View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16741_high_22 (Length: 432)

Name: NF16741_high_22
Description: NF16741
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16741_high_22
NF16741_high_22
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-414)||(23289651-23290064)
chr6 (5-309)||(23283443-23283747)
chr6 (5-293)||(23391241-23391529)
chr6 (1-278)||(23586943-23587220)
chr6 (1-275)||(23257804-23258078)
chr6 (1-308)||(23251795-23252102)
chr6 (1-308)||(23266326-23266633)
chr6 (5-278)||(23583060-23583332)
chr6 (5-277)||(23633978-23634250)
chr6 (1-278)||(23247413-23247690)
chr6 (5-276)||(23506799-23507070)
chr6 (315-408)||(23283317-23283410)
chr6 (150-278)||(23506635-23506763)
chr6 (5-199)||(23594088-23594282)
chr6 (336-414)||(23251707-23251782)
chr6 (334-414)||(23257680-23257760)
chr6 (336-408)||(23247298-23247370)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23290064 - 23289651
Alignment:
Q  1 tagaggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23290064 tagaggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgag 23289965  T
Q  101 atggctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23289964 atggctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaagcttcctattcctgcct 23289865  T
Q  201 ccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgactactgtcattgacacggttgtggc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23289864 ccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagccgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgactactggcattgacacggttgtggc 23289765  T
Q  301 tgttgtcgttgcggtggaagaagaggaagaagtgttgaatatgttttgtgtggaagtcgaaaaagaagagcaagtgttgaatatgcaagagttgtggaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23289764 tgttgtcgttgcggtggaagaagaggaagaagtgttgaatatgttttgtgtggaagtcgaaaaagaagaggaagtgttgaatatgcaagagttgtggaaa 23289665  T
Q  401 aatatggcactaat 414  Q
    ||||||||||||||    
T  23289664 aatatggcactaat 23289651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23283747 - 23283443
Alignment:
Q  5 ggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgagatgg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  23283747 ggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtttgtgaaatgagggaacccaacaaaaagactaggatttggctagggacttttccaacggctgagatgg 23283648  T
Q  105 ctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcctccgc 204  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23283647 ctgcacgagcacacgacgttgcagccatggcattaaggggccgctatgcctgtctcaactttgcagactcggtgtggaggcttcctattcctgcctccgc 23283548  T
Q  205 tgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgactactgtcattgacacggttgtggctgtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||     
T  23283547 tgaagcaaaagacattcaaagggcagctgcagaagccgccgaggctttcagaccagacaagactttaatgactaacgacattgacaccgttgtggctgtc 23283448  T
Q  305 gtcgt 309  Q
    |||||    
T  23283447 gtcgt 23283443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23391529 - 23391241
Alignment:
Q  5 ggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgagatgg 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  23391529 ggtgtgaggaaaagaaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaaaatttggctaggcacttttccaactgcggagatgg 23391430  T
Q  105 ctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcctccgc 204  Q
    | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| || |    
T  23391429 cagcccgagcacatgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactccgcgtggcggctccctatacctgccaccac 23391330  T
Q  205 tgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgactactgtcattgacacgg 293  Q
    | | |||||||| || |||| ||| |||| | | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  23391329 tcaggcaaaagatatacaaaaggcggctgcacaggccgctgaggctttcagaccagacaagacttcaattactaatgacattgacacgg 23391241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23587220 - 23586943
Alignment:
Q  1 tagaggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23587220 tagaggagtgaggaagaggaacttagataaatgggtttgtgaaatgagggagcctaacaagaagactaagatttggctagggacttttccaactgccgag 23587121  T
Q  101 atggctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcct 200  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |  |||||      
T  23587120 atggcagcccgtgcccacgatgttgctgcaatggcattgaggggccgctacgcttgtctcaactttgcagactcagcgtggcggctccccaaacctgcaa 23587021  T
Q  201 ccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgacta 278  Q
    |  || ||||||| || || |||| ||| |||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23587020 ctactcaagcaaaggatatacaaaaggctgctacagaggccgccgaggctttcagaccagacaagactttattgacta 23586943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23258078 - 23257804
Alignment:
Q  1 tagaggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  23258078 tagaggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaacccaacacaaagaccaggatttggctggggacttttccaacacccgaa 23257979  T
Q  101 atggctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcct 200  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||      
T  23257978 atggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcctgtctcaattttgcagactcggtgtggcgccttcctattccagcaa 23257879  T
Q  201 ccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatga 275  Q
    |  | |    |||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23257878 cttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttagaccagacaagactttaatga 23257804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23252102 - 23251795
Alignment:
Q  1 tagaggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || |  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23252102 tagaggtgtgaggaagaggaacttaaataaatgggtttgtgaaatgagggagccgaacacaaagaataggatttggctaggaacttttccaacagccgag 23252003  T
Q  101 atggctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcct 200  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||      
T  23252002 atggcagcccgagcccacgatgttgccgcgatagcattgaggggccgctatgcctgtctcaattttgcagactcggtgtggcgccttcctattccagcaa 23251903  T
Q  201 ccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgactactgtcattgacacggttgtggc 300  Q
    |  | |    |||||| ||||||| |||||||  | |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||    
T  23251902 cttccgcgataaaagatattcaaaaggcagctacaaaagccgccgaagcttttagaccagacaatactttaatgaccagtgacattgacaccgttgtagc 23251803  T
Q  301 tgttgtcg 308  Q
    ||||||||    
T  23251802 tgttgtcg 23251795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23266633 - 23266326
Alignment:
Q  1 tagaggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23266633 tagaggtgtaaggaagaggaacttagataaatgggtttgtgaaatgagggaacccaacacgaagactagaatttggctaggaacttttccaacagccgag 23266534  T
Q  101 atggctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcct 200  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||      
T  23266533 atggcagcccgagcccacgatgttgctgcgatggcattgaggggtcgctacgcctgtctcaattttgcagattcggtgtggcggcttcctattccagcaa 23266434  T
Q  201 ccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgactactgtcattgacacggttgtggc 300  Q
    |  |   |  |||||| ||||||| |||||||  | |||| || || ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||   |||||| || ||||| ||    
T  23266433 cttcctcaataaaagatattcaaaaggcagctacaaaagccgccgaagcttttagaccagacaatactataatgattaccaacattgagactgttgtagc 23266334  T
Q  301 tgttgtcg 308  Q
    ||||||||    
T  23266333 tgttgtcg 23266326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23583332 - 23583060
Alignment:
Q  5 ggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgagatgg 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  23583332 ggtgtaaggaagaggaacttagataaatgggtttgtgaaatgaggaagcctaacaagaagactaagatttggctagggacttttccaactgcggagatgg 23583233  T
Q  105 ctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcctccgc 204  Q
    |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || |  |||||  |  |    
T  23583232 caacccgtgcccacgatgttgctgcaatggcattga-gggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcagcatggcggctccccaaacctgcaactac 23583134  T
Q  205 tgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgacta 278  Q
    | | ||||| || || |||| ||| |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23583133 tcaggcaaaggatatacaaaaggctgctgcagaggccgccaaggctttcagaccagacaagactttattgacta 23583060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23634250 - 23633978
Alignment:
Q  5 ggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgagatgg 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23634250 ggtgtgaggaggaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggagcctaacaagaagactaagatttggctagggacttttccaacggccgagatgg 23634151  T
Q  105 ctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcctccgc 204  Q
    | || || ||||| || || || ||| | ||||| || || ||| |||||||||| || ||||| ||||| || | | ||||||||||||||||| |  |    
T  23634150 cagcacgagcacatgatgtcgcggcattggcattaagaggtcgcaacgcctgtcttaattttgctgactctgcctcgcggcttcctattcctgccactac 23634051  T
Q  205 tgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgact 277  Q
     ||  ||| ||| || |||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23634050 agagacaagagatatacaaaagacggctgcagaagctgccgaggctttcagaccagacaagactttaacgact 23633978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23247690 - 23247413
Alignment:
Q  1 tagaggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || |  |||| |||||||||||| || |||||| ||||| | |||    
T  23247690 tagaggtgtgaggaagaggaacttaaataaatgggtttgtgaaatgagggagccgaacacaaagaataggatttggctgggaacttttccaacaccggag 23247591  T
Q  101 atggctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcct 200  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||| | ||||||||||| ||      
T  23247590 atggctgcccgagcccacgatgttgctgcaatggcattgaggggccgctatgcctgtctcaatttctcagactcggtgtggcgccttcctattccagcaa 23247491  T
Q  201 ccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgacta 278  Q
    |  | | |  |||||| ||||||| |||||||  | |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23247490 cttccgcaataaaagatattcaaaaggcagctacaaaagcggccgaagcttttagaccagacaatactttaatgacta 23247413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23507070 - 23506799
Alignment:
Q  5 ggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgagatgg 104  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | || || || ||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23507070 ggtgtgaggagtaggaacctagataaatgggtgtgtgaaataagacagcctaacaaaaagaccaagatttggctaggaacttttccaacagccgagatgg 23506971  T
Q  105 ctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcctccgc 204  Q
    | || || || || || ||||| ||| | || ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||  |       
T  23506970 cagctcgggcccatgatgttgcggcactggcgttgaaaggtggcgacgcctgtctcaactttgcagactcggccttgacgctccctattcctgctacttg 23506871  T
Q  205 tgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggctttcagaccagacaagactttaatgac 276  Q
     ||  ||||||| || |||| | | ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  23506870 cgagacaaaagatatacaaaagacggctgctgaagctgctgaggcattcagaccaggcaagactgtaatgac 23506799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23283410 - 23283317
Alignment:
Q  315 tggaagaagaggaagaagtgttgaatatgttttgtgtggaagtcgaaaaagaagagcaagtgttgaatatgcaagagttgtggaaaaatatggc 408  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||    
T  23283410 tggaagaagaggaggaagtgttgaatatgttttgtgtggaagtcgaaaaagaagaggaagtgttgaatatgtcagagatgtggaggaatatggc 23283317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23506763 - 23506635
Alignment:
Q  150 acgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcctccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagctgctgaggc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |    ||  ||| ||| || ||||  || |||| ||||||| |||||||    
T  23506763 acgcctgtctcaactttgcagactcggcctcgcggcttcctattcctgccactaaagagacaagagatatacaaaacgcggctgcagaagctactgaggc 23506664  T
Q  250 tttcagaccagacaagactttaatgacta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23506663 tttcagaccagacaagactttaacgacta 23506635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23594282 - 23594088
Alignment:
Q  5 ggtgtgaggaagaggaacttagataaatgggtgtgtgaaatgagggaaccaaataagaagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgagatgg 104  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||  || |||||||    
T  23594282 ggtgtgaggagtaggaatttaggtaaatgggtgtgtgaaatgagggagcctaacaagatgactaagatatggctaggaacttttccaatggctgagatgg 23594183  T
Q  105 ctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcagactcggcgtggaggcttcctattcctgcc 199  Q
      || || || || || || ||  || | |||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||    
T  23594182 aagcacgagcccatgatgtcgcgacattggcattgagaggttgttacgcttgtctcaactttgcagactctgcatggcggctccttattcctgcc 23594088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23251782 - 23251707
Alignment:
Q  336 tgaatatgttttgtgtggaagtcgaaaaagaagagcaagtgttgaatatgcaagagttgtggaaaaatatggcactaat 414  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  23251782 tgaatatgtttcgtgttgaagtcgaa---gaagaggaagtgttgaatatgccagagttgtggaggaatatggcactaat 23251707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23257760 - 23257680
Alignment:
Q  334 gttgaatatgttttgtgtggaagtcgaaaaagaagagcaagtgttgaatatgcaagagttgtggaaaaatatggcactaat 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  23257760 gttgaatatgttttgtgtggaagtcgaagaagagcaggaaatgttgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaat 23257680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23247370 - 23247298
Alignment:
Q  336 tgaatatgttttgtgtggaagtcgaaaaagaagagcaagtgttgaatatgcaagagttgtggaaaaatatggc 408  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || | ||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  23247370 tgaatatgttttgtgtggaagttgatgaacaggaggaaatgttgaatatgccagagttgtggaggaatatggc 23247298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University