View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16754_low_8 (Length: 521)

Name: NF16754_low_8
Description: NF16754
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16754_low_8
NF16754_low_8
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-505)||(2444-2948)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (1-505)||(27717404-27717908)
chr6 (1-505)||(27610025-27610529)
chr6 (1-505)||(31285332-31285836)
chr6 (1-505)||(28787011-28787515)
chr6 (1-505)||(27603609-27604113)
chr6 (1-505)||(28793132-28793636)
chr6 (1-505)||(27591926-27592430)
chr6 (1-505)||(27676525-27677029)
chr6 (16-505)||(27679738-27680227)
chr6 (1-349)||(28781874-28782222)
chr6 (1-505)||(26624044-26624548)
chr6 (1-505)||(26730021-26730525)
chr6 (1-505)||(27426517-27427021)
chr6 (1-481)||(27530233-27530710)
chr6 (1-505)||(26884843-26885344)
chr6 (1-505)||(26803219-26803723)
chr6 (1-505)||(26656738-26657239)
chr6 (1-505)||(26762709-26763210)
chr6 (1-505)||(26647252-26647756)
chr6 (1-505)||(26753220-26753724)
chr6 (1-473)||(26143641-26144113)
chr6 (1-505)||(26862353-26862857)
chr6 (1-505)||(27337000-27337504)
chr6 (1-505)||(27397740-27398244)
chr6 (1-505)||(27697491-27697995)
chr6 (1-473)||(25483832-25484304)
chr6 (1-487)||(26056695-26057181)
chr6 (1-470)||(25580495-25580964)
chr6 (1-487)||(25511665-25512150)
chr6 (1-487)||(26076665-26077151)
chr6 (1-473)||(25539316-25539788)
chr6 (263-505)||(27705159-27705401)
chr6 (1-481)||(25492248-25492728)
chr6 (203-500)||(26824794-26825091)
chr6 (1-322)||(27215225-27215546)
chr6 (1-265)||(27705549-27705813)
chr6 (195-335)||(28326445-28326585)
chr6 (195-335)||(28504081-28504221)
chr6 (437-505)||(26636855-26636923)
chr6 (437-505)||(26742821-26742889)
chr6 (437-505)||(26960334-26960402)
chr6 (439-505)||(27664119-27664185)
chr6 (208-505)||(26950723-26951020)
chr6 (437-505)||(26849921-26849989)
chr6 (373-487)||(27215597-27215711)
chr6 (437-505)||(25075076-25075144)
chr6 (1-81)||(28140308-28140388)
chr6 (203-335)||(28227927-28228059)
chr6 (249-313)||(28240375-28240439)
chr6 (211-335)||(28243778-28243902)
chr6 (175-505)||(26812475-26812805)
chr6 (394-500)||(28140701-28140807)
chr6 (205-335)||(29826963-29827093)
chr6 (195-314)||(28182085-28182204)
chr6 (272-314)||(25074911-25074953)
chr6 (195-404)||(28235532-28235741)
chr6 (460-505)||(28244027-28244072)
chr6 (1-81)||(26824592-26824672)
chr6 (8-79)||(26950523-26950594)
chr6 (283-314)||(26976006-26976037)
chr6 (267-310)||(27664305-27664348)
chr6 (438-505)||(28326688-28326755)
chr6 (438-505)||(28504324-28504391)
chr6 (279-314)||(31289320-31289355)
chr6 (460-502)||(26978612-26978654)
chr6 (283-312)||(26849767-26849796)
chr6 (460-505)||(28186626-28186671)
chr6 (460-505)||(28296645-28296690)
chr6 (460-505)||(28515383-28515428)
chr6 (8-44)||(25074647-25074683)
chr6 (195-231)||(28490735-28490771)
chr6 (247-299)||(29477176-29477228)
chr6 (33-77)||(29674432-29674476)
chr6 (195-231)||(29803145-29803181)
chr6 (9-57)||(29843340-29843388)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-505)||(3617-4121)
scaffold0277 (1-505)||(12580-13084)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-505)||(8260-8764)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (1-505)||(18678461-18678965)
chr4 (1-505)||(18698301-18698805)
chr4 (1-505)||(18722986-18723490)
chr4 (1-505)||(18654378-18654882)
chr4 (1-505)||(18730405-18730909)
chr4 (1-505)||(18074534-18075038)
chr4 (376-505)||(18688527-18688656)
chr4 (136-500)||(5089860-5090224)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-505)||(60342-60846)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (1-505)||(29272743-29273247)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1-505)||(267245-267749)
chr1 (1-505)||(28126580-28127084)
chr1 (1-488)||(28163298-28163784)
chr1 (372-500)||(26137032-26137160)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (277-505)||(17992120-17992348)
chr2 (1-80)||(3280432-3280511)
chr2 (439-479)||(17713508-17713548)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (265-332)||(16691904-16691971)
chr5 (9-57)||(16691648-16691696)
[»] scaffold0038 (5 HSPs)
scaffold0038 (203-335)||(28425-28557)
scaffold0038 (249-313)||(40537-40601)
scaffold0038 (211-335)||(43940-44064)
scaffold0038 (195-404)||(35694-35903)
scaffold0038 (460-505)||(44189-44234)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (195-314)||(57390-57509)


Alignment Details
Target: scaffold0349 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 2948 - 2444
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2948 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatc 2849  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  2848 ttcagttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaa 2749  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2748 ggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattacc 2649  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2648 actcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 2549  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2548 cttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttc 2449  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  2448 taact 2444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27717908 - 27717404
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27717908 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatc 27717809  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  27717808 ttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaa 27717709  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27717708 ggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattacc 27717609  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27717608 actcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 27717509  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27717508 cttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttc 27717409  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  27717408 taact 27717404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27610529 - 27610025
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27610529 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatc 27610430  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  27610429 ttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaa 27610330  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27610329 ggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgcc 27610230  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  |||  ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27610229 actcgagacaaacacttgctaacctgtcatgggataaaaagtatgcataaagtggaagggctgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 27610130  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27610129 cttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaaccgtgctgttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttc 27610030  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  27610029 taact 27610025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 31285332 - 31285836
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  31285332 cttgcaagagcaatctataattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatc 31285431  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| ||  | | ||||||||||| |    |||||||||||||||| |    || |||||||||||   |  ||||||    
T  31285432 tccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaa 31285531  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31285532 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 31285631  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31285632 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 31285731  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31285732 cttttaaaagtgacaaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatattcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 31285831  T
Q  501 aaact 505  Q
    |||||    
T  31285832 aaact 31285836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 28787011 - 28787515
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28787011 cttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatc 28787110  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28787111 tccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaa 28787210  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28787211 gactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacg 28787310  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  28787311 actcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatgg 28787410  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  28787411 cttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcttatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttc 28787510  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  28787511 caact 28787515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27604113 - 27603609
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27604113 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatc 27604014  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27604013 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaa 27603914  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||  | |||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  27603913 gattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggggcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcattacc 27603814  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||  ||| |||| |   ||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27603813 actcgagacagacacttactaaccagtcatgatatagaaagaaagtatgcattagaagggttgtgtaggacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 27603714  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  27603713 cttttaagaataacaaagtaccttcagtttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttttggaagtagtgggttc 27603614  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  27603613 caact 27603609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 28793132 - 28793636
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  28793132 cttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatc 28793231  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28793232 tccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaa 28793331  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28793332 gattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacg 28793431  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  28793432 actcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatgg 28793531  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  28793532 cttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcgtatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttc 28793631  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  28793632 caact 28793636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27592430 - 27591926
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||| |||    
T  27592430 cttgcgaaagcaatttataactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatc 27592331  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| || | |||||||||||||| |||  ||||||    
T  27592330 tccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaa 27592231  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  27592230 gattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagatgctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcacc 27592131  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| ||||||||||||    ||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27592130 acccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggaagg 27592031  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27592030 cttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttc 27591931  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  27591930 taact 27591926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27677029 - 27676525
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||| |||    
T  27677029 cttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatc 27676930  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| || | |||||||||||||| |||  ||||||    
T  27676929 tccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaa 27676830  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||  | |||||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||||||||| |||    
T  27676829 gattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggctttggctggaagactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcacc 27676730  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| ||||||||||||    ||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27676729 acccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggaagg 27676630  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27676629 cttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttc 27676530  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  27676529 taact 27676525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 16 - 505
Target Start/End: Original strand, 27679738 - 27680227
Alignment:
Q  16 tataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatctccaggaggagctcc 115  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  27679738 tataattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctccaagagaagctcc 27679837  T
Q  116 ttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattct 215  Q
    |||||||||||       | ||||||||||| |    |||||||||||||||| |    |||||||||||  |   |  |||||||||||||||||||||    
T  27679838 ttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattct 27679937  T
Q  216 cgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacac 315  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27679938 cgatgatgttgacaatttgaagcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagac 27680037  T
Q  316 ttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgata 415  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27680038 ttactaagcagtcatggcatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgata 27680137  T
Q  416 aagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27680138 aagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttttggccttccgttagttttagaagtagtgggttctaact 27680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 28781874 - 28782222
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28781874 cttgtaaaagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatc 28781973  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28781974 tccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaa 28782073  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28782074 gactcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacc 28782173  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  28782174 actcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacgcatg 28782222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 26624044 - 26624548
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  26624044 cttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatc 26624143  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||  |  | | ||||||||||| |    ||||||||||||||||||    || |||||||||||   |  ||||||    
T  26624144 tccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaa 26624243  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  26624244 gattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattacc 26624343  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||| ||||||||||    
T  26624344 actcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatgg 26624443  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  26624444 cttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttc 26624543  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  26624544 caact 26624548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 26730021 - 26730525
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  26730021 cttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatc 26730120  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||  |  | | ||||||||||| |    ||||||||||||||||||    || |||||||||||   |  ||||||    
T  26730121 tccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaa 26730220  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  26730221 gattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattacc 26730320  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||| ||||||||||    
T  26730321 actcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatgg 26730420  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  26730421 cttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttc 26730520  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  26730521 caact 26730525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27427021 - 27426517
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||   |||||| |     
T  27427021 cttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtt 27426922  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||    |||||||||||| ||  |  ||||||    
T  27426921 tccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaa 27426822  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  27426821 gattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcacc 27426722  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| ||||||||||||    |||||| |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27426721 acccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 27426622  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  27426621 cttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttc 27426522  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  27426521 taact 27426517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 27530710 - 27530233
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| ||||  |||||||||    
T  27530710 cttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttctagaaaatgtgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatc 27530611  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| ||  | | || |||||||| |||||||||||| |||||||| |    || ||| |||||||   |  ||||||    
T  27530610 tccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgttagtcagggaattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaa 27530511  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||     
T  27530510 gattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggccttggctggaggacttgattggttcggtcctgggagtagagtcatcattact 27530411  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27530410 actcgaaacaaacacttactaaagattcatgggatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgcgacagaagctctcgaattgttgaggtggatgg 27530311  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattag 481  Q
    |||| |||   || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  27530310 ctttcaaa---gaaaatgttccttcaagtcatgaagacattttaaaccgtgcacttacttatgcttctggccttccattag 27530233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 26884843 - 26885344
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   |||||  |||||||||    
T  26884843 cttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataacttgaaacatc 26884942  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || || |  | |||||||| |||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||| || |||  ||||||    
T  26884943 tccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactacatagaaagaa 26885042  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  26885043 gattcttttgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattacc 26885142  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||| || |||||||||||||   | ||| || || | || ||| ||| |||||||||| |  ||||||  |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  26885143 actcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacatatgaagtagaagggatatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctgg 26885242  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    | ||||||   || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26885243 cctttaaa---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttc 26885339  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  26885340 caact 26885344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 26803219 - 26803723
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  26803219 cttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatc 26803318  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||||  |  | |  |||| ||||| |    |||| ||||||| ||| |   |||||||||||| |||  |  ||| ||    
T  26803319 tccaagagaagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataa 26803418  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26803419 gattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattacc 26803518  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||||||  ||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26803519 actcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 26803618  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  26803619 cttttaaaaataacaaagtaccttcaagttatgaagacattttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggtcttcccttagttttagagatagtgggttc 26803718  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  26803719 caact 26803723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 26656738 - 26657239
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||   |||||  |||||||||    
T  26656738 cttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatc 26656837  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||  | |  | |||||||| |||| |||||||||||||||| |    ||||||||||| ||   |  ||||||    
T  26656838 tccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaa 26656937  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26656938 gattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattacc 26657037  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||| |||| |||||||| ||||   |||| |||||| |||  ||| |||| ||| ||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  26657038 actagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatgg 26657137  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    |||||   || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  26657138 ctttt---agagacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttc 26657234  T
Q  501 aaact 505  Q
    |||||    
T  26657235 aaact 26657239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 26762709 - 26763210
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||   |||||  |||||||||    
T  26762709 cttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatc 26762808  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||  | |  | |||||||| |||| |||||||||||||||| |    ||||||||||| ||   |  ||||||    
T  26762809 tccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaa 26762908  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26762909 gattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattacc 26763008  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||| |||| |||||||| ||||   |||| |||||| |||  ||| |||| ||| ||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  26763009 actagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatgg 26763108  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    |||||   || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  26763109 ctttt---agagacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttc 26763205  T
Q  501 aaact 505  Q
    |||||    
T  26763206 aaact 26763210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 26647252 - 26647756
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||   |||||  |||||||||    
T  26647252 cttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatc 26647351  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || || |  | ||||||||||||  | || ||||||||||| |    || |||||||||||   |  ||||||    
T  26647352 tccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaa 26647451  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  26647452 gattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcacc 26647551  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26647552 acccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 26647651  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    | ||||| | | | ||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26647652 cgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttc 26647751  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  26647752 caact 26647756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 26753220 - 26753724
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||   |||||  |||||||||    
T  26753220 cttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatc 26753319  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || || |  | ||||||||||||  | || ||||||||||| |    || |||||||||||   |  ||||||    
T  26753320 tccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaa 26753419  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  26753420 gattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcacc 26753519  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26753520 acccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 26753619  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    | ||||| | | | ||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26753620 cgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttc 26753719  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  26753720 caact 26753724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Original strand, 26143641 - 26144113
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||  |||||||||    
T  26143641 cttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatc 26143740  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaat-taagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaaga 199  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| || || |||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||    || |||||||| ||   |  |||||    
T  26143741 tccaggaagatctccttttaagaacagttaaa-ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaaga 26143839  T
Q  200 agattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattac 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  26143840 agattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagggtcatcattac 26143939  T
Q  300 cactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatg 399  Q
    |||||| || ||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||    
T  26143940 cactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatg 26144039  T
Q  400 gcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 473  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  26144040 gcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaaattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 26144113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 26862353 - 26862857
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |   |||||||||| | || ||||||||||||||| ||   ||||   |||||||||    
T  26862353 cttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattcaactcataatagcttgaaacatc 26862452  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaaga 199  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| | | |||||||||||| ||  ||  || ||    
T  26862453 tccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaa-ttgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttataaaggaaagactaaatagaatga 26862551  T
Q  200 agattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||  | || || |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  26862552 agattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggaacagctagaggcattagctggaggacttgattggtttggtcatggaagtagagtcatcattac 26862651  T
Q  300 cactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatg 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |  ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  26862652 cactcgagataaacacttactaacatgccatgggatagaaagaacatatgcggtaaacgggctacatgagacagaagcttttgaattgttgaggtggatg 26862751  T
Q  400 gcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggtt 499  Q
    |||||||||| || | ||||||||||  ||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||    
T  26862752 gcttttaaaaatggtgaagttccttcgagttataacgatgttttaaaccgtgcagttgcatatgcttccggccttccgttagttctcgaaatagtgggtt 26862851  T
Q  500 caaact 505  Q
    | ||||    
T  26862852 ctaact 26862857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27337504 - 27337000
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||| |||||| | |||||||||||||||||||||   || ||  |||||||||    
T  27337504 cttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatc 27337405  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||  ||| ||||  |||||||||| |    || |||||||||||   |   |||||    
T  27337404 tccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtaggaagaa 27337305  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  27337304 gattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcacc 27337205  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| |  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27337204 acccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacgg 27337105  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | | ||||| ||  || |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  27337104 cttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaaccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttc 27337005  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  27337004 taact 27337000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27398244 - 27397740
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||| |||||| | |||||||||||||||||||||   || ||  |||||||||    
T  27398244 cttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatc 27398145  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||  ||| ||||  |||||||||| |    || |||||||||||   |   |||||    
T  27398144 tccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtaggaagaa 27398045  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  27398044 gattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcacc 27397945  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| |  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27397944 acccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacgg 27397845  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | | ||||| ||  || |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  27397844 cttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaaccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttc 27397745  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  27397744 taact 27397740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27697995 - 27697491
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||| |||  ||||||||||  ||||||  || ||||||    
T  27697995 cttgcaagagcaatctataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatgtgagaatgaattcagctaaaaataacttggaacatc 27697896  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||  |  |   |||||||| || |    ||||||||| |||||| |    || |||||||||||   |  ||||||    
T  27697895 tccaagagaagctcctttttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaa 27697796  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| |||    
T  27697795 gattcttttgattctcgacgatgttgacaaactggatcagctacaggctttggctggaggactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcacc 27697696  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| ||||||||||||     |||||||||| |||  ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27697695 acccgagataaacacttactagaccatcatgggatagaaaaaacgtatgcagtaaaagggttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 27697596  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27697595 cttttaaaagtgacaatgttccatcaaggtacaaagagattttaagtcgtgcagtttcatatgtttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttc 27697496  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  27697495 taact 27697491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Original strand, 25483832 - 25484304
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||  |||||||||    
T  25483832 cttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatc 25483931  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||  ||  |||||||| ||||| | || || ||||   |||||| | || |||||||||||||||  |    ||||||||||| ||   |  ||||||    
T  25483932 tccaaaagatgctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcataaaggaaagactatctagaaagaa 25484031  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25484032 gattcttttgattgttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattacc 25484131  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||| || ||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  25484132 actcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatgg 25484231  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 473  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  25484232 cttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 25484304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 487
Target Start/End: Original strand, 26056695 - 26057181
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||   || ||  |||||||||    
T  26056695 cttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatc 26056794  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| | || || ||||   | |||| | || |||||||||||||||  |   |||||||||||| ||   |  ||||||    
T  26056795 tccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaa 26056894  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26056895 gattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattacc 26056994  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||| || |||| |||||||     ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||  | |  |    
T  26056995 actcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatg 26057094  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatag 487  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  26057095 cttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatag 26057181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 470
Target Start/End: Original strand, 25580495 - 25580964
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||| ||||  |   |||||  |||||||||    
T  25580495 cttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttcaattcttaataacttgaaacatc 25580594  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||  |  | |||||||||| || | || || || |  ||||||| | || ||||||||||||||||||    || |||||||| ||   |  ||||||    
T  25580595 tccattattatctccttttaataatagttaaattttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaa 25580694  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  25580695 gattcttttgatttttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagtgtcatcattacc 25580794  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||| || ||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  25580795 actcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatgg 25580894  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctgg 470  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  25580895 cttttaaaaatgacaaagttccttcaatttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctgg 25580964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 487
Target Start/End: Original strand, 25511665 - 25512150
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||   || ||  |||||||||    
T  25511665 cttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatc 25511764  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| | || || ||||   | || | | || |||||||||||||||  |   |||||||||||| ||   |  ||||||    
T  25511765 tccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaa 25511864  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  || | || ||  | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25511865 gattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgactggttcggtcctggaagcagagtcatcattacc 25511964  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||| || ||||||||||||    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   ||||| ||| | ||||    
T  25511965 actcgtgataaacacttactagcctgtcatgg-attacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagatagaagctcttattttgttgaggcgaatgg 25512063  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatag 487  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  25512064 cttttaaacatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatag 25512150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 487
Target Start/End: Original strand, 26076665 - 26077151
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||   || ||  |||||||||    
T  26076665 cttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatc 26076764  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| | || || ||||   | || | | || |||||||||||||||  |   |||||||||||| ||   |  ||||||    
T  26076765 tccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaa 26076864  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26076865 gattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattacc 26076964  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||| || |||| |||||||     ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||  | |  |    
T  26076965 actcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatg 26077064  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatag 487  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  26077065 cttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatag 26077151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Original strand, 25539316 - 25539788
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||     |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||  |||||||||    
T  25539316 cttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaagttgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacttgaaacatc 25539415  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||  || ||||||||| ||||| | || || ||||   |||||| | || |||||||||||||||  |    ||||||||||| ||   |  ||||||    
T  25539416 tccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataacaatcataaaggaaagactatctaaaaagaa 25539515  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |  | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25539516 gattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcattacc 25539615  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||| || | ||| ||| ||    |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  25539616 actcgtgatacacatttattagcctgtcatgggattacaagtacacatgtagtaaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatgg 25539715  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 473  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  25539716 cgtttaaaaatgacaaagttccttcgagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 25539788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 263 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27705401 - 27705159
Alignment:
Q  263 ttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggtt 362  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||     |||| ||||| |||  ||| || |||||||||||||    
T  27705401 ttgattggtttggccctggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttactagcctctcataggatagaaaaaacatatccagtagaagggtt 27705302  T
Q  363 gaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatat 462  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27705301 gaatgggatagatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatat 27705202  T
Q  463 gcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  27705201 gcttctggccttccgttagttttagaagtaatgggttctaact 27705159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25492728 - 25492248
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||| | | |||| |||||||||||| || |||  ||  ||||| |||    
T  25492728 cttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgagagagaattcaactccaagaaacttgaaagatc 25492629  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||  | |||||||  ||||   ||  | | || ||||||||  || ||||||||||||||||| |    |||||  || | ||   |  | ||||    
T  25492628 tccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaagaagtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaggactatgtagagagaa 25492529  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   || | || ||  | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  25492528 gattcttttgattctcgatgatgttgacagactggagcagctagaggatttggctgaaggacttgattggttcggtcgtggaagcggagttatcattacc 25492429  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  25492428 actcgagacaaacacatactaaccagtcatgggatagaaagtatgcatgcagtagaagagttgcatggggaagaagctcttgaattgcttatgtggatgg 25492329  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattag 481  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  25492328 cttttaaaaatgacagagttccttcaatttatgaagacattttaacacttgcaattacctatgcttctggccttccattag 25492248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 203 - 500
Target Start/End: Original strand, 26824794 - 26825091
Alignment:
Q  203 ttcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccac 302  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||  || | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||    
T  26824794 ttcttctgattctcgatgacattgacaaactggagcaactagatgctttggctggaggatttgattggttcggtaatggcagcagagtcatcattacaac 26824893  T
Q  303 tcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggct 402  Q
    |||||||||||| ||||| |  | ||||| |||| ||   |   ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26824894 tcgagacaaacaattacttaccaatcatgagatagaattaatgtatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttaaggtggatggct 26824993  T
Q  403 tttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | ||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  26824994 tttaaaaataacaaagtaccgtcaagttatgaacacattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtattagaaatagtgggttc 26825091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 27215225 - 27215546
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||| |||| | |||||||||| ||| ||||||  ||||||| |    
T  27215225 cttgcaaaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtgaaagagaattcaactttaaataacttgaaacacc 27215324  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    | |||||  || ||||| | |||||  ||  | | ||   |||||| ||||||||||||||||| ||| |  | |||||  ||| |||   |  ||||||    
T  27215325 tgcaggaaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttaggaggtgttagtgaggggattacaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaa 27215424  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |  | || ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||     
T  27215425 gattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatcattacg 27215524  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaa 322  Q
    |||||| ||| ||| |||||||    
T  27215525 actcgaaacagacagttactaa 27215546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27705813 - 27705549
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| |  |||||||||    
T  27705813 cttgcaagagcaatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatc 27705714  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||||  |  |    |||| ||||| |    |||| ||||||| ||| |    |||||||||||||||  |  ||||||    
T  27705713 tccaagagaagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtgaggggattccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaa 27705614  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27705613 gattcttttgattctcgatgatgttgacgataggaagcaactgcatgctttggctgggggacttg 27705549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 335
Target Start/End: Original strand, 28326445 - 28326585
Alignment:
Q  195 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatc 294  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| || |  |||| ||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||    
T  28326445 aaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatc 28326544  T
Q  295 attaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggat 335  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||    
T  28326545 gttaccactcgagacaaacatttgctaaaaagtcacgggat 28326585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 335
Target Start/End: Original strand, 28504081 - 28504221
Alignment:
Q  195 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatc 294  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| || |  |||| ||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||    
T  28504081 aaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatc 28504180  T
Q  295 attaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggat 335  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||    
T  28504181 gttaccactcgagacaaacatttgctaaaaagtcacgggat 28504221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 437 - 505
Target Start/End: Original strand, 26636855 - 26636923
Alignment:
Q  437 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  26636855 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaact 26636923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 437 - 505
Target Start/End: Original strand, 26742821 - 26742889
Alignment:
Q  437 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  26742821 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaact 26742889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 437 - 505
Target Start/End: Original strand, 26960334 - 26960402
Alignment:
Q  437 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  26960334 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaact 26960402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 439 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27664185 - 27664119
Alignment:
Q  439 attttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  27664185 attttaaaccgtgcagttgaatatgcttctggccttccattagctttaaaagtagtgggttccaact 27664119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 505
Target Start/End: Original strand, 26950723 - 26951020
Alignment:
Q  208 ttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgag 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| || | | ||||  |||||  | || |||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26950723 ttgattctcgatgatgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgattggagagcctggttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgtg 26950822  T
Q  308 acaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaa 407  Q
    ||||||| ||  ||    |||||||||| ||||  | | ||| || ||| || || |||  |    |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  26950823 acaaacatttgttatcatgtcatgggattaaaaaaatatatgaagcagatggtttaaataaggaacaagctcttgaattgttaagaatgatggcttttaa 26950922  T
Q  408 aagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    |||| | |||  |  |||| | || ||    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  26950923 aagtaacaaaaatgattcaaggtatgatagtattttaaaccgtgcagttaaatatgctgctggccttccattagctttagaagtagtgggttctaact 26951020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 505
Target Start/End: Original strand, 26849921 - 26849989
Alignment:
Q  437 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  26849921 acattttaaatcgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaact 26849989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 487
Target Start/End: Original strand, 27215597 - 27215711
Alignment:
Q  373 gaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcc 472  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||| || | ||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||| || | |||| ||||||||    
T  27215597 gaagctcataaattgttgaggttgatggcatttaaaaatggtgaagttccttcaagttatgaaggcatttttaatcgtgcacttacttatgtttctggcc 27215696  T
Q  473 ttccattagttatag 487  Q
    ||||||||| |||||    
T  27215697 ttccattagctatag 27215711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 505
Target Start/End: Original strand, 25075076 - 25075144
Alignment:
Q  437 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  25075076 acattttaaaccgtgcaattaaatatgcttctggccttccattagctttagaagttgtgggttccaact 25075144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 28140308 - 28140388
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagct 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| | ||||| ||||| | |||||||    
T  28140308 cttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtgagagaaatttcagct 28140388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 28227927 - 28228059
Alignment:
Q  203 ttcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccac 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||| ||   | |||||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||| |||||||||||    
T  28227927 ttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagcaattgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccac 28228026  T
Q  303 tcgagacaaacacttactaagtagtcatgggat 335  Q
    |||| ||||||| || |||   |||||||||||    
T  28228027 tcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggat 28228059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Original strand, 28240375 - 28240439
Alignment:
Q  249 tttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaac 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28240375 tttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccactcgagacaaac 28240439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 335
Target Start/End: Original strand, 28243778 - 28243902
Alignment:
Q  211 attctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 310  Q
    ||||||||||||||| || |  |||| ||| || | | ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  28243778 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcgagaca 28243877  T
Q  311 aacacttactaagtagtcatgggat 335  Q
     ||| || ||||  |||||||||||    
T  28243878 gacatttgctaaaaagtcatgggat 28243902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 505
Target Start/End: Original strand, 26812475 - 26812805
Alignment:
Q  175 ataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcg 274  Q
    ||||| || |||||||||  ||||||  || | |||||||||||||||||||||||    || ||| || | | ||||| |||||  | || |||| |||    
T  26812475 ataaaagataggctgcatcaaaagaaagttttgttgattctcgatgatgttgacaaaccaaagcaattgaaggttttggttggagagcctggttggctcg 26812574  T
Q  275 gccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactga 374  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    ||||||||||||  || |   |||   |||| || || ||||  |  ||    
T  26812575 gtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacagacatttgctatcatgtcatgggataactagaatttatgacttagatggattaaatgacaaaga 26812674  T
Q  375 agctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcctt 474  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| ||||||||| | | | ||  |||| |||| ||  |||||||||| || |||||   |||| |||||||||||    
T  26812675 agctcttgaattgtttataaagatggcatttaaaagtaacataattgattcaagttatgattacattttaaatcgcgcagtaaaatatacttctggcctt 26812774  T
Q  475 ccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26812775 ccattagctatagaagtagtgggttccaact 26812805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 500
Target Start/End: Original strand, 28140701 - 28140807
Alignment:
Q  394 tggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtag 493  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||  |||| |||| ||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | | |||||||||    
T  28140701 tggaaggcatttaaaaataataaagttgattcaagttatgagcacattttaaaccgtgcagttacttatgcctctggccttccattggctttagaagtag 28140800  T
Q  494 tgggttc 500  Q
    | |||||    
T  28140801 ttggttc 28140807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 335
Target Start/End: Original strand, 29826963 - 29827093
Alignment:
Q  205 cttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactc 304  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||  ||| || | | | |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  29826963 cttttgattcttgacgacgttgacaacatgaggcaattgcaagttatggcgggaggacttgattggtttggtcctggcagcatagtgatcattaccactc 29827062  T
Q  305 gagacaaacacttactaagtagtcatgggat 335  Q
    ||||| |||| || ||||  |||||||||||    
T  29827063 gagaccaacatttgctaacaagtcatgggat 29827093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Original strand, 28182085 - 28182204
Alignment:
Q  195 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatc 294  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |  |||| ||| || | | ||||||||||||| |||||||||| || | ||| || | ||| |||    
T  28182085 aaagaaggttctattgattctagatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggaattgattggtttggtcctggtagtaaagtgatc 28182184  T
Q  295 attaccactcgagacaaaca 314  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28182185 attaccactcgagacgaaca 28182204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 314
Target Start/End: Original strand, 25074911 - 25074953
Alignment:
Q  272 tcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 314  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25074911 tcggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 25074953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 28235532 - 28235741
Alignment:
Q  195 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatc 294  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |  | || ||| || | | |||||| |||| | |||||||||| || | |||||| | ||| |||    
T  28235532 aaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatc 28235631  T
Q  295 attaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggt 394  Q
    |||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||  |||| ||  | | | ||||   ||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  28235632 attaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagaacgtacgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgttgaggt 28235731  T
Q  395 ggatggcttt 404  Q
    ||| ||||||    
T  28235732 ggaaggcttt 28235741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 460 - 505
Target Start/End: Original strand, 28244027 - 28244072
Alignment:
Q  460 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  28244027 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaact 28244072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 26824592 - 26824672
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagct 81  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||   |  ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  26824592 cttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgagagagaattcagct 26824672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 79
Target Start/End: Original strand, 26950523 - 26950594
Alignment:
Q  8 aagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcag 79  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  26950523 aagcagtttataacttgattgctaatcaatttgaatgcaaatgttttcttcacaatgtgagagaaaattcag 26950594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 314
Target Start/End: Original strand, 26976006 - 26976037
Alignment:
Q  283 agcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26976006 agcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 26976037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27664348 - 27664305
Alignment:
Q  267 ttggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 310  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27664348 ttggttcggtcaaggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 27664305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 505
Target Start/End: Original strand, 28326688 - 28326755
Alignment:
Q  438 cattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  28326688 cattttatactgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaact 28326755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 505
Target Start/End: Original strand, 28504324 - 28504391
Alignment:
Q  438 cattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  28504324 cattttatactgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaact 28504391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 314
Target Start/End: Original strand, 31289320 - 31289355
Alignment:
Q  279 tggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31289320 tggaagcagagtcatcattaccacttgagacaaaca 31289355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 460 - 502
Target Start/End: Original strand, 26978612 - 26978654
Alignment:
Q  460 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaa 502  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26978612 tatgcttctggtcttccattagctttagaagtagtgggttcaa 26978654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 312
Target Start/End: Original strand, 26849767 - 26849796
Alignment:
Q  283 agcagagtcatcattaccactcgagacaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26849767 agcagagtcatcattaccactcgagacaaa 26849796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 505
Target Start/End: Original strand, 28186626 - 28186671
Alignment:
Q  460 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  28186626 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaact 28186671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28296690 - 28296645
Alignment:
Q  460 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  28296690 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaact 28296645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 505
Target Start/End: Original strand, 28515383 - 28515428
Alignment:
Q  460 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  28515383 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaact 28515428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 25074647 - 25074683
Alignment:
Q  8 aagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 44  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25074647 aagcaatttataatttgattgctaatcaatttgaatg 25074683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28490771 - 28490735
Alignment:
Q  195 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaat 231  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28490771 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaat 28490735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29477228 - 29477176
Alignment:
Q  247 gctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||  |||||||    
T  29477228 gctttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagcagagttgtcattac 29477176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29674476 - 29674432
Alignment:
Q  33 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattc 77  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29674476 tcaatttgaatgttcctgttttcttgaaaaagttagagaaaattc 29674432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29803181 - 29803145
Alignment:
Q  195 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaat 231  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29803181 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaat 29803145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 29843388 - 29843340
Alignment:
Q  9 agcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttctt 57  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  29843388 agcaatttataatttgattgctgataaatttgaatgtttgtgttttctt 29843340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4121 - 3617
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4121 cttggaaaagcaatttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatc 4022  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4021 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 3922  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  | |||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3921 gattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagcagggtcatcattacc 3822  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  3821 actcgagacaaacacttgctaagaagtcatgggatagaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatgg 3722  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  3721 cttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttc 3622  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  3621 caact 3617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 13084 - 12580
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13084 cttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatc 12985  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12984 tccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaa 12885  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12884 gactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacc 12785  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || |||| || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  12784 actcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatgg 12685  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  12684 cttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttc 12585  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  12584 caact 12580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 8260 - 8764
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8260 cttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatc 8359  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8360 tccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaa 8459  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8460 gactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacc 8559  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || |||| || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  8560 actcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatgg 8659  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  8660 cttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttc 8759  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  8760 caact 8764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18678965 - 18678461
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18678965 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatc 18678866  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18678865 tccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaa 18678766  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18678765 gattcttttgattctcgatgatgtgcacaatttggaacaactgcatgctttggccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattacc 18678666  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||  |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||| ||  | ||    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  18678665 actcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatgg 18678566  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18678565 cttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaacgtgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttc 18678466  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  18678465 caact 18678461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18698805 - 18698301
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18698805 cttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatc 18698706  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18698705 tccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaa 18698606  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18698605 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattacc 18698506  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||  |||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||| ||  |  |    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  18698505 actcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatgg 18698406  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18698405 cttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttc 18698306  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  18698305 caact 18698301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18723490 - 18722986
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18723490 cttgcaaaaggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatc 18723391  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  18723390 tccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaa 18723291  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18723290 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaaacaactgcatgctttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagttatcattacc 18723191  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||  ||||||| |||||||  | ||||| | || ||| ||  |||| |||| ||||| ||  |  |    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  18723190 actcgtaacaaacaattactaaccaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatgg 18723091  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18723090 cttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgagcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttc 18722991  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  18722990 caact 18722986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18654882 - 18654378
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  18654882 cttgcaaaatcaattaataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatc 18654783  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18654782 tccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaa 18654683  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18654682 gattcttttgattctcgatgatgtggacaatttggaaccactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattacc 18654583  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||  |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||| ||  |  |    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  18654582 actcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatgg 18654483  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18654482 cttttaaaatttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtcgtgggttc 18654383  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  18654382 caact 18654378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18730909 - 18730405
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18730909 cttgctaaagtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatc 18730810  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18730809 tccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaa 18730710  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18730709 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattacc 18730610  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||  |||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||| ||  |  |    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  18730609 actcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatgg 18730510  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18730509 cttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttc 18730410  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  18730409 caact 18730405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 18074534 - 18075038
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||   |||||| |     
T  18074534 cttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtt 18074633  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||    |||||||||||| ||  |  ||||||    
T  18074634 tccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaa 18074733  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  18074734 gattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcacc 18074833  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| ||||||||||||    |||||| |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18074834 acccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 18074933  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  18074934 cttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttc 18075033  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  18075034 taact 18075038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 376 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18688656 - 18688527
Alignment:
Q  376 gctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttc 475  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  18688656 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttc 18688557  T
Q  476 cattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18688556 cattagctatagaagtagtgggttccaact 18688527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5090224 - 5089860
Alignment:
Q  136 gaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatga 235  Q
    ||||||| |||||||| | | |||||||||||| |    |||||| ||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  5090224 gaaattaggtttggagatatcagtgagggaattccaatcataaagaaaaggctacaaagaaagaaagttcttttgattctcgatgatattgacaaactga 5090125  T
Q  236 atcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggat 335  Q
    | |||||  | | |||||| |||| || ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  5090124 aacaactacaggttttggccggagaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaaaatgtcatgggat 5090025  T
Q  336 aaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaa 435  Q
      | |  ||| | | |||||| || || |||| ||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |  ||  |||  | || |||| |||    
T  5090024 tgatataacatacgaagtagatggtttaaatgagaacgaagctcttcaattattaaggtggaaggcttttaaaaatagtactgttaatccaagttatgaa 5089925  T
Q  436 gacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    |  |||||||||||||  ||  | |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  5089924 ggaattttaaaccgtgtggtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagttgtgggttc 5089860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Original strand, 60342 - 60846
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||   |||||| |     
T  60342 cttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtt 60441  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||    |||||||||||| ||  |  ||||||    
T  60442 tccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaa 60541  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  60542 gattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcacc 60641  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    || ||||| ||||||||||||    |||||| |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  60642 acccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatgg 60741  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  60742 cttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttc 60841  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  60842 taact 60846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 29273247 - 29272743
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||| |  |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  29273247 cttgcaagagcaatctataatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatc 29273148  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||  |  | | ||||||||||| |    |||||||||||| ||| |   ||||||||| |||||   |  ||||||    
T  29273147 tccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaa 29273048  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29273047 aattcttttgattctcgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattact 29272948  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29272947 actcgagacaaacacttgctaacttgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggctgtatgggacaaaagctcttgaattgttgaggtggatgg 29272848  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||| | | | ||||| ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  29272847 cttttaagaataacaaagtaccttcaatttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttc 29272748  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  29272747 caact 29272743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 267749 - 267245
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||  || |||  |||||||||    
T  267749 cttgcaagagcaatctataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatgtgagagaaaattcagctataagtaacttgaaacatc 267650  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  |  | | ||||||||||| |    |||||||||||| ||| |    || |||||||||||   |  ||||||    
T  267649 tccaagagaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggcattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaa 267550  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  267549 gattcttttgattctcgatgatgttaacgatataaaacaattgcatgctttggctggaggacttgattggttcggctatggaagcagagtcgtcgttacc 267450  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||| || |||||||   ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  267449 actcgagacaagcaattactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgaagtagaagggttgtatgggaccgaagctcttgaattgttgagttggatgg 267350  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||| ||||  |||||| |||  |||| | || |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  267349 cttttaaaaatgatccagttccatcaatttacaatgagattttaattcgtgcagttgcttatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttc 267250  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  267249 taact 267245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28127084 - 28126580
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||| ||||||| |||| || || ||||  |||||||||    
T  28127084 cttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagatttcaactccatataatttgaaacatc 28126985  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    |||| ||  |||||||||| |||||| ||  | | || |||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||  |||||||      ||||||    
T  28126984 tccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaa 28126885  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28126884 gattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattacc 28126785  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28126784 actcgagagaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgcggtaaaagggttgtatgtaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatgg 28126685  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||||||  | | |||||||||||| |||| || ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28126684 cttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgggcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttatagaaatagtgggttc 28126585  T
Q  501 aaact 505  Q
     ||||    
T  28126584 caact 28126580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28163784 - 28163298
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagcttcaaataaagtgaaacatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||| |||||||||||| || ||   ||  |||||||||    
T  28163784 cttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatc 28163685  T
Q  101 tccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaa 200  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| || ||  |   || |||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||| |||  ||| ||    
T  28163684 tccaggaagagctctttttgaaa-cagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaataa 28163586  T
Q  201 gattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattacc 300  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||  || | || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28163585 aattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagggtcatcattacc 28163486  T
Q  301 actcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  28163485 actcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcattcggtagaagggttgtatgggacggaagcgcttgaattgttgacgtggatgg 28163386  T
Q  401 cttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttataga 488  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28163385 cttttaaaaataacaaagttccttcaagttatgaagatgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttataga 28163298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 500
Target Start/End: Original strand, 26137032 - 26137160
Alignment:
Q  372 tgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggc 471  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |   |   ||| |||| ||  | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  26137032 tgaagctcttgaattgtttaggtggatggcttttaaaagtaaccacaatgactcaagttatgattatattttaaacagtgcagttaaatatgcttctggc 26137131  T
Q  472 cttccattagttatagaagtagtgggttc 500  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  26137132 cttccgttagctttagaagtagtgggttc 26137160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 17992348 - 17992120
Alignment:
Q  277 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   |||||||||| ||||  | | ||| |||||| || || |||| |   ||||    
T  17992348 cgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacatttgttaacatgtcatgggattaaaacaatatatgaagtagatggattaaatgaggaagaag 17992249  T
Q  377 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 476  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |  |  || ||  |||  ||||  |  | ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||    
T  17992248 ctcttgaactgttaaggtggaaggcatttaaaggcaacgaaattgattctagttataactatattttaaaccgtgtagttaaatatgctgctggcctccc 17992149  T
Q  477 attagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  17992148 attagctttagaagtagtgggttccaact 17992120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 3280432 - 3280511
Alignment:
Q  1 cttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgttagagagaattcagc 80  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  3280432 cttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattcagc 3280511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 439 - 479
Target Start/End: Original strand, 17713508 - 17713548
Alignment:
Q  439 attttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccatt 479  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17713508 atttcaaaccgtgcagtttcttatgcttctggccttccatt 17713548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 332
Target Start/End: Original strand, 16691904 - 16691971
Alignment:
Q  265 gattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgg 332  Q
    |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16691904 gattggtttggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacaagtcatgg 16691971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Original strand, 16691648 - 16691696
Alignment:
Q  9 agcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttctt 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  16691648 agcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttctt 16691696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 5)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 28425 - 28557
Alignment:
Q  203 ttcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccac 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||| ||   | |||||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||| |||||||||||    
T  28425 ttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagcaattgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccac 28524  T
Q  303 tcgagacaaacacttactaagtagtcatgggat 335  Q
    |||| ||||||| || |||   |||||||||||    
T  28525 tcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggat 28557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Original strand, 40537 - 40601
Alignment:
Q  249 tttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaac 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40537 tttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccactcgagacaaac 40601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 335
Target Start/End: Original strand, 43940 - 44064
Alignment:
Q  211 attctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 310  Q
    ||||||||||||||| || |  |||| ||| || | | ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43940 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcgagaca 44039  T
Q  311 aacacttactaagtagtcatgggat 335  Q
     ||| || ||||  |||||||||||    
T  44040 gacatttgctaaaaagtcatgggat 44064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 35694 - 35903
Alignment:
Q  195 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatc 294  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |  | || ||| || | | |||||| |||| | |||||||||| || | |||||| | ||| |||    
T  35694 aaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatc 35793  T
Q  295 attaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggt 394  Q
    |||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||  |||| ||  | | | ||||   ||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  35794 attaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagaacgtacgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgttgaggt 35893  T
Q  395 ggatggcttt 404  Q
    ||| ||||||    
T  35894 ggaaggcttt 35903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 460 - 505
Target Start/End: Original strand, 44189 - 44234
Alignment:
Q  460 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaact 505  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  44189 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaact 44234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 57509 - 57390
Alignment:
Q  195 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatc 294  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| || |  |||| ||| |  | | |||||||||||||||||||||||| || | ||| || | ||| |||    
T  57509 aaagaaggttttgttgattctcgatgatgttcacgagctgaagcaattacaggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagtaaagtgatc 57410  T
Q  295 attaccactcgagacaaaca 314  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  57409 attaccactcgagacgaaca 57390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University