View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16735_low_107 (Length: 235)

Name: NF16735_low_107
Description: NF16735
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16735_low_107
NF16735_low_107
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (1-221)||(12089843-12090063)
chr7 (1-221)||(31879156-31879376)
chr7 (1-221)||(2796947-2797167)
chr7 (1-221)||(8107272-8107492)
chr7 (1-221)||(22321184-22321405)
chr7 (1-221)||(2631954-2632174)
chr7 (1-221)||(6173073-6173293)
chr7 (1-221)||(10345690-10345909)
chr7 (1-221)||(23795652-23795871)
chr7 (1-221)||(12184417-12184638)
chr7 (1-221)||(12191399-12191620)
chr7 (1-221)||(31157659-31157880)
chr7 (1-210)||(31882668-31882877)
chr7 (1-221)||(31663896-31664116)
chr7 (1-217)||(45500099-45500315)
chr7 (11-221)||(19471618-19471828)
chr7 (1-221)||(2478218-2478438)
chr7 (1-221)||(22825166-22825386)
chr7 (1-189)||(1954484-1954672)
chr7 (1-221)||(3544262-3544482)
chr7 (1-214)||(24483303-24483515)
chr7 (1-169)||(4704814-4704982)
chr7 (1-91)||(22909675-22909765)
chr7 (5-91)||(1275150-1275236)
chr7 (5-53)||(29032345-29032394)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (1-221)||(16832167-16832387)
chr1 (1-221)||(11738182-11738402)
chr1 (1-221)||(33491582-33491802)
chr1 (1-221)||(40999488-40999708)
chr1 (1-221)||(12167600-12167820)
chr1 (1-221)||(16131059-16131279)
chr1 (1-221)||(9667080-9667300)
chr1 (1-221)||(38121316-38121536)
chr1 (1-221)||(39000565-39000785)
chr1 (1-221)||(431724-431945)
chr1 (1-221)||(13217432-13217652)
chr1 (1-221)||(20225746-20225966)
chr1 (1-221)||(49249622-49249842)
chr1 (5-91)||(8995776-8995862)
chr1 (1-91)||(3365740-3365830)
chr1 (1-91)||(15161984-15162074)
chr1 (5-54)||(9269197-9269247)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (4-221)||(26373015-26373232)
chr4 (4-221)||(35416080-35416297)
chr4 (1-221)||(52619060-52619280)
chr4 (1-221)||(22048239-22048459)
chr4 (1-221)||(40994931-40995151)
chr4 (1-221)||(55327329-55327549)
chr4 (1-221)||(4838520-4838740)
chr4 (1-221)||(5272947-5273166)
chr4 (1-221)||(21668288-21668508)
chr4 (1-221)||(21677052-21677272)
chr4 (1-221)||(42532269-42532490)
chr4 (1-220)||(1188522-1188741)
chr4 (1-221)||(323996-324217)
chr4 (1-221)||(44428773-44428995)
chr4 (1-220)||(26070285-26070504)
chr4 (1-220)||(19247214-19247432)
chr4 (1-218)||(33239475-33239691)
chr4 (1-218)||(46691424-46691641)
chr4 (1-218)||(30217773-30217991)
chr4 (1-210)||(42271935-42272143)
chr4 (1-218)||(20949304-20949522)
chr4 (5-85)||(53895940-53896021)
chr4 (141-221)||(19730904-19730984)
chr4 (9-69)||(33110235-33110296)
chr4 (126-220)||(24576812-24576909)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (1-221)||(7315762-7315982)
chr5 (1-221)||(16903993-16904213)
chr5 (1-221)||(27166482-27166702)
chr5 (1-221)||(9404982-9405202)
chr5 (1-221)||(30606460-30606680)
chr5 (1-221)||(34456853-34457073)
chr5 (1-221)||(11767312-11767533)
chr5 (1-221)||(11722660-11722880)
chr5 (1-221)||(14345019-14345238)
chr5 (1-221)||(24836280-24836500)
chr5 (1-221)||(33435160-33435380)
chr5 (4-221)||(6270451-6270668)
chr5 (1-221)||(31846510-31846724)
chr5 (1-221)||(34869128-34869348)
chr5 (5-91)||(37251419-37251505)
chr5 (174-221)||(42801036-42801083)
chr5 (4-53)||(32227219-32227268)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (1-221)||(7652606-7652826)
chr3 (1-220)||(4742387-4742606)
chr3 (1-221)||(36468820-36469040)
chr3 (1-221)||(9989953-9990173)
chr3 (1-221)||(33248547-33248767)
chr3 (1-221)||(52307469-52307689)
chr3 (1-221)||(8626181-8626402)
chr3 (1-221)||(10385453-10385674)
chr3 (1-221)||(20962642-20962860)
chr3 (1-221)||(27849935-27850155)
chr3 (1-221)||(37023248-37023468)
chr3 (1-221)||(48167575-48167798)
chr3 (1-221)||(22098538-22098758)
chr3 (3-189)||(11260203-11260389)
chr3 (1-170)||(20837651-20837820)
chr3 (1-134)||(45528205-45528338)
chr3 (1-145)||(22098224-22098368)
chr3 (89-221)||(23382950-23383083)
chr3 (1-75)||(23394127-23394201)
chr3 (112-221)||(23396965-23397074)
chr3 (1-69)||(23194477-23194545)
chr3 (1-91)||(1232006-1232095)
chr3 (1-53)||(3588958-3589010)
chr3 (5-53)||(2357722-2357771)
chr3 (176-221)||(2357892-2357937)
chr3 (1-48)||(37471244-37471291)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (1-221)||(9067551-9067771)
chr8 (1-221)||(11308371-11308591)
chr8 (1-221)||(28370651-28370872)
chr8 (1-221)||(8742667-8742887)
chr8 (1-221)||(34006157-34006377)
chr8 (1-221)||(16959108-16959329)
chr8 (1-221)||(3299359-3299579)
chr8 (1-221)||(22181134-22181354)
chr8 (1-221)||(28925526-28925747)
chr8 (1-221)||(41576715-41576935)
chr8 (4-221)||(27348587-27348804)
chr8 (1-221)||(13848711-13848932)
chr8 (129-221)||(16583062-16583155)
chr8 (1-69)||(17993424-17993492)
chr8 (1-69)||(4861487-4861555)
chr8 (1-56)||(13510521-13510576)
chr8 (1-56)||(13600051-13600106)
chr8 (5-53)||(12538725-12538774)
chr8 (4-91)||(1607830-1607918)
chr8 (8-91)||(22222189-22222272)
chr8 (8-91)||(22228531-22228614)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (1-221)||(32806147-32806367)
chr6 (1-220)||(25055942-25056161)
chr6 (3-221)||(21595912-21596130)
chr6 (1-221)||(9932188-9932409)
chr6 (1-221)||(5670660-5670881)
chr6 (1-221)||(26514811-26515032)
chr6 (1-221)||(3539605-3539826)
chr6 (1-221)||(8667489-8667709)
chr6 (1-221)||(16698467-16698687)
chr6 (1-221)||(24160638-24160860)
chr6 (1-188)||(5988419-5988606)
chr6 (3-136)||(24879425-24879558)
chr6 (58-221)||(6778170-6778333)
chr6 (20-135)||(34007032-34007147)
chr6 (5-215)||(26604882-26605093)
chr6 (1-91)||(25977507-25977596)
chr6 (1-91)||(1455349-1455439)
chr6 (1-91)||(1467041-1467131)
chr6 (1-89)||(15642974-15643064)
chr6 (1-91)||(34914246-34914335)
chr6 (3-91)||(14271232-14271319)
chr6 (1-91)||(21631741-21631831)
chr6 (5-91)||(9517961-9518046)
chr6 (5-53)||(13181908-13181957)
chr6 (118-154)||(14479776-14479812)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (1-220)||(115953-116172)
scaffold0019 (1-221)||(168792-169012)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-220)||(36667273-36667492)
chr2 (1-221)||(29224272-29224493)
chr2 (1-221)||(29337571-29337792)
chr2 (1-221)||(13229726-13229946)
chr2 (1-221)||(28457261-28457481)
chr2 (1-221)||(43992072-43992290)
chr2 (16-221)||(42700358-42700563)
chr2 (1-221)||(8679179-8679399)
chr2 (1-221)||(23924416-23924636)
chr2 (1-221)||(27257942-27258162)
chr2 (1-221)||(36556946-36557166)
chr2 (1-221)||(36039646-36039866)
chr2 (1-221)||(14701201-14701422)
chr2 (1-221)||(32523486-32523708)
chr2 (1-121)||(9786588-9786708)
chr2 (112-221)||(28006753-28006862)
chr2 (1-217)||(24662515-24662732)
chr2 (5-91)||(41978156-41978242)
chr2 (176-221)||(31759011-31759056)
chr2 (176-221)||(9783656-9783701)
chr2 (1-38)||(21160523-21160560)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (1-221)||(28283-28503)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (1-221)||(11588-11808)
scaffold0298 (1-221)||(15358-15578)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-221)||(12752-12973)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-221)||(11870-12092)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-221)||(9300-9521)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (15-219)||(349992-350196)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (1-221)||(7289-7508)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-221)||(25033-25254)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-165)||(75892-76056)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (89-221)||(175247-175379)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (1-68)||(16009-16077)
scaffold0059 (154-218)||(14610-14674)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (16-217)||(6088-6290)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-69)||(14742-14810)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (5-91)||(4860-4946)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (1-91)||(7314-7403)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (1-91)||(7324-7413)
[»] scaffold0152 (1 HSPs)
scaffold0152 (1-91)||(24935-25024)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (5-53)||(34874-34923)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (107-171)||(399-463)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (5-53)||(535-584)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (5-53)||(45781-45830)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12090063 - 12089843
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12090063 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 12089964  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12089963 ttcacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcaactccctgcggaaacgatcctattata 12089864  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12089863 cttacgtgtaaatagttttat 12089843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 31879156 - 31879376
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879156 tcgagagattgaagctgttacgcttggttgatgtctctgactgtaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 31879255  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31879256 tttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 31879355  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31879356 cttacgtgtaaatagttttat 31879376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2797167 - 2796947
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2797167 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcaaataggaaaatagt 2797068  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2797067 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttttgaaatacgcaactccatgcggaaacgatcctattata 2796968  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2796967 cttacgtgtaaatagttttat 2796947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8107492 - 8107272
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8107492 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaattagt 8107393  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  8107392 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 8107293  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8107292 cttacgtgtaaatagttttat 8107272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22321405 - 22321184
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22321405 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 22321306  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  22321305 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctatatat 22321206  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22321205 acttacgtgtaaatagttttat 22321184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2631954 - 2632174
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2631954 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgtttaggaaaatagt 2632053  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  2632054 tttacacaaacaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 2632153  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  2632154 ctcacgtgtaaatagttttat 2632174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6173073 - 6173293
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  6173073 tcgagagattgcagctcttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacgtttatgtcaattaggaaaatagt 6173172  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  6173173 tttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 6173272  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6173273 cttacatgtaaatagttttat 6173293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10345909 - 10345690
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  10345909 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaattaggaaaatag- 10345811  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  10345810 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 10345711  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10345710 cttacgtgtaaatagttttat 10345690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23795652 - 23795871
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  23795652 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaattaggaaaatag- 23795750  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  23795751 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 23795850  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23795851 cttacgtgtaaatagttttat 23795871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 12184417 - 12184638
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12184417 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttattttcatgtcgaataggaaaatagt 12184516  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  || |||||| |||    
T  12184517 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgtggattcgatcctatatat 12184616  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  12184617 actcacgtgtaaatagttttat 12184638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 12191399 - 12191620
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12191399 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttatttttatgtcgaataggaaaatagt 12191498  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || |||||| |||    
T  12191499 tttacacaaacaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggattcgatcctatatat 12191598  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  12191599 actcacgtgtaaatagttttat 12191620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31157880 - 31157659
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31157880 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgctttacttttatgttgattaggaaaatagt 31157781  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  31157780 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 31157681  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31157680 acttacgtgtaaatagttttat 31157659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 31882668 - 31882877
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882668 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 31882767  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||  |  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31882768 ttcacataaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgcggaaacgatcctattata 31882867  T
Q  201 cttacgtgta 210  Q
    || |||||||    
T  31882868 ctcacgtgta 31882877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31664116 - 31663896
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664116 tcgagagattgcaggtgttacgcttggttgatgtttctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 31664017  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||| ||||||||||    
T  31664016 ttcacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcaaccccttgcaaaaacgatcctattata 31663917  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  31663916 cttacgtgtaaatggttttat 31663896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45500315 - 45500099
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45500315 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagc 45500216  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| || |||||||    
T  45500215 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgagaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtagaaacgatcatattata 45500116  T
Q  201 cttacgtgtaaatagtt 217  Q
    || ||||||||||||||    
T  45500115 ctcacgtgtaaatagtt 45500099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19471828 - 19471618
Alignment:
Q  11 gcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  19471828 gcagctattacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacctttatgtcgattaggaaaatagttttacacgaa 19471729  T
Q  111 taaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgta 210  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19471728 caaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgta 19471629  T
Q  211 aatagttttat 221  Q
    |||||||||||    
T  19471628 aatagttttat 19471618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2478218 - 2478438
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  2478218 tcgagaaattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgaaatagctctatctcttctctttttacttctaggtcgaatagaaaaatagt 2478317  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2478318 tttactcaaacaaacaatttatacccaagcacttaatgtgaaaaatattgtggaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 2478417  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2478418 cttacgtgtaaatagttttat 2478438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22825166 - 22825386
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22825166 tcgagagattgcatctgttacgcttggttgatgtctttgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgtttgacttttatgtcgaataggaaaatagt 22825265  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||| ||  ||| ||| ||||||||||    
T  22825266 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattatgaaaatgcttatgaaatacacaactctctatggacacgatcctattata 22825365  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  22825366 ctcacgtgtaaatagttttat 22825386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1954484 - 1954672
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1954484 tcgagagattgcagctgttacgcttggtagatgtctctgaccgcaagcgaaatatccctatctcttctccttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 1954583  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacg 189  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1954584 tttacacaaacaaacaatttatacccaagcacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgcggaaacg 1954672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3544482 - 3544262
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  3544482 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctgaacccaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgaatagataaacagt 3544383  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    |||   |||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||    
T  3544382 tttattcaaacaaacactttatacccaaacatttaatgcgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacaattctattata 3544283  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  3544282 cttacttgtaaatagttttat 3544262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 24483303 - 24483515
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24483303 tcgagagattgcagttgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatagccatatatcttctcgttttacttttatgtcgaataagaaaatagt 24483402  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| |  ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||    
T  24483403 tttacataaacaaacaatttatacccaaacacttgatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgc-gaaaatatcctgttata 24483501  T
Q  201 cttacgtgtaaata 214  Q
    ||||||||||||||    
T  24483502 cttacgtgtaaata 24483515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4704982 - 4704814
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4704982 tcgagagattgcagctattacgcttggttgatgtctttgaccccaagcgaaatagtcctatctcttctcattttacttttctatcgaataggaaaatagt 4704883  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaata 169  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||    
T  4704882 tttacacaaacaaacaatttatacccaagcacttaatgtgataaatactgtgaaaatacttatgaaata 4704814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22909675 - 22909765
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||  ||||||||| |||||    
T  22909675 tcgagaaattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccatatctcttctcaattttattttatgtcaaatag 22909765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Original strand, 1275150 - 1275236
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||    
T  1275150 gagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatggccctatctcttatcg-attaattttatgtcaaatag 1275236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 29032394 - 29032345
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 53  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29032394 gagaatgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaat 29032345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16832387 - 16832167
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16832387 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 16832288  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16832287 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 16832188  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16832187 ctcacgtgtaaatagttttat 16832167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11738402 - 11738182
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11738402 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaaatagaaaaatagt 11738303  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||    
T  11738302 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaattattgtgaaaatgcttatgaaatacgaaactccctgcggaaatgatcctattata 11738203  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11738202 cttacgtgtaaatagttttat 11738182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33491802 - 33491582
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33491802 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 33491703  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||    
T  33491702 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtagacacgatcctattata 33491603  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33491602 cttacgtgtaaatagttttat 33491582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40999708 - 40999488
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40999708 tcgagaaattgcaactgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcaaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 40999609  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40999608 ttaacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 40999509  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40999508 cttacgtgtaaatagttttat 40999488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12167820 - 12167600
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12167820 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 12167721  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12167720 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 12167621  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12167620 cttacgtgtaaatagttttat 12167600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16131059 - 16131279
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16131059 tcgagatattgcagctgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagcgaaataaccctatcccttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 16131158  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16131159 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccgtgcggaaacgatcctattata 16131258  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16131259 cttacttgtaaatagttttat 16131279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9667300 - 9667080
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9667300 tcgagagattgaagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 9667201  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  9667200 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgcgaaaatgcttatgaactacgcaactccctgtggacacgatcctattata 9667101  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9667100 cttacgtgtaaatagttttat 9667080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38121536 - 38121316
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38121536 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 38121437  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||    
T  38121436 ttcacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcttattata 38121337  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  38121336 cttacgtgtaaataattttat 38121316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39000785 - 39000565
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39000785 tcgaaagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagtcctatctcttcttgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 39000686  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  39000685 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 39000586  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39000585 cttacgtgtaaatagttttat 39000565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 431945 - 431724
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  431945 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaattaggaaaataat 431846  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  431845 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 431746  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  431745 acttacgtgtaaatagttttat 431724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13217652 - 13217432
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13217652 tcgagagattgcagctgttacgtttggttgagctctgtgaccgcaagcgaaatggccctatctcttttcgttttacatttatgtcgaataggaaaatagt 13217553  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13217552 tttacacaaacatacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 13217453  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13217452 ctcacgtgtaaataattttat 13217432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20225966 - 20225746
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20225966 tcgagagattgtagctgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatatccccatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 20225867  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    |||   |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20225866 tttatacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgcggaaacgatcctattata 20225767  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  20225766 ctttcgtgtaaatagttttat 20225746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 49249622 - 49249842
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||     
T  49249622 tcgagagattgcagctgttacacttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgctttacatttatgtcaattaggaaaatag- 49249720  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||| || ||| |||    
T  49249721 tttacacaaacaaacaatttatatccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctatggacacgatcatatatat 49249820  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49249821 acttacgtgtaaatagttttat 49249842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 8995862 - 8995776
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  8995862 gagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatggccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 8995776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3365830 - 3365740
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  3365830 tcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatgaccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 3365740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 15161984 - 15162074
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||  || ||||||||  |||  ||||||||| |||||    
T  15161984 tcgagcgattgcagctgttacgcttagttgatatctctaaccccaagcgaaatagccatacctcttctctattttattttatgtcaaatag 15162074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Original strand, 9269197 - 9269247
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaata 54  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  9269197 gagattgcagttgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagcgaaata 9269247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26373232 - 26373015
Alignment:
Q  4 agagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26373232 agagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttt 26373133  T
Q  104 gcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 203  Q
     | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  26373132 acacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgcggaaacgatcctatcatactt 26373033  T
Q  204 acgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26373032 acgtgtaaatagttttat 26373015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35416297 - 35416080
Alignment:
Q  4 agagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35416297 agagattgcagctgttacgcttggctgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttt 35416198  T
Q  104 gcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 203  Q
     |  ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35416197 acagaaacaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactt 35416098  T
Q  204 acgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35416097 acgtgtaaatagttttat 35416080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 52619060 - 52619280
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52619060 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccccatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 52619159  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  52619160 tttacacaaacaaacaatttataaacaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccgtgcggaaacgatcctgttata 52619259  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52619260 cttacgtgtaaatagttttat 52619280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22048239 - 22048459
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22048239 tcgagagattgcaactgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 22048338  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  22048339 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 22048438  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22048439 cttacgtgtaaatagttttat 22048459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40995151 - 40994931
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40995151 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcatgcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaaataggaaaatagt 40995052  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||    
T  40995051 tttacacaaacaaacactttatacccaaacacttaatgtgacaagtattgtgaaaatgcatatgaaatacgcaactccctgtagaaacgatcttattata 40994952  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40994951 cttacgtgtaaatagttttat 40994931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 55327329 - 55327549
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55327329 tcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccctgtctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 55327428  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| || || ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  55327429 tttacacaaacaatcaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcatattata 55327528  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  55327529 cttacgtgtaaatagttttat 55327549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4838740 - 4838520
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4838740 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctaaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 4838641  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  4838640 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 4838541  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4838540 cttacgtgtaaatagttttat 4838520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5273166 - 5272947
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5273166 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatag- 5273068  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  5273067 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 5272968  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5272967 cttacgtgtaaatagttttat 5272947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21668508 - 21668288
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21668508 tcgagagattgcagctattactcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaataacactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataagaaaatagt 21668409  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| |||||||||||||  |||||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21668408 tttacacaaacaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 21668309  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21668308 cttacgtgtaaatagttttat 21668288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21677272 - 21677052
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21677272 tcgagagattgcagctattacacttggttgatgtctctgaccccaagcgaaataacactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataagaaaatagt 21677173  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| |||||||||||||  |||||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21677172 tttacacaaacaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 21677073  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21677072 cttacgtgtaaatagttttat 21677052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42532490 - 42532269
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42532490 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgatcgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 42532391  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  42532390 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacagttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttacgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctatatat 42532291  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  42532290 actcacgtataaatagttttat 42532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 1188522 - 1188741
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1188522 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagtgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 1188621  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||  | |||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1188622 ttcacacaaacaaacaatttatacccacacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacggaaacgatcctattata 1188721  T
Q  201 cttacgtgtaaatagtttta 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  1188722 ctaacgtgtaaatagtttta 1188741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 323996 - 324217
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  323996 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggtaaatagt 324095  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  324096 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 324195  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  324196 actcatgtgtaaatagttttat 324217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44428995 - 44428773
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44428995 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagtggtatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 44428896  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgac-tccctgcggaaacggtcctat-ta 198  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||    
T  44428895 tttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttccctgtggacacgatcctatata 44428796  T
Q  199 tacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44428795 tacttacgtgtaaatagttttat 44428773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 26070285 - 26070504
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26070285 tcgagagattgcagctgttatgcttggttgatgtctctgacccgaagtgaaattgccctatctcttctcattttacttttatgtcgaacaggaaaatagt 26070384  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||| | | |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26070385 tttacacaaacaaacaatttgttcccaaacaattaatgtggcaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 26070484  T
Q  201 cttacgtgtaaatagtttta 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  26070485 ctcacgtgtaaatagtttta 26070504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19247432 - 19247214
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatagg-aaaatag 99  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19247432 tcgagagattgcagttgttatgcttggttgatgtctctaaccgtaagcgaaatagctctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaaatag 19247333  T
Q  100 ttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattat 199  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  19247332 ttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgggataaacattgtgaaaatac--atgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcttattat 19247235  T
Q  200 acttacgtgtaaatagtttta 220  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  19247234 actcacgtgtaaatagtttta 19247214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 33239475 - 33239691
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33239475 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtttctgaccgcaagcggaatagccctaactcttctcattttacttttatgtctattaggaaaatagt 33239574  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | ||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33239575 tttacacaaa-caacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 33239673  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttt 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33239674 cttacgtgtaaatagttt 33239691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46691641 - 46691424
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46691641 tcgagagattgtagctgttacgcttgattgatgtctctgagcgcaagcgaaatagtcctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 46691542  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| | |  ||||| ||||||||||    
T  46691541 tttacacaaccaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaacattatgaaaatacttatgaaatacgcaactccttacaaaaacgatcctattata 46691442  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttt 218  Q
    || || ||||||||||||    
T  46691441 ctcacatgtaaatagttt 46691424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30217991 - 30217773
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatagg-aaaatag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  30217991 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgagctagccctatctcgtctcgttttacttttacgtcgaatagttaaaatag 30217892  T
Q  100 ttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattat 199  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||    
T  30217891 ttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgcgaaaacgatcttattat 30217792  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttt 218  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  30217791 acttacgtgtaaatggttt 30217773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 42271935 - 42272143
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  42271935 tcgagaggttgcagctgttacgcttgattgatgcctctgaccctaagcgaaatatc-ctatctcttctcgttttactttattgttgaataggaaaatagt 42272033  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42272034 tttacacaaataaacactttatacccaaacacttaaagtgataaatattgtgaacatacttatgaaatatgcaactccatgcggaaacgatcctattata 42272133  T
Q  201 cttacgtgta 210  Q
    ||||||||||    
T  42272134 cttacgtgta 42272143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20949304 - 20949522
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag-gaaaata 98  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20949304 tcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaagtagccttatctctactcgatttacttttatgtcgaatagttaaaata 20949403  T
Q  99 gttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctatta 198  Q
    ||||| | |||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||    ||  ||||||||| || |||||| ||| || |||||| || || |||||    
T  20949404 gttttacacaaacaaac-ttttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacgcaacttccagcggaatcgatcttatta 20949502  T
Q  199 tacttacgtgtaaatagttt 218  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  20949503 tactcacatgtaaatagttt 20949522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Original strand, 53895940 - 53896021
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtc 85  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  53895940 gagattgcagttgttaggcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctctatttatttttatgtc 53896021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19730984 - 19730904
Alignment:
Q  141 acaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  19730984 acaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacatgtgaaaagttttat 19730904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33110296 - 33110235
Alignment:
Q  9 ttgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 69  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  33110296 ttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagtcatatctcttctc 33110235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24576909 - 24576812
Alignment:
Q  126 caaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgct---tatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaatagtttta 220  Q
    |||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||   |||||||||||| | ||||| || ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  24576909 caaacatttaatgtgataaacattgtgaaaatactaattatgaaatacgcaattccctacgaaaacgatcatattatactcatgtgtaaatagtttta 24576812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 7315762 - 7315982
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7315762 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 7315861  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  7315862 tttacacaaataaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 7315961  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7315962 cttacgtgtaaatagttttat 7315982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16904213 - 16903993
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16904213 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 16904114  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16904113 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 16904014  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16904013 cttacgtgtaaatagttttat 16903993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27166702 - 27166482
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27166702 tcgagagattgcaacttttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 27166603  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27166602 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 27166503  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  27166502 ctgacgtgtaaatagttttat 27166482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 9404982 - 9405202
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9404982 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 9405081  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  9405082 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 9405181  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9405182 cttacgtgtaaatagttttat 9405202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30606680 - 30606460
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30606680 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 30606581  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  30606580 tttacacaaacaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 30606481  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30606480 cttacgtgtaaatagttttat 30606460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 34456853 - 34457073
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34456853 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcagaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 34456952  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  34456953 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 34457052  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34457053 cttacgtgtaaatagttttat 34457073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 11767312 - 11767533
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11767312 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 11767411  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  11767412 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 11767511  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11767512 acttacgtgtaaatagttttat 11767533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11722880 - 11722660
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11722880 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctaaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 11722781  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  11722780 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 11722681  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11722680 cttacgtgtaaatagttttat 11722660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14345019 - 14345238
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  14345019 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagctctatcttttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatag- 14345117  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | || | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  14345118 tttacacagacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaacattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 14345217  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14345218 cttacgtgtaaatagttttat 14345238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 24836280 - 24836500
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24836280 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctggttttacttttatgtcaattaggaaaatagt 24836379  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||| ||||||||||    
T  24836380 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctttggacacgatcctattata 24836479  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24836480 cttacgtgtaaatagttttat 24836500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 33435160 - 33435380
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33435160 tcgagagattgcagcagttacgcttgattgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttatcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 33435259  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||| ||||||||||    
T  33435260 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctttgtggacacgatcctattata 33435359  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33435360 cttacgtgtaaatagttttat 33435380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 6270451 - 6270668
Alignment:
Q  4 agagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6270451 agagattgcagctgttacgcatggttgatgtctctgacagcaagcgaaatgaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttt 6270550  T
Q  104 gcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 203  Q
     |  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||     
T  6270551 acataaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgcaatacgcaactccctacgaaaatgatcctattatactc 6270650  T
Q  204 acgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6270651 acgtgtaaatagttttat 6270668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 31846510 - 31846724
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  31846510 tcgagagattgcagctg--acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctccttttacttttatgttgattaggaaa-tagt 31846606  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| |  ||| ||||| ||||||| ||||||| |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  31846607 tttacataaacaaacaatttatacccaaacacct---gtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctatggacacgatcctattata 31846703  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31846704 cttacgtgtaaatagttttat 31846724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34869348 - 34869128
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34869348 tcgagaggttgcagttgttacacttggttgatgtctctgacccccagcgaaatagccctatctcttctcgctttacttttatgttgaataggaagatagt 34869249  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||    
T  34869248 tttacacaaacaaacaatttatacctaaacacttaatatgataaatattatgaaaatacttatgaaatacgcaatttcctacggaaacgatcctattata 34869149  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || || |||||||||||||||    
T  34869148 ctcacatgtaaatagttttat 34869128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 37251505 - 37251419
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  37251505 gagattgtagttgttacgcttggttgagtgtctctgacctcaagcgaaatgaccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 37251419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 221
Target Start/End: Original strand, 42801036 - 42801083
Alignment:
Q  174 actccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42801036 actccatgcggaaacgatcctattatagtcacgtgtaaatagttttat 42801083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 32227219 - 32227268
Alignment:
Q  4 agagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaat 53  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  32227219 agagattgaagttgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgaaat 32227268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7652826 - 7652606
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7652826 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaattagt 7652727  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  7652726 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 7652627  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7652626 cttacgtgtaaatagttttat 7652606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4742606 - 4742387
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4742606 tcgagagattgcagctattacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtagattaggaaaatagt 4742507  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4742506 tttacacaaaaaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 4742407  T
Q  201 cttacgtgtaaatagtttta 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  4742406 ctcacgtgtaaatagtttta 4742387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36469040 - 36468820
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36469040 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatttctaaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 36468941  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36468940 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaagtgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 36468841  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36468840 cttacgtgtaaatagttttat 36468820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 9989953 - 9990173
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9989953 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 9990052  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  9990053 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 9990152  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9990153 cttacgtgtaaatagttttat 9990173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 33248547 - 33248767
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248547 tcgagagattgcatctgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgaataggaaaatagt 33248646  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33248647 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 33248746  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  33248747 attatgtgtaaatagttttat 33248767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52307689 - 52307469
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  52307689 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 52307590  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  52307589 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacacgatcctattata 52307490  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52307489 cttacgtgtaaatagttttat 52307469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 8626181 - 8626402
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8626181 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtctattaggaaaatagt 8626280  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  8626281 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctatatat 8626380  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8626381 acttacgtgtaaatagttttat 8626402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10385674 - 10385453
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  10385674 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgctttactttcatgttgattaggaaaatagt 10385575  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  10385574 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 10385475  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10385474 acttacgtgtaaatagttttat 10385453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20962860 - 20962642
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20962860 tcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttgcttttatgtcgaataggaaaatagt 20962761  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  20962760 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacact--atgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacagaaacgatcctattata 20962663  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20962662 cttacgtgtaaatagttttat 20962642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27850155 - 27849935
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27850155 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagctctatctcttctcactttacttttatgtcgattaggaaaatagt 27850056  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  27850055 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgtggacacgatcctattata 27849956  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || || |||||||||||||||    
T  27849955 ctcacatgtaaatagttttat 27849935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 37023248 - 37023468
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37023248 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagt 37023347  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||  || || |||||||    
T  37023348 tttacgcaaacaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgtaactccctgtggactcgatcatattata 37023447  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37023448 cttacgtgtaaatagttttat 37023468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48167798 - 48167575
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48167798 tcgagagattgcagccgttacacttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccgtatctcttcttgttttacttttttgtcaaataggaaaatagt 48167699  T
Q  101 tttgcgcaaataaacact---ttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctatt 197  Q
    ||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  48167698 tttacgcaaacaaacaatttattatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtcgaaacgatcctatt 48167599  T
Q  198 atacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  48167598 atacttacgtataaatagttttat 48167575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22098538 - 22098758
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22098538 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgaccgcaagcggaataaccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagt 22098637  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  22098638 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctattata 22098737  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || || |||||||||||||||    
T  22098738 ctcacatgtaaatagttttat 22098758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11260389 - 11260203
Alignment:
Q  3 gagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttt 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11260389 gagagattgcagctgttacacttggttagtgtctccgaccgcaagcgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttt 11260290  T
Q  103 tgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacg 189  Q
    | | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11260289 tacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaagtccctgcggaaacg 11260203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 20837651 - 20837820
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20837651 tcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccacaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 20837750  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatac 170  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  20837751 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatac 20837820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 45528205 - 45528338
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45528205 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgaataggaaaatagt 45528304  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacactt 134  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  45528305 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacactt 45528338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 22098224 - 22098368
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22098224 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgaccgcaagcggaataaccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagt 22098323  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaa 145  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22098324 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaa 22098368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Original strand, 23382950 - 23383083
Alignment:
Q  89 taggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaac 188  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| || |||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  23382950 taggaaaatagttttacacaaacaaacaattaatacccaaacacttaacgtcacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacac 23383049  T
Q  189 ggtcctat-tatacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23383050 gatcctatatatacttacgtgtaaatagttttat 23383083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 23394127 - 23394201
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtttta 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  23394127 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaataaccctatctcttctcgtttta 23394201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 23396965 - 23397074
Alignment:
Q  112 aaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tatacttacgtgta 210  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  23396965 aaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatg-aatacgcaactccctgtggatacgatcctatatatacttacgtgta 23397063  T
Q  211 aatagttttat 221  Q
    |||||||||||    
T  23397064 aatagttttat 23397074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 23194477 - 23194545
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   |||||||||||    
T  23194477 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatggtcatatctcttctc 23194545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1232095 - 1232006
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |   |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  1232095 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgatatggtcatatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 1232006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 3588958 - 3589010
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaat 53  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  3588958 tcgagagattacagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgaaat 3589010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 2357722 - 2357771
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 53  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2357722 gagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaat 2357771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 221
Target Start/End: Original strand, 2357892 - 2357937
Alignment:
Q  176 tccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357892 tccctgcagaaacgatcatattatacttacgtgtaaatagttttat 2357937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 37471291 - 37471244
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagc 48  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  37471291 tcgagagattgcagttgttacgtttgcttgatgtcgctgaccgcaagc 37471244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9067771 - 9067551
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9067771 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 9067672  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  9067671 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaaagtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 9067572  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9067571 cttacgtgtaaatagttttat 9067551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11308591 - 11308371
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  11308591 tcgaaagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaataat 11308492  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  11308491 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 11308392  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11308391 cttacgtgtaaatagttttat 11308371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 28370651 - 28370872
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28370651 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 28370750  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||| |||    
T  28370751 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctatggacacgatcctatatat 28370850  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  28370851 acttacatgtaaatagttttat 28370872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8742887 - 8742667
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8742887 tcgagagattgcaactgttacccttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 8742788  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  8742787 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacatttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 8742688  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8742687 cttacgtgtaaatagttttat 8742667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34006377 - 34006157
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34006377 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctctttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 34006278  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  34006277 tttacacaaacaaataatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctgtggacacgatcctattata 34006178  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  34006177 cttacgtgcaaatagttttat 34006157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16959108 - 16959329
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatagg-aaaatag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16959108 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctttaaccccaagcgaaatagccctatctcgtctcgttttacttttatgtcgaatagttaaaatag 16959207  T
Q  100 ttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattat 199  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16959208 ttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattat 16959307  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16959308 acttacgtgtaaatagttttat 16959329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 3299359 - 3299579
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3299359 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgttgattaggaaaatagt 3299458  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  3299459 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtaacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 3299558  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  3299559 cttatgtgtaaatagttttat 3299579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22181134 - 22181354
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22181134 tcgagagattgcagttgttacgattcgttgatgtctctgactgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 22181233  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  22181234 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 22181333  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  22181334 cttacgtgtgaatagttttat 22181354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28925747 - 28925526
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28925747 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 28925648  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  28925647 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgggaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 28925548  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28925547 acttacgtgtaaatagttttat 28925526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41576935 - 41576715
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  41576935 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgacagcaagcggaatagccatatctcttctcgatttacttttatgtaaattaggaaaatagt 41576836  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  41576835 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 41576736  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41576735 cttacgtgtaaatagttttat 41576715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 27348587 - 27348804
Alignment:
Q  4 agagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27348587 agagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagtttt 27348686  T
Q  104 gcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 203  Q
     | |||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  27348687 acacaaacaaacaatttataccccaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaattccctgtggacacgattctattatactt 27348786  T
Q  204 acgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27348787 acgtgtaaatagttttat 27348804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13848932 - 13848711
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag-gaaaata 98  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||    
T  13848932 tcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctctactcgatttacttttatgtcaaatagttaaaata 13848833  T
Q  99 gttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctatta 198  Q
    ||||| | |||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||    ||  || |||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13848832 gttttacacaaacaaac-ttttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaattgcttaagatatacgcaactccctgcggaaacgatcctatta 13848734  T
Q  199 tacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  13848733 tactcacttgtaaatagttttat 13848711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 221
Target Start/End: Original strand, 16583062 - 16583155
Alignment:
Q  129 acacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tatacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16583062 acacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgtggacacgatcctatatatacttacgtgtaaatagttttat 16583155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 17993424 - 17993492
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  17993424 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatggtcctatctcttctc 17993492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4861555 - 4861487
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |   |||||||||||    
T  4861555 tcgagagattgcagctgttacgcttggttggtatctctgaccccaagcgaaatggtcatatctcttctc 4861487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 13510521 - 13510576
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagc 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  13510521 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagtgaaatagc 13510576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 13600051 - 13600106
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagc 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  13600051 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagtgaaatagc 13600106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 12538725 - 12538774
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 53  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12538725 gagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaat 12538774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 1607830 - 1607918
Alignment:
Q  4 agagattgcagctgttacgcttggttgatgtct-ctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   | || ||| ||||||||||  | ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  1607830 agagattgcagttgttacgcttggttgattaattctaaccccaagcgaaatgaccctatctcttctctatttatttttatgtcaaatag 1607918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22222272 - 22222189
Alignment:
Q  8 attgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  22222272 attgcagttgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagtgaattggccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 22222189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22228614 - 22228531
Alignment:
Q  8 attgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  22228614 attgcagttgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagtgaattggccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 22228531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32806367 - 32806147
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32806367 tcgagagattgcagctgttacgcttgattgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 32806268  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||    
T  32806267 tttacacaaacaaacaaattatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggaaacgatcctatcata 32806168  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32806167 cttacgtgtaaatagttttat 32806147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25056161 - 25055942
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25056161 tcgagagattgcagctgttacgcttgactgatgtctctgacagcaagcgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 25056062  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  25056061 tttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcttattata 25055962  T
Q  201 cttacgtgtaaatagtttta 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25055961 cttacgtgtaaatagtttta 25055942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21596130 - 21595912
Alignment:
Q  3 gagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttt 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21596130 gagagattgcagctgttacgtttggttgatgtatctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgatttacttttatgtcgaataggaaaatagttt 21596031  T
Q  103 tgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatact 202  Q
    | | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21596030 tacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcacctccctgcggaaacgatcctattatact 21595931  T
Q  203 tacgtgtaaatagttttat 221  Q
     ||||||||||||||||||    
T  21595930 cacgtgtaaatagttttat 21595912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9932409 - 9932188
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9932409 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttcttgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 9932310  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  9932309 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 9932210  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  9932209 acttacgtgtaaagagttttat 9932188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5670881 - 5670660
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5670881 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 5670782  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  5670781 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaaaacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 5670682  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  5670681 actcacgtgtaaatagttttat 5670660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26515032 - 26514811
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26515032 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcagaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 26514933  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | | |||||| |||    
T  26514932 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacaagatcctatatat 26514833  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26514832 acttacgtgtaaatagttttat 26514811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 3539605 - 3539826
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3539605 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagtggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 3539704  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||| |||    
T  3539705 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacacgatcctatatat 3539804  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3539805 acttacgtgtaaatagttttat 3539826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 8667489 - 8667709
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8667489 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 8667588  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| | |||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  8667589 tttacacaaacaaacaatttataccctaacacttaacttgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctattata 8667688  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8667689 cttacgtgtaaatagttttat 8667709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16698467 - 16698687
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16698467 tcgagagattacagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagt 16698566  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||| ||  ||||||||||    
T  16698567 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcttgtggacacaatcctattata 16698666  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16698667 ctcacgtgtaaatagttttat 16698687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24160860 - 24160638
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag--gaaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  24160860 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgatcgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaatagttaaaaata 24160761  T
Q  99 gttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctatta 198  Q
    ||||| | |||| ||| | ||||||| ||| |||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  24160760 gttttacacaaacaaataatttatacccaaccacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgcggaaacgatcctatta 24160661  T
Q  199 tacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||||    
T  24160660 tacttacatgttaatagttttat 24160638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5988606 - 5988419
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5988606 tcgagagattgcagttgttgcgcttggttgatgtctctgaccccaagtgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcggatagaaaaatagt 5988507  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaac 188  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  5988506 tttacacaaacaaacattttatacccaaacagttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgcagaaac 5988419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Original strand, 24879425 - 24879558
Alignment:
Q  3 gagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttt 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879425 gagagattgcagctattacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttt 24879524  T
Q  103 tgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaa 136  Q
    | |  ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  24879525 tacaaaaacaaacaatttatacccaaatacttaa 24879558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 221
Target Start/End: Original strand, 6778170 - 6778333
Alignment:
Q  58 ctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||| || ||||| ||    
T  6778170 ctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaatacttaaagtgataaacattgtgaatat 6778269  T
Q  158 gcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  6778270 gcttatgaaatatgcaactccctgcagaaacgatcatattatactcacatgtaaatagttttat 6778333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 34007032 - 34007147
Alignment:
Q  20 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||||| ||    
T  34007032 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgttgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatt 34007131  T
Q  120 tatactcaaacactta 135  Q
    ||||| ||||||||||    
T  34007132 tatacccaaacactta 34007147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Original strand, 26604882 - 26605093
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag-gaaaatagttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| || || |||| ||||  |||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  26604882 gagattgcagctgttacgcttggttgattatctctaaccccaagcgaaatggccctctctcgtctccatttatttttatgtcaaatagttaaaatagttt 26604981  T
Q  103 tgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatact 202  Q
    |   |||| ||||  ||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||| | ||| || | ||| | ||||| ||||||    
T  26604982 taaacaaacaaac-ttttatacccaaacacttaagatgataaatatcgttaaaatgcttatcagatacgctagtccgtgtgaaaatgatcctaatatact 26605080  T
Q  203 tacgtgtaaatag 215  Q
     |||| |||||||    
T  26605081 cacgtataaatag 26605093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 25977507 - 25977596
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttg-atgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  25977507 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgaatgtc-ctgaccccaagtgaaatagccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 25977596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 1455349 - 1455439
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |   |||||||||||  |||  ||||||||| |||||    
T  1455349 tcgagagattgcagctgttatgcttggttgatctctctaaccccaagcgaaatggtcttatctcttctctattttattttatgtcaaatag 1455439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 1467041 - 1467131
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |   |||||||||||  |||  ||||||||| |||||    
T  1467041 tcgagagattgcagctgttatgcttggttgatctctctaaccccaagcgaaatggtcttatctcttctctattttattttatgtcaaatag 1467131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 15642974 - 15643064
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgat-gtctctgaccgcaa-gcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaat 89  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15642974 tcgaaagattgcagttgttatgcttggttgattgtctctgaccccaaagcgaaatttccctatctcgtctcgatttacttttatgtcgaat 15643064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 34914246 - 34914335
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |   |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  34914246 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaacccgaagcgaaatggttatatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 34914335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 14271232 - 14271319
Alignment:
Q  3 gagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |   |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  14271232 gagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaacccgaagcgaaatggtcatatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 14271319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 21631741 - 21631831
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  21631741 tcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcggaatgaccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 21631831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 9518046 - 9517961
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  9518046 gagattgcagttgttacacttggttgagtgtgtctgacc-caagcgaaatggccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 9517961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13181957 - 13181908
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 53  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  13181957 gagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgatcccaagcgaaat 13181908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 154
Target Start/End: Original strand, 14479776 - 14479812
Alignment:
Q  118 tttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaa 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14479776 tttatacccaaacacttaatgtgacaaaaattgtgaa 14479812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 116172 - 115953
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116172 tcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttcaagttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 116073  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  116072 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgcggaaacgatcctattata 115973  T
Q  201 cttacgtgtaaatagtttta 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  115972 ctcacgtgtaaatagtttta 115953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 169012 - 168792
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  169012 tcgagagattacagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaattaggaaaatagt 168913  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  168912 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 168813  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  168812 cttacgtgtaagtagttttat 168792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36667492 - 36667273
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36667492 tcgagagatttcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaattgccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 36667393  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36667392 tttacacaaacaaacaatttatattcaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattata 36667293  T
Q  201 cttacgtgtaaatagtttta 220  Q
    || || ||||||||||||||    
T  36667292 ctcacatgtaaatagtttta 36667273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 29224272 - 29224493
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29224272 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 29224371  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  29224372 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 29224471  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  29224472 actcacgtgtaaatagttttat 29224493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 29337571 - 29337792
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29337571 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 29337670  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  29337671 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 29337770  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  29337771 actcacgtgtaaatagttttat 29337792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13229946 - 13229726
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13229946 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgttgattaggaaaatagt 13229847  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| || |||||||    
T  13229846 tttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattataaaaatgcttataaaatacgcaactccatgtggaaacgatcatattata 13229747  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13229746 cttacgtgtaaatagttttat 13229726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28457481 - 28457261
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28457481 tcgagagattgcagctattacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcaaatagaaaaatagt 28457382  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  28457381 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcatattata 28457282  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28457281 cttacgtgtaaatagttttat 28457261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 43992072 - 43992290
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43992072 tcgagagattgcagatgttacgcttgattgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttt-atgtcgattaggaaaatagt 43992170  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||    
T  43992171 tttgcgcaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgtgg-aacgatcctattata 43992269  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43992270 cttacgtgtaaatagttttat 43992290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42700563 - 42700358
Alignment:
Q  16 tgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaac 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  42700563 tgttacgcttggttgatgtctccgactgcaagccaaatagccatatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaac 42700464  T
Q  116 actttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaatag 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42700463 aatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgtaaatag 42700364  T
Q  216 ttttat 221  Q
    ||||||    
T  42700363 ttttat 42700358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8679399 - 8679179
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8679399 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagctagataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 8679300  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8679299 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattattcaactccctgtggaaacgatcctattata 8679200  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8679199 cttacgtgtaaatagttttat 8679179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23924636 - 23924416
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23924636 tcgagagattgcagctgttacgtttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatggccctatctcttattgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 23924537  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| |  |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23924536 tttacagaaacgaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacggaaacgatcctattata 23924437  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23924436 ctcacgtgtaaatagttttat 23924416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 27257942 - 27258162
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27257942 tcgagagattgcagctgttacgattggttgatgtctctaaccccaagtgaaattgccctatctcttctcgttttacttttatgtcaaataggaaaatagt 27258041  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  27258042 tttacacaaacaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctgcggaaacaatcatattata 27258141  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27258142 cttacgtgtaaatagttttat 27258162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36557166 - 36556946
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  36557166 tcgagagattgcaactgttacgctttgttgatatctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataaaacaatagt 36557067  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||    
T  36557066 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgcggaaacgatcatattata 36556967  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36556966 cttacgtgtaaatagttttat 36556946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36039866 - 36039646
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36039866 tcgagagattgtatttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagt 36039767  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| || | | ||| ||||||||||    
T  36039766 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcatatgaaatacgcaactccttgtgaacacgatcctattata 36039667  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36039666 cttacgtgtaaatagttttat 36039646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14701201 - 14701422
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatagg-aaaatag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14701201 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatttctaaccccaagcgaaatagctctatcttgtctcgttttacttttatgtcgaatagttaaaatag 14701300  T
Q  100 ttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattat 199  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14701301 ttttacacaaacaaacaatttatactcaaacactcaatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatccaattat 14701400  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14701401 acttacgtgtaaatagttttat 14701422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 32523486 - 32523708
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtc--gaataggaaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||   | ||||||||||    
T  32523486 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttatcgttttaattttatgtcataagtaggaaaata 32523585  T
Q  99 gttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctatta 198  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||  || |||||    
T  32523586 gttttacacaaacaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgtttatgaaatatgcaactccctgcagaaacaatcatatta 32523685  T
Q  199 tacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || ||||||||||||| ||||||    
T  32523686 tagttacgtgtaaataattttat 32523708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9786708 - 9786588
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9786708 tcgatagattgcagttgttacgcttggttgatgtctttgaccccaagcgaaataattctatctcttatcgttttacttttatgtcgaatagaaaaatagt 9786609  T
Q  101 tttgcgcaaataaacacttta 121  Q
    ||| | |||||||||| ||||    
T  9786608 tttacacaaataaacatttta 9786588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 28006753 - 28006862
Alignment:
Q  112 aaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaa 211  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28006753 aaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaacttcctacggaaacgatcctattatacttacgtgtaa 28006852  T
Q  212 atagttttat 221  Q
    ||||||||||    
T  28006853 atagttttat 28006862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24662732 - 24662515
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatg-tctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatagg-aaaata 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | | | || |||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  24662732 tcgagagattgcagttgttacgcttggttgattatctctaatccctagtgaaatagccctatctcgtcccgatttacttttttgtcgaatagttaaaata 24662633  T
Q  99 gttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctatta 198  Q
    ||||| | |||| ||||  ||||||| ||||||| |||| ||| |||    ||  ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  24662632 gttttacacaaacaaact-tttatacccaaacacctaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacgcaactccctgcagaaacgatcctatta 24662534  T
Q  199 tacttacgtgtaaatagtt 217  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  24662533 tactcacgtgtaaatagtt 24662515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Original strand, 41978156 - 41978242
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  41978156 gagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 41978242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 221
Target Start/End: Original strand, 31759011 - 31759056
Alignment:
Q  176 tccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31759011 tccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgtaaatagttttat 31759056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9783701 - 9783656
Alignment:
Q  176 tccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9783701 tccctgcggaaacgatcctattatacttacgtgtaaagagttttat 9783656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 21160523 - 21160560
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctct 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21160523 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctct 21160560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28503 - 28283
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28503 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagggggatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 28404  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  28403 tttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 28304  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28303 cttacgtgtaaatagttttat 28283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11808 - 11588
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11808 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttactattatgtcgattaggaaaatagt 11709  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| |  ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  11708 tttacataaacaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 11609  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11608 cttacgtgtaaatagttttat 11588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15578 - 15358
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15578 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttactattatgtcgattaggaaaatagt 15479  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    ||| |  ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15478 tttacataaacaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 15379  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15378 cttacgtgtaaatagttttat 15358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 12752 - 12973
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12752 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaataat 12851  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  12852 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 12951  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12952 acttacgtgtaaatagttttat 12973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12092 - 11870
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12092 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaattaggaaaatagt 11993  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgac-tccctgcggaaacggtcctat-ta 198  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||    
T  11992 tttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttccctgtggacacgatcctatata 11893  T
Q  199 tacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11892 tacttacgtgtaaatagttttat 11870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 9300 - 9521
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9300 tcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 9399  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  9400 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 9499  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9500 acttacgtgtaaatagttttat 9521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 350196 - 349992
Alignment:
Q  15 ctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||    
T  350196 ctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaa 350097  T
Q  115 cactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaata 214  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  350096 caatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatacttacgtgtaaata 349997  T
Q  215 gtttt 219  Q
    |||||    
T  349996 gtttt 349992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 7289 - 7508
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7289 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgactgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 7388  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 200  Q
    |||||  ||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||    
T  7389 tttgcataaacaaacaatttatatccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactcccggtggacac-atcctattata 7487  T
Q  201 cttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  7488 ctcacgtgtaaatagttttat 7508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25254 - 25033
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25254 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgctttacttttatgttgatttggaaaatagt 25155  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat-tat 199  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| | | |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  25154 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgcggcaaatattgtgaaaatgcctatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatatat 25055  T
Q  200 acttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25054 acttacgtgtaaatagttttat 25033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 76056 - 75892
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 100  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  76056 tcgagagattgtagttgttacgtttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagt 75957  T
Q  101 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatga 165  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  75956 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 75892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Original strand, 175247 - 175379
Alignment:
Q  89 taggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaac 188  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  175247 taggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacac 175346  T
Q  189 ggtcctattatacttacgtgtaaatagttttat 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175347 gatcctattatacttacgtgtaaatagttttat 175379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16077 - 16009
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttct 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16077 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttct 16009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14674 - 14610
Alignment:
Q  154 aaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaatagttt 218  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  14674 aaatgcttaagatatatgcaactctctgcggaaacgatcctattatactcatgtgtaaatagttt 14610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 6088 - 6290
Alignment:
Q  16 tgttacgcttggttgatg-tctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatagg-aaaatagttttgcgcaaataa 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||| | |||| ||    
T  6088 tgttacgcttggttgattatctctaaccccaagcgaaatggccctatctcgtctcgatttatttttaagtcgaatagttaaaatagttttacacaaacaa 6187  T
Q  114 acactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatacttacgtgtaaat 213  Q
    ||  ||||||| |||| ||||||  ||| ||| || ||  ||||||||||||  || || | |||||||||||||| || | ||||||| || |||||||    
T  6188 act-tttatacccaaatacttaagatgataaatattgtttaaatgcttatgaggtaagctagtccctgcggaaacgatcatgttatactcacatgtaaat 6286  T
Q  214 agtt 217  Q
    ||||    
T  6287 agtt 6290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 14742 - 14810
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  14742 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaacctcaagcgaaatggtcctatctcttctc 14810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4946 - 4860
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  4946 gagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatggccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 7314 - 7403
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |   |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  7314 tcgagagattgcagctgttacgcttgattgatatctctaaccccaagcgaaatggtcatatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 7403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 7324 - 7413
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |   |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  7324 tcgagagattgcagctgttacgcttgattgatatctctaaccccaagcgaaatggtcatatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 7413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0152 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0152
Description:

Target: scaffold0152; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 24935 - 25024
Alignment:
Q  1 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |   |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  24935 tcgagagattgcagctgttacgcttgattgatatctctaaccccaagcgaaatggtcatatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 25024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 34923 - 34874
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 53  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34923 gagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaat 34874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Original strand, 399 - 463
Alignment:
Q  107 caaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacg 171  Q
    |||| ||||| |||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  399 caaacaaacattttaaacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgagatacg 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 584 - 535
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 53  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  584 gagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccgagcgaaat 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 45830 - 45781
Alignment:
Q  5 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 53  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45830 gagattgcatttgttacgcttggttgagtgtctctgacctcaagcgaaat 45781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University