaaagtcggactcgaaaacaacccggt 27533005  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||| | | |||| ||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||| ||  || |||||| |||||||||||    
T  27533006 cccatctattcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaagctattgcctccccctccaaaactgttatattttcctgctaccatttcgtttgagcccg 27533105  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgc-aaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactc 299  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||||||| | | |||||||| |||||||  | || |||    
T  27533106 aataaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcaaaaagatgtaaactggttacgatcatggaacgcgacatccacattacacttcagtcgcgtctc 27533205  T
Q  300 gctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgc 399  Q
    || |  ||||||||||||| |  | |||||||||||| |||| || | ||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27533206 gcgcgatttctcccaaactaaactattaccttgcactatattctgtctgtgttgcacaaccggtggtgagggatgtttatgaacctcttgtcattgttgc 27533305  T
Q  400 catgcatct 408  Q
    |||||||||    
T  27533306 catgcatct 27533314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Original strand, 11375537 - 11375796
Alignment:
Q  25 aatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttccatctgttctcatcagcaaagt 124  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||  |||| ||||| |    
T  11375537 aattccgaatcaccatggaccggagacgatagagcttgcactagaatagatgaatcagactcaaagacaacccggtcccatatatttgcatccgcaaaat 11375636  T
Q  125 gaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctct 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||   | ||| ||||||||    
T  11375637 gaagggcctcgagtaaggctactgtctccccctccaaaactgtcatatttactcgctgccatttcgtttgagtccgaataaatcacctgcgagagtctct 11375736  T
Q  225 aacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgca 284  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||    
T  11375737 aacacaacatgcaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacgcagcatccacattgca 11375796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 408
Target Start/End: Original strand, 30222988 - 30223206
Alignment:
Q  190 gtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttca 289  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||      
T  30222988 gtttgagcccgaataaattgcccatggaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacagtcatggaacgcgacgtccatgttgcactttg 30223087  T
Q  290 accacgactcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttg 389  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||   | |||| || |||||||||||||||||    
T  30223088 accacgtctcgcacggtttctcccaaacagagttgttaccttgcactctattctgcccgtgttgcacaactgttggtgagggctgtttatgaacctcttg 30223187  T
Q  390 ccattgctgccatgcatct 408  Q
     ||||| || |||||||||    
T  30223188 tcattgttgtcatgcatct 30223206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 34652254 - 34652507
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| |    
T  34652254 ataatactagaaacaataacatataattctgaatcaccatggcccagagacggtagagcttgcactagagtagtcgagtcgggctcgaagacaacccgat 34652353  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| || |  |||||| | ||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  34652354 cccatctgttcacatcggcaaagtgaatggcatcgagtaaggttattatctccccttacaacactgtcatatttgctcgctgcc-ttttgtttgagaccg 34652452  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggtta 255  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  34652453 gataaattgcccacgggagtctctaacacaacacacaaaagatgtaagatggtta 34652507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37448230 - 37448046
Alignment:
Q  83 actcaaagacaacccggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactg 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||    
T  37448230 actcgaagacaacccggttccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctaccgcctcccctttcaacactgtcatgtttgcacgctg 37448131  T
Q  183 ccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaac 267  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  37448130 ccattttgtttgagtccgaatacattgtccacgagagtctctaacacaacatataaacgatgtaagatggttatggtcatggaac 37448046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32632702 - 32632545
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| |  |||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32632702 ataatattagaaacaatgtcatagaattctgaatcactatggctcggagacgataaagcttacactaaagtagatgagtcagactcaaagacaacccggt 32632603  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctccccctt 158  Q
    |  |||| |||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||| || || |||||||||    
T  32632602 ttaatctattcgtatcagtaaaatgaaaggcctcgagtaaggttattgtctccccctt 32632545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 417
Target Start/End: Original strand, 34653865 - 34654007
Alignment:
Q  274 tccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggat 373  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||  |||||  ||||||  ||  ||| || |    
T  34653865 tccacattgcacttcaaccacgtctcgtgcggtttctcccaaacttagttgttgcc-tgcactctattctgcacgtgttgcacaactggtgttgagggtt 34653963  T
Q  374 gtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatctgatgatgtc 417  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  34653964 gtttatgaatcttttgccattgttgccatgcatctagtgatgtc 34654007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 256
Target Start/End: Original strand, 42989242 - 42989452
Alignment:
Q  46 ggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggcta 145  Q
    |||||||||| || ||| | |||||||| |||| | ||| | |||| ||| || || ||||||||| ||||| || |||||| | | ||||||||   |     
T  42989242 ggagacgataaagtttgcattagagtagttgagacggacacgaagataactcgattgcatctgttcacatcatcatagtgaatgacatcgagtaatattc 42989341  T
Q  146 ctgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgt 245  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| |  |||| |||| | ||||||| |||||||||   | ||| |||||||||  ||||||||||| ||||     
T  42989342 ctgcctaccccttcaaagttgtcatatttgtctgctgctatttcgcttgagccggaataaattagtcacggaagtctctaaaccaacacgcaaaagatga 42989441  T
Q  246 aatatggttac 256  Q
    |||||||||||    
T  42989442 aatatggttac 42989452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 93
Target Start/End: Original strand, 30222848 - 30222930
Alignment:
Q  11 aaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagaca 93  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||    
T  30222848 aaacaatagcatagaattccgaatcaccgtgacccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcagattcgaagaca 30222930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12660207 - 12660124
Alignment:
Q  325 ttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatct 408  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  ||||||| || || |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  12660207 ttaccttgcactctattatgtccatgttgcacaaccggtggtaatgcctgtttatgaatctcttgccattactgccatgtatct 12660124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16074675 - 16074597
Alignment:
Q  249 atggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttgtta 327  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||    
T  16074675 atggttacgttcatggaacgcggcatccacattgcactttgaccacgtctcgcacggtttctcctaaactaagttgtta 16074597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37448026 - 37447990
Alignment:
Q  305 gtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctatt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37448026 gtttctcccaaactgagctgttaccttgcactctatt 37447990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25730656 - 25730623
Alignment:
Q  373 tgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcat 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25730656 tgtttatgaacctcttggcattgctgccatgcat 25730623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27292262 - 27292226
Alignment:
Q  372 atgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27292262 atgtttatgaacctcttgccattgttgacatgcatct 27292226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 44527439 - 44527045
Alignment:
Q  2 taatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggtt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  44527439 taatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtc 44527340  T
Q  102 ccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccga 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44527339 ccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccattttgtttgagcccga 44527240  T
Q  202 ataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgc 301  Q
    |||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  44527239 ataaattgcccacaagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacagtcatggaacgcggcgtccacattgcactttaaccatgactcgg 44527140  T
Q  302 tcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcca 401  Q
    || ||||||||||||            |||||||||||||||| ||||||  |||||||  | || |   || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44527139 tcggtttctcccaaa------------cttgcactctattatgcccgtgttgcacaaccgatggtaaactatttttatgaacctcttgccattgttgcca 44527052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4395345 - 4394939
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||| |||    
T  4395345 ataatactataaacaataggatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagttggactcgaagataacctggt 4395246  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  4395245 cccatctattcgcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgcctcccc-ttcaaaactctcatatttgcccgctgccatttcgattgagcccg 4395147  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4395146 gataaattgcccacgagagtctctaacacagcatgcaaaagttgtgatatggttacggtcatggaacgcggcttccacattgcacttcagccacgtctcg 4395047  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||   ||||  ||  ||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  4395046 ctcggtttctcccaaactgagttgttgtcttgcactctgttatgcatgtgttgcattaccggtagcgagggatgtttataaacctcttgccattgttgtc 4394947  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  4394946 atgcatct 4394939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5609526 - 5609119
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  5609526 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccctgagacgatagagtttgcactagagtagatgagtcgaactcgaagacaacccgat 5609427  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
      ||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| || ||| |||   |||||||||||    
T  5609426 ctcatctgttcgcaacatcaaagtgaaggacctcgagtaaggctactgcctcccccttcaaaactatcatatttgtccgctgtcatagagtttgagcccg 5609327  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    |||||||||  || | ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5609326 aataaattgctcgtgtgagtctctagcacagcacgcgaaagttgtaatatggttacagtcatggaacgcgacatccacattgcacttcaaccacgtctcg 5609227  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||   |  |||  |||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  5609226 ctcggtttctcccaaactgagttgttgccttgcactctattatgcctgtgttgtattaccgatagtggaggccgtttatgaacctcttgccattgctacc 5609127  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  5609126 atgcatct 5609119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36733883 - 36733473
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||    
T  36733883 ataatactagaaacaataacatagaattatgaatcatcatggcccggagacgatatagcttgcactagagttatagagtcagactcgaagacaacccggt 36733784  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||   | | ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  36733783 cccatttgttcacatcagcaaagtgaataacattgagtaagactactgcctccccctccaaaactgccatatttacccgttgtcattttgtttgagcccg 36733684  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccac--attgcacttcaaccacgact 298  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  36733683 aataaattgtccacgagagtctctaacacaacacacaaaaggtgtaagatggttatagtcatgaaacgcggcatccacatattgcacttcaaccatgtct 36733584  T
Q  299 cgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtga-tggatgtttatgaacctcttgccattgct 397  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36733583 cgctcggtttctccgaaactcagttattaccttgcattctattttggccttgttgcacaaccggtagtgaggggatgtttatgaacctcttgccattgct 36733484  T
Q  398 gccatgcatct 408  Q
    |||||||||||    
T  36733483 gccatgcatct 36733473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 51113502 - 51113095
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  51113502 ataatactagaaacaatagcataaaactccgaatcaccatggcccagagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggt 51113403  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| || || ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||| |  |||||||| ||||||| |||    
T  51113402 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatgacatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaacggttatatttgctcgttgccatttcgtttgagtccg 51113303  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || |||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||     
T  51113302 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacggcatccacattgcactttaaccacgtctca 51113203  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| |  |  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51113202 cacgatttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggctgtttatgaacctcctgccattgctgcc 51113103  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  51113102 atgcatct 51113095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 48949724 - 48950115
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||   |||| |||||||||||||    
T  48949724 ataatactagaaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagttgaactcgaagacaacccggt 48949823  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| || || |||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  48949824 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactttcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 48949923  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  48949924 aatgaattgccaacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 48950023  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgcca 392  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| |  |  ||| || |||||||||||||| |||||    
T  48950024 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 48950115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25682838 - 25682431
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||    
T  25682838 ataatactagaaacaatagtatagaattctaaatcactgtggcccggagacgatagagcttgtactagagtagctgagtcaaactcgaagacagcccggt 25682739  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||     
T  25682738 cccatctgttcacattagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagccca 25682639  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| | |||     
T  25682638 gataaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttacgttcatgaaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctca 25682539  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    | | |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |  || |||  ||||| | |   | | || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25682538 cacggtttctcccaaattgagttcttgccttgcactctattctacccatgttgcacaatcggcgataagggttgtttatgaatctcttgccattgctgcc 25682439  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  25682438 atgcatct 25682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 16816797 - 16817092
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcac---catgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaaccc 97  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||   |||| |  ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16816797 ataatactagaaacaatagcgtagaattccgaatcacgtccatggctcggagacggtagaacttgaactagagtagacgagtcggactcgaagacaaccc 16816896  T
Q  98 ggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagc 197  Q
    ||| |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16816897 ggtcccatctgtttgcatcagcaaaatgaagggcctcgagtaaggctactgcctcccc-tccaaaattgtcatatttgcccactgccattttgattgagc 16816995  T
Q  198 ccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccac 294  Q
     |||||||||||  |||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16816996 tcgaataaattgcacgcgagagtctctaaaacaatacacaaaagatgtaatatggttacagacatggaacgcggcgtccgcattgcacttcaaccac 16817092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 52109639 - 52109324
Alignment:
Q  2 taatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggtt 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |     
T  52109639 taatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggtccggagacaatagagcttgtactagagtagatgaatcacactcaaagacaaccca-tc 52109541  T
Q  102 ccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccga 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  52109540 ccatctgttagcatcagcaaagtgaaggacctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaatgatcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcctga 52109441  T
Q  202 ataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgc 301  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||    |||||||||| ||||||||||||| ||       
T  52109440 ataaattgtccacaggagtctctaacacaacatgcaaaagatataagatgattacggtcatggaacacaacgtccacattacacttcaaccacgtctttg 52109341  T
Q  302 tcagtttctcccaaact 318  Q
    || ||||||||||||||    
T  52109340 tcggtttctcccaaact 52109324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48166377 - 48166153
Alignment:
Q  48 agacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctact 147  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| ||| || ||||| ||||||||||| | |||| | ||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||| |    
T  48166377 agactatagagcttgcaatagagtagctgaatcagactcgaagacaacccgatcccatatattcacataagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctatt 48166278  T
Q  148 gcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaa 247  Q
    | ||||| || ||| | |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  48166277 gtctcccactccaaaactgtcatatttgctcgctgccatttcatttgagcccgaataaattgaccacgggagtctctaacacaacacacaaaagatgtaa 48166178  T
Q  248 tatggttacagtcatggaacgtggc 272  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  48166177 gatggttacggtcatggaacgtggc 48166153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24538533 - 24538279
Alignment:
Q  165 tgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatgg 264  Q
    |||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||| || || |    
T  24538533 tgtcgtatttgcctgctgccaattcgtttgagcccgaataaattatccacgggagtctctaacacaacacacaaaagatctaacttggttacggttatag 24538434  T
Q  265 aacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagta 364  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| |||| | ||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |  |||  ||||||  ||     
T  24538433 aacgcggcatccacattgcatttcgaccaggtctcacttggtttctctcaaactgagatgttaccttgcactctattctgcctatgttgcacaactggtg 24538334  T
Q  365 gtgatggatgtttatg-aacctcttgccattgctgccatgcatctgatgatgtcc 418  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  24538333 gtgagggatgtttatgaaacctcttgccattgttgtcatgcatctaatgatgtcc 24538279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44602939 - 44602765
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||| |||||||||    
T  44602939 ataatactagaaacaatagcatagaattttgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaaggcaacccggt 44602840  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttg 175  Q
      ||||||||| |||||| |||||||| | | ||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  44602839 ctcatctgttcacatcagtaaagtgaatgacatcgagtaagactaatgtctccccctccaaaattgtcatatttg 44602765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2885410 - 2885306
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |    
T  2885410 ataatactagaaacaatagcatataactccgaatcaccatagcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtctgactcgaagacaacccgat 2885311  T
Q  101 tccat 105  Q
    |||||    
T  2885310 tccat 2885306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21031336 - 21031247
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaag 90  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  21031336 ataatactagaaactataacataaaattccgaatcaccatagtccggagacgatagagcttgcactagaatagctgagtcagactcaaag 21031247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17507349 - 17507308
Alignment:
Q  297 ctcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactct 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17507349 ctcgctcggtttctcccaaactgagatattaccttgcactct 17507308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24538674 - 24538589
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactc 86  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||| |||||| | ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  24538674 ataatactagaaataatagcgtagaattctgaatcactatgacccgaagcagatagatcttgcactagagtagaagagtcagactc 24538589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14680349 - 14679939
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||   || ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  14680349 ataatactagaaacaatagcagagaattttgaatcaccactgcccggagatgatagagcttgcaatagagtagacgagtcggaatcaaagacaactcggt 14680250  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||      
T  14680249 tccatctgtttgcatcagcagagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatattttcccgctgccatttcatttgagccat 14680150  T
Q  201 aataaattgtccgc---gggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgac 297  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |    
T  14680149 aataaattgcccgccgcgggagtctctaacacaacatgcaaaagatgtaatgtggttgcggtcatggaacgcggtatccacattgcacttcaaccatgtc 14680050  T
Q  298 tcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgct 397  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||      
T  14680049 tcgctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgctcgtgttgcacaactagtggtgagagttgtttatgaacctctttccattgtg 14679950  T
Q  398 gccatgcatct 408  Q
    |||||||||||    
T  14679949 gccatgcatct 14679939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28107326 - 28106919
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||||||  | |    
T  28107326 ataatactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaagacaacgtgat 28107227  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||| |||  ||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || || ||||||||| ||||||||| |    
T  28107226 cccatctattcatatttgcaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatctgtccgctgccatttcgtttgagcctg 28107127  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  28107126 aataaattgtccacgggagtctctaacacaacacacgaaagatgtaagatggttacgatcatggaacgtggcttcctcgttgcacttcaaccacgtctcg 28107027  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||||  |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28107026 tttggtttctcccaaactgagatgttaccttgcactctattttgcatgtgttgcacaaccaatggtgaaagatgtttatgaacctcttgccattgttgcc 28106927  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  28106926 atgcatct 28106919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 15605994 - 15606320
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||    
T  15605994 ataatactagaaacaatagcatagtgttctgaatcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 15606093  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15606094 cccatttgttcccatcaacaaagtgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatgttttcccgctgccattttgtttgagcccg 15606193  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  15606194 aataagttgcccatgggagtctctaacacaacacgaaaaagatgtaatatggttacgatcgtgaaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 15606293  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgtta 327  Q
      | |||||||||||||||||||||||    
T  15606294 tgcggtttctcccaaactgagttgtta 15606320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Original strand, 29368057 - 29368443
Alignment:
Q  2 taatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggtt 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||    |||     
T  29368057 taatactagaagcaatagcatagaattacgaatcactatgacccggagacgatagagcttgcactatagtagatgagtcggactcgaaaacagttaggtc 29368156  T
Q  102 ccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccga 201  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||  || |||||||||  ||||||  |||    
T  29368157 ccatctattagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggatattgcctccccctccaaaactgtcatatttatccgctgccatttcttttgag--cga 29368254  T
Q  202 ataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgc 301  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||      |||| |||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||||   |||     
T  29368255 ataaattgtccacgagagtctcaaacacaacacgcaaaagattta------ttacggtcatgaactgcagcgtccacatttcacttcaaccacatttcgt 29368348  T
Q  302 tcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcca 401  Q
    ||  |||||||||||             |||||||||||| ||  ||||| ||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29368349 tcgatttctcccaaa------------tttgcactctattgtgctcgtgttacacaaccgataatgaatgatgtttatgaacctcttgccattgctgtca 29368436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 15053175 - 15053430
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||| || || ||| |||||| |||| |||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||    
T  15053175 ataatattataagcaacagcatagaattccgaatcaccatggcccgaagacgatagcgtttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccttgt 15053274  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
      ||| | ||| | ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  15053275 ctcattttttcacgtcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcatcttgtttgagcccg 15053374  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttac 256  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15053375 aataaattgtccactgaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttac 15053430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 11731673 - 11731989
Alignment:
Q  5 tactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttcca 104  Q
    ||||||||||| ||||||| || | |||| ||||||| || |||||| |||||||||| |||| | |  | ||||| ||||| ||||||||| | | | |    
T  11731673 tactagaaacagtagcatagaactccgaaccaccatggcccggagacaatagagcttgcactatattgaaagagtcggactcgaagacaacctgttccta 11731772  T
Q  105 tctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaata 204  Q
    | |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  11731773 tatgttctcatcagcaaagtgaagagtctcgag--aggctgctgcctcccc-tccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccggata 11731869  T
Q  205 aattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctca 304  Q
    ||||                  | ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11731870 aatt-----------------ccccaacacttaaaagatgtaatattgttacagtcatggaatgcgtcatctacattgcacttccaccacgtctcgctca 11731952  T
Q  305 gtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctatt 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11731953 gtttctcccaagctgagttgttaccttgcactatatt 11731989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 30801991 - 30802199
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| | | |||||||| |  ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || ||||| |||||||||  ||    
T  30801991 ataatactagaaacaataacatagaattccaagtcaccatggctcggaaacgatagagcttgcactaaagtagctgaatcggactcgaagacaacctagt 30802090  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||| | ||| |||| ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30802091 cccattttttcacatctgcaaagtaaatggcatctagtaaggctactgcctcccccaccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttaagcccg 30802190  T
Q  201 aataaattg 209  Q
    |||||||||    
T  30802191 aataaattg 30802199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 19690879 - 19691033
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19690879 ataatactagaaacaatgacatagaattccaaatcaccatgactcagagacgatagagcttgcactaaagtagctgagtcagactcgaagacaactcggt 19690978  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccc 155  Q
      ||||||||| ||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||    
T  19690979 cacatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaggctattgcctcccc 19691033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 408
Target Start/End: Original strand, 30802210 - 30802377
Alignment:
Q  241 gatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctat 340  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| | ||| |||||| ||||||| ||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30802210 gatgtaagatggttacattcattgaatgcggcatccacaatgcactttaactacctctcgcttagtttttcccaaactgagttggtaccttgcactctat 30802309  T
Q  341 tatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatct 408  Q
    | || | ||||  |||||||  | |||| || ||||||||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  30802310 tctgcctgtgttccacaaccgttggtgagggctgtttatgaatgtcttaccattgttgtcatgcatct 30802377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 408
Target Start/End: Original strand, 19364219 - 19364352
Alignment:
Q  274 tccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggat 373  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||  ||||  |  | |||| || |    
T  19364219 tccacaatgcactttaaccact-ctcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactcgattttgctcgtgttgcacatgcgttggtgagggtt 19364317  T
Q  374 gtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatct 408  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  19364318 gtttatgaacctctcgccattgttgtcatgcatct 19364352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27443117 - 27443033
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactc 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||    
T  27443117 ataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc-tgcactagagtagctgagtccaactc 27443033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 34104465 - 34104542
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgag 78  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  34104465 ataatactaaaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggtccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgag 34104542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 8451123 - 8451526
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8451123 ataatactagacacaataacataaaattccgaatcaccatgacctggagacgataaagcttgcactaaagtagatgagtcagactcgaagacaacccggt 8451222  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     ||||| |||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  8451223 cccatccgttcacatcagcgaagtgaatggaatcgagtaaagctactgcctccccctccaacactgtcatatttgcccgcttcctttttgtttgagcccg 8451322  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8451323 aataaattgtccacaagagtctctaacacaacatccaaaagatgtaaaatggttacggtcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccacgtctcg 8451422  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    | | |||||||||||| |||  | | ||||||||||||||| ||   ||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8451423 cacggtttctcccaaattgaactatgaccttgcactctattttgctggtgttgcacaacctgtggtgatggctgtttatgaacctcttgccattgttgcc 8451522  T
Q  401 atgc 404  Q
    ||||    
T  8451523 atgc 8451526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 478056 - 478463
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||| ||||||||    
T  478056 ataatattagaaacaatatcataaaataccgaatcaccataacccggagacgatagagcttgcactagagtagtagagtcagattcgaagataacccggt 478155  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  478156 cccatctattcacattagcaaagtgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccattttgtttgagcccg 478255  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
     |||||||| ||  || | ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||   |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  478256 gataaattgaccatggaaatctctaacacaacacacaaaagatgttagatggttgtggtcatggaacgttgcatccacattacacttcaaccacatctcg 478355  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||  |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || | ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  478356 cttggtttctcccaaattgagatgttaccttggactctattttgcctgtgttgcacaaccactggtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 478455  T
Q  401 atgcatct 408  Q
    ||||||||    
T  478456 atgcatct 478463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23854118 - 23853726
Alignment:
Q  2 taatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggtt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||     
T  23854118 taatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagttgatgagtcggactcgaagacaactcagtc 23854019  T
Q  102 ccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccga 201  Q
     ||||||||  ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||  || ||| ||||| |||||| |||||    
T  23854018 tcatctgttagcatcaacaaagtgaatggcctcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatttttccgctgtcatttcgtttgaacccga 23853919  T
Q  202 ataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgc 301  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  23853918 ataaattgcccacgggagtctctaacataacacgcaaaagatgtaatatagttacggtcatggaacgcggcgtccacatcgcacttcaaccacgtctcgt 23853819  T
Q  302 tcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcca 401  Q
    || ||||||||||||            |||||||||||||||| | ||||  ||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23853818 tcggtttctcccaaa------------cttgcactctattatgcctgtgttgcacaacctgtggtgaataatgtttatgaacctcttgccattgttgtca 23853731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7127410 - 7127004
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||    |||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||   |||| ||||| ||| |||||||||    
T  7127410 ataatacttgaaacaataacatagaatactaaatcaccatggcccggagacgaaagagcttgcactaaagtagcatagtcagactcgaaggcaacccggt 7127311  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||  | ||||||  |||| || ||    
T  7127310 cccatctgttcacatcagcaaagtgaatagcatcgagtaaggctactacctccccctccaaaactttcatatttgcccgtttccatttcatttgtgcacg 7127211  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||  || || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  7127210 aataaatttcccccgagagtctctaacacaacatgcagaggatgtaagacggttacgttcatggaacgcggcatccacattccacttcaaccatgtctcg 7127111  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7127110 ctcggcttctcccaaactaagttgttaccttgccccctattctggctgtgttgcacaaccggtagtgagggatgtttatgaacctcatgccattgctgcc 7127011  T
Q  401 atgcatc 407  Q
    |||||||    
T  7127010 atgcatc 7127004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 40588730 - 40589122
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||| || || |||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40588730 ataatactataaacaatagcatagaattcagaatcatcatggcccggggacgatagagtttacactagagtagatgaatcagactcaaagacaacccggt 40588829  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
      ||||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40588830 ctcatctgtttgcatccgcaaaacgaagggcctcgagtacggctactgcctccccctccaaaactgttatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccg 40588929  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||||||||| | |               | ||| ||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||     
T  40588930 aataaattgcctg---------------ctacaagcaaaagttgttatatggttacgttcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctca 40589014  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40589015 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctgttatgcccgtgttgcacaaccggtggtgagggctgtttatgaacctcttgccattgttgcc 40589114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13415210 - 13414916
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||||| | |||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |    
T  13415210 ataatactaaaaacaatagcataaaattcagaatcaccatggcccggggacgatataccttgcactagagtagaagaatcggactcaaagacaactcgat 13415111  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  13415110 cccatctgtttgcatccgcaaaaggaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccg 13415011  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacg 295  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  13415010 aataaattgcccgcgaaagtctctaaaaaaacacacaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacacgacatccacattgcacttcaaccacg 13414916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 185591 - 185797
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||| |||||  ||||| |||||  ||||||||||||    
T  185591 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggtccggagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgtagacaacccggt 185690  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||     
T  185691 tccatctattcacatcaacaaagtgaatagtatcgagtaaggctacttcct-cccctccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgagccca 185789  T
Q  201 aataaatt 208  Q
     |||||||    
T  185790 gataaatt 185797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 598237 - 598336
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  598237 ataatactagaaacaatagcatagaacttcgaatcaccatgacctgaagacgatagagcttgcactagagtagctaagtccgacttgaagacaacccggt 598336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37712260 - 37712003
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| || | |||| |||||||||  ||||||||||  | |||  |||  |||| |||| | |    
T  37712260 ataatactagaaacaatagcatagtattctgaatcaccatgtcc-gaagacaatagagcttacactagagtagcagggtcaaactagaagataacctgat 37712162  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||| |     
T  37712161 ctcatctgttcacatcaacaaagtgaatggcat----taaagctactacctcccc-ttcaaaactgtcatattttcccgctgtcatttcgttttagctca 37712067  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatgg 264  Q
    ||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||    
T  37712066 aataaattgcccacacgagtttctaacacaacacgcaaaaaatgtaagataattacagtcatgg 37712003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 3606739 - 3606855
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| | |||||| ||||  || |||||  |||    
T  3606739 ataatactagaaacaatagcatagaattccaagtcaccatgaccctgagacgatagagtttgtactaaagttgttgagtcggacttgaaaacaacttggt 3606838  T
Q  101 tccatctgttctcatca 117  Q
    ||||||||||| |||||    
T  3606839 tccatctgttcacatca 3606855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 33642764 - 33642869
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||||||||| | |    
T  33642764 ataatactagaaacaatatcattgaattctgaatcaccatggcccggagacgacagagcttgcattagagtagatgagttggacttgaagacaacctgat 33642863  T
Q  101 tccatc 106  Q
    ||||||    
T  33642864 tccatc 33642869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11870451 - 11870366
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactc 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |   ||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  11870451 ataatactagaaacaatagcatagaaatccgaatcaccatggctccgagacaatagagcttgcacaagagtagctgagtcagactc 11870366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9496887 - 9496797
Alignment:
Q  82 gactcaaagacaacccggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatt 173  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  9496887 gactcaaagacaacacggtcccata-gttcacatcaacaaagtgaatgtcatcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatt 9496797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 53497218 - 53496824
Alignment:
Q  2 taatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggtt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  53497218 taatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtc 53497119  T
Q  102 ccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccga 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || | ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  53497118 ccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctctagtaaggctactgcctccccctcaaaaactgtcacatttgtccgctgtcattttgtttgagcccga 53497019  T
Q  202 ataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgc 301  Q
    |||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  53497018 ataaattgcccacaagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacggtcatggaacgcggcgtccacattgcactttaaccatgactcgg 53496919  T
Q  302 tcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcca 401  Q
    || ||||||||||||            |||||||||| || || ||||||  |||||||  | ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53496918 tcggtttctcccaaa------------cttgcactctgttctgcccgtgttgcacaaccgatggtgaacgatttttatgaacctcttgtcattgctgcca 53496831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 42340277 - 42340682
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  42340277 ataatattagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccggagacgacagagcttgcactaaagtagctgagtctgactcgaagacaactcggt 42340376  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42340377 cccatctgttcacatctgcaaagtgaatgacatcgagtagggctattgcctccccctccaacactgtcatatctgcccgctgccattttgtttgagcccg 42340476  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||| ||||    | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42340477 aataaattgtccacgagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttgccgacatagaac-caacatccacattgcacttcaaccacgtctcg 42340575  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgcc 400  Q
    | | ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||  |||||  ||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||||| || |    
T  42340576 cacggtttctctcaaactgagttgttgccttagactctattctgcacgtgttgcacaaccggtggtgagggctgtttatgaatctcttgccattgttgtc 42340675  T
Q  401 atgcatc 407  Q
    |||||||    
T  42340676 atgcatc 42340682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 55199698 - 55199358
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||    
T  55199698 ataatactagaaacaatagcataaaattccgaatcaccatgacccgtagacgatagcgcttgcaccagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 55199599  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     |||||||||  || || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||| ||||| |||||||||||    
T  55199598 cccatctgtttccaacaacaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttatcagctgtcatttcgtttgagcccg 55199499  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||     
T  55199498 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatattgacggtcatgaaacgtggcatccacattgcacgtcaaccacatctca 55199399  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctatt 341  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  55199398 cgcggtttctcccaaactgagttgttagcttgcactttatt 55199358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46007486 - 46007148
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||      
T  46007486 ataatgctagaaacaatagcataaaattccgaatcgccatggcccggagacgatatagtttgcactagagtagttgaatcggactcgaagaca-cccgc- 46007389  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  46007388 -ccatctgttcatatcgacaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgtctccccctaaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccg 46007290  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctct-aacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactc 299  Q
    |||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  46007289 aataaattttccacgagagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaataatggaacacggcatccacattgcacttcaaccacgtctc 46007190  T
Q  300 gctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctatt 341  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  46007189 gctttgtttttcccaaactgagttgttatcctgcactttatt 46007148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48227550 - 48227306
Alignment:
Q  52 gatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcg-tcgagtaaggctactgcc 150  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||  ||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||     
T  48227550 gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaactcggttttatccattcacatcagcaaagtgatggggtctcgagtaaggctactgca 48227451  T
Q  151 tcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatat 250  Q
    |||| || |||||  ||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48227450 tcccactccaatacagtcatgttttcccactgctgtttcgtttaagcccgaataaattgcccgcgagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaacat 48227351  T
Q  251 ggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacg 295  Q
    |||||| || ||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48227350 ggttacggtaatgaaatgcggcatccacattgtacttcaaccacg 48227306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2615670 - 2615341
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||| |    ||||||||||||| | |||||||||| |||||| || | |||||||||         
T  2615670 ataatactaaaaacaatatcatagaattctgaatcaccatggcacaaagacgatagagctcgcactagagtagttgagtcggattgaaagacaaca---- 2615575  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccg 200  Q
          | ||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  2615574 ------ttttcccatcagcaaagtgaacgacatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgcccgctgccaattcgtttgagcccg 2615481  T
Q  201 aataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 300  Q
    ||| ||||| || |   || |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||   ||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||| || |    
T  2615480 aatgaattgcccacaaaagcctctaacacaacgcacaaaaaatgtaatatggttatgatcatgaaacgcggtatccacattgcatttcaaccacgtcttg 2615381  T
Q  301 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctat 340  Q
    | |  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  2615380 cacgatttctcccaaactgaaccgttactttgcactctat 2615341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 268
Target Start/End: Original strand, 647307 - 647478
Alignment:
Q  97 cggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgag 196  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  647307 cggtcccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctgctgcctccccctccataactgtcatattagcccgctgccatttcgtttgag 647406  T
Q  197 cccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacg 268  Q
    |||| | |||||| |    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  647407 cccggaaaaattgcctagagaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacgctcatggaacg 647478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 647166 - 647306
Alignment:
Q  4 atactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggttcc 103  Q
    |||||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||  |    
T  647166 atactataaacaacaacatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcagactcgaagataactcggtcac 647265  T
Q  104 atctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggct 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  647266 atctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggct 647306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 11020180 - 11020360
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||  ||| |||||| | |||| ||||| |||||||||| ||    
T  11020180 ataatactagaaacaatagcacagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagaccttacactggagtagttaagtcagactcgaagacaacccagt 11020279  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccact 181  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||  || |||||||| |||  || |||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  11020280 tccatttgttcccatcagcaaagtaaatagcatcgagtaaagctgatgtctccccctccaaaagtgtcatatttgtccact 11020360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 256
Target Start/End: Original strand, 27941129 - 27941249
Alignment:
Q  136 agtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacg 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||    
T  27941129 agtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgtccgctgccattttgtttgagtccgaataaattgtcctcgagaatctctaatacaacacg 27941228  T
Q  236 caaaggatgtaatatggttac 256  Q
    ||||  || ||||||||||||    
T  27941229 caaaaaatataatatggttac 27941249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 27608903 - 27608999
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaaccc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  27608903 ataatactagaaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccc 27608999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 34497372 - 34497468
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaaccc 97  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  34497372 ataatactaggaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccc 34497468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 408
Target Start/End: Original strand, 36310808 - 36310903
Alignment:
Q  313 caaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgtgacacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgccattgctgccatgcatct 408  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36310808 caaactgaattgtcaccttgcactctattatggccgtgttgcacaatcagttgtgagggttgtttatgaacctcttgccattgctgcaatgtatct 36310903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24176957 - 24176861
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaaccc 97  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  24176957 ataatactagatacaatagcttagaattccgaatcaccatgacccagagacgatagagcttgcactagagtagttgtgtcagactcgaagacaaccc 24176861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2121268 - 2121129
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacccggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  |||| | |||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||| | |||| |||||||| ||||| || |    
T  2121268 ataatactagaaacaatagcacaaaattatgaataatcatggcctagagacaatagagcttgcattagagtagttaagtcggactcaaaaacaacacgat 2121169  T
Q  101 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaa 140  Q
     |||||| |||  |||||||||||||| | | ||||||||    
T  2121168 cccatctattcatatcagcaaagtgaatgacatcgagtaa 2121129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1070960 - 1070850
Alignment:
Q  241 gatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctat 340  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| |   | ||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1070960 gatgtaagatggttacgatcatggaaggcaacatccacattgcagttcaaccatgtctcgcgcggtttctcctaaactgaggttttaccttgctctctat 1070861  T
Q  341 tatggccgtgt 351  Q
    |||| ||||||    
T  1070860 tatgtccgtgt 1070850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 19117720 - 19117781
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttg 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19117720 ataatactaaaaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttg 19117781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 27747685 - 27747739
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgata 55  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  27747685 ataatactaaaaacaatagcatagaattttgaatcaccatggcccggagacgata 27747739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 31341725 - 31341828
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagac----gatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacc 96  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||    ||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||| ||||    
T  31341725 ataatattagaaacaatagtataaaattctgaatcaccatgacccggagacgtaggatagagcttgcactagagtagtggagtcagattcgaagataacc 31341824  T
Q  97 cggt 100  Q
    ||||    
T  31341825 cggt 31341828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 254
Target Start/End: Original strand, 36310728 - 36310793
Alignment:
Q  189 tgtttgagcccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggtt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36310728 tgtttgagctcgaataaattgtccacatgcttctctaacacaacacgcaaaagatgtaaaatggtt 36310793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 377 - 23
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaat----caccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactcaaagacaacc 96  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||    |||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  377 ataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatcaccatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacc 278  T
Q  97 cggttccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatattgtcatatttgcccactgccattttgtttgag 196  Q
    |||| |||| | ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||| |  || ||||| |||||||    
T  277 cggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctcccaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgag 178  T
Q  197 cccgaataaattgtccgcgggagtctctaacacaacacgcaaaggatgtaatatggttacagtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacga 296  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||   ||||| | || |||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||     
T  177 cccgaatgaattgcccacgggagtctctaaaacaacacgcgaaagatngtatatgttgacggtcatgaaacacgacatccacattgcacttcaaccacgt 78  T
Q  297 ctcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatggccgtgt 351  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||    
T  77 ctcacacagtttctcccaaactgagttgttagcttgcagtctgttctgcccgtgt 23  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 264 - 349
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactc 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  264 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaattaccatgacctggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactc 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 44244 - 44328
Alignment:
Q  1 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttggactagagtagatgagtccgactc 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||    
T  44244 ataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc-tgcactagagtagctgagtccaactc 44328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University