View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16733_low_24 (Length: 243)

Name: NF16733_low_24
Description: NF16733
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16733_low_24
NF16733_low_24
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (1-118)||(24886142-24886260)
chr5 (1-118)||(30969343-30969461)
chr5 (1-118)||(31705631-31705748)
chr5 (1-118)||(22255219-22255338)
chr5 (5-118)||(5112336-5112450)
chr5 (1-116)||(699190-699306)
chr5 (1-116)||(14919547-14919663)
chr5 (3-118)||(26268112-26268228)
chr5 (1-116)||(38528256-38528371)
chr5 (1-155)||(7208883-7209037)
chr5 (1-118)||(22974101-22974219)
chr5 (1-118)||(22980831-22980949)
chr5 (1-118)||(27318506-27318624)
chr5 (1-117)||(17158050-17158166)
chr5 (3-118)||(1429166-1429282)
chr5 (1-118)||(12910388-12910511)
chr5 (1-116)||(32563189-32563305)
chr5 (1-118)||(31786665-31786783)
chr5 (3-118)||(9200271-9200387)
chr5 (10-117)||(35826512-35826619)
chr5 (3-118)||(36860461-36860577)
chr5 (3-118)||(36866800-36866916)
chr5 (8-118)||(19119897-19120008)
chr5 (1-118)||(5837593-5837711)
chr5 (1-114)||(39572861-39572975)
chr5 (5-114)||(43308675-43308784)
chr5 (3-159)||(21088787-21088943)
chr5 (1-116)||(23116241-23116357)
chr5 (1-116)||(35511496-35511612)
chr5 (13-118)||(27330344-27330448)
chr5 (1-118)||(14409346-14409463)
chr5 (1-118)||(15724528-15724644)
chr5 (3-118)||(8741907-8742024)
chr5 (1-77)||(15992559-15992636)
chr5 (2-118)||(25668688-25668804)
chr5 (11-118)||(7693268-7693376)
chr5 (3-118)||(40133423-40133539)
chr5 (1-118)||(33908271-33908389)
chr5 (24-102)||(5829955-5830034)
chr5 (20-114)||(11898044-11898139)
chr5 (8-114)||(25500952-25501059)
chr5 (1-114)||(42342775-42342887)
chr5 (1-118)||(22019670-22019788)
chr5 (1-94)||(35504427-35504521)
chr5 (1-118)||(8466783-8466900)
chr5 (1-99)||(6824498-6824599)
chr5 (1-117)||(28416546-28416663)
chr5 (1-57)||(23954808-23954864)
chr5 (1-57)||(35933995-35934051)
chr5 (72-116)||(22255615-22255659)
chr5 (71-159)||(26317774-26317861)
chr5 (5-118)||(8437004-8437117)
chr5 (67-116)||(13956431-13956480)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-116)||(7927-8043)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (1-160)||(10555237-10555396)
chr8 (1-118)||(37970554-37970672)
chr8 (1-162)||(1150140-1150301)
chr8 (3-118)||(6098555-6098671)
chr8 (1-118)||(43643630-43643748)
chr8 (3-118)||(23854468-23854584)
chr8 (1-116)||(36695001-36695117)
chr8 (1-118)||(1204964-1205082)
chr8 (1-114)||(16446910-16447024)
chr8 (1-118)||(30654618-30654736)
chr8 (1-95)||(1149667-1149762)
chr8 (1-118)||(27082873-27082991)
chr8 (1-118)||(31933921-31934039)
chr8 (13-116)||(12876148-12876252)
chr8 (1-118)||(465879-465997)
chr8 (1-118)||(9864185-9864303)
chr8 (1-118)||(13307660-13307778)
chr8 (1-118)||(16222900-16223018)
chr8 (1-116)||(34895006-34895122)
chr8 (1-114)||(38644019-38644133)
chr8 (5-95)||(41362575-41362666)
chr8 (1-118)||(8803852-8803963)
chr8 (3-118)||(11727061-11727177)
chr8 (1-68)||(7890992-7891059)
chr8 (1-68)||(35459746-35459813)
chr8 (1-114)||(34952066-34952180)
chr8 (3-164)||(41911025-41911186)
chr8 (1-116)||(5299981-5300097)
chr8 (1-57)||(39099154-39099210)
chr8 (24-118)||(40862456-40862551)
chr8 (1-76)||(44869576-44869652)
chr8 (2-57)||(33197948-33198003)
chr8 (1-52)||(33906316-33906367)
chr8 (1-57)||(1954024-1954081)
chr8 (3-68)||(43025790-43025855)
chr8 (1-49)||(7998401-7998449)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (1-157)||(30055501-30055658)
chr7 (1-164)||(37109840-37110003)
chr7 (1-118)||(31579094-31579217)
chr7 (1-156)||(38258521-38258676)
chr7 (5-118)||(27283757-27283871)
chr7 (1-116)||(7334809-7334925)
chr7 (1-157)||(17842616-17842772)
chr7 (1-118)||(18797342-18797458)
chr7 (1-118)||(24211754-24211872)
chr7 (3-118)||(32821085-32821201)
chr7 (1-118)||(12390660-12390778)
chr7 (1-118)||(37347035-37347153)
chr7 (3-118)||(4582932-4583048)
chr7 (4-116)||(10481619-10481733)
chr7 (1-118)||(21991649-21991767)
chr7 (1-118)||(31520754-31520871)
chr7 (1-117)||(5657511-5657628)
chr7 (1-116)||(22687254-22687370)
chr7 (4-114)||(11071223-11071334)
chr7 (1-118)||(9355856-9355974)
chr7 (1-118)||(27421410-27421527)
chr7 (1-118)||(29173553-29173671)
chr7 (1-114)||(41765108-41765222)
chr7 (26-118)||(38053499-38053592)
chr7 (3-98)||(32432485-32432581)
chr7 (3-118)||(43686054-43686169)
chr7 (1-116)||(44413409-44413525)
chr7 (10-115)||(8861301-8861407)
chr7 (1-118)||(23111203-23111321)
chr7 (1-118)||(26980336-26980454)
chr7 (1-114)||(33688292-33688406)
chr7 (1-117)||(15612789-15612905)
chr7 (8-118)||(48928334-48928444)
chr7 (8-118)||(48928601-48928711)
chr7 (1-118)||(12165765-12165883)
chr7 (3-117)||(6546533-6546648)
chr7 (8-118)||(26524364-26524475)
chr7 (6-118)||(35353121-35353235)
chr7 (1-65)||(10359245-10359308)
chr7 (1-48)||(37704241-37704288)
chr7 (1-67)||(43925167-43925232)
chr7 (3-57)||(44598741-44598795)
chr7 (27-114)||(34362205-34362292)
chr7 (1-39)||(15672792-15672830)
chr7 (18-64)||(34362149-34362195)
chr7 (27-69)||(46481177-46481219)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-157)||(1945833-1945990)
chr6 (1-157)||(5627391-5627547)
chr6 (1-118)||(4318851-4318969)
chr6 (1-118)||(7055243-7055361)
chr6 (1-118)||(8513271-8513389)
chr6 (1-117)||(33893031-33893147)
chr6 (1-116)||(29182203-29182319)
chr6 (8-118)||(3879974-3880085)
chr6 (1-118)||(7235063-7235180)
chr6 (8-117)||(15491654-15491764)
chr6 (8-118)||(6088946-6089057)
chr6 (1-102)||(6091211-6091313)
chr6 (8-68)||(21017147-21017207)
chr6 (1-57)||(33618934-33618990)
chr6 (26-118)||(18498471-18498565)
chr6 (8-57)||(20768184-20768233)
chr6 (1-118)||(30353386-30353504)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (1-118)||(20373325-20373443)
chr3 (1-114)||(3655231-3655345)
chr3 (1-118)||(4761678-4761796)
chr3 (1-106)||(42506104-42506210)
chr3 (1-118)||(51213010-51213128)
chr3 (1-115)||(40552288-40552403)
chr3 (1-118)||(47481551-47481669)
chr3 (1-116)||(37203098-37203214)
chr3 (1-116)||(37157739-37157854)
chr3 (1-118)||(26941289-26941407)
chr3 (1-118)||(48354970-48355088)
chr3 (1-157)||(35844317-35844473)
chr3 (1-106)||(21009831-21009937)
chr3 (158-227)||(44454513-44454582)
chr3 (1-118)||(29099384-29099502)
chr3 (1-118)||(46297791-46297909)
chr3 (1-118)||(34132964-34133082)
chr3 (1-102)||(24708146-24708246)
chr3 (1-116)||(11466855-11466971)
chr3 (1-118)||(52040951-52041070)
chr3 (1-118)||(44186530-44186648)
chr3 (8-116)||(4015491-4015600)
chr3 (3-118)||(11357395-11357512)
chr3 (1-68)||(53176134-53176201)
chr3 (1-106)||(7327511-7327617)
chr3 (1-118)||(40936020-40936138)
chr3 (1-154)||(22446093-22446247)
chr3 (1-117)||(24488991-24489108)
chr3 (1-118)||(46994690-46994797)
chr3 (3-118)||(53229183-53229300)
chr3 (1-116)||(54505839-54505954)
chr3 (3-118)||(45174532-45174650)
chr3 (1-118)||(3362282-3362400)
chr3 (1-118)||(22450997-22451115)
chr3 (1-106)||(27480408-27480514)
chr3 (8-116)||(2007964-2008073)
chr3 (1-70)||(38591776-38591845)
chr3 (3-98)||(21193655-21193751)
chr3 (1-118)||(44891535-44891644)
chr3 (1-60)||(33378814-33378873)
chr3 (1-111)||(39282689-39282799)
chr3 (1-114)||(54828730-54828843)
chr3 (10-116)||(43975926-43976033)
chr3 (1-54)||(29163912-29163965)
chr3 (1-85)||(43348320-43348404)
chr3 (1-65)||(14586699-14586763)
chr3 (1-118)||(25579768-25579886)
chr3 (5-39)||(53811695-53811729)
chr3 (1-36)||(33698265-33698300)
chr3 (71-113)||(41585407-41585449)
chr3 (1-34)||(22622747-22622780)
chr3 (72-117)||(33698218-33698263)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (1-117)||(33551033-33551150)
chr2 (1-118)||(37905746-37905864)
chr2 (1-118)||(43648292-43648410)
chr2 (1-116)||(3176979-3177095)
chr2 (3-118)||(11366430-11366546)
chr2 (1-116)||(19289370-19289486)
chr2 (1-118)||(27349986-27350103)
chr2 (1-118)||(4478407-4478525)
chr2 (1-118)||(29242185-29242303)
chr2 (1-118)||(36642024-36642142)
chr2 (3-118)||(13711502-13711618)
chr2 (1-118)||(17054143-17054261)
chr2 (5-118)||(33902106-33902218)
chr2 (8-118)||(41463904-41464015)
chr2 (8-118)||(43770893-43771004)
chr2 (1-106)||(4763681-4763787)
chr2 (1-118)||(17071784-17071902)
chr2 (1-58)||(41960939-41960996)
chr2 (3-118)||(4166960-4167076)
chr2 (8-118)||(19424682-19424793)
chr2 (8-118)||(33709286-33709397)
chr2 (1-118)||(31570781-31570899)
chr2 (1-114)||(33660415-33660529)
chr2 (44-158)||(35958908-35959022)
chr2 (1-85)||(39167410-39167495)
chr2 (1-157)||(4264124-4264280)
chr2 (8-116)||(26357617-26357726)
chr2 (26-117)||(2325442-2325534)
chr2 (3-85)||(5881610-5881693)
chr2 (1-60)||(45327817-45327876)
chr2 (1-118)||(19313890-19314007)
chr2 (1-116)||(44285989-44286105)
chr2 (1-59)||(18494327-18494385)
chr2 (12-57)||(41051263-41051308)
chr2 (1-61)||(31861948-31862008)
chr2 (1-117)||(44913700-44913819)
chr2 (1-85)||(7006968-7007053)
chr2 (10-54)||(19501795-19501839)
chr2 (6-56)||(41465602-41465652)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (1-116)||(19089508-19089624)
chr4 (1-118)||(55477946-55478068)
chr4 (1-102)||(37663796-37663898)
chr4 (1-118)||(42199767-42199885)
chr4 (1-118)||(19440703-19440821)
chr4 (1-118)||(25184151-25184269)
chr4 (1-118)||(36493743-36493861)
chr4 (1-114)||(25701112-25701226)
chr4 (2-118)||(879604-879721)
chr4 (1-114)||(23761114-23761228)
chr4 (8-158)||(49375965-49376116)
chr4 (1-118)||(27396654-27396772)
chr4 (13-118)||(29584267-29584371)
chr4 (1-157)||(32912635-32912791)
chr4 (1-157)||(34361547-34361702)
chr4 (1-115)||(34948152-34948267)
chr4 (1-118)||(38011892-38012010)
chr4 (1-117)||(50697281-50697397)
chr4 (3-118)||(6864073-6864189)
chr4 (1-116)||(17167753-17167869)
chr4 (1-116)||(17173330-17173446)
chr4 (1-116)||(46888212-46888328)
chr4 (1-118)||(35021090-35021208)
chr4 (3-102)||(50764784-50764884)
chr4 (8-118)||(54499300-54499412)
chr4 (1-118)||(4598031-4598148)
chr4 (1-118)||(28003041-28003159)
chr4 (16-117)||(55241174-55241276)
chr4 (6-118)||(5048025-5048138)
chr4 (1-85)||(9139316-9139401)
chr4 (8-80)||(33341475-33341547)
chr4 (1-95)||(4934257-4934353)
chr4 (27-118)||(7703555-7703647)
chr4 (1-118)||(37775707-37775823)
chr4 (3-80)||(32592169-32592247)
chr4 (24-118)||(39397956-39398051)
chr4 (3-49)||(1815409-1815455)
chr4 (29-114)||(37287776-37287862)
chr4 (42-118)||(3042649-3042726)
chr4 (8-57)||(33816595-33816644)
chr4 (27-118)||(30002705-30002797)
chr4 (27-118)||(35025669-35025761)
chr4 (27-118)||(47253787-47253878)
chr4 (71-118)||(53124325-53124372)
chr4 (71-117)||(4396365-4396411)
chr4 (52-116)||(4205156-4205221)
chr4 (13-58)||(17272067-17272108)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (1-116)||(28564805-28564921)
chr1 (1-118)||(10922761-10922879)
chr1 (1-157)||(18422647-18422803)
chr1 (1-118)||(15752063-15752181)
chr1 (1-157)||(8222127-8222280)
chr1 (1-118)||(15382967-15383085)
chr1 (1-117)||(32267069-32267186)
chr1 (1-117)||(51128894-51129011)
chr1 (1-116)||(9903078-9903194)
chr1 (1-157)||(19899793-19899949)
chr1 (1-117)||(48620672-48620789)
chr1 (1-116)||(2959784-2959900)
chr1 (1-117)||(28769688-28769804)
chr1 (5-116)||(30254460-30254571)
chr1 (5-118)||(32216089-32216203)
chr1 (1-114)||(37451324-37451437)
chr1 (1-117)||(30326976-30327093)
chr1 (1-117)||(46931446-46931563)
chr1 (1-117)||(27763335-27763451)
chr1 (1-118)||(37618916-37619038)
chr1 (1-116)||(41926199-41926315)
chr1 (1-118)||(23999381-23999499)
chr1 (1-118)||(42721073-42721191)
chr1 (1-118)||(10182032-10182150)
chr1 (1-118)||(47279223-47279341)
chr1 (1-116)||(34012401-34012517)
chr1 (9-95)||(21289729-21289816)
chr1 (1-95)||(27267223-27267318)
chr1 (1-118)||(11742375-11742492)
chr1 (1-114)||(38823252-38823366)
chr1 (1-117)||(27563929-27564046)
chr1 (1-80)||(7079087-7079167)
chr1 (3-117)||(3534967-3535082)
chr1 (1-118)||(16415679-16415798)
chr1 (1-68)||(25160717-25160784)
chr1 (1-68)||(27227509-27227576)
chr1 (8-118)||(40884847-40884958)
chr1 (1-118)||(238537-238654)
chr1 (1-114)||(3309186-3309299)
chr1 (1-118)||(14758075-14758193)
chr1 (1-118)||(27533004-27533122)
chr1 (1-159)||(31621577-31621735)
chr1 (6-57)||(15168192-15168243)
chr1 (3-95)||(47682520-47682614)
chr1 (1-57)||(33725624-33725680)
chr1 (1-106)||(4330326-4330433)
chr1 (27-118)||(1547321-1547413)
chr1 (1-116)||(39393419-39393535)
chr1 (1-58)||(22170806-22170863)
chr1 (84-157)||(30254854-30254926)
chr1 (27-68)||(1359933-1359974)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (3-118)||(43995-44111)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (3-118)||(154676-154792)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-160)||(146045-146204)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (1-116)||(94412-94528)
scaffold0002 (1-102)||(408458-408559)
scaffold0002 (3-118)||(172-288)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (1-56)||(12010-12065)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-106)||(267333-267440)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (70-118)||(42386-42434)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24886260 - 24886142
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24886260 agtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatg 24886161  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24886160 ttatagtattaacttcacc 24886142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 30969343 - 30969461
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  30969343 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatg 30969442  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  30969443 ttatagtgttaacttcacc 30969461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 31705631 - 31705748
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31705631 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatg 31705729  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  31705730 ttatagtgttaacttcacc 31705748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22255338 - 22255219
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattaca-tttttgat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22255338 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgat 22255239  T
Q  99 gttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  22255238 gttataatgttaacttcacc 22255219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Original strand, 5112336 - 5112450
Alignment:
Q  5 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttat 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  5112336 tagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttat 5112435  T
Q  104 agtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||||    
T  5112436 agtattaacttcacc 5112450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 699306 - 699190
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| |||    
T  699306 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatg 699207  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
     |||||| |||||||||    
T  699206 ctatagtgttaacttca 699190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 14919547 - 14919663
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14919547 agtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatg 14919646  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||| | |||||||||    
T  14919647 ttataatgttaacttca 14919663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 26268228 - 26268112
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |    
T  26268228 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgatgct 26268129  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| |||||||||||    
T  26268128 atagtgttaacttcacc 26268112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 38528256 - 38528371
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38528256 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-agactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatg 38528354  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  38528355 ttatagtgttaacttca 38528371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 7208883 - 7209037
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||| || ||||||| |||    
T  7208883 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgcattttttatg 7208981  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaatttt 155  Q
    ||| | | |||||||||||       |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7208982 ttacaatgttaacttcaccaaaaaaagtcatttttatgacttcaccgtagaatttt 7209037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 22974101 - 22974219
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  22974101 agtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatg 22974200  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22974201 ttatagtgttaacttcacc 22974219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22980949 - 22980831
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattg-tacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||| |  |||||||||     
T  22980949 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgata 22980850  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  22980849 ctatagtgttaacttcacc 22980831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 27318506 - 27318624
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  27318506 agtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatg 27318605  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    || |||| |||||||||||    
T  27318606 ttttagtgttaacttcacc 27318624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 17158050 - 17158166
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  17158050 agtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatg 17158148  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  17158149 ttatagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 1429166 - 1429282
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| |    
T  1429166 tgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgct 1429265  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| |||||||||||    
T  1429266 atagtgttaacttcacc 1429282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12910511 - 12910388
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac------aacagtggggtgttgctcattacatttt 94  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||| | || || |||||    
T  12910511 agtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttt 12910412  T
Q  95 tgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  12910411 tgatgttatagttttaacttcacc 12910388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 32563305 - 32563189
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtaca-acagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  32563305 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatg 32563206  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  32563205 ttatagtgttaacttca 32563189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 31786665 - 31786783
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||   |||||| ||||||||| |||    
T  31786665 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatg 31786764  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  31786765 ctatagtgttaacttcacc 31786783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9200387 - 9200271
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  9200387 tgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 9200288  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9200287 atagtgttaacttcacc 9200271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Original strand, 35826512 - 35826619
Alignment:
Q  10 ttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtat 108  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35826512 ttgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtat 35826610  T
Q  109 taacttcac 117  Q
    |||||||||    
T  35826611 taacttcac 35826619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 36860577 - 36860461
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||  |    
T  36860577 tgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatact 36860478  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| |||||||||||    
T  36860477 atagtgttaacttcacc 36860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 36866916 - 36866800
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||    
T  36866916 tgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatatt 36866817  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| |||||||||||    
T  36866816 atagtgttaacttcacc 36866800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19120008 - 19119897
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    ||| |||||||| ||||||    
T  19120008 tcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagt 19119909  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     |||||||||||    
T  19119908 gttaacttcacc 19119897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5837711 - 5837593
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  5837711 agtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatg 5837612  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| ||| |||||||    
T  5837611 ctatagtgttaccttcacc 5837593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 39572975 - 39572861
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||     
T  39572975 agtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttata 39572876  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    |||||||||||||||    
T  39572875 ttatagtattaactt 39572861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 114
Target Start/End: Original strand, 43308675 - 43308784
Alignment:
Q  5 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttat 103  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43308675 tagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagt-gggtgttattcattacatttttgatgttat 43308773  T
Q  104 agtattaactt 114  Q
    | | |||||||    
T  43308774 aatgttaactt 43308784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 21088787 - 21088943
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| ||  |    
T  21088787 tgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatact 21088886  T
Q  102 atagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttccaa 159  Q
    | ||| |||||||||||       |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  21088887 acagt-ttaacttcaccaaaaaaagtcattttcgtgacttcatcgtagaattttccaa 21088943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 23116241 - 23116357
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  23116241 agtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatg 23116340  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||| | |||||||||    
T  23116341 ttataatgttaacttca 23116357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 35511496 - 35511612
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||| |||| | ||||||    
T  35511496 agtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatg 35511595  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||| | |||||||||    
T  35511596 ttataatgttaacttca 35511612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27330448 - 27330344
Alignment:
Q  13 ttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  27330448 ttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaa 27330351  T
Q  112 cttcacc 118  Q
    |||||||    
T  27330350 cttcacc 27330344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 14409346 - 14409463
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  14409346 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-agactgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcactacatttttgatg 14409444  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  14409445 ttatagtgttgacttcacc 14409463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15724644 - 15724528
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||  | | ||||||||    
T  15724644 agtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatg 15724547  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  15724546 ttatagtgttaacttcacc 15724528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 8741907 - 8742024
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagt-ggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||  ||| ||||||||     
T  8741907 tgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgc 8742006  T
Q  101 tatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||| |||||||||||    
T  8742007 tatagtgttaacttcacc 8742024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 15992559 - 15992636
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggt 77  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15992559 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668688
Alignment:
Q  2 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 25668705  T
Q  101 tatagtattaacttcacc 118  Q
    || ||| |||||||||||    
T  25668704 ta-agtgttaacttcacc 25668688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7693376 - 7693268
Alignment:
Q  11 tgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtatt 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||    
T  7693376 tgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgtt 7693277  T
Q  110 aacttcacc 118  Q
    |||||||||    
T  7693276 aacttcacc 7693268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40133539 - 40133423
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||  |    
T  40133539 tgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatact 40133440  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||| | |||||||||||    
T  40133439 ataatgttaacttcacc 40133423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 33908389 - 33908271
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| | |||| |||| ||||||||    
T  33908389 agtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatg 33908290  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| || ||||||||    
T  33908289 atatagtgttgacttcacc 33908271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 5830034 - 5829955
Alignment:
Q  24 aattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtta 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5830034 aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttatgtta 5829955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898044
Alignment:
Q  20 gatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaac-agtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaactt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| | || |||||||| |||| |||||||||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactt 11898044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 25500952 - 25501059
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||  |||  ||| |||||||| ||||||    
T  25500952 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagt 25501051  T
Q  107 attaactt 114  Q
     |||||||    
T  25501052 gttaactt 25501059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 42342887 - 42342775
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |  ||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  42342887 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggaa--attttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacatttttgatg 42342790  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    |||||||||||||||    
T  42342789 ttatagtattaactt 42342775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22019788 - 22019670
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||     
T  22019788 agtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgatt 22019689  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  22019688 ctatagttttaacttcacc 22019670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 35504521 - 35504427
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttt 94  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  35504521 agtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttactcattacatttt 35504427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8466900 - 8466783
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||    ||||||||  |||  ||| |||||||||    
T  8466900 agtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagagggggtgttattcacaacacttttgatgt 8466801  T
Q  101 tatagtattaacttcacc 118  Q
    || ||| |||||||||||    
T  8466800 tacagtgttaacttcacc 8466783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 6824498 - 6824599
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactga--acttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttga 97  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||| ||||||    
T  6824498 agtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttga 6824597  T
Q  98 tg 99  Q
    ||    
T  6824598 tg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 28416546 - 28416663
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||  || ||||| ||||||||| |||| ||||  | | |||||||     
T  28416546 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgata 28416645  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  28416646 ttatagtgttaacttcac 28416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23954808 - 23954864
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23954808 agtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatg 23954864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 35934051 - 35933995
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  35934051 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatg 35933995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22255659 - 22255615
Alignment:
Q  72 tggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22255659 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 22255615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Original strand, 26317774 - 26317861
Alignment:
Q  71 gtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttccaa 159  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  26317774 gtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcacc-aaaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttccaa 26317861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8437117 - 8437004
Alignment:
Q  5 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttat 103  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| |||| ||| || | |||    
T  8437117 tagttttgtaaatctgatgg-ttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctat 8437019  T
Q  104 agtattaacttcacc 118  Q
    ||| |||| ||||||    
T  8437018 agtgttaatttcacc 8437004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 116
Target Start/End: Original strand, 13956431 - 13956480
Alignment:
Q  67 aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13956431 aacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttca 13956480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 8043 - 7927
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8043 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatg 7944  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7943 ttatagtgttaacttca 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 10555237 - 10555396
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  10555237 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatg 10555336  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttccaaa 160  Q
    ||||||| |||||||||||       |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10555337 ttatagtgttaacttcacc-aaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccaaa 10555396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 37970554 - 37970672
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37970554 agtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatg 37970653  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  37970654 ttatagtgttaacttcacc 37970672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 1150140 - 1150301
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1150140 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatg 1150239  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttccaaatt 162  Q
    ||||||  |||||||||||       |||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  1150240 ttatagcgttaacttcacc-aaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctaatt 1150301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 6098555 - 6098671
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| |    
T  6098555 tgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgct 6098654  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||||||    
T  6098655 atagtattaacttcacc 6098671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 43643630 - 43643748
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  43643630 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatg 43643729  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  43643730 ttatagtgttaacttcacc 43643748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 23854468 - 23854584
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23854468 tgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgtt 23854567  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| |||||||||||    
T  23854568 atagtgttaacttcacc 23854584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 36695001 - 36695117
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  36695001 agtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgata 36695100  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  36695101 ttatagtgttaacttca 36695117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1205082 - 1204964
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||| |||    
T  1205082 agtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatg 1204983  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  1204982 ttatagtgttaacttcacc 1204964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 16446910 - 16447024
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  16446910 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatg 16447009  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  16447010 ttatagtgttaactt 16447024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 30654618 - 30654736
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  30654618 agtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatg 30654717  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  30654718 ttatagtgttaacttcacc 30654736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 1149667 - 1149762
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacattttt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1149667 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactcattacattttt 1149762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 27082873 - 27082991
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  27082873 agtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatg 27082972  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  27082973 ctatagtgttaacttcacc 27082991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 31933921 - 31934039
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  31933921 agtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgata 31934020  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  31934021 tcatagtgttaacttcacc 31934039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 12876252 - 12876148
Alignment:
Q  13 ttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||| || ||||||| ||||    
T  12876252 ttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaa 12876153  T
Q  112 cttca 116  Q
    |||||    
T  12876152 cttca 12876148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 465997 - 465879
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  465997 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatg 465898  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||| || |||||||||||    
T  465897 ttatcgtgttaacttcacc 465879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9864303 - 9864185
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  9864303 agtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgata 9864204  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||| ||||||    
T  9864203 ctatagtgttaatttcacc 9864185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13307778 - 13307660
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  13307778 agtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatg 13307679  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  13307678 ttatagtgttaacttcacc 13307660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16223018 - 16222900
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   | |||| || |||||| |||    
T  16223018 agtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatg 16222919  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  16222918 ttatagtgttaaattcacc 16222900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34895122 - 34895006
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||| |||| | ||||||    
T  34895122 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatg 34895023  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  34895022 ttatagtgttaacttca 34895006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 38644133 - 38644019
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |  || |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  38644133 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatg 38644034  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  38644033 ttatagtgttaactt 38644019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41362666 - 41362575
Alignment:
Q  5 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacattttt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  41362666 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcactatacaaatagtggggtgttactcactacattttt 41362575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 8803852 - 8803963
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaac-agtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||       | ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8803852 agtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatg 8803944  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  8803945 ttatagtgttaacttcacc 8803963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 11727177 - 11727061
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| || |  ||| ||||||||||    
T  11727177 tgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgtt 11727078  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| |||||||||||    
T  11727077 atagtgttaacttcacc 11727061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 7890992 - 7891059
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7890992 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaa 7891059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 35459746 - 35459813
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35459746 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaa 35459813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 34952066 - 34952180
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||    
T  34952066 agtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatg 34952165  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
     |||||| |||||||    
T  34952166 atatagtgttaactt 34952180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 164
Target Start/End: Original strand, 41911025 - 41911186
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattg-tacaacagt-ggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | || || || ||| |||||||| ||||  ||| ||||||||     
T  41911025 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatga 41911124  T
Q  101 tatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttccaaatttt 164  Q
    ||||||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41911125 tatagtattaacttcaccaaaaaaa-tca-tatcatgacttcatcgtagaattttccaattttt 41911186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 5299981 - 5300097
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| | || |  ||| ||||||||    
T  5299981 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatg 5300080  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
     |||||| |||||||||    
T  5300081 ctatagtgttaacttca 5300097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 39099154 - 39099210
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39099154 agtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatg 39099210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40862551 - 40862456
Alignment:
Q  24 aattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattaca-tttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  40862551 aattgatgataccatgag-actgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcacc 40862456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 44869652 - 44869576
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtgggg 76  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44869652 agtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 33198003 - 33197948
Alignment:
Q  2 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  33198003 gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatg 33197948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 33906367 - 33906316
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttt 52  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33906367 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 1954024 - 1954081
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgat-gatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1954024 agtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatg 1954081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 43025855 - 43025790
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa 68  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  43025855 tgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaa 43025790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 7998449 - 7998401
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaac 49  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  7998449 agtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggggaccgaac 7998401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30055658 - 30055501
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  30055658 agtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgata 30055559  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||| ||||||||| |       |||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  30055558 ttatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 30055501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37110003 - 37109840
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37110003 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatg 37109904  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttccaaatttt 164  Q
    ||||||| |||||||||||       |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  37109903 ttatagtgttaacttcacc-aaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttccaattttt 37109840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 31579094 - 31579217
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta------caacagtggggtgttgctcattacatttt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31579094 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttt 31579193  T
Q  95 tgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  31579194 tgatgttatagtgttaacttcacc 31579217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38258676 - 38258521
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  38258676 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatg 38258577  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttc 156  Q
    ||||||| |||||||||||        ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38258576 ttatagtgttaacttcaccaaaaaaa-tcatttttatgacttcaccgtagaattttc 38258521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27283871 - 27283757
Alignment:
Q  5 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttat 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27283871 tagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttat 27283772  T
Q  104 agtattaacttcacc 118  Q
    ||| |||||||||||    
T  27283771 agtgttaacttcacc 27283757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 7334925 - 7334809
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  7334925 agtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatg 7334826  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7334825 ttatagtgttaacttca 7334809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 17842616 - 17842772
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17842616 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatg 17842715  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||| |||||||||||       |||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  17842716 ttatagtgttaacttcacc-aaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 17842772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18797458 - 18797342
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18797458 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttttatg 18797359  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    |  |||| |||||||||||    
T  18797358 t--tagtgttaacttcacc 18797342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24211872 - 24211754
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24211872 agtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatg 24211773  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  24211772 ttatagtgttaacttcacc 24211754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 32821085 - 32821201
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  32821085 tgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgtt 32821184  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||| | |||||||||||    
T  32821185 atattgttaacttcacc 32821201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 12390660 - 12390778
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  12390660 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatg 12390759  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  12390760 ttatagtgttaacttcacc 12390778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 37347153 - 37347035
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37347153 agtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatg 37347054  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     ||||||||||||||||||    
T  37347053 gtatagtattaacttcacc 37347035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4583048 - 4582932
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||  |    
T  4583048 tgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatact 4582949  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||||||    
T  4582948 atagtattaacttcacc 4582932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10481733 - 10481619
Alignment:
Q  4 gtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagt-ggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  10481733 gtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgtt 10481634  T
Q  102 atagtattaacttca 116  Q
    ||||| |||||||||    
T  10481633 atagtgttaacttca 10481619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21991767 - 21991649
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||   ||| ||||||||    
T  21991767 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatg 21991668  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  21991667 ctatagtgttaacttcacc 21991649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 31520754 - 31520871
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  31520754 agtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatg 31520852  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     ||||||||||||||||||    
T  31520853 gtatagtattaacttcacc 31520871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 5657511 - 5657628
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  5657511 agtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatg 5657610  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  5657611 ttatagtgttaacttcac 5657628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22687370 - 22687254
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  22687370 agtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatg 22687271  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22687270 ttatagtgttaacttca 22687254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11071334 - 11071223
Alignment:
Q  4 gtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtta 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||  || |||||||||| ||    
T  11071334 gtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatatttttgatgata 11071235  T
Q  103 tagtattaactt 114  Q
    ||||| ||||||    
T  11071234 tagtactaactt 11071223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 9355856 - 9355974
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  9355856 agtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatg 9355955  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||| ||||||    
T  9355956 ctatagtgttaaattcacc 9355974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 27421410 - 27421527
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  27421410 agtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattata-ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatg 27421508  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  27421509 ttatagtgttaacttcacc 27421527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 29173671 - 29173553
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||||||     
T  29173671 agtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgata 29173572  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     || ||| |||||||||||    
T  29173571 ctacagtgttaacttcacc 29173553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 41765108 - 41765222
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  41765108 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatg 41765207  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
     ||||||||| ||||    
T  41765208 ctatagtattgactt 41765222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 38053592 - 38053499
Alignment:
Q  26 ttgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38053592 ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcacc 38053499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 32432581 - 32432485
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgat 98  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32432581 tgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttgat 32432485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43686169 - 43686054
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  43686169 tgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatatt 43686071  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| |||||||||||    
T  43686070 atagtgttaacttcacc 43686054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 44413409 - 44413525
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  44413409 agtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatg 44413508  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  44413509 ttatagtgttaacttca 44413525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8861407 - 8861301
Alignment:
Q  10 ttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtat 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||| |||||| |    
T  8861407 ttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgt 8861308  T
Q  109 taacttc 115  Q
    |||||||    
T  8861307 taacttc 8861301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23111321 - 23111203
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||  | ||||||||||    
T  23111321 agtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatg 23111222  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23111221 ttatagtgttaacttcacc 23111203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 26980454 - 26980336
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  26980454 agtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatg 26980355  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||| | |||||||||||    
T  26980354 ctataatgttaacttcacc 26980336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 33688292 - 33688406
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || || || |||||| || |||| ||||| ||| ||||||||    
T  33688292 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatg 33688391  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  33688392 ttatagtgttaactt 33688406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 15612789 - 15612905
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  15612789 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataaca-ctttgatg 15612887  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  15612888 ttatagtgttaacttcac 15612905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 48928334 - 48928444
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||    
T  48928334 tcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagt 48928432  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     || ||||||||    
T  48928433 gttgacttcacc 48928444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 48928601 - 48928711
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||    
T  48928601 tcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagt 48928699  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     || ||||||||    
T  48928700 gttgacttcacc 48928711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12165883 - 12165765
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||| ||||    
T  12165883 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatg 12165784  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  12165783 ctatagtgttaacttcacc 12165765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6546648 - 6546533
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||   ||| |||||||| |    
T  6546648 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgct 6546549  T
Q  102 atagtattaacttcac 117  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6546548 atagtgttaacttcac 6546533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524475
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || || |||| ||| |||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     ||||| |||||    
T  26524464 gttaacatcacc 26524475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35353235 - 35353121
Alignment:
Q  6 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactg-aacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||  ||| |||| |||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||    
T  35353235 agtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctat 35353136  T
Q  104 agtattaacttcacc 118  Q
    ||| || ||||||||    
T  35353135 agtgttgacttcacc 35353121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 10359245 - 10359308
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta 65  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  10359245 agtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactat-cagactgaacttttgatgtcactgta 10359308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 37704288 - 37704241
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37704288 agtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 43925232 - 43925167
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtaca 67  Q
    |||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43925232 agtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtaca 43925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 44598795 - 44598741
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  44598795 tgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatg 44598741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362292
Alignment:
Q  27 tgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaactt 114  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 34362292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 15672792 - 15672830
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 39  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15672792 agtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362195
Alignment:
Q  18 ctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgt 64  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgccattgt 34362195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 69
Target Start/End: Original strand, 46481177 - 46481219
Alignment:
Q  27 tgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaac 69  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46481177 tgatgatactatggggattgaatttttgatgtcattgtacaac 46481219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1945990 - 1945833
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1945990 agtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatg 1945891  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||| |||||||||||       |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1945890 ttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttcc 1945833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5627547 - 5627391
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  5627547 agtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatg 5627448  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||| |||||||||||       |||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  5627447 ttatagtgttaacttcacc-aaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcc 5627391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 4318851 - 4318969
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  4318851 agtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatg 4318950  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4318951 ttatagtgttaacttcacc 4318969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 7055243 - 7055361
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || |||| |||||| |||    
T  7055243 agtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatg 7055342  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  7055343 ttatagtgttaacttcacc 7055361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8513389 - 8513271
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||     
T  8513389 agtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgata 8513290  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  8513289 ttatagtgttaacttcacc 8513271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 33893031 - 33893147
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  33893031 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatg 33893129  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  33893130 ttatagtgttaacttcac 33893147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 29182319 - 29182203
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  29182319 agtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatg 29182220  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  29182219 ttatagtgttaacttca 29182203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 3879974 - 3880085
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||| |||||||  |||| |    
T  3879974 tcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataat 3880073  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     |||||||||||    
T  3880074 gttaacttcacc 3880085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 7235063 - 7235180
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  7235063 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatg-agactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatg 7235161  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  7235162 ttatagtgttgacttcacc 7235180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15491764 - 15491654
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| | |    
T  15491764 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaat 15491665  T
Q  107 attaacttcac 117  Q
     ||||||||||    
T  15491664 gttaacttcac 15491654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6089057 - 6088946
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||| ||||  ||| |||||||  ||||||    
T  6089057 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagt 6088958  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     |||||||||||    
T  6088957 gttaacttcacc 6088946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 6091211 - 6091313
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  6091211 agtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttttatg 6091310  T
Q  100 tta 102  Q
    |||    
T  6091311 tta 6091313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 21017147 - 21017207
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa 68  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21017147 tcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaa 21017207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 33618990 - 33618934
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33618990 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatg 33618934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498471
Alignment:
Q  26 ttgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagt-ggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcacc 18498471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20768233 - 20768184
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20768233 tcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatg 20768184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 30353386 - 30353504
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| || ||||||| ||||| | | || |||   ||| ||||||||    
T  30353386 agtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaacagtgagatattactcgcaacacttttgatg 30353485  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  30353486 ttataatgttaacttcacc 30353504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 20373325 - 20373443
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20373325 agtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcgttacatttttgatg 20373424  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20373425 ttatagtattaacttcacc 20373443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 3655231 - 3655345
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3655231 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatg 3655330  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  3655331 ttatagtgttaactt 3655345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 4761678 - 4761796
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  4761678 agtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgata 4761777  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4761778 ttatagtattaacttcacc 4761796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 42506104 - 42506210
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  42506104 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatg 42506203  T
Q  100 ttatagt 106  Q
    |||||||    
T  42506204 ttatagt 42506210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 51213010 - 51213128
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51213010 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatg 51213109  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  51213110 ttacagtgttaacttcacc 51213128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 40552288 - 40552403
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40552288 agtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatg 40552387  T
Q  100 ttatagtattaacttc 115  Q
    ||||||| ||||||||    
T  40552388 ttatagtgttaacttc 40552403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 47481669 - 47481551
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47481669 agtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatg 47481570  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  47481569 ttatagtgttaacttcacc 47481551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 37203214 - 37203098
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  37203214 agtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatg 37203115  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  37203114 ttatagtgttaacttca 37203098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 37157854 - 37157739
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  37157854 agtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtacaacagtggggtgttactcactacaattttgatgt 37157755  T
Q  101 tatagtattaacttca 116  Q
    |||||| |||||||||    
T  37157754 tatagtgttaacttca 37157739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 26941289 - 26941407
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||     
T  26941289 agtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgatt 26941388  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  26941389 ttatagtgttaacttcacc 26941407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 48355088 - 48354970
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||     
T  48355088 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaata 48354989  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  48354988 ttatagtgttaacttcacc 48354970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35844473 - 35844317
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||    
T  35844473 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttg 35844374  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||| |||||||||||       |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  35844373 ttatagtgttaacttcacc-agaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 35844317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 21009831 - 21009937
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21009831 agtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatg 21009930  T
Q  100 ttatagt 106  Q
    |||||||    
T  21009931 ttatagt 21009937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44454582 - 44454513
Alignment:
Q  158 aaattttatgtgtgttaatgaaaattaacggtagaagctagctatggattctctatgtatgcatgcatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44454582 aaattttatgtgtgttaatgaaaattaacggtagaagctagctatggattctctatgtatgcatgcatgt 44454513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 29099502 - 29099384
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  29099502 agtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatg 29099403  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  29099402 ttatagtgttaacttcacc 29099384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 46297791 - 46297909
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  46297791 agtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatg 46297890  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  46297891 ttatagtgttaacttcacc 46297909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 34133082 - 34132964
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  34133082 agtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgata 34132983  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||| ||||||    
T  34132982 ctatagtgttaatttcacc 34132964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 24708146 - 24708246
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| | || |||||||||    
T  24708146 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtac-acagtgaggtgttactcactgcagttttgatgt 24708244  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  24708245 ta 24708246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11466971 - 11466855
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||  ||||    
T  11466971 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatg 11466872  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  11466871 ttatagtcttaacttca 11466855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 52040951 - 52041070
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aaca-gtggggtgttgctcattacatttttgat 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  ||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  52040951 agtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgat 52041050  T
Q  99 gttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52041051 gttatagtattaacttcacc 52041070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 44186530 - 44186648
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  44186530 agtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatg 44186629  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  44186630 ctatagtgttaacttcacc 44186648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 4015600 - 4015491
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||    
T  4015600 tcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagt 4015501  T
Q  107 attaacttca 116  Q
     |||||||||    
T  4015500 gttaacttca 4015491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 11357395 - 11357512
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagt-ggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| |||| || | ||||||||     
T  11357395 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgc 11357494  T
Q  101 tatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||| |||||||||||    
T  11357495 tatagtgttaacttcacc 11357512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 53176201 - 53176134
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  53176201 agtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaa 53176134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 7327511 - 7327617
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  7327511 agtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatg 7327610  T
Q  100 ttatagt 106  Q
    |||||||    
T  7327611 ttatagt 7327617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40936138 - 40936020
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||| |||   ||| ||||||||    
T  40936138 agtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatg 40936039  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  40936038 ctatagtgttaacttcacc 40936020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 22446093 - 22446247
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggact-gaacttttgatgtcattgtacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  22446093 agtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaaagtggggtgttactcactatatttttgatg 22446192  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattt 154  Q
     |||| | |||||||||||       |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22446193 atataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattt 22446247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 24488991 - 24489108
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||  |||||||| ||     
T  24488991 agtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaata 24489090  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
     |||||| ||||||||||    
T  24489091 ctatagtcttaacttcac 24489108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 46994690 - 46994797
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||| ||||||||| |||||||||    
T  46994690 agtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta---------tgtgttactcattaca-ttttgatgt 46994779  T
Q  101 tatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46994780 tatagtattaacttcacc 46994797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 53229183 - 53229300
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtg-gggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||||     
T  53229183 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgc 53229282  T
Q  101 tatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  53229283 tatagtgttaatttcacc 53229300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 54505954 - 54505839
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaac-agtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| || ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54505954 agtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatg 54505856  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  54505855 ttatagtgttaacttca 54505839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 45174650 - 45174532
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgct--cattacatttttgatg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||  ||||| ||  ||  ||| ||||||||    
T  45174650 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatg 45174551  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  45174550 ttatagtgttaacttcacc 45174532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3362400 - 3362282
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||| |||| |||| || |||| |||||    
T  3362400 agtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatg 3362301  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  3362300 ctatagtgttaacttcacc 3362282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22451115 - 22450997
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||| |||| | |||| |||| ||||||||    
T  22451115 agtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatg 22451016  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| || ||||||||    
T  22451015 ctatagtgttgacttcacc 22450997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 27480408 - 27480514
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | || || | ||||||| | ||||||||    
T  27480408 agtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatg 27480507  T
Q  100 ttatagt 106  Q
    |||||||    
T  27480508 ttatagt 27480514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2008073 - 2007964
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||| | | ||||||    
T  2008073 tcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagt 2007974  T
Q  107 attaacttca 116  Q
     |||||||||    
T  2007973 gttaacttca 2007964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 38591845 - 38591776
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaaca 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38591845 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaaca 38591776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21193751 - 21193655
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgat 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  21193751 tgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 21193655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 44891644 - 44891535
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||        | |||||||| |||| ||||  ||| |||||||||    
T  44891644 agtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatg--------ccacagtgggatgttactcacaacacttttgatgt 44891553  T
Q  101 tatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||| |||||||||||    
T  44891552 tatagtgttaacttcacc 44891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 33378814 - 33378873
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33378814 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtca 33378873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 39282799 - 39282689
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  39282799 agtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactca-cacagttttgatg 39282701  T
Q  100 ttatagtattaa 111  Q
    ||||||| ||||    
T  39282700 ttatagtgttaa 39282689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 54828730 - 54828843
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattg-tacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  54828730 agtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattacattttt-atg 54828828  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  54828829 ttatagtgttaactt 54828843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Original strand, 43975926 - 43976033
Alignment:
Q  10 ttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||| || ||||| ||| | |||| |||| |||||||| |||||| |    
T  43975926 ttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgt 43976025  T
Q  109 taacttca 116  Q
    | ||||||    
T  43976026 tgacttca 43976033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29163965 - 29163912
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttg 54  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29163965 agtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 43348404 - 43348320
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctca 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  43348404 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaagactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtgttgctca 43348320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 14586699 - 14586763
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta 65  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||| ||||    
T  14586699 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgta 14586763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25579886 - 25579768
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| | |||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||| |  ||||  |||  ||| ||||||||    
T  25579886 agtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatg 25579787  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     ||||||||||||||||||    
T  25579786 ctatagtattaacttcacc 25579768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 39
Target Start/End: Original strand, 53811695 - 53811729
Alignment:
Q  5 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811695 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 53811729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 33698300 - 33698265
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 36  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698300 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 113
Target Start/End: Original strand, 41585407 - 41585449
Alignment:
Q  71 gtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaact 113  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41585407 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 41585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 22622747 - 22622780
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 34  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22622747 agtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 33698263 - 33698218
Alignment:
Q  72 tggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33698263 tggggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcac 33698218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 33551033 - 33551150
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33551033 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatg 33551132  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  33551133 ttatagtgttaacttcac 33551150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 37905864 - 37905746
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  37905864 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatg 37905765  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  37905764 ttatagtgttaacttcacc 37905746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 43648292 - 43648410
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43648292 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatg 43648391  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  43648392 ttatagtgttaacttcacc 43648410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3177095 - 3176979
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||  |||||||||||     
T  3177095 agtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgata 3176996  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    |||||||||||||||||    
T  3176995 ttatagtattaacttca 3176979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 11366430 - 11366546
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11366430 tgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgtt 11366529  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  11366530 atagtgttaatttcacc 11366546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 19289370 - 19289486
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19289370 agtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatg 19289469  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  19289470 ttatagtgttaacttca 19289486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 27349986 - 27350103
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  27349986 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatg 27350084  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  27350085 ctatagtgttaacttcacc 27350103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4478525 - 4478407
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  4478525 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatg 4478426  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4478425 ttatagtgttaacttcacc 4478407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 29242185 - 29242303
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| | || || |||||| |||    
T  29242185 agtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatg 29242284  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  29242285 ttatagttttaacttcacc 29242303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 36642142 - 36642024
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||   ||| ||||||||    
T  36642142 agtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatg 36642043  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  36642042 ctatagtattaatttcacc 36642024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13711618 - 13711502
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||  ||| |||||||| |    
T  13711618 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgct 13711519  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||| | |||||||||||    
T  13711518 ataatgttaacttcacc 13711502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 17054143 - 17054261
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   || | ||||||||||||||||||||| || || | |||| || | |||||||||||||    
T  17054143 agtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatg 17054242  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17054243 ttatagtattaacttcacc 17054261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 33902218 - 33902106
Alignment:
Q  5 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttat 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||  |    
T  33902218 tagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttatgt--t 33902121  T
Q  104 agtattaacttcacc 118  Q
    ||| |||||||||||    
T  33902120 agtgttaacttcacc 33902106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 41463904 - 41464015
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||| |||||||    
T  41463904 tcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagt 41464003  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
    ||||||||||||    
T  41464004 attaacttcacc 41464015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 43770893 - 43771004
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  43770893 tcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagt 43770992  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     |||||||||||    
T  43770993 gttaacttcacc 43771004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4763787 - 4763681
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  4763787 agtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttg 4763688  T
Q  100 ttatagt 106  Q
     ||||||    
T  4763687 atatagt 4763681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 17071784 - 17071902
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaac-agtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||  | || | |||| || | |||||||||| ||    
T  17071784 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttg 17071883  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  17071884 ttatagtgttaacttcacc 17071902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 41960996 - 41960939
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41960996 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 41960939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4167076 - 4166960
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||  |    
T  4167076 tgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatact 4166977  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||| | |||||||||||    
T  4166976 ataatgttaacttcacc 4166960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 19424682 - 19424793
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||  |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  19424682 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagt 19424781  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     |||||||||||    
T  19424782 gttaacttcacc 19424793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 33709286 - 33709397
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||   ||| |||||||||||||||    
T  33709286 tcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagt 33709385  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     |||||||||||    
T  33709386 gttaacttcacc 33709397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 31570781 - 31570899
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgt-acaacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||||||| || |  ||| |||| |||    
T  31570781 agtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatg 31570880  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  31570881 ttatagtgttaatttcacc 31570899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 33660415 - 33660529
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  33660415 agtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatg 33660514  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  33660515 ttatagtgttaactt 33660529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 35959022 - 35958908
Alignment:
Q  44 ctgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttc 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||       |||||| ||||||||||    
T  35959022 ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcacc-aaaaaagtcatttttatgacttc 35958924  T
Q  143 atcgtagaattttcca 158  Q
    ||| ||||||||||||    
T  35958923 atcatagaattttcca 35958908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 39167410 - 39167495
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctca 85  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  39167410 agtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactca 39167495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 4264124 - 4264280
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||    
T  4264124 agtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatg 4264223  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
     |||||| ||||||| |||       |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  4264224 ctatagtgttaactttacc-agaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcc 4264280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26357726 - 26357617
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  26357726 tcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagt 26357627  T
Q  107 attaacttca 116  Q
     |||||||||    
T  26357626 gttaacttca 26357617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Original strand, 2325442 - 2325534
Alignment:
Q  26 ttgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcac 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  2325442 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcac 2325534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5881693 - 5881610
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctca 85  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  5881693 tgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactca 5881610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 45327876 - 45327817
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtca 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45327876 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtca 45327817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19314007 - 19313890
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  || |||  |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  19314007 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatg 19313909  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||| | |||||||||||    
T  19313908 ctataatgttaacttcacc 19313890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 44286105 - 44285989
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||| | | ||||||   ||| ||||||||    
T  44286105 agtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatg 44286006  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
     |||||| |||||||||    
T  44286005 ctatagtgttaacttca 44285989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 18494327 - 18494385
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtc 59  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18494327 agtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 18494385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051308
Alignment:
Q  12 gttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 41051308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 31862008 - 31861948
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||    
T  31862008 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgatatcat 31861948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 44913819 - 44913700
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gtggactgaacttttgatgtcattgtacaa--cagtggggtgttgctcattacatttttga 97  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||   |||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  44913819 agtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttga 44913720  T
Q  98 tgttatagtattaacttcac 117  Q
    |  || ||| ||||||||||    
T  44913719 tactacagtgttaacttcac 44913700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 7006968 - 7007053
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctca 85  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  7006968 agtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtgggatgttactca 7007053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Original strand, 19501795 - 19501839
Alignment:
Q  10 ttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19501795 ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 41465652 - 41465602
Alignment:
Q  6 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgat 56  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  41465652 agtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgat 41465602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 19089508 - 19089624
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  19089508 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgata 19089607  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  19089608 ttatagtgttaacttca 19089624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 55477946 - 55478068
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-----aacagtggggtgttgctcattacattttt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  55477946 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacattttt 55478045  T
Q  96 gatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  55478046 gatgttatagtgttaacttcacc 55478068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 37663796 - 37663898
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  37663796 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaatg 37663895  T
Q  100 tta 102  Q
    |||    
T  37663896 tta 37663898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42199885 - 42199767
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| || | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  42199885 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatg 42199786  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42199785 ttatagtattaacttcacc 42199767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 19440703 - 19440821
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  19440703 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatg 19440802  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  19440803 ttatagtgttaacatcacc 19440821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25184269 - 25184151
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  25184269 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatg 25184170  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  25184169 ttatagtgttaacttcacc 25184151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 36493743 - 36493861
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  36493743 agtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatg 36493842  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     ||||||||||||||||||    
T  36493843 gtatagtattaacttcacc 36493861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 25701112 - 25701226
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  25701112 agtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatg 25701211  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||| | |||||||    
T  25701212 ttataatgttaactt 25701226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Original strand, 879604 - 879721
Alignment:
Q  2 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  879604 gtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgt 879703  T
Q  101 tatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||| || ||||||||    
T  879704 tatagtgtttacttcacc 879721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23761228 - 23761114
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  23761228 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatg 23761129  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  23761128 ttatagtgttaactt 23761114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 49376116 - 49375965
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||| |    
T  49376116 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataat 49376017  T
Q  107 attaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcca 158  Q
     |||||||||||       |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  49376016 gttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcca 49375965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27396772 - 27396654
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  27396772 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatg 27396673  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||| | |||||||||||    
T  27396672 ctataatgttaacttcacc 27396654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 29584267 - 29584371
Alignment:
Q  13 ttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  29584267 ttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaa 29584364  T
Q  112 cttcacc 118  Q
    |||||||    
T  29584365 cttcacc 29584371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 32912635 - 32912791
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaac-agtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||| |||||  | | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32912635 agtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatg 32912734  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||| |||||||||||       |||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  32912735 ttatagtgttaacttcacc-aaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 32912791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 34361547 - 34361702
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  34361547 agtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatg 34361645  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||| |||||||||||       |||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  34361646 ttatagtgttaacttcacc-aaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 34361702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 34948152 - 34948267
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  34948152 agtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatg 34948251  T
Q  100 ttatagtattaacttc 115  Q
    ||||||| ||||||||    
T  34948252 ttatagtgttaacttc 34948267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 38012010 - 38011892
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |  ||| |||| ||||||||    
T  38012010 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatg 38011911  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  38011910 ttatagtgttgacttcacc 38011892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 50697397 - 50697281
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  50697397 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatg 50697299  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| || |||||||    
T  50697298 ttatagtgtttacttcac 50697281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6864189 - 6864073
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| || ||| || ||||  |||||| ||||||||||||    
T  6864189 tgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgtt 6864090  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    |||||  ||||||||||    
T  6864089 atagtgataacttcacc 6864073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17167869 - 17167753
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  17167869 agtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgata 17167770  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||| | |||||||||    
T  17167769 ttataatgttaacttca 17167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17173446 - 17173330
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  17173446 agtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgata 17173347  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||| | |||||||||    
T  17173346 ttataatgttaacttca 17173330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 46888212 - 46888328
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  46888212 agtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatg 46888311  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    |||||||||||||||||    
T  46888312 ttatagtattaacttca 46888328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 35021090 - 35021208
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  35021090 agtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatg 35021189  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  35021190 ttataatgttaacttcacc 35021208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 50764884 - 50764784
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  50764884 tgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 50764785  T
Q  102 a 102  Q
    |    
T  50764784 a 50764784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 54499300 - 54499412
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcatt-gtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatag 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||    
T  54499300 tcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatag 54499399  T
Q  106 tattaacttcacc 118  Q
    | |||||||||||    
T  54499400 tgttaacttcacc 54499412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4598148 - 4598031
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  |||  |||||||    
T  4598148 agtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca-ctttgatg 4598050  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4598049 ttatagtgttaacttcacc 4598031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 28003041 - 28003159
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||| ||||||||    
T  28003041 agtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatg 28003140  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| || ||||||||    
T  28003141 ctatagtgttgacttcacc 28003159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Original strand, 55241174 - 55241276
Alignment:
Q  16 atctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||   ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  55241174 atctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaactt 55241273  T
Q  115 cac 117  Q
    |||    
T  55241274 cac 55241276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 118
Target Start/End: Original strand, 5048025 - 5048138
Alignment:
Q  6 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttata 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||  | |||| |||| |||||||||||||    
T  5048025 agtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttata 5048124  T
Q  105 gtattaacttcacc 118  Q
    |  || ||||||||    
T  5048125 gagttgacttcacc 5048138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9139401 - 9139316
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctca 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  9139401 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactca 9139316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 33341547 - 33341475
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgtt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  33341547 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtt 33341475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 4934257 - 4934353
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagt-ggggtgttgctcattacattttt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  4934257 agtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggtgttactcactacattttt 4934353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7703647 - 7703555
Alignment:
Q  27 tgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7703647 tgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacc 7703555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 37775823 - 37775707
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||     
T  37775823 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggg--ggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaata 37775726  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  37775725 ttatagtgctaacttcacc 37775707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 32592247 - 32592169
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgtt 80  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||    
T  32592247 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgtt 32592169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39398051 - 39397956
Alignment:
Q  24 aattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  39398051 aattgatgatactgagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcacc 39397956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 1815455 - 1815409
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaac 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1815455 tgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37287862 - 37287776
Alignment:
Q  29 atgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaactt 114  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37287862 atgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 37287776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3042726 - 3042649
Alignment:
Q  42 gactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  3042726 gactgaatttttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaacttcacc 3042649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 33816595 - 33816644
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33816595 tcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatg 33816644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Original strand, 30002705 - 30002797
Alignment:
Q  27 tgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||  ||| |||||||| || ||| |||||||||||    
T  30002705 tgatgatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcacc 30002797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Original strand, 35025669 - 35025761
Alignment:
Q  27 tgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  35025669 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcacc 35025761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 47253878 - 47253787
Alignment:
Q  27 tgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgta-caacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  47253878 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaat-gggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcacc 47253787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 53124372 - 53124325
Alignment:
Q  71 gtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53124372 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcacc 53124325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4396411 - 4396365
Alignment:
Q  71 gtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcac 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4396411 gtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 4396365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205156
Alignment:
Q  52 ttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttca 4205156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 17272108 - 17272067
Alignment:
Q  13 ttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  17272108 ttaatctgatgaattgatgatacta----gactgaacttttgatgt 17272067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 28564805 - 28564921
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  28564805 agtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatg 28564904  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  28564905 ttatagtgttaacttca 28564921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10922879 - 10922761
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  10922879 agtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatg 10922780  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  10922779 ttatagtgttaacttcacc 10922761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18422803 - 18422647
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  18422803 agtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatg 18422704  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||| |||||||||||       |||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  18422703 ttatagtgttaacttcacc-aaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 18422647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15752181 - 15752063
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||| |||    
T  15752181 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatg 15752082  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  15752081 ttatagtgttaacttcacc 15752063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8222280 - 8222127
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8222280 agtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt--aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgt 8222183  T
Q  101 tatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    |||||| ||||||||| |       |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8222182 tatagtgttaacttca-ctaaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaattttcc 8222127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15383085 - 15382967
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15383085 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatg 15382986  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  15382985 ttatagtgttaatttcacc 15382967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32267186 - 32267069
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32267186 agtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatg 32267087  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  32267086 ttatattgttaacttcac 32267069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 51129011 - 51128894
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  51129011 agtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatg 51128912  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  51128911 ttatagtgttaacttcac 51128894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 9903078 - 9903194
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||    
T  9903078 agtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatg 9903177  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  9903178 ttatagtgttaacttca 9903194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 19899793 - 19899949
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  19899793 agtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatg 19899892  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||| |||||||||||        ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19899893 ttatagtgttaacttcaccaaaaaaa-tcattattatgacttcaccatagaattttcc 19899949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 48620789 - 48620672
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  48620789 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatg 48620690  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  48620689 ttatattgttaacttcac 48620672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2959900 - 2959784
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  2959900 agtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatg 2959801  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  2959800 ttatagtgttaacttca 2959784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28769804 - 28769688
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28769804 agtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggtgggtgttactcattacatttttgatgt 28769705  T
Q  101 tatagtattaacttcac 117  Q
     ||||| ||||||||||    
T  28769704 catagtgttaacttcac 28769688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 30254571 - 30254460
Alignment:
Q  5 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||||||||||||    
T  30254571 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattactcattacatttttgatgttat 30254473  T
Q  104 agtattaacttca 116  Q
    | | |||||||||    
T  30254472 attgttaacttca 30254460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32216203 - 32216089
Alignment:
Q  5 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttat 103  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32216203 tagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttat 32216104  T
Q  104 agtattaacttcacc 118  Q
    ||| |||||||||||    
T  32216103 agtgttaacttcacc 32216089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37451437 - 37451324
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||||    
T  37451437 agtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatg 37451339  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  37451338 ttatagtgttaactt 37451324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 30326976 - 30327093
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||    
T  30326976 agtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatg 30327075  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  30327076 ttatagtgttaaattcac 30327093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 46931563 - 46931446
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| | || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  46931563 agtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatg 46931464  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  46931463 ttatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 27763335 - 27763451
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaacagtggggtgttgctcattacatttttgatgt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27763335 agtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaactatgggtgttactcattacatttttgatgt 27763434  T
Q  101 tatagtattaacttcac 117  Q
    |||||| ||||||||||    
T  27763435 tatagtgttaacttcac 27763451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 37618916 - 37619038
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg--atactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtg--ttgctcattacattttt 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  37618916 agtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaattttt 37619015  T
Q  96 gatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  37619016 gatgttatagtgttaacttcacc 37619038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 41926315 - 41926199
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |||| || ||||||||||    
T  41926315 agtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatg 41926216  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    |||||||||||||||||    
T  41926215 ttatagtattaacttca 41926199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23999499 - 23999381
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  23999499 agtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatg 23999400  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    || |||| |||||||||||    
T  23999399 ttgtagtgttaacttcacc 23999381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42721191 - 42721073
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| |||    
T  42721191 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatg 42721092  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||   ||||||||||    
T  42721091 atatagggctaacttcacc 42721073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 10182032 - 10182150
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| | || || |||||| |||    
T  10182032 agtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatg 10182131  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  10182132 ttacagttttaacttcacc 10182150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 47279341 - 47279223
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||     
T  47279341 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgata 47279242  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||| | |||||||||||    
T  47279241 gtataatgttaacttcacc 47279223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 34012401 - 34012517
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||| |||| | ||||||    
T  34012401 agtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatg 34012500  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||||| |||||||||    
T  34012501 ttatagtgttaacttca 34012517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289729
Alignment:
Q  9 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacattttt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttt 21289729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 27267223 - 27267318
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacattttt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  27267223 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttt 27267318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 11742375 - 11742492
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||| |||||||     
T  11742375 agtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgata 11742473  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  11742474 atatagtgttaacttcacc 11742492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 38823366 - 38823252
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||   ||| ||||||||    
T  38823366 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatg 38823267  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
     |||||| |||||||    
T  38823266 ctatagtgttaactt 38823252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 27563929 - 27564046
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||| || |||||| | |    
T  27563929 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatatttttaaag 27564028  T
Q  100 ttatagtattaacttcac 117  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  27564029 ttatagtgttaacttcac 27564046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 7079087 - 7079167
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgtt 80  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7079087 agtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgtt 7079167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3535082 - 3534967
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| || || ||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  3535082 tgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgtt 3534983  T
Q  102 atagtattaacttcac 117  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3534982 atagtgttaacttcac 3534967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16415798 - 16415679
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtg-gggtgttgctcattacatttttgat 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||| || |  ||||||| |||| |||| |||||||    
T  16415798 agtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgat 16415699  T
Q  99 gttatagtattaacttcacc 118  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  16415698 gctatagtgttaacttcacc 16415679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25160784 - 25160717
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa 68  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25160784 agtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaa 25160717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 27227509 - 27227576
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27227509 agtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaa 27227576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40884958 - 40884847
Alignment:
Q  8 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||    
T  40884958 tcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggt 40884859  T
Q  107 attaacttcacc 118  Q
     || ||||||||    
T  40884858 gttgacttcacc 40884847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 238537 - 238654
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||  |||||||| ||     
T  238537 agtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaata 238635  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  238636 ctatagtgttaacttcacc 238654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3309299 - 3309186
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  3309299 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatg 3309201  T
Q  100 ttatagtattaactt 114  Q
    ||||||| |||||||    
T  3309200 ttatagtgttaactt 3309186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14758193 - 14758075
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||| | ||| | |||| |||| ||||||||    
T  14758193 agtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatg 14758094  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  14758093 ttatagtgttgacttcacc 14758075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 27533004 - 27533122
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaac-agtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||  |||||| |||| | ||  | | ||||||||    
T  27533004 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatg 27533103  T
Q  100 ttatagtattaacttcacc 118  Q
     |||||| |||||||||||    
T  27533104 ctatagtgttaacttcacc 27533122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 31621577 - 31621735
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| || || |||||| | |||| ||||  |||||||    
T  31621577 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatg 31621676  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttccaa 159  Q
    ||||||| || |||||| |       |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  31621677 ttatagtgttgacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccaa 31621735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15168243 - 15168192
Alignment:
Q  6 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15168243 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 15168192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Original strand, 47682520 - 47682614
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggg-gtgttgctcattacattttt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  47682520 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttt 47682614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 33725624 - 33725680
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 57  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33725624 agtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 33725680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4330433 - 4330326
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagt-ggggtgttgctcattacatttttgat 98  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||||| |||| | |||||||| |||| |||| |||||||    
T  4330433 agtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgat 4330334  T
Q  99 gttatagt 106  Q
    | ||||||    
T  4330333 gctatagt 4330326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1547413 - 1547321
Alignment:
Q  27 tgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa-cagtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1547413 tgatgatactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcacc 1547321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39393535 - 39393419
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| |||| ||  || || ||||  ||| ||||||||    
T  39393535 agtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatg 39393436  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
     |||||| |||||||||    
T  39393435 ctatagtgttaacttca 39393419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22170863 - 22170806
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 58  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22170863 agtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatgt 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30254926 - 30254854
Alignment:
Q  84 cattacatttttgatgttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttcc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |       |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30254926 cattacatttttgatgttatagtgttaacttcatc-aaaaaagtcattattatgacttcaccatagaattttcc 30254854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 68
Target Start/End: Original strand, 1359933 - 1359974
Alignment:
Q  27 tgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtacaa 68  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1359933 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcattatacaa 1359974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 44111 - 43995
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44111 tgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatatt 44012  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||  |||||||||||    
T  44011 atagcgttaacttcacc 43995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 154676 - 154792
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  154676 tgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatatt 154775  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    ||||  |||||||||||    
T  154776 atagcgttaacttcacc 154792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 146045 - 146204
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  146045 agtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatg 146144  T
Q  100 ttatagtattaacttcaccnnnnnnngtcattattatgacttcatcgtagaattttccaaa 160  Q
    ||||| | ||||||| |||        ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  146145 ttataatgttaacttaaccaaaaaaa-tcattcttatgacttcaccgtagaatttttcaaa 146204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 94412 - 94528
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  94412 agtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatg 94511  T
Q  100 ttatagtattaacttca 116  Q
    ||||| | |||||||||    
T  94512 ttataatgttaacttca 94528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 408458 - 408559
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  408458 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacatttttgatg 408556  T
Q  100 tta 102  Q
    |||    
T  408557 tta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 172
Alignment:
Q  3 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac-aacagtggggtgttgctcattacatttttgatgtt 101  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||  |    
T  288 tgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatact 189  T
Q  102 atagtattaacttcacc 118  Q
    | ||| |||||||||||    
T  188 acagtgttaacttcacc 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 12065 - 12010
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgat 56  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12065 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgat 12010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 267440 - 267333
Alignment:
Q  1 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgtcattgtac--aacagtggggtgttgctcattacatttttgat 98  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||| || |||||  |||||| || |||| |||| || |||||||||    
T  267440 agtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgat 267341  T
Q  99 gttatagt 106  Q
    | ||||||    
T  267340 gctatagt 267333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42434 - 42386
Alignment:
Q  70 agtggggtgttgctcattacatttttgatgttatagtattaacttcacc 118  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  42434 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacc 42386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University