View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16734_high_1 (Length: 421)

Name: NF16734_high_1
Description: NF16734
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16734_high_1
NF16734_high_1
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (19-421)||(26655929-26656331)
chr6 (19-421)||(26761900-26762302)
chr6 (19-421)||(27337910-27338312)
chr6 (19-421)||(27398650-27399052)
chr6 (25-418)||(25579662-25580055)
chr6 (25-418)||(26055869-26056262)
chr6 (25-418)||(26075839-26076232)
chr6 (25-418)||(26142808-26143201)
chr6 (25-418)||(25481685-25482078)
chr6 (25-418)||(25538483-25538876)
chr6 (122-418)||(26048788-26049084)
chr6 (122-418)||(26069957-26070253)
chr6 (25-417)||(26646423-26646815)
chr6 (25-417)||(26752391-26752783)
chr6 (32-418)||(27718237-27718623)
chr6 (32-418)||(27610860-27611246)
chr6 (32-421)||(26802382-26802771)
chr6 (180-418)||(27698500-27698738)
chr6 (25-418)||(26884106-26884501)
chr6 (157-418)||(27724828-27725089)
chr6 (25-421)||(28781079-28781475)
chr6 (173-418)||(27531196-27531441)
chr6 (246-421)||(27229172-27229347)
chr6 (171-421)||(27593017-27593267)
chr6 (25-418)||(28786221-28786614)
chr6 (25-418)||(28792342-28792735)
chr6 (173-418)||(27678889-27679134)
chr6 (37-421)||(26823780-26824164)
chr6 (105-418)||(26622919-26623232)
chr6 (105-418)||(26728897-26729210)
chr6 (171-421)||(27604702-27604952)
chr6 (171-421)||(31284228-31284478)
chr6 (173-421)||(27677613-27677861)
chr6 (212-421)||(27706440-27706649)
chr6 (61-319)||(27427493-27427751)
chr6 (159-339)||(28139563-28139743)
chr6 (25-418)||(26861559-26861949)
chr6 (187-346)||(28149953-28150111)
chr6 (233-394)||(28234531-28234692)
chr6 (142-379)||(26937076-26937313)
chr6 (226-345)||(26341986-26342105)
chr6 (92-418)||(26848603-26848929)
chr6 (226-346)||(28181129-28181249)
chr6 (31-346)||(28185381-28185696)
chr6 (226-345)||(28242820-28242939)
chr6 (226-354)||(28226957-28227085)
chr6 (31-277)||(26949745-26949991)
chr6 (25-280)||(27214498-27214756)
chr6 (25-280)||(27234472-27234730)
chr6 (96-344)||(28098291-28098539)
chr6 (226-379)||(28325463-28325616)
chr6 (243-355)||(25506978-25507090)
chr6 (226-346)||(28297765-28297885)
chr6 (226-346)||(28514188-28514308)
chr6 (232-280)||(2184369-2184417)
chr6 (231-279)||(26975134-26975182)
chr6 (63-122)||(28234802-28234861)
chr6 (229-279)||(25071741-25071791)
chr6 (226-415)||(27665169-27665358)
chr6 (232-279)||(2184980-2185027)
chr6 (147-421)||(29825967-29826241)
chr6 (63-116)||(26617867-26617920)
chr6 (63-116)||(26723795-26723848)
chr6 (31-132)||(26959395-26959496)
chr6 (31-120)||(28297570-28297659)
chr6 (31-120)||(28514414-28514503)
chr6 (226-277)||(26635774-26635825)
chr6 (226-277)||(26741740-26741791)
chr6 (231-277)||(26959250-26959296)
chr6 (38-151)||(25506848-25506961)
chr6 (31-132)||(26635919-26636020)
chr6 (31-132)||(26741885-26741986)
chr6 (63-116)||(26811754-26811807)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (25-417)||(18655315-18655707)
chr4 (19-417)||(18731336-18731734)
chr4 (25-417)||(18723923-18724315)
chr4 (26-417)||(18699239-18699630)
chr4 (25-417)||(18679405-18679797)
chr4 (61-319)||(18073804-18074062)
chr4 (225-319)||(17989091-17989185)
chr4 (141-279)||(5090921-5091059)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (25-417)||(268195-268587)
chr1 (19-417)||(28127511-28127910)
chr1 (19-394)||(28164195-28164569)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (19-417)||(29273615-29274013)
chr8 (330-418)||(31903794-31903882)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (19-418)||(4516-4915)
scaffold0277 (19-421)||(13477-13879)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (32-418)||(14214-14599)
scaffold0349 (173-418)||(3420-3666)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (19-421)||(7465-7867)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (61-319)||(59612-59870)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (294-421)||(37-164)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (63-394)||(34692-35023)
scaffold0038 (226-345)||(42982-43101)
scaffold0038 (226-354)||(27455-27583)
scaffold0038 (226-379)||(116778-116931)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (226-418)||(58334-58526)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (226-354)||(3279695-3279823)
chr2 (226-279)||(17993736-17993789)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (233-379)||(16688993-16689139)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26656331 - 26655929
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656331 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 26656232  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656231 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 26656132  T
Q  219 gtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656131 gtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 26656032  T
Q  319 tggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656031 tggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 26655932  T
Q  419 gcc 421  Q
    |||    
T  26655931 gcc 26655929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26762302 - 26761900
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762302 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 26762203  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762202 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 26762103  T
Q  219 gtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762102 gtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 26762003  T
Q  319 tggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762002 tggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 26761903  T
Q  419 gcc 421  Q
    |||    
T  26761902 gcc 26761900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 421
Target Start/End: Original strand, 27337910 - 27338312
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27337910 acccttgactaaaatggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaactt 27338009  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 218  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27338010 atcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccctt 27338109  T
Q  219 gtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27338110 gtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaa 27338209  T
Q  319 tggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27338210 tggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagatt 27338309  T
Q  419 gcc 421  Q
    |||    
T  27338310 gcc 27338312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 421
Target Start/End: Original strand, 27398650 - 27399052
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27398650 acccttgactaaaatggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaactt 27398749  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 218  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27398750 atcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccctt 27398849  T
Q  219 gtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27398850 gtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaa 27398949  T
Q  319 tggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27398950 tggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagatt 27399049  T
Q  419 gcc 421  Q
    |||    
T  27399050 gcc 27399052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 25580055 - 25579662
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||   ||| | || |||||||| || ||||||||| ||| ||| |||    
T  25580055 gactataatgatagccggacaagttagcagcttgggtaagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttc 25579956  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||  | |||| |||||||||     
T  25579955 atgcttagtaagatactcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttg 25579856  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25579855 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 25579756  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25579755 tgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagatt 25579662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26056262 - 26055869
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||   ||| | || |||||||| || |||||||||||||  || ||     
T  26056262 gactataatgatagccggacaagttagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacccctcttt 26056163  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||  | |||| |||||| ||     
T  26056162 atgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttg 26056063  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26056062 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggcct 26055963  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26055962 tgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagatt 26055869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26076232 - 26075839
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||   ||| | || |||||||| || |||||||||||||  || ||     
T  26076232 gactataatgatagccggacaagttagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacccctcttt 26076133  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||  | |||| |||||| ||     
T  26076132 atgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttg 26076033  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26076032 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggcct 26075933  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26075932 tgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagatt 26075839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26143201 - 26142808
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||   ||| | || |||||||| || ||||||||| ||| ||| |||    
T  26143201 gactataatgatagccggacaagttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttc 26143102  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||  | |||| |||||||||     
T  26143101 atgcttagtaagatgctcaccataaatcccactctgatttcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggaaatactaagcaactctttgtcttg 26143002  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26143001 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 26142902  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26142901 tgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagatt 26142808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 25482078 - 25481685
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| || |||||||  || |||||||||||||||||   ||| | || |||||||| || |||||||||||||  || |||    
T  25482078 gactataatgatagccggacaaattagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacccctcttc 25481979  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||||| |  || ||| |||| |  | |||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||| |||||||||     
T  25481978 atgcttagtcagatattcaccataactacatgtatgacgtcgaacatcagtaggatccacaccatagaaaacgggtaatactaagcaactctttgtcttg 25481879  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25481878 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggcct 25481779  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25481778 tgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagatt 25481685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 25538876 - 25538483
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||   ||| | || |||||||| ||  |||||||| ||| ||| |||    
T  25538876 gactataatgatagccggacaagttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcattattttgaaacctctcttc 25538777  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||  | |||| |||||||||     
T  25538776 atgcttagtaaaatgctcaccataactcccactctgatgtcgtaactgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttg 25538677  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  25538676 tagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggcct 25538577  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25538576 tgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagatt 25538483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26049084 - 26048788
Alignment:
Q  122 ttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||  | |||| |||||||    
T  26049084 ttcatgcttagtaagatgctcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtc 26048985  T
Q  222 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatgg 321  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26048984 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatgg 26048885  T
Q  322 ccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    |||| || |||   ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  26048884 ccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagatt 26048788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26070253 - 26069957
Alignment:
Q  122 ttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||  | |||| |||||||    
T  26070253 ttcatgcttagtaagatgctcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtc 26070154  T
Q  222 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatgg 321  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26070153 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatgg 26070054  T
Q  322 ccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    |||| || |||   ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  26070053 ccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagatt 26069957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26646815 - 26646423
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |  | | |||||| |||||||||||||||  ||| |||    
T  26646815 gactataatggtatccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgttccttgtttttcttgttattttggaaactctcttc 26646716  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||     
T  26646715 gtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttg 26646616  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26646615 tagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 26646516  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26646515 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 26646423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26752783 - 26752391
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |  | | |||||| |||||||||||||||  ||| |||    
T  26752783 gactataatggtatccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgttccttgtttttcttgttattttggaaactctcttc 26752684  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||     
T  26752683 gtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttg 26752584  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26752583 tagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 26752484  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26752483 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 26752391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 418
Target Start/End: Original strand, 27718237 - 27718623
Alignment:
Q  32 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 131  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  27718237 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 27718336  T
Q  132 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcag 230  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  |||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  27718337 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 27718435  T
Q  231 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacga 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  27718436 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 27718535  T
Q  331 gtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27718536 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 27718623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 418
Target Start/End: Original strand, 27610860 - 27611246
Alignment:
Q  32 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 131  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||||  ||||||  || |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  27610860 atggtagccggaaaagtttgcagcctggctcagagccactttccatccctgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 27610959  T
Q  132 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcag 230  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  |||||||||| |  | |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  27610960 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcactttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 27611058  T
Q  231 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacga 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  27611059 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 27611158  T
Q  331 gtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27611159 gtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 27611246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26802771 - 26802382
Alignment:
Q  32 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 131  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| | |||||||||| |    
T  26802771 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctccaacctctccatgttatccttatcattttgaaaccttttttcatgctca 26802672  T
Q  132 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcag 230  Q
    |  | ||||| |||| || || |  || ||||| || |  | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    | ||||||||||||||||||     
T  26802671 gcca-atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaa 26802573  T
Q  231 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacga 330  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||    
T  26802572 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatga 26802473  T
Q  331 gtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26802472 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcc 26802382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 418
Target Start/End: Original strand, 27698500 - 27698738
Alignment:
Q  180 tccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 279  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||    | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698500 tccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 27698599  T
Q  280 tggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaa 379  Q
    ||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27698600 tgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 27698699  T
Q  380 agtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27698700 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 27698738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26884501 - 26884106
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||   ||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| | |||||    
T  26884501 gactaaaatggtagccggacaagttagcaacttgcctcatagccattttccatcgctgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaaccttttttc 26884402  T
Q  125 atgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctt 223  Q
    ||| | ||  | ||||| |||| ||||| || || |||||||| |  | ||||||||||||||||   ||||||||||||||    | |||||||||||     
T  26884401 atggtcagcca-atgcttcaccataactacctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaacaaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctc 26884303  T
Q  224 atagcagtgaatga--tgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatgg 321  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  26884302 gtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatgg 26884203  T
Q  322 ccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    |||| | ||||||||||||||||||   ||||||  |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  26884202 ccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatt 26884106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 157 - 418
Target Start/End: Original strand, 27724828 - 27725089
Alignment:
Q  157 tctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaa 256  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27724828 tctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaa 27724927  T
Q  257 acaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctg 356  Q
    |||||| |||||| | |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  27724928 acaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctt 27725027  T
Q  357 agaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27725028 tgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 27725089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28781475 - 28781079
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  28781475 gactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttttc 28781376  T
Q  125 atgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctt 223  Q
    |||   ||  | ||||| |||| |||   || || |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||| ||||||||    
T  28781375 atgtccagcca-atgcttcaccataaggacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctt 28781277  T
Q  224 atagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcc 323  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28781276 gtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggcc 28781177  T
Q  324 ttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28781176 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 28781079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 173 - 418
Target Start/End: Original strand, 27531196 - 27531441
Alignment:
Q  173 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 272  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||   |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531196 agtaggatccacaccaataaaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 27531295  T
Q  273 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 372  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27531296 gcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 27531395  T
Q  373 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27531396 caatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 27531441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 246 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229172
Alignment:
Q  246 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgattt 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  346 catctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 27229172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 171 - 421
Target Start/End: Original strand, 27593017 - 27593267
Alignment:
Q  171 tgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 270  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27593017 tgagaaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaag 27593116  T
Q  271 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtc 370  Q
    | |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  27593117 aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtc 27593216  T
Q  371 atcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27593217 atcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 27593267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28786614 - 28786221
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  28786614 gactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttttc 28786515  T
Q  125 atgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctt 223  Q
    ||||  ||  | ||||| |||| ||||  || || |||||||| |  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    | ||| ||||||||    
T  28786514 atgcccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctt 28786416  T
Q  224 atagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcc 323  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || |  || ||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28786415 gtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggcc 28786316  T
Q  324 ttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28786315 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 28786221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28792735 - 28792342
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  28792735 gactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttttc 28792636  T
Q  125 atgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctt 223  Q
    ||||  ||  | ||||| |||| ||||  || || |||||||| |  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    | ||| ||||||||    
T  28792635 atgcccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctt 28792537  T
Q  224 atagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcc 323  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || |  || ||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28792536 gtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggcc 28792437  T
Q  324 ttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28792436 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 28792342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 173 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27679134 - 27678889
Alignment:
Q  173 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 272  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27679134 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 27679035  T
Q  273 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 372  Q
    |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||    
T  27679034 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttat 27678935  T
Q  373 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27678934 caatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 27678889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26824164 - 26823780
Alignment:
Q  37 agccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaag 136  Q
    ||||||||||||  |||||||   |||||||| ||||||||||   |||  ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||    
T  26824164 agccagacaagtcagcagcttgtttcagagccttcttccattgaagcaatttctccatgttttccttgttatttccgaacctcttttcatgcttagtgag 26824065  T
Q  137 atgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatg 236  Q
    |||   | | ||||| |||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    |  ||||||  ||| |||  | |||||    
T  26824064 atgtatagcataactcccacgctgatgtcgtatgtcaccaggatccacaccatagaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatg 26823965  T
Q  237 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||     
T  26823964 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgatt 26823865  T
Q  337 gtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
    ||  ||||| ||| |||||  |||| |||   |||||||  || || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  26823864 gttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgcc 26823780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26623232 - 26622919
Alignment:
Q  105 ttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 203  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  26623232 ttattatggaacctctttgcatgcttagcaag-tgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaa 26623134  T
Q  204 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 303  Q
    ||   || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  26623133 acgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaa 26623034  T
Q  304 tcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataag 403  Q
    |||| || ||||| || || ||  | ||||||||| ||||||| || |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  26623033 tcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaag 26622934  T
Q  404 agccttgtagagatt 418  Q
    |||||||||||||||    
T  26622933 agccttgtagagatt 26622919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26729210 - 26728897
Alignment:
Q  105 ttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 203  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  26729210 ttattatggaacctctttgcatgcttagcaag-tgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaa 26729112  T
Q  204 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 303  Q
    ||   || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  26729111 acgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaa 26729012  T
Q  304 tcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataag 403  Q
    |||| || ||||| || || ||  | ||||||||| ||||||| || |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  26729011 tcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaag 26728912  T
Q  404 agccttgtagagatt 418  Q
    |||||||||||||||    
T  26728911 agccttgtagagatt 26728897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 421
Target Start/End: Original strand, 27604702 - 27604952
Alignment:
Q  171 tgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 270  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27604702 tgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaag 27604801  T
Q  271 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtc 370  Q
    | ||||| |||  |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  27604802 aggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttc 27604901  T
Q  371 atcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27604902 atcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 27604952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 171 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31284478 - 31284228
Alignment:
Q  171 tgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 270  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    | ||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31284478 tgagaaggatccacgccaaagaaaacgggcaaaacgaggcgaccattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaag 31284379  T
Q  271 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtc 370  Q
    | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||    
T  31284378 aggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatc 31284279  T
Q  371 atcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31284278 atcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 31284228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 421
Target Start/End: Original strand, 27677613 - 27677861
Alignment:
Q  173 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 272  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| |||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27677613 agtaggttccacagcaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 27677712  T
Q  273 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 372  Q
    |||||||||  |||||| |  | |||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||  |  |    
T  27677713 gcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgt 27677812  T
Q  373 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  27677813 caatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgcc 27677861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 421
Target Start/End: Original strand, 27706440 - 27706649
Alignment:
Q  212 accctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggat 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |  |||||||||||||| ||     
T  27706440 accctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagac 27706539  T
Q  312 tcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgt 411  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||  |||| ||||  |  |||||||| || ||||||||||| |||  || ||||||||    
T  27706540 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgt 27706639  T
Q  412 agagattgcc 421  Q
    ||||||||||    
T  27706640 agagattgcc 27706649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Original strand, 27427493 - 27427751
Alignment:
Q  61 tcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctc-accgtaacttccagtct 159  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| | | | |||||| ||| | |||||||||| ||  | |||||  ||| || || || || |    
T  27427493 tcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttcatgctcagcca-atgctttaccatacctacctgtat 27427591  T
Q  160 gatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 259  Q
    ||||||| |  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27427592 gatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaaca 27427691  T
Q  260 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaat 319  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27427692 agatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 27427751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28139743 - 28139563
Alignment:
Q  159 tgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 258  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28139743 tgatgtcgaatgtgagaaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagc 28139644  T
Q  259 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtg 339  Q
    |||| |||||||| |||||||||   ||||| |  || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  28139643 aaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtg 28139563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26861949 - 26861559
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| |  ||||||  || |||||||| |||||| ||| | | |||||| ||| | |||||    
T  26861949 gactaaaatggtagcctgacaagttagcagcttggttcagagcaactttccatctctgcaacctctccatgttatccatatcattttgaaaccttttttc 26861850  T
Q  125 atgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctt 223  Q
    ||||||||  | ||||| |||| ||| | ||  | |||||||| |  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    | |||||||  |||    
T  26861849 atgcttagcca-atgcttcaccataaatacctctatgatgtcgcacattagtaggatccatgccatagaaaacaggcaaaacgacgcgacccttttcctt 26861751  T
Q  224 atagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcc 323  Q
       ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||     
T  26861750 ---gcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggca 26861654  T
Q  324 ttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    ||  ||||||||  | |||||||||| |||||  |||| |||   ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26861653 ttgtcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 26861559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28150111 - 28149953
Alignment:
Q  187 catagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcaga 286  Q
    ||||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||    
T  28150111 catagaaaataggcagaactaagcaaccctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgataga 28150012  T
Q  287 aaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttc 346  Q
     || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28150011 gaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttc 28149953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28234692 - 28234531
Alignment:
Q  233 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| || |||||||||||||| |  |||    
T  28234692 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28234593  T
Q  333 gatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattccctt 394  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  28234592 gatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattccctt 28234531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26937313 - 26937076
Alignment:
Q  142 caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtg 241  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    |  ||| ||||||||  |||||| || ||||||    
T  26937313 caccataactcccagtttggtgtcgaacgtgagaaggatccacttcatagaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtg 26937214  T
Q  242 gacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||  || ||   ||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  26937213 gacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatggtgtg 26937114  T
Q  342 atttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaa 379  Q
    ||||| |||||||   | || || ||||||||||||||    
T  26937113 atttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaa 26937076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Original strand, 26341986 - 26342105
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26341986 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggcttt 26342085  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgattt 345  Q
     || |||||| |||||||||    
T  26342086 gacaagtgattgtgtgattt 26342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26848929 - 26848603
Alignment:
Q  92 catgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccata 190  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| |||| |||| ||||| | | |||||||||| |  |||| ||| || |  |||||    
T  26848929 catgctttccttgttattttgaaacacctcttcatgcttagcaag-tgcttcaccataactactattctgatgtcgcacatgagaaggttctatgccata 26848831  T
Q  191 gaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaat 290  Q
    ||||||||| | ||||   | |||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||| |||    
T  26848830 gaaaacaggaataaccatgctacccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaat 26848731  T
Q  291 atgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattc 390  Q
    |   ||||  ||||||| || |||||||||  ||| | ||| || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||    
T  26848730 acaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattc 26848631  T
Q  391 ccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    | || |||  |||||| || ||||||||    
T  26848630 cattgtcagaaagagctttatagagatt 26848603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28181249 - 28181129
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28181249 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28181150  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttc 346  Q
     |  ||||||| ||| |||||    
T  28181149 gaaaagtgatgatgttatttc 28181129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28185696 - 28185381
Alignment:
Q  31 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctt 130  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| ||  || |||||  ||||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| |     
T  28185696 aatggtggccagagaagttagcagtttgagtaagagcactcttccatttctgcaacctctccatgctatccttgttattttggaacttctttatatgatc 28185597  T
Q  131 agtaagatgctc-accgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagca 229  Q
    |   || ||||  ||| ||||| || || |||||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||   ||  ||  ||  |||  ||||    
T  28185596 atccag-tgctttaccataactgcccgtgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagca 28185498  T
Q  230 gtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || | |||||| |||||||| || |||||||||||||| |      
T  28185497 gttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaa 28185398  T
Q  330 agtgatggtgtgatttc 346  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  28185397 agtgatgatgttatttc 28185381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28242939 - 28242820
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28242939 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28242840  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgattt 345  Q
     |  ||||||||||| ||||    
T  28242839 gaaaagtgatggtgttattt 28242820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28227085 - 28226957
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28227085 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 28226986  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctc 354  Q
     |  ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  28226985 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctc 28226957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26949991 - 26949745
Alignment:
Q  31 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctt 130  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||| |  ||||| || ||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  26949991 aatggtagccagataagtcagcaactttgttcagagctatcttccatttcagcaaccgctccatgttttttttgctcttttggaacctctcttcatgctt 26949892  T
Q  131 agtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagca 229  Q
    || ||| |||| |||| |||||   | |||||||||| | ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| |||    | ||| |||  |||  || |    
T  26949891 agcaag-tgcttcaccataactataattctgatgtcgcacgtgagaaggttctacatcatagaaaactggcagaacaaggcgacctttttccttgaagta 26949793  T
Q  230 gtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 277  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26949792 gtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcata 26949745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27214756 - 27214498
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | | ||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  27214756 gactataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctcttc 27214657  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaac--ttccag-tctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 221  Q
    |||||||| |||    ||||| ||||  ||   | || ||||||| | ||||| ||| || || |||||||||||||| | |||    | ||| |||  |    
T  27214656 atgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgacctttttcc 27214557  T
Q  222 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 280  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27214556 ttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27214498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 27234472 - 27234730
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | | ||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  27234472 gactataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctcttc 27234571  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaac--ttccag-tctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 221  Q
    |||||||| |||    ||||| ||||  ||   | || ||||||| | ||||| ||| || || |||||||||||||| | |||    | ||| |||  |    
T  27234572 atgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgacctttttcc 27234671  T
Q  222 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 280  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27234672 ttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 344
Target Start/End: Original strand, 28098291 - 28098539
Alignment:
Q  96 ttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |||||  || | |||    
T  28098291 ttttctttgttattttggaacctctcttcatgcttagcta-atgcttcaccataactccccgtctgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcacaaaaa 28098389  T
Q  195 acaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta-tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatg 293  Q
    | ||| |||||  | ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||   ||| || |      
T  28098390 ataggaaaaacgaagcaacccttt-tcttcgtaacggtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagacc 28098488  T
Q  294 ggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatt 344  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  28098489 ggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgacaagggattgtgtgatt 28098539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325463
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28325517  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaa 379  Q
     |  ||||| ||||| ||||| || ||||   |||| || ||||||||||||||    
T  28325516 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaa 28325463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 355
Target Start/End: Original strand, 25506978 - 25507090
Alignment:
Q  243 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtga 342  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  25506978 acaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtga 25507077  T
Q  343 tttcatctcctct 355  Q
    |||||||||||||    
T  25507078 tttcatctcctct 25507090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 346
Target Start/End: Original strand, 28297765 - 28297885
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||| |||||||| |  |||||||||  |||    
T  28297765 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28297864  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttc 346  Q
     |  ||||||||||| |||||    
T  28297865 gaaaagtgatggtgttatttc 28297885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28514308 - 28514188
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||| |||||||| |  |||||||||  |||    
T  28514308 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28514209  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttc 346  Q
     |  ||||||||||| |||||    
T  28514208 gaaaagtgatggtgttatttc 28514188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2184417 - 2184369
Alignment:
Q  232 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2184417 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtt 2184369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26975182 - 26975134
Alignment:
Q  231 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26975182 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26975134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28234861 - 28234802
Alignment:
Q  63 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttt 122  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28234861 agagccatcttccatttctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttcttt 28234802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25071791 - 25071741
Alignment:
Q  229 agtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25071791 agtgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 415
Target Start/End: Original strand, 27665169 - 27665358
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||   ||| |||||   |||   |||||| ||||||||||||  |||    
T  27665169 agcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagttcttagagaatataataatggcaatcctcgattcttcaatgctctt 27665268  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagag 415  Q
       |||||| ||||||||||| || ||  |  |||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||  ||||||||| |||||    
T  27665269 ccggagtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagag 27665358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2185027 - 2184980
Alignment:
Q  232 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2185027 gaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 2184980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29826241 - 29825967
Alignment:
Q  147 taacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaa 246  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||   || ||||||  ||||    || | ||  || || ||||    
T  29826241 taactcccagtctgatgtcgcacatgagaaggatccacatcatagaaaataggcaaaacgagacgacccttcctcttgacacactcaactatatgcacaa 29826142  T
Q  247 gttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttc 346  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||||| |||| ||| || || |||||    ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  29826141 gttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttc 29826042  T
Q  347 atctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
     || |||||  |||| || |||||||||||||| ||  | |||  ||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  29826041 gtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgcc 29825967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26617920 - 26617867
Alignment:
Q  63 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaac 116  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26617920 agagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttggaac 26617867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26723848 - 26723795
Alignment:
Q  63 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaac 116  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26723848 agagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttggaac 26723795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26959496 - 26959395
Alignment:
Q  31 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctt 130  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| | | |||||  ||||||||| |  ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  26959496 aatggtggccagataagttagcagcttggttaagagctttcttccatttcagcaaccgctccatgttttccttgctattttgaaactgctcttcatgctt 26959397  T
Q  131 ag 132  Q
    ||    
T  26959396 ag 26959395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 28297570 - 28297659
Alignment:
Q  31 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttct 120  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| ||  || |||||  ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28297570 aatggtggccagagaagttagcagtttgagtaagagcactcttccatttctgcaacctctccatgttattcttgttattttggaacttct 28297659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28514503 - 28514414
Alignment:
Q  31 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttct 120  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| ||  || |||||  ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28514503 aatggtggccagagaagttagcagtttgagtaagagcactcttccatttctgcaacctctccatgttattcttgttattttggaacttct 28514414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635774
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26635774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741740
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26741740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26959296 - 26959250
Alignment:
Q  231 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  26959296 tgaatgatgtggacaagttcatccaaataaaacgaagaagaagcata 26959250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 25506848 - 25506961
Alignment:
Q  38 gccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaaga 137  Q
    |||||||| ||| |||| ||  || ||||| || |||||||| | | | |||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  25506848 gccagacaggttagcagattgtgttagagctattttccattgatgcgatctctccatgtttttcttattattttgaaacttctcttcatgcttagtcaga 25506947  T
Q  138 tgctcaccgtaact 151  Q
    |  ||||| |||||    
T  25506948 tcttcaccataact 25506961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26636020 - 26635919
Alignment:
Q  31 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctt 130  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| | | |||||  ||||||||| |  ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||    
T  26636020 aatggtggccagataagttagcagcttggttaagagctttcttccatttcagcaaccactccatgttttccttgctattttgaaactgatcttcatgctt 26635921  T
Q  131 ag 132  Q
    ||    
T  26635920 ag 26635919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26741986 - 26741885
Alignment:
Q  31 aatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctt 130  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| | | |||||  ||||||||| |  ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||    
T  26741986 aatggtggccagataagttagcagcttggttaagagctttcttccatttcagcaaccactccatgttttccttgctattttgaaactgatcttcatgctt 26741887  T
Q  131 ag 132  Q
    ||    
T  26741886 ag 26741885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26811807 - 26811754
Alignment:
Q  63 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaac 116  Q
    ||||| |||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  26811807 agagctatcttccatttctgcaaccgatccatgttttccttgttattttggaac 26811754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 417
Target Start/End: Original strand, 18655315 - 18655707
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  18655315 gactagaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaattctttct 18655414  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   || ||||||||||||     
T  18655415 gtgcttagtgagatgttcaccataacttccagtttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaaaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttg 18655514  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||| ||||| || |||| |||||| |    
T  18655515 tagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcat 18655614  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    |  ||||||||||| |||||||||| || ||  | || |||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  18655615 tgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagat 18655707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 417
Target Start/End: Original strand, 18731336 - 18731734
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||  |    
T  18731336 acccatgactaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaact 18731435  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 218  Q
    |||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||    
T  18731436 ctttttgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgacccttt 18731535  T
Q  219 gtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 318  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| || ||||| || |||||||    
T  18731536 gtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaa 18731635  T
Q  319 tggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||  | || |||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  18731636 tggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagat 18731734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 417
Target Start/End: Original strand, 18723923 - 18724315
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||  || |||     
T  18723923 gactaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactcatttt 18724022  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||     
T  18724023 gtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttggtgtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttg 18724122  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  18724123 tagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcat 18724222  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    |  ||||||||||| |||||||||| |||||  | || |||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18724223 tgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 18724315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Original strand, 18699239 - 18699630
Alignment:
Q  26 actacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttca 125  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||||| |     
T  18699239 actaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagctaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactctttccg 18699338  T
Q  126 tgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttat 225  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   || ||| |||||||| |    
T  18699339 tgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatctacgccatagaaaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttgt 18699438  T
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  18699439 agcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcatt 18699538  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
      ||||||||||| |||||||||| || ||  | || |||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  18699539 gtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagat 18699630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 417
Target Start/End: Original strand, 18679405 - 18679797
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| || ||||||||  ||||||||||||||  |||||      
T  18679405 gactaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagctaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttattgttattttggaaactctttca 18679504  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || ||||||||||||     
T  18679505 gtgattagtgagatgttcaccataactaccactttgatgtcatatgtgagtaggatccacgacatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttg 18679604  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  18679605 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcat 18679704  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    |  ||||||||||| |||||||||| |||||  | || |||  |||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  18679705 tgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagat 18679797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18074062 - 18073804
Alignment:
Q  61 tcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctc-accgtaacttccagtct 159  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| | | | |||||| ||| | |||||||||| ||  | |||||  ||| || || || || |    
T  18074062 tcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttcatgctcagcca-atgctttaccatacctacctgtat 18073964  T
Q  160 gatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 259  Q
    ||||||| |  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18073963 gatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaaca 18073864  T
Q  260 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaat 319  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18073863 agatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 18073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 319
Target Start/End: Original strand, 17989091 - 17989185
Alignment:
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17989091 tagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 279
Target Start/End: Original strand, 5090921 - 5091059
Alignment:
Q  141 tcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgt 240  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||  |||  |||||||||| || |    
T  5090921 tcaccataacttccagtctgatatcgcacatgagaaggttccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttccttggagcagtgaataatat 5091020  T
Q  241 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 279  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  5091021 ggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagt 5091059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 417
Target Start/End: Original strand, 268195 - 268587
Alignment:
Q  25 gactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttc 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| |||| ||||||||||  ||| |||    
T  268195 gactagaatggtagccagacaagttagaagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgctattttggaaactctcttc 268294  T
Q  125 atgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtctta 224  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    || ||||||| ||||     
T  268295 gtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaatgagacgaccctttttcttg 268394  T
Q  225 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  268395 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcat 268494  T
Q  325 taacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    |  ||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  268495 tgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 268587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 417
Target Start/End: Original strand, 28127511 - 28127910
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| | || |||||||| |||||||||||||||| |    
T  28127511 accctggactataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacct 28127610  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 218  Q
    || | ||||||||| ||| |  ||||| ||||| || || |||| ||| |  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    | |||||||    
T  28127611 ctctccatgcttagcaagctcttcaccataactccctgtatgatatcgcacatcagtaggatccacgccaaagaaaacaggcaaaactaggcgacccttt 28127710  T
Q  219 gtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  28127711 gtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaa 28127810  T
Q  319 tggccttaacgagtgatggtgtga-tttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    ||||||| |  ||||| ||||||| |||  ||||||||   ||||| |   ||||||||||| || ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  28127811 tggcctttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagat 28127910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 394
Target Start/End: Original strand, 28164195 - 28164569
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| | || |||||||| |||||||||||||||| |    
T  28164195 accctggactataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacct 28164294  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 218  Q
    ||   |||||||||||||||  |  || ||||| || || |||||||| |  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    | |||||||    
T  28164295 ctcaccatgcttagtaagatctttgccataactccctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacgcca-agaaaacaggcaaaactaggcgacccttt 28164393  T
Q  219 gtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |  ||||||||||| |  |||| |||||    
T  28164394 gtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaa 28164493  T
Q  319 tggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattccctt 394  Q
    ||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||   |||||||   ||||||||||| || || ||||||||    
T  28164494 tggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattccctt 28164569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 417
Target Start/End: Original strand, 29273615 - 29274013
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  | |||||||| |||| ||||||||||  |    
T  29273615 acccatgactagaatggtagccagacaagttagaagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaaccgatccatgtttttcttgctattttggaaact 29273714  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaacccttt 218  Q
    || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    || |||||||    
T  29273715 ctcttcgtacttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacaggcaaaatgagacgacccttt 29273814  T
Q  219 gtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaa 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| || || |||||||    
T  29273815 gtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaa 29273914  T
Q  319 tggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    || | ||  ||||||||| | |||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  29273915 tgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagat 29274013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31903882 - 31903794
Alignment:
Q  330 agtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |  || ||||| || || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  31903882 agtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatt 31903794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 418
Target Start/End: Original strand, 4516 - 4915
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| |    
T  4516 acccatgactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacct 4615  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctt 217  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||| ||  || ||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | ||||||    
T  4616 cttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttcagatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctt 4714  T
Q  218 tgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttca 317  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |  |||||| |  |||||||||||||| ||||| |||    
T  4715 tgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatca 4814  T
Q  318 atggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4815 atggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 4914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 421
Target Start/End: Original strand, 13477 - 13879
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| | || |||||| | ||| | |||||| ||| |    
T  13477 acccatgactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacct 13576  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctt 217  Q
    |||||||||   ||  | ||||| |||| ||||  || || |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||| ||    
T  13577 cttttcatgtccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttt 13675  T
Q  218 tgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttca 317  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  || ||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||     
T  13676 tgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcg 13775  T
Q  318 atggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13776 atggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 13875  T
Q  418 tgcc 421  Q
    ||||    
T  13876 tgcc 13879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 418
Target Start/End: Original strand, 14214 - 14599
Alignment:
Q  32 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 131  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||   ||||||  || |||||||| |||||||| |   | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  14214 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 14313  T
Q  132 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcag 230  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  |||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  14314 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 14412  T
Q  231 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacga 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  14413 tgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 14511  T
Q  331 gtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14512 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 14599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 173 - 418
Target Start/End: Original strand, 3420 - 3666
Alignment:
Q  173 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 272  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| |||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3420 agtaggttccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 3519  T
Q  273 gcatag-ttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtca 371  Q
    |||||| |||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3520 gcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtca 3619  T
Q  372 tcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3620 tcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 3666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7867 - 7465
Alignment:
Q  19 acccttgactacaatggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaactt 118  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| | || |||||| | ||| | |||||| ||| |    
T  7867 acccatgactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacct 7768  T
Q  119 cttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctt 217  Q
    |||||||||   ||  | ||||| |||| ||||  || || |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||| |     
T  7767 cttttcatgtccagcca-atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttc 7669  T
Q  218 tgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttca 317  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  || ||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||     
T  7668 tgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcg 7569  T
Q  318 atggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagat 417  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7568 atggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 7469  T
Q  418 tgcc 421  Q
    ||||    
T  7468 tgcc 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 59870 - 59612
Alignment:
Q  61 tcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctc-accgtaacttccagtct 159  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| | | | |||||| ||| | |||||||||| ||  | |||||  ||| || || || || |    
T  59870 tcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttcatgctcagcca-atgctttaccatacctacctgtat 59772  T
Q  160 gatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 259  Q
    ||||||| |  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  59771 gatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaaca 59672  T
Q  260 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaat 319  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  59671 agatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 59612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 421
Target Start/End: Original strand, 37 - 164
Alignment:
Q  294 ggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattccct 393  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  37 ggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattccct 136  T
Q  394 tatcaataagagccttgtagagattgcc 421  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  137 tgtcagtaagagccttgtagagattgcc 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35023 - 34692
Alignment:
Q  63 agagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctc-accgtaacttccagtctga 161  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | |   || ||||  ||| ||||| ||  | |||    
T  35023 agagccatcttccatttctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccag-tgctttaccataactgcccttgtga 34925  T
Q  162 tgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaa 261  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||   ||  ||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34924 tgtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaa 34825  T
Q  262 atgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaag 361  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  34824 atgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaag 34725  T
Q  362 atcattgtcatcaatgaaagtatggattccctt 394  Q
     ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  34724 ctccctgtcatcaatgaaggtgtggattccctt 34692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43101 - 42982
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  43101 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 43002  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgattt 345  Q
     |  ||||||||||| ||||    
T  43001 gaaaagtgatggtgttattt 42982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27583 - 27455
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  27583 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 27484  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctc 354  Q
     |  ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  27483 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctc 27455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116778
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 116832  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaa 379  Q
     |  ||||| ||||| ||||| || ||||   |||| || ||||||||||||||    
T  116831 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaa 116778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 418
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58526
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  ||| || | |||||| |||||||| || |||| |||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagatt 418  Q
     |  ||||||||||| ||||| || ||||   |||| ||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| |||  ||||||  ||||||||||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatt 58526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279695
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||| || |  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  326 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctc 354  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctc 3279695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 279
Target Start/End: Original strand, 17993736 - 17993789
Alignment:
Q  226 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17993736 agcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 17993789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16688993
Alignment:
Q  233 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagt 332  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||   |||||| | ||| ||   |||||| || |||||||| ||||| |  |||    
T  16689139 aatgatgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagt 16689040  T
Q  333 gatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaa 379  Q
    |||||||||||||  || |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  16689039 gatggtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaa 16688993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University