View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16744_low_12 (Length: 226)

Name: NF16744_low_12
Description: NF16744
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16744_low_12
NF16744_low_12
[»] chr7 (106 HSPs)
chr7 (1-226)||(20137096-20137320)
chr7 (1-226)||(24748672-24748897)
chr7 (1-226)||(44724657-44724881)
chr7 (1-226)||(13099461-13099687)
chr7 (1-226)||(31435033-31435258)
chr7 (1-226)||(39145973-39146198)
chr7 (1-226)||(4295921-4296145)
chr7 (1-226)||(38394064-38394288)
chr7 (1-226)||(48457731-48457955)
chr7 (1-226)||(37412112-37412338)
chr7 (1-226)||(7092200-7092423)
chr7 (1-226)||(7470009-7470233)
chr7 (1-226)||(9680898-9681122)
chr7 (1-226)||(21592130-21592354)
chr7 (1-226)||(21990228-21990452)
chr7 (1-225)||(20297441-20297664)
chr7 (1-226)||(42330984-42331210)
chr7 (1-220)||(20299544-20299762)
chr7 (1-222)||(9679141-9679361)
chr7 (1-226)||(11355336-11355560)
chr7 (1-226)||(20626116-20626340)
chr7 (1-226)||(20630007-20630231)
chr7 (1-226)||(20642426-20642650)
chr7 (1-226)||(40836730-40836953)
chr7 (8-226)||(27306224-27306441)
chr7 (1-226)||(35707-35931)
chr7 (1-226)||(1850059-1850283)
chr7 (1-226)||(3878655-3878879)
chr7 (1-226)||(7471967-7472191)
chr7 (1-226)||(18345619-18345843)
chr7 (1-225)||(7094447-7094670)
chr7 (1-226)||(443673-443898)
chr7 (8-226)||(27832631-27832844)
chr7 (1-226)||(44642-44866)
chr7 (1-226)||(1046912-1047135)
chr7 (1-226)||(1049283-1049506)
chr7 (4-226)||(42223236-42223457)
chr7 (1-226)||(28487631-28487855)
chr7 (1-226)||(40946406-40946630)
chr7 (1-222)||(43253504-43253724)
chr7 (67-226)||(25276219-25276378)
chr7 (1-226)||(3035799-3036026)
chr7 (1-226)||(7351639-7351863)
chr7 (8-226)||(21678144-21678361)
chr7 (1-226)||(21680105-21680332)
chr7 (38-215)||(24817377-24817554)
chr7 (1-226)||(25542608-25542830)
chr7 (1-226)||(38396713-38396936)
chr7 (1-222)||(24258545-24258770)
chr7 (11-215)||(24813494-24813699)
chr7 (1-226)||(31155898-31156122)
chr7 (48-215)||(20091581-20091745)
chr7 (1-226)||(28485644-28485867)
chr7 (38-226)||(7349297-7349484)
chr7 (11-198)||(2935374-2935560)
chr7 (1-198)||(22108173-22108368)
chr7 (1-198)||(40549933-40550128)
chr7 (71-220)||(11757314-11757462)
chr7 (54-226)||(22828672-22828844)
chr7 (1-198)||(22137184-22137379)
chr7 (1-198)||(40552211-40552406)
chr7 (54-215)||(7188628-7188789)
chr7 (11-198)||(9027191-9027376)
chr7 (1-148)||(22393878-22394025)
chr7 (11-198)||(1606486-1606671)
chr7 (8-171)||(26295580-26295743)
chr7 (11-212)||(24465629-24465829)
chr7 (11-197)||(6332326-6332514)
chr7 (114-225)||(26804651-26804762)
chr7 (71-185)||(22251602-22251720)
chr7 (66-174)||(6348912-6349020)
chr7 (11-212)||(16297018-16297222)
chr7 (11-212)||(11081598-11081803)
chr7 (1-61)||(11759369-11759429)
chr7 (1-52)||(26804761-26804812)
chr7 (157-215)||(22392550-22392608)
chr7 (8-197)||(25351353-25351539)
chr7 (38-130)||(6046668-6046759)
chr7 (8-197)||(25410130-25410318)
chr7 (9-185)||(6067193-6067370)
chr7 (65-198)||(6048976-6049111)
chr7 (14-197)||(21369642-21369824)
chr7 (42-209)||(40281411-40281572)
chr7 (38-197)||(2120899-2121056)
chr7 (11-198)||(13290470-13290658)
chr7 (8-197)||(25357047-25357233)
chr7 (156-212)||(11084467-11084523)
chr7 (38-197)||(3320076-3320232)
chr7 (38-197)||(3324824-3324980)
chr7 (187-226)||(18567691-18567730)
chr7 (38-197)||(25405393-25405549)
chr7 (156-197)||(12310157-12310198)
chr7 (8-84)||(34546874-34546951)
chr7 (38-197)||(42006663-42006820)
chr7 (8-51)||(6359946-6359989)
chr7 (38-197)||(7069780-7069936)
chr7 (38-197)||(7074787-7074943)
chr7 (159-197)||(8378648-8378686)
chr7 (159-197)||(15541139-15541177)
chr7 (38-84)||(44010775-44010821)
chr7 (8-84)||(2075226-2075303)
chr7 (8-84)||(7464513-7464590)
chr7 (1-34)||(22251572-22251605)
chr7 (156-212)||(26210631-26210688)
chr7 (14-62)||(9190053-9190101)
chr7 (14-58)||(30814560-30814604)
[»] chr6 (79 HSPs)
chr6 (1-226)||(13057297-13057522)
chr6 (1-226)||(13039857-13040082)
chr6 (3-226)||(3390482-3390705)
chr6 (1-226)||(9020029-9020253)
chr6 (1-226)||(11983016-11983240)
chr6 (1-226)||(3631926-3632149)
chr6 (1-209)||(1069705-1069913)
chr6 (1-223)||(32280102-32280324)
chr6 (1-226)||(1230236-1230460)
chr6 (1-226)||(3629852-3630075)
chr6 (1-226)||(4816218-4816442)
chr6 (1-226)||(30967304-30967528)
chr6 (4-226)||(25477377-25477606)
chr6 (1-226)||(14458754-14458976)
chr6 (1-226)||(28241308-28241532)
chr6 (1-226)||(3233712-3233941)
chr6 (1-226)||(30034590-30034814)
chr6 (1-226)||(19704554-19704780)
chr6 (1-226)||(14507163-14507386)
chr6 (1-226)||(26065086-26065308)
chr6 (1-226)||(26085055-26085277)
chr6 (1-220)||(14466432-14466651)
chr6 (1-226)||(2628873-2629096)
chr6 (11-226)||(5273213-5273427)
chr6 (1-226)||(30728811-30729039)
chr6 (9-226)||(20915351-20915567)
chr6 (1-213)||(12186058-12186271)
chr6 (57-226)||(15530166-15530333)
chr6 (1-226)||(15541127-15541351)
chr6 (6-225)||(15532674-15532891)
chr6 (11-213)||(15719758-15719961)
chr6 (1-223)||(24338435-24338655)
chr6 (1-226)||(26932548-26932773)
chr6 (11-214)||(16455421-16455625)
chr6 (56-215)||(3027895-3028054)
chr6 (1-226)||(12195502-12195726)
chr6 (1-198)||(26066111-26066307)
chr6 (1-226)||(12161545-12161768)
chr6 (1-198)||(29754696-29754892)
chr6 (1-198)||(33308988-33309183)
chr6 (1-198)||(26068382-26068578)
chr6 (1-198)||(33311257-33311452)
chr6 (11-215)||(15367145-15367349)
chr6 (73-198)||(22490771-22490896)
chr6 (11-214)||(26945258-26945463)
chr6 (75-214)||(17012155-17012294)
chr6 (11-212)||(19696556-19696759)
chr6 (121-226)||(19227514-19227619)
chr6 (11-212)||(22857949-22858152)
chr6 (11-134)||(25465587-25465710)
chr6 (11-212)||(25078554-25078755)
chr6 (1-97)||(10584227-10584323)
chr6 (11-135)||(15346541-15346664)
chr6 (38-130)||(30445723-30445815)
chr6 (51-212)||(20526922-20527083)
chr6 (11-211)||(28037722-28037927)
chr6 (11-197)||(12911442-12911629)
chr6 (11-197)||(12937190-12937376)
chr6 (34-130)||(28078215-28078310)
chr6 (66-124)||(3833481-3833540)
chr6 (156-198)||(7542525-7542567)
chr6 (38-194)||(22351877-22352031)
chr6 (11-110)||(11262678-11262777)
chr6 (38-197)||(13878727-13878883)
chr6 (38-197)||(16785919-16786075)
chr6 (8-194)||(17694846-17695030)
chr6 (140-212)||(11138423-11138496)
chr6 (8-84)||(25941780-25941857)
chr6 (8-84)||(33215938-33216015)
chr6 (38-197)||(13883475-13883631)
chr6 (38-197)||(31248740-31248896)
chr6 (159-197)||(3577658-3577696)
chr6 (135-185)||(5165936-5165985)
chr6 (140-194)||(19701988-19702041)
chr6 (159-197)||(26887368-26887406)
chr6 (159-197)||(35201470-35201508)
chr6 (8-84)||(3577484-3577560)
chr6 (12-110)||(22870100-22870196)
chr6 (1-84)||(30443532-30443616)
[»] chr1 (105 HSPs)
chr1 (1-226)||(17324625-17324849)
chr1 (1-226)||(25127940-25128165)
chr1 (1-225)||(18839656-18839880)
chr1 (4-226)||(13215149-13215375)
chr1 (1-222)||(16428725-16428946)
chr1 (1-226)||(50076661-50076885)
chr1 (1-226)||(10399817-10400041)
chr1 (1-226)||(25248540-25248765)
chr1 (6-226)||(50307540-50307759)
chr1 (1-226)||(31425004-31425231)
chr1 (1-226)||(9241074-9241299)
chr1 (1-226)||(11457464-11457688)
chr1 (1-226)||(12302494-12302718)
chr1 (1-226)||(51750107-51750331)
chr1 (1-226)||(15823614-15823838)
chr1 (1-226)||(25251263-25251488)
chr1 (1-226)||(38925470-38925691)
chr1 (1-226)||(6823082-6823306)
chr1 (1-226)||(15294823-15295047)
chr1 (1-226)||(18307177-18307401)
chr1 (1-226)||(28840748-28840971)
chr1 (1-226)||(40134012-40134237)
chr1 (1-226)||(47906338-47906562)
chr1 (1-226)||(16432462-16432688)
chr1 (1-226)||(39932141-39932366)
chr1 (1-226)||(17186116-17186341)
chr1 (1-226)||(31735510-31735734)
chr1 (1-226)||(39462587-39462811)
chr1 (1-226)||(50078809-50079034)
chr1 (1-201)||(16429050-16429250)
chr1 (1-226)||(6995689-6995913)
chr1 (1-226)||(27336929-27337152)
chr1 (1-226)||(6756596-6756820)
chr1 (1-226)||(14097958-14098183)
chr1 (1-226)||(3579606-3579829)
chr1 (1-226)||(28998242-28998466)
chr1 (1-226)||(29003958-29004182)
chr1 (1-214)||(41647000-41647212)
chr1 (1-226)||(46431695-46431920)
chr1 (8-226)||(17324131-17324349)
chr1 (1-226)||(2510314-2510537)
chr1 (1-226)||(2617584-2617808)
chr1 (1-226)||(13761905-13762128)
chr1 (1-226)||(20302527-20302750)
chr1 (1-226)||(27339120-27339343)
chr1 (1-226)||(31489981-31490204)
chr1 (1-226)||(51752433-51752655)
chr1 (1-226)||(4131364-4131592)
chr1 (2-226)||(24325731-24325954)
chr1 (1-226)||(2949221-2949444)
chr1 (1-226)||(28842563-28842786)
chr1 (1-226)||(50248559-50248785)
chr1 (1-226)||(9459406-9459630)
chr1 (1-226)||(9463233-9463457)
chr1 (3-226)||(31422851-31423086)
chr1 (1-214)||(6115091-6115304)
chr1 (3-215)||(14183581-14183794)
chr1 (11-214)||(42922310-42922514)
chr1 (1-226)||(28207057-28207279)
chr1 (1-226)||(17318961-17319179)
chr1 (38-215)||(15669419-15669596)
chr1 (12-226)||(16226235-16226448)
chr1 (1-220)||(20291531-20291748)
chr1 (38-216)||(8347298-8347476)
chr1 (12-226)||(47179781-47179993)
chr1 (1-201)||(51757624-51757822)
chr1 (12-226)||(16231631-16231843)
chr1 (12-226)||(47177430-47177642)
chr1 (53-226)||(21948229-21948400)
chr1 (11-198)||(23785935-23786121)
chr1 (67-226)||(48665245-48665404)
chr1 (16-185)||(47451751-47451919)
chr1 (1-153)||(23816027-23816178)
chr1 (40-215)||(18800600-18800775)
chr1 (8-213)||(49495206-49495411)
chr1 (13-214)||(30790401-30790602)
chr1 (11-215)||(16561545-16561751)
chr1 (38-212)||(30738653-30738830)
chr1 (70-215)||(8349109-8349254)
chr1 (38-214)||(13125483-13125660)
chr1 (11-212)||(26613237-26613440)
chr1 (36-212)||(155788-155963)
chr1 (95-226)||(6823953-6824091)
chr1 (11-122)||(15916562-15916674)
chr1 (11-212)||(27916576-27916780)
chr1 (1-79)||(13358787-13358865)
chr1 (70-198)||(28279361-28279490)
chr1 (65-208)||(43104245-43104390)
chr1 (8-194)||(21353342-21353525)
chr1 (12-214)||(26520119-26520321)
chr1 (68-212)||(14353047-14353190)
chr1 (11-107)||(13127685-13127782)
chr1 (140-212)||(26332616-26332688)
chr1 (135-197)||(14997040-14997101)
chr1 (1-40)||(13447262-13447301)
chr1 (135-197)||(4144804-4144865)
chr1 (53-91)||(11693351-11693389)
chr1 (39-84)||(9521826-9521871)
chr1 (66-102)||(8213579-8213615)
chr1 (11-130)||(46783212-46783331)
chr1 (159-197)||(2232597-2232635)
chr1 (38-84)||(9526577-9526623)
chr1 (150-212)||(26332699-26332761)
chr1 (14-58)||(3156989-3157033)
chr1 (14-58)||(28223421-28223465)
[»] chr5 (96 HSPs)
chr5 (1-226)||(1189594-1189820)
chr5 (1-226)||(695946-696170)
chr5 (1-226)||(16092186-16092411)
chr5 (1-216)||(20505830-20506042)
chr5 (1-222)||(6745140-6745360)
chr5 (1-226)||(18511199-18511423)
chr5 (1-226)||(25804093-25804316)
chr5 (3-226)||(40221590-40221813)
chr5 (1-222)||(18596717-18596938)
chr5 (1-226)||(24126924-24127148)
chr5 (1-226)||(25921460-25921684)
chr5 (6-226)||(10529091-10529310)
chr5 (1-225)||(27912605-27912828)
chr5 (1-226)||(6756562-6756784)
chr5 (1-226)||(2174987-2175210)
chr5 (5-226)||(17072951-17073172)
chr5 (1-226)||(21948094-21948318)
chr5 (1-226)||(41585731-41585955)
chr5 (1-223)||(10474310-10474531)
chr5 (1-222)||(6747377-6747596)
chr5 (1-226)||(25904171-25904395)
chr5 (1-222)||(31472599-31472820)
chr5 (1-226)||(39854551-39854775)
chr5 (1-226)||(658343-658564)
chr5 (1-226)||(2818322-2818547)
chr5 (1-226)||(17818479-17818701)
chr5 (4-226)||(18466752-18466973)
chr5 (1-215)||(39798126-39798339)
chr5 (1-226)||(4236697-4236920)
chr5 (1-226)||(18509305-18509529)
chr5 (1-226)||(27910518-27910742)
chr5 (1-226)||(38882174-38882397)
chr5 (1-226)||(34479405-34479630)
chr5 (1-226)||(2954485-2954708)
chr5 (1-226)||(16776226-16776449)
chr5 (1-226)||(34477040-34477265)
chr5 (1-226)||(2723970-2724185)
chr5 (1-225)||(10586901-10587124)
chr5 (1-226)||(26097801-26098023)
chr5 (4-213)||(36208656-36208865)
chr5 (8-226)||(37705774-37705991)
chr5 (1-226)||(4410091-4410314)
chr5 (1-226)||(36402315-36402539)
chr5 (11-215)||(6661181-6661386)
chr5 (1-226)||(15552313-15552537)
chr5 (5-226)||(18469079-18469297)
chr5 (1-226)||(31545148-31545372)
chr5 (1-226)||(21684439-21684662)
chr5 (11-226)||(31179368-31179582)
chr5 (1-222)||(39397980-39398200)
chr5 (7-198)||(10749796-10749986)
chr5 (1-226)||(31542803-31543026)
chr5 (70-226)||(34530721-34530877)
chr5 (1-222)||(12555910-12556130)
chr5 (1-198)||(38960119-38960314)
chr5 (1-213)||(9020299-9020512)
chr5 (4-225)||(21288839-21289050)
chr5 (1-198)||(15354562-15354757)
chr5 (1-198)||(23665140-23665335)
chr5 (1-198)||(23793252-23793447)
chr5 (4-224)||(31465979-31466187)
chr5 (7-198)||(10757273-10757462)
chr5 (1-198)||(3373124-3373320)
chr5 (1-198)||(15356838-15357033)
chr5 (1-214)||(20053923-20054129)
chr5 (48-212)||(17413200-17413365)
chr5 (1-181)||(23741846-23742023)
chr5 (132-226)||(20045078-20045172)
chr5 (38-212)||(15143547-15143722)
chr5 (140-226)||(20043118-20043204)
chr5 (1-194)||(4897828-4898022)
chr5 (80-168)||(42770936-42771024)
chr5 (1-106)||(26098275-26098380)
chr5 (11-164)||(15445263-15445417)
chr5 (155-226)||(26098391-26098462)
chr5 (53-212)||(2144601-2144763)
chr5 (11-198)||(34033563-34033753)
chr5 (126-215)||(42770847-42770934)
chr5 (1-61)||(20043222-20043282)
chr5 (66-212)||(35430259-35430408)
chr5 (8-194)||(22672837-22673022)
chr5 (38-197)||(1170811-1170967)
chr5 (150-197)||(10627364-10627411)
chr5 (135-197)||(2298122-2298183)
chr5 (14-83)||(11916996-11917065)
chr5 (8-84)||(28786515-28786592)
chr5 (8-84)||(42238371-42238448)
chr5 (64-124)||(20045210-20045270)
chr5 (135-198)||(32520533-32520597)
chr5 (8-192)||(25445501-25445684)
chr5 (38-84)||(1240539-1240585)
chr5 (155-197)||(31782597-31782639)
chr5 (159-197)||(35385596-35385634)
chr5 (135-212)||(4754235-4754312)
chr5 (14-58)||(533893-533937)
chr5 (14-58)||(42428430-42428474)
[»] chr4 (132 HSPs)
chr4 (8-226)||(16455363-16455581)
chr4 (1-226)||(40637196-40637420)
chr4 (1-222)||(40091402-40091622)
chr4 (1-225)||(36380472-36380696)
chr4 (1-226)||(12395832-12396056)
chr4 (1-226)||(12400794-12401018)
chr4 (1-226)||(22800849-22801073)
chr4 (1-226)||(48486441-48486665)
chr4 (1-226)||(24880573-24880798)
chr4 (1-226)||(8631406-8631630)
chr4 (1-226)||(14633441-14633664)
chr4 (1-226)||(17662232-17662456)
chr4 (1-226)||(24348340-24348564)
chr4 (1-226)||(24888918-24889142)
chr4 (1-226)||(38928164-38928388)
chr4 (1-224)||(24879113-24879336)
chr4 (1-226)||(16453431-16453656)
chr4 (1-222)||(33415475-33415695)
chr4 (1-226)||(36921480-36921704)
chr4 (1-226)||(37089359-37089582)
chr4 (1-226)||(47868523-47868747)
chr4 (1-225)||(22802721-22802944)
chr4 (1-226)||(36378414-36378639)
chr4 (1-226)||(47274848-47275071)
chr4 (1-206)||(2891433-2891638)
chr4 (1-226)||(7941445-7941669)
chr4 (1-226)||(9148375-9148598)
chr4 (1-226)||(22046673-22046896)
chr4 (1-215)||(19322826-19323041)
chr4 (1-226)||(19096005-19096229)
chr4 (4-226)||(37313055-37313277)
chr4 (1-226)||(6764966-6765190)
chr4 (1-226)||(36919571-36919795)
chr4 (5-226)||(38409327-38409546)
chr4 (1-226)||(2484860-2485083)
chr4 (1-226)||(5198542-5198766)
chr4 (11-215)||(18537470-18537675)
chr4 (1-226)||(22044378-22044601)
chr4 (1-226)||(26085964-26086187)
chr4 (1-226)||(51015368-51015591)
chr4 (1-200)||(13547302-13547500)
chr4 (1-226)||(11435077-11435300)
chr4 (8-226)||(14787423-14787642)
chr4 (11-226)||(22132389-22132602)
chr4 (1-220)||(31849586-31849803)
chr4 (1-226)||(9176461-9176685)
chr4 (1-226)||(11006224-11006448)
chr4 (1-226)||(18847275-18847498)
chr4 (1-226)||(619435-619658)
chr4 (34-222)||(13544085-13544272)
chr4 (1-226)||(11008555-11008777)
chr4 (1-226)||(27499167-27499388)
chr4 (11-226)||(41997614-41997828)
chr4 (1-226)||(16931776-16932000)
chr4 (1-226)||(16934130-16934354)
chr4 (1-226)||(18709151-18709374)
chr4 (12-226)||(44599836-44600049)
chr4 (1-171)||(4215483-4215652)
chr4 (1-226)||(9174133-9174357)
chr4 (11-215)||(38890221-38890426)
chr4 (11-226)||(18409344-18409558)
chr4 (11-226)||(22134615-22134827)
chr4 (12-226)||(22780371-22780584)
chr4 (12-226)||(22782736-22782949)
chr4 (1-215)||(30136682-30136896)
chr4 (11-215)||(18534828-18535033)
chr4 (18-226)||(56030566-56030770)
chr4 (11-215)||(8756247-8756453)
chr4 (1-153)||(5635463-5635614)
chr4 (11-213)||(12102221-12102425)
chr4 (71-226)||(3824627-3824781)
chr4 (18-201)||(47210756-47210938)
chr4 (80-226)||(5637530-5637676)
chr4 (11-212)||(28453818-28454020)
chr4 (1-226)||(53405251-53405479)
chr4 (1-153)||(11437558-11437708)
chr4 (40-213)||(31983554-31983727)
chr4 (38-199)||(15032572-15032733)
chr4 (38-198)||(3982200-3982362)
chr4 (130-226)||(6132994-6133090)
chr4 (1-147)||(5101130-5101274)
chr4 (11-197)||(16185831-16186018)
chr4 (1-86)||(6133098-6133183)
chr4 (120-226)||(3937314-3937420)
chr4 (1-212)||(25357772-25357989)
chr4 (69-212)||(47150948-47151092)
chr4 (93-226)||(52942537-52942657)
chr4 (11-212)||(9863842-9864049)
chr4 (55-212)||(40998990-40999148)
chr4 (1-100)||(47563009-47563107)
chr4 (40-212)||(9022438-9022613)
chr4 (20-212)||(10113003-10113198)
chr4 (1-197)||(5336767-5336964)
chr4 (7-126)||(49088791-49088911)
chr4 (8-80)||(14789422-14789496)
chr4 (65-130)||(54928699-54928764)
chr4 (11-130)||(3578668-3578786)
chr4 (11-110)||(26557823-26557922)
chr4 (53-128)||(24446680-24446754)
chr4 (38-197)||(55822265-55822420)
chr4 (11-100)||(22295412-22295502)
chr4 (38-194)||(31300427-31300580)
chr4 (1-51)||(52942475-52942525)
chr4 (38-197)||(7050282-7050439)
chr4 (8-194)||(8529270-8529455)
chr4 (48-194)||(4558314-4558458)
chr4 (48-197)||(4570094-4570241)
chr4 (38-197)||(11853549-11853705)
chr4 (187-226)||(24446756-24446795)
chr4 (84-212)||(54906722-54906852)
chr4 (1-46)||(3937261-3937306)
chr4 (8-84)||(4884985-4885062)
chr4 (140-197)||(16638827-16638883)
chr4 (8-194)||(16688934-16689119)
chr4 (38-197)||(36769479-36769636)
chr4 (1-37)||(24446641-24446677)
chr4 (153-212)||(10114463-10114522)
chr4 (135-194)||(16489352-16489410)
chr4 (187-226)||(38270158-38270197)
chr4 (38-84)||(15831252-15831298)
chr4 (159-197)||(36771396-36771434)
chr4 (125-163)||(38270120-38270158)
chr4 (1-34)||(3824597-3824630)
chr4 (156-197)||(4874620-4874661)
chr4 (14-83)||(10047383-10047452)
chr4 (8-84)||(18587077-18587154)
chr4 (14-83)||(39245998-39246067)
chr4 (150-194)||(4884877-4884921)
chr4 (14-58)||(12743925-12743969)
chr4 (14-58)||(12745314-12745358)
chr4 (158-194)||(25699752-25699788)
chr4 (150-198)||(29609606-29609654)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (1-223)||(14419177-14419399)
chr8 (1-226)||(30480490-30480714)
chr8 (1-226)||(3874134-3874358)
chr8 (1-226)||(32339433-32339657)
chr8 (1-226)||(15068105-15068329)
chr8 (1-226)||(25952644-25952869)
chr8 (1-226)||(27106884-27107108)
chr8 (1-226)||(28251554-28251778)
chr8 (3-226)||(27911138-27911359)
chr8 (3-226)||(27957557-27957778)
chr8 (6-226)||(608858-609077)
chr8 (1-226)||(22684640-22684867)
chr8 (1-226)||(4424142-4424366)
chr8 (1-226)||(15809342-15809566)
chr8 (1-226)||(14807875-14808109)
chr8 (1-222)||(1225294-1225515)
chr8 (1-226)||(15072834-15073059)
chr8 (1-226)||(27829421-27829644)
chr8 (1-226)||(43530239-43530463)
chr8 (7-226)||(13858477-13858695)
chr8 (1-226)||(28283208-28283430)
chr8 (1-226)||(41384868-41385092)
chr8 (4-215)||(15956092-15956303)
chr8 (1-225)||(36865663-36865885)
chr8 (1-226)||(5372163-5372389)
chr8 (1-226)||(18813006-18813229)
chr8 (1-226)||(27827110-27827333)
chr8 (11-215)||(21482445-21482649)
chr8 (1-192)||(41382820-41383010)
chr8 (1-226)||(15185701-15185921)
chr8 (20-215)||(21480637-21480832)
chr8 (1-226)||(43079726-43079950)
chr8 (1-226)||(18810832-18811055)
chr8 (1-226)||(44720967-44721191)
chr8 (11-216)||(31162343-31162551)
chr8 (1-226)||(43082097-43082321)
chr8 (8-212)||(3005624-3005829)
chr8 (11-226)||(24873178-24873392)
chr8 (11-212)||(31578273-31578476)
chr8 (104-226)||(14477400-14477522)
chr8 (11-215)||(31035252-31035459)
chr8 (1-226)||(33541397-33541599)
chr8 (53-226)||(181623-181795)
chr8 (11-144)||(2468126-2468259)
chr8 (83-212)||(31573794-31573924)
chr8 (38-198)||(17847677-17847830)
chr8 (11-198)||(3895972-3896162)
chr8 (38-197)||(6376141-6376300)
chr8 (1-62)||(37214251-37214312)
chr8 (155-226)||(5622878-5622949)
chr8 (13-110)||(16833789-16833886)
chr8 (1-51)||(14477548-14477599)
chr8 (38-197)||(28327908-28328064)
chr8 (53-128)||(35872479-35872553)
chr8 (53-107)||(14419732-14419786)
chr8 (132-226)||(37214317-37214402)
chr8 (8-197)||(17799418-17799606)
chr8 (38-197)||(16757293-16757449)
chr8 (187-226)||(35872555-35872594)
chr8 (69-197)||(13985135-13985262)
chr8 (170-215)||(2468261-2468306)
chr8 (14-83)||(4696620-4696689)
chr8 (173-226)||(26775325-26775378)
chr8 (8-197)||(9021101-9021289)
chr8 (8-197)||(21033870-21034057)
chr8 (1-37)||(35872440-35872476)
chr8 (159-197)||(16752666-16752704)
chr8 (159-197)||(28895502-28895540)
chr8 (14-83)||(7412345-7412414)
chr8 (8-84)||(23179555-23179632)
chr8 (1-29)||(181799-181827)
chr8 (14-58)||(6599096-6599140)
chr8 (14-58)||(6674549-6674593)
[»] chr3 (133 HSPs)
chr3 (1-226)||(1313457-1313681)
chr3 (1-226)||(4308266-4308490)
chr3 (1-226)||(38890088-38890312)
chr3 (1-222)||(45882991-45883212)
chr3 (1-226)||(3314732-3314957)
chr3 (1-226)||(53917649-53917873)
chr3 (1-226)||(4666562-4666786)
chr3 (1-226)||(10956012-10956236)
chr3 (1-223)||(51726992-51727213)
chr3 (1-226)||(1321527-1321751)
chr3 (1-226)||(1626668-1626892)
chr3 (1-226)||(9604592-9604816)
chr3 (1-226)||(18099155-18099379)
chr3 (4-224)||(28761415-28761636)
chr3 (1-223)||(6484411-6484632)
chr3 (1-226)||(24979755-24979980)
chr3 (1-226)||(10958308-10958532)
chr3 (1-226)||(25533490-25533714)
chr3 (1-226)||(43228339-43228563)
chr3 (1-226)||(43423448-43423672)
chr3 (1-226)||(53915481-53915705)
chr3 (1-225)||(42990353-42990576)
chr3 (1-226)||(53468438-53468665)
chr3 (7-226)||(5926755-5926973)
chr3 (8-226)||(43226133-43226350)
chr3 (1-226)||(3859576-3859799)
chr3 (1-226)||(7606573-7606796)
chr3 (1-226)||(27101166-27101390)
chr3 (1-226)||(28101987-28102211)
chr3 (1-226)||(30005889-30006113)
chr3 (1-226)||(43421400-43421624)
chr3 (4-226)||(11170452-11170673)
chr3 (1-226)||(4103881-4104104)
chr3 (1-226)||(6231849-6232072)
chr3 (1-226)||(18096885-18097109)
chr3 (1-226)||(51674751-51674975)
chr3 (1-226)||(51943419-51943642)
chr3 (1-223)||(25688145-25688367)
chr3 (1-226)||(746805-747029)
chr3 (1-226)||(18162711-18162935)
chr3 (1-226)||(32264023-32264248)
chr3 (1-226)||(880436-880660)
chr3 (1-226)||(10084374-10084598)
chr3 (1-223)||(5522612-5522832)
chr3 (4-226)||(15780919-15781148)
chr3 (1-222)||(36011879-36012099)
chr3 (1-226)||(48361656-48361880)
chr3 (1-220)||(47148880-47149097)
chr3 (1-226)||(25388954-25389177)
chr3 (1-226)||(5191701-5191923)
chr3 (1-226)||(32219132-32219357)
chr3 (1-213)||(5886261-5886470)
chr3 (1-213)||(5899734-5899943)
chr3 (1-226)||(39715517-39715737)
chr3 (57-223)||(6561861-6562028)
chr3 (1-226)||(12267960-12268173)
chr3 (50-213)||(13420219-13420382)
chr3 (12-226)||(38210418-38210631)
chr3 (1-226)||(10621515-10621739)
chr3 (1-210)||(11168165-11168373)
chr3 (1-226)||(22114290-22114514)
chr3 (1-226)||(26720596-26720819)
chr3 (12-226)||(458332-458545)
chr3 (1-200)||(23633528-23633725)
chr3 (1-226)||(6063431-6063655)
chr3 (1-215)||(17795317-17795531)
chr3 (1-215)||(19103757-19103971)
chr3 (12-226)||(455955-456168)
chr3 (11-226)||(10191305-10191518)
chr3 (1-226)||(28413016-28413241)
chr3 (53-225)||(29956735-29956906)
chr3 (9-215)||(31151404-31151609)
chr3 (14-226)||(53591232-53591442)
chr3 (12-226)||(50494047-50494260)
chr3 (1-226)||(6065781-6066005)
chr3 (11-214)||(561769-561974)
chr3 (22-223)||(889779-889978)
chr3 (16-226)||(35917944-35918152)
chr3 (5-147)||(47701660-47701801)
chr3 (11-208)||(25635447-25635644)
chr3 (1-201)||(27635643-27635830)
chr3 (1-226)||(54691559-54691783)
chr3 (1-196)||(3306839-3307032)
chr3 (38-213)||(53597297-53597472)
chr3 (11-168)||(24181486-24181644)
chr3 (66-226)||(54884203-54884362)
chr3 (1-226)||(42992334-42992542)
chr3 (109-226)||(35777469-35777587)
chr3 (11-212)||(36871295-36871497)
chr3 (86-212)||(1674034-1674160)
chr3 (119-226)||(28100143-28100250)
chr3 (66-212)||(14634491-14634638)
chr3 (97-215)||(23637082-23637200)
chr3 (38-212)||(1620483-1620657)
chr3 (114-220)||(28181076-28181182)
chr3 (1-79)||(35919100-35919178)
chr3 (11-131)||(25634030-25634150)
chr3 (126-226)||(28137415-28137515)
chr3 (1-90)||(41849243-41849331)
chr3 (38-186)||(11007545-11007684)
chr3 (77-226)||(4560352-4560493)
chr3 (1-68)||(53894042-53894109)
chr3 (48-212)||(13419941-13420106)
chr3 (8-194)||(29913949-29914132)
chr3 (8-194)||(10595028-10595213)
chr3 (8-194)||(27761980-27762165)
chr3 (8-194)||(47878165-47878350)
chr3 (38-197)||(10094100-10094256)
chr3 (20-212)||(7768632-7768825)
chr3 (8-84)||(10612772-10612849)
chr3 (8-194)||(10897008-10897193)
chr3 (1-85)||(16996987-16997072)
chr3 (38-197)||(22626009-22626166)
chr3 (170-215)||(24177335-24177380)
chr3 (10-102)||(27420822-27420915)
chr3 (182-226)||(41849200-41849244)
chr3 (150-197)||(7418064-7418111)
chr3 (38-197)||(10100117-10100273)
chr3 (38-197)||(10200980-10201136)
chr3 (38-197)||(10208026-10208182)
chr3 (8-130)||(15823641-15823763)
chr3 (4-51)||(42992608-42992655)
chr3 (159-197)||(6303310-6303348)
chr3 (187-225)||(7606830-7606868)
chr3 (38-84)||(11079628-11079674)
chr3 (150-184)||(13893475-13893509)
chr3 (159-197)||(16462203-16462241)
chr3 (159-197)||(27544273-27544311)
chr3 (159-197)||(47883026-47883064)
chr3 (38-84)||(48390327-48390373)
chr3 (14-83)||(1736319-1736388)
chr3 (14-83)||(18552897-18552966)
chr3 (14-83)||(30709804-30709873)
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (1-226)||(11739546-11739771)
chr2 (1-226)||(6258804-6259026)
chr2 (1-226)||(17849161-17849385)
chr2 (1-226)||(43623567-43623791)
chr2 (1-226)||(34979564-34979790)
chr2 (1-226)||(6264135-6264360)
chr2 (1-226)||(19501998-19502222)
chr2 (1-226)||(42452825-42453048)
chr2 (1-226)||(42923496-42923720)
chr2 (1-223)||(17848491-17848708)
chr2 (1-220)||(5375333-5375550)
chr2 (1-226)||(19007684-19007908)
chr2 (1-226)||(27104842-27105065)
chr2 (1-226)||(45279971-45280195)
chr2 (1-226)||(14837317-14837536)
chr2 (1-225)||(22287323-22287546)
chr2 (1-226)||(21520680-21520904)
chr2 (1-226)||(23452224-23452448)
chr2 (4-226)||(40032043-40032269)
chr2 (1-226)||(44289054-44289279)
chr2 (1-224)||(19504333-19504554)
chr2 (1-226)||(42064559-42064783)
chr2 (1-225)||(28196682-28196903)
chr2 (42-215)||(11578136-11578309)
chr2 (1-226)||(13910032-13910255)
chr2 (1-215)||(22874185-22874399)
chr2 (1-226)||(28459177-28459401)
chr2 (37-226)||(45239000-45239188)
chr2 (1-215)||(18800300-18800514)
chr2 (11-212)||(20146604-20146806)
chr2 (1-198)||(36558851-36559047)
chr2 (1-198)||(36561128-36561324)
chr2 (12-226)||(35215584-35215797)
chr2 (12-226)||(35217961-35218174)
chr2 (1-222)||(3022211-3022440)
chr2 (93-226)||(15539553-15539686)
chr2 (10-222)||(31732772-31732972)
chr2 (11-212)||(17897242-17897443)
chr2 (1-146)||(22407441-22407585)
chr2 (1-226)||(24162210-24162423)
chr2 (12-198)||(45332179-45332364)
chr2 (38-214)||(40699429-40699606)
chr2 (1-134)||(22707738-22707872)
chr2 (65-197)||(20589763-20589896)
chr2 (11-185)||(37962938-37963109)
chr2 (1-104)||(22163009-22163111)
chr2 (1-212)||(35107351-35107564)
chr2 (17-144)||(7462950-7463077)
chr2 (5-135)||(23870951-23871080)
chr2 (85-215)||(27136195-27136326)
chr2 (65-213)||(15693958-15694109)
chr2 (38-212)||(43139432-43139606)
chr2 (38-197)||(35028647-35028807)
chr2 (48-197)||(33603994-33604143)
chr2 (128-226)||(38414194-38414290)
chr2 (38-198)||(17921769-17921927)
chr2 (170-226)||(38020246-38020302)
chr2 (148-211)||(27583472-27583535)
chr2 (69-174)||(13828397-13828503)
chr2 (38-194)||(17943540-17943692)
chr2 (38-197)||(39686983-39687139)
chr2 (140-213)||(26345661-26345735)
chr2 (38-194)||(27517664-27517818)
chr2 (38-197)||(2740941-2741097)
chr2 (38-197)||(39680045-39680201)
chr2 (135-197)||(28458949-28459011)
chr2 (38-100)||(39287262-39287324)
chr2 (1-38)||(15539516-15539553)
chr2 (173-226)||(22163106-22163158)
chr2 (8-197)||(20054759-20054947)
chr2 (38-197)||(2736205-2736361)
chr2 (140-198)||(7502990-7503049)
chr2 (38-197)||(17462436-17462592)
chr2 (38-84)||(12781246-12781292)
chr2 (71-194)||(17932637-17932756)
chr2 (159-197)||(22712660-22712698)
chr2 (159-197)||(22717369-22717407)
chr2 (159-197)||(38190997-38191035)
chr2 (159-197)||(45567409-45567447)
chr2 (14-83)||(8390174-8390243)
chr2 (14-83)||(14699031-14699100)
chr2 (69-102)||(41303088-41303121)
chr2 (14-58)||(17057369-17057413)
chr2 (14-58)||(17085352-17085396)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (8-226)||(14376-14593)
scaffold0131 (8-226)||(15096-15313)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (1-226)||(183628-183851)
scaffold0005 (8-226)||(52088-52307)
scaffold0005 (8-80)||(50234-50308)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-226)||(79262-79486)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-226)||(69279-69502)
scaffold0025 (188-226)||(73160-73198)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-226)||(4073-4296)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (1-226)||(1440-1663)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-226)||(11460-11684)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (3-225)||(79938-80158)
scaffold0004 (159-197)||(188386-188424)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-226)||(41470-41694)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (11-214)||(1638-1842)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-221)||(85312-85532)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (11-214)||(15817-16021)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (1-226)||(6276-6500)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (1-226)||(118-342)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-226)||(29248-29471)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-226)||(2957-3180)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (1-198)||(22221-22416)
scaffold0140 (1-198)||(24496-24691)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (11-212)||(16646-16848)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (53-226)||(2118-2290)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (38-201)||(4912-5076)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (123-226)||(35716-35819)
scaffold0011 (1-80)||(35816-35895)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (1-68)||(4666-4733)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (38-197)||(57452-57613)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (2-46)||(1439-1483)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (159-197)||(224819-224857)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (8-84)||(16980-17057)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 106)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 20137096 - 20137320
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20137096 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaa 20137194  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20137195 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttccc 20137294  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  20137295 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 20137320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24748897 - 24748672
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24748897 aacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 24748798  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24748797 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttccc 24748698  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24748697 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 24748672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44724881 - 44724657
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44724881 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 44724783  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44724782 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 44724683  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  44724682 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 44724657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 13099461 - 13099687
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13099461 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaa 13099560  T
Q  101 -gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13099561 agagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcc 13099660  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||    
T  13099661 caaggtgaatcaaccctcaaactctag 13099687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 31435033 - 31435258
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31435033 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaa 31435132  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31435133 gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 31435232  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  31435233 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 31435258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 39145973 - 39146198
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||  | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39145973 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 39146072  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39146073 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttttcc 39146172  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  39146173 aaggtgaatcaaccttcaaaccctag 39146198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 4295921 - 4296145
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4295921 aacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 4296019  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4296020 gagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 4296119  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  4296120 aaggtgaatcaaccatcaaaccctag 4296145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38394288 - 38394064
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38394288 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 38394190  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38394189 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 38394090  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  38394089 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 38394064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48457955 - 48457731
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  48457955 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 48457857  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48457856 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 48457757  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
      ||||||| ||||||||||||||||    
T  48457756 taggtgaatgaaccctcaaaccctag 48457731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 37412112 - 37412338
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412112 aacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 37412211  T
Q  101 -gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37412212 agagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 37412311  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  37412312 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 37412338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 7092200 - 7092423
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7092200 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacattacaaaa 7092297  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7092298 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttccc 7092397  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  7092398 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 7092423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 7470009 - 7470233
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7470009 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 7470107  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7470108 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcac 7470207  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  7470208 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 7470233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9681122 - 9680898
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9681122 aacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 9681024  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9681023 gatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 9680924  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  9680923 gaggtgaatcaaccctcaaaccctag 9680898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21592130 - 21592354
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21592130 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 21592228  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  21592229 gagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgcc 21592328  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  21592329 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 21592354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21990452 - 21990228
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21990452 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 21990354  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  21990353 gagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttctc 21990254  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  21990253 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 21990228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20297664 - 20297441
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  20297664 aacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 20297566  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20297565 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20297466  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20297465 aaggtgaatcaaccctcaaacccta 20297441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 42330984 - 42331210
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||  || |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  42330984 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactata-taatgagtaactttacaaaa 42331082  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttccc--gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42331083 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 42331182  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42331183 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 42331210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20299762 - 20299544
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20299762 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 20299664  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20299663 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20299564  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaa 220  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  20299563 aaggtgaatcaaccctcaaa 20299544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9679361 - 9679141
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9679361 aacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 9679263  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9679262 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 9679163  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  9679162 aaggtgaatcaatcctcaaacc 9679141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11355560 - 11355336
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  11355560 aacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactata-tgatgagaaacgttacaaaa 11355462  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11355461 aagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 11355362  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  11355361 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 11355336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20626340 - 20626116
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20626340 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 20626242  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20626241 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20626142  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  20626141 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 20626116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20630231 - 20630007
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20630231 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 20630133  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20630132 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20630033  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  20630032 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 20630007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20642650 - 20642426
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20642650 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 20642552  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20642551 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20642452  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  20642451 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 20642426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 40836730 - 40836953
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  40836730 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 40836827  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40836828 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 40836927  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  40836928 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 40836953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 27306224 - 27306441
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27306224 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatat 27306322  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27306323 caatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 27306422  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27306423 atcaaccctcaaaccctag 27306441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35931 - 35707
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35931 aacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 35833  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35832 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 35733  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  35732 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 35707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1850283 - 1850059
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1850283 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 1850185  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  1850184 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgttttcc 1850085  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  1850084 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 1850059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3878879 - 3878655
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3878879 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 3878781  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3878780 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttacc 3878681  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  3878680 aaggtgaatcaacccacaagccctag 3878655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 7471967 - 7472191
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7471967 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 7472065  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7472066 gagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 7472165  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  7472166 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 7472191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18345843 - 18345619
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  18345843 aacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 18345745  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18345744 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 18345645  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  18345644 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 18345619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 7094447 - 7094670
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7094447 aacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacattacaaaa 7094545  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7094546 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgtttccc 7094645  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  7094646 aaggtgaatcaaccctcaaacccta 7094670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 443898 - 443673
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  443898 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttataaa 443800  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  443799 agagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcc 443700  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  443699 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 443673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 27832631 - 27832844
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    ||||||||||| |||||||||     ||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832631 aagaatttgtttacccagttc-----aaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatat 27832725  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27832726 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 27832825  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27832826 atcaaccctcaaaccctag 27832844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44866 - 44642
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44866 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 44768  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  44767 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgtttcct 44668  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  44667 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 44642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 1046912 - 1047135
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  1046912 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 1047009  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1047010 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 1047109  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  1047110 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 1047135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 1049283 - 1049506
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  1049283 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 1049380  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1049381 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttccc 1049480  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  1049481 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 1049506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42223457 - 42223236
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42223457 acaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagag 42223359  T
Q  104 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  42223358 atatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaag 42223259  T
Q  204 gtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42223258 gtgaatcaaccctcaaaccctag 42223236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28487855 - 28487631
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28487855 aacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 28487757  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28487756 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcca 28487657  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||    
T  28487656 aaggtgaatcaacccacgaaccctag 28487631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40946630 - 40946406
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40946630 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 40946532  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40946531 gagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttcc 40946432  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |  || ||||||||| ||||||||||    
T  40946431 aaagtaaatcaacccacaaaccctag 40946406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 43253504 - 43253724
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43253504 aacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 43253602  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43253603 gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttccc 43253702  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43253703 aaggtgaatcaaccctcaaacc 43253724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25276378 - 25276219
Alignment:
Q  67 ccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttccc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25276378 ccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccc 25276279  T
Q  167 gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25276278 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctag 25276219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3036026 - 3035799
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| | || |||||    
T  3036026 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat-atgatgagtatcgttgcaaaa 3035928  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatc---tcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3035927 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3035828  T
Q  198 cccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3035827 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 3035799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 7351639 - 7351863
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  7351639 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 7351736  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7351737 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 7351836  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  7351837 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 7351863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21678361 - 21678144
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||| || | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21678361 aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactata-tgataagtaaccttacaaaagatatat 21678263  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21678262 caatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 21678163  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21678162 atcaaccctcaaaccctag 21678144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21680332 - 21680105
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccag---ttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttaca 97  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21680332 aacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactata-tgatgagtaaccttaca 21680234  T
Q  98 aaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21680233 aaagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21680134  T
Q  198 cccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21680133 cccaagatgaatcaaccctcaaaccctag 21680105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 24817377 - 24817554
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24817377 tgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaataagtctcccgcct 24817476  T
Q  138 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||    
T  24817477 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaaccc 24817554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25542830 - 25542608
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  25542830 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 25542733  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  25542732 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtcttt-cc 25542634  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  25542633 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 25542608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38396936 - 38396713
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||     
T  38396936 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactata-tgatgagtaaagttacaaa- 38396839  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  38396838 gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttccc 38396739  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||    
T  38396738 aaggtgaatcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24258770 - 24258545
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaattt-gttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataat---gatgagtaaccttac 96  Q
    ||||||||||||||| ||| | | | |||| |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  24258770 aacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagtaactttac 24258671  T
Q  97 aaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24258670 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 24258571  T
Q  197 tcccagggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||    
T  24258570 ttccaaggtgaatcaaccctcaaacc 24258545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 24813494 - 24813699
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  24813494 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataa 24813593  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24813594 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaat 24813693  T
Q  210 caaccc 215  Q
    ||||||    
T  24813694 caaccc 24813699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 31155898 - 31156122
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||  |||||||| | |||||||     
T  31155898 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatag-gatgagtaccgttacaaa- 31155995  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31155996 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 31156095  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||    
T  31156096 caaggtgaatcaacccacaaatcctag 31156122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Original strand, 20091581 - 20091745
Alignment:
Q  48 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctaccc 147  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20091581 tgggggagagagcagccctccgttccactat---gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 20091677  T
Q  148 agagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20091678 aaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20091745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28485867 - 28485644
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||  |||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  28485867 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgag-gagagagcaaccctctgattcattata-tgatgagtaacgttacaaaa 28485770  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28485769 gagaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcca 28485670  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  28485669 aaggtgaatcaacccgcaaaccctag 28485644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 7349297 - 7349484
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 137  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7349297 tgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 7349394  T
Q  138 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7349395 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 7349484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2935560 - 2935374
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  2935560 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 2935463  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2935462 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22108368 - 22108173
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  22108368 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaa 22108271  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22108270 gagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40550128 - 40549933
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  40550128 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaa 40550031  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40550030 gagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11757462 - 11757314
Alignment:
Q  71 tccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaa 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  11757462 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaa 11757364  T
Q  171 ccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaa 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11757363 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 11757314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 226
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828844
Alignment:
Q  54 agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 153  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22828771  T
Q  154 tcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |   |||||||||| |||||| ||||    
T  22828772 tcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctag 22828844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22137379 - 22137184
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  22137379 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaa 22137282  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22137281 gagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40552406 - 40552211
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  40552406 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaa 40552309  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40552308 gagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7188789 - 7188628
Alignment:
Q  54 agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  7188789 agagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtc 7188690  T
Q  154 tcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7188689 tcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 7188628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 9027191 - 9027376
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  9027191 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 9027288  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9027289 tgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22394025 - 22393878
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | || |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22394025 aacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaa 22393926  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctaccca 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22393925 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccca 22393878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1606671 - 1606486
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  1606671 aatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 1606574  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1606573 tgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 26295743 - 26295580
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26295743 aagaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 26295644  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaac 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  26295643 caatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcacaatcgcttcctgtaac 26295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24465829 - 24465629
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||||| || ||||||| | || ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  24465829 aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcattataatgatgagta-ctttacaaaagacatatcaa 24465731  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    || |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  24465730 tgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatc 24465631  T
Q  211 aa 212  Q
    ||    
T  24465630 aa 24465629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6332514 - 6332326
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6332514 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatta 6332415  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    | | |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6332414 aagggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 6332326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26804762 - 26804651
Alignment:
Q  114 gttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26804762 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 26804663  T
Q  214 cctcaaacccta 225  Q
    ||||||||||||    
T  26804662 cctcaaacccta 26804651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 22251602 - 22251720
Alignment:
Q  71 tccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttccc 166  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  22251602 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttccc 22251701  T
Q  167 gtaaccaagagactcaatc 185  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22251702 gtaaccaagagactcaatc 22251720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6349020 - 6348912
Alignment:
Q  66 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcc 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6349020 tccgttccactgtaatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatcttttcc 6348921  T
Q  166 cgtaaccaa 174  Q
    ||| |||||    
T  6348920 cgtgaccaa 6348912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 16297018 - 16297222
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | |||| |||| | || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  16297018 aatttgtttacacagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatatta 16297117  T
Q  110 at-gtgttacaagaataagtctcccgc-ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    |  | ||||||||||| | ||| |    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  16297118 aaagggttacaagaatcaatcttcaaatctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtga 16297217  T
Q  208 atcaa 212  Q
    |||||    
T  16297218 atcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11081803 - 11081598
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc- 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||     
T  11081803 aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccgttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatca 11081704  T
Q  109 -aatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 206  Q
     || | ||||||||||| |||| ||   |||| || ||| || | ||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  11081703 aaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtg 11081604  T
Q  207 aatcaa 212  Q
    ||||||    
T  11081603 aatcaa 11081598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11759429 - 11759369
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagca 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11759429 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11759369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 26804812 - 26804761
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggt 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26804812 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggt 26804761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22392608 - 22392550
Alignment:
Q  157 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22392608 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 22392550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25351539 - 25351353
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  25351539 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagaacagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 25351441  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25351440 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6046759 - 6046668
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtct 130  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  6046759 tgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaggtttacaagaataagtct 6046668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25410318 - 25410130
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  25410318 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 25410220  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25410219 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Original strand, 6067193 - 6067370
Alignment:
Q  9 agaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  | ||   ||||||||||    
T  6067193 agaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactataatgacgagttccttttacaaagagatat 6067292  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 185  Q
    ||  |  |||||||||| |||| ||   |||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6067293 cagaggattacaagaattagtcttcaaacctaattcta-tcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatc 6067370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6049111 - 6048976
Alignment:
Q  65 ctccgttccactata--atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctc 161  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||| ||||||| |||| |   |||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  6049111 ctccgttccactatataatgatgagtaactttacaaagg-gatatcaaagggttataagaatacgtcttcaaacctaattctatccaaagtctcaatatc 6049013  T
Q  162 ttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6049012 ttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 6048976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21369824 - 21369642
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||| |||||||||| |||||   ||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||       
T  21369824 ttgtttacccagttcggtccaatgatgacctactatggcggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat--- 21369729  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    || |||||| |||| ||||| |   |||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21369728 tgagttacatgaatcagtcttcaaacctaattttaccca-agtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 40281411 - 40281572
Alignment:
Q  42 ctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatt 140  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||       |||| | ||||||||||||||||| |   |||| |    
T  40281411 ctagtctgggggagagagcatcccttcgttccacaacaacgatgagtaactttacaaa-------tcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaat 40281503  T
Q  141 tctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  40281504 tccaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaaggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2121056 - 2120899
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 134  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |       
T  2121056 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 2120961  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2120960 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2120899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 13290470 - 13290658
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||| || | ||||| | ||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13290470 aatttgtttacccagttcggtccaatactgaccaagtctgagggagagtgtagctctctgttccgctataatgatgagtaactttac-aaagagatatca 13290568  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    |   ||||||||||| | || ||   |||| |||||||||||||   ||| |||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  13290569 aaaggttacaagaattattcttcaaacctaattctacccagagttctaatatcttcctgtgaccaagagactaaattctaatagtgtttc 13290658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25357233 - 25357047
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| |||||| ||   || || ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  25357233 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagatcatctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 25357135  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25357134 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11084523 - 11084467
Alignment:
Q  156 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11084523 aatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 11084467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 3320076 - 3320232
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  3320076 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 3320171  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3320172 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 3324824 - 3324980
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  3324824 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 3324919  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3324920 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18567730 - 18567691
Alignment:
Q  187 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18567730 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 18567691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25405549 - 25405393
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  25405549 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 25405454  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25405453 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 197
Target Start/End: Original strand, 12310157 - 12310198
Alignment:
Q  156 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12310157 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 12310198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 34546874 - 34546951
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34546874 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 34546951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42006820 - 42006663
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 134  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||   || ||||||| ||| ||||| |       
T  42006820 tgacctagtctgggagagagagcagctcttcgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaaaaatcagtcttcaaa 42006725  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42006724 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 51
Target Start/End: Original strand, 6359946 - 6359989
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatggg 51  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6359946 aagaaattgttgacccagttcgatccaacttgacctaatatggg 6359989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7069936 - 7069780
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  7069936 tgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 7069841  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7069840 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7074943 - 7074787
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  7074943 tgacctagtctgggggagagtgcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 7074848  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7074847 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 8378648 - 8378686
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378648 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 15541139 - 15541177
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15541139 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 44010775 - 44010821
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44010775 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 44010821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 2075303 - 2075226
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2075303 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactataatgat 2075226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 7464513 - 7464590
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7464513 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggaagagagcagctctccgttccactataatgat 7464590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 22251572 - 22251605
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatcca 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22251572 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 22251605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26210688 - 26210631
Alignment:
Q  156 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 212  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  26210688 aatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa 26210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190053
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcag 62  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcag 9190053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 30814604 - 30814560
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  30814604 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 30814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13057522 - 13057297
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057522 aacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 13057423  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13057422 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccc 13057323  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  13057322 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 13057297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13040082 - 13039857
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13040082 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 13039983  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  13039982 gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttcc 13039883  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  13039882 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 13039857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3390705 - 3390482
Alignment:
Q  3 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3390705 cacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaaga 3390606  T
Q  103 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3390605 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 3390506  T
Q  203 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3390505 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 3390482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9020253 - 9020029
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9020253 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 9020155  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9020154 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 9020055  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  9020054 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 9020029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 11983016 - 11983240
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11983016 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 11983114  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11983115 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 11983214  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  11983215 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 11983240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 3631926 - 3632149
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631926 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg--acagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 3632023  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3632024 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttccc 3632123  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | | |||||||||||| |||||||||    
T  3632124 aagatgaatcaacccttaaaccctag 3632149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1069705 - 1069913
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1069705 aacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaa 1069804  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1069805 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 1069904  T
Q  201 agggtgaat 209  Q
    | |||||||    
T  1069905 aaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32280324 - 32280102
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  32280324 aacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaa 32280225  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32280224 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 32280125  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  32280124 aaggtgaatcaaccctcaaaccc 32280102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 1230236 - 1230460
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1230236 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 1230334  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1230335 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagtgtttccc 1230434  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  1230435 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 1230460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 3629852 - 3630075
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| | || |||||| ||||||||    
T  3629852 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gagagagcagccctcagtttcactatatt-attagtaactttacaaaa 3629949  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3629950 gagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttccc 3630049  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  3630050 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 3630075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 4816218 - 4816442
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  4816218 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaaa 4816316  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4816317 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 4816416  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  4816417 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 4816442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30967528 - 30967304
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30967528 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 30967430  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30967429 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 30967330  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  30967329 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 30967304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25477606 - 25477377
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacc-------ttac 96  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||        ||||    
T  25477606 acaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacgagtaacgttac 25477507  T
Q  97 aaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25477506 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 25477407  T
Q  197 tcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25477406 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 25477377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 14458754 - 14458976
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14458754 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 14458852  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14458853 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 14458952  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |  |||||| ||||||||||||||    
T  14458953 aag--gaatcagccctcaaaccctag 14458976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 28241308 - 28241532
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28241308 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 28241406  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28241407 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 28241506  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  28241507 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 28241532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 3233712 - 3233941
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttc-----gatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctta 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     | || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||| |||    
T  3233712 aacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactatacgg-tgagtaacgtta 3233810  T
Q  96 caaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgt 195  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3233811 caaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 3233910  T
Q  196 ttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3233911 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 3233941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 30034590 - 30034814
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30034590 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctata-tgatgagtaacgttacaaaa 30034688  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  30034689 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattgactcaatcctaatagtgtttccc 30034788  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  30034789 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 30034814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 19704554 - 19704780
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa- 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  19704554 aacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaag 19704652  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19704653 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 19704752  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  19704753 ccaaggtgaatcaacccacaaactctag 19704780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 14507163 - 14507386
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||| |||| | |||||||     
T  14507163 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgataagtatcgttacaaa- 14507260  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14507261 gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 14507360  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  14507361 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 14507386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26065308 - 26065086
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||     
T  26065308 aacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-taacgagtaacgttacaaa- 26065212  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26065211 gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 26065112  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  26065111 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 26065086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26085277 - 26085055
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||     
T  26085277 aacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-taacgagtaacgttacaaa- 26085181  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26085180 gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 26085081  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  26085080 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 26085055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14466651 - 14466432
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14466651 aacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaataaccttacaaaa 14466552  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14466551 gagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 14466452  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaa 220  Q
    | | |||||||| |||||||    
T  14466451 aagatgaatcaatcctcaaa 14466432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 2628873 - 2629096
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  2628873 aacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaccgttacaaa- 2628970  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2628971 gagaaatcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 2629070  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||    
T  2629071 aaggtgaatcaacccttaaaacctag 2629096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 5273213 - 5273427
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  5273213 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataa-gatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 5273310  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5273311 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 5273410  T
Q  210 caaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||| ||||||||||    
T  5273411 caacccacaaaccctag 5273427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 30728811 - 30729039
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30728811 aacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataat-atgagtaactttacaaaa 30728909  T
Q  101 gaga----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 196  Q
    ||||    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30728910 gagaaagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgtt 30729009  T
Q  197 tcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30729010 tcccaaggtgaatcaaccctcaaatcctag 30729039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 20915351 - 20915567
Alignment:
Q  9 agaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||    
T  20915351 agaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatc 20915448  T
Q  109 aatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20915449 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 20915548  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  20915549 atcaacccacaaaccctag 20915567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 12186058 - 12186271
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12186058 aacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaa 12186157  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12186158 gagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtttcc 12186257  T
Q  200 cagggtgaatcaac 213  Q
    || |||||||||||    
T  12186258 caaggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 226
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530333
Alignment:
Q  57 gagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctca 156  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctca 15530263  T
Q  157 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15530264 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 15530333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 15541127 - 15541351
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||||||||||   || ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15541127 aacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactata-tgatgaataactttacaaaa 15541225  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15541226 gagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttccc 15541325  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  15541326 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 15541351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15532891
Alignment:
Q  6 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| | || || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctagg-gatagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagat 15532771  T
Q  106 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  15532772 atcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggt 15532871  T
Q  206 gaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15532872 gaatcaaccctcaaacccta 15532891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15719961 - 15719758
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15719961 aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 15719862  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  15719861 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaat 15719762  T
Q  210 caac 213  Q
    ||||    
T  15719761 caac 15719758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24338435 - 24338655
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338435 aacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtctgggggagag--cagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 24338532  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  24338533 gagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttcc 24338632  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  24338633 aaggtaaatcaaccctcaaaccc 24338655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 26932548 - 26932773
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaa-tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||    
T  26932548 aacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa 26932646  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26932647 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26932745  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||    
T  26932746 tcaaggtgaatcaacccacaaaccctag 26932773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455625
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  16455521 aagggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaat 16455620  T
Q  210 caacc 214  Q
    |||||    
T  16455621 caacc 16455625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Original strand, 3027895 - 3028054
Alignment:
Q  56 agagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  3027895 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtctc 3027994  T
Q  156 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3027995 aatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 3028054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 12195502 - 12195726
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  12195502 aacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 12195599  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12195600 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 12195699  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  12195700 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 12195726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26066111 - 26066307
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||     
T  26066111 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatt-tgataagtaacgttacaaa- 26066208  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26066209 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 12161545 - 12161768
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| | || |||||| ||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12161545 aacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttagg-gagagaacagccatccattttactata-tgatgagtaaccttacaaaa 12161642  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | || || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  12161643 gagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttccc 12161742  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||    
T  12161743 aacgtgaaacaaccctcaaaccctag 12161768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 29754696 - 29754892
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||     
T  29754696 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa- 29754793  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29754794 gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33309183 - 33308988
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||     
T  33309183 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa- 33309086  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33309085 gagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26068382 - 26068578
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||     
T  26068382 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagcaacgttacaaa- 26068479  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26068480 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33311452 - 33311257
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||     
T  33311452 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa- 33311355  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33311354 gagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15367349 - 15367145
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggt-gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |    
T  15367349 aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactata-tgatgaataactttacaatagagatatta 15367251  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  || || |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  15367250 atgggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaat 15367151  T
Q  210 caaccc 215  Q
    ||||||    
T  15367150 caaccc 15367145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22490896 - 22490771
Alignment:
Q  73 cactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaacc 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  22490896 cactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacc 22490797  T
Q  173 aagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22490796 aagagactcaatcctaatagtgtttc 22490771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26945463 - 26945258
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  |||| || | |||| | |||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26945463 aatttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 26945364  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||     
T  26945363 atgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgac 26945264  T
Q  209 tcaacc 214  Q
    ||||||    
T  26945263 tcaacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17012294 - 17012155
Alignment:
Q  75 ctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaa 174  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||| ||| |||||    
T  17012294 ctataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaa 17012195  T
Q  175 gagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaacc 214  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  17012194 gagactcaatcctaatattgtttcagaaggtgaatcaacc 17012155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19696759 - 19696556
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||   || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19696759 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatca 19696660  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    | |  ||||||||||||||| ||   |||| ||||| ||| |||||||||||||| | || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  19696659 aaggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaa 19696560  T
Q  209 tcaa 212  Q
    ||||    
T  19696559 tcaa 19696556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227619
Alignment:
Q  121 gaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaa 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  221 ccctag 226  Q
    ||||||    
T  19227614 ccctag 19227619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 22857949 - 22858152
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22857949 aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatca 22858047  T
Q  110 at-gtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    |  | ||||||||||| ||||| |   ||||  |||||| | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22858048 aaagggttacaagaattagtcttcaaacctaaatctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtga 22858147  T
Q  208 atcaa 212  Q
    |||||    
T  22858148 atcaa 22858152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 25465587 - 25465710
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25465587 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatca 25465685  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccg 134  Q
    | | | |||||||||||||||||||    
T  25465686 aaggggtacaagaataagtctcccg 25465710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 25078554 - 25078755
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25078554 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactggga-agaaagcagtcctccgttccactgtaatgacgagtaactttacaaaagagatatca 25078652  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    | | |||||||||||||||| ||   |||| ||||||  | | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||    
T  25078653 aagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctactta-aatctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacggtgtttaccaaggtgaa 25078751  T
Q  209 tcaa 212  Q
    ||||    
T  25078752 tcaa 25078755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10584323 - 10584227
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttaca 97  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10584323 aacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15346664 - 15346541
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15346664 aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactat-atgatgaataactttacaatagagatatcaa 15346566  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgc 135  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  15346565 tgggttacaagaataagtcttccgc 15346541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30445815 - 30445723
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtct 130  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  30445815 tgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaattagtct 30445723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20527083 - 20526922
Alignment:
Q  51 gtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccag 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||| |     
T  20527083 gtgagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaa 20526985  T
Q  150 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20526984 agtcttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 20526922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 211
Target Start/End: Original strand, 28037722 - 28037927
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgt---tccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||  |||| |||||||||| | | |||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28037722 aatttgtttacccagctcggtccaaaactgacctagactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagata 28037821  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataag-tctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 205  Q
    |||| | |||||||||||||| | |    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  28037822 tcaaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtgtttcccaaggt 28037921  T
Q  206 gaatca 211  Q
    ||||||    
T  28037922 gaatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 12911442 - 12911629
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||   |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  12911442 aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatta 12911540  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |   ||||||||||| || | ||   ||||  |||||| | ||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12911541 aatggttacaagaattagccttcaaacctaactctaccaaaagtctcaatctattatcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12911629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 12937190 - 12937376
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||   |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  12937190 aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacctagtctggg-gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatta 12937287  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |   ||||||||||| || | ||   |||| ||||||| | ||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12937288 aatggttacaagaattagccttcaaacctaattctaccaaaagtttcaatctattctcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12937376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Original strand, 28078215 - 28078310
Alignment:
Q  34 aaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtct 130  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28078215 aaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataatccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaag-gttacaagaataagtct 28078310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3833540 - 3833481
Alignment:
Q  66 tccgttccactataatgatgagt-aaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3833540 tccgttccactataatgatgagttaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaat 3833481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 198
Target Start/End: Original strand, 7542525 - 7542567
Alignment:
Q  156 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7542525 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 7542567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 194
Target Start/End: Original strand, 22351877 - 22352031
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccg 134  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || |||||| |||| |||| ||       
T  22351877 tgacctagtctgggggagagagcagttctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacatgaatcagtcttcaaa 22351972  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||| ||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22351973 cctaattctaccca-aatctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11262777 - 11262678
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  11262777 aatttgtttaccccgttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagttctccgttacaatataatgatgagtttctttac-aaagagatatca 11262679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13878883 - 13878727
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  13878883 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 13878788  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13878787 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16786075 - 16785919
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  16786075 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 16785980  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16785979 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 17694846 - 17695030
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat-gagtaaccttacaaaagagat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  | |||| ||||||||    
T  17694846 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactataatgatatagtttctttac-aaagagat 17694944  T
Q  106 atcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    ||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17694945 at---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11138496 - 11138423
Alignment:
Q  140 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 212  Q
    ||||||| | |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11138496 ttctacctaaagtccccatctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25941857 - 25941780
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25941857 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 25941780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 33216015 - 33215938
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33216015 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggatagagcagctctccgttccactataatgat 33215938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13883631 - 13883475
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   |||  || ||||||| ||||| |   |    
T  13883631 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgaatttcaagaatcagtcttcaaac 13883536  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13883535 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 31248740 - 31248896
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  31248740 tgacctagtataggggagagagtagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 31248835  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31248836 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 3577658 - 3577696
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3577658 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 185
Target Start/End: Original strand, 5165936 - 5165985
Alignment:
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 185  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5165936 cctaattctaccca-agtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatc 5165985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 194
Target Start/End: Original strand, 19701988 - 19702041
Alignment:
Q  140 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19701988 ttctaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 26887368 - 26887406
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26887368 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 35201470 - 35201508
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35201470 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 3577484 - 3577560
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3577484 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggg-gagagagcagctctccgttccactataatgat 3577560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Original strand, 22870100 - 22870196
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |  ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  22870100 atttgttcacccagttcggtccaatactgacctact--gggagagagagaagctctccgttccactataatgatgagtttctttac-aaagagatatcaa 22870196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 30443616 - 30443532
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||| | || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  30443616 aacacacaaaaatttgtttacccagttcggtccaatacttacctagtctcggggagagagcagctctccgttacactataatgat 30443532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 105)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 17324625 - 17324849
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17324625 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 17324723  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17324724 gagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 17324823  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  17324824 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 17324849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25128165 - 25127940
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25128165 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaa 25128066  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  25128065 gagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttcac 25127966  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  25127965 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 25127940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18839880 - 18839656
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839880 aacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 18839781  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18839780 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 18839681  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  18839680 aaggtgaatcaaccctaaaacccta 18839656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13215375 - 13215149
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13215375 acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagag 13215276  T
Q  104 a----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215275 aaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 13215176  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13215175 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 13215149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16428946 - 16428725
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16428946 aacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaa 16428847  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16428846 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 16428747  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  16428746 aaggtgaatcaaccctcaaacc 16428725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 50076661 - 50076885
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50076661 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctggg-gagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaa 50076759  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50076760 gagatatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 50076859  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  50076860 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 50076885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 10399817 - 10400041
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10399817 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 10399915  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10399916 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 10400015  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  10400016 aaggtgaatcaaccttcaaaccctag 10400041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 25248540 - 25248765
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25248540 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaa 25248639  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  25248640 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttcc 25248739  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  25248740 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 25248765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Original strand, 50307540 - 50307759
Alignment:
Q  6 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  50307540 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 50307638  T
Q  106 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 205  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  50307639 gtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 50307738  T
Q  206 gaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50307739 gaatcaaccctcaaaccctag 50307759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 31425004 - 31425231
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425004 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gagagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 31425102  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagag---actcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  31425103 gagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgttt 31425202  T
Q  198 cccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31425203 tccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 31425231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 9241074 - 9241299
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9241074 aacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaa 9241173  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  9241174 gagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgttttcc 9241273  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  9241274 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 9241299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 11457464 - 11457688
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11457464 aacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 11457562  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457563 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 11457662  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  11457663 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 11457688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 12302494 - 12302718
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12302494 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 12302592  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12302593 gagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 12302692  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  12302693 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 12302718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51750331 - 51750107
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51750331 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 51750233  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51750232 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 51750133  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  51750132 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 51750107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15823838 - 15823614
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  15823838 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaata 15823740  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15823739 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttccc 15823640  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15823639 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 15823614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 25251263 - 25251488
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25251263 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaa 25251362  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  25251363 gatatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcct 25251462  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  25251463 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 25251488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 38925470 - 38925691
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||   |||||||||| ||||||||    
T  38925470 aacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgttttactat---gatgagtaacgttacaaaa 38925565  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38925566 gagatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 38925665  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  38925666 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 38925691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6823082
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 6823208  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6823207 gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttccc 6823108  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6823107 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 6823082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 15294823 - 15295047
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15294823 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 15294921  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15294922 gagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 15295021  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  15295022 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 15295047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18307401 - 18307177
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18307401 aacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaa 18307303  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18307302 gagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 18307203  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  18307202 gaggtgaatcaaccctcaaaccctag 18307177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28840971 - 28840748
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  28840971 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 28840874  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28840873 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 28840774  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  28840773 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 28840748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40134237 - 40134012
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40134237 aacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaa 40134138  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  40134137 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttccc 40134038  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  40134037 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 40134012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47906562 - 47906338
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47906562 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 47906464  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  47906463 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctc 47906364  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  47906363 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 47906338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16432688 - 16432462
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16432688 aacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattacaaa 16432589  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16432588 agagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgtttcc 16432489  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  16432488 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 16432462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39932366 - 39932141
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtga-gagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  39932366 aacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaa 39932268  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39932267 agagaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcc 39932168  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||    
T  39932167 caaggttaatcaaccctcaaaacctag 39932141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 17186116 - 17186341
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17186116 aacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaaaa 17186215  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17186216 gagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttccc 17186315  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  17186316 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 17186341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 31735510 - 31735734
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  31735510 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 31735608  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31735609 gagaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttccc 31735708  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  31735709 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 31735734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39462811 - 39462587
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||    
T  39462811 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgatgaataacttttcaaaa 39462713  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39462712 gagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 39462613  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||    
T  39462612 aaggtgaatcaaccctaaaaacctag 39462587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 50078809 - 50079034
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50078809 aacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaataactttacaaaa 50078908  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  50078909 gagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttcc 50079008  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  50079009 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 50079034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16429250 - 16429050
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16429250 aacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaa 16429151  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16429150 gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccc 16429051  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  16429050 a 16429050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 6995689 - 6995913
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  6995689 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttataaaa 6995787  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6995788 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttccc 6995887  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||| |||||||||    
T  6995888 aaggtgaatcaacccttaaaccctag 6995913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 27336929 - 27337152
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27336929 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 27337026  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27337027 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttccc 27337126  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27337127 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 27337152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6756820 - 6756596
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6756820 aacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaa 6756721  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  6756720 agagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatca--agactcaatcctaatagtgtttcc 6756623  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  6756622 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6756596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 14097958 - 14098183
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaac-cttacaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  14097958 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactat-atgatgagtaacgtttacaaa 14098056  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagag-tctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  14098057 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctct-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 14098155  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14098156 ccaaggtgaatcaaccctcaaactctag 14098183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 3579606 - 3579829
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  3579606 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta--atgatgagtaactttacaaaa 3579703  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  3579704 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttcct 3579803  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  3579804 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 3579829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 28998242 - 28998466
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||| ||| ||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  28998242 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatgagtaacgttgcaaaa 28998340  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28998341 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 28998440  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  28998441 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 28998466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 29003958 - 29004182
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||| ||| ||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  29003958 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatgagtaacgttgcaaaa 29004056  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29004057 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 29004156  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  29004157 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 29004182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41647212 - 41647000
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41647212 aacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 41647114  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41647113 gagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttccc 41647014  T
Q  201 agggtgaatcaacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  41647013 aaggtgaatcaacc 41647000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 46431695 - 46431920
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg--agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  46431695 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaa 46431793  T
Q  99 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46431794 a-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 46431892  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  46431893 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 46431920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17324349 - 17324131
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagt-atgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17324349 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggg-gagagaccagccttccgtttcactataatgatgaataaccttacaaaagagata 17324251  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17324250 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 17324151  T
Q  207 aatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17324150 aatcaaccctcaaaccctag 17324131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 2510314 - 2510537
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  2510314 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaga 2510412  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  2510413 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcca 2510511  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  2510512 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 2510537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2617808 - 2617584
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2617808 aacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 2617710  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2617709 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 2617610  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  2617609 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 2617584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13762128 - 13761905
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  13762128 aacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 13762031  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13762030 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 13761931  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||    
T  13761930 aagttgaatcaacccccaaaccctag 13761905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20302750 - 20302527
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||     
T  20302750 aacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatc-tgatgagtatcgttacaaa- 20302653  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20302652 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20302553  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  20302552 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 20302527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 27339120 - 27339343
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27339120 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 27339217  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27339218 gagaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttccc 27339317  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27339318 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 27339343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31490204 - 31489981
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  31490204 aacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagccctccgtttcaccata-tgatgaataaccttacaaaa 31490107  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  31490106 gagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttccc 31490007  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  31490006 aaggtgaatcaaccatcaaaccctag 31489981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51752655 - 51752433
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| || |||||| | |||||||     
T  51752655 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tggtgagtatcgttacaaa- 51752558  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  51752557 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatc-taatagtgtttcac 51752459  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  51752458 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 51752433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 4131364 - 4131592
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4131364 aacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaa 4131463  T
Q  101 g----agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 196  Q
    |    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4131464 gagaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagtc-cagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 4131562  T
Q  197 tcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4131563 tcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctag 4131592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24325954 - 24325731
Alignment:
Q  2 acacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||| | | || | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24325954 acacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactata-tgatgagtaacattacaaaag 24325856  T
Q  102 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 201  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24325855 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccta 24325756  T
Q  202 gggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
     ||||||||||||| ||||||||||    
T  24325755 aggtgaatcaacccacaaaccctag 24325731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 2949221 - 2949444
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2949221 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggg-gagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 2949318  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2949319 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttccc 2949418  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||    
T  2949419 aaggtgaatcaaccatcaacccctag 2949444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28842786 - 28842563
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  28842786 aacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 28842689  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28842688 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttccc 28842589  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||    
T  28842588 aatgtgaatcaacccacaaaccctag 28842563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 50248559 - 50248785
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagag--cagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | || |||||||  ||  | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50248559 aacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaa 50248657  T
Q  99 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50248658 aagagatgtcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 50248757  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  50248758 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctag 50248785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 9459406 - 9459630
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  9459406 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa- 9459503  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9459504 gagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcc 9459603  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  9459604 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 9459630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 9463233 - 9463457
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  9463233 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa- 9463330  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9463331 gagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcc 9463430  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  9463431 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 9463457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Original strand, 31422851 - 31423086
Alignment:
Q  3 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccac------------tataatgatgagtaa 90  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||            |||||||||||||||    
T  31422851 cacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaa 31422950  T
Q  91 ccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataat 190  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31422951 ccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaat 31423050  T
Q  191 agtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  31423051 agtgtttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctag 31423086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6115091 - 6115304
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6115091 aacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttacaaaa 6115190  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  6115191 gagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttttc 6115290  T
Q  201 agggtgaatcaacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  6115291 aaggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 14183581 - 14183794
Alignment:
Q  3 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 101  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14183581 cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaag 14183680  T
Q  102 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 201  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14183681 agatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgttttcca 14183780  T
Q  202 gggtgaatcaaccc 215  Q
     |||||||||||||    
T  14183781 aggtgaatcaaccc 14183794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42922514 - 42922310
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42922514 aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 42922415  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||    
T  42922414 atgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaat 42922315  T
Q  210 caacc 214  Q
    |||||    
T  42922314 caacc 42922310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 28207057 - 28207279
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||    
T  28207057 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcact---atgatgagtaacgttacaaaa 28207153  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||  || || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28207154 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttccc 28207253  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  28207254 aaggtgaataaactctcaaaccctag 28207279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17319179 - 17318961
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  17319179 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagg-gagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaa 17319081  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  17319080 gagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatc------ctgtttccc 17318987  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| || ||||||||    
T  17318986 aaggtgaatcaaccttccaaccctag 17318961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 15669419 - 15669596
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 137  Q
    ||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15669419 tgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 15669518  T
Q  138 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15669519 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 15669596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16226448 - 16226235
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  16226448 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 16226351  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16226350 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 16226251  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  16226250 aacccacaaaccctag 16226235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20291748 - 20291531
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||     
T  20291748 aacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactata-tgatgagaatcgttacaaa- 20291651  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20291650 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20291551  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaa 220  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  20291550 aaggtgaatcaaccctcaaa 20291531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 8347298 - 8347476
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 137  Q
    ||||||||| | || || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8347298 tgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 8347397  T
Q  138 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccct 216  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  8347398 aattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccct 8347476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47179993 - 47179781
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  47179993 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 47179897  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47179896 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 47179797  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  47179796 aacccacaaaccctag 47179781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51757822 - 51757624
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| || |||||| | |||||||     
T  51757822 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tggtgagtatcgttacaaa- 51757725  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51757724 gagaaatcgataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 51757625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16231843 - 16231631
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  16231843 atttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 16231747  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16231746 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 16231647  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  16231646 aacccacaaaccctag 16231631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47177642 - 47177430
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  47177642 atttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 47177546  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47177545 gggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 47177446  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  47177445 aacccacaaaccctag 47177430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Original strand, 21948229 - 21948400
Alignment:
Q  53 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagt 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21948229 gagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 21948327  T
Q  153 ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21948328 cccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 21948400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23786121 - 23785935
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  23786121 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 23786024  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23786023 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48665404 - 48665245
Alignment:
Q  67 ccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttccc 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  48665404 ccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccc 48665306  T
Q  167 -gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  48665305 ggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 48665245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451751
Alignment:
Q  16 gttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgt 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 47451821  T
Q  116 tacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 185  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451820 tacaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 47451751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23816178 - 23816027
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23816178 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattat-atgatgagtaacgttacaaaa 23816080  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 153  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23816079 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 18800600 - 18800775
Alignment:
Q  40 acctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctat 139  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||     
T  18800600 acctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaa 18800699  T
Q  140 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    ||||||||| |||   ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18800700 ttctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaaccc 18800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 213
Target Start/End: Original strand, 49495206 - 49495411
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||| || ||| |||||| || |||||||| |||| | || ||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49495206 aagaatttctttacctagttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 49495305  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  49495306 caatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtga 49495405  T
Q  208 atcaac 213  Q
    ||||||    
T  49495406 atcaac 49495411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 30790401 - 30790602
Alignment:
Q  13 tttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||| | |||||||| ||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30790401 tttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctggga-agagagcagtcatccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 30790499  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | |||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  30790500 gggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaaccaaaagactc-atcctaacagtgtttcccaaggtaaatc 30790598  T
Q  211 aacc 214  Q
    ||||    
T  30790599 aacc 30790602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16561751 - 16561545
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |  | |||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16561751 aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 16561652  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    | | ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16561651 aagggttacaagaataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 16561552  T
Q  209 tcaaccc 215  Q
    |||||||    
T  16561551 tcaaccc 16561545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 30738653 - 30738830
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataat--gatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |       
T  30738653 tgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaa 30738752  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30738753 cctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Original strand, 8349109 - 8349254
Alignment:
Q  70 ttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgta 169  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||     
T  8349109 ttccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtg 8349208  T
Q  170 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    ||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8349209 accatcaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaaccc 8349254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Original strand, 13125483 - 13125660
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 136  Q
    |||||||||| ||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||    
T  13125483 tgacctagtaagggggggagagcaactctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacc 13125582  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaacc 214  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||    
T  13125583 taattctacccaaagtcccaatctcttcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaatcaacc 13125660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 26613237 - 26613440
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| || || | ||||||| | |||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  26613237 aatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatca 26613336  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    | | |||||||||||||||| ||   |||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  26613337 aagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtgtttcccaaggtgaa 26613436  T
Q  209 tcaa 212  Q
    ||||    
T  26613437 tcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155788
Alignment:
Q  36 attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 134  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||   ||||||||||| | ||| |       
T  155963 attgacctagtttggg-gagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaa 155866  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6824091 - 6823953
Alignment:
Q  95 acaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgt-------aaccaagagactcaatcat 187  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||       |||||||||| |||||| |    
T  6824091 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgt 6823992  T
Q  188 aatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6823991 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 6823953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15916674 - 15916562
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaa-ttgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15916674 aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatca 15916575  T
Q  110 atgtgttacaaga 122  Q
    ||| |||||||||    
T  15916574 atgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27916780 - 27916576
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27916780 aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatca 27916682  T
Q  110 atg--tgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 206  Q
    | |   |||| |||||| |||| ||   |||| ||| ||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||    
T  27916681 aagaaggttaaaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtg 27916582  T
Q  207 aatcaa 212  Q
    ||||||    
T  27916581 aatcaa 27916576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 13358865 - 13358787
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactata 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  13358865 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata 13358787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28279490 - 28279361
Alignment:
Q  70 ttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgt 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28279490 ttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgt 28279391  T
Q  169 aaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  28279390 gaccaagaagctcaatcctaatagtgtttc 28279361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43104390 - 43104245
Alignment:
Q  65 ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaag-aataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctct 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||   |||| ||||||||| ||| ||||| |||    
T  43104390 ctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaaaaaaatcttcaaacctaattctacccaaagtttcaatgtct 43104291  T
Q  163 tcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    ||| || ||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  43104290 tcctgtgaccaaaagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 43104245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 21353342 - 21353525
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  21353342 aagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttac-aaagagata 21353440  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21353441 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 26520119 - 26520321
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||| | |||| || ||||||  |||||||||||||||||| || || ||| ||||        ||||||    
T  26520119 atttgtttacccagtttggtccaaaactgacctaatttgggggaaagagcaaccctccgttccactataattataagcaactttac--------tatcaa 26520210  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaac------caagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
    || ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26520211 tgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaag 26520310  T
Q  204 gtgaatcaacc 214  Q
    |||||||||||    
T  26520311 gtgaatcaacc 26520321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14353190 - 14353047
Alignment:
Q  68 cgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc-aatctcttccc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | |||||||||||| || ||   |||| ||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  14353190 cgttccactataatgatgaataactttacaaaaga--tttcaaagggttacaagaata-gtttcaaacctaattctacccaaagtctcgaatctctttcc 14353094  T
Q  167 gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 212  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14353093 gtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 13127685 - 13127782
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| | | ||||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13127685 aatttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 13127782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Original strand, 26332616 - 26332688
Alignment:
Q  140 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  26332616 ttctacacaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14997101 - 14997040
Alignment:
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14997101 cctaattctaccca-agtctcaatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 13447262 - 13447301
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattga 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13447262 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Original strand, 4144804 - 4144865
Alignment:
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4144804 cctaattctaccca-agtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 91
Target Start/End: Original strand, 11693351 - 11693389
Alignment:
Q  53 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaac 91  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11693351 gagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaac 11693389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 9521871 - 9521826
Alignment:
Q  39 gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9521871 gacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 9521826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 102
Target Start/End: Original strand, 8213579 - 8213615
Alignment:
Q  66 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8213579 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 8213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 46783331 - 46783212
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| || | |||  |||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  46783331 aatttgtttatccagttcgatccaatattgacttactctggaggagataacagctctctgttccactataatgatgagtttctttacaaaa-agatatca 46783233  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtct 130  Q
    | | ||||||||||| |||||    
T  46783232 aagggttacaagaattagtct 46783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2232635 - 2232597
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2232635 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 9526623 - 9526577
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9526623 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 9526577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Original strand, 26332699 - 26332761
Alignment:
Q  150 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  26332699 agtctcaatctattttcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3157033 - 3156989
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  3157033 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 3156989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 28223421 - 28223465
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  28223421 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 28223465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 96)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 1189594 - 1189820
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1189594 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttacaaa 1189693  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189694 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 1189793  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  1189794 caaagtgaatcaaccctcaaaccctag 1189820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 696170 - 695946
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  696170 aacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaa 696071  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  696070 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-cc 695972  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  695971 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 695946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 16092186 - 16092411
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| | |  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092186 aacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 16092285  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16092286 gagatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 16092385  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  16092386 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 16092411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20505830 - 20506042
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20505830 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 20505926  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20505927 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20506026  T
Q  201 agggtgaatcaaccct 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  20506027 aaggtgaatcaaccct 20506042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6745360 - 6745140
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6745360 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 6745262  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6745261 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 6745162  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  6745161 aaggtgaatcaaccctcaaacc 6745140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 18511199 - 18511423
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18511199 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 18511297  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18511298 gagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 18511397  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  18511398 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 18511423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25804316 - 25804093
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25804316 aacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 25804219  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25804218 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 25804119  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  25804118 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 25804093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40221813 - 40221590
Alignment:
Q  3 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40221813 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 40221714  T
Q  103 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  40221713 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 40221614  T
Q  203 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  40221613 ggtgaatcaaccctcaaatcctag 40221590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18596938 - 18596717
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18596938 aacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaa 18596839  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  18596838 gagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttcc 18596739  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  18596738 aaggtgaatcaaccctcaaacc 18596717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24127148 - 24126924
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24127148 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaa 24127050  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24127049 gagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccc 24126950  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||    
T  24126949 aaggtcaatcaatcttcaaaccctag 24126924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 25921460 - 25921684
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25921460 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 25921558  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25921559 gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcac 25921658  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  25921659 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 25921684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Original strand, 10529091 - 10529310
Alignment:
Q  6 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  10529091 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaa 10529189  T
Q  106 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10529190 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 10529289  T
Q  206 gaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10529290 gaatcaaccctcaaaccctag 10529310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27912828 - 27912605
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  27912828 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 27912730  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27912729 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 27912630  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | |||||||||||||||||| ||||    
T  27912629 aaggtgaatcaaccctcaaaaccta 27912605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6756784 - 6756562
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6756784 aacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc-gtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaa 6756686  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6756685 aagatatcaatgt--tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttccc 6756588  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  6756587 aaggagaatcaaccctcaaaccctag 6756562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2175210 - 2174987
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||     
T  2175210 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgataagtaacgttacaaa- 2175113  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175112 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 2175013  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  2175012 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 2174987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17073172 - 17072951
Alignment:
Q  5 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073172 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 17073073  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaggg 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  17073072 tatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagg 17072973  T
Q  205 tgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17072972 tgaatcaaccctcaaaccctag 17072951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21948318 - 21948094
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21948318 aacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 21948220  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21948219 gagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 21948120  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  21948119 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 21948094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 41585731 - 41585955
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41585731 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaa 41585829  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41585830 gagatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttccc 41585929  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  41585930 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 41585955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10474310 - 10474531
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10474310 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttagaaaa 10474408  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10474409 gagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttccc 10474508  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  10474509 aaggtgtatcaaccctcaaaccc 10474531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6747596 - 6747377
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  6747596 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgttacaaaa 6747498  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6747497 -agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 6747399  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  6747398 aaggtgaatcaaccctcaaacc 6747377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25904395 - 25904171
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |    
T  25904395 aacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgataagtaacgttacaata 25904297  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25904296 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 25904197  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  25904196 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 25904171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 31472599 - 31472820
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31472599 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaa 31472698  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||| ||||| | |  ||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31472699 gagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 31472798  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  31472799 aaggtgaatcaaccctcaaacc 31472820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39854775 - 39854551
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  39854775 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtagcgttacaaaa 39854677  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39854676 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttccc 39854577  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  39854576 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 39854551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 658343 - 658564
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  658343 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 658438  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  658439 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttctc 658538  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  658539 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 658564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 2818322 - 2818547
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2818322 aacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 2818420  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2818421 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttcc 2818520  T
Q  201 agggtgaatc-aaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  2818521 aaggtgaatcaaaccctcaaaccctag 2818547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 17818479 - 17818701
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  || |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17818479 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgta-tgatgagtaactttacaaaa 17818575  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17818576 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttccc 17818675  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||    
T  17818676 aaggtaaatcaaccatcaaaccctag 17818701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18466973 - 18466752
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  18466973 acaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaaagag 18466875  T
Q  104 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18466874 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 18466775  T
Q  204 gtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  18466774 gtgaatcaaccctcaaaacctag 18466752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39798339 - 39798126
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| | ||| ||||    
T  39798339 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatac-gatgagtatcattataaaa 39798241  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39798240 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 39798141  T
Q  201 agggtgaatcaaccc 215  Q
    | |||||||||||||    
T  39798140 aaggtgaatcaaccc 39798126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4236920 - 4236697
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4236920 aacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 4236823  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4236822 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 4236723  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  4236722 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 4236697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 18509305 - 18509529
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18509305 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 18509403  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18509404 tagatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 18509503  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  18509504 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 18509529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27910742 - 27910518
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||    
T  27910742 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaaa 27910644  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27910643 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttccc 27910544  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  27910543 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 27910518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38882397 - 38882174
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  38882397 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 38882300  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38882299 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 38882200  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  38882199 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 38882174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 34479405 - 34479630
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  34479405 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaa 34479502  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34479503 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttc 34479602  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34479603 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 34479630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2954708 - 2954485
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||     
T  2954708 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactata-tgatgagtaactttacaaa- 2954611  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2954610 gagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttcc 2954511  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  2954510 aaagtgaatcaaccctcaaaccctag 2954485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16776449 - 16776226
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  16776449 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgataagtaacgttacaaaa 16776351  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16776350 gagaaatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 16776252  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  16776251 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 16776226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 34477040 - 34477265
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  34477040 aacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaa 34477137  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34477138 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttc 34477237  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34477238 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 34477265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2724185 - 2723970
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2724185 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat-atgatgagtaatcttacaaaa 2724087  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2724086 gagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattctac---------caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttccc 2723996  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  2723995 aaggtgaatcatccctcaaaccctag 2723970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10587124 - 10586901
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10587124 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa 10587026  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
     |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10587025 -gagaaatcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttcc 10586927  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  10586926 caaggtgaatcaaccctcaaacccta 10586901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26098023 - 26097801
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26098023 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcag-cctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 26097926  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||   | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  26097925 gagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgttt-cc 26097827  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||    
T  26097826 aaggtgaatcaaccctctaaccctag 26097801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36208865 - 36208656
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36208865 acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagag 36208767  T
Q  104 atatcaatgtgttacaagaataagtct-cccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||     
T  36208766 atatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaa 36208667  T
Q  203 ggtgaatcaac 213  Q
    |||||||||||    
T  36208666 ggtgaatcaac 36208656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 37705774 - 37705991
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  || | | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37705774 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatat 37705872  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37705873 caatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 37705972  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37705973 atcaaccctcaaaccctag 37705991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4410314 - 4410091
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  4410314 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 4410217  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4410216 gagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 4410117  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  4410116 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 4410091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 36402315 - 36402539
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36402315 aacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 36402413  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||    
T  36402414 gagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtattttcc 36402513  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  36402514 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 36402539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 6661181 - 6661386
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6661181 aatttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatca 6661280  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6661281 atgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaat 6661380  T
Q  210 caaccc 215  Q
    ||||||    
T  6661381 caaccc 6661386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15552537 - 15552313
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  15552537 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 15552440  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15552439 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcc 15552340  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  15552339 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 15552313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18469297 - 18469079
Alignment:
Q  5 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||  || |||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||    
T  18469297 caaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctggg--agagagcagctcttcgttccactaga-tgatgagtatcgttacaaaagaga 18469201  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaggg 204  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18469200 aatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 18469101  T
Q  205 tgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18469100 tgaatcaaccctcaaaacctag 18469079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31545372 - 31545148
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  31545372 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtactgttacaaa- 31545275  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31545274 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttcc 31545175  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  31545174 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 31545148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21684439 - 21684662
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  21684439 aacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa- 21684536  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21684537 gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatccc 21684636  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | || ||||||||||  |||||||||    
T  21684637 aaggcgaatcaacccataaaccctag 21684662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 31179368 - 31179582
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| || ||    
T  31179368 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatgaa 31179465  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31179466 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 31179565  T
Q  210 caaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||| ||||||||||    
T  31179566 caacccacaaaccctag 31179582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 39397980 - 39398200
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||  |||||| | ||  ||||| | ||||||    
T  39397980 aacacaaaagaatgttttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactata-taattggtaacgtcacaaaa 39398078  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39398079 gagatatcaatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 39398178  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  39398179 aaggtgaatcaaccctcaaacc 39398200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10749986 - 10749796
Alignment:
Q  7 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |    
T  10749986 aaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaa 10749889  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10749888 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31543026 - 31542803
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  31543026 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtactgttacaaa- 31542929  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31542928 gagaaatcaatgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 31542830  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  31542829 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 31542803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Original strand, 34530721 - 34530877
Alignment:
Q  70 ttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  34530721 ttccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgta 34530820  T
Q  170 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34530821 gccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctag 34530877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 12555910 - 12556130
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||    
T  12555910 aacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgctttaa-gatgagtaacgttacaaaa 12556008  T
Q  101 -gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||  | ||| ||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12556009 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaactc-caatctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcc 12556107  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  12556108 caaggtgaatcaaccctcaaacc 12556130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38960119 - 38960314
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||     
T  38960119 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa- 38960216  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38960217 gagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9020512 - 9020299
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||   |||||| | |||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9020512 aacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaattttacaaa 9020413  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  9020412 agagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgttttc 9020313  T
Q  200 cagggtgaatcaac 213  Q
    || |||||||||||    
T  9020312 caaggtgaatcaac 9020299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21289050 - 21288839
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||      
T  21289050 acaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataa-gatgagtaacgttacaaaag-- 21288954  T
Q  104 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
          ||| |||||||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |    
T  21288953 ------atgagttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttt-tcaag 21288861  T
Q  204 gtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21288860 gtgaatcaaccctcaaacccta 21288839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15354562 - 15354757
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||| |||| |||    
T  15354562 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-aaa 15354659  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15354660 gagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23665335 - 23665140
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  23665335 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaa 23665238  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23665237 gagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 23793252 - 23793447
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  23793252 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaa 23793349  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23793350 gagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Original strand, 31465979 - 31466187
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||          ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  31465979 acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagccct----------ata-tgatgagtaactttacaaaatag 31466067  T
Q  104 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |    
T  31466068 atatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttctcaag 31466166  T
Q  204 gtgaatcaaccctcaaaccct 224  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  31466167 gtgaatcaaccgtcaaaccct 31466187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10757462 - 10757273
Alignment:
Q  7 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| || | |    
T  10757462 aaagaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gaaaaa 10757365  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10757364 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3373124 - 3373320
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  3373124 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 3373221  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3373222 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15356838 - 15357033
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||| |||| |||    
T  15356838 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-aaa 15356935  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15356936 gagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20054129 - 20053923
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20054129 aacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttacaaa 20054030  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||     |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20054029 agagatatc---gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatct-----ccaaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20053938  T
Q  200 cagggtgaatcaacc 214  Q
    || ||||||||||||    
T  20053937 caaggtgaatcaacc 20053923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Original strand, 17413200 - 17413365
Alignment:
Q  48 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataag-tctcccgcctatttctacc 146  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||   |||| |||||||    
T  17413200 tgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattctacc 17413299  T
Q  147 cagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
     | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17413300 taaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 17413365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 23741846 - 23742023
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  23741846 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaa 23741943  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactc 181  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23741944 gagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactc 23742023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20045078
Alignment:
Q  132 ccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 20045078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15143722 - 15143547
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 136  Q
    ||||||||| | || |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||    
T  15143722 tgacctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacc 15143623  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    || ||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||    
T  15143622 taattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgcttccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20043204 - 20043118
Alignment:
Q  140 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20043204 ttctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 20043118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4898022 - 4897828
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  || || | |||||||||||||| |||| ||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  4898022 aacacaaaa-aatttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagtatgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaat 4897924  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||||||||||   ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||    
T  4897923 agagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42771024 - 42770936
Alignment:
Q  80 atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgt 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42771024 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 42770936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 26098275 - 26098380
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| |||||||    
T  26098275 aacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccat-atgatgagtaacgttacaaa 26098373  T
Q  100 agagata 106  Q
    |||||||    
T  26098374 agagata 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 15445263 - 15445417
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15445263 aatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctggga-agagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 15445361  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttc 164  Q
    | | ||||||||||| | || ||   |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15445362 aagggttacaagaatcattcttcaaacctaattctactcaaagtctcaatctcttc 15445417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Original strand, 26098391 - 26098462
Alignment:
Q  155 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  26098391 caatctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 26098462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 212
Target Start/End: Original strand, 2144601 - 2144763
Alignment:
Q  53 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat-caatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccaga 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||   ||||||||||| |||| ||   |||| ||| ||||| |    
T  2144601 gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatataaaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaa 2144699  T
Q  151 gt-ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 212  Q
    || || ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2144700 gtcctgaatctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 2144763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 34033563 - 34033753
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc- 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  34033563 aatttgtttacccagttcgatccaatactgacctagtcaggg-gagagagcagttctatgttccacagtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcg 34033661  T
Q  109 aatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagt-ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    || | ||||| | || ||||| ||   | || ||||||||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34033662 aaggggttaccataacaagtcttcaaacttaattctacccaaaatcctgaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 34033753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770847
Alignment:
Q  126 agtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaata--gtttcccatggtgaatgaaccc 42770847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20043282 - 20043222
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagca 61  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  20043282 aacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35430408 - 35430259
Alignment:
Q  66 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc-aatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctc-aatctct 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |  |||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| || | | |||||||    
T  35430408 tccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaagaattacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaaagacccgaatctct 35430310  T
Q  163 tcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 212  Q
    ||||   |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35430309 tccctagaccaagagactcaattgtaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 35430259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22673022 - 22672837
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  22673022 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 22672924  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22672923 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1170967 - 1170811
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  1170967 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 1170872  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1170871 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10627411 - 10627364
Alignment:
Q  150 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10627411 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 10627364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Original strand, 2298122 - 2298183
Alignment:
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2298122 cctaattctaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11917065 - 11916996
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  11917065 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatga 11916996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 28786592 - 28786515
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28786592 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagttctccgttccattataatgat 28786515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 42238448 - 42238371
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42238448 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 42238371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20045270 - 20045210
Alignment:
Q  64 cctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaat 124  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20045270 cctccgtttctctataatgataagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttaaaagaat 20045210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32520597 - 32520533
Alignment:
Q  135 cctatttctacccagagtc-tcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  32520597 cctaattctacccaaagtcatgaatctcttcccgtaatcgagagactcaatcttaatagtgtttc 32520533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25445684 - 25445501
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  25445684 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 25445586  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 192  Q
    |||   || || |||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25445585 tat---tgagtaacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatag 25445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1240585 - 1240539
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1240585 tgacctagtttgggagagagagcagctctccgttccactataatgat 1240539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 197
Target Start/End: Original strand, 31782597 - 31782639
Alignment:
Q  155 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31782597 caatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 31782639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 35385596 - 35385634
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35385596 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4754312 - 4754235
Alignment:
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  4754312 cctaattctatccaaagtcacaatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaa 4754235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 533937 - 533893
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  533937 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 533893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 42428430 - 42428474
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  42428430 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 42428474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 132)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16455581 - 16455363
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16455581 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatat 16455482  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16455481 caatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 16455382  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  16455381 atcaaccatcaaaccctag 16455363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40637420 - 40637196
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40637420 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 40637322  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40637321 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttccc 40637222  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  40637221 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 40637196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 40091402 - 40091622
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40091402 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaa 40091500  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091501 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 40091600  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  40091601 aaggtgaatcaaccctcaaacc 40091622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36380696 - 36380472
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36380696 aacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaaaa 36380597  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36380596 gatatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttccc 36380497  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  36380496 aaggtgaatcaaccctcaaacccta 36380472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 12395832 - 12396056
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12395832 aacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaa 12395930  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12395931 gagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 12396030  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  12396031 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 12396056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 12400794 - 12401018
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12400794 aacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaa 12400892  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12400893 gagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttccc 12400992  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  12400993 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 12401018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 22800849 - 22801073
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22800849 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 22800947  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22800948 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttcc 22801047  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  22801048 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 22801073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48486665 - 48486441
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  48486665 aacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 48486567  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48486566 gagatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 48486467  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  48486466 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 48486441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24880798 - 24880573
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24880798 aacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaa 24880700  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24880699 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 24880600  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || |||||| |||||||||||||||||    
T  24880599 caaggtgaaccaaccctcaaaccctag 24880573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 8631406 - 8631630
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8631406 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 8631504  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8631505 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 8631604  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  8631605 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 8631630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14633664 - 14633441
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14633664 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaa 14633566  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14633565 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 14633467  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  14633466 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 14633441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 17662232 - 17662456
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17662232 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 17662330  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17662331 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 17662430  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  17662431 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 17662456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24348564 - 24348340
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24348564 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 24348466  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24348465 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 24348366  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  24348365 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 24348340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24889142 - 24888918
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  24889142 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgataagtaacgttacaaaa 24889044  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24889043 gagatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 24888944  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  24888943 aaggtgaatcaaccctcaaagcctag 24888918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 38928164 - 38928388
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38928164 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactata-tgatgagtaacgttacaaaa 38928262  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38928263 gagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 38928362  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  38928363 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 38928388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24879336 - 24879113
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| | || |||||    
T  24879336 aacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgtgtatcgtttacaaa 24879238  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24879237 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 24879138  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccct 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  24879137 caaggtgaatcaaccctcaaaccct 24879113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16453656 - 16453431
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453656 aacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 16453557  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16453556 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 16453457  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  16453456 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 16453431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 33415475 - 33415695
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33415475 aacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 33415573  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33415574 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttccc 33415673  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  33415674 aaggtgaatcaaccctcaaacc 33415695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 36921480 - 36921704
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36921480 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 36921578  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36921579 gagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 36921678  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  36921679 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 36921704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 37089359 - 37089582
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  37089359 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 37089456  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37089457 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttccc 37089556  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  37089557 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 37089582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47868747 - 47868523
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  47868747 aacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 47868649  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  47868648 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 47868549  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  47868548 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 47868523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22802721 - 22802944
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22802721 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactata-tgatgagtaacattacaaaa 22802819  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22802820 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 22802919  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  22802920 aaggtgaatcaaccctcaaacccta 22802944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36378639 - 36378414
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  36378639 aacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaaga 36378540  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  36378539 gagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgttttcc 36378440  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  36378439 aaggtgaatcaaccttcaaaccctag 36378414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47275071 - 47274848
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47275071 aacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 47274974  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47274973 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 47274874  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||    
T  47274873 aagatgaatcaaccctcaaaccctag 47274848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2891638 - 2891433
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891638 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 2891539  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2891538 gagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 2891439  T
Q  201 agggtg 206  Q
    | ||||    
T  2891438 aaggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7941669 - 7941445
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  7941669 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 7941571  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7941570 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 7941471  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  7941470 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 7941445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9148598 - 9148375
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  9148598 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 9148501  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9148500 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 9148401  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  9148400 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 9148375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 22046673 - 22046896
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  22046673 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 22046770  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22046771 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 22046870  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  22046871 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 22046896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19323041 - 19322826
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19323041 aacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 19322942  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19322941 agagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 19322842  T
Q  200 cagggtgaatcaaccc 215  Q
    || |||||||||||||    
T  19322841 caaggtgaatcaaccc 19322826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19096229 - 19096005
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  19096229 aacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgataagtaacgttacaaaa 19096131  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  19096130 gagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaag-ctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttca 19096032  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  19096031 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 19096005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 37313055 - 37313277
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37313055 acaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagag 37313154  T
Q  104 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  37313155 atattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaag 37313254  T
Q  204 gtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  37313255 gtgaatcaactctcaaaccctag 37313277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6765190 - 6764966
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6765190 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 6765092  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6765091 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttccc 6764992  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  6764991 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 6764966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 36919571 - 36919795
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| | ||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  36919571 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactata-tgatgaataacgttacaaaa 36919669  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36919670 gagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 36919769  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  36919770 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 36919795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38409546 - 38409327
Alignment:
Q  5 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||    
T  38409546 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gaga 38409449  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaggg 204  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  38409448 aatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 38409349  T
Q  205 tgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  38409348 tgaatcaacccacaaaccctag 38409327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 2484860 - 2485083
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  2484860 aacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 2484957  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2484958 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 2485057  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||  |||||||||    
T  2485058 aaggtgaatcaacccagaaaccctag 2485083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5198766 - 5198542
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  5198766 aacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 5198668  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5198667 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccc 5198568  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||    
T  5198567 aaagtgaatcaaccctcaaaacctag 5198542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 18537470 - 18537675
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| || |||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18537470 aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 18537569  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18537570 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaat 18537669  T
Q  210 caaccc 215  Q
    ||||||    
T  18537670 caaccc 18537675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 22044378 - 22044601
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  22044378 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 22044475  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22044476 gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 22044575  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | || |||||||||| ||||||||||    
T  22044576 aaggggaatcaacccacaaaccctag 22044601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 26085964 - 26086187
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  26085964 aacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 26086061  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26086062 gagaaaacaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 26086161  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  26086162 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 26086187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51015591 - 51015368
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  51015591 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa- 51015494  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51015493 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 51015394  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  51015393 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 51015368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13547500 - 13547302
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13547500 aacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 13547402  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13547401 gatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11435300 - 11435077
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  11435300 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 11435203  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11435202 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttccc 11435103  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  11435102 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 11435077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 14787423 - 14787642
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagag--cagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 105  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14787423 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 14787521  T
Q  106 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 205  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14787522 gtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 14787621  T
Q  206 gaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  14787622 gaatcaatcctcaaaccctag 14787642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 22132389 - 22132602
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  22132389 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 22132486  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22132487 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 22132586  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22132587 aacccacaaaccctag 22132602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 31849586 - 31849803
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  31849586 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 31849683  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31849684 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttccc 31849783  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaa 220  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  31849784 aaggtgaatcaacccacaaa 31849803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 9176461 - 9176685
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  9176461 aacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa- 9176558  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9176559 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 9176658  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  9176659 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 9176685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 11006224 - 11006448
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  11006224 aacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaccattacaaa- 11006321  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11006322 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 11006421  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11006422 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 11006448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18847498 - 18847275
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  18847498 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa- 18847402  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  18847401 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttcc 18847302  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  18847301 caaggtgaatcaacccacaaactctag 18847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 619435 - 619658
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  619435 aacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagttaggg-gagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 619532  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  619533 gagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttccc 619632  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||    
T  619633 aaggtaaatcaaccctcaaaccctag 619658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544085
Alignment:
Q  34 aaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctccc 133  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccc 13544174  T
Q  134 gcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13544173 gcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacc 13544085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 11008555 - 11008777
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  11008555 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccattacaaa- 11008652  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
      || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11008653 --gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 11008750  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11008751 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 11008777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27499388 - 27499167
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27499388 aacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggg-gaaagagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaa 27499290  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  27499289 gagatattag---gttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctc 27499193  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27499192 aggatgaatcaaccctcaaaccctag 27499167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41997828 - 41997614
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  41997828 aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctggg-gagagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaa 41997730  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
     | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  41997729 agggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 41997630  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  41997629 aaccctcaaaccctag 41997614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 16931776 - 16932000
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  16931776 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 16931873  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  16931874 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttct 16931973  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  16931974 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 16932000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 16934130 - 16934354
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  16934130 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 16934227  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  16934228 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttct 16934327  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  16934328 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 16934354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 18709151 - 18709374
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  18709151 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 18709248  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18709249 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttccc 18709348  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||    
T  18709349 aaggtgaatcaactcacaaaccctag 18709374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 44599836 - 44600049
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  44599836 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 44599933  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44599934 gagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 44600033  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  44600034 aacccacaaaccctag 44600049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4215652 - 4215483
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4215652 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 4215554  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaac 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  4215553 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 9174133 - 9174357
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  9174133 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa- 9174230  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9174231 gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcc 9174330  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||| | | ||||||||    
T  9174331 caaggtgaatcaactcacgaaccctag 9174357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 38890221 - 38890426
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| | | || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38890221 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 38890320  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||    
T  38890321 atgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatatgaat 38890420  T
Q  210 caaccc 215  Q
    ||||||    
T  38890421 caaccc 38890426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 18409344 - 18409558
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||   ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18409344 aatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaa 18409442  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||    
T  18409443 tgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcccgaaggttaatc 18409542  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  18409543 aaccctcaaaccctag 18409558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 22134615 - 22134827
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  22134615 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 22134711  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||  || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22134712 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 22134811  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22134812 aacccacaaaccctag 22134827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 22780371 - 22780584
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  22780371 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaat 22780468  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22780469 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatc 22780568  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22780569 aacccacaaaccctag 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 22782736 - 22782949
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  22782736 atttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaat 22782833  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22782834 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatc 22782933  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22782934 aacccacaaaccctag 22782949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30136896 - 30136682
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| | || ||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30136896 aacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttacaaaa 30136797  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30136796 gagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttccc 30136697  T
Q  201 agggtgaatcaaccc 215  Q
    | |||||||||||||    
T  30136696 aaggtgaatcaaccc 30136682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 18534828 - 18535033
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||  | ||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  18534828 aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatca 18534927  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  18534928 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaat 18535027  T
Q  210 caaccc 215  Q
    ||||||    
T  18535028 caaccc 18535033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 56030770 - 56030566
Alignment:
Q  18 tgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgtta 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||     ||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||    
T  56030770 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcat----atgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagtta 56030675  T
Q  118 caagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctc 217  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56030674 caagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 56030575  T
Q  218 aaaccctag 226  Q
    |||||||||    
T  56030574 aaaccctag 56030566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 8756247 - 8756453
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||   |||||||| |||  |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8756247 aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaactttacaaaagagatatca 8756346  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaacc-aagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  8756347 atgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgtttcccaaggtgaa 8756446  T
Q  209 tcaaccc 215  Q
    |||||||    
T  8756447 tcaaccc 8756453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 5635463 - 5635614
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5635463 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaa 5635561  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 153  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5635562 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12102425 - 12102221
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12102425 aatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 12102326  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
     || |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||  |||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12102325 gtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 12102226  T
Q  209 tcaac 213  Q
    |||||    
T  12102225 tcaac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 3824627 - 3824781
Alignment:
Q  71 tccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaa 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  3824627 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaa 3824725  T
Q  171 ccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3824726 ccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 3824781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 47210756 - 47210938
Alignment:
Q  18 tgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgtta 117  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  47210756 tgactcagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggtta 47210854  T
Q  118 caagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47210855 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttccca 47210938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 5637530 - 5637676
Alignment:
Q  80 atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  5637530 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 5637629  T
Q  180 tcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5637630 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctag 5637676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28454020 - 28453818
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28454020 aatttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 28453921  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    |    |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  28453920 aaagtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaat 28453821  T
Q  210 caa 212  Q
    |||    
T  28453820 caa 28453818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53405479 - 53405251
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  |||  ||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||    
T  53405479 aacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagctctctgttccactata-tgatgagtatcgtttcaaaa 53405383  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataag------tctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||      |||||||| || ||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53405382 gagaaatcaatgggttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagtg 53405283  T
Q  195 tttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  53405282 tttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctag 53405251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11437708 - 11437558
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  11437708 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaa 11437611  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 153  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11437610 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 11437558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 213
Target Start/End: Original strand, 31983554 - 31983727
Alignment:
Q  40 acctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-ccta 138  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |   ||||    
T  31983554 acctagtattgg-gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaaccta 31983652  T
Q  139 tttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 213  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31983653 attctacccaaagtctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 199
Target Start/End: Original strand, 15032572 - 15032733
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 137  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15032572 tgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcct 15032671  T
Q  138 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    | ||||||| | ||||  ||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15032672 aattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 15032733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 198
Target Start/End: Original strand, 3982200 - 3982362
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 136  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||   |     
T  3982200 tgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagtgttacaagaatcagtcttcaaact 3982299  T
Q  137 tatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3982300 taattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttc 3982362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132994
Alignment:
Q  130 tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctag 6132994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5101274 - 5101130
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5101274 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagatagcagccctccgttttactat-atgatgagtaaatttacaaaa 5101177  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctaccc 147  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  5101176 gacatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 16185831 - 16186018
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  16185831 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttac-aaagatatatca 16185929  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    | | ||| |||||||||||| ||   |||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16185930 aagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6133183 - 6133098
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6133183 aacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactataatgatga 6133098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 226
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937420
Alignment:
Q  120 agaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaa 219  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  220 accctag 226  Q
    |||||||    
T  3937414 accctag 3937420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25357989 - 25357772
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||| | || ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25357989 aacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaa 25357890  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct--att---tctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |   ||  |||   | || ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||     
T  25357889 agagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagta 25357790  T
Q  195 tttcccagggtgaatcaa 212  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  25357789 tttcccaaggtgaatcaa 25357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 212
Target Start/End: Original strand, 47150948 - 47151092
Alignment:
Q  69 gttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccg 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||| ||||||||| | |||||||||||||  |    
T  47150948 gttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatg 47151047  T
Q  168 taaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47151048 tgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 47151092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Original strand, 52942537 - 52942657
Alignment:
Q  93 ttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |             |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52942537 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaatag 52942623  T
Q  193 tgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  52942624 tgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctag 52942657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9864049 - 9863842
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtg--agagagcagtcctccgttccactataatgatga---gtaaccttacaaaagaga 104  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||| |||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||    
T  9864049 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagtaactttacaaa-gaga 9863951  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct-atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||| |   || | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |    
T  9863950 tatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaag 9863851  T
Q  204 gtgaatcaa 212  Q
    |||||||||    
T  9863850 gtgaatcaa 9863842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 212
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999148
Alignment:
Q  55 gagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtc 153  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |   |||||||   |||| ||||||||| ||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtc 40999089  T
Q  154 tcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  40999090 tcgatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaa 40999148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 47563107 - 47563009
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47563107 aacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataa-gatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9022613 - 9022438
Alignment:
Q  40 acctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat--gtgttacaagaataagtc-tcccgcc 136  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||   ||    
T  9022613 acctaatatgggggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaatagaggttacaagaattagtcttcaaacc 9022515  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 212  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  9022514 taattcaacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaa 9022438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10113198 - 10113003
Alignment:
Q  20 acccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtg-tta 117  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||||| | || ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||   | |||    
T  10113198 acccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattacaaa-gagatatcaaaaaggtta 10113100  T
Q  118 caagaataagtctcccgc-ctatttctacccagagtctcaatctcttccc-gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    ||||||| ||||| |    ||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10113099 caagaattagtcttcaaatctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaa 10113003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 5336767 - 5336964
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  | ||   ||    
T  5336767 aacacaaaagaatttgtttaatcagttcagtccaatattgacctactataggggagagagcagctctccgttccactataatgatgaatttcttttacaa 5336866  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||| |  |  |||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5336867 agagatataagaggattacaagaattagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 49088911 - 49088791
Alignment:
Q  7 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag-aga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||    
T  49088911 aaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactat-atgatgactaacattacaaaagaaga 49088813  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataa 126  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  49088812 tgtcaatgagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 14789422 - 14789496
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat--gggtgagagagcagtcctccgttccactataa 80  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14789422 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactataa 14789496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 130
Target Start/End: Original strand, 54928699 - 54928764
Alignment:
Q  65 ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtct 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  54928699 ctccgttccactatagtgatgagtaactttacaaaagagatattaaaatgttacaagaatcagtct 54928764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 3578668 - 3578786
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| || || | || |||||| |||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3578668 aatttgtttacccagttcggtctaatactggcctagtctgggggagaga-cagctctccattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatca 3578765  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtct 130  Q
    |  |||||||||||| |||||    
T  3578766 aaatgttacaagaattagtct 3578786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26557922 - 26557823
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| | |||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26557922 aatttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatca 26557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 24446680 - 24446754
Alignment:
Q  53 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagt 128  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  24446680 gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 24446754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55822420 - 55822265
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  55822420 tgacctagtatggg-gagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 55822326  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  55822325 ctaattctaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22295502 - 22295412
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| | || |||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22295502 aatttgtttacccagttcagtccaatactgccctagtgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31300580 - 31300427
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccg 134  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || ||||||||||| |||| ||       
T  31300580 tgacctagtctggg-gagagagcagccctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 31300486  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31300485 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 52942475 - 52942525
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatggg 51  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52942475 aacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggg 52942525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 7050282 - 7050439
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 134  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |       
T  7050282 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 7050377  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7050378 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8529455 - 8529270
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  8529455 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 8529357  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||   || ||| ||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8529356 tat---tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4558458 - 4558314
Alignment:
Q  48 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttcta 144  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || ||||||||||| |||| ||   |||| |||||    
T  4558458 tgggggagagagcagttctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattcta 4558363  T
Q  145 cccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4558362 ccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4570241 - 4570094
Alignment:
Q  48 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttcta 144  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |   |||| |||||    
T  4570241 tgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattcta 4570146  T
Q  145 cccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4570145 ccca-agtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcgatcctaatagtgttt 4570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11853705 - 11853549
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  11853705 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 11853610  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11853609 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446795
Alignment:
Q  187 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 24446795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54906852 - 54906722
Alignment:
Q  84 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactc 181  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||| | |||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  54906852 tgagtaactttacaaa-gagatatcaaagagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacctaaagtcttgaatctcttccagtgaccaagagactc 54906754  T
Q  182 aatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 212  Q
    |||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54906753 aattctaatagtgtttctccatggtgaatcaa 54906722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 3937261 - 3937306
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagt 46  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3937261 aacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagt 3937306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4885062 - 4884985
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4885062 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 4884985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16638883 - 16638827
Alignment:
Q  140 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16638883 ttctaccca-agtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16638827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 16688934 - 16689119
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| || | ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  16688934 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtttgtgggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 16689032  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  16689033 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36769636 - 36769479
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccg 134  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || ||||||||||| |||| ||       
T  36769636 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 36769541  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| || |||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  36769540 cctaattttaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagaaactcgatcctaatagtgttt 36769479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 24446641 - 24446677
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24446641 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat 24446677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10114522 - 10114463
Alignment:
Q  153 ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||    
T  10114522 ctcaatctcttatcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaa 10114463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16489410 - 16489352
Alignment:
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16489410 cctaattctaccca-agtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270197
Alignment:
Q  187 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 38270197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15831298 - 15831252
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15831298 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 15831252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36771434 - 36771396
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36771434 ctcttcccatgaccaagagactcaatcataatagtgttt 36771396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 163
Target Start/End: Original strand, 38270120 - 38270158
Alignment:
Q  125 aagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctctt 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38270120 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 3824597 - 3824630
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatcca 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3824597 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 3824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 197
Target Start/End: Original strand, 4874620 - 4874661
Alignment:
Q  156 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4874620 aatctcttcccgtgaccaagagactctatcttaatagtgttt 4874661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047452
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 10047452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18587154 - 18587077
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18587154 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgat 18587077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246067
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 39246067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4884921 - 4884877
Alignment:
Q  150 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4884921 agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 12743925 - 12743969
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  12743925 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12743969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 12745314 - 12745358
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  12745314 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12745358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25699788 - 25699752
Alignment:
Q  158 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25699788 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Original strand, 29609606 - 29609654
Alignment:
Q  150 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  29609606 agtctcaatctcttgccgtgatcaagagactcaattctaatagtgtttc 29609654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14419177 - 14419399
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419177 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 14419276  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14419277 gacatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttccc 14419376  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  14419377 aaggtgaatcaaccctcaaaccc 14419399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 30480490 - 30480714
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  30480490 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgactaacgttacaaaa 30480588  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30480589 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 30480688  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  30480689 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 30480714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3874358 - 3874134
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3874358 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 3874260  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3874259 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttccc 3874160  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  3874159 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 3874134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32339657 - 32339433
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  32339657 aacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 32339559  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32339558 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttacc 32339459  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  32339458 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 32339433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15068329 - 15068105
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  15068329 aacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattata-tgatgagtaacgttacaaaa 15068231  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  15068230 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttccc 15068131  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  15068130 aaggtgaattaaccctcaaaccctag 15068105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25952869 - 25952644
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25952869 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaa 25952770  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  25952769 gagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgttttcc 25952670  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  25952669 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 25952644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 27106884 - 27107108
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27106884 aacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccctacaaaa 27106982  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27106983 gagatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 27107082  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  27107083 aaggtgaatcaaccctcaaactctag 27107108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 28251554 - 28251778
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28251554 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacattacaaaa 28251652  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28251653 gagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 28251752  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||    
T  28251753 aaggtgaatcaacccacaaaacctag 28251778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27911359 - 27911138
Alignment:
Q  3 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  27911359 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggg-gagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaataga 27911262  T
Q  103 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27911261 gatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27911162  T
Q  203 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27911161 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 27911138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27957778 - 27957557
Alignment:
Q  3 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  27957778 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggg-gagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaataga 27957681  T
Q  103 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27957680 gatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27957581  T
Q  203 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27957580 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 27957557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 609077 - 608858
Alignment:
Q  6 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  609077 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaa 608979  T
Q  106 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  608978 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggt 608879  T
Q  206 gaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  608878 gaatcaaccctcaaaccctag 608858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 22684640 - 22684867
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  22684640 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaata 22684738  T
Q  101 gagatatcaatgt---gttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22684739 gagaaatcaatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22684838  T
Q  198 cccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22684839 cccaaggtgaatcaaccttcaaaccctag 22684867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4424366 - 4424142
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  4424366 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaatgttacaaaa 4424268  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4424267 gataaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 4424168  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  4424167 acggtgaatcaacccacaaaccctag 4424142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15809566 - 15809342
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15809566 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 15809468  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15809467 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 15809368  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15809367 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 15809342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14808109 - 14807875
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagag----------cagtcctccgttccactataatgatgagtaa 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||          ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14808109 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaa 14808011  T
Q  91 ccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataat 190  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14808010 cgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 14807911  T
Q  191 agtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14807910 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 14807875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1225515 - 1225294
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1225515 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 1225417  T
Q  101 -gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1225416 agagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 1225317  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  1225316 caaggtgaatcaaccctcaaacc 1225294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15073059 - 15072834
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15073059 aacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgta-tgatgagtaacgttacaaaa 15072961  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15072960 gagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 15072861  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || |||||||||||||| |||||||||    
T  15072860 caaggtgaatcaaccctaaaaccctag 15072834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27829644 - 27829421
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  27829644 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa- 27829547  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27829546 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 27829447  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27829446 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 27829421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43530463 - 43530239
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  43530463 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactata-tgatgagtagcgttacaaaa 43530365  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43530364 gagaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttccc 43530265  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||    
T  43530264 aaggtgaatcaaccttcaaaacctag 43530239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 13858477 - 13858695
Alignment:
Q  7 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13858477 aaagaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagata 13858576  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 206  Q
    | |||| | | |||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13858577 t-aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 13858675  T
Q  207 aatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13858676 aatcaaccctcaaaccctag 13858695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 28283208 - 28283430
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  28283208 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 28283304  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28283305 gagaaatcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttccc 28283404  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  28283405 aatgtgaatcaaccctcaaaccctag 28283430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41385092 - 41384868
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41385092 aacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 41384994  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41384993 gagatgtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttccc 41384894  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  41384893 aaggtgaatcaaccttcaaaccctag 41384868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15956303 - 15956092
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || | ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15956303 acaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagag 15956204  T
Q  104 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |    
T  15956203 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttcccaag 15956104  T
Q  204 gtgaatcaaccc 215  Q
    ||||||||||||    
T  15956103 gtgaatcaaccc 15956092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36865885 - 36865663
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  36865885 aacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttacaaa 36865786  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36865785 agagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgt---gaagagactcaatcctaatagtgtttcc 36865689  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  36865688 caaggtgaatcaaccctcaaacccta 36865663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 5372163 - 5372389
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5372163 aacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaa 5372262  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5372263 aaagatatcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 5372362  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  5372363 caaggtgaattaaccctcaaaccctag 5372389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18813229 - 18813006
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  18813229 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtattgttacaaa- 18813132  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18813131 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 18813032  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18813031 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 18813006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27827333 - 27827110
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  27827333 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa- 27827236  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27827235 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 27827136  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27827135 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 27827110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21482649 - 21482445
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21482649 aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 21482550  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  21482549 tgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactc 21482450  T
Q  211 aaccc 215  Q
    |||||    
T  21482449 aaccc 21482445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41383010 - 41382820
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41383010 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 41382912  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 192  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382911 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 41382820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 15185701 - 15185921
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15185701 aacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaa 15185800  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaacca--agagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||       ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||     
T  15185801 gagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctaccca-------aatctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgtttt 15185893  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
     || ||||||||||||||||||||||||    
T  15185894 acaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 15185921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21480832 - 21480637
Alignment:
Q  20 acccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttaca 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21480832 acccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaca 21480733  T
Q  120 agaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | |  | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21480732 agaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 21480637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43079950 - 43079726
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  43079950 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 43079853  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43079852 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 43079753  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  43079752 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 43079726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18811055 - 18810832
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  18811055 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtattgttacaaa- 18810958  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18810957 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 18810858  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18810857 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 18810832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44721191 - 44720967
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  44721191 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa- 44721094  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg-tttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44721093 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 44720994  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  44720993 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 44720967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31162551 - 31162343
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtg--agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31162551 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatat 31162452  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31162451 caatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31162352  T
Q  208 atcaaccct 216  Q
    |||||||||    
T  31162351 atcaaccct 31162343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43082321 - 43082097
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  43082321 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 43082224  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  43082223 gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttcc 43082124  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  43082123 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 43082097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 3005624 - 3005829
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3005624 aagaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagata 3005723  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 206  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||    
T  3005724 tcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgttttccaaagtg 3005823  T
Q  207 aatcaa 212  Q
    ||||||    
T  3005824 aatcaa 3005829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 24873178 - 24873392
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  24873178 aatttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 24873275  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24873276 tcggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaat 24873375  T
Q  210 caaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||| ||||||||||    
T  24873376 caacccacaaaccctag 24873392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 31578273 - 31578476
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||| | | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31578273 aatttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 31578372  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    |   ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31578373 aaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaa 31578472  T
Q  209 tcaa 212  Q
    ||||    
T  31578473 tcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14477522 - 14477400
Alignment:
Q  104 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  14477522 atatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaag 14477423  T
Q  204 gtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14477422 gtgaatcaaccctcaaaccctag 14477400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31035459 - 31035252
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgaccta--gtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||  || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31035459 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctatagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatat 31035361  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 206  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |   |||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  31035360 caaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtg 31035261  T
Q  207 aatcaaccc 215  Q
    |||||||||    
T  31035260 aatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 33541397 - 33541599
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33541397 aacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaa 33541495  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||                      ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33541496 gagatatcaat----------------------gcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttccc 33541573  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  33541574 aatgtgaatcaaccctcaaaccctag 33541599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 181795 - 181623
Alignment:
Q  53 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagt 152  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  181795 gagagagcagtcatctgtttcactat---gatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagt 181700  T
Q  153 ctcaatctcttcc--cgtaaccaagagactcaatcat-aatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | || ||||||||  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  181699 cccattctcttcccgcgtaactaagagacttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctag 181623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Original strand, 2468126 - 2468259
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2468126 aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 2468225  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttcta 144  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2468226 tgggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31573924
Alignment:
Q  83 atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactc 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 31573893  T
Q  182 aatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31573894 aatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 31573924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17847830 - 17847677
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 136  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |   ||    
T  17847830 tgacctagtctgggggagagagcagccctccattccactataatgatt-------ttacaaaagagatatcaaag-gttacaagaattagtcttcaaacc 17847739  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17847738 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttc 17847677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3896162 - 3895972
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| || || |||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3896162 aatttgtttactcaattcgatccaatactgatctactatgggggagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 3896063  T
Q  110 -atgtgttacaagaa-taagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
     | | |||||||||| ||| | ||   |||| || ||| || |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  3896062 taagagttacaagaattaattttcaaacctaattatactcaaagtcccaatttcttcccgtgacgaagagactcaatcgcaatagtgtttc 3895972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6376300 - 6376141
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 136  Q
    ||||||||| || | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   || |||||||| |||| ||   ||    
T  6376300 tgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaaggtaacaagaattagtcttcaaacc 6376202  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    || ||||||  | |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6376201 taattctacataaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttt 6376141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 37214251 - 37214312
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcag 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  37214251 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcag 37214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Original strand, 5622878 - 5622949
Alignment:
Q  155 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  5622878 caatctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctag 5622949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 16833886 - 16833789
Alignment:
Q  13 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||| ||||||||||  | ||| |||| |||| || | |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16833886 tttgtttacccagttcgtccaaaagtgacttagtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaa 16833789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 14477599 - 14477548
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacc-cagttcgatccaaattgacctagtatggg 51  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14477599 aacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggg 14477548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28328064 - 28327908
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  28328064 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 28327969  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28327968 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 35872479 - 35872553
Alignment:
Q  53 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagt 128  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  35872479 gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 35872553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14419786 - 14419732
Alignment:
Q  53 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419786 gagagagcagccatccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 14419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214402
Alignment:
Q  132 ccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaa---------tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 37214402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 17799418 - 17799606
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  17799418 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggagagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 17799516  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||   || |||| |||||| |||| ||   |||| || ||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17799517 tat---tgagttataagaatcagtcttcaaacctaattatactca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 16757293 - 16757449
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  16757293 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 16757388  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16757389 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872594
Alignment:
Q  187 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 35872594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Original strand, 13985135 - 13985262
Alignment:
Q  69 gttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc-aatctcttcccg 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||  |||||  ||| | ||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||| |||| | |||||||||| |    
T  13985135 gttccactataatgaggggtaactttataa--gagattccaaagggttacaagaatcagtttcaaacctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctg 13985232  T
Q  168 taaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13985233 tgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468306
Alignment:
Q  170 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 2468306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 4696689 - 4696620
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  4696689 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 4696620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775325
Alignment:
Q  173 aagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctag 26775325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 9021101 - 9021289
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  9021101 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggtggagagagcagctctccgatctactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 9021199  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9021200 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21034057 - 21033870
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  21034057 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatggggaaaagagcagatctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 21033959  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||||||||||||| |||| | | | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21033958 tat---tgagttacaagaattagtcttcaaacctatttctaccca-agtc-ccagcccttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21033870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 35872440 - 35872476
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35872440 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat 35872476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 16752666 - 16752704
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16752666 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28895540 - 28895502
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28895540 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 7412345 - 7412414
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  7412345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 7412414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 23179555 - 23179632
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23179555 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctatccgttccactataatgat 23179632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 181827 - 181799
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  181827 aacacaaaagaatttgttgacccagttcg 181799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 6599140 - 6599096
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6599140 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6599096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 6674593 - 6674549
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6674593 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6674549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 133)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1313681 - 1313457
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1313681 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 1313583  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1313582 gagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttccc 1313483  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  1313482 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 1313457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 4308266 - 4308490
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4308266 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 4308364  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4308365 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 4308464  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  4308465 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 4308490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38890312 - 38890088
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38890312 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 38890214  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38890213 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 38890114  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  38890113 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 38890088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45883212 - 45882991
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45883212 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa 45883114  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45883113 agagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 45883014  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  45883013 caaggtgaatcaaccctcaaacc 45882991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3314957 - 3314732
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||    
T  3314957 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaa 3314858  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3314857 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 3314758  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  3314757 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 3314732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 53917649 - 53917873
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  53917649 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 53917747  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53917748 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 53917847  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  53917848 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 53917873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4666786 - 4666562
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4666786 aacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 4666690  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataag--tctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4666689 gagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgtttc 4666590  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4666589 ccaagatgaatcaaccctcaaaccctag 4666562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 10956012 - 10956236
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10956012 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 10956110  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10956111 gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttccc 10956210  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  10956211 aaggtgaatcaaccttcaaaccctag 10956236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 51726992 - 51727213
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51726992 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 51727090  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51727091 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 51727190  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  51727191 aaggtgaatcaaccctcaaaccc 51727213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1321751 - 1321527
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1321751 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 1321653  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1321652 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 1321553  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  1321552 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 1321527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 1626668 - 1626892
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1626668 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaa 1626766  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1626767 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 1626866  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  1626867 aaggtgaatcaaccttcaaaccctag 1626892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 9604592 - 9604816
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9604592 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 9604690  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9604691 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 9604790  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  9604791 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 9604816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 18099155 - 18099379
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18099155 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaatgttacaaaa 18099253  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18099254 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 18099353  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  18099354 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 18099379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Original strand, 28761415 - 28761636
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaa-ttgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28761415 acaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 28761514  T
Q  103 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  28761515 gatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 28761614  T
Q  203 ggtgaatcaaccctcaaaccct 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  28761615 ggtgaatcaactctcaaaccct 28761636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6484632 - 6484411
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6484632 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 6484534  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6484533 aagatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttccc 6484434  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  6484433 aaggtgaatcaaccctcaaaccc 6484411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24979980 - 24979755
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||    
T  24979980 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaa 24979882  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24979881 aaagatattaatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcc 24979782  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  24979781 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 24979755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 10958308 - 10958532
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  10958308 aacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgaagagtaacgttacaaaa 10958406  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10958407 gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 10958506  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  10958507 aaggtgaatcaaccttcaaaccctag 10958532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25533714 - 25533490
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25533714 aacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 25533616  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25533615 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccc 25533516  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  25533515 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 25533490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43228563 - 43228339
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43228563 aacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 43228465  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43228464 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 43228365  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  43228364 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 43228339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 43423448 - 43423672
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43423448 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 43423546  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43423547 gagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 43423646  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  43423647 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 43423672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 53915481 - 53915705
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  53915481 aacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcacta-aatgatgagtaacattacaaaa 53915579  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  53915580 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcac 53915679  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||    
T  53915680 aaggtaaatcaaccatcaaaccctag 53915705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42990576 - 42990353
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  42990576 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccata-tgatgagtaacgttacaaaa 42990478  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42990477 gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 42990378  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | |||||||||||||||||| ||||    
T  42990377 aaggtgaatcaaccctcaaaaccta 42990353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 53468438 - 53468665
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat--gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53468438 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 53468537  T
Q  99 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  53468538 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 53468637  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  53468638 ccaaggtgaatcaatgctcaaaccctag 53468665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 5926755 - 5926973
Alignment:
Q  7 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5926755 aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattata-tgatgagtaaccttacaaaagatata 5926853  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 206  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  5926854 taaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcg 5926953  T
Q  207 aatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5926954 aatcaaccctcaaaccctag 5926973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43226350 - 43226133
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43226350 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaat 43226252  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43226251 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 43226152  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  43226151 atcaacccacaaaccctag 43226133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3859799 - 3859576
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  3859799 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactata-tgatgagtattgttacaaa- 3859702  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3859701 gagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 3859602  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  3859601 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 3859576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 7606573 - 7606796
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  7606573 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgttacaaat 7606671  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7606672 -agaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 7606770  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  7606771 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 7606796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 27101166 - 27101390
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  27101166 aacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttgcaaaa 27101264  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27101265 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 27101364  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  27101365 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 27101390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 28101987 - 28102211
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  | || |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  28101987 aacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactata-tgataagtaactttacaaaa 28102085  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28102086 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttccc 28102185  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  28102186 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 28102211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30006113 - 30005889
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30006113 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 30006015  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30006014 gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttccc 30005915  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  30005914 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 30005889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 43421400 - 43421624
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43421400 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 43421498  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43421499 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttccc 43421598  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  43421599 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 43421624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11170673 - 11170452
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11170673 acaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagag 11170575  T
Q  104 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 203  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  11170574 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaag 11170475  T
Q  204 gtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  11170474 gtgaatcaatccgcaaaccctag 11170452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 4103881 - 4104104
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  4103881 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 4103978  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4103979 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 4104078  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  4104079 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 4104104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6232072 - 6231849
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  6232072 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccgttc-actgtaatgatgagtagctttacaaaa 6231974  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6231973 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgtttccc 6231875  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  6231874 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 18096885 - 18097109
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18096885 aacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 18096983  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    | || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18096984 gggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 18097083  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  18097084 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 18097109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 51674751 - 51674975
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  51674751 aacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtata-tgatgagtaacattacaaaa 51674849  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51674850 gagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 51674949  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  51674950 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 51674975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51943642 - 51943419
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51943642 aacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 51943544  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51943543 gagacgtcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 51943445  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  51943444 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 51943419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 25688145 - 25688367
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaa 99  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  25688145 aacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaa 25688243  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25688244 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 25688343  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  25688344 caaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 747029 - 746805
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  747029 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 746932  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  746931 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 746832  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  746831 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 746805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18162935 - 18162711
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaa 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||    
T  18162935 aacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaa 18162838  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18162837 ataaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18162738  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || |||||||||| |||||||||||||    
T  18162737 caaggtgaatcaatcctcaaaccctag 18162711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 32264023 - 32264248
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32264023 aacacaaaagaatt-gttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaa 32264121  T
Q  101 -gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32264122 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 32264221  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  32264222 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 32264248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 880436 - 880660
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  880436 aacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactata-tgatgagtaactttacaaaa 880534  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  880535 gagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttccc 880634  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  880635 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 880660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 10084374 - 10084598
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10084374 aacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 10084472  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10084473 gagaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttccc 10084572  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  10084573 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 10084598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5522612 - 5522832
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  5522612 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 5522709  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5522710 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 5522809  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    | ||| ||||||||| |||||||    
T  5522810 aaggtaaatcaacccacaaaccc 5522832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15781148 - 15780919
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtc---ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |   || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  15781148 acaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataactttacaaaa 15781049  T
Q  101 gaga----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 196  Q
    ||||    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15781048 gagaaatatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtt 15780949  T
Q  197 tcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15780948 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 15780919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36012099 - 36011879
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36012099 aacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 36012001  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  36012000 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttccc 36011901  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  36011900 aacgtgaatcaaccctcaaacc 36011879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 48361656 - 48361880
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||  |||||| | ||||||||| || |||||    
T  48361656 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatatt-atgagtaacgttgcaaaa 48361754  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48361755 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttccc 48361854  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  48361855 aatgtgaatcaaccctcaaaccctag 48361880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 47148880 - 47149097
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||||    
T  47148880 aacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactata-tgatgagtaacgatacaaaa 47148978  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47148979 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt-cc 47149077  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaa 220  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  47149078 aaggtgaatcaaccatcaaa 47149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25389177 - 25388954
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  25389177 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 25389080  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  25389079 gagaaatcaatgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgttt-c 25388981  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  25388980 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 25388954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5191923 - 5191701
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  5191923 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagaacagccctctgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 5191827  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5191826 gagaaatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 5191727  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  5191726 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 5191701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32219357 - 32219132
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||    
T  32219357 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaa 32219259  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32219258 aaagatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcc 32219159  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || |||||||||||| |||||||||||    
T  32219158 caaggtgaatcaaccttcaaaccctag 32219132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5886470 - 5886261
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  5886470 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtttcaaa- 5886373  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  5886372 gacaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-cc 5886274  T
Q  201 agggtgaatcaac 213  Q
    | |||||||||||    
T  5886273 aaggtgaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5899943 - 5899734
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  5899943 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttgcaaa- 5899846  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  5899845 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-cc 5899747  T
Q  201 agggtgaatcaac 213  Q
    | |||||||||||    
T  5899746 aaggtgaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39715737 - 39715517
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||| |||||  ||  | || ||| ||||||   |||||||||| ||||||||    
T  39715737 aacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaaatgatctagtatgggggagag--caaccatctgtttcactat---gatgagtaactttacaaaa 39715643  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  39715642 gagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctc 39715543  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  39715542 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 39715517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561861
Alignment:
Q  57 gagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa-gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc 155  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 6561929  T
Q  156 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6561928 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 6561861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 12267960 - 12268173
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12267960 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 12268058  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12268059 gag-----------ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccg 12268147  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  12268148 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 12268173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 13420219 - 13420382
Alignment:
Q  50 ggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccag 149  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  13420219 ggtgagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 13420318  T
Q  150 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13420319 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 13420382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38210631 - 38210418
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  38210631 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 38210534  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38210533 gagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 38210434  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  38210433 aacccacaaaccctag 38210418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 10621515 - 10621739
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  10621515 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa- 10621612  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10621613 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 10621712  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  10621713 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 10621739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11168373 - 11168165
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||    
T  11168373 aacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatata-tgataagtaacgttacaaaa 11168275  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11168274 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttccc 11168175  T
Q  201 agggtgaatc 210  Q
    | ||||||||    
T  11168174 aaggtgaatc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 22114290 - 22114514
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || |||| |||||| ||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  22114290 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattata-tgatgagtaacgttacaaaa 22114388  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22114389 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 22114488  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||    
T  22114489 aaggtgaatcaacccacaaaacctag 22114514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26720819 - 26720596
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  26720819 aacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 26720721  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||    
T  26720720 gagaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-taaccc 26720622  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  26720621 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 26720596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 458545 - 458332
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  458545 atttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 458448  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  458447 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 458348  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  458347 aacccacaaaccctag 458332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23633725 - 23633528
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||     
T  23633725 aacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaa- 23633628  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23633627 gagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 23633528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 6063431 - 6063655
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  6063431 aacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 6063528  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6063529 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 6063628  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  6063629 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 6063655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17795531 - 17795317
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | || |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  17795531 aacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaa 17795432  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17795431 gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttccc 17795332  T
Q  201 agggtgaatcaaccc 215  Q
    |  ||||||||||||    
T  17795331 aaagtgaatcaaccc 17795317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19103971 - 19103757
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | || |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  19103971 aacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaa 19103872  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19103871 gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttccc 19103772  T
Q  201 agggtgaatcaaccc 215  Q
    |  ||||||||||||    
T  19103771 aaagtgaatcaaccc 19103757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 456168 - 455955
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  456168 atttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 456071  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  456070 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 455971  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  455970 aacccacaaaccctag 455955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 10191305 - 10191518
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  10191305 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaa 10191403  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
     | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10191404 cgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtc-cagcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 10191502  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  10191503 aacccacaaaccctag 10191518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 28413016 - 28413241
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaa-tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||    
T  28413016 aacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa 28413114  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttc 198  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28413115 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttc 28413213  T
Q  199 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28413214 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 28413241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29956906 - 29956735
Alignment:
Q  53 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagt 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29956906 gagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 29956808  T
Q  153 ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | ||  |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29956807 cccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 29956735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31151609 - 31151404
Alignment:
Q  9 agaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  31151609 agaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatat 31151510  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31151509 ca--gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31151412  T
Q  208 atcaaccc 215  Q
    ||||||||    
T  31151411 atcaaccc 31151404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53591442 - 53591232
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgt 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  53591442 ttgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctggg-gagagagcatcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatgg 53591345  T
Q  114 gttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 213  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  53591344 attagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 53591245  T
Q  214 cctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||    
T  53591244 cctcaaaccctag 53591232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50494260 - 50494047
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  50494260 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 50494163  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  50494162 gggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 50494063  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  50494062 aacccacaaaccctag 50494047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 6065781 - 6066005
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | || |||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  6065781 aacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 6065878  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6065879 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 6065978  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  6065979 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 6066005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 561769 - 561974
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgg-gtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc 108  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  561769 aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatc 561868  T
Q  109 aatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  561869 aatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 561968  T
Q  209 tcaacc 214  Q
    ||||||    
T  561969 tcaacc 561974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Original strand, 889779 - 889978
Alignment:
Q  22 ccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaag 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || | |||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaag 889877  T
Q  122 aataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaac 221  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  889878 aataactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaac 889976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Original strand, 35917944 - 35918152
Alignment:
Q  16 gttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| ||| || | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  35917944 gttgatccagttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactata-taatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 35918041  T
Q  116 tacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  35918042 tacaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccc 35918141  T
Q  216 tcaaaccctag 226  Q
    |||||| ||||    
T  35918142 tcaaactctag 35918152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 47701660 - 47701801
Alignment:
Q  5 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47701660 caaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagaga 47701758  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctaccc 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47701759 tatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25635644 - 25635447
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||    || |||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25635644 aatttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaa 25635545  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25635544 tgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 25635447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27635643 - 27635830
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27635643 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 27635741  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||            |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27635742 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaag------------cccgtaaccaagagactcaatcttaatattgtttccc 27635829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 54691559 - 54691783
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||  | ||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  54691559 aacataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactata-tgatgggtaacgttacaaaa 54691657  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| || || || |  ||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||    
T  54691658 gagatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttccc 54691757  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  54691758 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 54691783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3307032 - 3306839
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3307032 aacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctagg--agagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttacaaaa 3306935  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3306934 gagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53597472 - 53597297
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 137  Q
    ||||||||| || | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||    
T  53597472 tgacctagtttgtgggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataagtctcttgcct 53597373  T
Q  138 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 213  Q
    | |||||| || | ||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53597372 aattctactcaaaatctcaatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 53597297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24181644 - 24181486
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24181644 aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatca 24181545  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgt 168  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  24181544 atgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgt 24181486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54884362 - 54884203
Alignment:
Q  66 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||||||| |    
T  54884362 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatctctttc 54884264  T
Q  166 cgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  54884263 tgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctag 54884203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42992542 - 42992334
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  42992542 aacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactat-atgatgactaacgttacaaaa 42992444  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||               ||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  42992443 gagaaatcaatgagttacaagaataa---------------ctacccaaagtc-cactctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttctc 42992360  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  42992359 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 42992334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777469
Alignment:
Q  109 aatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  35777487 atcaacccacaaaccctag 35777469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 36871295 - 36871497
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||    
T  36871295 aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaactttac-aaagagataaca 36871393  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 208  Q
    | | ||| |||||||||||| ||   |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  36871394 aagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaa 36871493  T
Q  209 tcaa 212  Q
    ||||    
T  36871494 tcaa 36871497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1674160 - 1674034
Alignment:
Q  86 agtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 185  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1674160 agtaactttacaaaagacatatcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatc 1674061  T
Q  186 ataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1674060 ctaatagtgtttcccatggtgaatcaa 1674034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 226
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100250
Alignment:
Q  119 aagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctca 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  219 aaccctag 226  Q
    ||||||||    
T  28100243 aaccctag 28100250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 212
Target Start/End: Original strand, 14634491 - 14634638
Alignment:
Q  66 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttc 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |   |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  14634491 tccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatctcttc 14634590  T
Q  165 ccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
     ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14634591 tcgtgactaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14634638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23637082
Alignment:
Q  97 aaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtt 23637101  T
Q  197 tcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    || || ||| |||||||||    
T  23637100 tctcaaggtaaatcaaccc 23637082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 1620483 - 1620657
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 136  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||  || | ||   ||    
T  1620483 tgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaaagggttacaagaactagccttcaaacc 1620581  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1620582 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28181076
Alignment:
Q  114 gttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 213  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaac 28181083  T
Q  214 cctcaaa 220  Q
    |||||||    
T  28181082 cctcaaa 28181076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 35919100 - 35919178
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactata 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35919100 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 35919178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25634150 - 25634030
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||||||| |||||| |||  |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25634150 aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 25634051  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctc 131  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  25634050 tggattacaagaataagtctc 25634030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137515
Alignment:
Q  126 agtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  226 g 226  Q
    |    
T  28137515 g 28137515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 41849331 - 41849243
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaa 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  41849331 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactat-atgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007684
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 137  Q
    ||||||||| | || ||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |         |||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaaagagttacaagaaaa---------cct 11007635  T
Q  138 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatca 186  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11007636 aattctacccaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatca 11007684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Original strand, 4560352 - 4560493
Alignment:
Q  77 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaaga 176  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||    |||    | ||||| ||||||||| ||   ||||||||||| |||||||| |    
T  4560352 ataatgatgagtaactttgcaaaagagatattaatgggttacaa----aag----ctgcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaaca 4560443  T
Q  177 gactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4560444 ggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 4560493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 53894042 - 53894109
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctcc 68  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  53894042 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 53894109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13420106 - 13419941
Alignment:
Q  48 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg-tgttacaagaataagtctcccg-cctatttctac 145  Q
    |||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| ||| | ||| ||  || | ||||||    
T  13420106 tgggggagagaggagtccactattccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaaatgttacaaaaattattcttccaaccaaattctac 13420008  T
Q  146 ccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    ||| | | | |||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13420007 ccaaaatttgaatctctttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 13419941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 29913949 - 29914132
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  29913949 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 29914047  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29914048 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 10595028 - 10595213
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  10595028 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactataatgacatgagtttctttac-aaagaga 10595126  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||   || |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  10595127 tat---tgagttataagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtg 10595213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 27761980 - 27762165
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  27761980 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtttgggggatagagcggttctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 27762078  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27762079 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27762165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 47878165 - 47878350
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || | ||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  47878165 aagaatttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtctggaggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 47878263  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47878264 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 10094100 - 10094256
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  10094100 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 10094195  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10094196 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7768825 - 7768632
Alignment:
Q  20 acccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttac 118  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||   |||||    
T  7768825 acccaattcgatccaatactgacctagtatgggggagggagtaacccttcgttccactataataatgagtaactttac-aaaggtatattaaaaggttac 7768727  T
Q  119 aagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    |||||| |||| ||   |||| |||||| || |||  |||| |   ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7768726 aagaattagtcttcaaacctaattctactcaaagttccaattttagcccgtgagcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 7768632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 10612772 - 10612849
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10612772 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 10612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10897193 - 10897008
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  10897193 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 10897095  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  10897094 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagaatcaatcctaatagtg 10897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16997072 - 16996987
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatg 85  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||| | | | ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16997072 aacacaagagaatttgtttacccagttcagtcccatacttacctagtctgggggagtgagcagttctccgttccactataatgatg 16996987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 22626009 - 22626166
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataag-tctcccg 134  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||   |||| ||| ||||||| || | ||       
T  22626009 tgacctagtctgggggagagagcagttctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagagat---aatgagtttcaagaatcagttttcaaa 22626104  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22626105 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177335
Alignment:
Q  170 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 24177335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 27420915 - 27420822
Alignment:
Q  10 gaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 102  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||   ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27420915 gaatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctactatgggggagagagcaactctatgttccattataatgatgagtaactttacaaaaga 27420822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849200
Alignment:
Q  182 aatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 41849200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7418111 - 7418064
Alignment:
Q  150 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7418111 agtcccaatctcttcccgtgaccaatagactcaatcataatggtgttt 7418064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 10100117 - 10100273
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  10100117 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 10100212  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| || |||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10100213 ctaattttaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 10200980 - 10201136
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  10200980 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttccaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 10201075  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10201076 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 10208026 - 10208182
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| || | ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  10208026 tgacctagtctgcgggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 10208121  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10208122 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 15823641 - 15823763
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 106  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| || | | || ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||     
T  15823641 aagaatttgtttacccaattcggtccaatattgacttactcttggagagagagcagctctacgttccactataatgaagagtttctttac-aaagagatg 15823739  T
Q  107 tcaatgtgttacaagaataagtct 130  Q
    |||| | ||||||||||| |||||    
T  15823740 tcaaagggttacaagaattagtct 15823763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 42992655 - 42992608
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatggg 51  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42992655 acaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggg 42992608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6303348 - 6303310
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6303348 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 225
Target Start/End: Original strand, 7606830 - 7606868
Alignment:
Q  187 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7606830 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 7606868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 11079674 - 11079628
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11079674 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 11079628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13893509 - 13893475
Alignment:
Q  150 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaat 184  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13893509 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaat 13893475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16462241 - 16462203
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16462241 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27544311 - 27544273
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27544311 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 47883026 - 47883064
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47883026 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 48390327 - 48390373
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48390327 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 48390373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736319
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 1736319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552897
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 18552897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709804
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 30709804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 11739546 - 11739771
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11739546 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaa 11739645  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11739646 gagatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttccc 11739745  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  11739746 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 11739771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 6258804 - 6259026
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6258804 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gagagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaaa 6258902  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6258903 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaa--tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 6259000  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  6259001 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6259026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17849385 - 17849161
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849385 aacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 17849287  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17849286 gagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctc 17849187  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  17849186 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 17849161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 43623567 - 43623791
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43623567 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 43623665  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43623666 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttccc 43623765  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  43623766 aaggtgaatcaaccctcaaaacctag 43623791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 34979564 - 34979790
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgag-agagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34979564 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttacaaa 34979663  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34979664 agagatataaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcc 34979763  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  34979764 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 34979790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 6264135 - 6264360
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6264135 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaa 6264234  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || | |||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6264235 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccc 6264334  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  6264335 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6264360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 19501998 - 19502222
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  19501998 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 19502096  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19502097 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 19502196  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  19502197 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 19502222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42453048 - 42452825
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42453048 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 42452951  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42452950 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 42452851  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  42452850 aaggtgaatcaacccacaaactctag 42452825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 42923496 - 42923720
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  42923496 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactata-tgacgagtaactttacaaaa 42923594  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  42923595 gagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 42923694  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  42923695 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 42923720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17848708 - 17848491
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17848708 aacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 17848610  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17848609 gagatatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 17848514  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccc 223  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  17848513 aaagtgaatcaaccctcaaaccc 17848491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 5375333 - 5375550
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5375333 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat-atgatgagtaatgttacaaaa 5375431  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5375432 gagatatcaatgggttacaagaataagtct-ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcct 5375530  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaa 220  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  5375531 aaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19007908 - 19007684
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19007908 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 19007810  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  19007809 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttccc 19007710  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||| |||||||||    
T  19007709 aaggtgaatcaacccttaaaccctag 19007684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27105065 - 27104842
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||     
T  27105065 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaatgttacaaa- 27104968  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27104967 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 27104868  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27104867 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 27104842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 45279971 - 45280195
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45279971 aacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 45280069  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45280070 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatccc 45280169  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||| || |||||    
T  45280170 aaggtgaatcaaccctctaaacctag 45280195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14837536 - 14837317
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837536 aacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 14837437  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14837436 gagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttc------ccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 14837343  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  14837342 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 14837317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22287323 - 22287546
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22287323 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 22287421  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  22287422 gagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttccc 22287521  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  22287522 aaggtgaatcaaccctcaaacccta 22287546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21520680 - 21520904
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21520680 aacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 21520778  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21520779 gagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcct 21520878  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  21520879 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 21520904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 23452224 - 23452448
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23452224 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 23452322  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23452323 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctc 23452422  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  23452423 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 23452448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 40032043 - 40032269
Alignment:
Q  4 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40032043 acaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagag 40032142  T
Q  104 a----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40032143 aaagatatcaatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 40032242  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  40032243 caaggtgaatcaaccctcaaaccctag 40032269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 44289054 - 44289279
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||  | || ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44289054 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaa 44289153  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | || | || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44289154 gagatatcaacgggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttccc 44289253  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  44289254 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 44289279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19504333 - 19504554
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  19504333 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactat-atgatgagtatcgttacaaaa 19504431  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19504432 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 19504530  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccct 224  Q
    | ||||||||||||  ||||||||    
T  19504531 aaggtgaatcaaccaacaaaccct 19504554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42064783 - 42064559
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   |||||||    
T  42064783 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa 42064685  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42064684 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 42064586  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  42064585 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 42064559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28196903 - 28196682
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  28196903 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaa 28196807  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28196806 gagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 28196707  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  28196706 aaggtgaatcaacccttaaacccta 28196682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Original strand, 11578136 - 11578309
Alignment:
Q  42 ctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctattt 141  Q
    ||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11578136 ctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaatt 11578235  T
Q  142 ctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11578236 ctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccc 11578309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 13910032 - 13910255
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || | ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  13910032 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactata-tgatgagtattgttacaaa- 13910129  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13910130 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttccc 13910229  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||  |||||||||    
T  13910230 aaggtgaatcaacccataaaccctag 13910255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22874399 - 22874185
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22874399 aacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactttacaaaa 22874300  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  22874299 gagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgttttcc 22874200  T
Q  201 agggtgaatcaaccc 215  Q
    | |||||||||||||    
T  22874199 aaggtgaatcaaccc 22874185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 28459177 - 28459401
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28459177 aacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctaggt-agagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaa 28459275  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||   || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28459276 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttgcc 28459375  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||    
T  28459376 aaggtgaatccaccctcaaatcctag 28459401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239188
Alignment:
Q  37 ttgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcc 136  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgct 45239098  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45239099 taattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 45239188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18800300 - 18800514
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||| || |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18800300 aacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctggg-gagagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaa 18800398  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18800399 agagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18800498  T
Q  200 cagggtgaatcaaccc 215  Q
    || |||||||||||||    
T  18800499 caaggtgaatcaaccc 18800514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 20146604 - 20146806
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20146604 aattcgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 20146703  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  20146704 aagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaat 20146803  T
Q  210 caa 212  Q
    |||    
T  20146804 caa 20146806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36558851 - 36559047
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||     
T  36558851 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa- 36558948  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36558949 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36561128 - 36561324
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||     
T  36561128 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa- 36561225  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36561226 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 35215584 - 35215797
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  35215584 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 35215681  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35215682 gagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 35215781  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  35215782 aacccacaaaccctag 35215797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 35217961 - 35218174
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||     
T  35217961 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaac 35218058  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 210  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35218059 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 35218158  T
Q  211 aaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  35218159 aacccacaaaccctag 35218174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3022440 - 3022211
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataa---------tgatgagtaac 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||| || |||||         |||||||||||    
T  3022440 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattataacgatgataatgatgagtaac 3022341  T
Q  92 cttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataata 191  Q
     ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3022340 tttataaa-gagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaata 3022242  T
Q  192 gtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3022241 gtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaacc 3022211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Original strand, 15539553 - 15539686
Alignment:
Q  93 ttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 192  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15539553 ttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatag 15539652  T
Q  193 tgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15539653 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 15539686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Original strand, 31732772 - 31732972
Alignment:
Q  10 gaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31732772 gaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 31732871  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||            ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||    
T  31732872 atgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca------------aaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtgaat 31732959  T
Q  210 caaccctcaaacc 222  Q
    |||||||||||||    
T  31732960 caaccctcaaacc 31732972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 17897242 - 17897443
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17897242 aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctggg-gagagagcagccatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaatagatatca 17897340  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17897341 aagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 17897440  T
Q  210 caa 212  Q
    |||    
T  17897441 caa 17897443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 22407441 - 22407585
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22407441 aacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat-atgatgagtaacgttacaaaa 22407539  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacc 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22407540 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattctacc 22407585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 24162210 - 24162423
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||| | |||| |||    
T  24162210 aacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactat-atgatgagtagcattac-aaa 24162307  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||          || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24162308 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc----------ccagcaaccaagagactcaatcttaatagtgtttccc 24162397  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  24162398 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 24162423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 45332179 - 45332364
Alignment:
Q  12 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  45332179 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactata-tgatgagtacctttacaaa-gagaaatcaat 45332276  T
Q  112 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45332277 gggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40699606 - 40699429
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 136  Q
    ||||||||| |||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |   ||    
T  40699606 tgacctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataagtcttcaaacc 40699507  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaacc 214  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40699506 taattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 22707738 - 22707872
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgg--gtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22707738 aacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaa 22707836  T
Q  99 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22707837 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20589896 - 20589763
Alignment:
Q  65 ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctctt 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20589896 ctccgttacactataatgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctctt 20589797  T
Q  164 cccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20589796 cccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 37962938 - 37963109
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||    
T  37962938 aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaa---aaatcaa 37963034  T
Q  111 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 185  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  37963035 tggattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatc 37963109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 22163009 - 22163111
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22163009 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactat-atgatgagtaacgttacaaaa 22163107  T
Q  101 gaga 104  Q
    ||||    
T  22163108 gaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35107564 - 35107351
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa 99  Q
    |||||||||  ||||||| ||| | |||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35107564 aacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttccactataatgatgagtaacattacaaa 35107465  T
Q  100 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcc--cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |     ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35107464 agagataacaaag-gttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttt 35107366  T
Q  198 cccagggtgaatcaa 212  Q
    | || ||||||||||    
T  35107365 ctcaaggtgaatcaa 35107351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463077
Alignment:
Q  17 ttgacccagttcgatccaaa-ttgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgt 115  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-taatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagt 7463048  T
Q  116 tacaagaataagtctcccgcctatttcta 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7463049 tacaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23871080 - 23870951
Alignment:
Q  5 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |  | |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23871080 caaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttactaaagaga 23870982  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgc 135  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23870981 tattaatgggttacaagaataagtctgccgc 23870951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 215
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136326
Alignment:
Q  85 gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaa 27136294  T
Q  184 tcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 215  Q
    || ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  27136295 tcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccc 27136326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15694109 - 15693958
Alignment:
Q  65 ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctc-aatctct 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  15694109 ctccgttccactaaaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctct 15694010  T
Q  163 tcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaac 213  Q
    ||| || |||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15694009 tcctgtgaccaagagactttatcctaatagtgtttctccacggtgaatcaac 15693958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43139606 - 43139432
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 136  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||| ||| |||||   | ||    
T  43139606 tgacctagtatagggaaaagaacagtcctctgtaccactataatgatgagtaactttacaaa-gagaaatcaaaaggttacaataattagtctttagacc 43139508  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 212  Q
    || ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  43139507 taattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaa 43139432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35028807 - 35028647
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcc- 136  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||   ||||||||||| ||| | |   |     
T  35028807 tgacctagtaagggggagagagcagctctccgttccactgcaatgatgagtaattttagaaaagagatattaaaaggttacaagaattagtattcaaaca 35028708  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35028707 taattctacccaaagtgtcaatctcttctcgtgatcaagagactcaatcataatagtgttt 35028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33604143 - 33603994
Alignment:
Q  48 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacc 146  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |||| |||||| |||| ||   |||| |||| ||    
T  33604143 tgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagatatatcaaaaggttagaagaattagtcttcaaacctaattcttcc 33604045  T
Q  147 cagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
     | |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33604044 taaagtctcaatcacttcccatgaccaaaagactcaattataatagtgttt 33603994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414290
Alignment:
Q  128 tctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| |||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttcc-gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctag 38414290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17921927 - 17921769
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 136  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||   ||||| | ||| ||||||| ||| |     ||    
T  17921927 tgacctagtctgggt-agagagcagccctccgttccactataatgatgactaactttatgaaaga---atcaaagggttgcaagaatcagttttaaaacc 17921832  T
Q  137 tatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17921831 taattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 17921769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38020302 - 38020246
Alignment:
Q  170 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38020302 accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaaccctcaaaccctag 38020246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Original strand, 27583472 - 27583535
Alignment:
Q  148 agagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatca 211  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27583472 agagactcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 27583535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 174
Target Start/End: Original strand, 13828397 - 13828503
Alignment:
Q  69 gttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccg 167  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||   | || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13828397 gttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatcaaagggctacaagaataagtcttcaaacataattctacccaaagtctgaatctcttcccg 13828496  T
Q  168 taaccaa 174  Q
    | |||||    
T  13828497 tgaccaa 13828503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17943692 - 17943540
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 136  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |   ||    
T  17943692 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaattagtcttcaaacc 17943597  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    || ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17943596 taattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39687139 - 39686983
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  39687139 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 39687044  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39687043 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26345735 - 26345661
Alignment:
Q  140 ttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 213  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||    
T  26345735 ttctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 194
Target Start/End: Original strand, 27517664 - 27517818
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccg 134  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || ||||||||||| |||| ||       
T  27517664 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 27517759  T
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27517760 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2741097 - 2740941
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| |||||     |    
T  2741097 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtctttaaac 2741002  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2741001 ctaattctaccca-agtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39680201 - 39680045
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| | ||| |   |    
T  39680201 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcaatcttcaaac 39680106  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39680105 ctaattctaccca-agtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  135 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 39287324 - 39287262
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39287324 tgacctagtatgagggagagagcagctcttcgttccactataatgatgagtaattttacaaaa 39287262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 15539516 - 15539553
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaatt 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15539516 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163158
Alignment:
Q  173 aagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22163106 aagagactcaacc-taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 22163158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 20054759 - 20054947
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagaga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  20054759 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggtggagagagcagctctccgatctactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 20054857  T
Q  105 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20054858 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2736361 - 2736205
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  2736361 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 2736266  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||| | |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2736265 ctaattctaccaa-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7503049 - 7502990
Alignment:
Q  140 ttctacccagagtctcaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 198  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7503049 ttctacccaaagtctcaaatctcttcccttgaccaagatactcaatcctaatagtgtttc 7502990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17462592 - 17462436
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   | | ||| ||||||| ||||| |   |    
T  17462592 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---aggagtttcaagaatcagtcttcaaac 17462497  T
Q  136 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17462496 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 12781246 - 12781292
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12781246 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 12781292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17932756 - 17932637
Alignment:
Q  71 tccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgta 169  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||     
T  17932756 tccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtg 17932662  T
Q  170 accaagagactcaatcataatagtg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  17932661 accaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 22712660 - 22712698
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22712660 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 22717369 - 22717407
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22717369 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38191035 - 38190997
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191035 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45567447 - 45567409
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45567447 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390174
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 8390174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699031
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 83  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 14699031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 102
Target Start/End: Original strand, 41303088 - 41303121
Alignment:
Q  69 gttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41303088 gttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 41303121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  14 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 58  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 14376 - 14593
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14376 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatat 14474  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  14475 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtga 14574  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14575 atcaaccctcaaaccctag 14593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15313 - 15096
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 107  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15313 aagaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactata-tgatgagtaactttacaaaagagatat 15215  T
Q  108 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15214 caatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 15115  T
Q  208 atcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  15114 atcaaccctcaaactctag 15096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 183628 - 183851
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  183628 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaa 183726  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  183727 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 183825  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  183826 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 183851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52307 - 52088
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagag--cagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 105  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  52307 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 52209  T
Q  106 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 205  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  52208 gtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 52109  T
Q  206 gaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  52108 gaatcaatcctcaaaccctag 52088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 50308 - 50234
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat--gggtgagagagcagtcctccgttccactataa 80  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  50308 aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactataa 50234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 79486 - 79262
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  79486 aacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 79388  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  79387 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 79288  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | |||||||||||||| |||||||||    
T  79287 aaggtgaatcaacccttaaaccctag 79262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 69279 - 69502
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  69279 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 69376  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  69377 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 69476  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  69477 aaggtgaatcaaccctcaaaccctag 69502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73198
Alignment:
Q  188 aatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 73198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4296 - 4073
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4296 aacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaa 4199  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4198 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 4099  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||    
T  4098 aagatgaatcaaccctcaaaccctag 4073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 1440 - 1663
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  1440 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 1537  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1538 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 1637  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  1638 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 11460 - 11684
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11460 aacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa 11558  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11559 gagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 11658  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  11659 aaggaaaatcaaccctcaaaccctag 11684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 80158 - 79938
Alignment:
Q  3 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  80158 cacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 80060  T
Q  103 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 202  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  80059 gatgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaat-ctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaa 79961  T
Q  203 ggtgaatcaaccctcaaacccta 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  79960 ggtgaatcaaccctcaaacccta 79938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 188386 - 188424
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  188386 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 41470 - 41694
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41470 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 41568  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41569 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 41668  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  41669 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 41694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 1638 - 1842
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1638 aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 1737  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  1738 atgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaat 1837  T
Q  210 caacc 214  Q
    |||||    
T  1838 caacc 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 85532 - 85312
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  85532 aacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaa 85433  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||    
T  85432 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttttcc 85333  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaac 221  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  85332 aaggtgaatcaaccctcaaac 85312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 15817 - 16021
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15817 aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 15916  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||    
T  15917 atgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaat 16016  T
Q  210 caacc 214  Q
    |||||    
T  16017 caacc 16021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6500 - 6276
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||     
T  6500 aacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa- 6403  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6402 gagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcc 6303  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  6302 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 6276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 342 - 118
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  342 aacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 245  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcc 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  244 gagaaatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc 145  T
Q  200 cagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  144 caaggtgaatcaacccacaaaccctag 118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29471 - 29248
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   |||||||     
T  29471 aacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa- 29374  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29373 gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatccc 29274  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | || ||||||||||  |||||||||    
T  29273 aaggcgaatcaacccataaaccctag 29248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3180 - 2957
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||     
T  3180 aacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa- 3083  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3082 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 2983  T
Q  201 agggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  2982 aaggtgaatcaacccacaaaccctag 2957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22416 - 22221
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  22416 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaa 22319  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22318 gagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24691 - 24496
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  24691 aacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaa 24594  T
Q  101 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24593 gagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 16646 - 16848
Alignment:
Q  11 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  |||||| || |||| ||||||  |  |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16646 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtcccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 16745  T
Q  110 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16746 atgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaat 16845  T
Q  210 caa 212  Q
    |||    
T  16846 caa 16848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2290 - 2118
Alignment:
Q  53 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagt 152  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  2290 gagagagtagccctccgattcactata-tgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagt 2192  T
Q  153 ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctag 226  Q
    | ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2191 cccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 2118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5076 - 4912
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa-gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcc 136  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5076 tgacctagtctggggcagagagcagttctatgttccactataatgatgagtatctttacaaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcc 4977  T
Q  137 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 201  Q
    || ||||||| | ||  ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4976 taattctaccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35716
Alignment:
Q  123 ataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacc 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  223 ctag 226  Q
    ||||    
T  35719 ctag 35716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 35895 - 35816
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataa 80  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35895 aacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactataa 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 4666 - 4733
Alignment:
Q  1 aacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctcc 68  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  4666 aacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 57452 - 57613
Alignment:
Q  38 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 136  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||  || ||   ||    
T  57452 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaatagatcttcaaacc 57551  T
Q  137 tatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    || ||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  57552 taattccacccaaagtcccgaatctcttccaatgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 57613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 1439 - 1483
Alignment:
Q  2 acacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1439 acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt 1483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 224857 - 224819
Alignment:
Q  159 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  224857 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 16980 - 17057
Alignment:
Q  8 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16980 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgat 17057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University