View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16750_high_6 (Length: 346)

Name: NF16750_high_6
Description: NF16750
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16750_high_6
NF16750_high_6
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (1-346)||(27623579-27623922)
chr6 (1-342)||(8899575-8899912)
chr6 (6-342)||(27355987-27356319)
chr6 (6-338)||(34458388-34458714)
chr6 (12-342)||(13518070-13518396)
chr6 (6-338)||(33370311-33370639)
chr6 (1-342)||(27284238-27284575)
chr6 (11-342)||(27491128-27491455)
chr6 (6-342)||(4539634-4539967)
chr6 (6-342)||(26110287-26110618)
chr6 (6-342)||(26772505-26772836)
chr6 (13-342)||(4763760-4764085)
chr6 (6-342)||(28213444-28213777)
chr6 (13-342)||(16755817-16756143)
chr6 (6-342)||(27200176-27200509)
chr6 (6-342)||(27248724-27249057)
chr6 (13-342)||(26791813-26792138)
chr6 (13-342)||(27063479-27063803)
chr6 (6-342)||(30551876-30552208)
chr6 (19-342)||(29579018-29579336)
chr6 (1-342)||(29555543-29555880)
chr6 (13-342)||(28166491-28166817)
chr6 (6-343)||(4531278-4531610)
chr6 (13-342)||(29507413-29507740)
chr6 (12-342)||(16680135-16680462)
chr6 (13-326)||(26926765-26927073)
chr6 (19-338)||(13292831-13293140)
chr6 (9-342)||(16937901-16938230)
chr6 (13-343)||(4778877-4779204)
chr6 (1-343)||(22928756-22929096)
chr6 (13-342)||(27013730-27014048)
chr6 (13-342)||(14139276-14139595)
chr6 (97-342)||(26666534-26666774)
chr6 (13-343)||(27031020-27031343)
chr6 (13-343)||(24869707-24870027)
chr6 (13-339)||(27025142-27025460)
chr6 (13-342)||(27208901-27209222)
chr6 (13-342)||(27240006-27240327)
chr6 (13-343)||(24299635-24299956)
chr6 (13-343)||(15406408-15406730)
chr6 (13-343)||(15418195-15418517)
chr6 (56-343)||(20174589-20174882)
chr6 (56-343)||(22161109-22161402)
chr6 (1-92)||(23851450-23851541)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-342)||(39856636-39856971)
chr4 (6-342)||(18794546-18794878)
chr4 (13-338)||(20332355-20332677)
chr4 (13-338)||(40099569-40099891)
chr4 (13-338)||(27157245-27157568)
chr4 (13-342)||(24586290-24586616)
chr4 (12-338)||(14104553-14104874)
chr4 (12-342)||(30759774-30760098)
chr4 (12-342)||(33667732-33668056)
chr4 (13-342)||(54839402-54839726)
chr4 (13-343)||(14753422-14753747)
chr4 (6-342)||(21975708-21976040)
chr4 (13-342)||(5700551-5700876)
chr4 (13-343)||(34182892-34183216)
chr4 (6-342)||(31120439-31120772)
chr4 (1-342)||(5011876-5012214)
chr4 (13-343)||(24118674-24118999)
chr4 (13-343)||(36338454-36338772)
chr4 (19-343)||(6575879-6576191)
chr4 (19-343)||(1673877-1674200)
chr4 (13-343)||(1906263-1906594)
chr4 (13-343)||(15233827-15234157)
chr4 (13-342)||(15380167-15380492)
chr4 (1-338)||(15276562-15276898)
chr4 (13-343)||(14671027-14671350)
chr4 (13-343)||(17019063-17019385)
chr4 (92-343)||(36324245-36324484)
chr4 (6-65)||(18311379-18311439)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-342)||(5141149-5141487)
chr7 (1-342)||(26441238-26441576)
chr7 (14-338)||(4139064-4139386)
chr7 (6-342)||(11446878-11447210)
chr7 (1-342)||(3451303-3451641)
chr7 (1-337)||(16745340-16745673)
chr7 (13-338)||(26663731-26664053)
chr7 (13-338)||(26678923-26679245)
chr7 (13-342)||(39206954-39207279)
chr7 (9-342)||(45393212-45393541)
chr7 (6-342)||(26268900-26269236)
chr7 (6-338)||(24586354-24586682)
chr7 (13-343)||(26509509-26509837)
chr7 (13-342)||(31558209-31558534)
chr7 (13-342)||(5154081-5154405)
chr7 (13-342)||(26518790-26519113)
chr7 (19-342)||(5164387-5164706)
chr7 (1-342)||(4205374-4205711)
chr7 (1-342)||(26313664-26314000)
chr7 (13-342)||(45737298-45737625)
chr7 (19-342)||(11418594-11418913)
chr7 (13-342)||(16443818-16444144)
chr7 (1-342)||(31084437-31084775)
chr7 (1-342)||(16047300-16047634)
chr7 (13-343)||(2160567-2160895)
chr7 (98-338)||(26595750-26595988)
chr7 (13-342)||(2779249-2779568)
chr7 (13-342)||(31129902-31130221)
chr7 (1-338)||(10847568-10847905)
chr7 (13-343)||(16512254-16512574)
chr7 (13-343)||(10910740-10911060)
chr7 (13-97)||(26531926-26532010)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-343)||(4629736-4630073)
chr3 (1-343)||(21680652-21680989)
chr3 (1-343)||(29142725-29143066)
chr3 (6-342)||(29658940-29659272)
chr3 (13-338)||(5727941-5728263)
chr3 (1-338)||(32296580-32296914)
chr3 (13-338)||(47029416-47029738)
chr3 (6-342)||(4340648-4340980)
chr3 (13-338)||(5717031-5717353)
chr3 (13-338)||(5764105-5764427)
chr3 (6-339)||(20570821-20571150)
chr3 (6-342)||(18248694-18249026)
chr3 (6-342)||(28027247-28027577)
chr3 (13-338)||(10649034-10649355)
chr3 (14-342)||(31958427-31958753)
chr3 (1-342)||(28109923-28110265)
chr3 (14-342)||(5603285-5603611)
chr3 (14-342)||(24334137-24334463)
chr3 (13-342)||(5472951-5473275)
chr3 (13-342)||(51787985-51788310)
chr3 (6-338)||(5590337-5590665)
chr3 (13-342)||(8217595-8217922)
chr3 (13-342)||(4422881-4423206)
chr3 (13-343)||(22381552-22381877)
chr3 (13-342)||(18231156-18231481)
chr3 (13-342)||(22864820-22865143)
chr3 (13-342)||(22879879-22880202)
chr3 (6-342)||(17978922-17979255)
chr3 (13-342)||(17970838-17971161)
chr3 (14-342)||(28345135-28345458)
chr3 (13-342)||(4790605-4790931)
chr3 (13-342)||(10402112-10402436)
chr3 (19-343)||(18286326-18286645)
chr3 (19-343)||(18301627-18301946)
chr3 (13-342)||(5019676-5020000)
chr3 (13-342)||(20071996-20072323)
chr3 (1-342)||(16618461-16618802)
chr3 (1-343)||(16422134-16422472)
chr3 (13-342)||(6536715-6537040)
chr3 (21-342)||(11104333-11104651)
chr3 (13-342)||(7079185-7079515)
chr3 (13-342)||(48471890-48472219)
chr3 (13-343)||(31030216-31030535)
chr3 (11-343)||(18336589-18336911)
chr3 (13-343)||(18057223-18057552)
chr3 (19-343)||(6207869-6208185)
chr3 (18-343)||(32445122-32445434)
chr3 (18-343)||(19700454-19700787)
chr3 (19-343)||(4727602-4727916)
chr3 (13-343)||(15735071-15735392)
chr3 (19-343)||(35886733-35887049)
chr3 (13-343)||(4689614-4689934)
chr3 (13-343)||(5658097-5658420)
chr3 (13-342)||(8283430-8283766)
chr3 (13-121)||(15886894-15887004)
chr3 (13-97)||(8002523-8002607)
chr3 (193-343)||(15886712-15886857)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-343)||(40239495-40239832)
chr2 (1-342)||(12710520-12710857)
chr2 (6-343)||(27782223-27782556)
chr2 (13-338)||(27809699-27810022)
chr2 (13-338)||(37945788-37946110)
chr2 (13-338)||(254575-254896)
chr2 (13-338)||(16167476-16167797)
chr2 (13-342)||(3788492-3788816)
chr2 (13-342)||(37931370-37931702)
chr2 (14-342)||(22922062-22922388)
chr2 (19-342)||(12661543-12661861)
chr2 (13-342)||(13930463-13930790)
chr2 (13-338)||(12592808-12593133)
chr2 (14-342)||(19410403-19410729)
chr2 (1-342)||(39896054-39896391)
chr2 (13-342)||(27122523-27122846)
chr2 (12-342)||(34867680-34868005)
chr2 (6-342)||(16823256-16823588)
chr2 (6-342)||(16897892-16898224)
chr2 (13-342)||(37383675-37384000)
chr2 (13-342)||(9343906-9344231)
chr2 (1-343)||(11629103-11629440)
chr2 (13-342)||(34160842-34161169)
chr2 (1-342)||(37679810-37680149)
chr2 (1-342)||(37695075-37695414)
chr2 (13-342)||(39045741-39046066)
chr2 (13-342)||(32055800-32056124)
chr2 (1-342)||(21671089-21671429)
chr2 (13-342)||(31882285-31882609)
chr2 (6-343)||(21697091-21697427)
chr2 (63-342)||(31868705-31868979)
chr2 (13-342)||(34297154-34297472)
chr2 (13-342)||(27396321-27396656)
chr2 (13-343)||(28888277-28888598)
chr2 (13-343)||(34268844-34269165)
chr2 (1-338)||(19450341-19450683)
chr2 (13-343)||(23122496-23122817)
chr2 (13-343)||(27428371-27428690)
chr2 (13-342)||(20843910-20844235)
chr2 (216-342)||(23116993-23117119)
chr2 (13-68)||(31887682-31887737)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (7-342)||(3795539-3795871)
chr5 (1-343)||(33298528-33298870)
chr5 (12-342)||(33881132-33881458)
chr5 (13-338)||(30174472-30174794)
chr5 (1-343)||(28953608-28953946)
chr5 (12-342)||(18369361-18369687)
chr5 (6-342)||(31820239-31820569)
chr5 (19-342)||(11555367-11555685)
chr5 (13-343)||(41680711-41681038)
chr5 (9-342)||(30158037-30158366)
chr5 (6-342)||(32590105-32590436)
chr5 (6-342)||(37352473-37352805)
chr5 (13-342)||(37746157-37746482)
chr5 (13-342)||(37760989-37761315)
chr5 (6-337)||(2517065-2517393)
chr5 (6-343)||(6880303-6880637)
chr5 (18-342)||(43084270-43084590)
chr5 (9-342)||(8659301-8659629)
chr5 (1-342)||(9323472-9323808)
chr5 (13-342)||(13318657-13318981)
chr5 (12-342)||(24729976-24730302)
chr5 (1-342)||(12138171-12138507)
chr5 (1-343)||(22894411-22894748)
chr5 (18-342)||(18494597-18494916)
chr5 (6-342)||(33522382-33522715)
chr5 (13-342)||(28655249-28655575)
chr5 (13-342)||(40467382-40467707)
chr5 (13-342)||(9544536-9544862)
chr5 (13-342)||(15752687-15753006)
chr5 (13-342)||(30035433-30035757)
chr5 (12-342)||(11329643-11329971)
chr5 (1-342)||(26486391-26486717)
chr5 (19-343)||(23631982-23632304)
chr5 (13-342)||(5643807-5644130)
chr5 (13-342)||(13180622-13180943)
chr5 (13-342)||(13436503-13436834)
chr5 (13-343)||(18122244-18122570)
chr5 (13-343)||(37665314-37665640)
chr5 (13-342)||(34622525-34622851)
chr5 (13-342)||(31437471-31437789)
chr5 (13-343)||(15652588-15652912)
chr5 (18-342)||(25206289-25206616)
chr5 (18-342)||(25270445-25270772)
chr5 (13-343)||(22992952-22993270)
chr5 (18-343)||(23897886-23898201)
chr5 (13-343)||(33783494-33783815)
chr5 (18-343)||(24975861-24976176)
chr5 (13-339)||(24608252-24608570)
chr5 (13-343)||(30940643-30940963)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (13-342)||(12036-12360)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (6-338)||(28355845-28356176)
chr8 (13-342)||(9360622-9360946)
chr8 (13-338)||(31360528-31360849)
chr8 (13-342)||(33248366-33248690)
chr8 (14-342)||(31483761-31484087)
chr8 (6-342)||(12086614-12086947)
chr8 (7-342)||(29835317-29835647)
chr8 (1-342)||(19680436-19680772)
chr8 (13-342)||(18796706-18797032)
chr8 (13-342)||(33264731-33265055)
chr8 (13-342)||(18715480-18715807)
chr8 (13-342)||(15773574-15773899)
chr8 (1-342)||(19202266-19202592)
chr8 (19-342)||(21342061-21342381)
chr8 (13-342)||(44566980-44567308)
chr8 (6-275)||(16260216-16260480)
chr8 (19-343)||(19911052-19911374)
chr8 (1-343)||(27602804-27603135)
chr8 (18-342)||(22074820-22075141)
chr8 (13-343)||(19655237-19655560)
chr8 (13-343)||(19694095-19694417)
chr8 (13-343)||(2131158-2131478)
chr8 (13-343)||(22138906-22139226)
chr8 (51-343)||(14569194-14569480)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (13-342)||(3647148-3647473)
chr1 (13-342)||(10968667-10968993)
chr1 (6-342)||(51644215-51644549)
chr1 (20-342)||(10951100-10951419)
chr1 (12-342)||(28591084-28591409)
chr1 (13-342)||(28155728-28156055)
chr1 (13-342)||(41787238-41787565)
chr1 (1-343)||(20334343-20334683)
chr1 (8-342)||(16201956-16202294)
chr1 (19-343)||(20466785-20467113)
chr1 (1-343)||(21891690-21892014)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-342)||(3108-3447)
scaffold0159 (189-342)||(17980-18133)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (6-342)||(15562-15901)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (13-342)||(9571-9895)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (6-342)||(13942-14275)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (13-342)||(8858-9182)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-342)||(1645-1982)
scaffold0322 (1-342)||(12034-12382)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (13-342)||(9914-10238)
scaffold0143 (13-343)||(33297-33620)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (13-342)||(18585-18912)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (13-343)||(4531-4860)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-342)||(25103-25448)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (13-343)||(6066-6389)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (6-173)||(370-537)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (19-343)||(24834-25150)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (1-157)||(26243-26399)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (231-339)||(1-109)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (19-151)||(40759-40898)
scaffold0099 (296-343)||(40558-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27623922 - 27623579
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623922 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 27623823  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  27623822 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttca 27623726  T
Q  201 aagctatatacaaaaca-ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623725 aagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 27623626  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtata 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623625 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtata 27623579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8899912 - 8899575
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899912 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 8899813  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  8899812 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttca 8899718  T
Q  201 aagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899717 aagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 8899618  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899617 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 8899575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27356319 - 27355987
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356319 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 27356220  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||    
T  27356219 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagct 27356125  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27356124 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 27356025  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356024 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 27355987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34458714 - 34458388
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458714 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 34458615  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||| |||||    
T  34458614 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttctaagct 34458520  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458519 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 34458421  T
Q  306 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458420 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 34458388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13518396 - 13518070
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518396 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13518297  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||    
T  13518296 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt----ttccactttcaaagctatatac 13518201  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518200 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 13518101  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518100 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 13518070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33370639 - 33370311
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370639 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33370540  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  33370539 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 33370445  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33370444 atatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcgaacctga 33370345  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370344 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 33370311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27284575 - 27284238
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284575 gaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 27284476  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||    
T  27284475 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttctactttca 27284380  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284379 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 27284280  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284279 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 27284238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Original strand, 27491128 - 27491455
Alignment:
Q  11 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491128 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 27491227  T
Q  111 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||| ||||    
T  27491228 agtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctgtata 27491322  T
Q  211 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491323 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 27491422  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491423 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 27491455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4539967 - 4539634
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4539967 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 4539868  T
Q  105 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||        | || ||||||||||||    
T  4539867 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt---ctttttactttcaaagc 4539772  T
Q  205 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4539771 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctga 4539672  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4539671 gcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgag 4539634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26110618 - 26110287
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110618 ttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 26110519  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  26110518 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagct 26110424  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26110423 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgag 26110324  T
Q  306 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110323 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 26110287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26772836 - 26772505
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772836 ttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 26772737  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||         |||||||||||||||||    
T  26772736 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattctatttt-----cttctactttcaaagct 26772643  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26772642 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctga 26772543  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26772542 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 26772505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 4763760 - 4764085
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4763760 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4763859  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  4763860 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 4763954  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763955 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 4764054  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764055 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 4764085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 28213444 - 28213777
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28213444 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 28213543  T
Q  105 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||    
T  28213544 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagc 28213638  T
Q  205 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  28213639 tgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctg 28213738  T
Q  304 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28213739 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgag 28213777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 16755817 - 16756143
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16755916  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  16755917 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 16756011  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat--tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756012 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 16756111  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756112 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 16756143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 27200176 - 27200509
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27200176 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 27200275  T
Q  105 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||    
T  27200276 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagc 27200369  T
Q  205 tatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 302  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200370 tatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 27200469  T
Q  303 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27200470 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgag 27200509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27249057 - 27248724
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27249057 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 27248958  T
Q  105 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||    
T  27248957 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagc 27248864  T
Q  205 tatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 302  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248863 tatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 27248764  T
Q  303 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27248763 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgag 27248724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 26791813 - 26792138
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26791813 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaa 26791912  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26791913 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 26792007  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792008 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 26792107  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26792108 ggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 26792138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 27063479 - 27063803
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27063479 cttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27063578  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27063579 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 27063672  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063673 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 27063772  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063773 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 27063803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30552208 - 30551876
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552208 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30552109  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  30552108 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 30552014  T
Q  206 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30552013 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 30551914  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30551913 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 30551876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579336
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttctattttcaaagctatatacaaatcat 29579211  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 317  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579212 tttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 29579311  T
Q  318 ttcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  29579312 atcaaatgaaacatgcatgagcgag 29579336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 29555543 - 29555880
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555543 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 29555642  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||||||||    
T  29555643 aaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttctttttactttca 29555737  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29555738 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaaagcaaa 29555837  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555838 cctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 29555880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 28166491 - 28166817
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166491 cttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28166590  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28166591 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 28166685  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166686 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 28166785  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166786 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 28166817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Original strand, 4531278 - 4531610
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531278 ttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4531377  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||    
T  4531378 cgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagct 4531472  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4531473 gtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacccga 4531572  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4531573 gcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 4531610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 29507413 - 29507740
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29507413 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 29507512  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||           || ||||||||||||||||||||    
T  29507513 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttcttt--ttttactttcaaagctatataca 29507609  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507610 aaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 29507709  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29507710 ggtacattcaaatggaacatgcatgagcgag 29507740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 16680135 - 16680462
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16680135 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtgga 16680234  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| |||||||    
T  16680235 gtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttctactttcaaagttatatac 16680330  T
Q  212 aaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680331 aaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgaca 16680430  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680431 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 16680462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 326
Target Start/End: Original strand, 26926765 - 26927073
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26926765 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 26926864  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26926865 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 26926958  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926959 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 26927058  T
Q  312 ggtacattcaaatga 326  Q
    |||||||||||||||    
T  26927059 ggtacattcaaatga 26927073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13293140 - 13292831
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13293140 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 13293041  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293040 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 13292946  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292945 tttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 13292851  T
Q  319 tcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13292850 tcaaatgaaacatgcatgag 13292831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16938230 - 16937901
Alignment:
Q  9 tgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938230 tgtacttgcgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 16938131  T
Q  108 tggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctat 207  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||    
T  16938130 tggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctat 16938037  T
Q  208 atacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 306  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16938036 atacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagc 16937937  T
Q  307 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937936 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 16937901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 4778877 - 4779204
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778877 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 4778976  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaa-gctatata 210  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||| ||| ||||    
T  4778977 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaaagctgtata 4779071  T
Q  211 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779072 cgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 4779171  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4779172 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 4779204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22929096 - 22928756
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929096 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 22928997  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||        | |||||||||||    
T  22928996 aaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttca 22928902  T
Q  201 aagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagca 297  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||    
T  22928901 aagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagca 22928802  T
Q  298 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22928801 aacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagt 22928756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 27013730 - 27014048
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27013730 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27013829  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  27013830 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 27013924  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  27013925 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27014018  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27014019 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgag 27014048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14139595 - 14139276
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14139595 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14139496  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  14139495 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 14139401  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14139400 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatg 14139306  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14139305 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgag 14139276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666534
Alignment:
Q  97 ttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctact 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctact 26666681  T
Q  197 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26666680 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaa 26666581  T
Q  296 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26666580 caaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 26666534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 27031020 - 27031343
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27031020 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27031119  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  27031120 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtaca 27031214  T
Q  212 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    | ||||||||||||||||||||||||    
T  27031215 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaac 27031310  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27031311 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 27031343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 24869707 - 24870027
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24869707 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24869806  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  24869807 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgtaca 24869901  T
Q  212 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  24869902 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 24869994  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24869995 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 24870027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Original strand, 27025142 - 27025460
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27025142 cttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27025241  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  27025242 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 27025336  T
Q  212 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  27025337 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 27025429  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 339  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27025430 cagggtacattcaaacgagacatgcatgagc 27025460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 27208901 - 27209222
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27208901 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27209000  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  27209001 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 27209095  T
Q  212 aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
    ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||    
T  27209096 aaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagca 27209188  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27209189 acagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgag 27209222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27240327 - 27240006
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27240327 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27240228  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  27240227 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 27240133  T
Q  212 aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
    ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||    
T  27240132 aaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagca 27240040  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27240039 acagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgag 27240006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24299956 - 24299635
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24299956 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24299857  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || |||| |||||| ||| |||     
T  24299856 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactctcaaagttatgtaca 24299762  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    ||||| ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||    
T  24299761 aaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaaca 24299667  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24299666 gggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagt 24299635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15406730 - 15406408
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15406730 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15406631  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  15406630 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagatatgtac 15406536  T
Q  212 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||    
T  15406535 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 15406442  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15406441 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 15406408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15418517 - 15418195
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15418517 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15418418  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  15418417 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagatatgtac 15418323  T
Q  212 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||    
T  15418322 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 15418229  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15418228 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 15418195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 343
Target Start/End: Original strand, 20174589 - 20174882
Alignment:
Q  56 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20174589 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 20174688  T
Q  156 ctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaac 253  Q
    || |||||||||||| ||||||||        |  | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20174689 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctc--tttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaac 20174785  T
Q  254 aaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20174786 aaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagt 20174882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22161402 - 22161109
Alignment:
Q  56 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22161402 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 22161303  T
Q  156 ctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaac 253  Q
    || |||||||||||| ||||||||        |  | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22161302 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctc--tttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaac 22161206  T
Q  254 aaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22161205 aaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagt 22161109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23851541 - 23851450
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 92  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851541 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 39856636 - 39856971
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856636 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 39856735  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          ||||||||||||    
T  39856736 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactct-----tttttcttctactttca 39856829  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856830 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 39856929  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856930 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 39856971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18794878 - 18794546
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794878 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 18794779  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  18794778 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 18794684  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18794683 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 18794584  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18794583 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 18794546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20332677 - 20332355
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332677 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 20332578  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  20332577 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 20332481  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332480 aaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 20332381  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20332380 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 20332355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40099891 - 40099569
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099891 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 40099792  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  40099791 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 40099695  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099694 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 40099595  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40099594 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 40099569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27157568 - 27157245
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157568 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27157469  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27157468 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 27157372  T
Q  213 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157371 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 27157272  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27157271 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 27157245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24586616 - 24586290
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586616 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24586517  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  24586516 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 24586421  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24586420 aaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatag 24586321  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 24586290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 338
Target Start/End: Original strand, 14104553 - 14104874
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104553 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 14104652  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||         | ||||||||||||||||||||||    
T  14104653 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactct----gttttctttctactttcaaagctatatac 14104747  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104748 aaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 14104847  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14104848 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 14104874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 30759774 - 30760098
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759774 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30759873  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  30759874 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 30759967  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759968 aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 30760067  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30760068 ggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgag 30760098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33668056 - 33667732
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668056 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33667957  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  33667956 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 33667863  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667862 aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33667763  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33667762 ggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgag 33667732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 54839402 - 54839726
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54839402 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 54839501  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  54839502 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 54839595  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54839596 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacag 54839695  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839696 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 54839726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14753747 - 14753422
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14753747 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14753648  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  14753647 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 14753554  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14753553 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaaca 14753454  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14753453 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 14753422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 21975708 - 21976040
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975708 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21975807  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  21975808 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 21975902  T
Q  206 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21975903 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 21976002  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21976003 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 21976040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 5700551 - 5700876
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700551 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5700650  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||    
T  5700651 gtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 5700744  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5700745 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaaca 5700844  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700845 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 5700876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34183216 - 34182892
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34183216 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34183117  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  34183116 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 34183022  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183021 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 34182923  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34182922 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 34182892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31120772 - 31120439
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31120772 ttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatc 31120673  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  31120672 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 31120578  T
Q  206 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctg 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31120577 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccg 31120478  T
Q  304 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31120477 agcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 31120439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 5011876 - 5012214
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5011876 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 5011975  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||    
T  5011976 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctactttt----cttctactttc 5012070  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5012071 aaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 5012170  T
Q  299 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5012171 acctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgag 5012214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 24118674 - 24118999
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24118674 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24118773  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  24118774 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagctatataca 24118868  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24118869 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacag 24118968  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24118969 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 24118999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36338772 - 36338454
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338772 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 36338673  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  36338672 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 36338578  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  36338577 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 36338484  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36338483 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 36338454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Original strand, 6575879 - 6576191
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6575879 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 6575978  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6575979 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaacat 6576073  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576074 tttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 6576167  T
Q  319 tcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  6576168 tcaaatg-aacatgcatgagcgagt 6576191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674200
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac--aaaac 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||||||||||||||| || |||  ||||     
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaat 1674071  T
Q  217 attttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1674072 attttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacttgagcaacaggg 1674170  T
Q  314 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1674171 tacattcaaacgaaacatgcatgagcgagt 1674200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 1906263 - 1906594
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  1906263 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtatatctgtggag 1906362  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||        | ||||||||||||||| || ||||    
T  1906363 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctatctttctactttcaaagccatgtaca 1906457  T
Q  213 ----aaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 305  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1906458 aaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgag 1906556  T
Q  306 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1906557 caacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagt 1906594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 15233827 - 15234157
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15233827 cttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtagag 15233926  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||| ||||    
T  15233927 tcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttcaaagctatgtaca 15234021  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 306  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15234022 aaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgggc 15234120  T
Q  307 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15234121 aacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagt 15234157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15380492 - 15380167
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15380492 cttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15380393  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||| |||     
T  15380392 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttcaaagctatgtaca 15380298  T
Q  212 -aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15380297 aaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagcaagcctgagcaaca 15380199  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15380198 aggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgag 15380167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15276898 - 15276562
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15276898 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgt 15276799  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||        |  ||||||||||    
T  15276798 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctctctactttca 15276704  T
Q  201 aagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaaag 295  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  15276703 aagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaag 15276605  T
Q  296 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
     |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  15276604 taaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgag 15276562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 14671027 - 14671350
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14671027 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 14671126  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  14671127 gttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 14671221  T
Q  212 aa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    || ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  14671222 aagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 14671315  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14671316 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagt 14671350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 17019063 - 17019385
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17019063 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 17019162  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc-aaagctatata 210  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||| |||||||| ||    
T  17019163 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaaagctatgta 17019257  T
Q  211 c-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  17019258 caaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 17019351  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17019352 cagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 17019385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324245
Alignment:
Q  92 aagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnncctt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----ctt 36324390  T
Q  192 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||    
T  36324389 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttga 36324296  T
Q  292 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36324295 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 36324245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18311439 - 18311379
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtg-gttactg-tgttcaatgtacc 65  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  18311439 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaa-tgtagtgtattactgttgttcaatgtacc 18311379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5141487 - 5141149
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141487 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 5141388  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  5141387 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttca 5141293  T
Q  201 aagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaa 298  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5141292 aagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaa 5141193  T
Q  299 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141192 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 5141149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441576
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |         ||| ||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccatttttt---cttttactttca 26441434  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441435 aagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 26441534  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441535 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 26441576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4139386 - 4139064
Alignment:
Q  14 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 113  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139386 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 4139287  T
Q  114 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  4139286 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 4139189  T
Q  214 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139188 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4139089  T
Q  314 tacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4139088 tacattcaaatgaaacatgcatgag 4139064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 11446878 - 11447210
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446878 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 11446977  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||         |||||||||||||||||    
T  11446978 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattctatttt-----cttctactttcaaagct 11447071  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447072 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 11447171  T
Q  304 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11447172 agcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgag 11447210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 3451303 - 3451641
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3451303 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgt 3451402  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||         ||||||||||||    
T  3451403 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttg-aaattctatttt-----cttctactttca 3451496  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451497 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 3451596  T
Q  298 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3451597 aacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgag 3451641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16745673 - 16745340
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745673 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16745574  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  16745573 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttca 16745479  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745478 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 16745379  T
Q  299 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16745378 acctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatga 16745340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26664053 - 26663731
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664053 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26663954  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26663953 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 26663857  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26663856 aaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggg 26663757  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26663756 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 26663731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26679245 - 26678923
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679245 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26679146  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26679145 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 26679049  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26679048 aaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggg 26678949  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26678948 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 26678923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39207279 - 39206954
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207279 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 39207180  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  39207179 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 39207085  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207084 aaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 39206985  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206984 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 39206954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 45393212 - 45393541
Alignment:
Q  9 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393212 tgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 45393311  T
Q  109 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  45393312 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctactttt----cttctactttcaaagctata 45393406  T
Q  209 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393407 cacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 45393506  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393507 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 45393541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26269236 - 26268900
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26269236 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 26269137  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || |||||||||||||    
T  26269136 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagct 26269042  T
Q  206 atatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269041 atgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 26268942  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268941 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 26268900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24586682 - 24586354
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586682 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 24586583  T
Q  105 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||         ||||||||||||||||    
T  24586582 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgttt-aagactctattttt----cttctactttcaaagc 24586488  T
Q  205 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586487 tatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 24586388  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586387 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 24586354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26509837 - 26509509
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26509837 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 26509738  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  26509737 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 26509642  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509641 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 26509542  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509541 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 26509509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31558534 - 31558209
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31558534 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31558435  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31558434 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 31558340  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558339 aatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 31558240  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558239 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 31558209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 5154081 - 5154405
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5154081 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5154180  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  5154181 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 5154275  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154276 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5154375  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5154376 gtacatccaaatgaaacatgcatgagcgag 5154405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 26518790 - 26519113
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26518889  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  26518890 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 26518983  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518984 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 26519083  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26519084 gtacattcaaatgaaacatgcacgagcgag 26519113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Original strand, 5164387 - 5164706
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5164387 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 5164486  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc-tatatacaaaaca 217  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5164487 tttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagcctatatacaaaaca 5164581  T
Q  218 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164582 ttttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 5164681  T
Q  318 ttcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5164682 tccaaatgaaacatgcatgagcgag 5164706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 4205374 - 4205711
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205374 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 4205473  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||    
T  4205474 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttc 4205567  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4205568 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 4205667  T
Q  299 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205668 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 4205711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26314000 - 26313664
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314000 gaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 26313901  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||    
T  26313900 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttc 26313807  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26313806 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 26313707  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26313706 cctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 26313664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 45737298 - 45737625
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45737298 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 45737397  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  45737398 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 45737491  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737492 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 45737591  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737592 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 45737625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11418913 - 11418594
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11418913 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 11418814  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11418813 cttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttttactttcaaagctatatacaaaacat 11418719  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418718 tttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 11418619  T
Q  318 ttcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  11418618 ttcaaatgaaacatgcacgagcgag 11418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16444144 - 16443818
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16444144 cttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 16444045  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||| |||     
T  16444044 tcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactcta----ctttctttctactttcaaagctatgtaca 16443950  T
Q  212 -aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16443949 aaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 16443851  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16443850 agggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 16443818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31084775 - 31084437
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31084775 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 31084676  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||    
T  31084675 tgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctattttt----cttctactttc 31084581  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31084580 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaa 31084481  T
Q  299 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31084480 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 31084437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 16047300 - 16047634
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047300 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16047399  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | ||||||| |||    
T  16047400 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactgtca 16047494  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  16047495 aagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttg-aaagcaagc 16047592  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16047593 ctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 16047634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 2160567 - 2160895
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2160567 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2160666  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| ||||    
T  2160667 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttc----ctttttactttcaaagctatgtaca 2160761  T
Q  213 aaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  2160762 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaac 2160861  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160862 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 2160895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 98 - 338
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26595988
Alignment:
Q  98 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactt 26595846  T
Q  198 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595847 tcaaagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 26595946  T
Q  297 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595947 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 26595988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 2779249 - 2779568
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2779249 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2779348  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  2779349 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 2779443  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  2779444 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 2779538  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2779539 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgag 2779568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 31129902 - 31130221
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31129902 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31130001  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  31130002 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 31130096  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  31130097 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31130191  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31130192 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgag 31130221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 10847568 - 10847905
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10847568 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgt 10847667  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||        |  ||||||||||    
T  10847668 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctg-aaactcta----ttttctctctactttca 10847762  T
Q  201 aagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaaa 294  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||    
T  10847763 aagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttttg-aaa 10847861  T
Q  295 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  10847862 gtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgag 10847905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16512574 - 16512254
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16512574 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 16512475  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  16512474 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 16512380  T
Q  212 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||    
T  16512379 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 16512288  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16512287 agggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagt 16512254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10911060 - 10910740
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10911060 cttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10910961  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  10910960 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 10910866  T
Q  212 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  10910865 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 10910773  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10910772 atggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 10910740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26532010 - 26531926
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 97  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532010 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 4629736 - 4630073
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629736 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 4629835  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  4629836 taatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttca 4629930  T
Q  201 aagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629931 aagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 4630030  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4630031 cctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 4630073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 21680652 - 21680989
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680652 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 21680751  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  21680752 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttca 21680846  T
Q  201 aagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680847 aagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 21680946  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21680947 cctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 21680989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29143066 - 29142725
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143066 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 29142967  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||    
T  29142966 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttt----ttctactttca 29142871  T
Q  201 aagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaagca 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||    
T  29142870 aagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaaca 29142771  T
Q  298 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142770 aacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 29142725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29659272 - 29658940
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659272 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 29659173  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||| |    
T  29659172 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagtt 29659078  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29659077 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 29658978  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658977 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 29658940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 5727941 - 5728263
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727941 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5728040  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5728041 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5728137  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728138 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5728237  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5728238 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 5728263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 32296580 - 32296914
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296580 gaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 32296679  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||    
T  32296680 gaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttt---cttctactttca 32296776  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296777 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 32296876  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32296877 ctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgag 32296914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 47029416 - 47029738
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029416 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 47029515  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  47029516 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 47029612  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029613 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 47029712  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47029713 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 47029738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4340980 - 4340648
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 4340786  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340785 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 4340686  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4340685 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 4340648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 5717031 - 5717353
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717031 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5717130  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5717131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5717227  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717228 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5717327  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5717328 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 5717353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5764427 - 5764105
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764427 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5764328  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5764327 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5764231  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764230 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5764131  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5764130 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 5764105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20571150 - 20570821
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571150 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 20571051  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||    
T  20571050 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttcaaagct 20570956  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20570955 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 20570856  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 339  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20570855 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagc 20570821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 18248694 - 18249026
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18248694 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatc 18248793  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||||||||    
T  18248794 cgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-gaactctattttt----cttctactttcaaagct 18248888  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18248889 acatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 18248988  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248989 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 18249026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 28027247 - 28027577
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027247 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 28027346  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||         |||||||||||||||||    
T  28027347 cgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagct 28027440  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 305  Q
    ||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027441 atatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 28027540  T
Q  306 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027541 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 28027577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 10649034 - 10649355
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649034 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10649133  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||     
T  10649134 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 10649228  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649229 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10649328  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10649329 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 10649355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31958753 - 31958427
Alignment:
Q  14 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 113  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958753 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 31958654  T
Q  114 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  31958653 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 31958556  T
Q  214 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958555 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 31958456  T
Q  314 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31958455 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgag 31958427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28110265 - 28109923
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28110265 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttta 28110166  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||    
T  28110165 tgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttc 28110070  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110069 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 28109970  T
Q  296 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109969 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 28109923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5603611 - 5603285
Alignment:
Q  14 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 113  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603611 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 5603512  T
Q  114 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  5603511 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 5603414  T
Q  214 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603413 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 5603314  T
Q  314 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5603313 taccttcaaataaaacatgcatgagcgag 5603285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 24334137 - 24334463
Alignment:
Q  14 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 113  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334137 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 24334236  T
Q  114 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||| ||||    
T  24334237 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatacacaa 24334334  T
Q  214 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334335 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 24334434  T
Q  314 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24334435 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgag 24334463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 5472951 - 5473275
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472951 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5473050  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5473051 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 5473145  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473146 aaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5473244  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473245 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 5473275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 51787985 - 51788310
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787985 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 51788084  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  51788085 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 51788179  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788180 aaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 51788279  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788280 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 51788310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5590665 - 5590337
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5590665 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 5590566  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || |||||||||||||    
T  5590565 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagct 5590471  T
Q  206 atatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590470 atgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 5590371  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590370 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 5590337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 8217595 - 8217922
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8217595 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggag 8217694  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||     
T  8217695 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 8217789  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217790 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 8217889  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217890 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 8217922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 4422881 - 4423206
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4422881 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4422980  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  4422981 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 4423075  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423076 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 4423175  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423176 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 4423206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22381877 - 22381552
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381877 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 22381778  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  22381777 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 22381683  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22381682 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacag 22381583  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22381582 tgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 22381552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 18231156 - 18231481
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18231156 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggag 18231255  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         | |||||||||||||||||||||||    
T  18231256 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactct----gttttctttctactttcaaagctatataca 18231350  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18231351 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacag 18231450  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18231451 ggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgag 18231481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22865143 - 22864820
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22865143 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22865044  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  22865043 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgcttt---cttctactttcaaagctgtataca 22864950  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22864949 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22864850  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864849 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 22864820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22880202 - 22879879
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22880202 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22880103  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  22880102 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgcttt---cttctactttcaaagctgtataca 22880009  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22880008 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22879909  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879908 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 22879879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17979255 - 17978922
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979255 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 17979156  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  17979155 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 17979061  T
Q  206 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctg 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17979060 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctg 17978961  T
Q  304 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17978960 agcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgag 17978922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17971161 - 17970838
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971161 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 17971062  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  17971061 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 17970968  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970967 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 17970868  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970867 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 17970838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 28345135 - 28345458
Alignment:
Q  14 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 113  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345135 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 28345234  T
Q  114 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||||    
T  28345235 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatacaa 28345328  T
Q  214 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345329 atcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28345428  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345429 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 28345458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4790931 - 4790605
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4790931 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4790832  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  4790831 ttcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 4790737  T
Q  212 aaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790736 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 4790637  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790636 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 4790605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 10402112 - 10402436
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10402112 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10402211  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||          |||||||||||||||||||||||    
T  10402212 tcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaattctattttt-----ttctactttcaaagctatataca 10402305  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402306 aaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10402405  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402406 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 10402436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286326
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 18286452  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18286451 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtac 18286352  T
Q  317 attcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18286351 attcaaatg-aacatgcatgagcgagt 18286326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301627
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 18301753  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18301752 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtac 18301653  T
Q  317 attcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18301652 attcaaatg-aacatgcatgagcgagt 18301627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 5019676 - 5020000
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5019676 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5019775  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5019776 tcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctacttt-----cttctactttcaaagctatataca 5019869  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019870 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5019969  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019970 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 5020000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 20071996 - 20072323
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20071996 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 20072095  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  20072096 tcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 20072189  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072190 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 20072289  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072290 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 20072323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16618802 - 16618461
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618802 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16618703  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | |||||||||||    
T  16618702 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttca 16618608  T
Q  201 aagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaaa 294  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| |||||| |||    
T  16618607 aagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttg-aaa 16618509  T
Q  295 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16618508 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 16618461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 16422134 - 16422472
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422134 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccg-gaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16422232  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | |||||||||||    
T  16422233 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttca 16422327  T
Q  201 aagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagca 297  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  16422328 aagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttg-aaagca 16422426  T
Q  298 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422427 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 16422472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6537040 - 6536715
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6537040 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 6536941  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  6536940 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 6536846  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6536845 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacag 6536746  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6536745 ggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgag 6536715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11104651 - 11104333
Alignment:
Q  21 ttcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcct 120  Q
    ||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11104651 ttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgcct 11104552  T
Q  121 ttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta--tatacaaaacat 218  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||  |||||||   ||    
T  11104551 tcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt----ctttttactttcaaagctaaatatacaatttat 11104457  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 318  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104456 tttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 11104357  T
Q  319 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11104356 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 11104333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 7079185 - 7079515
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7079185 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 7079284  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata-- 210  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||||||||||||||||||      
T  7079285 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagctatatata 7079379  T
Q  211 --caaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 306  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079380 tacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 7079479  T
Q  307 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079480 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 7079515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 48471890 - 48472219
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48471890 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggag 48471989  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  48471990 tcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 48472084  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472085 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagca 48472184  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472185 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 48472219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31030535 - 31030216
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31030535 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31030436  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31030435 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 31030341  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  31030340 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31030246  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31030245 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 31030216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Original strand, 18336589 - 18336911
Alignment:
Q  11 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18336589 tacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 18336688  T
Q  110 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatat 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  18336689 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatat 18336783  T
Q  210 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  18336784 acaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaac 18336878  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18336879 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 18336911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 18057223 - 18057552
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18057223 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18057322  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  18057323 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 18057417  T
Q  212 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18057418 aaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaa 18057517  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057518 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 18057552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Original strand, 6207869 - 6208185
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6207869 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 6207968  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207969 ccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaaca 6208064  T
Q  218 ttttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 315  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208065 ttttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 6208158  T
Q  316 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6208159 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 6208185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 343
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445434
Alignment:
Q  18 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatatacaaaaca 32445316  T
Q  218 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 317  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445317 ttttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 32445409  T
Q  318 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  32445410 ttcaaatg-aacatgcatgagcgagt 32445434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 343
Target Start/End: Original strand, 19700454 - 19700787
Alignment:
Q  18 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19700454 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 19700553  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac------ 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||| |||          
T  19700554 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaa 19700648  T
Q  212 -----aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctg 303  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19700649 aaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctg 19700747  T
Q  304 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19700748 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagt 19700787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Original strand, 4727602 - 4727916
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4727602 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 4727701  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4727702 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaacat 4727796  T
Q  219 tttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 316  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727797 tttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 4727890  T
Q  317 attcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4727891 attcaaatg-aacatgcatgagcgagt 4727916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15735392 - 15735071
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735392 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15735293  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||          ||| ||||||||||| ||| |||     
T  15735292 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-----gctttcttttactttcaaagttatgtaca 15735199  T
Q  212 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  15735198 aaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaac 15735104  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15735103 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 15735071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Original strand, 35886733 - 35887049
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  35886733 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 35886832  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  35886833 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaac 35886927  T
Q  217 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 314  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35886928 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggt 35887021  T
Q  315 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  35887022 acattcaaacg-aacatacatgagcgagt 35887049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 4689614 - 4689934
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4689614 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 4689713  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||          ||| ||||||| ||| ||| |||    
T  4689714 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-----gctttcttttactttctaagttatgtac 4689807  T
Q  212 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  4689808 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 4689900  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4689901 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 4689934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 5658097 - 5658420
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5658097 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5658196  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 210  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||        |||| ||||||||| | ||| ||    
T  5658197 tcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttccttttactttcaacgttatgta 5658291  T
Q  211 c-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||      ||||||||||||||||| ||||    
T  5658292 caaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagca 5658385  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5658386 acagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 5658420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8283766 - 8283430
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283766 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 8283667  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||          | || ||||||||||| ||| |||     
T  8283666 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttg-aaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtaca 8283572  T
Q  212 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||          ||||| | | ||||| |||||||||    
T  8283571 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaac 8283472  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8283471 ctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgag 8283430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15887004 - 15886894
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatccgtgg 110  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15887004 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtgg 15886905  T
Q  111 agtcatgcctt 121  Q
    ||||| |||||    
T  15886904 agtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 8002523 - 8002607
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 97  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002523 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15886857 - 15886712
Alignment:
Q  193 tactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 289  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||       ||    
T  15886857 tactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaagcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tt 15886765  T
Q  290 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15886764 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 15886712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 40239495 - 40239832
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239495 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 40239594  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  40239595 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttca 40239689  T
Q  201 aagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239690 aagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 40239789  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40239790 cctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 40239832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12710857 - 12710520
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710857 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 12710758  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||         ||||||||||||    
T  12710757 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattctatttt-----cttctactttca 12710664  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710663 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 12710564  T
Q  299 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12710563 acctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 12710520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Original strand, 27782223 - 27782556
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782223 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 27782322  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||    
T  27782323 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttcaaagct 27782417  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27782418 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 27782517  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27782518 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagt 27782556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 27809699 - 27810022
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809699 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27809798  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27809799 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttt--cttctactttcaaagctatataca 27809896  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809897 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27809996  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  27809997 ttacattcaaatgaaacatgcatgag 27810022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37946110 - 37945788
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946110 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37946011  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  37946010 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 37945914  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945913 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37945814  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37945813 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 37945788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 254896 - 254575
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254896 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 254797  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  254796 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 254700  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254699 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 254601  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  254600 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 254575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 16167476 - 16167797
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167476 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16167575  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||     
T  16167576 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 16167670  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167671 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 16167770  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16167771 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 16167797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 3788492 - 3788816
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  3788492 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggag 3788591  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  3788592 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 3788686  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788687 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 3788786  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3788787 gtacattcaaatgaaacatgcatgaacgag 3788816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 37931370 - 37931702
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931370 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37931469  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta--nnnnnnnnccttctactttcaaagctatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||    
T  37931470 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatata 37931569  T
Q  211 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931570 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaac 37931669  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37931670 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 37931702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22922388 - 22922062
Alignment:
Q  14 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 113  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922388 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 22922289  T
Q  114 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  22922288 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 22922191  T
Q  214 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922190 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 22922091  T
Q  314 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22922090 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgag 22922062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Original strand, 12661543 - 12661861
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12661543 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 12661642  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661643 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 12661737  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661738 tttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 12661837  T
Q  319 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12661838 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 12661861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13930790 - 13930463
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13930691  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  13930690 tcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 13930595  T
Q  213 aaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930594 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 13930495  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930494 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 13930463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 12592808 - 12593133
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592808 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12592907  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  12592908 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 12593003  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12593004 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaa 12593103  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593104 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 12593133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19410729 - 19410403
Alignment:
Q  14 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 113  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410729 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 19410630  T
Q  114 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||| ||||    
T  19410629 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatacacaa 19410532  T
Q  214 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19410531 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagga 19410432  T
Q  314 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19410431 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgag 19410403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 39896054 - 39896391
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39896054 gaagcttctgtacttgagaattcaaagtttttggggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttg 39896153  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||    
T  39896154 tgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttc 39896248  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39896249 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 39896348  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896349 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 39896391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 27122523 - 27122846
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27122523 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27122622  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27122623 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 27122716  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27122717 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagg 27122816  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122817 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 27122846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 34867680 - 34868005
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34867680 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtaga 34867779  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  34867780 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 34867873  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867874 aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 34867973  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867974 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 34868005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16823588 - 16823256
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823588 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16823489  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  16823488 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 16823394  T
Q  206 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16823393 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16823294  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16823293 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 16823256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 16897892 - 16898224
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897892 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16897991  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  16897992 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 16898086  T
Q  206 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16898087 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16898186  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16898187 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 16898224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 37383675 - 37384000
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383675 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37383774  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  37383775 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 37383869  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383870 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 37383969  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37383970 ggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgag 37384000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9344231 - 9343906
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9344231 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9344132  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  9344131 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 9344037  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9344036 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacag 9343937  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343936 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 9343906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11629440 - 11629103
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629440 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 11629341  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||| || |||||    
T  11629340 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttttattttca 11629247  T
Q  201 aagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11629246 aagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaaaaacaa 11629147  T
Q  299 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11629146 acctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 11629103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 34160842 - 34161169
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34160842 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34160941  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  34160942 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 34161036  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161037 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 34161136  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161137 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 34161169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37680149 - 37679810
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37680149 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 37680050  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||    
T  37680049 tgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttc 37679956  T
Q  200 aaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37679955 aaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagc 37679856  T
Q  297 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679855 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 37679810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37695414 - 37695075
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37695414 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 37695315  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||    
T  37695314 tgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttc 37695221  T
Q  200 aaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37695220 aaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagc 37695121  T
Q  297 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695120 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 37695075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39046066 - 39045741
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| |  || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39046066 cttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 39045967  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  39045966 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 39045872  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045871 aaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 39045772  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045771 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 39045741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 32055800 - 32056124
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32055800 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 32055899  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  32055900 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 32055993  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055994 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 32056093  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056094 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 32056124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21671429 - 21671089
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21671429 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 21671330  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||    
T  21671329 tgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttc 21671236  T
Q  200 aaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaag 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  21671235 aaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaaag 21671136  T
Q  296 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671135 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 21671089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 31882285 - 31882609
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31882285 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31882384  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31882385 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 31882478  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31882479 aaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacgg 31882578  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882579 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 31882609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21697427 - 21697091
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697427 ttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 21697328  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | | ||||||||||||||    
T  21697327 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctatcttcctactttcaaagct 21697233  T
Q  206 atatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  21697232 atgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaac 21697134  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21697133 ctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagt 21697091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868705
Alignment:
Q  63 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgct 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  163 tttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 262  Q
    ||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868879 tttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 31868786  T
Q  263 -gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868785 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 31868705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 34297154 - 34297472
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34297154 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 34297253  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  34297254 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 34297348  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  34297349 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34297442  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297443 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 34297472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 27396321 - 27396656
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27396321 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27396420  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||| |||     
T  27396421 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttcaaagctatgtaca 27396515  T
Q  212 -aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----------ctttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||||  ||||| |||||||||    
T  27396516 aaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtcctttttg-aaagcaaac 27396614  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27396615 ctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 27396656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 28888277 - 28888598
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888277 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28888376  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  28888377 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 28888471  T
Q  212 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||    
T  28888472 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 28888565  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28888566 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 28888598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34269165 - 34268844
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34269165 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggag 34269066  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  34269065 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 34268971  T
Q  212 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  34268970 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 34268878  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34268877 agggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagt 34268844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19450683 - 19450341
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19450683 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgt 19450584  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||        |  ||||||||||    
T  19450583 aaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctctctactttca 19450489  T
Q  201 aagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg------aaaactttttgtctatttt 289  Q
    ||| ||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| ||||||||| ||||    
T  19450488 aaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgtttt 19450389  T
Q  290 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  19450388 g-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgag 19450341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23122817 - 23122496
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23122817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgga 23122718  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  23122717 gtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtac 23122623  T
Q  212 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||    
T  23122622 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 23122529  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23122528 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 23122496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27428690 - 27428371
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27428690 cttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27428591  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||| ||| | |     
T  27428590 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtgca 27428496  T
Q  212 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||    
T  27428495 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 27428404  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  27428403 agggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagt 27428371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 20843910 - 20844235
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20843910 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 20844009  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc-aaagctatat- 209  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||| ||| |||| ||| |     
T  20844010 gtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttaccttcaaaagttatgtt 20844104  T
Q  210 -acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 306  Q
     | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||    
T  20844105 caaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagc 20844199  T
Q  307 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20844200 aacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgag 20844235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 216 - 342
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117119
Alignment:
Q  216 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 315  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  316 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 23117119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 31887737 - 31887682
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccacc 68  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31887737 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 3795539 - 3795871
Alignment:
Q  7 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 106  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  107 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttt---cttctactttcaaagcta 3795735  T
Q  207 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795736 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 3795835  T
Q  307 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795836 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 3795871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 33298528 - 33298870
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298528 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 33298627  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||    
T  33298628 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttt---ttctactttca 33298724  T
Q  201 aagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaagca 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||    
T  33298725 aagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaaca 33298824  T
Q  298 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298825 aacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 33298870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 33881132 - 33881458
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881132 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33881231  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||    
T  33881232 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt----ttccactttcaaagctatatac 33881327  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881328 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33881427  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881428 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 33881458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 30174472 - 30174794
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174472 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30174571  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  30174572 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 30174668  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174669 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30174768  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30174769 gtacattcaaatgaaacatgcatgag 30174794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28953946 - 28953608
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953946 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 28953847  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  28953846 aaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttca 28953752  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28953751 aagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaa 28953652  T
Q  299 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28953651 acctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 28953608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18369687 - 18369361
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369687 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 18369588  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18369587 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctattttt----cttctactttcaaagctatatac 18369492  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369491 aaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18369392  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369391 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 18369361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31820569 - 31820239
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820569 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 31820470  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||    
T  31820469 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagct 31820376  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 305  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820375 atatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 31820276  T
Q  306 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31820275 caacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 31820239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Original strand, 11555367 - 11555685
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11555367 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 11555466  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555467 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 11555561  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555562 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 11555661  T
Q  319 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11555662 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 11555685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 41680711 - 41681038
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680711 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 41680810  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||     
T  41680811 tcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 41680906  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41680907 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaaca 41681006  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41681007 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 41681038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 30158037 - 30158366
Alignment:
Q  9 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158037 tgtactcgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 30158136  T
Q  109 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  30158137 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctaccttt----cttctactttcaaagctata 30158231  T
Q  209 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158232 tacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 30158331  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158332 acggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 30158366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32590436 - 32590105
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32590436 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatt 32590337  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||    
T  32590336 cgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctacttt-----cttctactttcaaagct 32590243  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590242 atatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 32590143  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590142 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 32590105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37352805 - 37352473
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352805 ttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 37352706  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  37352705 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 37352611  T
Q  206 atatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37352610 atatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 37352511  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37352510 gcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgag 37352473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37746482 - 37746157
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37746482 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37746383  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || ||||||||||||||||||||    
T  37746382 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt----ctttttactttcaaagctatataca 37746287  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37746286 aaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37746187  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37746186 gtacattcaaatgaagcatgcatgagcgag 37746157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 37760989 - 37761315
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37760989 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggag 37761088  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  37761089 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 37761183  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37761184 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaaca 37761283  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761284 gggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 37761315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 337
Target Start/End: Original strand, 2517065 - 2517393
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517065 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 2517164  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||         |||||||||||||||||    
T  2517165 cgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-agattctatttt-----cttctactttcaaagct 2517258  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517259 atatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 2517358  T
Q  303 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2517359 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatga 2517393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Original strand, 6880303 - 6880637
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880303 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 6880402  T
Q  105 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||         ||||||||||||||||    
T  6880403 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aagactctattttt----cttctactttcaaagc 6880497  T
Q  205 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880498 tatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 6880597  T
Q  304 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880598 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 6880637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084590
Alignment:
Q  18 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    |||||||||||||    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||||||| ||||||| ||||     
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttcaaagttatatacaaaaat 43084464  T
Q  217 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084465 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 43084564  T
Q  317 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43084565 attcaaatgaaacatgcatgaacgag 43084590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8659629 - 8659301
Alignment:
Q  9 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8659629 tgtacttgtgaattcaaagtttcgg-gaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgt 8659531  T
Q  109 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  8659530 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctata 8659436  T
Q  209 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8659435 tacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagca 8659336  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8659335 acagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 8659301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 9323472 - 9323808
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323472 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 9323571  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||    
T  9323572 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttc 9323665  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9323666 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 9323765  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9323766 cctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 9323808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13318981 - 13318657
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13318981 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 13318882  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  13318881 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 13318787  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13318786 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 13318687  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318686 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 13318657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 24729976 - 24730302
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729976 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24730075  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||    
T  24730076 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 24730169  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730170 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 24730269  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24730270 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 24730302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 12138171 - 12138507
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138171 gaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 12138270  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||    
T  12138271 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttc 12138364  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12138365 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 12138464  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12138465 cctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 12138507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 22894411 - 22894748
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894411 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 22894510  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | |||||||||||    
T  22894511 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttca 22894605  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  22894606 aagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttg-aaagcaaa 22894704  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22894705 cctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagt 22894748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18494916 - 18494597
Alignment:
Q  18 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18494916 gaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 18494817  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 217  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||   |    
T  18494816 ccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttt-----cttctactttcaaagctatatacaattta 18494722  T
Q  218 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 317  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494721 ctttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 18494622  T
Q  318 ttcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18494621 ttcaaatgaaacatgcatgagcgag 18494597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 33522382 - 33522715
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522382 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33522481  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||           || |||||||||||||    
T  33522482 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctt---ttttactttcaaagct 33522577  T
Q  206 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33522578 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 33522677  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33522678 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 33522715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 28655249 - 28655575
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655249 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28655348  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28655349 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 28655442  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655443 aaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 28655542  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655543 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 28655575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40467707 - 40467382
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40467707 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtggag 40467608  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  40467607 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 40467513  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467512 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 40467413  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467412 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 40467382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9544862 - 9544536
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9544862 cttgcgaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9544764  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9544763 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 9544670  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9544669 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaa 9544570  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544569 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 9544536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15753006 - 15752687
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753006 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15752907  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  15752906 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 15752813  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752812 aaacattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 15752717  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752716 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 15752687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 30035433 - 30035757
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30035433 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 30035532  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  30035533 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 30035626  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035627 aaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 30035726  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035727 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 30035757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 11329643 - 11329971
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329643 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 11329742  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct--atat 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||  ||||    
T  11329743 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctaaatat 11329837  T
Q  210 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329838 acaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 11329937  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329938 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 11329971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 26486391 - 26486717
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486391 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 26486490  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||                ||||    
T  26486491 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat---------------tttc 26486574  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26486575 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 26486674  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26486675 cctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 26486717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Original strand, 23631982 - 23632304
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23631982 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgc 23632081  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632082 cttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 23632176  T
Q  219 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23632177 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggta 23632276  T
Q  316 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632277 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 23632304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 5643807 - 5644130
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5643807 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggag 5643906  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||    
T  5643907 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttttactttcaaagctatataca 5644000  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644001 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5644100  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5644101 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 5644130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13180943 - 13180622
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13180943 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13180844  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  13180843 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 13180748  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  13180747 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 13180653  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180652 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 13180622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13436834 - 13436503
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436834 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13436735  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  13436734 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttctactttcaaagctatatac 13436639  T
Q  212 aaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436638 aaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 13436539  T
Q  307 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436538 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 13436503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18122570 - 18122244
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18122570 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18122471  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  18122470 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttttt---ttctactttcaaagctatataca 18122375  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122374 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18122275  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18122274 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 18122244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37665640 - 37665314
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37665640 cttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37665541  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  37665540 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctgtataca 37665446  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37665445 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaaca 37665346  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37665345 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 37665314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 34622525 - 34622851
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34622525 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgga 34622624  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||    
T  34622625 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatac 34622719  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34622720 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 34622819  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622820 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 34622851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 31437471 - 31437789
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31437471 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31437570  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  31437571 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 31437665  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  31437666 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31437759  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31437760 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgag 31437789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15652912 - 15652588
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15652912 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15652813  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  15652812 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 15652718  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |    ||||||||||||||||||||||    
T  15652717 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagg 15652618  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15652617 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 15652588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 25206289 - 25206616
Alignment:
Q  18 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcat 116  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25206289 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25206388  T
Q  117 gcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac--aaa 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||| |||  |||    
T  25206389 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 25206483  T
Q  215 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25206484 acattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaa 25206582  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25206583 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 25206616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 25270445 - 25270772
Alignment:
Q  18 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcat 116  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25270445 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25270544  T
Q  117 gcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac--aaa 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||| |||  |||    
T  25270545 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 25270639  T
Q  215 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25270640 acattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaa 25270738  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25270739 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 25270772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22993270 - 22992952
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22993270 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22993171  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  22993170 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 22993076  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  22993075 aaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22992982  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22992981 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 22992952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 343
Target Start/End: Original strand, 23897886 - 23898201
Alignment:
Q  18 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |    
T  23897886 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacg 23897985  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac----aa 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| |||    ||    
T  23897986 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaa 23898080  T
Q  214 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||    
T  23898081 aacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagg 23898170  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23898171 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagt 23898201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 33783494 - 33783815
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33783494 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33783593  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  33783594 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 33783688  T
Q  212 aaaacattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| ||||||    
T  33783689 aaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaa 33783781  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33783782 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 33783815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 343
Target Start/End: Original strand, 24975861 - 24976176
Alignment:
Q  18 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24975861 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 24975960  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24975961 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaac 24976055  T
Q  217 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 314  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24976056 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 24976147  T
Q  315 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24976148 acattcaaacgaaatatgcatgagcgagt 24976176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Original strand, 24608252 - 24608570
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24608252 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24608351  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||          | || ||||||||||| ||| |||    
T  24608352 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttg-aaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtac 24608446  T
Q  212 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  24608447 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 24608539  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 339  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24608540 cagggtacattcaaacaaaacatgcatgagc 24608570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 30940643 - 30940963
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30940643 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 30940742  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  30940743 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttg-aaattct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 30940837  T
Q  212 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||    
T  30940838 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 30940929  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30940930 cagggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagt 30940963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 12036 - 12360
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12036 cttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12135  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |    
T  12136 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatata 12230  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 12330  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 12360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28356176 - 28355845
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356176 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 28356077  T
Q  105 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||    
T  28356076 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttt--cttctactttcaaagc 28355979  T
Q  205 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355978 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 28355879  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355878 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 28355845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 9360622 - 9360946
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360622 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9360721  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9360722 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 9360816  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360817 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 9360916  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360917 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 9360946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 31360528 - 31360849
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360528 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 31360627  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||     
T  31360628 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 31360722  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360723 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 31360822  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31360823 ggtacattcaaatgaaacatgcatgag 31360849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 33248366 - 33248690
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248366 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33248465  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  33248466 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 33248560  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248561 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 33248660  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248661 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 33248690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31484087 - 31483761
Alignment:
Q  14 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 113  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484087 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 31483988  T
Q  114 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  31483987 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 31483890  T
Q  214 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31483889 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaagg 31483790  T
Q  314 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31483789 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgag 31483761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12086947 - 12086614
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12086947 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 12086848  T
Q  105 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||    
T  12086847 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagc 12086753  T
Q  205 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12086752 tgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaagcctg 12086653  T
Q  304 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12086652 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgag 12086614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 29835317 - 29835647
Alignment:
Q  7 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835317 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29835416  T
Q  107 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||    
T  29835417 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttt-----cttctactttcaaagcta 29835511  T
Q  207 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835512 tatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 29835611  T
Q  307 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835612 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 29835647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 19680436 - 19680772
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680436 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 19680535  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||    
T  19680536 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttc 19680629  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19680630 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 19680729  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19680730 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgag 19680772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 18796706 - 18797032
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18796706 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 18796805  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18796806 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 18796900  T
Q  212 aaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796901 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 18797000  T
Q  311 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797001 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 18797032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 33264731 - 33265055
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33264731 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33264830  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||     
T  33264831 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatacg 33264924  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264925 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33265024  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33265025 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 33265055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 18715480 - 18715807
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18715480 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18715579  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  18715580 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 18715673  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715674 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 18715773  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715774 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 18715807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 15773574 - 15773899
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15773574 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15773673  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||| |||||||||||    
T  15773674 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcagagctatataca 15773768  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773769 aaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 15773868  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773869 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 15773899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19202592 - 19202266
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagt-ttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202592 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 19202493  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||                ||||    
T  19202492 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat---------------tttc 19202409  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19202408 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 19202309  T
Q  300 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19202308 cctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 19202266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21342381 - 21342061
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21342381 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 21342282  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||||||||    
T  21342281 ccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaaca 21342187  T
Q  218 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342186 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 21342087  T
Q  317 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21342086 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 21342061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 44566980 - 44567308
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| ||||||||||||||  || || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44566980 cttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 44567079  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  44567080 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 44567173  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567174 aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 44567273  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44567274 acagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgag 44567308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 16260216 - 16260480
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16260216 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 16260315  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  16260316 cgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 16260410  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260411 atatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19911374 - 19911052
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19911374 aattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 19911275  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa--c 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| |||||||  |    
T  19911274 cttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttc----ctttttactttcaaagctatgtacaaaaaac 19911180  T
Q  217 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19911179 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggta 19911080  T
Q  316 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911079 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 19911052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27603135 - 27602804
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603135 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 27603036  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||    
T  27603035 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttca 27602941  T
Q  201 aagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 297  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||        ||||||||||||    
T  27602940 aagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt--------ttttgaaaagca 27602849  T
Q  298 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27602848 aacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 27602804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22075141 - 22074820
Alignment:
Q  18 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22075141 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 22075042  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac---aaa 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||| |||   |||    
T  22075041 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaa 22074947  T
Q  215 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  22074946 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttg-aaagcaagcatgagcaacaaggt 22074848  T
Q  315 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22074847 acattcaaacgaaacgtgcatgagcgag 22074820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19655560 - 19655237
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19655560 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19655461  T
Q  111 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 210  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| ||    
T  19655460 agtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgta 19655366  T
Q  211 c-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||| ||||||||||||||||    
T  19655365 caaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagca 19655273  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  19655272 acagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagt 19655237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 19694095 - 19694417
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19694095 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 19694194  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||          | || ||||||||||| ||| |||    
T  19694195 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtac 19694289  T
Q  212 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  19694290 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 19694383  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19694384 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 19694417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2131478 - 2131158
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2131478 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2131379  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 211  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  2131378 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgtaca 2131284  T
Q  212 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||||||    
T  2131283 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaac 2131191  T
Q  310 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2131190 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 2131158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 22138906 - 22139226
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22138906 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 22139005  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||    
T  22139006 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtac 22139100  T
Q  212 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |        ||||| ||||||||| |||||||    
T  22139101 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaa 22139191  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22139192 cagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagt 22139226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 343
Target Start/End: Original strand, 14569194 - 14569480
Alignment:
Q  51 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569194 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 14569293  T
Q  151 tgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aa 243  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  14569294 tgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaa 14569388  T
Q  244 tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14569389 tgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 14569480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 3647148 - 3647473
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3647148 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 3647247  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  3647248 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 3647343  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647344 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 3647443  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647444 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 3647473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 10968667 - 10968993
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968667 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10968766  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  10968767 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 10968863  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968864 aaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 10968963  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968964 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 10968993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 51644215 - 51644549
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51644215 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 51644314  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  51644315 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagct 51644411  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644412 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctga 51644511  T
Q  305 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  51644512 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 51644549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Original strand, 10951100 - 10951419
Alignment:
Q  20 attcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcc 119  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10951100 attcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcc 10951199  T
Q  120 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacatt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951200 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatatacaaaacatt 10951296  T
Q  220 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 319  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10951297 ttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacatt 10951396  T
Q  320 caaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  10951397 caaacgaaacatgcataagcgag 10951419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 28591084 - 28591409
Alignment:
Q  12 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591084 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 28591183  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||    
T  28591184 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatac 28591278  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591279 aaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28591378  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591379 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 28591409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 28155728 - 28156055
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28155728 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28155827  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28155828 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 28155921  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155922 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 28156021  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156022 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 28156055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41787565 - 41787238
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41787565 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 41787466  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  41787465 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 41787372  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787371 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 41787272  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787271 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 41787238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20334683 - 20334343
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20334683 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagccttgt 20334584  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||        | |||||||||||    
T  20334583 aaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttctactttca 20334489  T
Q  201 aagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagc 296  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  20334488 aagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagc 20334390  T
Q  297 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334389 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 20334343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16202294 - 16201956
Alignment:
Q  8 ctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 107  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16202294 ctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 16202195  T
Q  108 tggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctat 207  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || |||||||||||| ||    
T  16202194 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagccat 16202100  T
Q  208 atac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaaagca 297  Q
     |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||| ||||||    
T  16202099 gtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctattttg-aaagca 16202001  T
Q  298 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16202000 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 16201956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Original strand, 20466785 - 20467113
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20466785 aattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 20466884  T
Q  119 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa--c 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||| |||||||||||||| |||||||  |    
T  20466885 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttccactttcaaagctatgtacaaaaacc 20466979  T
Q  217 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt--------gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||         |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20466980 attttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctattttg-aaagcaaacctgagcag 20467078  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20467079 caaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagt 20467113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21892014 - 21891690
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892014 gaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 21891915  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||||  ||       
T  21891914 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta--------ctttcttttt--- 21891827  T
Q  201 aagctatatacaa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 297  Q
        ||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      || | ||||||||||||    
T  21891826 ----tatgttcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----aagttttttttgaaaagca 21891735  T
Q  298 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21891734 aacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 21891690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3108
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3447 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 3348  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||    
T  3347 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttca 3250  T
Q  201 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3249 aagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaac 3150  T
Q  301 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3149 ctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgag 3108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 189 - 342
Target Start/End: Original strand, 17980 - 18133
Alignment:
Q  189 cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17980 cttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattt 18079  T
Q  289 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18080 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgag 18133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 15562 - 15901
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15562 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 15661  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  15662 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 15756  T
Q  206 atatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagca 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15757 atatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagca 15856  T
Q  298 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15857 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 15901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9895 - 9571
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9895 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9796  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9795 tcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 9701  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9700 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 9601  T
Q  313 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9600 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 13942 - 14275
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13942 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 14041  T
Q  105 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||    
T  14042 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagc 14136  T
Q  205 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  14137 tgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctg 14236  T
Q  304 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14237 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgag 14275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9182 - 8858
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9182 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9083  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9082 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 8989  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8988 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacag 8889  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8888 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 8858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 1645 - 1982
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1645 gaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 1744  T
Q  100 tgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||||||||    
T  1745 taaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttctactttc 1838  T
Q  200 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1839 aaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagcaa 1938  T
Q  299 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1939 acctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgag 1982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12382
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12034 gaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 12133  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaa-tttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc 199  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||||||||||    
T  12134 aaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctatctttctactttc 12228  T
Q  200 aaagctat-----------atacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctatt 287  Q
    ||||||||           | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12229 aaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatt 12328  T
Q  288 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12329 ttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 12382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 9914 - 10238
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9914 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaag 10013  T
Q  113 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  10014 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 10107  T
Q  213 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10108 aaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10207  T
Q  312 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10208 ggtacattcaaatgaaacatgcataagcgag 10238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 33297 - 33620
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33297 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 33396  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  33397 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtac 33491  T
Q  212 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaa 308  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||    
T  33492 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaa 33586  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33587 cagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagt 33620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 18585 - 18912
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18585 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 18684  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 211  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18685 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 18778  T
Q  212 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18779 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 18878  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 18912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4860 - 4531
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4860 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4761  T
Q  111 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 210  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||    
T  4760 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatata 4666  T
Q  211 caaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4665 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaa 4566  T
Q  309 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4565 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 4531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 25103 - 25448
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25103 gaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgt 25202  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttca 200  Q
     ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||        | |||||||||||    
T  25203 aaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttca 25297  T
Q  201 aagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------ctttttgtctattttg 290  Q
    ||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||| |||||    
T  25298 aagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgttttg 25397  T
Q  291 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 342  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25398 -aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 25448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 6066 - 6389
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6066 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 6165  T
Q  112 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatat-- 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |      
T  6166 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgttc 6260  T
Q  210 acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 307  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||    
T  6261 aaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagca 6353  T
Q  308 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6354 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Original strand, 370 - 537
Alignment:
Q  6 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  370 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 469  T
Q  106 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  470 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25150 - 24834
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25150 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 25051  T
Q  118 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  25050 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaac 24956  T
Q  217 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 314  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24955 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggt 24862  T
Q  315 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 343  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24861 acattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 24834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26399 - 26243
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26399 gaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaagctttgt 26300  T
Q  101 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 157  Q
     |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26299 aaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcct 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 339
Target Start/End: Original strand, 1 - 109
Alignment:
Q  231 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  330 atgcatgagc 339  Q
    ||||||||||    
T  100 atgcatgagc 109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 40898 - 40759
Alignment:
Q  19 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgtt-caat-gtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggag 112  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  40898 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggag 40799  T
Q  113 tcatgcctttggct-gaccaccactcttatacatcaattt 151  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40798 tcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40558
Alignment:
Q  296 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagt 40558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University